lowQualScore : 222222 3333333333333333 111111111 222222222222
lowQualScore : 0 11 222222 0 777 1 0 1 2222 333 22 3 1 000 3333 1111 1111111111111111 1 77777777777777 4 0 2 111 4444 22 0 1 1111 555555555 1 0 1 222 4 5 666666666666 222
lowQualScore : . .. ...... . ... . . . .... ... .. . . ... .... .... ................ . .............. . . . ... .... .. . . .... ......... . . . ... . . ............ ...
lowQualScore : 9 22 000000 8 000 6 7 4 7777 333 33 6 0 999 7777 1111 5555555555555555 5 22222222222222 0 8 8 444 7777 22 7 2 2222 111111111 7 6 9 000 0 4 555555555555 000
consensus : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-C-T---ACTCTG---G-CA-GACAAGGATTAATC---CT----T----GCCATA---------TC-AGATTTGGAA----------GTANC-TAA---AT----T--GATAAAACA-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGAAGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTGG---AAGTATCT
Reference ( gi|22522 ) : ACA-AAAT--AT--A---A-A--TC-C-C-T---ACTCTG---G-CA-GACAAGGATTAATC---CT----T----GCCAGA---------TC-AGATTTGGGA----------GTATC-TAA---AT----T--GATAAAACA-CAAAAT----ATG--------TAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGAAGGATTAATCCTCGCCATA------TCGGATTTGA---AAGTATCT
gi|22504 : ACG-AAAT--AT--A---A-A--TT-C-C-T---ACTCTG---G-CA-GACATAGATTAATT---CT----T----GCCATA---------TC-AGATTTGGGA----------GTATC-TAA---AT----T--GATAAAACA-CAAAAT----ATG--------TAA-CCCC-TA-TTTG---GCAGAGAAGGAATAATCCTCGCC
gi|22488 : aaaaACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-C-T---ACTCTT---G-CA-GACAAGGATTAATC---CT----T----GCCATA---------TC-AGATTTGAAA----------GTAGC-TAA---AT----T--GATAAAACA-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCT-TTCTCTGAGAG-AGAGAAGGATTAATCCTTGCC
gi|22486 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-C-T---ACTCTG---G-CA-GAGAAGGATTAATC---CT----C----GCCATA---------TC-GGATTTGAAA----------GTATC-TAT---AT----T--GATAAAACG-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGAATGATTAATCCTTG
gi|22495 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-C-T---TCTCTG---G-CG-GACAACGATTAATC---CT----T----GCCATA---------TC-AAATTTGGAT----------GTATC-TTA---AT----T--AATAAAACA-CAAAAT----ATG--------CAA-CCCC-TTCTCTG---ACAGAGAAGGATTAATCCTTGCC
gi|22487 : aaACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-C-T---TCTCTG---G-GA-GAGAAGGGTTAATC---CT----T----GTCATA---------CC-AATTTTGGAA----------GTATC-TAA---AT----T--GATTAAACA-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCC-TTCTCTG---GTAGAGAAGGATTAATCCTTGTC------------GATTTGA---
gi|22514 : aaatACA-AAAT--AT--A---A-A--AC-C-C-TT--ACTCTG---T-CA-GACAAGGATTAATT---CT----T----GCCATA---------TC-AGATTTGAAA----------GTAGC-TGA---AT----T--AAAAAAACA-CAAAAT----ATG--------AAA-CTTC-TTCTCTG---AGAGAGAAGGATTAATCCTTGCCA
gi|22498 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-C-T---ACACTT---G-CA-GACAAAGATTAATC---CT----T----GCCATA---------TC-ATATTTGAAA----------GTAGC-TTA---AT----T--GATAAAACA-CTAAAT----ATG--------AAA-CCCC-TTCTCAG---AGAGAGAAGGATTTATCCTTGCCa
gi|22494 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--TC-T-C-T---TCTCTG---A-CA-GACAAAGATTAATC---AT----T----GCCATA---------GA-AGCTTTGAAA------------ATC-TAA---CT----T--AATGAAATA-CAAAAT----ATG--------CAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGAAGGGTTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTGG---AAGTATCT
gi|22493 : aaACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-C-T---ATT-TG---G-CA-GAGAAGGAATAATC---CT----C----GCCATA---------TC-GGATTTGAAA----------GTATC-AAT---AT----T--GATTAAACG-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGAATGATTAATCCTTGCC
gi|22485 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-C-T---TCTCTG---A-CA-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GCCATA---------AC-AATTTTGGAA----------GTAGC-TCA---AC----T--GATAAAACA-CAATAT----ATG--------CAA-CCCA-TTCTCTA---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCC-TA------C----TTTGAATGAAATATCT
gi|22510 : aaacACA-AGAT--AT--AC--A-A--CC-C-G-T---ACTCTA---G-CA-GACAAGGATTCATC---CT----T----GCC----------------GACTTTGAA----------TTATC-TAA---TT----T--GATGAAATA-CAAAAT----ATG--------TAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGAAAGATTAATCCTTGCC
gi|22519 : aaacACACAAAT--AT--A---A-AA-CC-C-C-T---ACTCTT---G-CA-GACAAGGATTAATC---CT----T----GCCATA---------TC-AGATTTGGAA----------GTTGC-TTA---AT----T--GATAAAACA-CCAACT----ATG--------AAA-CCCC-TTCTCTG---AGAGAG-AGGATTTAGCCTTGCC
gi|22516 : aACA-AAAT--AT--A---A-A--ACAC-C-T---ACTCTT---G-CA-GACAAGGATTAATC---CT----T----GCCATA---------TC-AGATTTGAAA----------GTAGC-TAA---AT----T--GATAAAAC----AAAT----ATG--------AAA-CCCC-CACTCCT---GTAGAGAA
gi|22484 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-C-T---TCTCTG---G-TA-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GTC----------------GATTTGAAA--------------C-TGA---AT----T--GATCAAACA-CAAAAC----ATG--------CAA-CCCG-TACTCTG---ACAGACAAGGATTAATCCTTGCC------------GACTTTG---AATTATCT
gi|22489 : aaacACA-AAAC--AT--GC--A-A--CC-C-G-T---ACTCTG---A-CA-GACAAGGATTAATC---CT----T----GCC----------------GACTTTGAA----------TTATC-TAA---CT----T--GATGAAATA-CGCAAT----ATA--------CAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGAAGGATTAATCCTTGCC
gi|22518 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--AC-A-T-T---ACTCTG---G-CA-GACAA-------TC---CT----T----GCCATA---------TC-CAATTTGGAT----------GTATA-TAG---AT----T--AATAAA-TA-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCC-TACTCTG---GCTGAGAAGGATTAATCCTGGTC------------GATTTGA---
gi|22503 : aaacACA-AAAT--ATGCA---A-C--CC-C-C-T---TCTCAA---G-GA-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GTCATA---------CC-AATTTTGGAA----------GTATC-TCA---AT----T--GACAAAACA-CAATAT----ATG--------CAA-TCTC-TTCTCTG---ACAGACAAAGATTAATCATTGCCATA------GAAGCTTTGA---
gi|22509 : aaatACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-C-T---TCTCTG---G-GA-GAGAAAGATTAATC---CT----T----GCCA------------T-AG---TGG----------------C-TGA---AT----T--GATAAAACA-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCC-TACTCTA---ATAGAGAAGGATTAATCCTTGCC
gi|22508 : aaatACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-C-T---ACTCTG---G-CT-GAGAAGGATTAATC---CT-------------GG---------TC--GATTTGAAA--------------C-TAA---CT----T--GATAAAACA-CAAGAT----ATA--------CAA-CCCG-TACTCTA---GCAGACAAGGATTCATCCTTGCC------------GACTTTG---AATTATCT
gi|22483 : aaatACA-AAAT--AT--A---A-A--ACGC-C-T---ACTCTT---G-TA-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GTC----------------GATTTGAAA--------------C-TAA---CT----T--GATCAAACA-CAAAAT----ATG--------CAA-CCCG-TACCCGG---GCAGACAAGGATTAATTCTTGCC------------GACTTTG---AATTATCT
gi|22482 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-C-T---ACTCAT---G-TA-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GTT----------------GATTTGAAA--------------C-TAA---CT----T--GTTAAAACA-CAAAAT----ATG--------CAA-CCCG-TACTCGG---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCC------------GACTTTG---AATTATCT
gi|22499 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-A-T---TCTCTA---G-CA-GACAAGGATTAATC---CT----T----GCCTAC---------TT-TGAAT--GAA----------ATATC-TTA---CT----G--GATGAAATA-CAAAAT----ATG--------CAA-CCCCCTTCTCAA---GGAGAGAAGGATTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTGG---AAGTATCT
gi|22490 : aaACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-G-T---ACCCGG---G-CA-GACAAGGATTAATT---CT----T----GCC----------------GACTTTGAA----------TTATC-TAA---CT----G--GATGGAATA-CAAAAT----ATG--------CAA-CCCC-TTCTCTA---GGACAGAAGGATTAATCCTTGCC
gi|22500 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--TC-C-C-T---ACTCTG---G-CA-GACAAGGATTAATC---CT----T----GCCAGA---------TC-AGATTTGGGA----------GTATC-T
gi|22500 : aaacacaaaatatgaaacccttctctgagagaaggattatctttgccatagtaacttaagaaACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-C-T---TCTCTG------A-GAGAAGGATTA-TC---TT----T----GCCA-------------------T---A----------GTAAC-T----------------TAAGAAA-CAAAAT----ATA---------AA-TCCC-TACTCTG---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCCAGA------TCAGATTTGG---GAGTATCT
gi|22506 : aaacATA-AAAT--AT--A---A-A--AA-CAC-T---ACTCTT---G-CG-GACATAGGTTAATT---CT----T----TCCATA---------TT-AGATTTGAAA----------GTAGC-TTA---AT----T--GATAAAACA-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGAAGGATT-ATCTTTGCC
gi|22523 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-A-T---ACTCTT---G-CA-GACAAGGATAAATC---CT----T----GCCATA---------TG-AGATTTGAAA----------GAAGC-TAA---AT----T--GATAAAAT---------------------------CCCC-TTCTTTG---AGAGAGAAGGATTAATCCTTGCC
gi|22517 : ACA-AAAT--AT--A---A-AA-TC-C-T-T---ACTCTG---G-AA-AACAAGGATTTATC---CT----T----TTAATA---------CT-AGATTTGAAA----------ATAGG-TAA---TT----T--GAAAAAACAGCAAAA-----ATG--------AAAGCCCC-T-CTCTG---ATAGAGAAGGATTAATCCTTGTC
gi|22502 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-G-T---ACTCGG---G-CA-GACAAGGATTAATC---CT----T----GCC----------------GACTTTGAA----------TTATC-TAA---CT----T--GATGAAATA-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGATG--TTAA-CCTTGCC
gi|22512 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-A--TC-C-CCT---ACTCTGAGAG--A-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GCC--A---------T-----------A----------GTAGC-TTA---AA----T--GTTAAAACA-CAAAAT----ATA--------AAA-CCCT-TACTCTG---TCAGACAAGGATTAATTCTTGCC
gi|22497 : aaacACT-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-C-T---TCTCAG---A-GA-GAGAAGGATTTATC---CT----T----GCCATA---------GT-AGATT-----------------------A---AT----T--GTTAAAACA-CAAAAT----ATA--------AAA-CGCC-TACTCTT---GTAGAGAAGGATTAATCCTTGTC------------GATTTGA---
gi|22511 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-C-T---ACTCTA---A-TA-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GCC--A---------T-----------A----------ATAGC-TTA---AT----T--GTTAAAACA-CAAAAT----ATA--------AAA-TCCT-TACTCTG---GAAAACAAGGATTTATCCT
gi|22507 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-C-T---TCTCTG---A-GA-GAT----GTTAA-C---CT----T----GCC--A---------T-----------A----------GTAGC-TTG---AT----T--GTTAAAAAA-CGAAAT----ATA---------AA-TTCC-TACTCTG---GCAGACATAGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTGG---GAGTATCTt
gi|22526 : aaatACA-AAAT--AT--G---A-A--TC-C-CCT---ACTCTGAGAG--A-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GCC
gi|22492 : tttggaagtatctcaattgataaaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-T-T---TCTCTGAGAG--A-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GCCA-------------------TAGAA----------G---C-TTA---CT----T--GTTAA--CA-CAAA-T----ATA--------AAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCC
gi|22501 : aaacACC-AACT--ATG-A---A-A--CC-C-C-T---TCTCTG---A-GA-GA-GAGGATTTAGC---CT----T----GCCATA---------GT-AGA-------------------AT----A---AT----T--GTTAAAACA-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCC-TACTCAT---GTAGAGAAGGATTAATCCTTGTT------------GATTTGA---
gi|22521 : aaacACA-CAAT--AT--A---ATA--CC-C-T-T---ACTCTG---G-GT-GAGAAGGATTAATT---CT----T----GTCATT---------CC-AGATTTAAAA----------GTAGC-TAA---AT----T--GATAAA--A-CAAAAT----ATG--------AAA-CACC-TAC
gi|22515 : acACA-AAAT--ATG-A---A-A--CT-T-C-T---TCTCTG---A-GA-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GCCA----------------------AA----------GTAGC-TTA---AT----T--GTTTAAACA-CAAAAT----ATG--------AAA-ACAT-TACTCTG---GCAGA-------CAATCCTTGCC
gi|22520 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-C-T---TCTCTA---G-GA-CAGAAGGATTAATC---CT----T----GCC--A---------T-----------A----------GTAGC-TTA---AT----T--GTTAAAACA-TAAAAT----ATA--------AAA-ACAC-TACTCTT---GCGGACATAGGTTAATTCT
gi|22505 : aatCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-C-T---TCTCTG---G-CA-GAGAATGATTAATC---CT----T----GGCACA---------TC-AGATTTGAAA----------GTGGC-TAA---AT----A--ATTAATACA-CACAAT----ATA--------ATA-CCCT-TACTCTG---GGTGAGAAGGATTAATTCTTGTCttcc
gi|22491 : aaacgCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-C-T---TCTCTG---G-CA-GAGAATGATTAATC---CT----T----GCC--A---------T-----------A----------GTAGC-TTA---AT----T--GCTAAAACA-CAAAAT----ATA---------AA-CCCC-TACACTT---GCAGACAAAGATTAATCCTTGCC
gi|22524 : aaacgA-AAAT--AT--GC--A-A--TC-C-C-T---ATTCTG---G-CA-GAAAAGGATTAATC---CT----T----GCTATG---------TG-CGATTTGGAA----------GTATC-TTA---AT----T--GATAAAACA-CAATAT----ATG--------CAA-CCCC-TTCTCTG---GCGGACAACGATTAATCCTTGCCATA------TCAAATTTGG---ATGTATCT
gi|22513 : A-AAAT--GA--A---A-G--CC-C-C-T----CTCTG---A-TA-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GTCATAGTAGCT---TC-AGATTTGAAA----------GTAGC-TAA---AT----T----------A-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCA-TACTCTT---GCAGACAAGGATAAATCCTTGCC
gi|22527 : aaacagcaA-AAAT--AT--GC--A-A--TC-C-C-T---ATTCTG---G-CA-GAAAAGGATTAATC---CT----T----GCTATG---------TG-CGATTTGGAA----------GTATC-T
gi|22525 : ttaaaactaaaattaagatagaatct-AAATTGAT--A---A-AATCC-C-C-T---TCTTTG---A-GA-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GCCA-------------------T---A----------GTAGC-TTA---AT----T--GTTAAAACA-CAAAAT----ATA--------AAA-CACC-TACTCTT---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCC
gi|22486 : AAT--AT--A---G-A--TA-C-T-TTCAAATCCG---A-TATGGCGAGGATTAATC---CTTCTCT----GCCAGA---------
gi|22496 : aaacacaaaatatgtaacccctacAAT--AT--AC--A-A--CC-C-C-T---TCTCTG---G-GA-GAGAAGGATTAATC---CT----T----GCC--A---------T-----------A----------GTAGC-TTA---AT----T--ATTAAAACA-CAAAAT----ATA---------AA-CCCC-TACTCTT---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCCgataaaacgcaaaatatgaaaccccttctctggcagagaatgattaatccttg
gi|22519 : aaatacgc--A---A-C--TT-C-C-A---AATCTG---A-TATGGCAAGGATTAATC---CT----T----GTC
gi|22500 : aacacaaatataaaacccctactcttgca--TC-C-C-A---AATCTG---ATCT-GGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCTG----------CC-AGAGTAGGGATTTATATTTTGTTTCTTAA---GT----T--ACTATGGCA--AAGA----------------TAA-TCCT-T-CTCT-----CAGAGAAGGGTTgcttaattgataaaacaccaactatgaaaccccttctctgagagagaggatttagccttgcc
gi|22496 : aaacacaaaatatga-C-T---ACTATG---G-CA-----AGGATTAATC---CT----T----gtatct
gi|22491 : aaatacgcaatatacaaccccttctctgggagag-C-T---ACTATG---G-CA-----AGGATTAATCATTCTC---T----GCCAGA---------cttaattattaaaacacaaaatataaacccctactcttgcagacaaggattaatccttgcc
gi|22513 : aaacgcaaaatatgaaaccccttc-C-T---ACTATG---------ACAAGGATTAATC---CT----T-----CTCTA---------TC-AGActtaattgctaaaacacaaaatataaacccctacacttgcagacaaagattaatccttgcc
gi|22512 : aaacagcaaaaatgaaagcccctc-C-T---ACTATG---G-CA-----AGGATTAATC---CT----T----cttcagatttgaaagtagctaaattacaaaatatgaaacccatactcttgcagacaaggataaatccttgcc
gi|22525 : aaacacaaaatatgaatcccctactctgagagagag-C-T---ACTATG---G-CA-----AGGATTAATC---CT----T----cttaaatgttaaaacacaaaatataaaacccttactctgtcagacaaggattaattcttgcc
gi|22515 : aaattgataaaatccccttctttgagagag-C-T---ACTTTG---G-CA-----AGGATTAATC---CT----T----cttaattgttaaaacacaaaatataaaacacctactcttgcagacaaggattaatccttgcc
gi|22520 : aaacacaaaatatgaaacttcttctctgagagag-C-T---ACTATG---G-CA-----AGGATTAATC---CT----T----cttaattgtttaaacacaaaatatgaaaacattactctggcagacaatccttgcc
gi|22488 : aatacaaaatatgcaaccccttctctaggacagTCTG---A-TATGGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCcttaattgttaaaacataaaatataaaaacactactcttgcggacataggttaattctttcc
gi|22514 : aaacacaaaatataaacccctactcttgcaTCTG---A-TATGGCAAGAATTAATC---CT----T----GTCTGA----------C-AGAtttgaaagtagctaaattgataaaacacaaaatatgaaaccctttctctgagagagagaaggattaatccttgcc
gi|22516 : aaacacaaaatataaaacccttacTCTG---A-TATGGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCtttgaaagtagctgaattaaaaaaacacaaaatatgaaacttcttctctgagagagaaggattaatccttgccaa
gi|22521 : aaacacaaaatataaaacacctactcttgcaTCTG---G-AATGACAAGAATTAATC---CT----T----CTCA-C---------CC-AGAGTAAGG-----------GTAT--TAT---AT----T--Gtttgaaagtagctaaattgataaaacaaatatgaaacccccactcctgtagagaa
gi|22503 : acacaTG---G-TATGACAAGGATTAATC---CT----T----tttaaaagtagctaaattgataaaacaaaatatgaaacacctac
gi|22485 : aaatacaaaatatgcaacccccttctcaaggagag---G-TA-GGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCattttggaagtatctcaattgacaaaacacaatatatgcaatctcttctctgacagacaaagattaatcattgccatagaagctttgaa
gi|22499 : aaacacaaaatatgcaaccccttctctgacagagaaggattaatccttgccataacaattttggaagtagctcaactgataaaacacaatatatgcaacccattctctagca---G-TA-GGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCtttgaatgaaatatct
gi|22487 : aaacacaatatatgcaacccattctctagca-GACAAGGATTAATC---CT----TCTCTACCAGAGAAGGGGTTTC-ATATTTTG-------------TGTT-TAATCAAT----TTAGATACTTC--CAAAATTGGTATGACAAGGATTAA-CCCT-T-CTCTC---CCAGAGAAGGtttgaatgaaatatcttactggatgaaatacaaaatatgcaacccccttctcaaggagagaaggattaatccttgtcataccaattttggaagtatct
gi|22484 : aaatacaaaatatgcaacc-GGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCTG----------TC-AGAgatttgaa
gi|22489 : aaacacaaaatatgaaaccccttctctggtagagaaggattaatccttgtcgatttgaaactgaattgatcaaacacaaaacatgcaacccgtac-GGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCTG----------TC-AGAgactttgaattatct
gi|22518 : aaacacaaaacatgcaacccgtac-GACCAGGATTAATC---CT----T----CTCAG----------CC-AGAGTAGGGgactttgaattatctaacttgatgaaatacgcaatatacaaccccttctctgggagagaaggattaatccttgcc
gi|22508 : aaacacaaaatatgaaaacattactctggcagacaatccttgccatatccaatttggatgtatatagattaataaatacaaaatatgaaac-GACCAGGATTAATC---CT----T----CTCAG----------CC-AGAGTAGGGgatttgaa
gi|22483 : aaatacaaaatatgaaac-GACAAGGATTAATC---CT----T----gatttgaaactaacttgataaaacacaagatatacaacccgtactctagcagacaaggattcatccttgccgactttgaattatct
gi|22482 : aaacacaaaatataaaacgcctactcttgtagag-GGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCgatttgaaactaacttgatcaaacacaaaatatgcaacccgtacccgggcagacaaggattaattcttgccgactttgaattatct
gi|22496 : aaacacaaaatatgaaacccctactcatgtagagaaggattaatccttgttgatttgaaactaacttgttaaaacacaaaatatgcaacccgtactcgggca-GGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCgactttgaattatct
gi|22517 : aaatacgcaatatacaaccccttctctgggagagaaggattaatccttgccatagtagcttaattattaaaacacaaaatataaacccctactcttgca-GACAAGGATTAATC---CT----T-----CTCTA---------TC-AGA
gi|22502 : aaacacaaaatataaaatccttactctggaaaacaaggatttatccttttaatactagatttgaaaataggtaatttgaaaaaacagcaaaaatgaaagcccctc-GGCAAGGATTAATC---CT----T----GTC
gi|22512 : aaacacaaaatatgcaacccgtactcgggca-GGCAAGAATTAATC---CT----T----GTCTGA----------C-AGAGTAAGG-----------GT-TT-TAT---ATTTTGT--GTTTTAAC------------ATT--------TAA---GC-TACTATG---GC----AAGGATTAATCCTgactttgaattatctaacttgatgaaatacaaaatatgaaacccttctctgagagatgttaaccttgcc
gi|22497 : aaacacaaaatatgaatcccctactctgagagagaga-GACAAGGATTAATC---CT----T----
gi|22525 : aaacactaaatatgaaaccccttctcagagagagaaggatttatccttgccatagtagattaattgttaaaacacaaaatataaaacgcctactcttgtagag-GGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCTG-----------C-AAGAGTAGGT----------GT-TT-TAT---ATTTTGT--GTTTTAAC-----AAT---------------TAA---GC-TACTATG---GC----AAGGATTAATCCTgatttgaa
gi|22492 : aaattgataaaatccccttctttgagagaga-GGCAAGGATTAATC---CT----T----GTCTG-----------CAAGAGTAGGG-----------GT-TT-TAT---ATTTG-T--GTTA----A-CAA---------G--------TAAGCTTC-TA---TG---GC----AAGGATTAATCCT
gi|22524 : aaacacaaaatatgaaaccctttctctgagagagagaCAAGGATTAATC---CTTTTCT----GCCAGA---------
gi|22527 : aaaatatgcaatccctatCAAGGATTAATC---CTTTTCT----GCCAGA---------ctatgtgcgatttggaagtatcttaattgataaaacacaatatatgcaaccccttctctggcggacaacgattaatccttgccatatcaaatttggatgtatct
gi|22526 : ttaaaactaaaattaagatagaatctaaaatatgcaatccctatTTTGGAA----------GTATC-TCA---AT----T--GATAAAACA-CAAAAT----ATG--------AAT-CCCC-TACTCTGAGAG-AGAGAAGGATTAATCCTTGCCctatgtgcgatttggaagtatct
gi|22527 : AA---AT----TAAGATAGAATC-TAAAAT----ATG--------CAA-TCCC-TATTCTG---GCAGAAAAGGATTAATCCTTGCTATG------TGCGATTTGG---AAGTATCT
gi|22504 : ttaaaactaAAAAA-CGAAAT----ATA---------AA-TTCC-TACTCTG---GCAGACATAGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTGG---GAGTATCT
gi|22488 : AAACA-CAAAAT----ATA---------AA-CCCC-TACTCTT---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTGA---AAGTAGCTaaattgataaaacacaaaatatgtaacccctatttggcagagaaggaataatcctcgcc
gi|22486 : AAACA-CAAAAT----ATG--------TAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGAAGGATTAATCCTCGCCATA------TCGGATTTGA---AAGTATCTaaattgataaaacacaaaatatgaaaccctttctctgagagagagaaggattaatccttgcc
gi|22495 : AAACA-CAATAT----ATG--------CAA-CCCC-TTCTCTG---GCGGACAACGATTAATCCTTGCCATA------TCAAATTTGG---ATGTATCTatattgataaaacgcaaaatatgaaaccccttctctggcagagaatgattaatccttg
gi|22514 : AAACA-CAAAAT----ATA--------AAA-CCCT-TACTCTG---TCAGACAAGGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTGA---AAGTAGCTtaattaataaaacacaaaatatgcaaccccttctctgacagagaaggattaatccttgcc
gi|22498 : AAACA-CAAAAT----ATA---------AA-CCCC-TACACTT---GCAGACAAAGATTAATCCTTGCCATA------TCATATTTGA---AAGTAGCTgaattaaaaaaacacaaaatatgaaacttcttctctgagagagaaggattaatccttgccaa
gi|22493 : AAACA-CAAAAT----ATG--------TAA-CCCC-TATT-TG---GCAGAGAAGGAATAATCCTCGCCATA------TCGGATTTGA---AAGTATCtaattgataaaacactaaatatgaaaccccttctcagagagagaaggatttatccttgcc
gi|22510 : AAACA-CAAGAT----ATA--------CAA-CCCG-TACTCTA---GCAGACAAGGATTCATCCTTGCC------------GACTTTG---AATTATCTaatattgattaaacgcaaaatatgaaaccccttctctggcagagaatgattaatccttgcc
gi|22516 : AAACA-CAAAAT----ATA--------AAA-CACC-TACTCTT---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTGA---AAGTAGCTaatttgatgaaatacaaaatatgtaaccccttctctgggagagaaagattaatccttgcc
gi|22489 : AAACA-CAAAAC----ATG--------CAA-CCCG-TACTCTG---ACAGACAAGGATTAATCCTTGCC------------GACTTTG---AATTATCTaaattgataaaacaaatatgaaacccccactcctgtagagaa
gi|22490 : AAACA-CAAAAT----ATG--------CAA-CCCG-TACCCGG---GCAGACAAGGATTAATTCTTGCC------------GACTTTG---AATTATCTaacttgatgaaatacgcaatatacaaccccttctctgggagagaaggattaatccttgcc
gi|22506 : AAACA-TAAAAT----ATA--------AAA-ACAC-TACTCTT---GCGGACATAGGTTAATTCTTTCCATA------TTAGATTTGA---AAGTAGCTaactggatggaatacaaaatatgcaaccccttctctaggacagaaggattaatccttgcc
gi|22505 : AAACG-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGAATGATTAATCCTTGGCACA------TCAGATTTGA---AAGTtaattgataaaacacaaaatatgaaacccttctctgagagaaggattatctttgcc
gi|22517 : AAACA-CAAAAT----ATA--------AAA-TCCT-TACTCTG---GAAAACAAGGATTTATCCTTTTAATA------CTAGATTTGA---AAATAggctaaataattaatacacacaatataatacccttactctgggtgagaaggattaattcttgtc
gi|22513 : AAACAGCAAAA-----ATG--------AAAGCCCC-T-CTCTG---ATAGAGAAGGATTAATCCTTGTCATAGTAGCTTCAGATTTGA---AAGTAGCTggtaatttgaaaaaacagcaaaaatgaaagcccctctctgatagagaaggattaatccttgtc
gi|22502 : AAACA-CAAAAT----ATG--------CAA-CCCG-TACTCGG---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCC------------GACTTTG---AATTATCTaaattacaaaatatgaaacccatactcttgcagacaaggataaatccttgcc
gi|22519 : AACA-CAAA-T----ATA--------AAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTGG---AAGTaacttgatgaaatacaaaatatgaaacccttctctgagagatgttaaccttgcc
gi|22521 : ACA-CACAAT----ATA--------ATA-CCCT-TACTCTG---GGTGAGAAGGATTAATTCTTGTCATT------CCAGATTTAA---AAGTAGCTtgcttaattgataaaacaccaactatgaaaccccttctctgagagagaggatttagccttgcc
gi|22523 : A-CAAAAT----ATG--------AAA-CCCA-TACTCTT---GCAGACAAGGATAAATCCTTGCCATA------TGAGATTTGA---AAGaaattgataaaacaaaatatgaaacacctac
gi|22496 : C-TACTATG---GCA----AGGATTAATCCTaagctaaattgataaaatccccttctttgagagagaaggattaatccttgcc
gi|22515 : aaatacgcaatatacaaccccttctctgggagagaC-TACTTTG---GCA----AGGATTAATCCTcttaattattaaaacacaaaatataaacccctactcttgcagacaaggattaatccttgcc
gi|22520 : aaacacaaaatatgaaacttcttctctgagagagaC-TACTATG---GCA----AGGATTAATCCTcttaattgtttaaacacaaaatatgaaaacattactctggcagacaatccttgcc
Alignments
lowQualScore : 222222 2222222222 333333
lowQualScore : 0 11 333333 0 44 1 0 3 333 1 5 1 2222222222 4444 3 4 0 11 0 0 0 3 333 1 0 0 777777 444
lowQualScore : . .. ...... . .. . . . ... . . . .......... .... . . . .. . . . . ... . . . ...... ...
lowQualScore : 9 22 333333 9 99 8 9 3 222 5 1 0 5555555555 3333 1 1 9 22 9 9 9 8 111 6 9 9 999999 444
consensus : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGAAGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTAGCTNAA-TT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA-CAGATTTG---GAAGTATCT
Reference ( family-512 ) : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACTCTG---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTANCTAAA-TT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATATCAGATTTG---GAAGTATCT
gi|22482 : ACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCAT---GTAGAGAAGGATTAATCCTTGTT------------GATTTG---AAA----CTAAC-TT--GTTAAAACA-CAAAATATGCAA-CCCG-TACTCGG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC------GACTTT---GAATTATCT
gi|22483 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--ACGC-CTACTCTT---GTAGAGAAGGATTAATCCTTGTC------------GATTTG---AAA----CTAAC-TT--GATCAAACA-CAAAATATGCAA-CCCG-TACCCGG---GCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC------GACTTT---GAATTATCT
gi|22484 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GTAGAGAAGGATTAATCCTTGTC------------GATTTG---AAA----CTGAA-TT--GATCAAACA-CAAAACATGCAA-CCCG-TACTCTG---ACAGACA-AGGATTAATCCTTGCC------GACTTT---GAATTATCT
gi|22485 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---ACAGAGAAGGATTAATCCTTGCCATA------ACAATTTTG---GAAGTAGCTCAA-CT--GATAAAACA-CAATATATGCAA-CCCA-TTCTCTA---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC-TAC----TTTGAATGAAATATCT
gi|22486 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTACTCTG---GCAGAGAAGGATTAATCCTCGCCATA------TCGGATTTG---AAAGTATCTATA-TT--GATAAAACG-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTG
gi|22487 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGAAGGGTTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTG---GAAGTATCTAAA-TT--GATTAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC------GATTTG---AA
gi|22488 : aaatACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACTCTT---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTAAA-TT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCT-TTCTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22489 : aaacACA-AAAC--AT--GC--A-A--CC-C-GTACTCTG---ACAGACAAGGATTAATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAAC-TT--GATGAAATA-CGCAATATACAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22490 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-GTACCCGG---GCAGACAAGGATTAATTCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAAC-TG--GATGGAATA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTA---GGACAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22491 : aaacCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GCAGAGAATGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAA-TT--GCTAAAACA-CAAAATAT-AAA-CCCC-TACACTT---GCAGACA-AAGATTAATCCTTGCC
gi|22492 : aaacgACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-TTTCTCTGAGAG-AGAGAAGGATTAATCCTTGCCATA------------------GAAG---CTTAC-TT--GTTAA--CA-CAAA-TATAAAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22493 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTATT-TG---GCAGAGAAGGAATAATCCTCGCCATA------TCGGATTTG---AAAGTATCAATA-TT--GATTAAACG-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGCC
gi|22494 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--TC-T-CTTCTCTG---ACAGACAAAGATTAATCATTGCCATA------GAAGCTTTG---AAA--ATCTAAC-TT--AATGAAATA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AGGGTTAATCCTTGTCATACCAATTTTG---GAAGTATCT
gi|22495 : aaACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-CTTCTCTG---GCGGACAACGATTAATCCTTGCCATA------TCAAATTTG---GATGTATCTTAA-TT--AATAAAACA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---ACAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22496 : aaAAT--AT--AC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGAAGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAA-TT--ATTAAAACA-CAAAATAT-AAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22497 : aaatacgcACT-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCAG---AGAGAGAAGGATTTATCCTTGCCATA------GTAGATT---------------AA-TT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CGCC-TACTCTT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC------GATTTG---AA
gi|22498 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACACTT---GCAGACAAAGATTAATCCTTGCCATA------TCATATTTG---AAAGTAGCTTAA-TT--GATAAAACA-CTAAATATGAAA-CCCC-TTCTCAG---AGAGAGA-AGGATTTATCCTTGCC
gi|22499 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-ATTCTCTA---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCC-TA------C----TTTGAATGAAATATCTTAC-TG--GATGAAATA-CAAAATATGCAA-CCCCCTTCTCAA---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCATACCAATTTTG---GAAGTATCT
gi|22500 : aaACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-CTTCTCTG-----AGAGAAGGATTA-TCTTTGCCATA---------------------GTAACT----------TAAGAAA-CAAAATAT-AAA-TCCC-TACTCTG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCAGATCAGATTTG---GGAGTATCT
gi|22501 : aaacACC-AACT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---AGAGA-GAGGATTTAGCCTTGCCATA------GTAGAAT---------------AA-TT--GTTAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCAT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTG
gi|22502 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-GTACTCGG---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAAC-TT--GATGAAATA-CAAAATATGAAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGA-TG--TTAA-CCTTGCCttgatttgaa
gi|22503 : aaacACA-AAAT--ATGCA---A-C--CC-C-CTTCTCAA---GGAGAGAAGGATTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTG---GAAGTATCTCAA-TT--GACAAAACA-CAATATATGCAA-TCTC-TTCTCTG---ACAGACA-AAGATTAATCATTGCCATAGAAGCTTTG---AA
gi|22504 : aaatACG-AAAT--AT--A---A-A--TT-C-CTACTCTG---GCAGACATAGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTG---GGAGTATCTAAA-TT--GATAAAACA-CAAAATATGTAA-CCCC-TA-TTTG---GCAGAGA-AGGAATAATCCTCGCC
gi|22505 : aaaaCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GCAGAGAATGATTAATCCTTGGCACA------TCAGATTTG---AAAGTGGCTAAA-TA--ATTAATACA-CACAATATAATA-CCCT-TACTCTG---GGTGAGA-AGGATTAATTCTTGTC
gi|22506 : aaacgATA-AAAT--AT--A---A-A--AA-CACTACTCTT---GCGGACATAGGTTAATTCTTTCCATA------TTAGATTTG---AAAGTAGCTTAA-TT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGA-AGGATT-ATCTTTGCC
gi|22507 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-CTTCTCTG---AGAGATG----TTAA-CCTTGCCATA---------------------GTAGCTTGA-TT--GTTAAAAAA-CGAAATAT-AAA-TTCC-TACTCTG---GCAGACA-TAGATTAATTCTTGCCATATCAGATTTG---GGAGTATCT
gi|22508 : aaatACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCTG---GCTGAGAAGGATTAATCCTGGTC------------GATTTG---AAA----CTAAC-TT--GATAAAACA-CAAGATATACAA-CCCG-TACTCTA---GCAGACA-AGGATTCATCCTTGCC------GACTTT---GAATTATCT
gi|22509 : aaatACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGAAAGATTAATCCTTGCCATA---------------------GTGGCTGAA-TT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTA---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22510 : aaatACA-AGAT--AT--AC--A-A--CC-C-GTACTCTA---GCAGACAAGGATTCATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAAT-TT--GATGAAATA-CAAAATATGTAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AAGATTAATCCTTGCC
gi|22511 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCTA---ATAGAGAAGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AATAGCTTAA-TT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-TCCT-TACTCTG---GAAAACA-AGGATTTATCCTT
gi|22512 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-AT-CC-C-CTACTCTGAGAG-AGAGAAGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAA-AT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CCCT-TACTCTG---TCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC
gi|22513 : aaacA-AAAT--GA--A---A-G--CC-C-CT-CTCTG---ATAGAGAAGGATTAATCCTTGTCATAGTAGCTTCAGATTTG---AAAGTAGCTAAA-TT----------A-CAAAATATGAAA-CCCA-TACTCTT---GCAGACA-AGGATAAATCCTTGCC
gi|22514 : aaacagcaACA-AAAT--AT--A---A-AA-CC-C-TTACTCTG---TCAGACAAGGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTGAA-TT--AAAAAAACA-CAAAATATGAAA-CTTC-TTCTCTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA
gi|22515 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CT-T-CTTCTCTG---AGAGAGAAGGATTAATCCTTGCCA---------------------AAGTAGCTTAA-TT--GTTTAAACA-CAAAATATGAAA-ACAT-TACTCTG---GCAGA--------CAATCCTTGCCa
gi|22516 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--ACAC-CTACTCTT---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTAAA-TT--GATAAAAC----AAATATGAAA-CCCC-CACTCCT---GTAGAGA-A
gi|22517 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-AA-TC-C-TTACTCTG---GAAAACAAGGATTTATCCTTTTAATA------CTAGATTTG---AAAATAGGTAAT-TT--GAAAAAACAGCAAAA-ATGAAAGCCCC-T-CTCTG---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC
gi|22518 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--AC-A-TTACTCTG---GCAGACAA-------TCCTTGCCATA------TCCAATTTG---GATGTATATAGA-TT--AATAAA-TA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCTGAGA-AGGATTAATCCTGGTC------GATTTG---AA
gi|22519 : aaacACACAAAT--AT--A---A-AA-CC-C-CTACTCTT---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTTGCTTAA-TT--GATAAAACA-CCAACTATGAAA-CCCC-TTCTCTG-----AGAGAGAGGATTTAGCCTTGCC
gi|22520 : aACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTA---GGACAGAAGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAA-TT--GTTAAAACA-TAAAATATAAAA-ACAC-TACTCTT---GCGGACA-TAGGTTAATTCTTTCC
gi|22521 : aatACA-CAAT--AT--A---ATA--CC-C-TTACTCTG---GGTGAGAAGGATTAATTCTTGTCATT------CCAGATTTA---AAAGTAGCTAAA-TT--GATAAA--A-CAAAATATGAAA-CACC-TAC
gi|22522 : acACA-AAAT--AT--A---A-A--TC-C-CTACTCTG---GCAGACAAGGATTAATCCTTGCCAGA------TCAGATTTG---GGAGTATCTAAA-TT--GATAAAACA-CAAAATATGTAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTCGCCATATCGGATTTG---AAAGTATCT
gi|22523 : ACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-ATACTCTT---GCAGACAAGGATAAATCCTTGCCATA------TGAGATTTG---AAAGAAGCTAAA-TT--GATAAAAT---------------CCCC-TTCTTTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22524 : A-AAAT--AT--GC--A-A--TC-C-CTATTCTG---GCAGAAAAGGATTAATCCTTGCTATG------TGCGATTTG---GAAGTATCTTAA-TT--GATAAAACA-CAATATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---GCGGACA-ACGATTAATCCTTGCCATATCAAATTTG---GATGTATCT
gi|22525 : -AAATTGAT--A---A-AATCC-C-CTTCTTTG---AGAGAGAAGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAA-TT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CACC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22526 : TTTG---GAAGTATCTCAA-TT--GATAAAACA-CAAAATATGAAT-CCCC-TACTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22527 : AACTAAAATTAAGATAGAATC-TAAAATATGCAA-TCCC-TATTCTG---GCAGAAA-AGGATTAATCCTTGCTATGTGCGATTTG---GAAGTATCT
Alignments
lowQualScore : 222222 222222222222 4444444
lowQualScore : 0 11 333333 0 44 1 0 1 333 1 1 0 1 888888888888 4444 2 1 11 0 0 0 3 333 1 0 0 8888888 4 444
lowQualScore : . .. ...... . .. . . . ... . . . . ............ .... . . .. . . . . ... . . . ....... . ...
lowQualScore : 9 22 333333 9 99 8 9 9 222 5 2 9 0 000000000000 3333 0 9 22 9 9 9 8 111 6 9 9 1111111 7 111
consensus : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTAGCTNAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA-C--GA-TTTG---GAAGTATCT
Reference ( family-512 ) : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTAGCTNAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA-CA-GA-TTTG---GAAGTATCT
gi|22482 : ACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCAT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTT------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GTTAAAACA-CAAAATATGCAA-CCCG-TACTCGG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC-------GA-CTTT---GAATTATCT
gi|22483 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--ACGC-CTACTCTT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GATCAAACA-CAAAATATGCAA-CCCG-TACCCGG---GCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC-------GA-CTTT---GAATTATCT
gi|22484 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC------------GATTTG---AAA----CTGAATT--GATCAAACA-CAAAACATGCAA-CCCG-TACTCTG---ACAGACA-AGGATTAATCCTTGCC-------GA-CTTT---GAATTATCT
gi|22485 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---ACAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------ACAATTTTG---GAAGTAGCTCAACT--GATAAAACA-CAATATATGCAA-CCCA-TTCTCTA---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC-TA-C-----TTTGAATGAAATATCT
gi|22486 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTCGCCATA------TCGGATTTG---AAAGTATCTATATT--GATAAAACG-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTG
gi|22487 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AGGGTTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTG---GAAGTATCTAAATT--GATTAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC-------GA-TTTG---AA
gi|22488 : aaatACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCT-TTCTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22489 : aaacACA-AAAC--AT--GC--A-A--CC-C-GTACTCTG---ACAGACA-AGGATTAATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTT--GATGAAATA-CGCAATATACAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22490 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-GTACCCGG---GCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTG--GATGGAATA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTA---GGACAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22491 : aaacCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GCTAAAACA-CAAAATAT-AAA-CCCC-TACACTT---GCAGACA-AAGATTAATCCTTGCC
gi|22492 : aaacgACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-TTTCTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------------------GAAG---CTTACTT--GTTAA--CA-CAAA-TATAAAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22493 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTATT-TG---GCAGAGA-AGGAATAATCCTCGCCATA------TCGGATTTG---AAAGTATCAATATT--GATTAAACG-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGCC
gi|22494 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--TC-T-CTTCTCTG---ACAGACA-AAGATTAATCATTGCCATA------GAAGCTTTG---AAAAT--CTAACTT--AATGAAATA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AGGGTTAATCCTTGTCATA-CC-AATTTTG---GAAGTATCT
gi|22495 : aaACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-CTTCTCTG---GCGGACA-ACGATTAATCCTTGCCATA------TCAAATTTG---GATGTATCTTAATT--AATAAAACA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---ACAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22496 : aaAAT--AT--AC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--ATTAAAACA-CAAAATAT-AAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22497 : aaatacgcACT-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCAG---AGAGAGA-AGGATTTATCCTTGCCAT---------------------AGTAGATTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CGCC-TACTCTT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC-------GA-TTTG---AA
gi|22498 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACACTT---GCAGACA-AAGATTAATCCTTGCCATA------TCATATTTG---AAAGTAGCTTAATT--GATAAAACA-CTAAATATGAAA-CCCC-TTCTCAG---AGAGAGA-AGGATTTATCCTTGCC
gi|22499 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-ATTCTCTA---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC-TA------C----TTTGAATGAAATATCTTACTG--GATGAAATA-CAAAATATGCAA-CCCCCTTCTCAA---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCATA-CC-AATTTTG---GAAGTATCT
gi|22500 : aaACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-CTTCTCTG-----AGAGA-AGGATTA-TCTTTGCCATA---------------------GTAACT---------TAAGAAA-CAAAATAT-AAA-TCCC-TACTCTG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCAGATCA-GA-TTTG---GGAGTATCT
gi|22501 : aaacACC-AACT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG-----AGAGAGAGGATTTAGCCTTGCCAT---------------------AGTAGAATAATT--GTTAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCAT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTT-------GA-TTTG---AA
gi|22502 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-GTACTCGG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTT--GATGAAATA-CAAAATATGAAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGA-TG--TTAA-CCTTGCC
gi|22503 : aaacACA-AAAT--ATGCA---A-C--CC-C-CTTCTCAA---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTG---GAAGTATCTCAATT--GACAAAACA-CAATATATGCAA-TCTC-TTCTCTG---ACAGACA-AAGATTAATCATTGCCATA-GA-AG-CTTT---GAA
gi|22504 : aaatACG-AAAT--AT--A---A-A--TT-C-CTACTCTG---GCAGACA-TAGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTG---GGAGTATCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGTAA-CCCC-TA-TTTG---GCAGAGA-AGGAATAATCCTCGCC
gi|22505 : aaaaCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGGCACA------TCAGATTTG---AAAGTGGCTAAATA--ATTAATACA-CACAATATAATA-CCCT-TACTCTG---GGTGAGA-AGGATTAATTCTTGTC
gi|22506 : aaacgATA-AAAT--AT--A---A-A--AA-CACTACTCTT---GCGGACA-TAGGTTAATTCTTTCCATA------TTAGATTTG---AAAGTAGCTTAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGA-AGGATT-ATCTTTGCC
gi|22507 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-CTTCTCTG-----AGAGA-TG--TTAA-CCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTGATT--GTTAAAAAA-CGAAATAT-AAA-TTCC-TACTCTG---GCAGACA-TAGATTAATTCTTGCCATATCA-GA-TTTG---GGAGTATCT
gi|22508 : aaatACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCTG---GCTGAGA-AGGATTAATCCTGGTC------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GATAAAACA-CAAGATATACAA-CCCG-TACTCTA---GCAGACA-AGGATTCATCCTTGCC-------GA-CTTT---GAATTATCT
gi|22509 : aaatACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AAGATTAATCCTTGCCATA---------------------GTGGCTGAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTA---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22510 : aaatACA-AGAT--AT--AC--A-A--CC-C-GTACTCTA---GCAGACA-AGGATTCATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAATTT--GATGAAATA-CAAAATATGTAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AAGATTAATCCTTGCC
gi|22511 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCTA---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AATAGCTTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-TCCT-TACTCTG---GAAAACA-AGGATTTATCCTT
gi|22512 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-AT-CC-C-CTACTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAAAT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CCCT-TACTCTG---TCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC
gi|22513 : aaacA-AAAT--GA--A---A-G--CC-C-CT-CTCTG---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCATAGTAGCTTCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT----------A-CAAAATATGAAA-CCCA-TACTCTT---GCAGACA-AGGATAAATCCTTGCC
gi|22514 : aaacagcaACA-AAAT--AT--A---A-AA-CC-C-TTACTCTG---TCAGACA-AGGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTGAATT--AAAAAAACA-CAAAATATGAAA-CTTC-TTCTCTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA
gi|22515 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CT-T-CTTCTCTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA---------------------AAGTAGCTTAATT--GTTTAAACA-CAAAATATGAAA-ACAT-TACTCTG---GCAGA--------CAATCCTTGCCa
gi|22516 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--ACAC-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT--GATAAAAC----AAATATGAAA-CCCC-CACTCCT---GTAGAGA-A
gi|22517 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-AA-TC-C-TTACTCTG---GAAAACA-AGGATTTATCCTTTTAATA------CTAGATTTG---AAAATAGGTAATTT--GAAAAAACAGCAAAA-ATGAAAGCCCC-T-CTCTG---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC
gi|22518 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--AC-A-TTACTCTG---GCAGA--------CAATCCTTGCCATA------TCCAATTTG---GATGTATATAGATT--AATAAA-TA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCTGAGA-AGGATTAATCCTGGTC-------GA-TTTG---AA
gi|22519 : aaacACACAAAT--AT--A---A-AA-CC-C-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTTGCTTAATT--GATAAAACA-CCAACTATGAAA-CCCC-TTCTCTG-----AGAGAGAGGATTTAGCCTTGCC
gi|22520 : aACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTA---GGACAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GTTAAAACA-TAAAATATAAAA-ACAC-TACTCTT---GCGGACA-TAGGTTAATTCTTTCC
gi|22521 : aatACA-CAAT--AT--A---ATA--CC-C-TTACTCTG---GGTGAGA-AGGATTAATTCTTGTCATT------CCAGATTTA---AAAGTAGCTAAATT--GATAAA--A-CAAAATATGAAA-CACC-TAC
gi|22522 : acACA-AAAT--AT--A---A-A--TC-C-CTACTCTG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCAGA------TCAGATTTG---GGAGTATCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGTAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTCGCCATATCG-GA-TTTG---AAAGTATCT
gi|22523 : ACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-ATACTCTT---GCAGACA-AGGATAAATCCTTGCCATA------TGAGATTTG---AAAGAAGCTAAATT--GATAAAAT---------------CCCC-TTCTTTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22524 : A-AAAT--AT--GC--A-A--TC-C-CTATTCTG---GCAGAAA-AGGATTAATCCTTGCTATG------TGCGATTTG---GAAGTATCTTAATT--GATAAAACA-CAATATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---GCGGACA-ACGATTAATCCTTGCCATATCA-AA-TTTG---GATGTATCT
gi|22525 : -AAATTGAT--A---A-AATCC-C-CTTCTTTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CACC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22526 : TTTG---GAAGTATCTCAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAT-CCCC-TACTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22527 : AATTAAGATAGAATC-TAAAATATGCAA-TCCC-TATTCTG---GCAGAAA-AGGATTAATCCTTGCTATG-TGCGA-TTTG---GAAGTATCT
Alignments
lowQualScore : 222222 222222222222 22222222
lowQualScore : 0 11 333333 0 44 1 0 1 333 1 1 0 1 888888888888 4444 2 1 11 0 0 0 3 333 1 0 0 33333333 66 444
lowQualScore : . .. ...... . .. . . . ... . . . . ............ .... . . .. . . . . ... . . . ........ .. ...
lowQualScore : 9 22 333333 9 99 8 9 9 222 5 2 9 0 000000000000 3333 0 9 22 9 9 9 8 111 6 9 9 11111111 99 444
consensus : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTAGCTNAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--TAC--GA--TTTG---GAAGTATCT
Reference ( family-512 ) : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTAGCTNAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--TAC--GA--TTTG---GAAGTATCT
gi|22482 : ACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCAT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTT------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GTTAAAACA-CAAAATATGCAA-CCCG-TACTCGG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22483 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--ACGC-CTACTCTT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GATCAAACA-CAAAATATGCAA-CCCG-TACCCGG---GCAGACA-AGGATTAATTCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22484 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC------------GATTTG---AAA----CTGAATT--GATCAAACA-CAAAACATGCAA-CCCG-TACTCTG---ACAGACA-AGGATTAATCCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22485 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---ACAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------ACAATTTTG---GAAGTAGCTCAACT--GATAAAACA-CAATATATGCAA-CCCA-TTCTCTA---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC---TAC------TTTGAATGAAATATCT
gi|22486 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTCGCCATA------TCGGATTTG---AAAGTATCTATATT--GATAAAACG-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTG
gi|22487 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AGGGTTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTG---GAAGTATCTAAATT--GATTAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGT------C--GA--TTTG---AA
gi|22488 : aaatACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCT-TTCTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22489 : aaacACA-AAAC--AT--GC--A-A--CC-C-GTACTCTG---ACAGACA-AGGATTAATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTT--GATGAAATA-CGCAATATACAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22490 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-GTACCCGG---GCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTG--GATGGAATA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTA---GGACAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22491 : aaacCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GCTAAAACA-CAAAATAT-AAA-CCCC-TACACTT---GCAGACA-AAGATTAATCCTTGCC
gi|22492 : aaacgACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-TTTCTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------------------GAAG---CTTACTT--GTTAA--CA-CAAA-TATAAAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22493 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTATT-TG---GCAGAGA-AGGAATAATCCTCGCCATA------TCGGATTTG---AAAGTATCAATATT--GATTAAACG-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGCC
gi|22494 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--TC-T-CTTCTCTG---ACAGACA-AAGATTAATCATTGCCATA------GAAGCTTTG---AAAAT--CTAACTT--AATGAAATA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AGGGTTAATCCTTGTCA--TAC--CAATTTTG---GAAGTATCT
gi|22495 : aaACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-CTTCTCTG---GCGGACA-ACGATTAATCCTTGCCATA------TCAAATTTG---GATGTATCTTAATT--AATAAAACA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---ACAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22496 : aaAAT--AT--AC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--ATTAAAACA-CAAAATAT-AAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22497 : aaatacgcACT-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCAG---AGAGAGA-AGGATTTATCCTTGCCAT---------------------AGTAGATTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CGCC-TACTCTT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGT------C--GA--TTTG---AA
gi|22498 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACACTT---GCAGACA-AAGATTAATCCTTGCCATA------TCATATTTG---AAAGTAGCTTAATT--GATAAAACA-CTAAATATGAAA-CCCC-TTCTCAG---AGAGAGA-AGGATTTATCCTTGCC
gi|22499 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-ATTCTCTA---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC-TA------C----TTTGAATGAAATATCTTACTG--GATGAAATA-CAAAATATGCAA-CCCCCTTCTCAA---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCA--TAC--CAATTTTG---GAAGTATCT
gi|22500 : aaACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-CTTCTCTG-----AGAGA-AGGATTA-TCTTTGCCATA---------------------GTAACT---------TAAGAAA-CAAAATAT-AAA-TCCC-TACTCTG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCA--GATCAGA--TTTG---GGAGTATCT
gi|22501 : aaacACC-AACT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG-----AGAGAGAGGATTTAGCCTTGCCAT---------------------AGTAGAATAATT--GTTAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCAT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGT------T--GA--TTTG---AA
gi|22502 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-GTACTCGG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTT--GATGAAATA-CAAAATATGAAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGA-TG--TTAA-CCTTGCC
gi|22503 : aaacACA-AAAT--ATGCA---A-C--CC-C-CTTCTCAA---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTG---GAAGTATCTCAATT--GACAAAACA-CAATATATGCAA-TCTC-TTCTCTG---ACAGACA-AAGATTAATCATTGCCA--TA
gi|22504 : aaatACG-AAAT--AT--A---A-A--TT-C-CTACTCTG---GCAGACA-TAGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTG---GGAGTATCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGTAA-CCCC-TA-TTTG---GCAGAGA-AGGAATAATCCTCGCCgaagctttgaa
gi|22505 : aaaaCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGGCACA------TCAGATTTG---AAAGTGGCTAAATA--ATTAATACA-CACAATATAATA-CCCT-TACTCTG---GGTGAGA-AGGATTAATTCTTGTC
gi|22506 : aaacgATA-AAAT--AT--A---A-A--AA-CACTACTCTT---GCGGACA-TAGGTTAATTCTTTCCATA------TTAGATTTG---AAAGTAGCTTAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGA-AGGATT-ATCTTTGCC
gi|22507 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-CTTCTCTG-----AGAGA-TG--TTAA-CCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTGATT--GTTAAAAAA-CGAAATAT-AAA-TTCC-TACTCTG---GCAGACA-TAGATTAATTCTTGCCA--TATCAGA--TTTG---GGAGTATCT
gi|22508 : aaatACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCTG---GCTGAGA-AGGATTAATCCTGGTC------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GATAAAACA-CAAGATATACAA-CCCG-TACTCTA---GCAGACA-AGGATTCATCCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22509 : aaatACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AAGATTAATCCTTGCCATA---------------------GTGGCTGAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTA---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22510 : aaatACA-AGAT--AT--AC--A-A--CC-C-GTACTCTA---GCAGACA-AGGATTCATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAATTT--GATGAAATA-CAAAATATGTAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AAGATTAATCCTTGCC
gi|22511 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCTA---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AATAGCTTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-TCCT-TACTCTG---GAAAACA-AGGATTTATCCTT
gi|22512 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-AT-CC-C-CTACTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAAAT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CCCT-TACTCTG---TCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC
gi|22513 : aaacA-AAAT--GA--A---A-G--CC-C-CT-CTCTG---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCATAGTAGCTTCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT----------A-CAAAATATGAAA-CCCA-TACTCTT---GCAGACA-AGGATAAATCCTTGCC
gi|22514 : aaacagcaACA-AAAT--AT--A---A-AA-CC-C-TTACTCTG---TCAGACA-AGGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTGAATT--AAAAAAACA-CAAAATATGAAA-CTTC-TTCTCTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--
gi|22515 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CT-T-CTTCTCTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA---------------------AAGTAGCTTAATT--GTTTAAACA-CAAAATATGAAA-ACAT-TACTCTG---GCAGA--------CAATCCTTGCCa
gi|22516 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--ACAC-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT--GATAAAAC----AAATATGAAA-CCCC-CACTCCT---GTAGAGA-A
gi|22517 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-AA-TC-C-TTACTCTG---GAAAACA-AGGATTTATCCTTTTAATA------CTAGATTTG---AAAATAGGTAATTT--GAAAAAACAGCAAAA-ATGAAAGCCCC-T-CTCTG---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC
gi|22518 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--AC-A-TTACTCTG---GCAGA--------CAATCCTTGCCATA------TCCAATTTG---GATGTATATAGATT--AATAAA-TA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCTGAGA-AGGATTAATCCTGGT------C--GA--TTTG---AA
gi|22519 : aaacACACAAAT--AT--A---A-AA-CC-C-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTTGCTTAATT--GATAAAACA-CCAACTATGAAA-CCCC-TTCTCTG-----AGAGAGAGGATTTAGCCTTGCC
gi|22520 : aACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTA---GGACAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GTTAAAACA-TAAAATATAAAA-ACAC-TACTCTT---GCGGACA-TAGGTTAATTCTTTCC
gi|22521 : aatACA-CAAT--AT--A---ATA--CC-C-TTACTCTG---GGTGAGA-AGGATTAATTCTTGTCATT------CCAGATTTA---AAAGTAGCTAAATT--GATAAA--A-CAAAATATGAAA-CACC-TAC
gi|22522 : acACA-AAAT--AT--A---A-A--TC-C-CTACTCTG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCAGA------TCAGATTTG---GGAGTATCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGTAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTCGCCA--TATCGGA--TTTG---AAAGTATCT
gi|22523 : ACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-ATACTCTT---GCAGACA-AGGATAAATCCTTGCCATA------TGAGATTTG---AAAGAAGCTAAATT--GATAAAAT---------------CCCC-TTCTTTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22524 : A-AAAT--AT--GC--A-A--TC-C-CTATTCTG---GCAGAAA-AGGATTAATCCTTGCTATG------TGCGATTTG---GAAGTATCTTAATT--GATAAAACA-CAATATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---GCGGACA-ACGATTAATCCTTGCCA--TATCAAA--TTTG---GATGTATCT
gi|22525 : -AAATTGAT--A---A-AATCC-C-CTTCTTTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CACC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22526 : TTTG---GAAGTATCTCAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAT-CCCC-TACTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22527 : AATTAAGATAGAATC-TAAAATATGCAA-TCCC-TATTCTG---GCAGAAA-AGGATTAATCCTTGCTATGTGC--GA--TTTG---GAAGTATCT
Alignments
lowQualScore : 222222 222222222222 22222222
lowQualScore : 0 11 333333 0 44 1 0 1 333 1 1 0 1 888888888888 4444 2 1 11 0 0 0 3 333 1 0 0 33333333 66 444
lowQualScore : . .. ...... . .. . . . ... . . . . ............ .... . . .. . . . . ... . . . ........ .. ...
lowQualScore : 9 22 333333 9 99 8 9 9 222 5 2 9 0 000000000000 3333 0 9 22 9 9 9 8 111 6 9 9 11111111 99 444
consensus : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTAGCTNAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--TAC--GA--TTTG---GAAGTATCT
Reference ( family-512 ) : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTAGCTNAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--TAC--GA--TTTG---GAAGTATCT
gi|22482 : ACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCAT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTT------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GTTAAAACA-CAAAATATGCAA-CCCG-TACTCGG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22483 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--ACGC-CTACTCTT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GATCAAACA-CAAAATATGCAA-CCCG-TACCCGG---GCAGACA-AGGATTAATTCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22484 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC------------GATTTG---AAA----CTGAATT--GATCAAACA-CAAAACATGCAA-CCCG-TACTCTG---ACAGACA-AGGATTAATCCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22485 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---ACAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------ACAATTTTG---GAAGTAGCTCAACT--GATAAAACA-CAATATATGCAA-CCCA-TTCTCTA---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC---TAC------TTTGAATGAAATATCT
gi|22486 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTCGCCATA------TCGGATTTG---AAAGTATCTATATT--GATAAAACG-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTG
gi|22487 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AGGGTTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTG---GAAGTATCTAAATT--GATTAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGT------C--GA--TTTG---AA
gi|22488 : aaatACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCT-TTCTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22489 : aaacACA-AAAC--AT--GC--A-A--CC-C-GTACTCTG---ACAGACA-AGGATTAATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTT--GATGAAATA-CGCAATATACAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22490 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-GTACCCGG---GCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTG--GATGGAATA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTA---GGACAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22491 : aaacCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GCTAAAACA-CAAAATAT-AAA-CCCC-TACACTT---GCAGACA-AAGATTAATCCTTGCC
gi|22492 : aaacgACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-TTTCTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------------------GAAG---CTTACTT--GTTAA--CA-CAAA-TATAAAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22493 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTATT-TG---GCAGAGA-AGGAATAATCCTCGCCATA------TCGGATTTG---AAAGTATCAATATT--GATTAAACG-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGCC
gi|22494 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--TC-T-CTTCTCTG---ACAGACA-AAGATTAATCATTGCCATA------GAAGCTTTG---AAAAT--CTAACTT--AATGAAATA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AGGGTTAATCCTTGTCA--TAC--CAATTTTG---GAAGTATCT
gi|22495 : aaACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-CTTCTCTG---GCGGACA-ACGATTAATCCTTGCCATA------TCAAATTTG---GATGTATCTTAATT--AATAAAACA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---ACAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22496 : aaAAT--AT--AC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--ATTAAAACA-CAAAATAT-AAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22497 : aaatacgcACT-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCAG---AGAGAGA-AGGATTTATCCTTGCCAT---------------------AGTAGATTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CGCC-TACTCTT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGT------C--GA--TTTG---AA
gi|22498 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACACTT---GCAGACA-AAGATTAATCCTTGCCATA------TCATATTTG---AAAGTAGCTTAATT--GATAAAACA-CTAAATATGAAA-CCCC-TTCTCAG---AGAGAGA-AGGATTTATCCTTGCC
gi|22499 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-ATTCTCTA---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC-TA------C----TTTGAATGAAATATCTTACTG--GATGAAATA-CAAAATATGCAA-CCCCCTTCTCAA---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCA--TAC--CAATTTTG---GAAGTATCT
gi|22500 : aaACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-CTTCTCTG-----AGAGA-AGGATTA-TCTTTGCCATA---------------------GTAACT---------TAAGAAA-CAAAATAT-AAA-TCCC-TACTCTG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCA--GATCAGA--TTTG---GGAGTATCT
gi|22501 : aaacACC-AACT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG-----AGAGAGAGGATTTAGCCTTGCCAT---------------------AGTAGAATAATT--GTTAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCAT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGT------T--GA--TTTG---AA
gi|22502 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-GTACTCGG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTT--GATGAAATA-CAAAATATGAAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGA-TG--TTAA-CCTTGCC
gi|22503 : aaacACA-AAAT--ATGCA---A-C--CC-C-CTTCTCAA---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTG---GAAGTATCTCAATT--GACAAAACA-CAATATATGCAA-TCTC-TTCTCTG---ACAGACA-AAGATTAATCATTGCCA--TA
gi|22504 : aaatACG-AAAT--AT--A---A-A--TT-C-CTACTCTG---GCAGACA-TAGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTG---GGAGTATCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGTAA-CCCC-TA-TTTG---GCAGAGA-AGGAATAATCCTCGCCgaagctttgaa
gi|22505 : aaaaCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGGCACA------TCAGATTTG---AAAGTGGCTAAATA--ATTAATACA-CACAATATAATA-CCCT-TACTCTG---GGTGAGA-AGGATTAATTCTTGTC
gi|22506 : aaacgATA-AAAT--AT--A---A-A--AA-CACTACTCTT---GCGGACA-TAGGTTAATTCTTTCCATA------TTAGATTTG---AAAGTAGCTTAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGA-AGGATT-ATCTTTGCC
gi|22507 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-CTTCTCTG-----AGAGA-TG--TTAA-CCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTGATT--GTTAAAAAA-CGAAATAT-AAA-TTCC-TACTCTG---GCAGACA-TAGATTAATTCTTGCCA--TATCAGA--TTTG---GGAGTATCT
gi|22508 : aaatACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCTG---GCTGAGA-AGGATTAATCCTGGTC------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GATAAAACA-CAAGATATACAA-CCCG-TACTCTA---GCAGACA-AGGATTCATCCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22509 : aaatACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AAGATTAATCCTTGCCATA---------------------GTGGCTGAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTA---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22510 : aaatACA-AGAT--AT--AC--A-A--CC-C-GTACTCTA---GCAGACA-AGGATTCATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAATTT--GATGAAATA-CAAAATATGTAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AAGATTAATCCTTGCC
gi|22511 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCTA---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AATAGCTTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-TCCT-TACTCTG---GAAAACA-AGGATTTATCCTT
gi|22512 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-AT-CC-C-CTACTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAAAT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CCCT-TACTCTG---TCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC
gi|22513 : aaacA-AAAT--GA--A---A-G--CC-C-CT-CTCTG---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCATAGTAGCTTCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT----------A-CAAAATATGAAA-CCCA-TACTCTT---GCAGACA-AGGATAAATCCTTGCC
gi|22514 : aaacagcaACA-AAAT--AT--A---A-AA-CC-C-TTACTCTG---TCAGACA-AGGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTGAATT--AAAAAAACA-CAAAATATGAAA-CTTC-TTCTCTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--
gi|22515 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CT-T-CTTCTCTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA---------------------AAGTAGCTTAATT--GTTTAAACA-CAAAATATGAAA-ACAT-TACTCTG---GCAGA--------CAATCCTTGCCa
gi|22516 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--ACAC-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT--GATAAAAC----AAATATGAAA-CCCC-CACTCCT---GTAGAGA-A
gi|22517 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-AA-TC-C-TTACTCTG---GAAAACA-AGGATTTATCCTTTTAATA------CTAGATTTG---AAAATAGGTAATTT--GAAAAAACAGCAAAA-ATGAAAGCCCC-T-CTCTG---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC
gi|22518 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--AC-A-TTACTCTG---GCAGA--------CAATCCTTGCCATA------TCCAATTTG---GATGTATATAGATT--AATAAA-TA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCTGAGA-AGGATTAATCCTGGT------C--GA--TTTG---AA
gi|22519 : aaacACACAAAT--AT--A---A-AA-CC-C-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTTGCTTAATT--GATAAAACA-CCAACTATGAAA-CCCC-TTCTCTG-----AGAGAGAGGATTTAGCCTTGCC
gi|22520 : aACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTA---GGACAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GTTAAAACA-TAAAATATAAAA-ACAC-TACTCTT---GCGGACA-TAGGTTAATTCTTTCC
gi|22521 : aatACA-CAAT--AT--A---ATA--CC-C-TTACTCTG---GGTGAGA-AGGATTAATTCTTGTCATT------CCAGATTTA---AAAGTAGCTAAATT--GATAAA--A-CAAAATATGAAA-CACC-TAC
gi|22522 : acACA-AAAT--AT--A---A-A--TC-C-CTACTCTG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCAGA------TCAGATTTG---GGAGTATCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGTAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTCGCCA--TATCGGA--TTTG---AAAGTATCT
gi|22523 : ACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-ATACTCTT---GCAGACA-AGGATAAATCCTTGCCATA------TGAGATTTG---AAAGAAGCTAAATT--GATAAAAT---------------CCCC-TTCTTTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22524 : A-AAAT--AT--GC--A-A--TC-C-CTATTCTG---GCAGAAA-AGGATTAATCCTTGCTATG------TGCGATTTG---GAAGTATCTTAATT--GATAAAACA-CAATATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---GCGGACA-ACGATTAATCCTTGCCA--TATCAAA--TTTG---GATGTATCT
gi|22525 : -AAATTGAT--A---A-AATCC-C-CTTCTTTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CACC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22526 : TTTG---GAAGTATCTCAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAT-CCCC-TACTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22527 : AATTAAGATAGAATC-TAAAATATGCAA-TCCC-TATTCTG---GCAGAAA-AGGATTAATCCTTGCTATGTGC--GA--TTTG---GAAGTATCT
blockSeqs : TG ATGC AT G A AGA T G A AGTAGCTTCAGA AATG G A AA A AGA C AGATCA AT AAT
blockSeqs : . ATGC T A T AGA T G A AACAAT A T G . A AGA C ATATCA AT .
blockSeqs : . ATGC A . T . C G A ATCGGA A T C . T . C ATATCG . .
blockSeqs : . GCA A . A . C G A ACCAAT G G A . T . C ATATCA . .
blockSeqs : . GA A . T . G G A ATCAGA A T A . T . T ATGTGC . .
blockSeqs : . GC . . A . C C A ATCGGA G T A . T . G ATAC . .
blockSeqs : . GT . . A . C C A AGAAGC A G A . T . G ATAC . .
blockSeqs : . GC . . A . C C A ATCAAA G T A . T . C TAC . .
blockSeqs : . GC . . T . C G A ATCATA G T T . A . C C . .
blockSeqs : . GC . . T . C G A ACCAAT G G T . A . C C . .
blockSeqs : . GA . . A . C G A ATCAGA A G A . T . G C . .
blockSeqs : . GA . . T . C C A ATCAGA A G A . T . C C . .
blockSeqs : . GT . . T . G C A ATTAGA G T T . T . C T . .
blockSeqs : . AC . . T . G G A ATCAGA A A T . A . T C . .
blockSeqs : . GA . . T . C G A ATCAGA G G T . A . G C . .
blockSeqs : . GA . . A . C C A ACTAGA G T T . T . G
blockSeqs : . GC . . T . C C A ATCCAA G T T . T . C
blockSeqs : . GA . . T . G G A ATCAGA A T T . A . T
blockSeqs : . GA . . T . C G A TCCAGA A G A . A . C
blockSeqs : . GT . . A . C C A ATCAGA A G C . T . C
blockSeqs : . AC . . T . C G A ATGAGA G G A . A . G
blockSeqs : . GA . . A . C C A GTGCGA A G A . A . C
blockSeqs : . GA . . T . G G A GA A T T . A . C
blockSeqs : . GA . . A . C C A GA A G T . A . T
blockSeqs : . GC . . T . T G A GA A G A . A . G
blockSeqs : . GA . . A . T G A GA G G G . T . A
blockSeqs : . GC . . T . C G A AC G G A . A . C
blockSeqs : . A . . A . G C A GA A G T . A . C
blockSeqs : . A . . A . C G A GA G G T . A . G
blockSeqs : . A . . A . A G A GA A G A . T . C
blockSeqs : . G . . A . C G A A G T G . A . T
blockSeqs : . A . . T . C C A A G G T . A . T
blockSeqs : . A . . A . G G A A . G A . A . C
blockSeqs : . G . . A . G C A . . G A . T . C
blockSeqs : . G . . A . C C A . . T A . A . C
blockSeqs : . A . . A . C C . . . G T . A . G
blockSeqs : . A . . T . C G . . . T T . A . C
blockSeqs : . A . . A . G G . . . G A . T . C
blockSeqs : . A . . A . . C . . . T A . T . C
blockSeqs : . A . . A . . C . . . . A . A . .
blockSeqs : . A . . A . . A . . . . T . A . .
blockSeqs : . A . . T . . G . . . . T . A . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ATCAGA******
originalCons : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTAGCTNAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--TAC--GA--TTTG---GAAGTATCT
finalCons : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATATCAGA------TTTG---GAAGTAGCTNAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--TAC--GA--TTTG---GAAGTATCT
Alignments
lowQualScore : 222222 222222222222 22222222
lowQualScore : 0 11 333333 0 44 1 0 1 333 1 1 0 1 888888888888 4444 2 1 11 0 0 0 3 333 1 0 0 33333333 66 444
lowQualScore : . .. ...... . .. . . . ... . . . . ............ .... . . .. . . . . ... . . . ........ .. ...
lowQualScore : 9 22 333333 9 99 8 9 9 222 5 2 9 0 000000000000 3333 0 9 22 9 9 9 8 111 6 9 9 11111111 99 444
consensus : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTAGCTNAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--TAC--GA--TTTG---GAAGTATCT
Reference ( family-512 ) : ACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTNCTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTAGCTNAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--TAC--GA--TTTG---GAAGTATCT
gi|22482 : ACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCAT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTT------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GTTAAAACA-CAAAATATGCAA-CCCG-TACTCGG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22483 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--ACGC-CTACTCTT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GATCAAACA-CAAAATATGCAA-CCCG-TACCCGG---GCAGACA-AGGATTAATTCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22484 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC------------GATTTG---AAA----CTGAATT--GATCAAACA-CAAAACATGCAA-CCCG-TACTCTG---ACAGACA-AGGATTAATCCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22485 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---ACAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------ACAATTTTG---GAAGTAGCTCAACT--GATAAAACA-CAATATATGCAA-CCCA-TTCTCTA---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC---TAC------TTTGAATGAAATATCT
gi|22486 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTCGCCATA------TCGGATTTG---AAAGTATCTATATT--GATAAAACG-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTG
gi|22487 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AGGGTTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTG---GAAGTATCTAAATT--GATTAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGT------C--GA--TTTG---AA
gi|22488 : aaatACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCT-TTCTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22489 : aaacACA-AAAC--AT--GC--A-A--CC-C-GTACTCTG---ACAGACA-AGGATTAATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTT--GATGAAATA-CGCAATATACAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22490 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-GTACCCGG---GCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTG--GATGGAATA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTA---GGACAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22491 : aaacCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GCTAAAACA-CAAAATAT-AAA-CCCC-TACACTT---GCAGACA-AAGATTAATCCTTGCC
gi|22492 : aaacgACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-TTTCTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCCATA------------------GAAG---CTTACTT--GTTAA--CA-CAAA-TATAAAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22493 : aaacACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTATT-TG---GCAGAGA-AGGAATAATCCTCGCCATA------TCGGATTTG---AAAGTATCAATATT--GATTAAACG-CAAAATATGAAA-CCCC-TTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGCC
gi|22494 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--TC-T-CTTCTCTG---ACAGACA-AAGATTAATCATTGCCATA------GAAGCTTTG---AAAAT--CTAACTT--AATGAAATA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AGGGTTAATCCTTGTCA--TAC--CAATTTTG---GAAGTATCT
gi|22495 : aaACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-CTTCTCTG---GCGGACA-ACGATTAATCCTTGCCATA------TCAAATTTG---GATGTATCTTAATT--AATAAAACA-CAAAATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---ACAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22496 : aaAAT--AT--AC--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--ATTAAAACA-CAAAATAT-AAA-CCCC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22497 : aaatacgcACT-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCAG---AGAGAGA-AGGATTTATCCTTGCCAT---------------------AGTAGATTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CGCC-TACTCTT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGT------C--GA--TTTG---AA
gi|22498 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--CC-C-CTACACTT---GCAGACA-AAGATTAATCCTTGCCATA------TCATATTTG---AAAGTAGCTTAATT--GATAAAACA-CTAAATATGAAA-CCCC-TTCTCAG---AGAGAGA-AGGATTTATCCTTGCC
gi|22499 : aaacACA-CAAT--AT--ATGCA-A--CC-C-ATTCTCTA---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC-TA------C----TTTGAATGAAATATCTTACTG--GATGAAATA-CAAAATATGCAA-CCCCCTTCTCAA---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCA--TAC--CAATTTTG---GAAGTATCT
gi|22500 : aaACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-CTTCTCTG-----AGAGA-AGGATTA-TCTTTGCCATA---------------------GTAACT---------TAAGAAA-CAAAATAT-AAA-TCCC-TACTCTG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCA--GATCAGA--TTTG---GGAGTATCT
gi|22501 : aaacACC-AACT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG-----AGAGAGAGGATTTAGCCTTGCCAT---------------------AGTAGAATAATT--GTTAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCAT---GTAGAGA-AGGATTAATCCTTGT------T--GA--TTTG---AA
gi|22502 : aaacACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-GTACTCGG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAACTT--GATGAAATA-CAAAATATGAAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGA-TG--TTAA-CCTTGCC
gi|22503 : aaacACA-AAAT--ATGCA---A-C--CC-C-CTTCTCAA---GGAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCATA------CCAATTTTG---GAAGTATCTCAATT--GACAAAACA-CAATATATGCAA-TCTC-TTCTCTG---ACAGACA-AAGATTAATCATTGCCA--TA
gi|22504 : aaatACG-AAAT--AT--A---A-A--TT-C-CTACTCTG---GCAGACA-TAGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTG---GGAGTATCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGTAA-CCCC-TA-TTTG---GCAGAGA-AGGAATAATCCTCGCCgaagctttgaa
gi|22505 : aaaaCA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTTCTCTG---GCAGAGA-ATGATTAATCCTTGGCACA------TCAGATTTG---AAAGTGGCTAAATA--ATTAATACA-CACAATATAATA-CCCT-TACTCTG---GGTGAGA-AGGATTAATTCTTGTC
gi|22506 : aaacgATA-AAAT--AT--A---A-A--AA-CACTACTCTT---GCGGACA-TAGGTTAATTCTTTCCATA------TTAGATTTG---AAAGTAGCTTAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCT-T-CTCTG-----AGAGA-AGGATT-ATCTTTGCC
gi|22507 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-A--AC-C-CTTCTCTG-----AGAGA-TG--TTAA-CCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTGATT--GTTAAAAAA-CGAAATAT-AAA-TTCC-TACTCTG---GCAGACA-TAGATTAATTCTTGCCA--TATCAGA--TTTG---GGAGTATCT
gi|22508 : aaatACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCTG---GCTGAGA-AGGATTAATCCTGGTC------------GATTTG---AAA----CTAACTT--GATAAAACA-CAAGATATACAA-CCCG-TACTCTA---GCAGACA-AGGATTCATCCTTGC------C--GA--CTTT---GAATTATCT
gi|22509 : aaatACA-AAAT--AT--GT--A-A--CC-C-CTTCTCTG---GGAGAGA-AAGATTAATCCTTGCCATA---------------------GTGGCTGAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTA---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22510 : aaatACA-AGAT--AT--AC--A-A--CC-C-GTACTCTA---GCAGACA-AGGATTCATCCTTGCC------------GACTTT---GAATTATCTAATTT--GATGAAATA-CAAAATATGTAA-CCCC-TTCTCTG---GGAGAGA-AAGATTAATCCTTGCC
gi|22511 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-CTACTCTA---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AATAGCTTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-TCCT-TACTCTG---GAAAACA-AGGATTTATCCTT
gi|22512 : aaacACA-AAAT--AT--G---A-AT-CC-C-CTACTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAAAT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CCCT-TACTCTG---TCAGACA-AGGATTAATTCTTGCC
gi|22513 : aaacA-AAAT--GA--A---A-G--CC-C-CT-CTCTG---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGTCATAGTAGCTTCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT----------A-CAAAATATGAAA-CCCA-TACTCTT---GCAGACA-AGGATAAATCCTTGCC
gi|22514 : aaacagcaACA-AAAT--AT--A---A-AA-CC-C-TTACTCTG---TCAGACA-AGGATTAATTCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTGAATT--AAAAAAACA-CAAAATATGAAA-CTTC-TTCTCTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA--
gi|22515 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--CT-T-CTTCTCTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCA---------------------AAGTAGCTTAATT--GTTTAAACA-CAAAATATGAAA-ACAT-TACTCTG---GCAGA--------CAATCCTTGCCa
gi|22516 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-A--ACAC-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---AAAGTAGCTAAATT--GATAAAAC----AAATATGAAA-CCCC-CACTCCT---GTAGAGA-A
gi|22517 : aaacACA-AAAT--AT--A---A-AA-TC-C-TTACTCTG---GAAAACA-AGGATTTATCCTTTTAATA------CTAGATTTG---AAAATAGGTAATTT--GAAAAAACAGCAAAA-ATGAAAGCCCC-T-CTCTG---ATAGAGA-AGGATTAATCCTTGTC
gi|22518 : aaacACA-AAAT--ATG-A---A-A--AC-A-TTACTCTG---GCAGA--------CAATCCTTGCCATA------TCCAATTTG---GATGTATATAGATT--AATAAA-TA-CAAAATATGAAA-CCCC-TACTCTG---GCTGAGA-AGGATTAATCCTGGT------C--GA--TTTG---AA
gi|22519 : aaacACACAAAT--AT--A---A-AA-CC-C-CTACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCATA------TCAGATTTG---GAAGTTGCTTAATT--GATAAAACA-CCAACTATGAAA-CCCC-TTCTCTG-----AGAGAGAGGATTTAGCCTTGCC
gi|22520 : aACA-AAAT--AT--GC--A-A--CC-C-CTTCTCTA---GGACAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GTTAAAACA-TAAAATATAAAA-ACAC-TACTCTT---GCGGACA-TAGGTTAATTCTTTCC
gi|22521 : aatACA-CAAT--AT--A---ATA--CC-C-TTACTCTG---GGTGAGA-AGGATTAATTCTTGTCATT------CCAGATTTA---AAAGTAGCTAAATT--GATAAA--A-CAAAATATGAAA-CACC-TAC
gi|22522 : acACA-AAAT--AT--A---A-A--TC-C-CTACTCTG---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCCAGA------TCAGATTTG---GGAGTATCTAAATT--GATAAAACA-CAAAATATGTAA-CCCC-TACTCTG---GCAGAGA-AGGATTAATCCTCGCCA--TATCGGA--TTTG---AAAGTATCT
gi|22523 : ACA-AAAT--ATG-A---A-A--CC-C-ATACTCTT---GCAGACA-AGGATAAATCCTTGCCATA------TGAGATTTG---AAAGAAGCTAAATT--GATAAAAT---------------CCCC-TTCTTTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22524 : A-AAAT--AT--GC--A-A--TC-C-CTATTCTG---GCAGAAA-AGGATTAATCCTTGCTATG------TGCGATTTG---GAAGTATCTTAATT--GATAAAACA-CAATATATGCAA-CCCC-TTCTCTG---GCGGACA-ACGATTAATCCTTGCCA--TATCAAA--TTTG---GATGTATCT
gi|22525 : -AAATTGAT--A---A-AATCC-C-CTTCTTTG---AGAGAGA-AGGATTAATCCTTGCCAT---------------------AGTAGCTTAATT--GTTAAAACA-CAAAATATAAAA-CACC-TACTCTT---GCAGACA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22526 : TTTG---GAAGTATCTCAATT--GATAAAACA-CAAAATATGAAT-CCCC-TACTCTGAGAG-AGAGA-AGGATTAATCCTTGCC
gi|22527 : AATTAAGATAGAATC-TAAAATATGCAA-TCCC-TATTCTG---GCAGAAA-AGGATTAATCCTTGCTATGTGC--GA--TTTG---GAAGTATCT