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Reference ( gi|85923 )        :          AAAT-CATAAGT-----AT--GT---A------TA----T--TTA-----A-A-ACAGT-TA----ACAGGTC-AACATAC-CT-GT-TCTTCA-TTGTT---AT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGCATTAA--ACCCCAC-T-TAAACAA
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gi|85926                      :          AAAT-CATAAGT-----AT--TT---A------TA----T--TTA-----A-A-ACAGT-TA----ACAGATA-AACATCC-CC-GT-TCTTCA-TTGTT---TT-AA-AC---TG--T-T---A---ACTGGCATTAA--ACCCCAC-T-TAA
gi|85927                      :          AAAT-CATAAGT-----AT--GTTGTA------TA----T--TTA-----A-A-ACAGT-TA----ACAGGTC-ATCATCC-CT-GT-TCTTCA-TTGTT---TT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACAGGAATTAA--TCCCCAC-T-TAAAAAA
gi|85930                      :          AAAT-AATAAGT-----AT--GT---C------TA----T--CTA-----A-A-ACAGT-TT----ACAGGTC-AACATCC-CT-GT-TCTTAA-TTGTT---TC-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGCATTAA--ACACCAC-T-TAAAAAA
gi|85931                      :          AAAT-CGTAACT-----AT--GT---A------T-----T--TTA-----A-A-GCAGT-TA----ACAGGTC-AACATCC-CT-GT-TTTTCA-TTGTT----T-AA-AC---TA--T-T--AA---ACTGGTACTAA--ACCCCAT-T-TAAA
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gi|85952                      : aataataaaAAAT-TATAAAT------T--TT---G------TG----T--TTA-----A-A-ACCAT-TT----AGAGGTC-ATCATCC-TT-GT-TCTTCC-TTGTT---AT-AA-ACAATTG--T-T--
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gi|85963                      :                atagaa-----AT--AT---A------TT----T--TCA-----A-A-ACAGT-TT----ACAGTTC-AAGATCC-CT-GT-TCTTCACTTGTT---GT-AA-AC---GG--G-T--AATTTCCTTACATTGAGGACCCC
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Alignments
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gi|85926                      :         AAAT-CATAAGT-----AT--TT------A------TAT----TTAAA-ACAGT-T--A-A----CAGATA-AACATCC-CC-GT-TCTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T---A---ACTGGCATT-------AA--ACCCC---AC-T-TAA-
gi|85927                      :         AAAT-CATAAGT-----AT--GTTGT---A------TAT----TTAAA-ACAGT-T--A-A----CAGGTC-ATCATCC-CT-GT-TCTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACAGGAATT-------AA--TCCCC---AC-T-TAA-AAAA
gi|85928                      :         AAAA-CATAAGT-----TT--GT------A------TGT----TGAAA-ACAGT-T--T-A----CAGGTC-AACA---------------------TATCTT-AA----------T-T--AA---ACTGGTTTT-------AA--ACCCC---A--T-TAA-AAAA
gi|85929                      :         AAAT-CATAAGT-----AT--GT------A------TGT----TTAAA-ACAGT-T--A-A----CAGGTC-AACATCC-TT-GT-CCTT-TA---TTGTTTA-AG-AC---TG--T-A--AA---ACTGGCATT-------AA--ATCCT---A--T-TAA-AAA
gi|85930                      :         AAAT-AATAAGT-----AT--GT------C------TAT----CTAAA-ACAGT-T--T-A----CAGGTC-AACATCC-CT-GT-TCTT-AA---TTGTTTC-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ACACC---AC-T-TAA-AAAA
gi|85931                      :         AAAT-CGTAACT-----AT--GT------A------T-T----TTAAA-GCAGT-T--A-A----CAGGTC-AACATCC-CT-GT-TTTT-CA---TTG-TTT-AA-AC---TA--T-T--AA---ACTGGTACT-------AA--ACCCC---AT-T-TAA-
gi|85932                      :                 AAGT-----AT--AT------A------TATAA--TTAAA-ACAGT-T--A-A----CAGGTC-AACATCT-AT-GT-TCTG-CA---TTGTTTT-AA-AT---TG--T-TA-AA---ACTGGCATT-------AG--ACCCC---AC-T-TAA-
gi|85933                      :  aaataaaAAGT-TGTAAAT-----AT--GT------A------TGT----T-AAA-ACAGT-T--T-A----CAGGTC-ATCTTCC-CT-GT-TTTT-TA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGACATT-------AA--ATCCT---A--T-TAA-AAAA
gi|85934                      :         AAATTCATAAGT-----AT--GT------A------TGT----TTTAT-ACAGT-T--T-G----CAGGTC-ATCTTCC-CT-AT-TCTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--G-T--AA---ACTGACATT-------AA--ACCCC---A--T-TAA-AAAA
gi|85935                      :         AAAT-CATAAGT-----AT--GT------ACCGGTATAT----TTAAA-ACAG---------------GTC-AACATCT-CA-GT-TCTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ACACC---AC-T-TAA-AAA
gi|85936                      :         AAAT-CGTAAGTTAACAAT--GT------A------TGT----TTAAA-AGAGT-T--A-A----GAGGTC-AACATCC-CT-GT-TCTT-AA---CTGTTTT-CA-AC---TG--T-T--AA---AGTGGCATT-------CA--ATTCC---A--T-TAA-AAAA
gi|85937                      :         AAAT-CATAAGT-----AT--AT------A------TAT----TTAAA-ACAG------------CAGGTC-AACATTC-CT-GT-TTTT-CA---TTGTTAT--A-AC---TG--T-T--TA---ACTGGCATT-------CA--ACCCC---AC-T-
gi|85938                      :         AAAT-CATAAGT-----CT--GT------A------TGT----TTAAA-ACAGT-T--G-A----CAGGTC-AACCTCC-AT-GT-TTTT-CA---ATGTTTT-TA-AA---TG--T-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ACCC
gi|85939                      :         AAAT-TATAAGT-----AT--TT------A------TAT----TTAAA-ACA------------------------TCC-CT-GT-TCTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ACCCC---AC-T-TAA-AAAAaaatacaaa
gi|85940                      :         AAAT-TGTAAGT-----AT--GT------A------TGT----TTAAA-ACAGT-TAAC-A----CAGGTC-AACATCC-CT-GTCTTTT-GA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AA---ATAGGTGTT-------TG--ATTCTAAAAT-T-TAA-AAAA
gi|85941                      :         AAGT-CATAAGT-----AT--GT------A------TGT----TTAAA-ACAGT-G--A-A----CAGGTC-AGGATCC-CT-GA-TATT-TA---TTATTTT-AA-AC----G---------------GGCATT-------AA--ACCCC---AT-T-
gi|85942                      :         AAAT-CATAAGT-----A----------------------------AA-ACAGT-A--A-A----CAGGTC-AACATCT-CT--T-TCTT-CA---TTGTTTT-AT-AC---TG----T--AA---ACTGGCATTAAACCCCAA--ACCCC---AT-T-TAA-AAAA
gi|85943                      :         AAAT-CATAAGT-----AT--GT------A------TAT----TCAAA--CAGT-T--A-A----CAAGTC-AACATCC-CT-GT-TCTT-CATTGTTGTTTT-AA-
gi|85944                      :         AAAT--GTAAATT----AT--GT------A------TAT----TTAAA-ACAGT-T--A-A----AAGGTC-AATATCC-CT-GT-TTTT-CA---T--TCTT-AAGACAAAT---T-T--AA---ATTGGCATT-------AA--A
gi|85945                      :         AAAT-TGTAAAT-----TTT-GT------A------TAT----TTAAA-ACAGT-T--T-A----TAGGTC-AATATCC-CG-GT-TCTT-TA---TT-CATC-AG-AC---TGTTT-T--AA---ACTGGCATT-------AA--
gi|85946                      :         AAAT-CGTAAATT----AT--GT------A------TATAT--TTGAA-ACAGT-T--T-A----TAGGTC-AATATCC-GT-GT-GCTT-CA---T--TCAC-AAGAC---TG--T-TTAAA---ATTGGCATT-------AA--A
gi|85947                      :         AAAT-TGTAAAT-----TTT-GT------A------TAT----TTAAA-ACAGT-T--T-A----TAGGTC-AATATCC-CG-GT-TCTT-TA---TT-CATC-AG-AC---TGTTT-T--AA---ATTGGCATT-------AA--A
gi|85948                      :         AAAT-TGTAAAT-----AT--GT------A------TATATATTTAAA-ACAAT-T--A-ATTTACAGGTT-TTCTTCC-TT-TT-TCTT-CA---TTGTTTTAAA-AT---TA--TAT--AA---AATACCATTAA-----AA--AACAT---AA-T-TAA-AAAA
gi|85949                      :         AAAT-CATAAGC-----AT--GT------A------TAA----T-AAA-CCAGT-T----------------AACATCC-CC-GC-T-TT-CT---TTGTTAT-AA-AC---AG--T-T--AA---ACAGGCATT-------AA--ACTC
gi|85950                      :         AAAT-CATAATT-----AT--GT------A------TAT----TTAAA-ACATT-T--A-A----TAG--------------------TT-CA-----------AA-AC---TA--T-T--AA---AATGGCATT-------AA--ACCCC---ATAT-TAA-AAAatt
gi|85951                      :         AAAT-TGTAAAT-----AT--GT------A------TGT----TTAAA-ACA------------------------TCC-TC-GT-TCTT-AA---TT-TTGT-AA--C---TG--G-T--AA---ACTTGCATT-------CA--ACCCC---AT-TGTAA-AAAA
gi|85952                      :         AAAT-TATAAAT------T--TT------G------TGT----TTAAA-ACCAT-T--T-A----GAGGTC-ATCATCC-TT-GT-TCTT-CC---TTGTTAT-AA-ACAATTG--T-T--
gi|85953                      :         AAAT--GCATGT-----ATCGGT------A------TGT----TAAAA-ACAGT-A--T-A----CTGATC-A----------------T-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGACTTT-------AT--ACCCC---AT-T-TAA-
gi|85954                      : aaaacataAAAT-TGTTGGT-----AT--GTGCATTTA------TGT----TAACA-ACAGT-T--T-A----CA-GTCAAATGTCC-CA-GT-TATT-CG---TTGTTTT-GA-AC---TA--A-C--AA---ACTGGTGTT-------TA--ACCAC---AT-T-
gi|85955                      :         AAGT-CTTAAGT-----AT-------------------------TAAA-ATAGT-T--T-A----CAGGTT-AACATCG--T-GT-CCTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--
gi|85956                      : aataataaaAAT-CATAAATG----AT--AT------A------CAT----TTAAA-ACAGT-T--A-A----GAGGTC-AATATT--------------A---TTGTTTG-AA-A--------T-T--A--------GTATT-------AA--ACCCC---GC-T-
gi|85957                      :           AT-CATAAGT-----AT--GT------A------TAT----TTAAA-ACTGT-T--A-A----CAGATC-AACATCC-CT-GT-ACTC-CA---TTGTGCT-AA-AT---TT--T-T--AA---ACTGGCATC-------AG--CCACC---GC-T-TAATAAAAagaa
gi|85958                      :           AT-CGTAAAT-----AT--GT--------------------TTAAA-ACAGT-T--T---------GTA-AACATGC-CT-GT-TCTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TT--T-T--AG---ACTGGAATT-------AA--ACACC---A--T-TAA-AAAaa
gi|85959                      :           AT-CATGAGT-----AT--GT------A------TGT----TTAAA-ACAGT-T--T-A----CAGGTC-AACATCC-CT-AT-T-----A---------T-AA-AC---TA--T-T--CA---ATTGGCATT-------CC--GCCTC---TT-T-TAA-AA
gi|85960                      :                    T-----AT--AT------A------TAT----TTAAA-ACATT-T--A-A----CAGGTC-AACATGC-CT-GT-TCTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TA--T-T--AA---ACTGACATT-------AA--ACACC---AC-T-TTA-AAAA
gi|85961                      :                atata-----AT--GT------A------TGT----TTGAA-ACAGT-T--A-A----TAGGTC-AACATCC-CT-GT-CCTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ACTGC----T-T-TAA-
gi|85962                      :          atagaaTAAGT-----AT--GT------A------TGT----TTAAG-ACAGT-T--T-A----CAGGTT--ATATTCACT-GT-TCTT-TA---TTGTTTT--A-AC---TG--T-T--AA---AATGGCATT-------AA--A-TCT---AA-T-TAA-
gi|85963                      :                     -----AT--AT------A------TTT----TCAAA-ACAGT-T--T-A----CAGTTC-AAGATCC-CT-GT-TCTT-CAC--TTGTTGT-AA-AC---GG--G-T--AATTTCCTTACATT-------GAGGACCCC---
gi|85964                      :                 taaT-----AT--GT------A------CAT----TTAAA-ACAGT-T--C-A----CATGTC-AACATCC-TT-GT-TCTT-TT---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGCATT-------TA--TTCCC---G--T-TAA-AAGA
gi|85965                      :                        agaT--GT------A------TGT----ATAGA-ACAGT-T--T-A----CAGGTA-AACATCT-CT-TT-TCTT-CA---TAATTTT-AA-AC---------T--AA-----TGGTATT-------AA--ACCC
gi|85966                      :                       aattT--GT------A------TAT----TTAAA-ACAGT-T--T-T----CAAGCT-AAGATCC-CT-GT-TCTC-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ATCCC---A----TAA-AAAAtgttctgacaaaaaa
gi|85967                      :                 aatT-----AT--GT------A------TGT----TTAAA-ACAG---------------ATC-AACATTC-CT-GT--CTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AT---ACTGGCAT-------------CTCC---A----TAA-AAAA
gi|85968                      :                    T-----AT--GT------A------TGT----TTAAA-ACTCT-A--A-A----CACGTT-TACACCT-CT-GT-TTTTTCA---TTAT-------------G--T-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ACCC
gi|85969                      :                                                ----TTAAA-ACAGT-T--T-A----CAGGTC-AACATTC-TT-GA-CCTT-TG---TTGTTTT-AA-AC---TA--T-T--CA---ACTTGCATT-------AA--ACCCC---A--T-TAA-AAGAgatt
gi|85970                      :                                                         -ACACT-T--A-C----CAG--T-GACATTT-CTTGT-T-TT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--TA---AATGGCATA-------AA--ATCCC---A----TAA-AAA
gi|85971                      :                                                              T-T--T-A----CAGGTC-AACATCC-CTTGT-TCTT-CA---TCGTTTT-AA-AC---TT--T-T--AA---AC-GCCATT-------AA--A---A---ACAT-TAA-GAAA
gi|85972                      :                                                                    -A----CAGGTC-AACATCC-CA-AT-TTTT-CA---TGGTT---------------T-T--AA---ACTGGCATT-------AA--GC
gi|85973                      :                                                                           AGGTC-AACATTT-CT-GT-ATTT-CA---TTGTTTT-AT-AC---TG--T-TA-AA---ACTGGCATT-------AA--ACCCC---A--T-TAA-AAAA
gi|85974                      :                                                                           AGGTA-AACATTC-CA-GT-TCTT-CA---TTGTTTT-AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGTATT-------
gi|85975                      :                                                                                           -GT-TTTT-CA---TTGTTTG-AA-GC---TG--C-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ATCC
gi|85976                      :                                                                                                  T-CA---TTGTTT--AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGCATT-------AA--AC
gi|85977                      :                                                                                                     A---TTGTTTT-AA-AC---TG--A-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ACCCC---A--T-TAA-ACAAagcacatt


blockSeqs                     :             T       TAACA  CG  GCATTT CCGGTA A ATAT             AAC  TTTA                 T          TTG          G  AAA  TT   TA  TTT         AAACCCC  GG     AAA TA G   T
blockSeqs                     :             .       T      T   TGT    .      A AA               AC   .                    T          C            G  AAT  TT   A   .           AA       .      .   CA .   .
blockSeqs                     :             .       T      T   .      .      A AT               T    .                    .          .            .  .    .    A   .           .        .      .   C  .   .
blockSeqs                     :             .       G      .   .      .      A .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   C  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   C  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   C  .   .
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blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   C  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   C  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   C  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   C  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   T  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   T  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                G    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   T  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   A  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   T  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   T  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   T  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   C  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   C  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   T  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   C  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   T  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   A  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      A .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .   .
blockSeqs                     :             .       .      .   .      .      G .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .    
blockSeqs                     :                     .      .   .      .      T .                C    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .    
blockSeqs                     :                     .      .   .      .      A .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .    
blockSeqs                     :                     .      .   .      .      G .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .   .  .    
blockSeqs                     :                     .      .   .      .      A .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .      .           
blockSeqs                     :                     .      .   .      .      G .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                     .      .   .      .      G .                A    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                     .      .   .      .      . .                T    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                     .      .   .      .      . .                .    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                            .   .      .      . .                .    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                            .   .      .      . .                .    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                                                .                .    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                                                                 .    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                                                                 .    .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                                                                      .                    .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                                                                                           .          .            .  .    .    .   .           .        .                  
blockSeqs                     :                                                                                           .          .            .  .    .    .   .           .                           
blockSeqs                     :                                                                                           .          .            .  .    .    .                                           
blockSeqs                     :                                                                                                      .            .  .    .                                                
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gi|85975                      :                                                                                           -GT-TTTT-CA---TTGTTTG-AA-GC---TG--C-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ATCC
gi|85976                      :                                                                                                  T-CA---TTGTTT--AA-AC---TG--T-T--AA---ACTGGCATT-------AA--AC
gi|85977                      :                                                                                                     A---TTGTTTT-AA-AC---TG--A-T--AA---ACTGGCATT-------AA--ACCCC---A--T-TAA-ACAAagcacatt