lowQualScore                  :                                                                 1                  
lowQualScore                  :      0                2 4                                     0 0  0  1 0  2       
lowQualScore                  :      .                . .                                     . .  .  . .  .       
lowQualScore                  :      8                7 0                                     4 1  4  6 4  2       
consensus                     : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
Reference ( gi|33616 )        : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCTGGCAACA
gi|33673                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTCCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33690                      : GACCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33680                      : GGCCC-GATTAACTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33758                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33756                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33755                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33753                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CCTCC-G-CCCGGCAACA
gi|33752                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33745                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33742                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33741                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33730                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAATT-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33626                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33632                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAT-T-CC-CC-G-CCTGGCAACA
gi|33799                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTGTCAACCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33658                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTATGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33655                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTG-CCCGGCAACA
gi|33660                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33668                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-G-CCTGGCAACA
gi|33665                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-G-CCTAGCAACA
gi|33663                      : GGCTC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTG-CCTGGCAACA
gi|33681                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAATTCGAA-C-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33695                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33672                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTGA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33736                      : GGCCC-GATTGGCTCAGTTTGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33778                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33773                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CCTG-CCCGGCAACA
gi|33766                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGCTTGAA-TCCC-CC-G-CCTGGCAACA
gi|33764                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCAAA-T-AC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33763                      : GGTCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTG-CCCGGCAACA
gi|33762                      : GGCCC-GATTAGCTTAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33784                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCTGGCAACA
gi|33807                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTCGGTTG-CGCGTCTGACTATCAACCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CTCGGCAACA
gi|33723                      : GGCCC-GATTAGTTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTGGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-G-CCTGGCAACA
gi|33676                      : GACCA-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33611                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CTGGGCAACA
gi|33667                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-G-CCCAGCAACA
gi|33666                      : GGCCC-GATTATCTCAGTTGGTTA-CGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33662                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-A-CCCGGCAACA
gi|33793                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTAGGTTA-TGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-A-CCTGGCAACA
gi|33619                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCAGTTA-CATGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CT-CC-G-CCTGGCAACA
gi|33782                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGC
gi|33759                      : GGCCC-GACTAGCTCAGTCGGTTA-CATGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33643                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGCGTCTGACTATCAATCCAGAGGCCGTGAGTTCGAA-T-TC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33645                      : GGCCC-GATTAGCTCAGCCGATAA-CGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33656                      : GGCCA-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33625                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTAGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33644                      : GGCCC-GATTAGATCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33647                      : GGCCCTGATTAGCTCAGTTTGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CCTGGCAACA
gi|33748                      : GGTCC-GATTAGCTCAGGCGGTAA-AGCGTCTGACTATCAATCCAGAGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCTGGCAACA
gi|33692                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGAGT-GTAAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCTACA
gi|33603                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGAGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CCTGGTAACA
gi|33636                      : GGCCC-AATTAGCTGAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCCACA
gi|33726                      : GGCCC-GGTCAGCTCAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-T-CC-AC-G-CCCGGCAACA
gi|33703                      : GGCCC-AATTAGCTTAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTAAA-T-CC-CC-T-CCTGACAACA
gi|33615                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTTGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-A-CCTGG
gi|33754                      : GGCCC-GATTAGCTCACTCGGTAG-CGCGTCTGATTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTAAA-T-CC-CC-T-CCCGGCAACA
gi|33601                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCAAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCCACA
gi|33790                      : GGCCC-GATTAGCACAGTTGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCTGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CT-G-CCCAGCAACA
gi|33711                      : GGCCT-GATTAGCTTAGTTGGTTG-CGCGTTTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-A-CCCAGCAACA
gi|33634                      : GGCCC-AATTAGCTC-GTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|33608                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCAATAG-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCACGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCCACA
gi|33725                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCCTGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-T-CCCGGCCAC
gi|33617                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTGGAA-T-CC-CT-G-TCCAGCAACA
gi|33737                      : GGCCC-GGTTAACTCAGTCGATTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGTA-T-CC-CC-A-CCTGGC
gi|33653                      : GGTCT-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTATGAGTTTGGA-T-CC-CT-G-CCCGGCAACA
gi|33650                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGGGTCATGAGTTTAAA-T-CC-CC-G-CTCGGCCACA
gi|33720                      : GGCCT-TATTAGCTCAGTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGCGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CCCTGCAACA
gi|33699                      : GGTCC-GATTAGCTTAGTTG-TTAGCGCGTTTGTCTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCCACA
gi|33598                      : GGCCC-GATTAGTTCAGTTGGTAG-TGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-TC-G-CCCGGCCACA
gi|33727                      : GGCCT-GATTAACTCAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CT-A-CTCGGCCACA
gi|33648                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCCTGAGTTTGAA-T-CC-CT-A-CCAGGTCACA
gi|33629                      : GGCCC-GATAAGCTCAGTTG-TTAGCGAGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-A-TCTGGCCACA
gi|33809                      : GGCAC-GGTTAGCTCAGTCGGAAG-TGCGCCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-TC-A-CCCGGCCACA
gi|33609                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTTGGTAG-CGCATCTGAATATCAGTCCAGGGGTTGTTAGTTTGAA-T-CC-CG-G-CCTGGCAACA
gi|33732                      : GGTTC-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CATGCCTGACTATCAATCAAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CT-G-TCTGGCTACA
gi|33675                      : GGACC-GGTTAGCTCAGTCGGTAG-CACGTCTGACTATCAATCCGGTGATCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-A-CCCGGTCACA
gi|33769                      : GGACC-GGTTGGCTTAGTCGTTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGTGGTTGTGAGTTCAAA-T-TC-CC-G-CCTGGCCACA
gi|33765                      : GGCCA-TGTTAGCTCAGTCAGTAG-TGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCTTGAGTTTGAA-T-CC-CC-A-CCTGGCCACA
gi|33687                      : GGTCT-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGTGTTTGACTATCAATCCAGGAGTTGTGGGTTTGAA-T-CC-CC-A-CCCAGCCACA
gi|33706                      : GGCCCTGTTTAGCTCAGTCAGTAG-CACGTCTGATTATCAATCCAGGGGTTGTGAATTCGAA-T-CC-CC-A-TTTGGCCACA
gi|33624                      : GGTCC-TGTTAGCTCAGTTTGT-A--GCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CATGGCCACA
gi|33640                      : GACCC-GGTTAGCTCAGTTGGTAG-CACATCTGACTATAAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CA-TC-G-CCTGTCA
gi|33724                      : GGCAT-GTTTAGCTCAGTCGGTAG-CACATCTAACTATCAATTCA-GGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CT-G-CCTGGCCACAca
gi|33679                      : GGCTT-GGTTAGCTCTGTTGGT-A--GTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAATTTGAA-T-CT-CT-G-CCTGGCCACA
gi|33621                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTTGGTGG-CAGGTCTGACTATCAATCCAGGGATTTCGAGTTTGAA-T-CC-CT-G-CCCTGCCACA
gi|33710                      : GGCCT-CGTTAGCTCAGTCAGTAG-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T----CT-GATCTGGCCACA
gi|33627                      : GACCC-AGTTAGCTCAATTGGTAG-CATGTCTGACTATCAATCTAGGGGTTGTGAGTTTGAA-A-CC-CC-A-CCCAGCCACA
gi|34128                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTAGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|34116                      :  GTCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-AC-G-CCCGGCCACA
gi|34117                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGCGTCTAACTATCAATCCAAGGGTTGTGAGTTCGCA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA
gi|34120                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAAGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-G-CTCAGCCACA
gi|34134                      :  GCCT-GGTTAGCTCAGTCGGT-A----GTCTGACTACCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-A-CCTGG
gi|34183                      :   CCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-G-CCCGGCAACAacaca
gi|34174                      :   CTC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CATATCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-TT-CT-G-CCCGGCCACA
gi|34235                      :      -GGTTAGCTCAGTTGGTAG-TGTGTCTGATTATCAATCCAGGGATTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CCAGGCAACA
gi|34286                      :         TTAGCTCAGTTGGTAA-TGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CT-CT-G-CCCGGC
gi|34269                      :         TTAGCTCAGTTGGTAG-CATGTCTGACAATCAATCCAGTGGTTGTGAGTTTGAA-T-CA-CT-G-CCCGGCCACAtata
gi|34323                      :            gCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-G-CCCGGCAACA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                 1                 
lowQualScore                  :      0                2 4                                     0 0  0  1           
lowQualScore                  :      .                . .                                     . .  .  .           
lowQualScore                  :      8                6 0                                     4 0  4  6           
consensus                     : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
Reference ( family-47 )       : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33598                      : GGCCC-GATTAGTTCAGTTGGTAG-TGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-TC-GCCCGGCCACA
gi|33601                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCAAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33603                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGAGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCTGGTAACA
gi|33608                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCAATAG-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCACGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33609                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTTGGTAG-CGCATCTGAATATCAGTCCAGGGGTTGTTAGTTTGAA-T-CC-CG-GCCTGGCAACA
gi|33611                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCTGGGCAACA
gi|33615                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTTGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGG
gi|33616                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33617                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTGGAA-T-CC-CT-GTCCAGCAACA
gi|33619                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCAGTTA-CATGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CT-CC-GCCTGGCAACA
gi|33621                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTTGGTGG-CAGGTCTGACTATCAATCCAGGGATTTCGAGTTTGAA-T-CC-CT-GCCCTGCCACA
gi|33624                      : GGTCC-TGTTAGCTCAGTTTGT-A--GCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCATGGCCACA
gi|33625                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTAGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33626                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33627                      : GACCC-AGTTAGCTCAATTGGTAG-CATGTCTGACTATCAATCTAGGGGTTGTGAGTTTGAA-A-CC-CC-ACCCAGCCACA
gi|33629                      : GGCCC-GATAAGCTCAGTTG-TTAGCGAGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-ATCTGGCCACA
gi|33632                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAT-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33634                      : GGCCC-AATTAGCTC-GTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33636                      : GGCCC-AATTAGCTGAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33640                      : GACCC-GGTTAGCTCAGTTGGTAG-CACATCTGACTATAAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CA-TC-GCCTGTCA
gi|33643                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGCGTCTGACTATCAATCCAGAGGCCGTGAGTTCGAA-T-TC-CC-GCCCGGCAACAca
gi|33644                      : GGCCC-GATTAGATCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33645                      : GGCCC-GATTAGCTCAGCCGATAA-CGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33647                      : GGCCCTGATTAGCTCAGTTTGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33648                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCCTGAGTTTGAA-T-CC-CT-ACCAGGTCACA
gi|33650                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGGGTCATGAGTTTAAA-T-CC-CC-GCTCGGCCACA
gi|33653                      : GGTCT-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTATGAGTTTGGA-T-CC-CT-GCCCGGCAACA
gi|33655                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTGCCCGGCAACA
gi|33656                      : GGCCA-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33658                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTATGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33660                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33662                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-ACCCGGCAACA
gi|33663                      : GGCTC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTGCCTGGCAACA
gi|33665                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCTAGCAACA
gi|33666                      : GGCCC-GATTATCTCAGTTGGTTA-CGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33667                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCAGCAACA
gi|33668                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33672                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTGA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33673                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTCCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33675                      : GGACC-GGTTAGCTCAGTCGGTAG-CACGTCTGACTATCAATCCGGTGATCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-ACCCGGTCACA
gi|33676                      : GACCA-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33679                      : GGCTT-GGTTAGCTCTGTTGGT-A--GTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAATTTGAA-T-CT-CT-GCCTGGCCACA
gi|33680                      : GGCCC-GATTAACTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33681                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAATTCGAA-C-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33687                      : GGTCT-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGTGTTTGACTATCAATCCAGGAGTTGTGGGTTTGAA-T-CC-CC-ACCCAGCCACA
gi|33690                      : GACCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33692                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGAGT-GTAAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCTACA
gi|33695                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33699                      : GGTCC-GATTAGCTTAGTTG-TTAGCGCGTTTGTCTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33703                      : GGCCC-AATTAGCTTAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTAAA-T-CC-CC-TCCTGACAACA
gi|33706                      : GGCCCTGTTTAGCTCAGTCAGTAG-CACGTCTGATTATCAATCCAGGGGTTGTGAATTCGAA-T-CC-CC-ATTTGGCCACA
gi|33710                      : GGCCT-CGTTAGCTCAGTCAGTAG-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-C
gi|33711                      : GGCCT-GATTAGCTTAGTTGGTTG-CGCGTTTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCCAGCAACAtgatctggccaca
gi|33720                      : GGCCT-TATTAGCTCAGTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGCGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCTGCAACA
gi|33723                      : GGCCC-GATTAGTTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTGGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33724                      : GGCAT-GTTTAGCTCAGTCGGTAG-CACATCTAACTATCAATTCA-GGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CT-GCCTGGCCACA
gi|33725                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCCTGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-TCCCGGCCAC
gi|33726                      : GGCCC-GGTCAGCTCAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-T-CC-AC-GCCCGGCAACA
gi|33727                      : GGCCT-GATTAACTCAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CT-ACTCGGCCACA
gi|33730                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAATT-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33732                      : GGTTC-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CATGCCTGACTATCAATCAAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CT-GTCTGGCTACA
gi|33736                      : GGCCC-GATTGGCTCAGTTTGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33737                      : GGCCC-GGTTAACTCAGTCGATTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGTA-T-CC-CC-ACCTGGC
gi|33741                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33742                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33745                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33748                      : GGTCC-GATTAGCTCAGGCGGTAA-AGCGTCTGACTATCAATCCAGAGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33752                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33753                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CCTCC-GCCCGGCAACA
gi|33754                      : GGCCC-GATTAGCTCACTCGGTAG-CGCGTCTGATTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTAAA-T-CC-CC-TCCCGGCAACA
gi|33755                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33756                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33758                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33759                      : GGCCC-GACTAGCTCAGTCGGTTA-CATGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33762                      : GGCCC-GATTAGCTTAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33763                      : GGTCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTGCCCGGCAACA
gi|33764                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCAAA-T-AC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33765                      : GGCCA-TGTTAGCTCAGTCAGTAG-TGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCTTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGGCCACA
gi|33766                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGCTTGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33769                      : GGACC-GGTTGGCTTAGTCGTTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGTGGTTGTGAGTTCAAA-T-TC-CC-GCCTGGCCACA
gi|33773                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CCTGCCCGGCAACA
gi|33778                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33782                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGC
gi|33784                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33790                      : GGCCC-GATTAGCACAGTTGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCTGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CT-GCCCAGCAACA
gi|33793                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTAGGTTA-TGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGGCAACA
gi|33799                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTGTCAACCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33807                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTCGGTTG-CGCGTCTGACTATCAACCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCTCGGCAACA
gi|33809                      : GGCAC-GGTTAGCTCAGTCGGAAG-TGCGCCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-TC-ACCCGGCCACA
gi|34116                      :  GTCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-AC-GCCCGGCCACA
gi|34117                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGCGTCTAACTATCAATCCAAGGGTTGTGAGTTCGCA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|34120                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAAGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCTCAGCCACA
gi|34128                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTAGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|34134                      :  GCCT-GGTTAGCTCAGTCGGT-A----GTCTGACTACCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGG
gi|34174                      :   CTC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CATATCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-TT-CT-GCCCGGCCACAacaca
gi|34183                      :   CCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|34235                      :      -GGTTAGCTCAGTTGGTAG-TGTGTCTGATTATCAATCCAGGGATTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCAGGCAACA
gi|34269                      :         TTAGCTCAGTTGGTAG-CATGTCTGACAATCAATCCAGTGGTTGTGAGTTTGAA-T-CA-CT-GCCCGGCCACA
gi|34286                      :        gTTAGCTCAGTTGGTAA-TGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CT-CT-GCCCGGC
gi|34323                      :             CTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACAtata





Alignments
lowQualScore                  :                                                                 1                 
lowQualScore                  :      0                2 4                                     0 0  0  1           
lowQualScore                  :      .                . .                                     . .  .  .           
lowQualScore                  :      8                6 0                                     4 0  4  6           
consensus                     : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
Reference ( family-47 )       : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33598                      : GGCCC-GATTAGTTCAGTTGGTAG-TGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-TC-GCCCGGCCACA
gi|33601                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCAAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33603                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGAGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCTGGTAACA
gi|33608                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCAATAG-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCACGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33609                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTTGGTAG-CGCATCTGAATATCAGTCCAGGGGTTGTTAGTTTGAA-T-CC-CG-GCCTGGCAACA
gi|33611                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCTGGGCAACA
gi|33615                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTTGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGG
gi|33616                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33617                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTGGAA-T-CC-CT-GTCCAGCAACA
gi|33619                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCAGTTA-CATGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CT-CC-GCCTGGCAACA
gi|33621                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTTGGTGG-CAGGTCTGACTATCAATCCAGGGATTTCGAGTTTGAA-T-CC-CT-GCCCTGCCACA
gi|33624                      : GGTCC-TGTTAGCTCAGTTTGT-A--GCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCATGGCCACA
gi|33625                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTAGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33626                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33627                      : GACCC-AGTTAGCTCAATTGGTAG-CATGTCTGACTATCAATCTAGGGGTTGTGAGTTTGAA-A-CC-CC-ACCCAGCCACA
gi|33629                      : GGCCC-GATAAGCTCAGTTG-TTAGCGAGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-ATCTGGCCACA
gi|33632                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAT-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33634                      : GGCCC-AATTAGCTC-GTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33636                      : GGCCC-AATTAGCTGAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33640                      : GACCC-GGTTAGCTCAGTTGGTAG-CACATCTGACTATAAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CA-TC-GCCTGTCA
gi|33643                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGCGTCTGACTATCAATCCAGAGGCCGTGAGTTCGAA-T-TC-CC-GCCCGGCAACAca
gi|33644                      : GGCCC-GATTAGATCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33645                      : GGCCC-GATTAGCTCAGCCGATAA-CGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33647                      : GGCCCTGATTAGCTCAGTTTGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33648                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCCTGAGTTTGAA-T-CC-CT-ACCAGGTCACA
gi|33650                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGGGTCATGAGTTTAAA-T-CC-CC-GCTCGGCCACA
gi|33653                      : GGTCT-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTATGAGTTTGGA-T-CC-CT-GCCCGGCAACA
gi|33655                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTGCCCGGCAACA
gi|33656                      : GGCCA-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33658                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTATGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33660                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33662                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-ACCCGGCAACA
gi|33663                      : GGCTC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTGCCTGGCAACA
gi|33665                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCTAGCAACA
gi|33666                      : GGCCC-GATTATCTCAGTTGGTTA-CGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33667                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCAGCAACA
gi|33668                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33672                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTGA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33673                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTCCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33675                      : GGACC-GGTTAGCTCAGTCGGTAG-CACGTCTGACTATCAATCCGGTGATCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-ACCCGGTCACA
gi|33676                      : GACCA-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33679                      : GGCTT-GGTTAGCTCTGTTGGT-A--GTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAATTTGAA-T-CT-CT-GCCTGGCCACA
gi|33680                      : GGCCC-GATTAACTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33681                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAATTCGAA-C-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33687                      : GGTCT-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGTGTTTGACTATCAATCCAGGAGTTGTGGGTTTGAA-T-CC-CC-ACCCAGCCACA
gi|33690                      : GACCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33692                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGAGT-GTAAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCTACA
gi|33695                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33699                      : GGTCC-GATTAGCTTAGTTG-TTAGCGCGTTTGTCTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33703                      : GGCCC-AATTAGCTTAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTAAA-T-CC-CC-TCCTGACAACA
gi|33706                      : GGCCCTGTTTAGCTCAGTCAGTAG-CACGTCTGATTATCAATCCAGGGGTTGTGAATTCGAA-T-CC-CC-ATTTGGCCACA
gi|33710                      : GGCCT-CGTTAGCTCAGTCAGTAG-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-C
gi|33711                      : GGCCT-GATTAGCTTAGTTGGTTG-CGCGTTTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCCAGCAACAtgatctggccaca
gi|33720                      : GGCCT-TATTAGCTCAGTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGCGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCTGCAACA
gi|33723                      : GGCCC-GATTAGTTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTGGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33724                      : GGCAT-GTTTAGCTCAGTCGGTAG-CACATCTAACTATCAATTCA-GGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CT-GCCTGGCCACA
gi|33725                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCCTGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-TCCCGGCCAC
gi|33726                      : GGCCC-GGTCAGCTCAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-T-CC-AC-GCCCGGCAACA
gi|33727                      : GGCCT-GATTAACTCAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CT-ACTCGGCCACA
gi|33730                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAATT-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33732                      : GGTTC-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CATGCCTGACTATCAATCAAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CT-GTCTGGCTACA
gi|33736                      : GGCCC-GATTGGCTCAGTTTGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33737                      : GGCCC-GGTTAACTCAGTCGATTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGTA-T-CC-CC-ACCTGGC
gi|33741                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33742                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33745                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33748                      : GGTCC-GATTAGCTCAGGCGGTAA-AGCGTCTGACTATCAATCCAGAGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33752                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33753                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CCTCC-GCCCGGCAACA
gi|33754                      : GGCCC-GATTAGCTCACTCGGTAG-CGCGTCTGATTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTAAA-T-CC-CC-TCCCGGCAACA
gi|33755                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33756                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33758                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33759                      : GGCCC-GACTAGCTCAGTCGGTTA-CATGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33762                      : GGCCC-GATTAGCTTAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33763                      : GGTCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTGCCCGGCAACA
gi|33764                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCAAA-T-AC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33765                      : GGCCA-TGTTAGCTCAGTCAGTAG-TGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCTTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGGCCACA
gi|33766                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGCTTGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33769                      : GGACC-GGTTGGCTTAGTCGTTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGTGGTTGTGAGTTCAAA-T-TC-CC-GCCTGGCCACA
gi|33773                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CCTGCCCGGCAACA
gi|33778                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33782                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGC
gi|33784                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33790                      : GGCCC-GATTAGCACAGTTGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCTGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CT-GCCCAGCAACA
gi|33793                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTAGGTTA-TGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGGCAACA
gi|33799                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTGTCAACCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33807                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTCGGTTG-CGCGTCTGACTATCAACCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCTCGGCAACA
gi|33809                      : GGCAC-GGTTAGCTCAGTCGGAAG-TGCGCCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-TC-ACCCGGCCACA
gi|34116                      :  GTCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-AC-GCCCGGCCACA
gi|34117                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGCGTCTAACTATCAATCCAAGGGTTGTGAGTTCGCA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|34120                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAAGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCTCAGCCACA
gi|34128                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTAGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|34134                      :  GCCT-GGTTAGCTCAGTCGGT-A----GTCTGACTACCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGG
gi|34174                      :   CTC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CATATCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-TT-CT-GCCCGGCCACAacaca
gi|34183                      :   CCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|34235                      :      -GGTTAGCTCAGTTGGTAG-TGTGTCTGATTATCAATCCAGGGATTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCAGGCAACA
gi|34269                      :         TTAGCTCAGTTGGTAG-CATGTCTGACAATCAATCCAGTGGTTGTGAGTTTGAA-T-CA-CT-GCCCGGCCACA
gi|34286                      :        gTTAGCTCAGTTGGTAA-TGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CT-CT-GCCCGGC
gi|34323                      :             CTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACAtata


blockSeqs                     :                       T G                                       C     T
blockSeqs                     :                       T G                                       C     T
blockSeqs                     :                       A G                                       C     T
blockSeqs                     :                       A G                                       C     T
blockSeqs                     :                       A G                                       C     .
blockSeqs                     :                       T G                                       C     .
blockSeqs                     :                       T G                                       C     .
blockSeqs                     :                       A G                                       C     .
blockSeqs                     :                       T G                                       C     .
blockSeqs                     :                       G G                                       C     .
blockSeqs                     :                       A .                                       C     .
blockSeqs                     :                       T .                                       C     .
blockSeqs                     :                       A .                                       C     .
blockSeqs                     :                       T .                                       C     .
blockSeqs                     :                       T .                                       C     .
blockSeqs                     :                       A .                                       C     .
blockSeqs                     :                       T .                                       C     .
blockSeqs                     :                       A .                                       C     .
blockSeqs                     :                       A .                                       C     .
blockSeqs                     :                       T .                                       C     .
blockSeqs                     :                       A .                                       C     .
blockSeqs                     :                       T .                                       C     .
blockSeqs                     :                       A .                                       C     .
blockSeqs                     :                       T .                                       C     .
blockSeqs                     :                       A .                                       C     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       G .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       T .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       A .                                       .     .
blockSeqs                     :                       . .                                       .     .
blockSeqs                     :                       . .                                       .     .
blockSeqs                     :                       . .                                       .      


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
finalCons                     : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                 1                 
lowQualScore                  :      0                2 4                                     0 0  0  1           
lowQualScore                  :      .                . .                                     . .  .  .           
lowQualScore                  :      8                6 0                                     4 0  4  6           
consensus                     : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
Reference ( family-47 )       : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33598                      : GGCCC-GATTAGTTCAGTTGGTAG-TGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-TC-GCCCGGCCACA
gi|33601                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCAAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33603                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGAGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCTGGTAACA
gi|33608                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCAATAG-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCACGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33609                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTTGGTAG-CGCATCTGAATATCAGTCCAGGGGTTGTTAGTTTGAA-T-CC-CG-GCCTGGCAACA
gi|33611                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCTGGGCAACA
gi|33615                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTTGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGG
gi|33616                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33617                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTGGAA-T-CC-CT-GTCCAGCAACA
gi|33619                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCAGTTA-CATGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CT-CC-GCCTGGCAACA
gi|33621                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTTGGTGG-CAGGTCTGACTATCAATCCAGGGATTTCGAGTTTGAA-T-CC-CT-GCCCTGCCACA
gi|33624                      : GGTCC-TGTTAGCTCAGTTTGT-A--GCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCATGGCCACA
gi|33625                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTAGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33626                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33627                      : GACCC-AGTTAGCTCAATTGGTAG-CATGTCTGACTATCAATCTAGGGGTTGTGAGTTTGAA-A-CC-CC-ACCCAGCCACA
gi|33629                      : GGCCC-GATAAGCTCAGTTG-TTAGCGAGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-ATCTGGCCACA
gi|33632                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAT-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33634                      : GGCCC-AATTAGCTC-GTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33636                      : GGCCC-AATTAGCTGAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33640                      : GACCC-GGTTAGCTCAGTTGGTAG-CACATCTGACTATAAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CA-TC-GCCTGTCA
gi|33643                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGCGTCTGACTATCAATCCAGAGGCCGTGAGTTCGAA-T-TC-CC-GCCCGGCAACAca
gi|33644                      : GGCCC-GATTAGATCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33645                      : GGCCC-GATTAGCTCAGCCGATAA-CGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33647                      : GGCCCTGATTAGCTCAGTTTGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33648                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCCTGAGTTTGAA-T-CC-CT-ACCAGGTCACA
gi|33650                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGGGTCATGAGTTTAAA-T-CC-CC-GCTCGGCCACA
gi|33653                      : GGTCT-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTATGAGTTTGGA-T-CC-CT-GCCCGGCAACA
gi|33655                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTGCCCGGCAACA
gi|33656                      : GGCCA-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33658                      : GGCCC-GGTTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTATGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33660                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33662                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-ACCCGGCAACA
gi|33663                      : GGCTC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTGCCTGGCAACA
gi|33665                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCTAGCAACA
gi|33666                      : GGCCC-GATTATCTCAGTTGGTTA-CGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33667                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCAGCAACA
gi|33668                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33672                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTGA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33673                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTCCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33675                      : GGACC-GGTTAGCTCAGTCGGTAG-CACGTCTGACTATCAATCCGGTGATCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-ACCCGGTCACA
gi|33676                      : GACCA-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33679                      : GGCTT-GGTTAGCTCTGTTGGT-A--GTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAATTTGAA-T-CT-CT-GCCTGGCCACA
gi|33680                      : GGCCC-GATTAACTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33681                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAATTCGAA-C-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33687                      : GGTCT-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGTGTTTGACTATCAATCCAGGAGTTGTGGGTTTGAA-T-CC-CC-ACCCAGCCACA
gi|33690                      : GACCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33692                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGAGT-GTAAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCTACA
gi|33695                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33699                      : GGTCC-GATTAGCTTAGTTG-TTAGCGCGTTTGTCTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCCACA
gi|33703                      : GGCCC-AATTAGCTTAGTCGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTAAA-T-CC-CC-TCCTGACAACA
gi|33706                      : GGCCCTGTTTAGCTCAGTCAGTAG-CACGTCTGATTATCAATCCAGGGGTTGTGAATTCGAA-T-CC-CC-ATTTGGCCACA
gi|33710                      : GGCCT-CGTTAGCTCAGTCAGTAG-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-C
gi|33711                      : GGCCT-GATTAGCTTAGTTGGTTG-CGCGTTTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCCAGCAACAtgatctggccaca
gi|33720                      : GGCCT-TATTAGCTCAGTTGGTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGCGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCTGCAACA
gi|33723                      : GGCCC-GATTAGTTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTGGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33724                      : GGCAT-GTTTAGCTCAGTCGGTAG-CACATCTAACTATCAATTCA-GGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CT-GCCTGGCCACA
gi|33725                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCCTGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-TCCCGGCCAC
gi|33726                      : GGCCC-GGTCAGCTCAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-T-CC-AC-GCCCGGCAACA
gi|33727                      : GGCCT-GATTAACTCAGTCG-TTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CT-ACTCGGCCACA
gi|33730                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAATT-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33732                      : GGTTC-GATTAGCTCAGTTGGTAA-CATGCCTGACTATCAATCAAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CT-GTCTGGCTACA
gi|33736                      : GGCCC-GATTGGCTCAGTTTGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33737                      : GGCCC-GGTTAACTCAGTCGATTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGTA-T-CC-CC-ACCTGGC
gi|33741                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33742                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33745                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33748                      : GGTCC-GATTAGCTCAGGCGGTAA-AGCGTCTGACTATCAATCCAGAGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33752                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33753                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CCTCC-GCCCGGCAACA
gi|33754                      : GGCCC-GATTAGCTCACTCGGTAG-CGCGTCTGATTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTAAA-T-CC-CC-TCCCGGCAACA
gi|33755                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33756                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33758                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33759                      : GGCCC-GACTAGCTCAGTCGGTTA-CATGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33762                      : GGCCC-GATTAGCTTAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33763                      : GGTCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CCTGCCCGGCAACA
gi|33764                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCAAA-T-AC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33765                      : GGCCA-TGTTAGCTCAGTCAGTAG-TGTGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCTTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGGCCACA
gi|33766                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGCTTGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33769                      : GGACC-GGTTGGCTTAGTCGTTAA-CACGTCTGACTATCAATCCAGTGGTTGTGAGTTCAAA-T-TC-CC-GCCTGGCCACA
gi|33773                      : GGCCT-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CCTGCCCGGCAACA
gi|33778                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CACGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33782                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGC
gi|33784                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCTGGCAACA
gi|33790                      : GGCCC-GATTAGCACAGTTGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCTGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-CC-CT-GCCCAGCAACA
gi|33793                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTAGGTTA-TGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGGCAACA
gi|33799                      : GGCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTGTCAACCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|33807                      : GGCCC-AATTAGCTCAGTCGGTTG-CGCGTCTGACTATCAACCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCTCGGCAACA
gi|33809                      : GGCAC-GGTTAGCTCAGTCGGAAG-TGCGCCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-TC-ACCCGGCCACA
gi|34116                      :  GTCC-GATTAGCTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-AC-GCCCGGCCACA
gi|34117                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CGCGTCTAACTATCAATCCAAGGGTTGTGAGTTCGCA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|34120                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTC-GTTAGCGCGTCTGACTATCAATCCAAGGGTCGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCTCAGCCACA
gi|34128                      :  GCCC-GATTAGCTCAGTCGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTAGTGAGTTCGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACA
gi|34134                      :  GCCT-GGTTAGCTCAGTCGGT-A----GTCTGACTACCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-ACCTGG
gi|34174                      :   CTC-GATTAGCTCAGTCGGTAG-CATATCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-TT-CT-GCCCGGCCACAacaca
gi|34183                      :   CCC-GATTAGCTCAGTTGGTTA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCCC-CC-GCCCGGCAACA
gi|34235                      :      -GGTTAGCTCAGTTGGTAG-TGTGTCTGATTATCAATCCAGGGATTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCAGGCAACA
gi|34269                      :         TTAGCTCAGTTGGTAG-CATGTCTGACAATCAATCCAGTGGTTGTGAGTTTGAA-T-CA-CT-GCCCGGCCACA
gi|34286                      :        gTTAGCTCAGTTGGTAA-TGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CT-CT-GCCCGGC
gi|34323                      :             CTCAGTCGGTAA-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTTGTGAGTTTGAA-T-CC-CC-GCCCGGCAACAtata