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lowQualScore                  :       .   ..       .     ..  ...      ..     .........                .. . .  .      .......     .......    .                ..      .   ......    .    ...       ...      .   .         .   .    ......     ...... .  ...                     ....    ... .............. ....... .  .................   ....          ..          .      ....  ....... .......    ..              .          .  ...  . ...  ...    .... ..  .... . ......   .. .   .    ...    .        ...   ......  .      . ...   .........  .   .   .... .  ..    ... . .             .   
lowQualScore                  :       7   99       9     22  000      99     444444444                11 7 7  7      2222222     9999999    7                22      7   111111    4    888       666      4   7         3   0    555555     111111 4  333                     1111    666 88888888888888 8888888 5  00000000000000000   0000          99          4      6666  9999999 6666666    55              0          2  222  2 999  333    7777 77  7777 8 666666   77 2   2    333    3        333   777777  8      4 999   000000000  2   4   0000 9  00    666 5 0             4   
consensus                     : AATTATTCACNGAGCTTAAATGGAT--GA-C-GTTTCC--TGAAA---------GGGTTAAATTTCAAAAA-G-CAGT-ACTCGTG------TATAA------ATCAT-TTAATGACCAGGCTCC--TGCATA-TCT-C-AAAGATTTATTT---ACTCTAA---CAGCTA-ATGTTCATACACGCACATTACGG-----TCATC------C-TC--TAATCTACAGTTGTATTCTCCT----AAGC---C-------------NA-------A-TT-----------------CTG----AAATGTTTCG--AAATTCGTTTGCTTATT----CA-------G----GC-TCTTG-TTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-A---AA---TGCA----A--AT----TCT------ATT--A-ATC-AGTT---CAAA-GCTTTATA---TTT------ACAATGGAG-T---AAAN--A-----TTCTTA-GCA----ACTC--TAAT-A-A-A-TCGGGTAGCTCTCATCA
Reference ( gi|105923 )       : AATTATCCACAGAGCTTAACTGGAT--GA-T-GTTTCC--TGAAA---------GAGTTAAATTTCAAAAA-G-CTGT-ACTTATA------TATAA------GTCAT-TTAATGACCAGGCTCC--TGCATA-TCT-T-AATGATTTATTT---ACTCTAA---CAGCTA-ATGGTCATACACGCACACTACGG-----TCATC------C-TC--AAATCTACAGTTGTATTCTCCT----AAGC---C-------------TA-------A-TT-----------------CTG----AAATGTTTCG--AAATTCGTTTACTTATT----CA-------G----GT-TCTTT-TTTGTGGAACTCTAATCCGTCTTAT-AT-A-AA-A---AA---TGCA----A--AT----TCT------ATT--A-ATC-AGTT---CAAA-GCTTTATA---TTT------ACGATGGAG-T---AAAT--T-----TTTTTA-GCA----ATTC--TAAT-G-A-A-TCGGGTAGCTCTCTTCA
gi|105924                     : AATTATTCACAGAGCTTAAATGGAT--GA-C-GTTTCC--TTAAA---------GAGTTAA-TATCAAACA-G-CAGT-ACTTATA------TATAA------ATCAT-GTGATGACCAGGCTCC--TGAATA-TCT-C-AAAAATGTATTT---ACTTTAA---CAGCTA-ATGTTCATACATGCACACTACGG-----TCATC------C-TC--TG-TCTACAGTTGTGTTCTCCT----AAGC---C-------------TA-------A-TT-----------------CTG----AAATATTTCG--AAATTCGTTTGCTTATT----CA-------G----GC-TCTTC-TTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-A---AA---TGCA----A--AT----TCT------TTT--A-ATC-AGTT---CAAA-GCCTTATA---TTT------ACAATGGAG-T---AAAA--A-----TTCTTA-GCA----ATTC--TAAT-A-A-A-TCTGGTAGCTCTCATCA
gi|105925                     : AATTATTCACATAGCTTGAATGGAT--GT-C-GTTTCC--TGAAA---------GAGTAAAATTTCAAAAA-G-CCGT-GCACGTG------TATAA------ATCAT-TAAATGACCAGGCTCC--TGCATA-GCT-C-AAAGATTAATTT---ACTCTAA---CAGCTA-ATGTTCATTCACGCACATTACGG-----TCATC------C-TC--TAATCTACAGTTGTATTCTCCG----AAGC---C-------------TA-------A-TT-----------------CTG----AAATGTTTCG--AAATCCGT----TTATT----CA-------G----GA-TCTTG-TTTGCGGAACTTTATTCCGTCTTAT-ATAA-AA-A---AA---TACA----A--AT----TCT------ATT--A-ATC-AGTT---CAAA-GTTTTATA---TTT------ACAATGGTG-T---AAAC--A-----TTCTT--GCA----GCTC--TAAT-A-A-A-TCGGGTAGCTCTCATCA
gi|105926                     : AATTATTCACAGAGATTAAATGGAT--GA-A-GTTTCT--TGAAA---------GAGTAAAATTTCAAAAA-G-CAGT-ACTTATA------TATAA------ATCAT-TTAATTATCAGGCTCC--AGCATA-TCT-CGAAT-ATTTATTT---ACTTCAT---CAGCTA-ATGTTCATACACGCACACTACGG-----TCATC------C-TC--TAATCTACAGTTGTATTCTCCT----AAGC---C-------------TA-------A-TT-----------------CTG----AAATTTTTCG--AAGTTCATTTGCTTATT----CA-------G----GC-TCTTC-CATGTGGAAAT-TATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-A---AA---TGCA----A--AA----TTT------ATT--A-ATC-AGTT---CAAA-GCTTTATA---TTT------ACGAT
gi|105930                     : AGTTATTCACAAAGCTTAAATGGAC--GA-A-ATC-CC--TGAAA---------GAGTTAAATTTCAAAAG-G-CAGT-ACTTACG------TATAC------ATCAT-TTAACGATCAGACTCC--TGCATG-TCT-G-GATGATTTATTG---AGTCTTA---CAGCTA-ATGTTCATACACGCACATTACGA-----TCATC------C-TC--TTATCTACCGTTGTATTCTGTT----AAGT---C-------------AA-------A-TT-----------------CT--------------G--AAATTCGTTTGCTTATT----AA-------G----GC-TCTTG-TTTATTGAACTCTATTCCATCTTATCAT-ATAA-A---AA---TACG----A--AT----TCT------ATC--A-ATC-AGTT---AAAA-ATTTTATA---TTT------ACAATGGAG-T---AAA---G-----GATGTA-GCA----ACTC--TTAT-A-A-A-TCGAGTAGCTCT
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gi|105931                     : AATTATGCATTAAACTTATATGAAT--GA-A-GCTTGC--TGAAA---------GAGTTAAATTTCAAAAG-G-CAGA-CCTCATG------TATGA------ATC------------------C--TTCATA-TCT-C-AAAGATTAGTTT---AGCCTAA---CAGCTA-ATGCTTATACACGGACATTGCGG-----TCATT------C-AC--TTGTCAACAATTGTATTCTCCT----TAGC---C-------------AA-------A-TT-----------------TTG----AAAAGTTTCG--AAATTCGTTTGCTTATT----CA---------------------------GAACCCCATTCCATCTTAT-AT-A-AA-A---A-----GCA----A--AT----TGT------ATT--A-ATC-AGTT---CAAA-GCTTGATA---TTC------ACAATGGAG-TA--AAAA--A-----TTCGTA-GC-----ACTC--TAAT-A-A-A-TCTGGTAGCTCTCATC
gi|105932                     : AATAATTCACTAATCTTAAATGGAT--GA-C-ATTTCA--TAAAA---------GGGTTAAATTTCAAAA------GT-A--TAAAAAAAAGTATGA------ATCAT-TTAATGACCAGGCGCC--TGAATA-TCT-C-AAAG------------CTC--A---CAGCTA-AAGTTCAAAAAAGTGCATAACGA-----CCATC------CCTT--AA----------------TCCT----AAGA---C-------------AA-------A-TT-----------------CTG----AAATGTTTCG--GAATTAGTTTGCTTATT----CC-------A-----C-TCTTG-TTTGTGGAATTCTATTCCATCTTAT-AT-A-AA-A---------GTG----A--TT----TCT------ATA--A-ATC-AGTT---CAAA-GCTTTATA---TTT------ACAATTGAA-T---AAAA--CAAAAATTCTTA-GCA----AGTC--TAAT-A-A-A-TTGGGTAGTTCCCATCA
gi|105933                     : AACTATTCACTTAGCTTAAATGGAT--GA-C-GTTTCC--TGTAA---------GAGTTAAATTTTAAAAAAG-CAGT-ACTCATG------TATAA------ATAAT-CTAATGACC-GGCTCC--TGTATA-TCT-C-AAAGACTTATTT---ACTCAAA---CAACTA-ATGTTCATAAACTCACAATACGG-----TTATC------C-TC--TAATCTACAGTTGTATTCTTA-----AAGC---C--------------------------------------------------AAATGTTTCA--AAATTCGTTTGCTT-TT----TA-------G----GT-TCTT
gi|105927                     : AATTATTCACTAAGTTTAAATGGAT--GA-T-GTTTCC--TAAAACTAGTAAATGGGATAAATTTCAAAAA-A-CAAT-ACTTGTG------TATAA------ATCAT-TTAATGACCAGGCTTT--TGCTCA-TCT-T-AAATATGTATTT---ACTCAAG---CAGCTG-ATGTCCATAGACGTACATTACGT-----TCGTT------C-TC--TAACCTACAGCTGat
gi|105934                     : AATTATTCAAAGAGCTTAAATGAAT--GA-C-GTCTC---TGTAA---------GAGTTAAATTTCCAAAA-G-CAGA-ACTTATA------TATAA------GTCAT-TTAATGACCGGGCCCC--
gi|105928                     : AATTATTCACTAAGCTTAAATG-AT--GA-C-GTTTCC---GAAA---------AGTTTTCATTTCAAAAG-G-CAGT-ACTCATagt
gi|105936                     :  ATTATTCAATGAGCCCATTTGGAT--GA-C-ATTTCC--TTAAG---------GGTTTACATTTCCGAAA-G-TTGA-ACCTGCG------TATAG------ATCAG-TTACCGACCAGAGTCG--TGCATA-TCG-T-----------------CTCTAG---CA--TATATGTTCATACATGAATATTGC
gi|105937                     :      TTCACAGAGATTAAATGGAT--TA-C-GTTTCC--TGAAA---------GAGTTAAATTTCAAAAA-T-TAGT-ACTTATA------TATAA------ATCAT-TTAAAGACCAGGCTCC--TGCATA-TCT-C-AAAGGTTTATTT---ACTCCAA---CAGCTA-ATGTTCATACACGCACACTACGG-----TCATC------C-TC--TAATATACAGTTGTTTTCTCCT----AAAC---C-------------AA-------A-TT-----------------CTA----AAATGTTTCG--AAATGTGTTTGCTTACT----CT-------G----GC-TCTTG-AATGTCGAACTCTATTCCGTCTTAT-GT---AA-A---AA---TGCA----A--AT----TTT------ATT--A-ATC-AGTC---CTAA-GCTTTATA---TTT------ACAA
gi|105938                     :             AGCTTAAATGGAT--GA-C-GTTTCC--TGGAA---------GGGTTAAATTTTAAAAG-G-CAGA-ACTCATG------TATAA------ATCAT-TTAATGACCAGACTCC--TGTATA-TGT-C-AAAGATTTATTT---ACTCTAG---CAGCTA-GTGTTTATACACGTACATTACGG-----TCATC------C-TC--TAATCTACAGTTGTATTCTTCT----AAGT---A-------------AA-------A-CT-----------------CTG----AAATGTTTCG--AAATGTATTTACTTATT----CA-------G----GC-TCTTA-TTTGTGGAATTCTATTCCATCTT
gi|105935                     :             tGCTGAACTGGATTAGA-TTACTTCCCATGAAA---------GAGTAACATTCCAAAAG-G-CAGT-TCTTAGG------TATGA------AACGT-TATATAACATTGCCCG--T-CGTA-TCT-T-AGGGATGTATTT---ATTCTAA----A--TA-CTGGT-ATTCATTCAC-TTAAGA-----TCATCGTCTAAC-TT--AAATTTAGA--TATATTCCACG----A--C---C-------------AA-------A-TC-----------------ATG----AATTATTTAG--AA
gi|105939                     :       aactatttCTCAGATGGAT--GA-C-GTTTCC--TGAAA---------AAGTTAAATTTAAAAAA-GGCAGT-ACTCGTG------TATAT------ATCAT-TTAATGAGCGGGCTCC--TGTATA-TCT-C-AAAGCTTTATAT---ACTCTAA---CAGCCA-ATGTTCATACA---AAAT--CTG-----TCATC------C-TC--TAATCTACAGCTGT-TTTTCCG----AACT---C-------------AA-------A-TT-----------------CTG----AAGTGTTTCA--AAATTTGTTAGTTTAGTAAAGAA-------A----GC-TCTTG-TTTGTGAAATTCTATTCCATCATGT-AT-A-AA-A---AAT--TGAA----AAGATTTGATTT------ATTCAA-ATG-AGTT---C
gi|105940                     :                     TGGAT--TACT-GTC-CC--TGAAA---------GGGTAAAATTTCAAAAAAG-CTGT-TCTTATG------TATAA------AACGT-TACATAACATTGCCCCGTTG--TA-TTT-T-AGGGATGTATTT---ATTCTAA---ATCCTG-ATATTCATTCA
gi|105941                     :                                     CC--TAAAA----------AGTTCAATTTCAAAAA-A-TCATTAATCATG------TATGA------ATCAT-TTAATGAC-AGGCTCC--TTCATA-TCT-C-GAAGATTCATTT---ACTCTAA---CAGCTA-ATGTTCATACACAAATATTATGA-----TCATC------C-TC--TAATCTA--GTTGTATTCTCCC----GAGT---C-------------CA-------A-TT-----------------TTG----AAATGTTTCA--AAATTC----------------------------------TTG-TTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-A---AA---TGC------------------------TT--A-ATCCAATT---CAAA-GCTTTATA---TTA------AAAATGGAG-T---AAAA--A-----TTCTTA-GCA----ACTaaaaatttaagatccttgtctcacctaaatgcatatactctccgactacatatttagttatttaggagatcttttatatattcag
gi|105942                     :                                       --TGAAA---------GGGTTAAATTTGAAAAG-G-CAGT-ACTTGTG------TATA-----------------------GGTTGC--TGC----------------TTAT-----A-TCTAA---CAGGTA-AGGTTCGTGAGCGTACATTACGG-----TCATC------T-TC--TAATCTACAGTTGTATTCTCTT----AAG----------------------------------------------------------TGTTCCGTCAAA--CGTTTATTTATT----CA-------G----GC-TCTT
gi|105944                     :                                                            AAATTTTAAAAA-G-CAGT-TTTTGTG------T-TAA------ATAAT-TTAATGAACACGCTCC--TGCATG-TCT-CGAATTATT-ATTTGAAAC---AA---CAGCTA-ATGTTTATATACGTACATTACTT-----TCATC------C-TC--TGATATACAGTTATAACCTCCT----AAGC---CAAAAATACTAAAATA-------A-TTCACTTTAACCTCTTAAACTG----AAACGATTCA--AAGAGCATTTACCTAAA----CA-------G----AA-TATTG-TTAATAGATCTCTATTCCATC--AT-AT-ACAC-C---AA---TGCG----A--AT----TCC------GTC--A-ATA-AGTT---TAAA-ACTTTATG---TTG------ACAATAGAGTT---AAAC--T-----TCTTgt
gi|105945                     :                                                             AATTTCAAAAT-G-CAAT-ACATCTG------TATAATTAACTATAAT-TGAATGAGGAGACTTC--TCGGTA-CC----AA-GAGGGGCTT---ACTTTTGGTTCGGCTA-ATGTTAATAGAGTAACGTTACGT-----TCATC------C-TC--TCACCTACATTTGatcaccttaaataaa
gi|105943                     :                                                               TTTCAAAAG-G-CAAT-ACTCATC------AGTAG------ATCAT-TAAATAACCAGGCTCC--TGTATA-TCT-C-AAAGATTTATTA---ACTCTAA---CAGCTA-ATGTTCATACATGCACATTACCG-----TCATC------C-TC--TAATCTACAGTTGTATTCTCCT----AGGT---C-------------TA-------AATT-----------------CTG----AAATGTTTCG---------------TATT----CA-------G----GC-TTTTA-TTTGTGGAGCACTATTCCATCTTAT-AT-T-AA-A---TA---TGCA----A--AT----TAT------GTT--A-ATC-ATTTT--CAAA-G-TTTATA---TTT------ACGACGGTC-T---AAAT--A-----TTCTTA-ACA----ACTC--TAAT-A-A-A-TCGGGTCGCCCTCATCA
gi|105946                     :                                               aaagagaaaaaaggttatttAAAAG-G-CAGT-ATGTGTG------CATAA------A--ATATTAAAGTCCAAGCACC--TGCATA-TCT-C-AAAGACTGAATG---ATTCTAA---CATCTA-
gi|105948                     :                                                                                                            T-TTAATGACCCGGCTCC--GACATA-T---------------TT---ACTCTAA---CATCTA-ATGTGCATACACGCACACTACGG-----TCATC------T-TC--TCATCTACAGTTGTATTTTCTT----AAGC---G-------------TA-------A-TT-----------------CTG-----ATTTTTTCG--AAATTCGCTTGCTTATT----CA-------G----AC-TCTTC-TTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-AAATAA---TGCT----A--AG----TCT------ATT--A-ATC-AGTT---CAAA-CCTTTATA---TTT------ACAATGGAG-T---AAAT--A-----TTCTTA-GCA----ACTCGGTAAT-A-T-A-TCGGGTAGCTCTCtttatttcatatttattttactattcacttgcctattaagtatttaagtatcttgtttaagaaagtctattccatcctacattaagaaaattgtcatacaccagtataaagcgttatatttacaatggagtagaaaatcttcatatctcaataaa
gi|105949                     :                                                                                                               aatgtACCATACTCT--TGCATA-TCTAT-AATGATTTATTT---ATTCTAA---CATCAA-ATGAGCATACACGAATACTACG-----------------T-TT--AA---------------CTTCT----TAGC---C-------------AA-------A-TA-----------------CTG----AAATA-TTCG--TTATTCGTTTGCTTAAC----CA-------G----AC-TCTTG-TTTatta
gi|105950                     :                                                                                                                        GGCTCC--TGGCTAATCT-C-AAAGAGGTATTT---ACTCTAA---CATCTA-ATGTTCATA
gi|105951                     :                                                                                                                                                GATTTATTT---ACTCTAA---CAGTAA-ATGTTCACACACGCACTTTACGG-----TCATC------C-TC--TAATCTACAGTTGTATTCTCCT----AAGC---T-------------TA-------A-TT-----------------CTG----AAATGCTTCG--AAATTCGTTTGCTTATT----CA-------G----GT-TCTTG-TTTGTAGAACTTTATTCCGTCTGAT-AT-A-AA-A---AA---TGCA----A--AT----TCT------AAT--A-AAC-AGTT---CAAA-GCTCTATA---TTT------ACAATGGAG-T---AAGA--A-----TTATTA-GCA----ACTC--TAAT-A-A-A-TTGAGTAGCTCTCATCA
gi|105953                     :                                                                                                                                                            aCTCT-----CATCTA-CTGTTTATAGAGATACATCACGT-----TCATC------C-TC--TCATCTACAGTTG
gi|105947                     :                                                                                                                                                                   ---CAGCTT-ATGTTCATACATGCACATTACGG-----TCATT------C-TC--TAATCTGCAGTTGTATTCTCCT----GAGA---C-------------AA-------A-CT-----------------TTGAAATAAATGTTTCG--AAATTCGTTTGTTTATT----CA-------A----GT-TCTTG-TTTATGGAACTCTCTTCCATCTTAC-AT---AA-T---AA---TGCA----A--AT----CAT------ATT--A-ATC-AGTT---CAAA-GCTTTATA---TTTACTGTAACAATTGAG-C---AAAA--A-----TTCTTA-GCA----ACTC--TAAT-ATA-A-TCGCGTAGCTCT
gi|105954                     :                                                                                                              tatttaaatgaatcatattgattagtctcaatattcaattcaattcaatatcctttattCTG-ATGTTAATACACGCATATTATTG-----TCATC------C-TC--TAATCTACAGTTGTATTCTCCG----AAGC---A-------------AA-------A-GT-----------------CTG----AAATGTTTCG--AAATTAGTTTGCTGATT----CA-------G----GC-TCTTG-TTTGCGGAACTCTATTTAGTCTTAT-AT---AA-A---AA---CGCA----A--AT----TCT------ATT--A-ATC-AGTT---CAAA-GCTTTATA---TTT------ACAATGGAG-T---AAAT--A-----GTCTTA-GCT----ACTC--TAAT-A-A-T-TCGGATAACTGTCATCAtacca
gi|105955                     :                                                                                                                                                                                   ATAGACGTACATTACGT-----TCATT------C-TC--TAACCTACAGTTGGAT
gi|105956                     :                                                                                                                                                                                    TACATGTACAATACATATCTTTCATC------C-TCTTATAT-TA-AATAACATTCTCCA----AATT---C-------------AA-------A-CA-----------------CTG----AAATGTTTCG--CCATTTGTTCATATATT----CA-------GCCTGGT-TTCTG-TTTATGAAAGTATATTCCAATTAAT-AT-A-AA-C---AA---TTCA----T--AT----TCT------ATC--A-ATC-AATT---TAAA-ACTCTATA---TTC------AGAGTGGCG-T---AAATACT-----TTTCTA--TA----ACCT--TAAT-T-A-A-
gi|105957                     :                                                                                                                                                                                           ACATTATGA-----TTATC------C-TG--AAATCTACAGTTGTATTGTCCT----AAGC---T-------------GA-------A-TT-----------------CTG----AAATATTTCG--AAATT-GTTTGATTTTT----TA-------G----TT-TTTTG-TTCGTGAAATTCTATTACATCATAT-AT-A-AATA---AAAATTGCC----A--GT----TGT------ATT--A-ATC-AGTT---CAAA-ACCTAATA---CTC------GCAATGGAG-T---ACAA--A-----CTCTTA-GCA----CTTC--TAAT-T-A-A-GCCAGAAGCTCCCTTCAgtc
gi|105958                     :                                                                                                                                                                                            CATTACGG-----TCATC------C-TC--TAATCTACAGTTGTATTCTCAA----AAGC---C-------------AA-------A-TT-----------------CTG----AAATGTTTCG--CAATTCGTTTGCTTACT----CG-------G----TC-TCATG-TCTATGCAATTCTTTCCCATCTTAC-TT-A-AG-A---AA---TGTA----C--AT----TTTCAGTTGATT--A-ATC-AGTT---GAAA-GCTTTAAG---TTT------ACAATGGAG-C---AAAG--A-----TACTTG-GCA----ACTC--TAAT-T-A-A-----GT--CTCTCATCA
gi|105959                     :                                                                                                                                                                                                                                 CAATTGTAT---CCT----AAGC---C-------------AA-------A-TT-----------------CTG----AAATGTTTCG--TCATTCGTTTGCTTATT----AA-------G----GC-TCTTG-TTTGTGGAACTCTATTCTATCATAT-AT-A-GA-A---AA---TGCA----A--AT----TAT------ATA--A-ATT-AGTT---TA
gi|105960                     :                                                                                                                                                                                                                                         TTATCCT----AAGC---C-------------AA-------A-TT-----------------CTG----AAATGTTTCG--TCATTCGTTTGCTTATT----AA-------G----GC-TCTTG-TTTGTGGAACTTTATTCCATCATAT-AT-T-GA-A---TA---TGCA----A--AT----TAT------ATC--A-ATT-AGTT---TGTA---TTGATA---TTT------
gi|105932                     :                                                                                                                                                                                                                                               T----AAGCAAAC-------------TA-------A-TT-----------------CCG----AAACATTTCA--GAATTTGTCT
gi|105952                     :                                                                                                                         aataattcactaatcttaaatggatgacatttcataaaagggttaaatttcaaaagtataaaaaaaagtatgaatcatttaatgaccaggcgcctgaatatctcaaagctcacagctaaagttcaaaaaagtgcataacgaccatcccttaatccta-----------------CTG----AAATATTTTG--CCATTTGTTTGCTTATT----CA-------G----AC-TCTTG-TTttccactcttgtttgtggaattctattccatcttatataaaagtgatttctataaatcagttcaaagctttatatttacaattgaataaaacaaaaattcttagcaagtctaataaattgggtagttcccatca
gi|105962                     :                                                                                                                                                                                                                                        atttgtttagtcgccctcctacagtttatagtgttacattacattcctcctctcagctaaagttcaaatgtaATGCTTCG--GCATTCGTTAGTTTATT----CA-------G----G---CTTG-ATTTCGGAACGCTATTCCATCTTAT-AT---AA-A---AA---TGCA----A--AT----TCT------TTT--A-ACC-
gi|105963                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATTCGTTTGCTTATT----CA-------G----TC-TCTTC-TTTGTTGAACTCTATTCTGTCTTAT-AT---AA-A---AA---TGCA----A--AT----TAT------ATT--A-AAC-AGTT---CAAA-GCT
gi|105964                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTACTTTTT----CACACAACTA----AT-TCTTA-TTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTGT-TT-A-AA-A---AA---AGCA----A--CT----TCT------ATT--G-ATC-AGTT---CAAA-GCTTTATA---TT----------------------AAT--T-----TCTT-A-GAT----ACTG--TAAT-A-ACG-TCGGGTAGCTCTCATCA
gi|105965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGCTTATT----CA-------C----GC-TATTG-TTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-ATAA-AA-A---AA---TGCA----A--AC----TCT------ATC--C-ATA-AGTT---CA--------------------------ATGGAG-T---AAA---A-----TTCTTA-GCA----ATTC--GAAT-A-A-A-TCGAGTATATCTCATCA
gi|105966                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTGAT----TA-------G----GC-TCTTG-TTTGTGGAACTTTTTTCCGTCTTAT-TT-A-AA-A----A---TGCA----A--AT----TCT------ATT--A-ATC-AGTT---CAAA-GCTTTATA---ATT------ACAATAATG-T---AAAA--A-----TTCTTA-GCA----ACTC--TAAT-A-A-A-TCGGGTTGCTCTCATCA
gi|105946                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TATT----TA-------A----GTATCTTG-TTTAAGAAAGTCTATTCCATCCTAC-AT-T-AA-G---AA-----------A--AT----TGT------CAT--ACACC-AGTA---TAAA-GCGTTATA---TTT------ACAATGGAG-TAGAAAAT--C-----TT
gi|105961                     :                                                                                                                                                                                                                    aaaaggcagtatgtgtgcataaaatattaaagtccaagcacctgcatatctcaaagactgaatgattctaacatctatttatttcatatttattttactattcacttgcctattaagTT----CA-------A----AT-TGTTTATTT----AACTCAATTTCATCATAT-AT-A-AA-A---AAAA-TGCC----A--AT----CCC------ATT--A-ATC-AGTT---TAAATGTTTT-TA---TTA------ACATTGGAG-T---AAAA--T-----CGTTTG-AC-------TC--TA-----A-G-TCATGTAGCACTCTTCAcatatctcaataaa
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Reference ( family-469 )      :         AATTATTCACNGAGCTTAAATGGATGACGTTTCCTGAAA---------GGGTTAAATTT-C-AAAAA-G-CAGTAC-TCGT--------GTATAA------ATCAT-TTAATGACCAGGCTCC--TGCATA-TCT-CAA---AGATTTATT-T---A------CTCTAA---CAGCT---A---ATGTTCATACACGCACATTACGG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCCT----AAG-------CC--NAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--AA---ATT-------CGTTTGCTTATT----CAG-------GC-------TCTTGTTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-A---AA---TGCA----A--AT----TCT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAA-NATTCTTA-GCAACTC--TAA-TA-A-A-TCGGGTAGCTCTCATCA
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gi|105925                     :         AATTATTCACATAGCTTGAATGGATGTCGTTTCCTGAAA---------GAGTAAAATTT-C-AAAAA-G-CCGTGC-ACGT--------GTATAA------ATCAT-TAAATGACCAGGCTCC--TGCATA-GCT-CAA---AGATTAATT-T---A------CTCTAA---CAGCT---A---ATGTTCATTCACGCACATTACGG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCCG----AAG-------CC--TAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--AA---ATC-------CGT----TTATT----CAG-------GA-------TCTTGTTTGCGGAACTTTATTCCGTCTTAT-ATAA-AA-A---AA---TACA----A--AT----TCT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-GTTTTA---TATTT------ACAATGGTGT-----AAA-CATTCTT--GCAGCTC--TAA-TA-A-A-TCGGGTAGCTCTCATCA
gi|105926                     :         AATTATTCACAGAGATTAAATGGATGAAGTTTCTTGAAA---------GAGTAAAATTT-C-AAAAA-G-CAGTAC-TTAT--------ATATAA------ATCAT-TTAATTATCAGGCTCC--AGCATA-TCT-CGA---ATATTTATT-T---A------CTTCAT---CAGCT---A---ATGTTCATACACGCACACTACGG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCCT----AAG-------CC--TAAT-T-CTG----AAATTTTTC------------------G--AA---GTT-------CATTTGCTTATT----CAG-------GC-------TCTTCCATGTGGAAAT-TATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-A---AA---TGCA----A--AA----TTT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATTT------ACGAT
gi|105927                     :         AATTATTCACTAAGTTTAAATGGATGATGTTTCCTAAAACTAGTAAATGGGATAAATTT-C-AAAAA-A-CAATAC-TTGT--------GTATAA------ATCAT-TTAATGACCAGGCTTT--TGCTCA-TCT-TAA---ATATGTATT-T---A------CTCAAG---CAGCT---G---ATGTCCATAGACGTACATTACGT-----TCGTTCTCTAACCTACAGC---TG
gi|105928                     :         AATTATTCACTAAGCTTAAATG-ATGACGTTTCC-GAAA---------AGTTTTCATTT-C-AAAAG-G-CAGTAC-TCAT--------
gi|105929                     :         AATTATTCACTCGGCTTAAATGGATAACGTTTCCTGAAC---------GGGTAAAATTT-C-AAAG--G-CAGTAC-TCAT--------GAATAA------AT----------A--AGGCTCC--TGCATA-TCT-CAA---ATATTTATT-T---A------CTCTAA---CAGCT---A---ATGTTCACTCACGCACGT--------------CCTATAATCTACAGT---TGTATTCTCCTTTTTAAGGCTAGGGCC--AAAT-T-CTG----AAATATTTC------------------G--AA---ATT-------CGTTTGCTTATT----CAG-------GC-------TCTTGTTTGTGGAACTCAATTCCGTCTTAT-AT-ATAA-A---AAAATTGCAAATTA--AT----TCT------GTT--A-AT-CA-GTT---CAAA-ATTGTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAC-CTTTCTAT-GCAACTC--TAA-TA-A-ATTCGAGTATCTCTCATCA
gi|105930                     :         AGTTATTCACAAAGCTTAAATGGACGAAATC-CCTGAAA---------GAGTTAAATTT-C-AAAAG-G-CAGTAC-TTAC--------GTATAC------ATCAT-TTAACGATCAGACTCC--TGCATG-TCT-GGA---TGATTTATT-G---A------GTCTTA---CAGCT---A---ATGTTCATACACGCACATTACGA-----TCATCCTCTTATCTACCGT---TGTATTCTGTT----AAG-------TC--AAAT-T-CT--------------------------------G--AA---ATT-------CGTTTGCTTATT----AAG-------GC-------TCTTGTTTATTGAACTCTATTCCATCTTATCAT-ATAA-A---AA---TACG----A--AT----TCT------ATC--A-AT-CA-GTT---AAAA-ATTTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAAGGAT--GTA-GCAACTC--TTA-TA-A-A-TCGAGTAGCTCTGAT
gi|105931                     :         AATTATGCATTAAACTTATATGAATGAAGCTTGCTGAAA---------GAGTTAAATTT-C-AAAAG-G-CAGACC-TCAT--------GTATGA------ATC------------------C--TTCATA-TCT-CAA---AGATTAGTT-T---A------GCCTAA---CAGCT---A---ATGCTTATACACGGACATTGCGG-----TCATTCACTTGTCAACAAT---TGTATTCTCCT----TAG-------CC--AAAT-T-TTG----AAAAGTTTC------------------G--AA---ATT-------CGTTTGCTTATT----CA----------------------------GAACCCCATTCCATCTTAT-AT-A-AA-A---A-----GCA----A--AT----TGT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTGA---TATTC------ACAATGGAGTA----AAA-AATTCGTA-GC-ACTC--TAA-TA-A-A-TCTGGTAGCTCTCATC
gi|105932                     :         AATAATTCACTAATCTTAAATGGATGACATTTCATAAAA---------GGGTTAAATTT-C-AAAA------GTA-----TAAAAAAAAGTATGA------ATCAT-TTAATGACCAGGCGCC--TGAATA-TCT-CAA---AG-------------------CTC--A---CAGCT---A---AAGTTCAAAAAAGTGCATAACGA-----CCATCCCTTAATC------------------CT----AAG-------AC--AAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--GA---ATT-------AGTTTGCTTATT----CCA--------C-------TCTTGTTTGTGGAATTCTATTCCATCTTAT-AT-A-AA-A---------GTG----A--TT----TCT------ATA--A-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATTT------ACAATTGAATAAAACAAA-AATTCTTA-GCAAGTC--TAA-TA-A-A-TTGGGTAGTTCCCATCA
gi|105933                     :         AACTATTCACTTAGCTTAAATGGATGACGTTTCCTGTAA---------GAGTTAAATTT-TAAAAAA-G-CAGTAC-TCAT--------GTATAA------ATAAT-CTAATGACC-GGCTCC--TGTATA-TCT-CAA---AGACTTATT-T---A------CTCAAA---CAACT---A---ATGTTCATAAACTCACAATACGG-----TTATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCT--TA---AAG-------CC----------------AAATGTTTC------------------A--AA---ATT-------CGTTTGCTT-TT----TAG-------GT-------TCTTAT
gi|105934                     :         AATTATTCAAAGAGCTTAAATGAATGACGTCTC-TGTAA---------GAGTTAAATTT-C-CAAAA-G-CAGAAC-TTAT--------ATATAA------GTCAT-TTAATGACCGGGCCCC--
gi|105936                     :          ATTATTCAATGAGCCCATTTGGATGACATTTCCTTAAG---------GGTTTACATTT-C-CGAAA-G-TTGAAC-CTGC--------GTATAG------ATCAG-TTACCGACCAGAGTCG--TGCATA-TC----------GT-----------------CTCTAG---CA--T---AT--ATGTTCATACATGAATATTGCagt
gi|105937                     :              TTCACAGAGATTAAATGGATTACGTTTCCTGAAA---------GAGTTAAATTT-C-AAAAA-T-TAGTAC-TTAT--------ATATAA------ATCAT-TTAAAGACCAGGCTCC--TGCATA-TCT-CAA---AGGTTTATT-T---A------CTCCAA---CAGCT---A---ATGTTCATACACGCACACTACGG-----TCATCCTCTAATATACAGT---TGTTTTCTCCT----AAA-------CC--AAAT-T-CTA----AAATGTTTC------------------G--AA---ATG-------TGTTTGCTTACT----CTG-------GC-------TCTTGAATGTCGAACTCTATTCCGTCTTAT-GT---AA-A---AA---TGCA----A--AT----TTT------ATT--A-AT-CA-GTC---CTAA-GCTTTA---TATTT------ACAA
gi|105938                     :                     AGCTTAAATGGATGACGTTTCCTGGAA---------GGGTTAAATTT-T-AAAAG-G-CAGAAC-TCAT--------GTATAA------ATCAT-TTAATGACCAGACTCC--TGTATA-TGT-CAA---AGATTTATT-T---A------CTCTAG---CAGCT---A---GTGTTTATACACGTACATTACGG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTTCT----AAG-------TA--AAAC-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--AA---ATG-------TATTTACTTATT----CAG-------GC-------TCTTATTTGTGGAATTCTATTCCATCTT
gi|105939                     :                      tCTCAGATGGATGACGTTTCCTGAAA---------AAGTTAAATTT-A-AAAAA-GGCAGTAC-TCGT--------GTATAT------ATCAT-TTAATGAGCGGGCTCC--TGTATA-TCT-CAA---AGCTTTATA-T---A------CTCTAA---CAGCC---A---ATGTTCATACA---AAAT--CTG-----TCATCCTCTAATCTACAGC---TGT-TTTTCCG----AAC-------TC--AAAT-T-CTG----AAGTGTTTC------------------A--AA---ATT-------TGTTAGTTTAGTAAAGAAA-------GC-------TCTTGTTTGTGAAATTCTATTCCATCATGT-AT-A-AA-A---AAT--TGAA----AAGATTTGATTT------ATTCAA-AT-GA-GTT---C
gi|105940                     :                             TGGATTACTGTCCCTGAAA---------GGGTAAAATTT-C-AAAAAAG-CTGTTC-TTAT--------GTATAA------AACGT-TACATAACATTGCCCCGTTG--TA-TTT-TAG---GGATGTATT-T---A------TTCTAA---ATCCT---G---ATATTCATTCAAAAAATTTAAGA-----TCCTTGTCTCACCTA-AATGCATATACTCTCC
gi|105941                     :                                         CCTAAAA---------AG-TTCAATTT-C-AAAAA-ATCATTAA-TCAT--------GTATGA------ATCAT-TTAATGAC-AGGCTCC--TTCATA-TCT-CGA---AGATTCATT-T---A------CTCTAA---CAGCT---A---ATGTTCATACACAAATATTATGA-----TCATCCTCTAATCTA--GT---TGTATTCTCCC----GAG-------TC--CAAT-T-TTG----AAATGTTTC------------------A--AA---ATT-------C------------------------------------TTGTTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-A---AA---TGC------------------------TT--A-ATCCA-ATT---CAAA-GCTTTA---TATTA------AAAATGGAGT-----AAA-AATTCTTA-GCAACTgactacatatttagttatttaggagatcttttatatattcag
gi|105942                     :                                           TGAAA---------GGGTTAAATTT-G-AAAAG-G-CAGTAC-TTGT--------GTATA-----------------------GGTTGC--TGC------------------TTAT------A-------TCTAA---CAGGT---A---AGGTTCGTGAGCGTACATTACGG-----TCATCTTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCTT----AAG----------------------------TGTTCC------------------GTCAA---A---------CGTTTATTTATT----CAG-------GC-------TCTTGT
gi|105943                     :                                             AAA---------AGGTTATTTTTTC-AAAAG-G-CAATAC-TCAT--------CAGTAG------ATCAT-TAAATAACCAGGCTCC--TGTATA-TCT-CAA---AGATTTATT-A---A------CTCTAA---CAGCT---A---ATGTTCATACATGCACATTACCG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCCT----AGGT------CT--AAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G-------------------------TATT----CAG-------GC-------TTTTATTTGTGGAGCACTATTCCATCTTAT-AT-T-AA-A---TA---TGCA----A--AT----TAT------GTT--A-AT-CATTTT---CAAA-G-TTTA---TATTT------ACGACGGTCT-----AAA-TATTCTTA-ACAACTC--TAA-TA-A-A-TCGGGTCGCCCTCATCA
gi|105944                     :                                                      aaagagaaAAATTT-T-AAAAA-G-CAGTTT-TTGT--------GT-TAA------ATAAT-TTAATGAACACGCTCC--TGCATG-TCT-CGA---ATTATTATT-TGAAA------C---AA---CAGCT---A---ATGTTTATATACGTACATTACTT-----TCATCCTCTGATATACAGT---TATAACCTCCT----AAG-------CCAAAAAT-A-CTA----AAATAATTCACTTTAACCTCTTAAACTG--AAACGATTCAAAGAGCATTTACCTAAA----CAG-------AA-------TATTGTTAATAGATCTCTATTCCATC--AT-AT-ACAC-C---AA---TGCG----A--AT----TCC------GTC--A-AT-AA-GTT---TAAA-ACTTTA---TGTTG------ACAATAGAGT-----TAA-ACTTCTTA-TCACCTT--AAA-TA-A-A-
gi|105945                     :                                                               AATTT-C-AAAAT-G-CAATACATC-T--------GTATAATTAACTATAAT-TGAATGAGGAGACTTC--TCGGTA-CC----A---AGAGGGGCT-T---A------CTTTTGGTTCGGCT---A---ATGTTAATAGAGTAACGTTACGT-----TCATCCTCTCACCTACATT---TG
gi|105946                     :                                                                      -AAAAG-G-CAGTAT-GTGT--------GCATAA------A--ATATTAAAGTCCAAGCACC--TGCATA-TCT-CAA---AGACTGAAT-G---A------TTCTAA---CATCT---ATTTAT-TTCATA
gi|105946                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---ATT-------CACTTGCCTATT----AAGTATTTAAGTA------TCTTGTTTAAGAAAGTCTATTCCATCCTAC-AT-T-AA-G---AA-----------A--AT----TGT------CAT--ACAC-CA-GTA---TAAA-GCGTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AGA-AAATCTTC-ATATCTC---AA-TA-A-A-tttattttactattcacttgcctattaagtatttaagtatcttgtttaagaaagtctattccatcctacattaagaaaattgtcatacaccagtataaagcgttatatttacaatggagtagaaaatcttcatatctcaataaa
gi|105947                     : aaaaggcagtatgtgtgcataaaatattaaagtccaagcacctgcatatctcaaagactgaatgattctaacatctatttatttcatatttattttactATGA------ATCAT-AT--TGATTAGTCTCA-----ATA-T-T-CAATTCA-ATTCAATAT---C------CTTTATT--CAGCT---T---ATGTTCATACATGCACATTACGG-----TCATTCTCTAATCTGCAGT---TGTATTCTCCT----GAG-------AC--AAAC-T-TTGAAATAAATGTTTC------------------G--AA---ATT-------CGTTTGTTTATT----CAA-------GT-------TCTTGTTTATGGAACTCTCTTCCATCTTAC-AT---AA-T---AA---TGCA----A--AT----CAT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATTTACTGTAACAATTGAGC-----AAA-AATTCTTA-GCAACTC--TAA-TATA-A-TCGCGTAGCTCTTACCA
gi|105948                     :                                                                                                           tatttaaT-TTAATGACCCGGCTCC--GACATA-T-----------------T-T---A------CTCTAA---CATCT---A---ATGTGCATACACGCACACTACGG-----TCATCTTCTCATCTACAGT---TGTATTTTCTT----AAG-------CG--TAAT-T-CTG-----ATTTTTTC------------------G--AA---ATT-------CGCTTGCTTATT----CAG-------AC-------TCTTCTTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-AAATAA---TGCT----A--AG----TCT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-CCTTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAA-TATTCTTA-GCAACTCGGTAA-TA-T-A-TCGGGTAGCTCTCATTA
gi|105949                     :                                                                                                                     aatgtACCATACTCT--TGCATA-TCTATAA---TGATTTATT-T---A------TTCTAA---CATCA---A---ATGAGCATACACGAATACTACG------------TTTAA-----------------CTTCT----TAG-------CC--AAAT-A-CTG----AAATA-TTC------------------G--TT---ATT-------CGTTTGCTTAAC----CAG-------AC-------TCTTGTTT
gi|105950                     :                                                                                                                              GGCTCC--TGGCTAATCT-CAA---AGAGGTATT-T---A------CTCTAA---CATCT---A---ATGTTCATA
gi|105951                     :                                                                                                                                                    ---AGATTTATT-T---A------CTCTAA---CAGTA---A---ATGTTCACACACGCACTTTACGG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCCT----AAG-------CT--TAAT-T-CTG----AAATGCTTC------------------G--AA---ATT-------CGTTTGCTTATT----CAG-------GT-------TCTTGTTTGTAGAACTTTATTCCGTCTGAT-AT-A-AA-A---AA---TGCA----A--AT----TCT------AAT--A-AA-CA-GTT---CAAA-GCTCTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAG-AATTATTA-GCAACTC--TAA-TA-A-A-TTGAGTAGCTCTCATCA
gi|105952                     :                                                                                                                                                         ATTTGTT-T---AGTCGCCCTCCTA---CAGTTTATA---GTGTT---------ACATTACAT-----TCCTCCTCTCAGCTAAAGT---T-------------------------C--AAATGTACTG----AAATATTTT------------------G--CC---ATT-------TGTTTGCTTATT----CAG-------AC-------TCTTGTT
gi|105953                     :                                                                                                                                                                      ------CTCT-----CATCT---A---CTGTTTATAGAGATACATCACGT-----TCATCCTCTCATCTACAGT---TG
gi|105954                     :                                                                                                                                                                                        CT---G---ATGTTAATACACGCATATTATTG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCCG----AAG-------CA--AAAG-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--AA---ATT-------AGTTTGCTGATT----CAG-------GC-------TCTTGTTTGCGGAACTCTATTTAGTCTTAT-AT---AA-A---AA---CGCA----A--AT----TCT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAA-TAGTCTTA-GCTACTC--TAA-TA-A-T-TCGGATAACTGTCATCA
gi|105955                     :                                                                                                                                                                                                       ATAGACGTACATTACGT-----TCATTCTCTAACCTACAGT---TGGAT
gi|105956                     :                                                                                                                                                                                                        TACATGTACAATACATATCTTTCATCCTCTTATATTAAAT---AACATTCTCCA----AAT-------TC--AAAC-A-CTG----AAATGTTTC------------------G--CC---ATT-------TGTTCATATATT----CAGCCTG---GT-------TTCTGTTTATGAAAGTATATTCCAATTAAT-AT-A-AA-C---AA---TTCA----T--AT----TCT------ATC--A-AT-CA-ATT---TAAA-ACTCTA---TATTC------AGAGTGGCGT-----AAA-TACTTTTCTATAACCT--TAATTA-A-G-TC
gi|105957                     :                                                                                                                                                                                                               ACATTATGA-----TTATCCTGAAATCTACAGT---TGTATTGTCCT----AAG-------CT--GAAT-T-CTG----AAATATTTC------------------G--AA---ATT--------GTTTGATTTTT----TAG-------TT-------TTTTGTTCGTGAAATTCTATTACATCATAT-AT-A-AATA---AAAATTGCC----A--GT----TGT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-ACCTAA---TACTC------GCAATGGAGT-----ACA-AACTCTTA-GCACTTC--TAA-TT-A-A-GCCAGAAGCTCCCTTCA
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gi|105960                     :                                                                                                                                                                                                                                                       TTATCCT----AAG-------CC--AAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--TC---ATT-------CGTTTGCTTATT----AAG-------GC-------TCTTGTTTGTGGAACTTTATTCCATCATAT-AT-T-GA-A---TA---TGCA----A--AT----TAT------ATC--A-AT-TA-GTT---TGTA---TTGA---TATTT------
gi|105961                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGTTTATTTAACTCAATTTCATCATAT-AT-A-AA-A---AAAA-TGCC----A--AT----CCC------ATT--A-AT-CA-GTT---TAAATGTTTT----TATTA------ACATTGGAGT-----AAA--ATCGTTT-G--ACTC------TA-A-G-TCATGTAGCACTCTTCA
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gi|105964                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTACTTTTT----CAC-------ACAACTAATTCTTATTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTGT-TT-A-AA-A---AA---AGCA----A--CT----TCT------ATT--G-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATT---------AAT----------------TTCTTA-GATACTG--TAA-TA-ACG-TCGGGTAGCTCTCATCA
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Unaligned ( gi|105935 ): AACTATTTGCTGAACTGGATTAGATTACTTCCCATGAAAGAGTAACATTCCAAAAGGCAGTTCTTAGGTATGAAACGTTATATAACATTGCCCGTCGTATCTTAGGGATGTATTTATTCTAAATACTGGTATTCATTCACTTAAGATCATCGTCTAACTTAAATTTAGATATATTCCACGACCAAATCATGAATTATTTAGAA






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gi|105938                     :                     AGCTTAAATGGATGACGTTTCCTGGAA---------GGGTTAAATTT-T-AAAAG-G-CAGAAC-TCAT--------GTATAA------ATCAT-TTAATGACCAGACTCC--TGTATA-TGT-CAA---AGATTTATT-T---A------CTCTAG---CAGCT---A---GTGTTTATACACGTACATTACGG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTTCT----AAG-------TA--AAAC-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--AA---ATG-------TATTTACTTATT----CAG-------GC-------TCTTATTTGTGGAATTCTATTCCATCTT
gi|105939                     :                      tCTCAGATGGATGACGTTTCCTGAAA---------AAGTTAAATTT-A-AAAAA-GGCAGTAC-TCGT--------GTATAT------ATCAT-TTAATGAGCGGGCTCC--TGTATA-TCT-CAA---AGCTTTATA-T---A------CTCTAA---CAGCC---A---ATGTTCATACA---AAAT--CTG-----TCATCCTCTAATCTACAGC---TGT-TTTTCCG----AAC-------TC--AAAT-T-CTG----AAGTGTTTC------------------A--AA---ATT-------TGTTAGTTTAGTAAAGAAA-------GC-------TCTTGTTTGTGAAATTCTATTCCATCATGT-AT-A-AA-A---AAT--TGAA----AAGATTTGATTT------ATTCAA-AT-GA-GTT---C
gi|105940                     :                             TGGATTACTGTCCCTGAAA---------GGGTAAAATTT-C-AAAAAAG-CTGTTC-TTAT--------GTATAA------AACGT-TACATAACATTGCCCCGTTG--TA-TTT-TAG---GGATGTATT-T---A------TTCTAA---ATCCT---G---ATATTCATTCAAAAAATTTAAGA-----TCCTTGTCTCACCTA-AATGCATATACTCTCCG----A---------CT--ACAT-A-TTT----AGTTATTTA------------------G--GA---GAT-------CTTTTATATATT----CAG-------
gi|105941                     :                                         CCTAAAA---------AG-TTCAATTT-C-AAAAA-ATCATTAA-TCAT--------GTATGA------ATCAT-TTAATGAC-AGGCTCC--TTCATA-TCT-CGA---AGATTCATT-T---A------CTCTAA---CAGCT---A---ATGTTCATACACAAATATTATGA-----TCATCCTCTAATCTA--GT---TGTATTCTCCC----GAG-------TC--CAAT-T-TTG----AAATGTTTC------------------A--AA---ATT-------C------------------------------------TTGTTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-A---AA---TGC------------------------TT--A-ATCCA-ATT---CAAA-GCTTTA---TATTA------AAAATGGAGT-----AAA-AATTCTTA-GCAACT
gi|105942                     :                                           TGAAA---------GGGTTAAATTT-G-AAAAG-G-CAGTAC-TTGT--------GTATA-----------------------GGTTGC--TGC------------------TTAT------A-------TCTAA---CAGGT---A---AGGTTCGTGAGCGTACATTACGG-----TCATCTTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCTT----AAG----------------------------TGTTCC------------------GTCAA---A---------CGTTTATTTATT----CAG-------GC-------TCTTGT
gi|105943                     :                                             AAA---------AGGTTATTTTTTC-AAAAG-G-CAATAC-TCAT--------CAGTAG------ATCAT-TAAATAACCAGGCTCC--TGTATA-TCT-CAA---AGATTTATT-A---A------CTCTAA---CAGCT---A---ATGTTCATACATGCACATTACCG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCCT----AGGT------CT--AAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G-------------------------TATT----CAG-------GC-------TTTTATTTGTGGAGCACTATTCCATCTTAT-AT-T-AA-A---TA---TGCA----A--AT----TAT------GTT--A-AT-CATTTT---CAAA-G-TTTA---TATTT------ACGACGGTCT-----AAA-TATTCTTA-ACAACTC--TAA-TA-A-A-TCGGGTCGCCCTCATCA
gi|105944                     :                                                      aaagagaaAAATTT-T-AAAAA-G-CAGTTT-TTGT--------GT-TAA------ATAAT-TTAATGAACACGCTCC--TGCATG-TCT-CGA---ATTATTATT-TGAAA------C---AA---CAGCT---A---ATGTTTATATACGTACATTACTT-----TCATCCTCTGATATACAGT---TATAACCTCCT----AAG-------CCAAAAAT-A-CTA----AAATAATTCACTTTAACCTCTTAAACTG--AAACGATTCAAAGAGCATTTACCTAAA----CAG-------AA-------TATTGTTAATAGATCTCTATTCCATC--AT-AT-ACAC-C---AA---TGCG----A--AT----TCC------GTC--A-AT-AA-GTT---TAAA-ACTTTA---TGTTG------ACAATAGAGT-----TAA-ACTTCTTA-TCACCTT--AAA-TA-A-A-
gi|105945                     :                                                               AATTT-C-AAAAT-G-CAATACATC-T--------GTATAATTAACTATAAT-TGAATGAGGAGACTTC--TCGGTA-CC----A---AGAGGGGCT-T---A------CTTTTGGTTCGGCT---A---ATGTTAATAGAGTAACGTTACGT-----TCATCCTCTCACCTACATT---TG
gi|105946                     :                                                                      -AAAAG-G-CAGTAT-GTGT--------GCATAA------A--ATATTAAAGTCCAAGCACC--TGCATA-TCT-CAA---AGACTGAAT-G---A------TTCTAA---CATCT---ATTTAT-TTCATA
gi|105946                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---ATT-------CACTTGCCTATT----AAGTATTTAAGTA------TCTTGTTTAAGAAAGTCTATTCCATCCTAC-AT-T-AA-G---AA-----------A--AT----TGT------CAT--ACAC-CA-GTA---TAAA-GCGTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AGA-AAATCTTC-ATATCTC---AA-TA-A-A-tttattttactattcacttgcctattaagtatttaagtatcttgtttaagaaagtctattccatcctacattaagaaaattgtcatacaccagtataaagcgttatatttacaatggagtagaaaatcttcatatctcaataaa
gi|105947                     : aaaaggcagtatgtgtgcataaaatattaaagtccaagcacctgcatatctcaaagactgaatgattctaacatctatttatttcatatttattttactATGA------ATCAT-AT--TGATTAGTCTCA-----ATA-T-T-CAATTCA-ATTCAATAT---C------CTTTATT--CAGCT---T---ATGTTCATACATGCACATTACGG-----TCATTCTCTAATCTGCAGT---TGTATTCTCCT----GAG-------AC--AAAC-T-TTGAAATAAATGTTTC------------------G--AA---ATT-------CGTTTGTTTATT----CAA-------GT-------TCTTGTTTATGGAACTCTCTTCCATCTTAC-AT---AA-T---AA---TGCA----A--AT----CAT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATTTACTGTAACAATTGAGC-----AAA-AATTCTTA-GCAACTC--TAA-TATA-A-TCGCGTAGCTCTTACCA
gi|105948                     :                                                                                                           tatttaaT-TTAATGACCCGGCTCC--GACATA-T-----------------T-T---A------CTCTAA---CATCT---A---ATGTGCATACACGCACACTACGG-----TCATCTTCTCATCTACAGT---TGTATTTTCTT----AAG-------CG--TAAT-T-CTG-----ATTTTTTC------------------G--AA---ATT-------CGCTTGCTTATT----CAG-------AC-------TCTTCTTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-AAATAA---TGCT----A--AG----TCT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-CCTTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAA-TATTCTTA-GCAACTCGGTAA-TA-T-A-TCGGGTAGCTCTCATTA
gi|105949                     :                                                                                                                     aatgtACCATACTCT--TGCATA-TCTATAA---TGATTTATT-T---A------TTCTAA---CATCA---A---ATGAGCATACACGAATACTACG------------TTTAA-----------------CTTCT----TAG-------CC--AAAT-A-CTG----AAATA-TTC------------------G--TT---ATT-------CGTTTGCTTAAC----CAG-------AC-------TCTTGTTT
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gi|105956                     :                                                                                                                                                                                                        TACATGTACAATACATATCTTTCATCCTCTTATATTAAAT---AACATTCTCCA----AAT-------TC--AAAC-A-CTG----AAATGTTTC------------------G--CC---ATT-------TGTTCATATATT----CAGCCTG---GT-------TTCTGTTTATGAAAGTATATTCCAATTAAT-AT-A-AA-C---AA---TTCA----T--AT----TCT------ATC--A-AT-CA-ATT---TAAA-ACTCTA---TATTC------AGAGTGGCGT-----AAA-TACTTTTCTATAACCT--TAATTA-A-G-TC
gi|105957                     :                                                                                                                                                                                                               ACATTATGA-----TTATCCTGAAATCTACAGT---TGTATTGTCCT----AAG-------CT--GAAT-T-CTG----AAATATTTC------------------G--AA---ATT--------GTTTGATTTTT----TAG-------TT-------TTTTGTTCGTGAAATTCTATTACATCATAT-AT-A-AATA---AAAATTGCC----A--GT----TGT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-ACCTAA---TACTC------GCAATGGAGT-----ACA-AACTCTTA-GCACTTC--TAA-TT-A-A-GCCAGAAGCTCCCTTCA
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gi|105959                     :                                                                                                                                                                                                                                            CAAT---TGTAT---CCT----AAG-------CC--AAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--TC---ATT-------CGTTTGCTTATT----AAG-------GC-------TCTTGTTTGTGGAACTCTATTCTATCATAT-AT-A-GA-A---AA---TGCA----A--AT----TAT------ATA--A-AT-TA-GTT---TA
gi|105960                     :                                                                                                                                                                                                                                                       TTATCCT----AAG-------CC--AAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--TC---ATT-------CGTTTGCTTATT----AAG-------GC-------TCTTGTTTGTGGAACTTTATTCCATCATAT-AT-T-GA-A---TA---TGCA----A--AT----TAT------ATC--A-AT-TA-GTT---TGTA---TTGA---TATTT------
gi|105961                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGTTTATTTAACTCAATTTCATCATAT-AT-A-AA-A---AAAA-TGCC----A--AT----CCC------ATT--A-AT-CA-GTT---TAAATGTTTT----TATTA------ACATTGGAGT-----AAA--ATCGTTT-G--ACTC------TA-A-G-TCATGTAGCACTCTTCA
gi|105962                     :                                                                                                                                                                                                                                                         taaatataactttgtaaatggagttaatatgctttcaaaATGCTTC------------------G--GC---ATT-------CGTTAGTTTATT----CAG-------GC-------T--TGATTTCGGAACGCTATTCCATCTTAT-AT---AA-A---AA---TGCA----A--AT----TCT------TTT--A-AC-C
gi|105963                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---ATT-------CGTTTGCTTATT----CAG-------TC-------TCTTCTTTGTTGAACTCTATTCTGTCTTAT-AT---AA-A---AA---TGCA----A--AT----TAT------ATT--A-AA-CA-GTT---CAAA-GCT
gi|105964                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTACTTTTT----CAC-------ACAACTAATTCTTATTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTGT-TT-A-AA-A---AA---AGCA----A--CT----TCT------ATT--G-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATT---------AAT----------------TTCTTA-GATACTG--TAA-TA-ACG-TCGGGTAGCTCTCATCA
gi|105965                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGCTTATT----CAC-------GC-------TATTGTTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-ATAA-AA-A---AA---TGCA----A--AC----TCT------ATC--C-AT-AA-GTT-----------------------------CAATGGAGT-----AAA--ATTCTTA-GCAATTC--GAA-TA-A-A-TCGAGTATATCTCATCA
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gi|105970                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTAT-AT-T-AA-----------GTA----A--AT----TAC------AT---A-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAA-AA-TCTTA-GCTAGTC--TAA-TA-A-A-TCAGGTAGCTCTCATCA
gi|105971                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TC--A-AT-CA-ATTAATCAAA-GCTTTA---TATTT------ACAATAGAGT-----AAG-CA----AA-GC-ACTC--TCA-TA-A-AGTCGTGTAGCTCTCGTCA
gi|105972                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TT---CAA---CTTTAACCT-TTT------ACACTGAAGT-----AAA-TATTCTTA-GTAACTC--T------A-A-TCGGGTAGCTCTC-TCA
gi|105973                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTA---TATTT------ACCATTGAGT-----AAA-AATTCTTA-GCAACTC--TAA-TA-A-A-TCGGGTAGATCTCATCA
gi|105974                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-AATTCTTA-GAAACT----AA-TA-A-A-TCGGGTAGCTCTCATCA
gi|105975                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTTA-GCAACTC--TAA-CA-A-AATCGGGTAGCTTTCATCA


blockSeqs                     :                   AG                           CTAGTAAAT           T A    AA G      A  A AAAAAAAA      TTAACT     A                GT      A   A   TTC         A GAA GTCGCC      GTT     TAT TTT             C        TATCTT                   GCA           TTTT   GCTAGGG  AAA   G A   AAAT         ACTTTAACCTCTTAAACT TC  ACG   CAAAGAG            AAAG   TATTTAA  AACTAAT                              C  AA   T AAT  AAT    AATT AG  TTGA   CAGTTG   CA C  C  T   AAT    T      ACC     ACTGTA          AAAAC   GG       T       GG   T  T C T
blockSeqs                     :                   AT                           .                   . .    A  T      .  G .             .          .                .       .   .   .           . .   .           T       .   T               C        G                        .             A      T        T     . .   .            .                  .   .     .                  .      CCTG     A                                    .  AT   . AA   AAT    .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               A       A        .       .    .  . . G
blockSeqs                     :                   AG                           .                   . .    A  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               C        G                        .             .      .        T     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  AT   . .    AA     .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       C        .       .    .  . . A
blockSeqs                     :                   TA                           .                   . .    A  .      .  G .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               T        G                        .             .      .        T     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  AC   . .    T      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       C        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                   TA                           .                   . .    A  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               C        T                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  AA   . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                   TC                           .                   . .    G  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               C        A                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                   AA                           .                   . .    G  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               G        G                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                   TA                           .                   . .    G  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               T        A                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       T        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                   TA                           .                   . .    A  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               C        G                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                   TT                           .                   . .    A  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               A        G                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                   AG                           .                   . .    A  .      .  G .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               C        G                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                   TG                           .                   . .    A  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               T        G                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  T    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       T        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                   AG                           .                   . .    G  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               A        A                        .             .      .        C     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  T    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                .                   . .    A  .      .  G .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               A        A                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       T        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                .                   . .    A  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               T        G                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       T        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                .                   . .    G  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               C        G                        .             .      .        T     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                .                   . .    G  .      .  G .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               T        T                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       G        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                .                   . .    A  .      .  A .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               A        T                        .             .      .        T     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                .                   . .    T  .      .  G .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               C        G                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       C        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                                    . .    G  .      .  G .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               C        G                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  T    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                                    . .    .  .      .  . .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               A        G                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                                      .    .  .      .  . .             .          .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               C        T                        .             .      .        G     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       C        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                   .                .       .   .   .           . .   .           .       .   .               T        T                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       T        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                    .       .   .   .           . .   .           .       .   .               C        G                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                    .               .           . .   .           .       .   .               T        T                        .             .      .        A     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       A        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                . .   .           .       .   .               T        A                        .             .      .        .     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  A    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       .        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                      .           .       .   .               .        G                        .             .      .        .     . .   .            .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  T    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       .        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                          .   .               .        .                        .                                                      .                  .   .     .                  .      .        .                                    .  .    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .               .       .        .       .    .  . . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                       .                        .                                                                             .     .                  .      .        .                                    .  .    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .                       .        .       .    .  . . .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       .      .        .                                    .  .    . .    .      .    .   .      .        .  .  .  .   .      .      .       .                                                     
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|105935 ): AACTATTTGCTGAACTGGATTAGATTACTTCCCATGAAAGAGTAACATTCCAAAAGGCAGTTCTTAGGTATGAAACGTTATATAACATTGCCCGTCGTATCTTAGGGATGTATTTATTCTAAATACTGGTATTCATTCACTTAAGATCATCGTCTAACTTAAATTTAGATATATTCCACGACCAAATCATGAATTATTTAGAA






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gi|105936                     :          ATTATTCAATGAGCCCATTTGGATGACATTTCCTTAAG---------GGTTTACATTT-C-CGAAA-G-TTGAAC-CTGC--------GTATAG------ATCAG-TTACCGACCAGAGTCG--TGCATA-TC----------GT-----------------CTCTAG---CA--T---AT--ATGTTCATACATGAATATTGCagt
gi|105937                     :              TTCACAGAGATTAAATGGATTACGTTTCCTGAAA---------GAGTTAAATTT-C-AAAAA-T-TAGTAC-TTAT--------ATATAA------ATCAT-TTAAAGACCAGGCTCC--TGCATA-TCT-CAA---AGGTTTATT-T---A------CTCCAA---CAGCT---A---ATGTTCATACACGCACACTACGG-----TCATCCTCTAATATACAGT---TGTTTTCTCCT----AAA-------CC--AAAT-T-CTA----AAATGTTTC------------------G--AA---ATG-------TGTTTGCTTACT----CTG-------GC-------TCTTGAATGTCGAACTCTATTCCGTCTTAT-GT---AA-A---AA---TGCA----A--AT----TTT------ATT--A-AT-CA-GTC---CTAA-GCTTTA---TATTT------ACAA
gi|105938                     :                     AGCTTAAATGGATGACGTTTCCTGGAA---------GGGTTAAATTT-T-AAAAG-G-CAGAAC-TCAT--------GTATAA------ATCAT-TTAATGACCAGACTCC--TGTATA-TGT-CAA---AGATTTATT-T---A------CTCTAG---CAGCT---A---GTGTTTATACACGTACATTACGG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTTCT----AAG-------TA--AAAC-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--AA---ATG-------TATTTACTTATT----CAG-------GC-------TCTTATTTGTGGAATTCTATTCCATCTT
gi|105939                     :                      tCTCAGATGGATGACGTTTCCTGAAA---------AAGTTAAATTT-A-AAAAA-GGCAGTAC-TCGT--------GTATAT------ATCAT-TTAATGAGCGGGCTCC--TGTATA-TCT-CAA---AGCTTTATA-T---A------CTCTAA---CAGCC---A---ATGTTCATACA---AAAT--CTG-----TCATCCTCTAATCTACAGC---TGT-TTTTCCG----AAC-------TC--AAAT-T-CTG----AAGTGTTTC------------------A--AA---ATT-------TGTTAGTTTAGTAAAGAAA-------GC-------TCTTGTTTGTGAAATTCTATTCCATCATGT-AT-A-AA-A---AAT--TGAA----AAGATTTGATTT------ATTCAA-AT-GA-GTT---C
gi|105940                     :                             TGGATTACTGTCCCTGAAA---------GGGTAAAATTT-C-AAAAAAG-CTGTTC-TTAT--------GTATAA------AACGT-TACATAACATTGCCCCGTTG--TA-TTT-TAG---GGATGTATT-T---A------TTCTAA---ATCCT---G---ATATTCATTCAAAAAATTTAAGA-----TCCTTGTCTCACCTA-AATGCATATACTCTCCG----A---------CT--ACAT-A-TTT----AGTTATTTA------------------G--GA---GAT-------CTTTTATATATT----CAG-------
gi|105941                     :                                         CCTAAAA---------AG-TTCAATTT-C-AAAAA-ATCATTAA-TCAT--------GTATGA------ATCAT-TTAATGAC-AGGCTCC--TTCATA-TCT-CGA---AGATTCATT-T---A------CTCTAA---CAGCT---A---ATGTTCATACACAAATATTATGA-----TCATCCTCTAATCTA--GT---TGTATTCTCCC----GAG-------TC--CAAT-T-TTG----AAATGTTTC------------------A--AA---ATT-------C------------------------------------TTGTTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-A---AA---TGC------------------------TT--A-ATCCA-ATT---CAAA-GCTTTA---TATTA------AAAATGGAGT-----AAA-AATTCTTA-GCAACT
gi|105942                     :                                           TGAAA---------GGGTTAAATTT-G-AAAAG-G-CAGTAC-TTGT--------GTATA-----------------------GGTTGC--TGC------------------TTAT------A-------TCTAA---CAGGT---A---AGGTTCGTGAGCGTACATTACGG-----TCATCTTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCTT----AAG----------------------------TGTTCC------------------GTCAA---A---------CGTTTATTTATT----CAG-------GC-------TCTTGT
gi|105943                     :                                             AAA---------AGGTTATTTTTTC-AAAAG-G-CAATAC-TCAT--------CAGTAG------ATCAT-TAAATAACCAGGCTCC--TGTATA-TCT-CAA---AGATTTATT-A---A------CTCTAA---CAGCT---A---ATGTTCATACATGCACATTACCG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCCT----AGGT------CT--AAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G-------------------------TATT----CAG-------GC-------TTTTATTTGTGGAGCACTATTCCATCTTAT-AT-T-AA-A---TA---TGCA----A--AT----TAT------GTT--A-AT-CATTTT---CAAA-G-TTTA---TATTT------ACGACGGTCT-----AAA-TATTCTTA-ACAACTC--TAA-TA-A-A-TCGGGTCGCCCTCATCA
gi|105944                     :                                                      aaagagaaAAATTT-T-AAAAA-G-CAGTTT-TTGT--------GT-TAA------ATAAT-TTAATGAACACGCTCC--TGCATG-TCT-CGA---ATTATTATT-TGAAA------C---AA---CAGCT---A---ATGTTTATATACGTACATTACTT-----TCATCCTCTGATATACAGT---TATAACCTCCT----AAG-------CCAAAAAT-A-CTA----AAATAATTCACTTTAACCTCTTAAACTG--AAACGATTCAAAGAGCATTTACCTAAA----CAG-------AA-------TATTGTTAATAGATCTCTATTCCATC--AT-AT-ACAC-C---AA---TGCG----A--AT----TCC------GTC--A-AT-AA-GTT---TAAA-ACTTTA---TGTTG------ACAATAGAGT-----TAA-ACTTCTTA-TCACCTT--AAA-TA-A-A-
gi|105945                     :                                                               AATTT-C-AAAAT-G-CAATACATC-T--------GTATAATTAACTATAAT-TGAATGAGGAGACTTC--TCGGTA-CC----A---AGAGGGGCT-T---A------CTTTTGGTTCGGCT---A---ATGTTAATAGAGTAACGTTACGT-----TCATCCTCTCACCTACATT---TG
gi|105946                     :                                                                      -AAAAG-G-CAGTAT-GTGT--------GCATAA------A--ATATTAAAGTCCAAGCACC--TGCATA-TCT-CAA---AGACTGAAT-G---A------TTCTAA---CATCT---ATTTAT-TTCATA
gi|105946                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---ATT-------CACTTGCCTATT----AAGTATTTAAGTA------TCTTGTTTAAGAAAGTCTATTCCATCCTAC-AT-T-AA-G---AA-----------A--AT----TGT------CAT--ACAC-CA-GTA---TAAA-GCGTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AGA-AAATCTTC-ATATCTC---AA-TA-A-A-tttattttactattcacttgcctattaagtatttaagtatcttgtttaagaaagtctattccatcctacattaagaaaattgtcatacaccagtataaagcgttatatttacaatggagtagaaaatcttcatatctcaataaa
gi|105947                     : aaaaggcagtatgtgtgcataaaatattaaagtccaagcacctgcatatctcaaagactgaatgattctaacatctatttatttcatatttattttactATGA------ATCAT-AT--TGATTAGTCTCA-----ATA-T-T-CAATTCA-ATTCAATAT---C------CTTTATT--CAGCT---T---ATGTTCATACATGCACATTACGG-----TCATTCTCTAATCTGCAGT---TGTATTCTCCT----GAG-------AC--AAAC-T-TTGAAATAAATGTTTC------------------G--AA---ATT-------CGTTTGTTTATT----CAA-------GT-------TCTTGTTTATGGAACTCTCTTCCATCTTAC-AT---AA-T---AA---TGCA----A--AT----CAT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATTTACTGTAACAATTGAGC-----AAA-AATTCTTA-GCAACTC--TAA-TATA-A-TCGCGTAGCTCTTACCA
gi|105948                     :                                                                                                           tatttaaT-TTAATGACCCGGCTCC--GACATA-T-----------------T-T---A------CTCTAA---CATCT---A---ATGTGCATACACGCACACTACGG-----TCATCTTCTCATCTACAGT---TGTATTTTCTT----AAG-------CG--TAAT-T-CTG-----ATTTTTTC------------------G--AA---ATT-------CGCTTGCTTATT----CAG-------AC-------TCTTCTTTGTGGAACTCTATTCCGTCTTAT-AT-A-AA-AAATAA---TGCT----A--AG----TCT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-CCTTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAA-TATTCTTA-GCAACTCGGTAA-TA-T-A-TCGGGTAGCTCTCATTA
gi|105949                     :                                                                                                                     aatgtACCATACTCT--TGCATA-TCTATAA---TGATTTATT-T---A------TTCTAA---CATCA---A---ATGAGCATACACGAATACTACG------------TTTAA-----------------CTTCT----TAG-------CC--AAAT-A-CTG----AAATA-TTC------------------G--TT---ATT-------CGTTTGCTTAAC----CAG-------AC-------TCTTGTTT
gi|105950                     :                                                                                                                              GGCTCC--TGGCTAATCT-CAA---AGAGGTATT-T---A------CTCTAA---CATCT---A---ATGTTCATA
gi|105951                     :                                                                                                                                                    ---AGATTTATT-T---A------CTCTAA---CAGTA---A---ATGTTCACACACGCACTTTACGG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCCT----AAG-------CT--TAAT-T-CTG----AAATGCTTC------------------G--AA---ATT-------CGTTTGCTTATT----CAG-------GT-------TCTTGTTTGTAGAACTTTATTCCGTCTGAT-AT-A-AA-A---AA---TGCA----A--AT----TCT------AAT--A-AA-CA-GTT---CAAA-GCTCTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAG-AATTATTA-GCAACTC--TAA-TA-A-A-TTGAGTAGCTCTCATCA
gi|105952                     :                                                                                                                                                         ATTTGTT-T---AGTCGCCCTCCTA---CAGTTTATA---GTGTT---------ACATTACAT-----TCCTCCTCTCAGCTAAAGT---T-------------------------C--AAATGTACTG----AAATATTTT------------------G--CC---ATT-------TGTTTGCTTATT----CAG-------AC-------TCTTGTT
gi|105953                     :                                                                                                                                                                      ------CTCT-----CATCT---A---CTGTTTATAGAGATACATCACGT-----TCATCCTCTCATCTACAGT---TG
gi|105954                     :                                                                                                                                                                                        CT---G---ATGTTAATACACGCATATTATTG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCCG----AAG-------CA--AAAG-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--AA---ATT-------AGTTTGCTGATT----CAG-------GC-------TCTTGTTTGCGGAACTCTATTTAGTCTTAT-AT---AA-A---AA---CGCA----A--AT----TCT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-GCTTTA---TATTT------ACAATGGAGT-----AAA-TAGTCTTA-GCTACTC--TAA-TA-A-T-TCGGATAACTGTCATCA
gi|105955                     :                                                                                                                                                                                                       ATAGACGTACATTACGT-----TCATTCTCTAACCTACAGT---TGGAT
gi|105956                     :                                                                                                                                                                                                        TACATGTACAATACATATCTTTCATCCTCTTATATTAAAT---AACATTCTCCA----AAT-------TC--AAAC-A-CTG----AAATGTTTC------------------G--CC---ATT-------TGTTCATATATT----CAGCCTG---GT-------TTCTGTTTATGAAAGTATATTCCAATTAAT-AT-A-AA-C---AA---TTCA----T--AT----TCT------ATC--A-AT-CA-ATT---TAAA-ACTCTA---TATTC------AGAGTGGCGT-----AAA-TACTTTTCTATAACCT--TAATTA-A-G-TC
gi|105957                     :                                                                                                                                                                                                               ACATTATGA-----TTATCCTGAAATCTACAGT---TGTATTGTCCT----AAG-------CT--GAAT-T-CTG----AAATATTTC------------------G--AA---ATT--------GTTTGATTTTT----TAG-------TT-------TTTTGTTCGTGAAATTCTATTACATCATAT-AT-A-AATA---AAAATTGCC----A--GT----TGT------ATT--A-AT-CA-GTT---CAAA-ACCTAA---TACTC------GCAATGGAGT-----ACA-AACTCTTA-GCACTTC--TAA-TT-A-A-GCCAGAAGCTCCCTTCA
gi|105958                     :                                                                                                                                                                                                                CATTACGG-----TCATCCTCTAATCTACAGT---TGTATTCTCAA----AAG-------CC--AAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--CA---ATT-------CGTTTGCTTACT----CGG-------TC-------TCATGTCTATGCAATTCTTTCCCATCTTAC-TT-A-AG-A---AA---TGTA----C--AT----TTTCAGTTGATT--A-AT-CA-GTT---GAAA-GCTTTA---AGTTT------ACAATGGAGC-----AAA-GATACTTG-GCAACTC--TAA-TT-A-A-----GT--CTCTCATCA
gi|105959                     :                                                                                                                                                                                                                                            CAAT---TGTAT---CCT----AAG-------CC--AAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--TC---ATT-------CGTTTGCTTATT----AAG-------GC-------TCTTGTTTGTGGAACTCTATTCTATCATAT-AT-A-GA-A---AA---TGCA----A--AT----TAT------ATA--A-AT-TA-GTT---TA
gi|105960                     :                                                                                                                                                                                                                                                       TTATCCT----AAG-------CC--AAAT-T-CTG----AAATGTTTC------------------G--TC---ATT-------CGTTTGCTTATT----AAG-------GC-------TCTTGTTTGTGGAACTTTATTCCATCATAT-AT-T-GA-A---TA---TGCA----A--AT----TAT------ATC--A-AT-TA-GTT---TGTA---TTGA---TATTT------
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gi|105962                     :                                                                                                                                                                                                                                                         taaatataactttgtaaatggagttaatatgctttcaaaATGCTTC------------------G--GC---ATT-------CGTTAGTTTATT----CAG-------GC-------T--TGATTTCGGAACGCTATTCCATCTTAT-AT---AA-A---AA---TGCA----A--AT----TCT------TTT--A-AC-C
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gi|105975                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTTA-GCAACTC--TAA-CA-A-AATCGGGTAGCTTTCATCA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|105935 ): AACTATTTGCTGAACTGGATTAGATTACTTCCCATGAAAGAGTAACATTCCAAAAGGCAGTTCTTAGGTATGAAACGTTATATAACATTGCCCGTCGTATCTTAGGGATGTATTTATTCTAAATACTGGTATTCATTCACTTAAGATCATCGTCTAACTTAAATTTAGATATATTCCACGACCAAATCATGAATTATTTAGAA