lowQualScore : 1 1
lowQualScore : 1 5 1 2 222 4 1 11 2 1 9 4 6 2 77 5 11 333333333 1 1 1 333 22 11 1 5 11 4 333 222 8888888888 55555555 1 3333333 33 555 11 9 2222 66666 11 0 0 0 22 0 0 1 33 9999 22 22 1 1 1 11 55 11 2 1 3 6 1 33 1 1 3333 1 555 3 2 1 1 1 11 11 5555
lowQualScore : . . . . ... . . .. . . . . . . .. . .. ......... . . . ... .. .. . . .. . ... ... .......... ........ . ....... .. ... .. . .... ..... .. . . . .. . . . .. .... .. .. . . . .. .. .. . . . . . .. . . .... . ... . . . . . .. .. ....
lowQualScore : 3 8 3 3 333 1 2 77 5 1 1 4 7 2 66 3 33 999999999 0 0 7 000 77 33 0 1 33 3 000 666 7777777777 55555555 0 1111111 33 777 33 6 0000 44444 22 9 9 9 22 9 9 0 22 6666 11 33 0 0 0 44 55 44 2 0 4 7 0 66 1 0 4444 0 777 2 2 3 2 3 77 77 3333
consensus : ATATCGTACGAT-GCGGAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAACTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT---C---TAACTTTC---TN----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-NTTT-N-ATG--AAATAAA----C--N--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAN-ATGT---AAAAA-TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-C-GATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGNC-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAAT-GGAC--A--CG----TACTAGCT
Reference ( gi|29825 ) : ACATCGCACGAT-GCGGAT---TTTACAC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAACCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AAA-CCCGTTGAA--TTATT---C---TAACTTTT---TT----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AACTAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAT-ATGT---TAAAA-TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCCAT-C-AATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAAT-GTAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29834 : ACATCGTACGAA-GCGAAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAGCCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AAA-TCCGTTTAA--TTATT---C---TAACTTTC---TA----AA--------T-ACTTA-------ATAGA-ATTT-G-ATG--AACTAAA----C--T--T--CAAAA-TGT-TTTATTATTT-AA--T-C-AAAGAATGAAA-ATGT---AAAAA-TAT--C-T-TGAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-C-AATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTGAATATA-GCCTATATCACTACAAT-GTAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29831 : ACATCGTACGAA-GCTCAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAACATA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT---C---TAACTTTC---TT----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AACTAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAA-ATGT---AAAAA-TAT--C-T-TATAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-C-AATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCCCTACATT-GGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29833 : ACATCGTACGAT-GCAGAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAACCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--ACA-CCCGTTTAG--TTATT---C---TAACTTTC---TT----AA--------T-ACTTG-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AACTAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTACTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAA-ATGT---AAAAA-TAT--C-T-TAAAA-A--CT--T--TGC-TCCTGTCGATCTAT-C-AATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCTCTACAAT-GGAA--A--CG----TACTAGTT
gi|29832 : ACATCGTACGAA-GCAGAT---TTTACGC-T--AT-TACG-C-C-AA-TG-TAAACCTA-A--TTTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AAA-CCTGTTTAG--TTATT---T---TAACTTTC---TA----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AACTAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAA-ATGT---AAACA-TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-C-AATACGTTTTA-ACAA---ATCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATAATTACAAT-TAAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29838 : ACATCGTACGAA-GCCGAT---TTT-CGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-AG-AAAACATA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AAA-CCCATTTAA--TTATT---C---TAATTTTC---TT----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AACTAAA----C--T--T--CAAAA-TTA-TTTATTCCTT-AA--T-C-AAAGAATTAAA-ATGT---AAACA-TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-C-AACACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAAC-GGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29828 : ATATAGTACGAT-GCCGAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAACTTA-A--ATTTG---------TAT-TAT-GACA---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT---C---TAACTTTC---TT----AA--------T-ACTTA-------ATGGT-ATTT-G-ATG--AAATAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAA-ATGTA--AAAAA-GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-ACCTATCGAGCTAT-C-GATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCTTTACAAT-GGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29824 : ATATCGTACGAA-GCCGAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAACTTA-A--ATTAG---------TTT-CAT-GACA---A--AT--AAA-TCCGTTTAA--TTATT---C---TAACTTTC---TT----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AAATAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAA-ATGT---AAAAC-GAT--G-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATCGAACTAT-C-GATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTTAATATA-GCCTATATCATTACAAT-GGAC--A--CG----TACTAGTT
gi|29823 : ATATGGTACGAT-GCGCAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-CGAA-TG-TAAAATTA-A--TTTTG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT---C---TAACTTTC---TT----AA--------T-ACTAA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AAA-AAA----C--T--G--CCAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAT-ATGT---AAAAA-GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-C-AATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTCCAAT-AGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29839 : ACATCGTACGAA-GCTGAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAACCTA-A--ATAAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT---C---TAACTTCC---GT----AA--------T-ACTTG-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AACTAAA----C--T--T--CAAAA-TAA-TTTATTCTTT-AA--T-A-AAAGAATGAAA-ATGT---AAAAA-TAT--T-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TTCTTTCAATTTAT-G-AAGACGTTTAA-ACAA---TTTCACGC-TAGCTGAT-CTAAATATT-GCCTATATCACTACAAT-GGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29830 : ATATCGTACGAA-GCGAAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AG-TG-TAAACTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AA--AAA-CCCGTTTAA--TTATT---C---TAACTTTC---TT----TA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATA--AAATAAA----C--T--T--TAAAA-TGA-TGTATTCTTT-AA--T-C-AAACAATGAAA-ATGT---AAAAA-GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCATATCGAGCTAT-C-GGTACGTTTTA-ACAG---TTCCACGC-TACCTGTT-TTAAATATA-GCCTATATCATTACAAT-AGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29836 : ATATCGTACGAT-GCAAAT---TTTACGT-T--TT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAACTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AGA-CCCGTTAAA--TTATT---C---TAACTTTC---GT----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AAATAAA----C--T--T--TAAAA-TGA-TGTGTTCTTT-AA--C-C-AAAGAATGACA-ATGT---AAAAC-GAT--C-C-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-A-GATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTGAATATA-GCCTTTATCATTACAAT-GGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29841 : ACATCGTACGAA-GCAGAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-C---AA-TG-TAAACCTG-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT---C---TATCTTTC---TT----AA--------T-ACTTA-------ATAGA-AAAC-G-ATG--AACTAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAA-ACGT---AAAAAATAT--C-T----------------------CCTATCGAGCTAT-C-AATACGTTTTA-ACAA---TTCCACTT-TACCTGAC-CTAAATATA-ACCTATATCACTACAGT-GGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29829 : ATATGGCACGAT-GCAGAT---TTTACGT-T--AT-TAGGAC-C-AA-TG-TAGAATTA-A--ATTTG---------TTT-TAT-AAAA---T--AT--AAAACCCGTTTAA--TTGTT---C---TAACTTGC---TG----AA--------T-ACTTA-------ATAGA-TTTT-C-ATG--AAA-AAA----C--CCAT--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAT-ATGT---TAAAA-AAT--C-T-TAAAA-A--CT--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-C-GATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATGTA-GCCTATATCATTTCAAA-AGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29837 : ATATGGTACGAT-GCAGAT---TTTACGC-TCCAT-TAGG-C-CGAA-TG-TGAAATTA-A--ATTAAAATTTAGTTTTT-TTT-GACA---A--AT--ATA-CCCGTTTAA--TTATT---C---TTACTTTC---TT----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AAA-AAG----C--T--TGTCAGAA-TAA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAT-ATGT---AAAAA-GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-C-GAAACGTTTAA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAACTATA-GCCTATATCATTCCAAT-AGAC--A--CG----TTCTAGCT
gi|29821 : ATATCGTACGAT-GCGGAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAATTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT---A--AT--AAA-CCCGTATAT--TTGTT---C---TAACATTC---TG----AA--------T-ATTTA-------ATGGA-TTTT-C-ATG--AAA-AAA----CCGT--T--CAAA--TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAATAATGAAT-ATGT---TAAAA-CAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGTTTT-C-GATACGTTTTA-ACAT---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GCATATATCATTCCAAT-AGAC--A--TG----TACTAGCT
gi|29840 : ATATGGTACGTT-GCGGCT---TAAACGC-T--AT-AAGG-C-CCAA-TG-TAAATTTT-A--ATTAG---------TTT-GAT-GACA---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT---C---TAACTTTC---TTTCTTAA--------T-GCTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AAAAAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-TA--T-C-AAAGAATGAAC-ATGT---TAAAA-TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-C-GATACGTTTCT-ACGT---TTTCATGT-T--------CTATATATA-GCCTATATCATTACAAT-AGAC--A--CC----TGCTAGCT
gi|29822 : ATATCGTACGGT-GCTGAT---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAATTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTGTT---C---TAACTTTC---TA----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-TTTT-C-ATG--AAATAAA----C--A--T--CAAAA-GGA-TTTATCCTTT-AA--T-C-AAAAAATGAAT-ATTT---TAAAA-GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATCGTATT-T-T-AAGATCTTTTA-AGAA---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GGCGATATCATTCCAAG-AGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29827 : ATATCATACGAT-GCAGTT---TTTACGC-T--GT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAATTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT---A--AT--AAA-CCTGTTTAA--TTGTT---C---TAACTTTC---TG----AA--------T-ACTTT-------AAGGA-TTTT-T-ATG--AAATAAA----C--A--T--CAAAA-TGATTTTATTCTTT-GA--T-T-AAAAAATGAAT-ATGT---TAAAA-GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCG----------ATACATTTTA-ACAA---ACACACGC-TACCTGCT-CAAAATATA-GCCTATATCATTCCAAT-AGAC--A--C-----TACTA
gi|29826 : ATATCGTACGAT-GCG--T---CTTACGA-T--AAATAGG-CTC-AA-TG-TAAATTTA-A--ATTAG---------TTT-TAC-AAAT---A--AT--AAA-CCCGTTTCA--TT-TT---C---TAACTTTC---TG----AA--------T-ACTTA-------TTGAA-TTTT-C-ATG--AAATAAA----C--A--T--AAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAAAATGAAT-ATGT---TAAAA-GAT--C---TGAAA-C--CG--T--TAC-TCCTATTGATCTAT-C-GATACGTTTTA-ACAA---ACCCACGC-TACCTGCG-CTAAATAAA-GTCTATATCATTCCAAA-AGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29835 : ATATGGTATGAT-GCTGCT---TTTACGC-A--AT--AGG-CTC-AA-GG-TAAATTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TT--T---T---TAACTTTC---TG----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-TTTT-C-ATG--AAAAAAAAACAC--G--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-GA--T-A-AAAAAAAGAAT-ATGT---TAAAC-GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCG----------ATACGTTTTA-ACAA---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATT-ACCTATATTATTCCAAT-AGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29843 : ATATGGTACGAT-GCGGAT---TATACGC-T--GT-TAGG-C-C-AAATG-TAAAATTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAA---T--AT--AAA-CACGTTTAA--TTGTT---C---TAACTTGC---TG----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-TTTT-C-ATGAAAAAAAAA----C--A--T--CAAAA-TGA-TTTAGTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGACT-ACGT---TAAA
gi|29844 : ATATCGTACGAT-GCGTCT---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAACTTT-A--ATTAG---------TTT-TATAAATA---A--AT---AA-CCCGTTTAA--TTATT---T---TAACTTTC---TG----AA--------T-ACTAA-------ATGGA-ATTT-C-GTG--AAATAAA----C--A--T--CAAAA-TGA-TATATTCTTT-
gi|29842 : ATATTGTACGAT-GCGGAT---TCTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AAATG-CAAACTTA-G--ATTAG---------TTT-TAT-GGCA---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TAATT---C---TAACTTTC---TT----AA--------T-ACATA-------AAGGgtgaaaacgtaaaa
gi|29846 : ATATCGTACGATTACAAAT---GT-ACA--T--AA-AAGG-C-T-AAAGG-TAAAA-TATG--ATTA----------TTT-TA---ACA---ATAAT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT---CC--TAAAATGC---TC----AT--------T-ACTT---------------TTT---ATA--AAATAAA----T--G--T--CAAAA-TAA-CTTATTCTTT-TACCT-C-AA--ACTGAAT-ATG----TAAAA-TAT--A-T-TTGAA-A--TGTTT--TAA-TCCTACCTATCTAG-C-GAGAAG-TTAA-ACAG---ACCTACGT-TACTTGAC-C--GATATACGTCTATA
gi|29852 : ATCGTACGAT-GCGGAT---TTTACGC-T--AG-AAGG-C-C-AA-TG-TAAACTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AGA-CCCATTTAA--TTACT---C---TAATTTTC---TT----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AAATAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTC-AA--C-C-AAAGAATGAAA-ATGT---AAACA-GAT--C-T-TTAAA-A--CG--T--TAC-TCATATCGAGCTAT-C-GATACGTTTCA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAACATA-GCCTATATCATTACAAT-GGAC--A--CG----TTTTAGCT
gi|29848 : ATGGTACGAT-GCGGCT---TTTACGC-T--AT-TAGA-C-CCAA-TG-TGAATTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT---A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTGTT---T---TAACTTCT---G-----AA--------T-ACTTG-------ATGGA-ATTTTA-ATA--AA-TAAA----C--A--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAT-ATGT---TAAAA-TAT--C-T-TAAAA-A--TG--T--TAC-TCCTAAAGATATAT-C-GATACGTTTTA-ACAA---ACACACGC-TATCTGCT-CTAAATATA-GCCTTTATCATTCCAATAGT----A--CG----TACTAG
gi|29849 : tATCGTACGAT-GCGGAT---TTTACGC-T--AG-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CT--------------------------------------T--GAA-TCAGTT-----TT-TT---T---TAACTTTC---AT----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AAATAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTTTTT-AA--T-A-AAAGAATGAAA-ATGT---AAAAA-TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAA-TCCTATCGAGCTAT-C-GATTCGTTCTA-ACAT---GCCCACGC-TACCTGTC-CTTAATATA-ACCTATATCATTACAAT-TGAC--A--CG----TAATAGCT
gi|29850 : tATCGTACGAT-GTG--T---CTTACGA-T--AAATAGG-CTC-AA-TG-TTTATTTA-T--ATTAG---------TTT-TAC-AAAATTTA--AT--AA-------TAAA--TTATTTTTC---TTATTTTC---TG----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-TTTT-C-ATG--AAATAAA----C--A--T--AAAAAATGA-TTTAGTCTTT-GA--T-A-AAATAATGAAT-ATGT---TTAAA-TAT--CGT-TAT------CG--T--CACATCCTATC----TAT-C-GATACGTTTTA-ACCA---ATCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GATAACATCATTCCAAT-AGAC--A--CG----TAC
gi|29851 : tATCGGACGAT-AC--ATCAATGTACAAAT--AT---GG-C-T-AACTG-TAAA-CTATA--GTTAG---------GTT-T----ACA---ATGAT--AAA-TC-----AA--TT-T----------ACTTTTCCCTG----AAATACACATT-ACTTA-------ACAGA-TTTT-T-ATG--TAATAAA----C--G--T--CAAAA-TGA-TATAATCTTT-AA--TAC-AAA-AATGAAT-ATGT---AAAAA-TATC-C-T-TAAA
gi|29847 : tTCGTACGAT-ACAAAT---GT-ACAA-C--AT--AGG-T-T-AAATG-TGAAC--A-ATGATAAG---------TTT-TA-----A---A--AT--AA-------------TTATT---CCCTTTACTTTT---TCCTAAAA--------T-ACTCATTACTCGACTGA-TTTT-T-ATA--GAATAAA----C--G--T--CAAAA-TGA-CTAATTCTTT-AA--C-C-ctatgtttaacaaacttacgctacttg
gi|29853 : atgT---TTTACAA-A--AT--AGG-CTC-AA-TG-TAAATTTA-A--ATTAG---------TTT-TAC-AAAC---A--AT--AAA-CCCGTTCAA--TTAAT---T---GAACTATT---TT----GA--------
gi|29856 : -T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAACCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA---A--AT--AAA-CCCCTTTAT--TTATT---C---TAACTTCC---TT----AC--------A-ACTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AACTAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAAA-ATAT---AAAAA-TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGATCTAT-C-AATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAAT-GTGC--A--CG----TACTAGCT
gi|29858 : AGG-C-T-AA-TGGTAAAACTG-A---TTAG---------TTT-AAC-AATA---A--TT--AAA-CCCTTTACT--TTTTT---C---TAAAATAC---TC----AT--------T-ACTCA-------ACGAA-TTTT-T-ATG--AAGTCGA----T--G--T--CGAAA-TGA-CTT-TTTTTA-AA--C-C-AAA-AATGAAT-ATGT---AAAAA-TAT----T-TAAAA-ATGTG--T--TAT-CCCTAT----CTAT-CTAATAAG-TTAA-ACAAACCTTCTA----TACTTGAC-CGATATAT--GTCTATA
gi|29857 : AGG-C-T-AAAGG-TAAAC-TATG--ATTAG---------TTT-TAT-AATA---A--TT--AAT-CCTTTT--A--TTTTTTC-C---TAAA-ATG---CT----GA--------TAACTCT-------ACGGA-TTCT-T-ATA--AAATAAA----C--G--T--CAAAA-TGA-CTTATTCTTT-AC--A-C-CACGAATGAAT-ATGT---T--TT-TTT--T-T-TAAAT-G--TG--T--TAT-TTCTATCTA-TTATGC-AACAAG-TTTA-ACAA---ACCTAAAC-TACTTG
gi|29859 : -C-C-AA-TAACATACTTATG--ATTAG---------TTT-TAC-AATA---A---C--AAA-TCCCTTTTC--TTTTT---C---TAAAATGC---TA----AT--------T-ACTCA-------ATGGA-TTTT-T-ATA--AAATAAA----C--G--T--CAATA-TTA-CTTTTTCTTT-AAC-C-C-CAAAAATGAAC-ATGT-----AAA-TAC--C-T-TTAAA-A--TGCTT--TAT-CCCAATCTAACTAG-T-GATACG-TTAA-ACAA---AGCTA-AC-CACTTGGC-T--GATATA-G
gi|29860 : -AA-GG-TAAAC-TATG--ATTAG---------TAT-TAC-GGTA---A---T--ACA-TCCTTTACT--TTTTC---C---TAAAATGC---GC----AT--------T-ACTCA-------ACGGA-TTTT-TTATG--AAATAAA----C--T--T--CAAAA-TGA-CTTATTCTTT-AA--C-C-CAAAATTGAAT-ATG----TAAAA-TAT--A-T-TTAAA-A--TG--TGATAT-TCCTATCTATCTAT-C-TATAAG-TTAA-ACAA---ACCTACAC-TACTTGAC-C--GATATACGTTTATA
gi|29845 : G-TAAAATGA-A--GTTAG---------TTT-TAC-AAAA---A--AT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT---C---TAAAATGC---TC----AT--------T-ACTCA-------ACGGA-TTTT-T-ATG--AAATAAA----C--G--T--AAAAA-TGA-CATATTTCTT-AA--C-C-GAA-AATAAAT-G------TAAAA-CAT--C-TCTAAAATA--TT--T--TGT-CCTTATCTATCTAA-C-GATGAG-TTAA-ACAA---ACCTGTAC-TGTGTGACTCTGTACAT--GTCTATA
gi|29854 : atatcatacgattcaaaactgtacagaaggttattgTA-A--AATAG---------TTAATAT-TACA---A--ATTTAAA-TCCGTTAAC--TT-TT---C---TTAATTCC---TA----AA--------T-AATTA-------ACGGACATT----ATG--AACTAAA----C--G--T--CAAAA-TGA-CTTAT-------A--C-C-AAA-AATAAATAATATAAATAAAA-TAT--G-T-TTAAA-A--CGCTT--TAT-TCTTATATACCTAG-C-GATACGTTTAACACAG---TCATAAACTTACCCCAC-ATACATAT---TCTATAT-AC--CAAT-caatt
gi|29862 : ttacctttcaagtcacata--ATTAG---------TTT-TAT-GAAT---A--AT--AAA-CTCATTTAA--TTGTT---C---TAACTTTC---TT----AA--------T-ACTTA-------ATGGA-ATTT-C-ATG--AAAAAAA----C--TG-T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-T-AAAGATTGAAT-CTGT---AAAAA-GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAA-TCCTATTGATCTAT-C---TATGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCAGTT-CTAAATATA-TCCTATATCATTTCAGT-AGAC--A--CA----TACTAGCT
gi|29861 : --ATTAA---------TTT-TAC-AA-A---A--AT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT---C---TCAAATAC---TC----AT--------C-ATTCA-------ACGGA-TTTT-T-ATG--AAATAAA----C--G--T--AAACA-TGA-CTTATTCTTG-AA--C-CTTAAGAATGAAT-ATAT---ACAAA-TAT--C-T-TTAAA-A--TGTTT--TAT-CCCTATCTATCAAG-C-GATAAG-TTTA-ACAA---ACCTACTC-TACTTGAC-C--GATATACGTCTA------TACAAT-GTACATA--CGTTGTTATTAGCT
gi|29863 : gtaaaatagg--ATTAG---------TT---A--AACAGT-A--AT--AAA-TCCATTTACGTTTTTT---C---TAAAAT-----------AAACAT----T-ACTCA-------ATGGA-TTTT-T-ATG--AAATAAA----C--G--T--CAAAA-TGA-C---TTCTTTGAA--C-C-AAA-AATGAAT-ATGT---AAAAA-TATTCT-T-TAAAT-G--TT--T--TAC-CCGTATTTATCTGG-C-GGTAAG-TTTA-ACAA---ACCTACTC-AACTTGAC-T--GATATA--CTTCTA----TACAAT-GTAC--ATTCGTTGTTATTAGCT
gi|29864 : T--AAA-CCCGTTTAA--TTAAT---C---TAACTTTC---TT----AA--------T-ATTTA-------ATGGA-ATTT-G-ATG--AACTAAA----C--T-----CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-G-AAAGAATGAAA-ATGT---AAAAA-TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGATCTAT-T-AATATTTTTTA-ATAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCCCTACAAT-GGAC--A--CG----TATTAG
gi|29865 : CCTA-------ATGAA-ATTT-G-ATG--AAATTAA----C--T--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGGAA-ATGT---AAAAC-GAT--C-T-TAAAA-A--TG--T--TAC-TCCTATTAAGCTAT-C-GATACGTTTTA-ACAT---TTCCACGC-TATCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAAT-GGAC--A--CG----TACCAGCT
gi|29855 : -ATG--AAATAAA----C--G--T--CAAAA-TGA-CGTATTCTTT-AA--C-C-CAAAAACGAAA-ATGT---AAAAA-TAT--C-T-TTAAA-A--TG--T--TGC-T
gi|29867 : tatgctctaagcattatgaatataacttagttcaaaatatacttaataaaaaacgtctttacaaactgttagaaaaatactcattactcatattattAAA----C--A--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTC-AA--T-C-AAAGAATGACT-ATGT---TAAAA-GAT--C-T-TAAAA-A--CG--C--TAC-ACCTTTAGAGCTTT-C-GATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTCAATATA-GCCTATATCATTCCAAT-AGAC--A--CA----TACTAGCTagcgatatatc
gi|29866 : aaaa--CACAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-T-AAAGAATGAAT-ATGT---TAAAA-GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATTGAGCTAT-C-GATACGTTTTA-ACAA---TTCCACAC-AACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTCCAAT-AGAC--A--CG----TACTAGCT
Alignments
lowQualScore : 1 2 1 222 1 11 2 2 8 3 6 3 1 1 11 333333333 1 1 1 444444 22 11 0 22 4 0 44 0 22222 111 1 22 11 1111 444 11 0 0 0 22 0 0 1 11 66666 2222 22 1 1 1 11 55 11 1 3 1 0 1 3333 1 1 1 3 0 11 11 5555
lowQualScore : . . . ... . .. . . . . . . . . .. ......... . . . ...... .. .. . .. . . .. . ..... ... . .. .. .... ... .. . . . .. . . . .. ..... .... .. . . . .. .. .. . . . . . .... . . . . . .. .. ....
lowQualScore : 2 0 2 111 2 66 4 2 6 2 3 1 0 0 33 888888888 0 0 2 000000 66 33 9 22 6 9 11 9 99999 666 3 88 22 9999 888 22 9 9 9 11 9 9 1 99 88888 9999 33 0 0 0 33 44 33 0 1 0 8 0 1111 0 0 0 1 6 77 77 2222
consensus : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTN----AA---TACTTAATGGANTTTN-ATG--AAATAAA----CN--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-NATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGNC-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
Reference ( family-509 ) : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTN----AA---TACTTAATGGANTTTN-ATG--AAATAAA----CN--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-NATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGNC-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29821 : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTATAT--TTGTT-C--TAACA-TTCTG----AA---TATTTAATGGATTTTC-ATG--AAAAAAC----CG--T--TCAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAATAATGAA-TATGT-T---AAAA---CAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGTTTT-CGATACGTTTTA-ACAT---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GCATATATCATTCCAATAGAC--A--TG----TACTAGCT
gi|29822 : ATATCGTACGGT-GCTGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TTCTA----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATG--AAATAAA----CA--T--CAAAA-GGA-TTTATCCTTT-AA--T-C-AAAAAATGAA-TATTT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATCGTATT-T-TAAGATCTTTTA-AGAA---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GGCGATATCATTCCAAGAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29823 : ATATGGTACGAT-GCGCA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-CGAA-TG-TAAA-ATTA-A--TTTTG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTAAATGGAATTTG-ATG--AAA-AAA----CT--G--CCAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29824 : ATATCGTACGAA-GCCGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-CAT-GACA------A--AT--AAA-TCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAC---GAT--G-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATCGAACTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTTAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGTT
gi|29825 : ACATCGCACGAT-GCGGA-T---TTTACAC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTGAA--TTATT-C--TAACT-TTTTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCCAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAATGTAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29826 : ATATCGTACGAT-GCG---T---CTTACGA-T--AAATAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAC-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTCA--TT-TT-C--TAACT-TTCTG----AA---TACTTATTGAATTTTC-ATG--AAATAAA----CA--T--AAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAAAATGAA-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T--GAAA-C--CG--T--TAC-TCCTATTGATCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---ACCCACGC-TACCTGCG-CTAAATAAA-GTCTATATCATTCCAAAAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29827 : ATATCATACGAT-GCAGT-T---TTTACGC-T--GT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCTGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TTCTG----AA---TACTTTAAGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CA--T--CAAAA-TGATTTTATTCTTT-GA--T-T-AAAAAATGAA-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TC--------CTAT-CGATACATTTTA-ACAA---ACACACGC-TACCTGCT-CAAAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--C-----TACTA
gi|29828 : ATATAGTACGAT-GCCGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTTG---------TAT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGTATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGTAA---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-ACCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCTTTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29829 : ATATGGCACGAT-GCAGA-T---TTTACGT-T--AT-TAGGAC-C-AA-TG-TAGA-ATTA-A--ATTTG---------TTT-TAT-AAAA------T--AT--AAAACCCGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TGCTG----AA---TACTTAATAGATTTTC-ATG--AAA-AAA----CCCAT--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---AAT--C-T-TAAAA-A--CT--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATGTA-GCCTATATCATTTCAAAAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29830 : ATATCGTACGAA-GCGAA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AG-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AA--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----TA---TACTTAATGGAATTTG-ATA--AAATAAA----CT--T--TAAAA-TGA-TGTATTCTTT-AA--T-C-AAACAATGAA-AATGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCATATCGAGCTAT-CGGTACGTTTTA-ACAG---TTCCACGC-TACCTGTT-TTAAATATA-GCCTATATCATTACAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29831 : ACATCGTACGAA-GCTCA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CATA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TATAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCCCTACATTGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29832 : ACATCGTACGAA-GCAGA-T---TTTACGC-T--AT-TACG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--TTTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCTGTTTAG--TTATT-T--TAACT-TTCTA----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AACA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---ATCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATAATTACAATTAAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29833 : ACATCGTACGAT-GCAGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--ACA-CCCGTTTAG--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTGATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTACTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CT--T--TGC-TCCTGTCGATCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCTCTACAATGGAA--A--CG----TACTAGTT
gi|29834 : ACATCGTACGAA-GCGAA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAG-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-TCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTA----AA---TACTTAATAGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGT-TTTATTATTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TGAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTGAATATA-GCCTATATCACTACAATGTAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29835 : ATATGGTATGAT-GCTGC-T---TTTACGC-A--AT--AGG-CTC-AA-GG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TT--T-T--TAACT-TTCTG----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATG--AAAAAAAAACACG--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-GA--T-A-AAAAAAAGAA-TATGT-T---AAAC---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTAT---------CGATACGTTTTA-ACAA---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATT-ACCTATATTATTCCAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29836 : ATATCGTACGAT-GCAAA-T---TTTACGT-T--TT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AGA-CCCGTTAAA--TTATT-C--TAACT-TTCGT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--TAAAA-TGA-TGTGTTCTTT-AA--C-C-AAAGAATGAC-AATGT-A---AAAC---GAT--C-C-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-AGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTGAATATA-GCCTTTATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29837 : ATATGGTACGAT-GCAGA-T---TTTACGC-TCCAT-TAGG-C-CGAA-TG-TGAA-ATTA-A--ATTAAAATTTAGTTTTT-TTT-GACA------A--AT--ATA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TTACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAA-AAG----CT--TGTCAGAA-TAA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGAAACGTTTAA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAACTATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CG----TTCTAGCT
gi|29838 : ACATCGTACGAA-GCCGA-T---TTT-CGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-AG-AAAA-CATA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCATTTAA--TTATT-C--TAATT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TTA-TTTATTCCTT-AA--T-C-AAAGAATTAA-AATGT-A---AACA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAACACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAACGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29839 : ACATCGTACGAA-GCTGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATAAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TCCGT----AA---TACTTGATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TAA-TTTATTCTTT-AA--T-A-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--T-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TTCTTTCAATTTAT-GAAGACGTTTAA-ACAA---TTTCACGC-TAGCTGAT-CTAAATATT-GCCTATATCACTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29840 : ATATGGTACGTT-GCGGC-T---TAAACGC-T--AT-AAGG-C-CCAA-TG-TAAA-TTTT-A--ATTAG---------TTT-GAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTTTCTTAA---TGCTTAATGGAATTTG-ATG--AAAAAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-TA--T-C-AAAGAATGAA-CATGT-T---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTCT-ACGT---TTTCA--------TGTT-CTATATATA-GCCTATATCATTACAATAGAC--A--CC----TGCTAGCT
gi|29841 : ACATCGTACGAA-GCAGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C---AA-TG-TAAA-CCTG-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TATCT-TTCTT----AA---TACTTAATAGAAAACG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AACGT-A---AAAAA--TAT--C-T----------------------CCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACTT-TACCTGAC-CTAAATATA-ACCTATATCACTACAGTGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29842 : ATATTGTACGAT-GCGGA-T---TCTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AAATG-CAAA-CTTA-G--ATTAG---------TTT-TAT-GGCA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TAATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACATAAAGG
gi|29843 : ATATGGTACGAT-GCGGA-T---TATACGC-T--GT-TAGG-C-C-AAATG-TAAA-ATTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAA------T--AT--AAA-CACGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TGCTG----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATGAAAAAAAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TTTAGTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAC-TACGT-T---AAA
gi|29844 : ATATCGTACGAT-GCGTC-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-CTTT-A--ATTAG---------TTT-TATAAATA------A--AT---AA-CCCGTTTAA--TTATT-T--TAACT-TTCTG----AA---TACTAAATGGAATTTC-GTG--AAATAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TATATTCTTT--------------GTGAA-AACGT-A---AAA
gi|29845 : ATATCATACGAT-TCAAAAC---TGTAC------AG-AAGG-T-T-AT-TGGTAAA-ATGA-A--GTTAG---------TTT-TAC-AAAA------A--AT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT-C--TAAAA-TGCTC----AT---TACTCAACGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CG--T--AAAAA-TGA-CATATTTCTT-AA--C-C-GAA-AAT--A-AATGT-----AAAA---CAT--C-TCTAAAATA--TT--T--TGT-CCTTATCTATCTAA-CGATGAG-TTAA-ACAA---ACCTGTAC-TGTGTGACTCTGTACAT--GTCTATACAATT
gi|29846 : ATATCGTACGATTACAAA-T---GT-ACA--T--AA-AAGG-C-T-AAAGG-TAAA-ATAT-G--ATTA----------TTT-TA---ACA------ATAAT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT-CC-TAAAA-TGCTC----AT---TACTT--------TTT-ATA--AAATAAA----TG--T--CAAAA-TAA-CTTATTCTTT-TACCT-C-AA--ACTGAA-TATGT-----AAAA---TAT--A-T-TTGAA-A--TGTTT--TAA-TCCTACCTATCTAG-CGAGAAG-TTAA-ACAG---ACCTACGT-TACTTGAC-C--GATATACGTCTATA
gi|29847 : ATGTCGTACGAT-ACAAA-T---GT-ACAA-C--AT--AGG-T-T-AAATG-TGAA-C--A-ATGATAAG---------TTT-TAA-AATA------A--TT--ATT-CCC-TTTAC--TTTTT-CC-TAAAA-TACTC----AT---TACTCGACTGATTTTT-ATA--GAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CTAATTCTTT-AA--C-C-
gi|29848 : TATGGTACGAT-GCGGC-T---TTTACGC-T--AT-TAGACC-C-AA-TG-TGAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTGTT-T--TAAC--TTCTG----AA---TACTTGATGGAATTTT-AAT--AAATAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--TG--T--TAC-TCCTAAAGATATAT-CGATACGTTTTA-ACAA---ACACACGC-TATCTGCT-CTAAATATA-GCCTTTATCATTCCAATAG-T--A--CG----TACTAG
gi|29849 : TATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AG-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTG-A--ATCAG---------TTT-T--------------------------------------TT-T--TAACT-TTCAT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTTTTT-AA--T-A-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAA-TCCTATCGAGCTAT-CGATTCGTTCTA-ACAT---GCCCACGC-TACCTGTC-CTTAATATA-ACCTATATCATTACAATTGAC--A--CG----TAATAGCT
gi|29850 : TATCGTACGAT-GTG---T---CTTACGA-T--AAATAGG-CTC-AA-TG-TTTA-TTTA-T--ATTAG---------TTT-TAC-AAAATTTAATA--AT--AAA------TTAT--TT-TT-C--TTATT-TTCTG----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATG--AAATAAA----CA--T--AAAAAATGA-TTTAGTCTTT-GA--T-A-AAATAATGAA-TATGT-T---TAAA---TAT--CGT-TAT------CG--T--CACATCCTATC----TAT-CGATACGTTTTA-ACCA---ATCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GATAACATCATTCCAATAGAC--A--CG----TAC
gi|29851 : TATCGGACGAT-AC--A-TCAATGTACAAAT--AT---GG-C-T-AACTG-TAAA-CTAT-A--GTTAG---------GTT-TA----CA------ATGAT--AAA-TCAATTTAC--TT-TT-CCCTGAAA-TACAC----AT---TACTTAACAGATTTTT-ATG--TAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-TATAATCTTT-AA--TAC-AAA-AATGAA-TATGT-A---AAAA---TATC-C-T-TAAA
gi|29852 : ATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AG-AAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AGA-CCCATTTAA--TTACT-C--TAATT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTC-AA--C-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AACA---GAT--C-T-TTAAA-A--CG--T--TAC-TCATATCGAGCTAT-CGATACGTTTCA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAACATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TTTTAGCTctatgtttaacaaacttacgctacttg
gi|29853 : -T---TTTACAA-A--AT--AGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAC-AAAC------A--AT--AAA-CCCGTTCAA--TTAAT-T--GAACTATTTTG----A
gi|29854 : TA-A--AATAG---------TTAATAT-TACA------A--ATTTAAA-TCCGTT-AA--CTTTT-C--TTAAT-TCCTA----AA---TAATTAACGGACATT--ATG--AACTAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CTTAT-------A--C-C-AAA-AATAAATAATAT-AAATAAAA---TAT--G-T-TTAAA-A--CGCTT--TAT-TCTTATATACCTAG-CGATACGTTTAACACAG---TCATAAACTTACCCCAC-ATACATAT---TCTATAT
gi|29855 : ttacctttcaagtcacataCTC----AT---TACTCA-T--ATTATT-ATG--AAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CGTATTCTTT-AA--C-C-CAAAAACGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TTAAA-A--TG--T--TGC-Taccaat
gi|29856 : tatgctctaagcattatgaatataacttagttcaaaatatacttaataaaaaacgtctttacaaactgttagaaaaata-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCCTTTAT--TTATT-C--TAACT-TCCTT----AC---AACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATAT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGATCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAATGTGC--A--CG----TACTAGCTagcgatatatc
gi|29857 : AGG-C-T-AAAGG-TAAA-CTAT-G--ATTAG---------TTT-TAT-AAT-------A--AT--TAA-TCCTTTTAT--TTTTTCC--TAAAA-TGCTG----AT---AACTCTACGGATTCTT-ATA--AAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CTTATTCTTT-AC--A-C-CACGAATGAA-TATGT---------TTTTTT--T-T-TAAAT-G--TG--T--TAT-TTCTATCTA-TTATGCAACAAG-TTTA-ACAA---ACCTAAAC-TACTTG
gi|29858 : AGG-C-T-AA-TGGTAAAACT---G--ATTAG---------TTT-AAC-AATA------A--TT--AAA-CCC-TTTACT-TTTTT-C--TAAAA-TACTC----AT---TACTCAACGAATTTTT-ATG--AAGTCGA----TG--T--CGAAA-TGA-CTT-TTTTTA-AA--C-C-AAA-AATGAA-TATGT-A---AAAA---TAT----T-TAAAA-ATGTG--T--TAT-CCCTATCTATCTA----ATAAG-TTAA-ACAAACCTTCTA----TACTTGAC-CGATATAT--GTCTATA
gi|29859 : -C-C-AA-TAACATA-CTTATG--ATTAG---------TTT-TAC-AATA------A---C--AAA-TCCCTTTTC--TTTTT-C--TAAAA-TGCTA----AT---TACTCAATGGATTTTT-ATA--AAATAAA----CG--T--CAATA-TTA-CTTTTTCTTT-AAC-C-C-CAAAAATGAA-CATGT------AAA---TAC--C-T-TTAAA-A--TGCTT--TAT-CCCAATCTAACTAG-TGATACG-TTAA-ACAA---AGCTA-AC-CACTTGGC-T--GATATA-G
gi|29860 : -AA-GG-TAAA-CTAT-G--ATTAG---------TAT-TAC-GGTA------A---T--ACA-TCC-TTTAC--TTTTT-CC-TAAAA-TGCGC----AT---TACTCAACGGATTTTTTATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-CTTATTCTTT-AA--C-C-CAAAATTGAA-TATGT-----AAAA---TAT--A-T-TTAAA-A--TG--TGATAT-TCCTATCTATCTAT-CTATAAG-TTAA-ACAA---ACCTACAC-TACTTGAC-C--GATATACGTTTATA
gi|29861 : G-TAAA-ATAG-G--ATTAA---------TTT-TAC-AA-A------A--AT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT-C--TCAAA-TACTC----AT---CATTCAACGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CG--T--AAACA-TGA-CTTATTCTTG-AA--C-CTTAAGAATGAA-TATAT-A---CAAA---TAT--C-T-TTAAA-A--TGTTT--TAT-CCCTATCTATCAAG-CGATAAG-TTTA-ACAA---ACCTACTC-TACTTGAC-C--GATATACGTCTA------TACAATGTACATA--CGTTGTTATTAGCT
gi|29862 : --ATTAG---------TTT-TAT-GAAT------A--AT--AAA-CTCATTTAA--TTGTT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTC-ATG--AAAAAAA----CTG-T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-T-AAAGATTGAA-TCTGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAA-TCCTATTGATCTAT-C--TATGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCAGTT-CTAAATATA-TCCTATATCATTTCAGTAGAC--A--CA----TACTAGCT
gi|29863 : --ATTAG---------TT---A--AACAGT----A--AT--AAA-TCCATTTACGTTTTTT-C--TAAA----ATA----AACATTACTCAATGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-C---TTCTTTGAA--C-C-AAA-AATGAA-TATGT-A---AAAA---TATTCT-T-TAAAT-G--TT--T--TAC-CCGTATTTATCTGG-CGGTAAG-TTTA-ACAA---ACCTACTC-AACTTGAC-T--GATATA--CTTCTA----TACAATGTAC--ATTCGTTGTTATTAGCT
gi|29864 : T--AAA-CCCGTTTAA--TTAAT-C--TAACT-TTCTT----AA---TATTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----C---T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-G-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGATCTAT-TAATATTTTTTA-ATAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCCCTACAATGGAC--A--CG----TATTAG
gi|29865 : CCTAATGAAATTTG-ATG--AAATTAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGGA-AATGT-A---AAAC---GAT--C-T-TAAAA-A--TG--T--TAC-TCCTATTAAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAT---TTCCACGC-TATCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACCAGCT
gi|29866 : -ATA--AAAAAAA----G------CACAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-T-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATTGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACAC-AACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29867 : --AAAAAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTC-AA--T-C-AAAGAATGAC-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--C--TAC-ACCTTTAGAGCTTT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTCAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CA----TACTAGCT
Alignments
lowQualScore : 1 2 1 222 1 11 2 2 8 3 6 3 1 1 11 333333333 1 1 1 444444 22 11 0 22 4 0 44 0 22222 111 1 22 11 1111 444 11 0 0 0 22 0 0 1 11 66666 2222 22 1 1 1 11 55 11 1 3 1 0 1 3333 1 1 1 3 0 11 11 5555
lowQualScore : . . . ... . .. . . . . . . . . .. ......... . . . ...... .. .. . .. . . .. . ..... ... . .. .. .... ... .. . . . .. . . . .. ..... .... .. . . . .. .. .. . . . . . .... . . . . . .. .. ....
lowQualScore : 2 0 2 111 2 66 4 2 6 2 3 1 0 0 33 888888888 0 0 2 000000 66 33 9 22 6 9 11 9 99999 666 3 88 22 9999 888 22 9 9 9 11 9 9 1 99 88888 9999 33 0 0 0 33 44 33 0 1 0 8 0 1111 0 0 0 1 6 77 77 2222
consensus : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTN----AA---TACTTAATGGANTTTN-ATG--AAATAAA----CN--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-NATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGNC-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
Reference ( family-509 ) : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTN----AA---TACTTAATGGANTTTN-ATG--AAATAAA----CN--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-NATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGNC-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29821 : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTATAT--TTGTT-C--TAACA-TTCTG----AA---TATTTAATGGATTTTC-ATG--AAAAAAC----CG--T--TCAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAATAATGAA-TATGT-T---AAAA---CAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGTTTT-CGATACGTTTTA-ACAT---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GCATATATCATTCCAATAGAC--A--TG----TACTAGCT
gi|29822 : ATATCGTACGGT-GCTGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TTCTA----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATG--AAATAAA----CA--T--CAAAA-GGA-TTTATCCTTT-AA--T-C-AAAAAATGAA-TATTT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATCGTATT-T-TAAGATCTTTTA-AGAA---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GGCGATATCATTCCAAGAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29823 : ATATGGTACGAT-GCGCA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-CGAA-TG-TAAA-ATTA-A--TTTTG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTAAATGGAATTTG-ATG--AAA-AAA----CT--G--CCAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29824 : ATATCGTACGAA-GCCGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-CAT-GACA------A--AT--AAA-TCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAC---GAT--G-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATCGAACTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTTAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGTT
gi|29825 : ACATCGCACGAT-GCGGA-T---TTTACAC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTGAA--TTATT-C--TAACT-TTTTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCCAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAATGTAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29826 : ATATCGTACGAT-GCG---T---CTTACGA-T--AAATAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAC-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTCA--TT-TT-C--TAACT-TTCTG----AA---TACTTATTGAATTTTC-ATG--AAATAAA----CA--T--AAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAAAATGAA-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T--GAAA-C--CG--T--TAC-TCCTATTGATCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---ACCCACGC-TACCTGCG-CTAAATAAA-GTCTATATCATTCCAAAAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29827 : ATATCATACGAT-GCAGT-T---TTTACGC-T--GT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCTGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TTCTG----AA---TACTTTAAGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CA--T--CAAAA-TGATTTTATTCTTT-GA--T-T-AAAAAATGAA-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TC--------CTAT-CGATACATTTTA-ACAA---ACACACGC-TACCTGCT-CAAAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--C-----TACTA
gi|29828 : ATATAGTACGAT-GCCGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTTG---------TAT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGTATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGTAA---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-ACCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCTTTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29829 : ATATGGCACGAT-GCAGA-T---TTTACGT-T--AT-TAGGAC-C-AA-TG-TAGA-ATTA-A--ATTTG---------TTT-TAT-AAAA------T--AT--AAAACCCGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TGCTG----AA---TACTTAATAGATTTTC-ATG--AAA-AAA----CCCAT--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---AAT--C-T-TAAAA-A--CT--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATGTA-GCCTATATCATTTCAAAAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29830 : ATATCGTACGAA-GCGAA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AG-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AA--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----TA---TACTTAATGGAATTTG-ATA--AAATAAA----CT--T--TAAAA-TGA-TGTATTCTTT-AA--T-C-AAACAATGAA-AATGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCATATCGAGCTAT-CGGTACGTTTTA-ACAG---TTCCACGC-TACCTGTT-TTAAATATA-GCCTATATCATTACAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29831 : ACATCGTACGAA-GCTCA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CATA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TATAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCCCTACATTGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29832 : ACATCGTACGAA-GCAGA-T---TTTACGC-T--AT-TACG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--TTTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCTGTTTAG--TTATT-T--TAACT-TTCTA----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AACA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---ATCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATAATTACAATTAAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29833 : ACATCGTACGAT-GCAGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--ACA-CCCGTTTAG--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTGATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTACTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CT--T--TGC-TCCTGTCGATCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCTCTACAATGGAA--A--CG----TACTAGTT
gi|29834 : ACATCGTACGAA-GCGAA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAG-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-TCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTA----AA---TACTTAATAGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGT-TTTATTATTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TGAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTGAATATA-GCCTATATCACTACAATGTAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29835 : ATATGGTATGAT-GCTGC-T---TTTACGC-A--AT--AGG-CTC-AA-GG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TT--T-T--TAACT-TTCTG----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATG--AAAAAAAAACACG--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-GA--T-A-AAAAAAAGAA-TATGT-T---AAAC---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTAT---------CGATACGTTTTA-ACAA---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATT-ACCTATATTATTCCAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29836 : ATATCGTACGAT-GCAAA-T---TTTACGT-T--TT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AGA-CCCGTTAAA--TTATT-C--TAACT-TTCGT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--TAAAA-TGA-TGTGTTCTTT-AA--C-C-AAAGAATGAC-AATGT-A---AAAC---GAT--C-C-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-AGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTGAATATA-GCCTTTATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29837 : ATATGGTACGAT-GCAGA-T---TTTACGC-TCCAT-TAGG-C-CGAA-TG-TGAA-ATTA-A--ATTAAAATTTAGTTTTT-TTT-GACA------A--AT--ATA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TTACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAA-AAG----CT--TGTCAGAA-TAA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGAAACGTTTAA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAACTATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CG----TTCTAGCT
gi|29838 : ACATCGTACGAA-GCCGA-T---TTT-CGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-AG-AAAA-CATA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCATTTAA--TTATT-C--TAATT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TTA-TTTATTCCTT-AA--T-C-AAAGAATTAA-AATGT-A---AACA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAACACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAACGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29839 : ACATCGTACGAA-GCTGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATAAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TCCGT----AA---TACTTGATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TAA-TTTATTCTTT-AA--T-A-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--T-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TTCTTTCAATTTAT-GAAGACGTTTAA-ACAA---TTTCACGC-TAGCTGAT-CTAAATATT-GCCTATATCACTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29840 : ATATGGTACGTT-GCGGC-T---TAAACGC-T--AT-AAGG-C-CCAA-TG-TAAA-TTTT-A--ATTAG---------TTT-GAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTTTCTTAA---TGCTTAATGGAATTTG-ATG--AAAAAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-TA--T-C-AAAGAATGAA-CATGT-T---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTCT-ACGT---TTTCA--------TGTT-CTATATATA-GCCTATATCATTACAATAGAC--A--CC----TGCTAGCT
gi|29841 : ACATCGTACGAA-GCAGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C---AA-TG-TAAA-CCTG-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TATCT-TTCTT----AA---TACTTAATAGAAAACG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AACGT-A---AAAAA--TAT--C-T----------------------CCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACTT-TACCTGAC-CTAAATATA-ACCTATATCACTACAGTGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29842 : ATATTGTACGAT-GCGGA-T---TCTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AAATG-CAAA-CTTA-G--ATTAG---------TTT-TAT-GGCA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TAATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACATAAAGG
gi|29843 : ATATGGTACGAT-GCGGA-T---TATACGC-T--GT-TAGG-C-C-AAATG-TAAA-ATTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAA------T--AT--AAA-CACGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TGCTG----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATGAAAAAAAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TTTAGTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAC-TACGT-T---AAA
gi|29844 : ATATCGTACGAT-GCGTC-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-CTTT-A--ATTAG---------TTT-TATAAATA------A--AT---AA-CCCGTTTAA--TTATT-T--TAACT-TTCTG----AA---TACTAAATGGAATTTC-GTG--AAATAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TATATTCTTT--------------GTGAA-AACGT-A---AAA
gi|29845 : ATATCATACGAT-TCAAAAC---TGTAC------AG-AAGG-T-T-AT-TGGTAAA-ATGA-A--GTTAG---------TTT-TAC-AAAA------A--AT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT-C--TAAAA-TGCTC----AT---TACTCAACGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CG--T--AAAAA-TGA-CATATTTCTT-AA--C-C-GAA-AAT--A-AATGT-----AAAA---CAT--C-TCTAAAATA--TT--T--TGT-CCTTATCTATCTAA-CGATGAG-TTAA-ACAA---ACCTGTAC-TGTGTGACTCTGTACAT--GTCTATACAATT
gi|29846 : ATATCGTACGATTACAAA-T---GT-ACA--T--AA-AAGG-C-T-AAAGG-TAAA-ATAT-G--ATTA----------TTT-TA---ACA------ATAAT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT-CC-TAAAA-TGCTC----AT---TACTT--------TTT-ATA--AAATAAA----TG--T--CAAAA-TAA-CTTATTCTTT-TACCT-C-AA--ACTGAA-TATGT-----AAAA---TAT--A-T-TTGAA-A--TGTTT--TAA-TCCTACCTATCTAG-CGAGAAG-TTAA-ACAG---ACCTACGT-TACTTGAC-C--GATATACGTCTATA
gi|29847 : ATGTCGTACGAT-ACAAA-T---GT-ACAA-C--AT--AGG-T-T-AAATG-TGAA-C--A-ATGATAAG---------TTT-TAA-AATA------A--TT--ATT-CCC-TTTAC--TTTTT-CC-TAAAA-TACTC----AT---TACTCGACTGATTTTT-ATA--GAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CTAATTCTTT-AA--C-C-
gi|29848 : TATGGTACGAT-GCGGC-T---TTTACGC-T--AT-TAGACC-C-AA-TG-TGAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTGTT-T--TAAC--TTCTG----AA---TACTTGATGGAATTTT-AAT--AAATAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--TG--T--TAC-TCCTAAAGATATAT-CGATACGTTTTA-ACAA---ACACACGC-TATCTGCT-CTAAATATA-GCCTTTATCATTCCAATAG-T--A--CG----TACTAG
gi|29849 : TATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AG-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTG-A--ATCAG---------TTT-T--------------------------------------TT-T--TAACT-TTCAT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTTTTT-AA--T-A-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAA-TCCTATCGAGCTAT-CGATTCGTTCTA-ACAT---GCCCACGC-TACCTGTC-CTTAATATA-ACCTATATCATTACAATTGAC--A--CG----TAATAGCT
gi|29850 : TATCGTACGAT-GTG---T---CTTACGA-T--AAATAGG-CTC-AA-TG-TTTA-TTTA-T--ATTAG---------TTT-TAC-AAAATTTAATA--AT--AAA------TTAT--TT-TT-C--TTATT-TTCTG----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATG--AAATAAA----CA--T--AAAAAATGA-TTTAGTCTTT-GA--T-A-AAATAATGAA-TATGT-T---TAAA---TAT--CGT-TAT------CG--T--CACATCCTATC----TAT-CGATACGTTTTA-ACCA---ATCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GATAACATCATTCCAATAGAC--A--CG----TAC
gi|29851 : TATCGGACGAT-AC--A-TCAATGTACAAAT--AT---GG-C-T-AACTG-TAAA-CTAT-A--GTTAG---------GTT-TA----CA------ATGAT--AAA-TCAATTTAC--TT-TT-CCCTGAAA-TACAC----AT---TACTTAACAGATTTTT-ATG--TAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-TATAATCTTT-AA--TAC-AAA-AATGAA-TATGT-A---AAAA---TATC-C-T-TAAA
gi|29852 : ATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AG-AAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AGA-CCCATTTAA--TTACT-C--TAATT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTC-AA--C-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AACA---GAT--C-T-TTAAA-A--CG--T--TAC-TCATATCGAGCTAT-CGATACGTTTCA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAACATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TTTTAGCTctatgtttaacaaacttacgctacttg
gi|29853 : -T---TTTACAA-A--AT--AGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAC-AAAC------A--AT--AAA-CCCGTTCAA--TTAAT-T--GAACTATTTTG----A
gi|29854 : TA-A--AATAG---------TTAATAT-TACA------A--ATTTAAA-TCCGTT-AA--CTTTT-C--TTAAT-TCCTA----AA---TAATTAACGGACATT--ATG--AACTAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CTTAT-------A--C-C-AAA-AATAAATAATAT-AAATAAAA---TAT--G-T-TTAAA-A--CGCTT--TAT-TCTTATATACCTAG-CGATACGTTTAACACAG---TCATAAACTTACCCCAC-ATACATAT---TCTATAT
gi|29855 : ttacctttcaagtcacataCTC----AT---TACTCA-T--ATTATT-ATG--AAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CGTATTCTTT-AA--C-C-CAAAAACGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TTAAA-A--TG--T--TGC-Taccaat
gi|29856 : tatgctctaagcattatgaatataacttagttcaaaatatacttaataaaaaacgtctttacaaactgttagaaaaata-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCCTTTAT--TTATT-C--TAACT-TCCTT----AC---AACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATAT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGATCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAATGTGC--A--CG----TACTAGCTagcgatatatc
gi|29857 : AGG-C-T-AAAGG-TAAA-CTAT-G--ATTAG---------TTT-TAT-AAT-------A--AT--TAA-TCCTTTTAT--TTTTTCC--TAAAA-TGCTG----AT---AACTCTACGGATTCTT-ATA--AAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CTTATTCTTT-AC--A-C-CACGAATGAA-TATGT---------TTTTTT--T-T-TAAAT-G--TG--T--TAT-TTCTATCTA-TTATGCAACAAG-TTTA-ACAA---ACCTAAAC-TACTTG
gi|29858 : AGG-C-T-AA-TGGTAAAACT---G--ATTAG---------TTT-AAC-AATA------A--TT--AAA-CCC-TTTACT-TTTTT-C--TAAAA-TACTC----AT---TACTCAACGAATTTTT-ATG--AAGTCGA----TG--T--CGAAA-TGA-CTT-TTTTTA-AA--C-C-AAA-AATGAA-TATGT-A---AAAA---TAT----T-TAAAA-ATGTG--T--TAT-CCCTATCTATCTA----ATAAG-TTAA-ACAAACCTTCTA----TACTTGAC-CGATATAT--GTCTATA
gi|29859 : -C-C-AA-TAACATA-CTTATG--ATTAG---------TTT-TAC-AATA------A---C--AAA-TCCCTTTTC--TTTTT-C--TAAAA-TGCTA----AT---TACTCAATGGATTTTT-ATA--AAATAAA----CG--T--CAATA-TTA-CTTTTTCTTT-AAC-C-C-CAAAAATGAA-CATGT------AAA---TAC--C-T-TTAAA-A--TGCTT--TAT-CCCAATCTAACTAG-TGATACG-TTAA-ACAA---AGCTA-AC-CACTTGGC-T--GATATA-G
gi|29860 : -AA-GG-TAAA-CTAT-G--ATTAG---------TAT-TAC-GGTA------A---T--ACA-TCC-TTTAC--TTTTT-CC-TAAAA-TGCGC----AT---TACTCAACGGATTTTTTATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-CTTATTCTTT-AA--C-C-CAAAATTGAA-TATGT-----AAAA---TAT--A-T-TTAAA-A--TG--TGATAT-TCCTATCTATCTAT-CTATAAG-TTAA-ACAA---ACCTACAC-TACTTGAC-C--GATATACGTTTATA
gi|29861 : G-TAAA-ATAG-G--ATTAA---------TTT-TAC-AA-A------A--AT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT-C--TCAAA-TACTC----AT---CATTCAACGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CG--T--AAACA-TGA-CTTATTCTTG-AA--C-CTTAAGAATGAA-TATAT-A---CAAA---TAT--C-T-TTAAA-A--TGTTT--TAT-CCCTATCTATCAAG-CGATAAG-TTTA-ACAA---ACCTACTC-TACTTGAC-C--GATATACGTCTA------TACAATGTACATA--CGTTGTTATTAGCT
gi|29862 : --ATTAG---------TTT-TAT-GAAT------A--AT--AAA-CTCATTTAA--TTGTT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTC-ATG--AAAAAAA----CTG-T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-T-AAAGATTGAA-TCTGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAA-TCCTATTGATCTAT-C--TATGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCAGTT-CTAAATATA-TCCTATATCATTTCAGTAGAC--A--CA----TACTAGCT
gi|29863 : --ATTAG---------TT---A--AACAGT----A--AT--AAA-TCCATTTACGTTTTTT-C--TAAA----ATA----AACATTACTCAATGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-C---TTCTTTGAA--C-C-AAA-AATGAA-TATGT-A---AAAA---TATTCT-T-TAAAT-G--TT--T--TAC-CCGTATTTATCTGG-CGGTAAG-TTTA-ACAA---ACCTACTC-AACTTGAC-T--GATATA--CTTCTA----TACAATGTAC--ATTCGTTGTTATTAGCT
gi|29864 : T--AAA-CCCGTTTAA--TTAAT-C--TAACT-TTCTT----AA---TATTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----C---T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-G-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGATCTAT-TAATATTTTTTA-ATAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCCCTACAATGGAC--A--CG----TATTAG
gi|29865 : CCTAATGAAATTTG-ATG--AAATTAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGGA-AATGT-A---AAAC---GAT--C-T-TAAAA-A--TG--T--TAC-TCCTATTAAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAT---TTCCACGC-TATCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACCAGCT
gi|29866 : -ATA--AAAAAAA----G------CACAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-T-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATTGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACAC-AACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29867 : --AAAAAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTC-AA--T-C-AAAGAATGAC-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--C--TAC-ACCTTTAGAGCTTT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTCAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CA----TACTAGCT
blockSeqs : T T A CAA A CC A A T G A G A T TG AATTTAGTT A TTTAAT TA TT GT G CC TTCTT CAT T TT AA AACA CCA GT CC A TA AAAT TTTT TC TG TT GA A G C ACCT T C T C AT TT TTGT
blockSeqs : . G . . . . A C T G A G . . . . C GT TG . T A C A . A C . . TG . C G T AA AT C . CT . G . . A . T . C . . TTGT
blockSeqs : . C . . . . . . T C A A . . . . C . . . . A C T . A G . . A . . G T T G . . CT . A . . T . T . C . . .
blockSeqs : . G . . . . . . T . A . . . . . C . . . . A C T . A G . . T . . G A A G . . TT . G . . T . A . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . T . C . . . . . A . . . . G . T . T G . . T . . A T A G . . . . T . . T . C . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . T . A . . . . . A . . . . A . G . T C . . T . . A T T T . . . . G . . A . C . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . T . . . . . . . C . . . . G . G . A T . . A . . G T T G . . . . G . . A . T . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . T . T G . . A . . G A T G . . . . G . . T . T . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . G . A C . . T . . C T T G . . . . G . . T . T . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . T . A G . . T . . G A A A . . . . G . . T . A . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . T . A G . . T . . G A A G . . . . T . . T . A . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . A . A G . . T . . G A A T . . . . G . . A . A . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . T . A G . . T . . G A A T . . . . G . . T . A . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . A . T G . . T . . A A A T . . . . G . . T . C . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . G . A C . . G . . G T T T . . . . G . . A . T . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . T . A G . . T . . G A A G . . . . T . . T . T . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . T . A G . . T . . G T A G . . . . G . . T . A . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . T . A G . . T . . G A A G . . . . G . . T . A . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . T . A G . . T . . G A A T . . . . T . . T . T . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . G . T . A G . . T . . G C T T . . . . T . . T . A . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . T . T G . . T . . G A A T . . . . T . . T . A . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . G . A C . . A . . G T T C . . . . G . . A . A . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . G . T C . . A . . G A A T . . . . G . . A . C . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . C . T T . . G . . T A T T . . . . C . . A . T . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . C . . . . G . C . A T . . G . . G T A T . . . . T . . G . C . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . C . A T . . G . . A T T T . . . . T . . A . T . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . G . T T . . A . . G A A T . . . . A . . T . A . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . T . T G . . T . . G T A G . . . . T . . T . A . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . A . G . A C . . A . . A T A T . . . . T . . T . A . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . C . C T . . G . . A A A T . . . . T . . A . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . T . T G . . T . . G A A T . . . . T . . A . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . T . G . A T . . G . . G A A T . . . . T . . A . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . T . A . T G . . G . . G T A T . . . . G . . A . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . T . C . T T . . T . . G T A T . . . . G . . T . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . G . T . T T . . G . . G C A T . . . . G . . A . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . T . G . T T . . G . . G T A G . . . . . . . T . T . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . A . C . T T . . G . . . T T T . . . . . . . T . T . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . A . A C . . T . . . T T T . . . . . . . T . T . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . C . T T . . G . . . T . G . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . C . A G . . G . . . A . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . A G . . T . . . A . G .
blockSeqs : . . . . A . . . . . A . . . T .
blockSeqs : T . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTN----AA---TACTTAATGGANTTTN-ATG--AAATAAA----CN--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-NATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGNC-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
finalCons : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTN----AA---TACTTAATGGANTTTN-ATG--AAATAAA----CN--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-NATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGNC-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
Alignments
lowQualScore : 1 2 1 222 1 11 2 2 8 3 6 3 1 1 11 333333333 1 1 1 444444 22 11 0 22 4 0 44 0 22222 111 1 22 11 1111 444 11 0 0 0 22 0 0 1 11 66666 2222 22 1 1 1 11 55 11 1 3 1 0 1 3333 1 1 1 3 0 11 11 5555
lowQualScore : . . . ... . .. . . . . . . . . .. ......... . . . ...... .. .. . .. . . .. . ..... ... . .. .. .... ... .. . . . .. . . . .. ..... .... .. . . . .. .. .. . . . . . .... . . . . . .. .. ....
lowQualScore : 2 0 2 111 2 66 4 2 6 2 3 1 0 0 33 888888888 0 0 2 000000 66 33 9 22 6 9 11 9 99999 666 3 88 22 9999 888 22 9 9 9 11 9 9 1 99 88888 9999 33 0 0 0 33 44 33 0 1 0 8 0 1111 0 0 0 1 6 77 77 2222
consensus : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTN----AA---TACTTAATGGANTTTN-ATG--AAATAAA----CN--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-NATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGNC-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
Reference ( family-509 ) : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTN----AA---TACTTAATGGANTTTN-ATG--AAATAAA----CN--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-NATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGNC-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29821 : ATATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTATAT--TTGTT-C--TAACA-TTCTG----AA---TATTTAATGGATTTTC-ATG--AAAAAAC----CG--T--TCAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAATAATGAA-TATGT-T---AAAA---CAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGTTTT-CGATACGTTTTA-ACAT---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GCATATATCATTCCAATAGAC--A--TG----TACTAGCT
gi|29822 : ATATCGTACGGT-GCTGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TTCTA----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATG--AAATAAA----CA--T--CAAAA-GGA-TTTATCCTTT-AA--T-C-AAAAAATGAA-TATTT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATCGTATT-T-TAAGATCTTTTA-AGAA---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GGCGATATCATTCCAAGAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29823 : ATATGGTACGAT-GCGCA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-CGAA-TG-TAAA-ATTA-A--TTTTG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTAAATGGAATTTG-ATG--AAA-AAA----CT--G--CCAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29824 : ATATCGTACGAA-GCCGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-CAT-GACA------A--AT--AAA-TCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAC---GAT--G-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATCGAACTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTTAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGTT
gi|29825 : ACATCGCACGAT-GCGGA-T---TTTACAC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTGAA--TTATT-C--TAACT-TTTTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCCAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAATGTAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29826 : ATATCGTACGAT-GCG---T---CTTACGA-T--AAATAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAC-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTCA--TT-TT-C--TAACT-TTCTG----AA---TACTTATTGAATTTTC-ATG--AAATAAA----CA--T--AAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAAAATGAA-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T--GAAA-C--CG--T--TAC-TCCTATTGATCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---ACCCACGC-TACCTGCG-CTAAATAAA-GTCTATATCATTCCAAAAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29827 : ATATCATACGAT-GCAGT-T---TTTACGC-T--GT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCTGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TTCTG----AA---TACTTTAAGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CA--T--CAAAA-TGATTTTATTCTTT-GA--T-T-AAAAAATGAA-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TC--------CTAT-CGATACATTTTA-ACAA---ACACACGC-TACCTGCT-CAAAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--C-----TACTA
gi|29828 : ATATAGTACGAT-GCCGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTTG---------TAT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGTATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGTAA---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-ACCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCTTTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29829 : ATATGGCACGAT-GCAGA-T---TTTACGT-T--AT-TAGGAC-C-AA-TG-TAGA-ATTA-A--ATTTG---------TTT-TAT-AAAA------T--AT--AAAACCCGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TGCTG----AA---TACTTAATAGATTTTC-ATG--AAA-AAA----CCCAT--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---AAT--C-T-TAAAA-A--CT--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAATGTA-GCCTATATCATTTCAAAAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29830 : ATATCGTACGAA-GCGAA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AG-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AA--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----TA---TACTTAATGGAATTTG-ATA--AAATAAA----CT--T--TAAAA-TGA-TGTATTCTTT-AA--T-C-AAACAATGAA-AATGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCATATCGAGCTAT-CGGTACGTTTTA-ACAG---TTCCACGC-TACCTGTT-TTAAATATA-GCCTATATCATTACAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29831 : ACATCGTACGAA-GCTCA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CATA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TATAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCCCTACATTGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29832 : ACATCGTACGAA-GCAGA-T---TTTACGC-T--AT-TACG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--TTTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCTGTTTAG--TTATT-T--TAACT-TTCTA----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AACA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---ATCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATAATTACAATTAAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29833 : ACATCGTACGAT-GCAGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--ACA-CCCGTTTAG--TTATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTGATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTACTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CT--T--TGC-TCCTGTCGATCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCTCTACAATGGAA--A--CG----TACTAGTT
gi|29834 : ACATCGTACGAA-GCGAA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAG-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-TCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTA----AA---TACTTAATAGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGT-TTTATTATTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TGAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTGAATATA-GCCTATATCACTACAATGTAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29835 : ATATGGTATGAT-GCTGC-T---TTTACGC-A--AT--AGG-CTC-AA-GG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TT--T-T--TAACT-TTCTG----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATG--AAAAAAAAACACG--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-GA--T-A-AAAAAAAGAA-TATGT-T---AAAC---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTAT---------CGATACGTTTTA-ACAA---ACCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATT-ACCTATATTATTCCAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29836 : ATATCGTACGAT-GCAAA-T---TTTACGT-T--TT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AGA-CCCGTTAAA--TTATT-C--TAACT-TTCGT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--TAAAA-TGA-TGTGTTCTTT-AA--C-C-AAAGAATGAC-AATGT-A---AAAC---GAT--C-C-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-AGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTGAATATA-GCCTTTATCATTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29837 : ATATGGTACGAT-GCAGA-T---TTTACGC-TCCAT-TAGG-C-CGAA-TG-TGAA-ATTA-A--ATTAAAATTTAGTTTTT-TTT-GACA------A--AT--ATA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TTACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAA-AAG----CT--TGTCAGAA-TAA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGAAACGTTTAA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAACTATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CG----TTCTAGCT
gi|29838 : ACATCGTACGAA-GCCGA-T---TTT-CGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-AG-AAAA-CATA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCATTTAA--TTATT-C--TAATT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TTA-TTTATTCCTT-AA--T-C-AAAGAATTAA-AATGT-A---AACA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGAGCTAT-CAACACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAACGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29839 : ACATCGTACGAA-GCTGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATAAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TCCGT----AA---TACTTGATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TAA-TTTATTCTTT-AA--T-A-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--T-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TTCTTTCAATTTAT-GAAGACGTTTAA-ACAA---TTTCACGC-TAGCTGAT-CTAAATATT-GCCTATATCACTACAATGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29840 : ATATGGTACGTT-GCGGC-T---TAAACGC-T--AT-AAGG-C-CCAA-TG-TAAA-TTTT-A--ATTAG---------TTT-GAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TAACT-TTCTTTCTTAA---TGCTTAATGGAATTTG-ATG--AAAAAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-TA--T-C-AAAGAATGAA-CATGT-T---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCCTATCGAGCTAT-CGATACGTTTCT-ACGT---TTTCA--------TGTT-CTATATATA-GCCTATATCATTACAATAGAC--A--CC----TGCTAGCT
gi|29841 : ACATCGTACGAA-GCAGA-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-C---AA-TG-TAAA-CCTG-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTATT-C--TATCT-TTCTT----AA---TACTTAATAGAAAACG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AACGT-A---AAAAA--TAT--C-T----------------------CCTATCGAGCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACTT-TACCTGAC-CTAAATATA-ACCTATATCACTACAGTGGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29842 : ATATTGTACGAT-GCGGA-T---TCTACGC-T--AT-TAGG-C-C-AAATG-CAAA-CTTA-G--ATTAG---------TTT-TAT-GGCA------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TAATT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACATAAAGG
gi|29843 : ATATGGTACGAT-GCGGA-T---TATACGC-T--GT-TAGG-C-C-AAATG-TAAA-ATTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAA------T--AT--AAA-CACGTTTAA--TTGTT-C--TAACT-TGCTG----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATGAAAAAAAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TTTAGTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAC-TACGT-T---AAA
gi|29844 : ATATCGTACGAT-GCGTC-T---TTTACGC-T--AT-TAGG-CTC-AA-TG-TAAA-CTTT-A--ATTAG---------TTT-TATAAATA------A--AT---AA-CCCGTTTAA--TTATT-T--TAACT-TTCTG----AA---TACTAAATGGAATTTC-GTG--AAATAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TATATTCTTT--------------GTGAA-AACGT-A---AAA
gi|29845 : ATATCATACGAT-TCAAAAC---TGTAC------AG-AAGG-T-T-AT-TGGTAAA-ATGA-A--GTTAG---------TTT-TAC-AAAA------A--AT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT-C--TAAAA-TGCTC----AT---TACTCAACGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CG--T--AAAAA-TGA-CATATTTCTT-AA--C-C-GAA-AAT--A-AATGT-----AAAA---CAT--C-TCTAAAATA--TT--T--TGT-CCTTATCTATCTAA-CGATGAG-TTAA-ACAA---ACCTGTAC-TGTGTGACTCTGTACAT--GTCTATACAATT
gi|29846 : ATATCGTACGATTACAAA-T---GT-ACA--T--AA-AAGG-C-T-AAAGG-TAAA-ATAT-G--ATTA----------TTT-TA---ACA------ATAAT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT-CC-TAAAA-TGCTC----AT---TACTT--------TTT-ATA--AAATAAA----TG--T--CAAAA-TAA-CTTATTCTTT-TACCT-C-AA--ACTGAA-TATGT-----AAAA---TAT--A-T-TTGAA-A--TGTTT--TAA-TCCTACCTATCTAG-CGAGAAG-TTAA-ACAG---ACCTACGT-TACTTGAC-C--GATATACGTCTATA
gi|29847 : ATGTCGTACGAT-ACAAA-T---GT-ACAA-C--AT--AGG-T-T-AAATG-TGAA-C--A-ATGATAAG---------TTT-TAA-AATA------A--TT--ATT-CCC-TTTAC--TTTTT-CC-TAAAA-TACTC----AT---TACTCGACTGATTTTT-ATA--GAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CTAATTCTTT-AA--C-C-
gi|29848 : TATGGTACGAT-GCGGC-T---TTTACGC-T--AT-TAGACC-C-AA-TG-TGAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-AAAT------A--AT--AAA-CCCGTTTAA--TTGTT-T--TAAC--TTCTG----AA---TACTTGATGGAATTTT-AAT--AAATAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--TG--T--TAC-TCCTAAAGATATAT-CGATACGTTTTA-ACAA---ACACACGC-TATCTGCT-CTAAATATA-GCCTTTATCATTCCAATAG-T--A--CG----TACTAG
gi|29849 : TATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AG-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTG-A--ATCAG---------TTT-T--------------------------------------TT-T--TAACT-TTCAT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTTTTT-AA--T-A-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAA-TCCTATCGAGCTAT-CGATTCGTTCTA-ACAT---GCCCACGC-TACCTGTC-CTTAATATA-ACCTATATCATTACAATTGAC--A--CG----TAATAGCT
gi|29850 : TATCGTACGAT-GTG---T---CTTACGA-T--AAATAGG-CTC-AA-TG-TTTA-TTTA-T--ATTAG---------TTT-TAC-AAAATTTAATA--AT--AAA------TTAT--TT-TT-C--TTATT-TTCTG----AA---TACTTAATGGATTTTC-ATG--AAATAAA----CA--T--AAAAAATGA-TTTAGTCTTT-GA--T-A-AAATAATGAA-TATGT-T---TAAA---TAT--CGT-TAT------CG--T--CACATCCTATC----TAT-CGATACGTTTTA-ACCA---ATCCACGC-TACCTGCT-CTAAATATA-GATAACATCATTCCAATAGAC--A--CG----TAC
gi|29851 : TATCGGACGAT-AC--A-TCAATGTACAAAT--AT---GG-C-T-AACTG-TAAA-CTAT-A--GTTAG---------GTT-TA----CA------ATGAT--AAA-TCAATTTAC--TT-TT-CCCTGAAA-TACAC----AT---TACTTAACAGATTTTT-ATG--TAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-TATAATCTTT-AA--TAC-AAA-AATGAA-TATGT-A---AAAA---TATC-C-T-TAAA
gi|29852 : ATCGTACGAT-GCGGA-T---TTTACGC-T--AG-AAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CTTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AGA-CCCATTTAA--TTACT-C--TAATT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTG-ATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTC-AA--C-C-AAAGAATGAA-AATGT-A---AACA---GAT--C-T-TTAAA-A--CG--T--TAC-TCATATCGAGCTAT-CGATACGTTTCA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTAAACATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TTTTAGCTctatgtttaacaaacttacgctacttg
gi|29853 : -T---TTTACAA-A--AT--AGG-CTC-AA-TG-TAAA-TTTA-A--ATTAG---------TTT-TAC-AAAC------A--AT--AAA-CCCGTTCAA--TTAAT-T--GAACTATTTTG----A
gi|29854 : TA-A--AATAG---------TTAATAT-TACA------A--ATTTAAA-TCCGTT-AA--CTTTT-C--TTAAT-TCCTA----AA---TAATTAACGGACATT--ATG--AACTAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CTTAT-------A--C-C-AAA-AATAAATAATAT-AAATAAAA---TAT--G-T-TTAAA-A--CGCTT--TAT-TCTTATATACCTAG-CGATACGTTTAACACAG---TCATAAACTTACCCCAC-ATACATAT---TCTATAT
gi|29855 : ttacctttcaagtcacataCTC----AT---TACTCA-T--ATTATT-ATG--AAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CGTATTCTTT-AA--C-C-CAAAAACGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TTAAA-A--TG--T--TGC-Taccaat
gi|29856 : tatgctctaagcattatgaatataacttagttcaaaatatacttaataaaaaacgtctttacaaactgttagaaaaata-T--AT-TAGG-C-C-AA-TG-TAAA-CCTA-A--ATTAG---------TTT-TAT-GACA------A--AT--AAA-CCCCTTTAT--TTATT-C--TAACT-TCCTT----AC---AACTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGAA-AATAT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGATCTAT-CAATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCACTACAATGTGC--A--CG----TACTAGCTagcgatatatc
gi|29857 : AGG-C-T-AAAGG-TAAA-CTAT-G--ATTAG---------TTT-TAT-AAT-------A--AT--TAA-TCCTTTTAT--TTTTTCC--TAAAA-TGCTG----AT---AACTCTACGGATTCTT-ATA--AAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-CTTATTCTTT-AC--A-C-CACGAATGAA-TATGT---------TTTTTT--T-T-TAAAT-G--TG--T--TAT-TTCTATCTA-TTATGCAACAAG-TTTA-ACAA---ACCTAAAC-TACTTG
gi|29858 : AGG-C-T-AA-TGGTAAAACT---G--ATTAG---------TTT-AAC-AATA------A--TT--AAA-CCC-TTTACT-TTTTT-C--TAAAA-TACTC----AT---TACTCAACGAATTTTT-ATG--AAGTCGA----TG--T--CGAAA-TGA-CTT-TTTTTA-AA--C-C-AAA-AATGAA-TATGT-A---AAAA---TAT----T-TAAAA-ATGTG--T--TAT-CCCTATCTATCTA----ATAAG-TTAA-ACAAACCTTCTA----TACTTGAC-CGATATAT--GTCTATA
gi|29859 : -C-C-AA-TAACATA-CTTATG--ATTAG---------TTT-TAC-AATA------A---C--AAA-TCCCTTTTC--TTTTT-C--TAAAA-TGCTA----AT---TACTCAATGGATTTTT-ATA--AAATAAA----CG--T--CAATA-TTA-CTTTTTCTTT-AAC-C-C-CAAAAATGAA-CATGT------AAA---TAC--C-T-TTAAA-A--TGCTT--TAT-CCCAATCTAACTAG-TGATACG-TTAA-ACAA---AGCTA-AC-CACTTGGC-T--GATATA-G
gi|29860 : -AA-GG-TAAA-CTAT-G--ATTAG---------TAT-TAC-GGTA------A---T--ACA-TCC-TTTAC--TTTTT-CC-TAAAA-TGCGC----AT---TACTCAACGGATTTTTTATG--AAATAAA----CT--T--CAAAA-TGA-CTTATTCTTT-AA--C-C-CAAAATTGAA-TATGT-----AAAA---TAT--A-T-TTAAA-A--TG--TGATAT-TCCTATCTATCTAT-CTATAAG-TTAA-ACAA---ACCTACAC-TACTTGAC-C--GATATACGTTTATA
gi|29861 : G-TAAA-ATAG-G--ATTAA---------TTT-TAC-AA-A------A--AT--AAA-CCCCTTTAC--TTTTT-C--TCAAA-TACTC----AT---CATTCAACGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CG--T--AAACA-TGA-CTTATTCTTG-AA--C-CTTAAGAATGAA-TATAT-A---CAAA---TAT--C-T-TTAAA-A--TGTTT--TAT-CCCTATCTATCAAG-CGATAAG-TTTA-ACAA---ACCTACTC-TACTTGAC-C--GATATACGTCTA------TACAATGTACATA--CGTTGTTATTAGCT
gi|29862 : --ATTAG---------TTT-TAT-GAAT------A--AT--AAA-CTCATTTAA--TTGTT-C--TAACT-TTCTT----AA---TACTTAATGGAATTTC-ATG--AAAAAAA----CTG-T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-T-AAAGATTGAA-TCTGT-A---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAA-TCCTATTGATCTAT-C--TATGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCAGTT-CTAAATATA-TCCTATATCATTTCAGTAGAC--A--CA----TACTAGCT
gi|29863 : --ATTAG---------TT---A--AACAGT----A--AT--AAA-TCCATTTACGTTTTTT-C--TAAA----ATA----AACATTACTCAATGGATTTTT-ATG--AAATAAA----CG--T--CAAAA-TGA-C---TTCTTTGAA--C-C-AAA-AATGAA-TATGT-A---AAAA---TATTCT-T-TAAAT-G--TT--T--TAC-CCGTATTTATCTGG-CGGTAAG-TTTA-ACAA---ACCTACTC-AACTTGAC-T--GATATA--CTTCTA----TACAATGTAC--ATTCGTTGTTATTAGCT
gi|29864 : T--AAA-CCCGTTTAA--TTAAT-C--TAACT-TTCTT----AA---TATTTAATGGAATTTG-ATG--AACTAAA----C---T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-G-AAAGAATGAA-AATGT-A---AAAA---TAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TGC-TCCTATCGATCTAT-TAATATTTTTTA-ATAA---TTCCACGC-TACCTGAC-CTAAATATA-GCCTATATCCCTACAATGGAC--A--CG----TATTAG
gi|29865 : CCTAATGAAATTTG-ATG--AAATTAA----CT--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-C-AAAGAATGGA-AATGT-A---AAAC---GAT--C-T-TAAAA-A--TG--T--TAC-TCCTATTAAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAT---TTCCACGC-TATCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTACAATGGAC--A--CG----TACCAGCT
gi|29866 : -ATA--AAAAAAA----G------CACAA-TGA-TTTATTCTTT-AA--T-T-AAAGAATGAA-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--T--TAC-TCTTATTGAGCTAT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACAC-AACCTGTT-CTAAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CG----TACTAGCT
gi|29867 : --AAAAAAA----CA--T--CAAAA-TGA-TTTATTCTTC-AA--T-C-AAAGAATGAC-TATGT-T---AAAA---GAT--C-T-TAAAA-A--CG--C--TAC-ACCTTTAGAGCTTT-CGATACGTTTTA-ACAA---TTCCACGC-TACCTGTT-CTCAATATA-GCCTATATCATTCCAATAGAC--A--CA----TACTAGCT