lowQualScore : 333 1111111111111 111111111111111111111111111 11111111 11111 11111 444444444444444444444 1 1 1111 222222222
lowQualScore : 77777 666 222 2222 222222 7777777777777 11 33333333 0 22222 0 0 0 111 111 111 666666666666666666666666666 1 66666666 1 1 1 1 33333 1 11 4444444 1 444 333333 3 11111 66666 777777777777777777777 11 2222 222 1 33333 5 2222 333333 11 1 222 6 666 333333 3 1 11 2222 1 1 999999999 999 444444 6
lowQualScore : ..... ... ... .... ...... ............. .. ........ . ..... . . . ... ... ... ........................... . ........ . . . . ..... . .. ....... . ... ...... . ..... ..... ..................... .. .... ... . ..... . .... ...... .. . ... . ... ...... . . .. .... . . ......... ... ...... .
lowQualScore : 55555 222 000 7777 555555 4444444444444 22 22222222 9 22222 9 9 9 555 555 555 999999999999999999999999999 3 22222222 3 3 3 3 33333 3 88 3333333 3 000 888888 5 66666 00000 111111111111111111111 99 9999 444 4 44444 2 9999 666666 77 2 222 1 111 777777 3 3 88 3333 1 4 555555555 888 000000 8
consensus : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATGG------CTC----GTATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------AT--TT----------GT-TA------C-AT-TT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATA-GGT-GTGC-----------------GC-AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATGTACGT----ATA------AT--AA-CCCTAAA---TACTNCAATTG--CATGACTA------GAATAAT-A--TAAGTTGGTCAAGC--AATATCA-A---G--A--TACN--AATT------AAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
Reference ( gi|103954 ) : TTGAAAA----TA---A---A----GT------GAATGGATGG------TTG----ATATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------AT--TT----------GT-TA------A-AT-TT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATA-AGT-GTGT-----------------GTAAATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATGTAGGT----ATA------AT--AA-CCCTAAA---TACTTCAATTA--CATGACTA------GACTAAT-A--TAAGTTGGTCAAGC--AATACCA-A---T--A--TACA--AATT------AAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTACAGTTGAGATGAT
gi|103957 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATTG------CTC----GTATT--GT--------C-TTAA-----T-ATTAT-TC-AA---TTTA---G---CATTT--GTC------AT--TT----------GT-AA------A-AT-TTTGTCTTTCAAACTTTA-AAA-C-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATA---T-GTGT-----------------GTA----CCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATGTACATTATTATA------AT--AA-CCCTAAA---TACTTCAATTG--CATGACTA------GAATAAT-A--TAAATTGGTCAAAC--AATACTA-A---T--A--TACA--AATT------AAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAGGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTGTAGTTGAGATGAT
gi|103956 : TTGAAAA----CA---ACAAA----TT------TCATTGATGG------CTC----ATATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---AATT---ATC------AT--TT----------GA-TA------C-AT-TT-ATCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTT-AT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC--AATA-GGT-GTGC-----------------C--AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACAGC-----ATGTACGT----ATA------AT--AA-CCCTAAA---TACTTCAATTG--CATGACTA------GACTAAT-G--TAAGTTGGCCAAGC--AATACTA-A---T--A--TACA--AATT------AAACATTACCTGAAATAATTCCAGCATGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103953 : TTGAAAA----TA---ACAAA----GT------GAATGGATGG------CTC----ATATT--AC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTA------AT--TT----------GT-GA------T-AT-TT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCT-CAATA-GGT-GTGC-----------------C--AATACCT--A----ACT---AA-AGGGACATC-----ATGTACGT----ATG------AT--AA-CTCTAAA---TACTTCAATTG--CATGACTA------GAATAAT-A--TAAGTTGGTCAAGC--AATACTA-A---A--A--TACA--AATT------AAACATAACTTGATCTAATTCCAGCAAGAAATTAAACTATTGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103960 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATTGATGG------CTC----GTATT--GC--------C-TCAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTT------AT--TC----------AT-TA------T-AT-TT-GTCTTTCAATCTTTA-AAA-T-----T-GCTCTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATA-GGT-GTACCGAACGACGCACTTCCGATAAAAACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATGTGCAT----ATACATGTAAT--AA-CCCTAAA---TACTTCAATTG--CATGACTG------GAATAAT-A--TAAATAAGTCAAGC--AATACTA-A---T--T--TACA--AATT------AAACATTACCTGAAATAATTCCAACAAGAA-AAAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103959 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATTGATGG------CTC----GTAGT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTTT-GTC------AT--TT----------GT-TA------C-AT-TT-GTCTTTAAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTGTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------A-AAAAA-CAATA-GGC-ATGC-----------------C--AATACCT--A----ACA---TA-AGGTACATC-----ATGTAAAT----ATA------AT--AA-CCCTAAA---TACTTCAATTG--AATGGCAA------GAATAAT-A--TAAATTGGTCAACC--AATACTA-A---T--A--TACA--AATT------AATCATAACCCAATGTAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGAAAGCTATAGTTGAATTGAT
gi|103963 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATGG------CCG----ATATT--GC--------A-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--A------------------------GT-TA------C-AT----GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGTTGAAATAA------AAAACT----ATA-GGT-GTGC-----------------C--AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACAGG-----GTGTATGT----ACA------AT--TA-ACCTAAA---TACTACAATTA--CATTACTA------GAATAAT-A--TAAGTTGGTCAAGC---ATATCA-C---T-----------AATT------AAACATTACCTGAAATAAATCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGTTATAGTTGAGATAAT
gi|103961 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATGG------CTC----GTATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--TCC------AT--TT----------GC-TA------C-AT-TT-GTCTTTCAAACTTTA-ATA-T-----T-GCTTTAT--AA-------TTTC-ATTAATCATT-CTGA--CAA------ATAACAC---ATT-TG--GTGT-----------------GCCAATACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ACGTACGT----ATA------AT--AA-CTCCAAA---TACTTCAGTTG--CATGTCAA------GAATAAT-A--TACGTTGGTCAAGC--AATAC---------------------TT--------ACATTACCTGAAATTATTCCACCAGAGATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103962 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATGG------CTT----GTATC--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCT---G---CATTT--GTC------AT--TT----------GT-TA------C-AT-TT-GTCTT---------------------------TAT--AA-------ATTC-ATTAACAATTGCTGA--CAA------ATAAACC-CAATA-GGT-GTGC-----------------C--AATACCT--A----ACT---TA-AAGCACACC-----ATGCACAT----ACA------AT--AA-CCCTAAA---TACTTCAATCG--CATGACTA------GGTTGAT-A--TTAGTTTATCAAGC---ATGTCA-A---GAAA--TACT--AATT------AAACATTACCTGAAATAATTCCAGTAAGAATTTTAAATACAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103955 : TTGAAAA----AA---AGTAA----GT------GAATGGATGG------CTT----GTATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTT------AT--TA----------GT-TACATTGTACAT-TT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-A-----T-GCTTCAT--AA-------ATTG-ATTAACCATTGCTGA--CTA------ATAACCC-CAATA---C-GTGT-----------------GCCAATACCT--T----ACT---AA-AGGCACATC-----ATGTACGT----ATA------AC--AA-CCCTAAA---TA-------------------------------------AAGTTGGTCAATC--AATACTT-A---T--A--AACA--AATT------AAACATTACCTGAAATAATTCCAGTAAGAATTTGAAATATAATGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103966 : TTGAAAA----CA---A---AAAAAGT------GAATTGATGT------CTC----GTATT--GT--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---T---CATTT--GTC------AT--TT----------GT-TA------C-AT-TT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-G-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTCACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAGTA-GGT-GTGC------------------TAAA-ACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATGCACGT----ATA------AT--AA-CC---------------ATTG--CATGACTA------GAATAAT-A--TAAGTTTGTAAAGC--AATACTA-A---T--A--TACA--AATA------AAACATTACCTGAAATAAT
gi|103968 : TTGAAAA----CATCAA---A----GT------GAAGGGATGA------CTC----GTATT--GC--------C-TTAC-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------AT--TT----------GT-TA------C-AT-TT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCGTTAT--AA-------ATGC-ATTTACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC---ATATAG--GTGT-----------------GCCAATACCT--ACCTTACT---TA-AGGCACACC-----ATGTACGT----ATA------AT--AA-CTCTAAA---TACTTCAATGG--CATGACAA------AAATAAC-A--AAAGCT-GTCA
gi|103970 : TTGAAAA----CA---A---A----AA------AAGTGAATGG-------------ATA-----C--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-TA---TTAA---G---CA--------------AT--TA----------GT-TA------C-AT-TT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--TA-------ATTT-GTTAGCCAATGCTAA--AAA------ATAA-CT-TGATA-A----TGT-----------------GTCAATAC----------CT---TA-ATGCACCCC-----AGGTACAT----ATA------TT--TA-CCCTAAA---TACTACAATTG--CATGACTA------GAATGAT-A--TAA-----TCAAGC---ATATTA-A---GAAA--TGCT--AATT------AAATGTTATTTGAAATAGTTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGC-ATTGTTGAGAgaagacaacaa
gi|103971 : TTGAAAA----CA---ACAGA----GT------GAATGGATGA------CTT----ATTTT--GC--------C-TAAA-----T-ATTAT-TTTAA---TTTA---G---CATTT--ACC------GT--A-----------GT-TA------C-AT-TT-GTCATTCAAACATTA-AAAAT-----T-GGTTTAG--AA-------ATTC-ATTTTCCATTGCTGA--CAA------ATAA-CC-TGATA-G---GCGT-----------------GCCAATACCT--A----ACTAAACA-AGGCACACC-----ATGTATGT----ATA------AT--AA-CCCTAAA---TATTGCAATTG--CATGAATA------GA------A--TAATTTAGTCGAG---GATATCA-
gi|103973 : TTGAAAA----CA---A---T----GT------GAATGAATAG------CTC----ATATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTGT-GT-AA---TTCA---AAATCATTA--ACC------AT--Tcgaagaactaatttaata
gi|103972 : TTGAAAAACAACA---A---A----GT------GAATGGATGG------CTC----GTATT--GT--------C-TCAA-----T-ATGAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------AT--TT----------GT-TA------C-AT-TT-GTCTTTC-------A-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTCTATGAA-CA--GCTAA---AA------ACAACgctgaaaaataacacgataggtgtaccaatacctaacttaaggtacacattcttaataccacaattgcattagttggtcttggtcaagcctatcaagaaatactaattaaacattacctgaattaactccagcaagaatttgaaataaagtgtaagccaaagttaacat
gi|103976 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATGG------TTC----ATATT--AC--------C-TTAA-----T-ATTAT-CT-AA---TTCA---G---CATaaggaataaaaacaagagtgccaa
gi|103975 : TTGAAAA----CAGCAA---A----GT------GAATGGATGG------CTC----ATATT--GC--------T-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103958 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GG------GAATGGATGG------CTC----ATATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103977 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATGG------CTT----GTATT--GC--------CCTTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103980 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GC------GAATGGATGG------TTT----GTATT--GC--------C-TCAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---A---CAT
gi|103981 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GG------GAATGAATGG------TTT----GTATT--GC--------C-TTAA-----C-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103978 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATGG------CTC----GTATT--GC--------C-TTAATAAATT-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103982 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATGG------CTT----GTATT--GC--------C-TT-A-----T-ACTAT-CA-AA---TTCA---G---CAT
gi|103983 : TTGAAAA----CAGGAA---A----GT------GAATAGATGG------CTC----GTATT--GC--------T-TT-------T-A--AT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103984 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATGG------CTC----ATAGT--GT--------C-TTAA-----
gi|103974 : TTGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGGATGGCTCACATTGACTTACATT--GC--------C-ATAA-----T-ACTAA-TT-AA---TTTA--------ATTT--AAC------AT--TCA---------GT-TA------
gi|103985 : TGAAAA----CA---ACCAA----GT------GAATGGATGG------CTC----AAATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CTTTT--GTC------AT--TT----------AT-TA------C-AT-TT-GTCTTTAAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AATTTGTAAATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATA-GGT-GTGC-----------------C--AATACCT--A----ACT---TA-AGGAACATC-----ATGTATGT----ATA------AT--AA-CCCTAAA---TATTTCAATTG--CATGACTA------GTATAAT-A--TAAGTTGGTCAAGC--AATACTA-A---C--A--CAAA--AATT------AAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAACAAATTTTAAGCTATAGTTGAGATGATca
gi|103986 : TGAAAA----CAGCAA---A----GT------GAATGACTGG------CTC----ATATT--GC--------C-TTAA-----T-ATCAA-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103987 : TGAAAA----CA---ACAAA----GT------GAATGACTGG------CCT----ATATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAA-TT-AA---TTTA---G---CAT
gi|103988 : TGAAAA----CA---A---AT---GTCAAAACAAATGGATTG------CTT----ACATT--GC--------C-ACAT-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103964 : AAAA----CA---A---A----GT------GAATGAATGG------CTT----GTATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TC-AA---TTCA---G---CATTA--GTC------AT--TT----------GT-TA------C-AT-TT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-AATTTAT--AA-------TTTC-ATTAACCATTGCTGC--CAA------ATAACCC-CAATA-G---GTGT-----------------GCCAATACAT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----CTGCATGT----ATA------AT--AA-CCCTAAA---TACTTCAATTG--CATGACGA------AACCAAT-A--TAAGTTGGTCAAGC--AATATTA-A---T--A--TACA--AACC------AA
gi|103993 : ttgaaAAAA----CA---A--------GT------GAATGAATGG------CTC----ATATT--GC--------C-TAAA-----T-ATTGTATC-AAACTTTCAAATG---CATTG--ATC------AT--
gi|103991 : AAAA----CA---A---A----GT------GAATGACTGG------CTC----ATATT--GC--------C-TTTA-----T-ATTAA-TT-AA---TTCA---G---CATgactgaaaaataaccccatatgtgtgtcaatactatgtacgtatagtaacccttattactacaattgcaaggtcaagcatatcaagaaataccaattaaacattacctgaaattattccagcaagaattaaaaatatagtgtaagccatagttaagacgat
gi|103999 : gaaaAA----CA---A---A----GT------GAATGGATGG------CAC----ACATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CATTG--A------------------------GT-TA------C-AT-TT-GTCGTTCAAACTTTACAAA-TGTTTAT-GCTTTTT--AA-------ATTC-ATTAACCTTTGCTGA--CAA------ATAACCC-----------GTGT-----------------GTTAATACCTTAA----ATT---TA-A-------C-----ATGTATGT----ATA------AT------CCTAAA---TATTACAATTG--CATGAATA------GAATAAT-G--TAAGTAGGTCAAGC--A-TATCA-A---G--AAATACT--AATT------AAACATTATCTGAAATAAGTCTAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTGTAGTTCAGATGAT
gi|103992 : AA----CA---A---A----GT------GAACGGAAAG------CTC----ATATT--GC--------T-TTAA-----T-ATTGT-TT-AA---TTAA---G---CATTT--A------------------------AT-TA------C-AT-TG-GTCTTTCAAACTGTA-AAA-T-----T-GCTCTAT--TA-------ATTC-ATTAATCATTGCTGA--AGA------A-AAT----GATA-GGT-GTGC-----------------C---ATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----GTGTACAT----ACA------AT--TA-CCCTAAA---TACTATAAATG--CAGGACTA------GAATAAT-A--TAAGTTGGTCAAGC---ATATCA-A---G--A--AACACTAATT------AAACATTATCTAAAACAATTCAAGCAAGAATTTAAAATATCTTGTAAGCCATAGTTCAGATGAT
gi|103965 : aaaacAA----CA---A---A----GT------GAATGGGTTG------CTC----ATATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CATTT--A------------------------GA-TA------T-AT-TT-GTCTTTTAAACTTTA-AAA-T-----T----------------------C-ATTAACCATTG-------------------------ATA-GGT-GTGC-----------------C--AATATCC--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATGTACGT----ATA------AT--AA-CCTTAAA---T--------TG--CATGAATA------CAATAAT-A--TAAGTTGGTCGAGC--A-TATCA-A---G--AAATACT--AATT------AAACATTACCTAAAATAATTGCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103967 : ttaaaaacAA----CA---A---A----GT------GAGCGGATAG------CTC----ATATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTAA--------ATTT------------T--TA----------GT-TT------C-AT-TT-GTCTTTCAATCTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------GTTC-ATTAACCATTGCTGA---AA------A-AA-----GATA-GGT-AAGC-----------------C--AATACCT--A----GCT---TA-AGGCACACC-----ATATACAT----ATA------AT--TA-CCCTAAA---TACTACAGTTG--CATGACTA------GAATAAT-A--GAAGTTGTTCAAGC---ATATCA-A---GAAA--TACT--AATT------AAACATTATCTGAAATAATTCCAGCAAGAAGTTAAAATAT
gi|103969 : tttaaaacAA----CA---A---A----GT------GAATGGATGA------------------------------C-TTAA-----T-ATCAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------AT--TT----------GT-TA------C-AT-TT-GTCTTTTAAATTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACTATTGCTGG--CAA------ATAACCA-CAGT----TGGTGT-----------------GCCAATACCC--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATGTACGT----AAA------AT--AA-CCCTAAA---TACTTCAATTG--CA-GACTA------GAATAACAA--GAGGTTG
gi|103994 : tttaaaacAA----CA---A---A----GT------GAACGGATAG------CTC----ATATT--GC--------C-T-AA-----T-ATTTT-TT-AA---TTAA---G---CATTT--A------------------------GT-TA------C-AT-TT-GTCTTTCAAACATTA-AAA-T-----T----------------------C-ATTA-CCATTGCTG---CAAAAAAAGACAACCC-TAA
gi|103990 : aaacAA----CA---A---G----GT------GAACGGATGG------CTC----ATATT--AC--------C-TCAA-----T-ATTAT-TT-AA---TACA---G---AA-----G-C------AT--TTA---------GA-TA------C-AT-TT-GTCTT--A------A-AAA-T-----TGGATTTAT--AA-------ATTA-CCTAATCATTGCTGA---AA------A----------------------------------------AAACA-----A----ACT---TA-AGGCACACC-----AAGTAAGT----ATA------AT--TT-CCCTAAA---TACTACAATTAATCACGCCTG------GAatatttcaattgcatgactaaaacaatataaattggtcaagcatatcgagaaatactaatttaacattatctgaaataattccagcaataatttaaaatatagtgtaagtcatagttgagatgat
gi|103996 : gaaaacAA----CA---A---A----GG------TAATGGTTCG------CTT----GTATT--GC--------C-TTAA-----A-ATTAT-TT-AA---CTGA---G---CATTT--ATA------ATAATT----------G--CA------A----TT-GTCTTTCAAACATTA-ACA-T-----T-G-TGTAT--AA-------ATCC-ATTAA
gi|103995 : acAA----CA---A---A----TT------GAATGGATGA------CTC----GTATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---A---CAT
gi|103979 : aagtAA----CA---A---A----GT------GAATGGATGG------CTC----ACATT--GCCTTGATATC-TTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CATTT--A------------------------GT-TA------C-AT-TT-CTCT
gi|103989 : ttcaaaac----TA---A---A----CT------CAGTGG--GG------ATA----AAATTAAGC--------T-ATAA-----TTATTAT-AT-AA---TTC-----------TT--GTCTGTTAAAT--TTAAAAGCATGAGT-TA------C-AT-TT-GTCTTTCAAACTTTA-TAA-C-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--AAA------A-AACAAACAATA-GGT-GTG--------------------------CC--A----A-----TA----CA-ACC-----ATGTACAT----ATA------ATTTA----TTAAA---TACTACAATTG--CACGACTACCAGTAGAAAAAT-A--TAAGTTGGTCAAGC--A-TATCA-A---G--AAATACT--AATT------AAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAA-TTAAAACATAGTGTAAGCTATAGTTGAGAAGAT
gi|103997 : gaaaacaattaatatA---A---A----GA------GAATGGATGG------CTT----ATATT--GC--------C-GTAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTTAAGTC------AT--TT----------GT-TA------C-AT-TT-ATCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAA-CATTGCTGA--CAA------ATAA-CC-CAACA-G---GTAT-----------------GCCAATACCT--A----ACT---TA-AGGCGCACCAATCAATGTATGT----ACC------AT--AA-CCCTAAA---TACTACAACTG--CATGACTA------AAATAAT-A--TAAGTTGGTAAAGC---ATATCA-A---G--AATTTCT--AATT------AAACATGACCTGAATTAATTCCAGCAAGAATTTAAAATAAAGTGCAAG
gi|103998 : caacag---A----GT------G--TGGCTGG------TTC----ATATT--GC--------C-TTAA-----T-ATTAA-TT-AA---TTTA---G---CAT
gi|104000 : caacactT-AA---TTCA---A---CAACA--AT-------AT--TT----------AT-T----------T-TC-ATCAT-CAA----TG-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCCTTGCTGA--CAA------ATAACCC--AATA-GGT-GTGC-----------------C--AATACCT--A----ACT---TA-AGGTACACC-----ATGTA--C----AT----------------CTAAA---TATTACAATTG--CATGGATA------GAATGAT-A--TATGTTAGTCAAGT--A-TATCA-A---G--AAATACT--AATT------AAACATTTCCTGAAATAATACCAGCAAGAATTTAAAATATAGTTTAAGCTATTGCTGAGCTGAT
gi|104001 : -AA---TTAA---G---CATTT--A------------------------GT-TA------A-AT-CT-GTCTTTCAAATTTCA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA---AA------A--------AATA-GGT-GTGC------------------CAAA-ACCT--A----ACT---TA-ATGCACTCC-----ATGTATGT----ATA------AT--TA-CCCTAAA---TACTACAATTG--CATGACAG------GAATAAA-A--TAAGTTGGTCAAGC---ATATCA-A---GAAA--TACT--AATC------AAACATTACCTGAAATAATTCTAGCAAGAA-TTAAAATAAATTATAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103993 : TC------ATA-TT----------GCCTA------A-ATATT-GTAT--CAAACTTT--------------------C--AA-------ATGC-ATTGATCATGACTGA--AAA------ATAACCC-CA-TA---T-GTGT-----------------GTCAATACT-------------------------------ATGTACGT----ATA------GT--AA-CCCTTAT---TACTACAATTG--CA--A--------------------------GGTCAAGC---ATATCA-A---GAAA--TACC--AATT------AAACATTACCTGAAATTATTCCAGCAAGAATTAAAAATATAGTGTAAGCCATAGTTAAGACGAT
gi|103973 : aaaacaagtgaatgaatggcCCTTA-ATA-T-----T-GTGTAATTCAA-------AATC-ATTAACCATTGCTGA--AAA------ATAACAC--GATA-GGT-GTAC-----------------C--AATACCT--A----ACT---TA-AGGTACAC--------------------------------A-TTCTTAA---TACCACAATTG--CAT---TA------G-TTGGT-C--T----TGGTCAAGC--C-TATCA-A---G--AAATACT--AATT------AAACATTACCTGAATTAACTCCAGCAAGAATTTGAAATAAAGTGTAAGCCAAAGTTAACAT
gi|104002 : ttgaaaacaatgtgaatgaatagctcatattgGA--CAG-------TAACTT--AATA-GGT-GTGC-----------------C--AACACG---G----ACT---TAGAGGCACACC-----ATGTTCAT----ATA------AT--AACCCCTAAATTTTATTT--GTTA--AA-AACTA------AATTAAT-AACTAA--TATTAAATT--AATAACA-AAATT--T--TACAT-AAT--------AATATCACCT
gi|104003 : AACAACT--A----ACT---TA-AGGCACAAC-----AT-TACGT----CTA------AT--AA-CCCTAAA---TATTACGATTA--TAT
gi|104004 : TG------AT--GA-TCCTTAA---TACTGCAATTG--CATGAATA------GAATAAC-A--TAAGTTGGTCAAGC---ATACAAGA---A--A--TATT--AATT------AAACATTACATGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTAGAGTTGAAATGAT
gi|104005 : A------AT--AG-CCCTAAA---TACTGCAACTG--CATAACTA------GAATAAT-A--TAACTTGGTCAAACTTAACAAAA-A---T-----TACC--ATTT------AAACATTAGCTGAAATAATATCAACAAGTATTTAAAATATAGTGTAATCTATAGTTGAGATGAT
gi|103994 : ------AC--AA-CCCTAAA---TATTTCAATTG--CATGACTA------AAACAAT-A--TAAATTGGTCAAGC--A-TATCG-A---G--AAATACT--AATT------TAACATTATCTGAAATAATTCCAGCAATAATTTAAAATATAGTGTAAGTCATAGTTGAGATGAT
gi|104006 : aaacaacaaagtgaacggatagctcatattgcctaatattttttaattaagcatttagttacatttgtctttcaaacattaaaattcattaccattgctgcaaaaaaagTAAT-A--AAAATTGGTCAAGC--A-TATCA-A---G--A--------AATTCTTTTTAAACATTACCTAAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAATTATAGTATCAGCTATAGTTGAGA
gi|104007 : T------AAACATTACCCGAAATAATTCAAGAAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111 3 11 2222222
lowQualScore : 0 1111 11 0 1 0 0 33333333 3333333333 22222 0 0 0 111 111 111 5555555555555555555555555 4444444 1 1 1 33333 1 11 4444444 1 222 333333 3 1 999 55555555 4 333333 1 2222 11 2222 222 1 33333 333333 2222 11 1 2 11 11 333333 1 11 11 11 222 4444444 11 22
lowQualScore : . .... .. . . . . ........ .......... ..... . . . ... ... ... ......................... ....... . . . ..... . .. ....... . ... ...... . . ... ........ . ...... . .... .. .... ... . ..... ...... .... .. . . .. .. ...... . .. .. .. ... ....... .. ..
lowQualScore : 9 8888 22 9 7 1 9 22222222 7777777777 11111 9 9 8 555 555 555 9999999999999999999999999 2222222 3 3 3 33333 3 88 2222222 3 888 777777 1 0 555 00000000 8 888888 3 8888 88 8888 333 3 33333 888888 8888 77 2 3 77 77 666666 2 77 77 99 333 1111111 88 88
consensus : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACGT----ATAAT--AA-CCCTAAATACTNCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATATC---AAG--A---TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
Reference ( family-464 ) : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGT--------GCGCA------A-T----ACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACGT----ATAAT--AA-CCCTAAATACTNCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATATC---AAG--A---TA--C-NAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103953 : TTGAAAA-TAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATATTA-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTA------ATTT----------GTGATA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCT-CAATAGGTGT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACT---AA-AGGGACATC-----ATG------TACGT----ATGAT--AA-CTCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATACT---AAA--A---TA--C-AAATTAAACATAACTTGATCTAATTCCAGCAAGAAATTAAACTATTGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103954 : TTGAAAA-TAA----------A-GTGAATGGATGGTTGATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------ATTT----------GTTAAA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAAGTGT--------GTGTA------AAT----ACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TAGGT----ATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTA--C--ATGACTA------GACTAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATACC---AAT--A---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTACAGTTGAGATGAT
gi|103955 : TTGAAAA-AAA----GT--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTT------ATTA----------GTTACATTGTACATTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-A-----T-GCTTCAT--AA-------ATTG-ATTAACCATTGCTGA--CTA------ATAACCC-CAATACGTGT--------GC-CA------A-T----ACCT--T----ACT---AA-AGGCACATC-----ATG------TACGT----ATAAC--AA-CCCTAAATA---------------------------------------AAGT--TGGTCAATCAATACT---TAT--A---AA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGTAAGAATTTGAAATATAATGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103956 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-TTTCATTGATGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---AATT---ATC------ATTT----------GATACA-------TTT-ATCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTT-AT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC--AATAGGTGT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACT---TA-AGGCACAGC-----ATG------TACGT----ATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GACTAAT-G--TAAGT--TGGCCAAGCAATACT---AAT--A---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCATGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103957 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATTGCTCGTATTG-T--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TC-AA---TTTA---G---CATTT--GTC------ATTT----------GTAAAA-------TTTTGTCTTTCAAACTTTA-AAA-C-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATATGTGT--------G------------T----ACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATG------TACATTATTATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAAT--TGGTCAAACAATACT---AAT--A---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAGGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTGTAGTTGAGATGAT
gi|103958 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GGGAATGGATGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103959 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATTGATGGCTCGTAGTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTTT-GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTAAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTGTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------A-AAAAA-CAATAGGCAT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACA---TA-AGGTACATC-----ATG------TAAAT----ATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--A--ATGGCAA------GAATAAT-A--TAAAT--TGGTCAACCAATACT---AAT--A---TA--C-AAATTAATCATAACCCAATGTAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGAAAGCTATAGTTGAATTGAT
gi|103960 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATTGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTT------ATTC----------ATTATA-------TTT-GTCTTTCAATCTTTA-AAA-T-----T-GCTCTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTACCGAACGACGCACTTCCGA-TAAAAACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATGTGCATATACAT----GTAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTG------GAATAAT-A--TAAAT--AAGTCAAGCAATACT---AAT--T---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAACAAGAA-AAAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103961 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--TCC------ATTT----------GCTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-ATA-T-----T-GCTTTAT--AA-------TTTC-ATTAATCATT-CTGA--CAA------ATAA-CA-CATTTGGTGT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ACG------TACGT----ATAAT--AA-CTCCAAATACTTCAGTTG--C--ATGTCAA------GAATAAT-A--TACGT--TGGTCAAGCAATAC----------------------TT--ACATTACCTGAAATTATTCCACCAGAGATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103962 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATCG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCT---G---CATTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTT---------------------------AT--AA-------ATTC-ATTAACAATTGCTGA--CAA------ATAAACC-CAATAGGTGT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACT---TA-AAGCACACC-----ATG------CACAT----ACAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATCG--C--ATGACTA------GGTTGAT-A--TTAGT--TTATCAAGC-ATGTC---AAGAAA---TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGTAAGAATTTTAAATACAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103963 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCCGATATTG-C--------AT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--A----------------------GTTACA-------T---GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGTTGAAATAA------AAAACT----ATAGGTGT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACT---TA-AGGCACAGG-----GTG------TATGT----ACAAT--TA-ACCTAAATACTACAATTA--C--ATTACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATATC-------------A--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAAATCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGTTATAGTTGAGATAAT
gi|103964 : TTGAAAA--AA----CA--A-A-GTGAATGAATGGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TC-AA---TTCA---G---CATTA--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-AATTTAT--AA-------TTTC-ATTAACCATTGCTGC--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGT--------GC-CA------A-T----ACAT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----CTG------CATGT----ATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACGA------AACCAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATATT---AAT--A---TA--C-AAACCAA
gi|103965 : TTAAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGGTTGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CATTT--A----------------------GATATA-------TTT-GTCTTTTAAACTTTA-AAA-T-----T----------------------C-ATTAACCATTG-------------------------ATAGGTGT--------GC-CA------A-T----ATCC--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACGT----ATAAT--AA-CCTTAAAT--------TG--C--ATGAATA------CAATAAT-A--TAAGT--TGGTCGAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTACCTAAAATAATTGCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103966 : TTGAAAA-CAA----AA--A-AAGTGAATTGATGTCTCGTATTG-T--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---T---CATTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-G-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTCACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAGTAGGTGT--------GC-TA------A-A----ACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATG------CACGT----ATAAT--AA-CC------------ATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TTGTAAAGCAATACT---AAT--A---TA--C-AAATAAAACATTACCTGAAATAAT
gi|103967 : TTTAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAGCGGATAGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTAA--------ATTT------------TTA----------GTTTCA-------TTT-GTCTTTCAATCTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------GTTC-ATTAACCATTGCTGA---AA------A-AA-----GATAGGTAA--------GC-CA------A-T----ACCT--A----GCT---TA-AGGCACACC-----ATA------TACAT----ATAAT--TA-CCCTAAATACTACAGTTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--GAAGT--TGTTCAAGC-ATATC---AAGAAA---TA--C-TAATTAAACATTATCTGAAATAATTCCAGCAAGAAGTTAAAATAT
gi|103968 : TTGAAAA-CAT----CA--A-A-GTGAAGGGATGACTCGTATTG-C--------CT----------TAC-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCGTTAT--AA-------ATGC-ATTTACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-ATATAGGTGT--------GC-CA------A-T----ACCT--ACCTTACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACGT----ATAAT--AA-CTCTAAATACTTCAATGG--C--ATGACAA------AAATAAC-A--AAAGC--T-GTCA
gi|103969 : TTTAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGACT-----------------------------TAA-----T-ATCAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTTAAATTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACTATTGCTGG--CAA------ATAACCA-CAGTTGGTGT--------GC-CA------A-T----ACCC--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATG------TACGT----AAAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--A-GACTA------GAATAACAA--GAGGT--TGgaagacaacaa
gi|103970 : TTGAAAA-CAA----AA--A-AAGTGAATGGATA-----------C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-TA---TTAA---G---CA--------------ATTA----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--TA-------ATTT-GTTAGCCAATGCTAA--AAA------ATAA-CT-TGATA-ATGT--------GT-CA------A-T----AC----------CT---TA-ATGCACCCC-----AGG------TACAT----ATATT--TA-CCCTAAATACTACAATTG--C--ATGACTA------GAATGAT-A--TAA-------TCAAGC-ATATT---AAGAAA---TG--C-TAATTAAATGTTATTTGAAATAGTTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGC-ATTGTTGAGA
gi|103971 : TTGAAAA-CAA----CA--G-A-GTGAATGGATGACTTATTTTG-C--------CT----------AAA-----T-ATTAT-TTTAA---TTTA---G---CATTT--ACC------GTA-----------GTTACA-------TTT-GTCATTCAAACATTA-AAAAT-----T-GGTTTAG--AA-------ATTC-ATTTTCCATTGCTGA--CAA------ATAACCT--GATAGGCGT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACTAAACA-AGGCACACC-----ATG------TATGT----ATAAT--AA-CCCTAAATATTGCAATTG--C--ATGAATA------GAATAAT--------T--TAGTCGAG-GATATCACGAAG--A----A--C-TAATTTAATA
gi|103972 : TTGAAAAACAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-T--------CT----------CAA-----T-ATGAT-TT-AA---TTCA---G---CATTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTC-------A-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTCTATGAA-CA--GCTAA---AA------ACAAC
gi|103973 : TTGAAAA-CAA----T-------GTGAATGAATAGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTGT-GT-AA---TTCA---AAATCATTA--ACC------ATTaaggaataaaaacaagagtgccaa
gi|103973 : CCTTA-ATA-T-----T-GTGTAATTCAA-------AATC-ATTAACCATTGCTGA--AAA------ATAACAC--GATAGGTGT--------AC-CA------A-T----ACCT--A----ACT---TA-AGGTACAC--------------------------------A-TTCTTAATACCACAATTG--C--AT---TA------G----------TTGGTCTTGGTCAAGCC-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTACCTGAATTAACTCCAGCAAGAATTTGAAATAAAGTGTAAGCCAAAGTTAACATgctgaaaaataacacgataggtgtaccaatacctaacttaaggtacacattcttaataccacaattgcattagttggtcttggtcaagcctatcaagaaatactaattaaacattacctgaattaactccagcaagaatttgaaataaagtgtaagccaaagttaacat
gi|103974 : ttgaaaacaatgtgaatgaatagctcatattgTTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCACATTG-A--------CTTACATTGCCATAA-----T-ACTAA-TT-AA---TTTA--------ATTT--AAC------ATTCA---------GTTACA-------
gi|103975 : TTGAAAA-CAG----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATATTG-C--------TT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103976 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGTTCATATTA-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-CT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103977 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTGCC--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103978 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAATAAATT-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103979 : TTCAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCACATTG-CCTTGATATCT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CATTT--A----------------------GTTACA-------TTT-CTCT
gi|103980 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GCGAATGGATGGTTTGTATTG-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---A---CAT
gi|103981 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GGGAATGAATGGTTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----C-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103982 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTG-C--------CT----------T-A-----T-ACTAT-CA-AA---TTCA---G---CAT
gi|103983 : TTGAAAA-CAG----GA--A-A-GTGAATAGATGGCTCGTATTG-C--------TT----------T-------T-A--AT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103984 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATAGTG-T--------CT----------TAA-----
gi|103985 : TGAAAA-CAA----CC--A-A-GTGAATGGATGGCTCAAATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CTTTT--GTC------ATTT----------ATTACA-------TTT-GTCTTTAAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AATTTGTAAATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACT---TA-AGGAACATC-----ATG------TATGT----ATAAT--AA-CCCTAAATATTTCAATTG--C--ATGACTA------GTATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATACT---AAC--A---CA--A-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAACAAATTTTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103986 : TGAAAA-CAG----CA--A-A-GTGAATGACTGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATCAA-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103987 : TGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGACTGGCCTATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAA-TT-AA---TTTA---G---CAT
gi|103988 : TGAAAA-CAAATGTCA--A-A-ACAAATGGATTGCTTACATTG-C--------CA----------CAT-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103989 : ----------TAA-----TTATTAT-AT-AA---TTC-----------TT--GTCTGTTAAATTTAAAAGCATGAGTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-TAA-C-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--AAA------A-AACAAACAATAGGTGT--------GC-CA------A-T----AC----------------------A-ACC-----ATG------TACAT----ATAATTTA----TTAAATACTACAATTG--C--ACGACTACCAGTAGAAAAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAA-TTAAAACATAGTGTAAGCTATAGTTGAGAAGAT
gi|103990 : gaaaacaattaatattaaactcagtggggataaaattaagctaGAAAA-CAA----CA--A-G-GTGAACGGATGGCTCATATTA-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TACA---G---AA-----G-C------ATTTA---------GATACA-------TTT-GTCTT--A------A-AAA-T-----TGGATTTAT--AA-------ATTA-CCTAATCATTGCTGA--AAA------A--------AACA-------------------------------------A----ACT---TA-AGGCACACC-----AAG------TAAGT----ATAAT--TT-CCCTAAATACTACAATTAATC--ACGCCTG------GA
gi|103991 : GAAAA-AAA----CA--A-A-GTGAATGACTGGCTCATATTG-C--------CT----------TTA-----T-ATTAA-TT-AA---TTCA---G---CAT
gi|103992 : AAAA-CAA----CA--A-A-GTGAACGGAAAGCTCATATTG-C--------TT----------TAA-----T-ATTGT-TT-AA---TTAA---G---CATTT--A----------------------ATTACA-------TTG-GTCTTTCAAACTGTA-AAA-T-----T-GCTCTAT--TA-------ATTC-ATTAATCATTGCTGA--AGA------A-AAT----GATAGGTGT--------GC-CA--------T----ACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----GTG------TACAT----ACAAT--TA-CCCTAAATACTATAAATG--C--AGGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATATC---AAGAAA---CA--C-TAATTAAACATTATCTAAAACAATTCAAGCAAGAATTTAAAATATCTTGTAAGCCATAGTTCAGATGAT
gi|103993 : AAAA-CAA------------GTGAATGAATGGCTCATATTG-C--------CT----------AAA-----T-ATTGTATC-AAACTTTCAAATG---CATTG--ATC------AT
gi|103993 : CTTT-C--AA-------ATGC-ATTGATCATGACTGA--AAA------ATAACCC-CA-TATGTGT--------GT-CA------A-T----ACT-------------------------------ATG------TACGT----ATAGT--AA-CCCTTATTACTACAATTG--C--A-------------------------AG-----GTCAAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-CAATTAAACATTACCTGAAATTATTCCAGCAAGAATTAAAAATATAGTGTAAGCCATAGTTAAGACGATgactgaaaaataaccccatatgtgtgtcaatactatgtacgtatagtaacccttattactacaattgcaaggtcaagcatatcaagaaataccaattaaacattacctgaaattattccagcaagaattaaaaatatagtgtaagccatagttaagacgat
gi|103994 : aaaacaagtgaatgaatggctcatattgcctaaatattgtatcaaaAAA-CAA----CA--A-A-GTGAACGGATAGCTCATATTG-C--------C-----------TAA-----T-ATTTT-TT-AA---TTAA---G---CATTT--A----------------------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACATTA----------------------AA-------ATTC-ATT-ACCATTGCTG---CAAAAAAAGACAACCC-TAA
gi|103994 : AC--AA-CCCTAAATATTTCAATTG--C--ATGACTA------AAACAAT-A--TAAAT--TGGTCAAGCA-TATC---GAG--AAA-TA--C-TAATTTAACATTATCTGAAATAATTCCAGCAATAATTTAAAATATAGTGTAAGTCATAGTTGAGATGATatatttcaattgcatgactaaaacaatataaattggtcaagcatatcgagaaatactaatttaacattatctgaaataattccagcaataatttaaaatatagtgtaagtcatagttgagatgat
gi|103995 : aaacaacaaagtgaacggatagctcatattgcctaatattttttaattaagcatttagttacatttgtctttcaaacattaaaattcattaccattgctgcaaaaaaagAAG-TAA----CA--A-A-TTGAATGGATGACTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---A---CAT
gi|103996 : A-CAA----CA--A-A-GGTAATGGTTCGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----A-ATTAT-TT-AA---CTGA---G---CATTT--ATA------A-TA----------ATTGCA-------ATT-GTCTTTCAAACATTA-ACA-T-----T-G-TGTAT--AA-------ATCC-ATTAA
gi|103997 : -CAA----CAGAA-A-GAGAATGGATGGCTTATATTG-C--------CG----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTTAAGTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-ATCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAA-CATTGCTGA--CAA------ATAA-CC-CAACAGGTAT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACT---TA-AGGCGCACCAATCAATG------TATGT----ACCAT--AA-CCCTAAATACTACAACTG--C--ATGACTA------AAATAAT-A--TAAGT--TGGTAAAGC-ATATC---AAG--AAT-TT--C-TAATTAAACATGACCTGAATTAATTCCAGCAAGAATTTAAAATAAAGTGCAAG
gi|103998 : -CAA----CA--CTA-GTG--TGGCTGGTTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAA-TT-AA---TTTA---G---CAT
gi|103999 : AA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCACACATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CATTG--A----------------------GTTACA-------TTT-GTCGTTCAAACTTTACAAA-TGTTTAT-GCTTTTT--AA-------ATTC-ATTAACCTTTGCTGA--CAA------ATAACCC-------GTGT--------GT-TA------A-T----ACCTTAA----ATT---TA-A-------C-----ATG------TATGT----ATAAT------CCTAAATATTACAATTG--C--ATGAATA------GAATAAT-G--TAAGT--AGGTCAAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTATCTGAAATAAGTCTAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTGTAGTTCAGATGAT
gi|104000 : T-AA---TTCA---A---CAACA--AT-------ATTT----------ATT----------TTC-ATCAT-CAA----TG-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCCTTGCTGA--CAA------ATAACCC--AATAGGTGT--------GC-CA------A-T----ACCT--A----ACT---TA-AGGTACACC-----ATG------TACAT----------------CTAAATATTACAATTG--C--ATGGATA------GAATGAT-A--TATGT--TAGTCAAGTA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTTCCTGAAATAATACCAGCAAGAATTTAAAATATAGTTTAAGCTATTGCTGAGCTGAT
gi|104001 : -AA---TTAA---G---CATTT--A----------------------GTTAAA-------TCT-GTCTTTCAAATTTCA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA---AA------A--------AATAGGTGT--------GC-CA------A-A----ACCT--A----ACT---TA-ATGCACTCC-----ATG------TATGT----ATAAT--TA-CCCTAAATACTACAATTG--C--ATGACAG------GAATAAA-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATATC---AAGAAA---TA--C-TAATCAAACATTACCTGAAATAATTCTAGCAAGAA-TTAAAATAAATTATAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|104002 : GA--CAG-------TAACTT--AATAGGTGT--------GC-CA------A-C----ACG---G----ACT---TAGAGGCACACC-----ATG------TTCAT----ATAAT--AACCCCTAAAT--TTTATTTG--TTAAAAACTA------AATTAAT-AACTAA----TATTAAATTAATAAC---AAA--ATTTTA--CATAAT--AATATCACCT
gi|104003 : A------A-C----AACT--A----ACT---TA-AGGCACAAC-----AT-------TACGT----CTAAT--AA-CCCTAAATATTACGATTA--T--AT
gi|104004 : TGAT--GA-TCCTTAATACTGCAATTG--C--ATGAATA------GAATAAC-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATA-C---AAGAAA---TA--T-TAATTAAACATTACATGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTAGAGTTGAAATGAT
gi|104005 : AAT--AG-CCCTAAATACTGCAACTG--C--ATAACTA------GAATAAT-A--TAACT--TGGTCAAACT-TAAC---AAA--AAT-TA--C-CATTTAAACATTAGCTGAAATAATATCAACAAGTATTTAAAATATAGTGTAATCTATAGTTGAGATGAT
gi|104006 : TAAT-A--AAAAT--TGGTCAAGCA-TATC---AAG--A---AATTC-TTTTTAAACATTACCTAAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAATTATAGTATCAGCTATAGTTGAGA
gi|104007 : TAAACATTACCCGAAATAATTCAAGAAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111 1111111111111111111 11 2222222
lowQualScore : 0 1111 11 0 1 0 0 33333333 3333333333 22222 0 0 0 111 111 111 0 4444444444444444444444444 4444444 1 1 1 33333 1 11 4444444 1 222 333333 3 1 999 2222222222222222222 11 2222 222 1 33333 333333 2222 11 1 2 11 11 333333 1 11 11 11 222 4444444 11 22
lowQualScore : . .... .. . . . . ........ .......... ..... . . . ... ... ... . ......................... ....... . . . ..... . .. ....... . ... ...... . . ... ................... .. .... ... . ..... ...... .... .. . . .. .. ...... . .. .. .. ... ....... .. ..
lowQualScore : 9 8888 22 9 7 1 9 22222222 7777777777 11111 9 9 8 555 555 555 8 7777777777777777777777777 2222222 3 3 3 33333 3 88 2222222 3 888 777777 1 0 555 2222222222222222222 88 8888 333 3 33333 888888 8888 77 2 3 77 77 666666 2 77 77 99 333 1111111 88 88
consensus : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTNCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATATC---AAG--A---TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
Reference ( family-464 ) : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTNCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATATC---AAG--A---TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103953 : TTGAAAA-TAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATATTA-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTA------ATTT----------GTGATA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCT-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---AA-AGGGACATC-----ATG------TACG----TATGAT--AA-CTCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATACT---AAA--A---TA--C-AAATTAAACATAACTTGATCTAATTCCAGCAAGAAATTAAACTATTGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103954 : TTGAAAA-TAA----------A-GTGAATGGATGGTTGATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTAAA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAAGTGTGTGTA-----------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TAGG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTA--C--ATGACTA------GACTAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATACC---AAT--A---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTACAGTTGAGATGAT
gi|103955 : TTGAAAA-AAA----GT--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTT------ATTA----------GTTACATTGTACATTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-A-----T-GCTTCAT--AA-------ATTG-ATTAACCATTGCTGA--CTA------ATAACCC-CAATACGTGTGCC-------------------AATACCT--T----ACT---AA-AGGCACATC-----ATG------TACG----TATAAC--AA-CCCTAAATA---------------------------------------AAGT--TGGTCAATCAATACT---TAT--A---AA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGTAAGAATTTGAAATATAATGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103956 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-TTTCATTGATGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---AA-TT---ATC------ATTT----------GATACA-------TTT-ATCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTT-AT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC--AATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACAGC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GACTAAT-G--TAAGT--TGGCCAAGCAATACT---AAT--A---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCATGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103957 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATTGCTCGTATTG-T--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TC-AA---TTTA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTAAAA-------TTTTGTCTTTCAAACTTTA-AAA-C-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATATGTGTG-----------------------TACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATG------TACATTATTATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAAT--TGGTCAAACAATACT---AAT--A---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAGGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTGTAGTTGAGATGAT
gi|103958 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GGGAATGGATGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103959 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATTGATGGCTCGTAGTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTAAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTGTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------A-AAAAA-CAATAGGCATGCC-------------------AATACCT--A----ACA---TA-AGGTACATC-----ATG------TAAA----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--A--ATGGCAA------GAATAAT-A--TAAAT--TGGTCAACCAATACT---AAT--A---TA--C-AAATTAATCATAACCCAATGTAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGAAAGCTATAGTTGAATTGAT
gi|103960 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATTGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTT------ATTC----------ATTATA-------TTT-GTCTTTCAATCTTTA-AAA-T-----T-GCTCTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTACCGAACGACGCACTTCCGATAAAAACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATGTGCATATACA----TGTAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTG------GAATAAT-A--TAAAT--AAGTCAAGCAATACT---AAT--T---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAACAAGAA-AAAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103961 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--TCC------ATTT----------GCTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-ATA-T-----T-GCTTTAT--AA-------TTTC-ATTAATCATT-CTGA--CAA------ATAA-CA-CATTTGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ACG------TACG----TATAAT--AA-CTCCAAATACTTCAGTTG--C--ATGTCAA------GAATAAT-A--TACGT--TGGTCAAGCAATAC----------------------TT--ACATTACCTGAAATTATTCCACCAGAGATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103962 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATCG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCT---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTT---------------------------AT--AA-------ATTC-ATTAACAATTGCTGA--CAA------ATAAACC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AAGCACACC-----ATG------CACA----TACAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATCG--C--ATGACTA------GGTTGAT-A--TTAGT--TTATCAAGC-ATGTC---AAGAAA---TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGTAAGAATTTTAAATACAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103963 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCCGATATTG-C--------AT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--A----------------------GTTACA-------T---GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGTTGAAATAA------AAAACT----ATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACAGG-----GTG------TATG----TACAAT--TA-ACCTAAATACTACAATTA--C--ATTACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATATC-------------A--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAAATCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGTTATAGTTGAGATAAT
gi|103964 : TTGAAAA--AA----CA--A-A-GTGAATGAATGGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TC-AA---TTCA---G---CA-TTA--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-AATTTAT--AA-------TTTC-ATTAACCATTGCTGC--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACAT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----CTG------CATG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACGA------AACCAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATATT---AAT--A---TA--C-AAACCAA
gi|103965 : TTAAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGGTTGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CA-TTT--A----------------------GATATA-------TTT-GTCTTTTAAACTTTA-AAA-T-----T----------------------C-ATTAACCATTG-------------------------ATAGGTGTGCC-------------------AATATCC--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CCTTAAAT--------TG--C--ATGAATA------CAATAAT-A--TAAGT--TGGTCGAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTACCTAAAATAATTGCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103966 : TTGAAAA-CAA----AA--A-AAGTGAATTGATGTCTCGTATTG-T--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---T---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-G-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTCACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAGTAGGTGTGCT-------------------AAAACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATG------CACG----TATAAT--AA-CC------------ATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TTGTAAAGCAATACT---AAT--A---TA--C-AAATAAAACATTACCTGAAATAAT
gi|103967 : TTTAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAGCGGATAGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTAA--------A-TTT------------TTA----------GTTTCA-------TTT-GTCTTTCAATCTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------GTTC-ATTAACCATTGCTGA---AA------A-AA-----GATAGGTAAGCC-------------------AATACCT--A----GCT---TA-AGGCACACC-----ATA------TACA----TATAAT--TA-CCCTAAATACTACAGTTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--GAAGT--TGTTCAAGC-ATATC---AAGAAA---TA--C-TAATTAAACATTATCTGAAATAATTCCAGCAAGAAGTTAAAATAT
gi|103968 : TTGAAAA-CAT----CA--A-A-GTGAAGGGATGACTCGTATTG-C--------CT----------TAC-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCGTTAT--AA-------ATGC-ATTTACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-ATATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--ACCTTACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CTCTAAATACTTCAATGG--C--ATGACAA------AAATAAC-A--AAAGC--T-GTCA
gi|103969 : TTTAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGACT-----------------------------TAA-----T-ATCAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTTAAATTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACTATTGCTGG--CAA------ATAACCA-CAGTTGGTGTGCC-------------------AATACCC--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATG------TACG----TAAAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--A-GACTA------GAATAACAA--GAGGT--TGgaagacaacaa
gi|103970 : TTGAAAA-CAA----AA--A-AAGTGAATGGATA-----------C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-TA---TTAA---G---CA---------------ATTA----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--TA-------ATTT-GTTAGCCAATGCTAA--AAA------ATAA-CT-TGATA-ATGTGTC-------------------AATAC----------CT---TA-ATGCACCCC-----AGG------TACA----TATATT--TA-CCCTAAATACTACAATTG--C--ATGACTA------GAATGAT-A--TAA-------TCAAGC-ATATT---AAGAAA---TG--C-TAATTAAATGTTATTTGAAATAGTTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGC-ATTGTTGAGA
gi|103971 : TTGAAAA-CAA----CA--G-A-GTGAATGGATGACTTATTTTG-C--------CT----------AAA-----T-ATTAT-TTTAA---TTTA---G---CA-TTT--ACC------GTA-----------GTTACA-------TTT-GTCATTCAAACATTA-AAAAT-----T-GGTTTAG--AA-------ATTC-ATTTTCCATTGCTGA--CAA------ATAACCT--GATAGGCGTGCC-------------------AATACCT--A----ACTAAACA-AGGCACACC-----ATG------TATG----TATAAT--AA-CCCTAAATATTGCAATTG--C--ATGAATA------GAATAAT--------T--TAGTCGAG-GATATCACGAAG--A----A--C-TAATTTAATA
gi|103972 : TTGAAAAACAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-T--------CT----------CAA-----T-ATGAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTC-------A-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTCTATGAA-CA--GCTAA---AA------ACAAC
gi|103973 : TTGAAAA-CAA----T-------GTGAATGAATAGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTGT-GT-AA---TTCA---AAATCA-TTA--ACC------ATTaaggaataaaaacaagagtgccaa
gi|103973 : CCTTA-ATA-T-----T-GTGTAATTCAA-------AATC-ATTAACCATTGCTGA--AAA------ATAACAC--GATAGGTGTACC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGTACAC--------------------------------A-TTCTTAATACCACAATTG--C--AT---TA------G----------TTGGTCTTGGTCAAGCC-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTACCTGAATTAACTCCAGCAAGAATTTGAAATAAAGTGTAAGCCAAAGTTAACATgctgaaaaataacacgataggtgtaccaatacctaacttaaggtacacattcttaataccacaattgcattagttggtcttggtcaagcctatcaagaaatactaattaaacattacctgaattaactccagcaagaatttgaaataaagtgtaagccaaagttaacat
gi|103974 : ttgaaaacaatgtgaatgaatagctcatattgTTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCACATTG-A--------CTTACATTGCCATAA-----T-ACTAA-TT-AA---TTTA--------A-TTT--AAC------ATTCA---------GTTACA-------
gi|103975 : TTGAAAA-CAG----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATATTG-C--------TT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103976 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGTTCATATTA-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-CT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103977 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTGCC--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103978 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAATAAATT-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103979 : TTCAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCACATTG-CCTTGATATCT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CA-TTT--A----------------------GTTACA-------TTT-CTCT
gi|103980 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GCGAATGGATGGTTTGTATTG-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---A---CA-T
gi|103981 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GGGAATGAATGGTTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----C-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103982 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTG-C--------CT----------T-A-----T-ACTAT-CA-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103983 : TTGAAAA-CAG----GA--A-A-GTGAATAGATGGCTCGTATTG-C--------TT----------T-------T-A--AT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103984 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATAGTG-T--------CT----------TAA-----
gi|103985 : TGAAAA-CAA----CC--A-A-GTGAATGGATGGCTCAAATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CT-TTT--GTC------ATTT----------ATTACA-------TTT-GTCTTTAAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AATTTGTAAATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGAACATC-----ATG------TATG----TATAAT--AA-CCCTAAATATTTCAATTG--C--ATGACTA------GTATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATACT---AAC--A---CA--A-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAACAAATTTTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103986 : TGAAAA-CAG----CA--A-A-GTGAATGACTGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATCAA-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103987 : TGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGACTGGCCTATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAA-TT-AA---TTTA---G---CA-T
gi|103988 : TGAAAA-CAAATGTCA--A-A-ACAAATGGATTGCTTACATTG-C--------CA----------CAT-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103989 : ----------TAA-----TTATTAT-AT-AA---TTC------------TT--GTCTGTTAAATTTAAAAGCATGAGTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-TAA-C-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--AAA------A-AACAAACAATAGGTGTGCC-------------------AATAC----------------------A-ACC-----ATG------TACA----TATAATTTA----TTAAATACTACAATTG--C--ACGACTACCAGTAGAAAAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAA-TTAAAACATAGTGTAAGCTATAGTTGAGAAGAT
gi|103990 : gaaaacaattaatattaaactcagtggggataaaattaagctaGAAAA-CAA----CA--A-G-GTGAACGGATGGCTCATATTA-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TACA---G---AA------G-C------ATTTA---------GATACA-------TTT-GTCTT--A------A-AAA-T-----TGGATTTAT--AA-------ATTA-CCTAATCATTGCTGA--AAA------A--------AACA------------------------------------A----ACT---TA-AGGCACACC-----AAG------TAAG----TATAAT--TT-CCCTAAATACTACAATTAATC--ACGCCTG------GA
gi|103991 : GAAAA-AAA----CA--A-A-GTGAATGACTGGCTCATATTG-C--------CT----------TTA-----T-ATTAA-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103992 : AAAA-CAA----CA--A-A-GTGAACGGAAAGCTCATATTG-C--------TT----------TAA-----T-ATTGT-TT-AA---TTAA---G---CA-TTT--A----------------------ATTACA-------TTG-GTCTTTCAAACTGTA-AAA-T-----T-GCTCTAT--TA-------ATTC-ATTAATCATTGCTGA--AGA------A-AAT----GATAGGTGTGCC-------------------A-TACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----GTG------TACA----TACAAT--TA-CCCTAAATACTATAAATG--C--AGGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATATC---AAGAAA---CA--C-TAATTAAACATTATCTAAAACAATTCAAGCAAGAATTTAAAATATCTTGTAAGCCATAGTTCAGATGAT
gi|103993 : AAAA-CAA------------GTGAATGAATGGCTCATATTG-C--------CT----------AAA-----T-ATTGTATC-AAACTTTCAAATG---CA-TTG--ATC------AT
gi|103993 : CTTT-C--AA-------ATGC-ATTGATCATGACTGA--AAA------ATAACCC-CA-TATGTGTGTC-------------------AATACT-------------------------------ATG------TACG----TATAGT--AA-CCCTTATTACTACAATTG--C--A-------------------------AG-----GTCAAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-CAATTAAACATTACCTGAAATTATTCCAGCAAGAATTAAAAATATAGTGTAAGCCATAGTTAAGACGATgactgaaaaataaccccatatgtgtgtcaatactatgtacgtatagtaacccttattactacaattgcaaggtcaagcatatcaagaaataccaattaaacattacctgaaattattccagcaagaattaaaaatatagtgtaagccatagttaagacgat
gi|103994 : aaaacaagtgaatgaatggctcatattgcctaaatattgtatcaaaAAA-CAA----CA--A-A-GTGAACGGATAGCTCATATTG-C--------C-----------TAA-----T-ATTTT-TT-AA---TTAA---G---CA-TTT--A----------------------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACATTA----------------------AA-------ATTC-ATT-ACCATTGCTG---CAAAAAAAGACAACCC-TAA
gi|103994 : AC--AA-CCCTAAATATTTCAATTG--C--ATGACTA------AAACAAT-A--TAAAT--TGGTCAAGCA-TATC---GAG--AAA-TA--C-TAATTTAACATTATCTGAAATAATTCCAGCAATAATTTAAAATATAGTGTAAGTCATAGTTGAGATGATatatttcaattgcatgactaaaacaatataaattggtcaagcatatcgagaaatactaatttaacattatctgaaataattccagcaataatttaaaatatagtgtaagtcatagttgagatgat
gi|103995 : aaacaacaaagtgaacggatagctcatattgcctaatattttttaattaagcatttagttacatttgtctttcaaacattaaaattcattaccattgctgcaaaaaaagAAG-TAA----CA--A-A-TTGAATGGATGACTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---A---CA-T
gi|103996 : A-CAA----CA--A-A-GGTAATGGTTCGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----A-ATTAT-TT-AA---CTGA---G---CA-TTT--ATA------A-TA----------ATTGCA-------ATT-GTCTTTCAAACATTA-ACA-T-----T-G-TGTAT--AA-------ATCC-ATTAA
gi|103997 : -CAA----CAGAA-A-GAGAATGGATGGCTTATATTG-C--------CG----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTTAAGTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-ATCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAA-CATTGCTGA--CAA------ATAA-CC-CAACAGGTATGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCGCACCAATCAATG------TATG----TACCAT--AA-CCCTAAATACTACAACTG--C--ATGACTA------AAATAAT-A--TAAGT--TGGTAAAGC-ATATC---AAG--AAT-TT--C-TAATTAAACATGACCTGAATTAATTCCAGCAAGAATTTAAAATAAAGTGCAAG
gi|103998 : -CAA----CA--CTA-GTG--TGGCTGGTTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAA-TT-AA---TTTA---G---CA-T
gi|103999 : AA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCACACATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CA-TTG--A----------------------GTTACA-------TTT-GTCGTTCAAACTTTACAAA-TGTTTAT-GCTTTTT--AA-------ATTC-ATTAACCTTTGCTGA--CAA------ATAACCC-------GTGTGTT-------------------AATACCTTAA----ATT---TA-A-------C-----ATG------TATG----TATAAT------CCTAAATATTACAATTG--C--ATGAATA------GAATAAT-G--TAAGT--AGGTCAAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTATCTGAAATAAGTCTAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTGTAGTTCAGATGAT
gi|104000 : T-AA---TTCA---A---CA-ACA--AT-------ATTT----------ATT----------TTC-ATCAT-CAA----TG-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCCTTGCTGA--CAA------ATAACCC--AATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGTACACC-----ATG------TACA----T------------CTAAATATTACAATTG--C--ATGGATA------GAATGAT-A--TATGT--TAGTCAAGTA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTTCCTGAAATAATACCAGCAAGAATTTAAAATATAGTTTAAGCTATTGCTGAGCTGAT
gi|104001 : -AA---TTAA---G---CA-TTT--A----------------------GTTAAA-------TCT-GTCTTTCAAATTTCA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA---AA------A--------AATAGGTGTGCC-------------------AAAACCT--A----ACT---TA-ATGCACTCC-----ATG------TATG----TATAAT--TA-CCCTAAATACTACAATTG--C--ATGACAG------GAATAAA-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATATC---AAGAAA---TA--C-TAATCAAACATTACCTGAAATAATTCTAGCAAGAA-TTAAAATAAATTATAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|104002 : GA--CAG-------TAACTT--AATAGGTGTGCC-------------------AACA-CG--G----ACT---TAGAGGCACACC-----ATG------TTCA----TATAAT--AACCCCTAAAT--TTTATTTG--TTAAAAACTA------AATTAAT-AACTAA----TATTAAATTAATAAC---AAA--ATTTTA--CATAAT--AATATCACCT
gi|104003 : -------------------AACAACT--A----ACT---TA-AGGCACAAC-----AT-------TACG----TCTAAT--AA-CCCTAAATATTACGATTA--T--AT
gi|104004 : TGAT--GA-TCCTTAATACTGCAATTG--C--ATGAATA------GAATAAC-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATA-C---AAGAAA---TA--T-TAATTAAACATTACATGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTAGAGTTGAAATGAT
gi|104005 : AAT--AG-CCCTAAATACTGCAACTG--C--ATAACTA------GAATAAT-A--TAACT--TGGTCAAACT-TAAC---AAA--AAT-TA--C-CATTTAAACATTAGCTGAAATAATATCAACAAGTATTTAAAATATAGTGTAATCTATAGTTGAGATGAT
gi|104006 : TAAT-A--AAAAT--TGGTCAAGCA-TATC---AAG--A---AATTC-TTTTTAAACATTACCTAAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAATTATAGTATCAGCTATAGTTGAGA
gi|104007 : TAAACATTACCCGAAATAATTCAAGAAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111 1111111111111111111 11 2222222
lowQualScore : 0 1111 11 0 1 0 0 33333333 3333333333 22222 0 0 0 111 111 111 0 4444444444444444444444444 4444444 1 1 1 33333 1 11 4444444 1 222 333333 3 1 999 2222222222222222222 11 2222 222 1 33333 333333 2222 11 1 2 11 11 333333 1 11 11 11 222 4444444 11 22
lowQualScore : . .... .. . . . . ........ .......... ..... . . . ... ... ... . ......................... ....... . . . ..... . .. ....... . ... ...... . . ... ................... .. .... ... . ..... ...... .... .. . . .. .. ...... . .. .. .. ... ....... .. ..
lowQualScore : 9 8888 22 9 7 1 9 22222222 7777777777 11111 9 9 8 555 555 555 8 7777777777777777777777777 2222222 3 3 3 33333 3 88 2222222 3 888 777777 1 0 555 2222222222222222222 88 8888 333 3 33333 888888 8888 77 2 3 77 77 666666 2 77 77 99 333 1111111 88 88
consensus : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTNCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATATC---AAG--A---TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
Reference ( family-464 ) : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTNCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATATC---AAG--A---TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103953 : TTGAAAA-TAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATATTA-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTA------ATTT----------GTGATA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCT-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---AA-AGGGACATC-----ATG------TACG----TATGAT--AA-CTCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATACT---AAA--A---TA--C-AAATTAAACATAACTTGATCTAATTCCAGCAAGAAATTAAACTATTGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103954 : TTGAAAA-TAA----------A-GTGAATGGATGGTTGATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTAAA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAAGTGTGTGTA-----------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TAGG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTA--C--ATGACTA------GACTAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATACC---AAT--A---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTACAGTTGAGATGAT
gi|103955 : TTGAAAA-AAA----GT--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTT------ATTA----------GTTACATTGTACATTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-A-----T-GCTTCAT--AA-------ATTG-ATTAACCATTGCTGA--CTA------ATAACCC-CAATACGTGTGCC-------------------AATACCT--T----ACT---AA-AGGCACATC-----ATG------TACG----TATAAC--AA-CCCTAAATA---------------------------------------AAGT--TGGTCAATCAATACT---TAT--A---AA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGTAAGAATTTGAAATATAATGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103956 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-TTTCATTGATGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---AA-TT---ATC------ATTT----------GATACA-------TTT-ATCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTT-AT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC--AATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACAGC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GACTAAT-G--TAAGT--TGGCCAAGCAATACT---AAT--A---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCATGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103957 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATTGCTCGTATTG-T--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TC-AA---TTTA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTAAAA-------TTTTGTCTTTCAAACTTTA-AAA-C-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATATGTGTG-----------------------TACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATG------TACATTATTATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAAT--TGGTCAAACAATACT---AAT--A---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAGGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTGTAGTTGAGATGAT
gi|103958 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GGGAATGGATGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103959 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATTGATGGCTCGTAGTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTAAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTGTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------A-AAAAA-CAATAGGCATGCC-------------------AATACCT--A----ACA---TA-AGGTACATC-----ATG------TAAA----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--A--ATGGCAA------GAATAAT-A--TAAAT--TGGTCAACCAATACT---AAT--A---TA--C-AAATTAATCATAACCCAATGTAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGAAAGCTATAGTTGAATTGAT
gi|103960 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATTGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTT------ATTC----------ATTATA-------TTT-GTCTTTCAATCTTTA-AAA-T-----T-GCTCTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTACCGAACGACGCACTTCCGATAAAAACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATGTGCATATACA----TGTAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTG------GAATAAT-A--TAAAT--AAGTCAAGCAATACT---AAT--T---TA--C-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAACAAGAA-AAAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103961 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--TCC------ATTT----------GCTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-ATA-T-----T-GCTTTAT--AA-------TTTC-ATTAATCATT-CTGA--CAA------ATAA-CA-CATTTGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ACG------TACG----TATAAT--AA-CTCCAAATACTTCAGTTG--C--ATGTCAA------GAATAAT-A--TACGT--TGGTCAAGCAATAC----------------------TT--ACATTACCTGAAATTATTCCACCAGAGATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103962 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATCG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCT---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTT---------------------------AT--AA-------ATTC-ATTAACAATTGCTGA--CAA------ATAAACC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AAGCACACC-----ATG------CACA----TACAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATCG--C--ATGACTA------GGTTGAT-A--TTAGT--TTATCAAGC-ATGTC---AAGAAA---TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGTAAGAATTTTAAATACAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103963 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCCGATATTG-C--------AT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--A----------------------GTTACA-------T---GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGTTGAAATAA------AAAACT----ATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACAGG-----GTG------TATG----TACAAT--TA-ACCTAAATACTACAATTA--C--ATTACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATATC-------------A--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAAATCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGTTATAGTTGAGATAAT
gi|103964 : TTGAAAA--AA----CA--A-A-GTGAATGAATGGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TC-AA---TTCA---G---CA-TTA--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-AATTTAT--AA-------TTTC-ATTAACCATTGCTGC--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACAT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----CTG------CATG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACGA------AACCAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATATT---AAT--A---TA--C-AAACCAA
gi|103965 : TTAAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGGTTGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CA-TTT--A----------------------GATATA-------TTT-GTCTTTTAAACTTTA-AAA-T-----T----------------------C-ATTAACCATTG-------------------------ATAGGTGTGCC-------------------AATATCC--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CCTTAAAT--------TG--C--ATGAATA------CAATAAT-A--TAAGT--TGGTCGAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTACCTAAAATAATTGCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103966 : TTGAAAA-CAA----AA--A-AAGTGAATTGATGTCTCGTATTG-T--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---T---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-G-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTCACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAGTAGGTGTGCT-------------------AAAACCT--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATG------CACG----TATAAT--AA-CC------------ATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TTGTAAAGCAATACT---AAT--A---TA--C-AAATAAAACATTACCTGAAATAAT
gi|103967 : TTTAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAGCGGATAGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTAA--------A-TTT------------TTA----------GTTTCA-------TTT-GTCTTTCAATCTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------GTTC-ATTAACCATTGCTGA---AA------A-AA-----GATAGGTAAGCC-------------------AATACCT--A----GCT---TA-AGGCACACC-----ATA------TACA----TATAAT--TA-CCCTAAATACTACAGTTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--GAAGT--TGTTCAAGC-ATATC---AAGAAA---TA--C-TAATTAAACATTATCTGAAATAATTCCAGCAAGAAGTTAAAATAT
gi|103968 : TTGAAAA-CAT----CA--A-A-GTGAAGGGATGACTCGTATTG-C--------CT----------TAC-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCGTTAT--AA-------ATGC-ATTTACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-ATATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--ACCTTACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CTCTAAATACTTCAATGG--C--ATGACAA------AAATAAC-A--AAAGC--T-GTCA
gi|103969 : TTTAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGACT-----------------------------TAA-----T-ATCAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTTAAATTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACTATTGCTGG--CAA------ATAACCA-CAGTTGGTGTGCC-------------------AATACCC--A----ACT---TA-AGGCACATC-----ATG------TACG----TAAAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--A-GACTA------GAATAACAA--GAGGT--TGgaagacaacaa
gi|103970 : TTGAAAA-CAA----AA--A-AAGTGAATGGATA-----------C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-TA---TTAA---G---CA---------------ATTA----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--TA-------ATTT-GTTAGCCAATGCTAA--AAA------ATAA-CT-TGATA-ATGTGTC-------------------AATAC----------CT---TA-ATGCACCCC-----AGG------TACA----TATATT--TA-CCCTAAATACTACAATTG--C--ATGACTA------GAATGAT-A--TAA-------TCAAGC-ATATT---AAGAAA---TG--C-TAATTAAATGTTATTTGAAATAGTTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGC-ATTGTTGAGA
gi|103971 : TTGAAAA-CAA----CA--G-A-GTGAATGGATGACTTATTTTG-C--------CT----------AAA-----T-ATTAT-TTTAA---TTTA---G---CA-TTT--ACC------GTA-----------GTTACA-------TTT-GTCATTCAAACATTA-AAAAT-----T-GGTTTAG--AA-------ATTC-ATTTTCCATTGCTGA--CAA------ATAACCT--GATAGGCGTGCC-------------------AATACCT--A----ACTAAACA-AGGCACACC-----ATG------TATG----TATAAT--AA-CCCTAAATATTGCAATTG--C--ATGAATA------GAATAAT--------T--TAGTCGAG-GATATCACGAAG--A----A--C-TAATTTAATA
gi|103972 : TTGAAAAACAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-T--------CT----------CAA-----T-ATGAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTC-------A-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTCTATGAA-CA--GCTAA---AA------ACAAC
gi|103973 : TTGAAAA-CAA----T-------GTGAATGAATAGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTGT-GT-AA---TTCA---AAATCA-TTA--ACC------ATTaaggaataaaaacaagagtgccaa
gi|103973 : CCTTA-ATA-T-----T-GTGTAATTCAA-------AATC-ATTAACCATTGCTGA--AAA------ATAACAC--GATAGGTGTACC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGTACAC--------------------------------A-TTCTTAATACCACAATTG--C--AT---TA------G----------TTGGTCTTGGTCAAGCC-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTACCTGAATTAACTCCAGCAAGAATTTGAAATAAAGTGTAAGCCAAAGTTAACATgctgaaaaataacacgataggtgtaccaatacctaacttaaggtacacattcttaataccacaattgcattagttggtcttggtcaagcctatcaagaaatactaattaaacattacctgaattaactccagcaagaatttgaaataaagtgtaagccaaagttaacat
gi|103974 : ttgaaaacaatgtgaatgaatagctcatattgTTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCACATTG-A--------CTTACATTGCCATAA-----T-ACTAA-TT-AA---TTTA--------A-TTT--AAC------ATTCA---------GTTACA-------
gi|103975 : TTGAAAA-CAG----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATATTG-C--------TT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103976 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGTTCATATTA-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-CT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103977 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTGCC--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103978 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAATAAATT-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103979 : TTCAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCACATTG-CCTTGATATCT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CA-TTT--A----------------------GTTACA-------TTT-CTCT
gi|103980 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GCGAATGGATGGTTTGTATTG-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---A---CA-T
gi|103981 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GGGAATGAATGGTTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----C-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103982 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTG-C--------CT----------T-A-----T-ACTAT-CA-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103983 : TTGAAAA-CAG----GA--A-A-GTGAATAGATGGCTCGTATTG-C--------TT----------T-------T-A--AT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103984 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATAGTG-T--------CT----------TAA-----
gi|103985 : TGAAAA-CAA----CC--A-A-GTGAATGGATGGCTCAAATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CT-TTT--GTC------ATTT----------ATTACA-------TTT-GTCTTTAAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AATTTGTAAATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGAACATC-----ATG------TATG----TATAAT--AA-CCCTAAATATTTCAATTG--C--ATGACTA------GTATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATACT---AAC--A---CA--A-AAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAACAAATTTTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103986 : TGAAAA-CAG----CA--A-A-GTGAATGACTGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATCAA-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103987 : TGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGACTGGCCTATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAA-TT-AA---TTTA---G---CA-T
gi|103988 : TGAAAA-CAAATGTCA--A-A-ACAAATGGATTGCTTACATTG-C--------CA----------CAT-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103989 : ----------TAA-----TTATTAT-AT-AA---TTC------------TT--GTCTGTTAAATTTAAAAGCATGAGTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-TAA-C-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--AAA------A-AACAAACAATAGGTGTGCC-------------------AATAC----------------------A-ACC-----ATG------TACA----TATAATTTA----TTAAATACTACAATTG--C--ACGACTACCAGTAGAAAAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAA-TTAAAACATAGTGTAAGCTATAGTTGAGAAGAT
gi|103990 : gaaaacaattaatattaaactcagtggggataaaattaagctaGAAAA-CAA----CA--A-G-GTGAACGGATGGCTCATATTA-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TACA---G---AA------G-C------ATTTA---------GATACA-------TTT-GTCTT--A------A-AAA-T-----TGGATTTAT--AA-------ATTA-CCTAATCATTGCTGA--AAA------A--------AACA------------------------------------A----ACT---TA-AGGCACACC-----AAG------TAAG----TATAAT--TT-CCCTAAATACTACAATTAATC--ACGCCTG------GA
gi|103991 : GAAAA-AAA----CA--A-A-GTGAATGACTGGCTCATATTG-C--------CT----------TTA-----T-ATTAA-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103992 : AAAA-CAA----CA--A-A-GTGAACGGAAAGCTCATATTG-C--------TT----------TAA-----T-ATTGT-TT-AA---TTAA---G---CA-TTT--A----------------------ATTACA-------TTG-GTCTTTCAAACTGTA-AAA-T-----T-GCTCTAT--TA-------ATTC-ATTAATCATTGCTGA--AGA------A-AAT----GATAGGTGTGCC-------------------A-TACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----GTG------TACA----TACAAT--TA-CCCTAAATACTATAAATG--C--AGGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATATC---AAGAAA---CA--C-TAATTAAACATTATCTAAAACAATTCAAGCAAGAATTTAAAATATCTTGTAAGCCATAGTTCAGATGAT
gi|103993 : AAAA-CAA------------GTGAATGAATGGCTCATATTG-C--------CT----------AAA-----T-ATTGTATC-AAACTTTCAAATG---CA-TTG--ATC------AT
gi|103993 : CTTT-C--AA-------ATGC-ATTGATCATGACTGA--AAA------ATAACCC-CA-TATGTGTGTC-------------------AATACT-------------------------------ATG------TACG----TATAGT--AA-CCCTTATTACTACAATTG--C--A-------------------------AG-----GTCAAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-CAATTAAACATTACCTGAAATTATTCCAGCAAGAATTAAAAATATAGTGTAAGCCATAGTTAAGACGATgactgaaaaataaccccatatgtgtgtcaatactatgtacgtatagtaacccttattactacaattgcaaggtcaagcatatcaagaaataccaattaaacattacctgaaattattccagcaagaattaaaaatatagtgtaagccatagttaagacgat
gi|103994 : aaaacaagtgaatgaatggctcatattgcctaaatattgtatcaaaAAA-CAA----CA--A-A-GTGAACGGATAGCTCATATTG-C--------C-----------TAA-----T-ATTTT-TT-AA---TTAA---G---CA-TTT--A----------------------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACATTA----------------------AA-------ATTC-ATT-ACCATTGCTG---CAAAAAAAGACAACCC-TAA
gi|103994 : AC--AA-CCCTAAATATTTCAATTG--C--ATGACTA------AAACAAT-A--TAAAT--TGGTCAAGCA-TATC---GAG--AAA-TA--C-TAATTTAACATTATCTGAAATAATTCCAGCAATAATTTAAAATATAGTGTAAGTCATAGTTGAGATGATatatttcaattgcatgactaaaacaatataaattggtcaagcatatcgagaaatactaatttaacattatctgaaataattccagcaataatttaaaatatagtgtaagtcatagttgagatgat
gi|103995 : aaacaacaaagtgaacggatagctcatattgcctaatattttttaattaagcatttagttacatttgtctttcaaacattaaaattcattaccattgctgcaaaaaaagAAG-TAA----CA--A-A-TTGAATGGATGACTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---A---CA-T
gi|103996 : A-CAA----CA--A-A-GGTAATGGTTCGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----A-ATTAT-TT-AA---CTGA---G---CA-TTT--ATA------A-TA----------ATTGCA-------ATT-GTCTTTCAAACATTA-ACA-T-----T-G-TGTAT--AA-------ATCC-ATTAA
gi|103997 : -CAA----CAGAA-A-GAGAATGGATGGCTTATATTG-C--------CG----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTTAAGTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-ATCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAA-CATTGCTGA--CAA------ATAA-CC-CAACAGGTATGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCGCACCAATCAATG------TATG----TACCAT--AA-CCCTAAATACTACAACTG--C--ATGACTA------AAATAAT-A--TAAGT--TGGTAAAGC-ATATC---AAG--AAT-TT--C-TAATTAAACATGACCTGAATTAATTCCAGCAAGAATTTAAAATAAAGTGCAAG
gi|103998 : -CAA----CA--CTA-GTG--TGGCTGGTTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAA-TT-AA---TTTA---G---CA-T
gi|103999 : AA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCACACATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CA-TTG--A----------------------GTTACA-------TTT-GTCGTTCAAACTTTACAAA-TGTTTAT-GCTTTTT--AA-------ATTC-ATTAACCTTTGCTGA--CAA------ATAACCC-------GTGTGTT-------------------AATACCTTAA----ATT---TA-A-------C-----ATG------TATG----TATAAT------CCTAAATATTACAATTG--C--ATGAATA------GAATAAT-G--TAAGT--AGGTCAAGCA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTATCTGAAATAAGTCTAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTGTAGTTCAGATGAT
gi|104000 : T-AA---TTCA---A---CA-ACA--AT-------ATTT----------ATT----------TTC-ATCAT-CAA----TG-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCCTTGCTGA--CAA------ATAACCC--AATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGTACACC-----ATG------TACA----T------------CTAAATATTACAATTG--C--ATGGATA------GAATGAT-A--TATGT--TAGTCAAGTA-TATC---AAG--AAA-TA--C-TAATTAAACATTTCCTGAAATAATACCAGCAAGAATTTAAAATATAGTTTAAGCTATTGCTGAGCTGAT
gi|104001 : -AA---TTAA---G---CA-TTT--A----------------------GTTAAA-------TCT-GTCTTTCAAATTTCA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA---AA------A--------AATAGGTGTGCC-------------------AAAACCT--A----ACT---TA-ATGCACTCC-----ATG------TATG----TATAAT--TA-CCCTAAATACTACAATTG--C--ATGACAG------GAATAAA-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATATC---AAGAAA---TA--C-TAATCAAACATTACCTGAAATAATTCTAGCAAGAA-TTAAAATAAATTATAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|104002 : GA--CAG-------TAACTT--AATAGGTGTGCC-------------------AACA-CG--G----ACT---TAGAGGCACACC-----ATG------TTCA----TATAAT--AACCCCTAAAT--TTTATTTG--TTAAAAACTA------AATTAAT-AACTAA----TATTAAATTAATAAC---AAA--ATTTTA--CATAAT--AATATCACCT
gi|104003 : -------------------AACAACT--A----ACT---TA-AGGCACAAC-----AT-------TACG----TCTAAT--AA-CCCTAAATATTACGATTA--T--AT
gi|104004 : TGAT--GA-TCCTTAATACTGCAATTG--C--ATGAATA------GAATAAC-A--TAAGT--TGGTCAAGC-ATA-C---AAGAAA---TA--T-TAATTAAACATTACATGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTAGAGTTGAAATGAT
gi|104005 : AAT--AG-CCCTAAATACTGCAACTG--C--ATAACTA------GAATAAT-A--TAACT--TGGTCAAACT-TAAC---AAA--AAT-TA--C-CATTTAAACATTAGCTGAAATAATATCAACAAGTATTTAAAATATAGTGTAATCTATAGTTGAGATGAT
gi|104006 : TAAT-A--AAAAT--TGGTCAAGCA-TATC---AAG--A---AATTC-TTTTTAAACATTACCTAAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAATTATAGTATCAGCTATAGTTGAGA
gi|104007 : TAAACATTACCCGAAATAATTCAAGAAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
blockSeqs : ATGT GA A CTTGATAT TACATTGCCA TAAAT ACT AAT AAT GTCTGTTAAATTTAAAAGCATGA TTGTACA T C A GTTTA G TC TTTGTAA T AAT AAAAAG T C AAC GAACGACGCACTTCCGATA TA CCTT AAA G AATCA TGCATA TTAT TT C T AT TA CCAGTA A AC CT AA ACG AATTT TT AT
blockSeqs : . . A . . . . . . AAGTCATTT . . . . . . . . . C . T C CC TA . . . . . . . . . T . . . . . . AA . GAAA . A
blockSeqs : . . . . . . . . . AACATTCA . . . . . . . . . C . T C CC . . . . . . . . . . T . . . . . . AA . GAAA . A
blockSeqs : . . . . . . . . . GTCATTT . . . . . . . . . C . T C CC . . . . . . . . . . T . . . . . . AA . GAAA . A
blockSeqs : . . . . . . . . . GTTATTA . . . . . . . . . C . T A AC . . . . . . . . . . T . . . . . . AA . GAAA . A
blockSeqs : . . . . . . . . . ATCATTT . . . . . . . . . C . T C CC . . . . . . . . . . T . . . . . . AA . GAAA . A
blockSeqs : . . . . . . . . . GTCATTT . . . . . . . . . C . T A AC . . . . . . . . . . T . . . . . . AA . GAAA . A
blockSeqs : . . . . . . . . . GTCATTT . . . . . . . . . C . A C CC . . . . . . . . . . A . . . . . . AA . GAAA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . GTTATTC . . . . . . . . . C . T C CC . . . . . . . . . . T . . . . . . AA . GAAA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . TCCATTT . . . . . . . . . C . T C CC . . . . . . . . . . A . . . . . . GA . GAAA . A
blockSeqs : . . . . . . . . . GTCATTT . . . . . . . . . C . T C CA . . . . . . . . . . T . . . . . . AA . GAAT . T
blockSeqs : . . . . . . . . . GTCATTT . . . . . . . . . C . T C AC . . . . . . . . . . T . . . . . . AA . GAAA . A
blockSeqs : . . . . . . . . . GTCATTT . . . . . . . . . C . T C TT . . . . . . . . . . A . . . . . . A . GAAA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . GTCATTT . . . . . . . . . A . T C CC . . . . . . . . . . G . . . . . . A . GAAA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . GTCATTT . . . . . . . . . C . C C CC . . . . . . . . . . A . . . . . . A . GAAA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . GTCATTT . . . . . . . . . A . T C CT . . . . . . . . . . T . . . . . . A . AAAT . T
blockSeqs : . . . . . . . . . GTCATTT . . . . . . . . . C . T C CC . . . . . . . . . . A . . . . . . A . TA . A
blockSeqs : . . . . . . . . . GCATTTA . . . . . . . . . A . T T C . . . . . . . . . . A . . . . . . C . TA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . ACCGTA . . . . . . . . . A . C C T . . . . . . . . . . A . . . . . . A . TA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . ATAATA . . . . . . . . . A . T C C . . . . . . . . . . A . . . . . . A . TA . C
blockSeqs : . . . . . . . . . ATATTT . . . . . . . . . A . T C C . . . . . . . . . . T . . . . . . A . TA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . ATTA . . . . . . . . . C . T C C . . . . . . . . . . A . . . . . . A . TT . T
blockSeqs : . . . . . . . . . TTA . . . . . . . . . C . T C T . . . . . . . . . . A . . . . . . A . TA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . TA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . GA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . CA . T
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . GA . C
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . T . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : A* GAAA***
originalCons : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTNCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCAATATC---AAG--A---TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
finalCons : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAGGTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACC-----ATG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTNCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-A--TAAGT--TGGTCAAGCA-TATC---AAGAAA---TA--C-TAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111 111 1111111111111111111 1
lowQualScore : 0 1111 11 0 1 0 0 33333333 3333333333 22222 0 0 0 111 111 111 0 4444444444444444444444444 4444444 1 1 1 33333 1 11 4444444 1 222 333333 3 222 11 0000000000000000000 11 2222 222 1 33333 333333 2222 11 1 2 11 11 333333 1 11 3 33 0
lowQualScore : . .... .. . . . . ........ .......... ..... . . . ... ... ... . ......................... ....... . . . ..... . .. ....... . ... ...... . ... .. ................... .. .... ... . ..... ...... .... .. . . .. .. ...... . .. . .. .
lowQualScore : 9 8888 22 9 7 1 9 22222222 7777777777 11111 9 9 8 555 555 555 8 7777777777777777777777777 2222222 3 3 3 33333 3 88 2222222 3 888 777777 1 555 99 3333333333333333333 88 8888 333 3 33333 888888 8888 77 2 3 77 77 666666 2 88 8 66 3
consensus : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAG--GTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACCA-----TG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTNCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-ATAAGT--TGGTCAAGC-ATATCAAGAAATACTAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
Reference ( family-464 ) : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAG--GTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACCA-----TG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTNCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-ATAAGT--TGGTCAAGC-ATATCAAGAAATACTAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103953 : TTGAAAA-TAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATATTA-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTA------ATTT----------GTGATA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCT-CAATAG--GTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---AA-AGGGACATCA-----TG------TACG----TATGAT--AA-CTCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-ATAAGT--TGGTCAAGCAATACTA--AAATACAAATTAAACATAACTTGATCTAATTCCAGCAAGAAATTAAACTATTGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103954 : TTGAAAA-TAA----------A-GTGAATGGATGGTTGATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTAAA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAAGTGTGTGTA-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACACCA-----TG------TAGG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTA--C--ATGACTA------GACTAAT-ATAAGT--TGGTCAAGCAATACCAAT--ATACAAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTACAGTTGAGATGAT
gi|103955 : TTGAAAA-AAA----GT--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTT------ATTA----------GTTACATTGTACATTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-A-----T-GCTTCAT--AA-------ATTG-ATTAACCATTGCTGA--CTA------ATAACCC-CAATAC--GTGTGCC-------------------AATACCT--T----ACT---AA-AGGCACATCA-----TG------TACG----TATAAC--AA-CCCTAAATA-------------------------------------AAGT--TGGTCAATCAATACTTATAAACA--AATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGTAAGAATTTGAAATATAATGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103956 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-TTTCATTGATGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---AA-TT---ATC------ATTT----------GATACA-------TTT-ATCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTT-AT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC--AATAG--GTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACAGCA-----TG------TACG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GACTAAT-GTAAGT--TGGCCAAGCAATACTAAT--ATACAAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCATGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103957 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATTGCTCGTATTG-T--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TC-AA---TTTA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTAAAA-------TTTTGTCTTTCAAACTTTA-AAA-C-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAT--GTGTG-----------------------TACCT--A----ACT---TA-AGGCACATCA-----TG------TACATTATTATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-ATAAAT--TGGTCAAACAATACTAAT--ATACAAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAGGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTGTAGTTGAGATGAT
gi|103958 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GGGAATGGATGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103959 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATTGATGGCTCGTAGTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CATTTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTAAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTGTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------A-AAAAA-CAATAG--GCATGCC-------------------AATACCT--A----ACA---TA-AGGTACATCA-----TG------TAAA----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--A--ATGGCAA------GAATAAT-ATAAAT--TGGTCAACCAATACTAAT--ATACAAATTAATCATAACCCAATGTAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGAAAGCTATAGTTGAATTGAT
gi|103960 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATTGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTT------ATTC----------ATTATA-------TTT-GTCTTTCAATCTTTA-AAA-T-----T-GCTCTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAG--GTGTACCGAACGACGCACTTCCGATAAAAACCT--A----ACT---TA-AGGCACATCA-----TGTGCATATACA----TGTAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACTG------GAATAAT-ATAAAT--AAGTCAAGCAATACTAAT--TTACAAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAACAAGAA-AAAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103961 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--TCC------ATTT----------GCTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-ATA-T-----T-GCTTTAT--AA-------TTTC-ATTAATCATT-CTGA--CAA------ATAA-CA-CATTTG--GTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACATCA-----CG------TACG----TATAAT--AA-CTCCAAATACTTCAGTTG--C--ATGTCAA------GAATAAT-ATACGT--TGGTCAAGC----------AATACT--T---ACATTACCTGAAATTATTCCACCAGAGATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103962 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATCG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCT---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTT---------------------------AT--AA-------ATTC-ATTAACAATTGCTGA--CAA------ATAAACC-CAATAG--GTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AAGCACACCA-----TG------CACA----TACAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATCG--C--ATGACTA------GGTTGAT-ATTAGT--TTATCAAGC-ATGTCAAGAAATACTAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGTAAGAATTTTAAATACAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103963 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCCGATATTG-C--------AT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--A----------------------GTTACA-------T---GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGTTGAAATAA------AAAACT----ATAG--GTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCACAGGG-----TG------TATG----TACAAT--TA-ACCTAAATACTACAATTA--C--ATTACTA------GAATAAT-ATAAGT--TGGTCAAGC-ATATC-------ACTAATTAAACATTACCTGAAATAAATCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGTTATAGTTGAGATAAT
gi|103964 : TTGAAAA--AA----CA--A-A-GTGAATGAATGGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TC-AA---TTCA---G---CA-TTA--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-AATTTAT--AA-------TTTC-ATTAACCATTGCTGC--CAA------ATAACCC-CAATAG--GTGTGCC-------------------AATACAT--A----ACT---TA-AGGCACATCC-----TG------CATG----TATAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--ATGACGA------AACCAAT-ATAAGT--TGGTCAAGCAATATTAA
gi|103965 : TTAAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGGTTGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CA-TTT--A----------------------GATATA-------TTT-GTCTTTTAAACTTTA-AAA-T-----T----------------------C-ATTAACCATTG-------------------------ATAG--GTGTGCC-------------------AATATCC--A----ACT---TA-AGGCACACCA-----TG------TACG----TATAAT--AA-CCTTAAAT--------TG--C--ATGAATA------CAATAAT-ATAAGT--TGGTCGAGC-ATATCAAGAAATACTAATTAAACATTACCTAAAATAATTGCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGATtatacaaaccaa
gi|103966 : TTGAAAA-CAA----AA--A-AAGTGAATTGATGTCTCGTATTG-T--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---T---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-G-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTCACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAGTAG--GTGTGCT-------------------AAAACCT--A----ACT---TA-AGGCACATCA-----TG------CACG----TATAAT--AA-CC------------ATTG--C--ATGACTA------GAATAAT-ATAAGT--TTGTAAAGCAATACTAAT--ATACAAATAAAACATTACCTGAAATAAT
gi|103967 : TTTAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAGCGGATAGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTAA--------A-TTT------------TTA----------GTTTCA-------TTT-GTCTTTCAATCTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------GTTC-ATTAACCATTGCTGA---AA------A-AA-----GATAG--GTAAGCC-------------------AATACCT--A----GCT---TA-AGGCACACCA-----TA------TACA----TATAAT--TA-CCCTAAATACTACAGTTG--C--ATGACTA------GAATAAT-AGAAGT--TGTTCAAGC-ATATCAAGAAATACTAATTAAACATTATCTGAAATAATTCCAGCAAGAAGTTAAAATAT
gi|103968 : TTGAAAA-CAT----CA--A-A-GTGAAGGGATGACTCGTATTG-C--------CT----------TAC-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCGTTAT--AA-------ATGC-ATTTACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-ATATAG--GTGTGCC-------------------AATACCT--ACCTTACT---TA-AGGCACACCA-----TG------TACG----TATAAT--AA-CTCTAAATACTTCAATGG--C--ATGACAA------AAATAAC-AAAAGC--T-GTCA
gi|103969 : TTTAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGACT-----------------------------TAA-----T-ATCAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTTAAATTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACTATTGCTGG--CAA------ATAACCA-CAGTTG--GTGTGCC-------------------AATACCC--A----ACT---TA-AGGCACATCA-----TG------TACG----TAAAAT--AA-CCCTAAATACTTCAATTG--C--A-GACTA------GAATAACAAGAGGT--TGgaagacaacaa
gi|103970 : TTGAAAA-CAA----AA--A-AAGTGAATGGATA-----------C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-TA---TTAA---G---CA---------------ATTA----------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--TA-------ATTT-GTTAGCCAATGCTAA--AAA------ATAACTT--GATAA---TGTGTC-------------------AATACCT-------------TA-ATGCACCCCA-----GG------TACA----TATATT--TA-CCCTAAATACTACAATTG--C--ATGACTA------GAATGAT-ATAA-------TCAAGC-ATATTAAGAAATGCTAATTAAATGTTATTTGAAATAGTTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGC-ATTGTTGAGA
gi|103971 : TTGAAAA-CAA----CA--G-A-GTGAATGGATGACTTATTTTG-C--------CT----------AAA-----T-ATTAT-TTTAA---TTTA---G---CA-TTT--ACC------GTA-----------GTTACA-------TTT-GTCATTCAAACATTA-AAAAT-----T-GGTTTAG--AA-------ATTC-ATTTTCCATTGCTGA--CAA------ATAACCT--GATAG--GCGTGCC-------------------AATACCT--A----ACTAAACA-AGGCACACCA-----TG------TATG----TATAAT--AA-CCCTAAATATTGCAATTG--C--ATGAATA------GAATAAT------T--TAGTCGAGG-ATATCACGAAGAACTAATTTAATA
gi|103972 : TTGAAAAACAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-T--------CT----------CAA-----T-ATGAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTT--GTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-GTCTTTC-------A-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTCTATGAA-CA--GCTAA---AA------ACAAC
gi|103973 : TTGAAAA-CAA----T-------GTGAATGAATAGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTGT-GT-AA---TTCA---AAATCA-TTA--ACC------ATTaaggaataaaaacaagagtgccaa
gi|103973 : CCTTA-ATA-T-----T-GTGTAATTCAA-------AATC-ATTAACCATTGCTGA--AAA------ATAACAC--GATAG--GTGTACC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGTACAC--------------------------------A-TTCTTAATACCACAATTG--C--AT---TA------G--------TTGGTCTTGGTCAAGC-CTATCAAGAAATACTAATTAAACATTACCTGAATTAACTCCAGCAAGAATTTGAAATAAAGTGTAAGCCAAAGTTAACATgctgaaaaataacacgataggtgtaccaatacctaacttaaggtacacattcttaataccacaattgcattagttggtcttggtcaagcctatcaagaaatactaattaaacattacctgaattaactccagcaagaatttgaaataaagtgtaagccaaagttaacat
gi|103974 : ttgaaaacaatgtgaatgaatagctcatattgTTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCACATTG-A--------CTTACATTGCCATAA-----T-ACTAA-TT-AA---TTTA--------A-TTT--AAC------ATTCA---------GTTACA-------
gi|103975 : TTGAAAA-CAG----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATATTG-C--------TT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103976 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGTTCATATTA-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-CT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103977 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTGCC--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103978 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCGTATTG-C--------CT----------TAATAAATT-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103979 : TTCAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCACATTG-CCTTGATATCT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CA-TTT--A----------------------GTTACA-------TTT-CTCT
gi|103980 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GCGAATGGATGGTTTGTATTG-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---A---CA-T
gi|103981 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GGGAATGAATGGTTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----C-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103982 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTTGTATTG-C--------CT----------T-A-----T-ACTAT-CA-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103983 : TTGAAAA-CAG----GA--A-A-GTGAATAGATGGCTCGTATTG-C--------TT----------T-------T-A--AT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103984 : TTGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCTCATAGTG-T--------CT----------TAA-----
gi|103985 : TGAAAA-CAA----CC--A-A-GTGAATGGATGGCTCAAATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CT-TTT--GTC------ATTT----------ATTACA-------TTT-GTCTTTAAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AATTTGTAAATTC-ATTAACCATTGCTGA--CAA------ATAACCC-CAATAG--GTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGAACATCA-----TG------TATG----TATAAT--AA-CCCTAAATATTTCAATTG--C--ATGACTA------GTATAAT-ATAAGT--TGGTCAAGCAATACTAACACAAA--AATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAACAAATTTTAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|103986 : TGAAAA-CAG----CA--A-A-GTGAATGACTGGCTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATCAA-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103987 : TGAAAA-CAA----CA--A-A-GTGAATGACTGGCCTATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAA-TT-AA---TTTA---G---CA-T
gi|103988 : TGAAAA-CAAATGTCA--A-A-ACAAATGGATTGCTTACATTG-C--------CA----------CAT-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103989 : ----------TAA-----TTATTAT-AT-AA---TTC------------TT--GTCTGTTAAATTTAAAAGCATGAGTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACTTTA-TAA-C-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA--AAA------A-AACAAACAATAG--GTGTGCC-------------------AATAC----------------------A-ACCA-----TG------TACA----TATAATTTA----TTAAATACTACAATTG--C--ACGACTACCAGTAGAAAAAT-ATAAGT--TGGTCAAGC-ATATCAAGAAATACTAATTAAACATTACCTGAAATAATTCCAGCAAGAA-TTAAAACATAGTGTAAGCTATAGTTGAGAAGAT
gi|103990 : gaaaacaattaatattaaactcagtggggataaaattaagctaGAAAA-CAA----CA--A-G-GTGAACGGATGGCTCATATTA-C--------CT----------CAA-----T-ATTAT-TT-AA---TACA---G---AA------G-C------ATTTA---------GATACA-------TTT-GTCTT--A------A-AAA-T-----TGGATTTAT--AA-------ATTA-CCTAATCATTGCTGA--AAA------A--------AACA--------------------------------------A----ACT---TA-AGGCACACCA-----AG------TAAG----TATAAT--TT-CCCTAAATACTACAATTAATC--ACGCCTG------GA
gi|103991 : GAAAA-AAA----CA--A-A-GTGAATGACTGGCTCATATTG-C--------CT----------TTA-----T-ATTAA-TT-AA---TTCA---G---CA-T
gi|103992 : AAAA-CAA----CA--A-A-GTGAACGGAAAGCTCATATTG-C--------TT----------TAA-----T-ATTGT-TT-AA---TTAA---G---CA-TTT--A----------------------ATTACA-------TTG-GTCTTTCAAACTGTA-AAA-T-----T-GCTCTAT--TA-------ATTC-ATTAATCATTGCTGA--AGA------A-AAT----GATAG--GTGTGCC-------------------A-TACCT--A----ACT---TA-AGGCACACCG-----TG------TACA----TACAAT--TA-CCCTAAATACTATAAATG--C--AGGACTA------GAATAAT-ATAAGT--TGGTCAAGC-ATATCAAGAAACACTAATTAAACATTATCTAAAACAATTCAAGCAAGAATTTAAAATATCTTGTAAGCCATAGTTCAGATGAT
gi|103993 : AAAA-CAA------------GTGAATGAATGGCTCATATTG-C--------CT----------AAA-----T-ATTGTATC-AAACTTTCAAATG---CA-TTG--ATC------AT
gi|103993 : CTTT-C--AA-------ATGC-ATTGATCATGACTGA--AAA------ATAACCC-CA-TAT--GTGTGTC-------------------AATACT--------------------------A-----TG------TACG----TATAGT--AA-CCCTTATTACTACAATTG--C--A-----------------------AG-----GTCAAGC-ATATCAAGAAATACCAATTAAACATTACCTGAAATTATTCCAGCAAGAATTAAAAATATAGTGTAAGCCATAGTTAAGACGATgactgaaaaataaccccatatgtgtgtcaatactatgtacgtatagtaacccttattactacaattgcaaggtcaagcatatcaagaaataccaattaaacattacctgaaattattccagcaagaattaaaaatatagtgtaagccatagttaagacgat
gi|103994 : aaaacaagtgaatgaatggctcatattgcctaaatattgtatcaaaAAA-CAA----CA--A-A-GTGAACGGATAGCTCATATTG-C--------C-----------TAA-----T-ATTTT-TT-AA---TTAA---G---CA-TTT--A----------------------GTTACA-------TTT-GTCTTTCAAACATTA----------------------AA-------ATTC-ATT-ACCATTGCTG---CAAAAAAAGACAACCC-
gi|103994 : AC--AA-CCCTAAATATTTCAATTG--C--ATGACTA------AAACAAT-ATAAAT--TGGTCAAGC-ATATCGAGAAATACTAATTTAACATTATCTGAAATAATTCCAGCAATAATTTAAAATATAGTGTAAGTCATAGTTGAGATGATtaaatatttcaattgcatgactaaaacaatataaattggtcaagcatatcgagaaatactaatttaacattatctgaaataattccagcaataatttaaaatatagtgtaagtcatagttgagatgat
gi|103995 : aaacaacaaagtgaacggatagctcatattgcctaatattttttaattaagcatttagttacatttgtctttcaaacattaaaattcattaccattgctgcaaaaaaagAAG-TAA----CA--A-A-TTGAATGGATGACTCGTATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---A---CA-T
gi|103996 : A-CAA----CA--A-A-GGTAATGGTTCGCTTGTATTG-C--------CT----------TAA-----A-ATTAT-TT-AA---CTGA---G---CA-TTT--ATA------A-TA----------ATTGCA-------ATT-GTCTTTCAAACATTA-ACA-T-----T-G-TGTAT--AA-------ATCC-ATTAA
gi|103997 : -CAA----CAGAA-A-GAGAATGGATGGCTTATATTG-C--------CG----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTCA---G---CA-TTTAAGTC------ATTT----------GTTACA-------TTT-ATCTTTCAAACTTTA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAAC-ATTGCTGA--CAA------ATAACCC--AACAG--GTATGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGCGCACCAATCAATG------TATG----TACCAT--AA-CCCTAAATACTACAACTG--C--ATGACTA------AAATAAT-ATAAGT--TGGTAAAGC-ATATCAAGAATTTCTAATTAAACATGACCTGAATTAATTCCAGCAAGAATTTAAAATAAAGTGCAAG
gi|103998 : -CAA----CA--CTA-GTG--TGGCTGGTTCATATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAA-TT-AA---TTTA---G---CA-T
gi|103999 : AA----CA--A-A-GTGAATGGATGGCACACATTG-C--------CT----------TAA-----T-ATTAT-TT-AA---TTTA---G---CA-TTG--A----------------------GTTACA-------TTT-GTCGTTCAAACTTTACAAA-TGTTTAT-GCTTTTT--AA-------ATTC-ATTAACCTTTGCTGA--CAA------ATAACCC---------GTGTGTT-------------------AATACCTTAA----ATT---TA-A-------CA-----TG------TATG----TATAAT------CCTAAATATTACAATTG--C--ATGAATA------GAATAAT-GTAAGT--AGGTCAAGC-ATATCAAGAAATACTAATTAAACATTATCTGAAATAAGTCTAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTGTAGTTCAGATGAT
gi|104000 : T-AA---TTCA---A---CA-ACA--AT-------ATTT----------ATT----------TTC-ATCAT-CAA----TG-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCCTTGCTGA--CAA------ATAACCC--AATAG--GTGTGCC-------------------AATACCT--A----ACT---TA-AGGTACACCA-----TG------TACA----T------------CTAAATATTACAATTG--C--ATGGATA------GAATGAT-ATATGT--TAGTCAAGT-ATATCAAGAAATACTAATTAAACATTTCCTGAAATAATACCAGCAAGAATTTAAAATATAGTTTAAGCTATTGCTGAGCTGAT
gi|104001 : -AA---TTAA---G---CA-TTT--A----------------------GTTAAA-------TCT-GTCTTTCAAATTTCA-AAA-T-----T-GCTTTAT--AA-------ATTC-ATTAACCATTGCTGA---AA------A--------AATAG--GTGTGCC-------------------AAAACCT--A----ACT---TA-ATGCACTCCA-----TG------TATG----TATAAT--TA-CCCTAAATACTACAATTG--C--ATGACAG------GAATAAA-ATAAGT--TGGTCAAGC-ATATCAAGAAATACTAATCAAACATTACCTGAAATAATTCTAGCAAGAA-TTAAAATAAATTATAAGCTATAGTTGAGATGAT
gi|104002 : GA--CAG-------TAACTT--AATAG--GTGTGCC-------------------AACA-CG--G----ACT---TAGAGGCACACCA-----TG------TTCA----TATAAT--AACCCCTAAAT--TTTATTTG--TTAAAAACTA------AATTAAT-A
gi|104003 : -------------------AACAACT--A----ACT---TA-AGGCACAACA-----T-------TACG----TCTAAT--AA-CCCTAAATATTACGATTA--T--ATactaatattaaattaataacaaaattttacataataatatcacct
gi|104004 : TGAT--GA-TCCTTAATACTGCAATTG--C--ATGAATA------GAATAAC-ATAAGT--TGGTCAAGC-ATA-CAAGAAATATTAATTAAACATTACATGAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTAGAGTTGAAATGAT
gi|104005 : AAT--AG-CCCTAAATACTGCAACTG--C--ATAACTA------GAATAAT-ATAACT--TGGTCAAAC-TTAACAAAAATTACCATTTAAACATTAGCTGAAATAATATCAACAAGTATTTAAAATATAGTGTAATCTATAGTTGAGATGAT
gi|104006 : TAAT-AAAAAT--TGGTCAAGC-ATATCAAGAAATTCTTTTTAAACATTACCTAAAATAATTCCAGCAAGAATTTAAATTATAGTATCAGCTATAGTTGAGA
gi|104007 : TAAACATTACCCGAAATAATTCAAGAAAGAATTTAAAATATAGTGTAAGCTATAGTTGAGATGAT