lowQualScore : 222222 3333333333333333333 11111111 111111 4444444444444444444444444444444444444444444444 111111111 2222 11
lowQualScore : 0 6 33 0 0 5555 11 0 44444 0 555555 2 33333 1 1111 3333333333333333333 11 0 0 00000000 1 0 0 1 111 2 666 111 0 1 888 2 0 3333 2 000000 33 4444444444444444444444444444444444444444444444 0 222 33333333 000000000 0 0 3333 5555555 111 7777 1 11 222 77 888 11 0 3333 0 222222 22222 66 11 0 0 11 3333333 33 111 1 55 22 11 2222 222 1 333333 4 8 11 33 1
lowQualScore : . . .. . . .... .. . ..... . ...... . ..... . .... ................... .. . . ........ . . . . ... . ... ... . . ... . . .... . ...... .. .............................................. . ... ........ ......... . . .... ....... ... .... . .. ... .. ... .. . .... . ...... ..... .. .. . . .. ....... .. ... . .. .. .. .... ... . ...... . . .. .. .
lowQualScore : 9 1 44 8 8 9999 99 8 00000 8 888888 4 44444 6 7777 4444444444444444444 11 8 4 77777777 6 8 8 0 444 4 777 444 8 6 999 4 8 9999 4 333333 55 4444444444444444444444444444444444444444444444 9 333 00000000 000000000 9 9 0000 8888888 555 2222 7 22 111 22 000 22 9 9999 9 777777 33333 44 55 9 9 33 2222222 88 888 0 55 88 44 3333 333 3 888888 3 7 88 77 3
consensus : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C----ACAT-CA---T-A-T----A-AC--A-A---T-----A-A--A-CAT--A-----TA-CATGAAC-GTTTA---A-ANT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT---T---------TT---A-A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-------A-T-A----C-------A---A----T-ACAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTG---ACAT-G------ATA-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAA----CTGC---AATAAA-C------CAAGTTTTNAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
Reference ( gi|142676 ) : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C----TTAT-CA---C-A-T----A-AT--A-A---T----CA-A--A-CAT--A-----TA-CATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT---T---------TT---A-A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-------A-T-A----C-------A---A----T-ACAA--AG--TA--CA---ATTA--T-TTG---ACAT-G------ATA-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAA----CTGC---AATAAA-C------CAAGTTTTTAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142677 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC--T-TTG-----TA-C----TAAT-CA---C-A-T----A-AT--A-A---T----CA-A--A-CAT--A-----TA-CATGGAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT---T---------TT---A-A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-------A-T-AC---C-------A---A----T-ACGA--AG--TA--CA---ATTA--T-TTG---ACAT-A------ATA-----AAG--AT--A-TG-CA--AAATATTGTTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAA----CTGC---AATAAA-C------CAAGTTTTTAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142675 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--TTCTCATC--T-ATG-----TA-C----ATAT-TA---C-A-T----A-AT--A-A---T----AA-A--A-CAT--A-----TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT---T---------TT---A-A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-------A-T-AC---C-------A---A----T-ACAA--AG--TA--CA---ATTA--T-TTG---ACAT-G------ATA-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAA----CTGC---AATAAA-C------CAAAAATTTAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142678 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C----TGAT-CA---C-A-T----A-AT--A-A---T----AA-A--A-CAT--A-----TA-TATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-ATCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT---T---------TC---A-A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-------A-T-AC---C-------A---A----T-ACAA--AG--AA--CA---ATTA--T-TTG---ACAT-G------TTA-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTTA-------TT--TTT---A-T--AC--TAA--AAA----CTGC---AATAAA-C------CAAGTTTTCAATTAAAAAG--TTG--AAG-CAGAAAaagacca
gi|142679 : AGTA-C-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCAAC--T-ATG-----TA-C----ACTT-CA---T-A-T----A-CT--A-A---T----AA-A--A-CAT--A-----TA-CATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGAAC---A-AA-GCCATTC---TT-A-A----A-GAATTAGAAGA------GA--T--------------AG---T---------TT---T-A-----A---CAT-A-A--AT--------ATGC-------A-T-AC---C-------A---A----T-ACAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTG---ACAT-G------AAA-----AAG--CT--A-TG-TA--AAGTTTTGCTTA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAA----CTGT---AGTTAA-C------CAAGTTTTGCATTTAAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142680 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC--T-ATG-----TG-C----ATAT-CA---C-A-T----A-AT--A-A---TACACCATA--A-TTT--A-----TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATAATAAGA------GA--C--------------AT---T---------TC---A-A-----A---CATAA-A--AT--------ATAC-------A-T-AC---C-------A---A----T-ACAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTG---AAAT-G------ATA-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAaagagca
gi|142681 : AGTA-T-T--ATC-TTT-TTTTTCTCGTCTCATC--T-ATG-----TA-C----ACAT-CA---C-A-T----A-AT--A-T---T----AA-A--A-CAT--A-----TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TCTAC---A-TA-GACATTC---TA-A-A----A-GAATTATATGA------TA--A--------------AT---T---------TT---A-A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-------A-C-AC---C-------A---A----T-ACAA--AG--CA--CA---ATTA--G-TTG---ACAG-G------ATA-----AAG--CT--A-CG-TG--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAA----CTGC---AATAtgtatatatgatgcaagtatcaaaattgaaa
gi|142682 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C----TTAT-CA---C-A-T----A-AT--A-A---T----AA-A--A-CAT--A-----TA-CATGAAC-ATTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-ACCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--T--------------AT---T---------TT---A-A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-------A-T-AC---C-------A---A----T-ACAA--AG--TA--CA---ATTA--T-TTG---ACAT-G------ATA-----GAG--AT--A-TGATA--AAA
gi|142684 : AGTAAT-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC--T-ATA-----TA-C----ACGT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAG--C-----TA-TATGAAC-------------T-TGTAC---A-AA-GCGATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT---TCA-------TT---------------CATTC-T--TT--------ATAC-------A-T-AT---C-------A---A----T-GTAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTT---ACAC-G------ATA-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTTA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAG----CTGC---AATCAA-C------CAAGTTTTGAATT----AG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142683 : AGTA-T-T--GTC-TTTTATTT----GTCTTGTC--T-ATG-----TA-CATAATTAT-CG---T-A-T----A-AT--A-A-----------A--A-CAT--A-----TA-CATGAAC-------------T-TGTTC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAAT------------------------------------------------------------------TGA-A--AT--------ATGC-------A-T-A----CA------A---A----T-GCAA--AG--TA--CA---AATA--T-TAG---ACAT-G------ATA-----GAT--AT--A-TG-GA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---G-T--AC--TAA--AAA----TTGC---AATAAA-T------CCCGTTTTTAG-TACAAAT--CTG--AAG-AAGAAAagaaca
gi|142685 : AATA-C-T--ATC-TTT-ATTTTC--ATCTCATT--A-AGG-----TA-------TAT-AA---C-A-C----A-A---A-A---T----AA-A--A-TATT-A-----TT-CATGTGA-TTTTA---A-AAT-GGTACGGCA-TA-GCCACTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------TT--C--------------AT---T---------TT---A-A-----A---CATAA-A--AT--------ATGT-------A-T-AG---CGATATAAA---G----T-ACAA--AG--TA--CA---ATTA--T-TTG---ACAG-G------ATT-----AAG--TT--A-TG--G--AAATATTGCTTA-------TC--TTT---A-T--AT--TAA--AAG----CTGT---AATAAA-TAAAAAAAAAA----TAAATAAAAAA--TTG--AAG-AGAAAAaagagca
gi|142686 : AGTG-T-T--ACC-TTT-ATTTTC--GTCTCATA--T-TTG-----TA-C----ACAT-CATTTC-A-T----A-AC--A-----C----CG-A--A-------------A-CAAGAAC-GTTTA---A-ACT-TGCAC---A-CA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAAATATAAGA------GA--C--------------AA---T---------T------A-----A---CATGA-A--AC--------ATGT-------A---AGC--C-------G---A----T-ACAA--AG--CA--CA---ATTA--A-TCG---GCAT-G------ATA-----AAG--CT--A-T--TG--AAATACTCCTAA-------TC--CTTCTGA-T--AA---AA--AAA----CTGC---AATAAA-T------AAACATCAGAACTGAAAAT--CGG--AAGAAAGAAAaatag
gi|142687 : AGTA-T-C---TA-TTT-AGTTTC--GTATCATC--T-ATC-----TA-T----ATAT-CA---T-A-T----A-AT--A-A-----------A--A-CAG--A-----TA-CGTGGAC-GTTTC---A-ACG-CACAC---A-TA-GCAATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AC---T---------TT---A-A-----A---CATAA-A--AT--------ATGA-------A-T-A----CCG-----A---A------ACAA--AG--CA--CA---ATTA--A-TTA---ACAT-AGTATATGTA-----AAG--CT--A-TC-GA--AAATACGGCTTG-------TCT-TTT---A-T--AT--TAA--aaagc
gi|142688 : AGTA-G-T--CTT-TTT-ACTTTC--GTTTTATC--A-ATT-----TA-C----TGAT--A---C-A-T----A--T--G-A---T-----A-T--A-CTG--A-----TA-CATGATT-GTTTA---A-ACG-TGCGC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----G-GAGTTATTAGA------GA--T--------------AC---T---------TT---A-C-----A----ATAA-AT-AT--------ATAA-------A-C------C-------G---A----T-ACAA--CG--CA--CA---CTTA--A-ATG---ACAT-G------ATA-----AAA--CT--A--A-TA--AAATA--ACTAAATAGTATTC--GTT---A-T------TGA--AAA----CTGT---AATAAA-T------GATCTTTTTAAAAAAAAAACTCTG--AAA-AA
gi|142689 : AGTA-G-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCCCATCGGT-GTG-----TA-------TAC-CG---T-A-T----A-CT--A-----------A-A--A-CAG--A-----TA-AATGAAC-G-----------------C---A-TA-GCCATTC---AA-A-T----A-TAGTTATAAAA------GA--C--------------AC---T---------T------A-----A---CATAT-ATGAT--------ATGA-------ATT-AAACCC-------G---A----T-AC-A--AG--CA--CA---CTTT--A-TTG---ACGT-G------ATA-----AAG--CT--G-TA-CG--GAACATC-CTAA-------Ttagca
gi|142690 : AATA-T-T--A-A-TTT-ATTGGT--GTCTCATCA-T-ATG-----TA-C------AA-AA---C-A-T----A-G-----------------A--A-CAT--AG----TA-CATTTAC-AT--A---A-AAT-AACAC---A-T--GCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C---------------T---C---------AT---A-A-----AACTCATCA-A--AT--------ATTTCTTTTTAA-TCA----C-------C---A----T-ATAATTAT--TA--TA---ATTA--T-TTA---A
gi|142691 : AATG-T-T--ATA-TTT-ATTT----ATTT-ATT--C-ATG-----T--C----TCAT-CA---T-A-TTTAGA-AC--A-A---TA---TAGA--A-CAT--AA----TA-TATATAC-AT--A---A-AAT-A--AC---A-TATGCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C--------------A
gi|142693 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC--T-ACA-----CATC----TTAT-AA---C-A-A----A-AC--A----------TA-A--A-T-T--A-----TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------AA--C--------------AT---T---------TT---A-A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-------A-T-AT---C-------A---A----T-ACAA--AG--CA--CA---TTT---T-TTG---ACAT-G------ATA-----AAA--CTCCA-TG-TA--AAATACTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAT----CTGC---AATAAA-C------TAAGTTTTTAATTAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAA
gi|142694 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC--T-AC-------A-C------AT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAT--AAATTATA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TTAAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GG--C--------------AT---T---------TT---A-A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-------A-T-AT---C-------A---A----T-ACAA--AG--CA--CA---TTTT--T-TTG---ACAT-G------ATA-----AAA--CTCCA-TG-TA--AAATACTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAT----CTGC---AATAAA-C------TAAGTTTTTAATTAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaatagca
gi|142695 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC--T-AC-------A-C------AT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAT--AAATTATA-CATGAAC-GTTTA---A-ACA-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATGATAAGA------GA--T--------------AT---T---------TT---A-A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-------A-T-AT---C-------A---A----T-ACAA--AG--CA--CA---TTT---T-TTG---ACAT-G------ATA-----AAG--CTCCA-TG-TA--AAGTATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAT----CTGC---AATAAA-C------TAAGTTTTTAAATAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142696 : GTA-T-T--ATT-TTT-CTTTTT--GTCTCATC--T-AC-------A-C------GT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAT--AAATTATA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTGC---A-TA-GTCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--T--------------AT---T---------TT---A-A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-------A-T-A----TT------A---A----T-ACAA--AG------CA---TTTT--T-TTG---ACAT-G------ATA-----AAG--CTCCA-TG-CA--AAATACTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAT----CTGC---AATAAA-C------TAAGTTTTTAATTTAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142692 : GTA-T-T--ATT-TTT-ATTTTC--ATCTCATC--T-ATA------A-C----ATATACAT--C-A-T----A--T--A-A---C----AA-A--A-CAT--A-----TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCTTTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------TA--C--------------AT---T---------TTA--A-A-----A---CATAA-A--TT--------ATGC-------A-T-AT---C-------A---A----T-ACAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTG---ACAA-G------ATA-----AAG--CT-------------------CT------------------------AC--TAA--AAT----CTGC---AATAAA-C------CAAGTTTTGAATTAAAAAC--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142697 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC--T--T------CA-C------AT-CA---T-A-T----A-AC--A-AAA-TA---TA-A--A-T-T--A-----TA-CATGAAC-GTT------------GTAC---A-GA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------A---------------A---A-A-----A---CA-AA-A--AT--------aagagca
gi|142698 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC--T-ATA-----TA-C----ACGT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAT--C-----TA-TATGAAC-GTTTT---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATTGATTGATTC--------------AT---TCA-------TT---------------CATTC-T--GT--------ATGC-------A-T-AT---C-------A---A----T-GTAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTT---ACAC-G------ATA-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAG----CTGC---AATCAA-C------CAAGTTTTGAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142702 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC--T-ATA-----TA-A----ACGT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAT--C-----TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT---TGAT------TC---A-T-----T---CATTC-T--TT--------TTGC-------A-T-AT---C-------A---A----T-GTAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTT---ACAC-G------ATA-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAG----CTGC---AATCAA-C------CAAGTTTTGAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAagagca
gi|142699 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAAGC--T-ATA-----TA-C----ACGT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAG--C-----TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATTGATTGATTC--------------AT---TCA-------TT---------------CATTC-T--TT--------ATGC-------A-T-AT---C-------A---A----T-GTAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTT---ACAC-G------ATA-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------CC--TTT---A-T--AC--TAA--AAG----CTGC---AATCAA-C------CAAGTTTTGAATT-AAAAT--CTG--AAG-AAGAAAa
gi|142700 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAAGT--T-ATA-----TA-C----ACGT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAG--C-----TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT---TGAT------TC---A-T-----T---CATTC-T--TT--------ATGC-------A-C-AT---C-------A---A----T-GTAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTT---ACAC-G------ATA-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAG----CTAC---AATCAA-C------CAAGTTTTGAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagc
gi|142701 : TA-T-T--ATC-TTT-AGTTTT--GTCTAATC--T-ATA-----TA-C----ACGT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAT--C-----TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-GA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT---TGA-------TT---G-ATTG--ATT-CATTC-A--TTCTTTCTTTATGC-------A-T-AT---C-------A---A----T-GTAA--AG--CA--CA---ATTG--T-TTT---ACAT-A------ATA-----AAGCTCT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TA--TTT---A-T--AC--TAA--AAT----CTGC---AATTAA-T------CGAGTTTTGAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagc
gi|142704 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC--T-ATA-----TA-C----ACGT-CA---T-A-T----A-----------T----CA-A--AACAT--C-----TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GTCATTC---TA-A-A----A-ATTTTTTATGATT----GATTC--------------AT---TGA-------TT---G-ATTC--ATT-CATTC-G--TT--------ATGT-------A-T-AT---C-------A---A----T-GTAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTC---ACAT-G------ATA-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAT----CTGC---AATTAA-C------CAAGTTTTTAACT-AAAAG--TTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142703 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC--T-ATA-----TA-C----ACGT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAG--C-----TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGaagagca
gi|142705 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATT--T-ATA-----TA-C----ACGT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAT--C-----TA-CATCAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTT---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------tttgattgattgattgattgattcattcatttattctttatgcatatcaatgtaaagcacacttattttacacgatcaagttctttgtaaaatattgctaatctttatactaaaagctgcaatcaaccaagtttttaattaaaagctgaagaagaaaaagag
gi|142706 : TA-T-TTCATC-TTT-ATTTTT--GTCTTATC--T-ATA-----TA-C----ATGT-CA---T-A-T----A-AC--A-A-----------A--A-CAG--C-----TA-TATGAAT-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------
gi|142709 : TA-T-TTAATC-TTT-ATTTCA--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C------AT-CG---CAA-T----A-AC--A-A---T-------A--A-CATTAA-----TATCAT--ACAG--TA---T-AAT---TAC---A-TA-GCCATTCAAATA-T-A----T-GAATTACAAGA------GA--C--------------------------------------------------------T--------AT-C-------A-C-A----T-------A---A----T-GCAA--AA--TA--TA---ATTA--T-TTATTCACAT-A------ATA-----AGA--CA--A-TG-TG--AAATGCTGCAAA-------TCGATTT---A-TTAAA--AAA--AAA----ATGTTAAGATAAA-C------AACATT-----TTAAAATT--CTGACAAG-AAAAAA
gi|142711 : TA-T-TTAATC-TTT-ATTTCA--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C------AT-CG---C-AAT----A-AC--A-A---T-------A--A-CATTAA-----TATCAT--AC-----A---A-TATATGTAC---A-TA-GCTATTC----------------------AA---------------------------AT---T---------T-----------------ATGA-A--TT--------AT-C-------A-C-A----C-------A---A----T-GCAA--AA--TA--CA---ATTAACTATTC---ACAT-A------ATA-----AGA--CT--A-TG-TG--TAATACTGCAAA-------TCGATTT---A-T------TAA--AAAAGTGTTAA---GATAAA-T------AAAATT-----TTAAAATA--CTGACAAG-AAAAAAaag
gi|142710 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C-----AAA-CA---T-A-T----A-----A-A---T----AA-A--A-C----A-----TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------ATCGCT---------AT---A-ATATTGA---CATAA-A--AT--------AT---------A-T-A----C-------A---ACTATC-ACAG--AT--TATTCATGCATTA--T-TTT------T-G------AAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--ATT---A-TACAC--TAA--GAA----TTGaag
gi|142712 : TA-T-T---TC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C----AAA--CA---T-A-T----A-A-----A---T----AA-A--A-CAT--A-----CA-C-T-AAT-CTATA---C-AAC--GTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-ATT--A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------AC---C---------CT---------------TATAA-A--AT--------TT---------A-T------T-------A---A----T-ATAA--AA--TA--TA---AACA--T-CTG---TCA
gi|142707 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C-----AAA-CA---T-A-T----A-----A-A---T----AA-A--A-C----A-----TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CTATCGCTATA----AT---A---------TT---A-ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---------A-T-A----C-------A---ACTATC-ACAG--AT--TATTCATGCATTA--T-TTT------T-G------AAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--ATT---A-TACAC--TAA--GAA----TT
gi|142716 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTGA--GTCTCATC--A-ATA-----TA-C----ATACACA---T-A-T----A-AA--ATA---T----C--A--A-TAT--A-----TA-CA-GCAC-ATT-------AAG-TGTAT---A-TT-GCCACTC---TA-T-ATT--G-GAGTTATTAGA------GA--CTATCACAGTTGTATAT---T---------AC---A-A-----G---CATAA-A--GA--------ACACT------G-T-A----C-----------A----T-GCAA--AA--TA--TA---A--------TA---ACATAG------GTA-----ACA--CT----TC-AG--AAACATTGCTAA-------TC--AAT---A----AA--TAA--GAA----CTGC---CATAAA-A------TAA-----TGA-TAAGACA--CTG---AG-AAGAAA
gi|142715 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C-----AAA-CA---T-A-T----A-----A-A---T----AA-A--A-C----A-----TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------ATCGCT---------AT---A-ATATTGA---CATAA-A--AT--------AT---------A-T-A----C-------A---ACTATC-ACAG--AT--TATTCATGCATTA--T-TTT------T-G------AAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--AGT---A-T--ACATTAA--GAA----TTGaa
gi|142714 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C-----AAA-CA---T-A-T----A-----A-A---T----AA-A--A-C----A-----TA-CAGTAAC-ACATA---C-AG--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------AT---CGCTATAAAATT---A-ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---------A-T-A----C-------A---ACTATC-ACAG--AT--TATTCATGCATTA--T-TTT------T-G------AAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--ATT---A-TACAC--TAA--GAA----TTG
gi|142713 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C-----AAA-CA---T-A-T----A-----A-A---T----AA-A--A-C----A-----TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-A----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------AT---TGCTATAAAATT---A-ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---------A-T-A----C-------ATCTA----TCACAG--AT--TATTCATGCATTA--T-TTT---AGA---------AT------AAG--AT--A-TA-TACTATATAGCGCTA--------------T---A-C--ACTGTAA--GAA----TTG
gi|142719 : TA-T-T--CT--TTT-ATAATA--GTCTCATC--C-ATA-----TA-C----ATA--CA---C-A-T----A-AA--A-A--------CA-ATAA-AAT--A-----TA-CATACAT-GTATACATA-AAT--GTAC---A-TG-GCCATTC----A-A-ATATTA-GAATAACAAGA------GA--CT-------------AT---T---------TTCACA-A-----A---TAGAACA--AT--------A----------A-T-A----T----------------T-ACA-------TA--CG---TTTA--T-ATC---ACA--A------AGG-----AAG--AT--ACTA-CA--AAATATTAC
gi|142708 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC--T-TTG-----TA-C-----AAA-CA---T-A-T----A-----A-A---T----AA-A--A-C----A-----TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCTATTCAA-TA-T-T----A-AAATTACAAGA------GA--C--------------
gi|142717 : TA-T-T---TC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC----ATGGTTAATA-C----ACAG-TA---T-A-T----ACATTAA-A---T----TA-A--A-CAT--------TA-TAT-------TTA---ACAGT-TAGCC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------AT---A---------TT---A-C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---------A-T------C-------A---A----T-ACA
gi|142718 : TA-T-T---TC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC----ATGGTTAATA-C----ACAG-TA---T-A-T----ACATTAA-A---T----TA-A--A-CAT--------TA-TAT-------TTA---ACAGT-TAACC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------AT---A---------TT---A-C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---------A-T------C-------A---A----T-ACA
gi|142720 : -T-T--ATT-TTT-ATTTTC--CTCTCATC--T-ATG-----TA-C----ATAA-CA---T-A-T----A-AT--A-A-----------A--A-CAT--T-----TA-CATGAAT-GTTTA---A-ACT-TGACC---A-TA-GCCATTT---TG-A-A----A-GAATTATAATA------GA--C--------------AT---T---------TT---A-A-----A---TATAA-A--AT--------ATGC-------A-T-A----C-------C---G----CCACGA--AG--CA--CA---GTTA--T-TTG---ACAT-A------ATG-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAA----CCGC---AATAAG-C------CAA-TTTTTAATTAAAAAG--CTG--AAT-AAGAAA
gi|142721 : -T--ATT-TTT-ATTATA--GTCTCATC--C-ATA-----TA-C-----TAA-CA---C-A-T----A-CTA-A-A---C----CAGA--A-AAT--A-----TA-CATATAC-A--CA---A-AA--TGTAC---A-TG-GCCATTCAA-TA-ATT----A-GAATTGCAAGA------GA--CT-------------AT---T----------------A-----A---CACAA--------------ATGG-------A---------------------------ACAA--AA--TAT-CA---CATG--T-TT----ATAT-C------ACA-----AAG---------G-C---AAATA-CACTAA------------TT---A-T--AT--TAA--aagagca
gi|142722 : --ATA-TTT-ATTTAA--GTCTCATC----ATG------G-T----TAATGCA---C-A-T----A-AT--A-AACAT----TA-A--A-TAA--A------A-CATTA-C-ATTTA---ACAAT-TAGCC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------ATA--T---------TT---A-C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---------A-T------C-------A---A----T-ACA
gi|142723 : --ATCATTT-ATTCAT--GTCTCATC--TTATG-----TA------------G---A-A-C----A-AT--A-----T----AG-A--A-CAT--AA----TA-TATATAC-AT--A---A-AAT-A--AC---G-TATGCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C--------------AA---T---------AT---ACA-----ACT-CATAA-A--AT--------AT
gi|142724 : C-TTT-ATTTTTT-GTCTCATC--T-ATG-----TA-C----ATAT-C----C-AGT----ATAT--A-A---T----------A-CAT--A-----TA-CAGGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---ATTG-GTCATTA---TA-A-
gi|142725 : C--GTCTCATC--T-ATG-----TA-C----ATTT-CG---T-A-T----A-AT--A-A-----------A--A-CAG--T-----GA-CATGAAC-TTTTC---A-ACT-TGTAT---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT---T---------TC---A-A-----A---CATAG-A--AT--------ATGC-------A-T-AT---C-------A---A----T-ACCA--AGCATA--AA---ATTA--T-TTG---ACAT-G------ATATCATAAAG--CT--G-AG-GA--GAATGTGGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAA----CTGC---AATAAA-C------CAAGTTTTGAATTAAAAAG--CTA--AAG-AAGAAA
gi|142726 : TTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------A---------------------A-----A---CATA----------------TAC----------------C-------G---A----T-ACAA--AG--CA--CA---ATGT--T-TTA---ACAG-G------AAA-----AAG--CT--A-TG-GA--AACTATTGCTGA-------TA--ATT---A-T--AT--TAATCAAA----CTaggag
gi|142727 : T--------ATGC-------G-T-AT---C-------A---A----T-GTAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TCT---ACAT-G------ATA-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AT--TAA--AAT----CTGC---AATTAA-C------CAAGTTTTGAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142703 : T--------ATGC-------A-T-AT---C-------A---A----T-GTAA--AG--CA--CA---CTTA--T-TTT---ACAC-G------ATC-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTT---A-T--AC--TAA--AAG----CTGC---AATCAA-C------CAAGTTTTTAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagag
gi|142728 : tattatctttatttttgtctaatctatatacacgtcatataacaaaacagctatatgaacgtttaaacttgtacaaagccattctaaaagaattataagtttgattgattgattgattgattcattcatttattcttT--------ATGT-------T-T-AT---C-------A---A----T-GTAA--AG--CA--CA---ATTA--T-TTT---ACAC-G------TTA-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TT--TTT---A-T--AC--TGA--AAG----CTGC---AGTCAA-C------C---------------AAG--CTG--AAG-AAGAAAaagag
gi|142729 : ----T-ACTA--TG--CA--CA---ATTA--T-TTG---ACAT-G------ATA-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--TTA---A-T--AC--TGA--AAA----CTGC---AATA-----------AAGTTCTGAATTAAAAAT--CTG--AAG-AAGAAAagagca
gi|142730 : TG---ACGT-G------ATA-----AAG--CT--A-TG--A--AAATATTTCTAA-------TC--T-----ACT--AT--CAA--AAA----CTCT---AATAAAAC------CAAGCTTTGAACTAAAACA--CTG--AAG-AAGAaaaagca
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 2222 11
lowQualScore : 0 6 33 0 0 5555 0 0 77777 11 11 777777 11 111 4444 22 2222222222222 1 777777 0 1 0 111 2 555 111 0 0 888 2 0 3333 2 000000 33 333333333333333333333333333333333333333333333333 0 22 33333333 555 0 0000 8888888 111 3 1 0 11 555 11 11 0 33 2222 0 222222 9999999 22222 66 11 0 0 11 3333333 33 1 55 11 11 11 33333 222 222 1 333333 1 33 9 11 33 1
lowQualScore : . . .. . . .... . . ..... .. .. ...... .. ... .... .. ............. . ...... . . . ... . ... ... . . ... . . .... . ...... .. ................................................ . .. ........ ... . .... ....... ... . . . .. ... .. .. . .. .... . ...... ....... ..... .. .. . . .. ....... .. . .. .. .. .. ..... ... ... . ...... . .. . .. .. .
lowQualScore : 9 0 44 8 8 5555 8 8 33333 11 22 444444 11 444 1111 22 0000000000000 6 999999 8 6 8 444 4 999 444 8 8 888 3 8 8888 4 111111 44 777777777777777777777777777777777777777777777777 9 11 00000000 222 9 9999 6666666 666 5 7 9 33 333 33 33 9 88 1111 9 666666 1111111 33333 44 55 9 9 33 2222222 88 0 55 44 44 44 22222 111 111 2 666666 2 11 6 88 55 3
consensus : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA----T-A------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ANT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-NAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
Reference ( family-460 ) : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA----T-A------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ANT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-NAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142675 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--TTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TA----T-T--AC---AT----AATAA----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----CC------A---A-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAAA-ATT-TAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142676 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--T-TA----T-C--AC---AT----AATAA----TCA------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagacca
gi|142677 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-TTG-----TAC--T-AA----T-C--AC---AT----AATAA----TCA------A-A-CAT--A-TA-CATGGAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----CC------A---A-T-ACGA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-A------AT-------A-----AAG--AT--A-TG-CA--AAATATTGTTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142678 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--T-GA----T-C--AC---AT----AATAA----T-A------A-AACAT--A-TA-TATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-ATCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TC---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----CC------A---A-T-ACAA-AGAA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------TT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTTA-------TT--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-CAATTAAAAAG--TTG--AAG-CAGAAAaagagca
gi|142679 : AGTA-C-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCAAC-T-ATG-----TAC--A-CT----T-C--AT---AT----ACTAA----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGAAC---A-AA-GCCATTC---TT-A-A----A-GAATTAGAAGA------GA--T--------------AG----T---------TT---T--A-----A---CAT-A-A--AT--------ATGC-A-TAC---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AA-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAGTTTTGCTTA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGT---A---GTTAA-C------CAAGT-TTT-GCATTTAAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142680 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TGC--A-TA----T-C--AC---AT----AATAA----T-ACACCATA-A-TTT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATAATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TC---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATAC-A-TAC---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---AAAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AA------TGT---ATATATGAT-G------CAAGTATCA-AAATTGAAAaagagca
gi|142681 : AGTA-T-T--ATC-TTT-TTTTTCTCGTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AC---AT----AATAT----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TCTAC---A-TA-GACATTC---TA-A-A----A-GAATTATATGA------TA--A--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-CA----CC------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--G-T--TG---ACAG-G------AT-------A-----AAG--CT--A-CG-TG--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATA
gi|142682 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--T-TA----T-C--AC---AT----AATAA----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-ATTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-ACCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--T--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TAC---C-------A---A-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----GAG--AT--A-TGATA--AAA
gi|142683 : AGTA-T-T--GTC-TTTTATTT----GTCTTGTC-T-ATG-----TAC--A-TAATTAT-C--GT---AT----AATAA-------------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-------------T-TGTTC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAAT--------------------------------------------------------------------TGA-A--AT--------ATGC-A-TA----CA------A---A-T-GCAA-AGTA--CA---A--ATA--T-T--AG---ACAT-G------AT-------A-----GAT--AT--A-TG-GA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTGT--AC--T--AA--AAA----TTGC---A---ATAAA-T------CCCGT-TTT-TAG-TACAAAT--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142684 : AGTAAT-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-------------T-TGTAC---A-AA-GCGATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TCA-------TT----------------CATTC-T--TT--------ATAC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTTA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT----AG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142685 : AATA-C-T--ATC-TTT-ATTTTC--ATCTCATT-A-AGG-----TAT--A-TA----A-C--AC---AA----AATAA-------------A-A-TATT-A-TT-CATGTGA-TTTTA---A-AAT-GGTACGGCA-TA-GCCACTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------TT--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGT-A-TAG---CGATATAAA---G-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAG-G------AT-------T-----AAG--TT--A-TG--G--AAATATTGCTTA-------TC--T-TTAT--AT--T--AA--AAG----CTGT---A---ATAAA-TAAAAAAAAAAT------AAATAAAAAA--TTG--AAG-AGAAAAagaaca
gi|142686 : AGTG-T-T--ACC-TTT-ATTTTC--GTCTCATA-T-TTG-----TAC--A-CA----T-C--ATTTCAT----AACAC----C-G------A-A---------A-CAAGAAC-GTTTA---A-ACT-TGCAC---A-CA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAAATATAAGA------GA--C--------------AA----T---------T-------A-----A---CATGA-A--AC--------ATGT-A--AGC--C-------G---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--A-T--CG---GCAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-T--TG--AAATACTCCTAA-------TC--C-TTCT--GA--TAAAA--AAA----CTGC---A---ATAAA-T------AAACA-TCA-GAACTGAAAAT--CGG--AAGAAAGAAAaatag
gi|142687 : AGTA-T-C---TA-TTT-AGTTTC--GTATCATC-T-ATC-----TAT--A-TA----T-C--AT---AT----AATAA-------------A-A-CAG--A-TA-CGTGGAC-GTTTC---A-ACG-CACAC---A-TA-GCAATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AC----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGA-A-TA----CCG-----A---A---ACAA-AGCA--CA---A--TTA--A-T--TA---ACAT-AGTATATGT-------A-----AAG--CT--A-TC-GA--AAATACGGCTTG-------TCT-T-TTAT--AT--T--AA--aaagc
gi|142688 : AGTA-G-T--CTT-TTT-ACTTTC--GTTTTATC-A-ATT-----TAC--T-GA----TAC--AT---AT----GA-------T-A------T-A-CTG--A-TA-CATGATT-GTTTA---A-ACG-TGCGC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----G-GAGTTATTAGA------GA--T--------------AC----T---------TT---A--C-----A----ATAA-AT-AT--------ATAA-A-C-----C-------G---A-T-ACAA-CGCA--CA---C--TTA--A-A--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAA--CT--A--A-TA--AAATA--ACTAAATAGTATTC--G-TTAT------T--GA--AAA----CTGT---A---ATAAA-T------GATCT-TTT-TAAAAAAAAAACTCTG--AAA-AA
gi|142689 : AGTA-G-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCCCATC-G-GTG-----TGT--A-TA----C-C--GT---AT----ACTA-------A------A-A-CAG--A-TA-AATGAAC-G-----------------C---A-TA-GCCATTC---AA-A-T----A-TAGTTATAAAA------GA--C--------------AC----T---------T-------A-----A---CATAT-ATGAT--------ATGA-ATTAAACCC-------G---A-T-AC-A-AGCA--CA---C--TTT--A-T--TG---ACGT-G------AT-------A-----AAG--CT--G-TA-CG--GAACATC-CTAA-------Ttagca
gi|142690 : AATA-T-T--A-A-TTT-ATTGGT--GTCTCATCAT-ATG-----TAC--A-AA----A-C--AT---AG----AACA-----T-A------GTA-CAT--T-TA-CAT---------A---A-AAT-AACAC---A-T--GCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C---------------T----C---------AT---A--A-----AACTCATCA-A--AT--------AT
gi|142691 : AATG-T-T--ATA-TTT-ATTT----ATTT-ATT-C-ATG-----T-C--T-CA----T-C--AT---ATTTAGAACAA----T-ATAG---A-A-CAT--AATA-TATATAC-AT--A---A-AAT-A--AC---A-TATGCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C--------------Attctttttaatcaccatataattattataattatttaa
gi|142692 : GTA-T-T--ATT-TTT-ATTTTC--ATCTCATC-T-ATAACA--TAT--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCTTTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------TA--C--------------AT----T---------TTA--A--A-----A---CATAA-A--TT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAA-G------AT-------A-----AAG--CT-------------------C-------------------T--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-GAATTAAAAAC--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142693 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T-A---------C--A-CA----T-C--TT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------AA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---T--TT---T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAA--CTCCA-TG-TA--AAATACTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142694 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T-A---------C--A-CA----T-C--AT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TTAAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GG--C--------------AT----T---------TT---A--A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---T--TTT--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAA--CTCCA-TG-TA--AAATACTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaatagca
gi|142695 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T-A---------C--A-CA----T-C--AT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACA-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATGATAAGA------GA--T--------------AT----T---------TT---A--A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---T--TT---T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCCA-TG-TA--AAGTATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAAATAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142696 : GTA-T-T--ATT-TTT-CTTTTT--GTCTCATC-T-A---------C--A-CG----T-C--AT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTGC---A-TA-GTCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--T--------------AT----T---------TTA--A--A-----A---CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---T-------A---A-T-ACAA-AGCA--T-------TTT--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCCA-TG-CA--AAATACTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAATTTAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142697 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T---------T-C--A-CA----T-C--AT---AT----AACAAAATAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTT------------GTAC---A-GA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------A----------------A---A--A-----A---CA-AA-A--AT--------aagagca
gi|142698 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-TATGAAC-GTTTT---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATTGATTGATTC--------------AT----TCA-------TT----------------CATTC-T--GT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142699 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAAGC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATTGATTGATTC--------------AT----TCA-------TT----------------CATTC-T--TT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------CC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAT--CTG--AAG-AAGAAAagagca
gi|142700 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAAGT-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TGAT------TC---A--T-----T---CATTC-T--TT--------ATGC-A-CAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTAC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagc
gi|142701 : TA-T-T--ATC-TTT-AGTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-GA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TGA-------TT---G--ATTG--ATT-CATTC-A--TTCTTTCTTTATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTG--T-T--TT---ACAT-A------AT-------A-----AAGCTCT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TA--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATTAA-T------CGAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagc
gi|142702 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAA--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TGAT------TC---A--T-----T---CATTC-T--TT--------TTGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142703 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGa
gi|142703 : T--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---C--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------C-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-TAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAtttgattgattgattgattgattcattcatttattctttatgcatatcaatgtaaagcacacttattttacacgatcaagttctttgtaaaatattgctaatctttatactaaaagctgcaatcaaccaagtttttaattaaaagctgaagaagaaaaagag
gi|142704 : tattatctttatttttgtctaatctatatacacgtcatataacaaaacagctatatgaacgtttaaacttgtacaaagccattctaaaagaattataagtttgattgattgattgattgattcattcatttattcttTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----ATCAA-------------A-A-CAT--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GTCATTC---TA-A-A----A-ATTTTTTATGATT----GATTC--------------AT----TGA-------TT---G--ATTC--ATT-CATTC-G--TT--------ATGT-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TC---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATTAA-C------CAAGT-TTT-TAACT-AAAAG--TTG--AAG-AAGAAAaagag
gi|142705 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATT-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-CATCAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTT---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------aagagca
gi|142706 : TA-T-TTCATC-TTT-ATTTTT--GTCTTATC-T-ATA-----TAC--A-TG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAT-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------
gi|142707 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CTATCGCTATA----AT----A---------TT---A--ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-TCATG----CAT-T------ATTTTTGAAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--A-TTATACAC--T--AA--GAA----TT
gi|142708 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC-T-TTG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCTATTCAA-TA-T-T----A-AAATTACAAGA------GA--C--------------
gi|142709 : TA-T-TTAATC-TTT-ATTTCA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TC----G-C--A----AT----AACAA----T--------A-A-CATTAA-TATCAT--ACAGTATA---A---T---TAC---A-TA-GCCATTCAAATA-T-A----T-GAATTACAAGA------GA--C----------------------------------------------------------T--------AT-C-A-CA----T-------A---A-T-GCAA-AATA--TA---A--TTA--T-T--TATTCACAT-A------AT-------A-----AGA--CA--A-TG-TG--AAATGCTGCAAA-------TCGAT-TTATTAAA--A--AA--AAA----ATGTTAAG---ATAAA-C------AACAT-TTTAAAATT--------CTGACAAG-AAAAAA
gi|142710 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------ATCGC-T---------AT---A--ATATTGA---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-TCATG----CAT-T------ATTTTTGAAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--A-TTATACAC--T--AA--GAA----TTGaag
gi|142711 : TA-T-TTAATC-TTT-ATTTCA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TC----G-C--A----AT----AACAA----T-A------A---CATTAA-TATCAT--AC-----A---A-TATATGTAC---A-TA-GCTATTC----------------------AA---------------------------AT----T---------T------------------ATGA-A--TT--------AT-C-A-CA----C-------A---A-T-GCAA-AATA--CA---A--TTAACTAT--TC---ACAT-A------AT-------A-----AGA--CT--A-TG-TG--TAATACTGCAAA-------TCGAT-TTAT------T--AA--AAAAGTGTTAA---G---ATAAA-T------AAAAT-TTT-AAAATA-------CTGACAAG-AAAAAA
gi|142712 : TA-T-T---TC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CACTAAT-CTATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-ATT--A-GAATTACAAGA------GA--CTACCCTT-------ATAAAAT---------TT---ATTA-----A---TATAA-A--AT--------ATaag
gi|142713 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-A----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------AT----TGCTATAAAATT---A--ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------ATCTA-TCACAG-ATTATTCATGCA--TTA--T-T--TT---AGA---------AT-------------AAG--AT--A-TA-TACTATATAGCGCTA---------------TAC--ACTGT--AA--GAA----TTGaaacatctgtca
gi|142714 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AG--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------AT----CGCTATAAAATT---A--ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-TCATG----CAT-T------ATTTTTGAAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--A-TTATACAC--T--AA--GAA----TTG
gi|142715 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------ATCGC-T---------AT---A--ATATTGA---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-T--------CAT-G------
gi|142716 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTGA--GTCTCATC-A-ATA-----TAC--A-TA----CAC--AT---AT----AA-AA----T-ATC----A-A-TAT--A-TA-CA-GCAC-ATT-----A-AGT--GTAT---A-TT-GCCACTC---TA-T-ATT--G-GAGTTATTAGA------GA--CTATCACAGTTGTATAT----T---------AC---A--A-----G---CATAA-A--GA--------ACACTG-TA----C-------A-----T-GCAA-AATA--TA---A--T----------A---ACATAG------GT-------A-----ACA--CT----TC-AG--AAACATTGCTAA-------TC--A-ATA---AA--T--AA--GAA----CTGC---C---ATAAA-A------TAA-----T-GA--TAAGACA--CTG---AG-AAGAAAcattatttttgaaaaagatgtatactataaagcagtatacattaagaattg
gi|142717 : TA-T-T---TC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC---ATGGTTAATAC--A-CA----G-T--AT---AT----A-CAT----T-A------A-A-T-T--A-AA-CATTA-T-ATTTA---ACAGT-TAGCC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------AT----A---------TT---A--C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---A-T-----C-------A---A-T-ACAaa
gi|142718 : TA-T-T---TC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC---ATGGTTAATAC--A-CA----G-T--AT---AT----A-CAT----T-A------A-A-T-T--A-AA-CATTA-T-ATTTA---ACAGT-TAACC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------AT----A---------TT---A--C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---A-T-----C-------A---A-T-ACA
gi|142719 : TA-T-T--CT--TTT-ATAATA--GTCTCATC-C-ATA-----TAC--A-TA------C--AC---ATAAA-AACAA----T-A------A-A--AT--A-TA-CATACAT-GTATACATA-AA--TGTAC---A-TG-GCCATTC----A-A-ATATTA-GAATAACAAGA------GA--CT-------------AT----T---------TTCACA--A-----A---TAGAACA--AT--------A----A-TA----T-------------T-ACA----TA--CG---T--TTA--T-A--TC---ACA--A------AG-------G-----AAG--AT--ACTA-CA--AAATATTAC
gi|142720 : -T-T--ATT-TTT-ATTTTC--CTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TA----A-C--AT---AT----AATAA-------------A-A-CAT--T-TA-CATGAAT-GTTTA---A-ACT-TGACC---A-TA-GCCATTT---TG-A-A----A-GAATTATAATA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---TATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------C---G-CCACGA-AGCA--CA---G--TTA--T-T--TG---ACAT-A------AT-------G-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CCGC---A---ATAAG-C------CAA-T-TTT-TAATTAAAAAG--CTG--AAT-AAGAAA
gi|142721 : -T--ATT-TTT-ATTATA--GTCTCATC-C-ATA-----TACTAA-CA------C--AT---ACTA--AACCA----G-A------A-A--AT--A-TA-CATATAC-A--CA---A-AA--TGTAC---A-TG-GCCATTCAA-TA-ATT----A-GAATTGCAAGA------GA--CT-------------AT----T-----------------A-----A---CACAA--------------ATGG-A--A----C-------A---A-----AATATCA--CA-------TG--T-T--T----ATAT-C------AC-------A-----AAG---------G-C---AAATA-CACTAA-------------TTAT--AT--T--AA--aagagca
gi|142722 : --ATA-TTT-ATTTAA--GTCTCATC---ATGGTTAATGC--A-CA----T-A--AT---A-----AACAT----T-A------A-A-TAA--A--A-CATTA-C-ATTTA---ACAAT-TAGCC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------ATA---T---------TT---A--C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---A-T-----C-------A---A-T-ACA
gi|142723 : --ATCATTT-ATTCAT--GTCTCATC-TTATG-----TAG--AACA----A-T--AT---AG----AACA-----T-A------ATA-TAT--A-TA-CATAAAA----TA---A-----CGTAT--------GCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C--------------AA----T---------AT---AC-A-----ACT-CATAA-A--AT--------AT
gi|142724 : C-TTT-ATTTTTT-GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TA----T-CCAGT---AT----A-TAA----T-A----------CAT--A-TA-CAGGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---ATTG-GTCATTA---TA-A-
gi|142725 : C--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TT----T-C--GT---AT----AATAA-------------A-A-CAG--T-GA-CATGAAC-TTTTC---A-ACT-TGTAT---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TC---A--A-----A---CATAG-A--AT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-ACCA-AGCA--TA---AAATTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------ATCATAAAG--CT--G-AG-GA--GAATGTGGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-GAATTAAAAAG--CTA--AAG-AAGAAA
gi|142726 : TTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------A-----------------------A-----A---CATA----------------TAC---------C-------G---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TGT--T-T--TA---ACAG-G------AA-------A-----AAG--CT--A-TG-GA--AACTATTGCTGA-------TA--A-TTAT--AT--T--AATCAAA----CTaggag
gi|142727 : T--------ATGC-G-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--CT---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AT--T--AA--AAT----CTGC---A---ATTAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142728 : T--------ATGT-T-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------TT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TT--T-TTAT--AC--T--GA--AAG----CTGC---A---GTCAA-C------C-----------------AAG--CTG--AAG-AAGAAAaagag
gi|142729 : -T-ACTA-TGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TAAT--AC--T--GA--AAA----CTGC---A---ATA-----------AAGT-TCT-GAATTAAAAAT--CTG--AAG-AAGAAAagagca
gi|142730 : --TG---ACGT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG--A--AAATATTTCTAA-------TC--TACTAT------C--AA--AAA----CTCT---A---ATAAAAC------CAAGC-TTT-GAACTAAAACA--CTG--AAG-AAGAaaaagca
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 2222 11
lowQualScore : 0 6 33 0 0 5555 0 0 77777 11 11 777777 11 111 4444 22 2222222222222 1 777777 0 1 0 111 2 555 111 0 0 888 2 0 3333 2 000000 33 333333333333333333333333333333333333333333333333 0 22 33333333 555 0 0000 8888888 111 3 1 0 11 555 11 11 0 33 2222 0 222222 9999999 22222 66 11 0 0 11 3333333 33 1 55 11 11 11 33333 222 222 1 333333 1 33 9 11 33 1
lowQualScore : . . .. . . .... . . ..... .. .. ...... .. ... .... .. ............. . ...... . . . ... . ... ... . . ... . . .... . ...... .. ................................................ . .. ........ ... . .... ....... ... . . . .. ... .. .. . .. .... . ...... ....... ..... .. .. . . .. ....... .. . .. .. .. .. ..... ... ... . ...... . .. . .. .. .
lowQualScore : 9 0 44 8 8 5555 8 8 33333 11 22 444444 11 444 1111 22 0000000000000 6 999999 8 6 8 444 4 999 444 8 8 888 3 8 8888 4 111111 44 777777777777777777777777777777777777777777777777 9 11 00000000 222 9 9999 6666666 666 5 7 9 33 333 33 33 9 88 1111 9 666666 1111111 33333 44 55 9 9 33 2222222 88 0 55 44 44 44 22222 111 111 2 666666 2 11 6 88 55 3
consensus : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA----T-A------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ANT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-NAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
Reference ( family-460 ) : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA----T-A------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ANT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-NAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142675 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--TTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TA----T-T--AC---AT----AATAA----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----CC------A---A-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAAA-ATT-TAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142676 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--T-TA----T-C--AC---AT----AATAA----TCA------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagacca
gi|142677 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-TTG-----TAC--T-AA----T-C--AC---AT----AATAA----TCA------A-A-CAT--A-TA-CATGGAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----CC------A---A-T-ACGA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-A------AT-------A-----AAG--AT--A-TG-CA--AAATATTGTTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142678 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--T-GA----T-C--AC---AT----AATAA----T-A------A-AACAT--A-TA-TATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-ATCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TC---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----CC------A---A-T-ACAA-AGAA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------TT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTTA-------TT--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-CAATTAAAAAG--TTG--AAG-CAGAAAaagagca
gi|142679 : AGTA-C-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCAAC-T-ATG-----TAC--A-CT----T-C--AT---AT----ACTAA----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGAAC---A-AA-GCCATTC---TT-A-A----A-GAATTAGAAGA------GA--T--------------AG----T---------TT---T--A-----A---CAT-A-A--AT--------ATGC-A-TAC---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AA-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAGTTTTGCTTA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGT---A---GTTAA-C------CAAGT-TTT-GCATTTAAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142680 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TGC--A-TA----T-C--AC---AT----AATAA----T-ACACCATA-A-TTT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATAATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TC---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATAC-A-TAC---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---AAAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AA------TGT---ATATATGAT-G------CAAGTATCA-AAATTGAAAaagagca
gi|142681 : AGTA-T-T--ATC-TTT-TTTTTCTCGTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AC---AT----AATAT----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TCTAC---A-TA-GACATTC---TA-A-A----A-GAATTATATGA------TA--A--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-CA----CC------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--G-T--TG---ACAG-G------AT-------A-----AAG--CT--A-CG-TG--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATA
gi|142682 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--T-TA----T-C--AC---AT----AATAA----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-ATTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-ACCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--T--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TAC---C-------A---A-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----GAG--AT--A-TGATA--AAA
gi|142683 : AGTA-T-T--GTC-TTTTATTT----GTCTTGTC-T-ATG-----TAC--A-TAATTAT-C--GT---AT----AATAA-------------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-------------T-TGTTC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAAT--------------------------------------------------------------------TGA-A--AT--------ATGC-A-TA----CA------A---A-T-GCAA-AGTA--CA---A--ATA--T-T--AG---ACAT-G------AT-------A-----GAT--AT--A-TG-GA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTGT--AC--T--AA--AAA----TTGC---A---ATAAA-T------CCCGT-TTT-TAG-TACAAAT--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142684 : AGTAAT-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-------------T-TGTAC---A-AA-GCGATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TCA-------TT----------------CATTC-T--TT--------ATAC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTTA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT----AG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142685 : AATA-C-T--ATC-TTT-ATTTTC--ATCTCATT-A-AGG-----TAT--A-TA----A-C--AC---AA----AATAA-------------A-A-TATT-A-TT-CATGTGA-TTTTA---A-AAT-GGTACGGCA-TA-GCCACTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------TT--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGT-A-TAG---CGATATAAA---G-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAG-G------AT-------T-----AAG--TT--A-TG--G--AAATATTGCTTA-------TC--T-TTAT--AT--T--AA--AAG----CTGT---A---ATAAA-TAAAAAAAAAAT------AAATAAAAAA--TTG--AAG-AGAAAAagaaca
gi|142686 : AGTG-T-T--ACC-TTT-ATTTTC--GTCTCATA-T-TTG-----TAC--A-CA----T-C--ATTTCAT----AACAC----C-G------A-A---------A-CAAGAAC-GTTTA---A-ACT-TGCAC---A-CA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAAATATAAGA------GA--C--------------AA----T---------T-------A-----A---CATGA-A--AC--------ATGT-A--AGC--C-------G---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--A-T--CG---GCAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-T--TG--AAATACTCCTAA-------TC--C-TTCT--GA--TAAAA--AAA----CTGC---A---ATAAA-T------AAACA-TCA-GAACTGAAAAT--CGG--AAGAAAGAAAaatag
gi|142687 : AGTA-T-C---TA-TTT-AGTTTC--GTATCATC-T-ATC-----TAT--A-TA----T-C--AT---AT----AATAA-------------A-A-CAG--A-TA-CGTGGAC-GTTTC---A-ACG-CACAC---A-TA-GCAATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AC----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGA-A-TA----CCG-----A---A---ACAA-AGCA--CA---A--TTA--A-T--TA---ACAT-AGTATATGT-------A-----AAG--CT--A-TC-GA--AAATACGGCTTG-------TCT-T-TTAT--AT--T--AA--aaagc
gi|142688 : AGTA-G-T--CTT-TTT-ACTTTC--GTTTTATC-A-ATT-----TAC--T-GA----TAC--AT---AT----GA-------T-A------T-A-CTG--A-TA-CATGATT-GTTTA---A-ACG-TGCGC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----G-GAGTTATTAGA------GA--T--------------AC----T---------TT---A--C-----A----ATAA-AT-AT--------ATAA-A-C-----C-------G---A-T-ACAA-CGCA--CA---C--TTA--A-A--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAA--CT--A--A-TA--AAATA--ACTAAATAGTATTC--G-TTAT------T--GA--AAA----CTGT---A---ATAAA-T------GATCT-TTT-TAAAAAAAAAACTCTG--AAA-AA
gi|142689 : AGTA-G-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCCCATC-G-GTG-----TGT--A-TA----C-C--GT---AT----ACTA-------A------A-A-CAG--A-TA-AATGAAC-G-----------------C---A-TA-GCCATTC---AA-A-T----A-TAGTTATAAAA------GA--C--------------AC----T---------T-------A-----A---CATAT-ATGAT--------ATGA-ATTAAACCC-------G---A-T-AC-A-AGCA--CA---C--TTT--A-T--TG---ACGT-G------AT-------A-----AAG--CT--G-TA-CG--GAACATC-CTAA-------Ttagca
gi|142690 : AATA-T-T--A-A-TTT-ATTGGT--GTCTCATCAT-ATG-----TAC--A-AA----A-C--AT---AG----AACA-----T-A------GTA-CAT--T-TA-CAT---------A---A-AAT-AACAC---A-T--GCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C---------------T----C---------AT---A--A-----AACTCATCA-A--AT--------AT
gi|142691 : AATG-T-T--ATA-TTT-ATTT----ATTT-ATT-C-ATG-----T-C--T-CA----T-C--AT---ATTTAGAACAA----T-ATAG---A-A-CAT--AATA-TATATAC-AT--A---A-AAT-A--AC---A-TATGCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C--------------Attctttttaatcaccatataattattataattatttaa
gi|142692 : GTA-T-T--ATT-TTT-ATTTTC--ATCTCATC-T-ATAACA--TAT--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCTTTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------TA--C--------------AT----T---------TTA--A--A-----A---CATAA-A--TT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAA-G------AT-------A-----AAG--CT-------------------C-------------------T--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-GAATTAAAAAC--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142693 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T-A---------C--A-CA----T-C--TT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------AA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---T--TT---T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAA--CTCCA-TG-TA--AAATACTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142694 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T-A---------C--A-CA----T-C--AT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TTAAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GG--C--------------AT----T---------TT---A--A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---T--TTT--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAA--CTCCA-TG-TA--AAATACTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaatagca
gi|142695 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T-A---------C--A-CA----T-C--AT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACA-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATGATAAGA------GA--T--------------AT----T---------TT---A--A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---T--TT---T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCCA-TG-TA--AAGTATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAAATAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142696 : GTA-T-T--ATT-TTT-CTTTTT--GTCTCATC-T-A---------C--A-CG----T-C--AT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTGC---A-TA-GTCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--T--------------AT----T---------TTA--A--A-----A---CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---T-------A---A-T-ACAA-AGCA--T-------TTT--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCCA-TG-CA--AAATACTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAATTTAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142697 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T---------T-C--A-CA----T-C--AT---AT----AACAAAATAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTT------------GTAC---A-GA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------A----------------A---A--A-----A---CA-AA-A--AT--------aagagca
gi|142698 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-TATGAAC-GTTTT---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATTGATTGATTC--------------AT----TCA-------TT----------------CATTC-T--GT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142699 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAAGC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATTGATTGATTC--------------AT----TCA-------TT----------------CATTC-T--TT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------CC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAT--CTG--AAG-AAGAAAagagca
gi|142700 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAAGT-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TGAT------TC---A--T-----T---CATTC-T--TT--------ATGC-A-CAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTAC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagc
gi|142701 : TA-T-T--ATC-TTT-AGTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-GA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TGA-------TT---G--ATTG--ATT-CATTC-A--TTCTTTCTTTATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTG--T-T--TT---ACAT-A------AT-------A-----AAGCTCT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TA--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATTAA-T------CGAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagc
gi|142702 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAA--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TGAT------TC---A--T-----T---CATTC-T--TT--------TTGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142703 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGa
gi|142703 : T--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---C--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------C-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-TAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAtttgattgattgattgattgattcattcatttattctttatgcatatcaatgtaaagcacacttattttacacgatcaagttctttgtaaaatattgctaatctttatactaaaagctgcaatcaaccaagtttttaattaaaagctgaagaagaaaaagag
gi|142704 : tattatctttatttttgtctaatctatatacacgtcatataacaaaacagctatatgaacgtttaaacttgtacaaagccattctaaaagaattataagtttgattgattgattgattgattcattcatttattcttTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----ATCAA-------------A-A-CAT--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GTCATTC---TA-A-A----A-ATTTTTTATGATT----GATTC--------------AT----TGA-------TT---G--ATTC--ATT-CATTC-G--TT--------ATGT-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TC---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATTAA-C------CAAGT-TTT-TAACT-AAAAG--TTG--AAG-AAGAAAaagag
gi|142705 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATT-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-CATCAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTT---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------aagagca
gi|142706 : TA-T-TTCATC-TTT-ATTTTT--GTCTTATC-T-ATA-----TAC--A-TG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAT-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------
gi|142707 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CTATCGCTATA----AT----A---------TT---A--ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-TCATG----CAT-T------ATTTTTGAAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--A-TTATACAC--T--AA--GAA----TT
gi|142708 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC-T-TTG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCTATTCAA-TA-T-T----A-AAATTACAAGA------GA--C--------------
gi|142709 : TA-T-TTAATC-TTT-ATTTCA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TC----G-C--A----AT----AACAA----T--------A-A-CATTAA-TATCAT--ACAGTATA---A---T---TAC---A-TA-GCCATTCAAATA-T-A----T-GAATTACAAGA------GA--C----------------------------------------------------------T--------AT-C-A-CA----T-------A---A-T-GCAA-AATA--TA---A--TTA--T-T--TATTCACAT-A------AT-------A-----AGA--CA--A-TG-TG--AAATGCTGCAAA-------TCGAT-TTATTAAA--A--AA--AAA----ATGTTAAG---ATAAA-C------AACAT-TTTAAAATT--------CTGACAAG-AAAAAA
gi|142710 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------ATCGC-T---------AT---A--ATATTGA---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-TCATG----CAT-T------ATTTTTGAAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--A-TTATACAC--T--AA--GAA----TTGaag
gi|142711 : TA-T-TTAATC-TTT-ATTTCA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TC----G-C--A----AT----AACAA----T-A------A---CATTAA-TATCAT--AC-----A---A-TATATGTAC---A-TA-GCTATTC----------------------AA---------------------------AT----T---------T------------------ATGA-A--TT--------AT-C-A-CA----C-------A---A-T-GCAA-AATA--CA---A--TTAACTAT--TC---ACAT-A------AT-------A-----AGA--CT--A-TG-TG--TAATACTGCAAA-------TCGAT-TTAT------T--AA--AAAAGTGTTAA---G---ATAAA-T------AAAAT-TTT-AAAATA-------CTGACAAG-AAAAAA
gi|142712 : TA-T-T---TC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CACTAAT-CTATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-ATT--A-GAATTACAAGA------GA--CTACCCTT-------ATAAAAT---------TT---ATTA-----A---TATAA-A--AT--------ATaag
gi|142713 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-A----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------AT----TGCTATAAAATT---A--ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------ATCTA-TCACAG-ATTATTCATGCA--TTA--T-T--TT---AGA---------AT-------------AAG--AT--A-TA-TACTATATAGCGCTA---------------TAC--ACTGT--AA--GAA----TTGaaacatctgtca
gi|142714 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AG--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------AT----CGCTATAAAATT---A--ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-TCATG----CAT-T------ATTTTTGAAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--A-TTATACAC--T--AA--GAA----TTG
gi|142715 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------ATCGC-T---------AT---A--ATATTGA---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-T--------CAT-G------
gi|142716 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTGA--GTCTCATC-A-ATA-----TAC--A-TA----CAC--AT---AT----AA-AA----T-ATC----A-A-TAT--A-TA-CA-GCAC-ATT-----A-AGT--GTAT---A-TT-GCCACTC---TA-T-ATT--G-GAGTTATTAGA------GA--CTATCACAGTTGTATAT----T---------AC---A--A-----G---CATAA-A--GA--------ACACTG-TA----C-------A-----T-GCAA-AATA--TA---A--T----------A---ACATAG------GT-------A-----ACA--CT----TC-AG--AAACATTGCTAA-------TC--A-ATA---AA--T--AA--GAA----CTGC---C---ATAAA-A------TAA-----T-GA--TAAGACA--CTG---AG-AAGAAAcattatttttgaaaaagatgtatactataaagcagtatacattaagaattg
gi|142717 : TA-T-T---TC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC---ATGGTTAATAC--A-CA----G-T--AT---AT----A-CAT----T-A------A-A-T-T--A-AA-CATTA-T-ATTTA---ACAGT-TAGCC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------AT----A---------TT---A--C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---A-T-----C-------A---A-T-ACAaa
gi|142718 : TA-T-T---TC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC---ATGGTTAATAC--A-CA----G-T--AT---AT----A-CAT----T-A------A-A-T-T--A-AA-CATTA-T-ATTTA---ACAGT-TAACC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------AT----A---------TT---A--C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---A-T-----C-------A---A-T-ACA
gi|142719 : TA-T-T--CT--TTT-ATAATA--GTCTCATC-C-ATA-----TAC--A-TA------C--AC---ATAAA-AACAA----T-A------A-A--AT--A-TA-CATACAT-GTATACATA-AA--TGTAC---A-TG-GCCATTC----A-A-ATATTA-GAATAACAAGA------GA--CT-------------AT----T---------TTCACA--A-----A---TAGAACA--AT--------A----A-TA----T-------------T-ACA----TA--CG---T--TTA--T-A--TC---ACA--A------AG-------G-----AAG--AT--ACTA-CA--AAATATTAC
gi|142720 : -T-T--ATT-TTT-ATTTTC--CTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TA----A-C--AT---AT----AATAA-------------A-A-CAT--T-TA-CATGAAT-GTTTA---A-ACT-TGACC---A-TA-GCCATTT---TG-A-A----A-GAATTATAATA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---TATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------C---G-CCACGA-AGCA--CA---G--TTA--T-T--TG---ACAT-A------AT-------G-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CCGC---A---ATAAG-C------CAA-T-TTT-TAATTAAAAAG--CTG--AAT-AAGAAA
gi|142721 : -T--ATT-TTT-ATTATA--GTCTCATC-C-ATA-----TACTAA-CA------C--AT---ACTA--AACCA----G-A------A-A--AT--A-TA-CATATAC-A--CA---A-AA--TGTAC---A-TG-GCCATTCAA-TA-ATT----A-GAATTGCAAGA------GA--CT-------------AT----T-----------------A-----A---CACAA--------------ATGG-A--A----C-------A---A-----AATATCA--CA-------TG--T-T--T----ATAT-C------AC-------A-----AAG---------G-C---AAATA-CACTAA-------------TTAT--AT--T--AA--aagagca
gi|142722 : --ATA-TTT-ATTTAA--GTCTCATC---ATGGTTAATGC--A-CA----T-A--AT---A-----AACAT----T-A------A-A-TAA--A--A-CATTA-C-ATTTA---ACAAT-TAGCC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------ATA---T---------TT---A--C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---A-T-----C-------A---A-T-ACA
gi|142723 : --ATCATTT-ATTCAT--GTCTCATC-TTATG-----TAG--AACA----A-T--AT---AG----AACA-----T-A------ATA-TAT--A-TA-CATAAAA----TA---A-----CGTAT--------GCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C--------------AA----T---------AT---AC-A-----ACT-CATAA-A--AT--------AT
gi|142724 : C-TTT-ATTTTTT-GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TA----T-CCAGT---AT----A-TAA----T-A----------CAT--A-TA-CAGGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---ATTG-GTCATTA---TA-A-
gi|142725 : C--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TT----T-C--GT---AT----AATAA-------------A-A-CAG--T-GA-CATGAAC-TTTTC---A-ACT-TGTAT---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TC---A--A-----A---CATAG-A--AT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-ACCA-AGCA--TA---AAATTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------ATCATAAAG--CT--G-AG-GA--GAATGTGGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-GAATTAAAAAG--CTA--AAG-AAGAAA
gi|142726 : TTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------A-----------------------A-----A---CATA----------------TAC---------C-------G---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TGT--T-T--TA---ACAG-G------AA-------A-----AAG--CT--A-TG-GA--AACTATTGCTGA-------TA--A-TTAT--AT--T--AATCAAA----CTaggag
gi|142727 : T--------ATGC-G-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--CT---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AT--T--AA--AAT----CTGC---A---ATTAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142728 : T--------ATGT-T-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------TT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TT--T-TTAT--AC--T--GA--AAG----CTGC---A---GTCAA-C------C-----------------AAG--CTG--AAG-AAGAAAaagag
gi|142729 : -T-ACTA-TGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TAAT--AC--T--GA--AAA----CTGC---A---ATA-----------AAGT-TCT-GAATTAAAAAT--CTG--AAG-AAGAAAagagca
gi|142730 : --TG---ACGT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG--A--AAATATTTCTAA-------TC--TACTAT------C--AA--AAA----CTCT---A---ATAAAAC------CAAGC-TTT-GAACTAAAACA--CTG--AAG-AAGAaaaagca
blockSeqs : A TC TCTC GTTAA TA AC ATTAT CA TTC TTAG AT TACACCAT T CATTA T CAT C ATA GGC AAA T TATT A TTGATT TT TATCACAGTTGTATATTACAAG TG CTTTCTTT ACT AACC GATATAA TCT C C TT TGC AA AC CA ATTC GTATAT TTTTGAA TCATA TT CT CT ATAGTAT GA A AC TG AA TC AAGTG TAA TAT A AAAAAA A AA A CT AC A
blockSeqs : A TA TTT GTTAA . T TA . . AAA AT AACATA T CATTA T . C AT . AA T TT A TTGATT TT TATCGCTATAATATTAATTGA T . GC GC CG . C C . G . . CA G . TTTTGAA . TT CC . . GA . TA . . . A . . . . . T A . AC .
blockSeqs : A TA TC GTTAA . A CA . . TA AT AACATA . ACAT . . C AT . AA T TT A TT TT TACCCTTATAAAATTTATTAA . . GC C C . C . . G . . CA G . TTTTGAA . CT CC . . T . AC . . . A . . . . . T A . . .
blockSeqs : A . TC ACA . G T . . . CT AACATA . ACAT . . . AT . AA . . . TT . TATTGCTATAAAATTAATTGA . . GC C C . C . . G . . . G . . . TT CC . . . . AC . . . A . . . . . C T . . .
blockSeqs : A . TC . . C T . . . AT AACATA . ACAT . . . AT . AA . . . TT . TATCGCTATAAAATTAATTGA . . GC C C . . . . G . . . G . . . TT CC . . . . . . . . A . . . . . G G . . .
blockSeqs : A . TC . . T T . . . AT AATATA . ACAT . . . CT . AA . . . TT . TGATTGATTGATTGATT . . AC T A . . . . . . . . G . . . . CT . . . . . . . . A . . . . . A A . . .
blockSeqs : A . TC . . C T . . . AT TATAG . TATT . . . CT . AA . . . TT . TATCGCTATAATATTGA . . GC G . . . . . . . . . G . . . . CT . . . . . . . . A . . . . . T A . . .
blockSeqs : . . TT . . T T . . . AT TATC . CAT . . . AT . AA . . . . . TATCGCTATAATATTGA . . GC T . . . . . . . . . G . . . . CT . . . . . . . . G . . . . . G G . . .
blockSeqs : . . TT . . T T . . . AC TCA . CAT . . . AT . . . . . . . ATTGATTGATTCATT . . GC T . . . . . . . . . G . . . . CT . . . . . . . . G . . . . . G A . . .
blockSeqs : . . TC . . C T . . . AT TCA . TTT . . . CT . . . . . . . TGATTGATTCATT . . AC T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T A . . .
blockSeqs : . . TC . . T T . . . AC TA . CAT . . . CG . . . . . . . TGATTGATTCATT . . GT T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G A . . .
blockSeqs : . . TC . . C A . . . AT TA . CAG . . . CG . . . . . . . TATTTTCACAAA . . GT T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T A . . .
blockSeqs : . . TC . . T T . . . CT TA . CAG . . . AT . . . . . . . AATATACAACT . . GA T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T A . . .
blockSeqs : . . TT . . G T . . . AC TA . CTG . . . AT . . . . . . . TCATAAAACT . . AA T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T T . . .
blockSeqs : . . GT . . T C . . . AC CG . CAG . . . CT . . . . . . . TATATTTACA . . GA T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T A . . .
blockSeqs : . . TC . . A A . . . AC TA . CAT . . . CT . . . . . . . TGATTCATT . . GC T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G A . . .
blockSeqs : . . TC . . C T . . . AC TA . CAT . . . CT . . . . . . . ATTTTAAAA . . GA T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G A . . .
blockSeqs : . . TC . . C T . . . AC TA . CAT . . . CA . . . . . . . ATTTTAAAA . . GA T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G A . . .
blockSeqs : . . TC . . C T . . . AC TA . CAT . . . CT . . . . . . . ATTTTAAAA . . GA T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G A . . .
blockSeqs : . . TT . . C T . . . AC TA . CAG . . . CT . . . . . . . ATTTTAAAA . . GA T . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G A . . .
blockSeqs : . . TC . . C T . . . AC TA . CAG . . . CT . . . . . . . ATTTTAAAA . . GC T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . TT . . C T . . . AC TA . CAT . . . CT . . . . . . . TATATTACA . . GC T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . TT . . C T . . . AC TA . CAT . . . CT . . . . . . . TATATTACA . . GC . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . TT . . C T . . . AC TA . CAG . . . CT . . . . . . . ATTTTAAA . . GC . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . TT . . C T . . . AC TA . CAT . . . CT . . . . . . . ATTTTAAA . . GC . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . TT . . C T . . . AC TA . CAT . . . CT . . . . . . . ATTTCAAA . . GC . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . TT . . C T . . . AC TA . CAG . . . CT . . . . . . . AGTTTTAA . . GT . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . TT . . C T . . . TC TA . TAT . . . CT . . . . . . . ATTTCAAA . . GC . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . TT . . C T . . . AC GA . CAT . . . GT . . . . . . . ATTTTAAA . . GG . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . TT . . C T . . . AC TA . TAA . . . GT . . . . . . . ATTTTAAA . . GC . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . AA . . C T . . . AC TA . TAT . . . GT . . . . . . . ATTTTAAA . . AC . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . AA . . T T . . . AC TA . CAT . . . CT . . . . . . . ACTTTAAA . . GC . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . CA . . A G . . . AC A . CAG . . . AT . . . . . . . ACTTTACA . . GT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . AA . . A G . . . AT T . TT . . . CT . . . . . . . ATTTTAAA . . C . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . CA . . T G . . . AC . . TT . . . CT . . . . . . . ATTTCAAA . . C . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . AA . . A G . . . AC . . TT . . . T . . . . . . . ATTCATT . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . AA . . T A . . . AC . . TT . . . T . . . . . . . ATTCATT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . AA . . A T . . . AT . . TT . . . A . . . . . . . AATTAA . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . AA . . A A . . . A . . AC . . . A . . . . . . . ACTTAA . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GA . . A T . . . A . . AC . . . T . . . . . . . TATTAA . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . AA . . A T . . . C . . AC . . . A . . . . . . . AAAAA . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . AA . . T . . . . C . . AC . . . A . . . . . . . ATTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TA . . C . . . . T . . AC . . . A . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TC . . C . . . . . . . AC . . . G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TA . . T . . . . . . . AC . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . AA . . T . . . . . . . TT . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . AT . . C . . . . . . . TT . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . AT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . AT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : CAT*** *******
originalCons : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA----T-A------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ANT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-NAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
finalCons : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA----T-A------A-ACAT---A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ANT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-NAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 2222 11
lowQualScore : 0 6 33 0 0 5555 0 0 77777 11 11 777777 11 111 4444 22 2222222222222 1 777777 0 1 0 111 2 555 111 0 0 888 2 0 3333 2 000000 33 333333333333333333333333333333333333333333333333 0 22 33333333 555 0 0000 8888888 111 3 1 0 11 555 11 11 0 33 2222 0 222222 9999999 22222 66 11 0 0 11 3333333 33 1 55 11 11 11 33333 222 222 1 333333 1 33 9 11 33 1
lowQualScore : . . .. . . .... . . ..... .. .. ...... .. ... .... .. ............. . ...... . . . ... . ... ... . . ... . . .... . ...... .. ................................................ . .. ........ ... . .... ....... ... . . . .. ... .. .. . .. .... . ...... ....... ..... .. .. . . .. ....... .. . .. .. .. .. ..... ... ... . ...... . .. . .. .. .
lowQualScore : 9 0 44 8 8 5555 8 8 33333 11 22 444444 11 444 1111 22 0000000000000 6 999999 8 6 8 444 4 999 444 8 8 888 3 8 8888 4 111111 44 777777777777777777777777777777777777777777777777 9 11 00000000 222 9 9999 6666666 666 5 7 9 33 333 33 33 9 88 1111 9 666666 1111111 33333 44 55 9 9 33 2222222 88 0 55 44 44 44 22222 111 111 2 666666 2 11 6 88 55 3
consensus : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA----T-A------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ANT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-NAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
Reference ( family-460 ) : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA----T-A------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ANT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-NAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142675 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--TTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TA----T-T--AC---AT----AATAA----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----CC------A---A-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAAA-ATT-TAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142676 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--T-TA----T-C--AC---AT----AATAA----TCA------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------A---A-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagacca
gi|142677 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-TTG-----TAC--T-AA----T-C--AC---AT----AATAA----TCA------A-A-CAT--A-TA-CATGGAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----CC------A---A-T-ACGA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-A------AT-------A-----AAG--AT--A-TG-CA--AAATATTGTTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142678 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--T-GA----T-C--AC---AT----AATAA----T-A------A-AACAT--A-TA-TATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-ATCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TC---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----CC------A---A-T-ACAA-AGAA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------TT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTTA-------TT--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-CAATTAAAAAG--TTG--AAG-CAGAAAaagagca
gi|142679 : AGTA-C-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCAAC-T-ATG-----TAC--A-CT----T-C--AT---AT----ACTAA----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-AAT-TGAAC---A-AA-GCCATTC---TT-A-A----A-GAATTAGAAGA------GA--T--------------AG----T---------TT---T--A-----A---CAT-A-A--AT--------ATGC-A-TAC---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AA-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAGTTTTGCTTA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGT---A---GTTAA-C------CAAGT-TTT-GCATTTAAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142680 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTC--GTCTCATC-T-ATG-----TGC--A-TA----T-C--AC---AT----AATAA----T-ACACCATA-A-TTT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATAATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TC---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATAC-A-TAC---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---AAAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AA------TGT---ATATATGAT-G------CAAGTATCA-AAATTGAAAaagagca
gi|142681 : AGTA-T-T--ATC-TTT-TTTTTCTCGTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-CA----T-C--AC---AT----AATAT----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TCTAC---A-TA-GACATTC---TA-A-A----A-GAATTATATGA------TA--A--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-CA----CC------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--G-T--TG---ACAG-G------AT-------A-----AAG--CT--A-CG-TG--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATA
gi|142682 : AGTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--T-TA----T-C--AC---AT----AATAA----T-A------A-AACAT--A-TA-CATGAAC-ATTTA---A-AAT-TGTAC---A-TA-ACCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--T--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGC-A-TAC---C-------A---A-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----GAG--AT--A-TGATA--AAA
gi|142683 : AGTA-T-T--GTC-TTTTATTT----GTCTTGTC-T-ATG-----TAC--A-TAATTAT-C--GT---AT----AATAA-------------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-------------T-TGTTC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAAT--------------------------------------------------------------------TGA-A--AT--------ATGC-A-TA----CA------A---A-T-GCAA-AGTA--CA---A--ATA--T-T--AG---ACAT-G------AT-------A-----GAT--AT--A-TG-GA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTGT--AC--T--AA--AAA----TTGC---A---ATAAA-T------CCCGT-TTT-TAG-TACAAAT--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142684 : AGTAAT-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-------------T-TGTAC---A-AA-GCGATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TCA-------TT----------------CATTC-T--TT--------ATAC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTTA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT----AG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142685 : AATA-C-T--ATC-TTT-ATTTTC--ATCTCATT-A-AGG-----TAT--A-TA----A-C--AC---AA----AATAA-------------A-A-TATT-A-TT-CATGTGA-TTTTA---A-AAT-GGTACGGCA-TA-GCCACTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------TT--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGT-A-TAG---CGATATAAA---G-T-ACAA-AGTA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAG-G------AT-------T-----AAG--TT--A-TG--G--AAATATTGCTTA-------TC--T-TTAT--AT--T--AA--AAG----CTGT---A---ATAAA-TAAAAAAAAAAT------AAATAAAAAA--TTG--AAG-AGAAAAagaaca
gi|142686 : AGTG-T-T--ACC-TTT-ATTTTC--GTCTCATA-T-TTG-----TAC--A-CA----T-C--ATTTCAT----AACAC----C-G------A-A---------A-CAAGAAC-GTTTA---A-ACT-TGCAC---A-CA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAAATATAAGA------GA--C--------------AA----T---------T-------A-----A---CATGA-A--AC--------ATGT-A--AGC--C-------G---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--A-T--CG---GCAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-T--TG--AAATACTCCTAA-------TC--C-TTCT--GA--TAAAA--AAA----CTGC---A---ATAAA-T------AAACA-TCA-GAACTGAAAAT--CGG--AAGAAAGAAAaatag
gi|142687 : AGTA-T-C---TA-TTT-AGTTTC--GTATCATC-T-ATC-----TAT--A-TA----T-C--AT---AT----AATAA-------------A-A-CAG--A-TA-CGTGGAC-GTTTC---A-ACG-CACAC---A-TA-GCAATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AC----T---------TT---A--A-----A---CATAA-A--AT--------ATGA-A-TA----CCG-----A---A---ACAA-AGCA--CA---A--TTA--A-T--TA---ACAT-AGTATATGT-------A-----AAG--CT--A-TC-GA--AAATACGGCTTG-------TCT-T-TTAT--AT--T--AA--aaagc
gi|142688 : AGTA-G-T--CTT-TTT-ACTTTC--GTTTTATC-A-ATT-----TAC--T-GA----TAC--AT---AT----GA-------T-A------T-A-CTG--A-TA-CATGATT-GTTTA---A-ACG-TGCGC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----G-GAGTTATTAGA------GA--T--------------AC----T---------TT---A--C-----A----ATAA-AT-AT--------ATAA-A-C-----C-------G---A-T-ACAA-CGCA--CA---C--TTA--A-A--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAA--CT--A--A-TA--AAATA--ACTAAATAGTATTC--G-TTAT------T--GA--AAA----CTGT---A---ATAAA-T------GATCT-TTT-TAAAAAAAAAACTCTG--AAA-AA
gi|142689 : AGTA-G-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCCCATC-G-GTG-----TGT--A-TA----C-C--GT---AT----ACTA-------A------A-A-CAG--A-TA-AATGAAC-G-----------------C---A-TA-GCCATTC---AA-A-T----A-TAGTTATAAAA------GA--C--------------AC----T---------T-------A-----A---CATAT-ATGAT--------ATGA-ATTAAACCC-------G---A-T-AC-A-AGCA--CA---C--TTT--A-T--TG---ACGT-G------AT-------A-----AAG--CT--G-TA-CG--GAACATC-CTAA-------Ttagca
gi|142690 : AATA-T-T--A-A-TTT-ATTGGT--GTCTCATCAT-ATG-----TAC--A-AA----A-C--AT---AG----AACA-----T-A------GTA-CAT--T-TA-CAT---------A---A-AAT-AACAC---A-T--GCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C---------------T----C---------AT---A--A-----AACTCATCA-A--AT--------AT
gi|142691 : AATG-T-T--ATA-TTT-ATTT----ATTT-ATT-C-ATG-----T-C--T-CA----T-C--AT---ATTTAGAACAA----T-ATAG---A-A-CAT--AATA-TATATAC-AT--A---A-AAT-A--AC---A-TATGCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C--------------Attctttttaatcaccatataattattataattatttaa
gi|142692 : GTA-T-T--ATT-TTT-ATTTTC--ATCTCATC-T-ATAACA--TAT--A-CA----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCTTTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------TA--C--------------AT----T---------TTA--A--A-----A---CATAA-A--TT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAA-G------AT-------A-----AAG--CT-------------------C-------------------T--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-GAATTAAAAAC--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142693 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T-A---------C--A-CA----T-C--TT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------AA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---T--TT---T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAA--CTCCA-TG-TA--AAATACTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142694 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T-A---------C--A-CA----T-C--AT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TTAAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GG--C--------------AT----T---------TT---A--A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---T--TTT--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAA--CTCCA-TG-TA--AAATACTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAATTAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaatagca
gi|142695 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T-A---------C--A-CA----T-C--AT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACA-TGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATGATAAGA------GA--T--------------AT----T---------TT---A--A-----AA--CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---C-------A---A-T-ACAA-AGCA--CA---T--TT---T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCCA-TG-TA--AAGTATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAAATAAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142696 : GTA-T-T--ATT-TTT-CTTTTT--GTCTCATC-T-A---------C--A-CG----T-C--AT---AT----AACAAAACAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTGC---A-TA-GTCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--T--------------AT----T---------TTA--A--A-----A---CATAA-A--TT--------ATGA-A-TAT---T-------A---A-T-ACAA-AGCA--T-------TTT--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCCA-TG-CA--AAATACTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATAAA-C------TAAGT-TTT-TAATTTAAAAG--ATG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142697 : GTA-T-T--ATC-TTT-CTTTTC--GTCTCATC-T---------T-C--A-CA----T-C--AT---AT----AACAAAATAT-A------A-A-T-T--A-TA-CATGAAC-GTT------------GTAC---A-GA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------A----------------A---A--A-----A---CA-AA-A--AT--------aagagca
gi|142698 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-TATGAAC-GTTTT---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATTGATTGATTC--------------AT----TCA-------TT----------------CATTC-T--GT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142699 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAAGC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATTGATTGATTC--------------AT----TCA-------TT----------------CATTC-T--TT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------CC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAT--CTG--AAG-AAGAAAagagca
gi|142700 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAAGT-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TGAT------TC---A--T-----T---CATTC-T--TT--------ATGC-A-CAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTAC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagc
gi|142701 : TA-T-T--ATC-TTT-AGTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-CATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-GA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TGA-------TT---G--ATTG--ATT-CATTC-A--TTCTTTCTTTATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTG--T-T--TT---ACAT-A------AT-------A-----AAGCTCT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TA--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATTAA-T------CGAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagc
gi|142702 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAA--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGATT----GA--TTG------------AT----TGAT------TC---A--T-----T---CATTC-T--TT--------TTGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------A-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAaagagca
gi|142703 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGa
gi|142703 : T--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---C--TTA--T-T--TT---ACAC-G------AT-------C-----AAGTTCT--T-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAG----CTGC---A---ATCAA-C------CAAGT-TTT-TAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAAtttgattgattgattgattgattcattcatttattctttatgcatatcaatgtaaagcacacttattttacacgatcaagttctttgtaaaatattgctaatctttatactaaaagctgcaatcaaccaagtttttaattaaaagctgaagaagaaaaagag
gi|142704 : tattatctttatttttgtctaatctatatacacgtcatataacaaaacagctatatgaacgtttaaacttgtacaaagccattctaaaagaattataagtttgattgattgattgattgattcattcatttattcttTA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATC-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----ATCAA-------------A-A-CAT--C-TA-TATGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GTCATTC---TA-A-A----A-ATTTTTTATGATT----GATTC--------------AT----TGA-------TT---G--ATTC--ATT-CATTC-G--TT--------ATGT-A-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TC---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAT----CTGC---A---ATTAA-C------CAAGT-TTT-TAACT-AAAAG--TTG--AAG-AAGAAAaagag
gi|142705 : TA-T-T--ATC-TTT-ATTTTT--GTCTAATT-T-ATA-----TAC--A-CG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAT--C-TA-CATCAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTT---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------aagagca
gi|142706 : TA-T-TTCATC-TTT-ATTTTT--GTCTTATC-T-ATA-----TAC--A-TG----T-C--AT---AT----AACAA-------------A-A-CAG--C-TA-TATGAAT-GTTTA---A-ACT-TGTAC---A-AA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------
gi|142707 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CTATCGCTATA----AT----A---------TT---A--ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-TCATG----CAT-T------ATTTTTGAAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--A-TTATACAC--T--AA--GAA----TT
gi|142708 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC-T-TTG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCTATTCAA-TA-T-T----A-AAATTACAAGA------GA--C--------------
gi|142709 : TA-T-TTAATC-TTT-ATTTCA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TC----G-C--A----AT----AACAA----T--------A-A-CATTAA-TATCAT--ACAGTATA---A---T---TAC---A-TA-GCCATTCAAATA-T-A----T-GAATTACAAGA------GA--C----------------------------------------------------------T--------AT-C-A-CA----T-------A---A-T-GCAA-AATA--TA---A--TTA--T-T--TATTCACAT-A------AT-------A-----AGA--CA--A-TG-TG--AAATGCTGCAAA-------TCGAT-TTATTAAA--A--AA--AAA----ATGTTAAG---ATAAA-C------AACAT-TTTAAAATT--------CTGACAAG-AAAAAA
gi|142710 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------ATCGC-T---------AT---A--ATATTGA---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-TCATG----CAT-T------ATTTTTGAAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--A-TTATACAC--T--AA--GAA----TTGaag
gi|142711 : TA-T-TTAATC-TTT-ATTTCA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TC----G-C--A----AT----AACAA----T-A------A---CATTAA-TATCAT--AC-----A---A-TATATGTAC---A-TA-GCTATTC----------------------AA---------------------------AT----T---------T------------------ATGA-A--TT--------AT-C-A-CA----C-------A---A-T-GCAA-AATA--CA---A--TTAACTAT--TC---ACAT-A------AT-------A-----AGA--CT--A-TG-TG--TAATACTGCAAA-------TCGAT-TTAT------T--AA--AAAAGTGTTAA---G---ATAAA-T------AAAAT-TTT-AAAATA-------CTGACAAG-AAAAAA
gi|142712 : TA-T-T---TC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CACTAAT-CTATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTC---TA-A-ATT--A-GAATTACAAGA------GA--CTACCCTT-------ATAAAAT---------TT---ATTA-----A---TATAA-A--AT--------ATaag
gi|142713 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTAAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-A----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------AT----TGCTATAAAATT---A--ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------ATCTA-TCACAG-ATTATTCATGCA--TTA--T-T--TT---AGA---------AT-------------AAG--AT--A-TA-TACTATATAGCGCTA---------------TAC--ACTGT--AA--GAA----TTGaaacatctgtca
gi|142714 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AG--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------AT----CGCTATAAAATT---A--ATTG--A---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-TCATG----CAT-T------ATTTTTGAAA-----AAG------A-TG-T-----ATACTATAAA-------GC--A-TTATACAC--T--AA--GAA----TTG
gi|142715 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-AA------C--AT---AT----A--AA----T-A------A-A--AC--A-TA-CAGTAAC-ACATA---C-AA--CGTAC---A-TA-GCCATTCAA-TA-T-T----A-GAATTACAAGA------GA--CT-------------ATCGC-T---------AT---A--ATATTGA---CATAA-A--AT--------AT---A-TA----C-------A---ACT-AT-----CA--CAG--A--TTA--T-T--------CAT-G------
gi|142716 : TA-TAT--ATC-TTT-ATTTGA--GTCTCATC-A-ATA-----TAC--A-TA----CAC--AT---AT----AA-AA----T-ATC----A-A-TAT--A-TA-CA-GCAC-ATT-----A-AGT--GTAT---A-TT-GCCACTC---TA-T-ATT--G-GAGTTATTAGA------GA--CTATCACAGTTGTATAT----T---------AC---A--A-----G---CATAA-A--GA--------ACACTG-TA----C-------A-----T-GCAA-AATA--TA---A--T----------A---ACATAG------GT-------A-----ACA--CT----TC-AG--AAACATTGCTAA-------TC--A-ATA---AA--T--AA--GAA----CTGC---C---ATAAA-A------TAA-----T-GA--TAAGACA--CTG---AG-AAGAAAcattatttttgaaaaagatgtatactataaagcagtatacattaagaattg
gi|142717 : TA-T-T---TC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC---ATGGTTAATAC--A-CA----G-T--AT---AT----A-CAT----T-A------A-A-T-T--A-AA-CATTA-T-ATTTA---ACAGT-TAGCC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------AT----A---------TT---A--C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---A-T-----C-------A---A-T-ACAaa
gi|142718 : TA-T-T---TC-TTT-ATTTAA--GTCTCATC---ATGGTTAATAC--A-CA----G-T--AT---AT----A-CAT----T-A------A-A-T-T--A-AA-CATTA-T-ATTTA---ACAGT-TAACC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------AT----A---------TT---A--C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---A-T-----C-------A---A-T-ACA
gi|142719 : TA-T-T--CT--TTT-ATAATA--GTCTCATC-C-ATA-----TAC--A-TA------C--AC---ATAAA-AACAA----T-A------A-A--AT--A-TA-CATACAT-GTATACATA-AA--TGTAC---A-TG-GCCATTC----A-A-ATATTA-GAATAACAAGA------GA--CT-------------AT----T---------TTCACA--A-----A---TAGAACA--AT--------A----A-TA----T-------------T-ACA----TA--CG---T--TTA--T-A--TC---ACA--A------AG-------G-----AAG--AT--ACTA-CA--AAATATTAC
gi|142720 : -T-T--ATT-TTT-ATTTTC--CTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TA----A-C--AT---AT----AATAA-------------A-A-CAT--T-TA-CATGAAT-GTTTA---A-ACT-TGACC---A-TA-GCCATTT---TG-A-A----A-GAATTATAATA------GA--C--------------AT----T---------TT---A--A-----A---TATAA-A--AT--------ATGC-A-TA----C-------C---G-CCACGA-AGCA--CA---G--TTA--T-T--TG---ACAT-A------AT-------G-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CCGC---A---ATAAG-C------CAA-T-TTT-TAATTAAAAAG--CTG--AAT-AAGAAA
gi|142721 : -T--ATT-TTT-ATTATA--GTCTCATC-C-ATA-----TACTAA-CA------C--AT---ACTA--AACCA----G-A------A-A--AT--A-TA-CATATAC-A--CA---A-AA--TGTAC---A-TG-GCCATTCAA-TA-ATT----A-GAATTGCAAGA------GA--CT-------------AT----T-----------------A-----A---CACAA--------------ATGG-A--A----C-------A---A-----AATATCA--CA-------TG--T-T--T----ATAT-C------AC-------A-----AAG---------G-C---AAATA-CACTAA-------------TTAT--AT--T--AA--aagagca
gi|142722 : --ATA-TTT-ATTTAA--GTCTCATC---ATGGTTAATGC--A-CA----T-A--AT---A-----AACAT----T-A------A-A-TAA--A--A-CATTA-C-ATTTA---ACAAT-TAGCC---A-T--GCCATTC---TATA-A----A-GAATTATAAGA------GA--CT-------------ATA---T---------TT---A--C-----A---TGTAA-A--AC--------AT---A-T-----C-------A---A-T-ACA
gi|142723 : --ATCATTT-ATTCAT--GTCTCATC-TTATG-----TAG--AACA----A-T--AT---AG----AACA-----T-A------ATA-TAT--A-TA-CATAAAA----TA---A-----CGTAT--------GCCATTC---TA-A-A----AAGAATTATAAGA------GA--C--------------AA----T---------AT---AC-A-----ACT-CATAA-A--AT--------AT
gi|142724 : C-TTT-ATTTTTT-GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TA----T-CCAGT---AT----A-TAA----T-A----------CAT--A-TA-CAGGAAC-GTTTA---A-ACT-TGTAC---ATTG-GTCATTA---TA-A-
gi|142725 : C--GTCTCATC-T-ATG-----TAC--A-TT----T-C--GT---AT----AATAA-------------A-A-CAG--T-GA-CATGAAC-TTTTC---A-ACT-TGTAT---A-TA-GCCATTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------AT----T---------TC---A--A-----A---CATAG-A--AT--------ATGC-A-TAT---C-------A---A-T-ACCA-AGCA--TA---AAATTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------ATCATAAAG--CT--G-AG-GA--GAATGTGGCTAA-------TC--T-TTAT--AC--T--AA--AAA----CTGC---A---ATAAA-C------CAAGT-TTT-GAATTAAAAAG--CTA--AAG-AAGAAA
gi|142726 : TTC---TA-A-A----A-GAATTATAAGA------GA--C--------------A-----------------------A-----A---CATA----------------TAC---------C-------G---A-T-ACAA-AGCA--CA---A--TGT--T-T--TA---ACAG-G------AA-------A-----AAG--CT--A-TG-GA--AACTATTGCTGA-------TA--A-TTAT--AT--T--AATCAAA----CTaggag
gi|142727 : T--------ATGC-G-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--CT---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TTAT--AT--T--AA--AAT----CTGC---A---ATTAA-C------CAAGT-TTT-GAATT-AAAAG--CTG--AAG-AAGAAA
gi|142728 : T--------ATGT-T-TAT---C-------A---A-T-GTAA-AGCA--CA---A--TTA--T-T--TT---ACAC-G------TT-------A-----AAG--CTCTA-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TT--T-TTAT--AC--T--GA--AAG----CTGC---A---GTCAA-C------C-----------------AAG--CTG--AAG-AAGAAAaagag
gi|142729 : -T-ACTA-TGCA--CA---A--TTA--T-T--TG---ACAT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG-TA--AAATATTGCTAA-------TC--T-TAAT--AC--T--GA--AAA----CTGC---A---ATA-----------AAGT-TCT-GAATTAAAAAT--CTG--AAG-AAGAAAagagca
gi|142730 : --TG---ACGT-G------AT-------A-----AAG--CT--A-TG--A--AAATATTTCTAA-------TC--TACTAT------C--AA--AAA----CTCT---A---ATAAAAC------CAAGC-TTT-GAACTAAAACA--CTG--AAG-AAGAaaaagca