lowQualScore : 1 33333333333333333333333333333333333333 22222 555555555555555555 1 1111111111111111111111
lowQualScore : 33 0 555555 33 444 33 2 33 33 3 2 33333333333333333333333333333333333333 2 3 55555 3 000000000000000000 3 77777 33 33 2 444 3 4444 22 4444 44444 1 6666666666666666666666 333 3 777777 99 444 1 11 3 1 777
lowQualScore : .. . ...... .. ... .. . .. .. . . ...................................... . . ..... . .................. . ..... .. .. . ... . .... .. .... ..... . ...................... ... . ...... .. ... . .. . . ...
lowQualScore : 44 9 111111 44 444 22 4 22 11 8 2 66666666666666666666666666666666666666 2 1 99999 3 888888888888888888 1 11111 22 22 4 111 5 2222 88 5555 55555 8 1111111111111111111111 222 1 777777 44 333 0 44 6 9 666
consensus : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TAT--CAAATTAATGG-AT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-ATATTA---A-TTATTTAGTTC-AA-----G-----TTA--TTGATGATGC-ACA-----GATCTGT--A--C-T---CTGTGGACAACTATT----T--T----TCCA-----AAC-GT----------------------TATGGCTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCNACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGGTTTNATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAATN--TTATAA
Reference ( gi|19442 ) : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TAT--CAAATTAATTG-AT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-ATATTA---T-TTATTTAGTTC-AA-----G-----TT-----GATGATGC-ACA-----GATCTGT--A--C-T---CTGTCGACAACTATT----T--T----TCCA-----AAC-GT----------------------TATGGCTA---ACACAAACAATTCCG-----GTCTGACATCAAAA-T-AAAATCGG-TC--CAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAATA--TTATAA
gi|19444 : CTTGTTGAAAATTGAAGCGTTTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TAT--CAAATTAATGG-AT-------------T----A----------T--------AT-AAATAAACGGTATGGAAATTTT-ATATGA---A-TTATTTAGTTC-AA-----G-----TTACATTGATGATGC-ACA-----GATCTGT--A--C-T---CTGTGGACAACTGTT----T--T----TCCA-----AAC-GT----------------------TATGGCGA---ACGCAAACATTTCCG-----GTCCGACATCAAAA-T-AAAATCAG-TC--CAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAATA--TTATAA
gi|19443 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTCAAT--TGCACAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TAT--CAAATTAATGG-AT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGACATTTT-ATATTA---A-TTATTTAGTTC-AAGTTAGG-----TT-----GATGTTGC-ACA-----GATCTGT--A--C-T---CTGTGGACAACTATT----T--T----TCCA-----AAC-AT----------------------TATGGCTA---ACGCAAATAATTCTG-----GTCCGACATCAAAA-T-AAAGTTGG-TC--CAGGTTTAATCACTTT-CTTAATTAATATCATTAATA--TTATAA
gi|19446 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTGTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TAT--AAAAAAAATGG-AT-------------A----A----------GCCAAAG--AT-ATATAACCGGTATGGAAATTTT-ATATTT---A-TTATTTAGTTC-AA-----G-----TTATGTTGATGATGC-CCA-----GATCTGT--T--C-T---TTGTGGACAACCATT----T--T----TCCA-----AAC-GT----------------------TATGACTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CAGGTTTGATCAATTTCCTTAATTAATGTCATTAATA--TTATAA
gi|19447 : CTTTTTGAAAACTGAAGCATGTTTTTG-AT--TGCAAAGTTAGT--A---AAATA---TGGAGGAA--AATA--TAT--CAAATTAATGA-AT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-ATATAA---A-TTATTCTGTTT-AA-----G-----TTACGTTGATGATGC-CCA-----GATCTGT--A--C-T---ATGTGGACAACTATT----T--T----TCCA-----AAC-AT----------------------TATGGCTA---GCGCAAACAATTCCG-----GTCGAACATCAAAA-T-AAAATCGG-TC--CAGATTTGATCACTTCCTTTAACT-ATGTCATTAATA--TTATAA
gi|19445 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTCTGCAT--TGCAAAGT-----------------------GAA--A-TA--TAT--CAAATTAATGG-AT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACAGTATGGATATTTT-ATATTA---A-TTATTTAGTTC-AAGTTACG-----TT-----GATGATGC-CCA-----GATCTGT--A--C-T---CTGTGGACAACTATT----T--T----TCC------AAC-AT----------------------TATGGCTG---ACGCAAACAATTCCA-----GTCCGACATCAAAA-T-AAAATCGG-TC--CAGGTTTGGTCACTTTCC-TAATTAATGTCATTAATA--TTATAA
gi|19448 : CTTTTTGAAAGTTGGAGCATGTTGTTGGAA--TG-----TTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TAT--CAAATTAATGG-GT-------------A----A----------GCCAAAG--AT-ATATAACCAGTATGGTAATTTT-ATATTA---A-TTATTTAGTTC-AA-----G-----TTATGTTGATGATGC-ACA-----GATCTGT--A--C-T---TTGTGAACAACCATT----T--T----TCCA-----AAC-AT----------------------TATGACTA---ACGCAAAGAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-C-AAAATTGG-TC--CAGATTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAATA--TTATAA
gi|19449 : CTTTTTGAAAATTGAATCATGTTGTTGGAT--TGCGAAATTAGT--T---A--TA---TAGACGAA--A-TA--TAT--CAAATTAATGG-AT-------------A----AACCAAAGAAAG--------AG-ATATAAACTGTATGGAAACTTT-ATATTA---A-ATATTTAGTTC-CA-----G-----TTACATTGATGATGC-ACA-----GATCTGT--A--C-TACTCTGTGGACAAATCTG----T--T----TCCA-----AAC-AT----------------------TATGACTA---ACACAAACAATTCCA-----GTTCGACATCAAAA-T-AAAATCTG-TC--CAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAATA--TTATAA
gi|19450 : CTTTTTAAAAATTGAAGCATATTGTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TAATATTGAGGAA--A-TA--TAT--CAAATTAATGG-AT-------------A----AACCAAA----G--------AT-ATATAAACGATATGGAAATTTT-AAATTT---A-TTATTTAGTTC-AA-----GCTACGTT-----GATGACGC-ACA-----GATCTGT--A--C-T---CTGTGGACAACTATT----T--T----TCCA-----AAC-GT----------------------TATGACTA---AAGCAAACAATTCCA-----GCCCGACATCAAAA-T-AAAATCTG-TT--CAGGTTTGATCACTTT-CTCAATCAA
gi|19451 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTGTTGCAT--TACGAAGTTAAT--ATTGA--TA---TGGAGGAA--A-TA--T----TAAATTAATGG-AT-------------A----A----------ACTCAAGATAT-ATATAGACGGTATGGAAATTTT-ATATTA---A-TTATTTAGTTC-AA-----G-----TT-----A------C-ACA-----GATCTGT--C--C-T---CTGTGGACAACTTTT----T--T----TCCA-----AAT-GT----------------------TATGACGA---ACACAAACAGTTCCG-----GTCAGACTTTAAAA-T-AAAATCGG-TC--CAG
gi|19454 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTCTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TAT--CAAATTAATAG-AT-------------A----A----------G--------ATAATATAAACGGTATGGATATTTT-ATATTT---A-TTATTTAGTTC-AAGTTACG-----TT-----GATGATGC-ACA-----GATCTGT--A--C-T---CTACCGACAACTATT----T--
gi|19452 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TAT--CAAATTAATGT-AT-------------A----A----------G--------AT-ATTTAAACGGTATG
gi|19453 : CTTTTTGAAAATTGAAGCAAGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--T---A--TA---TGGAAGAA--A-TA--TAT--CAAATTAATGG-AT-------------A----A----------GAT------AT-ATATAAACGGTATGtactctgtggacaactattttaccaaacgttatggctataaatgcaaacaattccagttcgacatcaaaataaaatcggtccaggtttggtcactttccttattaatgtcattaatattataa
gi|19455 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TTCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TAT--TAAATTAATGG-AT-------------A----A----------G--------AT-ATATCAACGGTATGtactctgtggactattatttttcctaacgttatggctaatgcaaacaattccagtccaacatcaaaataaaatcggtccaggtttggtcactttcctaattaatgtcattaatattataa
gi|19456 : CTTTTTGAAAATTGAATCATGTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGTAAA---A--TA---TGGAGGAATTA-TAATTAT--C-AATTTATGG-AC-------------A----A----------G--------AT-ATATTAACGGTATGGAAATTTT-ATATtactctttgaacaactatttttccaaacgttatggttaacgcaaataattccagtctgacatcaaaataaaatcggtcccggtcactttcctaattaatttcattaatttcataa
gi|19457 : TTCTTGAAAGT-GA--CATGTTTTAAAATAATGTGAAATTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATATCAAACTAATGG-ATTAATGTTAAGCCAA----A----------G--------AT-GTATAACTCGAAAG--AATTTT-TTTTTAAGCTATTATTTTGTTT-AT-----G-----TT-----GGTCAGGTTACGTTGGTGATCTGT--AAAC-T---TTGTGGACAACCTTT----T--TGCTTTCCA-----ATCAGTAAGCTTAATCAAAACTGAAAACTATGACTT---ACGCAAACAATTCTG-----GTCCTATATAAAAA-A-AAAATTGT-TTTTCAAGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCGTTCATACTTTAT
gi|19458 : --TGTGAAGTTAGT--C---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TAC--CAAGT-AATTGGAT-------------ATGCCA----------A--------AG-ATATAATCGGTATGGAAATTTTTATATTA-------ATTTAGTTCCAA-----GATACGTT-----GATGATTC-ACA-----GATCTTT--A--C-T---GAGTGGACAATCATT----T--C----TCCA-----AAC-GT----------------------TACAACTT---AAGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATC--AA-TCAAAATTTG-TC--CAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAAAGTCATTAATA--TT
gi|19459 : GAA--G-TA--TAT--CAAATTAATGG-AT-------------A----A----------G--------AT-ATATTAAAGGTATG
gi|19461 : T--CAAATTAATGG-AT-------------A----A----------G--------AT-ATATTAAAGGTATG
gi|19460 : -----TT-----GATGATGC-ACA-----GATCTGTAAA--CAT---TTGTGAATAACCATTTTGCT--T----TCCATTGATAA---------------------------ACGGCTA---ACtactctatggacaacaatttttccaaaagttatggctaacgcaaacaattccagtctgaaatcaaaacaaaatcggtccaggtttgatctatgtcctaattaatgtcaataatattataa
gi|19461 : gttgcaaggcttacaA-----GGTATGT--A--C-T---CTATGGACAACAATT----T--T----TCCA-----AAA-GT----------------------TATGGCTA---ACGCAAACAATTCCA-----GTCTGAAATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CAGGTTTGATCTATGTCC-TAATTAATGTCAATAATA--TTATAA
gi|19452 : tcaaattaatggataagatatattaaTGT--A--C-T---CTGTGGACAACTATT----T--T----ACCA-----AAC-GT----------------------TATGGCTATAAATGCAAACAATTCCA-----GTTCGACATCAAAA-T-AAAATCGG-TC--CAGGTTTGGTCACTTTCCTT-ATTAATGTCATTAATA--TTATAA
gi|19453 : ctttttgaaaattgaagcatgtttttggattgcgaagttagtaatatggaggaaatatatcaaattaatgtataagatatttaaacggtaTGT--A--C-T---CTGTGGACTATTATT----T--T----TCCT-----AAC-GT----------------------TATGGCTA---ATGCAAACAATTCCA-----GTCCAACATCAAAA-T-AAAATCGG-TC--CAGGTTTGGTCACTTTCC-TAATTAATGTCATTAATA--TTATAA
gi|19455 : ctttttgaaaattgaagcaagtttttggattgcgaagttagttatatggaagaaatatatcaaattaatggataagatatatataaacggtaTGT--A--C-T---CTTTGAACAACTATT----T--T----TCCA-----AAC-GT----------------------TATGGTTA---ACGCAAATAATTCCA-----GTCTGACATCAAAA-T-AAAATCGG-TC--CCGG-----TCACTTTCC-TAATTAATTTCATTAATT--TCATAA
gi|19463 : ctttttgaaaattgaagcatgtttttggatttcgaagttagtaatatggaggaaatatattaaattaatggataagatatatcaacggtaACAACAATT----T--T----TCCA-----AAC-GT----------------------TATGGCTA---ACACAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-T-AAAATCGG-TC--CAGGTTTGATAACTTTCCTTAATTAATGTTATTAATA--TTATAA
gi|19462 : ACTACTATT----T--T----CTCA-----AAT-GT----------------------TATGGCTA---ATGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-T-AAAATCTG-TC--CAGGTTTGATAACTTTCCTTAATCAATGTCATTAATA--TTATAA
gi|19464 : TATT----TAAT----ACCA-----AAC-AC----------------------TATGACCA---ACGCAAACGATTCGG-----GTCCTACATCAAAA-C-AAAATCAGTTC--CAGGTTTGATCTCTTTCCTTAACTAAT-TAATCAATG--TCAT
gi|19465 : CCA-----CAC-GT----------------------TATGACTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-C-AAAATCGG-TT--CAGGTTTTATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAATT--TTATAA
gi|19466 : CCA-----ATC-GT----------------------TACGATAA---ACGCAATCAATTCCG-----ATCCGACATCAAAA-C-CAAATCTG-TC--CAGATTTGATCACTTTCCTTAATTTATGTCATTAATA--TTATA
gi|19467 : CCA-----CAT-GT----------------------TACGACTA---ACACAAACATTTCAG-----GTCAGACATCAAAA-C-AAAATCAG-TT--CAGGTATTATCCCTTAACTTAATAAATGTCATTAATT--TTATA
gi|19468 : AAACCATTCAGAACCTGTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAATT--TTATAA
gi|19469 : AAACCATTCAGAACCTGTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--TGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAATT--TTATAA
gi|19470 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAATT--TTATAA
gi|19472 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAATT--TTATAA
gi|19471 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGGTTTAATCACTTGCATTAATTAATGTCATTAATT--TTATAA
gi|19473 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT
gi|19474 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTATTT--TTATAA
gi|19475 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--TGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAATT--TTATAA
gi|19476 : CCT-----GTCCCACATTAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGGTTTTATCACTTTTATTAATTAATGTCATTAATT--TTATAA
gi|19477 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGGTTTTATCACTTTCAGTAATTAATGTCATCAATT--TTATAA
gi|19478 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAATT--TTATAA
gi|19479 : CCT-----GTCCCACATCAAAAAC-AAAATCGG-TC--CGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAATT--TTATAA
gi|19480 : CCT-----GTCCCACATCAAAAAC-AAAATCGG-TC--CGGCTTTTATCACTTTAATTAATTAATGTCATTAATT--TTATAA
gi|19481 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-C-AAAATTGG-TC--CGGGTT----CACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT---TTATAA
gi|19482 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-C-AAAATTGG-TC--TGGGTT----CAATTTCATTAATTAATGTCATCAATT--TTATAA
gi|19483 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGTTTTTTTTCACTTTCATTAATTTATGTCTTTATTT--TTATAA
gi|19484 : -----GTCCCACATCAAAA-C-AAAATCGG-TC--CGGGTTTTGTCACTTGCATTAATTAATGTCATTAATT--TTATAA
gi|19485 : AAATCGG-TC--CGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAATT--TTATAA
gi|19486 : -TC--CAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAATA--TTATAA
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333 222222 11111 1111111111111111111111
lowQualScore : 33 444444 33 444 66 2 33 33333333333333333333333333333333333333 2 2 33 5555 2 33 2 2 22 55 666666 55 2 333 11111 66 2 333 8888 22 1 5555555555555555555555 44444 333 777777 1 2 11 1 2 1 333
lowQualScore : .. ...... .. ... .. . .. ...................................... . . .. .... . .. . . .. .. ...... .. . ... ..... .. . ... .... .. . ...................... ..... ... ...... . . .. . . . ...
lowQualScore : 22 222222 22 111 11 2 11 66666666666666666666666666666666666666 2 2 11 0000 4 22 1 1 99 00 888888 55 0 999 11111 11 2 999 1111 66 7 4444444444444444444444 33333 000 333333 0 1 44 0 0 7 444
consensus : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA--T--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTNATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--NTTATAA
Reference ( family-515 ) : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA--T--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCNACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTNATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--NTTATAA
gi|19442 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATTGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----T-TTATT--TAGTT-C--AA--GTT-------GAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTCGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACACAAACAATTCCG-----GTCTGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19443 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTCAAT--TGCACAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGACATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTAGGT--TGAT--GTTG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAATAATTCTG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAGTTG--G-TCCAGGTTTAATCACTTT-CTTAATTAATATCATTAAT--ATTATAA
gi|19444 : CTTGTTGAAAATTGAAGCGTTTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------T----A----------T--------AT-AAATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATGA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTACAT--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTGTT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCGA---ACGCAAACATTTCCG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCA--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19445 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTCTGCAT--TGCAAAGT-----------------------GAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACAGTATGGATATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTACGT--TGAT--GATG-CCC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCC-AAC-AT----------------------T-----ATGGCTG---ACGCAAACAATTCCA-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGGTCACTTTCC-TAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19446 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTGTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATAAAAAAAATGGAT-------------A----A----------GCCAAAG--AT-ATATAACCGGTATGGAAATTTT-AT--ATTT----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA--TGTTGAT--GATG-CCC---A-----GATCTGT--TC-T---TTGTGGACAACCATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGACTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATCAATTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19447 : CTTTTTGAAAACTGAAGCATGTTTTTG-AT--TGCAAAGTTAGT--A---AAATA---TGGAGGAA--AATA--TATCAAATTAATGAAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATAA----A-TTATT--CTGTT-T--AA--GTTACGT--TGAT--GATG-CCC---A-----GATCTGT--AC-T---ATGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGGCTA---GCGCAAACAATTCCG-----GTCGAACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGATTTGATCACTTCCTTTAACT-ATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19448 : CTTTTTGAAAGTTGGAGCATGTTGTTGGAA--TG-----TTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGGT-------------A----A----------GCCAAAG--AT-ATATAACCAGTATGGTAATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA--TGTTGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---TTGTGAACAACCATT----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGACTA---ACGCAAAGAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATTG--G-TCCAGATTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19449 : CTTTTTGAAAATTGAATCATGTTGTTGGAT--TGCGAAATTAGT--T---A--TA---TAGACGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----AACCAAAGAAAG--------AG-ATATAAACTGTATGGAAACTTT-AT--ATTA----A-ATATT--TAGTT-C--CA--GTTACAT--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-TACTCTGTGGACAAATCTG----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGACTA---ACACAAACAATTCCA-----GTTCGACATCAAAA-TAAAATCT--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19450 : CTTTTTAAAAATTGAAGCATATTGTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TAATATTGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----AACCAAA----G--------AT-ATATAAACGATATGGAAATTTT-AA--ATTT----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GCTACGT--TGAT--GACG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGACTA---AAGCAAACAATTCCA-----GCCCGACATCAAAA-TAAAATCT--G-TTCAGGTTTGATCACTTT-CTCAATCAA
gi|19451 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTGTTGCAT--TACGAAGTTAAT--ATTGA--TA---TGGAGGAA--A-TA--T--TAAATTAATGGAT-------------A----A----------ACTCAAGATAT-ATATAGACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA----------------CAC---A-----GATCTGT--CC-T---CTGTGGACAACTTTT----T--TTCCAAAT-GT----------------------T-----ATGACGA---ACACAAACAGTTCCG-----GTCAGACTTTAAAA-TAAAATCG--G-TCCAG
gi|19452 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGTAT-------------A----A----------G--------AT-ATTTAAACGGTATG
gi|19452 : GGAAAT----AT--ATCA----AATTAAT----GTA-T--AA--GATA--T--T--T--AA----AC---G-----G-TATGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TACCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTATAAATGCAAACAATTCCA-----GTTCGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGGTCACTTTCCTT-ATTAATGTCATTAAT--ATTATAAtactctgtggacaactattttaccaaacgttatggctataaatgcaaacaattccagttcgacatcaaaataaaatcggtccaggtttggtcactttccttattaatgtcattaatattataa
gi|19453 : ctttttgaaaattgaagcatgtttttggattgcgaagttagtaatatggaCTTTTTGAAAATTGAAGCAAGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--T---A--TA---TGGAAGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------GAT------AT-ATATAAACGGTATGT--ACTCT-GTGGACT-----A-TTATT--T--TT-CCTAAC-GTTA--T--GGCT--AATG-CA
gi|19453 : T-C--AA--ATTAA-T--GGATAAGATA-TAT---ATAAACGGTATGT--AC-T---CTGTGGACTATTATT----T--TTCCTAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ATGCAAACAATTCCA-----GTCCAACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGGTCACTTTCC-TAATTAATGTCATTAAT--ATTATAAaacaattccagtccaacatcaaaataaaatcggtccaggtttggtcactttcctaattaatgtcattaatattataa
gi|19454 : ctttttgaaaattgaagcaagtttttggattgcgaagttagttatatggaagaaatataCTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTCTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATAGAT-------------A----A----------G--------ATAATATAAACGGTATGGATATTTT-AT--ATTT----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTACGT--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTACCGACAACTATT----T--
gi|19455 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TTCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATTAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATCAACGGTATGTACTCTTT-G---AACA----A-CTATT--T-TTC-C--AAACGTTA--T--GGTT--AACG-CA
gi|19455 : GGAAAT----AT--ATTA----A---ATTAATGGAT----AA--GATA--T----AT--CA----AC---G-----G-TATGT--AC-T---CTTTGAACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGTTA---ACGCAAATAATTCCA-----GTCTGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCCGG-----TCACTTTCC-TAATTAATTTCATTAAT--TTCATAAaataattccagtctgacatcaaaataaaatcggtcccggtcactttcctaattaatttcattaatttcataa
gi|19456 : ctttttgaaaattgaagcatgtttttggatttcgaagttagtaatatggaCTTTTTGAAAATTGAATCATGTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGTAAA---A--TA---TGGAGGAATTA-TAATTATC-AATTTATGGAC-------------A----A----------G--------AT-ATATTAACGGTATGGAAATTTT-AT--AT
gi|19457 : TTCTTGAAAGT-GA--CATGTTTTAAAATAATGTGAAATTAGT--A---A--TA---TGGAGGAAATA-TA--TATCAAACTAATGGATTAATGTTAAGCCAA----A----------G--------AT-GTATAACTCGAAAG--AATTTT-TT--TTTAAGCTA-TTATT--TTGTT-T--A-----TG--T--TGGT--CAGGTTAC---GTTGGTGATCTGTAAAC-T---TTGTGGACAACCTTTTTGCT--TTCCAATCAGTAAGCTTAATCAAAACTGAAAACT-----ATGACTT---ACGCAAACAATTCTG-----GTCCTATATAAAAA-AAAAATTGTTT-TTCAAGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCGTTCATACTTTAT
gi|19458 : --TGTGAAGTTAGT--C---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TACCAAGTAATTGGAT-------------ATGCCA----------A--------AG-ATATAATCGGTATGGAAATTTTTAT--ATTA--------ATT--TAGTTCC--AA--GATACGT--TGAT--GATT-CAC---A-----GATCTTT--AC-T---GAGTGGACAATCATT----T--CTCCAAAC-GT----------------------T-----ACAACTT---AAGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATC-AAT-CAAAATTT--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAAAGTCATTAAT--ATT
gi|19459 : GAA--G-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATTAAAGGTATG
gi|19460 : A--T--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGTAAACAT---TTGTGAATAACCATTTTGCT--TTCCA-----T----------------------TGATAAACGGCTA---AC
gi|19461 : gttgcaaggcttacT-C--AA--ATTAA-T--GGATAAGATA-TATTAAA-----GGTATGT--AC-T---CTATGGACAACAATT----T--TTCCAAAA-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCA-----GTCTGAAATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATCTATGTCC-TAATTAATGTCAATAAT--ATTATAA
gi|19462 : ACTACTATT----T--TCTCAAAT-GT----------------------T-----ATGGCTA---ATGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCT--G-TCCAGGTTTGATAACTTTCCTTAATCAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19463 : ACAACAATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACACAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATAACTTTCCTTAATTAATGTTATTAAT--ATTATAA
gi|19464 : TATT----TAATACCAAAC-AC----------------------T-----ATGACCA---ACGCAAACGATTCGG-----GTCCTACATCAAAA-CAAAATCA--GTTCCAGGTTTGATCTCTTTCCTTAACTAAT-TAATCAAT--GTCAT
gi|19465 : CCACAC-GT----------------------T-----ATGACTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TTCAGGTTTTATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19466 : CCAATC-GT----------------------T-----ACGATAA---ACGCAATCAATTCCG-----ATCCGACATCAAAA-CCAAATCT--G-TCCAGATTTGATCACTTTCCTTAATTTATGTCATTAAT--ATTATA
gi|19467 : CCACAT-GT----------------------T-----ACGACTA---ACACAAACATTTCAG-----GTCAGACATCAAAA-CAAAATCA--G-TTCAGGTATTATCCCTTAACTTAATAAATGTCATTAAT--TTTATA
gi|19468 : AAACCATTCAGAACCTGTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19469 : AAACCATTCAGAACCTGTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCTGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19470 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19471 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTAATCACTTGCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19472 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19473 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--
gi|19474 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTATT--TTTATAA
gi|19475 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCTGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19476 : CCT-----GTCCCACATTAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTTATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19477 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCAGTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19478 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19479 : CCT-----GTCCCACATCAAAAACAAAATCG--G-TCCGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19480 : CCT-----GTCCCACATCAAAAACAAAATCG--G-TCCGGCTTTTATCACTTTAATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19481 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-CAAAATTG--G-TCCGGGT----TCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT---TTATAA
gi|19482 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-CAAAATTG--G-TCTGGGT----TCAATTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19483 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGTTTTTTTTCACTTTCATTAATTTATGTCTTTATT--TTTATAA
gi|19484 : -----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTGTCACTTGCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19485 : AAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19486 : -TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333 222222 11111 1111111111111111111111
lowQualScore : 33 444444 33 444 66 2 33 33333333333333333333333333333333333333 2 2 33 5555 2 33 2 2 22 55 666666 55 2 333 11111 66 2 333 8888 22 1 5555555555555555555555 44444 333 777777 3 2 11 1 2 1 333
lowQualScore : .. ...... .. ... .. . .. ...................................... . . .. .... . .. . . .. .. ...... .. . ... ..... .. . ... .... .. . ...................... ..... ... ...... . . .. . . . ...
lowQualScore : 22 222222 22 111 11 2 11 66666666666666666666666666666666666666 2 2 11 0000 4 22 1 1 99 00 888888 55 0 999 11111 11 2 999 1111 66 7 4444444444444444444444 33333 000 333333 0 1 44 0 0 7 444
consensus : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA--T--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTNATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--NTTATAA
Reference ( family-515 ) : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA--T--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTNATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--NTTATAA
gi|19442 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATTGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----T-TTATT--TAGTT-C--AA--GTT-------GAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTCGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACACAAACAATTCCG-----GTCTGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19443 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTCAAT--TGCACAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGACATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTAGGT--TGAT--GTTG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAATAATTCTG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAGTTG--G-TCCAGGTTTAATCACTTT-CTTAATTAATATCATTAAT--ATTATAA
gi|19444 : CTTGTTGAAAATTGAAGCGTTTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------T----A----------T--------AT-AAATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATGA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTACAT--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTGTT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCGA---ACGCAAACATTTCCG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCA--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19445 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTCTGCAT--TGCAAAGT-----------------------GAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACAGTATGGATATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTACGT--TGAT--GATG-CCC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCC-AAC-AT----------------------T-----ATGGCTG---ACGCAAACAATTCCA-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGGTCACTTTCC-TAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19446 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTGTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATAAAAAAAATGGAT-------------A----A----------GCCAAAG--AT-ATATAACCGGTATGGAAATTTT-AT--ATTT----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA--TGTTGAT--GATG-CCC---A-----GATCTGT--TC-T---TTGTGGACAACCATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGACTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATCAATTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19447 : CTTTTTGAAAACTGAAGCATGTTTTTG-AT--TGCAAAGTTAGT--A---AAATA---TGGAGGAA--AATA--TATCAAATTAATGAAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATAA----A-TTATT--CTGTT-T--AA--GTTACGT--TGAT--GATG-CCC---A-----GATCTGT--AC-T---ATGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGGCTA---GCGCAAACAATTCCG-----GTCGAACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGATTTGATCACTTCCTTTAACT-ATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19448 : CTTTTTGAAAGTTGGAGCATGTTGTTGGAA--TG-----TTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGGT-------------A----A----------GCCAAAG--AT-ATATAACCAGTATGGTAATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA--TGTTGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---TTGTGAACAACCATT----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGACTA---ACGCAAAGAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATTG--G-TCCAGATTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19449 : CTTTTTGAAAATTGAATCATGTTGTTGGAT--TGCGAAATTAGT--T---A--TA---TAGACGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----AACCAAAGAAAG--------AG-ATATAAACTGTATGGAAACTTT-AT--ATTA----A-ATATT--TAGTT-C--CA--GTTACAT--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-TACTCTGTGGACAAATCTG----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGACTA---ACACAAACAATTCCA-----GTTCGACATCAAAA-TAAAATCT--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19450 : CTTTTTAAAAATTGAAGCATATTGTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TAATATTGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----AACCAAA----G--------AT-ATATAAACGATATGGAAATTTT-AA--ATTT----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GCTACGT--TGAT--GACG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGACTA---AAGCAAACAATTCCA-----GCCCGACATCAAAA-TAAAATCT--G-TTCAGGTTTGATCACTTT-CTCAATCAA
gi|19451 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTGTTGCAT--TACGAAGTTAAT--ATTGA--TA---TGGAGGAA--A-TA--T--TAAATTAATGGAT-------------A----A----------ACTCAAGATAT-ATATAGACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA----------------CAC---A-----GATCTGT--CC-T---CTGTGGACAACTTTT----T--TTCCAAAT-GT----------------------T-----ATGACGA---ACACAAACAGTTCCG-----GTCAGACTTTAAAA-TAAAATCG--G-TCCAG
gi|19452 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGTAT-------------A----A----------G--------AT-ATTTAAACGGTATG
gi|19452 : GGAAAT----AT--ATCA----AATTAAT----GTA-T--AA--GATA--T--T--T--AA----AC---G-----G-TATGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TACCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTATAAATGCAAACAATTCCA-----GTTCGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGGTCACTTTCCTT-ATTAATGTCATTAAT--ATTATAAtactctgtggacaactattttaccaaacgttatggctataaatgcaaacaattccagttcgacatcaaaataaaatcggtccaggtttggtcactttccttattaatgtcattaatattataa
gi|19453 : ctttttgaaaattgaagcatgtttttggattgcgaagttagtaatatggaCTTTTTGAAAATTGAAGCAAGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--T---A--TA---TGGAAGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------GAT------AT-ATATAAACGGTATGT--ACTCT-GTGGACT-----A-TTATT--T--TT-CCTAAC-GTTA--T--GGCT--AATG-CA
gi|19453 : T-C--AA--ATTAA-T--GGATAAGATA-TAT---ATAAACGGTATGT--AC-T---CTGTGGACTATTATT----T--TTCCTAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ATGCAAACAATTCCA-----GTCCAACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGGTCACTTTCC-TAATTAATGTCATTAAT--ATTATAAaacaattccagtccaacatcaaaataaaatcggtccaggtttggtcactttcctaattaatgtcattaatattataa
gi|19454 : ctttttgaaaattgaagcaagtttttggattgcgaagttagttatatggaagaaatataCTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTCTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATAGAT-------------A----A----------G--------ATAATATAAACGGTATGGATATTTT-AT--ATTT----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTACGT--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTACCGACAACTATT----T--
gi|19455 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TTCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATTAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATCAACGGTATGTACTCTTT-G---AACA----A-CTATT--T-TTC-C--AAACGTTA--T--GGTT--AACG-CA
gi|19455 : GGAAAT----AT--ATTA----A---ATTAATGGAT----AA--GATA--T----AT--CA----AC---G-----G-TATGT--AC-T---CTTTGAACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGTTA---ACGCAAATAATTCCA-----GTCTGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCCGG-----TCACTTTCC-TAATTAATTTCATTAAT--TTCATAAaataattccagtctgacatcaaaataaaatcggtcccggtcactttcctaattaatttcattaatttcataa
gi|19456 : ctttttgaaaattgaagcatgtttttggatttcgaagttagtaatatggaCTTTTTGAAAATTGAATCATGTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGTAAA---A--TA---TGGAGGAATTA-TAATTATC-AATTTATGGAC-------------A----A----------G--------AT-ATATTAACGGTATGGAAATTTT-AT--AT
gi|19457 : TTCTTGAAAGT-GA--CATGTTTTAAAATAATGTGAAATTAGT--A---A--TA---TGGAGGAAATA-TA--TATCAAACTAATGGATTAATGTTAAGCCAA----A----------G--------AT-GTATAACTCGAAAG--AATTTT-TT--TTTAAGCTA-TTATT--TTGTT-T--A-----TG--T--TGGT--CAGGTTAC---GTTGGTGATCTGTAAAC-T---TTGTGGACAACCTTTTTGCT--TTCCAATCAGTAAGCTTAATCAAAACTGAAAACT-----ATGACTT---ACGCAAACAATTCTG-----GTCCTATATAAAAA-AAAAATTGTTT-TTCAAGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCGTTCATACTTTAT
gi|19458 : --TGTGAAGTTAGT--C---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TACCAAGTAATTGGAT-------------ATGCCA----------A--------AG-ATATAATCGGTATGGAAATTTTTAT--ATTA--------ATT--TAGTTCC--AA--GATACGT--TGAT--GATT-CAC---A-----GATCTTT--AC-T---GAGTGGACAATCATT----T--CTCCAAAC-GT----------------------T-----ACAACTT---AAGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATC-AAT-CAAAATTT--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAAAGTCATTAAT--ATT
gi|19459 : GAA--G-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATTAAAGGTATG
gi|19460 : A--T--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGTAAACAT---TTGTGAATAACCATTTTGCT--TTCCA-----T----------------------TGATAAACGGCTA---AC
gi|19461 : gttgcaaggcttacT-C--AA--ATTAA-T--GGATAAGATA-TATTAAA-----GGTATGT--AC-T---CTATGGACAACAATT----T--TTCCAAAA-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCA-----GTCTGAAATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATCTATGTCC-TAATTAATGTCAATAAT--ATTATAA
gi|19462 : ACTACTATT----T--TCTCAAAT-GT----------------------T-----ATGGCTA---ATGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCT--G-TCCAGGTTTGATAACTTTCCTTAATCAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19463 : ACAACAATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACACAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATAACTTTCCTTAATTAATGTTATTAAT--ATTATAA
gi|19464 : TATT----TAATACCAAAC-AC----------------------T-----ATGACCA---ACGCAAACGATTCGG-----GTCCTACATCAAAA-CAAAATCA--GTTCCAGGTTTGATCTCTTTCCTTAACTAAT-TAATCAAT--GTCAT
gi|19465 : CCACAC-GT----------------------T-----ATGACTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TTCAGGTTTTATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19466 : CCAATC-GT----------------------T-----ACGATAA---ACGCAATCAATTCCG-----ATCCGACATCAAAA-CCAAATCT--G-TCCAGATTTGATCACTTTCCTTAATTTATGTCATTAAT--ATTATA
gi|19467 : CCACAT-GT----------------------T-----ACGACTA---ACACAAACATTTCAG-----GTCAGACATCAAAA-CAAAATCA--G-TTCAGGTATTATCCCTTAACTTAATAAATGTCATTAAT--TTTATA
gi|19468 : AAACCATTCAGAACCTGTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19469 : AAACCATTCAGAACCTGTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCTGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19470 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19471 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTAATCACTTGCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19472 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19473 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--
gi|19474 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTATT--TTTATAA
gi|19475 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCTGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19476 : CCT-----GTCCCACATTAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTTATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19477 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCAGTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19478 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19479 : CCT-----GTCCCACATCAAAAACAAAATCG--G-TCCGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19480 : CCT-----GTCCCACATCAAAAACAAAATCG--G-TCCGGCTTTTATCACTTTAATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19481 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-CAAAATTG--G-TCCGGGT----TCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT---TTATAA
gi|19482 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-CAAAATTG--G-TCTGGGTT----CAATTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19483 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGTTTTTTTTCACTTTCATTAATTTATGTCTTTATT--TTTATAA
gi|19484 : -----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTGTCACTTGCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19485 : AAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19486 : -TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
blockSeqs : AA ATTG AA ATA TT A AT TAATGTTAAGCCAAAG A T GG AGCT A AA A C CT AC GGTT AA T TAA TAAAC AA A ACT TTGC AA A AAGCTTAATCAAAACTGAAAAC GATAA TAA GAACCT G A TT A C ACT
blockSeqs : . AAA . . AT . . AAACCAAAGAAAG . . . . . . A . . C CATT AA . . TTGGT AA . . TTGC . . . . . GAACCT G A . G C A
blockSeqs : . A . . . . . AAACTCAAGAT . . . . . . A . . . CGTT . . . . . . . . . . . . . G G . . G C A
blockSeqs : . A . . . . . AAGCCAAAG . . . . . . A . . . TGTT . . . . . . . . . . . . . G G . . G C A
blockSeqs : . A . . . . . AAGCCAAAG . . . . . . T . . . CGTT . . . . . . . . . . . . . A A . . G T A
blockSeqs : . A . . . . . AAACCAAAG . . . . . . A . . . TGTT . . . . . . . . . . . . . G G . . G C A
blockSeqs : . A . . . . . ATGCCAA . . . . . . A . . . CATT . . . . . . . . . . . . . G G . . G C A
blockSeqs : . T . . . . . AAGAT . . . . . . A . . . CGTT . . . . . . . . . . . . . G G . . G C A
blockSeqs : . A . . . . . AAG . . . . . . A . . . CGTT . . . . . . . . . . . . . A G . . G C A
blockSeqs : . A . . . . . TAT . . . . . . A . . . CGTT . . . . . . . . . . . . . A G . . G C A
blockSeqs : . T . . . . . AAG . . . . . . G . . . ATG . . . . . . . . . . . . . G A . . G C T
blockSeqs : . A . . . . . AAG . . . . . . T . . . ATG . . . . . . . . . . . . . A G . . G C A
blockSeqs : . A . . . . . AAG . . . . . . A . . . TT . . . . . . . . . . . . . A T . . G C A
blockSeqs : . A . . . . . AAG . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . A G . . G C A
blockSeqs : . C . . . . . AAG . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . G G . . G C A
blockSeqs : . . . . . . . AAG . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . G G . . G C G
blockSeqs : . . . AAG . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . A G . . T C T
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . G T . . G C A
blockSeqs : . . . . . . . . . G G . . T C T
blockSeqs : . . . . . . G G . . T C T
blockSeqs : . . . . G G . . T A T
blockSeqs : . . . . G C . . T A T
blockSeqs : G C . . A A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . T A T
blockSeqs : T C . . G A A
blockSeqs : T C . . . A .
blockSeqs : C . . . A
blockSeqs : . . C
blockSeqCons : CGTT**
originalCons : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTA--T--TGAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTNATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--NTTATAA
finalCons : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----A-TTATT--TAGTT-C--AA--GTTACGTT--GAT--GATG-CAC---A-----GATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTNATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--NTTATAA
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333333333 1111111111111111111111
lowQualScore : 33 444444 33 444 66 2 33 33333333333333333333333333333333333333 2 2 33 5555 1 999999999 2 55 2 33 33 444 66 2 333 8888 22 1 5555555555555555555555 44444 333 777777 3 2 11 1 2 1 333
lowQualScore : .. ...... .. ... .. . .. ...................................... . . .. .... . ......... . .. . .. .. ... .. . ... .... .. . ...................... ..... ... ...... . . .. . . . ...
lowQualScore : 22 222222 22 111 11 2 11 66666666666666666666666666666666666666 2 5 44 7777 0 444444444 4 66 4 22 22 777 11 2 999 1111 66 7 4444444444444444444444 33333 000 333333 0 1 44 0 0 7 444
consensus : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----ATTATTTAGT---------T-C--AA-G--TTACGTTGAT--GATGCAC---AGATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTNATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--NTTATAA
Reference ( family-515 ) : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----ATTATTTAGT---------T-C--AA-G--TTACGTTGAT--GATGCAC---AGATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTNATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--NTTATAA
gi|19442 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATTGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----TTTATTTAGT---------T-C--AA-G--TT-----GAT--GATGCAC---AGATCTGT--AC-T---CTGTCGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACACAAACAATTCCG-----GTCTGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19443 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTCAAT--TGCACAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGACATTTT-AT--ATTA----ATTATTTAGT---------T-C--AA-G--TTAGGTTGAT--GTTGCAC---AGATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAATAATTCTG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAGTTG--G-TCCAGGTTTAATCACTTT-CTTAATTAATATCATTAAT--ATTATAA
gi|19444 : CTTGTTGAAAATTGAAGCGTTTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------T----A----------T--------AT-AAATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATGA----ATTATTTAGT---------T-C--AA-G--TTACATTGAT--GATGCAC---AGATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTGTT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCGA---ACGCAAACATTTCCG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCA--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19445 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTCTGCAT--TGCAAAGT-----------------------GAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACAGTATGGATATTTT-AT--ATTA----ATTATTTAGT---------T-C--AA-G--TTACGTTGAT--GATGCCC---AGATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCC-AAC-AT----------------------T-----ATGGCTG---ACGCAAACAATTCCA-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGGTCACTTTCC-TAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19446 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTGTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATAAAAAAAATGGAT-------------A----A----------GCCAAAG--AT-ATATAACCGGTATGGAAATTTT-AT--ATTT----ATTATTTAGT---------T-C--AA-G--TTATGTTGAT--GATGCCC---AGATCTGT--TC-T---TTGTGGACAACCATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGACTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATCAATTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19447 : CTTTTTGAAAACTGAAGCATGTTTTTG-AT--TGCAAAGTTAGT--A---AAATA---TGGAGGAA--AATA--TATCAAATTAATGAAT-------------A----A----------G--------AT-ATATAAACGGTATGGAAATTTT-AT--ATAA----ATTATTCTGT---------T-T--AA-G--TTACGTTGAT--GATGCCC---AGATCTGT--AC-T---ATGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGGCTA---GCGCAAACAATTCCG-----GTCGAACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGATTTGATCACTTCCTTTAACT-ATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19448 : CTTTTTGAAAGTTGGAGCATGTTGTTGGAA--TG-----TTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGGT-------------A----A----------GCCAAAG--AT-ATATAACCAGTATGGTAATTTT-AT--ATTA----ATTATTTAGT---------T-C--AA-G--TTATGTTGAT--GATGCAC---AGATCTGT--AC-T---TTGTGAACAACCATT----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGACTA---ACGCAAAGAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATTG--G-TCCAGATTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19449 : CTTTTTGAAAATTGAATCATGTTGTTGGAT--TGCGAAATTAGT--T---A--TA---TAGACGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----AACCAAAGAAAG--------AG-ATATAAACTGTATGGAAACTTT-AT--ATTA----AATATTTAGT---------T-C--CA-G--TTACATTGAT--GATGCAC---AGATCTGT--AC-TACTCTGTGGACAAATCTG----T--TTCCAAAC-AT----------------------T-----ATGACTA---ACACAAACAATTCCA-----GTTCGACATCAAAA-TAAAATCT--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19450 : CTTTTTAAAAATTGAAGCATATTGTTGGAT--TGCAAAGTTAGT--A---A--TAATATTGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----AACCAAA----G--------AT-ATATAAACGATATGGAAATTTT-AA--ATTT----ATTATTTAGT---------T-C--AA-G--CTACGTTGAT--GACGCAC---AGATCTGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGACTA---AAGCAAACAATTCCA-----GCCCGACATCAAAA-TAAAATCT--G-TTCAGGTTTGATCACTTT-CTCAATCAA
gi|19451 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTGTTGCAT--TACGAAGTTAAT--ATTGA--TA---TGGAGGAA--A-TA--T--TAAATTAATGGAT-------------A----A----------ACTCAAGATAT-ATATAGACGGTATGGAAATTTT-AT--ATTA----ATTATTTAGT---------T-C--AA-G--TTAC-------------AC---AGATCTGT--CC-T---CTGTGGACAACTTTT----T--TTCCAAAT-GT----------------------T-----ATGACGA---ACACAAACAGTTCCG-----GTCAGACTTTAAAA-TAAAATCG--G-TCCAG
gi|19452 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATGTAT-------------A----A----------G--------AT-ATTTAAACGGTATG
gi|19452 : TGT--AC-T---CTGTGGACAACTATT----T--TACCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTATAAATGCAAACAATTCCA-----GTTCGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGGTCACTTTCCTT-ATTAATGTCATTAAT--ATTATAAtactctgtggacaactattttaccaaacgttatggctataaatgcaaacaattccagttcgacatcaaaataaaatcggtccaggtttggtcactttccttattaatgtcattaatattataa
gi|19453 : ctttttgaaaattgaagcatgtttttggattgcgaagttagtaatatggaggaaatatatcaaattaatgtataagatatttaaacggtaCTTTTTGAAAATTGAAGCAAGTTTTTGGAT--TGCGAAGTTAGT--T---A--TA---TGGAAGAA--A-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------GAT------AT-ATATAAACGGTATGT--ACTCT-GTGGACT-----ATTATTT--T---------T-CCTAACG--TTATG--GCT--AATGCA
gi|19453 : TGT--AC-T---CTGTGGACTATTATT----T--TTCCTAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ATGCAAACAATTCCA-----GTCCAACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGGTCACTTTCC-TAATTAATGTCATTAAT--ATTATAAaacaattccagtccaacatcaaaataaaatcggtccaggtttggtcactttcctaattaatgtcattaatattataa
gi|19454 : ctttttgaaaattgaagcaagtttttggattgcgaagttagttatatggaagaaatatatcaaattaatggataagatatatataaacggtaCTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTCTGGAT--TGCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATCAAATTAATAGAT-------------A----A----------G--------ATAATATAAACGGTATGGATATTTT-AT--ATTT----ATTATTTAGT---------T-C--AA-G--TTACGTTGAT--GATGCAC---AGATCTGT--AC-T---CTACCGACAACTATT----T--
gi|19455 : CTTTTTGAAAATTGAAGCATGTTTTTGGAT--TTCGAAGTTAGT--A---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TATTAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATCAACGGTATGTACTCTTT-G---AACA----ACTATTT-TT---------C-C--AA------ACGTT-AT--GGT
gi|19455 : TGT--AC-T---CTTTGAACAACTATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGTTA---ACGCAAATAATTCCA-----GTCTGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCCGG-----TCACTTTCC-TAATTAATTTCATTAAT--TTCATAAtaacgcaaataattccagtctgacatcaaaataaaatcggtcccggtcactttcctaattaatttcattaatttcataa
gi|19456 : ctttttgaaaattgaagcatgtttttggatttcgaagttagtaatatggaggaaatatattaaattaatggataagatatatcaacggtaCTTTTTGAAAATTGAATCATGTTTTTGGAT--TGCAAAGTTAGTAAA---A--TA---TGGAGGAATTA-TAATTATC-AATTTATGGAC-------------A----A----------G--------AT-ATATTAACGGTATGGAAATTTT-AT--AT
gi|19457 : TTCTTGAAAGT-GA--CATGTTTTAAAATAATGTGAAATTAGT--A---A--TA---TGGAGGAAATA-TA--TATCAAACTAATGGATTAATGTTAAGCCAA----A----------G--------AT-GTATAACTCGAAAG--AATTTT-TT--TTTAAGCTATTATTTTGTTTATGTTGGT-C--AG-G--TTACGTTGGT-------------GATCTGTAAAC-T---TTGTGGACAACCTTTTTGCT--TTCCAATCAGTAAGCTTAATCAAAACTGAAAACT-----ATGACTT---ACGCAAACAATTCTG-----GTCCTATATAAAAA-AAAAATTGTTT-TTCAAGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCGTTCATACTTTAT
gi|19458 : --TGTGAAGTTAGT--C---A--TA---TGGAGGAA--A-TA--TACCAAGTAATTGGAT-------------ATGCCA----------A--------AG-ATATAATCGGTATGGAAATTTTTAT--ATTA----ATT---TAGT---------T-CC-AA-G--ATACGTTGAT--GATTCAC---AGATCTTT--AC-T---GAGTGGACAATCATT----T--CTCCAAAC-GT----------------------T-----ACAACTT---AAGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATC-AAT-CAAAATTT--G-TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAAAGTCATTAAT--ATT
gi|19459 : GAA--G-TA--TATCAAATTAATGGAT-------------A----A----------G--------AT-ATATTAAAGGTATG
gi|19460 : GT---------TGC--AA-GGCTTACATTGAT--GATGCAC---AGATCTGTAAACAT---TTGTGAATAACCATTTTGCT--TTCCA-----T----------------------TGATAAACGGCTA---AC
gi|19461 : ---------T-C--AA-A--TTA-ATGGATAAGATATATTAAAGGTATGT--AC-T---CTATGGACAACAATT----T--TTCCAAAA-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACGCAAACAATTCCA-----GTCTGAAATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATCTATGTCC-TAATTAATGTCAATAAT--ATTATAA
gi|19462 : ACTACTATT----T--TCTCAAAT-GT----------------------T-----ATGGCTA---ATGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCT--G-TCCAGGTTTGATAACTTTCCTTAATCAATGTCATTAAT--ATTATAA
gi|19463 : ACAACAATT----T--TTCCAAAC-GT----------------------T-----ATGGCTA---ACACAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-TAAAATCG--G-TCCAGGTTTGATAACTTTCCTTAATTAATGTTATTAAT--ATTATAA
gi|19464 : TATT----TAATACCAAAC-AC----------------------T-----ATGACCA---ACGCAAACGATTCGG-----GTCCTACATCAAAA-CAAAATCA--GTTCCAGGTTTGATCTCTTTCCTTAACTAAT-TAATCAAT--GTCAT
gi|19465 : CCACAC-GT----------------------T-----ATGACTA---ACGCAAACAATTCCG-----GTCCGACATCAAAA-CAAAATCG--G-TTCAGGTTTTATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19466 : CCAATC-GT----------------------T-----ACGATAA---ACGCAATCAATTCCG-----ATCCGACATCAAAA-CCAAATCT--G-TCCAGATTTGATCACTTTCCTTAATTTATGTCATTAAT--ATTATA
gi|19467 : CCACAT-GT----------------------T-----ACGACTA---ACACAAACATTTCAG-----GTCAGACATCAAAA-CAAAATCA--G-TTCAGGTATTATCCCTTAACTTAATAAATGTCATTAAT--TTTATA
gi|19468 : AAACCATTCAGAACCTGTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19469 : AAACCATTCAGAACCTGTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCTGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19470 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19471 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTAATCACTTGCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19472 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19473 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--
gi|19474 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTATT--TTTATAA
gi|19475 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCTGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19476 : CCT-----GTCCCACATTAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTTATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19477 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCAGTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19478 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19479 : CCT-----GTCCCACATCAAAAACAAAATCG--G-TCCGGCTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19480 : CCT-----GTCCCACATCAAAAACAAAATCG--G-TCCGGCTTTTATCACTTTAATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19481 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-CAAAATTG--G-TCCGGGT----TCACTTTCATTAATTAATGTCATCAAT---TTATAA
gi|19482 : CCT-----GTCCCAAATCAAAA-CAAAATTG--G-TCTGGGT----TCAATTTCATTAATTAATGTCATCAAT--TTTATAA
gi|19483 : CCT-----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGTTTTTTTTCACTTTCATTAATTTATGTCTTTATT--TTTATAA
gi|19484 : -----GTCCCACATCAAAA-CAAAATCG--G-TCCGGGTTTTGTCACTTGCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19485 : AAATCG--G-TCCGGGTTTTATCACTTTCATTAATTAATGTCATTAAT--TTTATAA
gi|19486 : -TCCAGGTTTGATCACTTTCCTTAATTAATGTCATTAAT--ATTATAA