lowQualScore                  :                                                                                                                         1                                 11111111111111111111111                                                                                                                 
lowQualScore                  :                                                                            5             222222222           0      11  2     0  22222222  44444444444444 55555555555555555555555 11 3333333333   0  111  11  2222222 111   1111 111        3333333333333            00   222222222  2        0   
lowQualScore                  :                                                                            .             .........           .      ..  .     .  ........  .............. ....................... .. ..........   .  ...  ..  ....... ...   .... ...        .............            ..   .........  .        .   
lowQualScore                  :                                                                            3             777777777           7      00  2     7  66666666  22222222222222 66666666666666666666666 00 1111111111   4  222  00  3333333 222   4444 222        7777777777777            99   888888888  4        7   
consensus                     :                                                                CTTTATCACATGGATAATCACAAACT---------CAATATCGTGT-CTGACC--GCCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------A--------C--C----------AATGCC---TG--GC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
Reference ( gi|48648 )        :                                                                CTTTATCACATGAATAATCACAAACT---------CAATATTGTGT-CTGACC--GCATCCAG-TA--------GC--------------C--------------T--------C--C----------AATACC---TG--GC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAGTATTGTGT-CTG
gi|48649                      :                                                                CTTTATCACATGGATAATCACAAACT---------CAATATCATGT-CTGACT--GCCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------T--------C--C----------AATACC---TG--GC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GGACAATCAAAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48652                      :                                                                CTTTATCACACGGATAATCACAAACT---------CAATATTGTGT-CTGACC--GCCTCCAG-TA--------G---------------C--------------T--------C--C----------AATACC---TG--GC-------A---CCA----T---TATCCTAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------TAATATCGTGT-CTG
gi|48654                      :                                                                CTTTATCACACGGATAATCACAAACT---------CAATATTGTCT-CTGACC--GCCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------A--------C--C----------AATACC---TG--TC-------A---CCG----T---TATCACAT-------------TGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATGT-CTG
gi|48653                      :                                                                CTTTATCACATAGACAATCACAAACT---------CAGTATTATTT-CTGACC--ACATTGAT-TA--------GC--------------C--------------T--------C--C----------AATACC---TG--AC-------A---CCT----T---TATCACAC-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48651                      :                                                                CTTTATCACATGGACAATCACAAACT---------CAATATCGTGT-CTGACT--GCCTCCAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATGCC---TG--GC-------A---CCT----T---TATTACAT-------------TGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48647                      :                                                                CTTTATCACATAGACAATCACAAATT---------CAGTATCGTGT-GTAACC--GCCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------T--------C--C----------AATACC---TA--GA-------A---CTT----T---TATTACAT-------------GGATAATCGCAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48657                      :                                                                CTTTATCACATGGGTAATCACAAACA---------CAATATCATGT-ATGGCA--GTCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------T--------C--C----------AATGCC---TG--GC-------A---ACT----T---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAGTATCTTGT-CTG
gi|48659                      :                                                                CTTTATCACATGGATAATCACAAACT---------CAGTATTGTGT-CTGGTC--GACCCCAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATGAC---TG--GC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GGATAATTACAA--ACA---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48655                      :                                                                CTTTATCATATAGATAATCACAAACT---------CAATAGTGTGTACTGACC--GCCTCCAG-TA--------GC--------------T--------------A--------C--C----------AGTGCC---TG--GC-------A---CAA----T---TATCACAT-------------GGACAATCACAA--ACC---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48664                      :                                                                CTTTATCACATGGACAATCACAAACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC--GTCTCCAG-AA--------GC--------------C--------------A--------C--C----------AATGCC---CG--TC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------AGACAATCACAA--ATT---------CAGTATCGTGT-
gi|48661                      :                                                                CTTTATCAAATAGACAATCACAAACT---------CAGTATTATGT-CTGACC--ATATTCAT-TC--------GC--------------C--------------T--------C--A----------AATACC---TG--AC-------A---CCT----T---TATCACAC-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTCT-CTG
gi|48656                      :                                                                CTTTATCACATGGACAATCAAAAACT---------CAATATTGTGT-CTGACT--GCCTCCAG-TA--------GT--------------G--------------A--------C--A----------AATGCC---TG--GC-------A---CGT----T---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-ATG
gi|48658                      :                                                                CTTTATCAGATGGATAATCACAAATT---------CAGTATCGAGT-CTGACC--ACCTCCAG-GA--------GC--------------G--------------A--------C--C----------AATGCC---TC--GC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48672                      :                                                                CTTCATCACATGGATAAACACAA-CA---------CAATATTATGT-CTGACC--GCA-CCTG-TA--------GC--------------C--------------A--------T--C----------AATGCC---TG--GC-------A---CCT----T---TATCATAT-------------GGACAATCACAA--ACT---------TAATATTGTGT-CTG
gi|48663                      :                                                                CTTTTTTACATTAATAATCACAAACT---------CAATATCCTGT-CTGACC--ACCTCCTG-TA--------GC--------------C--------------A--------C--A----------AATGCC---TG--TC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GGACAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48650                      :                                                                CTTTATCAAATAGACAATCACAAATT---------CAGTATCGTGT-GTAACC--GCCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------T--------C--C----------AATACC---TT--AA-------A---CTT----T---TATTACAT-------------GGATAATCGCAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48665                      :                                                                CTTTATCACATGGATAATCACAAATA---------CAATATTGTGT-CTGACC--ACCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------T--------C--C----------AATGCC---TT--GC-------A---GCT----T---TATCACAT-------------GGACAATCACAA--GCA---------CAATAGCATGT-
gi|48662                      :                                                                CTTAATTACATGGATAATCACAAACT---------CAA-ATCGTGT-CTGAAT--GCCTCAAC-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATACC---TG--GC-------A---CCT----T---TATTACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48667                      :                                                                CTTTATCACATGGACAATCACAAACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC--GTCTCCAG-AA--------GC--------------C--------------A--------C--C----------AATGCC---GG--TC-------A---CCT----T---TATCAAAT-------------AGACAATCACAA--ATT---------CAGTATCGTGT-
gi|48660                      :                                                                CTTTATTACATGGACAATCACAAGCA---------CAATATCATGT-ATGACC--GCCTCCAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATGCC---TG--GC-------A---CCT----T---AATTACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAA-ATCGTGT-CTG
gi|48676                      :                                                                CTTTATCACATGGATAATCACAAACT---------CAGTATTGTGT-CTGNNN--NNNNNNN-----------------------------------------------------------------------C---TG--GC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAGTATTGTGT-CTG
gi|48671                      :                                                                CTTTATCACATGGATAATCACAAACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC--GCCTCCAG-TT--------GC--------------NNNNNNNNNNAGTAAT--------CATC----------AATGCC---TA--GC-------A---CCA----T---TATCCCAT-------------GGATAATCACAA--ACA---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48668                      :                                                                CTTTATAATATGGACACTCACAA-CT---------CAATAGCATGT-ATGAAC--GCCTCTAG-TA--------GC--------------C--------------T--------C--C----------AGTGCC---TG--GC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ACA---------CAGTATCTTGT-CTG
gi|48666                      :                                                                CTTTATTACATTGATAATCACAAACT---------CAATATCATGT-CTGACG--ACCTCTAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATACC---TG--GC-------A---CCT----T---TATTACAT-------------GGACAATCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48673                      :                                                                CTTCATCAGATGGATAACCACAAACA---------CAATATTGTGT-TTTACC--ACCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------A--------C--C----------AATGCC---TG--GC-------T---CCT----T---TATCACATNNNNNNNNNNCATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48678                      :                                                                CTTCTTCACATGGATAATCAGAAACT---------TAGTGTTGTGT-CTGACC--GCA-CCAG--A--------CG--------------C--------------T--------C--C----------AATACCTCTTG--G-------------CT----T---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48677                      :                                                                CTTTATCACATGGATAATTACAAACA---------CAATATTGTGT-CTGATC--ATCTCCTG-TA--------GC--------------C--------------T--------C--A----------GATACC---TG--GC-------A---CCT----T---TATAATAT-------------GGACACTCAC-A--ACT---------CAATAGCATGT-ATG
gi|48669                      :                                                                CTTTATCACATGGATAATCACAAACA---------CAGTATCTTGT-CTGACT--GACTTCAG-AA--------AT--------------C--------------A--------C--C----------AATGCC---TG--GG-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GGGTAATCACAA--ACA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48670                      :                                                                CTTTATCACAAGGACAACCACAAGCA---------CAATATCATGT-ATGACT--GCCTCCAG-CA--------AC--------------C--------------A--------T--C----------AATGCC---TG--GC-------A---TTT----A---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAACATCATGT-CTG
gi|48701                      :                                                                CTTTATCACAAGGACAACCACAAGCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48674                      : catggataatcacaaactcaatatcatgtctgaccatctcctgtagcatccaatgcctggcagCTTTATCACATGGACAACCACAAGCA---------CAATATCATGT-ATGACG--GCCTCTAG-CA--------AC--------------C--------------A--------T--C----------AATGCC---TG--GC-------A---TTT----A---TATCAAAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAACATCATGT-CTG
gi|48681                      :                                                                CTTCATCACATGGATAACTACAAACT---------CAATAGTGTGT-CTAACC--GCCTCCAG-CA--------GC--------------C--------------A--------T--C----------AATGCC---TG--GC-------A---CC-----T---TATCACAT-------------GGATA
gi|48682                      :                                                                CTTTATTACGT--ATAATCACAAACT---------GAATATCATGT-CTGACC--GCCTCAAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATACC---TG--GC-------A---CCT----T---TATTACGT---------------ATAATCACAA--ACTGANNNNNNNNNNTATCATGT-CTG
gi|48679                      :                                                                CTTTATCACATGGATAATCACAAACT---------CAGTATCTTGT-CTGACT--GACTTCAG-CA--------AT--------------C--------------A--------C--C----------AATGCC---TGTAGCCACAAATG---CCT----T---CATCACAT-------------GGATAAACAC-A--ACA---------CAATATTATGT-CTG
gi|48680                      :                                                                CTTTATCACATGGACAATCACAAGCA---------CAGTATCATGT-ATGACC--GCCTCCAG-CT--------AC--------------C--------------A--------T--C----------AATGCC---TG--GC-------A---TCT----A---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ACA---------CA
gi|48702                      :                                                                CTTTATCACATGGACAATCACAAGCA---------CAGTATCATGT-ATGa
gi|48675                      :            atcacatggatattgtgcctaaccacctccagtagcctccaatgccttgcatCTATATCACATAGACAATTACAAGCA---------CAATATCATGT-CTGA-C--GCCTCTAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATACA---TG--GC-------A---CCT----T---TATTACGT---------------ATAATCACAA--ACT---------GAATATCATGT-CTG
gi|48683                      :                                                                CTTTATTACATGGATAATCACAAACT---------CAATATCGTGT-CTGACC--GCCTCTAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATACC--------------------------------------T-------------GGNNNNNNNNNN--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48685                      :                                                                CTTTATCATATGGACAATCACAAACT---------TAATATTGTGT-CTGACC--TCCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------A--------T--C----------AATGCC---TA--GC-------A---CC
gi|48684                      :                                                                CTTTATCACATGGACAATCACAAGCA---------CAATAGCATGT-ATAACCAAGCA--CAA-TA--------GCATGTATAACCACCTC--------------TAGCAACAAC--C----------AATACC---TG--GC-------A---TCT----A---TTTTACAT-------------GGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-TTG
gi|48704                      :                                                                CTTTATCACATGAATAATCACAAACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48686                      :                                                     atgcctggcacCTATATCACATGGATAATCACAAACA---------CAANNNNNNNN-NN-----------------------------------------C--------------T--------C--C----------AATGCC---TG--GC-------A---GCT----T---TATCACAT-------------GGACAACCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48687                      :                                                                CTTTATTACGT--ATAATCACAAACTGANNNNNNNNNNTATCATGT-CTGACC--GCCTCTAG-AA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATACC---TG--GC-------AATGCCTGGCATCTATATCACCT-------------GGATAACTAGAG--GCT---------C
gi|48688                      :                                                                 TTTATTACATGGATAATCGCAAACT---------CAATATTGTGT-CTGACC--GCCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------A--------T--C----------AATACC---TG--TC-------A---CCT----T---TATCAAAT-------------AGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATGT-CTG
gi|48689                      :                                                                 TTTATTACATGGATAATCGCAAACT---------CAATATTGTGT-CTGACC--ACCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------A--------C--A----------AATGCC---TG--TC-------A---CCT----T---CATCAGAT-------------GGATAACCACAA--ACA---------CAATATTGTGT-TT
gi|48690                      :                                                                 TTTATCACATGGATAATCACAAACT---------CAATATCATGT-ATGACC--GCCTCCAGCTACCATCAATTC--------------C--------------TG-------C--C----------AAAACG---TG--GC-------A---CCT----T---TATCATAT-------------AGATAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGTACTG
gi|48691                      :                                                                  TTATCACATGGACAATCACAAACC---------CAATATTGTGT-CTGACT--GCCTCCTG-TA--------GC--------------C--------------A--------C--A----------AATGCC---TG--GC-------A---CCT----T---CATCACAT-------------GGATAACTACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CT
gi|48692                      :                                                                  TTATCCCATGGATAATCACAAACA---------CAATATCGTGT-CTGACC--GCCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------A--------T--C----------AATGCC---TG--TC-------A---CCT----T---CTTCACAT-------------GGATAATCAGAA--ACT---------TAGTGTTGTGT-CTG
gi|48695                      :                                                                  TTATCACATTGACAATCACAAACT---------CAGTATTATGT-CTGACC--ACATTCAT-TA--------GC--------------C--------------T--------C--CNNNNNNNNNNAATACC---TG--TC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------AGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATTT-CTG
gi|48694                      :                                                                  TTATCCCGTGGATAATCACAATCT---------CAATGTTGTGT-CTGACC--ACCTACTG-CA--------GC--------------G--------------G--------C--C----------AATGCC---TG--GC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GGATAATCACAA--ATA---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48693                      :                                                                  TTATCCTATGGATAATCACAAACT---------TAATATCGTGT-CTGACT--GCCTCAAG-TA--------GC--------------C--------------A--------T--C----------AATGCC---TG--GC-------A---CCA----T---TATCCCGT-------------GGATAATCACAA--TCT---------CAATGTTGTGT-CTG
gi|48696                      :                                                                  TTATCCCATGAATAATCACAAACA---------CAATATC--------ACC--GACTCCAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATGCC---TG--GA-------A---TCT----T---TTTTACAT-------------TAATAATCACAA--ACT---------CAATATCCTGT-CTG
gi|48703                      :                                                                  TTATCCCATGAATAATCACAAACA---------CAATAT
gi|48697                      :                              tctgacctcctccagtagccatcaatgcctagcaccaTATCACATGGATAATCACAAACT---------CAACATCATGT-CTGACC--ACCTCTAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATACA---TG--GC-------A---TCT----T---TATCACAT-------------GGACAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48698                      :                                                                   TATCAAATGGATAATCACAAACT---------CAACATCATGT-CTGACC--ACCTCTAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATACA---TG--GC-------A---TCT----T---TATCACAT-------------GGACAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48699                      :                                                                     TTACATGGATAATCACAAACT---------CAATATCATGT-TTGACC--ACCTCCTG-TA--------GC--------------C--------------T--------C--C----------AATGCC---TG--GC-------A---GCT----A---TATCACAT-------------AGACAATTACAAGCANN---------NNNNNNNNTGC-CTG
gi|48700                      :                                                                       ACCTGGNNNNNNNNNNACT---------CAATATCGTGT-CTGACC--GCCTCTAG-CA--------AC--------------C--------------A--------C--C----------AATACC---TG--GC-------A---CCT----T---TATCAGAT-------------GGATAATCACAA--ATT---------CAGTATCGAGT-CTG
gi|48701                      :                                                                        CATGGATAATCACAAACT---------CAATATCATGT-CTGACC--ATCTCCTG-TA--------GC--------------A--------------T--------C--C----------AATGCC---TG--GC-------A---GCT----T---TATCACAA-------------GGACAACCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48702                      :                                                                                ATCACA---T---------GGATATTGTGC-CTAACC--ACCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------T--------C--C----------AATGCC---TT--GC-------A---TCT----T---TATCACAT-------------GGACAATCACAA--GCA---------CAGTATCATGT-ATG
gi|48703                      :                                                                                                             T-CTGACC--TCCTCCAG-TA--------GC--------------C--------------A--------T--C----------AATGCC---TA--GC-------A---CCA----T---TATCCCAT-------------GAATAATCACAA--ACA---------CAATAT
gi|48704                      :                                                                                                                                                                                                 ATGCC---TG--GC-------A---CCT----T---TATCACAT-------------GAATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48681                      :                                                                                                                                                                                                                           CT----T---CATCACAT-------------GGATAACTACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CT
gi|48680                      :                                                                                                                                                                                                                           CT----T---TATCACAT-------------GGACAATCACAA--GCA---------CAGTATCATGT-ATGaaccgcctccagcagccatcaatgcctggcaccttatcacatggata
gi|48685                      :                                                                                                                                                                                                                           CT----T---TATCATAT-------------GGACAATCACAA--ACT---------TAATATTGTGT-CTGaccgcctccagctaccatcaatgcctggcatctatatcacatggataatcacaaacacaa





Alignments
lowQualScore                  :                   222222     33333333333   444444444           0      3333333333            4444444444444444   3333333333   1111    222222 111 00  2222222          3333333333333               11   222222222           0   
lowQualScore                  :                   ......     ...........   .........           .      ..........            ................   ..........   ....    ...... ... ..  .......          .............               ..   .........           .   
lowQualScore                  :                   111111     44444444444   666666666           7      1111111111            6666666666666666   1111111111   5555    000000 222 99  2222222          9999999999999               00   999999999           8   
consensus                     : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGCAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
Reference ( family-446 )      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48647                      : CTTTATCACATAGACAAT------CACAA-----------ATT---------CAGTATCGTGT-GTAACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---A--GA-------ACTTTTATTA-------------CATGGATAATCGCAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48648                      : CTTTATCACATGAATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------GCATCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAGTATTGTGT-CTG
gi|48649                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-CTGACT----------GCCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGACAATCAAAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48650                      : CTTTATCAAATAGACAAT------CACAA-----------ATT---------CAGTATCGTGT-GTAACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---T--AA-------ACTTTTATTA-------------CATGGATAATCGCAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48651                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACT----------GCCTCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CATTGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48652                      : CTTTATCACACGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------T-C----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCATTATCC-------------TATGGATAATCACAA--ACT---------TAATATCGTGT-CTG
gi|48653                      : CTTTATCACATAGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTATTT-CTGACC----------ACATTGATTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---G--AC-------ACCTTTATCA-------------CACGGATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48654                      : CTTTATCACACGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATTGTCT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--TC-------ACCGTTATCA-------------CATTGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATGT-CTG
gi|48655                      : CTTTATCATATAGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGTACTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------TAC----------CAG----TGCC------T---G--GC-------ACAATTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACC---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48656                      : CTTTATCACATGGACAAT------CAAAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACT----------GCCTCCAGTAGT----------------GAC----------AAA----TGCC------T---G--GC-------ACGTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-ATG
gi|48657                      : CTTTATCACATGGGTAAT------CACAA-----------ACA---------CAATATCATGT-ATGGCA----------GTCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------AACTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAGTATCTTGT-CTG
gi|48658                      : CTTTATCAGATGGATAAT------CACAA-----------ATT---------CAGTATCGAGT-CTGACC----------ACCTCCAGGAGC----------------GAC----------CAA----TGCC------T---C--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48659                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTGTGT-CTGGTC----------GACCCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGAC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATTACAA--ACA---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48660                      : CTTTATTACATGGACAAT------CACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-ATGACC----------GCCTCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTAATTA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAA-ATCGTGT-CTG
gi|48661                      : CTTTATCAAATAGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTATGT-CTGACC----------ATATTCATTCGC----------------CTC----------AAA----TACC------T---G--AC-------ACCTTTATCA-------------CACGGATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTCT-CTG
gi|48662                      : CTTAATTACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAA-ATCGTGT-CTGAAT----------GCCTCAACCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48663                      : CTTTTTTACATTAATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCCTGT-CTGACC----------ACCTCCTGTAGC----------------CAC----------AAA----TGCC------T---G--TC-------ACCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48664                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC----------GTCTCCAGAAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------C---G--TC-------ACCTTTATCA-------------CATAGACAATCACAA--ATT---------CAGTATCGTGT-
gi|48665                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ATA---------CAATATTGTGT-CTGACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---T--GC-------AGCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--GCA---------CAATAGCATGT-
gi|48666                      : CTTTATTACATTGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-CTGACG----------ACCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CATGGACAATCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48667                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC----------GTCTCCAGAAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------G---G--TC-------ACCTTTATCA-------------AATAGACAATCACAA--ATT---------CAGTATCGTGT-
gi|48668                      : CTTTATAATATGGACACT------CACAA------------CT---------CAATAGCATGT-ATGAAC----------GCCTCTAGTAGC----------------CTC----------CAG----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACA---------CAGTATCTTGT-CTG
gi|48669                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACA---------CAGTATCTTGT-CTGACT----------GACTTCAGAAAT----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GG-------ACCTTTATCA-------------CATGGGTAATCACAA--ACA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48670                      : CTTTATCACAAGGACAAC------CACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-ATGACT----------GCCTCCAGCAAC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ATTTATATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAACATCATGT-CTG
gi|48671                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTTGCNNNNNNNNNNAGTAATCAT----------CAA----TGCC------T---A--GC-------ACCATTATCC-------------CATGGATAATCACAA--ACA---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48672                      : CTTCATCACATGGATAAA------CACAA------------CA---------CAATATTATGT-CTGACC----------GCA-CCTGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------TATGGACAATCACAA--ACT---------TAATATTGTGT-CTG
gi|48673                      : CTTCATCAGATGGATAAC------CACAA-----------ACA---------CAATATTGTGT-TTTACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------TCCTTTATCACATNNNNNNNNNNCATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48674                      : CTTTATCACATGGACAAC------CACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-ATGACG----------GCCTCTAGCAAC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ATTTATATCA-------------AATGGATAATCACAA--ACT---------CAACATCATGT-CTG
gi|48675                      : CTATATCACATAGACAAT------TACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-CTGA-C----------GCCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACA------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CGT--ATAATCACAA--ACT---------GAATATCATGT-CTG
gi|48676                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTGTGT-CTGNNN----------NNNNNNN--------------------------------------------C------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAGTATTGTGT-CTG
gi|48677                      : CTTTATCACATGGATAAT------TACAA-----------ACA---------CAATATTGTGT-CTGATC----------ATCTCCTGTAGC----------------CTC----------AGA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATAA-------------TATGGACACTCAC-A--ACT---------CAATAGCATGT-ATG
gi|48678                      : CTTCTTCACATGGATAAT------CAGAA-----------ACT---------TAGTGTTGTGT-CTGACC----------GCA-CCAGACGC----------------T-C----------CAA----TACC------TCTTG--GC----------TTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48679                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATCTTGT-CTGACT----------GACTTCAGCAAT----------------CAC----------CAA----TGCC------T---GTAGCCACAAATGCCTTCATCA-------------CATGGATAAACAC-A--ACA---------CAATATTATGT-CTG
gi|48680                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------GCA---------CAGTATCATGT-ATGACC----------GCCTCCAGCTAC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ATCTATATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACA---------CAA
gi|48681                      : CTTCATCACATGGATAAC------TACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTAACC----------GCCTCCAGCAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACC-TTATCA-------------CATGGATA
gi|48682                      : CTTTATTACGT--ATAAT------CACAA-----------ACT---------GAATATCATGT-CTGACC----------GCCTCAAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CGT--ATAATCACAA--ACTGANNNNNNNNNNTATCATGT-CTG
gi|48683                      : CTTTATTACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC-----------------------------------------------TGGNNNNNNNNNN--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48684                      : CTTTATCACATGGACAATCACAAGCACAATAGCATGTATAACCAAGCA----CAATAGCATGT-ATAACC----------ACCTCTAGCAAC----------------AAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ATCTATTTTA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-TTG
gi|48685                      : CTTTATCATATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------TAATATTGTGT-CTGACC----------TCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---A--GC-------ACC
gi|48686                      : CTATATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACA---------CAA------NN-NNNNNN----------NNCT--------------------------C----------CAA----TGCC------T---G--GC-------AGCTTTATCA-------------CATGGACAACCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48687                      : CTTTATTACGT--ATAAT------CACAA-----------ACTGANNNNNNNNNNTATCATGT-CTGACC----------GCCTCTAGAAAC----------------CACCAATACCTGGCAA----TGCC------T---G--GC-------ATCTATATCA-------------CCTGGATAACTAGAG--GCT---------
gi|48688                      :  TTTATTACATGGATAAT------CGCAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TACC------T---G--TC-------ACCTTTATCA-------------AATAGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATGT-CTG
gi|48689                      :  TTTATTACATGGATAAT------CGCAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CAC----------AAA----TGCC------T---G--TC-------ACCTTCATCA-------------GATGGATAACCACAA--ACA---------CAATATTGTGT-TT
gi|48690                      :  TTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-ATGACC----------GCCTCCAGCTAC----------------CAT----------CAATTCCTGCCAAAACGT---G--GC-------ACCTTTATCA-------------TATAGATAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGTACTG
gi|48691                      :   TTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACC---------CAATATTGTGT-CTGACT----------GCCTCCTGTAGC----------------CAC----------AAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTCATCA-------------CATGGATAACTACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CT
gi|48692                      :   TTATCCCATGGATAAT------CACAA-----------ACA---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--TC-------ACCTTCTTCA-------------CATGGATAATCAGAA--ACT---------TAGTGTTGTGT-CTG
gi|48693                      :   TTATCCTATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------TAATATCGTGT-CTGACT----------GCCTCAAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCATTATCC-------------CGTGGATAATCACAA--TCT---------CAATGTTGTGT-CTG
gi|48694                      :   TTATCCCGTGGATAAT------CACAA-----------TCT---------CAATGTTGTGT-CTGACC----------ACCTACTGCAGC----------------GGC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ATA---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48695                      :   TTATCACATTGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTATGT-CTGACCACATTCATTAGCCTCCNNNNNN----------------NNN----------NAA----TACC------T---G--TC-------ACCTTTATCA-------------CATAGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATTT-CTG
gi|48696                      :   TTATCCCATGAATAAT------CACAA-----------ACA---------CAATATC--------ACC----------GACTCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GA-------ATCTTTTTTA-------------CATTAATAATCACAA--ACT---------CAATATCCTGT-CTG
gi|48697                      :    TATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAACATCATGT-CTGACC----------ACCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACA------T---G--GC-------ATCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48698                      :    TATCAAATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAACATCATGT-CTGACC----------ACCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACA------T---G--GC-------ATCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48699                      :      TTACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-TTGACC----------ACCTCCTGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------AGCTATATCA-------------CATAGACAATTACAAGCANN---------NNNNNNNNTGC-CTG
gi|48700                      :        ACCTGGNNNNN------NNNNN-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------GATGGATAATCACAA--ATT---------CAGTATCGAGT-CTG
gi|48701                      :         CATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-CTGACC----------ATCTCCTGTAGC----------------ATC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------AGCTTTATCA-------------CAAGGACAACCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48702                      :                 AT------CACA--------------T---------GGATATTGTGC-CTAACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---T--GC-------ATCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--GCA---------CAGTATCATGT-ATG
gi|48703                      :                                                               T-CTGACC----------TCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---A--GC-------ACCATTATCC-------------CATGAATAATCACAA--ACA---------CAATAT
gi|48704                      :                                                                                                                            A----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGAATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG





Alignments
lowQualScore                  :                   222222     33333333333   444444444           0      3333333333        1   4444444444444444   3333333333   1111    222222 111 00  2222222          3333333333333               11   222222222           0   
lowQualScore                  :                   ......     ...........   .........           .      ..........        .   ................   ..........   ....    ...... ... ..  .......          .............               ..   .........           .   
lowQualScore                  :                   111111     44444444444   666666666           7      1111111111        6   6666666666666666   1111111111   5555    000000 222 99  2222222          9999999999999               00   999999999           8   
consensus                     : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGCAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
Reference ( family-446 )      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGCAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48647                      : CTTTATCACATAGACAAT------CACAA-----------ATT---------CAGTATCGTGT-GTAACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---A--GA-------ACTTTTATTA-------------CATGGATAATCGCAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48648                      : CTTTATCACATGAATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------GCATCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAGTATTGTGT-CTG
gi|48649                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-CTGACT----------GCCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGACAATCAAAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48650                      : CTTTATCAAATAGACAAT------CACAA-----------ATT---------CAGTATCGTGT-GTAACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---T--AA-------ACTTTTATTA-------------CATGGATAATCGCAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48651                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACT----------GCCTCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CATTGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48652                      : CTTTATCACACGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------T-C----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCATTATCC-------------TATGGATAATCACAA--ACT---------TAATATCGTGT-CTG
gi|48653                      : CTTTATCACATAGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTATTT-CTGACC----------ACATTGATTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---G--AC-------ACCTTTATCA-------------CACGGATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48654                      : CTTTATCACACGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATTGTCT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--TC-------ACCGTTATCA-------------CATTGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATGT-CTG
gi|48655                      : CTTTATCATATAGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGTACTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------TAC----------CAG----TGCC------T---G--GC-------ACAATTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACC---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48656                      : CTTTATCACATGGACAAT------CAAAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACT----------GCCTCCAGTAGT----------------GAC----------AAA----TGCC------T---G--GC-------ACGTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-ATG
gi|48657                      : CTTTATCACATGGGTAAT------CACAA-----------ACA---------CAATATCATGT-ATGGCA----------GTCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------AACTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAGTATCTTGT-CTG
gi|48658                      : CTTTATCAGATGGATAAT------CACAA-----------ATT---------CAGTATCGAGT-CTGACC----------ACCTCCAGGAGC----------------GAC----------CAA----TGCC------T---C--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48659                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTGTGT-CTGGTC----------GACCCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGAC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATTACAA--ACA---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48660                      : CTTTATTACATGGACAAT------CACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-ATGACC----------GCCTCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTAATTA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAA-ATCGTGT-CTG
gi|48661                      : CTTTATCAAATAGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTATGT-CTGACC----------ATATTCATTCGC----------------CTC----------AAA----TACC------T---G--AC-------ACCTTTATCA-------------CACGGATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTCT-CTG
gi|48662                      : CTTAATTACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAA-ATCGTGT-CTGAAT----------GCCTCAACCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48663                      : CTTTTTTACATTAATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCCTGT-CTGACC----------ACCTCCTGTAGC----------------CAC----------AAA----TGCC------T---G--TC-------ACCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48664                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC----------GTCTCCAGAAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------C---G--TC-------ACCTTTATCA-------------CATAGACAATCACAA--ATT---------CAGTATCGTGT-
gi|48665                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ATA---------CAATATTGTGT-CTGACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---T--GC-------AGCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--GCA---------CAATAGCATGT-
gi|48666                      : CTTTATTACATTGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-CTGACG----------ACCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CATGGACAATCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48667                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC----------GTCTCCAGAAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------G---G--TC-------ACCTTTATCA-------------AATAGACAATCACAA--ATT---------CAGTATCGTGT-
gi|48668                      : CTTTATAATATGGACACT------CACAA------------CT---------CAATAGCATGT-ATGAAC----------GCCTCTAGTAGC----------------CTC----------CAG----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACA---------CAGTATCTTGT-CTG
gi|48669                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACA---------CAGTATCTTGT-CTGACT----------GACTTCAGAAAT----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GG-------ACCTTTATCA-------------CATGGGTAATCACAA--ACA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48670                      : CTTTATCACAAGGACAAC------CACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-ATGACT----------GCCTCCAGCAAC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ATTTATATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAACATCATGT-CTG
gi|48671                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTTGCNNNNNNNNNNAGTAATCAT----------CAA----TGCC------T---A--GC-------ACCATTATCC-------------CATGGATAATCACAA--ACA---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48672                      : CTTCATCACATGGATAAA------CACAA------------CA---------CAATATTATGT-CTGACC----------GCA-CCTGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------TATGGACAATCACAA--ACT---------TAATATTGTGT-CTG
gi|48673                      : CTTCATCAGATGGATAAC------CACAA-----------ACA---------CAATATTGTGT-TTTACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------TCCTTTATCACATNNNNNNNNNNCATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48674                      : CTTTATCACATGGACAAC------CACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-ATGACG----------GCCTCTAGCAAC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ATTTATATCA-------------AATGGATAATCACAA--ACT---------CAACATCATGT-CTG
gi|48675                      : CTATATCACATAGACAAT------TACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-CTGAC-----------GCCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACA------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CGT--ATAATCACAA--ACT---------GAATATCATGT-CTG
gi|48676                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTGTGT-CTGNNN----------NNNNNNN--------------------------------------------C------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAGTATTGTGT-CTG
gi|48677                      : CTTTATCACATGGATAAT------TACAA-----------ACA---------CAATATTGTGT-CTGATC----------ATCTCCTGTAGC----------------CTC----------AGA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATAA-------------TATGGACACTCAC-A--ACT---------CAATAGCATGT-ATG
gi|48678                      : CTTCTTCACATGGATAAT------CAGAA-----------ACT---------TAGTGTTGTGT-CTGACC----------GCA-CCAGACGC----------------T-C----------CAA----TACC------TCTTG--GC----------TTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48679                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATCTTGT-CTGACT----------GACTTCAGCAAT----------------CAC----------CAA----TGCC------T---GTAGCCACAAATGCCTTCATCA-------------CATGGATAAACAC-A--ACA---------CAATATTATGT-CTG
gi|48680                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------GCA---------CAGTATCATGT-ATGACC----------GCCTCCAGCTAC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ATCTATATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACA---------CAA
gi|48681                      : CTTCATCACATGGATAAC------TACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTAACC----------GCCTCCAGCAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACC-TTATCA-------------CATGGATA
gi|48682                      : CTTTATTACGT--ATAAT------CACAA-----------ACT---------GAATATCATGT-CTGACC----------GCCTCAAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CGT--ATAATCACAA--ACTGANNNNNNNNNNTATCATGT-CTG
gi|48683                      : CTTTATTACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC-----------------------------------------------TGGNNNNNNNNNN--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48684                      : CTTTATCACATGGACAATCACAAGCACAATAGCATGTATAACCAAGCA----CAATAGCATGT-ATAACC----------ACCTCTAGCAAC----------------AAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ATCTATTTTA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-TTG
gi|48685                      : CTTTATCATATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------TAATATTGTGT-CTGACC----------TCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---A--GC-------ACC
gi|48686                      : CTATATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACA---------CAANNNNNNNN-NN----------------CTCCA------------------------------------A----TGCC------T---G--GC-------AGCTTTATCA-------------CATGGACAACCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48687                      : CTTTATTACGT--ATAAT------CACAA-----------ACTGANNNNNNNNNNTATCATGT-CTGACC----------GCCTCTAGAAAC----------------CACCAATACCTGGCAA----TGCC------T---G--GC-------ATCTATATCA-------------CCTGGATAACTAGAG--GCT---------
gi|48688                      :  TTTATTACATGGATAAT------CGCAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TACC------T---G--TC-------ACCTTTATCA-------------AATAGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATGT-CTG
gi|48689                      :  TTTATTACATGGATAAT------CGCAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CAC----------AAA----TGCC------T---G--TC-------ACCTTCATCA-------------GATGGATAACCACAA--ACA---------CAATATTGTGT-TT
gi|48690                      :  TTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-ATGACC----------GCCTCCAGCTAC----------------CAT----------CAATTCCTGCCAAAACGT---G--GC-------ACCTTTATCA-------------TATAGATAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGTACTG
gi|48691                      :   TTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACC---------CAATATTGTGT-CTGACT----------GCCTCCTGTAGC----------------CAC----------AAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTCATCA-------------CATGGATAACTACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CT
gi|48692                      :   TTATCCCATGGATAAT------CACAA-----------ACA---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--TC-------ACCTTCTTCA-------------CATGGATAATCAGAA--ACT---------TAGTGTTGTGT-CTG
gi|48693                      :   TTATCCTATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------TAATATCGTGT-CTGACT----------GCCTCAAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCATTATCC-------------CGTGGATAATCACAA--TCT---------CAATGTTGTGT-CTG
gi|48694                      :   TTATCCCGTGGATAAT------CACAA-----------TCT---------CAATGTTGTGT-CTGACC----------ACCTACTGCAGC----------------GGC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ATA---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48695                      :   TTATCACATTGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTATGT-CTGACCACATTCATTAGCCTCCNNNNNN----------------NNN----------NAA----TACC------T---G--TC-------ACCTTTATCA-------------CATAGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATTT-CTG
gi|48696                      :   TTATCCCATGAATAAT------CACAA-----------ACA---------CAATATC--------ACC----------GACTCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GA-------ATCTTTTTTA-------------CATTAATAATCACAA--ACT---------CAATATCCTGT-CTG
gi|48697                      :    TATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAACATCATGT-CTGACC----------ACCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACA------T---G--GC-------ATCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48698                      :    TATCAAATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAACATCATGT-CTGACC----------ACCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACA------T---G--GC-------ATCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48699                      :      TTACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-TTGACC----------ACCTCCTGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------AGCTATATCA-------------CATAGACAATTACAAGCANN---------NNNNNNNNTGC-CTG
gi|48700                      :        ACCTGGNNNNN------NNNNN-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------GATGGATAATCACAA--ATT---------CAGTATCGAGT-CTG
gi|48701                      :         CATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-CTGACC----------ATCTCCTGTAGC----------------ATC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------AGCTTTATCA-------------CAAGGACAACCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48702                      :                 AT------CACA--------------T---------GGATATTGTGC-CTAACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---T--GC-------ATCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--GCA---------CAGTATCATGT-ATG
gi|48703                      :                                                               T-CTGACC----------TCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---A--GC-------ACCATTATCC-------------CATGAATAATCACAA--ACA---------CAATAT
gi|48704                      :                                                                                                                            A----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGAATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG


blockSeqs                     :                   CACAAG     TAGCATGTATA   GANNNNNNN                  ACATTCATTA        T   NNNNNNNNNNAGTAAT   CAATACCTGG   TTCC    AAAACG CTT     CACAAAT          CATNNNNNNNNNN                    GANNNNNNN
blockSeqs                     :                   .          .             AAGCA                      .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 G   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 A   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 A   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 A   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 A   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 A   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 N   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 C   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 T   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                   .          .             .                          .                 .   .                  .            .       .      .       .                .                                .        
blockSeqs                     :                                                                       .                 .   .                  .            .       .      .       .                .                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                             .       .      .       .                                                          


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGCAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
finalCons                     : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGCAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG





Alignments
lowQualScore                  :                   222222     33333333333   444444444           0      3333333333        1   4444444444444444   3333333333   1111    222222 111 00  2222222          3333333333333               11   222222222           0   
lowQualScore                  :                   ......     ...........   .........           .      ..........        .   ................   ..........   ....    ...... ... ..  .......          .............               ..   .........           .   
lowQualScore                  :                   111111     44444444444   666666666           7      1111111111        6   6666666666666666   1111111111   5555    000000 222 99  2222222          9999999999999               00   999999999           8   
consensus                     : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGCAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
Reference ( family-446 )      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGCAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48647                      : CTTTATCACATAGACAAT------CACAA-----------ATT---------CAGTATCGTGT-GTAACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---A--GA-------ACTTTTATTA-------------CATGGATAATCGCAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48648                      : CTTTATCACATGAATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------GCATCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAGTATTGTGT-CTG
gi|48649                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-CTGACT----------GCCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGACAATCAAAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48650                      : CTTTATCAAATAGACAAT------CACAA-----------ATT---------CAGTATCGTGT-GTAACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---T--AA-------ACTTTTATTA-------------CATGGATAATCGCAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48651                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACT----------GCCTCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CATTGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48652                      : CTTTATCACACGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------T-C----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCATTATCC-------------TATGGATAATCACAA--ACT---------TAATATCGTGT-CTG
gi|48653                      : CTTTATCACATAGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTATTT-CTGACC----------ACATTGATTAGC----------------CTC----------CAA----TACC------T---G--AC-------ACCTTTATCA-------------CACGGATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48654                      : CTTTATCACACGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATTGTCT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--TC-------ACCGTTATCA-------------CATTGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATGT-CTG
gi|48655                      : CTTTATCATATAGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGTACTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------TAC----------CAG----TGCC------T---G--GC-------ACAATTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACC---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48656                      : CTTTATCACATGGACAAT------CAAAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACT----------GCCTCCAGTAGT----------------GAC----------AAA----TGCC------T---G--GC-------ACGTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-ATG
gi|48657                      : CTTTATCACATGGGTAAT------CACAA-----------ACA---------CAATATCATGT-ATGGCA----------GTCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------AACTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAGTATCTTGT-CTG
gi|48658                      : CTTTATCAGATGGATAAT------CACAA-----------ATT---------CAGTATCGAGT-CTGACC----------ACCTCCAGGAGC----------------GAC----------CAA----TGCC------T---C--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48659                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTGTGT-CTGGTC----------GACCCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGAC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATTACAA--ACA---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48660                      : CTTTATTACATGGACAAT------CACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-ATGACC----------GCCTCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTAATTA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAA-ATCGTGT-CTG
gi|48661                      : CTTTATCAAATAGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTATGT-CTGACC----------ATATTCATTCGC----------------CTC----------AAA----TACC------T---G--AC-------ACCTTTATCA-------------CACGGATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTCT-CTG
gi|48662                      : CTTAATTACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAA-ATCGTGT-CTGAAT----------GCCTCAACCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48663                      : CTTTTTTACATTAATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCCTGT-CTGACC----------ACCTCCTGTAGC----------------CAC----------AAA----TGCC------T---G--TC-------ACCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48664                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC----------GTCTCCAGAAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------C---G--TC-------ACCTTTATCA-------------CATAGACAATCACAA--ATT---------CAGTATCGTGT-
gi|48665                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ATA---------CAATATTGTGT-CTGACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---T--GC-------AGCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--GCA---------CAATAGCATGT-
gi|48666                      : CTTTATTACATTGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-CTGACG----------ACCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CATGGACAATCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48667                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC----------GTCTCCAGAAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------G---G--TC-------ACCTTTATCA-------------AATAGACAATCACAA--ATT---------CAGTATCGTGT-
gi|48668                      : CTTTATAATATGGACACT------CACAA------------CT---------CAATAGCATGT-ATGAAC----------GCCTCTAGTAGC----------------CTC----------CAG----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACA---------CAGTATCTTGT-CTG
gi|48669                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACA---------CAGTATCTTGT-CTGACT----------GACTTCAGAAAT----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GG-------ACCTTTATCA-------------CATGGGTAATCACAA--ACA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48670                      : CTTTATCACAAGGACAAC------CACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-ATGACT----------GCCTCCAGCAAC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ATTTATATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAACATCATGT-CTG
gi|48671                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTTGCNNNNNNNNNNAGTAATCAT----------CAA----TGCC------T---A--GC-------ACCATTATCC-------------CATGGATAATCACAA--ACA---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48672                      : CTTCATCACATGGATAAA------CACAA------------CA---------CAATATTATGT-CTGACC----------GCA-CCTGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------TATGGACAATCACAA--ACT---------TAATATTGTGT-CTG
gi|48673                      : CTTCATCAGATGGATAAC------CACAA-----------ACA---------CAATATTGTGT-TTTACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------TCCTTTATCACATNNNNNNNNNNCATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48674                      : CTTTATCACATGGACAAC------CACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-ATGACG----------GCCTCTAGCAAC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ATTTATATCA-------------AATGGATAATCACAA--ACT---------CAACATCATGT-CTG
gi|48675                      : CTATATCACATAGACAAT------TACAA-----------GCA---------CAATATCATGT-CTGAC-----------GCCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACA------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CGT--ATAATCACAA--ACT---------GAATATCATGT-CTG
gi|48676                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTGTGT-CTGNNN----------NNNNNNN--------------------------------------------C------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAGTATTGTGT-CTG
gi|48677                      : CTTTATCACATGGATAAT------TACAA-----------ACA---------CAATATTGTGT-CTGATC----------ATCTCCTGTAGC----------------CTC----------AGA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATAA-------------TATGGACACTCAC-A--ACT---------CAATAGCATGT-ATG
gi|48678                      : CTTCTTCACATGGATAAT------CAGAA-----------ACT---------TAGTGTTGTGT-CTGACC----------GCA-CCAGACGC----------------T-C----------CAA----TACC------TCTTG--GC----------TTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-CTG
gi|48679                      : CTTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATCTTGT-CTGACT----------GACTTCAGCAAT----------------CAC----------CAA----TGCC------T---GTAGCCACAAATGCCTTCATCA-------------CATGGATAAACAC-A--ACA---------CAATATTATGT-CTG
gi|48680                      : CTTTATCACATGGACAAT------CACAA-----------GCA---------CAGTATCATGT-ATGACC----------GCCTCCAGCTAC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ATCTATATCA-------------CATGGATAATCACAA--ACA---------CAA
gi|48681                      : CTTCATCACATGGATAAC------TACAA-----------ACT---------CAATAGTGTGT-CTAACC----------GCCTCCAGCAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACC-TTATCA-------------CATGGATA
gi|48682                      : CTTTATTACGT--ATAAT------CACAA-----------ACT---------GAATATCATGT-CTGACC----------GCCTCAAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATTA-------------CGT--ATAATCACAA--ACTGANNNNNNNNNNTATCATGT-CTG
gi|48683                      : CTTTATTACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC-----------------------------------------------TGGNNNNNNNNNN--ACT---------CAATATCGTGT-CTG
gi|48684                      : CTTTATCACATGGACAATCACAAGCACAATAGCATGTATAACCAAGCA----CAATAGCATGT-ATAACC----------ACCTCTAGCAAC----------------AAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ATCTATTTTA-------------CATGGATAATCACAA--ACT---------CAATATCATGT-TTG
gi|48685                      : CTTTATCATATGGACAAT------CACAA-----------ACT---------TAATATTGTGT-CTGACC----------TCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---A--GC-------ACC
gi|48686                      : CTATATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACA---------CAANNNNNNNN-NN----------------CTCCA------------------------------------A----TGCC------T---G--GC-------AGCTTTATCA-------------CATGGACAACCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48687                      : CTTTATTACGT--ATAAT------CACAA-----------ACTGANNNNNNNNNNTATCATGT-CTGACC----------GCCTCTAGAAAC----------------CACCAATACCTGGCAA----TGCC------T---G--GC-------ATCTATATCA-------------CCTGGATAACTAGAG--GCT---------
gi|48688                      :  TTTATTACATGGATAAT------CGCAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TACC------T---G--TC-------ACCTTTATCA-------------AATAGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATGT-CTG
gi|48689                      :  TTTATTACATGGATAAT------CGCAA-----------ACT---------CAATATTGTGT-CTGACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CAC----------AAA----TGCC------T---G--TC-------ACCTTCATCA-------------GATGGATAACCACAA--ACA---------CAATATTGTGT-TT
gi|48690                      :  TTTATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-ATGACC----------GCCTCCAGCTAC----------------CAT----------CAATTCCTGCCAAAACGT---G--GC-------ACCTTTATCA-------------TATAGATAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGTACTG
gi|48691                      :   TTATCACATGGACAAT------CACAA-----------ACC---------CAATATTGTGT-CTGACT----------GCCTCCTGTAGC----------------CAC----------AAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTCATCA-------------CATGGATAACTACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CT
gi|48692                      :   TTATCCCATGGATAAT------CACAA-----------ACA---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--TC-------ACCTTCTTCA-------------CATGGATAATCAGAA--ACT---------TAGTGTTGTGT-CTG
gi|48693                      :   TTATCCTATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------TAATATCGTGT-CTGACT----------GCCTCAAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCATTATCC-------------CGTGGATAATCACAA--TCT---------CAATGTTGTGT-CTG
gi|48694                      :   TTATCCCGTGGATAAT------CACAA-----------TCT---------CAATGTTGTGT-CTGACC----------ACCTACTGCAGC----------------GGC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGGATAATCACAA--ATA---------CAATATTGTGT-CTG
gi|48695                      :   TTATCACATTGACAAT------CACAA-----------ACT---------CAGTATTATGT-CTGACCACATTCATTAGCCTCCNNNNNN----------------NNN----------NAA----TACC------T---G--TC-------ACCTTTATCA-------------CATAGACAATCACAA--ACT---------CAGTATTATTT-CTG
gi|48696                      :   TTATCCCATGAATAAT------CACAA-----------ACA---------CAATATC--------ACC----------GACTCCAGCAAC----------------CAC----------CAA----TGCC------T---G--GA-------ATCTTTTTTA-------------CATTAATAATCACAA--ACT---------CAATATCCTGT-CTG
gi|48697                      :    TATCACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAACATCATGT-CTGACC----------ACCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACA------T---G--GC-------ATCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48698                      :    TATCAAATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAACATCATGT-CTGACC----------ACCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACA------T---G--GC-------ATCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--ACT---------CAATAGTGTGT-CTG
gi|48699                      :      TTACATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-TTGACC----------ACCTCCTGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------AGCTATATCA-------------CATAGACAATTACAAGCANN---------NNNNNNNNTGC-CTG
gi|48700                      :        ACCTGGNNNNN------NNNNN-----------ACT---------CAATATCGTGT-CTGACC----------GCCTCTAGCAAC----------------CAC----------CAA----TACC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------GATGGATAATCACAA--ATT---------CAGTATCGAGT-CTG
gi|48701                      :         CATGGATAAT------CACAA-----------ACT---------CAATATCATGT-CTGACC----------ATCTCCTGTAGC----------------ATC----------CAA----TGCC------T---G--GC-------AGCTTTATCA-------------CAAGGACAACCACAA--GCA---------CAATATCATGT-ATG
gi|48702                      :                 AT------CACA--------------T---------GGATATTGTGC-CTAACC----------ACCTCCAGTAGC----------------CTC----------CAA----TGCC------T---T--GC-------ATCTTTATCA-------------CATGGACAATCACAA--GCA---------CAGTATCATGT-ATG
gi|48703                      :                                                               T-CTGACC----------TCCTCCAGTAGC----------------CAT----------CAA----TGCC------T---A--GC-------ACCATTATCC-------------CATGAATAATCACAA--ACA---------CAATAT
gi|48704                      :                                                                                                                            A----TGCC------T---G--GC-------ACCTTTATCA-------------CATGAATAATCACAA--ACT---------CAATATTGTGT-CTG