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lowQualScore                  :       . ....     .......    .            .....   ....      . ..... .  .    .     .  . . . .......   ..     .           ............. ..    ..   . .  .....      ....   ... ..... . .. .. . . ......  ..  .   ..  .......  .....  ............................ ......   .........         .. ..    ..  . .  .              
lowQualScore                  :       8 9999     4444444    0            44444   3333      7 11111 4  9    0     0  0 0 0 5555555   33     0           9999999999999 55    55   2 1  66666      4444   999 66666 1 55 55 1 1 666666  55  1   66  5555555  99999  1111111111111111111111111111 333333   666666666         77 77    22  6 3  9              
consensus                     : TATGATGG----TGTTA-------CCGG-TTTTCGATCACT-----TAA---GAATCGCCGT----TAAAATATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-G--GAT-GTTGAC-ACTAAATGCTT-------------G--TATAT-AAC-G-TT----TAAATAA----CTA---T-N---A-A--A--T-A-A--T--AAT--TT-TCT--AC-C-----AA-----AA------NG-ATA----------------A------CAA---------ATACATGCC--C--ATTG-CCT-T-CACCATTCACGTTAGAT
Reference ( gi|80290 )        : TATGATTG----TGTTA-------CCGG-TTTTCGATCACT-----TAA---TAATCGCTGC----TAAAATATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-G--GAT-TTTGAC-ACTAAATGCTT-------------G--TATAC-AAC-G-TT----AAAATAA----CTA---T-C---A-A--A--T-A-A--T--TAT--TT-TCT--AC-C-----AA-----AA------CA-ATT----------------A------CAA---------ATACATGCC--C--ATTG-ACT-T-CACCATTCACGTTAGAT
gi|80291                      : TATGATTG----TGTTA-------CCGG-TTTTCGATCACT-----TAA---TAATCTCTGC----TAAAATATT-TCAAT-GTTA-A-A--C-G--GAT-TTTGAC-ACTAAATGCTT-------------G--TATAC-AAC-G-TT----AAAATAA----CTG---T-C---A-A--A--T-A-A--T--TAT--TT-TCT--AC-C-----AA-----AA------CA-ATT----------------A------CAA---------ATACATGCC--C--ATTG-ACT-T-CACCATTCACGTTAGAT
gi|80294                      : TATGATTG----TGTTA-------CCGG-TTTTCGATCACT-----TAA---TAATCGCTGC----TAAAATATT-TCAAT-GC-A-A-AA-C-G--GAT-TTTGAC-ACTAAATGCAT-------------G--TATAC-AAC-G-TT----AAATTAA----CTA---T-C---A-A--A--T-A-A--T--TAT--TT-TCT--AC-C-----AT-----AA------CA-ATT----------------A------CAA---------ATACATGCC--C--ATTG-TCT-T-CACCATTCACGTTAGAT
gi|80293                      : TATTATGG----TGTTA-------CCAG-TTTTCGATAACT-----TAA---GAATCGCAGC----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-AA-C-G--GAT-GTTGAC-AATAAATGCTA-------------AAATATAA-AAT-G-TT----TAAATAA----CTA---T-C---A-A--A--T-A-A--T--TAT--TT-TCT--AT-C-----AA-----AA------AT-ATA----------------A------TAA---------ATACGTGCC--C--ATTG-ACT-T-CACCATTCACGT
gi|80298                      : TATGATGG----TGCTA-------TCGG-TTTTTGATTACT-----TAG---GAATCGCCGC----TAAA-TATT-TCAAT-GA-A-A-AA-C-G--GAT-GTTGTC-ATCAAATGCTT-------------G--TATAT-AGC-G-TT----TAAATAA----CTA---T-C---A-A--A--T-A-A--T--TAT--TT-TCT--AC-CA----AA-----AA------TG-ACA----------------A------CAA---------ATACATTTC--C--AATG-TCT-T-CACAATTCACATAAGAT
gi|80292                      : TATGATGA----TGTTA-------CCAG-TTTTCGATCACT-----TAA---GAATCGACAT----T-AAGTATT-TCAAT-GCAA-A-A--C-G--GAT-GTTGAC-ACTAAAT-CTT-------------G--TATAA-AAT-A-TT----TAGATAA----CTA---T-A---A-A--A--T-A-A--C--AAT--TT-TCT--AC-C-----AA-----AA------C--ATA----------------A------CAA---------ATACATGTC--C--ATTG--CTAT-CACAATTCATGTTAGAT
gi|80297                      : TATGATGG----TGTTA-------CCTG-TTTTCGATCACT-----TAA---GAATCACCGC----T-AAATATT-TCAAT-GC-A-A-A-------GAT-GTTGAC-ACTAAATGCTT-------------G--AATAG-AAA-G-TT----TAATTAA----CTA---T-G---A-G--A--T-A-A-----TAT--TT-TCT--AC-C-----AA-----AA------AG-ATA----------------A------TAC---------GTACATGCC--C--ATAG-CCT-T-CA-CATTTACGTTAGAT
gi|80296                      : TATGATGG----TGTTA-------CTGG-TTTTAGATCACC-----TAA---GAATTGCCAT----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-AA-C-G--GAT-GTCGAC-TCTAAATGCTT-------------G--TATAT-AAC-G-TT----TAAATAA----CTA---T-A---A-G--A--T-A-A--T--ATT--TT-TCT--AA-C-----AA-----AAAAATAACA-ATT----------------ATAGCCGCAA---------ATATATGCT--C--ATTT-CCT-T-CAC-ATTCACGTTAGAT
gi|80295                      : TGTGATGG----TGTTA-------CTGG-TTTTCGATCACT-----TAA---GAATCATCGT----T-GAATATT-TCAAT-GCAA-A-A--A-G--GAT-ATTGGC-ACTAAATGCTT-------------G--TATAT-AGC-ATTT----AAAAC-A----CTA---T-A---A-A--AATT-A-A--T--CATAATTATCT--AC-T-----AA-----AA-------G-ATA----------------A------CAA---------ATACATGCC--C--ATTG-CCT-T-CACCATTCATGTTAG
gi|80299                      : TATGATGG----TCCTA-------CCCG-TTTTTTATCACT-----TAA---GAATCGACAC----TAAA-TATT-TCGAT-TC-A-A-AACC-AC-AAT-GTTGAC-ACTAAATGCTT-------------G--TAAAT-AAC-G-TT----TAAATAA----CTA---T-----A-A--A--T-A-A--TAGT-T--TT-TCT--AC-C-----AA-----AA------AG-ATA----------------A------CAA---------ATACAAGCC--C--ATTG-CTT-T-CA-CACTCACGTTAGAT
gi|80300                      : TATGATGG----TGTTA---------------TCGATCACT-----GAA---GAGTCGCCGT----TAAA-TATT-TCAAT-GT-A-A-AA-C-G--GAT-TTATAT-ATTGAATGCTT-------------G--TATAT-AAC-G-TT----TAAACAA----TTA---T-A---A-G--A--T-A-A--T--AAT--TT-TCT--ACTT-----AG-----AA------AT-ATA----------------A------CAA---------ATACATGTC--C--ATTGCAAT-T-CACCATTCACGTTAGAT
gi|80302                      : TATGATGG----TGTCA-------CCGG-TTTTCGACAACT-----TAA---GAATCGCCGT----T-AAATATT-TCAAT-AC-A-A-A--CTT--GAT-GTTGAC-GCTTAATGCTT-------------G--TACAT-AACAG-TT-----AATTAA----CCA---T-T---A-A--A--T-A-G--T--AAT--TT-TCT--ACAC-----AA-----AA-------G-ATA----------------A------CAA---------ATATATGCT--C--ACTG-CTT-T-CA-CATTC-CGTTATAT
gi|80301                      : TATGATGG----TGTCA-------CCGG-TTTTCGACAACT-----TAA---GAATCGCCGT----T-AAATATT-TCAAT-AC-A-A-A--CTT--GAT-GTTGAC-GCTTAATGCTT-------------G--TACAT-AACAG-TT-----AATTAA----CCA---T-T---A-A--A--T-A-G--T--AAT--TT-TCT--ACAC-----AA-----AA-------G-ATA----------------A------CAA---------ATATATGCT--C--ACTG-CTT-T-CA-CATTC-CGTTATAT
gi|80307                      : TATGATTACTGATGTTA-------CCGG-TTT-CGATC----------------------GT----TAAA---TT-TCAATTGA-A-A-A--C-G--GAT-GTTGAC-ACTAAATGCTT-------------G--TATAT-AAA-G-TT----TAAATAA----CTA---T-G---A-ATTA--T-A-A-----TAT--TT---T--AC-T-----AA-----AA------CG-ATA----------------A------CAA---------ATATATGCC--C--ATTG-TCT-T-CGCCATTTACCTTA
gi|80303                      : TATTATGG----TGTTA-------CCGG-TTTTCGATCAAT-----TAA---GAATTG-TCC----TTGAATATT-TCAAT-GC-A-A-AG-C-C--GAT-GTTGAC-ATTAAATGCTT-------------T--TATAT-AAC-G-TT----TTAATAA----CTA---T-A---G-A--A--T-A-A--T--AAT--TT-TCT--AC-A-----AA-----AA----------------------------A------GAA---------A-------------ATTG-CCT-T-CA-CATTCACTTTAGAT
gi|80304                      : TAT-ATGG----TGTTA-------CCGG-TTTTCGATCATC-----TAA---GAATCGCCGT----TAAG-TATG-TAAAT-GC-A-A-AA-C-A--GAT-GTTGTC-A-----TGCTT-------------G--TATAT-CAT-G-TT----TGAAAAG----CTA---T-T---A-A--A--T-G-A--T---AT--TT-TTTTAAC-C-----TA-----AA------AG-ATA----------------G------CAA---------ATACATGTC--C--GTTG-CCT-T-CACAATTCACGTTAGAT
gi|80305                      : TATAATTGG---TGTGA-------CCGA-TTTTCGATCACA-----TAA---GAATCGCCGT----TAAA-TATG-TCAAT-GC-A-A-A--T-C--GTG-TTTGAC-ACTTATTGCTT-------------G--TATAT-AAC-G-TT----TAGATAA----ACA---T-A---A-A--A--T-A-A--T--AAT--TG-TCT--AC-C-----AA-----A-------TATATA----------------A------CAA---------ATACATGTC--
gi|80308                      : TATGATGG----TGTTA-------CCAG-TTTTTGATCACT-----T-A---CAATCGCTGT----T-AAATATT-TCAAT-GCAA-A-A--T-G--GAG-GTTGAT-ACTAAATGTTTGTATTATCACACAG--TATAT-AAT-G-TTTTTAAAAATAA----ATA---T-A---A-A--A--T-A-G--T--AGT--TT-TAT--AA-C-----AA-----AA----------------------------A------CGT---------A-ACAT--------ATTG-CCT-G-CACAGTTCACGCTAGAT
gi|80310                      : TATGATGG----TGTAA-------CCTG-TTTTTGATCACT-----TAA---GAATCGCTGT----TGAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-AA-C-A--GAT-ATTGAC-ACTTGATGCTT-------------G--TATAT-AAC-G-AT----TTAATAA----CTA---------A-A--A--T-
gi|80309                      : TATGATGA----TGTTG-------CCGG-TTTGCGATCACT-----TAA---GAAACGCC-C----TTTAATGTT-TCAAT-GCAA-A-A--A-G--GATGTGTG-C-ATTAAATGCTT-------------G--TGTAT-AAC-G-TT----TAAACAA----CTAGATT-CTATA-A--A--T-CTA--T--AAT--TT-TCT--AC-C-----AT-----AA------C------------------------------------------ACATGTC--C--ATTC-AC
gi|80313                      : TATGGTGG----TGTTAGAATCTATCGG-TTTTCAATCACTAACAGTAC---CAATCGCTG-----TCAACTATT-TCATT-GC-ATA-A--C-G--GGT-GTTTAA-ACTAAAAGCTT-------------G--TATAT-AAG-G-TT----TAAATAA----CTA-----------A--A--C-A-AACT--TAT--TT-TCT--AA-C-----A--------------CA-AAT----------------G------TAACATGTTTTTATACATGCA--C--ATTG-CCT-
gi|80312                      : TATGGTGG----TGTTA-------CCGA-TTTGCGCTCACT-----TGA---GAGTCACCGT----T-AGGTATT-TCAAT-GC-A-A-AG-C-G--GAT-GTTGAC-A--ACATGATT-------------G--TATAT-AAC-
gi|80315                      : TATGAAGG----TGTTA-------GCAG-TTTTTGATCACT-----TAA---GAATCGATGTTAAATAAAATATT-TCAAT-AC-AGA-G--C-G--GAT-
gi|80314                      : TATGTTGG----TGTTA-------CCAG-TTTTTGATCAGT-----GAA---GAATCGCCGT----T-AAATATT-TCAAT-GCAA-A-A--T-G--TCT-TATAACAACTGAATGgctg
gi|80316                      : TGTGATGG----TGTTA-------CCAG-TTTTTGATCAAT-----TAA---GAATTGCTGT----TAAA
gi|80317                      : TATGATGG----TGTTA-------CCGG-TTTTTGTTCACT-----TAA---GAATCACTGtgtt
gi|80318                      :  ATGATGG----TGTTA-------CAGG-TTTTCGATCACT-----TGA---GCATCA-TAT----TAAA-TATT-TCAAT-GCTA-A-A--C-A--GAT-GTTGCC-ATTAAATGCTT-------------G--TATAT-AAC-G-CT----AATACAA----CTA---T-A---A-A--A--C-A-A--T--AAG--TT-TCT--GC-C-----TA-----AA------AG-ATG----------------A------CAA---------TTACATGTC--C--ATTG-TCT-T-TACCATTCATGTTGGAT
gi|80319                      :  ATGATGA----TGATA-------CCAG-TTTTCGATCACT-----TAA---GAATCACCAT----TTA--TATT-TCACT-GC-A-A-A----GTTGAT-GTTGAC-ATTAAATCCAT-------------G--TATAT-AGC-G-TTTA--AAAATG------TA---T-A---A-A--A--T-A-A--T--AAT--TT-TCA--ACAT-----AA-----AA------TA--TA----------------A------CAA---------ATACATGCCCAC--ATTA-CCT-T-CACAATTCACATTAGAT
gi|80320                      :  ATGATGG----TGTTA-------GCGG-TTTTCGATCACT-----TAAGCTTACTCGCT--------AAATATT-TCAAT-GTAA-A-A--C-T--GAT-CTTGAC-ACTAAATGCTT-------------G--TAT
gi|80321                      :   TGATGG----TGTTA-------CTAG-TTTTCAGTCACA-----TAA---GAAACGCTGT----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--A-AT-GAT-GTTAAA-ATTAAATG-TT-------------A--AATAT-AAC-A-TT----AAAACAA----CTT---T-A---A-A--A--T-A-A--T--AAT--TT-TCT--AC-CT----AATAGATAA------TA-ATTTTCTTCCTAAAAGATAA------CAA---------ATACATGCC--A--ATTG-CCA-T-CGCCATTCACGTTAGAT
gi|80322                      :   TGATGG----TGTTA-------ACAG-TTTTCACTCGCG-----TAG---GAATCACCA-----TGAAATATT-TCAAT-GC-A-A-AG-C-G--GAT-GTTGAC-ACTAAATATTT-------------G--TAAAT-AAC-A-TT----TAAATAA----CTA---T-A---A-A--A--TAA-A--T--AAT--TT-ACT--AC-CTGGTAAA-----AA------GA-A-A----------------A------C-A---------ATACATG
gi|80306                      :        G----TGTTA-------CCGGGTTTTCGATCTTT-----TAA---GAATCGCTGT----T-TAATATT-TCAAT-GC-ACA-A--C-G--GAT-GCTGAT-ACTAAATGCTT-------------G--TATAT-AAC-G-TT----TAAACAA----CTA---T-A---A-A--A--T-A-A-----TAC--TT-T
gi|80311                      :  tatggaa----TGTAA-------CCAG-TTTTCGATCAAT-----TAA---GAATCGTCGT----TAAA-TATT-TCAA-----------------G----TTGAC-ACTAAATGCTT-------------------ACTAAC-G-TT----TCAATAA----CTA---T-G---C-A--A--T-A-A--T--AAT--TT-TAT--AG-C-----AA-----AA------AG-ACA----------------A------CAA---------ATATATGCC-------TG------------TTCACGTTAGAT
gi|80323                      :      tatggagaGTTA-------CCTG-TTTTCG-TCATT-----TAG----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AAT-GTCGAC-ACTCATTGCTT-------------G--TATAA-AAT-G-TT-----------------------T---A-A--G--T-A-A--T--TAT------CT--AC-C-----AA-----AA------AA-ATA----------------A------CAA---------ATACATGTA--C--ATTA-CCT-T-CACCATTCACGTTAGAT
gi|80324                      :              GTGA-------CCTG-TTTTCGATCACT-----TGG----AATCGCCGT----T-AGATAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AAT-GTCGAC-ACTCATTGCTT-------------C--TGTAA-TAT-G-TT---------------TT------------A--A--T-A-A--T--TA------TCT--AC-C-----AA-----AA------AC-ATA----------------A------CAA---------ATACATGTA--C--TTTA-CCT-A-CACCATTCACG
gi|80325                      :              GTTA-------CCTG-TTTTCAATCACC-----TAG----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AAT-GTCGCC-ACTCA-TTTTT-------------G--TATAA-ATT-G-TT----TAAATAAGTATCTA---C-C---A-A--A--A-A-A---------------------------AA-----AA------CA-ACA----------------A------CAA---------ATACATGCA--T--ATT---------ACCAT---CGCTAGAT
gi|80326                      :                TA-------CTGT-TTTTTGATCACT------AA---GAATCGCTGT----TTAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--AAG--GAT-GTTGAT-ACTATATGCTT-------------A--ATTTT-AAC-G-TT----TTAGTAA----CTA---TAC---ACA--A--T-A-A--T--ACT--TT-TCT--AC-C-----AA-----AA------AG-GTA----------------A------CAA---------GAACATGCC--A--ATTG--CT-TGCACCATTCATGTAAGGT
gi|80327                      :                 A-------CCAT-TTTTTGATCGCT-----TAA---GAATCA--GT----TAAG-TGTT-TCAAT-GC-------------------TGAT-ACTAAATGTTT-------------G--TATAT-AAC-A-TT----TAAATAA----CTA---T-A---A-A--A--T-A-A--T--ATT--TT-TCT--AC-C-----AA-----AA------AG-ATA----------------A------CAA---------ATATATGCT--C--TTTG-CCT-T-CA-CATTCATGTTAGAT
gi|80328                      :                 A-------CCGG-TTTT-GATCACT-----TAA---GAATCATAGT----TAAA-TAAG-TCAAT-GC-A-A-AA-C-G--AAT-GTGGAC-ACTAAATGCTT-------------G--TATTA-AAT-G-TT----TAAATAA----CTT---T-T---A-A--A--T-G-A------AT-------------------AA-----A-----------------------------A------CAA---------ATATATGCC--CAAATAG-ACTAT-CA
gi|80329                      :                           GG-TTTTCGAGCACT-----TAC---GAATCACCGC----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-AA-C-G--GAT-GTTGAC-ATCAAATGCTT-------------G--TATAT-AAT-G-TT----
gi|80330                      :                             -TTTTCAATCACG-----TAA---GAATCATCAT----TAAT-TATT-TCAAT-TC-A-A-AA-C-A--GAC-ATTGAC-ATTAAATGCTT-------------G--TCTGT-ATC-G-TT----TAATCAA----CTA---T-A---T-A--A--C-A-A--T--AAT--TT-T
gi|80331                      :                                     TCACT-----AGA---GAATTGC-AC----TTGAATATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-A--GAT-GTTGAC-GCTAAAT
gi|80332                      :                                                                        TATTGTCATT-GG-A-ATA--G-G--AAT-ATTGAC-GCTAAATGCTT-------------G--TGTAT-AAC-G-TT----AATATAA----CTA---T-G---A-T--A--T-A-A--T--GAT--TT-TAT--AT-A-----AA-----AA------AATATA----------------A------CAA---------ATAC
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gi|80334                      :                                                                                                                                             aacatg-TT----TAAACAA----TTA---T-A---G-T--A--T-A-A--T--AAT--TT-TCT--AC-C-----TA-----AA------AA-ATC----------------ATTT---CAA---------ATACCTGCC--C--TTTG-CAT-G-CACCATTCATATCAGAT
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gi|80313                      : TATGGT----GGTGTTAGAATCTATCGG-TTTTCAATCACTAACAGTACCAATCGCTGT----CAAC-TATT-TCATT-GC-ATA-A--C-G--GGTGT----T-TAA-ACTAAAAGCTT-------------GTATATAA--GGTTT----AAATAAC-T----------A-AA--C-A---AACTTA-TTTTCTA-A-C----ACAAATG--TAA----------------------CATGTTTTT------------ATACATGCA--CATTGC-CT
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gi|80315                      : TATGAA----GGTGTTA-------GCAG-TTTTTGATCACTTA-AG----AATCGATGTTAAATAAAATATT-TCAAT-AC-AGA-G--C-G--GATGC----T-G
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gi|80319                      :  ATGAT----GATGATA-------CCAG-TTTTCGATCACTTA-AG----AATCACCAT----TTA--TATT-TCACT-GC-A-A-A----GTTGATGT----T-GAC-ATTAAATCCAT-------------GTATATAG--CGTTT----AAA-AATGT--AT----A-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCAA-C-A----T-AAAAT-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGCCCACATTAC-CTTCACAATTCACATTAGAT
gi|80320                      :  ATGAT----GGTGTTA-------GCGG-TTTTCGATCACTTA-AGCTT-ACTCGCT--------AAATATT-TCAAT-GTAA-A-A--C-T--GATCT----T-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTAT
gi|80321                      :   TGAT----GGTGTTA-------CTAG-TTTTCAGTCACATA-AG----AAACGCTGT----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--A-AT-GATGT----T-AAA-ATTAAATG-TT-------------AAATATAA--CATTA----AAACAAC-T--TT----A-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCTA-C-C----T-AATAG-ATAATAATTTTCTTCCTAAAAGATAACA------A------------ATACATGCC--AATTGC-CATCGCCATTCACGTTAGAT
gi|80322                      :   TGAT----GGTGTTA-------ACAG-TTTTCACTCGCGTA-GG----AATCACCA-----TGAAATATT-TCAAT-GC-A-A-AG-C-G--GATGT----T-GAC-ACTAAATATTT-------------GTAAATAA--CATTT----AAATAAC-T--AT----A-A-AA--TAA---A--TAA-TTTACTA-C-CTGGTA-AAAAG-AAAA----------------------C-------A------------ATACATG
gi|80323                      :              GTTA-------CCTG-TTTTCG-TCATTTA--G----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GAC-ACTCATTGCTT-------------GTATAAAA--TGTTT----AAGTAAT-T--A-----------------------------TCTA-C-C----A-AAAAA-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGTA--CATTAC-CTTCACCATTCACGTTAGAT
gi|80324                      :              GTGA-------CCTG-TTTTCGATCACTT--GG----AATCGCCGT----T-AGATAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GAC-ACTCATTGCTT-------------CTGTAATA--TGTTT-----------------------------T-A---A--TAA-TTATCTA-C-C----A-AAAAC-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGTA--CTTTAC-CTACACCATTCACG
gi|80325                      :              GTTA-------CCTG-TTTTCAATCACCTA--G----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GCC-ACTCA-TTTTT-------------GTATAAAT--TGTTT----AAATAAG-T--AT----C-T-AC--C-A---A--AAA-------A--------A-AAACA-ACAA----------------------CA------A------------ATACATGCA--TATTAC-CATCGCTA
gi|80326                      :                TA-------CTGT-TTTTTGATCACT-A-AG----AATCGCTGT----TTAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--AAG--GATGT----T-GAT-ACTATATGCTT-------------AATTTTAA--CGTTT----TAGTAAC-T--AT----ACACAA--T-A---A--TAC-TTTTCTA-C-C----A-AAAAG-GTAA----------------------CA------A------------GAACATGCC--AATTGC-TTGCACCATTCATGTAAGGTgat
gi|80327                      :                 A-------CCAT-TTTTTGATCGCTTA-AG----AATCA--GT----TAAG-TGTT-TCAAT-GC----------------------T-GAT-ACTAAATGTTT-------------GTATATAA--CATTT----AAATAAC-T--AT----A-A-AA--T-A---A--TAT-TTTTCTA-C-C----A-AAAAG-ATAA----------------------CA------A------------ATATATGCT--CTTTGC-CTTCA-CATTCATGTTAGAT
gi|80328                      :                 A-------CCGG-TTTT-GATCACTTA-AG----AATCATAGT----T-AAATAAG-TCAAT-GCAA-A-A--C-G--AATGT----G-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTATTAAA--TGTTT----AAATAAC-T--TT----T-A-AA--TGA---A--TAA--------------------------AA----------------------CA------A------------ATATATGCC--CA
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gi|80330                      :                             -TTTTCAATCACGTA-AG----AATCATCAT----TAAT-TATT-TCAAT-TC-A-A-AA-C-A--GACAT----T-GAC-ATTAAATGCTT-------------GTCTGTAT--CGTTT----AATCAAC-T--AT----A-T-AA--C-A---A--TAA-TTTT
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gi|80315                      : TATGAA----GGTGTTA-------GCAG-TTTTTGATCACTTA-AG----AATCGATGTTAAATAAAATATT-TCAAT-AC-AGA-G--C-G--GATGC----T-G
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gi|80319                      :  ATGAT----GATGATA-------CCAG-TTTTCGATCACTTA-AG----AATCACCAT----TTA--TATT-TCACT-GC-A-A-A----GTTGATGT----T-GAC-ATTAAATCCAT-------------GTATATAG--CGTTT----AAA-AATGT--AT----A-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCAA-C-A----TAAAA------T-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGCCCACATTAC-CTTCACAATTCACATTAGAT
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gi|80321                      :   TGAT----GGTGTTA-------CTAG-TTTTCAGTCACATA-AG----AAACGCTGT----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--A-AT-GATGT----T-AAA-ATTAAATG-TT-------------AAATATAA--CATTA----AAACAAC-T--TT----A-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCTA-C-C----TAATA------G-ATAATAATTTTCTTCCTAAAAGATAACA------A------------ATACATGCC--AATTGC-CATCGCCATTCACGTTAGAT
gi|80322                      :   TGAT----GGTGTTA-------ACAG-TTTTCACTCGCGTA-GG----AATCACCA-----TGAAATATT-TCAAT-GC-A-A-AG-C-G--GATGT----T-GAC-ACTAAATATTT-------------GTAAATAA--CATTT----AAATAAC-T--AT----A-A-AA--TAA---A--TAA-TTTACTA-C-CTGGTAAAAA------G-AAAA----------------------C-------A------------ATACATG
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gi|80324                      :              GTGA-------CCTG-TTTTCGATCACTT--GG----AATCGCCGT----T-AGATAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GAC-ACTCATTGCTT-------------CTGTAATA--TGTTT-----------------------------T-A---A--TAA-TTATCTA-C-C----AAAAA------C-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGTA--CTTTAC-CTACACCATTCACG
gi|80325                      :              GTTA-------CCTG-TTTTCAATCACCTA--G----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GCC-ACTCA-TTTTT-------------GTATAAAT--TGTTT----AAATAAG-T--A-----------------------------TCTA-C-C----AAAAAAAAAACA-ACAA----------------------CA------A------------ATACATGCA--TATTAC-CATCGCTA
gi|80326                      :                TA-------CTGT-TTTTTGATCACT-A-AG----AATCGCTGT----TTAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--AAG--GATGT----T-GAT-ACTATATGCTT-------------AATTTTAA--CGTTT----TAGTAAC-T--AT----ACACAA--T-A---A--TAC-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-GTAA----------------------CA------A------------GAACATGCC--AATTGC-TTGCACCATTCATGTAAGGTgat
gi|80327                      :                 A-------CCAT-TTTTTGATCGCTTA-AG----AATCA--GT----TAAG-TGTT-TCAAT-GC----------------------T-GAT-ACTAAATGTTT-------------GTATATAA--CATTT----AAATAAC-T--AT----A-A-AA--T-A---A--TAT-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATATATGCT--CTTTGC-CTTCA-CATTCATGTTAGAT
gi|80328                      :                 A-------CCGG-TTTT-GATCACTTA-AG----AATCATAGT----T-AAATAAG-TCAAT-GCAA-A-A--C-G--AATGT----G-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTATTAAA--TGTTT----AAATAAC-T--TT----T-A-AA--TGA---A--TAA-------------------------------AA----------------------CA------A------------ATATATGCC--CA
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gi|80331                      :                                     TCACTAG-AG----AATTGCACT----TGAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-A--GATGT----T-GAC-GCTAAAT
gi|80332                      :                                                                     TATTGTCATT-GG-A-ATA--G-G--AATAT----T-GAC-GCTAAATGCTT-------------GTGTATAA--CGTTA----ATATAAC-T--AT----G-A-TA--T-A---A--TGA-TTTTATA-T-A----AAAAA------ATATAA----------------------CA------A------------ATAC
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Reference ( family-507 )      : TATGAT----GGTGTTA-------CCGG-TTTTCGATCACTTA-AG----AATCGCCGT----TAAAATATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-G--GATGT----T-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTATATAA--CGTTT----AAATAAC-TA-----TA-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGCC--CATTGC-CTTCACCATTCACGTTAGAT
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gi|80315                      : TATGAA----GGTGTTA-------GCAG-TTTTTGATCACTTA-AG----AATCGATGTTAAATAAAATATT-TCAAT-AC-AGA-G--C-G--GATGC----T-G
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gi|80319                      :  ATGAT----GATGATA-------CCAG-TTTTCGATCACTTA-AG----AATCACCAT----TTA--TATT-TCACT-GC-A-A-A----GTTGATGT----T-GAC-ATTAAATCCAT-------------GTATATAG--CGTTT----AAA-AATGTA-----TA-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCAA-C-A----TAAAA------T-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGCCCACATTAC-CTTCACAATTCACATTAGAT
gi|80320                      :  ATGAT----GGTGTTA-------GCGG-TTTTCGATCACTTA-AGCTT-ACTCGCT--------AAATATT-TCAAT-GTAA-A-A--C-T--GATCT----T-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTAT
gi|80321                      :   TGAT----GGTGTTA-------CTAG-TTTTCAGTCACATA-AG----AAACGCTGT----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--A-AT-GATGT----T-AAA-ATTAAATG-TT-------------AAATATAA--CATTA----AAACAAC-TT-----TA-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCTA-C-C----TAATA------G-ATAATAATTTTCTTCCTAAAAGATAACA------A------------ATACATGCC--AATTGC-CATCGCCATTCACGTTAGAT
gi|80322                      :   TGAT----GGTGTTA-------ACAG-TTTTCACTCGCGTA-GG----AATCACCA-----TGAAATATT-TCAAT-GC-A-A-AG-C-G--GATGT----T-GAC-ACTAAATATTT-------------GTAAATAA--CATTT----AAATAAC-TA-----TA-A-AA--TAA---A--TAA-TTTACTA-C-CTGGTAAAAA------G-AAAA----------------------C-------A------------ATACATG
gi|80323                      :              GTTA-------CCTG-TTTTCG-TCATTTA--G----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GAC-ACTCATTGCTT-------------GTATAAAA--TGTTT----AAGTAAT-TA------------------------------TCTA-C-C----AAAAA------A-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGTA--CATTAC-CTTCACCATTCACGTTAGAT
gi|80324                      :              GTGA-------CCTG-TTTTCGATCACTT--GG----AATCGCCGT----T-AGATAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GAC-ACTCATTGCTT-------------CTGTAATA--TGTTT----------------------------T-A---A--TAA-TTATCTA-C-C----AAAAA------C-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGTA--CTTTAC-CTACACCATTCACG
gi|80325                      :              GTTA-------CCTG-TTTTCAATCACCTA--G----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GCC-ACTCA-TTTTT-------------GTATAAAT--TGTTT----AAATAAG-TA------------------------------TCTA-C-C----AAAAAAAAAACA-ACAA----------------------CA------A------------ATACATGCA--TATTAC-CATCGCTA
gi|80326                      :                TA-------CTGT-TTTTTGATCACT-A-AG----AATCGCTGT----TTAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--AAG--GATGT----T-GAT-ACTATATGCTT-------------AATTTTAA--CGTTT----TAGTAAC-TA-----TACACAA--T-A---A--TAC-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-GTAA----------------------CA------A------------GAACATGCC--AATTGC-TTGCACCATTCATGTAAGGTgat
gi|80327                      :                 A-------CCAT-TTTTTGATCGCTTA-AG----AATCA--GT----TAAG-TGTT-TCAAT-GC----------------------T-GAT-ACTAAATGTTT-------------GTATATAA--CATTT----AAATAAC-TA-----TA-A-AA--T-A---A--TAT-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATATATGCT--CTTTGC-CTTCA-CATTCATGTTAGAT
gi|80328                      :                 A-------CCGG-TTTT-GATCACTTA-AG----AATCATAGT----T-AAATAAG-TCAAT-GCAA-A-A--C-G--AATGT----G-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTATTAAA--TGTTT----AAATAAC-TT-----TT-A-AA--TGA---A--TAA-------------------------------AA----------------------CA------A------------ATATATGCC--CA
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gi|80331                      :                                     TCACTAG-AG----AATTGCACT----TGAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-A--GATGT----T-GAC-GCTAAAT
gi|80332                      :                                                                     TATTGTCATT-GG-A-ATA--G-G--AATAT----T-GAC-GCTAAATGCTT-------------GTGTATAA--CGTTA----ATATAAC-TA-----TG-A-TA--T-A---A--TGA-TTTTATA-T-A----AAAAA------ATATAA----------------------CA------A------------ATAC
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Alignments
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Reference ( family-507 )      : TATGAT----GGTGTTA-------CCGG-TTTTCGATCACTTA-AG----AATCGCCGT----TAAAATATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-G--GATGT----T-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTATATAA--CGTTT----AAATAAC-TA-----TA-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGCC--CATTGC-CTTCACCATTCACGTTAGAT
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gi|80315                      : TATGAA----GGTGTTA-------GCAG-TTTTTGATCACTTA-AG----AATCGATGTTAAATAAAATATT-TCAAT-AC-AGA-G--C-G--GATGC----T-G
gi|80316                      : TGTGAT----GGTGTTA-------CCAG-TTTTTGATCAATTA-AG----AATTGCTGT----TAAA
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gi|80319                      :  ATGAT----GATGATA-------CCAG-TTTTCGATCACTTA-AG----AATCACCAT----TTA--TATT-TCACT-GC-A-A-A----GTTGATGT----T-GAC-ATTAAATCCAT-------------GTATATAG--CGTTT----AAA-AATGTA-----TA-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCAA-C-A----TAAAA------T-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGCCCACATTAC-CTTCACAATTCACATTAGAT
gi|80320                      :  ATGAT----GGTGTTA-------GCGG-TTTTCGATCACTTA-AGCTT-ACTCGCT--------AAATATT-TCAAT-GTAA-A-A--C-T--GATCT----T-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTAT
gi|80321                      :   TGAT----GGTGTTA-------CTAG-TTTTCAGTCACATA-AG----AAACGCTGT----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--A-AT-GATGT----T-AAA-ATTAAATG-TT-------------AAATATAA--CATTA----AAACAAC-TT-----TA-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCTA-C-C----TAATA------G-ATAATAATTTTCTTCCTAAAAGATAACA------A------------ATACATGCC--AATTGC-CATCGCCATTCACGTTAGAT
gi|80322                      :   TGAT----GGTGTTA-------ACAG-TTTTCACTCGCGTA-GG----AATCACCA-----TGAAATATT-TCAAT-GC-A-A-AG-C-G--GATGT----T-GAC-ACTAAATATTT-------------GTAAATAA--CATTT----AAATAAC-TA-----TA-A-AA--TAA---A--TAA-TTTACTA-C-CTGGTAAAAA------G-AAAA----------------------C-------A------------ATACATG
gi|80323                      :              GTTA-------CCTG-TTTTCG-TCATTTA--G----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GAC-ACTCATTGCTT-------------GTATAAAA--TGTTT----AAGTAAT-TA------------------------------TCTA-C-C----AAAAA------A-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGTA--CATTAC-CTTCACCATTCACGTTAGAT
gi|80324                      :              GTGA-------CCTG-TTTTCGATCACTT--GG----AATCGCCGT----T-AGATAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GAC-ACTCATTGCTT-------------CTGTAATA--TGTTT----------------------------T-A---A--TAA-TTATCTA-C-C----AAAAA------C-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGTA--CTTTAC-CTACACCATTCACG
gi|80325                      :              GTTA-------CCTG-TTTTCAATCACCTA--G----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GCC-ACTCA-TTTTT-------------GTATAAAT--TGTTT----AAATAAG-TA------------------------------TCTA-C-C----AAAAAAAAAACA-ACAA----------------------CA------A------------ATACATGCA--TATTAC-CATCGCTA
gi|80326                      :                TA-------CTGT-TTTTTGATCACT-A-AG----AATCGCTGT----TTAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--AAG--GATGT----T-GAT-ACTATATGCTT-------------AATTTTAA--CGTTT----TAGTAAC-TA-----TACACAA--T-A---A--TAC-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-GTAA----------------------CA------A------------GAACATGCC--AATTGC-TTGCACCATTCATGTAAGGTgat
gi|80327                      :                 A-------CCAT-TTTTTGATCGCTTA-AG----AATCA--GT----TAAG-TGTT-TCAAT-GC----------------------T-GAT-ACTAAATGTTT-------------GTATATAA--CATTT----AAATAAC-TA-----TA-A-AA--T-A---A--TAT-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATATATGCT--CTTTGC-CTTCA-CATTCATGTTAGAT
gi|80328                      :                 A-------CCGG-TTTT-GATCACTTA-AG----AATCATAGT----T-AAATAAG-TCAAT-GCAA-A-A--C-G--AATGT----G-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTATTAAA--TGTTT----AAATAAC-TT-----TT-A-AA--TGA---A--TAA-------------------------------AA----------------------CA------A------------ATATATGCC--CA
gi|80329                      :                           GG-TTTTCGAGCACTTA-CG----AATCACCGC----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-AA-C-G--GATGT----T-GAC-ATCAAATGCTT-------------GTATATAA--TGTTaatagactatca
gi|80330                      :                             -TTTTCAATCACGTA-AG----AATCATCAT----TAAT-TATT-TCAAT-TC-A-A-AA-C-A--GACAT----T-GAC-ATTAAATGCTT-------------GTCTGTAT--CGTTT----AATCAAC-TA-----TA-T-AA--C-A---A--TAA-TTTT
gi|80331                      :                                     TCACTAG-AG----AATTGCACT----TGAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-A--GATGT----T-GAC-GCTAAAT
gi|80332                      :                                                                     TATTGTCATT-GG-A-ATA--G-G--AATAT----T-GAC-GCTAAATGCTT-------------GTGTATAA--CGTTA----ATATAAC-TA-----TG-A-TA--T-A---A--TGA-TTTTATA-T-A----AAAAA------ATATAA----------------------CA------A------------ATAC
gi|80333                      :                                                                                                                                                 GTTT----GAATAAC-TA-----TG-A-GA--C-A---A--TAA-TTTTGTA-C-G----AAAAC------G-ATAG----------------------AA------A------------ATACATGCC--CATTGT-GTCCACTATTCACGTTAGAT
gi|80334                      :                                                                                                                                            aacatgTTT----AAACAAT-TA-----TA-G-TA--T-A---A--TAA-TTTTCTA-C-C----TAAAA------A-ATCATTT-------------------CA------A------------ATACCTGCC--CTTTGC-ATGCACCATTCATATCAGAT
gi|80335                      :                                                                                                                                                                                             -TTGTCTA-C-A----TAAAA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGCC--CATTAC-CATCACCATTCATGTTA
gi|80336                      :                                                                                                                                                                                                TTCTA-C---------GA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATATATGCT--CATTGC-CTTCA-CATTCACGTTAGAT


blockSeqs                     :       TACT       GAATCTA                      TACC         TAAA A  A             T C   ACCAC       CTTA     A           GTATTATCACACA        AA     TTAA       G  GATTC AT C  AT A ATC AC   T       A T TGGTA    AAAAACA     TAATTTTCTTCCTAAAAGATAA  TGTTTT TTATAGCCGCAA         CA      A     C
blockSeqs                     :       T          .                            CTT          .    A  G             A T   ACG         G        .           .                    .      .          .  .     AC .  .  G T   .    .       . . A        TG          TTT                     .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             A G   ACG         .        .           .                    .      .          .  .     C  .  .  . .   .    .       . . A        AT          .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             A .   ACG         .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        A           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             A .   ACG         .        .           .                    .      .          .  .     C  .  .  . .   .    .       . . A        C           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             A .   ACG         .        .           .                    .      .          .  .     C  .  .  . .   .    .       . . A        T           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             T .   CTT         .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        A           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             A .   CTT         .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        G           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             A .   GCC         .        .           .                    .      .          .  .     G  .  .  . .   .    .       . . A        A           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             . .   ACA         .        .           .                    .      .          .  .     C  .  .  . .   .    .       . . C        G           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             . .   TCG         .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . C        G           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             . .   GCG         .        .           .                    .      .          .  .     T  .  .  . .   .    .       . . A        T           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  G             . .   GTT         .        .           .                    .      .          .  .     T  .  .  . .   .    .       . . T        G           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             . .   AAT         .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        G           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             . .   GCG         .        .           .                    .      .          .  .     T  .  .  . .   .    .       . . A        G           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    T  A             . .   AAG         .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        G           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             . .   ACG         .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        T           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    G  A             . .   ACA         .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        G           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  A             . .   CG          .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . T        C           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  .             . .   CG          .        .           .                    .      .          .  .     G  .  .  . .   .    .       . . T        G           .                       .      .                    .       .     C
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    T  .             . .   AG          .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . T        T           .                       .      .                    .       .     .
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  .             . .   CG          .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        G           .                       .      .                    .       .     .
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  .             . .   CG          .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        T           .                       .      .                    .       .     .
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    A  .             . .   TG          .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        G           .                       .      .                    .       .     .
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    G  .             . .   AG          .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        G           .                       .      .                    .       .     .
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    .  .             . .   CA          .        .           .                    .      .          .  .     T  .  .  . .   .    .       . . A        A           .                       .      .                    .       .     .
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    .  .             . .   CG          .        .           .                    .      .          .  .     A  .  .  . .   .    .       . . A        C           .                       .      .                    .       .     .
blockSeqs                     :       .          .                            .            .    .  .             . .   CG          .        .           .                    .      .          .  .     G  .  .  . .   .    .       . . A        G           .                       .      .                    .       .     .
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blockSeqs                     :       .          .                            .            .    .  .             . .   AG          .        .           .                    .      .          .  .     .  .  .  . .   .    .       . . .        A           .                       .      .                    .              
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Reference ( family-507 )      : TATGAT----GGTGTTA-------CCGG-TTTTCGATCACTTA-AG----AATCGCCGT----TAAAATATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-G--GATGT----T-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTATATAA--CGTTT----AAATAAC-TA-----TA-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGCC--CATTGC-CTTCACCATTCACGTTAGAT
gi|80290                      : TATGAT----TGTGTTA-------CCGG-TTTTCGATCACTTA-AT----AATCGCTGC----TAAAATATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-G--GATTT----T-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTATACAA--CGTTA----AAATAAC-TA-----TC-A-AA--T-A---A--TTA-TTTTCTA-C-C----AAAAC------A-ATTA----------------------CA------A------------ATACATGCC--CATTGA-CTTCACCATTCACGTTAGAT
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gi|80314                      : TATGTT----GGTGTTA-------CCAG-TTTTTGATCAGTGA-AG----AATCGCCGT----T-AAATATT-TCAAT-GC-A-A-A--------ATGTCTTAT-AACAACTGAATG
gi|80315                      : TATGAA----GGTGTTA-------GCAG-TTTTTGATCACTTA-AG----AATCGATGTTAAATAAAATATT-TCAAT-AC-AGA-G--C-G--GATGC----T-G
gi|80316                      : TGTGAT----GGTGTTA-------CCAG-TTTTTGATCAATTA-AG----AATTGCTGT----TAAA
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gi|80318                      :  ATGAT----GGTGTTA-------CAGG-TTTTCGATCACTTG-AG----CATCAT-AT----TAAA-TATT-TCAAT-GCTA-A-A--C-A--GATGT----T-GCC-ATTAAATGCTT-------------GTATATAA--CGCTA----ATACAAC-TA-----TA-A-AA--C-A---A--TAA-GTTTCTG-C-C----TAAAA------G-ATGA----------------------CA------A------------TTACATGTC--CATTGT-CTTTACCATTCATGTTGGAT
gi|80319                      :  ATGAT----GATGATA-------CCAG-TTTTCGATCACTTA-AG----AATCACCAT----TTA--TATT-TCACT-GC-A-A-A----GTTGATGT----T-GAC-ATTAAATCCAT-------------GTATATAG--CGTTT----AAA-AATGTA-----TA-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCAA-C-A----TAAAA------T-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGCCCACATTAC-CTTCACAATTCACATTAGAT
gi|80320                      :  ATGAT----GGTGTTA-------GCGG-TTTTCGATCACTTA-AGCTT-ACTCGCT--------AAATATT-TCAAT-GTAA-A-A--C-T--GATCT----T-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTAT
gi|80321                      :   TGAT----GGTGTTA-------CTAG-TTTTCAGTCACATA-AG----AAACGCTGT----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--A-AT-GATGT----T-AAA-ATTAAATG-TT-------------AAATATAA--CATTA----AAACAAC-TT-----TA-A-AA--T-A---A--TAA-TTTTCTA-C-C----TAATA------G-ATAATAATTTTCTTCCTAAAAGATAACA------A------------ATACATGCC--AATTGC-CATCGCCATTCACGTTAGAT
gi|80322                      :   TGAT----GGTGTTA-------ACAG-TTTTCACTCGCGTA-GG----AATCACCA-----TGAAATATT-TCAAT-GC-A-A-AG-C-G--GATGT----T-GAC-ACTAAATATTT-------------GTAAATAA--CATTT----AAATAAC-TA-----TA-A-AA--TAA---A--TAA-TTTACTA-C-CTGGTAAAAA------G-AAAA----------------------C-------A------------ATACATG
gi|80323                      :              GTTA-------CCTG-TTTTCG-TCATTTA--G----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GAC-ACTCATTGCTT-------------GTATAAAA--TGTTT----AAGTAAT-TA------------------------------TCTA-C-C----AAAAA------A-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGTA--CATTAC-CTTCACCATTCACGTTAGAT
gi|80324                      :              GTGA-------CCTG-TTTTCGATCACTT--GG----AATCGCCGT----T-AGATAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GAC-ACTCATTGCTT-------------CTGTAATA--TGTTT----------------------------T-A---A--TAA-TTATCTA-C-C----AAAAA------C-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGTA--CTTTAC-CTACACCATTCACG
gi|80325                      :              GTTA-------CCTG-TTTTCAATCACCTA--G----AATCGCCGT----TAGA-TAGA-TCAGT-AC-A-A-A--A-G--AATGT----C-GCC-ACTCA-TTTTT-------------GTATAAAT--TGTTT----AAATAAG-TA------------------------------TCTA-C-C----AAAAAAAAAACA-ACAA----------------------CA------A------------ATACATGCA--TATTAC-CATCGCTA
gi|80326                      :                TA-------CTGT-TTTTTGATCACT-A-AG----AATCGCTGT----TTAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--AAG--GATGT----T-GAT-ACTATATGCTT-------------AATTTTAA--CGTTT----TAGTAAC-TA-----TACACAA--T-A---A--TAC-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-GTAA----------------------CA------A------------GAACATGCC--AATTGC-TTGCACCATTCATGTAAGGTgat
gi|80327                      :                 A-------CCAT-TTTTTGATCGCTTA-AG----AATCA--GT----TAAG-TGTT-TCAAT-GC----------------------T-GAT-ACTAAATGTTT-------------GTATATAA--CATTT----AAATAAC-TA-----TA-A-AA--T-A---A--TAT-TTTTCTA-C-C----AAAAA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATATATGCT--CTTTGC-CTTCA-CATTCATGTTAGAT
gi|80328                      :                 A-------CCGG-TTTT-GATCACTTA-AG----AATCATAGT----T-AAATAAG-TCAAT-GCAA-A-A--C-G--AATGT----G-GAC-ACTAAATGCTT-------------GTATTAAA--TGTTT----AAATAAC-TT-----TT-A-AA--TGA---A--TAA-------------------------------AA----------------------CA------A------------ATATATGCC--CA
gi|80329                      :                           GG-TTTTCGAGCACTTA-CG----AATCACCGC----TAAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-AA-C-G--GATGT----T-GAC-ATCAAATGCTT-------------GTATATAA--TGTTaatagactatca
gi|80330                      :                             -TTTTCAATCACGTA-AG----AATCATCAT----TAAT-TATT-TCAAT-TC-A-A-AA-C-A--GACAT----T-GAC-ATTAAATGCTT-------------GTCTGTAT--CGTTT----AATCAAC-TA-----TA-T-AA--C-A---A--TAA-TTTT
gi|80331                      :                                     TCACTAG-AG----AATTGCACT----TGAA-TATT-TCAAT-GC-A-A-A--C-A--GATGT----T-GAC-GCTAAAT
gi|80332                      :                                                                     TATTGTCATT-GG-A-ATA--G-G--AATAT----T-GAC-GCTAAATGCTT-------------GTGTATAA--CGTTA----ATATAAC-TA-----TG-A-TA--T-A---A--TGA-TTTTATA-T-A----AAAAA------ATATAA----------------------CA------A------------ATAC
gi|80333                      :                                                                                                                                                 GTTT----GAATAAC-TA-----TG-A-GA--C-A---A--TAA-TTTTGTA-C-G----AAAAC------G-ATAG----------------------AA------A------------ATACATGCC--CATTGT-GTCCACTATTCACGTTAGAT
gi|80334                      :                                                                                                                                            aacatgTTT----AAACAAT-TA-----TA-G-TA--T-A---A--TAA-TTTTCTA-C-C----TAAAA------A-ATCATTT-------------------CA------A------------ATACCTGCC--CTTTGC-ATGCACCATTCATATCAGAT
gi|80335                      :                                                                                                                                                                                             -TTGTCTA-C-A----TAAAA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATACATGCC--CATTAC-CATCACCATTCATGTTA
gi|80336                      :                                                                                                                                                                                                TTCTA-C---------GA------G-ATAA----------------------CA------A------------ATATATGCT--CATTGC-CTTCA-CATTCACGTTAGAT