lowQualScore : 1
lowQualScore : 1 2 2222 0 11 222222 0 8888 0 22 0 222222 1111 11 33333333 22222 3333 1111 11 3
lowQualScore : . . .... . .. ...... . .... . .. . ...... .... .. ........ ..... .... .... .. .
lowQualScore : 1 1 1111 9 33 777777 9 3333 9 55 9 555555 8888 22 11111111 00000 6666 9999 33 6
consensus : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAA------ACA-AAT---CC-CAGA-GTTCA-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTGGTAACACAATG
Reference ( gi|87034 ) : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAA------ACA-AAT---TC-CAGA-ATTCA-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTGGTAACAGAATG
gi|87017 : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--ACA------ACA-AAT---TC-CAGA-ATTCG-TAAGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCAA----C--CTAGTGGTAACACAGTG
gi|87016 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--ACA------GCA-AAT---CC-CAGA-ATGTA-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AATCGCCA----C--CTAGTGGTAACACAACG
gi|87018 : aTAT-AAA-A----TAATTCT-GATC--ACA------ACA-AAT---CC-CAGA-ATTCA-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGA-----GT----AAGTGCCA----C--CTAGT-GTAACACAATG
gi|87020 : aTAT-AAG-A----TAATTCT-CAAG--AAA------ACA-AAT---CC-CAGA-ATTCA-TGTGTCG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----AC----AAGCGCCA----C--CTAGTGGTAACACAA
gi|87019 : aTAT-AAA-A----TAGTACT-AATG--ACA------ACA-AAT---CC-CAGA-GTTCA-TATATTG------GG----TCA--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTGGTAACA
gi|87021 : aTAT-AAA-A-----AGTTGT-AACG--AAA------ACA-AAT---CC-CAGA-AT-----GCATTG------CG----ATA--CA--------TGTTAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTGGTAACACAATGc
gi|87023 : aTGT-AAA-A----TAATTCT-AATG--TCA------ACA-AAT----C-CAGA-GTTTA-TGTGTTT------GG----ATA--CA--------AGCCAGTGT-----GT----AAGCACCA----C--CTAGTGGTAACA
gi|87035 : aTATCAAA-A----TAGTTCT-AATG--ACA------ACA-ATT---CC-CAGA-ATCCA-TTCATTG------GG----ATG--CA--------GGTCAGTGC-----GTCACAGAGCCCCA----C--CTTGTAATAACAGAATGcagt
gi|87024 : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAA------GCA-AAT---CT-TAGA-GTTGA-TGCTTTG------GG----ACA--AA--------GGTCAGTGT-----TA----AAGCTCCA----C--ATTGTGGTAACACAATG
gi|87036 : aTGT-GAA-A----CAGTTCT-AATG--AAA------ACA-AGT---TC----------A-TGCGTTA------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCACTA----C--CTAGTGGTTACA
gi|87022 : TAT-AGA-A----TAGATCT-AATG--ACA------ACA-AAT---CC-CGAA-ATTCA-TCTGTTG------AG----ACA--CA--------GTTCAGTGC-----GT----AAGCTCCA----T--GTAGTAGTAGCACAGTG
gi|87025 : aTAT-AAA-A----TAGTGCTTAACG--AAA------ACA-AAC---CC-CACA-GTTCA-TGCATAT------GA----TCA--TA--------GGTCACTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGCGGTAACA
gi|87029 : aTAT-AAG-A----TGGTTCT-AACA--AAA------ACA-AAT---TC-CAGA-GTCTA-TGCATTA------GA----AAA--CA--------GGTTGATGC-----AT----AAGCACCA----c
gi|87026 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-TATT--ACA------ACA-AAT----C-CAGA-GTTCA-TTAATTG------GG----ACA--CA--------GATCAGTGC-----GC----ATGCGACA----C--
gi|87028 : aTAT-AAA-A----TAGTTTT-AATG--AAA------ACA-AAT---AC-CA-A-GTTCA-TGCGTT--------------------------------AGAGC-----GT----AAACGCCA----A--CTAGTGGTA
gi|87030 : aTAT-AAA-A----TAGTTCC-AATGAAAAA------AAA-AAT---CC-CAGA-GTTCATTGCGTTG------AG----ACA--CA--------GGCCAGGGC-----catgtaacacaatg
gi|87031 : aTAT-TAG-G----TAGTTTT-AATG--AAA------ACA-AA----TC-CAAATGTTCA-TGCGTTA------GA----ACA--CC--------CGTCAGTAT-----GT----TAGCGCAA----C--CAAGTAATA
gi|87037 : aTAT-AAA-C----TG----T-AACG--ACA------A-A-AAT---CC-CAGA-GTTCT-TGCGTTG------GT----ACG--AA--------GATTAGTACAGTATGT----AAGCGCCA----C--CTAGTGGTAACACAAcaa
gi|87032 : TAT-AAA-A----TTATTCG-GATG--AAA------ACA-AAT---CC-CAAA-GTTCA-TGGGATG------GG----ACA--AA--------AGTCAGTGC-----AT----AA
gi|87038 : aTGT-AAC-A----TAATTAT-AACA--AAA------ACA-AAT---CC-CAAA-GTTCA-TGCCTTGCAACCAAA----ACG--CA---------GTCAGTGC-----AT----AAGAACCA----CAACTACTGGTA
gi|87039 : TAT-AAA-AATAATAATATT-AATG--AAA------ACA-AAA---CC-AAGA-GATCA-TTCGTT-------AG----ACA--CA--------TGTCAGTGC-----GT----TAGCGCTAGGTTT--CTAATGG
gi|87033 : TAT-AATTA----TAGTTCT-TATG--ACA------ACA-AAT---CC-CAGA-ATGCA-TGCGTTT------GG----AAA--CA--------GA-CAAT-C-----GT----A
gi|87040 : aAT-AAA-C----TAGTTCT-AACG--AAA------ACACAAT---CC-CAGA-GTTCA-TACGTTG------GA----ACA--CA--------GGCCAATGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTGGCAACACAAT
gi|87042 : AT-AGG-A----TAGTTCT-AATA--AAA------ACA-AAT---CC-CAGG-GTCCA-TGCGTTT------GG----ACA--TA--------GGTAAGTAC-----CT----AAGCGCCA----C--CTACTG
gi|87041 : AT-GAA-A----TAGTTAG-AATG--AAA------ACA-AAT---AT-GGGG-GTTCA-TGCTTTG------GT----ACA--AA--------GGTCAG-GC-----AT----AAGCACCA----C--CTAGTGGTAACACGATG
gi|87043 : AT-AAA-A----TAGT-------------------AC---AT---CC-CAGG-GTTCA-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCATTGT-----GT----TAACACCA----C--CAAGTGGTAACACAATG
gi|87045 : AT-GAA-A----GTGTTGT-AATG--AAA------ACA-AAG---CC-CGGT-GCCCG-TACGTTG------GG----ACA--CA--------GGTAAGTGC-----GT----AAGCGCAC----C--CTAGTGGCAA
gi|87046 : AT-AAAGA----TA-TTTT-AATG--AAA------ATA-AAT---CC-AAGA-GTTTA-TGAGTTG------GGCACAGCA--CA--------GGTCAGTTC-----GTAAGCAAGCGCCA----C--CTAGTG
gi|87044 : AT-AAA-A----TAGTTTT-AAAG--AAATAAACCACA-TGTATATA-TAGG-GTTAA-TGTGTTG------GG----ATA--CA--------GGTCAGTGC-----CT----AATCGCTA----C--CCAGTGCTAACACAATG
gi|87047 : AT-AAA-A----TAGGTCT-AATG--AAA------ACA-GTT---CC-CAGG-GTTCG-TGCGTT-------GG----ACA--AA--------GGTCAGTGC-----
gi|87027 : AT-AAA-A----TAGGTCA-AATG--ACA------ACA-AAT---CC-CATA-ATTCA-TGCGTTG------GG----TCA--CA--------GGT
gi|87048 : acAT-AAA-A----TA------AATG------------CC-AAT---GCACAGC-CCTAA-TGCTTTG------GT----ACA--CA--------TGTCAGTAC-----AT----AAGCGCCA----C--ATTGTGGTGATAggtaacacaatgacataaatagcataatagtaagtaagttgctgcgtaagcgccacctggtggtaacacaat
gi|87049 : T-AAA-A----TGGTTTT-AATG--AAA------AGT-ATT---CC-CAGA-GTGCA-TGCGTTG------GG----ACA--AA--------TGTCGGTAC-----AT----tgtgacaatg
gi|87050 : -AAA-A----TAGTTCT-AAAG--TAA------ATA-AAT---GC-AAGA-GTTTA-TGTGATG------GG----AAA--CA--------GGTCAGTGC-----GA----AAGCGCCA----C--CTAGAGTTAGCAAAATG
gi|87051 : -AAA-A----TAGTCCC-AATA--AAA------ACG-TAT---CC-CAGA-AGTCA-TGCGTT-------GG----ATA--CA--------GTTAAGTGC-----TT----AAGAGACA----C--ATA
gi|87052 : -AAA-A----TAGTTCC-AGAG--AAA------ACA-AAT---CC-CAGA-CTGCA-TGCGTTG------GG----AC
gi|87054 : AA-A----TAGTTCT-TATG--AAA------ACA-AAT---CC-CAGG-GTTCA-TGTGTTG------GG----ACA--CAGGAACGCTGGTCAATGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTGGTAACA
gi|87053 : AA-A----TAGTTCT-GATG--ACA------ACA-AAT---CC-CAGA-ATTCA-TGTGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTTT-----GT----AAGCACCA----A--CTAATGGca
gi|87055 : AA-A----CATTTAT-AATG--AAA------ATA-TAT---CC-CAGA-GTTCA-TGTGTTA------AG----AAA--TA--------TGTCAGTGC-----TT----AAGTGCCA----C--CAAGAGGTAACGCAATG
gi|87056 : ----TAGATTT-AATG--AAA------ACA-AAT---CC-CAGA-ATGCA-CGCGTTG------GG----ACG--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTGGTAACACAATG
gi|87057 : ----TAGCTCA-GATG--ACA------ACA-AAT---CC-CAGA-ATTCA-TGCAATT------CG----ACAGGCA--------GGTCAGCGG-----AC----AAGCGCCA----C--CTAGTGGTAACACAATG
gi|87058 : TCC-AATG--AAA------ACA-AAT---CC-CAGA-ATCCA-TGCGGTG------GG----ACA--CA--------GGCCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----T--ATAGCGGTAACACAAT
gi|87059 : -AACG--AAA------ATA-AAT---CA-AAGA-GGTCA-TGCGTTG------GG----ATG--TG--------GGTCATTGC-----GT----AAACACCA----C--CTGGTGGT
gi|87060 : -AAT---CT-TAGA-ATTCA-TGTATTG------GG----ACA--AA--------GATCAATGC-----GT----AAGCTCCA----C--CTAGTGGTAACACAATGctcacaat
gi|87061 : A-GTTCA-TGTGTCA------G-------A--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCTA----C--CTAGTGGTA
gi|87063 : TA------GG----ACA--CA--------GGTCGATGC-----AT----AAGTGTCA----T--CTAGTGTTAACACAACGccgtagtg
gi|87064 : G----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AGGCGCCA----C--ATAGCGGTAACACAATG
gi|87065 : A--------GGTCAGTAC-----GT----AAGCGGCA----C--CTAGCGGTAACACAATG
gi|87066 : GTTAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTGGTAACACAATG
gi|87062 : GTCAGTGC-----GT----AAGTGCCA----C--ATAGCGGTAATACAACG
gi|87027 : attgcgtcacaatctccTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTGGTGGTAACACAAT
Alignments
lowQualScore : 1 2 2222 0 11 0 3333333333 22222 11 0 222222 1111 11 33333333 22222 3333 1111 11 222222 22222
lowQualScore : . . .... . .. . .......... ..... .. . ...... .... .. ........ ..... .... .... .. ...... .....
lowQualScore : 1 1 1111 9 22 9 9999999999 22222 22 9 444444 8888 22 00000000 00000 5555 9999 22 777777 88888
consensus : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
Reference ( family-479 ) : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87016 : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--ACAGCA-AATCCCA----------G-----AATGT--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AATCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAACG
gi|87017 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--ACAACA-AATTCCA----------G-----AATTC--G-TAAGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCAA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAGTG
gi|87018 : aTAT-AAA-A----TAATTCT-GATC--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGA-----GT----AAGTGCCA----C--CTAGT-------GTAAC-----ACAATG
gi|87019 : aTAT-AAA-A----TAGTACT-AATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TATATTG------GG----TCA--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----AC
gi|87020 : aTAT-AAG-A----TAATTCT-CAAG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGTGTCG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----AC----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAA
gi|87021 : aTAT-AAA-A-----AGTTGT-AACG--AAAACA-AATCCCA----------G-----A------A-TGCATTG------CG----ATA--CA--------TGTTAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87022 : aTAT-AGA-A----TAGATCT-AATG--ACAACA-AATCCCG----------A-----AATTC--A-TCTGTTG------AG----ACA--CA--------GTTCAGTGC-----GT----AAGCTCCA----T--GTAGTA------GTAGC-----ACAGTG
gi|87023 : aTGT-AAA-A----TAATTCT-AATG--TCAACA-AATCC-A----------G-----AGTTT--A-TGTGTTT------GG----ATA--CA--------AGCCAGTGT-----GT----AAGCACCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAGT
gi|87024 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAGCA-AATCTTA----------G-----AGTTG--A-TGCTTTG------GG----ACA--AA--------GGTCAGTGT-----TA----AAGCTCCA----C--ATTGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87025 : aTAT-AAA-A----TAGTGCTTAACG--AAAACA-AACCCCA----------C-----AGTTC--A-TGCATAT------GA----TCA--TA--------GGTCACTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGCG------GTAAC-----AC
gi|87026 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-TATT--ACAACA-AATCC-A----------G-----AGTTC--A-TTAATTG------GG----ACA--CA--------GATCAGTGC-----GC----ATGCGACA----C--
gi|87027 : aAT-AAA-A----TAGGTCA-AATG--ACAACA-AATCCCA----------T-----AATTC--A-TGCGTTG------GG----TCA--CA--------GGT
gi|87027 : acTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTGGTG------GTAAC-----ACAATggtaacacaatgacataaatagcataatagtaagtaagttgctgcgtaagcgccacctggtggtaacacaat
gi|87028 : acataaaataggtcaaatgacaacaaatcccataattcatgcgttgggtcacaggtggtaacacaatgacataaatagcataatagtaagtaagttgcTAT-AAA-A----TAGTTTT-AATG--AAAACA-AATACCA----------------AGTTC--A-TGCGTT--------------------------------AGAGC-----GT----AAACGCCA----A--CTAGTGGTACATGTAAC-----ACAATG
gi|87029 : aTAT-AAG-A----TGGTTCT-AACA--AAAACA-AATTCCA----------G-----AGTCT--A-TGCATTA------GA----AAA--CA--------GGTTGATGC-----AT----AAGCACCA----
gi|87030 : aTAT-AAA-A----TAGTTCC-AATGAAAAAAAA-AATCCCA----------G-----AGTTC--ATTGCGTTG------AG----ACA--CA--------GGCCAGGGC-----
gi|87031 : aTAT-TAG-G----TAGTTTT-AATG--AAAACA-AATCCAA----------A-----TGTTC--A-TGCGTTA------GA----ACA--CC--------CGTCAGTAT-----GT----TAGCGCAA----C--CAA---------GTAAT-----ACAA
gi|87032 : aTAT-AAA-A----TTATTCG-GATG--AAAACA-AATCCCA----------A-----AGTTC--A-TGGGATG------GG----ACA--AA--------AGTCAGTGC-----AT----AA
gi|87033 : aTAT-AATTA----TAGTTCT-TATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATGC--A-TGCGTTT------GG----AAA--CA--------GA-CAAT-C-----GT----A
gi|87034 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATTCCA----------G-----AATTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----AGAATG
gi|87035 : TATCAAA-A----TAGTTCT-AATG--ACAACA-ATTCCCA----------G-----AATCC--A-TTCATTG------GG----ATG--CA--------GGTCAGTGC-----GTCACAGAGCCCCA----C--CTTGTA------ATAAC-----AGAATG
gi|87036 : TGT-GAA-A----CAGTTCT-AATG--AAAACA-A-----------------------GTTC--A-TGCGTTA------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCACTA----C--CTAGTG------GTTAC-----
gi|87037 : TAT-AAA-C----TG----T-AACG--ACAA-A-AATCCCA----------G-----AGTTC--T-TGCGTTG------GT----ACG--AA--------GATTAGTACAGTATGT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAA
gi|87038 : TGT-AAC-A----TAATTAT-AACA--AAAACA-AATCCCA----------A-----AGTTC--A-TGCCTTGCAACCAAA----ACG--CA---------GTCAGTGC-----AT----AAGAACCA----CAACTACTG------GTA
gi|87039 : TAT-AAA-AATAATAATATT-AATG--AAAACA-AAACCAA----------G-----AGATC--A-TTCGTT-------AG----ACA--CA--------TGTCAGTGC-----GT----TAGCGCTAGGTTT--CTAATG------G
gi|87040 : AT-AAA-C----TAGTTCT-AACG--AAAACACAATCCCA----------G-----AGTTC--A-TACGTTG------GA----ACA--CA--------GGCCAATGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GCAAC-----ACAAT
gi|87041 : AT-GAA-A----TAGTTAG-AATG--AAAACA-AATATGG----------G-----GGTTC--A-TGCTTTG------GT----ACA--AA--------GGTCAG-GC-----AT----AAGCACCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACGATG
gi|87042 : AT-AGG-A----TAGTTCT-AATA--AAAACA-AATCCCA----------G-----GGTCC--A-TGCGTTT------GG----ACA--TA--------GGTAAGTAC-----CT----AAGCGCCA----C--CTACTG------
gi|87043 : AT-AAA-A----TAGT-------------AC---ATCCCA----------G-----GGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCATTGT-----GT----TAACACCA----C--CAAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87044 : AT-AAA-A----TAGTTTT-AAAG--AAA-TA-AACCACATGTATATATAG-----GGTTA--A-TGTGTTG------GG----ATA--CA--------GGTCAGTGC-----CT----AATCGCTA----C--CCAGTG------CTAAC-----ACAATG
gi|87045 : AT-GAA-A----GTGTTGT-AATG--AAAACA-AAGCCCG----------G-----TGCCC--G-TACGTTG------GG----ACA--CA--------GGTAAGTGC-----GT----AAGCGCAC----C--CTAGTG------GCAA
gi|87046 : AT-AAAGA----TA-TTTT-AATG--AAAATA-AATCCAA----------G-----AGTTT--A-TGAGTTG------GGCACAGCA--CA--------GGTCAGTTC-----GTAAGCAAGCGCCA----C--CTAGTG------
gi|87047 : AT-AAA-A----TAGGTCT-AATG--AAAACA-GTTCCCA----------G-----GGTTC--G-TGCGTT-------GG----ACA--AA--------GGTCAGTGC-----
gi|87048 : --AAAATA-AATGCCA----------ATGCACAGCCCTAA-TGCTTTG------GT----ACA--CA--------TGTCAGTAC-----AT----AAGCGCCA----C--ATTGTG------GTGATATGTGACAATG
gi|87049 : atT-AAA-A----TGGTTTT-AATG--AAAAGT-ATTCCCA----------G-----AGTGC--A-TGCGTTG------GG----ACA--AA--------TGTCGGTAC-----AT----
gi|87050 : -AAA-A----TAGTTCT-AAAG--TAAATA-AATGCAA----------G-----AGTTT--A-TGTGATG------GG----AAA--CA--------GGTCAGTGC-----GA----AAGCGCCA----C--CTAGAG------TTAGC-----AAAATG
gi|87051 : -AAA-A----TAGTCCC-AATA--AAAACG-TATCCCA----------G-----AAGTC--A-TGCGTT-------GG----ATA--CA--------GTTAAGTGC-----TT----AAGAGACA----C--ATA
gi|87052 : -AAA-A----TAGTTCC-AGAG--AAAACA-AATCCCA----------G-----ACTGC--A-TGCGTTG------GG----AC
gi|87053 : AA-A----TAGTTCT-GATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGTGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTTT-----GT----AAGCACCA----A--CTAATG------G
gi|87054 : AA-A----TAGTTCT-TATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----GGTTC--A-TGTGTTG------GG----ACA--CAGGAACGCTGGTCAATGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACA
gi|87055 : AA-A----CATTTAT-AATG--AAAATA-TATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGTGTTA------AG----AAA--TA--------TGTCAGTGC-----TT----AAGTGCCA----C--CAAGAG------GTAAC-----GCAATG
gi|87056 : ----TAGATTT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AATGC--A-CGCGTTG------GG----ACG--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87057 : ----TAGCTCA-GATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGCAATT------CG----ACAGGCA--------GGTCAGCGG-----AC----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87058 : TCC-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AATCC--A-TGCGGTG------GG----ACA--CA--------GGCCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----T--ATAGCG------GTAAC-----ACAAT
gi|87059 : -AACG--AAAATA-AATCAAA----------G-----AGGTC--A-TGCGTTG------GG----ATG--TG--------GGTCATTGC-----GT----AAACACCA----C--CTGGTG------GTCTC-----ACAAT
gi|87060 : -AATCTTA----------G-----AATTC--A-TGTATTG------GG----ACA--AA--------GATCAATGC-----GT----AAGCTCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87061 : -----AGTTC--A-TGTGTCA------G-------A--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCTA----C--CTAGTG------GTACC-----GTAGTG
gi|87062 : GTCAGTGC-----GT----AAGTGCCA----C--ATAGCG------GTAAT-----ACAACG
gi|87063 : attgcgtcacaatctccTA------GG----ACA--CA--------GGTCGATGC-----AT----AAGTGTCA----T--CTAGTG------TTAAC-----ACAACG
gi|87064 : G----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AGGCGCCA----C--ATAGCG------GTAAC-----ACAATG
gi|87065 : A--------GGTCAGTAC-----GT----AAGCGGCA----C--CTAGCG------GTAAC-----ACAATG
gi|87066 : GTTAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
Alignments
lowQualScore : 1 2 2222 0 11 0 3333333333 22222 11 0 222222 1111 11 33333333 22222 3333 1111 11 222222 22222
lowQualScore : . . .... . .. . .......... ..... .. . ...... .... .. ........ ..... .... .... .. ...... .....
lowQualScore : 1 1 1111 9 22 9 9999999999 22222 22 9 444444 8888 22 00000000 00000 5555 9999 22 777777 88888
consensus : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
Reference ( family-479 ) : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87016 : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--ACAGCA-AATCCCA----------G-----AATGT--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AATCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAACG
gi|87017 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--ACAACA-AATTCCA----------G-----AATTC--G-TAAGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCAA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAGTG
gi|87018 : aTAT-AAA-A----TAATTCT-GATC--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGA-----GT----AAGTGCCA----C--CTAGT-------GTAAC-----ACAATG
gi|87019 : aTAT-AAA-A----TAGTACT-AATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TATATTG------GG----TCA--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----AC
gi|87020 : aTAT-AAG-A----TAATTCT-CAAG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGTGTCG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----AC----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAA
gi|87021 : aTAT-AAA-A-----AGTTGT-AACG--AAAACA-AATCCCA----------G-----A------A-TGCATTG------CG----ATA--CA--------TGTTAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87022 : aTAT-AGA-A----TAGATCT-AATG--ACAACA-AATCCCG----------A-----AATTC--A-TCTGTTG------AG----ACA--CA--------GTTCAGTGC-----GT----AAGCTCCA----T--GTAGTA------GTAGC-----ACAGTG
gi|87023 : aTGT-AAA-A----TAATTCT-AATG--TCAACA-AATCC-A----------G-----AGTTT--A-TGTGTTT------GG----ATA--CA--------AGCCAGTGT-----GT----AAGCACCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAGT
gi|87024 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAGCA-AATCTTA----------G-----AGTTG--A-TGCTTTG------GG----ACA--AA--------GGTCAGTGT-----TA----AAGCTCCA----C--ATTGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87025 : aTAT-AAA-A----TAGTGCTTAACG--AAAACA-AACCCCA----------C-----AGTTC--A-TGCATAT------GA----TCA--TA--------GGTCACTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGCG------GTAAC-----AC
gi|87026 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-TATT--ACAACA-AATCC-A----------G-----AGTTC--A-TTAATTG------GG----ACA--CA--------GATCAGTGC-----GC----ATGCGACA----C--
gi|87027 : aAT-AAA-A----TAGGTCA-AATG--ACAACA-AATCCCA----------T-----AATTC--A-TGCGTTG------GG----TCA--CA--------GGT
gi|87027 : acTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTGGTG------GTAAC-----ACAATggtaacacaatgacataaatagcataatagtaagtaagttgctgcgtaagcgccacctggtggtaacacaat
gi|87028 : acataaaataggtcaaatgacaacaaatcccataattcatgcgttgggtcacaggtggtaacacaatgacataaatagcataatagtaagtaagttgcTAT-AAA-A----TAGTTTT-AATG--AAAACA-AATACCA----------------AGTTC--A-TGCGTT--------------------------------AGAGC-----GT----AAACGCCA----A--CTAGTGGTACATGTAAC-----ACAATG
gi|87029 : aTAT-AAG-A----TGGTTCT-AACA--AAAACA-AATTCCA----------G-----AGTCT--A-TGCATTA------GA----AAA--CA--------GGTTGATGC-----AT----AAGCACCA----
gi|87030 : aTAT-AAA-A----TAGTTCC-AATGAAAAAAAA-AATCCCA----------G-----AGTTC--ATTGCGTTG------AG----ACA--CA--------GGCCAGGGC-----
gi|87031 : aTAT-TAG-G----TAGTTTT-AATG--AAAACA-AATCCAA----------A-----TGTTC--A-TGCGTTA------GA----ACA--CC--------CGTCAGTAT-----GT----TAGCGCAA----C--CAA---------GTAAT-----ACAA
gi|87032 : aTAT-AAA-A----TTATTCG-GATG--AAAACA-AATCCCA----------A-----AGTTC--A-TGGGATG------GG----ACA--AA--------AGTCAGTGC-----AT----AA
gi|87033 : aTAT-AATTA----TAGTTCT-TATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATGC--A-TGCGTTT------GG----AAA--CA--------GA-CAAT-C-----GT----A
gi|87034 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATTCCA----------G-----AATTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----AGAATG
gi|87035 : TATCAAA-A----TAGTTCT-AATG--ACAACA-ATTCCCA----------G-----AATCC--A-TTCATTG------GG----ATG--CA--------GGTCAGTGC-----GTCACAGAGCCCCA----C--CTTGTA------ATAAC-----AGAATG
gi|87036 : TGT-GAA-A----CAGTTCT-AATG--AAAACA-A-----------------------GTTC--A-TGCGTTA------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCACTA----C--CTAGTG------GTTAC-----
gi|87037 : TAT-AAA-C----TG----T-AACG--ACAA-A-AATCCCA----------G-----AGTTC--T-TGCGTTG------GT----ACG--AA--------GATTAGTACAGTATGT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAA
gi|87038 : TGT-AAC-A----TAATTAT-AACA--AAAACA-AATCCCA----------A-----AGTTC--A-TGCCTTGCAACCAAA----ACG--CA---------GTCAGTGC-----AT----AAGAACCA----CAACTACTG------GTA
gi|87039 : TAT-AAA-AATAATAATATT-AATG--AAAACA-AAACCAA----------G-----AGATC--A-TTCGTT-------AG----ACA--CA--------TGTCAGTGC-----GT----TAGCGCTAGGTTT--CTAATG------G
gi|87040 : AT-AAA-C----TAGTTCT-AACG--AAAACACAATCCCA----------G-----AGTTC--A-TACGTTG------GA----ACA--CA--------GGCCAATGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GCAAC-----ACAAT
gi|87041 : AT-GAA-A----TAGTTAG-AATG--AAAACA-AATATGG----------G-----GGTTC--A-TGCTTTG------GT----ACA--AA--------GGTCAG-GC-----AT----AAGCACCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACGATG
gi|87042 : AT-AGG-A----TAGTTCT-AATA--AAAACA-AATCCCA----------G-----GGTCC--A-TGCGTTT------GG----ACA--TA--------GGTAAGTAC-----CT----AAGCGCCA----C--CTACTG------
gi|87043 : AT-AAA-A----TAGT-------------AC---ATCCCA----------G-----GGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCATTGT-----GT----TAACACCA----C--CAAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87044 : AT-AAA-A----TAGTTTT-AAAG--AAA-TA-AACCACATGTATATATAG-----GGTTA--A-TGTGTTG------GG----ATA--CA--------GGTCAGTGC-----CT----AATCGCTA----C--CCAGTG------CTAAC-----ACAATG
gi|87045 : AT-GAA-A----GTGTTGT-AATG--AAAACA-AAGCCCG----------G-----TGCCC--G-TACGTTG------GG----ACA--CA--------GGTAAGTGC-----GT----AAGCGCAC----C--CTAGTG------GCAA
gi|87046 : AT-AAAGA----TA-TTTT-AATG--AAAATA-AATCCAA----------G-----AGTTT--A-TGAGTTG------GGCACAGCA--CA--------GGTCAGTTC-----GTAAGCAAGCGCCA----C--CTAGTG------
gi|87047 : AT-AAA-A----TAGGTCT-AATG--AAAACA-GTTCCCA----------G-----GGTTC--G-TGCGTT-------GG----ACA--AA--------GGTCAGTGC-----
gi|87048 : --AAAATA-AATGCCA----------ATGCACAGCCCTAA-TGCTTTG------GT----ACA--CA--------TGTCAGTAC-----AT----AAGCGCCA----C--ATTGTG------GTGATATGTGACAATG
gi|87049 : atT-AAA-A----TGGTTTT-AATG--AAAAGT-ATTCCCA----------G-----AGTGC--A-TGCGTTG------GG----ACA--AA--------TGTCGGTAC-----AT----
gi|87050 : -AAA-A----TAGTTCT-AAAG--TAAATA-AATGCAA----------G-----AGTTT--A-TGTGATG------GG----AAA--CA--------GGTCAGTGC-----GA----AAGCGCCA----C--CTAGAG------TTAGC-----AAAATG
gi|87051 : -AAA-A----TAGTCCC-AATA--AAAACG-TATCCCA----------G-----AAGTC--A-TGCGTT-------GG----ATA--CA--------GTTAAGTGC-----TT----AAGAGACA----C--ATA
gi|87052 : -AAA-A----TAGTTCC-AGAG--AAAACA-AATCCCA----------G-----ACTGC--A-TGCGTTG------GG----AC
gi|87053 : AA-A----TAGTTCT-GATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGTGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTTT-----GT----AAGCACCA----A--CTAATG------G
gi|87054 : AA-A----TAGTTCT-TATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----GGTTC--A-TGTGTTG------GG----ACA--CAGGAACGCTGGTCAATGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACA
gi|87055 : AA-A----CATTTAT-AATG--AAAATA-TATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGTGTTA------AG----AAA--TA--------TGTCAGTGC-----TT----AAGTGCCA----C--CAAGAG------GTAAC-----GCAATG
gi|87056 : ----TAGATTT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AATGC--A-CGCGTTG------GG----ACG--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87057 : ----TAGCTCA-GATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGCAATT------CG----ACAGGCA--------GGTCAGCGG-----AC----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87058 : TCC-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AATCC--A-TGCGGTG------GG----ACA--CA--------GGCCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----T--ATAGCG------GTAAC-----ACAAT
gi|87059 : -AACG--AAAATA-AATCAAA----------G-----AGGTC--A-TGCGTTG------GG----ATG--TG--------GGTCATTGC-----GT----AAACACCA----C--CTGGTG------GTCTC-----ACAAT
gi|87060 : -AATCTTA----------G-----AATTC--A-TGTATTG------GG----ACA--AA--------GATCAATGC-----GT----AAGCTCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87061 : -----AGTTC--A-TGTGTCA------G-------A--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCTA----C--CTAGTG------GTACC-----GTAGTG
gi|87062 : GTCAGTGC-----GT----AAGTGCCA----C--ATAGCG------GTAAT-----ACAACG
gi|87063 : attgcgtcacaatctccTA------GG----ACA--CA--------GGTCGATGC-----AT----AAGTGTCA----T--CTAGTG------TTAAC-----ACAACG
gi|87064 : G----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AGGCGCCA----C--ATAGCG------GTAAC-----ACAATG
gi|87065 : A--------GGTCAGTAC-----GT----AAGCGGCA----C--CTAGCG------GTAAC-----ACAATG
gi|87066 : GTTAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
blockSeqs : C T ATAA AA TGTATATATA TGCAC TA CAACCA CACA GG GGAACGCT AGTAT CACA GGTT AA GTACAT ATGTG
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . AAGC . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
finalCons : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
Alignments
lowQualScore : 1 2 2222 0 11 0 3333333333 22222 11 0 222222 1111 11 33333333 22222 3333 1111 11 222222 22222
lowQualScore : . . .... . .. . .......... ..... .. . ...... .... .. ........ ..... .... .... .. ...... .....
lowQualScore : 1 1 1111 9 22 9 9999999999 22222 22 9 444444 8888 22 00000000 00000 5555 9999 22 777777 88888
consensus : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
Reference ( family-479 ) : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87016 : TAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--ACAGCA-AATCCCA----------G-----AATGT--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AATCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAACG
gi|87017 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--ACAACA-AATTCCA----------G-----AATTC--G-TAAGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCAA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAGTG
gi|87018 : aTAT-AAA-A----TAATTCT-GATC--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGA-----GT----AAGTGCCA----C--CTAGT-------GTAAC-----ACAATG
gi|87019 : aTAT-AAA-A----TAGTACT-AATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AGTTC--A-TATATTG------GG----TCA--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----AC
gi|87020 : aTAT-AAG-A----TAATTCT-CAAG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGTGTCG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----AC----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAA
gi|87021 : aTAT-AAA-A-----AGTTGT-AACG--AAAACA-AATCCCA----------G-----A------A-TGCATTG------CG----ATA--CA--------TGTTAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87022 : aTAT-AGA-A----TAGATCT-AATG--ACAACA-AATCCCG----------A-----AATTC--A-TCTGTTG------AG----ACA--CA--------GTTCAGTGC-----GT----AAGCTCCA----T--GTAGTA------GTAGC-----ACAGTG
gi|87023 : aTGT-AAA-A----TAATTCT-AATG--TCAACA-AATCC-A----------G-----AGTTT--A-TGTGTTT------GG----ATA--CA--------AGCCAGTGT-----GT----AAGCACCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAGT
gi|87024 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAGCA-AATCTTA----------G-----AGTTG--A-TGCTTTG------GG----ACA--AA--------GGTCAGTGT-----TA----AAGCTCCA----C--ATTGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87025 : aTAT-AAA-A----TAGTGCTTAACG--AAAACA-AACCCCA----------C-----AGTTC--A-TGCATAT------GA----TCA--TA--------GGTCACTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGCG------GTAAC-----AC
gi|87026 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-TATT--ACAACA-AATCC-A----------G-----AGTTC--A-TTAATTG------GG----ACA--CA--------GATCAGTGC-----GC----ATGCGACA----C--
gi|87027 : aAT-AAA-A----TAGGTCA-AATG--ACAACA-AATCCCA----------T-----AATTC--A-TGCGTTG------GG----TCA--CA--------GGT
gi|87027 : acTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTGGTG------GTAAC-----ACAATggtaacacaatgacataaatagcataatagtaagtaagttgctgcgtaagcgccacctggtggtaacacaat
gi|87028 : acataaaataggtcaaatgacaacaaatcccataattcatgcgttgggtcacaggtggtaacacaatgacataaatagcataatagtaagtaagttgcTAT-AAA-A----TAGTTTT-AATG--AAAACA-AATACCA----------------AGTTC--A-TGCGTT--------------------------------AGAGC-----GT----AAACGCCA----A--CTAGTGGTACATGTAAC-----ACAATG
gi|87029 : aTAT-AAG-A----TGGTTCT-AACA--AAAACA-AATTCCA----------G-----AGTCT--A-TGCATTA------GA----AAA--CA--------GGTTGATGC-----AT----AAGCACCA----
gi|87030 : aTAT-AAA-A----TAGTTCC-AATGAAAAAAAA-AATCCCA----------G-----AGTTC--ATTGCGTTG------AG----ACA--CA--------GGCCAGGGC-----
gi|87031 : aTAT-TAG-G----TAGTTTT-AATG--AAAACA-AATCCAA----------A-----TGTTC--A-TGCGTTA------GA----ACA--CC--------CGTCAGTAT-----GT----TAGCGCAA----C--CAA---------GTAAT-----ACAA
gi|87032 : aTAT-AAA-A----TTATTCG-GATG--AAAACA-AATCCCA----------A-----AGTTC--A-TGGGATG------GG----ACA--AA--------AGTCAGTGC-----AT----AA
gi|87033 : aTAT-AATTA----TAGTTCT-TATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATGC--A-TGCGTTT------GG----AAA--CA--------GA-CAAT-C-----GT----A
gi|87034 : aTAT-AAA-A----TAGTTCT-AATG--AAAACA-AATTCCA----------G-----AATTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----AGAATG
gi|87035 : TATCAAA-A----TAGTTCT-AATG--ACAACA-ATTCCCA----------G-----AATCC--A-TTCATTG------GG----ATG--CA--------GGTCAGTGC-----GTCACAGAGCCCCA----C--CTTGTA------ATAAC-----AGAATG
gi|87036 : TGT-GAA-A----CAGTTCT-AATG--AAAACA-A-----------------------GTTC--A-TGCGTTA------GG----ACA--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCACTA----C--CTAGTG------GTTAC-----
gi|87037 : TAT-AAA-C----TG----T-AACG--ACAA-A-AATCCCA----------G-----AGTTC--T-TGCGTTG------GT----ACG--AA--------GATTAGTACAGTATGT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAA
gi|87038 : TGT-AAC-A----TAATTAT-AACA--AAAACA-AATCCCA----------A-----AGTTC--A-TGCCTTGCAACCAAA----ACG--CA---------GTCAGTGC-----AT----AAGAACCA----CAACTACTG------GTA
gi|87039 : TAT-AAA-AATAATAATATT-AATG--AAAACA-AAACCAA----------G-----AGATC--A-TTCGTT-------AG----ACA--CA--------TGTCAGTGC-----GT----TAGCGCTAGGTTT--CTAATG------G
gi|87040 : AT-AAA-C----TAGTTCT-AACG--AAAACACAATCCCA----------G-----AGTTC--A-TACGTTG------GA----ACA--CA--------GGCCAATGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GCAAC-----ACAAT
gi|87041 : AT-GAA-A----TAGTTAG-AATG--AAAACA-AATATGG----------G-----GGTTC--A-TGCTTTG------GT----ACA--AA--------GGTCAG-GC-----AT----AAGCACCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACGATG
gi|87042 : AT-AGG-A----TAGTTCT-AATA--AAAACA-AATCCCA----------G-----GGTCC--A-TGCGTTT------GG----ACA--TA--------GGTAAGTAC-----CT----AAGCGCCA----C--CTACTG------
gi|87043 : AT-AAA-A----TAGT-------------AC---ATCCCA----------G-----GGTTC--A-TGCGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCATTGT-----GT----TAACACCA----C--CAAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87044 : AT-AAA-A----TAGTTTT-AAAG--AAA-TA-AACCACATGTATATATAG-----GGTTA--A-TGTGTTG------GG----ATA--CA--------GGTCAGTGC-----CT----AATCGCTA----C--CCAGTG------CTAAC-----ACAATG
gi|87045 : AT-GAA-A----GTGTTGT-AATG--AAAACA-AAGCCCG----------G-----TGCCC--G-TACGTTG------GG----ACA--CA--------GGTAAGTGC-----GT----AAGCGCAC----C--CTAGTG------GCAA
gi|87046 : AT-AAAGA----TA-TTTT-AATG--AAAATA-AATCCAA----------G-----AGTTT--A-TGAGTTG------GGCACAGCA--CA--------GGTCAGTTC-----GTAAGCAAGCGCCA----C--CTAGTG------
gi|87047 : AT-AAA-A----TAGGTCT-AATG--AAAACA-GTTCCCA----------G-----GGTTC--G-TGCGTT-------GG----ACA--AA--------GGTCAGTGC-----
gi|87048 : --AAAATA-AATGCCA----------ATGCACAGCCCTAA-TGCTTTG------GT----ACA--CA--------TGTCAGTAC-----AT----AAGCGCCA----C--ATTGTG------GTGATATGTGACAATG
gi|87049 : atT-AAA-A----TGGTTTT-AATG--AAAAGT-ATTCCCA----------G-----AGTGC--A-TGCGTTG------GG----ACA--AA--------TGTCGGTAC-----AT----
gi|87050 : -AAA-A----TAGTTCT-AAAG--TAAATA-AATGCAA----------G-----AGTTT--A-TGTGATG------GG----AAA--CA--------GGTCAGTGC-----GA----AAGCGCCA----C--CTAGAG------TTAGC-----AAAATG
gi|87051 : -AAA-A----TAGTCCC-AATA--AAAACG-TATCCCA----------G-----AAGTC--A-TGCGTT-------GG----ATA--CA--------GTTAAGTGC-----TT----AAGAGACA----C--ATA
gi|87052 : -AAA-A----TAGTTCC-AGAG--AAAACA-AATCCCA----------G-----ACTGC--A-TGCGTTG------GG----AC
gi|87053 : AA-A----TAGTTCT-GATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGTGTTG------GG----ACA--CA--------GGTCAGTTT-----GT----AAGCACCA----A--CTAATG------G
gi|87054 : AA-A----TAGTTCT-TATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----GGTTC--A-TGTGTTG------GG----ACA--CAGGAACGCTGGTCAATGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACA
gi|87055 : AA-A----CATTTAT-AATG--AAAATA-TATCCCA----------G-----AGTTC--A-TGTGTTA------AG----AAA--TA--------TGTCAGTGC-----TT----AAGTGCCA----C--CAAGAG------GTAAC-----GCAATG
gi|87056 : ----TAGATTT-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AATGC--A-CGCGTTG------GG----ACG--CA--------GGTCAGTGT-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87057 : ----TAGCTCA-GATG--ACAACA-AATCCCA----------G-----AATTC--A-TGCAATT------CG----ACAGGCA--------GGTCAGCGG-----AC----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87058 : TCC-AATG--AAAACA-AATCCCA----------G-----AATCC--A-TGCGGTG------GG----ACA--CA--------GGCCAGTGC-----GT----AAGCGCCA----T--ATAGCG------GTAAC-----ACAAT
gi|87059 : -AACG--AAAATA-AATCAAA----------G-----AGGTC--A-TGCGTTG------GG----ATG--TG--------GGTCATTGC-----GT----AAACACCA----C--CTGGTG------GTCTC-----ACAAT
gi|87060 : -AATCTTA----------G-----AATTC--A-TGTATTG------GG----ACA--AA--------GATCAATGC-----GT----AAGCTCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG
gi|87061 : -----AGTTC--A-TGTGTCA------G-------A--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AAGCGCTA----C--CTAGTG------GTACC-----GTAGTG
gi|87062 : GTCAGTGC-----GT----AAGTGCCA----C--ATAGCG------GTAAT-----ACAACG
gi|87063 : attgcgtcacaatctccTA------GG----ACA--CA--------GGTCGATGC-----AT----AAGTGTCA----T--CTAGTG------TTAAC-----ACAACG
gi|87064 : G----ACA--CA--------GGTCAGTGC-----GT----AGGCGCCA----C--ATAGCG------GTAAC-----ACAATG
gi|87065 : A--------GGTCAGTAC-----GT----AAGCGGCA----C--CTAGCG------GTAAC-----ACAATG
gi|87066 : GTTAGTGC-----GT----AAGCGCCA----C--CTAGTG------GTAAC-----ACAATG