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lowQualScore                  :      0                  8888                  2222222222222     33      9            44   44      44  0 0   1  999     999 6666666   1      4   00 11111111111111        4       99 99999                         00       666666     5    44     4  
consensus                     :  ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTC--TCT--ACCGAC--TG-C-GCC-AC---CGCAA---C-------AAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--A-----TATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-CGGG-ATTTATNAT
Reference ( gi|108355 )       :  ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTC--TCT--ACCGAC--TG-C-GCC-AC---CGCAA---C-------AAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--A-----TATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-CGGG-ATTTATAAT
gi|108359                     :  ACTT-TTGTGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATC-AATGACGACGTC--TCT--ACCGAC--TG-C-GCC-AC---CGCAA---C-------AAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--A-----TAGATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-CGGG-ATTTATAAT
gi|108356                     :  ACTT-TGGAGATTCGAACCCATG----GCCCCTGCGGAGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AA-GACGACATC--TCT--ACCGAC--TG-C-GTC-AC---CGCAA---C-------AAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--A-----TATATTGGCGTCGCCATTTATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-TGGG-ATTTATAATtat
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gi|108364                     :  ACTT-TCGGGATTCGAACTCGCG----GTCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTC--TCT--ACCGAC--TGCC-GAC-GC---CGCA
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gi|108380                     :  ACTT-TAGAGATTCGAACCCACG----G-CTCTGCAGTCTCAGCG-------------TCTTC--CACACT-GA----GACGTC--TCC--ACAAAC--TG-T-ACT-AC---CACAA---A-------GAC-GCC
gi|108381                     :  ACTG-TGGGGTTTTGAACCGATG----GCCTCTGCAGTGTCAGT----------------------ACATT-AATGATGGTGTC--TCT--ACCACC--TG-C-ACT-AC---AGCAA---C-------AAC-G
gi|108382                     :  ACGT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CC
gi|108383                     :  ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCTCTGCGGCGTCAG
gi|108384                     :  ATTT-TCAAGATTCGAACCCACA----GTCCCTGCGACATCAATG-------------CCTTG--CACATT-AATCACTAC
gi|108365                     :  ACTT-TCGGGATTCGAACCCATG----GCCCCTGCGGCGTCGGC
gi|108385                     :  ACTT-TGGAGATTCGAACCCGCG----GCCCCTGCG
gi|108378                     :  ACCT-TGAAGATTCGAACCCACG----GCCCCAGCGGCG
gi|108371                     :  ACTT-TCGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGC
gi|108386                     :   CTA-TGG-GATTTGAACCCACA----GCCCCTACAGCATCAGCG-------------TC-AG--CACATC-AATGATGACGTC--TCT--ACTGAC--TT-C-CCC-AA---CGCAT---C-------AAC-GCCAAA-AGA--G---------G----TGGCGCAA-AT--TAC--A-----TATATTGG---TGCCATTCATGTAC--ACAAGAC------ATAGG-C
gi|108388                     :    TT-TGG-GACTCGATCTCGCA----GCCCTTGCGGAGTCAACG-------------CCTAC--CATATT-AATGACGACGTC--TTT--A--------A-C-GCC-A---------------------A-----AAA-AAA--T---------G----TTGCACAA-ATAACGC--A-----TATATTGACGTCGTCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-CGGG-TTTTAT
gi|108389                     :    TT-TCAAGATTCGAACCCATG----GTTCTTATGGCGTCAGCG-------------TCTAA--CACTCT-A-T----ATATC--TCT--ACCGAC--TG-C-GCC-GC---CGCAC---C-------AAC-GTCAAA-CAA--A---------G----TT-CGCAA-ATAACGC--A-----TATAATGACTGCTTCATTACTGTAC--ATAGAAA------ATAtgt
gi|108387                     :    TT-TGCAGATTTGAACCCACG----GCCCCTGCGGTGTCAGTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACAACGTC--TCT--TCTGTC--TG-C-GCC-AC---CGCAA---C-------AAC-TCC
gi|108391                     :    TT-CGGA-ATTCGAACCCAAG----GTCCTTTCGGCGTCAGCG-------------CTAAG--CACAAT-AACGACAACGTC--TCT--ACCAAT--TG-C-GCC-AC---C
gi|108390                     :    TC-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-
gi|108392                     :    TT-TAGAGATTGTAACTCGC------TCCCTGCAGCGTCAGCA-------------CCTAG--CACATT-AAT---GACATC--TCT--ACC-ACTTTT-T-GTA-AC---TGCAA---C-------AAA-GCnnnnnnnnnnagtagcgcatatattggcgtcgccattaatgtacacaggacataggc
gi|108393                     :    TT-CGGAG-TTCAAACATACA----GCCCATAAGACGTCAGCA-------------CCAAGAACACATT-AATGATGACG----TTT--ACCGAC--AG-C-
gi|108394                     :    TT-TGG-GATTCATACCCACA----GCCCCTGTTTTGTCAGT----------------T------CATT-AATTCCAACGTC--TCT--ACAAAA--TG-T-GCT-AC---AACAA---C-------AGC-
gi|108395                     :          AGATTAGAACCCACA----GCCCCTCCGACGTCATTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTC--TCT--ACTGAC--TG-C-
gi|108396                     :            ATTCGAACCAACG----CACTCTGCGGCGTAAGTG-------------CCTAG--CAAATT-ACTGACAACGTC--TAT--ACCGAC--TA-C-GCC-AC---CACAG---C-------AAT-GCCAAA-AAC--G---------G----TTGCGTAAGATA-CGC--A-----TATGCTGctggtgcatatattggcatcgccattgatgtacacaggacataggagggtatcattat
gi|108397                     :            ATTCGACCCCCCGCCGGGCCCCTGCGGCGTCAACG-------------CCTAG--CACATT-AATGACTATGTC--TCT--ACCGTC--TG-C-A-C-GC---CTCAA---C-------
gi|108398                     :            ATTTGAACCCACG----GTCCCTGCAACGTCAGCA-------------CTTCG--TACATT-AATGACAATGTG--TCT--ACCAAC--
gi|108399                     :              TCGAACACACG----ACCCCTGCAGCGTCAGCG-------------TCTAC--CACATT-AATGACGACGTC--TCT--ACCGAC--TG-T-GCC-AC---CGCAA---C-------AAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--A-----TATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAGGTTGGT-ATT
gi|108400                     :                GAACTCACG----ACTCCTGCGGCTTCAGCGGCTTCGGCGCCTACTTAG--CACATT-AATGACGACGGG--ACT--A-CGAC--TG-C-CGC-AC---TGCAA---T-------AAC-G------AAA--C---------------------A-ATAACGCATA-----TATATTGACGTCACCAGTAATTTACGTACAG--C------ATATG-CG
gi|108401                     :                         ----GTCCCTATTGCACCACCG-------------CCTAG--CACATG-AATGACGATGTC--TCT--ATCGAT--TG-C-GCT-AC---CCCAA---T-------GTC-GCCA
gi|108402                     :                                              G-------------CCTCG--TACATT-ACTGACGACTTA--ACT--ACCGA--------------------AA---C-------AACTACTGAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-GAAGCAC--A-----TATTTTAGCTTCGCCATTAACGTAC--ACAGGAA------AGAGC-CG
gi|108359                     :                                                                G--TACATT-AATGGCGACGCCAATCT--A-------TG-C-GCT-ATTTGCGCAA---CGTTTTTTGGC-GT----------T---------G----TTGCG----GTGGCGC--AGTCGGTAGA--GACGTCGTCATTGATGTGC--atgatatcat
gi|108388                     :                    acttttgtgattcgaacccacggcccctgcggcgtcagcgcctaG--TACATT-AATGACGACGTC--acaggacataggcgggatttataattat
gi|108360                     : tttgggactcgatctcgcagcccttgcggagtcaacgcctaccatattaatgacgacgtctttaacgccaaaaaaaatgttgcacaaataacgcatatattG-C-GCCTAG---CACAT---T-------AAT-GCAAAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-ATAGCGC--A-----TAGATTGGCGTTGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-CGGG-ATTTATAATacaggacataggcgggttttattgt
gi|108369                     :                                                                                   actttggagattcgaacccacggcccctgcggcgtca---C-------AAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--A-----TATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAGGTTGGT-ATTTATA
gi|108403                     :                                                                                            actttggagattcgaacccacggaccctgcggcgtcagcgcctagcaAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-CTAGCAC--A-----TTTATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGAAC------ATAGG-AGGGTATTT
gi|108367                     :                                                                                                                                                    ---------G----TTGCG----GTGGCGC--AGTCAGTAGA--GACGTCGTCATTAATGTGC--A-AGGta
gi|108405                     :                                                                                                                      actttggagattccaacccacagcccctgcggcgtcagcg----TTGCGCAA-ATAACGC--A-----TATATTGACGTCACCATTAATGTAC--ATAGAAC------ATA-G-CGGGTATTaacgccaaaaaa
gi|108404                     :                                                                                                                                                              ----TTGCACAA-ATAACGC--A-----AACATTGACGTCGCCATTAATGAAC--ACAGGAC------ATAGG-CGGG-TATTATTATat
gi|108390                     :                                                                                                                                                                         A-GTAGCGC--A-----TATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-C
gi|108395                     :                                                                                                                 tctggagattcgaacccacggcccctgcggcgtcagcgcctagcacattnnnnnnnnnnTGGTGC--A-----TATATTGGCATCGCCATTGATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-AGGG-





Alignments
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lowQualScore                  :                                                                0                  8888                  1111111111111     33      0               44      44  0 0   1       999    1      4   00 88888888888888        4       00                          11       444444     3   2 666    0  
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Reference ( family-481 )      :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-CGG-G-ATTTATNAT
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gi|108387                     :                                                              TT-TGCAGATTTGAACCCACG----GCCCCTGCGGTGTCAGTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACAACGTCTCT--TCTGTC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-TCC
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gi|108393                     :                                                              TT-CGGAG-TTCAAACATACA----GCCCATAAGACGTCAGCA-------------CCAAGAACACATT-AATGATGACG--TTT--ACCGAC--AG-C-
gi|108394                     :                                                              TT-TGG-GATTCATACCCACA----GCCCCTGTTTTGTCAGT----------------T------CATT-AATTCCAACGTCTCT--ACAAAA--TG-T-GCT-ACAACAA---CAGC-
gi|108395                     :                                                                    AGATTAGAACCCACA----GCCCCTCCGACGTCATTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-
gi|108395                     :                                                                                                                                                                                                                          TGGTGC--ATATATTGGCATCGCCATTGATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-AGG-G----TATCATctggtgcatatattggcatcgccattgatgtacacaggacataggagggtatcattat
gi|108396                     : agattagaacccacagcccctccgacgtcattgcctagcacattaatgacgacgtctctactgactgccATTCGAACCAACG----CACTCTGCGGCGTAAGTG-------------CCTAG--CAAATT-ACTGACAACGTCTAT--ACCGAC--TA-C-GCC-ACCACAG---CAAT-GCCAAA-AAC--G---------G----TTGCGTAAGATA-CGC--ATATGCTGtat
gi|108397                     :                                                                      ATTCGACCCCCCGCCGGGCCCCTGCGGCGTCAACG-------------CCTAG--CACATT-AATGACTATGTCTCT--ACCGTC--TG-C-A-C-GCCTCAA---C
gi|108398                     :                                                                      ATTTGAACCCACG----GTCCCTGCAACGTCAGCA-------------CTTCG--TACATT-AATGACAATGTGTCT--ACCAAC--
gi|108399                     :                                                                        TCGAACACACG----ACCCCTGCAGCGTCAGCG-------------TCTAC--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-T-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAGGTTGG-T-ATT
gi|108400                     :                                                                          GAACTCACG----ACTCCTGCGGCTTCAGCGGCTTCGGCGCCTACTTAG--CACATT-AATGACGACGGGACT--A-CGAC--TG-C-CGC-ACTGCAA---TAAC-G------AAA--C---------------------A-ATAACGCATATATATTGACGTCACCAGTAATTTACGTACAG--C------ATATG-CG
gi|108401                     :                                                                                   ----GTCCCTATTGCACCACCG-------------CCTAG--CACATG-AATGACGATGTCTCT--ATCGAT--TG-C-GCT-ACCCCAA---TGTC-GCCA
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lowQualScore                  :                                                                0                  8888                  1111111111111     33      0               44      44  0 0   1       999    1      4   00 88888888888888        4       00                          11       444444     7    22222       
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Reference ( family-481 )      :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-CGGG--NT-TTATTAT
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gi|108372                     :                                                            ACTT-AGGAGATTCAA---CA-----------TGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CGCATT-AATGATGACATCTCT--ACCGAC--CG---GCC-ACCAAAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGTGCAA-ATAGTGC--ATATATTGGGGTTGCCATTATTGTAC--AGAGGAC------ATAGG-
gi|108373                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-G-C-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------T----TT
gi|108374                     :                                                            ACTTATGG-GATTTGAACCCACA----GACCCTGTGGTGTCAGCG-------------ACTAA--CACATT---------------T--ATCGAC--TG-C-GCC-ACCACAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------A----TTGTGCCA-ATAACTT--GTATATTGGAGTTGCCATCAATGTAC-------AC------ATAGG-TGGG--TA-TTATTAT
gi|108375                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACA----GCCCCTGCAGCGTTGGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-ACC-ACGGCAA---CAAC-GCCAGA-AAA--C---------A----TTGCGC
gi|108376                     :                                                            ACTT-TGGGGATTTGAATCCACG----GCCCCTGTGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CAGATT-AATAACGACTTCTAT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-
gi|108377                     :                                                            ACTT-TGGA-ATTCGAA-CCAAA----ACCCATGCGACGAAAGTG-------------CCAAT--TACAGT-AATGACGACGTCTCTTCTCCAAA--TG-T-GCT-GCCACAT---AAAC-GCC-AC-ATA--T---------A----TTGCACAA-ATAGCAC--ATATATAGATATCGTCATCAATATAA--ACAGGAC------ATGG---GAG--CTGTTATTAT
gi|108378                     :                                                            ACCT-TGAAGATTCGAACCCACG----GCCCCAGCGGCGta
gi|108379                     :                                                            ATTT-TAGAGATTCGAACCAACG----ACTC-TGCGGTCTCAACG-------------TCTAG--CACATTCACTGA-GACGTCTCC--ACAAAC--TG-T-ACT-ACCACAA---CGAC-GTC
gi|108380                     :                                                            ACTT-TAGAGATTCGAACCCACG----G-CTCTGCAGTCTCAGCG-------------TCTTC--CACACT-GA----GACGTCTCC--ACAAAC--TG-T-ACT-ACCACAA---AGAC-GCC
gi|108381                     :                                                            ACTG-TGGGGTTTTGAACCGATG----GCCTCTGCAGTGTCAGT----------------------ACATT-AATGATGGTGTCTCT--ACCACC--TG-C-ACT-ACAGCAA---CAAC-G
gi|108382                     :                                                            ACGT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CC
gi|108383                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCTCTGCGGCGTCAG
gi|108384                     :                                                            ATTT-TCAAGATTCGAACCCACA----GTCCCTGCGACATCAATG-------------CCTTG--CACATT-AATCACTAC
gi|108385                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCGCG----GCCCCTGCG
gi|108386                     :                                                             CTA-TGG-GATTTGAACCCACA----GCCCCTACAGCATCAGCG-------------TC-AG--CACATC-AATGATGACGTCTCT--ACTGAC--TT-C-CCC-AACGCAT---CAAC-GCCAAA-AGA--G---------G----TGGCGCAA-AT--TAC--ATATATTGG---TGCCATTCATGTAC--ACAAGAC------ATAGG-C
gi|108387                     :                                                              TT-TGCAGATTTGAACCCACG----GCCCCTGCGGTGTCAGTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACAACGTCTCT--TCTGTC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-TCC
gi|108388                     :                                                              TT-TGG-GACTCGATCTCGCA----GCCCTTGCGGAGTCAACG-------------CCTAC--CATATT-AATGACGACGTCTTT--A--------A-C-GCC-A-----------A-----AAA-AAA--T---------G----TTGCACAA-ATAACGC--ATATATTGACGTCGTCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-CGGG--TT-TTATTGT
gi|108389                     :                                                              TT-TCAAGATTCGAACCCATG----GTTCTTATGGCGTCAGCG-------------TCTAA--CACTCT-A-T----ATATCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-GCCGCAC---CAAC-GTCAAA-CAA--A---------G----TT-CGCAA-ATAACGC--ATATAATGACTGCTTCATTACTGTAC--ATAGAAA------ATA
gi|108390                     :                                                              TC-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-
gi|108390                     :                                                                                                                                                                                                                       A-GTAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-Cnnnnnnnnnnagtagcgcatatattggcgtcgccattaatgtacacaggacataggc
gi|108391                     :   tctggagattcgaacccacggcccctgcggcgtcagcgcctagcacattnnnnnnnnnnTT-CGGA-ATTCGAACCCAAG----GTCCTTTCGGCGTCAGCG-------------CTAAG--CACAAT-AACGACAACGTCTCT--ACCAAT--TG-C-GCC-ACC
gi|108392                     :                                                              TT-TAGAGATTGTAACTCGC------TCCCTGCAGCGTCAGCA-------------CCTAG--CACATT-AAT---GACATCTCT--ACC-ACTTTT-T-GTA-ACTGCAA---CAAA-GC
gi|108393                     :                                                              TT-CGGAG-TTCAAACATACA----GCCCATAAGACGTCAGCA-------------CCAAGAACACATT-AATGATGACG--TTT--ACCGAC--AG-C-
gi|108394                     :                                                              TT-TGG-GATTCATACCCACA----GCCCCTGTTTTGTCAGT----------------T------CATT-AATTCCAACGTCTCT--ACAAAA--TG-T-GCT-ACAACAA---CAGC-
gi|108395                     :                                                                    AGATTAGAACCCACA----GCCCCTCCGACGTCATTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-
gi|108395                     :                                                                                                                                                                                                                          TGGTGC--ATATATTGGCATCGCCATTGATGTAC--ACAGGAC------ATAGG-AGGG--TA-TCATTATctggtgcatatattggcatcgccattgatgtacacaggacataggagggtatcattat
gi|108396                     : agattagaacccacagcccctccgacgtcattgcctagcacattaatgacgacgtctctactgactgccATTCGAACCAACG----CACTCTGCGGCGTAAGTG-------------CCTAG--CAAATT-ACTGACAACGTCTAT--ACCGAC--TA-C-GCC-ACCACAG---CAAT-GCCAAA-AAC--G---------G----TTGCGTAAGATA-CGC--ATATGCTG
gi|108397                     :                                                                      ATTCGACCCCCCGCCGGGCCCCTGCGGCGTCAACG-------------CCTAG--CACATT-AATGACTATGTCTCT--ACCGTC--TG-C-A-C-GCCTCAA---C
gi|108398                     :                                                                      ATTTGAACCCACG----GTCCCTGCAACGTCAGCA-------------CTTCG--TACATT-AATGACAATGTGTCT--ACCAAC--
gi|108399                     :                                                                        TCGAACACACG----ACCCCTGCAGCGTCAGCG-------------TCTAC--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-T-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAGG-
gi|108400                     :                                                                          GAACTCACG----ACTCCTGCGGCTTCAGCGGCTTCGGCGCCTACTTAG--CACATT-AATGACGACGGGACT--A-CGAC--TG-C-CGC-ACTGCAA---TAAC-G------AAA--C---------------------A-ATAACGCATATATATTGACGTCACCAGTAATTTACGTACAG--C------ATATG-CGttggtatt
gi|108401                     :                                                                                   ----GTCCCTATTGCACCACCG-------------CCTAG--CACATG-AATGACGATGTCTCT--ATCGAT--TG-C-GCT-ACCCCAA---TGTC-GCCA
gi|108402                     :                                                                                                        G-------------CCTCG--TACATT-ACTGACGACTTAACT--ACCGA-----------------AA---CAACTACTGAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-GAAGCAC--ATATTTTAGCTTCGCCATTAACGTAC--ACAGGAA------AGAGC-CG
gi|108403                     :                                                                                                                                                                                         AA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-CTAGCAC--ATTTATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGAAC------ATAGG-AGGGTATT-TTAatgatatcat
gi|108404                     :                                                                                                                                                                                                            ----TTGCACAA-ATAACGC--AAACATTGACGTCGCCATTAATGAAC--ACAGGAC------ATAGG-CGGG--TA-TTATTAT
gi|108405                     :                                                                                                                                                                                                            ----TTGCGCAA-ATAACGC--ATATATTGACGTCACCATTAATGTAC--ATAGAAC------ATA-G-CGGG------TATTAT





Alignments
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lowQualScore                  :                                                                .                  ....                  .............     ..      .               ..      ..  . .   .       ...    .      .   .. ..............        .       ..                          ..       ......         .. ..   ...    
lowQualScore                  :                                                                0                  8888                  1111111111111     33      0               44      44  0 0   1       999    1      4   00 88888888888888        4       00                          11       444444         11 66   111    
consensus                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCGGG--T-NTTA---TTAT
Reference ( family-481 )      :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCGGG--T-TTTA---TTAT
gi|108355                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCGGG--A-TTTA---TAAT
gi|108356                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCATG----GCCCCTGCGGAGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AA-GACGACATCTCT--ACCGAC--TG-C-GTC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTTATGTAC--ACAGGAC------ATAGGTGGG--A-TTTA---TAAT
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gi|108358                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACA----GCCCCTGCAGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AA-GACGACATCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--CAATGCGCAAA----TAGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTTGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG
gi|108359                     :                                                            ACTT-TTGTGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATC-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATAGATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCGGG--A-TTTA---TAAT
gi|108360                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGtat
gi|108360                     :                                                                                                                                                              G-C-GCCTAGCACAT---TAAT-GCAAAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-ATAGCGC--ATAGATTGGCGTTGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCGGG--A-TTTA---TAATcaaaaaaacgttgcacaaatagcgcatagattggcgttgccattaatgtacacaggacataggcgggatttataat
gi|108361                     :                       actttggagattcgaacccacggcccctgcggcgtcaACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCATGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATA-AATGACGTCGTCTCT--ATAGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCATA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGAAC------ATAGGCGGG--T-ATTA---TTAT
gi|108362                     :                                                            ACTT-TGGAGATCCGAACCTACG----ACCCCTGAGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-TATGGTGACGTCTCT--ACCAAC--TG-C-GCC-ACAGCAA---GAAC-GCCAAATAAA--C---------A----TTGCGCAA-ATAGCG
gi|108363                     :                                                            ACTT-TCGGGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACTTT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-CCGAC-ACCGCAA---CAAC-GCCGAA-TAA--C---------G----TTGCGCAA-GTAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCGGG--T-ATTAATTTTAT
gi|108364                     :                                                            ACTT-TCGGGATTCGAACTCGCG----GTCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TGCC-GAC-GCCGCA
gi|108365                     :                                                            ACTT-TCGGGATTCGAACCCATG----GCCCCTGCGGCGTCGGC
gi|108366                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCAAACCCATG----GCCCCTGCTAAATCAGCG-------------CCTAA--CACATT-AATGACGACATCTCT--ACCAAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-TCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTAAAGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCGGG--T-ATTG---TTAT
gi|108367                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCCAACCCACA----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTTG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--
gi|108368                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--AACATC-AATGACGACATCTCT--AACGAC--TG-C-GCT-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TT-------ATA------ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAAGACGCCTATATAGGCGGG--T-ATTA---TTAT
gi|108369                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GACCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CATATA-AATACCAAC--CTAT--GCC--C--TG-T-G-T-ACATTAATGGCGAC-GCCAAT-ATATTC---------ACTTTTTGCGC-A-ATGGC-------TTTTGGCGTTG
gi|108369                     :                                                                                                                                                                             ---CAAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAGGTTGG--TATTTA---
gi|108370                     :            actttggagattcgaacccacggaccctgcggcgtcagcgcctagcatACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----CCCCCTGTGACGTCAGCG-------------CCTAG--CACGTT-AATGACG---TCACC--ATCGAC--TG-C-GCC-ACAGCAA---CAAC-GCTAAA-AAA--A---------GG---TTGCGCAA-ATAGCAC--ATATATTGGTGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCGGT--T-TTTA---TTAT
gi|108371                     :                                                            ACTT-TCGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGC
gi|108372                     :                                                            ACTT-AGGAGATTCAA---CA-----------TGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CGCATT-AATGATGACATCTCT--ACCGAC--CG---GCC-ACCAAAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGTGCAA-ATAGTGC--ATATATTGGGGTTGCCATTATTGTAC--AGAGGAC------ATAGG
gi|108373                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-G-C-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------T----TT
gi|108374                     :                                                            ACTTATGG-GATTTGAACCCACA----GACCCTGTGGTGTCAGCG-------------ACTAA--CACATT---------------T--ATCGAC--TG-C-GCC-ACCACAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------A----TTGTGCCA-ATAACTT--GTATATTGGAGTTGCCATCAATGTAC-------AC------ATAGGTGGG--T-ATTA---TTAT
gi|108375                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACA----GCCCCTGCAGCGTTGGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-ACC-ACGGCAA---CAAC-GCCAGA-AAA--C---------A----TTGCGC
gi|108376                     :                                                            ACTT-TGGGGATTTGAATCCACG----GCCCCTGTGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CAGATT-AATAACGACTTCTAT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-
gi|108377                     :                                                            ACTT-TGGA-ATTCGAA-CCAAA----ACCCATGCGACGAAAGTG-------------CCAAT--TACAGT-AATGACGACGTCTCTTCTCCAAA--TG-T-GCT-GCCACAT---AAAC-GCC-AC-ATA--T---------A----TTGCACAA-ATAGCAC--ATATATAGATATCGTCATCAATATAA--ACAGGAC------ATGGG-AGC--T-GTTA---TTAT
gi|108378                     :                                                            ACCT-TGAAGATTCGAACCCACG----GCCCCAGCGGCGta
gi|108379                     :                                                            ATTT-TAGAGATTCGAACCAACG----ACTC-TGCGGTCTCAACG-------------TCTAG--CACATTCACTGA-GACGTCTCC--ACAAAC--TG-T-ACT-ACCACAA---CGAC-GTC
gi|108380                     :                                                            ACTT-TAGAGATTCGAACCCACG----G-CTCTGCAGTCTCAGCG-------------TCTTC--CACACT-GA----GACGTCTCC--ACAAAC--TG-T-ACT-ACCACAA---AGAC-GCC
gi|108381                     :                                                            ACTG-TGGGGTTTTGAACCGATG----GCCTCTGCAGTGTCAGT----------------------ACATT-AATGATGGTGTCTCT--ACCACC--TG-C-ACT-ACAGCAA---CAAC-G
gi|108382                     :                                                            ACGT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CC
gi|108383                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCTCTGCGGCGTCAG
gi|108384                     :                                                            ATTT-TCAAGATTCGAACCCACA----GTCCCTGCGACATCAATG-------------CCTTG--CACATT-AATCACTAC
gi|108385                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCGCG----GCCCCTGCG
gi|108386                     :                                                             CTA-TGG-GATTTGAACCCACA----GCCCCTACAGCATCAGCG-------------TC-AG--CACATC-AATGATGACGTCTCT--ACTGAC--TT-C-CCC-AACGCAT---CAAC-GCCAAA-AGA--G---------G----TGGCGCAA-AT--TAC--ATATATTGG---TGCCATTCATGTAC--ACAAGAC------ATAGGC
gi|108387                     :                                                              TT-TGCAGATTTGAACCCACG----GCCCCTGCGGTGTCAGTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACAACGTCTCT--TCTGTC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-TCC
gi|108388                     :                                                              TT-TGG-GACTCGATCTCGCA----GCCCTTGCGGAGTCAACG-------------CCTAC--CATATT-AATGACGACGTCTTT--A--------A-C-GCC-A-----------A-----AAA-AAA--T---------G----TTGCACAA-ATAACGC--ATATATTGACGTCGTCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCGGG--T-TTTA---TTGT
gi|108389                     :                                                              TT-TCAAGATTCGAACCCATG----GTTCTTATGGCGTCAGCG-------------TCTAA--CACTCT-A-T----ATATCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-GCCGCAC---CAAC-GTCAAA-CAA--A---------G----TT-CGCAA-ATAACGC--ATATAATGACTGCTTCATTACTGTAC--ATAGAAA------ATA
gi|108390                     :                                                              TC-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-
gi|108390                     :                                                                                                                                                                                                                       A-GTAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCnnnnnnnnnnagtagcgcatatattggcgtcgccattaatgtacacaggacataggc
gi|108391                     :   tctggagattcgaacccacggcccctgcggcgtcagcgcctagcacattnnnnnnnnnnTT-CGGA-ATTCGAACCCAAG----GTCCTTTCGGCGTCAGCG-------------CTAAG--CACAAT-AACGACAACGTCTCT--ACCAAT--TG-C-GCC-ACC
gi|108392                     :                                                              TT-TAGAGATTGTAACTCGC------TCCCTGCAGCGTCAGCA-------------CCTAG--CACATT-AAT---GACATCTCT--ACC-ACTTTT-T-GTA-ACTGCAA---CAAA-GC
gi|108393                     :                                                              TT-CGGAG-TTCAAACATACA----GCCCATAAGACGTCAGCA-------------CCAAGAACACATT-AATGATGACG--TTT--ACCGAC--AG-C-
gi|108394                     :                                                              TT-TGG-GATTCATACCCACA----GCCCCTGTTTTGTCAGT----------------T------CATT-AATTCCAACGTCTCT--ACAAAA--TG-T-GCT-ACAACAA---CAGC-
gi|108395                     :                                                                    AGATTAGAACCCACA----GCCCCTCCGACGTCATTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-
gi|108395                     :                                                                                                                                                                                                                          TGGTGC--ATATATTGGCATCGCCATTGATGTAC--ACAGGAC------ATAGGAGGG--T-ATCA---TTATctggtgcatatattggcatcgccattgatgtacacaggacataggagggtatcattat
gi|108396                     : agattagaacccacagcccctccgacgtcattgcctagcacattaatgacgacgtctctactgactgccATTCGAACCAACG----CACTCTGCGGCGTAAGTG-------------CCTAG--CAAATT-ACTGACAACGTCTAT--ACCGAC--TA-C-GCC-ACCACAG---CAAT-GCCAAA-AAC--G---------G----TTGCGTAAGATA-CGC--ATATGCTG
gi|108397                     :                                                                      ATTCGACCCCCCGCCGGGCCCCTGCGGCGTCAACG-------------CCTAG--CACATT-AATGACTATGTCTCT--ACCGTC--TG-C-A-C-GCCTCAA---C
gi|108398                     :                                                                      ATTTGAACCCACG----GTCCCTGCAACGTCAGCA-------------CTTCG--TACATT-AATGACAATGTGTCT--ACCAAC--
gi|108399                     :                                                                        TCGAACACACG----ACCCCTGCAGCGTCAGCG-------------TCTAC--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-T-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAGGTTGG--T-ATT
gi|108400                     :                                                                          GAACTCACG----ACTCCTGCGGCTTCAGCGGCTTCGGCGCCTACTTAG--CACATT-AATGACGACGGGACT--A-CGAC--TG-C-CGC-ACTGCAA---TAAC-G------AAA--C---------------------A-ATAACGCATATATATTGACGTCACCAGTAATTTACGTACAG--C------ATATGCG
gi|108401                     :                                                                                   ----GTCCCTATTGCACCACCG-------------CCTAG--CACATG-AATGACGATGTCTCT--ATCGAT--TG-C-GCT-ACCCCAA---TGTC-GCCA
gi|108402                     :                                                                                                        G-------------CCTCG--TACATT-ACTGACGACTTAACT--ACCGA-----------------AA---CAACTACTGAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-GAAGCAC--ATATTTTAGCTTCGCCATTAACGTAC--ACAGGAA------AGAGCCG
gi|108403                     :                                                                                                                                                                                         AA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-CTAGCAC--ATTTATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGAAC------ATAGGAGGGTAT-TTTA---atgatatcat
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lowQualScore                  :                                                                .                  ....                  .............     ..      .               ..      ..  . .   .       ...    .      .   .. ..............        .       ..                          ..       ......       ..   .   ...    
lowQualScore                  :                                                                0                  8888                  1111111111111     33      0               44      44  0 0   1       999    1      4   00 88888888888888        4       00                          11       444444       66   0   111    
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Reference ( family-481 )      :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCG--GGTNTTA---TTAT
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gi|108365                     :                                                            ACTT-TCGGGATTCGAACCCATG----GCCCCTGCGGCGTCGGC
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gi|108370                     :         actttggagattcgaacccacggaccctgcggcgtcagcgcctagcatataACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----CCCCCTGTGACGTCAGCG-------------CCTAG--CACGTT-AATGACG---TCACC--ATCGAC--TG-C-GCC-ACAGCAA---CAAC-GCTAAA-AAA--A---------GG---TTGCGCAA-ATAGCAC--ATATATTGGTGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCG--GTTTTTA---TTAT
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gi|108372                     :                                                            ACTT-AGGAGATTCAA---CA-----------TGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CGCATT-AATGATGACATCTCT--ACCGAC--CG---GCC-ACCAAAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGTGCAA-ATAGTGC--ATATATTGGGGTTGCCATTATTGTAC--AGAGGAC------ATAGG
gi|108373                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-G-C-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------T----TT
gi|108374                     :                                                            ACTTATGG-GATTTGAACCCACA----GACCCTGTGGTGTCAGCG-------------ACTAA--CACATT---------------T--ATCGAC--TG-C-GCC-ACCACAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------A----TTGTGCCA-ATAACTT--GTATATTGGAGTTGCCATCAATGTAC-------AC------ATAGGTG--GGTATTA---TTAT
gi|108375                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACA----GCCCCTGCAGCGTTGGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-ACC-ACGGCAA---CAAC-GCCAGA-AAA--C---------A----TTGCGC
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gi|108377                     :                                                            ACTT-TGGA-ATTCGAA-CCAAA----ACCCATGCGACGAAAGTG-------------CCAAT--TACAGT-AATGACGACGTCTCTTCTCCAAA--TG-T-GCT-GCCACAT---AAAC-GCC-AC-ATA--T---------A----TTGCACAA-ATAGCAC--ATATATAGATATCGTCATCAATATAA--ACAGGAC------ATGGG-A--GCTGTTA---TTAT
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gi|108385                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCGCG----GCCCCTGCG
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gi|108387                     :                                                              TT-TGCAGATTTGAACCCACG----GCCCCTGCGGTGTCAGTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACAACGTCTCT--TCTGTC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-TCC
gi|108388                     :                                                              TT-TGG-GACTCGATCTCGCA----GCCCTTGCGGAGTCAACG-------------CCTAC--CATATT-AATGACGACGTCTTT--A--------A-C-GCC-A-----------A-----AAA-AAA--T---------G----TTGCACAA-ATAACGC--ATATATTGACGTCGTCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCG--GGTTTTA---TTGT
gi|108389                     :                                                              TT-TCAAGATTCGAACCCATG----GTTCTTATGGCGTCAGCG-------------TCTAA--CACTCT-A-T----ATATCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-GCCGCAC---CAAC-GTCAAA-CAA--A---------G----TT-CGCAA-ATAACGC--ATATAATGACTGCTTCATTACTGTAC--ATAGAAA------ATA
gi|108390                     :                                                              TC-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-
gi|108390                     :                                                                                                                                                                                                                       A-GTAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAGGCnnnnnnnnnnagtagcgcatatattggcgtcgccattaatgtacacaggacataggc
gi|108391                     :   tctggagattcgaacccacggcccctgcggcgtcagcgcctagcacattnnnnnnnnnnTT-CGGA-ATTCGAACCCAAG----GTCCTTTCGGCGTCAGCG-------------CTAAG--CACAAT-AACGACAACGTCTCT--ACCAAT--TG-C-GCC-ACC
gi|108392                     :                                                              TT-TAGAGATTGTAACTCGC------TCCCTGCAGCGTCAGCA-------------CCTAG--CACATT-AAT---GACATCTCT--ACC-ACTTTT-T-GTA-ACTGCAA---CAAA-GC
gi|108393                     :                                                              TT-CGGAG-TTCAAACATACA----GCCCATAAGACGTCAGCA-------------CCAAGAACACATT-AATGATGACG--TTT--ACCGAC--AG-C-
gi|108394                     :                                                              TT-TGG-GATTCATACCCACA----GCCCCTGTTTTGTCAGT----------------T------CATT-AATTCCAACGTCTCT--ACAAAA--TG-T-GCT-ACAACAA---CAGC-
gi|108395                     :                                                                    AGATTAGAACCCACA----GCCCCTCCGACGTCATTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-
gi|108395                     :                                                                                                                                                                                                                          TGGTGC--ATATATTGGCATCGCCATTGATGTAC--ACAGGAC------ATAGGAG--GGTATCA---TTATctggtgcatatattggcatcgccattgatgtacacaggacataggagggtatcattat
gi|108396                     : agattagaacccacagcccctccgacgtcattgcctagcacattaatgacgacgtctctactgactgccATTCGAACCAACG----CACTCTGCGGCGTAAGTG-------------CCTAG--CAAATT-ACTGACAACGTCTAT--ACCGAC--TA-C-GCC-ACCACAG---CAAT-GCCAAA-AAC--G---------G----TTGCGTAAGATA-CGC--ATATGCTG
gi|108397                     :                                                                      ATTCGACCCCCCGCCGGGCCCCTGCGGCGTCAACG-------------CCTAG--CACATT-AATGACTATGTCTCT--ACCGTC--TG-C-A-C-GCCTCAA---C
gi|108398                     :                                                                      ATTTGAACCCACG----GTCCCTGCAACGTCAGCA-------------CTTCG--TACATT-AATGACAATGTGTCT--ACCAAC--
gi|108399                     :                                                                        TCGAACACACG----ACCCCTGCAGCGTCAGCG-------------TCTAC--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-T-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAGGTT--GGTATT
gi|108400                     :                                                                          GAACTCACG----ACTCCTGCGGCTTCAGCGGCTTCGGCGCCTACTTAG--CACATT-AATGACGACGGGACT--A-CGAC--TG-C-CGC-ACTGCAA---TAAC-G------AAA--C---------------------A-ATAACGCATATATATTGACGTCACCAGTAATTTACGTACAG--C------ATATGCG--
gi|108401                     :                                                                                   ----GTCCCTATTGCACCACCG-------------CCTAG--CACATG-AATGACGATGTCTCT--ATCGAT--TG-C-GCT-ACCCCAA---TGTC-GCCA
gi|108402                     :                                                                                                        G-------------CCTCG--TACATT-ACTGACGACTTAACT--ACCGA-----------------AA---CAACTACTGAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-GAAGCAC--ATATTTTAGCTTCGCCATTAACGTAC--ACAGGAA------AGAGCCGATGATATCA---
gi|108403                     :                                                                                                                                                                                         AA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-CTAGCAC--ATTTATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGAAC------ATAGGAG--GGTATT----TTA
gi|108404                     :                                                                                                                                                                                                            ----TTGCACAA-ATAACGC--AAACATTGACGTCGCCATTAATGAAC--ACAGGAC------ATAGGCG--GGTATTA---TTAT
gi|108405                     :                                                                                                                                                                                                            ----TTGCGCAA-ATAACGC--ATATATTGACGTCACCATTAATGTAC--ATAGAAC------ATA-GCG--GGTATTA---





Alignments
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lowQualScore                  :                                                                .                  ....                  .............     ..      .               ..      ..  . .   .       ...    .      .   .. ..............        .       ..                          ..       ......    ..   ..  ...     ...    
lowQualScore                  :                                                                0                  8888                  1111111111111     33      0               44      44  0 0   1       999    1      4   00 88888888888888        4       00                          11       444444    22   66  777     111    
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Reference ( family-481 )      :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TATTA---TTAT
gi|108355                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---ATTTA---TAAT
gi|108356                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCATG----GCCCCTGCGGAGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AA-GACGACATCTCT--ACCGAC--TG-C-GTC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTTATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GTG--GG---ATTTA---TAAT
gi|108357                     :                                                            ACTT-TGGAGATCTGAACCCATG----GCCCCTGCGGCGTCAGCA-------------CCTAG--CACATT-AATGATGACGTCTCT--ACCAAC--TG-T-GCC-ACCACAA---CAAT-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCAC--ATATATTGGCATCCCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATGG--GCG--
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gi|108359                     :                                                            ACTT-TTGTGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATC-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATAGATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GGATTTATAA---TTAT
gi|108360                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATG
gi|108360                     :                                                                                                                                                              G-C-GCCTAGCACAT---TAAT-GCAAAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-ATAGCGC--ATAGATTGGCGTTGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---ATTTA---TAATcaaaaaaacgttgcacaaatagcgcatagattggcgttgccattaatgtacacaggacataggcgggatttataat
gi|108361                     :                       actttggagattcgaacccacggcccctgcggcgtcaACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCATGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATA-AATGACGTCGTCTCT--ATAGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCATA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGAAC------ATAG--GCG--GG---TATTA---TTAT
gi|108362                     :                                                            ACTT-TGGAGATCCGAACCTACG----ACCCCTGAGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-TATGGTGACGTCTCT--ACCAAC--TG-C-GCC-ACAGCAA---GAAC-GCCAAATAAA--C---------A----TTGCGCAA-ATAGCG
gi|108363                     :                                                            ACTT-TCGGGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACTTT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-CCGAC-ACCGCAA---CAAC-GCCGAA-TAA--C---------G----TTGCGCAA-GTAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TATTAATTTTAT
gi|108364                     :                                                            ACTT-TCGGGATTCGAACTCGCG----GTCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TGCC-GAC-GCCGCA
gi|108365                     :                                                            ACTT-TCGGGATTCGAACCCATG----GCCCCTGCGGCGTCGGC
gi|108366                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCAAACCCATG----GCCCCTGCTAAATCAGCG-------------CCTAA--CACATT-AATGACGACATCTCT--ACCAAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-TCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTAAAGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TATTG---TTAT
gi|108367                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCCAACCCACA----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTTG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--
gi|108368                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--AACATC-AATGACGACATCTCT--AACGAC--TG-C-GCT-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TT-------ATA------ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAAGACGCCTATATAG--GCG--GG---TATTA---TTAT
gi|108369                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GACCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CATATA-AATACCAAC--CTAT--GCC--C--TG-T-G-T-ACATTAATGGCGAC-GCCAAT-ATATTC---------ACTTTTTGCGC-A-ATGGC-------TTTTGGCGTTG
gi|108369                     :                                                                                                                                                                             ---CAAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAG--GTT--GG---TATT
gi|108370                     :         actttggagattcgaacccacggaccctgcggcgtcagcgcctagcatataACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----CCCCCTGTGACGTCAGCG-------------CCTAG--CACGTT-AATGACG---TCACC--ATCGAC--TG-C-GCC-ACAGCAA---CAAC-GCTAAA-AAA--A---------GG---TTGCGCAA-ATAGCAC--ATATATTGGTGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GT---TTTTA---TTAT
gi|108371                     :                                                            ACTT-TCGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGC
gi|108372                     :                                                            ACTT-AGGAGATTCAA---CA-----------TGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CGCATT-AATGATGACATCTCT--ACCGAC--CG---GCC-ACCAAAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGTGCAA-ATAGTGC--ATATATTGGGGTTGCCATTATTGTAC--AGAGGAC------ATAG--G
gi|108373                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-G-C-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------T----TT
gi|108374                     :                                                            ACTTATGG-GATTTGAACCCACA----GACCCTGTGGTGTCAGCG-------------ACTAA--CACATT---------------T--ATCGAC--TG-C-GCC-ACCACAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------A----TTGTGCCA-ATAACTT--GTATATTGGAGTTGCCATCAATGTAC-------AC------ATAG--GTG--GG---TATTA---TTAT
gi|108375                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACA----GCCCCTGCAGCGTTGGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-ACC-ACGGCAA---CAAC-GCCAGA-AAA--C---------A----TTGCGC
gi|108376                     :                                                            ACTT-TGGGGATTTGAATCCACG----GCCCCTGTGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CAGATT-AATAACGACTTCTAT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-
gi|108377                     :                                                            ACTT-TGGA-ATTCGAA-CCAAA----ACCCATGCGACGAAAGTG-------------CCAAT--TACAGT-AATGACGACGTCTCTTCTCCAAA--TG-T-GCT-GCCACAT---AAAC-GCC-AC-ATA--T---------A----TTGCACAA-ATAGCAC--ATATATAGATATCGTCATCAATATAA--ACAGGAC------ATGGGAGCT--GT---TATTA---TTA
gi|108378                     :                                                            ACCT-TGAAGATTCGAACCCACG----GCCCCAGCGGCG
gi|108379                     :                                                            ATTT-TAGAGATTCGAACCAACG----ACTC-TGCGGTCTCAACG-------------TCTAG--CACATTCACTGA-GACGTCTCC--ACAAAC--TG-T-ACT-ACCACAA---CGAC-GTC
gi|108380                     :                                                            ACTT-TAGAGATTCGAACCCACG----G-CTCTGCAGTCTCAGCG-------------TCTTC--CACACT-GA----GACGTCTCC--ACAAAC--TG-T-ACT-ACCACAA---AGAC-GCC
gi|108381                     :                                                            ACTG-TGGGGTTTTGAACCGATG----GCCTCTGCAGTGTCAGT----------------------ACATT-AATGATGGTGTCTCT--ACCACC--TG-C-ACT-ACAGCAA---CAAC-G
gi|108382                     :                                                            ACGT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CC
gi|108383                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCTCTGCGGCGTCAG
gi|108384                     :                                                            ATTT-TCAAGATTCGAACCCACA----GTCCCTGCGACATCAATG-------------CCTTG--CACATT-AATCACTAC
gi|108385                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCGCG----GCCCCTGCG
gi|108386                     :                                                             CTA-TGG-GATTTGAACCCACA----GCCCCTACAGCATCAGCG-------------TC-AG--CACATC-AATGATGACGTCTCT--ACTGAC--TT-C-CCC-AACGCAT---CAAC-GCCAAA-AGA--G---------G----TGGCGCAA-AT--TAC--ATATATTGG---TGCCATTCATGTAC--ACAAGAC------ATAG--GC
gi|108387                     :                                                              TT-TGCAGATTTGAACCCACG----GCCCCTGCGGTGTCAGTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACAACGTCTCT--TCTGTC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-TCC
gi|108388                     :                                                              TT-TGG-GACTCGATCTCGCA----GCCCTTGCGGAGTCAACG-------------CCTAC--CATATT-AATGACGACGTCTTT--A--------A-C-GCC-A-----------A-----AAA-AAA--T---------G----TTGCACAA-ATAACGC--ATATATTGACGTCGTCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TTTTA---TTGT
gi|108389                     :                                                              TT-TCAAGATTCGAACCCATG----GTTCTTATGGCGTCAGCG-------------TCTAA--CACTCT-A-T----ATATCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-GCCGCAC---CAAC-GTCAAA-CAA--A---------G----TT-CGCAA-ATAACGC--ATATAATGACTGCTTCATTACTGTAC--ATAGAAA------ATA
gi|108390                     :                                                              TC-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-
gi|108390                     :                                                                                                                                                                                                                       A-GTAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCnnnnnnnnnnagtagcgcatatattggcgtcgccattaatgtacacaggacataggc
gi|108391                     :   tctggagattcgaacccacggcccctgcggcgtcagcgcctagcacattnnnnnnnnnnTT-CGGA-ATTCGAACCCAAG----GTCCTTTCGGCGTCAGCG-------------CTAAG--CACAAT-AACGACAACGTCTCT--ACCAAT--TG-C-GCC-ACC
gi|108392                     :                                                              TT-TAGAGATTGTAACTCGC------TCCCTGCAGCGTCAGCA-------------CCTAG--CACATT-AAT---GACATCTCT--ACC-ACTTTT-T-GTA-ACTGCAA---CAAA-GC
gi|108393                     :                                                              TT-CGGAG-TTCAAACATACA----GCCCATAAGACGTCAGCA-------------CCAAGAACACATT-AATGATGACG--TTT--ACCGAC--AG-C-
gi|108394                     :                                                              TT-TGG-GATTCATACCCACA----GCCCCTGTTTTGTCAGT----------------T------CATT-AATTCCAACGTCTCT--ACAAAA--TG-T-GCT-ACAACAA---CAGC-
gi|108395                     :                                                                    AGATTAGAACCCACA----GCCCCTCCGACGTCATTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-
gi|108395                     :                                                                                                                                                                                                                          TGGTGC--ATATATTGGCATCGCCATTGATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GAG--GG---TATCA---TTATctggtgcatatattggcatcgccattgatgtacacaggacataggagggtatcattat
gi|108396                     : agattagaacccacagcccctccgacgtcattgcctagcacattaatgacgacgtctctactgactgccATTCGAACCAACG----CACTCTGCGGCGTAAGTG-------------CCTAG--CAAATT-ACTGACAACGTCTAT--ACCGAC--TA-C-GCC-ACCACAG---CAAT-GCCAAA-AAC--G---------G----TTGCGTAAGATA-CGC--ATATGCTG
gi|108397                     :                                                                      ATTCGACCCCCCGCCGGGCCCCTGCGGCGTCAACG-------------CCTAG--CACATT-AATGACTATGTCTCT--ACCGTC--TG-C-A-C-GCCTCAA---C
gi|108398                     :                                                                      ATTTGAACCCACG----GTCCCTGCAACGTCAGCA-------------CTTCG--TACATT-AATGACAATGTGTCT--ACCAAC--
gi|108399                     :                                                                        TCGAACACACG----ACCCCTGCAGCGTCAGCG-------------TCTAC--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-T-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAG--GTT--GG---TATT
gi|108400                     :                                                                          GAACTCACG----ACTCCTGCGGCTTCAGCGGCTTCGGCGCCTACTTAG--CACATT-AATGACGACGGGACT--A-CGAC--TG-C-CGC-ACTGCAA---TAAC-G------AAA--C---------------------A-ATAACGCATATATATTGACGTCACCAGTAATTTACGTACAG--C------ATAT--GCG--
gi|108401                     :                                                                                   ----GTCCCTATTGCACCACCG-------------CCTAG--CACATG-AATGACGATGTCTCT--ATCGAT--TG-C-GCT-ACCCCAA---TGTC-GCCA
gi|108402                     :                                                                                                        G-------------CCTCG--TACATT-ACTGACGACTTAACT--ACCGA-----------------AA---CAACTACTGAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-GAAGCAC--ATATTTTAGCTTCGCCATTAACGTAC--ACAGGAA------AGAG--CCGATGA---TATCA---
gi|108403                     :                                                                                                                                                                                         AA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-CTAGCAC--ATTTATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGAAC------ATAG--GAG--GG---TATT----TTA
gi|108404                     :                                                                                                                                                                                                            ----TTGCACAA-ATAACGC--AAACATTGACGTCGCCATTAATGAAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TATTA---TTAT
gi|108405                     :                                                                                                                                                                                                            ----TTGCGCAA-ATAACGC--ATATATTGACGTCACCATTAATGTAC--ATAGAAC------ATA---GCG--GG---TATTA---





Alignments
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lowQualScore                  :                                                                .                  ....                  .............     ..      .               ..      ..  . .   .       ...    .      .   .. ..............        .       ..                          ..       ......    ..   ..  ...     ...    
lowQualScore                  :                                                                0                  8888                  1111111111111     33      0               44      44  0 0   1       999    1      4   00 88888888888888        4       00                          11       444444    22   66  777     111    
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Reference ( family-481 )      :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TATTA---TTAT
gi|108355                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---ATTTA---TAAT
gi|108356                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCATG----GCCCCTGCGGAGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AA-GACGACATCTCT--ACCGAC--TG-C-GTC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTTATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GTG--GG---ATTTA---TAAT
gi|108357                     :                                                            ACTT-TGGAGATCTGAACCCATG----GCCCCTGCGGCGTCAGCA-------------CCTAG--CACATT-AATGATGACGTCTCT--ACCAAC--TG-T-GCC-ACCACAA---CAAT-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCAC--ATATATTGGCATCCCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATGG--GCG--
gi|108358                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACA----GCCCCTGCAGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AA-GACGACATCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--CAATGCGCAAA----TAGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTTGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--
gi|108359                     :                                                            ACTT-TTGTGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATC-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATAGATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GGATTTATAA---TTAT
gi|108360                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATG
gi|108360                     :                                                                                                                                                              G-C-GCCTAGCACAT---TAAT-GCAAAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-ATAGCGC--ATAGATTGGCGTTGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---ATTTA---TAATcaaaaaaacgttgcacaaatagcgcatagattggcgttgccattaatgtacacaggacataggcgggatttataat
gi|108361                     :                       actttggagattcgaacccacggcccctgcggcgtcaACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCATGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATA-AATGACGTCGTCTCT--ATAGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCATA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGAAC------ATAG--GCG--GG---TATTA---TTAT
gi|108362                     :                                                            ACTT-TGGAGATCCGAACCTACG----ACCCCTGAGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-TATGGTGACGTCTCT--ACCAAC--TG-C-GCC-ACAGCAA---GAAC-GCCAAATAAA--C---------A----TTGCGCAA-ATAGCG
gi|108363                     :                                                            ACTT-TCGGGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACTTT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-CCGAC-ACCGCAA---CAAC-GCCGAA-TAA--C---------G----TTGCGCAA-GTAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TATTAATTTTAT
gi|108364                     :                                                            ACTT-TCGGGATTCGAACTCGCG----GTCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TGCC-GAC-GCCGCA
gi|108365                     :                                                            ACTT-TCGGGATTCGAACCCATG----GCCCCTGCGGCGTCGGC
gi|108366                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCAAACCCATG----GCCCCTGCTAAATCAGCG-------------CCTAA--CACATT-AATGACGACATCTCT--ACCAAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-TCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTAAAGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TATTG---TTAT
gi|108367                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCCAACCCACA----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTTG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--
gi|108368                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--AACATC-AATGACGACATCTCT--AACGAC--TG-C-GCT-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TT-------ATA------ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAAGACGCCTATATAG--GCG--GG---TATTA---TTAT
gi|108369                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GACCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CATATA-AATACCAAC--CTAT--GCC--C--TG-T-G-T-ACATTAATGGCGAC-GCCAAT-ATATTC---------ACTTTTTGCGC-A-ATGGC-------TTTTGGCGTTG
gi|108369                     :                                                                                                                                                                             ---CAAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAG--GTT--GG---TATT
gi|108370                     :         actttggagattcgaacccacggaccctgcggcgtcagcgcctagcatataACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----CCCCCTGTGACGTCAGCG-------------CCTAG--CACGTT-AATGACG---TCACC--ATCGAC--TG-C-GCC-ACAGCAA---CAAC-GCTAAA-AAA--A---------GG---TTGCGCAA-ATAGCAC--ATATATTGGTGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GT---TTTTA---TTAT
gi|108371                     :                                                            ACTT-TCGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGC
gi|108372                     :                                                            ACTT-AGGAGATTCAA---CA-----------TGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CGCATT-AATGATGACATCTCT--ACCGAC--CG---GCC-ACCAAAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGTGCAA-ATAGTGC--ATATATTGGGGTTGCCATTATTGTAC--AGAGGAC------ATAG--G
gi|108373                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-G-C-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------T----TT
gi|108374                     :                                                            ACTTATGG-GATTTGAACCCACA----GACCCTGTGGTGTCAGCG-------------ACTAA--CACATT---------------T--ATCGAC--TG-C-GCC-ACCACAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------A----TTGTGCCA-ATAACTT--GTATATTGGAGTTGCCATCAATGTAC-------AC------ATAG--GTG--GG---TATTA---TTAT
gi|108375                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACA----GCCCCTGCAGCGTTGGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-ACC-ACGGCAA---CAAC-GCCAGA-AAA--C---------A----TTGCGC
gi|108376                     :                                                            ACTT-TGGGGATTTGAATCCACG----GCCCCTGTGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CAGATT-AATAACGACTTCTAT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-
gi|108377                     :                                                            ACTT-TGGA-ATTCGAA-CCAAA----ACCCATGCGACGAAAGTG-------------CCAAT--TACAGT-AATGACGACGTCTCTTCTCCAAA--TG-T-GCT-GCCACAT---AAAC-GCC-AC-ATA--T---------A----TTGCACAA-ATAGCAC--ATATATAGATATCGTCATCAATATAA--ACAGGAC------ATGGGAGCT--GT---TATTA---TTA
gi|108378                     :                                                            ACCT-TGAAGATTCGAACCCACG----GCCCCAGCGGCG
gi|108379                     :                                                            ATTT-TAGAGATTCGAACCAACG----ACTC-TGCGGTCTCAACG-------------TCTAG--CACATTCACTGA-GACGTCTCC--ACAAAC--TG-T-ACT-ACCACAA---CGAC-GTC
gi|108380                     :                                                            ACTT-TAGAGATTCGAACCCACG----G-CTCTGCAGTCTCAGCG-------------TCTTC--CACACT-GA----GACGTCTCC--ACAAAC--TG-T-ACT-ACCACAA---AGAC-GCC
gi|108381                     :                                                            ACTG-TGGGGTTTTGAACCGATG----GCCTCTGCAGTGTCAGT----------------------ACATT-AATGATGGTGTCTCT--ACCACC--TG-C-ACT-ACAGCAA---CAAC-G
gi|108382                     :                                                            ACGT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CC
gi|108383                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCTCTGCGGCGTCAG
gi|108384                     :                                                            ATTT-TCAAGATTCGAACCCACA----GTCCCTGCGACATCAATG-------------CCTTG--CACATT-AATCACTAC
gi|108385                     :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCGCG----GCCCCTGCG
gi|108386                     :                                                             CTA-TGG-GATTTGAACCCACA----GCCCCTACAGCATCAGCG-------------TC-AG--CACATC-AATGATGACGTCTCT--ACTGAC--TT-C-CCC-AACGCAT---CAAC-GCCAAA-AGA--G---------G----TGGCGCAA-AT--TAC--ATATATTGG---TGCCATTCATGTAC--ACAAGAC------ATAG--GC
gi|108387                     :                                                              TT-TGCAGATTTGAACCCACG----GCCCCTGCGGTGTCAGTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACAACGTCTCT--TCTGTC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-TCC
gi|108388                     :                                                              TT-TGG-GACTCGATCTCGCA----GCCCTTGCGGAGTCAACG-------------CCTAC--CATATT-AATGACGACGTCTTT--A--------A-C-GCC-A-----------A-----AAA-AAA--T---------G----TTGCACAA-ATAACGC--ATATATTGACGTCGTCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TTTTA---TTGT
gi|108389                     :                                                              TT-TCAAGATTCGAACCCATG----GTTCTTATGGCGTCAGCG-------------TCTAA--CACTCT-A-T----ATATCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-GCCGCAC---CAAC-GTCAAA-CAA--A---------G----TT-CGCAA-ATAACGC--ATATAATGACTGCTTCATTACTGTAC--ATAGAAA------ATA
gi|108390                     :                                                              TC-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-
gi|108390                     :                                                                                                                                                                                                                       A-GTAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCnnnnnnnnnnagtagcgcatatattggcgtcgccattaatgtacacaggacataggc
gi|108391                     :   tctggagattcgaacccacggcccctgcggcgtcagcgcctagcacattnnnnnnnnnnTT-CGGA-ATTCGAACCCAAG----GTCCTTTCGGCGTCAGCG-------------CTAAG--CACAAT-AACGACAACGTCTCT--ACCAAT--TG-C-GCC-ACC
gi|108392                     :                                                              TT-TAGAGATTGTAACTCGC------TCCCTGCAGCGTCAGCA-------------CCTAG--CACATT-AAT---GACATCTCT--ACC-ACTTTT-T-GTA-ACTGCAA---CAAA-GC
gi|108393                     :                                                              TT-CGGAG-TTCAAACATACA----GCCCATAAGACGTCAGCA-------------CCAAGAACACATT-AATGATGACG--TTT--ACCGAC--AG-C-
gi|108394                     :                                                              TT-TGG-GATTCATACCCACA----GCCCCTGTTTTGTCAGT----------------T------CATT-AATTCCAACGTCTCT--ACAAAA--TG-T-GCT-ACAACAA---CAGC-
gi|108395                     :                                                                    AGATTAGAACCCACA----GCCCCTCCGACGTCATTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-
gi|108395                     :                                                                                                                                                                                                                          TGGTGC--ATATATTGGCATCGCCATTGATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GAG--GG---TATCA---TTATctggtgcatatattggcatcgccattgatgtacacaggacataggagggtatcattat
gi|108396                     : agattagaacccacagcccctccgacgtcattgcctagcacattaatgacgacgtctctactgactgccATTCGAACCAACG----CACTCTGCGGCGTAAGTG-------------CCTAG--CAAATT-ACTGACAACGTCTAT--ACCGAC--TA-C-GCC-ACCACAG---CAAT-GCCAAA-AAC--G---------G----TTGCGTAAGATA-CGC--ATATGCTG
gi|108397                     :                                                                      ATTCGACCCCCCGCCGGGCCCCTGCGGCGTCAACG-------------CCTAG--CACATT-AATGACTATGTCTCT--ACCGTC--TG-C-A-C-GCCTCAA---C
gi|108398                     :                                                                      ATTTGAACCCACG----GTCCCTGCAACGTCAGCA-------------CTTCG--TACATT-AATGACAATGTGTCT--ACCAAC--
gi|108399                     :                                                                        TCGAACACACG----ACCCCTGCAGCGTCAGCG-------------TCTAC--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-T-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAG--GTT--GG---TATT
gi|108400                     :                                                                          GAACTCACG----ACTCCTGCGGCTTCAGCGGCTTCGGCGCCTACTTAG--CACATT-AATGACGACGGGACT--A-CGAC--TG-C-CGC-ACTGCAA---TAAC-G------AAA--C---------------------A-ATAACGCATATATATTGACGTCACCAGTAATTTACGTACAG--C------ATAT--GCG--
gi|108401                     :                                                                                   ----GTCCCTATTGCACCACCG-------------CCTAG--CACATG-AATGACGATGTCTCT--ATCGAT--TG-C-GCT-ACCCCAA---TGTC-GCCA
gi|108402                     :                                                                                                        G-------------CCTCG--TACATT-ACTGACGACTTAACT--ACCGA-----------------AA---CAACTACTGAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-GAAGCAC--ATATTTTAGCTTCGCCATTAACGTAC--ACAGGAA------AGAG--CCGATGA---TATCA---
gi|108403                     :                                                                                                                                                                                         AA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-CTAGCAC--ATTTATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGAAC------ATAG--GAG--GG---TATT----TTA
gi|108404                     :                                                                                                                                                                                                            ----TTGCACAA-ATAACGC--AAACATTGACGTCGCCATTAATGAAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TATTA---TTAT
gi|108405                     :                                                                                                                                                                                                            ----TTGCGCAA-ATAACGC--ATATATTGACGTCACCATTAATGTAC--ATAGAAC------ATA---GCG--GG---TATTA---


blockSeqs                     :                                                                A                  CCGG                  GCTTCGGCGCCTA     AA                      TC      TT  C C   T       TGG    T      T   TT AATGCGCAAA            G       AT                          GT       GCCTAT    GA   AT  ATT     ATT
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  ACTTT                 .       .                           .        .         .    .   .       .  
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  GG                    .       .                           .        .         .    .   .       .  
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  G                     .       .                           .        .         .    .   .       .  
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  G                     .       .                           .        .         .    .   .       .  
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  G                     .       .                           .        .         .    .   .       .  
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blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  T                     .       .                           .        .         .    .   .       .  
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blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  G                     .       .                           .        .         .                   
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  G                     .       .                           .        .         .                   
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  A                     .       .                           .        .         .                   
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  G                     .       .                           .        .         .                   
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  G                     .       .                           .        .                             
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .  .                     .       .                                                                  
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .      .   .                        .       .                                                                  
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .      .                                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .       .                                                                                                                     
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .   .                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                       .       .   . .                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                .                  .                     .                 .                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                   .                     .                 .                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                   .                     .                 .                                                                                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                   .                     .                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                   .                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                   .                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                   .                                                                                                                                                                                                               
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blockSeqCons                  :                                                            
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Reference ( family-481 )      :                                                            ACTT-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-ATAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TATTA---TTAT
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gi|108389                     :                                                              TT-TCAAGATTCGAACCCATG----GTTCTTATGGCGTCAGCG-------------TCTAA--CACTCT-A-T----ATATCTCT--ACCGAC--TG-C-GCC-GCCGCAC---CAAC-GTCAAA-CAA--A---------G----TT-CGCAA-ATAACGC--ATATAATGACTGCTTCATTACTGTAC--ATAGAAA------ATA
gi|108390                     :                                                              TC-TGGAGATTCGAACCCACG----GCCCCTGCGGCGTCAGCG-------------CCTAG--CACATT-
gi|108390                     :                                                                                                                                                                                                                       A-GTAGCGC--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GCnnnnnnnnnnagtagcgcatatattggcgtcgccattaatgtacacaggacataggc
gi|108391                     :   tctggagattcgaacccacggcccctgcggcgtcagcgcctagcacattnnnnnnnnnnTT-CGGA-ATTCGAACCCAAG----GTCCTTTCGGCGTCAGCG-------------CTAAG--CACAAT-AACGACAACGTCTCT--ACCAAT--TG-C-GCC-ACC
gi|108392                     :                                                              TT-TAGAGATTGTAACTCGC------TCCCTGCAGCGTCAGCA-------------CCTAG--CACATT-AAT---GACATCTCT--ACC-ACTTTT-T-GTA-ACTGCAA---CAAA-GC
gi|108393                     :                                                              TT-CGGAG-TTCAAACATACA----GCCCATAAGACGTCAGCA-------------CCAAGAACACATT-AATGATGACG--TTT--ACCGAC--AG-C-
gi|108394                     :                                                              TT-TGG-GATTCATACCCACA----GCCCCTGTTTTGTCAGT----------------T------CATT-AATTCCAACGTCTCT--ACAAAA--TG-T-GCT-ACAACAA---CAGC-
gi|108395                     :                                                                    AGATTAGAACCCACA----GCCCCTCCGACGTCATTG-------------CCTAG--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACTGAC--TG-C-
gi|108395                     :                                                                                                                                                                                                                          TGGTGC--ATATATTGGCATCGCCATTGATGTAC--ACAGGAC------ATAG--GAG--GG---TATCA---TTATctggtgcatatattggcatcgccattgatgtacacaggacataggagggtatcattat
gi|108396                     : agattagaacccacagcccctccgacgtcattgcctagcacattaatgacgacgtctctactgactgccATTCGAACCAACG----CACTCTGCGGCGTAAGTG-------------CCTAG--CAAATT-ACTGACAACGTCTAT--ACCGAC--TA-C-GCC-ACCACAG---CAAT-GCCAAA-AAC--G---------G----TTGCGTAAGATA-CGC--ATATGCTG
gi|108397                     :                                                                      ATTCGACCCCCCGCCGGGCCCCTGCGGCGTCAACG-------------CCTAG--CACATT-AATGACTATGTCTCT--ACCGTC--TG-C-A-C-GCCTCAA---C
gi|108398                     :                                                                      ATTTGAACCCACG----GTCCCTGCAACGTCAGCA-------------CTTCG--TACATT-AATGACAATGTGTCT--ACCAAC--
gi|108399                     :                                                                        TCGAACACACG----ACCCCTGCAGCGTCAGCG-------------TCTAC--CACATT-AATGACGACGTCTCT--ACCGAC--TG-T-GCC-ACCGCAA---CAAC-GCCAAA-AGC--C---------A----TTGCGCAA-AAAGTGA--ATATATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGGGC------ATAG--GTT--GG---TATT
gi|108400                     :                                                                          GAACTCACG----ACTCCTGCGGCTTCAGCGGCTTCGGCGCCTACTTAG--CACATT-AATGACGACGGGACT--A-CGAC--TG-C-CGC-ACTGCAA---TAAC-G------AAA--C---------------------A-ATAACGCATATATATTGACGTCACCAGTAATTTACGTACAG--C------ATAT--GCG--
gi|108401                     :                                                                                   ----GTCCCTATTGCACCACCG-------------CCTAG--CACATG-AATGACGATGTCTCT--ATCGAT--TG-C-GCT-ACCCCAA---TGTC-GCCA
gi|108402                     :                                                                                                        G-------------CCTCG--TACATT-ACTGACGACTTAACT--ACCGA-----------------AA---CAACTACTGAA-AAA--C---------G----TTGCACAA-GAAGCAC--ATATTTTAGCTTCGCCATTAACGTAC--ACAGGAA------AGAG--CCGATGA---TATCA---
gi|108403                     :                                                                                                                                                                                         AA-AAA--C---------G----TTGCGCAA-CTAGCAC--ATTTATTGGCGTCGCCATTAATGTAC--ACAGAAC------ATAG--GAG--GG---TATT----TTA
gi|108404                     :                                                                                                                                                                                                            ----TTGCACAA-ATAACGC--AAACATTGACGTCGCCATTAATGAAC--ACAGGAC------ATAG--GCG--GG---TATTA---TTAT
gi|108405                     :                                                                                                                                                                                                            ----TTGCGCAA-ATAACGC--ATATATTGACGTCACCATTAATGTAC--ATAGAAC------ATA---GCG--GG---TATTA---