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Reference ( gi|118142 )       :  GTCAATTGTTGA-CAAAACGTTTCAT----GTCTTT-----AAT----G--T--A-TTATTG--TAC-TTGTGT-AA----AT--AT-A------AAT----G-TATTTG-TGT-CA----CT---GGTA---T-AT-G--T-A------CTC---TTA-C-C---AA-A-TAA-TA-A--C---A-CT-CG--T--AT----AC-TTA-AG--GG----AT-G-AAA-A--CGG-C----G--TGTGG-AAC-GAAA-A--AGACGAAG---TCGTTCA--TC--AGTA-T-A----------TATA-GA---A---CA--TTGCAT-----------AAAGT--AGTGCT---CGGCGT-CT-TCTTTTT------CATTAC-CGC-A-T-CC-GTC-----G--CATCTTGCA-------T-CAA------------T-T---G---T-T--A-AA---G--AATT----T------AAA-----TAT-TT---------ATC-A-AA------C-TTAAGATGACTACATC-----CGTTTATCAAA--CGAGCGTGGA--AAACTGATAA---A--ATT-T--GAC---TACCAG-CT-AGAT-AA--TAC-GAT--GGTAC-T--AT-T--------TG--CGT------TTTA-AA-AT--AC----A--TGTTT-G-T-TA-TA----G-G--A---GT---TT---TA--A---AC-ATTTATAA---AGTCTCTAAGTTACG-A-ATG-TACTCG-GGAAGTGTATTCCA--A----ATAG---ATACGCAT
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gi|118140                     :  GTCAGTTGTTGA-CAAAACGTTTCGT----GTTTTT-----AAT----GAATGAA-TTAATG--TAC-CTGTGT-AC----AT--TT-A------
gi|118138                     : aGTTAATTAATAT-CAAATCGTTTTGT----GTCTTT-----GAT----A--A--A-TTGTTG--CAC-AGATGT-GA----AT--AT-A------AAT----G-AGTTTT-CAT-CG----TC---AGTA---T-AA-G--T-G------TCT---TTA-C-C---GA-A-CA
gi|118141                     : aGTCAATTATTGA-CAAAATGTTTTGT----GCTTTT-----AAT----G--A--A-TTGTTA--T
gi|118126                     :  aTCAGTTGTTGA-CAAAACGTATC------GTCTTT-----AAT----G--A--C-TTGTTG--TAC-CTGTGT-AA----AT--AT-ATATATAAGT----G-TATTTG-TAT-CC----CT---GGTA---T-AT-G--C-A------ATC---TTA-C-C---AA-A-TAA-AA-G--C---G-CT-CA--T--GT----AC-TTA-AG--CG----AT-G-AAA-A--CGG-C----G--TGTGG-ATC-GAAA-A--CGACGTAG---TCGTTCA--TC--AGTA-T-A----------TATA-GG---A---CA--TTGCAT-----------AAAGT--AGTGTT---CGGCGT-CT-TCTTTTT------CATTAC-CAC-A---CC-GTC-----G--CATCTTGCA-------T-CAA------------G-T---G---T-T--A-AA---G--AATT----T------AAA-----CAC-GC---------ATC-A-AA------C-TTAAGTTGACTACAAC-----TGTT
gi|118131                     : aaTCAATTGTTGA-CAAAACGTTTCGT----GTCTTT-----AAT----G--T--A-TTGTTG--TAC-TTGTGT-AA----AT--AT-A------AAT----G-TATTTG-TGT-CA----CT---GGTA---T-AT-G--T-A------CTC---TTA-C-C---AA-A-TAA-AA-A--C---A-CT-CG--T--GT----AC-TTA-AG--GG----AT-G-AAA-A--CGG-C----A--CGTGG-AAC-GAAA-A--AGACGgctaagagagaaagagctg
gi|118145                     : aaTCTATTGTTTATCAAAACGTTTAGT----GTCTTT-----AAT----G--T--A-AGTTTG--GACATTGT-T-AA----CT--AT-ATT----AAT----A-TTTTCATTGT-------CT---GAGA---T-ATCA--TCA------CTC-------C-C---GT-G-TAA-TA-A--G---G-TT-TT--A--AC----AC-TTA-AA--GG----AA-G-ACG-A--TGA-C----G--TGTAG-CAT-GAAA-G--AGACGAAG---TCGATCAT-TT--AAAA-A-A----------GA-A-GA---A---CA--TTGCAT-----------GAAAT--AGTGTT---CGGCGT-CC-TCTTTTT------CATGCC-CAC-A-T-TT-TTC-----A--CAAGTTGAAAATAGTTT-TAAT-----------T-T---G---T-T--A-AC---A--AA------T------AAA---------TC---------AT----AA------T-TT-AGGTTACTACAAC-----CATTTCTTAAA--CGTGCATGAA--AAATAGAT-----A--ATT-TACGAG---GGCCTG-CT-AAA--AA--AAC--AT--AGTAA-T--ATGG--------TG--GAT------TT---AA-AC--AG----A--TGCT----T-CA-TA----A-GCTG---GTG--TT---TG--A---AT-GATGATAG---AGTTTCAGAATTGCG-T-AAG-TATTCC-GGAAGACAATTCCA--A----GAAG---AAATACAT
gi|118146                     :   TCTATTCTTTATCAAAACGTTTAGT----GTCTTT-----AAT----A--T--A-AGTTTG--GACATTGT-T-AA----ATTTAT-AC-----AAC----AATATTTT-CAT-CG----TTT--GAAA---T-AA-T--C-AT-----CTC---TC--C-C---GT-G-TAA-CA-G--G---G-TT-TT--A--AC----AC-TTA-AA--GG----AT-G-AAG-G--TGA-T----G--TGTAG-CAT-GAAA-G--AGACGAAG---TCGATCGC-TT--AAAA-A-A----------GA-A-GG---A---CA--TTGCAT-----------GAAAT--AGTGTT---CGGCTT-CC-TCTTTTT------CATGCC-CAC-A-T-TT-TTC-----A--CAAGTTAAA-------TATAATTTTAGT-----T-T---G---T-T--G-AC---A--AA------T------AAA---------TT---------AT--A-A---------TTAAGGTTACTGCAAC-----CATTTCTTAAA--CATGCATGAA--AAATAGAT-----A--ATT-TACGAG---GACCTG-TT-AAAT-AA--AAA-CAT--GGTAT-T---T-TGG------TG--GGT------TT---AA-AC--AA----A--TGAT----T-CA-TAAGCTG-G--C---G----TT---TA--A---AT-GATGGTAG---AGTTTCAGAATCGTG-T-AAG-TGTTCC-GGAAGATTATTC
gi|118147                     :   TCTATTCTTTATCAAAACGTTTAGT----GTCTTT-----AAT----A--T--A-AGTTTG--GACATTGT-T-AA----AT--AC-AGC----AA-------TATTTT-CAT-CGT---CT---GAAA---T-AT----C-A------TCT---TTC-C-C---GT-G-TAA-CA-G--G---G-TT-TT--TA-AC----AC-TTA-CA--GG----AT-G-AAG-G--TGG-C----G--TGTAG-CAT-GAAA-G--AGACAAAGCGATCGTTTA------AA-A-A-A----------GA-A-GG---A---CA--TTGCAT-----------GAAAT--AGTGTT---TGGCAT-CC-TCTCTTT------CATGCC-CAC-A-T-TT-TTC-----A--CAAGTTGAA-------TACAA------------T-T-------T-T------------AATT----TGTTGACAAA-----TA---A---------ATC-A-TA------A-TTAAGGTTACTGTAAC-----CATTTCTTAAA--CGTGCATGAA--AAATAGATAA---
gi|118148                     :   TCAGTTGTTGA-TAAAACGTTTTGT----CTCTTT-----AAT----G-----A---ATTG--TAC-CTGTGT-AA----AT--AT-C------AAT----A-TATTTT-CGT-CA----CT---GGTAT--T-AT-G--T-T------CTCT--TTA-C-C---AA-A-TAA-AA-G--C---G-CA-CC--T--GT--------------------------AAA-A--CGG-A----G--TGTAG-AAC-GAAtttacgaagacctgtcaaat
gi|118149                     :   TCTATTGTTTATCAAAACGTTTAGT----GTCTTT-----AATAAAAG--T-------TTG--GACATTGT-T-AA----AT--AT-A------ACA----C-TATTTT-CAT-CGT---CT---GAAA---T-AT----C-AT-----CTC---TC--C-C---GT-G-TAA-CA-G--G---G-TT-TT--A--AC----AC-T-A-AA--GG----AT-G-AAG-G--TGA-C----A--TGTAG-CAT-GAAA-G--AGACGAAG---TCGATTAT-TT--AAAA-A-A----------GA-A-GG---A---CA--TTGCAT-----------GAAAT--AGTGTT---CGGCAT-CC-TCTTTTT------CATGCC-CAC-A-T-
gi|118150                     :   TCTATTCTTTATCAAAATGTTTAGT----GTCTTT-----AAT----A--T--A-AGTTTG--GACTTTGT-T-AA----AT--AC-AGC----AAT----A-TTTTCA-TCT-T-----CT---GAAA---T-ATCA--T--------CTC---TC--C-C---GT-G-TAA-CA-G--G---G-TT-TT--A--AC----AC-TTA-AA--GG----AT-G-AAG-G--TGG-C----A--TGTAG-CAT-GAAA-G--AGACGAAG---TCG---A--TC--GCTG-A-A----------AAAA-GAAGCA---CA--TTGCAT-----------GAAGT--AG
gi|118127                     :   TCAGTTGTTGA-CAAAAGGTTTC------GTCTTT-----AAT----G--A--C-TTGTTG--TAC-CTGTGT-AAATATAT--AT-A------AGT----G-TATTTG-TAT-
gi|118151                     :    aaATTGTTTATCAAAATGTTT-A-----GTCTTT-----AAT----G--T--A-AGTTTG--GACATTGTTA-AA----AT--AT-A------A-T----T-T-TTTT-TTT-CATTGTCT---GAGA---T-ATCA--TCA------CTC-------C-C---GT-G-TAA-TA-A--G---G-TT-TT--A--AC----AT-TTA-AG--TG----AT-G-AAG-A--TGA-C----G--TGTAG-CAT-GAAA-G--GGACGA-----TCATTTA------AAAA-A-A----------GA-A-GG---A---CA--TTGCAT-----------GAAAT--AGTGTT---CGGCGT-CC-TCTTTTT------CAT-----GC-A--------C-----A--CATTCTCCA---------CAA------------------G---T-TGAA-AA---T--AGTT----T------TAA-----TTTGTTAACACATAAATC-ATAA------T-TTAGGCT-ACTGCAAC-----CATTTCTTAAA--CG
gi|118152                     :      ATTGTTTATCAAAACGTTTAGT----GTCTTT-----AAT----A--T--A-GT-TTGGATA--TTGT-T-AA----AT--AT-A------ACA----A-TATTT----T-CA----TTTTGGGTA---T-CA-A--C-A------CT--------C-C---AGTG-TAT-CA-A--G---G-CT-TT--A--AC----AC-TTA-AA--AG----AT-G-AAG-A--TGA-C----G--TGTAG-CAT-GAAA-G--AGACAAAG---TAGATCA--T
gi|118153                     :       TTGTTAATCAAAACATTTAGT----GTCTTT-----AAC----A--C--A-AGTTTG--GATATTGT-T-AA----AT--TA-A------AAA----A-TATTT----T-CATTGTCT---GAGA---T-AT-TATT-A------CTC---T-----C---AT-G-TAC-TGCA--C---AGCT-CT--A--AT----GC-T-A-AA--GG----AT-G-AAG-G--TGA-C----A--TGTAG-AAT-GAAA-C--AGACAAAG---TCGATCA--TT--AAAA-C-A-----------ATA-GG---A---CA--TTTCTT-----------AAAAT--CGTGTT---CGGCAT-CT-TCTTTTT------CATGTC-CAC-A-T-TT-TTC-----A--CATGTTGAA-------T-
gi|118154                     :              -CAAATCATTTTGA----GTCTTT-----AAT----G--A--A-TTGCTG--CAC-AGATGT-AA----AT--AT-A------AAT----G-AGTTTT-CAT-CG----TC---AGTA---T-AA-G--G-G------TCT---TTA-C-C---GA----------------------TG-----------AC-TGA-GA--GG----AT-G-AAA-T--CGA-C----G--CGTGC-CTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCA--TT--TGAG-A-A----------TATA-AT---A---CA--TTTCAT-----------AAAAT--AATGTT---CGACGT-CT-TTTTTTT------CGTTAC-CAC-A-G-CC---C-----GGACATCTAGAA-------T-ATG------------T-T---G---T-T--A-GT---C--GATT----T------GTA-----AAT-TT---------ATCAA-AA------C-CTAA-ATTACTACACC-----GATTTCTAATG--CGTGCGTGTATTAAA--GATAA---C--TTT-C--TAT---TTCCAG-TA-AGAT-AA--TACTGA---GGCAC-T--GG-T--------TG--TAA------GTTA-AA-GA--AA----T--TGGTG-A-C-TA-AA----G-T--AC--GT---TT---GA--AGG-AC-ATTAATGA------TTCTGAGCAACT-C-ATG-TGTTGA-GGAAGGGTGTTCCAATA----AGAA---ATACACataagtttaa
gi|118156                     :              -CAAAACGTTTGAT----GTCTT-------------G--T-------TTG--CAC-ATGGTT-AA----AT--AT-AT-----AAT----T-TTTTTC-T-T-C-----TT---AGGA---A-AT-A--T-C------GTC---ACATC-C---AC-G-TAT-CA-A--G---G-C---G--TTAAC----AA-TCA-AA--GG----ATTA-AAA-A--TGG-C----G--TGTAG-TAC-GAAA-A--AGACAAAT---TTGATCA--T--------T-T----------TATA-GG---A---CA--TTGCAT-----------GAAAA--AGTGTT---CGGCGT-CC-TCTTTTT------CATGCT-CAC-A-A-AT-TTC-----A--CATATTGAA-------T-AAA------------A-T---T---T-T--A-A
gi|118155                     :              -CGAATCGCTTTGT----GTCTTT-----GGT----A--A--A-TTGTTG--TAC-AGACGT-GA----AA--AG-A------AAT----G-AGTTTT-CGT-CG----TT---AGTA---T-AG-G--T-A------TCT---TTA-T-CCAAAA-A-AAA-TA-A--C--------TG--TG-ATG---AC-TGA-GA--TG----AT-A-AAA-T--CGC-C----G--TGTAG-GTC-GAAA-A--G-----AG---TTGTTCG--TT--TG-A-T-A-----------ATA--A---A---CAAATTGCAT-----------GAAAT--AGTGTT---CGACGT-CT-TCATTTT------CGCTGA-CGCAA-A-CC-G-------GA-CATCTAGAA-------T----------------T-T---G---T-T--ATAAGTCG--ACTTG---T------AAA-----TGT-AT---------ATA-A-AG------C-TCA--GTTACTACACCTAGTTCGCTT-TCA----------TGTT--AAGATAATGG---GTTATT-T--CAC---TA--------AGAT-GA--CACTGA---GGTAC-T--GG-C--------TG--TAC------GTCA-AA-G-------------GTTG-GCT-TA-CA----T-A--C---GT---TT---AA--AAG-AC-ATTTATGA------TTTTAAGCAACG-T-ATA-TG-TCGAGGAAGGGTGTTCCA--ATC--AGAA---ATACACtttgtttagaaacaaatcataatttaggttactgcgaccatgaataattgataagtcacgaggacttgttaagtaaaagcatggtatctggcgattttaaa
gi|118159                     :                AAAACGTTTGGTTGGTGTCCTT-----ACT----A--A--AATTCTTA---AC-ATGAGT-TA----AT--A--A------AAT----GATACTAG-TTTGCT----CT---G-TA---A-GC-G--T-A------TCC---TGG-C-C---AA-A-TAA--A-A--CTGCA-TT-----T--AC----AC-T--------G----AT-A-TAATA--CAA-TTATAG--TGAGC-TAC-GTAA-G--AGA---AG---TCGTTCATTTC--GATA---A----------TAT--GG---A---CA--TTGCAT-----------AAAAT--AATGTT---CGGTCT-AT-TCTCTTT------CGTGAT-CAC-
gi|118160                     :                 AAACGTTTGGT----GTGCAT-----AAT----A--A--A-TATTTG--TGT-TTCTTT-GA----AA--AT-G------AAT----T-CGTTT----T-CA----------GCA---T-CT-G--T-AAGAAGATTA---TTC-C-C---GA-A-CAA-TA-G--T------T-TG--TTTGT----GC-TCA-AG--GG----AT-G-GAA-A--ATT-C----T--TGTAG---T-CAAA-A--A--C-AGG---TTGT----------GTT-T-T----------TGTA-AA---A---CG--TAGCGTTTACACTTAAAAAAAT--AGTGCT---CTGCAT-CT-TCAATGT------CACTAC-CAC-A------GTC-----A--CATGTAGAG-------T-T--------------T-T---G---TCT--C-AA---GT-GATT----T------ATA-----AAC-AA---------ATCTG-AA------T-TTAA-ATTACTACATT-----GATTTCTAATT--CGAGCATGGT--ATATTGATGA---A--ATTCT--TAC----ACCAC-TT-AAAT-AA--TAT-TTT--GGGAC-A--AA-T--------GG--TGG------TTTA-AA-CTGAAC----A--TATAT-G-
gi|118161                     :                     GTTTAGT----GTCTTT-----AAT----A--T--A-AGTTTG--GACATTGT-T-AA----AT--AT-A------ACA----A-TATTT----T-CATTGTCT---GAGA---T-AT-AATC-A------CTC-------C-C---GT-G-TAA-CA-A--G---G-TT-TA-----AC----AC-TTA-AA--GA----AT-G-ACG-A--TGA-C----G--TGTAG-TTT-GAAA-G--AGACGAAG---TCAATCAT-TT--AAAA-A-A----------GA-A-GG---A---CA--TTGCAT-----------GAAAT--AGTGTT---CAGATT-CC-TCTTTTT------CAT-----GC-C-T-TT-TTT-----A--TTTTTTGTAAGT----T-CAATATAATTTTAATT-T---G---C-T--A-AC---A--AA------T------AAA-----TA-------------AT----AA------T-TTAGGCT-ACTGCAAC-----CATTTCTTAAA--TGTGCAT--A--AAAT--ATAG---A------T--GAT---T-CAAGATT-AAAT-AA--T
gi|118163                     :                                                             TTGA-TAC-CTTTGT-AA----CT--AT-A------AAT----G-TGTTTT-TGT-CA----CT---GGTA---T-GT-G--T-A------CTCAGTTTA-C-C---AA-A-TAA-AA-G--C---A-CA-CAATT--GT----TC-TTG-AG--GG----GT-G-GAA-A--CG
gi|118164                     :                                                             TTG--TAT-CTGAAT-AA----AT--AT-A------CAT----G-TATTTT-CGT-CA----CC---GGTA---TGGT-G----A------CTC---TTC-C-C---AA-A-TAA-AA-AAGT---G-CA-CG--T--GT----AC-ATATAG--GG----A
gi|118162                     :                                                             TTG--TAC-TTGGAT-AA----AT--AT-A------AAT----G-TATTTG-TGT-CA----CT---
gi|118165                     :                                                                   atggTATGT-AA----AT--ATGA------AAT----G-TACTTG-TAT-CA----CT---GTTA---T-AT-G--T-A------CTT---TAG-C-C---AA-A-
gi|118157                     :                                                                               ----AT--AT-A------AAT----G-CGTTTT-CAT-CG----CT---AGCA---T-AA-G--T-T------TTG---TTA-T-C---GG-A-AAG-TA-A-----------TG--T--ATGACAAC-TGA-GA--GG----AT-G-AAA-T--CGA-T----A--TGCGG-CTA-GAAA-A--AGTCGGAT---TATTTCG--CC--TG-------------------A-AA---A-----------AT-----------AAAAT--GATGTT---GAACAT-TT-TCATTTT------CGTTGC-CACAA-C-CC-G-G-----G--AATTTAGAA-------T-CTG------------C-T---G---T------AC---GTCGGTT----T------GTA-----AAT-GT---------ATC-G-GA------CGTTAA-ATTATTACACC-----CATTTTTCATA--TGTGCGTTTA------TTCTAA---C--TTT-C--TAT---TTCTAG-TT-AGAT-AA---AC-TAA--GGCAC-T--GA-T--------TG--TAT------GTT---A-AT--GC----AACTG---------A-TA----G-G----------------TA--AAT-AC-GTTTATAA---AAT
gi|118167                     :                                                                                           caaatcactttgagtctttgacaattgctccaccgacatgc---T-AC-G--T-A------ATC---TTA-C-C---AA-A-TAA-AA-G--C---A-CT-CG--T--GG----AT-TTA-AA--GG----AT-G-AAA---------------------------------------AAG---TCCTTCA--TC--AGTA-T-A----------TATA-GG---A---CA--TTGCAT-----------AAA--------------AGAGT-CT-TCTTTTT------CTTTAG-CAC-A-T-CC-GTC-----G--CATCTTataaacattaatgattctgacaacgtatgtgttgatgcagagtgttccaatgagacataca
gi|118168                     :                                                                                                                                          T-G--T-A-------TG---TTG-C-C---AA-A-AAAACA-A--C---AACTGCA--T--TT----ACACTA-AGAAGGTGTAAT-G-AA---------C----G--TGAGA-CAC-GAAA-A--AGAAGAAG---TCCTTCA--TT--TTTA-T-A-----------ATA-GGG--A---CA--TTGCAT-----------AA
gi|118158                     :                                                                                                                                                                A-C-C---AA-G-TAA-CA----T---A-GT-GT--T--AC----AG-CTA-AGA-GG----AT-G-CAA-C--CTA-T----G--AGTTG-CTC-TGAA-G--AGATGAAG---TCGTTCA--TT--TCTA-T-A----------TCTA-TT---A---CA--TTGAAA-----------AAAA---AATGTT---CAGTAT-CC-TCTCTTCTCGAGCCACAAT-CGC-A-A-GC-TTC---------ATTTTCTA-------C-TAA------------G-T---GA--T-T--A-GA---A--AAC------------AAA-----TCT------------------GA------T-TTGAAGTCACTACATT-----CATTT--CGAAGTCGAGCAAGGA--TAACGGA--A---A--ATT----GACGTGTACCAA-CT-AGAT-AA--TAT-GAT--GGAAT-TTCAC-T--------TC--TG--------TTG-AA-AT--G-----G--GATTT-ACT-TA-TA----A-C--A---TT---TT---TA--A---A--ATTttcatacctgcacaactcacacactgaatcgagttgtaagttaacgaaaacgtcattatttaagttattacaactgaaacgagcatgtagtaatgacatacgcgcatacacggttagataatac
gi|118122                     :                                                                                                  aaaacgactggtatcttttatgaacttttgaacctccaagcataatatggtattgtcctcttctgaaaaaccttgacg-TA-A--C---A-CT-TG-----AT----GC---A-AG--------AT-G--------CGA-C----GGATGTGGTAAT-GAAA-A--AGAAGACG---CCG----------AGTACT-ACTT-------TATG-CA---A---TG--TTCTAT-----------ATA-T--ACTGATTAACGACTT-CG-TCTTTTT------CGTT-C-CAC-A-CGCC-GTa
gi|118169                     :                                                  agtcaattgttgacaaaacgtttcgtgtctttaatgcattgttgtacttgtgtaaatataaatatatttgctacacttgtatatgtacttttaccaaataaaaacactcgtgtacttaagggatgaaaA-G--C---A-CT-CG--T--GT----AC-TTA-AT--GG----AT-G-AAA-A--CGC-C----G--TGGAG-AAC-GAAA-A--ACACGAAG---TTGTTCA--TC--AGTA-T-A----------CATA-GA---A---CA--TTGCAT-----------ATAGT--AGTGCT---CGGTGT-CT-TCTTTTT------CATTAC-CAC-A-T-CC-GTG-----G--CGTCTTGCA-------T-CAA------------G-T---GT--T-T--T-AA---G--AATT----T------TAA-----AAA-GT---------ATC-A-AA------C-TTAAGGTGACTGCATC-----CGTTTCTCAAA--CGAGCGTGGA--GAACTGATAA---A--ATT-C--GAC---TACTAG-TT-AGAT-AA--TAC-GAT--GGTAC-C--AT-T--------TG--CGT------TTTA-AA-AT--AC----A--TGTTT-G-T-TA-TG----T-G--T---GG---TT---TACGA---AC-A--GATAA---CGTCTCTGAGATAAA-A-ATATTACTCG-GGAAGTGTACTCCA--A----ATAG---ATACGCATaagaatttaaaaatgtttaaaagttaaggtgactacatccgtttttcaaacgagcgtagagaactgataaaattcgactaccagttagataatacgatggtaccatttgcgttttaaaatacatgtttgttatatgtgtcttaaaaaccgataaattctctgagttacgaatgtactcgggaagtgtattccaaatagatacgc
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Reference ( family-442 )      :                                                                                                                                           GTCAGTTGTTGA-CAAAACGTTTCGT----GTCTTT-----AATGNA-TTGTTG-TACNT-GTG-T--AA----AT--AT-A------A-AT----G-TATT--TN-CGTC-G-CT-GGTA---TAT-G--T-A------CTC---T----T----A-C-CGAA-TAANAA--CGC-TCG--T--G-T-AC--TTA-AG-GGAT-GAAA-ACGG-C----GTGTGGNAC-GAAA-A--AGACGAAG---TCGTTCA--TC--AGTA----------T-ATAT--AGG-A-C--ATTGCAT-----------AAAAT--AGTGTTCGGCGTCTTCT-TTT-TCGTT-A-C---CAC-ATCC-GTC-----G--CATCTTGNA---T-C-AAT----TG---T-TA--AA---G--AAT---T----TA---A-AAATNT-ATC-A-AAC-TTAAGGTNACTACANCCGTTTCTCAAA--CGNGCGTGGA--A-AACTGATAA---A--ATTC-G--AC---TA--C-CAGTT-AGAT-AA--TAC-GAT--GG-----CA--CTGNT---------TG--CG-T------TTTA-AA-AT--AC----A--T--GTTT-G-TT-ATANG--NGT---TT--------TA--A---AC-ATTNATAAAGTTTCTGAGCNACGNATG-TGCTCG-GGAAGNGTATTCCA--A----ANAGATACGCAT
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gi|118133                     : agtcagttgttgacaaaacgattcgtgtctttaatatattgttgtacttgtgtaaatatgaatgtatttgtgtcactggtatatgtactcttaccaagtaaaagcactcgtgtactaaagggatgaaaacggcgtgtagaacgaaaatcg-CAAGTCGTTTTGA----GTCTTT-----AATGAA-TTGTTG-CACAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CGTC-G-TT-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGAAA--AGTATTA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TAGTTCG--TTTAAG-A------------ATAT--AAT-A-C--ATTTCAT-----------AAAAT--AATGTTCGACGTCTTCT-TTT-TCGTT-A-C---CACAACCC-G-G-----G--CATCTAGAA---T-C-TGT----TG---T-----AA---GTCGAT---G----T------AAATTG-ATCAA-AAC-CTAA-ATTACTACACCCGTTTCTAATG--CGTGCGTGTATTA-AA--GATAA---C--TTTC-T--AT---TT--C-CAGTA-ATAT-AA--TACTGA---GG-----CA--CTGGT---------TGTACG-T------T----AA-AG--AA----A------TTT-G-TG-ACTGA--AGTACGTT--------TA--AAAGAC-ATTTAT---GTTTCTGAGCAACGTATG-TGTTGA-GGAAGGGTGTTCCAATA----GGAAATACACgta
gi|118134                     :                                                                                                                                          agttaattaatat-CAAATCGTTTTGA----GTCTTT-----GATAAA-TTGCTG-CATAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CATC-A-TC-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGTAA--AGTATGA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCA--TT--TGAG----------A-ATAT--AAT-A-C--ATTTCAT-----------AAAAT--AATGTTCGACG
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gi|118137                     :                                                                                                                                                      a-CAAATCGTTTTGA----GTCTTT-----GATAAA-TTGCTG-CACAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CATC-G-TC-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGTAA--AGTATAA--T--G---AC--TGA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCA--TT--TG-A----------TCATAT--AAT-A-C--GTTTCAT-----------AAAAT--AATACT-GACGTCTTCG-TTT-TCGTT-A-C---CAC-Ata
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Reference ( family-442 )      :                                                                                                                                           GTCAGTTGTTGA-CAAAACGTTTCGT----GTCTTT-----AATG-AA-TTGTT---G-TACNT-GTG-T--AA----AT--AT-A------A-AT----G-TATT--TT-CGTC-G-CT-GGTA---TAT-G--T-A------CTC---T----T----A-C-CGAA-TAANAA--CGC-TCG--T--G-T-AC--TTA-AG-GGAT-GAAA-ACGG-C----GTGTGGCAC-GAAA-A--AGACGAAG---TCGTTCA-TT--AGTA----------T-A-TAT--A-G-G---A-C--ATTGCATAAAAT--AGTGTTCGGCGTCTTCT-TTT-TCGTT-A-C---CAC-ATCC-GTC-----G--CATCTTGNA---T-C-AAT----TG---T-TA--AAG--GAT---T----TA---A-AAAC--GNAT-C-A-AA-C-TTAAGGTTACTACANCCGTTTCTNAAACGNGCGTGGA--A-AACTGATAANNTTC-G--AC---TA--C-CAGTTAGA-T-AA-TAC-GAT--GGTA--CTGNT---------TG--CG-T------TTTA-AA-AT--ACA--T--GTTTG-TT-AT----A---T-GC--GT-TT--------TA--A--ACATTNATAAAGTTTCTGAG--CNACGTATGTGCTCG-GGAAGNGTATTCCA--A----ANAGATACGCAT
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gi|118132                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a---CAC-ATCC-GTT-----G--CATCTTGCA---T-C-AAtcgcacatccgttgcatcttgcatcaagta
gi|118133                     : agtcagttgttgacaaaacgattcgtgtctttaatatattgttgtacttgtgtaaatatgaatgtatttgtgtcactggtatatgtactcttaccaagtaaaagcactcgtgtactaaagggatgaaaacggcgtgtagaacgaaaatcg-CAAGTCGTTTTGA----GTCTTT-----AATG-AA-TTGTT---G-CACAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CGTC-G-TT-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGAAA--AGTATTA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TAGTTCG-TTTAAG-A------------A-TAT--A-A-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTCGACGTCTTCT-TTT-TCGTT-A-C---CACAACCC-G-G-----G--CATCTAGAA---T-C-TGT----TG---T-----AAGTCGAT---G----T------AAAT--TGAT-CAA-AA-C-CTAA-ATTACTACACCCGTTTCTAATGCGTGCGTGTATTA-AA--GATAACTTTC-T--AT---TT--C-CAGTAATA-T-AA-TACTGA---GGCA--CTGGT---------TGTACG-T------T----AA-AG--AAA------TTTG-TG-ACTGAAG---T-AC--GT-TT--------AA--AAGACATTTAT---GTTTCTGAG--CAACGTATGTGTTGA-GGAAGGGTGTTCCAATA----GGAAATACACgta
gi|118134                     :                                                                                                                                          agttaattaatat-CAAATCGTTTTGA----GTCTTT-----GATA-AA-TTGCT---G-CATAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CATC-A-TC-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGTAA--AGTATGA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCA-TT--TGAG----------A-A-TAT--A-A-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTCGACG
gi|118135                     :                                                                                                                                          agttaattaatat-CAAATCGTTTTGA----GTCTTT-----GATA-AA-TTGCT---G-CACAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CATC-G-TC-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGTAA--AGTATGA--T--G---AC--TTA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCG-TT--TGAG----------A-A-TAT--A-G-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTCGACGTCTTCT-TTT-TCGTT-A-C---CAC-AACC-AGG-----G--CATCTAGAA---T-C-TGT----TG---T-TA--GTC--GAT---T----TG---T-AAAT--TTAT-CAA-AA-C-CTAA-ATTACTACACCAATTTCTAATGCGTGCGTGTATTA-AA--GATAACTTTC-T--AT---TT--C-CAGTAAGA-T-AA-TAC-TGT--GGCA--CTGGT---------TG--TA-C------GTTA-AA-GA--AAT--T--GGTGA-CTAAA----A---T-AC--GT-TT--------GA--AGGACATTAATGA---TTCTGAG--CAACGTATGTG-TAG-GGGAAAGGATTCCAATA----AGAAATACAC
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gi|118145                     :                                                                                                                                                TTGTTTATCAAAACGTTTAGT----GTCTTT-----AATGTAA-GT-TT---G-GACATTGT--T--AA----CT--AT-ATT----A-AT-------ATT--TT-CATT-GTCT-GAGA---TATCA--TCA------CTC---------------C-CGTG-TAATAA--GGT-TTT--A--A-C-AC--TTA-AA-GGAA-GACG-ATGA-C----GTGTAGCAT-GAAA-G--AGACGAAG---TCGATCA-TTT-AAAA----------A-A-GA---A-G-A---A-C--ATTGCATGAAAT--AGTGTTCGGCGTCCTCT-TTT-TCATG-C-C---CAC-ATTT-TTC-----A--CAAGTTGAA-------AAT----AG---T-TT--TA----ATTTGT----TA---ACAAAT--AAAT-C-ATAA-T-TT-AGGTTACTACAACCATTTCTTAAACGTGCATGAA--A-AATAGATAATTTAC-G--AG---GG--C-CTGCTAAA---AA-AAC--AT--AGTA--AT-AT---------GG--TG-G------ATTT-AA-AC--AGA--T--GCT---TC-AT----A---A-GCTGGTGTT--------TG--A--ATGATGATAGAGTTTCAGAA--TTGCGTAAGTATTCC-GGAAGACAATTCCA--A----GAAGAAATACATggtgt
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gi|118166                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---T----T----C-C-CGTA-TAAAAA--GGT-TTT--A--A-C-AC--TTA-AA-GGAT-GAAG-ATGA-C----GTGTAGCAT-AAAA-A--AGACAAAG---TCGATCA-TT----TA----------C-A-AAAGAA-G-G---A-C--ATTGCATGAAAG--AGTGTTCAACATCCCAT-TTT---------------C-AT-----------G--C-CCTT------------T----TG---T-TA--AA------------------------------T-C-ATAA-T-TT-AGGTTACTGCAATCATTTCTTAAACGTGCATGAA--A-AATTTATAATTTAC-G--AA---TA--T-CTATTAAA-TGAA-TAC--AT--GGTA--TT--T---------TG---G-TGGG---TTTA-AA-
gi|118167                     :                                                                                                                                                                                                                                            tatttgttttacagtcaaataaacgtct---TAC-G--T-A------ATC---T----T----A-C-CAAA-TAAAAG--CAC-TCG--T--G-G-AT--TTA-AA-GGAT-GAAA-A---------------------------------AG---TCCTTCA-TC--AGTA----------T-A-TAT--A-G-G---A-C--ATTGCATAAAA-----------GAGTCTTCT-TTT-TCTTT-A-G---CAC-ATCC-GTC-----G--CATCTT
gi|118168                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AT-GAA-------C----GTGAGACAC-GAAA-A--AGAAGAAG---TCCTTCA-TT--TTTA----------T-A--AT--AGG-G---A-C--ATTGCATAA---------TTCA------------------T-A-CCTGCAC-AAC---TC-----A--CACACTGAA---T-CGAGT----TG---T-----AAG--------T----TAACGA-AAAC--G--T-C-ATTA-T-TTAA-GTTATTACAA------CTGAAACGAGCATGTA--G----TAATGACATAC-GC-GCA--TA--CACGGTTAGA-T-AA-TAC-
gi|118169                     :                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtatgttgccaaaaaaacaacaactgcatttacactaagaaggtgtaAG--CAC-TCG--T--G-T-AC--TTA-AT-GGAT-GAAA-ACGC-C----GTGGAGAAC-GAAA-A--ACACGAAG---TTGTTCA-TC--AGTA----------T-A-CAT--A-G-A---A-C--ATTGCATATAGT--AGTGCTCGGTGTCTTCT-TTT-TCATT-A-C---CAC-ATCC-GTG-----G--CGTCTTGCA---T-C-AAG----TG---T-TTT-AAG--AAT---T----TT---A-AAAA--GTAT-C-A-AA-C-TTAAGGTGACTGCATCCGTTTCTCAAACGAGCGTGGA--G-AACTGATAAAATTC-G--AC---TA--C-TAGTTAGA-T-AA-TAC-GAT--GGTA--CCATT---------TG--CG-T------TTTA-AA-AT--ACA--T--GTTTG-TT-AT----G---T-GT--GG-TT--------TACGA--ACA--GATAACGTCTCTGAGATAAAAATAT-TACTCG-GGAAGTGTACTCCA--A----ATAGATACGCAT
gi|118170                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  a--T--G-C-AG--CTA-AGAGGAT-GAAA-TCTA-C----GAGTTTTTC-GGAA-G--AGGTGAAG---TCGTTCA-TT--TATA----------T-A-TCT--A-T-T---A-C--ATTTAACAAAATAAAATTTTCAGTATGCTCTCTTC-TCG-A-A-C---CGC-A----ATC-----G--CAAGTTTTA---T-T-CTC----TA---C-CA--AGG--GAT---T----AG---A-AAAC--AAAT-C-T-GC-T-TTTAAGTCACTGCATCTATTCCGAAGTCGGGCGAGGA--T-AAC--AGAAAATT--G--ACGTGTA--C-CAACTAGG-T-AG-TAT-GAT--GG
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gi|118176                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TTAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCA-TT--TGAG----------A-A-TAT--A-A-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTGGACGTCTTCT-TTT-TCTTA-A-C---CAC-AGCC-CGG-----G--CATCTAGAA---T-C-TGT----TG---T-TT--GTC--GAT---T----TG---T-TAAT--TTAT-CAA-AA-C-CTAA-ATTACTACACCCATTTCAAATGCGTGCGTGTATTA-AA--GATAACTTTT-T--AT---TT--C-AAGTAAGA-T-AA-TACTGA---GGCA--CTGGT---------TGAACG-T------T----AA-AG--AAA--TTGGTGTC-TA-AA----G---T-AC--GT-TT--------GA--AGGACATTTATGA---TTCTGAG--CAACGTATGTTTTGA-GGAAGGGTGTTCCA--ATAAGAAAGACACGaatttcacttctgttgaaatgggatttacttatgacatttttaaaatta
gi|118177                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATAAAAT--AGTGCTCTGCATCTTCA-AAG-TCACT-A-C---CAC-A----GTC-----A--CATGTAGAG---T-T---T----TG---TCTC--AAGT-GAT---T----TA---T-AAAC--AAAT-CTG-AA-T-TTAAA--TACTACATTGATTTCTGATTCTAGTATGGT--A-AATCGATGAAATT--GTTAC----A--C-CACTTAAA-T-AA-TAT-TTT--GGGA--C-AAT---------AG--TG-G------TTTA-AA-
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gi|118126                     :                                                                                                                                           aTCAGTTGTTGA-CAAAACGTATCGT------CTTT-----AATG-AC-TTGTT---G-TACCT-GTG-T--AA----AT--AT-ATATATAA-GT----G-TATT--TG-TATC-C-CT-GGTA---TAT-G--C-A------ATC---T----T----A-C-CAAA-TAAAAG--CGC-TCA--T--G-T-AC--TTA-AG-CGAT-GAAA-ACGG-C----GTGTGGATC-GAAA-A--CGACGTAG---TCGTTCA-TC--AGTA----------T-A-TAT--A-G-G---A-C--ATTGCATAAAGT--AGTGTTCGGCGTCTTCT-TTT-TCATT-A-C---CAC-A--CC-GTC-----G--CATCTTGCA---T-C-AAG----TG---T-TA--AAG--AAT---T----TA---A-ACAC--GCAT-C-A-AA-C-TTAAGTTGACTACAACTGTTGCTAAGAgt
gi|118127                     :                                                                                                                                          aaTCAGTTGTTGA-CAAAAGGTTTCGT------CTTT-----AATG-AC-TTGTT---G-TACCT-GTG-T--AAATATAT--AT-A------A-GT----G-TATT--Tgagaaagagctg
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gi|118129                     :                                                                                                                                          aGTCAGTTGTTGG-CAAAACGTTTTGT----GTTTTT-----AATG-AA-TTGTT---G-TACCT-GTA-T--AA----AT--AT-A------A-AT----A-TATT--TT-CGTC-A-CT-GTTA---TAT-G--T-A------CTC---T----T----A-CACAAA--AAAAG--CAC-CCG--T--T-T-AC--TTA-AA-GGAT-GAAA-ACTG-C----GTGTAGAAA-AAAA-A--TGACGAAG---TCATTAA-TC--AGTATACATGCATGT-A-TAT--A-G-T---G-C--ATTGCATTTAGT--AGTGTTCGGCTTCTTAT-CTA-CCATT-A-C---CAT-A-TCC-GTCACGTGA--CATCTTGCG---A-T-AAG----TG---T-CA--AAT--AAT---T----TA---A-GAAA--GTAT-C-A-AA-C-ATAAAATGACTCAATCCGTT
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gi|118132                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a---CAC-A-TCC-GTT-----G--CATCTTGCA---T-C-AAtcgcacatccgttgcatcttgcatcaagta
gi|118133                     : agtcagttgttgacaaaacgattcgtgtctttaatatattgttgtacttgtgtaaatatgaatgtatttgtgtcactggtatatgtactcttaccaagtaaaagcactcgtgtactaaagggatgaaaacggcgtgtagaacgaaaatcg-CAAGTCGTTTTGA----GTCTTT-----AATG-AA-TTGTT---G-CACAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CGTC-G-TT-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGAAA--AGTATTA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TAGTTCG-TTTAAG-A------------A-TAT--A-A-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTCGACGTCTTCT-TTT-TCGTT-A-C---CACAA-CCC-G-G-----G--CATCTAGAA---T-C-TGT----TG---T-----AAGTCGAT---G----T------AAAT--TGAT-CAA-AA-C-CTAA-ATTACTACACCCGTTTCTAATGCGTGCGTGTATTA-AA--GATAACTTTC-T--AT---TT--C-CAGTAATA-T-AA-TACTGA---GGCA--CTGGT---------TGTACG-T------T----AA-AG--AAA------TTTG-TG-ACTGAAG---T-AC----GTTTAAA------A-G-ACATTTAT---GTTTCTGAG--CAACGTATGTGTTGA-GGAAGGGTGTTCCAATA----GGAAATACACgta
gi|118134                     :                                                                                                                                          agttaattaatat-CAAATCGTTTTGA----GTCTTT-----GATA-AA-TTGCT---G-CATAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CATC-A-TC-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGTAA--AGTATGA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCA-TT--TGAG----------A-A-TAT--A-A-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTCGACG
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gi|118163                     :                                                                                                                                                                                               TT---GATACCT-TTG-T--AA----CT--AT-A------A-AT----G-TGTT--TT-TGTC-A-CT-GGTA---TGT-G--T-A------CTCAGTT----T----A-C-CAAA-TAAAAG--CAC-ACAATT--G-T-TC--TTG-AG-GGGT-GGAA-ACG
gi|118164                     :                                                                                                                                                                                               TT---G-TATCT-GAA-T--AA----AT--AT-A------C-AT----G-TATT--TT-CGTC-A-CC-GGTA---TG--G--TGA------CTC---T----T----C-C-CAAA-TAAAAAAGTGC-ACG--T--G-T-AC--ATATAG-GGA
gi|118165                     :                                                                                                                                                                                                          T-ATG-T--AA----AT--ATGA------A-AT----G-TACT--TG-TATC-A-CT-GTTA---TAT-G--T-A------CTT---T----A----G-C-CAAA-
gi|118166                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---T----T----C-C-CGTA-TAAAAA--GGT-TTT--A--A-C-AC--TTA-AA-GGAT-GAAG-ATGA-C----GTGTAGCAT-AAAA-A--AGACAAAG---TCGATCA-TT----TA----------C-A-AAAGAA-G-G---A-C--ATTGCATGAAAG--AGTGTTCAACATCCCAT-TTT---------------C-A-T-----------G--C-CCTT------------T----TG---T-TA--AA------------------------------T-C-ATAA-T-TT-AGGTTACTGCAATCATTTCTTAAACGTGCATGAA--A-AATTTATAATTTAC-G--AA---TA--T-CTATTAAA-TGAA-TAC--AT--GGTA--TT--T---------TG---G-TGGG---TTTA-AA-
gi|118167                     :                                                                                                                                                                                                                                            tatttgttttacagtcaaataaacgtct---TAC-G--T-A------ATC---T----T----A-C-CAAA-TAAAAG--CAC-TCG--T--G-G-AT--TTA-AA-GGAT-GAAA-A---------------------------------AG---TCCTTCA-TC--AGTA----------T-A-TAT--A-G-G---A-C--ATTGCATAAAA-----------GAGTCTTCT-TTT-TCTTT-A-G---CAC-A-TCC-GTC-----G--CATCTT
gi|118168                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AT-GAA-------C----GTGAGACAC-GAAA-A--AGAAGAAG---TCCTTCA-TT--TTTA----------T-A--AT--AGG-G---A-C--ATTGCATAA---------TTCA------------------T-A-CCTGCAC-A-AC---TC-----A--CACACTGAA---T-CGAGT----TG---T-----AAG--------T----TAACGA-AAAC--G--T-C-ATTA-T-TTAA-GTTATTACAA------CTGAAACGAGCATGTA--G----TAATGACATAC-GC-GCA--TA--CACGGTTAGA-T-AA-TAC-
gi|118169                     :                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtatgttgccaaaaaaacaacaactgcatttacactaagaaggtgtaAG--CAC-TCG--T--G-T-AC--TTA-AT-GGAT-GAAA-ACGC-C----GTGGAGAAC-GAAA-A--ACACGAAG---TTGTTCA-TC--AGTA----------T-A-CAT--A-G-A---A-C--ATTGCATATAGT--AGTGCTCGGTGTCTTCT-TTT-TCATT-A-C---CAC-A-TCC-GTG-----G--CGTCTTGCA---T-C-AAG----TG---T-TTT-AAG--AAT---T----TT---A-AAAA--GTAT-C-A-AA-C-TTAAGGTGACTGCATCCGTTTCTCAAACGAGCGTGGA--G-AACTGATAAAATTC-G--AC---TA--C-TAGTTAGA-T-AA-TAC-GAT--GGTA--CCATT---------TG--CG-T------TTTA-AA-AT--ACA--T--GTTTG-TT-AT----G---T-GT----GGTT-TA------C-GAACA--GATAACGTCTCTGAGATAAAAATAT-TACTCG-GGAAGTGTACTCCA--A----ATAGATACGCAT
gi|118170                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  a--T--G-C-AG--CTA-AGAGGAT-GAAA-TCTA-C----GAGTTTTTC-GGAA-G--AGGTGAAG---TCGTTCA-TT--TATA----------T-A-TCT--A-T-T---A-C--ATTTAACAAAATAAAATTTTCAGTATGCTCTCTTC-TCG-A-A-C---CGC-A-----ATC-----G--CAAGTTTTA---T-T-CTC----TA---C-CA--AGG--GAT---T----AG---A-AAAC--AAAT-C-T-GC-T-TTTAAGTCACTGCATCTATTCCGAAGTCGGGCGAGGA--T-AAC--AGAAAATT--G--ACGTGTA--C-CAACTAGG-T-AG-TAT-GAT--GG
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gi|118124                     :                                                                                                                                          aGTCAGTTGTTGA-CAAAACGATTCGT----GTCTTT-----AATG-AA-CTGTT---G-TAC-T-GTG-T--AA----AT--AT-A------A-AT----G-CATT--TG-TGTC-A-CT-GGTA---TAT-T--T-A------CTC---T----T----A-C-CAAA-TAAAAG--CAC-TCT--T--G-T-AC--TTA-AG-GTAT-AGGA-ACGG-T----CTATAGAAC-GAAA-A--CGAAAAAG---CCGTTCA-TC--AGTA----------T-A-TAT--A-G-G---A-C--ATTGCAAAAAGT--AGTGCCCAGCGTCTTCT-TTT-TCATT-A-C---CAC-AT-CCGTC-----G--CATCTTGCA---T-C-AAG----TG---T-TA--AAA--TAT---T----TA---G-AAAA--GTAT--------C-TTAAGGTGACCATAGCCGTTTCCCAAACGAGCGTGGA--G-AACTGATAAAAT--TT-G--AC---TA--C-CAGTAAGA-T-AA--TAC-GTT--GGTA--CCTTT---------TG--TG-T------TTTT-AA-AT--AC----A--G--GTTTA-TT-AT----A---T-GT----GTTT--TG------A-A-A------ATAAAGTCTCTGGG--TTACTAATGTGCTCC-AGAAGTGTATTCAA--G----ATAGATACACAT
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gi|118126                     :                                                                                                                                           aTCAGTTGTTGA-CAAAACGTATCGT------CTTT-----AATG-AC-TTGTT---G-TACCT-GTG-T--AA----AT--AT-ATATATAA-GT----G-TATT--TG-TATC-C-CT-GGTA---TAT-G--C-A------ATC---T----T----A-C-CAAA-TAAAAG--CGC-TCA--T--G-T-AC--TTA-AG-CGAT-GAAA-ACGG-C----GTGTGGATC-GAAA-A--CGACGTAG---TCGTTCA-TC--AGTA----------T-A-TAT--A-G-G---A-C--ATTGCATAAAGT--AGTGTTCGGCGTCTTCT-TTT-TCATT-A-C---CAC-A--CCGTC-----G--CATCTTGCA---T-C-AAG----TG---T-TA--AAG--AAT---T----TA---A-ACAC--GCAT-C-A-AA-C-TTAAGTTGACTACAACTGTTGCTAAGAgt
gi|118127                     :                                                                                                                                          aaTCAGTTGTTGA-CAAAAGGTTTCGT------CTTT-----AATG-AC-TTGTT---G-TACCT-GTG-T--AAATATAT--AT-A------A-GT----G-TATT--Tgagaaagagctg
gi|118128                     :                                                                                                                                         aaGCCAGCTGTTGA-CAAAATGTTTTGT----GCTTAT-----AACG-AA-TTGGT---G-TACCT-GTA-T--A------TC-AT-A------A-TT----G-TATT--TT-CGTC-A-CT-GATA---TAT-G--T-A------TTC---T----T----A-T-CAAAATAAAAG--CGC-GCG--T--G-T-AC--TTA-AG-GGGT-GAAA-ACGG-C----GTGTAGAAC-AAAA-A--AGACGAAG---TCGATCG-TC--AGTA----------T-A-TAT--A-G-G---A-C--TTTGCATAAAGT--AGTGTTCGGCGTCTTTT-TTT-TAATT-A-C---CCC-AT-CCGTC-----A--CAACTTGCA---T-C-AAG----TG---T-TA--AAC--AAT---T----TA---A-GAAA--GTAC-C-A-CA-C-TTAAgtat
gi|118129                     :                                                                                                                                          aGTCAGTTGTTGG-CAAAACGTTTTGT----GTTTTT-----AATG-AA-TTGTT---G-TACCT-GTA-T--AA----AT--AT-A------A-AT----A-TATT--TT-CGTC-A-CT-GTTA---TAT-G--T-A------CTC---T----T----A-CACAAA--AAAAG--CAC-CCG--T--T-T-AC--TTA-AA-GGAT-GAAA-ACTG-C----GTGTAGAAA-AAAA-A--TGACGAAG---TCATTAA-TC--AGTATACATGCATGT-A-TAT--A-G-T---G-C--ATTGCATTTAGT--AGTGTTCGGCTTCTTAT-CTA-CCATT-A-C---CAT-AT-CCGTCACGTGA--CATCTTGCG---A-T-AAG----TG---T-CA--AAT--AAT---T----TA---A-GAAA--GTAT-C-A-AA-C-ATAAAATGACTCAATCCGTT
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gi|118132                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a---CAC-AT-CCGTT-----G--CATCTTGCA---T-C-AAtcgcacatccgttgcatcttgcatcaagta
gi|118133                     : agtcagttgttgacaaaacgattcgtgtctttaatatattgttgtacttgtgtaaatatgaatgtatttgtgtcactggtatatgtactcttaccaagtaaaagcactcgtgtactaaagggatgaaaacggcgtgtagaacgaaaatcg-CAAGTCGTTTTGA----GTCTTT-----AATG-AA-TTGTT---G-CACAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CGTC-G-TT-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGAAA--AGTATTA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TAGTTCG-TTTAAG-A------------A-TAT--A-A-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTCGACGTCTTCT-TTT-TCGTT-A-C---CACAAC-CCG-G-----G--CATCTAGAA---T-C-TGT----TG---T-----AAGTCGAT---G----T------AAAT--TGAT-CAA-AA-C-CTAA-ATTACTACACCCGTTTCTAATGCGTGCGTGTATTA-AA--GATAACTT--TC-T--AT---TT--C-CAGTAATA-T-AA--TACTGA---GGCA--CTGGT---------TGTACG-T------T----AA-AG--AA----A------TTTG-TG-ACTGAAG---T-AC----GTTTA-AA------A-G-AC-ATTTAT---GTTTCTGAG--CAACGTATGTGTTGA-GGAAGGGTGTTCCAATA----GGAAATACACgta
gi|118134                     :                                                                                                                                          agttaattaatat-CAAATCGTTTTGA----GTCTTT-----GATA-AA-TTGCT---G-CATAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CATC-A-TC-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGTAA--AGTATGA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCA-TT--TGAG----------A-A-TAT--A-A-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTCGACG
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gi|118137                     :                                                                                                                                                      a-CAAATCGTTTTGA----GTCTTT-----GATA-AA-TTGCT---G-CACAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CATC-G-TC-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGTAA--AGTATAA--T--G---AC--TGA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCA-TT--TG-A----------TCA-TAT--A-A-T---A-C--GTTTCATAAAAT--AATACT-GACGTCTTCG-TTT-TCGTT-A-C---CAC-Ata
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gi|118139                     :                                                                                                                              agttaattaatatGTCAGTTGTTGA-CAAAACGTTTCGT----GTCTTT-----AATG-TA-TTGGT---G-TACTT-GCA-T--AA----AT--AT-A------C-AT----G-TATT--TA-TGTC-A-CT-
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gi|118145                     :                                                                                                                                                TTGTTTATCAAAACGTTTAGT----GTCTTT-----AATGTAA-GT-TT---G-GACATTGT--T--AA----CT--AT-ATT----A-AT-------ATT--TT-CATT-GTCT-GAGA---TATCA--TCA------CTC---------------C-CGTG-TAATAA--GGT-TTT--A--A-C-AC--TTA-AA-GGAA-GACG-ATGA-C----GTGTAGCAT-GAAA-G--AGACGAAG---TCGATCA-TTT-AAAA----------A-A-GA---A-G-A---A-C--ATTGCATGAAAT--AGTGTTCGGCGTCCTCT-TTT-TCATG-C-C---CAC-AT-TTTTC-----A--CAAGTTGAA-------AAT----AG---T-TT--TA----ATTTGT----TA---ACAAAT--AAAT-C-ATAA-T-TT-AGGTTACTACAACCATTTCTTAAACGTGCATGAA--A-AATAGATAATTT--AC-G--AG---GG--C-CTGCTAAA---AA--AAC--AT--AGTA--AT-AT---------GG--TG-G------ATTT-AA-AC--AG----A--T--GCT---TC-AT----A---A-GCTGGTGTTT--GA------ATG-A----TGATAGAGTTTCAGAA--TTGCGTAAGTATTCC-GGAAGACAATTCCA--A----GAAGAAATACATggtgt
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gi|118160                     :                                                                                                                                                          AAACGTTTGGT----GTGCAT-----AATA-AA-TATTT---G-TGTTT-CTT-T--GA----AA--AT-G------A-AT----T-CGTT--TT-CA---------GCA---TCT-G--T-AAGAAGATTA---T----T----C-C-CGAA-CAATA----GT-TTG--TTTG-T-GC--TCA-AG-GGAT-GGAA-AATT-C----TTGTAGT-C-AAAA-A-----C-AGG---TTGTGTT-TT--TGTA----------A-AACGT--A-GCGTTTA-C--ACTTAAAAAAAT--AGTGCTCTGCATCTTCA-ATG-TCACT-A-C---CAC-A----GTC-----A--CATGTAGAG---T-T---T----TG---TCTC--AAGT-GAT---T----TA---T-AAAC--AAAT-CTG-AA-T-TTAAA-TTACTACATTGATTTCTAATTCGAGCATGGT--A-TATTGATGAAAT--TCTT--AC----A--C-CACTTAAA-T-AA--TAT-TTT--GGGA--CAAAT---------GG--TG-G------TTTA-AA-CTGAAC----A--T--ATATG-
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gi|118162                     :                                                                                                                                                                                          A-TGGTT---G-TACTT-GGA-T--AA----AT--AT-A------A-AT----G-TATT--TG-TGTC-A-CT-
gi|118163                     :                                                                                                                                                                                               TT---GATACCT-TTG-T--AA----CT--AT-A------A-AT----G-TGTT--TT-TGTC-A-CT-GGTA---TGT-G--T-A------CTCAGTT----T----A-C-CAAA-TAAAAG--CAC-ACAATT--G-T-TC--TTG-AG-GGGT-GGAA-ACG
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gi|118166                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---T----T----C-C-CGTA-TAAAAA--GGT-TTT--A--A-C-AC--TTA-AA-GGAT-GAAG-ATGA-C----GTGTAGCAT-AAAA-A--AGACAAAG---TCGATCA-TT----TA----------C-A-AAAGAA-G-G---A-C--ATTGCATGAAAG--AGTGTTCAACATCCCAT-TTT---------------C-AT-----------G--C-CCTT------------T----TG---T-TA--AA------------------------------T-C-ATAA-T-TT-AGGTTACTGCAATCATTTCTTAAACGTGCATGAA--A-AATTTATAATTT--AC-G--AA---TA--T-CTATTAAA-TGAA--TAC--AT--GGTA--TT--T---------TG---G-TGGG---TTTA-AA-
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Reference ( family-442 )      :                                                                                                                                           GTCAGTTGTTGA-CAAAACGTTTCGT----GTCTTT-----AATG-AA-TTGTT---G-TACNT-GTG-T--AA----AT--AT-A------A-AT----G-TATT--TT-CGTC-G-CT-GGTA---TAT-G--T-A------CTC---T----T----A-C-CGAA-TAANAA--CGC-TCG--T--G-T-AC--TTA-AG-GGAT-GAAA-ACGG-C----GTGTGGCAC-GAAA-A--AGACGAAG---TCGTTCA-TT--AGTA----------T-A-TAT--A-G-G---A-C--ATTGCATAAAAT--AGTGTTCGGCGTCTTCT-TTT-TCGTT-A-C---CAC-AT-CCGTC-----G--CATCTTGNA---T-C-AAT----TG---T-TA--AAG--GAT---T----TA---A-AAAC--GNAT-C-A-AA-C-TTAAGGTTACTACANCCGTTTCTNANACGNGCGTGGA--A-AACTGATAANNT--TC-G--AC---TA--C-CAGTTAGA-T-AA--TAC-GAT--GGTA--CTGNT---------TG--CG-T------TTTA-AA-AT--AC----A--T--GTTTG-TT-AT----A---T-GC----GTTT--NA------A-G-AC-ATTNATAAAGTTTCTGAG--CNACGTATGTGCTCG-GGAAGNGTATTCCA--A----ANAGATACGCAT
gi|118122                     :                                                                                                                                           GTCAATTGTTGA-CAAAACGTTTCGT----GTCTTT-----AATG-CA-TTGTT---G-TACTT-GTG-T--AA----AT--AT-A------A-AT----A-TATT--TG-CTAC-A-CT-TGTA---TAT-G--T-A------CTT---T----T----A-C-CAAA-TAAAAA--CAC-TCG--T--G-T-AC--TTA-AG-GGAT-GAAA-ACGG-C----GTGTGGAAC-GAAA-A--AGACGAAG---TCGTTAA-TC--AGTA----------T-A-TAT--A-G-A---A-C--ATTGCATAAAGT--AGTACTCGGCGTCTTCT-TTT-TCATT-A-C---CAC-AT-CCGTC-----G--CATCTTGCA---T-C-AAG----TG---T-TA--AAG--AAT---T----TA---A-AAAT--GTTT-A-A-AA-G-TTAAGGTGACTACATCCGTTTTTCAAACGAGCGTAGA--G-AACTGATAAAAT--TC-G--AC---TA--C-CAGTTAGA-T-AA--TAC-GAT--GGTA--CCATT---------TG--CG-T------TTTA-AA-AT--AC----A--T--GTTTG-TT-AT----A---T-GT----GTCT--TA------A-A-A--ACCGATAAATTCTCTGAG--TTACGAATGTACTCG-GGAAGTGTATTCCA--A----ATAGATACGC
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gi|118132                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a---CAC-AT-CCGTT-----G--CATCTTGCA---T-C-AAtcgcacatccgttgcatcttgcatcaagta
gi|118133                     : agtcagttgttgacaaaacgattcgtgtctttaatatattgttgtacttgtgtaaatatgaatgtatttgtgtcactggtatatgtactcttaccaagtaaaagcactcgtgtactaaagggatgaaaacggcgtgtagaacgaaaatcg-CAAGTCGTTTTGA----GTCTTT-----AATG-AA-TTGTT---G-CACAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CGTC-G-TT-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGAAA--AGTATTA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TAGTTCG-TTTAAG-A------------A-TAT--A-A-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTCGACGTCTTCT-TTT-TCGTT-A-C---CACAAC-CCG-G-----G--CATCTAGAA---T-C-TGT----TG---T-----AAGTCGAT---G----T------AAAT--TGAT-CAA-AA-C-CTAA-ATTACTACACCCGTTTCTAATGCGTGCGTGTATTA-AA--GATAACTT--TC-T--AT---TT--C-CAGTAATA-T-AA--TACTGA---GGCA--CTGGT---------TGTACG-T------T----AA-AG--AA----A------TTTG-TG-ACTGAAG---T-AC----GTTTA-AA------A-G-AC-ATTTAT---GTTTCTGAG--CAACGTATGTGTTGA-GGAAGGGTGTTCCAATA----GGAAATACACgta
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gi|118158                     :                                                                                                                                                         AAAACGACTGGT----ATCTTT-----TATG-AA-CTTTT---G-AACCT-CC-----AA----GC--AT-A------ATAT----GGTATT--GT-CCTC-TTCT-GAAA------------A------ACC---T----TGACGA-C-CAAG-TAACA-------TAG--T--G-TTACAGCTA-AGAGGAT-GCAA-CCTA-T----GAGTTGCTC-TGAA-G--AGATGAAG---TCGTTCA-TT--TCTA----------T-A-TCT--A-T-T---A-C--ATTGAAAAAAA---AATGTTCAGTATCCTCT-CTTCTCG---AGC---CAC-A----ATC-----G--CAA---GCT---T-C-ATT----TT---C-TACTAAGT-GAT---T----AG---A-AAAC--AAAT-C-T-GA-T-TTGAAGTCACTACATTCATTTCGAAGTCGAGCAAGGA--T-AACGGA--AAAT--T--G--ACGTGTA--C-CAACTAGA-T-AA--TAT-GAT--GG
gi|118159                     :                                                                                                                                                         AAAACGTTTGGTTGGTGTCCTT-----ACTA-AAATTCTT---A--ACAT-GAG-T--TA----AT--A--A------A-AT----GATACTAGTT-TG-C-T-CT-G-TA---AGC-G--T-A------TCC---T----G----G-C-CAAA-TAA-AA--C--------T--G-C-AT--TTACAC-TGAT-ATAATACAA-TTATAGTGAGCTAC-GTAA-G--AGA---AG---TCGTTCA-TTTCGATA------------A-TAT----G-G---A-C--ATTGCATAAAAT--AATGTTCGGTCTATTCT-CTT-TCGTG-A-T---CAC-aatttcacttctgttgaaatgggatttacttataacatttttaaaatta
gi|118160                     :                                                                                                                                                          AAACGTTTGGT----GTGCAT-----AATA-AA-TATTT---G-TGTTT-CTT-T--GA----AA--AT-G------A-AT----T-CGTT--TT-CA---------GCA---TCT-G--T-AAGAAGATTA---T----T----C-C-CGAA-CAATA----GT-TTG--TTTG-T-GC--TCA-AG-GGAT-GGAA-AATT-C----TTGTAGT-C-AAAA-A-----C-AGG---TTGTGTT-TT--TGTA----------A-AACGT--A-GCGTTTA-C--ACTTAAAAAAAT--AGTGCTCTGCATCTTCA-ATG-TCACT-A-C---CAC-A----GTC-----A--CATGTAGAG---T-T---T----TG---TCTC--AAGT-GAT---T----TA---T-AAAC--AAAT-CTG-AA-T-TTAAA-TTACTACATTGATTTCTAATTCGAGCATGGT--A-TATTGATGAAAT--TCTT--AC----A--C-CACTTAAA-T-AA--TAT-TTT--GGGA--CAAAT---------GG--TG-G------TTTA-AA-CTGAAC----A--T--ATATG-
gi|118161                     :                                                                                                                                                              GTTTAGT----GTCTTT-----AATATAA-GT-TT---G-GACATTGT--T--AA----AT--AT-A------A-CA----A-TATT--TT-CATT-GTCT-GAGA---TAT-AATC-A------CTC---------------C-CGTG-TAACAA--GGT-TTA-----A-C-AC--TTA-AA-GAAT-GACG-ATGA-C----GTGTAGTTT-GAAA-G--AGACGAAG---TCAATCA-TTT-AAAA----------A-A-GA---A-G-G---A-C--ATTGCATGAAAT--AGTGTTCAGATTCCTCT-TTT-TCA-T-G-C---C----T-TTTTT-----A--TTTTTTGTAAGTT-C-AATATAATT---T-TA--------AT---TTGC-TA---ACAAAT--AAAT-A-ATAA-T-TT-AGGCTACTGCAACCATTTCTTAAATGTGCATAAA--A-TATAGATGA--T--TC-A--A-----------GATTAAA-T-AA--T
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gi|118163                     :                                                                                                                                                                                               TT---GATACCT-TTG-T--AA----CT--AT-A------A-AT----G-TGTT--TT-TGTC-A-CT-GGTA---TGT-G--T-A------CTCAGTT----T----A-C-CAAA-TAAAAG--CAC-ACAATT--G-T-TC--TTG-AG-GGGT-GGAA-ACG
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                       T          C  .         .        T     G  .   T   C T  G  .   .     .     GC        GA        .  G     TT   .    .    TCA   AT         .   .    A      .    .   A GGGTTTTTAAC          .    . G          A   G  .       G AT        .         .            TCGATA             C  T   . G     . .             .                  .   .  ATC  . .     . TCCG   .     .        C .   CGAGT       .   .  AAGTCG    .   TGTTA         AGT    . AT   C    A G         A        A G   T     T GAACT        CT TGTT     CA    .  .        . .  .    TGA       .   GGT           TACGT          A   . TAC       .  .    TC   AAAG        . C        GAAGGAC             T    AG        CA           C  A      A        ATA     G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       T          C  .         .        T     G  .   T   C T  G  .   .     .     C         G         .  G     GT   .    .    TCA   CA         .   .    A      .    .   A ACACTCGTGT           .    . G          A   G  .       A AA        .         .            TAAAAA             T  T   . G     . .             .                  .   .  ATT  . .     . TCCG   .     .        C .   CAAT        .   .  ACGTCG    .   TAAC          CGC    . AA   C    A A         T        A T   T     T TTAAA        CT TCG      C     .  .        . .  .    TGT       .   GGT           AACGT          A   . TAC       .  .    TG   AAAA        . C        GAAGGAC             G    AG        CA           C  G      T        ATC     T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          T  .         .        C     G  .   T   C T  G  .   .     .     T         G         .  T     GT   .    .    TG    GA         .   .    A      .    .   A GCACTCTTGT           .    . G          A   G  .       A AA        .         .            AGTAT              T  T   . G     . .             .                  .   .  ATT  . .     . TCCG   .     .        C .   CAAG        .   .  AAGTG     .   TAA           AGT    . AT   C    A G         C        A T   A     G TTAAA        AA TTG      C     .  .        . .  .    GAT       .   ATT           CGAT           A   . GAA       .  .    GA   ATA         . C        AAAAGAC             G    AG        TT           T  G      T        ATA     T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          T  .         .        T     G  .   T   C .  A  .   .     .     .         G         .  T     TT   .    .    TT    T          .   .    A      .    .   A GCACTCGTGT           .    . G          A   G  .       A AA        .         .            AGTAT              T  T   . T     . .             .                  .   .  ATT  . .     . TCCG   .     .        C .   CAAG        .   .  TAAGA     .   TAG           AGT    . TG   C    A G         C        C A   A     G AAACT        TT TCG      T     .  .        . .  .    AAT       .   GTT           CGT            T   . AAA       .  .    TG   ATA         . A        TACGAAC             G    CG        TT           T  G      A        A       A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          C  .         .        .     G  .   T   T .  A  .   .     .     .         G         .  G     GT   .    .    TG    A          .   .    A      .    .   A GCGCTCATGT           .    . A          A   G  .       G AA        .         .            AGTAT              T  T   . G     . .             .                  .   .  ATA  . .     . CCCG   .     .        A .   CAAG        .   .  AAGTG     .   TAG           TTG    . AT   C    A G         T        C A   T     A GAACT        TT TCT      T     .  .        . .  .    CAT       .   GGT           TGT            A   . TAC       .  .    TG   ATA         . T        GAAGGGC             A    AG        TT           T  C      A        G       G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          C  .         .        .     G  .   C   T .  G  .   .     .     .         G         .  G     A    .    .    TG    A          .   .    A      .    .   A GCGCGCGTGT           .    . G          A   G  .       A AA        .         .            AGTAT              T  T   . T     . .             .                  .   .  GTT  . .     . ACCA   .     .        A .   CAAG        .   .  AAGA      .   TAA           TTT    . AT   C    A G         T        T A   T     A AAATA        TT TCT      T     .  .        . .  .    TGA       .   GGC           TAC            A   . TAC       .  .    GA   ATA         . C        GAAGGAC             T    G         TC           T  C      G        A       G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          C  .         .        .     G  .   T   A .  G  .   .     .     .         A         .  T     A    .    .    TG    A          .   .    A      .    .   A GCACCCGTTT           .    . G          A   G  .       G CT        .         .            AGTAT              T  T   . T     . .             .                  .   .  GTT  . .     . TCCG   .     .        C .   TAAG        .   .  AAAT      .   TAA           TTT    . AT   C    A G         A        T A   T     A AAATA        CT TTG      C     .  .        . .  .    TGA       .   GAT           CGT            A   . CAG       .  .    AG   ATA         . C        TAAAAC              A    .         CA           C  A      G        A       G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          T  .         .        .     G  .   T   A .  G  .   .     .     .         G         .  T     A    .    .    TG    A          .   .    A      .    .   T ACACCCGTGT           .    . A          T   A  .       G CT        .         .            AGTAT              T  T   . T     . .             .                  .   .  GTT  . .     . TTCG   .     .        C .   CTGT        .   .  AATA      .   TAA           TGT    . AA   C    A G         A        T A   T     T AAATA        TG TCG      C     .  .        . .  .    CAT       .   AAT           CGT            A   . CAA       .  .    TG   ACA         . C        GAATGA              G    .         CA           T  A      A        A       T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          T  .         .        .     G  .   C   A .  G  .   .     .     .         G         .  T     C    .    .    TG    A          .   .    A      .    .   T ACACTCGTGT           .    . A          T   A  .       G CT        .         .            TAAGA              T  T   . T     . .             .                  .   .  ATT  . .     . TTTT   .     .        A .   CTGT        .   .  AAGA      .   TGT           TAA    . AT   C    A G         A        T A   T     T TTAAA        GT ACG      G     .  .        . .  .    TAA       .   ATT           TGG            A   . AAA       .  .    TG   AAA         . C        AAATGA              A    .         CA           T  G      T        A       G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          T  .         .        .     G  .   C   C .  G  .   .     .     .         G         .  G     A    .    .    TG    A          .   .    A      .    .   T GCACTCGTGT           .    . A          T   A  .       G CT        .         .            TGAGA              T  T   . A     . .             .                  .   .  ATT  . .     . TTTT   .     .        A .   CAAT        .   .  AACA      .   TAA           TAA    . TG   T    A A         A        A T   T     G TAACG        CT ACG      G     .  .        . .  .    GAT       .   GGT           GGT            A   . TGC       .  .    GA   ATG         . T        TAAAA               T    .         CA           .  A      G        A       A
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          C  .         .        .     G  .   C   A .  G  .   .     .     .         G         .  T     A    .    .    AG    A          .   .    A      .    .   T AAGTATTATG           .    . A          T   A  .       G AA        .         .            TGAGA              T  T   . A     . .             .                  .   .  ATG  . .     . TTTT   .     .        A .   CAAG        .   .  AATA      .   GAC           TAA    . AA   A    A A         C        C T   A     T ATATT        AA ACG      A     .  .        . .  .    TTT       .   TAT           TAA            A   . TAC       .  .    TT   TGG         . C        TGAAA               T    .         CA           .  A      G                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          T  .         .        .     G  .   T   A .  G  .   .     .     .         G         .  T     A    .    .    AG    A          .   .    A      .    .   T AAGTATGATG           .    . G          A   G  .       G AA        .         .            TGATC              G  A   . A     . .             .                  .   .  ATG  . .     . TTCT   .     .        A .   ATGT        .   .  GTCG      .   GAC           TTT    . TG   A    A G         C        A G   A     G ATATA        AA TCT      T     .  .        . .  .    GAT       .   GGT           TAC            A   . GAA       .  .    TC   AAG         . G        TAAAC               T    .         TT                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          T  .         .        .     G  .   C   T .  G  .   .     .     .         G         .  A     A    .    .    AG    G          .   .    A      .    .   T AAGTATGATG           .    . G          A   G  .       A CA        .         .            AGTAT              G  T   . G     . .             .                  .   .  ATG  . .     . TTTT   .     .        A .   AAAA        .   .  AAGA      .   TGT           TGT    . A    T    G G         A        A T   T     G AAATT        TT ACG      T     .  .        . .  .    GAT       .   AAT           TAT            .   . AAC       .  .    TT   TTA         . C        GAAAG               .                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          C  .         .        .     G  .   C   C .  G  .   .     .     .         G         .  G     G    .    .    TG    G          .   .    A      .    .   C AAGTATAATG           .    . A          A   A  .       A CA        .         .            ATTAT              G  T   . G     . .             .                  .   .  ATG  . .     . CCGG   .     .        A .   CTGC        .   .  AAGA      .   TGT           CAA    . A    C    A G         C        T A   T     A GAACT        CA TCT      G     .  .        . .  .    TGT       .   ATG           TGG            .   . T         .  .    .    TA          . .                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          C  .         .        .     A  .   T   T .  A  .   .     .     .         G         .  G     A    .    .    AG    G          .   .    A      .    .   C ACACTCGTAT           .    . A          G   A  .       A CA        .         .            AAAAA              G  T   . G     . .             .                  .   .  ATG  . .     . AATT   .     .        A .   CATT        .   .  GTTT      .   TAG           TGT    . A    T    A A         T        T A   A     A TTAAA        AA TCA      T     .  .        . .  .    GAT       .   AT            CGT            .   . .         .  .    .                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          T  .         .        .     G  .   T   T .  G  .   .     .     .         G         .  T     G    .    .    AG    A          .   .    A      .    .   A ACACTCGTGT           .    . A          G   G  .       A AA        .         .            AAAAA              A  T   . C     . .             .                  .   .  ATG  . .     . CCCG   .     .        A .   CAAG        .   .  ATTT      .   TGT           CAA    . A    T    A G         T        G A   A     T TAACG        AA ACG      C     .  .        . .  .    TGA       .   GG            TGG            .   .                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          C  .         .        .     A  .   T   C .  G  .   .     .     .         G         .  T     A    .    .    TG    G          .   .    C      .    .   C AGGTTTTAAC           .    . A          A   G  .       A CA        .         .            GAAAA              G  T   . G     . .             .                  .   .  GTT  . .     . TTTT   .     .        A .   TCTC        .   .  GTCG      .   AGA           CAA    . A    T    T A         A        C A   G     G TTAAA        CT TCG      A     .  .        . .  .    TTT       .   G             GGG            .   .                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          C  .         .        .     G  .   T   A .  G  .   .     .     .         G         .  T     G    .    .    TG    G          .   .    A      .    .   C GGGTTTTAAC           .    . A          G   A  .       A CA        .         .            AAAAA              T  T   . G     . .             .                  .   .  ATG  . .     . TCCG   .     .        C .   CTGT        .   .  ATTT      .   TAT           TAA    . A    T    A G         A        A G   T     G AAATC        TT TCT      C     .  .        . .  .    AT        .   T             .              .   .                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          C  .         .        .     G  .   T   A .  G  .   .     .     .         G         .  T     G    .    .    AT    A          .   .    A      .    .   T GCGCACCTGT           .    . G          G   G  .       A CA        .         .            AAAAC              T  T   . T     . .             .                  .   .  GTT  . .     . TCCG   .     .        A .   TAAT        .   .  AGGG      .   TTA           AGT    . A    T    A .         A        A T   A     T GTAAT        AT TTT      T     .  .        . .  .    AT                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          A  .         .        .     T  .   T   A .  G  .   .     .     .         G         .  T     A    .    .    TG    A          .   .    A      .    .   C GGGTTTTAAC           .    . A          A   A  .       A CA        .         .            TGAGA              T  T   . A     . .             .                  .   .  GTG  . .     . CCCG   .     .        T .   CAAG        .   .  GTCG      .   AGA           CAA    . A    T    A .         T        T C   G     G TAAC         CT CCT      A     .  .        . .  .    GA                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          A  .         .        .     G  .   G   C .  G  .   .     .     .         A         .  T     A    .    .    AA    A          .   .    A      .    .   A GGGTTTTAAC           .    . A          A   A  .       A AA        .         .            TCTAT              T  T   . G     . .             .                  .   .  ACT  . .     . TTTT   .     .        A .   CTGT        .   .  GTCG      .   TGT           TTT    . A    C    A .         T        A G   T     T AAT          AA TG       T     .  .        . .  .    .                                                                                                                                                                          
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          A  .         .        .     G  .   G   A .  G  .   .     .     .         C         .  T     G    .    .    AG    T          .   .    A      .    .   C AGGTTTTAAC           .    . A          G   A  .       G CT        .         .            TGTAA              G  T   . A     . .             .                  .   .  TTT  . .     . GCCC   .     .        C .   CAAG        .   .  AATG      .   GCA           CAA    . A    T    T .         C        A T   A     G AA           AC TG       C     .  .        . .  .                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          T  .         .        .     G  .   G   T .  G  .   .     .     .         T         .  T     G    .    .    GG    A          .   .    G      .    .   T AGGCTTTAAC           .    . A          T   A  .       A GT        .         .            AGTAT              A  T   . T     . .             .                  .   .  ATT  . .     . CAAC   .     .        T .   AAT         .   .  AAGA      .   TGA           CAA    . G    C    . .         A        G T   A     A GT           A  G        T     .  .        . .  .                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          A  .         .        .     G  .   T   A .  T  .   .     .     .         A         .  T     A    .    .    TA    A          .   .    C      .    .   C ATGTATGACA           .    . A          T   C  .       A TA        .         .            TTTAT              T  T   . G     . .             .                  .   .  GTT  . .     . TCCG   .     .        A .   AAT         .   .  AAG       .   TGT           TTT    . T    T    . .         T        T T   .     . T            .  G        .     .  .        . .                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                       .          A  .         .        .     T  .   G   T .  A  .   .     .     .         A         .  T     T    .    .    AG    G          .   .    A      .    .   T GTTTGTTTGT           .    . A          A   G  .       G CT        .         .            AGTAT              C  T   . G     . .             .                  .   .  ATG  . .     . CCG    .     .        A .   TT          .   .  TA        .   TAT           CAA    . A    T    . .         C        . .                                                                                                                                                                                                                                           
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|118180 ): AAAAAAATGTTATTAATATGACTACAACCATTTCGTTAATGAGCTTGCATAAGTGATAAAACTCGATTACC






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gi|118132                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a---CAC-AT-CCGTT-----G--CATCTTGCA---T-C-AAtcgcacatccgttgcatcttgcatcaagta
gi|118133                     : agtcagttgttgacaaaacgattcgtgtctttaatatattgttgtacttgtgtaaatatgaatgtatttgtgtcactggtatatgtactcttaccaagtaaaagcactcgtgtactaaagggatgaaaacggcgtgtagaacgaaaatcg-CAAGTCGTTTTGA----GTCTTT-----AATG-AA-TTGTT---G-CACAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CGTC-G-TT-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGAAA--AGTATTA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TAGTTCG-TTTAAG-A------------A-TAT--A-A-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTCGACGTCTTCT-TTT-TCGTT-A-C---CACAAC-CCG-G-----G--CATCTAGAA---T-C-TGT----TG---T-----AAGTCGAT---G----T------AAAT--TGAT-CAA-AA-C-CTAA-ATTACTACACCCGTTTC-TAATGCGTGCGTGTATTA-AA--GATAACTT--TC-T--AT---TT--C-CAGTAATA-T-AA--TACTGA---GGCA--CTGGT---------TGTACG-T------T----AA-AG--AA----A------TTTG-TG-ACTGAAG---T-AC----G-TTT-A-AA-----AGAC-ATTTAT----GTTTCTGAG--CAACGTATGTGTTGA-GGAAGGGTGTTCCAATA----GGAAATACACgta
gi|118134                     :                                                                                                                                          agttaattaatat-CAAATCGTTTTGA----GTCTTT-----GATA-AA-TTGCT---G-CATAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CATC-A-TC-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGTAA--AGTATGA--T--G---AC--TAA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCA-TT--TGAG----------A-A-TAT--A-A-T---A-C--ATTTCATAAAAT--AATGTTCGACG
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gi|118137                     :                                                                                                                                                      a-CAAATCGTTTTGA----GTCTTT-----GATA-AA-TTGCT---G-CACAG-ATG-T--GA----AT--AT-A------A-AT----G-AGTT--TT-CATC-G-TC-AGTA---TAA-G--T-G------TCT---T----T----A-C-CGAA-CAGTAA--AGTATAA--T--G---AC--TGA-GA-GGAT-GAAA-TCGA-C----GTGTGGCTC-TAAA-A--AGTCGGAT---TCGTTCA-TT--TG-A----------TCA-TAT--A-A-T---A-C--GTTTCATAAAAT--AATACT-GACGTCTTCG-TTT-TCGTT-A-C---CAC-Ata
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gi|118168                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AT-GAA-------C----GTGAGACAC-GAAA-A--AGAAGAAG---TCCTTCA-TT--TTTA----------T-A--AT--AGG-G---A-C--ATTGCATAA---------TTCA------------------T-A-CCTGCAC-AA-C--TC-----A--CACACTGAA---T-CGAGT----TG---T-----AAG--------T----TAACGA-AAAC--G--T-C-ATTA-T-TTAA-GTTATTACAA------C-TGAAACGAGCATGTA--G----TAATGACAT--AC-GC-GCA--TA--CACGGTTAGA-T-AA--TAC-
gi|118169                     :                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtatgttgccaaaaaaacaacaactgcatttacactaagaaggtgtaAG--CAC-TCG--T--G-T-AC--TTA-AT-GGAT-GAAA-ACGC-C----GTGGAGAAC-GAAA-A--ACACGAAG---TTGTTCA-TC--AGTA----------T-A-CAT--A-G-A---A-C--ATTGCATATAGT--AGTGCTCGGTGTCTTCT-TTT-TCATT-A-C---CAC-AT-CCGTG-----G--CGTCTTGCA---T-C-AAG----TG---T-TTT-AAG--AAT---T----TT---A-AAAA--GTAT-C-A-AA-C-TTAAGGTGACTGCATCCGTTTC-TCAAACGAGCGTGGA--G-AACTGATAAAAT--TC-G--AC---TA--C-TAGTTAGA-T-AA--TAC-GAT--GGTA--CCATT---------TG--CG-T------TTTA-AA-AT--AC----A--T--GTTTG-TT-AT----G---T-GT----G-GTT-T-AC-----GAAC-A--GATAA-CGTCTCTGAGATAAAAATAT-TACTCG-GGAAGTGTACTCCA--A----ATAGATACGCAT
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