lowQualScore : 11111 111111111
lowQualScore : 44444 1 11111 0 33333 111 0 00 0 99 333333 0 00 333333333 00 11 0 00 3333 1
lowQualScore : ..... . ..... . ..... ... . .. . .. ...... . .. ......... .. .. . .. .... .
lowQualScore : 66666 4 66666 6 11111 888 6 99 6 55 666666 6 99 555555555 99 99 7 99 1111 8
consensus : CGATGGTTC----AAC-GCAACACT-----GCTCTAT-TT-----CC-T-TAT-T--TG-TTTA------T-A--TG---N-----AG--ATA--G-A--ACAGTGT----TGCGCTGAA
Reference ( gi|154582 ) : CGATGGTTC----TAT-GCAACACT-----GCTCTAT-TT-----CC-T-TAT-T--TG-TTCA------T-A--TG---A-----AG--ATA--G-A--ACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154556 : CGATCATTC----AAT-GCAACACT-----GCTCTAT-TT-----TC-T-TAT-T--TG-TTTA------T-A--TG---A-----AG--ACA--G-A--ACAGTGT----TGCGCTAAA
gi|154583 : tCGATGGTTC----TAT-GCAACACT-----GCCATTT-TT-----CT-T-TAT-T--AG-TTTA------T-A--TG---T-----AG--ATA--G-A--ACAATGT----TGCACTGAA
gi|154557 : CAATGGTTC----AAG-ACAACACT-----GCTCTAT-TT-----CC-T-TAA-T--TG-TTTA------T-A--TA---T-----AG--ATA--G-A--AGAGTGT----TGCGCTGAA
gi|154568 : tCAATGGTTC----AAC-ACAACACT-----GCTGTGT-TT-----CC-T-TAA-A--TG-TTGG------T-A--TG---T-----AG--ATA--G-A--ACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154566 : tCGGTGGATC----AAC-GCAATACT-----GCTCTAT-TT-----CC-T-TAT-T--TG-TTCA------T-A--TA---T-----AG--ATA--A-A--ATAGTGT----CGCACTCAA
gi|154562 : tCGATGGTTC----AAC-GCAACACT-----GGTCTAT-TT-----CC-A-TAT-C--TG-TTTA------T-A--T-----------G--GTA--G-A--ACAGTGTTGCATGCGCTGAA
gi|154584 : tCGTTGGTTC----------AACACT-----GCTCTAA-TT-----TC-T-TAT-T--TG-TATA------T-G--TG---T-----AA--ACA--G-A--ACAGTGT----TGTGCTGGA
gi|154576 : CGTTGACTC----GAC-GCAACACT-----GCACTAT-TT-----CC-T-TAG-T--TG-TTAA------T-A--TG---T-----AG--ATA--G-A--ACTGTGT----TGCACCG
gi|154571 : tCAACAGCTC----AGT-GCAACACT-----ACTCTAT-TT-----CT-T-TAT-T--TG-TTTA------T-A--TG---T-----AG--ATA--GAA--AAAGTTT----TGCGCTTAA
gi|154575 : tCGATGGTTTAACGTAA-GCAGCACC-----GCTCTAT-TT-----CC-T-TCT-T--TG-TT------------------A-----AG--AGA--G-A--ACAGTGT----TGCACTGAA
gi|154574 : tCAATGGATC----AAC-GCAACACT-----GTTCTGT-TT-----TA-G-TAT-T--TG-TCTA------T-A--TG---T-----AG--ATA--A-A--ACAGTGC----TGCGCTCAA
gi|154577 : tCAATGATTC----AGC-GCAACACT-----GCTATAT-TT-----CT-T-TAT-T--TG-TTTA------C-A--TGTCTA-----A-----A--G-A--ACAGTGT----T
gi|154555 : tCGATGGTTC----AAC-TCAACATT-----GCCCTAT-TT-----GT-T-TAT-C--TA-T-------------------------AG--ATA--G-A--ACAGTGT----TGCAATGAtcact
gi|154579 : tCGATGTTTC----AAT-GCAACACT-----ACTGTGT-TT-----CC-------T--TG-TTTA------C-A--TG---T-----AG--ACA--A-A--ACCATGT----TG
gi|154585 : tCAATGGTTA----AAC-GAAACAAT-----TATCTAT-TT-----AC-T-GAT-C--TG-TTCA------T-A--TG---A-----AA--ATA--A-A--ACAGT
gi|154587 : CGATGGTTG----AAC-GCAACACT-----G--CTAT-TT-----CC-T-TAT-T--CG-TTTA------C----TG---G-----AG--tctgc
gi|154586 : CGATGATTC----AAT-GCAACACT-----TCTCTAT-TA-----TT-T-TAT-T--TG-TT
gi|154581 : CGACGGTTC----AAC-GCAACACTCAAGTGTTCTAG-TT-----CC-T-TAT-T--TG-TTTA------
gi|154560 : tGATGGTGC----AAT-GTAACACC-----GTTGTAT-TT-----CC-T-TAT-T--TG-TTTA------T-A--TG---T-----AG--ATA--G-A--ATGGTGT----TGTGCTGAA
gi|154570 : ttGATGGTTC----CAC-ACAACACT-----GCTCTAT-AT-----CT-T-TAT-T--TG-TGTA------T-A--TG---A-----AG--AAA--G-A--ACAGTGT----TGT
gi|154561 : ttGACGGTTC----AGT-GCAATACT-----GCTTTAT-TC-----TC-T-TAC-T--TG-TTTA------T-A--CG---T-----AG--ATA--G-A--ACAGTGT----TGTACTGAA
gi|154558 : ttGATTGTTC----AAC-GCAACACT-----GCTCTAT-TT-----CC-T-TAT-T--TA-TTTA------T-A--TG---GTATGTAG--ATA--G-A--ATAGTGT----TGCGCAGAA
gi|154573 : ttGATGGTTC----CAT-GTAAC--T-----GCTCT----------CC-T-TAT-T--TG-TTTA------T-A--TG---T-----AG--ATA--G-A--ACAGTGT----TGTACTGA
gi|154572 : ttGATGGTTT----AAC-GCAACACT-----GCCCTAT-TT-----CC-T-TAG-T--TA-TGCA------T-G--TG---T-----AG--ACA--G-A--ACAGTGC----TGCACTGAA
gi|154559 : ttGATGGTTC----TGC-GCAACACT-----ATTCTAT-CTACATACC-A-TAT-A--AA-TAAA------T-A--AG---G-----AA--ATA--G-A--GCAGTGT----TGCGTTGAA
gi|154569 : ttGACGGTTC----AAT-GCAACACT-----GGTCTAT-TT-----CC-T-TAT-T--TG-TGTA------C-A--TG---T-----AG--ATA--G-A--ACATCGT----GACACTGA
gi|154589 : ttGATGGCTC----AAT-GCAACACT-----ATTATAT-TT-----CT-G-TAT-T--TGTTTTA------T-A--TG---C-----AG--ATA--G-A--ACTGTGT----TGCACTG
gi|154565 : GATGGTTC----AAT-GCAAGCCT-----GCTATAT-TT-----CT-T-TTTCT--TG-TTTA------T-A--T----------------A--G-A--ACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154590 : ttGACAGTCC----AAC-ACAACACT-----GCTCTAT-AT-----CC-T-TAT-A--TG-TTTA------T-A--CG---C-----AG--ATA--A-A--ACAATGT----TGCGATAAA
gi|154578 : GACGGTTC----AGT-GCA-CGCT-----GCTCTAT-GA-----CC-A-TAT-T--TG-TTTA------T-A--TA---T-----AA--ATG--G-A--ACAGTAC----TGTGTTGAA
gi|154591 : ttGATGGTTC----AGG-GCAACACT-----GCTGTAT-TT-----CC-T-TGT-T--TG-T-------------------------AG--ATA--G-T--ATAGTGT----GGCACTGAA
gi|154593 : GGTGGTGC----AAC-GCAACACT-----GTTTTAG-TT-----CC-T-TAT-T--TG-TTAA------C-A--TG---T-----AG--ACA--A-A--A
gi|154592 : GATGGGTC----AAC-ACAAAATT-----GCTC-ATCTT-----TC-T-TAT-T--TG-TTTC------T-A--CC---T-----AG--ATA--G-A--ACCGTGT----TGCAATGA
gi|154595 : ATGGGCC----AAC-GCAACACT-----GCTTTAT-TT-----CC-A-TAT-T--TG-TTTA------TAA--TG---T-----AG--ATA--G-A--AAAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154594 : ATGGTTC----AAT-GCAACACT-----GCCCTCT-TT-----CC-T-TAC-A--TG-CTTA------T-A--TG---T-----AG--ATA--G-A--ACAGTGT----TGCGATGGA
gi|154596 : ATGATTC----TAT-GCAACACT-----GCTCTAT-TT-----GC---TAT-T--CG-TTTA------T-A--TG---T-----AG--ATA--T-A--A-GGCGT----TGAGC
gi|154580 : ATGGTTC----AAC-GCAACTTT-----GCTCTAC-TC-----CC-A-TAT-T--TG-TTTA------T-A--
gi|154597 : tctTGGTTC----AAT-GCAACACT-----GCCCTAT-TT-----CC-T-TCT-T--TG-TTTG------T-A--TG---A-----AG--ATA--A-A--ACTGTGT----TGCGCTAAAattaactattctgtagatgttgcagtgttgc
gi|154598 : TAGTTC----AAT-GCAACACT-----GCTCTAT-TT-----CC-T-TAT-T--TG-T-------------------------AG--ATA--G-A--GCA
gi|154599 : TGGTTC----TCT-GCAACACT-----GCTCCAT-TT-----CC-T-TAT-T--TG-GTTA------T-A--Tctcttac
gi|154600 : GATTC----AAC-GCA-CACT-----ACTCCAT-TT-----CC-T-TAT-A--TG-CT------------------------AG--GTA--A-A--ATAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154558 : TTC----TGC-GCAACACT-----ATTCTAT-CTACATACC-A-TAT-A--AA-TAAA------T-A--AG---G-----AA--ATA--G-A--GCAGTGT----TGCGTTGAA
gi|154559 : ttgattgTTC----AAC-GCAACACT-----GCTCTAT-TT-----CC-T-TAT-T--TA-TTTA------T-A--TG---GTATGTAG--ATA--G-A--ATAGTGT----TGCGCAGAA
gi|154563 : ttgatggTTC----AAC-GCAACACT-----GGTCTAT-TT-----CC-A-TAT-C--TG-TTTA------T-A--T-----------G--GTA--G-A--ACAGTGTTGCATGCGCTGAA
gi|154594 : tcgagtgTC----CATCGCAACACT-----GTTCTAT-CT-----AC-A-TAT-A--AG---CA------T-G--TA---A-----GG--AAA--G-AGGGCAGTGT----TGCATTGAA
gi|154590 : atggTT----TATCGCAACATT-----GTTTTAT-CT-----GC-G-TAT-A--AA---CA------T-A--TA---A-----GG--ATATAG-A--GCAGTGT----TGTGTTGGA
gi|154562 : gacagAT-GCAACACT-----GTTCTA---------CC-A-TAT-A--AA-CAGA------T-A--TG---G-----AA--ATA--G-A--CCAGTGT----TGCGTTGAA
gi|154563 : tcgatggAT-GCAACACT-----GTTCTA---------CC-A-TAT-A--AA-CAGA------T-A--TG---G-----AA--ATA--G-A--CCAGTGT----TGCGTTGAAgcgctgaa
gi|154601 : tcgagtgttcagcgcAT-ATAACACT-----GCTCTAT-GT-----TC-T-TAT-T--TC-TTTA------T-A--TG---T-----AG--ATG--T-A--ACATTGT----TGCACCAAA
gi|154564 : aT-GCAACACT-----GCTCTAT-TT-----CT-T-TTT-T--TG-TCTA------T-A--TG---T-----AG--ATA--G-A--ACAGTTT----TGCACTGAA
gi|154576 : tcaatagttaacT-GCAACACA-----GTTCTAT-CT-----AC-A-TAT-T--AA---CAAC----T-A--AG---G-----AA--ATA--G-T--GCAGTGT----TGCGTCGA
gi|154567 : tcgttgacT-GCACCACT-----GTTCTAT-TT-----------AT-A--TA-TCAA------G-AAATA---A-----GGTAATA--G-A--ACAGTGT----T-TGTTGGAccg
gi|154602 : ttggttgT-GCAATGCT-----GCTCTAT-TT-----CT-G-TAT-T--TG-T-------------------------AG--ATA--G-A--ACAATGG----TGGGCTGActga
gi|154556 : -GCAACACT-----GTTCTGT-CT-----TC-A-TAT-A--AA-CAAA------T-A--AG---A-----AA--ATA--G-A--GCAGTGT----TGCATTGAA
gi|154557 : tcgatca-GCAACACT-----CTTCTAT---------C-TATAT-A--TA-AACAAT----T-A--AG---G-----AA--ATA--G-A--GCAGTGT----TGTCTTGAAgctaaa
gi|154574 : tcaatgg-GCAGCACT-----GTTTTAT-CT-----AC-A-TAT-A--GA-CAAA------T-A--CT---A-----AA--ACA--G-A--ACAGTGT----TGCGTTGAgctgaa
gi|154603 : tcaatgga-GCAACACT-----GCTCTTT-TT-----CC-T-TAT-T--CG-TTTA------T-A--TG---T-----AG--ACT--G-A--AC--TGT----TCTGCTGgctcaa
gi|154570 : CAACACT-----GTTCT---TT-----CT-T-CAT-A--TA-CACA------A-A--TA---A-----AG--ATATAG-A--GCAGTGT----TGTGTGGAA
gi|154568 : ttgatggCAACACT-----GTTCTAT-CT-----AC-A-TAC-CAACA-TT--------T-A--AG---G-----AA--ACA--C-A--GCAGTGT----TGTGTTGAAtg
gi|154595 : tcaatggCAACACT-----TTTCTAT-CT-----ACAT-TAT-A--AA-CAAA------T-A--TG---G-----AA--ATA--A-A--GCAGTGT----TGCGTTGtgctgaa
gi|154584 : atgggcCAACACT-----GTTCTGT-TT-----AC-A-CAT-A--TA-CAAA------T-A--AG---A-----AA--TTA--G-A--GCAGTGT----TGtgctgaa
gi|154604 : cgttggttCAACACT-----GATCTAT-TT-----CT-T-TAT-T--TG-TTTATACATGT-A--TG---T-----AG--ATA--G-A--AAAGTCT----TGCTCTGAAtgctgga
gi|154567 : AACACT-----GTTCTAT-TA-----CC-T-TAT-T--TC-TTGA------T-A--TA---T-----AA--ATA--G-A--ACAGTGG----TGCACTGA
gi|154588 : ttggttgtccaacaT-----GCTCTAT-TT-----CT-T-TAT-T--AG-TTTA------T-A--TG---T-----AG--ATA--G-A--GCA
Alignments
lowQualScore : 0 1111 22222 0 0 0 666666 0 44444444444 2 0 3333
lowQualScore : . .... ..... . . . ...... . ........... . . ....
lowQualScore : 8 7777 00000 8 8 8 444444 8 00000000000 5 9 9999
consensus : CGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TGTAGATAG-AACAGTGT----TGCGCTGAA
Reference ( family-491 ) : CGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TGNAGATAG-AACAGTGT----TGCGCTGAA
gi|154555 : CGATGGTTCAAC-T----CAACAT-----TGCCCTAT-T---------TG-TTTA------T-C-----------TATAGATAG-AACAGTGT----TGCAATGA
gi|154556 : tCGATCATTCAAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTTCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TGAAGACAG-AACAGTGT----TGCGCTAAA
gi|154557 : tCAATGGTTCAAG-A----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAA-TTG-TTTA------T-A-----------TATAGATAG-AAGAGTGT----TGCGCTGAA
gi|154558 : tGATTGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTA-TTTATATGG-T-A-----------TGTAGATAG-AATAGTGT----TGCGCAGAA
gi|154559 : ttTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTA-TTTATATGG-T-A-----------TGTAGATAG-AATAGTGT----TGCGCAGAA
gi|154560 : ttgatggGATGGTGCAAT-G----TAACAC-----CGTTGTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TGTAGATAG-AATGGTGT----TGTGCTGAA
gi|154561 : ttGACGGTTCAGT-G----CAATAC-----TGCTTTAT-TCTCTTAC-TTG-TTTA------T-A-----------CGTAGATAG-AACAGTGT----TGTACTGAA
gi|154562 : ttCGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCATAT-CTG-TTTA------T-A-----------TGG---TAG-AACAGTGTTGCATGCGCTGAA
gi|154563 : tTTCAAC-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCATAT-CTG-TTTA------T-A-----------TGG---TAG-AACAGTGTTGCATGCGCTGAA
gi|154564 : tcgagtgCAATAGTT-AACTG----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCTTTTT-TTG-TCTA------T-A-----------TGTAGATAG-AACAGTTT----TGCACTGAA
gi|154565 : tGATGGTTCAAT-G----CAAGCC-----TGCTATAT-TTCTTTTTCTTG-TTTA------T------------------ATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154566 : ttCGGTGGATCAAC-G----CAATAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTCA------T-A-----------TATAGATAA-AATAGTGT----CGCACTCAA
gi|154567 : tGTCCAAC-A-----AACAC-----TGTTCTAT-TACCTTAT-TTC-TTGA------T-A-----------TATAAATAG-AACAGTGG----TGCACTGA
gi|154568 : ttggttCAATGGTTCAAC-A----CAACAC-----TGCTGTGT-TTCCTTAA-ATG-TTGG------T-A-----------TGTAGATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154569 : tGACGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TGTA------C-A-----------TGTAGATAG-AACATCGT----GACACTGA
gi|154570 : ttGATGGTTCCAC-A----CAACAC-----TGCTCTAT-ATCTTTAT-TTG-TGTA------T-A-----------TGAAGAAAG-AACAGTGT----TGTG
gi|154571 : ttCAACAGCTCAGT-G----CAACAC-----TACTCTAT-TTCTTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TGTAGATAGAAAAAGTTT----TGCGCTTAA
gi|154572 : tGATGGTTTAAC-G----CAACAC-----TGCCCTAT-TTCCTTAG-TTA-TGCA------T-G-----------TGTAGACAG-AACAGTGC----TGCACTGAA
gi|154573 : ttGATGGTTCCAT-G----TAAC-------TGCTCT-----CCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TGTAGATAG-AACAGTGT----TGTACTGA
gi|154574 : ttCAATGGATCAAC-G----CAACAC-----TGTTCTGT-TTTAGTAT-TTG-TCTA------T-A-----------TGTAGATAA-AACAGTGC----TGCGCTCAA
gi|154575 : tCGATGGTTTAAC-GTAAGCAGCAC-----CGCTCTAT-TTCCTTCT-TTG-TT------------------------AAGAGAG-AACAGTGT----TGCACTGAA
gi|154576 : tCGTTGACTCGAC-G----CAACAC-----TGCACTAT-TTCCTTAG-TTG-TTAA------T-A-----------TGTAGATAG-AACTGTGT----TGCACCG
gi|154577 : tCAATGATTCAGC-G----CAACAC-----TGCTATAT-TTCTTTAT-TTG-TTTA------C-A-----------TGTCTAAAG-AACAGTGT----TTCACT
gi|154578 : tGACGGTTCAGT-G----CA-CGC-----TGCTCTAT-GACCATAT-TTG-TTTA------T-A-----------TATAAATGG-AACAGTAC----TGTGTTGAA
gi|154579 : ttCGATGTTTCAAT-G----CAACAC-----TACTGTGT-TTCC-----TTG-TTTA------C-A-----------TGTAGACAA-AACCATGT----TG
gi|154580 : tATGGTTCAAC-G----CAACTT-----TGCTCTAC-TCCCATAT-TTG-TTTA------T-AATTAACTATTCTGTAGATGT-TGCAGTGT----TGC
gi|154581 : tctCGACGGTTCAAC-G----CAACACTCAAGTGTTCTAG-TTCCTTAT-TTG-TTTA------
gi|154582 : tCGATGGTTCTAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTCA------T-A-----------TGAAGATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154583 : CGATGGTTCTAT-G----CAACAC-----TGCCATTT-TTCTTTAT-TAG-TTTA------T-A-----------TGTAGATAG-AACAATGT----TGCACTGAA
gi|154584 : CGTTGGTTCAAC----------AC-----TGCTCTAA-TTTCTTAT-TTG-TATA------T-G-----------TGTAAACAG-AACAGTGT----TGTGCTGGA
gi|154585 : CAATGGTTAAAC-G----AAACAA-----TTATCTAT-TTACTGAT-CTG-TTCA------T-A-----------TGAAAATAA-AACAGTTC----TGC
gi|154586 : CGATGATTCAAT-G----CAACAC-----TTCTCTAT-TATTTTAT-TTG-TT
gi|154587 : CGATGGTTGAAC-G----CAACAC-----TG--CTAT-TTCCTTAT-TCG-TTTA------C-------------TGGAG
gi|154588 : CAATGATTTAAC-T----CAAG-------TGCTCTAT-TTCTTTAT-TAG-TTTA------T-A-----------TGTAGATAG-AGCA
gi|154589 : GATGGCTCAAT-G----CAACAC-----TATTATAT-TTCTGTAT-TTGTTTTA------T-A-----------TGCAGATAG-AACTGTGT----TGCACTG
gi|154590 : GACAGTCCAAC-A----CAACAC-----TGCTCTAT-ATCCTTAT-ATG-TTTA------T-A-----------CGCAGATAA-AACAATGT----TGCGATAAA
gi|154591 : GATGGTTCAGG-G----CAACAC-----TGCTGTAT-TTCCTTGT-TTG-T--------------------------AGATAG-TATAGTGT----GGCACTGAA
gi|154592 : GATGGGTCAAC-A----CAAAAT-----TGCTC-ATCTTTCTTAT-TTG-TTTC------T-A-----------CCTAGATAG-AACCGTGT----TGCAATGA
gi|154593 : GGTGGTGCAAC-G----CAACAC-----TGTTTTAG-TTCCTTAT-TTG-TTAA------C-A-----------TGTAGACAA-AA
gi|154594 : ATGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCCCTCT-TTCCTTAC-ATG-CTTA------T-A-----------TGTAGATAG-AACAGTGT----TGCGATGGA
gi|154595 : ATGGGCCAAC-G----CAACAC-----TGCTTTAT-TTCCATAT-TTG-TTTA------TAA-----------TGTAGATAG-AAAAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154596 : ATGATTCTAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTGC-TAT-TCG-TTTA------T-A-----------TGTAGATAT-AA-GGCGT----TGAGC
gi|154597 : TGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCCCTAT-TTCCTTCT-TTG-TTTG------T-A-----------TGAAGATAA-AACTGTGT----TGCGCTAAA
gi|154598 : TAGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-T--------------------------AGATAG-AGCACTCT----TAC
gi|154599 : TGGTTCTCT-G----CAACAC-----TGCTCCAT-TTCCTTAT-TTG-GTTA------T-A-----------T
gi|154600 : GATTCAAC-G----CA-CAC-----TACTCCAT-TTCCTTAT-ATG-CT-------------------------AGGTAA-AATAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154601 : AACAC-----TGCTCTAT-GTTCTTAT-TTC-TTTA------T-A-----------TGTAGATGT-AACATTGT----TGCACCAAA
gi|154602 : aatat-G----CAATGC-----TGCTCTAT-TTCTGTAT-TTG-T--------------------------AGATAG-AACAATGG----TGGGCTGA
gi|154603 : t-G----CAACAC-----TGCTCTTT-TTCCTTAT-TCG-TTTA------T-A-----------TGTAGACTG-AAC--TGT----TCTGCTG
gi|154604 : ----CAACAC-----TGATCTAT-TTCTTTAT-TTG-TTTATACATGT-A-----------TGTAGATAG-AAAAGTCT----TGCTCTGAA
Alignments
lowQualScore : 0 1111 22222 0 0 0 666666 0 44444444444 0 0 3333
lowQualScore : . .... ..... . . . ...... . ........... . . ....
lowQualScore : 8 7777 00000 8 8 8 444444 9 00000000000 9 9 9999
consensus : CGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGCTGAA
Reference ( family-491 ) : CGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGCTGAA
gi|154555 : CGATGGTTCAAC-T----CAACAT-----TGCCCTAT-T---------TG-TTTA------T-C-----------TA-TAGATAG-AACAGTGT----TGCAATGA
gi|154556 : tCGATCATTCAAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTTCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-AAGACAG-AACAGTGT----TGCGCTAAA
gi|154557 : tCAATGGTTCAAG-A----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAA-TTG-TTTA------T-A-----------TA-TAGATAG-AAGAGTGT----TGCGCTGAA
gi|154558 : tGATTGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTA-TTTATATGG-T-A-----------TG-TAGATAG-AATAGTGT----TGCGCAGAA
gi|154559 : ttTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTA-TTTATATGG-T-A-----------TG-TAGATAG-AATAGTGT----TGCGCAGAA
gi|154560 : ttgatggGATGGTGCAAT-G----TAACAC-----CGTTGTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AATGGTGT----TGTGCTGAA
gi|154561 : ttGACGGTTCAGT-G----CAATAC-----TGCTTTAT-TCTCTTAC-TTG-TTTA------T-A-----------CG-TAGATAG-AACAGTGT----TGTACTGAA
gi|154562 : ttCGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCATAT-CTG-TTTA------T-A-----------T----GGTAG-AACAGTGTTGCATGCGCTGAA
gi|154563 : tTTCAAC-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCATAT-CTG-TTTA------T-A-----------T----GGTAG-AACAGTGTTGCATGCGCTGAA
gi|154564 : tcgagtgCAATAGTT-AACTG----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCTTTTT-TTG-TCTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTTT----TGCACTGAA
gi|154565 : tGATGGTTCAAT-G----CAAGCC-----TGCTATAT-TTCTTTTTCTTG-TTTA------T-------------------ATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154566 : ttCGGTGGATCAAC-G----CAATAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTCA------T-A-----------TA-TAGATAA-AATAGTGT----CGCACTCAA
gi|154567 : tGTCCAAC-A-----AACAC-----TGTTCTAT-TACCTTAT-TTC-TTGA------T-A-----------TA-TAAATAG-AACAGTGG----TGCACTGA
gi|154568 : ttggttCAATGGTTCAAC-A----CAACAC-----TGCTGTGT-TTCCTTAA-ATG-TTGG------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154569 : tGACGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TGTA------C-A-----------TG-TAGATAG-AACATCGT----GACACTGA
gi|154570 : ttGATGGTTCCAC-A----CAACAC-----TGCTCTAT-ATCTTTAT-TTG-TGTA------T-A-----------TG-AAGAAAG-AACAGTGT----TGTG
gi|154571 : ttCAACAGCTCAGT-G----CAACAC-----TACTCTAT-TTCTTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAGAAAAAGTTT----TGCGCTTAA
gi|154572 : tGATGGTTTAAC-G----CAACAC-----TGCCCTAT-TTCCTTAG-TTA-TGCA------T-G-----------TG-TAGACAG-AACAGTGC----TGCACTGAA
gi|154573 : ttGATGGTTCCAT-G----TAAC-------TGCTCT-----CCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGTACTGA
gi|154574 : ttCAATGGATCAAC-G----CAACAC-----TGTTCTGT-TTTAGTAT-TTG-TCTA------T-A-----------TG-TAGATAA-AACAGTGC----TGCGCTCAA
gi|154575 : tCGATGGTTTAAC-GTAAGCAGCAC-----CGCTCTAT-TTCCTTCT-TTG--TTA------------------------AGAGAG-AACAGTGT----TGCACTGAA
gi|154576 : tCGTTGACTCGAC-G----CAACAC-----TGCACTAT-TTCCTTAG-TTG-TTAA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACTGTGT----TGCACCG
gi|154577 : tCAATGATTCAGC-G----CAACAC-----TGCTATAT-TTCTTTAT-TTG-TTTA------C-A-----------TG-TCTAAAG-AACAGTGT----TTCACT
gi|154578 : tGACGGTTCAGT-G----CA-CGC-----TGCTCTAT-GACCATAT-TTG-TTTA------T-A-----------TA-TAAATGG-AACAGTAC----TGTGTTGAA
gi|154579 : ttCGATGTTTCAAT-G----CAACAC-----TACTGTGT-TTCC-----TTG-TTTA------C-A-----------TG-TAGACAA-AACCATGT----TG
gi|154580 : tATGGTTCAAC-G----CAACTT-----TGCTCTAC-TCCCATAT-TTG-TTTA------T-AATTAACTATTCTG-TAGATGT-TGCAGTGT----TGC
gi|154581 : tctCGACGGTTCAAC-G----CAACACTCAAGTGTTCTAG-TTCCTTAT-TTG-TTTA------
gi|154582 : tCGATGGTTCTAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTCA------T-A-----------TG-AAGATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154583 : CGATGGTTCTAT-G----CAACAC-----TGCCATTT-TTCTTTAT-TAG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAATGT----TGCACTGAA
gi|154584 : CGTTGGTTCAAC----------AC-----TGCTCTAA-TTTCTTAT-TTG-TATA------T-G-----------TG-TAAACAG-AACAGTGT----TGTGCTGGA
gi|154585 : CAATGGTTAAAC-G----AAACAA-----TTATCTAT-TTACTGAT-CTG-TTCA------T-A-----------TG-AAAATAA-AACAGTTC----TGC
gi|154586 : CGATGATTCAAT-G----CAACAC-----TTCTCTAT-TATTTTAT-TTG-TT
gi|154587 : CGATGGTTGAAC-G----CAACAC-----TG--CTAT-TTCCTTAT-TCG-TTTA------
gi|154588 : CAATGATTTAAC-T----CAAG-------TGCTCTAT-TTCTTTAT-TAG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AGCActggag
gi|154589 : GATGGCTCAAT-G----CAACAC-----TATTATAT-TTCTGTAT-TTGTTTTA------T-A-----------TG-CAGATAG-AACTGTGT----TGCACTG
gi|154590 : GACAGTCCAAC-A----CAACAC-----TGCTCTAT-ATCCTTAT-ATG-TTTA------T-A-----------CG-CAGATAA-AACAATGT----TGCGATAAA
gi|154591 : GATGGTTCAGG-G----CAACAC-----TGCTGTAT-TTCCTTGT-T---------------------------TG-TAGATAG-TATAGTGT----GGCACTGAA
gi|154592 : GATGGGTCAAC-A----CAAAAT-----TGCTC-ATCTTTCTTAT-TTG-TTTC------T-A-----------CC-TAGATAG-AACCGTGT----TGCAATGA
gi|154593 : GGTGGTGCAAC-G----CAACAC-----TGTTTTAG-TTCCTTAT-TTG-TTAA------C-A-----------TG-TAGACAA-AA
gi|154594 : ATGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCCCTCT-TTCCTTAC-ATG-CTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGATGGA
gi|154595 : ATGGGCCAAC-G----CAACAC-----TGCTTTAT-TTCCATAT-TTG-TTTA------TAA-----------TG-TAGATAG-AAAAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154596 : ATGATTCTAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTGC-TAT-TCG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAT-AA-GGCGT----TGAGC
gi|154597 : TGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCCCTAT-TTCCTTCT-TTG-TTTG------T-A-----------TG-AAGATAA-AACTGTGT----TGCGCTAAA
gi|154598 : TAGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-T---------------------------TG-TAGATAG-AGCACTCT----TAC
gi|154599 : TGGTTCTCT-G----CAACAC-----TGCTCCAT-TTCCTTAT-TTG-GTTA------T-A-----------T
gi|154600 : GATTCAAC-G----CA-CAC-----TACTCCAT-TTCCTTAT-----------------A-----------TGCTAGGTAA-AATAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154601 : AACAC-----TGCTCTAT-GTTCTTAT-TTC-TTTA------T-A-----------TG-TAGATGT-AACATTGT----TGCACCAAA
gi|154602 : aatat-G----CAATGC-----TGCTCTAT-TTCTGTAT-TTG-T---------------------------AGATAG-AACAATGG----TGGGCTGA
gi|154603 : t-G----CAACAC-----TGCTCTTT-TTCCTTAT-TCG-TTTA------T-A-----------TG-TAGACTG-AAC--TGT----TCTGCTG
gi|154604 : ----CAACAC-----TGATCTAT-TTCTTTAT-TTG-TTTATACATGT-A-----------TG-TAGATAG-AAAAGTCT----TGCTCTGAA
Alignments
lowQualScore : 0 1111 22222 0 0 0 666666 0 44444444444 0 0 3333
lowQualScore : . .... ..... . . . ...... . ........... . . ....
lowQualScore : 8 7777 00000 8 8 8 444444 9 00000000000 9 9 9999
consensus : CGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGCTGAA
Reference ( family-491 ) : CGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGCTGAA
gi|154555 : CGATGGTTCAAC-T----CAACAT-----TGCCCTAT-T---------TG-TTTA------T-C-----------TA-TAGATAG-AACAGTGT----TGCAATGA
gi|154556 : tCGATCATTCAAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTTCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-AAGACAG-AACAGTGT----TGCGCTAAA
gi|154557 : tCAATGGTTCAAG-A----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAA-TTG-TTTA------T-A-----------TA-TAGATAG-AAGAGTGT----TGCGCTGAA
gi|154558 : tGATTGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTA-TTTATATGG-T-A-----------TG-TAGATAG-AATAGTGT----TGCGCAGAA
gi|154559 : ttTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTA-TTTATATGG-T-A-----------TG-TAGATAG-AATAGTGT----TGCGCAGAA
gi|154560 : ttgatggGATGGTGCAAT-G----TAACAC-----CGTTGTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AATGGTGT----TGTGCTGAA
gi|154561 : ttGACGGTTCAGT-G----CAATAC-----TGCTTTAT-TCTCTTAC-TTG-TTTA------T-A-----------CG-TAGATAG-AACAGTGT----TGTACTGAA
gi|154562 : ttCGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCATAT-CTG-TTTA------T-A-----------T----GGTAG-AACAGTGTTGCATGCGCTGAA
gi|154563 : tTTCAAC-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCATAT-CTG-TTTA------T-A-----------T----GGTAG-AACAGTGTTGCATGCGCTGAA
gi|154564 : tcgagtgCAATAGTT-AACTG----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCTTTTT-TTG-TCTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTTT----TGCACTGAA
gi|154565 : tGATGGTTCAAT-G----CAAGCC-----TGCTATAT-TTCTTTTTCTTG-TTTA------T-------------------ATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154566 : ttCGGTGGATCAAC-G----CAATAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTCA------T-A-----------TA-TAGATAA-AATAGTGT----CGCACTCAA
gi|154567 : tGTCCAAC-A-----AACAC-----TGTTCTAT-TACCTTAT-TTC-TTGA------T-A-----------TA-TAAATAG-AACAGTGG----TGCACTGA
gi|154568 : ttggttCAATGGTTCAAC-A----CAACAC-----TGCTGTGT-TTCCTTAA-ATG-TTGG------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154569 : tGACGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TGTA------C-A-----------TG-TAGATAG-AACATCGT----GACACTGA
gi|154570 : ttGATGGTTCCAC-A----CAACAC-----TGCTCTAT-ATCTTTAT-TTG-TGTA------T-A-----------TG-AAGAAAG-AACAGTGT----TGTG
gi|154571 : ttCAACAGCTCAGT-G----CAACAC-----TACTCTAT-TTCTTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAGAAAAAGTTT----TGCGCTTAA
gi|154572 : tGATGGTTTAAC-G----CAACAC-----TGCCCTAT-TTCCTTAG-TTA-TGCA------T-G-----------TG-TAGACAG-AACAGTGC----TGCACTGAA
gi|154573 : ttGATGGTTCCAT-G----TAAC-------TGCTCT-----CCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGTACTGA
gi|154574 : ttCAATGGATCAAC-G----CAACAC-----TGTTCTGT-TTTAGTAT-TTG-TCTA------T-A-----------TG-TAGATAA-AACAGTGC----TGCGCTCAA
gi|154575 : tCGATGGTTTAAC-GTAAGCAGCAC-----CGCTCTAT-TTCCTTCT-TTG--TTA------------------------AGAGAG-AACAGTGT----TGCACTGAA
gi|154576 : tCGTTGACTCGAC-G----CAACAC-----TGCACTAT-TTCCTTAG-TTG-TTAA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACTGTGT----TGCACCG
gi|154577 : tCAATGATTCAGC-G----CAACAC-----TGCTATAT-TTCTTTAT-TTG-TTTA------C-A-----------TG-TCTAAAG-AACAGTGT----TTCACT
gi|154578 : tGACGGTTCAGT-G----CA-CGC-----TGCTCTAT-GACCATAT-TTG-TTTA------T-A-----------TA-TAAATGG-AACAGTAC----TGTGTTGAA
gi|154579 : ttCGATGTTTCAAT-G----CAACAC-----TACTGTGT-TTCC-----TTG-TTTA------C-A-----------TG-TAGACAA-AACCATGT----TG
gi|154580 : tATGGTTCAAC-G----CAACTT-----TGCTCTAC-TCCCATAT-TTG-TTTA------T-AATTAACTATTCTG-TAGATGT-TGCAGTGT----TGC
gi|154581 : tctCGACGGTTCAAC-G----CAACACTCAAGTGTTCTAG-TTCCTTAT-TTG-TTTA------
gi|154582 : tCGATGGTTCTAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTCA------T-A-----------TG-AAGATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154583 : CGATGGTTCTAT-G----CAACAC-----TGCCATTT-TTCTTTAT-TAG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAATGT----TGCACTGAA
gi|154584 : CGTTGGTTCAAC----------AC-----TGCTCTAA-TTTCTTAT-TTG-TATA------T-G-----------TG-TAAACAG-AACAGTGT----TGTGCTGGA
gi|154585 : CAATGGTTAAAC-G----AAACAA-----TTATCTAT-TTACTGAT-CTG-TTCA------T-A-----------TG-AAAATAA-AACAGTTC----TGC
gi|154586 : CGATGATTCAAT-G----CAACAC-----TTCTCTAT-TATTTTAT-TTG-TT
gi|154587 : CGATGGTTGAAC-G----CAACAC-----TG--CTAT-TTCCTTAT-TCG-TTTA------
gi|154588 : CAATGATTTAAC-T----CAAG-------TGCTCTAT-TTCTTTAT-TAG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AGCActggag
gi|154589 : GATGGCTCAAT-G----CAACAC-----TATTATAT-TTCTGTAT-TTGTTTTA------T-A-----------TG-CAGATAG-AACTGTGT----TGCACTG
gi|154590 : GACAGTCCAAC-A----CAACAC-----TGCTCTAT-ATCCTTAT-ATG-TTTA------T-A-----------CG-CAGATAA-AACAATGT----TGCGATAAA
gi|154591 : GATGGTTCAGG-G----CAACAC-----TGCTGTAT-TTCCTTGT-T---------------------------TG-TAGATAG-TATAGTGT----GGCACTGAA
gi|154592 : GATGGGTCAAC-A----CAAAAT-----TGCTC-ATCTTTCTTAT-TTG-TTTC------T-A-----------CC-TAGATAG-AACCGTGT----TGCAATGA
gi|154593 : GGTGGTGCAAC-G----CAACAC-----TGTTTTAG-TTCCTTAT-TTG-TTAA------C-A-----------TG-TAGACAA-AA
gi|154594 : ATGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCCCTCT-TTCCTTAC-ATG-CTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGATGGA
gi|154595 : ATGGGCCAAC-G----CAACAC-----TGCTTTAT-TTCCATAT-TTG-TTTA------TAA-----------TG-TAGATAG-AAAAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154596 : ATGATTCTAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTGC-TAT-TCG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAT-AA-GGCGT----TGAGC
gi|154597 : TGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCCCTAT-TTCCTTCT-TTG-TTTG------T-A-----------TG-AAGATAA-AACTGTGT----TGCGCTAAA
gi|154598 : TAGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-T---------------------------TG-TAGATAG-AGCACTCT----TAC
gi|154599 : TGGTTCTCT-G----CAACAC-----TGCTCCAT-TTCCTTAT-TTG-GTTA------T-A-----------T
gi|154600 : GATTCAAC-G----CA-CAC-----TACTCCAT-TTCCTTAT-----------------A-----------TGCTAGGTAA-AATAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154601 : AACAC-----TGCTCTAT-GTTCTTAT-TTC-TTTA------T-A-----------TG-TAGATGT-AACATTGT----TGCACCAAA
gi|154602 : aatat-G----CAATGC-----TGCTCTAT-TTCTGTAT-TTG-T---------------------------AGATAG-AACAATGG----TGGGCTGA
gi|154603 : t-G----CAACAC-----TGCTCTTT-TTCCTTAT-TCG-TTTA------T-A-----------TG-TAGACTG-AAC--TGT----TCTGCTG
gi|154604 : ----CAACAC-----TGATCTAT-TTCTTTAT-TTG-TTTATACATGT-A-----------TG-TAGATAG-AAAAGTCT----TGCTCTGAA
blockSeqs : TAAG TCAAG TACATG ATTAACTATTC TGCA
blockSeqs : . . TATGG . TGCA
blockSeqs : . . TATGG . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : CGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGCTGAA
finalCons : CGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGCTGAA
Alignments
lowQualScore : 0 1111 22222 0 0 0 666666 0 44444444444 0 0 3333
lowQualScore : . .... ..... . . . ...... . ........... . . ....
lowQualScore : 8 7777 00000 8 8 8 444444 9 00000000000 9 9 9999
consensus : CGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGCTGAA
Reference ( family-491 ) : CGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGCTGAA
gi|154555 : CGATGGTTCAAC-T----CAACAT-----TGCCCTAT-T---------TG-TTTA------T-C-----------TA-TAGATAG-AACAGTGT----TGCAATGA
gi|154556 : tCGATCATTCAAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTTCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-AAGACAG-AACAGTGT----TGCGCTAAA
gi|154557 : tCAATGGTTCAAG-A----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAA-TTG-TTTA------T-A-----------TA-TAGATAG-AAGAGTGT----TGCGCTGAA
gi|154558 : tGATTGTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTA-TTTATATGG-T-A-----------TG-TAGATAG-AATAGTGT----TGCGCAGAA
gi|154559 : ttTTCAAC-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTA-TTTATATGG-T-A-----------TG-TAGATAG-AATAGTGT----TGCGCAGAA
gi|154560 : ttgatggGATGGTGCAAT-G----TAACAC-----CGTTGTAT-TTCCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AATGGTGT----TGTGCTGAA
gi|154561 : ttGACGGTTCAGT-G----CAATAC-----TGCTTTAT-TCTCTTAC-TTG-TTTA------T-A-----------CG-TAGATAG-AACAGTGT----TGTACTGAA
gi|154562 : ttCGATGGTTCAAC-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCATAT-CTG-TTTA------T-A-----------T----GGTAG-AACAGTGTTGCATGCGCTGAA
gi|154563 : tTTCAAC-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCATAT-CTG-TTTA------T-A-----------T----GGTAG-AACAGTGTTGCATGCGCTGAA
gi|154564 : tcgagtgCAATAGTT-AACTG----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCTTTTT-TTG-TCTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTTT----TGCACTGAA
gi|154565 : tGATGGTTCAAT-G----CAAGCC-----TGCTATAT-TTCTTTTTCTTG-TTTA------T-------------------ATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154566 : ttCGGTGGATCAAC-G----CAATAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTCA------T-A-----------TA-TAGATAA-AATAGTGT----CGCACTCAA
gi|154567 : tGTCCAAC-A-----AACAC-----TGTTCTAT-TACCTTAT-TTC-TTGA------T-A-----------TA-TAAATAG-AACAGTGG----TGCACTGA
gi|154568 : ttggttCAATGGTTCAAC-A----CAACAC-----TGCTGTGT-TTCCTTAA-ATG-TTGG------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154569 : tGACGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGGTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TGTA------C-A-----------TG-TAGATAG-AACATCGT----GACACTGA
gi|154570 : ttGATGGTTCCAC-A----CAACAC-----TGCTCTAT-ATCTTTAT-TTG-TGTA------T-A-----------TG-AAGAAAG-AACAGTGT----TGTG
gi|154571 : ttCAACAGCTCAGT-G----CAACAC-----TACTCTAT-TTCTTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAGAAAAAGTTT----TGCGCTTAA
gi|154572 : tGATGGTTTAAC-G----CAACAC-----TGCCCTAT-TTCCTTAG-TTA-TGCA------T-G-----------TG-TAGACAG-AACAGTGC----TGCACTGAA
gi|154573 : ttGATGGTTCCAT-G----TAAC-------TGCTCT-----CCTTAT-TTG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGTACTGA
gi|154574 : ttCAATGGATCAAC-G----CAACAC-----TGTTCTGT-TTTAGTAT-TTG-TCTA------T-A-----------TG-TAGATAA-AACAGTGC----TGCGCTCAA
gi|154575 : tCGATGGTTTAAC-GTAAGCAGCAC-----CGCTCTAT-TTCCTTCT-TTG--TTA------------------------AGAGAG-AACAGTGT----TGCACTGAA
gi|154576 : tCGTTGACTCGAC-G----CAACAC-----TGCACTAT-TTCCTTAG-TTG-TTAA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACTGTGT----TGCACCG
gi|154577 : tCAATGATTCAGC-G----CAACAC-----TGCTATAT-TTCTTTAT-TTG-TTTA------C-A-----------TG-TCTAAAG-AACAGTGT----TTCACT
gi|154578 : tGACGGTTCAGT-G----CA-CGC-----TGCTCTAT-GACCATAT-TTG-TTTA------T-A-----------TA-TAAATGG-AACAGTAC----TGTGTTGAA
gi|154579 : ttCGATGTTTCAAT-G----CAACAC-----TACTGTGT-TTCC-----TTG-TTTA------C-A-----------TG-TAGACAA-AACCATGT----TG
gi|154580 : tATGGTTCAAC-G----CAACTT-----TGCTCTAC-TCCCATAT-TTG-TTTA------T-AATTAACTATTCTG-TAGATGT-TGCAGTGT----TGC
gi|154581 : tctCGACGGTTCAAC-G----CAACACTCAAGTGTTCTAG-TTCCTTAT-TTG-TTTA------
gi|154582 : tCGATGGTTCTAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-TTG-TTCA------T-A-----------TG-AAGATAG-AACAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154583 : CGATGGTTCTAT-G----CAACAC-----TGCCATTT-TTCTTTAT-TAG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAATGT----TGCACTGAA
gi|154584 : CGTTGGTTCAAC----------AC-----TGCTCTAA-TTTCTTAT-TTG-TATA------T-G-----------TG-TAAACAG-AACAGTGT----TGTGCTGGA
gi|154585 : CAATGGTTAAAC-G----AAACAA-----TTATCTAT-TTACTGAT-CTG-TTCA------T-A-----------TG-AAAATAA-AACAGTTC----TGC
gi|154586 : CGATGATTCAAT-G----CAACAC-----TTCTCTAT-TATTTTAT-TTG-TT
gi|154587 : CGATGGTTGAAC-G----CAACAC-----TG--CTAT-TTCCTTAT-TCG-TTTA------
gi|154588 : CAATGATTTAAC-T----CAAG-------TGCTCTAT-TTCTTTAT-TAG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AGCActggag
gi|154589 : GATGGCTCAAT-G----CAACAC-----TATTATAT-TTCTGTAT-TTGTTTTA------T-A-----------TG-CAGATAG-AACTGTGT----TGCACTG
gi|154590 : GACAGTCCAAC-A----CAACAC-----TGCTCTAT-ATCCTTAT-ATG-TTTA------T-A-----------CG-CAGATAA-AACAATGT----TGCGATAAA
gi|154591 : GATGGTTCAGG-G----CAACAC-----TGCTGTAT-TTCCTTGT-T---------------------------TG-TAGATAG-TATAGTGT----GGCACTGAA
gi|154592 : GATGGGTCAAC-A----CAAAAT-----TGCTC-ATCTTTCTTAT-TTG-TTTC------T-A-----------CC-TAGATAG-AACCGTGT----TGCAATGA
gi|154593 : GGTGGTGCAAC-G----CAACAC-----TGTTTTAG-TTCCTTAT-TTG-TTAA------C-A-----------TG-TAGACAA-AA
gi|154594 : ATGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCCCTCT-TTCCTTAC-ATG-CTTA------T-A-----------TG-TAGATAG-AACAGTGT----TGCGATGGA
gi|154595 : ATGGGCCAAC-G----CAACAC-----TGCTTTAT-TTCCATAT-TTG-TTTA------TAA-----------TG-TAGATAG-AAAAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154596 : ATGATTCTAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTGC-TAT-TCG-TTTA------T-A-----------TG-TAGATAT-AA-GGCGT----TGAGC
gi|154597 : TGGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCCCTAT-TTCCTTCT-TTG-TTTG------T-A-----------TG-AAGATAA-AACTGTGT----TGCGCTAAA
gi|154598 : TAGTTCAAT-G----CAACAC-----TGCTCTAT-TTCCTTAT-T---------------------------TG-TAGATAG-AGCACTCT----TAC
gi|154599 : TGGTTCTCT-G----CAACAC-----TGCTCCAT-TTCCTTAT-TTG-GTTA------T-A-----------T
gi|154600 : GATTCAAC-G----CA-CAC-----TACTCCAT-TTCCTTAT-----------------A-----------TGCTAGGTAA-AATAGTGT----TGTGCTGAA
gi|154601 : AACAC-----TGCTCTAT-GTTCTTAT-TTC-TTTA------T-A-----------TG-TAGATGT-AACATTGT----TGCACCAAA
gi|154602 : aatat-G----CAATGC-----TGCTCTAT-TTCTGTAT-TTG-T---------------------------AGATAG-AACAATGG----TGGGCTGA
gi|154603 : t-G----CAACAC-----TGCTCTTT-TTCCTTAT-TCG-TTTA------T-A-----------TG-TAGACTG-AAC--TGT----TCTGCTG
gi|154604 : ----CAACAC-----TGATCTAT-TTCTTTAT-TTG-TTTATACATGT-A-----------TG-TAGATAG-AAAAGTCT----TGCTCTGAA