lowQualScore                  :       0      111      3                 0      0     11 33333         
lowQualScore                  :       .      ...      .                 .      .     .. .....         
lowQualScore                  :       8      333      8                 7      7     00 55555         
consensus                     : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
Reference ( gi|64005 )        : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64006                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64007                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATTGGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64010                      : AAGATC-ACGTTC---TAACCATTAATTATCAGATATCAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64008                      : AAGATC-ATGTTC---TAACTAATAATTCTCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64012                      : AAGATC-ATATTC---TAACTAATAATTATCAGATATTAC-AATAGT-ACTTC--A-----TATCTAGTT
gi|64011                      : AAGACC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AGTAAT-ACATC--A-----TATCCAGT
gi|64013                      : AAGATC-AGGTTC---TAACCAACAGTTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAATT
gi|64014                      : AAGATT-ATGTTC---TAACCAATAGTTATCAGATATAAC-AATAAT-GCTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64015                      : AAGATC-AAGTTC---TAACCAATAATTATCAGATTTTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCATTT
gi|64016                      : AAGATC-ATGCTC---TAACCAATAATTATCATATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATTCAGT
gi|64017                      : AAGATC-ATGTTG---TAACCAATGATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATTGAGTT
gi|64019                      : AAGCTC-ATGTTC---TAACCAGTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--ATGATTTATCCAGTT
gi|64021                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATAATAC-AATAAT-ACTTC--A-----TAT
gi|64022                      : AAGATT-ATGTTC---TAACCAATAATTAATAGATATAAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAATT
gi|64023                      : AAGATC-ATGTTC---TAAC-------TATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGT
gi|64009                      : AAGATC-ATGTTA---TACCCAATAACTATCAGATGTTAC-AATAAT-ACTTT--A-----TATTCAGTT
gi|64024                      : AAGATC-ATGTAC---TAACCAATATTTATCCGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TGTCCATTT
gi|64025                      : AAGATC-ATGTTT---TAACCACTAATCATCAGATATTAC----AAT-ATTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64026                      : AATATC-ATGTTC---TAACCATTA-TTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TACCTAGT
gi|64028                      : AAGACC-A-GTTA---TAACCAATAATTATCTGATATTGC-CATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64027                      : AAGATC-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAGATGTT---AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64018                      : AATATC-TTGTTC---TAACAAATAATTATCAGAGATTAC-AATAAA-ACTTC--A-----TATCCAG
gi|64029                      : AAAATT-ATATTC---TAACCA----TTATCAGATATGAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGT
gi|64030                      : AAGATC-ATATTC---TAACCATTAATGATCAGATATTAT-AACATT-ATTTC--A-----TATCCAG
gi|64031                      : AAGTTC-ATGTTC---TAACCATTAATCATCAAATATCAT-AGTAAA-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64033                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCATCAATAATCAGATATAAC-AGTAAT-ATTCC--A-----TATCCAAT
gi|64032                      : AAGATT-ATGTTC---TAATTTATAATTGTCATATATTCC-AATAAT-ACTTC--A-----TAACCAGTT
gi|64034                      : AAGATC-ATGTTC---TGTCCAATAGTTATCAGATTTTAC-AATAAA-AGTTA--A-----TATCCAGT
gi|64035                      : AAGATC-ATGTTC---AAACCAATAATAATCCAATATAAC-AGTAAT-ACATC--A-----TATCCAGT
gi|64036                      : AAGATC-ATTTTC---TATCCAATAATTATCAGATATGAC-AATGAA-ACTTC--A-----TATCTA
gi|64037                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAGATATTAC-AACAAT-ATTAC--A-----TATCC
gi|64038                      : AAGATC-ATGTTC---TTACCAATAATTATCAGAAATTAC-AATAAT-A-TTC--A-----
gi|64039                      : AAGAAC-ATGTTC---TGACCATTAATTATCTGATATTAC-ATTAAT-AGTAC--A-----TATCCAGT
gi|64041                      : AAGAAC-ATGTTC---TAACCATTTCTTACCAGGTATTAC-TATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64040                      : AAGATCCATGTTC---TAACCATTATTTATCAGATATTAA-AATAAT-ATTTC--ATAAT-TATCTAGT
gi|64042                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATCATAAGATATTAC-AACAAT-ATTTC--A-----TATCC
gi|64020                      : AAGATC-AAGTTC---AAACCATTAATTATCAGATATTACAAAAAAC-ACTTC--A-----TACCAAGT
gi|64043                      : AAGATC-ATGTTC---TTACCATTAATAATCCAATATTAC-AAAAAT-ATTAC--A-----TATCCAGT
gi|64044                      : AAGATC-TTGGTC---TAACTA-TAATTATCAGATATTCC-AATAAT-ACTTC--T-----TAT
gi|64045                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAAATTTTAC-AACAAT-ATTAC--A-----TATCC
gi|64046                      :  AAATC-ATGTTC---TAACCAGTAACTATCAGATATTAC-AATAAT-ACGTC--A-----TATCCAGTT
gi|64047                      :  AGGTC-GTGTTC---TAACCA-TAATTATCAGATATTAC-AATAAT-TATTC--A-----TATCCAAT
gi|64048                      :  AGATC-GTGTCC---TAACCAATAATTATCAGATATCAC-AA-AGCAACTTCTTA-----CATCCAGTT
gi|64049                      :   GATC-ATGTTC---ATTCCATTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64050                      :   GATC-ATGTTTATTCAACTAATCATTATCAGAAACTAC-AACAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64051                      :    ATC-GTGTTC---TAACCAATGATTATCAGATATTAC-AATAAT-A
gi|64053                      :      C-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TACCCAG
gi|64054                      :      C-ATGTTC---TTACCGATAATTGTCAGATATTAC-AATAAT-ACTTT--A-----TATCCAG
gi|64055                      :      C-ATGTTC---TAACCAAAAATGATTAGATATTAC-AATAAT-ATGTC--A-----TATCCAGTT
gi|64052                      :      C-ATGTTC---CAACCATAAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TGTACAGT
gi|64056                      :       -ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTA--A-----TATCCAG
gi|64057                      :       -ATGTTA---AAACCATTATCCATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64058                      :             C---TTACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----AATTCAGTT
gi|64059                      :                  AAGCATTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT





Alignments
lowQualScore                  :       0      111      3                 0      0     11 33333         
lowQualScore                  :       .      ...      .                 .      .     .. .....         
lowQualScore                  :       8      333      6                 7      7     00 44444         
consensus                     : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
Reference ( family-462 )      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64005                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64006                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64007                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATTGGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64008                      : AAGATC-ATGTTC---TAACTAATAATTCTCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64009                      : AAGATC-ATGTTA---TACCCAATAACTATCAGATGTTAC-AATAAT-ACTTT--A-----TATTCAGTT
gi|64010                      : AAGATC-ACGTTC---TAACCATTAATTATCAGATATCAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64011                      : AAGACC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AGTAAT-ACATC--A-----TATCCAGT
gi|64012                      : AAGATC-ATATTC---TAACTAATAATTATCAGATATTAC-AATAGT-ACTTC--A-----TATCTAGTT
gi|64013                      : AAGATC-AGGTTC---TAACCAACAGTTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAATT
gi|64014                      : AAGATT-ATGTTC---TAACCAATAGTTATCAGATATAAC-AATAAT-GCTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64015                      : AAGATC-AAGTTC---TAACCAATAATTATCAGATTTTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCATTT
gi|64016                      : AAGATC-ATGCTC---TAACCAATAATTATCATATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATTCAGT
gi|64017                      : AAGATC-ATGTTG---TAACCAATGATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATTGAGTT
gi|64018                      : AATATC-TTGTTC---TAACAAATAATTATCAGAGATTAC-AATAAA-ACTTC--A-----TATCCAG
gi|64019                      : AAGCTC-ATGTTC---TAACCAGTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--ATGATTTATCCAGTT
gi|64020                      : AAGATC-AAGTTC---AAACCATTAATTATCAGATATTACAAAAAAC-ACTTC--A-----TACCAAGT
gi|64021                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATAATAC-AATAAT-ACTTC--A-----TAT
gi|64022                      : AAGATT-ATGTTC---TAACCAATAATTAATAGATATAAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAATT
gi|64023                      : AAGATC-ATGTTC---TAAC-------TATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGT
gi|64024                      : AAGATC-ATGTAC---TAACCAATATTTATCCGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TGTCCATTT
gi|64025                      : AAGATC-ATGTTT---TAACCACTAATCATCAGATATTAC----AAT-ATTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64026                      : AATATC-ATGTTC---TAACCATTA-TTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TACCTAGT
gi|64027                      : AAGATC-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAGATGTT---AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64028                      : AAGACC-A-GTTA---TAACCAATAATTATCTGATATTGC-CATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64029                      : AAAATT-ATATTC---TAACCA----TTATCAGATATGAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGT
gi|64030                      : AAGATC-ATATTC---TAACCATTAATGATCAGATATTAT-AACATT-ATTTC--A-----TATCCAG
gi|64031                      : AAGTTC-ATGTTC---TAACCATTAATCATCAAATATCAT-AGTAAA-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64032                      : AAGATT-ATGTTC---TAATTTATAATTGTCATATATTCC-AATAAT-ACTTC--A-----TAACCAGTT
gi|64033                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCATCAATAATCAGATATAAC-AGTAAT-ATTCC--A-----TATCCAAT
gi|64034                      : AAGATC-ATGTTC---TGTCCAATAGTTATCAGATTTTAC-AATAAA-AGTTA--A-----TATCCAGT
gi|64035                      : AAGATC-ATGTTC---AAACCAATAATAATCCAATATAAC-AGTAAT-ACATC--A-----TATCCAGT
gi|64036                      : AAGATC-ATTTTC---TATCCAATAATTATCAGATATGAC-AATGAA-ACTTC--A-----TATCTA
gi|64037                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAGATATTAC-AACAAT-ATTAC--A-----TATCC
gi|64038                      : AAGATC-ATGTTC---TTACCAATAATTATCAGAAATTAC-AATAAT-A-TTC--A-----
gi|64039                      : AAGAAC-ATGTTC---TGACCATTAATTATCTGATATTAC-ATTAAT-AGTAC--A-----TATCCAGT
gi|64040                      : AAGATCCATGTTC---TAACCATTATTTATCAGATATTAA-AATAAT-ATTTC--ATAAT-TATCTAGT
gi|64041                      : AAGAAC-ATGTTC---TAACCATTTCTTACCAGGTATTAC-TATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64042                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATCATAAGATATTAC-AACAAT-ATTTC--A-----TATCC
gi|64043                      : AAGATC-ATGTTC---TTACCATTAATAATCCAATATTAC-AAAAAT-ATTAC--A-----TATCCAGT
gi|64044                      : AAGATC-TTGGTC---TAACTA-TAATTATCAGATATTCC-AATAAT-ACTTC--T-----TAT
gi|64045                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAAATTTTAC-AACAAT-ATTAC--A-----TATCC
gi|64046                      :  AAATC-ATGTTC---TAACCAGTAACTATCAGATATTAC-AATAAT-ACGTC--A-----TATCCAGTT
gi|64047                      :  AGGTC-GTGTTC---TAACCA-TAATTATCAGATATTAC-AATAAT-TATTC--A-----TATCCAAT
gi|64048                      :  AGATC-GTGTCC---TAACCAATAATTATCAGATATCAC-AA-AGCAACTTCTTA-----CATCCAGTT
gi|64049                      :   GATC-ATGTTC---ATTCCATTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64050                      :   GATC-ATGTTTATTCAACTAATCATTATCAGAAACTAC-AACAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64051                      :    ATC-GTGTTC---TAACCAATGATTATCAGATATTAC-AATAAT-A
gi|64052                      :      C-ATGTTC---CAACCATAAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TGTACAGT
gi|64053                      :      C-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TACCCAG
gi|64054                      :      C-ATGTTC---TTACCGATAATTGTCAGATATTAC-AATAAT-ACTTT--A-----TATCCAG
gi|64055                      :      C-ATGTTC---TAACCAAAAATGATTAGATATTAC-AATAAT-ATGTC--A-----TATCCAGTT
gi|64056                      :       -ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTA--A-----TATCCAG
gi|64057                      :       -ATGTTA---AAACCATTATCCATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64058                      :             C---TTACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----AATTCAGTT
gi|64059                      :                  AAGCATTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT





Alignments
lowQualScore                  :       0      111      3                 0      0     11 33333         
lowQualScore                  :       .      ...      .                 .      .     .. .....         
lowQualScore                  :       8      333      6                 7      7     00 44444         
consensus                     : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
Reference ( family-462 )      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64005                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64006                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64007                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATTGGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64008                      : AAGATC-ATGTTC---TAACTAATAATTCTCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64009                      : AAGATC-ATGTTA---TACCCAATAACTATCAGATGTTAC-AATAAT-ACTTT--A-----TATTCAGTT
gi|64010                      : AAGATC-ACGTTC---TAACCATTAATTATCAGATATCAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64011                      : AAGACC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AGTAAT-ACATC--A-----TATCCAGT
gi|64012                      : AAGATC-ATATTC---TAACTAATAATTATCAGATATTAC-AATAGT-ACTTC--A-----TATCTAGTT
gi|64013                      : AAGATC-AGGTTC---TAACCAACAGTTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAATT
gi|64014                      : AAGATT-ATGTTC---TAACCAATAGTTATCAGATATAAC-AATAAT-GCTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64015                      : AAGATC-AAGTTC---TAACCAATAATTATCAGATTTTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCATTT
gi|64016                      : AAGATC-ATGCTC---TAACCAATAATTATCATATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATTCAGT
gi|64017                      : AAGATC-ATGTTG---TAACCAATGATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATTGAGTT
gi|64018                      : AATATC-TTGTTC---TAACAAATAATTATCAGAGATTAC-AATAAA-ACTTC--A-----TATCCAG
gi|64019                      : AAGCTC-ATGTTC---TAACCAGTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--ATGATTTATCCAGTT
gi|64020                      : AAGATC-AAGTTC---AAACCATTAATTATCAGATATTACAAAAAAC-ACTTC--A-----TACCAAGT
gi|64021                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATAATAC-AATAAT-ACTTC--A-----TAT
gi|64022                      : AAGATT-ATGTTC---TAACCAATAATTAATAGATATAAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAATT
gi|64023                      : AAGATC-ATGTTC---TAAC-------TATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGT
gi|64024                      : AAGATC-ATGTAC---TAACCAATATTTATCCGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TGTCCATTT
gi|64025                      : AAGATC-ATGTTT---TAACCACTAATCATCAGATATTAC----AAT-ATTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64026                      : AATATC-ATGTTC---TAACCATTA-TTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TACCTAGT
gi|64027                      : AAGATC-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAGATGTT---AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64028                      : AAGACC-A-GTTA---TAACCAATAATTATCTGATATTGC-CATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64029                      : AAAATT-ATATTC---TAACCA----TTATCAGATATGAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGT
gi|64030                      : AAGATC-ATATTC---TAACCATTAATGATCAGATATTAT-AACATT-ATTTC--A-----TATCCAG
gi|64031                      : AAGTTC-ATGTTC---TAACCATTAATCATCAAATATCAT-AGTAAA-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64032                      : AAGATT-ATGTTC---TAATTTATAATTGTCATATATTCC-AATAAT-ACTTC--A-----TAACCAGTT
gi|64033                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCATCAATAATCAGATATAAC-AGTAAT-ATTCC--A-----TATCCAAT
gi|64034                      : AAGATC-ATGTTC---TGTCCAATAGTTATCAGATTTTAC-AATAAA-AGTTA--A-----TATCCAGT
gi|64035                      : AAGATC-ATGTTC---AAACCAATAATAATCCAATATAAC-AGTAAT-ACATC--A-----TATCCAGT
gi|64036                      : AAGATC-ATTTTC---TATCCAATAATTATCAGATATGAC-AATGAA-ACTTC--A-----TATCTA
gi|64037                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAGATATTAC-AACAAT-ATTAC--A-----TATCC
gi|64038                      : AAGATC-ATGTTC---TTACCAATAATTATCAGAAATTAC-AATAAT-A-TTC--A-----
gi|64039                      : AAGAAC-ATGTTC---TGACCATTAATTATCTGATATTAC-ATTAAT-AGTAC--A-----TATCCAGT
gi|64040                      : AAGATCCATGTTC---TAACCATTATTTATCAGATATTAA-AATAAT-ATTTC--ATAAT-TATCTAGT
gi|64041                      : AAGAAC-ATGTTC---TAACCATTTCTTACCAGGTATTAC-TATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64042                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATCATAAGATATTAC-AACAAT-ATTTC--A-----TATCC
gi|64043                      : AAGATC-ATGTTC---TTACCATTAATAATCCAATATTAC-AAAAAT-ATTAC--A-----TATCCAGT
gi|64044                      : AAGATC-TTGGTC---TAACTA-TAATTATCAGATATTCC-AATAAT-ACTTC--T-----TAT
gi|64045                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAAATTTTAC-AACAAT-ATTAC--A-----TATCC
gi|64046                      :  AAATC-ATGTTC---TAACCAGTAACTATCAGATATTAC-AATAAT-ACGTC--A-----TATCCAGTT
gi|64047                      :  AGGTC-GTGTTC---TAACCA-TAATTATCAGATATTAC-AATAAT-TATTC--A-----TATCCAAT
gi|64048                      :  AGATC-GTGTCC---TAACCAATAATTATCAGATATCAC-AA-AGCAACTTCTTA-----CATCCAGTT
gi|64049                      :   GATC-ATGTTC---ATTCCATTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64050                      :   GATC-ATGTTTATTCAACTAATCATTATCAGAAACTAC-AACAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64051                      :    ATC-GTGTTC---TAACCAATGATTATCAGATATTAC-AATAAT-A
gi|64052                      :      C-ATGTTC---CAACCATAAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TGTACAGT
gi|64053                      :      C-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TACCCAG
gi|64054                      :      C-ATGTTC---TTACCGATAATTGTCAGATATTAC-AATAAT-ACTTT--A-----TATCCAG
gi|64055                      :      C-ATGTTC---TAACCAAAAATGATTAGATATTAC-AATAAT-ATGTC--A-----TATCCAGTT
gi|64056                      :       -ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTA--A-----TATCCAG
gi|64057                      :       -ATGTTA---AAACCATTATCCATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64058                      :             C---TTACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----AATTCAGTT
gi|64059                      :                  AAGCATTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT


blockSeqs                     :              ATT      A                              TT TGATT
blockSeqs                     :              .        A                              .  TAAT 
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        G                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        C                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        G                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        A                              .  .    
blockSeqs                     :              .        T                              .  .    
blockSeqs                     :              .        .                              .  .    
blockSeqs                     :              .        .                              .  .    
blockSeqs                     :              .        .                              .  .    
blockSeqs                     :                       .                                      


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
finalCons                     : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT





Alignments
lowQualScore                  :       0      111      3                 0      0     11 33333         
lowQualScore                  :       .      ...      .                 .      .     .. .....         
lowQualScore                  :       8      333      6                 7      7     00 44444         
consensus                     : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
Reference ( family-462 )      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64005                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64006                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64007                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATTGGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64008                      : AAGATC-ATGTTC---TAACTAATAATTCTCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64009                      : AAGATC-ATGTTA---TACCCAATAACTATCAGATGTTAC-AATAAT-ACTTT--A-----TATTCAGTT
gi|64010                      : AAGATC-ACGTTC---TAACCATTAATTATCAGATATCAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64011                      : AAGACC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AGTAAT-ACATC--A-----TATCCAGT
gi|64012                      : AAGATC-ATATTC---TAACTAATAATTATCAGATATTAC-AATAGT-ACTTC--A-----TATCTAGTT
gi|64013                      : AAGATC-AGGTTC---TAACCAACAGTTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAATT
gi|64014                      : AAGATT-ATGTTC---TAACCAATAGTTATCAGATATAAC-AATAAT-GCTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64015                      : AAGATC-AAGTTC---TAACCAATAATTATCAGATTTTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCATTT
gi|64016                      : AAGATC-ATGCTC---TAACCAATAATTATCATATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATTCAGT
gi|64017                      : AAGATC-ATGTTG---TAACCAATGATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATTGAGTT
gi|64018                      : AATATC-TTGTTC---TAACAAATAATTATCAGAGATTAC-AATAAA-ACTTC--A-----TATCCAG
gi|64019                      : AAGCTC-ATGTTC---TAACCAGTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--ATGATTTATCCAGTT
gi|64020                      : AAGATC-AAGTTC---AAACCATTAATTATCAGATATTACAAAAAAC-ACTTC--A-----TACCAAGT
gi|64021                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATAATAC-AATAAT-ACTTC--A-----TAT
gi|64022                      : AAGATT-ATGTTC---TAACCAATAATTAATAGATATAAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAATT
gi|64023                      : AAGATC-ATGTTC---TAAC-------TATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGT
gi|64024                      : AAGATC-ATGTAC---TAACCAATATTTATCCGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TGTCCATTT
gi|64025                      : AAGATC-ATGTTT---TAACCACTAATCATCAGATATTAC----AAT-ATTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64026                      : AATATC-ATGTTC---TAACCATTA-TTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TACCTAGT
gi|64027                      : AAGATC-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAGATGTT---AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64028                      : AAGACC-A-GTTA---TAACCAATAATTATCTGATATTGC-CATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64029                      : AAAATT-ATATTC---TAACCA----TTATCAGATATGAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGT
gi|64030                      : AAGATC-ATATTC---TAACCATTAATGATCAGATATTAT-AACATT-ATTTC--A-----TATCCAG
gi|64031                      : AAGTTC-ATGTTC---TAACCATTAATCATCAAATATCAT-AGTAAA-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64032                      : AAGATT-ATGTTC---TAATTTATAATTGTCATATATTCC-AATAAT-ACTTC--A-----TAACCAGTT
gi|64033                      : AAGATC-ATGTTC---TAACCATCAATAATCAGATATAAC-AGTAAT-ATTCC--A-----TATCCAAT
gi|64034                      : AAGATC-ATGTTC---TGTCCAATAGTTATCAGATTTTAC-AATAAA-AGTTA--A-----TATCCAGT
gi|64035                      : AAGATC-ATGTTC---AAACCAATAATAATCCAATATAAC-AGTAAT-ACATC--A-----TATCCAGT
gi|64036                      : AAGATC-ATTTTC---TATCCAATAATTATCAGATATGAC-AATGAA-ACTTC--A-----TATCTA
gi|64037                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAGATATTAC-AACAAT-ATTAC--A-----TATCC
gi|64038                      : AAGATC-ATGTTC---TTACCAATAATTATCAGAAATTAC-AATAAT-A-TTC--A-----
gi|64039                      : AAGAAC-ATGTTC---TGACCATTAATTATCTGATATTAC-ATTAAT-AGTAC--A-----TATCCAGT
gi|64040                      : AAGATCCATGTTC---TAACCATTATTTATCAGATATTAA-AATAAT-ATTTC--ATAAT-TATCTAGT
gi|64041                      : AAGAAC-ATGTTC---TAACCATTTCTTACCAGGTATTAC-TATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64042                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATCATAAGATATTAC-AACAAT-ATTTC--A-----TATCC
gi|64043                      : AAGATC-ATGTTC---TTACCATTAATAATCCAATATTAC-AAAAAT-ATTAC--A-----TATCCAGT
gi|64044                      : AAGATC-TTGGTC---TAACTA-TAATTATCAGATATTCC-AATAAT-ACTTC--T-----TAT
gi|64045                      : AAGATA-ATGTTC---TAACAATTAATTATCAAATTTTAC-AACAAT-ATTAC--A-----TATCC
gi|64046                      :  AAATC-ATGTTC---TAACCAGTAACTATCAGATATTAC-AATAAT-ACGTC--A-----TATCCAGTT
gi|64047                      :  AGGTC-GTGTTC---TAACCA-TAATTATCAGATATTAC-AATAAT-TATTC--A-----TATCCAAT
gi|64048                      :  AGATC-GTGTCC---TAACCAATAATTATCAGATATCAC-AA-AGCAACTTCTTA-----CATCCAGTT
gi|64049                      :   GATC-ATGTTC---ATTCCATTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64050                      :   GATC-ATGTTTATTCAACTAATCATTATCAGAAACTAC-AACAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT
gi|64051                      :    ATC-GTGTTC---TAACCAATGATTATCAGATATTAC-AATAAT-A
gi|64052                      :      C-ATGTTC---CAACCATAAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TGTACAGT
gi|64053                      :      C-ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TACCCAG
gi|64054                      :      C-ATGTTC---TTACCGATAATTGTCAGATATTAC-AATAAT-ACTTT--A-----TATCCAG
gi|64055                      :      C-ATGTTC---TAACCAAAAATGATTAGATATTAC-AATAAT-ATGTC--A-----TATCCAGTT
gi|64056                      :       -ATGTTC---TAACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTA--A-----TATCCAG
gi|64057                      :       -ATGTTA---AAACCATTATCCATCAGATATTAC-AATAAT-ATTTC--A-----TATCCAGT
gi|64058                      :             C---TTACCAATAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----AATTCAGTT
gi|64059                      :                  AAGCATTAATTATCAGATATTAC-AATAAT-ACTTC--A-----TATCCAGTT