lowQualScore                  :                               1                                                                                                                                                                                                    111111111                                                             1                                                                     1                  
lowQualScore                  :                               6  333 0 3   33333333 0 1  66 1          1   33   5   33       9         555555    22  7      333               0  2       22        3333  222          222    55555555       1                      666666666               33333            1  1 1 33333    4         1  4    1    2222 22    0  44  11  9                  333    1           1           22     
lowQualScore                  :                               .  ... . .   ........ . .  .. .          .   ..   .   ..       .         ......    ..  .      ...               .  .       ..        ....  ...          ...    ........       .                      .........               .....            .  . . .....    .         .  .    .    .... ..    .  ..  ..  .                  ...    .           .           ..     
lowQualScore                  :                               6  555 9 5   44444444 4 0  88 5          5   66   2   88       8         000000    44  4      000               8  0       44        4444  888          777    66666666       3                      222222222               44444            3  7 3 33333    0         2  2    3    7777 55    5  55  88  9                  777    4           3           22     
consensus                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAT---T-TNATA--------AAA-TCC-A-TATTTATGCA-AGTA-CATCGCT--ATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGT--GCATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATGCATACATGG-TT-----AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTTG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAA----TC-ATTTCCCT-GT--AAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
Reference ( gi|134607 )       : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACATAT---T-TAATA--------AAA-TCT-A-TATTTATGCA-AGTG-CATAGCT--ATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTAGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGT--ATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACATGA-TA-----AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCG-A-----CAGACAAATATGTG-AATAATA-ACAA----TC-ATTTTCCC-GT--AACACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCATG
gi|134608                     : TACCAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAT---T-TAATA--------AAA-TCT-A-TATTTATGCA-AGTG-CATAGCT--ATATTTTTCACAACTTA------ATTA--TTGGTGTAT---TTGTCATAGATGTACGGTGTTTTAGT--ATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATGGCAACATACATACATGA-TA-----AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCG-A-----CAGACAAATGTGTG-TATAATA-ACAA----TC-ATTTTCCC-GT--AACACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCAT
gi|134610                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAT---T-TAATA--------AAA-TCT-T-TATTTATGCA-AGTG-CATAGCT--ATATTTTTCACAACTTA------AATA--CTGATGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTGTTTTTGT--ATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATATATGA-TA-----AGTGCCGCAGCTCAA-----AATTTTGAACAA-TTTG-A-----CAGACAAATATGTG-AGTAATA-ACAA----TC-ATTTTCCC-GT--AACACTCGCGATAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACAGCATCAATGTGT--GCATG
gi|134614                     : TACAAGGGGTTATCCAGAAGTTCTTGGACAAGT---T-TAATA--------AAA-TCT-A-TATTTATGCA-AGTG-CATAGCT--ATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCAT-GATGTACGGTGTTTTAGT--TTATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATG--------TTGTGGTATCCATAACAACATACAAACATGA-TA-----AGTGCCGCAGCTCAA-----TATGTTGAAAAA-TTTG-A-----CAGACAAATATGTG-AATAATA-ACAA----TC-ATTTTCCC-GT--AACACTCGCGGTAAATCATAC---ATTA-ATGAGGACACGGCATCAATATCT--ACATG
gi|134612                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCATGGACACAT---T-TAATA--------AAA-TCC-A-TATTTATGCA-AGTA-CATAGCT--ATATTTTTCACAACTTA------GGTA--CTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGT--ATATTTCG----TA---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATTCATAGCAACAAACATATATGA-TT-----AGTGCCACAGCTCAA-----AATGTTGAACAA--ACG-A-----CAGTTAAATATGTG-AAAAATA-ACAA----TC-ATTTCCCT-GC--AAAACCCACGGTGTATAATAT---ATTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134618                     : TAGGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGACAAAT---T-TAATA--------AAAATCC-A-TATTTATGCA-AGTA-CATAGCT--ATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGT--ATATTTCA----TA---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATGCATGA-AT-----AGTTCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCG-A-----CA----------------AATA-ACAA----TCAATTTTCCC-AT--AACACTCGCAGTGAATCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134617                     : TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAATT---T-TAATA--------AAA-TCC-A-TATTTATACA-GGCA-CATCGTT--ATATTTT-CACAACTTA------ATTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTGCGGTGTTTTAGT--ATATTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGAAACATATATACAAGA-AT-----ATTGCCACACCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAA----TC-ATTTTCCT-GT--AACGCTCGCGGTGAAGCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--ACATG
gi|134619                     : TACGAGTGGTTATCAAAAAGTTCATGGACAACT---T-TGATA--------AAA-TCC-A-TATTCATGCA-AGTA-CATCGCC--ATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTTAGT--GCATTTCT----TA---TATTAATAAT---AATG--------TTACGGTCTCCATAGCAACATGCATGCATGG-TT-----AGTGCCACAGCTCAA-----ATTGTTGAACAA-TTTG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAA----TG-ATTTCCAT-GT--AAAACTCACGGTAAATCATAT---ATTATTTGATGACAAGTCATCAATGTCT--ACAT
gi|134621                     : TACGAGGTGTTATCCAGAAGTTTGTGGACAAAT---T-TATTA--------AAA-TCC-A-TATTTATGCA-AGTA-CATGGCT--ATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTAAGT--ACATTTTT----TA---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGG-TT-----AGTGCCGCA-----------------GAACAATTTTG-A-----CTGATAAATATGTG-AAAAATA-ACTA----TG-ATTTTCCT-GT--AAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGATGACACGTCATCAATGTCA--GCAT
gi|134623                     : TACGACGGGTTATCCAGAAGTTCGTAGACAAAT---T-TGATA--------AAA-TCC-A-TATTCATGCA-AGTA-CATAGCT--GTATTTGGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTTTAT---TTGTTGTCGATGTACAGTATTTTAAT--GCATTTGT----TA---TGTTAATAAT---AATG--------ATATGGTCTCCTTAAC-ACATGCATACATGT-TT-----AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACCA-TTTG-A-----CAGATAAATATTTG-AAAAATA-ACAA----TG-ATTTCCCT-GT--AAAACTCGTGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--ATAT
gi|134625                     : TACGAGGGGTTATCCGGAAGTTCATGGATA-ATG--T-TAATA--------AAA-TCC-A-TATTTATGCA-AGTA-AATAGCT--GTATTTTCCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCAT-GATGTACGGTTTTTTAGT--ATA--------------------TAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACAGAA-CT-----AGTGCCGCAGCTTCA-----AATGTTTGACAA-TTCG-A-----CAGATAATCATGTG-AAAAATA-ACAA----TC-CTTTTCCT--T--AATACTCGAGGTGAAGCATAT---ATTA-TTGAGAACACATCATCAATGTCT--GCATG
gi|134624                     : TACGAGGGGTGTTCCAGAAGTTTGTGGACAAAT---T-TAATA--------AAA-TCC-A-TATTCATGCA-AGTA-TATCGCT--ATATTTTGCACAGCTGA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATTGATGTACAGTACTTTAGT--GCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAGCATGCATACATGG-TT-----AGTGCCGCAGTTCAA-----ATTGTTAAACAA-TTTG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAA----CG-AATTTCCT-GT--AAAACTTGCCGTAAATCATAT---ATTA-TTGA
gi|134627                     : TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGACAAAC---T-CAATACATTTGTTAAA-TCC-A-TATTCAT------TA-TATCGCT--ATATTTTGCACAGTTTC------AGAA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTTAGT--GCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGT-TA-----AGTGCCGCAGCTCAA-----AGCGTTGATCAG-CTTG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-AC------TG-ATTTCC-----------CTCGTGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACATCATCAATGTCtgcgtgtcat
gi|134628                     : TATGAGGGGTTATCCAGAAGTCTGTGGACAAAT---T-TAATA--------AAA-TCC-A-TATTTA-------TG-CA-AGT---------------AC------------A--TTGGTGTAT---TTTCTATCAATGTGCGGTGTTTTAGT--ATATTT-------A---TATCAGTAAA---AATG--------TTATAGTATTCATTGCAACATACATACACAA-TT-----AGTCCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAG-CTCG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAA----TA-ATTTTCCT-GT--AAATCTCACGTTAAAACATAT---ATTA-TTGAGAACATGTCATCAATGTCT--GCA
gi|134630                     : TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGACAAAT---T-TATTC--------ATA-TCC-A-TATAAATGCA-AATA-CATTGCT--ATATTTT------------------------GGCGTAT---TTGTCTTCGATTTACAGTTTTTTAAT--GCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCGTAGCACAATGCACACATGT-TA-----AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTTG-A-----CTGATAAATATGTG-AAACATA-ACAC----TG-ATTTCCCT-GT--AAAACTC-TAGTAAGTCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--GCAT
gi|134631                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTTCACAAAT---T-TAATA--------AAA-TCC-A-TATTTATGCA-AGTA-CATCACT--ATATTTTGCTCAACATA------AGTA--TTGGTTTATTCATCATCATCAATGTACAGTAACTTAGT--GCATTTCT----TA---TGTCAACAAT---AATGTTAAGGACTTATGGTATCCATAGCAACATGCATGTATGG-TT-----AGTGCACCAGCTCAA-----AATGTTGAGCAA-TTTG-A-----CAGATAAATATTTG-AAAGATA-ACAT----TC-ATTTGCCT-GT--A----------TAA--CATATC--AATA-TTAAGGACACGCCATCAATGTCT--GCA
gi|134632                     : TACGAGGGGTTATCAAGAAGTTTGTGGACAAAT---A-AAATA--------AAA-TCC-T-TAATTATGCA-AGTG-C--AGCTCCATATTTTGCACAACTGA------AGTG--TTGGTGTA----TTGTCATCGGTGTACAATATTTTAGT--GTATTTCTAAAGCA---TGTCAGTACT---AATT--------TTATGGTA--------ACCATGCATACATGT-TT-----AGTGCTTCAGTTC-A-----TATGTTGAACAA-TTTG-A-----CAGATCAGTATGTG-AAAAATA-ACAA----TA-GTTTCCAT-GT--AA-ACTCGCAGTAAATC-TAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAAAGACT--GCAT
gi|134634                     : TACGGCGGGTTATGCAAAAGTTTTTGAACAAAT---T-TAATA--------ACA-TTA-A-TGATTATGCA-AGTA-CATCACT--AT-TTTTTTACATCTTACATGTAAGTA--TTTGTGTAT---TTGACATCGATATCCAATTTTCTAGT--GCATTTGT----TA---CGTCAGTAAT---ACTG--------TTATGGTATCCATAGCAACTTGCATACATGG-TT-----AATGCCGCAGTTAAA-----ATTGTTGAACAA-TTTG-A-----CAAGTAAAT-----------TA-ACAA----TC-GTTTCCAT-GT--AAAACTTGCAGTTATTCATATATAATTA-TTGATGACATGTCAT
gi|134636                     : TACAAAAGGTTATCCAGAAGTTTGTAAACACAT---T-TCATA--------AAA-TTT-A-TAT------A-AGTA-CATCGCT--ATATTTGGCAAAGCTTT------AGTG--CTG----AT---TTATTGTTGATAGCCGGTTTCTTATT--GCATTTCT----TACTATGTCAGTAAT---CATG--------TTATGGTTTCCATAGCAATATGCATACTTGGTTACCGGTAGTGCTGCAGCTCAA-----AATGTTTAACAG-TTTG-A-----CAGGTGAGAATGTG-AA
gi|134629                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGACATAT---C-TCATA--------ATA-Ta
gi|134638                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAT---C-T-CCA--------AAA-TTC-ACTATGTATGTACAGAG-TATA
gi|134637                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAT---C-TCATA--------ATA-T
gi|134620                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAT---C-TCATA--------ATA-T
gi|134635                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-------------A--------AAA-TCTCA-TA-TTATGAA-CATGACATGTCTG-ATATATTT
gi|134609                     : TACGAGGGGTTATCCAGATGTTCGTGGACAAAT---T-TCATA--------ATA-T
gi|134639                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACGAAT---G-CTATA--------AAA-T
gi|134613                     : TGCGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAT---C-TCATA--------ATA-T
gi|134611                     : TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGAACAAATCTCT-TAATA--------
gi|134622                     : TACGAGGGGTTATCCTGAAGTTCGTGGACAAAT---C-TCATA--------ATA-T
gi|134615                     : TACGAGGGGTTGTCCAGAAGTTCGTGGACTAAT---T-TCATA--------ATA-T
gi|134626                     : TACGAGGGGATATCCAGAAGTTCGTGGACAAAT---C-TCATA--------
gi|134640                     : TACGAGGGGTTATCAAGAGGTTCGTGGACAAAT---C-TCATA--------ATA-T
gi|134616                     : TACGAGGGGTAATCCAGAAGTTTGTGGACAAAT---C-TCATA--------ATA-T
gi|134641                     : TACTAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGACAAAT---C-TCATA--------
gi|134642                     : TACAAAGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGACAAAT---C-TCATA--------ATA-T
gi|134633                     : TACGAGGGGTTATCAAGAAGTTTGTGGACA-AT---TCTCATC--------AAA-T
gi|134644                     :  ACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGCCAAAT---T-TAATA--------AAA-TCC-A-TATTCATGCA-TGTA-CATCGCT--ATATTTTGCACAGCCTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCAATGTACAGTATTTTAGT--GCATTTCT----TA---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGG-TT-----AGTGCCGCAGCTCAA-----ATTGTTGCACAA-TTTG-A-----CAGATAAATATGTGAAAAAATA-ACAA----TT-ATTTCCCT-GT--AA-ACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGATGACACATCATAAATGTCT--ACAT
gi|134645                     :  ACGAGGGGTTATCCA-AAGTTTGTGAACAAAT---T-TAATA--------AAA-TCC-A-TATTTATGCA-AGTA-CATCGCT--ATAT
gi|134643                     :  ATGAGGGGTTATCCAGAAGTTGGTGGACAAAT---C-TCATA--------ATA-T
gi|134646                     :   CGAGGGGTGATCCAGAAGTTCATGGACAAAT---T-TAATA--------AAA-TCC-G-TATTCATGCA-AGAA-CATCGCT--ATATTTTGCACAGCTTA------AGAT--TTTGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGAATTTTAGC--GCATTTCA----TA---TGTAAATAAA---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGG-TT-----AGTGCCGCAGCTCAA-----AGTGTTGAACAA-TTTC-A-----CAGATAAATATTTG-GAAAATA-ACAA----TG-GTTTCCCT-GT--AAAACTCGCGGTAAATTATAT---ATTA-TTGATGACACGTCATCAATGTCA--ACAT
gi|134647                     :     AGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGACAAAT---G-TCATA--------AAA-T
gi|134648                     :           TATCCAGAAGTTCAT-GACAAAA---T-TAATA--------ATT-TC--A-TATTCATGCA-AATA-CATTGCT--ATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCCATGTATTGTACTTTAGTGCATTTTTTT----TA---TGTTAAAAAT---ATTG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGG-TT-----TGTGTTGCAGCTCAA-----AATGCTGAACAA-TTTG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATATAAAA----TA-ATTTCCCA-GT--AAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-CTGAGGACACATCAACAATGTCT--GCAT
gi|134649                     :                   AATTTGTGGACGGAT---C-TCATA--------AAA-TCA-A-CATTTATGTA-AATA-CACCGCT--ACTCTCTACACA
gi|134650                     :                         TGGACACATG--T-TAATA--------AG--TCC-A-AATTTATGTA-A-----ATCGCT--A--------AAAACTGA------GGTACTTTTGTGTCT---TCGATATC-ATGT-CAGTGTTTCACT--GTATTTCT----CA---CGCCAGTAAT---AATA--------TCATGGTATACAAAGAGGCATGCATTTATAG-GG-----AACGCCGCAGCTCAA-----AATATTGAAAAG-TTTA-A-----CAGGTAAACATACG-AATAA-A-ACAA----TC-GTTTCCCT-GT-------------TAAATTACAG---AAGA-TT---GTCCCGTCATCAATATCT--ACATtcgacattcttacagtaattataatgtcattgtatccatggcaacatgcatacatgggtagcagtttggtagtaaatatgtgaaaaatattaagtgtctccttgtacaacacctattattgacgatacgtcgtcattatctgcat
gi|134651                     :                                                                                               CACAACTTA------AGTA--TTGATGTAT---TTCTCACCGACATCCAGTATTTCATT--ACACTCCT----T-----GTCCGTAAT---GATA--------TTGTCATTTTAATAGCAATAAA---GC-TG----------GTGCCGCAGCTCAA-----AATGGTGAACAA-GGTA-AGGATGCAAAAAAAAACAAC-AA-AAAA-ACAA----TC-GTATCTCT-GT--AAAATTTACAATAAATCATTT---ATTA-TTAATGATACGTTATCAATGTCTTCGTATG
gi|134652                     :                                                                                                                                                               TTTCT----TA---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACAGGA-TT-----AGTGTCGCAGCTCAA-----AATGTTAAACAA-TTCG-A-----CAGATAAATATGTG-AAAAATA-ACAATAATTG-ATTTTCCCTGT--AACACTCGTGGTGAAGCCTAT---ATTA-TTGAGAACACGTCATCAATGTTT--GCATG
gi|134649                     :                                                                                                                                                                TTCT----TA------CAGTAATTATAATG--------TCATTGTATCCATGGCAACATGCATACATGG--------------GTAG-------------------CAG-TTTG-G-----TAG-TAAATATGTG-AAAAATA-TTAA----GT-GTCTCCTT-GTACAACACC--------------T---ATTA-TTGACGATACGTCGTCATTATCT--GCAT
gi|134653                     :                                                                                                                   aatttgtggacggatctcataaaatcaacatttatgtaaatacaccgctactctctacacatcgacaT---AATA--------TTATATTATCTATAGCAACATGCATACATGGGTG-----AGCACCGCAACTCAA-----AATAATGAAAAA-TTTGTA-----GAGTC-AACATGTG-AAAAATG-ATGA----GT-GTGTCCCT-AC--AAGATTCGCAGGAAATCATA
gi|134654                     :                                                                                                                                                                                                                 ATAGCAACATACGTACATGA-TT-----GATGCCGCAGCTCAAATCAAAATGTTGAACAA-TTTG-A-----GAGTTAAATATGTG-AAATATA-ACAA----TC-ATTTCCCT-GT--AAAACTCGCGGTGAATCATAT---GTTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134655                     :                                                                                                                                                                                                                                     -TA-----AGTGCTAAAGCTTAA-----AATGTTGAATAA-TTTG-A-----CAGGTAAGTATGCA-CA-AATA---AA----CG-AGTTCCCA-GT--AAAATTTGCGGTACCTCATAT---ATTA-GTAAAGGCACG
gi|134656                     :                                                                                                                                                                                                                                                          AA-----AGTGTTGAACAA-TTCG-A-----CAGTTAGATATGTG-AAATATA-ACAA----TC-ATTTCCCT-GT--AAAACTCGCTGTCAATGATAT---ATTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATt
gi|134657                     :                                                                                                                                                                                                                                                                       GATCAA-TTTG-A-----CA--TAAATATGTG-AAAAATA-ACAA----TC-ATTTCCTT-GT--AAATCTCATTGTAAATCATAT---ATTG-CTTAGGACGTGTCATCAATGTAT--GCAT
gi|134658                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACAAATTTGTG-AATAATA-ACAG----TC-ATTTTCCC-GT--AACACTCGCGGTAAATCATAT---ATAA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCATG
gi|134659                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TATGTG-AAAAATT-ACTA----TC-ATTTTCCC-GT--GAAACTCGCGGTATATCATAT---AT

lowQualScore                  :                                                                         0    0  1   33333333 0 1    1          222       2          4    1    444444    22                  222      0  1               3333 22 222          222       55555555    0                        444444 1               33333            1     33333    1          1       1     22 33333                              222    1                       22     
lowQualScore                  :                                                                         .    .  .   ........ . .    .          ...       .          .    .    ......    ..                  ...      .  .               .... .. ...          ...       ........    .                        ...... .               .....            .     .....    .          .       .     .. .....                              ...    .                       ..     
lowQualScore                  :                                                                         9    9  0   33333333 4 0    5          777       3          2    1    888888    33                  999      4  5               3333 11 777          666       44444444    9                        111111 4               33333            3     22222    2          2       2     11 11111                              333    3                       11     
consensus                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTNATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTATTTGTCATCG---ATGTACGGTGTTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
Reference ( family-470 )      :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTNATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTATTTGTCATCG---ATGTACGGTGTTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134607                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-ATAT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTAGTGTATTTGTCATCG---ATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-CAAATATGTG-AATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCATG
gi|134608                     :                                            TACCAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------ATTA--TTGGTGTATTTGTCATAG---ATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATGGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-CAAATGTGTG-TATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCAT
gi|134609                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGATGTTCGTGGAC-AAAT-TTCATA--------ATA-T
gi|134610                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCTT-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AATA--CTGATGTATTTGTCATCG---ATGTACAGTGTTTTTGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATATATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATTTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-CAAATATGTG-AGTAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGATAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACAGCATCAATGTGT--GCATG
gi|134611                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGAAC-AAAT-CTCTTA--------A
gi|134612                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCATGGAC-ACAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATAGCTATATTTTTCACAACTTA------GGTA--CTGGTGTATTTGTCATCG---ATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCG----T--A---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATTCATAGCAACAAACATATATGAT------T-AGTGCCACAGCTCAA-----AATGTTGAACAA--ACGA-----CAGT-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGCAAAACCCACGGTGTATAATAT---ATTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATGta
gi|134613                     :                                            TGCGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134614                     :                                            TACAAGGGGTTATCCAGAAGTTCTTGGAC-AAGT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTATTTGTCAT-G---ATGTACGGTGTTTTAGTTTATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATGTTG--------TGGTATCCATAACAACATACAAACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----TATGTTGAAAAA-TTTGA-----CAGA-CAAATATGTG-AATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAC---ATTA-ATGAGGACACGGCATCAATATCT--ACATG
gi|134615                     :                                            TACGAGGGGTTGTCCAGAAGTTCGTGGAC-TAAT-TTCATA--------ATA-T
gi|134616                     :                                            TACGAGGGGTAATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134617                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AATT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATACA---GGCACATCGTTATATTTT-CACAACTTA------ATTA--TTGGTGTATTTGTCATCG---ATGTGCGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGAAACATATATACAAGAA------T-ATTGCCACACCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATC-A-----TTTTCCTGTAACGCTCGCGGTGAAGCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--ACATG
gi|134618                     :                                            TAGGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAAATCCA-TATTTATGCA---AGTACATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTATTTGTCATCG---ATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCA----T--A---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATGCATGAA------T-AGTTCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGA-----C-----------------AAATA-ACAATCAA-----TTTTCCCATAACACTCGCAGTGAATCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134619                     :                                            TACGAGTGGTTATCAAAAAGTTCATGGAC-AACT-TTGATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTACATCGCCATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTATTTGTCATCG---ATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TATTAATAAT---AATGTTA--------CGGTCTCCATAGCAACATGCATGCATGGT------T-AGTGCCACAGCTCAA-----ATTGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATG-A-----TTTCCATGTAAAACTCACGGTAAATCATAT---ATTATTTGATGACAAGTCATCAATGTCT--ACAT
gi|134620                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134621                     :                                            TACGAGGTGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTATTA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATGGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTATTTGTCATCG---ATGTACAGTATTTAAGTACATTTTT----T--A---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCA-----------------GAACAATTTTGA-----CTGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACTATG-A-----TTTTCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGATGACACGTCATCAATGTCA--GCAT
gi|134622                     :                                            TACGAGGGGTTATCCTGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134623                     :                                            TACGACGGGTTATCCAGAAGTTCGTAGAC-AAAT-TTGATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTACATAGCTGTATTTGGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTTTATTTGTTGTCG---ATGTACAGTATTTTAATGCATTTGT----T--A---TGTTAATAAT---AATGATA--------TGGTCTCCTTAAC-ACATGCATACATGTT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACCA-TTTGA-----CAGA-TAAATATTTG-AAAAATA-ACAATG-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGTGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--ATAT
gi|134624                     :                                            TACGAGGGGTGTTCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTATATCGCTATATTTTGCACAGCTGA------AGTA--TTGGTGTATTTGTCATTG---ATGTACAGTACTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAGCATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGTTCAA-----ATTGTTAAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAACG-A-----ATTTCCTGTAAAACTTGCCGTAAATCATAT---ATTA-TTGATG-CGTGTCAT
gi|134625                     :                                            TACGAGGGGTTATCCGGAAGTTCATGGAT-AATG-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTAAATAGCTGTATTTTCCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTATTTGTCAT-G---ATGTACGGTTTTTTAGTATA----------------------TAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACAGAAC------T-AGTGCCGCAGCTTCA-----AATGTTTGACAA-TTCGA-----CAGA-TAATCATGTG-AAAAATA-ACAATC-C-----TTTTCCT-TAATACTCGAGGTGAAGCATAT---ATTA-TTGAGAACACATCATCAATGTCT--GCATG
gi|134626                     :                                            TACGAGGGGATATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------
gi|134627                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAC-TCAATACATTTGTTAAA-TCCA-TATTCAT--------TATATCGCTATATTTTGCACAGTTTC------AGAA--TTGGTGTATTTGTCATCG---ATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AGCGTTGATCAG-CTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-AC--TG-A-----TTTCC--------CTCGTGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACATCATCAATGTC
gi|134628                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTCTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACAT----------------------------------TGGTGTATTTTCTATCA---ATGTGCGGTGTTTTAGTATATTT---------A---TATCAGTAAA---AATGTTA--------TAGTATTCATTGCAACATACATACACAAT------T-AGTCCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAG-CTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATA-A-----TTTTCCTGTAAATCTCACGTTAAAACATAT---ATTA-TTGAGAACATGTCATCAATGTCT--GCA
gi|134629                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-ATAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134630                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTATTC--------ATA-TCCA-TATAAATGCA---AATACATTGCTATATT------------------------TTGGCGTATTTGTCTTCG---ATTTACAGTTTTTTAATGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCGTAGCACAATGCACACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTTGA-----CTGA-TAAATATGTG-AAACATA-ACACTG-A-----TTTCCCTGTAAAACTC-TAGTAAGTCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--GCAT
gi|134631                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTTCAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCACTATATTTTGCTCAACATA------AGTA--TTGGTTTATTCATCATCATCAATGTACAGTAACTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAACAAT---AATGTTAAGGACTTATGGTATCCATAGCAACATGCATGTATGGT------T-AGTGCACCAGCTCAA-----AATGTTGAGCAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATTTG-AAAGATA-ACATTC-A-----TTTGCCTGTATAAC-------ATATCA-AT---ATTA----AGGACACGCCATCAATGTCT--GCA
gi|134632                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-AAAATA--------AAA-TCCT-TAATTATGCA---AGTGCAGCTCCATATTTTGCACAACTGA------AGTG--TTGGTGTA-TTGTCATCG---GTGTACAATATTTTAGTGTATTTCTAAAGC--A---TGTCAGTACT---AATTTTA--------TGGTA--------ACCATGCATACATGTT------T-AGTGCTTCAGTTC-A-----TATGTTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TCAGTATGTG-AAAAATA-ACAATA-G-----TTTCCATGT-AAACTCGCAGTAAATC-TAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAAAGACT--GCAT
gi|134633                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAAGTTTGTGGAC-AATT-CTCATC--------AAA-T
gi|134634                     :                                            TACGGCGGGTTATGCAAAAGTTTTTGAAC-AAAT-TTAATA--------ACA-TTAA-TGATTATGCA---AGTACATCACTAT-TTTTTTACATCTTACATGTAAGTA--TTTGTGTATTTGACATCG---ATATCCAATTTTCTAGTGCATTTGT----T--A---CGTCAGTAAT---ACTGTTA--------TGGTATCCATAGCAACTTGCATACATGGT------T-AATGCCGCAGTTAAA-----ATTGTTGAACAA-TTTGA-----CAAG-TAAAT-----------TA-ACAATC-G-----TTTCCATGTAAAACTTGCAGTTATTCATATATAATTA-TTGATGACATGTCAT
gi|134635                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAAT-CTCATA--------
gi|134636                     :                                            TACAAAAGGTTATCCAGAAGTTTGTAAAC-ACAT-TTCATA--------AAA-TTTA-TAT------A---AGTACATCGCTATATTTGGCAAAGCTTT------AGTG--CTG----ATTTATTGTTG---ATAGCCGGTTTCTTATTGCATTTCT----T--ACTATGTCAGTAAT---CATGTTA--------TGGTTTCCATAGCAATATGCATACTTGGTTACCGGT-AGTGCTGCAGCTCAA-----AATGTTTAACAG-TTTGA-----CAGG-TGAGAATGTG-AAAttatgaacatgacatgtctgatatattt
gi|134637                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134638                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTC-CA--------AAA-TTCACTATGTATGTACAGAGTATA
gi|134639                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-GAAT-GCTATA--------AAA-T
gi|134640                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAGGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134641                     :                                            TACTAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------
gi|134642                     :                                            TACAAAGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134643                     :                                             ATGAGGGGTTATCCAGAAGTTGGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134644                     :                                             ACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGCC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---TGTACATCGCTATATTTTGCACAGCCTA------AGTA--TTGGTGTATTTGTCATCA---ATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----ATTGTTGCACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTGAAAAAATA-ACAATT-A-----TTTCCCTGT-AAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGATGACACATCATAAATGTCT--ACAT
gi|134645                     :                                             ACGAGGGGTTATCCA-AAGTTTGTGAAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATAT
gi|134646                     :                                              CGAGGGGTGATCCAGAAGTTCATGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCG-TATTCATGCA---AGAACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGAT--TTTGTGTATTTGTCATCG---ATGTACAGAATTTTAGCGCATTTCA----T--A---TGTAAATAAA---AATGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AGTGTTGAACAA-TTTCA-----CAGA-TAAATATTTG-GAAAATA-ACAATG-G-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATTATAT---ATTA-TTGATGACACGTCATCAATGTCA--ACAT
gi|134647                     :                                                AGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-GTCATA--------AAA-T
gi|134648                     :                                                      TATCCAGAAGTTCATG-AC-AAAA-TTAATA--------AT--TTCA-TATTCATGCA---AATACATTGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTATTTGTCATCC---ATGTATTGTACTTTAGTGCATTTTT----TTTA---TGTTAAAAAT---ATTGTTA--------TGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-TGTGTTGCAGCTCAA-----AATGCTGAACAA-TTTGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATATAAAATA-A-----TTTCCCAGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-CTGAGGACACATCAACAATGTCT--GCAT
gi|134649                     :                                                              AATTTGTGGAC-GGAT-CTCATA--------AAA-TCAA-CATTTATGTA---AATACACCGCTACTCTCTACACA
gi|134649                     :                                                                                                                                                                                                     TTCT----T--A------CAGTAATTATAATGTCA--------TTGTATCCATGGCAACATGCATACATGGG------T-AG---------------------------CAG-TTTGG-----TAG--TAAATATGTG-AAAAATA-TTAAGT-G-----TCTCCTTGTACAAC---------ACC---T---ATTA-TTGACGATACGTCGTCATTATCT--GCATtcgacattcttacagtaattataatgtcattgtatccatggcaacatgcatacatgggtagcagtttggtagtaaatatgtgaaaaatattaagtgtctccttgtacaacacctattattgacgatacgtcgtcattatctgcat
gi|134650                     : aatttgtggacggatctcataaaatcaacatttatgtaaatacaccgctactctctacacatcgacaTGGAC-ACATGTTAATA--------AG--TCCA-AATTTATGTA---A----ATCGCTA--------AAAACTGA------GGTACTTTTGTGTCTTCGATATC----ATGT-CAGTGTTTCACTGTATTTCT----C--A---CGCCAGTAAT---AATATCA--------TGGTATACAAAGAGGCATGCATTTATAGG------G-AACGCCGCAGCTCAA-----AATATTGAAAAG-TTTAA-----CAGG-TAAACATACG-AATAA-A-ACAATC-G-----TTTCCCTGT-----------TAAATTACAG---AAGA-TT---GTCCCGTCATCAATATCT--ACAT
gi|134651                     :                                                                                                                                      CACAACTTA------AGTA--TTGATGTATTTCTCACCG---ACATCCAGTATTTCATTACACTCCT-----------TGTCCGTAAT---GATATTG--------TCATTTTAATAGCA------ATAAA--GC------T-GGTGCCGCAGCTCAA-----AATGGTGAACAA-GGTAAGGATGCAAA-AAAAAACAAC-AAAAA-A-ACAATC-G-----TATCTCTGTAAAATTTACAATAAATCATTT---ATTA-TTAATGATACGTTATCAATGTCTTCGTATG
gi|134652                     :                                                                                                                                                                                                    TTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATGTTA--------TGGTATCCATAGCAACATACATACAGGAT------T-AGTGTCGCAGCTCAA-----AATGTTAAACAA-TTCGA-----CAGA-TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATA-ATTGATTTTCCCTGTAACACTCGTGGTGAAGCCTAT---ATTA-TTGAGAACACGTCATCAATGTTT--GCATG
gi|134653                     :                                                                                                                                                                                                                             T---AATATTA--------TATTATCTATAGCAACATGCATACATGGG------TGAGCACCGCAACTCAA-----AATAATGAAAAA-TTTG------TAGAGTCAACATGTG-AAAAATG-ATGAGT-G-----TGTCCCTACAAGATTCGCAGGAAATCATA
gi|134654                     :                                                                                                                                                                                                                                                        ATAGCAACATACGTACATGAT------T-GATGCCGCAGCTCAAATCAAAATGTTGAACAA-TTTGA-----GAGT-TAAATATGTG-AAATATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTGAATCATAT---GTTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134655                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -AGTGCTAAAGCTTAA-----AATGTTGAATAA-TTTGA-----CAGG-TAAGTATGC--ACAAATA---AACG-A-----GTTCCCAGTAAAATTTGCGGTACCTCATAT---ATTA-GTAAAGGCACGT
gi|134656                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                taAA-----AGTGTTGAACAA-TTCGA-----CAGT-TAGATATGTG-AAATATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCTGTCAATGATAT---ATTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCAT
gi|134657                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATCAA-TTTGA-----CA---TAAATATGTG-AAAAATA-ACAATC-A-----TTTCCTTGTAAATCTCATTGTAAATCATAT---ATTG-CTTAGGACGTGTCATCAATGTAT--GCAT
gi|134658                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-CAAATTTGTG-AATAATA-ACAGTC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATAA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCATG
gi|134659                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATGTG-AAAAATT-ACTATC-A-----TTTTCCCGTGAAACTCGCGGTATATCATAT---AT

lowQualScore                  :                                                                         0    0  1   33333333 0 1    1          222       2          4    1    444444    22         222               0  1               3333 22 222          222    55555555       0                        444444 1               33333            1  1      1          1 55555555555      1     22 33333                              222    1                       22     
lowQualScore                  :                                                                         .    .  .   ........ . .    .          ...       .          .    .    ......    ..         ...               .  .               .... .. ...          ...    ........       .                        ...... .               .....            .  .      .          . ...........      .     .. .....                              ...    .                       ..     
lowQualScore                  :                                                                         9    9  0   33333333 4 0    5          777       3          2    1    888888    33         999               4  5               3333 11 777          666    44444444       9                        111111 4               33333            3  6      2          2 88888888888      2     11 11111                              333    3                       11     
consensus                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTNATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
Reference ( family-470 )      :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTNATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134607                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-ATAT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTAGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-CAAATATGTG-A-----------ATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCATG
gi|134608                     :                                            TACCAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------ATTA--TTGGTGTAT---TTGTCATAGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATGGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-CAAATGTGTG-T-----------ATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCAT
gi|134609                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGATGTTCGTGGAC-AAAT-TTCATA--------ATA-T
gi|134610                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCTT-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AATA--CTGATGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTGTTTTTGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATATATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATTTTGAACAA-TTTGACAGA-CAAATATGTG-A-----------GTAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGATAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACAGCATCAATGTGT--GCATG
gi|134611                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGAAC-AAAT-CTCTTA--------A
gi|134612                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCATGGAC-ACAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATAGCTATATTTTTCACAACTTA------GGTA--CTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCG----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATTCATAGCAACAAACATATATGAT------T-AGTGCCACAGCTCAA-----AATGTTGAACAA--ACGACAGT-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGCAAAACCCACGGTGTATAATAT---ATTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATGta
gi|134613                     :                                            TGCGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134614                     :                                            TACAAGGGGTTATCCAGAAGTTCTTGGAC-AAGT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCAT-GATGTACGGTGTTTTAGTTTATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTGTGGTATCCATAACAACATACAAACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----TATGTTGAAAAA-TTTGACAGA-CAAATATGTG-A-----------ATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAC---ATTA-ATGAGGACACGGCATCAATATCT--ACATG
gi|134615                     :                                            TACGAGGGGTTGTCCAGAAGTTCGTGGAC-TAAT-TTCATA--------ATA-T
gi|134616                     :                                            TACGAGGGGTAATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134617                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AATT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATACA---GGCACATCGTTATATTTT-CACAACTTA------ATTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTGCGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGAAACATATATACAAGAA------T-ATTGCCACACCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTTCCTGTAACGCTCGCGGTGAAGCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--ACATG
gi|134618                     :                                            TAGGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAAATCCA-TATTTATGCA---AGTACATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCA----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATGCATGAA------T-AGTTCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGAC----------------------------AAATA-ACAATCAA-----TTTTCCCATAACACTCGCAGTGAATCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134619                     :                                            TACGAGTGGTTATCAAAAAGTTCATGGAC-AACT-TTGATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTACATCGCCATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TATTAATAAT---AATG--------TTACGGTCTCCATAGCAACATGCATGCATGGT------T-AGTGCCACAGCTCAA-----ATTGTTGAACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATG-A-----TTTCCATGTAAAACTCACGGTAAATCATAT---ATTATTTGATGACAAGTCATCAATGTCT--ACAT
gi|134620                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134621                     :                                            TACGAGGTGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTATTA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATGGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTAAGTACATTTTT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCA-----------------GAACAATTTTGACTGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACTATG-A-----TTTTCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGATGACACGTCATCAATGTCA--GCAT
gi|134622                     :                                            TACGAGGGGTTATCCTGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134623                     :                                            TACGACGGGTTATCCAGAAGTTCGTAGAC-AAAT-TTGATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTACATAGCTGTATTTGGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTTTAT---TTGTTGTCGATGTACAGTATTTTAATGCATTTGT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------ATATGGTCTCCTTAAC-ACATGCATACATGTT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACCA-TTTGACAGA-TAAATATTTG-A-----------AAAATA-ACAATG-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGTGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--ATAT
gi|134624                     :                                            TACGAGGGGTGTTCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTATATCGCTATATTTTGCACAGCTGA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATTGATGTACAGTACTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAGCATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGTTCAA-----ATTGTTAAACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAACG-A-----ATTTCCTGTAAAACTTGCCGTAAATCATAT---ATTA-TTGATG-CGTGTCAT
gi|134625                     :                                            TACGAGGGGTTATCCGGAAGTTCATGGAT-AATG-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTAAATAGCTGTATTTTCCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCAT-GATGTACGGTTTTTTAGTATA----------------------TAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACAGAAC------T-AGTGCCGCAGCTTCA-----AATGTTTGACAA-TTCGACAGA-TAATCATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-C-----TTTTCCT-TAATACTCGAGGTGAAGCATAT---ATTA-TTGAGAACACATCATCAATGTCT--GCATG
gi|134626                     :                                            TACGAGGGGATATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------
gi|134627                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAC-TCAATACATTTGTTAAA-TCCA-TATTCAT--------TATATCGCTATATTTTGCACAGTTTC------AGAA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AGCGTTGATCAG-CTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-AC--TG-A-----TTTCC--------CTCGTGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACATCATCAATGTC
gi|134628                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTCTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACAT----------------------------------TGGTGTAT---TTTCTATCAATGTGCGGTGTTTTAGTATATTT---------A---TATCAGTAAA---AATG--------TTATAGTATTCATTGCAACATACATACACAAT------T-AGTCCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAG-CTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATA-A-----TTTTCCTGTAAATCTCACGTTAAAACATAT---ATTA-TTGAGAACATGTCATCAATGTCT--GCA
gi|134629                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-ATAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134630                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTATTC--------ATA-TCCA-TATAAATGCA---AATACATTGCTATATT------------------------TTGGCGTAT---TTGTCTTCGATTTACAGTTTTTTAATGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCGTAGCACAATGCACACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTTGACTGA-TAAATATGTG-A-----------AACATA-ACACTG-A-----TTTCCCTGTAAAACTC-TAGTAAGTCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--GCAT
gi|134631                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTTCAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCACTATATTTTGCTCAACATA------AGTA--TTGGTTTATTCATCATCATCAATGTACAGTAACTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAACAAT---AATGTTAAGGACTTATGGTATCCATAGCAACATGCATGTATGGT------T-AGTGCACCAGCTCAA-----AATGTTGAGCAA-TTTGACAGA-TAAATATTTG-A-----------AAGATA-ACATTC-A-----TTTGCCTGTATAAC-------ATATCA-AT---ATTA----AGGACACGCCATCAATGTCT--GCA
gi|134632                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-AAAATA--------AAA-TCCT-TAATTATGCA---AGTGCAGCTCCATATTTTGCACAACTGA------AGTG--TTGGTGTA----TTGTCATCGGTGTACAATATTTTAGTGTATTTCTAAAGC--A---TGTCAGTACT---AATT--------TTATGGTA--------ACCATGCATACATGTT------T-AGTGCTTCAGTTC-A-----TATGTTGAACAA-TTTGACAGA-TCAGTATGTG-A-----------AAAATA-ACAATA-G-----TTTCCATGT-AAACTCGCAGTAAATC-TAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAAAGACT--GCAT
gi|134633                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAAGTTTGTGGAC-AATT-CTCATC--------AAA-T
gi|134634                     :                                            TACGGCGGGTTATGCAAAAGTTTTTGAAC-AAAT-TTAATA--------ACA-TTAA-TGATTATGCA---AGTACATCACTAT-TTTTTTACATCTTACATGTAAGTA--TTTGTGTAT---TTGACATCGATATCCAATTTTCTAGTGCATTTGT----T--A---CGTCAGTAAT---ACTG--------TTATGGTATCCATAGCAACTTGCATACATGGT------T-AATGCCGCAGTTAAA-----ATTGTTGAACAA-TTTGACAAG-TAAAT----------------------TA-ACAATC-G-----TTTCCATGTAAAACTTGCAGTTATTCATATATAATTA-TTGATGACATGTCAT
gi|134635                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAAT-CTCATA--------
gi|134636                     :                                            TACAAAAGGTTATCCAGAAGTTTGTAAAC-ACAT-TTCATA--------AAA-TTTA-TAT------A---AGTACATCGCTATATTTGGCAAAGCTTT------AGTG--CTG----AT---TTATTGTTGATAGCCGGTTTCTTATTGCATTTCT----T--ACTATGTCAGTAAT---CATG--------TTATGGTTTCCATAGCAATATGCATACTTGGTTACCGGT-AGTGCTGCAGCTCAA-----AATGTTTAACAG-TTTGACAGG-TGAGAATGTG-A-----------AAttatgaacatgacatgtctgatatattt
gi|134637                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134638                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTC-CA--------AAA-TTCACTATGTATGTACAGAGTATA
gi|134639                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-GAAT-GCTATA--------AAA-T
gi|134640                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAGGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134641                     :                                            TACTAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------
gi|134642                     :                                            TACAAAGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134643                     :                                             ATGAGGGGTTATCCAGAAGTTGGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134644                     :                                             ACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGCC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---TGTACATCGCTATATTTTGCACAGCCTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCAATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----ATTGTTGCACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTGAA-----------AAAATA-ACAATT-A-----TTTCCCTGT-AAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGATGACACATCATAAATGTCT--ACAT
gi|134645                     :                                             ACGAGGGGTTATCCA-AAGTTTGTGAAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATAT
gi|134646                     :                                              CGAGGGGTGATCCAGAAGTTCATGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCG-TATTCATGCA---AGAACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGAT--TTTGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGAATTTTAGCGCATTTCA----T--A---TGTAAATAAA---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AGTGTTGAACAA-TTTCACAGA-TAAATATTTG-G-----------AAAATA-ACAATG-G-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATTATAT---ATTA-TTGATGACACGTCATCAATGTCA--ACAT
gi|134647                     :                                                AGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-GTCATA--------AAA-T
gi|134648                     :                                                      TATCCAGAAGTTCATG-AC-AAAA-TTAATA--------AT--TTCA-TATTCATGCA---AATACATTGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCCATGTATTGTACTTTAGTGCATTTTT----TTTA---TGTTAAAAAT---ATTG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-TGTGTTGCAGCTCAA-----AATGCTGAACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATATAAAATA-A-----TTTCCCAGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-CTGAGGACACATCAACAATGTCT--GCAT
gi|134649                     :                                                              AATTTGTGGAC-GGAT-CTCATA--------AAA-TCAA-CATTTATGTA---AATACACCGCTACTCTCTACACA
gi|134649                     :                                                                                                                                                                                                     TTCT----T--A------CAGTAATTATAATG--------TCATTGTATCCATGGCAACATGCATACATGGG------T-AG---------------------------CAG-TTTGGTAG--TAAATATGTG-A-----------AAAATA-TTAAGT-G-----TCTCCTTGTACAAC---------ACC---T---ATTA-TTGACGATACGTCGTCATTATCT--GCATtcgacattcttacagtaattataatgtcattgtatccatggcaacatgcatacatgggtagcagtttggtagtaaatatgtgaaaaatattaagtgtctccttgtacaacacctattattgacgatacgtcgtcattatctgcat
gi|134650                     : aatttgtggacggatctcataaaatcaacatttatgtaaatacaccgctactctctacacatcgacaTGGAC-ACATGTTAATA--------AG--TCCA-AATTTATGTA---A----ATCGCTA--------AAAACTGA------GGTACTTTTGTGTCT---TCGATATC-ATGT-CAGTGTTTCACTGTATTTCT----C--A---CGCCAGTAAT---AATA--------TCATGGTATACAAAGAGGCATGCATTTATAGG------G-AACGCCGCAGCTCAA-----AATATTGAAAAG-TTTAACAGG-TAAACATACG-A-----------ATAA-A-ACAATC-G-----TTTCCCTGT-----------TAAATTACAG---AAGA-TT---GTCCCGTCATCAATATCT--ACAT
gi|134651                     :                                                                                                                                      CACAACTTA------AGTA--TTGATGTAT---TTCTCACCGACATCCAGTATTTCATTACACTCCT-----------TGTCCGTAAT---GATA--------TTGTCATTTTAATAGCA------ATAAA--GC------T-GGTGCCGCAGCTCAA-----AATGGTGAACA--------AGG-TAAGGATGCA-AAAAAAAACAACAAAAAA-ACAATC-G-----TATCTCTGTAAAATTTACAATAAATCATTT---ATTA-TTAATGATACGTTATCAATGTCTTCGTATG
gi|134652                     :                                                                                                                                                                                                    TTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACAGGAT------T-AGTGTCGCAGCTCAA-----AATGTTAAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATA-ATTGATTTTCCCTGTAACACTCGTGGTGAAGCCTAT---ATTA-TTGAGAACACGTCATCAATGTTT--GCATG
gi|134653                     :                                                                                                                                                                                                                             T---AATA--------TTATATTATCTATAGCAACATGCATACATGGG------TGAGCACCGCAACTCAA-----AATAATGAAAAA-TTTG-TAGAGTCAACATGTG-A-----------AAAATG-ATGAGT-G-----TGTCCCTACAAGATTCGCAGGAAATCATA
gi|134654                     :                                                                                                                                                                                                                                                        ATAGCAACATACGTACATGAT------T-GATGCCGCAGCTCAAATCAAAATGTTGAACAA-TTTGAGAGT-TAAATATGTG-A-----------AATATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTGAATCATAT---GTTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134655                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -AGTGCTAAAGCTTAA-----AATGTTGAATAA-TTTGACAGG-TAAGTATGC--A-----------CAAATA---AACG-A-----GTTCCCAGTAAAATTTGCGGTACCTCATAT---ATTA-GTAAAGGCACGT
gi|134656                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                taAA-----AGTGTTGAACAA-TTCGACAGT-TAGATATGTG-A-----------AATATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCTGTCAATGATAT---ATTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCAT
gi|134657                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATCAA-TTTGACA---TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCTTGTAAATCTCATTGTAAATCATAT---ATTG-CTTAGGACGTGTCATCAATGTAT--GCAT
gi|134658                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-CAAATTTGTG-A-----------ATAATA-ACAGTC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATAA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCATG
gi|134659                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATGTG-A-----------AAAATT-ACTATC-A-----TTTTCCCGTGAAACTCGCGGTATATCATAT---AT

lowQualScore                  :                                                                         0    0  1   33333333 0 1    1          222       2          4    1    444444    22         222               0  1               3333 22 222          222    55555555       0                        444444 1               33333            1  1      1          1 55555555555      1     22 33333                              222    1                       22     
lowQualScore                  :                                                                         .    .  .   ........ . .    .          ...       .          .    .    ......    ..         ...               .  .               .... .. ...          ...    ........       .                        ...... .               .....            .  .      .          . ...........      .     .. .....                              ...    .                       ..     
lowQualScore                  :                                                                         9    9  0   33333333 4 0    5          777       3          2    1    888888    33         999               4  5               3333 11 777          666    44444444       9                        111111 4               33333            3  6      2          2 88888888888      2     11 11111                              333    3                       11     
consensus                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTNATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
Reference ( family-470 )      :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTNATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134607                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-ATAT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTAGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-CAAATATGTG-A-----------ATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCATG
gi|134608                     :                                            TACCAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------ATTA--TTGGTGTAT---TTGTCATAGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATGGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-CAAATGTGTG-T-----------ATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCAT
gi|134609                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGATGTTCGTGGAC-AAAT-TTCATA--------ATA-T
gi|134610                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCTT-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AATA--CTGATGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTGTTTTTGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATATATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATTTTGAACAA-TTTGACAGA-CAAATATGTG-A-----------GTAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGATAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACAGCATCAATGTGT--GCATG
gi|134611                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGAAC-AAAT-CTCTTA--------A
gi|134612                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCATGGAC-ACAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATAGCTATATTTTTCACAACTTA------GGTA--CTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCG----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATTCATAGCAACAAACATATATGAT------T-AGTGCCACAGCTCAA-----AATGTTGAACAA--ACGACAGT-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGCAAAACCCACGGTGTATAATAT---ATTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATGta
gi|134613                     :                                            TGCGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134614                     :                                            TACAAGGGGTTATCCAGAAGTTCTTGGAC-AAGT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCAT-GATGTACGGTGTTTTAGTTTATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTGTGGTATCCATAACAACATACAAACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----TATGTTGAAAAA-TTTGACAGA-CAAATATGTG-A-----------ATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAC---ATTA-ATGAGGACACGGCATCAATATCT--ACATG
gi|134615                     :                                            TACGAGGGGTTGTCCAGAAGTTCGTGGAC-TAAT-TTCATA--------ATA-T
gi|134616                     :                                            TACGAGGGGTAATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134617                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AATT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATACA---GGCACATCGTTATATTTT-CACAACTTA------ATTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTGCGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGAAACATATATACAAGAA------T-ATTGCCACACCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTTCCTGTAACGCTCGCGGTGAAGCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--ACATG
gi|134618                     :                                            TAGGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAAATCCA-TATTTATGCA---AGTACATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCA----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATGCATGAA------T-AGTTCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGAC----------------------------AAATA-ACAATCAA-----TTTTCCCATAACACTCGCAGTGAATCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134619                     :                                            TACGAGTGGTTATCAAAAAGTTCATGGAC-AACT-TTGATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTACATCGCCATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TATTAATAAT---AATG--------TTACGGTCTCCATAGCAACATGCATGCATGGT------T-AGTGCCACAGCTCAA-----ATTGTTGAACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATG-A-----TTTCCATGTAAAACTCACGGTAAATCATAT---ATTATTTGATGACAAGTCATCAATGTCT--ACAT
gi|134620                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134621                     :                                            TACGAGGTGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTATTA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATGGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTAAGTACATTTTT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCA-----------------GAACAATTTTGACTGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACTATG-A-----TTTTCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGATGACACGTCATCAATGTCA--GCAT
gi|134622                     :                                            TACGAGGGGTTATCCTGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134623                     :                                            TACGACGGGTTATCCAGAAGTTCGTAGAC-AAAT-TTGATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTACATAGCTGTATTTGGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTTTAT---TTGTTGTCGATGTACAGTATTTTAATGCATTTGT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------ATATGGTCTCCTTAAC-ACATGCATACATGTT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACCA-TTTGACAGA-TAAATATTTG-A-----------AAAATA-ACAATG-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGTGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--ATAT
gi|134624                     :                                            TACGAGGGGTGTTCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTATATCGCTATATTTTGCACAGCTGA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATTGATGTACAGTACTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAGCATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGTTCAA-----ATTGTTAAACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAACG-A-----ATTTCCTGTAAAACTTGCCGTAAATCATAT---ATTA-TTGATG-CGTGTCAT
gi|134625                     :                                            TACGAGGGGTTATCCGGAAGTTCATGGAT-AATG-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTAAATAGCTGTATTTTCCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCAT-GATGTACGGTTTTTTAGTATA----------------------TAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACAGAAC------T-AGTGCCGCAGCTTCA-----AATGTTTGACAA-TTCGACAGA-TAATCATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-C-----TTTTCCT-TAATACTCGAGGTGAAGCATAT---ATTA-TTGAGAACACATCATCAATGTCT--GCATG
gi|134626                     :                                            TACGAGGGGATATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------
gi|134627                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAC-TCAATACATTTGTTAAA-TCCA-TATTCAT--------TATATCGCTATATTTTGCACAGTTTC------AGAA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AGCGTTGATCAG-CTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-AC--TG-A-----TTTCC--------CTCGTGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACATCATCAATGTC
gi|134628                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTCTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACAT----------------------------------TGGTGTAT---TTTCTATCAATGTGCGGTGTTTTAGTATATTT---------A---TATCAGTAAA---AATG--------TTATAGTATTCATTGCAACATACATACACAAT------T-AGTCCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAG-CTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATA-A-----TTTTCCTGTAAATCTCACGTTAAAACATAT---ATTA-TTGAGAACATGTCATCAATGTCT--GCA
gi|134629                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-ATAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134630                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTATTC--------ATA-TCCA-TATAAATGCA---AATACATTGCTATATT------------------------TTGGCGTAT---TTGTCTTCGATTTACAGTTTTTTAATGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCGTAGCACAATGCACACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTTGACTGA-TAAATATGTG-A-----------AACATA-ACACTG-A-----TTTCCCTGTAAAACTC-TAGTAAGTCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--GCAT
gi|134631                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTTCAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCACTATATTTTGCTCAACATA------AGTA--TTGGTTTATTCATCATCATCAATGTACAGTAACTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAACAAT---AATGTTAAGGACTTATGGTATCCATAGCAACATGCATGTATGGT------T-AGTGCACCAGCTCAA-----AATGTTGAGCAA-TTTGACAGA-TAAATATTTG-A-----------AAGATA-ACATTC-A-----TTTGCCTGTATAAC-------ATATCA-AT---ATTA----AGGACACGCCATCAATGTCT--GCA
gi|134632                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-AAAATA--------AAA-TCCT-TAATTATGCA---AGTGCAGCTCCATATTTTGCACAACTGA------AGTG--TTGGTGTA----TTGTCATCGGTGTACAATATTTTAGTGTATTTCTAAAGC--A---TGTCAGTACT---AATT--------TTATGGTA--------ACCATGCATACATGTT------T-AGTGCTTCAGTTC-A-----TATGTTGAACAA-TTTGACAGA-TCAGTATGTG-A-----------AAAATA-ACAATA-G-----TTTCCATGT-AAACTCGCAGTAAATC-TAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAAAGACT--GCAT
gi|134633                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAAGTTTGTGGAC-AATT-CTCATC--------AAA-T
gi|134634                     :                                            TACGGCGGGTTATGCAAAAGTTTTTGAAC-AAAT-TTAATA--------ACA-TTAA-TGATTATGCA---AGTACATCACTAT-TTTTTTACATCTTACATGTAAGTA--TTTGTGTAT---TTGACATCGATATCCAATTTTCTAGTGCATTTGT----T--A---CGTCAGTAAT---ACTG--------TTATGGTATCCATAGCAACTTGCATACATGGT------T-AATGCCGCAGTTAAA-----ATTGTTGAACAA-TTTGACAAG-TAAAT----------------------TA-ACAATC-G-----TTTCCATGTAAAACTTGCAGTTATTCATATATAATTA-TTGATGACATGTCAT
gi|134635                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAAT-CTCATA--------
gi|134636                     :                                            TACAAAAGGTTATCCAGAAGTTTGTAAAC-ACAT-TTCATA--------AAA-TTTA-TAT------A---AGTACATCGCTATATTTGGCAAAGCTTT------AGTG--CTG----AT---TTATTGTTGATAGCCGGTTTCTTATTGCATTTCT----T--ACTATGTCAGTAAT---CATG--------TTATGGTTTCCATAGCAATATGCATACTTGGTTACCGGT-AGTGCTGCAGCTCAA-----AATGTTTAACAG-TTTGACAGG-TGAGAATGTG-A-----------AAttatgaacatgacatgtctgatatattt
gi|134637                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134638                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTC-CA--------AAA-TTCACTATGTATGTACAGAGTATA
gi|134639                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-GAAT-GCTATA--------AAA-T
gi|134640                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAGGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134641                     :                                            TACTAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------
gi|134642                     :                                            TACAAAGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134643                     :                                             ATGAGGGGTTATCCAGAAGTTGGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134644                     :                                             ACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGCC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---TGTACATCGCTATATTTTGCACAGCCTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCAATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----ATTGTTGCACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTGAA-----------AAAATA-ACAATT-A-----TTTCCCTGT-AAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGATGACACATCATAAATGTCT--ACAT
gi|134645                     :                                             ACGAGGGGTTATCCA-AAGTTTGTGAAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATAT
gi|134646                     :                                              CGAGGGGTGATCCAGAAGTTCATGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCG-TATTCATGCA---AGAACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGAT--TTTGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGAATTTTAGCGCATTTCA----T--A---TGTAAATAAA---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AGTGTTGAACAA-TTTCACAGA-TAAATATTTG-G-----------AAAATA-ACAATG-G-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATTATAT---ATTA-TTGATGACACGTCATCAATGTCA--ACAT
gi|134647                     :                                                AGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-GTCATA--------AAA-T
gi|134648                     :                                                      TATCCAGAAGTTCATG-AC-AAAA-TTAATA--------AT--TTCA-TATTCATGCA---AATACATTGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCCATGTATTGTACTTTAGTGCATTTTT----TTTA---TGTTAAAAAT---ATTG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-TGTGTTGCAGCTCAA-----AATGCTGAACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATATAAAATA-A-----TTTCCCAGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-CTGAGGACACATCAACAATGTCT--GCAT
gi|134649                     :                                                              AATTTGTGGAC-GGAT-CTCATA--------AAA-TCAA-CATTTATGTA---AATACACCGCTACTCTCTACACA
gi|134649                     :                                                                                                                                                                                                     TTCT----T--A------CAGTAATTATAATG--------TCATTGTATCCATGGCAACATGCATACATGGG------T-AG---------------------------CAG-TTTGGTAG--TAAATATGTG-A-----------AAAATA-TTAAGT-G-----TCTCCTTGTACAAC---------ACC---T---ATTA-TTGACGATACGTCGTCATTATCT--GCATtcgacattcttacagtaattataatgtcattgtatccatggcaacatgcatacatgggtagcagtttggtagtaaatatgtgaaaaatattaagtgtctccttgtacaacacctattattgacgatacgtcgtcattatctgcat
gi|134650                     : aatttgtggacggatctcataaaatcaacatttatgtaaatacaccgctactctctacacatcgacaTGGAC-ACATGTTAATA--------AG--TCCA-AATTTATGTA---A----ATCGCTA--------AAAACTGA------GGTACTTTTGTGTCT---TCGATATC-ATGT-CAGTGTTTCACTGTATTTCT----C--A---CGCCAGTAAT---AATA--------TCATGGTATACAAAGAGGCATGCATTTATAGG------G-AACGCCGCAGCTCAA-----AATATTGAAAAG-TTTAACAGG-TAAACATACG-A-----------ATAA-A-ACAATC-G-----TTTCCCTGT-----------TAAATTACAG---AAGA-TT---GTCCCGTCATCAATATCT--ACAT
gi|134651                     :                                                                                                                                      CACAACTTA------AGTA--TTGATGTAT---TTCTCACCGACATCCAGTATTTCATTACACTCCT-----------TGTCCGTAAT---GATA--------TTGTCATTTTAATAGCA------ATAAA--GC------T-GGTGCCGCAGCTCAA-----AATGGTGAACA--------AGG-TAAGGATGCA-AAAAAAAACAACAAAAAA-ACAATC-G-----TATCTCTGTAAAATTTACAATAAATCATTT---ATTA-TTAATGATACGTTATCAATGTCTTCGTATG
gi|134652                     :                                                                                                                                                                                                    TTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACAGGAT------T-AGTGTCGCAGCTCAA-----AATGTTAAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATA-ATTGATTTTCCCTGTAACACTCGTGGTGAAGCCTAT---ATTA-TTGAGAACACGTCATCAATGTTT--GCATG
gi|134653                     :                                                                                                                                                                                                                             T---AATA--------TTATATTATCTATAGCAACATGCATACATGGG------TGAGCACCGCAACTCAA-----AATAATGAAAAA-TTTG-TAGAGTCAACATGTG-A-----------AAAATG-ATGAGT-G-----TGTCCCTACAAGATTCGCAGGAAATCATA
gi|134654                     :                                                                                                                                                                                                                                                        ATAGCAACATACGTACATGAT------T-GATGCCGCAGCTCAAATCAAAATGTTGAACAA-TTTGAGAGT-TAAATATGTG-A-----------AATATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTGAATCATAT---GTTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134655                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -AGTGCTAAAGCTTAA-----AATGTTGAATAA-TTTGACAGG-TAAGTATGC--A-----------CAAATA---AACG-A-----GTTCCCAGTAAAATTTGCGGTACCTCATAT---ATTA-GTAAAGGCACGT
gi|134656                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                taAA-----AGTGTTGAACAA-TTCGACAGT-TAGATATGTG-A-----------AATATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCTGTCAATGATAT---ATTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCAT
gi|134657                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATCAA-TTTGACA---TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCTTGTAAATCTCATTGTAAATCATAT---ATTG-CTTAGGACGTGTCATCAATGTAT--GCAT
gi|134658                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-CAAATTTGTG-A-----------ATAATA-ACAGTC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATAA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCATG
gi|134659                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATGTG-A-----------AAAATT-ACTATC-A-----TTTTCCCGTGAAACTCGCGGTATATCATAT---AT


blockSeqs                     :                                                                                 A   CATTTGTT   A    C          CAG       A          T    A    CATGTA    CT         TCA                  G               AAAG TT CTA          TAT    TTAAGGAC                                TACCGG G               ATCAA            T  C      G          A AAAAAAACAAC      T     CA TTGAT                              ATA    T                       TC
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .    .          .         A          T    A    .         .          .                    G               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     C  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         A          T    A    .         .          .                    G               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  C      .          . .                .     C  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .    .          .         A          T    A    .         .          .                    G               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     C  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         C          T    A    .         .          .                    G               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  C      .          . .                .     C  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .    .          .         A          G    A    .         .          .                    G               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  C      .          . .                .     C  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         C          G    G    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     G  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .    .          .         G          G    G    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     G  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .    .          .         A          G    G    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     G  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         C          C    G    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     G  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         A          G    A    .         .          .                    T               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  C      .          . .                .     C  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 G   .          .    .          .         C          G    G    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     G  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .    .          .         T          G    A    .         .          .                    G               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  C      .          . .                .     A  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         C          T    A    .         .          .                    T               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     G  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .    .          .         C          G    T    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     C  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 G   .          .    .          .         C          G    G    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     A  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         C          G    G    .         .          .                    T               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     C  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         C          G    G    .         .          .                    T               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     T  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .    .          .         C          A    G    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     G  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         C          .    A    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     A  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         T          .    A    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     T  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .    .          .         C          .    .    .         .          .                    G               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     C  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         C          .    .    .         .          .                    A               .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     C  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .         .                                                                              .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  C      .          . .                .     A  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .    .          .                                                                                        .    .  .            .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     T  .                                  .      .                       . 
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .                                                                                                                             .      .                                       .      .               .                .  T      .          . .                .     C  .                                  .      .                         
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .                                                                                                                                                                            .      .               .                .  T      .          . .                .     G  .                                  .      .                         
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .                                                                                                                                                                                   .               .                .  C      .          . .                .     C  .                                  .      .                         
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .                                                                                                                                                                                                   .                .  T      .          . .                .     C  .                                  .      .                         
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .                                                                                                                                                                                                                    .  .      .          . .                .     C  .                                  .                                
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .                                                                                                                                                                                                                              .          . .                .     C  .                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                 T   .          .                                                                                                                                                                                                                                         . .                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                 C   .          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                 A   .          .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                 C   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                 A   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                 C   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                 A   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    


blockSeqCons                  :                                            
originalCons                  :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTNATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
finalCons                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTNATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG

lowQualScore                  :                                                                         0    0  1   33333333 0 1    1          222       2          4    1    444444    22         222               0  1               3333 22 222          222    55555555       0                        444444 1               33333            1  1      1          1 55555555555      1     22 33333                              222    1                       22     
lowQualScore                  :                                                                         .    .  .   ........ . .    .          ...       .          .    .    ......    ..         ...               .  .               .... .. ...          ...    ........       .                        ...... .               .....            .  .      .          . ...........      .     .. .....                              ...    .                       ..     
lowQualScore                  :                                                                         9    9  0   33333333 4 0    5          777       3          2    1    888888    33         999               4  5               3333 11 777          666    44444444       9                        111111 4               33333            3  6      2          2 88888888888      2     11 11111                              333    3                       11     
consensus                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTNATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
Reference ( family-470 )      :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTNATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134607                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-ATAT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTAGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-CAAATATGTG-A-----------ATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCATG
gi|134608                     :                                            TACCAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------ATTA--TTGGTGTAT---TTGTCATAGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATGGCAACATACATACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-CAAATGTGTG-T-----------ATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCAT
gi|134609                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGATGTTCGTGGAC-AAAT-TTCATA--------ATA-T
gi|134610                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCTT-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AATA--CTGATGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTGTTTTTGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATATATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATTTTGAACAA-TTTGACAGA-CAAATATGTG-A-----------GTAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGATAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACAGCATCAATGTGT--GCATG
gi|134611                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGAAC-AAAT-CTCTTA--------A
gi|134612                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCATGGAC-ACAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATAGCTATATTTTTCACAACTTA------GGTA--CTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCG----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATTCATAGCAACAAACATATATGAT------T-AGTGCCACAGCTCAA-----AATGTTGAACAA--ACGACAGT-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGCAAAACCCACGGTGTATAATAT---ATTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATGta
gi|134613                     :                                            TGCGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134614                     :                                            TACAAGGGGTTATCCAGAAGTTCTTGGAC-AAGT-TTAATA--------AAA-TCTA-TATTTATGCA---AGTGCATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCAT-GATGTACGGTGTTTTAGTTTATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTGTGGTATCCATAACAACATACAAACATGAT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----TATGTTGAAAAA-TTTGACAGA-CAAATATGTG-A-----------ATAATA-ACAATC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAC---ATTA-ATGAGGACACGGCATCAATATCT--ACATG
gi|134615                     :                                            TACGAGGGGTTGTCCAGAAGTTCGTGGAC-TAAT-TTCATA--------ATA-T
gi|134616                     :                                            TACGAGGGGTAATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134617                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AATT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATACA---GGCACATCGTTATATTTT-CACAACTTA------ATTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTGCGGTGTTTTAGTATATTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGAAACATATATACAAGAA------T-ATTGCCACACCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTTCCTGTAACGCTCGCGGTGAAGCATAT---ATTA-TTGAGGACACGTCATCAATGTCT--ACATG
gi|134618                     :                                            TAGGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAAATCCA-TATTTATGCA---AGTACATAGCTATATTTTTCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACGGTGTTTTAGTATATTTCA----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATGCATGAA------T-AGTTCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTCGAC----------------------------AAATA-ACAATCAA-----TTTTCCCATAACACTCGCAGTGAATCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134619                     :                                            TACGAGTGGTTATCAAAAAGTTCATGGAC-AACT-TTGATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTACATCGCCATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TATTAATAAT---AATG--------TTACGGTCTCCATAGCAACATGCATGCATGGT------T-AGTGCCACAGCTCAA-----ATTGTTGAACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATG-A-----TTTCCATGTAAAACTCACGGTAAATCATAT---ATTATTTGATGACAAGTCATCAATGTCT--ACAT
gi|134620                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134621                     :                                            TACGAGGTGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTATTA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATGGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTAAGTACATTTTT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCA-----------------GAACAATTTTGACTGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACTATG-A-----TTTTCCTGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGATGACACGTCATCAATGTCA--GCAT
gi|134622                     :                                            TACGAGGGGTTATCCTGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134623                     :                                            TACGACGGGTTATCCAGAAGTTCGTAGAC-AAAT-TTGATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTACATAGCTGTATTTGGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTTTAT---TTGTTGTCGATGTACAGTATTTTAATGCATTTGT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------ATATGGTCTCCTTAAC-ACATGCATACATGTT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACCA-TTTGACAGA-TAAATATTTG-A-----------AAAATA-ACAATG-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGTGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--ATAT
gi|134624                     :                                            TACGAGGGGTGTTCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---AGTATATCGCTATATTTTGCACAGCTGA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATTGATGTACAGTACTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAGCATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGTTCAA-----ATTGTTAAACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAACG-A-----ATTTCCTGTAAAACTTGCCGTAAATCATAT---ATTA-TTGATG-CGTGTCAT
gi|134625                     :                                            TACGAGGGGTTATCCGGAAGTTCATGGAT-AATG-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTAAATAGCTGTATTTTCCACAACTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCAT-GATGTACGGTTTTTTAGTATA----------------------TAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACAGAAC------T-AGTGCCGCAGCTTCA-----AATGTTTGACAA-TTCGACAGA-TAATCATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-C-----TTTTCCT-TAATACTCGAGGTGAAGCATAT---ATTA-TTGAGAACACATCATCAATGTCT--GCATG
gi|134626                     :                                            TACGAGGGGATATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------
gi|134627                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAC-TCAATACATTTGTTAAA-TCCA-TATTCAT--------TATATCGCTATATTTTGCACAGTTTC------AGAA--TTGGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AGCGTTGATCAG-CTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-AC--TG-A-----TTTCC--------CTCGTGGTAAATCATAT---ATTA-TTGAGGACACATCATCAATGTC
gi|134628                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTCTGTGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACAT----------------------------------TGGTGTAT---TTTCTATCAATGTGCGGTGTTTTAGTATATTT---------A---TATCAGTAAA---AATG--------TTATAGTATTCATTGCAACATACATACACAAT------T-AGTCCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAG-CTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATA-A-----TTTTCCTGTAAATCTCACGTTAAAACATAT---ATTA-TTGAGAACATGTCATCAATGTCT--GCA
gi|134629                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-ATAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134630                     :                                            TATGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-TTATTC--------ATA-TCCA-TATAAATGCA---AATACATTGCTATATT------------------------TTGGCGTAT---TTGTCTTCGATTTACAGTTTTTTAATGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCGTAGCACAATGCACACATGTT------A-AGTGCCGCAGCTCAA-----AATGTTGAACAA-TTTGACTGA-TAAATATGTG-A-----------AACATA-ACACTG-A-----TTTCCCTGTAAAACTC-TAGTAAGTCATAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAATGTCT--GCAT
gi|134631                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTTCAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCACTATATTTTGCTCAACATA------AGTA--TTGGTTTATTCATCATCATCAATGTACAGTAACTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTCAACAAT---AATGTTAAGGACTTATGGTATCCATAGCAACATGCATGTATGGT------T-AGTGCACCAGCTCAA-----AATGTTGAGCAA-TTTGACAGA-TAAATATTTG-A-----------AAGATA-ACATTC-A-----TTTGCCTGTATAAC-------ATATCA-AT---ATTA----AGGACACGCCATCAATGTCT--GCA
gi|134632                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-AAAATA--------AAA-TCCT-TAATTATGCA---AGTGCAGCTCCATATTTTGCACAACTGA------AGTG--TTGGTGTA----TTGTCATCGGTGTACAATATTTTAGTGTATTTCTAAAGC--A---TGTCAGTACT---AATT--------TTATGGTA--------ACCATGCATACATGTT------T-AGTGCTTCAGTTC-A-----TATGTTGAACAA-TTTGACAGA-TCAGTATGTG-A-----------AAAATA-ACAATA-G-----TTTCCATGT-AAACTCGCAGTAAATC-TAT---ATTA-TTGAGGACATGTCATCAAAGACT--GCAT
gi|134633                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAAGTTTGTGGAC-AATT-CTCATC--------AAA-T
gi|134634                     :                                            TACGGCGGGTTATGCAAAAGTTTTTGAAC-AAAT-TTAATA--------ACA-TTAA-TGATTATGCA---AGTACATCACTAT-TTTTTTACATCTTACATGTAAGTA--TTTGTGTAT---TTGACATCGATATCCAATTTTCTAGTGCATTTGT----T--A---CGTCAGTAAT---ACTG--------TTATGGTATCCATAGCAACTTGCATACATGGT------T-AATGCCGCAGTTAAA-----ATTGTTGAACAA-TTTGACAAG-TAAAT----------------------TA-ACAATC-G-----TTTCCATGTAAAACTTGCAGTTATTCATATATAATTA-TTGATGACATGTCAT
gi|134635                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGACAAAAT-CTCATA--------
gi|134636                     :                                            TACAAAAGGTTATCCAGAAGTTTGTAAAC-ACAT-TTCATA--------AAA-TTTA-TAT------A---AGTACATCGCTATATTTGGCAAAGCTTT------AGTG--CTG----AT---TTATTGTTGATAGCCGGTTTCTTATTGCATTTCT----T--ACTATGTCAGTAAT---CATG--------TTATGGTTTCCATAGCAATATGCATACTTGGTTACCGGT-AGTGCTGCAGCTCAA-----AATGTTTAACAG-TTTGACAGG-TGAGAATGTG-A-----------AAttatgaacatgacatgtctgatatattt
gi|134637                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134638                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-AAAT-CTC-CA--------AAA-TTCACTATGTATGTACAGAGTATA
gi|134639                     :                                            TACGAGGGGTTATCCAGAAGTTCGTGGAC-GAAT-GCTATA--------AAA-T
gi|134640                     :                                            TACGAGGGGTTATCAAGAGGTTCGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134641                     :                                            TACTAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------
gi|134642                     :                                            TACAAAGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134643                     :                                             ATGAGGGGTTATCCAGAAGTTGGTGGAC-AAAT-CTCATA--------ATA-T
gi|134644                     :                                             ACGAGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGCC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTCATGCA---TGTACATCGCTATATTTTGCACAGCCTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCAATGTACAGTATTTTAGTGCATTTCT----T--A---TGTTAATAAT---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----ATTGTTGCACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTGAA-----------AAAATA-ACAATT-A-----TTTCCCTGT-AAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-TTGATGACACATCATAAATGTCT--ACAT
gi|134645                     :                                             ACGAGGGGTTATCCA-AAGTTTGTGAAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCA-TATTTATGCA---AGTACATCGCTATAT
gi|134646                     :                                              CGAGGGGTGATCCAGAAGTTCATGGAC-AAAT-TTAATA--------AAA-TCCG-TATTCATGCA---AGAACATCGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGAT--TTTGTGTAT---TTGTCATCGATGTACAGAATTTTAGCGCATTTCA----T--A---TGTAAATAAA---AATG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-AGTGCCGCAGCTCAA-----AGTGTTGAACAA-TTTCACAGA-TAAATATTTG-G-----------AAAATA-ACAATG-G-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTAAATTATAT---ATTA-TTGATGACACGTCATCAATGTCA--ACAT
gi|134647                     :                                                AGGGGTTATCCAGAAGTTTGTGGAC-AAAT-GTCATA--------AAA-T
gi|134648                     :                                                      TATCCAGAAGTTCATG-AC-AAAA-TTAATA--------AT--TTCA-TATTCATGCA---AATACATTGCTATATTTTGCACAGCTTA------AGTA--TTGGTGTAT---TTGTCATCCATGTATTGTACTTTAGTGCATTTTT----TTTA---TGTTAAAAAT---ATTG--------TTATGGTCTCCATAGCAACATGCATACATGGT------T-TGTGTTGCAGCTCAA-----AATGCTGAACAA-TTTGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATATAAAATA-A-----TTTCCCAGTAAAACTCGCGGTAAATCATAT---ATTA-CTGAGGACACATCAACAATGTCT--GCAT
gi|134649                     :                                                              AATTTGTGGAC-GGAT-CTCATA--------AAA-TCAA-CATTTATGTA---AATACACCGCTACTCTCTACACA
gi|134649                     :                                                                                                                                                                                                     TTCT----T--A------CAGTAATTATAATG--------TCATTGTATCCATGGCAACATGCATACATGGG------T-AG---------------------------CAG-TTTGGTAG--TAAATATGTG-A-----------AAAATA-TTAAGT-G-----TCTCCTTGTACAAC---------ACC---T---ATTA-TTGACGATACGTCGTCATTATCT--GCATtcgacattcttacagtaattataatgtcattgtatccatggcaacatgcatacatgggtagcagtttggtagtaaatatgtgaaaaatattaagtgtctccttgtacaacacctattattgacgatacgtcgtcattatctgcat
gi|134650                     : aatttgtggacggatctcataaaatcaacatttatgtaaatacaccgctactctctacacatcgacaTGGAC-ACATGTTAATA--------AG--TCCA-AATTTATGTA---A----ATCGCTA--------AAAACTGA------GGTACTTTTGTGTCT---TCGATATC-ATGT-CAGTGTTTCACTGTATTTCT----C--A---CGCCAGTAAT---AATA--------TCATGGTATACAAAGAGGCATGCATTTATAGG------G-AACGCCGCAGCTCAA-----AATATTGAAAAG-TTTAACAGG-TAAACATACG-A-----------ATAA-A-ACAATC-G-----TTTCCCTGT-----------TAAATTACAG---AAGA-TT---GTCCCGTCATCAATATCT--ACAT
gi|134651                     :                                                                                                                                      CACAACTTA------AGTA--TTGATGTAT---TTCTCACCGACATCCAGTATTTCATTACACTCCT-----------TGTCCGTAAT---GATA--------TTGTCATTTTAATAGCA------ATAAA--GC------T-GGTGCCGCAGCTCAA-----AATGGTGAACA--------AGG-TAAGGATGCA-AAAAAAAACAACAAAAAA-ACAATC-G-----TATCTCTGTAAAATTTACAATAAATCATTT---ATTA-TTAATGATACGTTATCAATGTCTTCGTATG
gi|134652                     :                                                                                                                                                                                                    TTTCT----T--A---TGTCAGTAAT---AATG--------TTATGGTATCCATAGCAACATACATACAGGAT------T-AGTGTCGCAGCTCAA-----AATGTTAAACAA-TTCGACAGA-TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATA-ATTGATTTTCCCTGTAACACTCGTGGTGAAGCCTAT---ATTA-TTGAGAACACGTCATCAATGTTT--GCATG
gi|134653                     :                                                                                                                                                                                                                             T---AATA--------TTATATTATCTATAGCAACATGCATACATGGG------TGAGCACCGCAACTCAA-----AATAATGAAAAA-TTTG-TAGAGTCAACATGTG-A-----------AAAATG-ATGAGT-G-----TGTCCCTACAAGATTCGCAGGAAATCATA
gi|134654                     :                                                                                                                                                                                                                                                        ATAGCAACATACGTACATGAT------T-GATGCCGCAGCTCAAATCAAAATGTTGAACAA-TTTGAGAGT-TAAATATGTG-A-----------AATATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCGGTGAATCATAT---GTTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCATG
gi|134655                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                    -AGTGCTAAAGCTTAA-----AATGTTGAATAA-TTTGACAGG-TAAGTATGC--A-----------CAAATA---AACG-A-----GTTCCCAGTAAAATTTGCGGTACCTCATAT---ATTA-GTAAAGGCACGT
gi|134656                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                taAA-----AGTGTTGAACAA-TTCGACAGT-TAGATATGTG-A-----------AATATA-ACAATC-A-----TTTCCCTGTAAAACTCGCTGTCAATGATAT---ATTA-TTGAAGACACGTCATCAATGTCT--GCAT
gi|134657                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATCAA-TTTGACA---TAAATATGTG-A-----------AAAATA-ACAATC-A-----TTTCCTTGTAAATCTCATTGTAAATCATAT---ATTG-CTTAGGACGTGTCATCAATGTAT--GCAT
gi|134658                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A-CAAATTTGTG-A-----------ATAATA-ACAGTC-A-----TTTTCCCGTAACACTCGCGGTAAATCATAT---ATAA-TTGAGGACACGGCATCAATGTCT--GCATG
gi|134659                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TATGTG-A-----------AAAATT-ACTATC-A-----TTTTCCCGTGAAACTCGCGGTATATCATAT---AT