lowQualScore : 1 1111111 111111111111 33333333333333333333 1111111111111111111 111111111111111
lowQualScore : 0 66 1 1 2 22 1 5 77 22 4444444 0 666666 5 2 0 11 0 222 777777777777 11 0 666666 9999999999 44444444 11 99999999999 1 6666 4444 0 0 0 00000000000000000000 22 5 0000000000000000000 11 2 111 0 000000000000000 1 1 9999
lowQualScore : . .. . . . .. . . .. .. ....... . ...... . . . .. . ... ............ .. . ...... .......... ........ .. ........... . .... .... . . . .................... .. . ................... .. . ... . ............... . . ....
lowQualScore : 7 88 7 0 0 66 9 7 11 88 8888888 3 777777 4 5 8 11 8 222 999999999999 99 8 111111 4444444444 44444444 99 77777777777 9 5555 6666 9 9 9 99999999999999999999 66 7 2222222222222222222 33 9 777 7 222222222222222 0 0 0000
consensus : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGTACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--C--TC-NT----TGGGGAGGGCTGT---NG-CTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACC--C-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA--T--A-T---TTG-T----ATT---GT-T-A-T---TA--N----T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-ATA---ATA-NA--T---------G-CAAT-AAAATAT--GNTTAAACTAA
Reference ( gi|104118 ) : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAATTGTGTACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--C--TC-AC----TGGGGAGGGCTGT---TG-CTAATGTTGTCAAAA-CTTGTAGCCCAACC--C-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA--T--A-T---TTG-T----ATT---GT-T-A-T---TA--A----T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-ATA---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATAT--TATTAAACTAA
gi|104119 : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-TAATTGTGTACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--C--TC-AT----TGGG-----CTGT---TG-CTAATGTTGTCAAAA-CTTGTAGCCCAACC--C-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA--T--A-T---TTG-T----ATT---GT-T-A-T---TA--A----T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TG----T--TT-ATA---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATAT--TATTAAACTAA
gi|104108 : TGTGATTACATGTAAAATATCGG-AAAATGTGTACAATTA-T--AT-GTG-ATTTT--C--TC-TC----TGGGGAGGGCTGT---TG-CTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACC--C-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA--T--A-T---TTG-T----ATT---GT-T-A-T---TA--T----T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TG----C--AT-ATA---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATAT--TATTAAACCAA
gi|104109 : aaTGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGTACATTTA-A--AT-GTG-ATATT--C--TC-TT----TGGGGAAGACTTT---TG-CTTATGTTGTAAAAA-CTTGTAGCCCAACC--C-AT---TTAT----A----A--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA--T--A-A---TTG-T----ATT---AT-T-A-T------------T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-ATA---AAA-GG--T---------G-CAAT-AAAATAG--TATTTAACTAA
gi|104110 : aaTGTGATTACACGTAAAGTATCGG-AAAAGATGTACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--C--TC-TT----TTGGGAGGTCTGT---TG-CTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACC--T-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--G----A--TA--T--A-A---TTG-T----ATT---GT-T-A-T---TA--T----T-----C-G--TG-T-A---G-T-----TG----T--AT-ATA---TTA-
gi|104115 : aaTGTGATTACATGTATAATATCGT-TAAACGTGTACTTTTA-A--AT-GTT-ATTTT--C--TC-TT----TAGGGAGGGTTGA---TG-CTAATGTTGGTATAA-CTTGTAGTCCGACC--C-ATA--TT--------------TA--C-A------T-A--------TA--C----A--TT--T--A-A---TTG-A----ATT---AT-T-T-T---TA--T----T-----C-A--TG-T-T---A-T-----TA----T--AT-ATA---ATA-CA--T---------A-AAAT-AAAATAT--TAATAGA
gi|104112 : aTGTTATTACATTTCA--TTTCGG-------TATACAT----A--AT-GTA-ATGGT--A--TTGACGATATGGAGAGAACTGT---AA-CTAATGTTGTTATGA-CTTGTGGTTCAATC--A-AT---TTGC----G----CA-TG--T--------T-A--------TA--A----AATTA--T--A-T---ATG-T----ATC---GT-T-A-T-------G----T-----G-A--TGTT-A---A-T-----TA----T--CT-GTA---ACA-TA--A---------G-TAAT-AAAATAT--GTTTTAACTAA
gi|104120 : aaGTGATAACATGTAAAGTATCAG-AAAACATGTACATTTA-A--AT-GTG-GTTTT--C--TC-TT----TAAGGAAGACAGT---TG-CTAATGTTGTTAAAA-CTTGTGGCCAGACC--A-AT---TTGA----A----CTATA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA--T--A-A---TTG-T----ATT---AT-T-A-T---TA--G----T-----C-A--TG-T-A---A-TA----TA----T--AT-AT
gi|104121 : TGATGATATGTAAAATATCGGGAAAGTGT-TGCACTAA-A--AT-GTG-ATTTT--C--TT-TT----TGGTGAGGACTGACCATG-CTACTGTTGATAAAA-CTTGTGACTCGACC--C-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------C-AGTTGAATTTA--C----A--TA--T--A-T---ATG-T----AT-----T-C-A-A---GA--AC---T-----T-A--TA-T-A---A-TC----TC----T--GT-ATA---ATA-AG--T-----------CATT-GATATATTGTATTA
gi|104122 : TGATTACATGTCAAGTATTGGAAAAATGTGTACATTAACA--AT-GTG-ATTTT--gtcaagtaattgtatataataaatgtattaaaatgtcattgaacta
gi|104123 : GATAATATGTAAAGTTTATG-AAAATGTGTACATTTA-A--AT-GTG-ATTTTT-C--TC-AT----TCTGAAGGAATGT---TG-TTAATTTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACC--C-AA---TTTC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA--T--A-A---TTG-T----TTT---GT-T-A-T---TAT-AT---T-----C-A--TG-C-A---A-T-----TG----T--AT-ATA---CTA-GT--T---------G-CAAT-AGAATAT--TATCAAACTAAaattttcggaagactagcagtgtggttaa
gi|104124 : ATTACCTGTACAGTATCGGGAAA----ATACATT-A-A--AT-GTG-ATTTT--C--GT-TT----TGGGCAGGGCTGT---TG-CTAATGTTGTTAAAA-CTTATAGCTCGACC--C-AT---TTGA----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--AA------------TG-C----ATT----------------------------------TG-C-A---A-T-----T------------------TA-AA--T---------G-CAAT-AAACTAT--TATAAAACTAA
gi|104125 : ATT-CATATAAA--AACGT-AAACTGTGTGTATT---------ATA-ATT----------AA----TGGAGAGAAATGT---AG-CTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATC--C-AT---TTG-------------TA--T-A------T-G--------T---T----A--TA--T--A-T---TTG-------TT---AT-T-A-T---T---T----T-----T-A--TGTT-A---ATT-----TG----T--AT-ATATTGATA-AA--TGTAACATTCG-CAAT-AAAATAT--GTTTAAACTAA
gi|104116 : TATATAAAAAATATCGT-CACTT---TA-ATTTG-T--AT-GTGCATTTTGAC--GC-AT----TAGGGAGGGCTGT---AC-CTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAAACCAACC--A-TT---TTGC----A----T--T---T-----------------------------------T--A-T---TCGTT----ATT---GG-T-G-T---TA--AAAATT-----G-A--TG-T-----T-T-----TGAA--C--AT-ATA---AAA-TT--T---------T-CAAT-AAAATAT--TATTGAATTAA
gi|104126 : atgtgtttgtttgATGTAAAGTATCGG-AAAATGAATACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--C--TC-TT----TGAGAAAGGGTGT---TG-CTAATGTTGTTAAAC-CCTGTAG------C--C-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA--T--A-A---TAG-T----ATT---GT-T-A-T---TA--T----T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AC-CTA---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAA
gi|104111 : GTGAAATATGGG-GAAATGTGTTCATTTA-A--AT-GTG-ATTAT--C--TC-TT----TGGGGAGACTTGT---TG-CTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCACACC--C-AT---TTGT----G----C--TA--T-A------TAA--------AA--A----A--TA-----A-A---TTG-T----ATT---GT-T-A-T---TA--T----T-----C-A--TG-T-T---A-T-----TG----T--AT-ATA---ATA-GA--T---------G-CTAT-GAACTAT--TATTAAAC
gi|104117 : aatgtgttccAAAATATCGT-CACTT---TA-ATTTG-T--AT-GTGCATTAT--GAAGC-AT----TGGGGAAGGCTGT---AA-CTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGTCCAACC--C--T---TTGC----A----T--T---T-----------------------------------T--A-T---TCGTT----ATTGGGGC-T-A-C---AA--A----T-----TGA--TG-T-----T-T-----TG----A--AC-ATG---TCA-AATTT---------G-CAAT-AAAATAT--TACTAAATTAA
gi|104127 : atatgtttgtttgtatatcaTATCGG-AAAATATGTACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--C--TC-TT----TGGGGAAAGCTGT---AA-CTAATGTTATTAAAA-CTTGTAGCCCAACC--C-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--G----A--TA--T--A-G---TTG-T----ATT---GT-T-A-T---TA--T----T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-ATA---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATAT--TATTAAACTAA
gi|104129 : -AAATTG---ACATTTA-A--AT-GAG-AAATT--C--TT-TT----TGGGA----------------AATGTTGTTAAAA-CATTTAGTTCGACCTTT-TT---TTGC----A----C--TA----A------------------------------A--C--A-T---TTG-T----A-T---AT-TAA-T---TA--T----T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-ATA---ATA-GA--T---------G-CAAT-ACGA-----TATCAAACTA
gi|104130 : TACATATA-ACGACAGTG-GTTTT--C--AT-TT----TGAGGAGGGCTAT---TG-CTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCGACC--G-AT---TTAC----A----C--TC--T-A------T-A--------TA--A--------A--T--A-T---TTG-TTTC-ATT---GA-T-A-T---T
gi|104131 : TTG-A--AT-ATG-----T--C--GC-AC----TGGAGAGAACTGT---AA-CTAATGTTGTTATAA-CTTCTAGTTCAATA--C-AT---TTGC----A-------TA--T-G------T-T--------T-----------TA--T--ATT---TTG-TTATCATT---TTAT-G-T---TC--A----T-------A--TG-T-ATATA-T-----TGATA-T--AT-GTA---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATAT--GTGTAAACTAA
gi|104132 : --AT-GTGCATTTTGAC--TC-AT----TAGGGAGGGCTGT---AA-TTAATGTTGTTAACA-CTTGTAGACTGACC--C-TT---TTGC----A----T--TT--T-ACTCGT-T-A--------TT--G----G--TG--T--A-CAAATTG------A-T---GT-T---T---TG--A----A-----C-A--TG-G-A---A----------------A----A---AT---T--T---------G-CAAT-AAAATAT--TATTA
gi|104128 : C-AC----TGGAGAGAACTGT---AA-CTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATC--C-AT---TTGC----ATATGT--TA--T-A------T-ATTTGT---TATCATCTTA--TG--TTCA-T---TTG-T----AT-----T-T-A-T---TG--A----TA----C-A--TG-T-G-----------TA----T--AT-GTA---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATAT--GTTTAAACTAA
gi|104113 : tcggtacacatatacattcataaagctg----TGGAAAGACCTGT---AT-CTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATG--C-AT---TTGCGTATG----T--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA------------TG-C----ATT---AT-C-A-T-------G----T-----G-A--TGTT-C---A-T-----TA----T--CT-GCA---ACA-TA--A---------G-TAAT-GAAATAT--GTTTAAACTAA
gi|104134 : aatgttattacatttcattccagtatacgtaatatattgatattgatgata----TGGCAAGAACTGT---AA-CTAATGTTGTTATAA-CTTGTTGTTCAATC--C-AT---TTGCGTATG----T--TA--T-T------T-A--------TA--A----A--CA------------GG-T----AGT---AT-C-A-T-------G----T-----G-A--TGTT-A---A-A-----TA----T--CT-GTA---ATA-TA--A---------G-TAAT-AAAATAT--GTTTAAACTAA
gi|104135 : taGGAGGGATGT---TG-CTAATGGTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACC--C-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--C----A--TA--T--A-A---TTG-T----ATT---AT-T-A-T---TATTAT---T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TT----T--AT-ATA---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAACTAT--TATTAA
gi|104136 : tGGAGGGCTGT---TG-CTAATGTTGTTTAAA-CTTGTAGTCCGACC--C-AT---TTGC----A----C------T-A------T-A--------TA--A----T--TA--T--A-A---TTA-T----ATT---AT-T-A-T---TA--T----T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-ATA---ATA-GA--T---------G-CAATAAAAATGT--GATTAAACTAA
gi|104138 : GGAGGGCCGT---AA-CTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACC--C-GT---TTGC----------------T-A------T-G--------TG--A----A--T
gi|104139 : GGAGGGCAGT---TA-CTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGACCCAACC--T-GT---TTGC---------T--TA--TGA------T-G--------TG--A----A--T
gi|104133 : GGAGAACTTC---AA-CTAATGTTGTTTTAA-CTTGTAGATCAATC--CAATTTATTAT----G----T--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA------------TG-T----ATT---AT-C-A-T-------G----T-----G-A--TGTT-A---A-T-----TG----T--CT-GTA---ATA-TA--TTAA------G-TAAT-AAAA-AT--GTTTAAACTAA
gi|104140 : tatGGAGGGCCGT---AA-CTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACC--C-GT---TT
gi|104137 : GGAGGGCC-T---TGACTGATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACC--C-GT---TTG----------C--TA----A------T-G--------TG--A----AT-TA--T--A-
gi|104141 : GAGAACTGT---AA-CTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATT--C-AT---TTGC----A-------TA--T-G------T----------T--------A--TA--T--A-T---TTA------GTT---AT-C-ATT---TA--ATGT-T-----C-ATTTG-T-ATATA-T-----TGATATT--AT-GTA---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATAT--GTTTAAACTAA
gi|104143 : GAGAACTGT---AA-CTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATC--C-AT---TTGC----A-------TA--T-G------T----------TA--T----A--TA--T----T---TTT-T----ATC---AT-T---T---TATGT----T-----C-ATTTG-T-AT--A-TATGGATA----T--AT-GTA---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATAT--GTTTTAACTA
gi|104142 : GAGAACTGT---AA-CTAATGTTGTTATAA-ATTGCAGTTCAATC--C-AT---TTGCGA--A----T--GA--T-A------T-ATT------TA--A----A--TA------------TG-T----ATT---AT-A-A-T-------G----T-----G-A--TGTT-A---A-A-----TA----T--CT-GTA---ACA-TA--A---------G-TAAT-AAAATAT--GTTTAAACT
gi|104144 : GAGAACTGT---AA-CTAATATTGTTATAA-CTTGTAGTACAATT--C-AT---TTGC----A-------TA--T-G------T----------T--------A--TA--T--G-T---TTG-TTATCATT----T-T-A-TGTATA--T----T-----T-G--TA-T-AT--A-T-----TGACA-T--AT-GTA---ACA-TA--C---------G-AAAT-AAAATAG--GTTTAAACTAA
gi|104146 : ---TA-CTTATGTTGTAATAA-CTTGTAGCCCAACC--C-AT---TTGC---------T--TA--T-G------T----------------------TA--T--G-T---TTG-TA---ATT---G--T-A-G---GA--A----TGGTTAT-A--TG-T-ATATG-T-----TA----TAAAC-ATA---ATATTA--T---------G-CAAT-AAAATGT--GATTAAACTAA
gi|104151 : -CTAATGTTGGCAGAA-CTTGTGGACCAACC--C-TC---TTGC---------T--TA--T-ACGTGTTT-G--------TA--A----A--TAGTT--A-TAG-TTA-T----ACT---AC-T-A-T---T---G----T-----A-A--TG-T-A---A-T-----TG----T--ATGAT-----TA-AA--A---------A-CAAT--AAATAT--GTTTAAACTAA
gi|104148 : -CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACC--C-TT---TTGC---------T--TA--T-A------T-A--------TG--T----A--TA--T--A-T---ATA-T----AT--------------------------------A--TA-T-A-----------TG----T------TA---A-A-AA------------G-CAAT-AAAATAT--GTTTAAACTA
gi|104147 : -CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACC--C-TT---TTGC---------T--TA--T-A------T-A--------TT--T----A--TA--T--A-T---ATA-T----A--------T-A-T--------------------A--TG-T--------------------------TA---AAA-G-------------G-CAAT-AAAATAT--GTTTAAACTAA
gi|104150 : -CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACC--C-TC---TTGC---------T--TA--T-A------T-ATGTTTG--TA--A----A--TATTT--A-TAG-TTA-C----ACT---AC-T-A-T---T---T----T-----A-A--TG-TAA---A-T-----TG----T--ACGATT---ATA-A-------------G-CAAT--AAATAT--GTTTAAACTAA
gi|104149 : -CTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACC--C-GT---TTGC----------------T-A------T-G--------TA--A----A--T
gi|104152 : -CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACT--C-TT---TTGC---------T--TA--T-A------T-A--------TG--T----A--TA--T--A-T---ATA-T----A--------T-A-T--------------------A--TG-T--------------------------TA---A-A-AA------------G-CAAT-AAAATAT--GTTTAAACTAA
gi|104155 : -CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACC--C-TT---TTGC---------T--TA--T-A------T-A--------TG--T----A--TA--T--A-T---ATA-T----AT--------------------------------A--TG-T--------------------------TA---A-A-AA------------G-CAAT-AAAGTAT--GTTTAAACTAA
gi|104153 : -CTAACGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACC--C-AT---TTG----------C--TAATT-A------T-G--------TA--A----A--T
gi|104156 : -CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACC--C-TT---TTGC---------T--TA--T-A------T-A--------T--------A--TA--C--A------TG-T----AT--------------------------------A--TA-T-A-----------TA----T--AT-AT----ACA-AA--T---------GCCAAG-AAGATAT--
gi|104154 : -CTAATTTTGTTAGAA-CTTGTAGCCGAACC--C-GT---TTGC---------T--TAT-T-A------T-G--------TA--A----A--T
gi|104145 : TAATGTTGTTAAAATCTTTTTGCACGACC--G-AT---TTGT----A----C--TT--A-A------T-A--------TA--A----A--TA--T--A-T---T-G-T----ATT---GT-T----------------------C-A--TA-T-A---G-T-----TA----T--AT-ATA---ATA-GA--T---------G-AAAT--AAATAT--TATTAAACTA
gi|104157 : ctttTAATGTTGGCAGAA-CTTGTAGCCCAACC--C-TC---TTG-----A----T--TA--T-GTGTT--T-G--------TA--A----A--TATTT--A-TAG-TTA-T----ACT---AC-T-G-T---T---G----T-----A-A--TA-T-A---A-T-----TG----T--ATGACA---ATA-A-------------G-CAAT--AAATAT--GTTTAAACT
gi|104158 : GTTGTTTAAA-CTTGTAGCCCGACC--C-AT---TTGC----A----T--TT--T-A------T-
gi|104114 : TATTAAAA-CCTATAGCTTGAAC--C-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--A----A---A--------------------ATT---GT-------------A----T-----C-A---G-T-----------------------------------GA--T---------G-CAAT-AAAATAT--GATTAAACTAA
gi|104159 : aatgtgaaataaaattatacatatatgaaaaatgttgcaatgttattgtttttgttttttaaatattcttaag-AT---TTGC----A----C--TA--T-A------T-A--------TA--A----A--TA--T--A-C---TTG-T----AAT---GT-T-A-T---TA--T----T-----C-A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-ATA---ATA-GA--T---------G-AAAT-AAAATAT--TATTAAACTAA
gi|104160 : --A----A--CA--T--A-A---TTG-T----ATT---GT-T-A-T---TA--T----T-----C-A--TG-T-A---A-T-----CG----T--AA-ATA---ATG-GA--T---------G-CAAT-AAAATTT--TATTAAACT
Alignments
lowQualScore : 111111111111 22222222222222222222222
lowQualScore : 2 0 2 22 2 22 1 3 77 1 111 11 111 1 1 0 0 222 11 666666666666 11 0 444444 7777777 33333333 11 33 22 555 11 444 4444 0 6666666666666 1 22222222222222222222222 22 5 6666666 33333 6666 11 2 111 111 0 22 777777777777 1 1 22
lowQualScore : . . . .. . .. . . .. . ... .. ... . . . . ... .. ............ .. . ...... ....... ........ .. .. .. ... .. ... .... . ............. . ....................... .. . ....... ..... .... .. . ... ... . .. ............ . . ..
lowQualScore : 5 8 2 88 0 66 9 8 11 0 999 55 999 4 0 8 8 222 11 111111111111 99 8 777777 4444444 55555555 11 66 11 999 22 666 3333 9 3333333333333 8 99999999999999999999999 55 5 9999999 22222 4444 22 7 666 666 3 00 999999999999 0 0 66
consensus : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATT--TA-A--AT-GTG-ATTTT--CTCTTTGGGGAG---GGC--TG---TNGCTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----A-T-T---G-T-----TA-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----TA--T-AT---A---ATAN-A--T---------G-CAAT-AAAATATGNTTAAACTAA
Reference ( family-471 ) : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATT--TA-A--AT-GTG-ATTTT--CTCNTTGGGGAG---GGC--TG---TNGCTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----A-T-T---G-T-----TA-T----T-----A--N----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----TA--T-AT---A---ATAN-A--T---------G-CAAT-AAAATATGNTTAAACTAA
gi|104108 : TGTGATTACATGTAAAATATCGG-AAAATGTGT-ACAAT--TA-T--AT-GTG-ATTTT--CTCTCTGGGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----A-T-T---G-T-----TA-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----CA--T-AT---A---ATAG-A--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACCAA
gi|104109 : aaTGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATT--TA-A--AT-GTG-ATATT--CTCTTTGGGGAA---GAC--TT---TTGCTTATGTTGTAAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--AT----A----A--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----A---------T-----TA-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----TA--T-AT---A---AAAG-G--T---------G-CAAT-AAAATAGTATTTAACTAA
gi|104110 : aaTGTGATTACACGTAAAGTATCGG-AAAAGATGT-ACATT--TA-A--AT-GTG-ATTTT--CTCTTTTGGGAG---GTC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCT-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--G----A--TA--T--AA--T--TG---T----A-T-T---G-T-----TA-T----T-----A--T----T-C--G--TG-T-A---G-T-----TG----TA--T-AT---A---TTA
gi|104111 : aaGTGAAATATGGG-GAAATGTGT-TCATT--TA-A--AT-GTG-ATTAT--CTCTTTGGGGAG---ACT--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCACACCC-AT---TT--GT----G----C--TA--T-A------TA-------A--A----A--AA--TA-AA--T--TG---T----A-T-T---G-T-----TA-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-T---A-T-----TG----TA--T-AT---A---ATAG-A--T---------G-CTAT-GAACTATTATTAAAC
gi|104112 : aatgtgttccTGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATGA-CTTGTGGTTCAATCA-AT---TT--GC----G----C---A--T-GT-----TA------TA--A----AATTA--T--AT--A--TG---T----A-T-C---G-T-----TA-T-------------G----T-G--A--TGTT-A---A-T-----TA----TC--T-GT---A---ACAT-A--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTTAACTAA
gi|104113 : aatgttattacatttcatttcggtatacataatgtaatggtattgacgataTGGAAAG---ACC--TG---TATCTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATGC-AT---TT--GCGTATG----T--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA------------TG---C----A-T-T---A-T-----CA-T-------------G----T-G--A--TGTT-C---A-T-----TA----TC--T-GC---A---ACAT-A--A---------G-TAAT-GAAATATGTTTAAACTAA
gi|104114 : aatgttattacatttcattccagtatacgtaatatattgatattgatgataTATTAAAA-CCTATAGCTTGAACC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A-----------------------------------------------------------------------------A---A-T-----TG----TA--T--C---A---GT-G-A--T---------G-CAAT-AAAATATGATTAAACTAA
gi|104115 : aatgtgaaataaaattatacatatatgaaaaatgttgcaatgttattgtttttgttttttaaatattcttaagTGTGATTACATGTATAATATCGT-TAAACGTGT-ACTTT--TA-A--AT-GTT-ATTTT--CTCTTTAGGGAG---GGT--TG---ATGCTAATGTTGGTATAA-CTTGTAGTCCGACCC-ATA--TT----------------TA--C-A------TA------TA--C----A--TT--T--AA--T--TG---A----A-T-T---A-T-----TT-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-T---A-T-----TA----TA--T-AT---A---ATAC-A--T---------A-AAAT-AAAATAT
gi|104116 : aATT--TG-T--AT-GTGCATTTTGACGCATTAGGGAG---GGC--TG---TACCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAAACCAACCA-TT---TT--GC----A----T--T--------------------------------T---T--AT--T--CG---TT---A-T-T---G-G-----TG-T----T-----A--AAAATT-G--A--TG-T-T-----T-----TGAA--CA--T-AT---A---AAAT-T--T---------T-CAAT-AAAATATTATTGAATTAAtaataga
gi|104117 : atgtgtttgtttgtatataaaaaatatcgtcactttaCATTGGGGAA---GGC--TG---TAACTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGTCCAACCC--T---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AT--T--CGT--T----A-T-TGGGG-C-----TA-C----A-----A--A----T-TG-A--TG-T-----T-T-----TG----AA--C-AT---G---TCAA-ATTT---------G-CAAT-AAAATATTACTAAATTAA
gi|104118 : atatgtttgtttgtatatcaaaaatatcgtcactttaatttgtatgtgcattatgaagTGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAATTGTGT-ACATT--TA-A--AT-GTG-ATTTT--CTCACTGGGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTCAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----A-T-T---G-T-----TA-T----T-----A--A----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----TA--T-AT---A---ATAG-A--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104119 : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-TAATTGTGT-ACATT--TA-A--AT-GTG-ATTTT--CTCATTGGG--------C--TG---TTGCTAATGTTGTCAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----A-T-T---G-T-----TA-T----T-----A--A----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----TT--T-AT---A---ATAG-A--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104120 : GTGATAACATGTAAAGTATCAG-AAAACATGT-ACATT--TA-A--AT-GTG-GTTTT--CTCTTTAAGGAA---GAC--AG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTGGCCAGACCA-AT---TT--GA----A----CTATA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----A-T-T---A-T-----TA-T----T-----A--G----T-C--A--TG-T-A---A-------TA----TA--T-AT---A---
gi|104121 : TGATGATATGTAAAATATCGG-GAAA-GTGTTGCACT--AA-A--AT-GTG-ATTTT--CTTTTTGGTGAG---GAC--TGACCATGCTACTGTTGATAAAA-CTTGTGACTCGACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------CAGT----TG--A----A--TT--T--AC--A--TA---T----A-TAT---G-------TA-T----TCAAGAA--C----T-T--A--TA-T-A---A-TC----TC----TG--T-AT---A---ATAA-G--T-----------CATT-GATATATt
gi|104121 : ----C--TG--T-A------TAA-----TA--A----G--T---C--AT--TGATA---T----A-T-T---G-T------A-T----T-----A--G----T-C--A--AG-T-A---A-T-----TG----TA--T-AT---A---ATAA-A--T---------G-TATT-AAAATGTCATTGAACTAtgtattagtcaagtaattgtatataataaatgtattaaaatgtcattgaacta
gi|104122 : tgatgatatgtaaaatatcgggaaagtgttgcactaaaatgtgattttctttttggtgaggactgaccatgctactgttgataaaacttgtgactcgacccatttgcactatacagttgaatttacatatatatgtattcaagaacttatataatctTGATTACATGTCAAGTATTGGAAAAATGTGT-ACATT--AACA--AT-GTG-ATTTT--AATTTTCGGAAGACTAGCAGTG---TGGTTAA
gi|104123 : GATAATATGTAAAGTTTATG-AAAATGTGT-ACATT--TA-A--AT-GTG-ATTTTT-CTCATTCTGAAG---GAA--TG---TTGTTAATTTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AA---TT--TC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----T-T-T---G-T-----TA-TTA--T-----A--T----T-C--A--TG-C-A---A-T-----TG----TA--T-AT---A---CTAG-T--T---------G-CAAT-AGAATATTATCAAACTAA
gi|104124 : ATTACCTGTACAGTATCGG-GAAA---AT-ACATT---A-A--AT-GTG-ATTTT--CGTTTTGGGCAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTATAGCTCGACCC-AT---TT--GA----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--AA------------TG---C----A-T-T-----------------------------------------TG-C-A---A-T-----T---------------------TAA-A--T---------G-CAAT-AAACTATTATAAAACTAA
gi|104125 : ATT-CATATAAA--AACGT-AAACTGTGT-GTATT-----------ATA-ATT-------AATGGAGAG---AAA--TG---TAGCTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--G-------------TA--T-A------TG------T---T----A--TA--T--AT--T--TG----------T-T---A-T-----TA-T----T--------T----T-T--A--TGTT-A---ATT-----TG----TA--T-AT---ATTGATAA-A--TGTAACATTCG-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104126 : ATGTAAAGTATCGG-AAAATGAAT-ACATT--TA-A--AT-GTG-ATTTT--CTCTTTGAGAAA---GGG--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAC-CCTGTAG------CC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--AG---T----A-T-T---G-T-----TA-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----TA--C-CT---A---ATAG-A--T---------G-CAAT-AAAA
gi|104127 : TATCGG-AAAATATGT-ACATT--TA-A--AT-GTG-ATTTT--CTCTTTGGGGAA---AGC--TG---TAACTAATGTTATTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--G----A--TA--T--AG--T--TG---T----A-T-T---G-T-----TA-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----TA--T-AT---A---ATAG-A--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104128 : TCGG-TACACATAT-ACATTCATA-A--AG-CTG----------CACTGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--GC----ATATGT--TA--T-A------TATTTGT-TATCATCTTA--TG--TTCAT--T--TG---T----A-T-------T-----TA-T----T-----G--A----TAC--A--TG-T-G-----------TA----TA--T-GT---A---ACAT-A--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104129 : AAAT-TG--ACATT--TA-A--AT-GAG-AAATT--CTTTTTGGGAA--------------------ATGTTGTTAAAA-CATTTAGTTCGACCT-TT---TTTTGC----A----C--TA----------------------------A---A--C--AT--T--TG---T----A-T-----A-T-----TAAT----T-----A--T----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----TA--T-AT---A---ATAG-A--T---------G-CAAT-ACGATA---TCAAACTA
gi|104130 : T-ACATA--TA-ACGACAGTG-GTTTT--CATTTTGAGGAG---GGC--TA---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCGACCG-AT---TT--AC----A----C--TC--T-A------TA------TA--A--------A--T--AT--T--TG---TTTC-A-T-T---G-A-----TA-T----T-----
gi|104131 : T--TG-A--AT-ATG-----T--CGCACTGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTCTAGTTCAATAC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------TT------T-----------TA--T--AT--T--T----T----G-T-T---A-T-----CA-TTTTAT-----G--T----T-CATA--TG-T-ATATA-T-----TGATA-TA--T-GT---A---ACAT-A--C---------G-TAAT-AAAATATGTGTAAACTAA
gi|104132 : --AT-GTGCATTTTGACTCATTAGGGAG---GGC--TG---TAATTAATGTTGTTAACA-CTTGTAGACTGACCC-TT---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AC--T--CGT--T----A-T-T---G-G-----TG-TACA-A-----A--T----T-G--A--TG-T-----T-T-----TG----AA--C-ATGGAA---AAAT-T--T---------G-CAAT-AAAATATTATTA
gi|104133 : GGAG---AAC--TT---CAACTAATGTTGTTTTAA-CTTGTAGATCAATCCAATTTATT--AT----G----T--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA------------TG---T----A-T-T---A-T-----CA-T-------------G----T-G--A--TGTT-A---A-T-----TG----TC--T-GT---A---ATAT-A--TTAA------G-TAAT-AAAA-ATGTTTAAACTAA
gi|104134 : tatTGGCAAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTTGTTCAATCC-AT---TT--GCGTATG----T--TA--T-T------TA------TA--A----A--CA------------GG---T----A-G-T---A-T-----CA-T-------------G----T-G--A--TGTT-A---A-A-----TA----TC--T-GT---A---ATAT-A--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104135 : taGGAG---GGA--TG---TTGCTAATGGTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--C----A--TA--T--AA--T--TGTATT----A-T-T---A-T-----TA-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TT----TA--T-AT---A---ATAG-A--T---------G-CAAT-AAACTATTATTAA
gi|104136 : tGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTTAAA-CTTGTAGTCCGACCC-AT---TT--GC----A----C------T-A------TA------TA--A----T--TA--T--AA--T--TA---T----A-T-T---A-T-----TA-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----TA--T-AT---A---ATAG-A--T---------G-CAATAAAAATGTGATTAAACTAA
gi|104137 : GGAG---GGC--CT---TGACTGATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--G----------C--TA----A------TG------TG--A----A--T---T--AT--
gi|104138 : GGAG---GGC--CG---TAACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--GC----------------T-A------TG------TG--A----A--Ta
gi|104139 : GGAG---GGC--AG---TTACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGACCCAACCT-GT---TT--GC---------T--TA--TGA------TG------TG--A----A--T
gi|104140 : GGAG---GGC--CG---TAACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--
gi|104141 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATTC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------T--------A--TA--T--AT--T--TAGT-T----A-T-C---ATT-----TA-A----T-----G--T----T-C--ATTTG-T-ATATA-T-----TGATATTA--T-GT---A---ACAT-A--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104142 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-ATTGCAGTTCAATCC-AT---TT--GCGA--A----T--GA--T-A------TATT----TA--A----A--TA------------TG---T----A-T-T---A-T-----AA-T-------------G----T-G--A--TGTT-A---A-A-----TA----TC--T-GT---A---ACAT-A--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACT
gi|104143 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------TA--T----A--TA--T---T--T--TT---T----A-T-C---A-T-----T--T----T-----ATGT----T-C--ATTTG-T-AT--A-TATGGATA----TA--T-GT---A---ACAT-A--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTTAACTA
gi|104144 : GAG---AAC--TG---TAACTAATATTGTTATAA-CTTGTAGTACAATTC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------T--------A--TA--T--GT--T--TG---TTATCA-T-T-----T-----TA-TGTA-T-----A--T----T-T--G--TA-T-AT--A-T-----TGACA-TA--T-GT---A---ACAT-A--C---------G-AAAT-AAAATAGGTTTAAACTAA
gi|104145 : TAATGTTGTTAAAATCTTTTTGCACGACCG-AT---TT--GT----A----C--TT--A-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T---G---T----A-T-T---G-T-----T-----------------------C--A--TA-T-A---G-T-----TA----TA--T-AT---A---ATAG-A--T---------G-AAAT--AAATATTATTAAACTA
gi|104146 : ctttCTTATGTTGTAATAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC---------T--TA--T-G------T-------------------TA--T--GT--T--TG---T----AAT-T---G-TAGGAATGGT----T-----A--T---------A--TG-T-ATATG-T-----TA----TAAAC-AT---A---ATATTA--T---------G-CAAT-AAAATGTGATTAAACTAA
gi|104147 : taCTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TT--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----A---------------TA-T-----------------------A--TG-T-------------------TA---------------AA-A--G---------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104148 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----A-T----------------------------------------A--TA-T-A-----------TG----T------T---A---A-AA-A------------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTA
gi|104149 : CTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--GC----------------T-A------TG------TA--A----A--T
gi|104150 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TC---TT--GC---------T--TA--T-A------TATGTTTGTA--A----A--TATTT--ATAGT--TA---C----A-C-T---A-C-----TA-T----T--------T----T-A--A--TG-TAA---A-T-----TG----TA--CGAT--------TAT-A--A---------G-CAAT--AAATATGTTTAAACTAA
gi|104151 : CTAATGTTGGCAGAA-CTTGTGGACCAACCC-TC---TT--GC---------T--TA--T-ACGTGTTTG------TA--A----A--TAGTT--ATAGT--TA---T----A-C-T---A-C-----TA-T----T--------G----T-A--A--TG-T-A---A-T-----TG----TA--TGAT--------TAA-A--A---------A-CAAT--AAATATGTTTAAACTAA
gi|104152 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACTC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----A---------------TA-T-----------------------A--TG-T--------------------------T---A---A-AA-A------------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104153 : CTAACGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-AT---TT--G----------C--TAATT-A------TG------TA--A----A--T
gi|104154 : CTAATTTTGTTAGAA-CTTGTAGCCGAACCC-GT---TT--GC---------T--TAT-T-A------TG------TA--A----A--T
gi|104155 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----A-T----------------------------------------A--TG-T--------------------------T---A---A-AA-A------------G-CAAT-AAAGTATGTTTAAACTAA
gi|104156 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------T--------A--TA--C--A------TG---T----A-T----------------------------------------A--TA-T-A-----------TA----TA--T-AT-------ACAA-A--T---------GCCAAG-AAGATAT
gi|104157 : TAATGTTGGCAGAA-CTTGTAGCCCAACCC-TC---TT--G-----A----T--TA--T-GTGTT--TG------TA--A----A--TATTT--ATAGT--TA---T----A-C-T---A-C-----TG-T----T--------G----T-A--A--TA-T-A---A-T-----TG----TA--TGAC---A---ATAA--------------G-CAAT--AAATATGTTTAAACT
gi|104158 : GTTGTTTAAA-CTTGTAGCCCGACCC-AT---TT--GC----A----T--TT--T-A------T
gi|104159 : -AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AC--T--TG---T----A-A-T---G-T-----TA-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-A---A-T-----TG----TA--T-AT---A---ATAG-A--T---------G-AAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104160 : --A----A--CA--T--AA--T--TG---T----A-T-T---G-T-----TA-T----T-----A--T----T-C--A--TG-T-A---A-T-----CG----TA--A-AT---A---ATGG-A--T---------G-CAAT-AAAATTTTATTAAACT
Alignments
lowQualScore : 111111111111 2222222222222222222
lowQualScore : 22 1 2 2 22 1 3 77 44444 111 11 111 1 1 0 0 222 11 666666666666 11 0 444444 7777777 44444444 11 33 11 555 11 555 4444 7777777777777 0 0 0000000000000000000 22 5 77777 0 33333 6666 11 2 111 111 0 11 777777777777 1 1 22
lowQualScore : .. . . . .. . . .. ..... ... .. ... . . . . ... .. ............ .. . ...... ....... ........ .. .. .. ... .. ... .... ............. . . ................... .. . ..... . ..... .... .. . ... ... . .. ............ . . ..
lowQualScore : 66 4 2 0 66 9 8 11 88888 999 55 999 4 0 8 8 222 11 111111111111 99 8 777777 4444444 00000000 99 66 22 444 22 444 3333 6666666666666 9 9 2222222222222222222 55 5 22222 9 22222 4444 22 7 666 666 3 99 999999999999 0 0 66
consensus : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAG---GGC--TG---TNGCTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-NA--T---------G-CAAT-AAAATATGNTTAAACTAA
Reference ( family-471 ) : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAG---GGC--TG---TNGCTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-NA--T---------G-CAAT-AAAATATGNTTAAACTAA
gi|104108 : TGTGATTACATGTAAAATATCGG-AAAATGTGT-ACAATTA-T--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TCTGGGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----C--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACCAA
gi|104109 : aaTGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATATT--CTC-----TTTGGGGAA---GAC--TT---TTGCTTATGTTGTAAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--AT----A----A--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----A--------T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---AAA-GG--T---------G-CAAT-AAAATAGTATTTAACTAA
gi|104110 : aaTGTGATTACACGTAAAGTATCGG-AAAAGATGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTTGGGAG---GTC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCT-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--G----A--TA--T--AA--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--G--TG-T-A---G-T-----TG----T--AT-AT---A---TTA-
gi|104111 : aaGTGAAATATGGG-GAAATGTGT-TCATTTA-A--AT-GTG-ATTAT--CTC-----TTTGGGGAG---ACT--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCACACCC-AT---TT--GT----G----C--TA--T-A------TA------AA--A----AA-TA--A--AT--T---G---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-T---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CTAT-GAACTATTATTAAAC
gi|104112 : aatgtgttccTGTTATTACATTTCA--TTTCGG-------TAT-ACAT----A--AT-GTA-ATGGT--ATTGACGATATGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATGA-CTTGTGGTTCAATCA-AT---TT--GC----G----C---A--T-GT-----TA------TA--A----AATTA--T--AT--A--TG---T----AT-C---G-T-----T-A-T-------------G-TG--A--TGTT-A---A-T-----TA----T--CT-GT---A---ACA-TA--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTTAACTAA
gi|104113 : aaTGGAAAG---ACC--TG---TATCTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATGC-AT---TT--GCGTATG----T--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA------------TG---C----AT-T---A-T-----C-A-T-------------G-TG--A--TGTT-C---A-T-----TA----T--CT-GC---A---ACA-TA--A---------G-TAAT-GAAATATGTTTAAACTAA
gi|104114 : aatgttattacatttcattccagtatacgtaatatattgatattgatgataTATTAAAA-CCTATAGCTTGAACC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A-------------------------------------------------------------------------A---A-T-----TG----T--AT--C---A---GT--GA--T---------G-CAAT-AAAATATGATTAAACTAA
gi|104115 : aatgtgaaataaaattatacatatatgaaaaatgttgcaatgttattgtttttgttttttaaatattcttaagTGTGATTACATGTATAATATCGT-TAAACGTGT-ACTTTTA-A--AT-GTT-ATTTT--CTC-----TTTAGGGAG---GGT--TG---ATGCTAATGTTGGTATAA-CTTGTAGTCCGACCC-ATA--TT----------------TA--C-A------TA------TA--C----A--TT--T--AA--T--TG---A----AT-T---A-T-----T-T-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-T---A-T-----TA----T--AT-AT---A---ATA-CA--T---------A-AAAT-AAAATAT
gi|104116 : aATTTG-T--AT-GTGCATTTTGACGC-----ATTAGGGAG---GGC--TG---TACCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAAACCAACCA-TT---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AT--T--CGT--T----AT-T---G-G-----T-G-T----TAAAA-A--T-TG--A--TG-T-----T-T-----TGAA--C--AT-AT---A---AAA-TT--T---------T-CAAT-AAAATATTATTGAATTAAtaataga
gi|104117 : atgtgtttgtttgtatataaaaaatatcgtcactttaTTGGGGAA---GGC--TG---TAACTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGTCCAACCC--T---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AT--T--CGT--T----AT-TGGGG-C-----T-A-CA---A-----A--T-TG--A--TG-T-----T-T-----TG----A--AC-AT---G---TCA-AATTT---------G-CAAT-AAAATATTACTAAATTAA
gi|104118 : atatgtttgtttgtatatcaaaaatatcgtcactttaatttgtatgtgcattatgaagcaTGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAATTGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----ACTGGGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTCAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--A-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104119 : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-TAATTGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----ATTGGG--------C--TG---TTGCTAATGTTGTCAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--A-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--TT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104120 : GTGATAACATGTAAAGTATCAG-AAAACATGT-ACATTTA-A--AT-GTG-GTTTT--CTC-----TTTAAGGAA---GAC--AG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTGGCCAGACCA-AT---TT--GA----A----CTATA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----AT-T---A-T-----T-A-T----T-----A--G-TC--A--TG-T-A---A-------TA----T--AT-AT---A---
gi|104121 : TGATGATATGTAAAATATCGG-GAAA-GTGTTGCACTAA-A--AT-GTG-ATTTT--CTT-----TTTGGTGAG---GAC--TGACCATGCTACTGTTGATAAAA-CTTGTGACTCGACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------CAGT----TG--A----A--TT--T--AC--A--TA---T----ATAT---G-------T-A-T----TCAAGAA--C-TT--A--TA-T-A---A-TC----TC----T--GT-AT---A---ATA-AG--T-----------CATT-GATATATt
gi|104121 : ----C--TG--T-A------TAA-----TA--A----G--T---C--AT--TGATA---T----AT-T---G-T-------A-T----T-----A--G-TC--A--AG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-AA--T---------G-TATT-AAAATGTCATTGAACTAtgtattagtcaagtaattgtatataataaatgtattaaaatgtcattgaacta
gi|104122 : tgatgatatgtaaaatatcgggaaagtgttgcactaaaatgtgattttctttttggtgaggactgaccatgctactgttgataaaacttgtgactcgacccatttgcactatacagttgaatttacatatatatgtattcaagaacttatataatctTGATTACATGTCAAGTATTGGAAAAATGTGT-ACATTAACA--AT-GTG-ATTTT--AAT-----TTTCGGAAGACTAGCAGTG---TGGTTAA
gi|104123 : GATAATATGTAAAGTTTATG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTTT-CTC-----ATTCTGAAG---GAA--TG---TTGTTAATTTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AA---TT--TC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----TT-T---G-T-----T-A-TTA--T-----A--T-TC--A--TG-C-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---CTA-GT--T---------G-CAAT-AGAATATTATCAAACTAA
gi|104124 : ATTACCTGTACAGTATCGG-GAAA---AT-ACATT-A-A--AT-GTG-ATTTT--CGT-----TTTGGGCAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTATAGCTCGACCC-AT---TT--GA----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--AA------------TG---C----AT-T--------------------------------------TG-C-A---A-T-----T---------------------TA-AA--T---------G-CAAT-AAACTATTATAAAACTAA
gi|104125 : ATT-CATATAAA--AACGT-AAACTGTGT-GTATTAT-A--AT--TA-AT----------------GGAGAG---AAA--TG---TAGCTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--G-------------TA--T-A------TG------T---T----A--TA--T--AT--T--TG---------T-T---A-T-----T-A-T----T--------T-TT--A--TGTT-A---ATT-----TG----T--AT-AT---ATTGATA-AA--TGTAACATTCG-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104126 : ATGTAAAGTATCGG-AAAATGAAT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGAGAAA---GGG--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAC-CCTGTAG------CC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--AG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AC-CT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAA
gi|104127 : TATCGG-AAAATATGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAA---AGC--TG---TAACTAATGTTATTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--G----A--TA--T--AG--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104128 : TGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--GC----ATATGT--TA--T-A------TATTTGT-TATCATCTTA--TG--TTCAT--T--TG---T----AT-------T-----T-A-T----TG----A--T-AC--A--TG-T-G-----------TA----T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104129 : tcggtacacatatacattcataaagctgcacAAAT-TG--ACATTTA-A--AT-GAG-AAATT--CTT-----TTTGGGAA--------------------ATGTTGTTAAAA-CATTTAGTTCGACCT-TT---TTTTGC----A----C--TA----------------------------A---A--C--AT--T--TG---T----AT-----A-T-----T-AAT----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-ACGATA---TCAAACTA
gi|104130 : T-ACATATA-ACGACAGTG-GTTTT--CAT-----TTTGAGGAG---GGC--TA---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCGACCG-AT---TT--AC----A----C--TC--T-A------TA------TA--A--------A--T--AT--T--TG---TTTC-AT-T---G-A-----T-A-T----T-----
gi|104131 : TTG-A--AT-ATG-----T--CGC-----ACTGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTCTAGTTCAATAC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------TT------T-----------TA--T--AT--T--T----T----GT-T---A-T-----C-A-TTTTAT-----G--T-TCATA--TG-T-ATATA-T-----TGATA-T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTGTAAACTAA
gi|104132 : --AT-GTGCATTTTGACTC-----ATTAGGGAG---GGC--TG---TAATTAATGTTGTTAACA-CTTGTAGACTGACCC-TT---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AC--T--CGT--T----AT-T---G-G-----T-G-TACA-A-----A--T-TG--A--TG-T-----T-T-----TG----A--AC-ATGGAA---AAA-TT--T---------G-CAAT-AAAATATTATTA
gi|104133 : GGAG---AAC--TT---CAACTAATGTTGTTTTAA-CTTGTAGATCAATCCAATTTATT--AT----G----T--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA------------TG---T----AT-T---A-T-----C-A-T-------------G-TG--A--TGTT-A---A-T-----TG----T--CT-GT---A---ATA-TA--TTAA------G-TAAT-AAAA-ATGTTTAAACTAA
gi|104134 : tatTGGCAAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTTGTTCAATCC-AT---TT--GCGTATG----T--TA--T-T------TA------TA--A----A--CA------------GG---T----A------G-------T-A-T----C-----A--TGTG--A--TGTT-A---A-A-----TA----T--CT-GT---A---ATA-TA--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104135 : taGGAG---GGA--TG---TTGCTAATGGTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--C----A--TA--T--AA--T--TGTATT----AT-T---A-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TT----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAACTATTATTAA
gi|104136 : tGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTTAAA-CTTGTAGTCCGACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA----------A----T--TA--T--AA--T--TA---T----AT-T---A-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAATAAAAATGTGATTAAACTAA
gi|104137 : GGAG---GGC--CT---TGACTGATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--G----------C--TA----A------TG------TG--A----A--T---T--AT--
gi|104138 : GGAG---GGC--CG---TAACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--GC----------------T-A------TG------TG--A----A--Ta
gi|104139 : GGAG---GGC--AG---TTACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGACCCAACCT-GT---TT--GC---------T--TA--TGA------TG------TG--A----A--T
gi|104140 : GGAG---GGC--CG---TAACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--
gi|104141 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATTC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------T--------A--TA--T--AT--T--TAGT-T----AT-C---ATT-----T-A-A----T-----G--T-TC--ATTTG-T-ATATA-T-----TGATATT--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104142 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-ATTGCAGTTCAATCC-AT---TT--GCGA--A----T--GA--T-A------TATT----TA--A----A--TA------------TG---T----AT-T---A-T-----A-A-T-------------G-TG--A--TGTT-A---A-A-----TA----T--CT-GT---A---ACA-TA--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACT
gi|104143 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------TA--T----A--TA--T---T--T--TT---T----AT-C---A-T-----T---T----T-----ATGT-TC--ATTTG-T-AT--A-TATGGATA----T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTTAACTA
gi|104144 : GAG---AAC--TG---TAACTAATATTGTTATAA-CTTGTAGTACAATTC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------T--------A--TA--T--GT--T--TG---TTATCAT-T-----T-----T-A-TGTA-T-----A--T-TT--G--TA-T-AT--A-T-----TGACA-T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-AAAT-AAAATAGGTTTAAACTAA
gi|104145 : TAATGTTGTTAAAATCTTTTTGCACGACCG-AT---TT--GT----A----C--TT--A-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T---G---T----AT-T---G-T-----T--------------------C--A--TA-T-A---G-T-----TA----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-AAAT--AAATATTATTAAACTA
gi|104146 : ctttCTTATGTTGTAATAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC---------T--TA--T-G------T-------------------TA--T--GT--T--TG---TA---AT-T---G-TAGGAATGG-T----T-----A--T-----A--TG-T-ATATG-T-----TA----TAAAC-AT---A---ATATTA--T---------G-CAAT-AAAATGTGATTAAACTAA
gi|104147 : taCTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TT--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----A--------------T-A-T-------------------A--TG-T-------------------T--A-------------A-AA--G---------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104148 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----AT-------------------------------------A--TA-T-A-----------TG----T------T---A---A-A-AA------------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTA
gi|104149 : CTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--GC----------------T-A------TG------TA--A----A--T
gi|104150 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TC---TT--GC---------T--TA--T-A------TATGTTTGTA--A----A--TATTT--ATAGT--TA---C----AC-T---A-C-----T-A-T----T--------T-TA--A--TG-TAA---A-T-----TG----T--ACGAT--------TA-TA--A---------G-CAAT--AAATATGTTTAAACTAA
gi|104151 : CTAATGTTGGCAGAA-CTTGTGGACCAACCC-TC---TT--GC---------T--TA--T-ACGTGTTTG------TA--A----A--TAGTT--ATAGT--TA---T----AC-T---A-C-----T-A-T----T-----G----TA--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--ATGAT--------TA-AA--A---------A-CAAT--AAATATGTTTAAACTAA
gi|104152 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACTC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----A--------------T-A-T-------------------A--TG-T--------------------------T---A---A-A-AA------------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104153 : CTAACGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-AT---TT--G----------C--TAATT-A------TG------TA--A----A--T
gi|104154 : CTAATTTTGTTAGAA-CTTGTAGCCGAACCC-GT---TT--GC---------T--TAT-T-A------TG------TA--A----A--T
gi|104155 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----AT-------------------------------------A--TG-T--------------------------T---A---A-A-AA------------G-CAAT-AAAGTATGTTTAAACTAA
gi|104156 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------T--------A--TA--C--A------TG---T----AT-------------------------------------A--TA-T-A-----------TA----T--AT-AT-------ACA-AA--T---------GCCAAG-AAGATAT
gi|104157 : TAATGTTGGCAGAA-CTTGTAGCCCAACCC-TC---TT--G-----A----T--TA--T-GTGTT--TG------TA--A----A--TATTT--ATAGT--TA---T----AC-T---A-C-----T-G-T----T-----G----TA--A--TA-T-A---A-T-----TG----T--ATGAC---A---ATA-A-------------G-CAAT--AAATATGTTTAAACT
gi|104158 : GTTGTTTAAA-CTTGTAGCCCGACCC-AT---TT--GC----A----T--TT--T-A------T
gi|104159 : -AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AC--T--TG---T----AA-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-AAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104160 : --A----A--CA--T--AA--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----CG----T--AA-AT---A---ATG-GA--T---------G-CAAT-AAAATTTTATTAAACT
Alignments
lowQualScore : 111111111111 2222222222222222222
lowQualScore : 22 1 2 2 22 1 3 77 44444 111 11 111 1 1 0 0 222 11 666666666666 11 0 444444 7777777 44444444 11 33 11 555 11 555 4444 7777777777777 0 0 0000000000000000000 22 5 77777 0 33333 6666 11 2 111 111 0 11 777777777777 1 1 22
lowQualScore : .. . . . .. . . .. ..... ... .. ... . . . . ... .. ............ .. . ...... ....... ........ .. .. .. ... .. ... .... ............. . . ................... .. . ..... . ..... .... .. . ... ... . .. ............ . . ..
lowQualScore : 66 4 2 0 66 9 8 11 88888 999 55 999 4 0 8 8 222 11 111111111111 99 8 777777 4444444 00000000 99 66 22 444 22 444 3333 6666666666666 9 9 2222222222222222222 55 5 22222 9 22222 4444 22 7 666 666 3 99 999999999999 0 0 66
consensus : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAG---GGC--TG---TNGCTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-NA--T---------G-CAAT-AAAATATGNTTAAACTAA
Reference ( family-471 ) : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAG---GGC--TG---TNGCTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-NA--T---------G-CAAT-AAAATATGNTTAAACTAA
gi|104108 : TGTGATTACATGTAAAATATCGG-AAAATGTGT-ACAATTA-T--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TCTGGGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----C--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACCAA
gi|104109 : aaTGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATATT--CTC-----TTTGGGGAA---GAC--TT---TTGCTTATGTTGTAAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--AT----A----A--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----A--------T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---AAA-GG--T---------G-CAAT-AAAATAGTATTTAACTAA
gi|104110 : aaTGTGATTACACGTAAAGTATCGG-AAAAGATGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTTGGGAG---GTC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCT-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--G----A--TA--T--AA--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--G--TG-T-A---G-T-----TG----T--AT-AT---A---TTA-
gi|104111 : aaGTGAAATATGGG-GAAATGTGT-TCATTTA-A--AT-GTG-ATTAT--CTC-----TTTGGGGAG---ACT--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCACACCC-AT---TT--GT----G----C--TA--T-A------TA------AA--A----AA-TA--A--AT--T---G---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-T---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CTAT-GAACTATTATTAAAC
gi|104112 : aatgtgttccTGTTATTACATTTCA--TTTCGG-------TAT-ACAT----A--AT-GTA-ATGGT--ATTGACGATATGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATGA-CTTGTGGTTCAATCA-AT---TT--GC----G----C---A--T-GT-----TA------TA--A----AATTA--T--AT--A--TG---T----AT-C---G-T-----T-A-T-------------G-TG--A--TGTT-A---A-T-----TA----T--CT-GT---A---ACA-TA--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTTAACTAA
gi|104113 : aaTGGAAAG---ACC--TG---TATCTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATGC-AT---TT--GCGTATG----T--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA------------TG---C----AT-T---A-T-----C-A-T-------------G-TG--A--TGTT-C---A-T-----TA----T--CT-GC---A---ACA-TA--A---------G-TAAT-GAAATATGTTTAAACTAA
gi|104114 : aatgttattacatttcattccagtatacgtaatatattgatattgatgataTATTAAAA-CCTATAGCTTGAACC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A-------------------------------------------------------------------------A---A-T-----TG----T--AT--C---A---GT--GA--T---------G-CAAT-AAAATATGATTAAACTAA
gi|104115 : aatgtgaaataaaattatacatatatgaaaaatgttgcaatgttattgtttttgttttttaaatattcttaagTGTGATTACATGTATAATATCGT-TAAACGTGT-ACTTTTA-A--AT-GTT-ATTTT--CTC-----TTTAGGGAG---GGT--TG---ATGCTAATGTTGGTATAA-CTTGTAGTCCGACCC-ATA--TT----------------TA--C-A------TA------TA--C----A--TT--T--AA--T--TG---A----AT-T---A-T-----T-T-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-T---A-T-----TA----T--AT-AT---A---ATA-CA--T---------A-AAAT-AAAATAT
gi|104116 : aATTTG-T--AT-GTGCATTTTGACGC-----ATTAGGGAG---GGC--TG---TACCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAAACCAACCA-TT---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AT--T--CGT--T----AT-T---G-G-----T-G-T----TAAAA-A--T-TG--A--TG-T-----T-T-----TGAA--C--AT-AT---A---AAA-TT--T---------T-CAAT-AAAATATTATTGAATTAAtaataga
gi|104117 : atgtgtttgtttgtatataaaaaatatcgtcactttaTTGGGGAA---GGC--TG---TAACTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGTCCAACCC--T---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AT--T--CGT--T----AT-TGGGG-C-----T-A-CA---A-----A--T-TG--A--TG-T-----T-T-----TG----A--AC-AT---G---TCA-AATTT---------G-CAAT-AAAATATTACTAAATTAA
gi|104118 : atatgtttgtttgtatatcaaaaatatcgtcactttaatttgtatgtgcattatgaagcaTGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAATTGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----ACTGGGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTCAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--A-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104119 : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-TAATTGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----ATTGGG--------C--TG---TTGCTAATGTTGTCAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--A-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--TT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104120 : GTGATAACATGTAAAGTATCAG-AAAACATGT-ACATTTA-A--AT-GTG-GTTTT--CTC-----TTTAAGGAA---GAC--AG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTGGCCAGACCA-AT---TT--GA----A----CTATA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----AT-T---A-T-----T-A-T----T-----A--G-TC--A--TG-T-A---A-------TA----T--AT-AT---A---
gi|104121 : TGATGATATGTAAAATATCGG-GAAA-GTGTTGCACTAA-A--AT-GTG-ATTTT--CTT-----TTTGGTGAG---GAC--TGACCATGCTACTGTTGATAAAA-CTTGTGACTCGACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------CAGT----TG--A----A--TT--T--AC--A--TA---T----ATAT---G-------T-A-T----TCAAGAA--C-TT--A--TA-T-A---A-TC----TC----T--GT-AT---A---ATA-AG--T-----------CATT-GATATATt
gi|104121 : ----C--TG--T-A------TAA-----TA--A----G--T---C--AT--TGATA---T----AT-T---G-T-------A-T----T-----A--G-TC--A--AG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-AA--T---------G-TATT-AAAATGTCATTGAACTAtgtattagtcaagtaattgtatataataaatgtattaaaatgtcattgaacta
gi|104122 : tgatgatatgtaaaatatcgggaaagtgttgcactaaaatgtgattttctttttggtgaggactgaccatgctactgttgataaaacttgtgactcgacccatttgcactatacagttgaatttacatatatatgtattcaagaacttatataatctTGATTACATGTCAAGTATTGGAAAAATGTGT-ACATTAACA--AT-GTG-ATTTT--AAT-----TTTCGGAAGACTAGCAGTG---TGGTTAA
gi|104123 : GATAATATGTAAAGTTTATG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTTT-CTC-----ATTCTGAAG---GAA--TG---TTGTTAATTTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AA---TT--TC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----TT-T---G-T-----T-A-TTA--T-----A--T-TC--A--TG-C-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---CTA-GT--T---------G-CAAT-AGAATATTATCAAACTAA
gi|104124 : ATTACCTGTACAGTATCGG-GAAA---AT-ACATT-A-A--AT-GTG-ATTTT--CGT-----TTTGGGCAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTATAGCTCGACCC-AT---TT--GA----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--AA------------TG---C----AT-T--------------------------------------TG-C-A---A-T-----T---------------------TA-AA--T---------G-CAAT-AAACTATTATAAAACTAA
gi|104125 : ATT-CATATAAA--AACGT-AAACTGTGT-GTATTAT-A--AT--TA-AT----------------GGAGAG---AAA--TG---TAGCTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--G-------------TA--T-A------TG------T---T----A--TA--T--AT--T--TG---------T-T---A-T-----T-A-T----T--------T-TT--A--TGTT-A---ATT-----TG----T--AT-AT---ATTGATA-AA--TGTAACATTCG-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104126 : ATGTAAAGTATCGG-AAAATGAAT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGAGAAA---GGG--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAC-CCTGTAG------CC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--AG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AC-CT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAA
gi|104127 : TATCGG-AAAATATGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAA---AGC--TG---TAACTAATGTTATTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--G----A--TA--T--AG--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104128 : TGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--GC----ATATGT--TA--T-A------TATTTGT-TATCATCTTA--TG--TTCAT--T--TG---T----AT-------T-----T-A-T----TG----A--T-AC--A--TG-T-G-----------TA----T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104129 : tcggtacacatatacattcataaagctgcacAAAT-TG--ACATTTA-A--AT-GAG-AAATT--CTT-----TTTGGGAA--------------------ATGTTGTTAAAA-CATTTAGTTCGACCT-TT---TTTTGC----A----C--TA----------------------------A---A--C--AT--T--TG---T----AT-----A-T-----T-AAT----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-ACGATA---TCAAACTA
gi|104130 : T-ACATATA-ACGACAGTG-GTTTT--CAT-----TTTGAGGAG---GGC--TA---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCGACCG-AT---TT--AC----A----C--TC--T-A------TA------TA--A--------A--T--AT--T--TG---TTTC-AT-T---G-A-----T-A-T----T-----
gi|104131 : TTG-A--AT-ATG-----T--CGC-----ACTGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTCTAGTTCAATAC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------TT------T-----------TA--T--AT--T--T----T----GT-T---A-T-----C-A-TTTTAT-----G--T-TCATA--TG-T-ATATA-T-----TGATA-T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTGTAAACTAA
gi|104132 : --AT-GTGCATTTTGACTC-----ATTAGGGAG---GGC--TG---TAATTAATGTTGTTAACA-CTTGTAGACTGACCC-TT---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AC--T--CGT--T----AT-T---G-G-----T-G-TACA-A-----A--T-TG--A--TG-T-----T-T-----TG----A--AC-ATGGAA---AAA-TT--T---------G-CAAT-AAAATATTATTA
gi|104133 : GGAG---AAC--TT---CAACTAATGTTGTTTTAA-CTTGTAGATCAATCCAATTTATT--AT----G----T--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA------------TG---T----AT-T---A-T-----C-A-T-------------G-TG--A--TGTT-A---A-T-----TG----T--CT-GT---A---ATA-TA--TTAA------G-TAAT-AAAA-ATGTTTAAACTAA
gi|104134 : tatTGGCAAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTTGTTCAATCC-AT---TT--GCGTATG----T--TA--T-T------TA------TA--A----A--CA------------GG---T----A------G-------T-A-T----C-----A--TGTG--A--TGTT-A---A-A-----TA----T--CT-GT---A---ATA-TA--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104135 : taGGAG---GGA--TG---TTGCTAATGGTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--C----A--TA--T--AA--T--TGTATT----AT-T---A-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TT----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAACTATTATTAA
gi|104136 : tGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTTAAA-CTTGTAGTCCGACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA----------A----T--TA--T--AA--T--TA---T----AT-T---A-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAATAAAAATGTGATTAAACTAA
gi|104137 : GGAG---GGC--CT---TGACTGATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--G----------C--TA----A------TG------TG--A----A--T---T--AT--
gi|104138 : GGAG---GGC--CG---TAACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--GC----------------T-A------TG------TG--A----A--Ta
gi|104139 : GGAG---GGC--AG---TTACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGACCCAACCT-GT---TT--GC---------T--TA--TGA------TG------TG--A----A--T
gi|104140 : GGAG---GGC--CG---TAACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--
gi|104141 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATTC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------T--------A--TA--T--AT--T--TAGT-T----AT-C---ATT-----T-A-A----T-----G--T-TC--ATTTG-T-ATATA-T-----TGATATT--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104142 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-ATTGCAGTTCAATCC-AT---TT--GCGA--A----T--GA--T-A------TATT----TA--A----A--TA------------TG---T----AT-T---A-T-----A-A-T-------------G-TG--A--TGTT-A---A-A-----TA----T--CT-GT---A---ACA-TA--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACT
gi|104143 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------TA--T----A--TA--T---T--T--TT---T----AT-C---A-T-----T---T----T-----ATGT-TC--ATTTG-T-AT--A-TATGGATA----T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTTAACTA
gi|104144 : GAG---AAC--TG---TAACTAATATTGTTATAA-CTTGTAGTACAATTC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------T--------A--TA--T--GT--T--TG---TTATCAT-T-----T-----T-A-TGTA-T-----A--T-TT--G--TA-T-AT--A-T-----TGACA-T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-AAAT-AAAATAGGTTTAAACTAA
gi|104145 : TAATGTTGTTAAAATCTTTTTGCACGACCG-AT---TT--GT----A----C--TT--A-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T---G---T----AT-T---G-T-----T--------------------C--A--TA-T-A---G-T-----TA----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-AAAT--AAATATTATTAAACTA
gi|104146 : ctttCTTATGTTGTAATAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC---------T--TA--T-G------T-------------------TA--T--GT--T--TG---TA---AT-T---G-TAGGAATGG-T----T-----A--T-----A--TG-T-ATATG-T-----TA----TAAAC-AT---A---ATATTA--T---------G-CAAT-AAAATGTGATTAAACTAA
gi|104147 : taCTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TT--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----A--------------T-A-T-------------------A--TG-T-------------------T--A-------------A-AA--G---------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104148 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----AT-------------------------------------A--TA-T-A-----------TG----T------T---A---A-A-AA------------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTA
gi|104149 : CTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--GC----------------T-A------TG------TA--A----A--T
gi|104150 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TC---TT--GC---------T--TA--T-A------TATGTTTGTA--A----A--TATTT--ATAGT--TA---C----AC-T---A-C-----T-A-T----T--------T-TA--A--TG-TAA---A-T-----TG----T--ACGAT--------TA-TA--A---------G-CAAT--AAATATGTTTAAACTAA
gi|104151 : CTAATGTTGGCAGAA-CTTGTGGACCAACCC-TC---TT--GC---------T--TA--T-ACGTGTTTG------TA--A----A--TAGTT--ATAGT--TA---T----AC-T---A-C-----T-A-T----T-----G----TA--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--ATGAT--------TA-AA--A---------A-CAAT--AAATATGTTTAAACTAA
gi|104152 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACTC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----A--------------T-A-T-------------------A--TG-T--------------------------T---A---A-A-AA------------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104153 : CTAACGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-AT---TT--G----------C--TAATT-A------TG------TA--A----A--T
gi|104154 : CTAATTTTGTTAGAA-CTTGTAGCCGAACCC-GT---TT--GC---------T--TAT-T-A------TG------TA--A----A--T
gi|104155 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----AT-------------------------------------A--TG-T--------------------------T---A---A-A-AA------------G-CAAT-AAAGTATGTTTAAACTAA
gi|104156 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------T--------A--TA--C--A------TG---T----AT-------------------------------------A--TA-T-A-----------TA----T--AT-AT-------ACA-AA--T---------GCCAAG-AAGATAT
gi|104157 : TAATGTTGGCAGAA-CTTGTAGCCCAACCC-TC---TT--G-----A----T--TA--T-GTGTT--TG------TA--A----A--TATTT--ATAGT--TA---T----AC-T---A-C-----T-G-T----T-----G----TA--A--TA-T-A---A-T-----TG----T--ATGAC---A---ATA-A-------------G-CAAT--AAATATGTTTAAACT
gi|104158 : GTTGTTTAAA-CTTGTAGCCCGACCC-AT---TT--GC----A----T--TT--T-A------T
gi|104159 : -AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AC--T--TG---T----AA-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-AAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104160 : --A----A--CA--T--AA--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----CG----T--AA-AT---A---ATG-GA--T---------G-CAAT-AAAATTTTATTAAACT
blockSeqs : AA T T C CG A C GA GACGA ACT AG ACC T A TTA TT GTATGT AT CGTGTT ATGTTTG ATCATCTT AT TT TC TAG GA TAT TATC TGTAGGAA TTTATGTTCAT TT T ATAT ATGGA ATAT AA G GGA TTG TT TGTAACATTC TA
blockSeqs : A G . . . . C GA . . . . T A A . ATATGT T TGTT ATTTGT AA A GT . TAG . GT TTC TGGGGC TCAAGAACTT TT T ATAT C ATA . G . . G TTAA TA
blockSeqs : A T . . . . . T . . . . T A . . GTATGT . T AGT AG . TT . TAG . T A CATT TAAAAATTG . T ATAT . ACA . G . . G TTT GT
blockSeqs : G C . . . . . . . . . . A T . . ACTA . . ATT AA . . . A . T . TGT ACAAATTG . T AT . AA . . . . T T GT
blockSeqs : T T . . . . . . . . . . A T . . GAAT . . AA AA . . . A . T . TGT GTATATTT . T AT . . . . . . T T GA
blockSeqs : A T . . . . . . . . . . T A . . AA . . A AA . . . T . . . CGT TATATTC . T AA . . . . . . G A TA
blockSeqs : T C . . . . . . . . . . A T . . AC . . A AA . . . T . . . TAT TATGTTC . . A . . . . . . C A TA
blockSeqs : A T . . . . . . . . . . A A . . GC . . A AC . . . A . . . TAT AAATTG . . A . . . . . . T T TA
blockSeqs : G T . . . . . . . . . . T A . . GC . . A AA . . . T . . . TGG TGATAC . . T . . . . . . A T TA
blockSeqs : A T . . . . . . . . . . T A . . AC . . A AA . . . T . . . TGT CATGTG . . A . . . . . . G T CA
blockSeqs : G T . . . . . . . . . . T A . . AT . . A AA . . . T . . . TGT TATTC . . C . . . . . . G T TA
blockSeqs : A T . . . . . . . . . . T A . . AT . . A GA . . . T . . . TAT TATTC . . A . . . . . . A T TA
blockSeqs : A T . . . . . . . . . . G A . . AC . . A AA . . . A . . . ATG TATTC . . T . . . . . . A T GT
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . T A . . AC . . A AA . . . C . . . TGT TATTC . . A . . . . . . G T TA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T A . . AC . . A AA . . . T . . . TGT TAATC . . A . . . . . . A T GT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A T . . AC . . A AA . . . A . . . TAT TAATC . . A . . . . . . A T GT
blockSeqs : . . . . . . . . . . T A . . AC . . A AG . . . T . . . TGT TAGTC . . A . . . . . . G T TA
blockSeqs : . . . . . . . . . A A . . AC . . G AA . . . A . . . TGT TAGTC . . A . . . . . . G T GT
blockSeqs : . . . . . . . . . A T . . AC . . A AA . . . G . . . TGA TATTC . . A . . . . . . T C GT
blockSeqs : . . . . . . . . T A . . AC . . A AA . . . T . . . TAT TATTC . . A . . . . . . G T TA
blockSeqs : . . . A A . . AC . . A AC . . . T . . . TGG TATTC . . A . . . . . . T C GA
blockSeqs : . . . A T . . AT . . T GA . . . T . . . TAT TATTC . . A . . . . . . T T GT
blockSeqs : . . . A A . . GT . . A GA . . . T . . . TAT TATTC . . A . . . . . . T A GT
blockSeqs : . . . A T . . AC . . A GA . . . C . . . TAT TGTTC . . G . . . . . . T T GT
blockSeqs : . . . T T . . AC . . A AA . . . A . . . TAT TATTC . . A . . . . . . G T GT
blockSeqs : . . . T A . . AC . . A AT . . . A . . . CAT TATTC . . A . . . . . . G C TA
blockSeqs : . . . G A . . AT . . G AA . . . T . . . TGT TTTT . . A . . . . . . T A GA
blockSeqs : . . . A G . . AT . . G TT . . . T . . . TAC TTTA . . A . . . . . . T C GT
blockSeqs : . . . T G . . AC . . G GT . . . T . . . TAC TGTA . . A . . . . . . T C GT
blockSeqs : . . . A G . . A . . A AA . . . T . . . TAC TGTA . . A . . . . . . T T GT
blockSeqs : . . . A G . . C . . A AA . . . T . . . TGT GTG . . A . . . . . . G T GT
blockSeqs : . . . A T . . T . . A AA . . . T . . . TGT GTG . . A . . . . . . A G GT
blockSeqs : . . . A T . . A . . G GT . . . T . . . AT GTG . . A . . . . . . A A GT
blockSeqs : . . . A T . . A . . G AA . . . T . . . TT GTG . . A . . . . . . T A GT
blockSeqs : . . . . T . . A . . A AA . . . T . . . T TAT . . A . . . . . . A T TA
blockSeqs : A . . T . . G GT . . . T . . . T C . . A . . . . . . A T TA
blockSeqs : T . . T . . G AA . . . C . . . T . . . A . . . . . . A T .
blockSeqs : G . . T . . A AA . . . A . . . G . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : G . . T . . A T . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : G . . T . . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : G . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . T . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAG---GGC--TG---TNGCTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-NA--T---------G-CAAT-AAAATATGNTTAAACTAA
finalCons : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAG---GGC--TG---TNGCTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-NA--T---------G-CAAT-AAAATATGNTTAAACTAA
Alignments
lowQualScore : 111111111111 2222222222222222222
lowQualScore : 22 1 2 2 22 1 3 77 44444 111 11 111 1 1 0 0 222 11 666666666666 11 0 444444 7777777 44444444 11 33 11 555 11 555 4444 7777777777777 0 0 0000000000000000000 22 5 77777 0 33333 6666 11 2 111 111 0 11 777777777777 1 1 22
lowQualScore : .. . . . .. . . .. ..... ... .. ... . . . . ... .. ............ .. . ...... ....... ........ .. .. .. ... .. ... .... ............. . . ................... .. . ..... . ..... .... .. . ... ... . .. ............ . . ..
lowQualScore : 66 4 2 0 66 9 8 11 88888 999 55 999 4 0 8 8 222 11 111111111111 99 8 777777 4444444 00000000 99 66 22 444 22 444 3333 6666666666666 9 9 2222222222222222222 55 5 22222 9 22222 4444 22 7 666 666 3 99 999999999999 0 0 66
consensus : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAG---GGC--TG---TNGCTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-NA--T---------G-CAAT-AAAATATGNTTAAACTAA
Reference ( family-471 ) : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAG---GGC--TG---TNGCTAATGTTGTTANAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-NA--T---------G-CAAT-AAAATATGNTTAAACTAA
gi|104108 : TGTGATTACATGTAAAATATCGG-AAAATGTGT-ACAATTA-T--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TCTGGGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----C--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACCAA
gi|104109 : aaTGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATATT--CTC-----TTTGGGGAA---GAC--TT---TTGCTTATGTTGTAAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--AT----A----A--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----A--------T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---AAA-GG--T---------G-CAAT-AAAATAGTATTTAACTAA
gi|104110 : aaTGTGATTACACGTAAAGTATCGG-AAAAGATGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTTGGGAG---GTC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCT-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--G----A--TA--T--AA--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--G--TG-T-A---G-T-----TG----T--AT-AT---A---TTA-
gi|104111 : aaGTGAAATATGGG-GAAATGTGT-TCATTTA-A--AT-GTG-ATTAT--CTC-----TTTGGGGAG---ACT--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCACACCC-AT---TT--GT----G----C--TA--T-A------TA------AA--A----AA-TA--A--AT--T---G---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-T---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CTAT-GAACTATTATTAAAC
gi|104112 : aatgtgttccTGTTATTACATTTCA--TTTCGG-------TAT-ACAT----A--AT-GTA-ATGGT--ATTGACGATATGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATGA-CTTGTGGTTCAATCA-AT---TT--GC----G----C---A--T-GT-----TA------TA--A----AATTA--T--AT--A--TG---T----AT-C---G-T-----T-A-T-------------G-TG--A--TGTT-A---A-T-----TA----T--CT-GT---A---ACA-TA--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTTAACTAA
gi|104113 : aaTGGAAAG---ACC--TG---TATCTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATGC-AT---TT--GCGTATG----T--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA------------TG---C----AT-T---A-T-----C-A-T-------------G-TG--A--TGTT-C---A-T-----TA----T--CT-GC---A---ACA-TA--A---------G-TAAT-GAAATATGTTTAAACTAA
gi|104114 : aatgttattacatttcattccagtatacgtaatatattgatattgatgataTATTAAAA-CCTATAGCTTGAACC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A-------------------------------------------------------------------------A---A-T-----TG----T--AT--C---A---GT--GA--T---------G-CAAT-AAAATATGATTAAACTAA
gi|104115 : aatgtgaaataaaattatacatatatgaaaaatgttgcaatgttattgtttttgttttttaaatattcttaagTGTGATTACATGTATAATATCGT-TAAACGTGT-ACTTTTA-A--AT-GTT-ATTTT--CTC-----TTTAGGGAG---GGT--TG---ATGCTAATGTTGGTATAA-CTTGTAGTCCGACCC-ATA--TT----------------TA--C-A------TA------TA--C----A--TT--T--AA--T--TG---A----AT-T---A-T-----T-T-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-T---A-T-----TA----T--AT-AT---A---ATA-CA--T---------A-AAAT-AAAATAT
gi|104116 : aATTTG-T--AT-GTGCATTTTGACGC-----ATTAGGGAG---GGC--TG---TACCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAAACCAACCA-TT---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AT--T--CGT--T----AT-T---G-G-----T-G-T----TAAAA-A--T-TG--A--TG-T-----T-T-----TGAA--C--AT-AT---A---AAA-TT--T---------T-CAAT-AAAATATTATTGAATTAAtaataga
gi|104117 : atgtgtttgtttgtatataaaaaatatcgtcactttaTTGGGGAA---GGC--TG---TAACTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGTCCAACCC--T---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AT--T--CGT--T----AT-TGGGG-C-----T-A-CA---A-----A--T-TG--A--TG-T-----T-T-----TG----A--AC-AT---G---TCA-AATTT---------G-CAAT-AAAATATTACTAAATTAA
gi|104118 : atatgtttgtttgtatatcaaaaatatcgtcactttaatttgtatgtgcattatgaagcaTGTGATTACATGTAAAGTATCGG-AAATTGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----ACTGGGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTCAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--A-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104119 : TGTGATTACATGTAAAGTATCGG-TAATTGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----ATTGGG--------C--TG---TTGCTAATGTTGTCAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--A-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--TT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104120 : GTGATAACATGTAAAGTATCAG-AAAACATGT-ACATTTA-A--AT-GTG-GTTTT--CTC-----TTTAAGGAA---GAC--AG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTGGCCAGACCA-AT---TT--GA----A----CTATA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----AT-T---A-T-----T-A-T----T-----A--G-TC--A--TG-T-A---A-------TA----T--AT-AT---A---
gi|104121 : TGATGATATGTAAAATATCGG-GAAA-GTGTTGCACTAA-A--AT-GTG-ATTTT--CTT-----TTTGGTGAG---GAC--TGACCATGCTACTGTTGATAAAA-CTTGTGACTCGACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------CAGT----TG--A----A--TT--T--AC--A--TA---T----ATAT---G-------T-A-T----TCAAGAA--C-TT--A--TA-T-A---A-TC----TC----T--GT-AT---A---ATA-AG--T-----------CATT-GATATATt
gi|104121 : ----C--TG--T-A------TAA-----TA--A----G--T---C--AT--TGATA---T----AT-T---G-T-------A-T----T-----A--G-TC--A--AG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-AA--T---------G-TATT-AAAATGTCATTGAACTAtgtattagtcaagtaattgtatataataaatgtattaaaatgtcattgaacta
gi|104122 : tgatgatatgtaaaatatcgggaaagtgttgcactaaaatgtgattttctttttggtgaggactgaccatgctactgttgataaaacttgtgactcgacccatttgcactatacagttgaatttacatatatatgtattcaagaacttatataatctTGATTACATGTCAAGTATTGGAAAAATGTGT-ACATTAACA--AT-GTG-ATTTT--AAT-----TTTCGGAAGACTAGCAGTG---TGGTTAA
gi|104123 : GATAATATGTAAAGTTTATG-AAAATGTGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTTT-CTC-----ATTCTGAAG---GAA--TG---TTGTTAATTTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AA---TT--TC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--TG---T----TT-T---G-T-----T-A-TTA--T-----A--T-TC--A--TG-C-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---CTA-GT--T---------G-CAAT-AGAATATTATCAAACTAA
gi|104124 : ATTACCTGTACAGTATCGG-GAAA---AT-ACATT-A-A--AT-GTG-ATTTT--CGT-----TTTGGGCAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTATAGCTCGACCC-AT---TT--GA----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--AA------------TG---C----AT-T--------------------------------------TG-C-A---A-T-----T---------------------TA-AA--T---------G-CAAT-AAACTATTATAAAACTAA
gi|104125 : ATT-CATATAAA--AACGT-AAACTGTGT-GTATTAT-A--AT--TA-AT----------------GGAGAG---AAA--TG---TAGCTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--G-------------TA--T-A------TG------T---T----A--TA--T--AT--T--TG---------T-T---A-T-----T-A-T----T--------T-TT--A--TGTT-A---ATT-----TG----T--AT-AT---ATTGATA-AA--TGTAACATTCG-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104126 : ATGTAAAGTATCGG-AAAATGAAT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGAGAAA---GGG--TG---TTGCTAATGTTGTTAAAC-CCTGTAG------CC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AA--T--AG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AC-CT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAA
gi|104127 : TATCGG-AAAATATGT-ACATTTA-A--AT-GTG-ATTTT--CTC-----TTTGGGGAA---AGC--TG---TAACTAATGTTATTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--G----A--TA--T--AG--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104128 : TGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--GC----ATATGT--TA--T-A------TATTTGT-TATCATCTTA--TG--TTCAT--T--TG---T----AT-------T-----T-A-T----TG----A--T-AC--A--TG-T-G-----------TA----T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104129 : tcggtacacatatacattcataaagctgcacAAAT-TG--ACATTTA-A--AT-GAG-AAATT--CTT-----TTTGGGAA--------------------ATGTTGTTAAAA-CATTTAGTTCGACCT-TT---TTTTGC----A----C--TA----------------------------A---A--C--AT--T--TG---T----AT-----A-T-----T-AAT----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-ACGATA---TCAAACTA
gi|104130 : T-ACATATA-ACGACAGTG-GTTTT--CAT-----TTTGAGGAG---GGC--TA---TTGCTAATGTTGTTAAAA-CTTGTAGCCCGACCG-AT---TT--AC----A----C--TC--T-A------TA------TA--A--------A--T--AT--T--TG---TTTC-AT-T---G-A-----T-A-T----T-----
gi|104131 : TTG-A--AT-ATG-----T--CGC-----ACTGGAGAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTCTAGTTCAATAC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------TT------T-----------TA--T--AT--T--T----T----GT-T---A-T-----C-A-TTTTAT-----G--T-TCATA--TG-T-ATATA-T-----TGATA-T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTGTAAACTAA
gi|104132 : --AT-GTGCATTTTGACTC-----ATTAGGGAG---GGC--TG---TAATTAATGTTGTTAACA-CTTGTAGACTGACCC-TT---TT--GC----A----T--T---T--------------------------------T--AC--T--CGT--T----AT-T---G-G-----T-G-TACA-A-----A--T-TG--A--TG-T-----T-T-----TG----A--AC-ATGGAA---AAA-TT--T---------G-CAAT-AAAATATTATTA
gi|104133 : GGAG---AAC--TT---CAACTAATGTTGTTTTAA-CTTGTAGATCAATCCAATTTATT--AT----G----T--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA------------TG---T----AT-T---A-T-----C-A-T-------------G-TG--A--TGTT-A---A-T-----TG----T--CT-GT---A---ATA-TA--TTAA------G-TAAT-AAAA-ATGTTTAAACTAA
gi|104134 : tatTGGCAAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTTGTTCAATCC-AT---TT--GCGTATG----T--TA--T-T------TA------TA--A----A--CA------------GG---T----A------G-------T-A-T----C-----A--TGTG--A--TGTT-A---A-A-----TA----T--CT-GT---A---ATA-TA--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104135 : taGGAG---GGA--TG---TTGCTAATGGTGTTAAAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--C----A--TA--T--AA--T--TGTATT----AT-T---A-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TT----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAAT-AAACTATTATTAA
gi|104136 : tGGAG---GGC--TG---TTGCTAATGTTGTTTAAA-CTTGTAGTCCGACCC-AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA----------A----T--TA--T--AA--T--TA---T----AT-T---A-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-CAATAAAAATGTGATTAAACTAA
gi|104137 : GGAG---GGC--CT---TGACTGATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--G----------C--TA----A------TG------TG--A----A--T---T--AT--
gi|104138 : GGAG---GGC--CG---TAACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--GC----------------T-A------TG------TG--A----A--Ta
gi|104139 : GGAG---GGC--AG---TTACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGACCCAACCT-GT---TT--GC---------T--TA--TGA------TG------TG--A----A--T
gi|104140 : GGAG---GGC--CG---TAACTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--
gi|104141 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATTC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------T--------A--TA--T--AT--T--TAGT-T----AT-C---ATT-----T-A-A----T-----G--T-TC--ATTTG-T-ATATA-T-----TGATATT--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104142 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-ATTGCAGTTCAATCC-AT---TT--GCGA--A----T--GA--T-A------TATT----TA--A----A--TA------------TG---T----AT-T---A-T-----A-A-T-------------G-TG--A--TGTT-A---A-A-----TA----T--CT-GT---A---ACA-TA--A---------G-TAAT-AAAATATGTTTAAACT
gi|104143 : GAG---AAC--TG---TAACTAATGTTGTTATAA-CTTGTAGTTCAATCC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------TA--T----A--TA--T---T--T--TT---T----AT-C---A-T-----T---T----T-----ATGT-TC--ATTTG-T-AT--A-TATGGATA----T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-TAAT-AAAATATGTTTTAACTA
gi|104144 : GAG---AAC--TG---TAACTAATATTGTTATAA-CTTGTAGTACAATTC-AT---TT--GC----A-------TA--T-G------T-------T--------A--TA--T--GT--T--TG---TTATCAT-T-----T-----T-A-TGTA-T-----A--T-TT--G--TA-T-AT--A-T-----TGACA-T--AT-GT---A---ACA-TA--C---------G-AAAT-AAAATAGGTTTAAACTAA
gi|104145 : TAATGTTGTTAAAATCTTTTTGCACGACCG-AT---TT--GT----A----C--TT--A-A------TA------TA--A----A--TA--T--AT--T---G---T----AT-T---G-T-----T--------------------C--A--TA-T-A---G-T-----TA----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-AAAT--AAATATTATTAAACTA
gi|104146 : ctttCTTATGTTGTAATAA-CTTGTAGCCCAACCC-AT---TT--GC---------T--TA--T-G------T-------------------TA--T--GT--T--TG---TA---AT-T---G-TAGGAATGG-T----T-----A--T-----A--TG-T-ATATG-T-----TA----TAAAC-AT---A---ATATTA--T---------G-CAAT-AAAATGTGATTAAACTAA
gi|104147 : taCTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TT--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----A--------------T-A-T-------------------A--TG-T-------------------T--A-------------A-AA--G---------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104148 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----AT-------------------------------------A--TA-T-A-----------TG----T------T---A---A-A-AA------------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTA
gi|104149 : CTAATGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-GT---TT--GC----------------T-A------TG------TA--A----A--T
gi|104150 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TC---TT--GC---------T--TA--T-A------TATGTTTGTA--A----A--TATTT--ATAGT--TA---C----AC-T---A-C-----T-A-T----T--------T-TA--A--TG-TAA---A-T-----TG----T--ACGAT--------TA-TA--A---------G-CAAT--AAATATGTTTAAACTAA
gi|104151 : CTAATGTTGGCAGAA-CTTGTGGACCAACCC-TC---TT--GC---------T--TA--T-ACGTGTTTG------TA--A----A--TAGTT--ATAGT--TA---T----AC-T---A-C-----T-A-T----T-----G----TA--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--ATGAT--------TA-AA--A---------A-CAAT--AAATATGTTTAAACTAA
gi|104152 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACTC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----A--------------T-A-T-------------------A--TG-T--------------------------T---A---A-A-AA------------G-CAAT-AAAATATGTTTAAACTAA
gi|104153 : CTAACGTTGCTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-AT---TT--G----------C--TAATT-A------TG------TA--A----A--T
gi|104154 : CTAATTTTGTTAGAA-CTTGTAGCCGAACCC-GT---TT--GC---------T--TAT-T-A------TG------TA--A----A--T
gi|104155 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------TG--T----A--TA--T--AT--A--TA---T----AT-------------------------------------A--TG-T--------------------------T---A---A-A-AA------------G-CAAT-AAAGTATGTTTAAACTAA
gi|104156 : CTAATGTTGGTAGAA-CTTGTGGCCCAACCC-TT---TT--GC---------T--TA--T-A------TA------T--------A--TA--C--A------TG---T----AT-------------------------------------A--TA-T-A-----------TA----T--AT-AT-------ACA-AA--T---------GCCAAG-AAGATAT
gi|104157 : TAATGTTGGCAGAA-CTTGTAGCCCAACCC-TC---TT--G-----A----T--TA--T-GTGTT--TG------TA--A----A--TATTT--ATAGT--TA---T----AC-T---A-C-----T-G-T----T-----G----TA--A--TA-T-A---A-T-----TG----T--ATGAC---A---ATA-A-------------G-CAAT--AAATATGTTTAAACT
gi|104158 : GTTGTTTAAA-CTTGTAGCCCGACCC-AT---TT--GC----A----T--TT--T-A------T
gi|104159 : -AT---TT--GC----A----C--TA--T-A------TA------TA--A----A--TA--T--AC--T--TG---T----AA-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----TG----T--AT-AT---A---ATA-GA--T---------G-AAAT-AAAATATTATTAAACTAA
gi|104160 : --A----A--CA--T--AA--T--TG---T----AT-T---G-T-----T-A-T----T-----A--T-TC--A--TG-T-A---A-T-----CG----T--AA-AT---A---ATG-GA--T---------G-CAAT-AAAATTTTATTAAACT