lowQualScore : 4444 111 333333 44444 1 1 1 1 1111 1111 11 11111 333333 222 1
lowQualScore : 11 666 4444 222 0 222 777 0 0 3 44 11 0 1 0 666666 2 0 33333 11 11 9999 333 999 7777777777777777 4 555 4 2 2 2 5 88888 3 666 3 0 4 4 3 3 77 0 1 5 4444 4444 6 3 7 22 44444 999999 555 0 4 7 3 1
lowQualScore : .. ... .... ... . ... ... . . . .. .. . . . ...... . . ..... .. .. .... ... ... ................ . ... . . . . . ..... . ... . . . . . . .. . . . .... .... . . . .. ..... ...... ... . . . . .
lowQualScore : 33 777 4444 777 8 888 777 8 8 6 77 88 8 4 3 777777 3 8 55555 11 11 7777 666 999 1111111111111111 2 999 7 5 7 5 7 22222 1 444 6 9 0 4 7 7 99 1 9 0 2222 2222 0 5 8 00 33333 000000 000 4 4 0 9 0
consensus : AAAA--A---CG-C-A---AA-TGTG--CCACC-C-GAAA-TTTAGAC-AAG--CGCC-TGCAGTCGCC-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-N-TA---C-TAC-T-A-C--CA-AGA-CTA-A-TA-CTATATATTT-A--T-TATCT---TT-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAAGAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAAACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC---T--GCGCGGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
Reference ( gi|20368 ) : AAAA--A---C----A---AA-TGTG--ACATT-C-GAAA-TTTAAAT-AAG--CACC-TGCAGTCACTC---ATATCTCTG-T-T--G--A--TGT--CT---AT---G-T-TA---C-TAC-T-A-C--CA-AGA-CTA-A-TA-CTATATATTC-A--T-TATCT---TT-AAAGTCAA-ATTT-CTTCGGGGCAGCAAGAG--TTTACGCGTGATTGAACATAATAAACTGATAAAAGACG----AGAT----AGGGATGTATACGGAAATCGTCGATAAATTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC---A--GCGC-G-ATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCAATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20343 : AAAA--A---CGCC-A---AA-TATG--ACATT-C-GAAA-TTAAAAT-AAG--CACT-TGCAGTCACTC---ATATCTTTG-T-------G--T-T--CT---AT---G-T-TA---C-TAC-T-A-C--CA-AGA-CTA-A-TA-CTATATATTTTG--T-AATCT---TT-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAAGAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAAACTTATATAAGACA----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCTTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC---T--GCGCGG-ATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGT
gi|20344 : aAAAA--A---CCGCCA---AA-TGTG--ACATT-C-GAT--TTTAAAT-AAG--CACT-TGTAGTCACTC---ATATCTCTG-T-T--T--A--TGT--TT---AT---G-T-CA---T-CAC-T-T-C--CA-AGA-CTA-A-TA-CTATAAATTT-A--T-CCTCT---TT-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAATAG--TTTACGCGTGATTGAACAGACTTAACTTATAAAAGACG----AGAT----GGAGATGTATTCGGATAGTGTCGATAAGCAGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC---T--GCGCGG-ATCGTCTGCTTAAAAACCTATATTTCGTCCTGCTACAGGAAATTGATATAGGAAATATCCGGAATATAACGAGT
gi|20345 : AAAA--A---CGCC-A---AA-TGTG--ACATT-C-GAAA-TTTAAAT-AAG--CACC-TGCAGTCACTC---TTATCTATG-T-T--T--A--TGT--CA---AT---G-C-TA---C-TAC-T-A-C--AA-AGA-CTA-A-CA-CTATATAATT-A--TCTATCTTCCTT-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAAGAT--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAAACTTATAAAAGACG----AGATAGACAGAGATGTTTACCGAAACCGTCGATAAGCTATGAATGGCGAAACGATTACCCATAACTCTT-T--GCACGG-ACCGTTTGCTTATATATCTATATTTTAT-CCGCTAC
gi|20346 : aAAAA--A---CCACCA---AA-TGTG--ACATT-T-GAAA-TTGATAT-AAG--CATC-TGCAGTTACAC---ATATTTCTG-T-T--A--A--TTT--CT---AT---T-T-TA---C-TAT-T-A-C--CA-AGA-TTA-A-TA-CTATATATTT-A--T-CATCT---TT-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAAGAG--TTTACGCGTGACTGAACAGAATAGACT
gi|20369 : AAAA--AGC-C----A---AA-TGTG--TCATT-C-GAAA-TTTAAAT-AAG--CACA-TGCAGTCACTC---TTATCTCTG-T-T--T--A--TGT--CT---TT---G------------------C--CA-AGA-CTA-A-TATCTATTTATCT-A--T-TTTCT---TT--AAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCTCAAAGAT--TTTACGTATGATTGAACAAAATAAACTTATAAAAGACGAGGTAGAC----AGAGATGTAT-CGGAAAttta
gi|20371 : aAAAA--ATGCC----A---AA-TGTG--CCACT-C-GAAA-TTTGAGT-AAAA-CACGGTGCAGTCTCT-----TATCTCTG-T-T--T--A--TAT--GT---AT---
gi|20370 : AAAA--A---CGCC-A---AA-TGTG--CCATA-C-AAAA-TT--AGTGAAG--CAGC-TACAGTCACCC-----ATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-T-T
gi|20354 : AAAA--A---C----A---AAATGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---
gi|20353 : aAAAA--G---CCA--A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTG-T-T--AATA--TGT--CT---CT---G-A-TA---
gi|20359 : agaAAAA--G---CTA--A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---
gi|20351 : agaAAAATGA---C----A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-CTTAGAC-ACA--AACC-TGAAGTTACT-----TATCTCTG-T-T--T--T--TGT--CT---
gi|20362 : aaAAAA--G---CCA--A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---A-AAC-TGA-T--CA-A-A-TTAGG-TA-CT-TGT-TTC-A--T-TA
gi|20372 : aagAAAA--A---CGTC-A---AA-TGTG--CC-TC-CAGAAA-TGTAAAC-ACG--TATC-TGCAGTCACT-----TATCACTG-T-TTAT--A--TGT--CT---aggacaa
gi|20355 : AAAA--G---CCA--A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TACC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTT-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---
gi|20357 : agaAAAA--G---CCA--A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCCCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---
gi|20358 : agaAAAA--G---CCA--A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAA--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---
gi|20363 : agaAAAA--G---CCA--A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---A-AAT-TGA-T--CA-A-A-TTAGG-TA-CT-TTTCTTC-A--T-TA
gi|20366 : agaAAAA--G---CTA--A---AA-TGTG--CAACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---aggacaa
gi|20386 : agaAAAA--G---CCA--A---AA-TGTG--CCACC-T-TAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---
gi|20360 : aAAAA--G---CCA--A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TAACTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---
gi|20367 : agaAAAA--G---CCA--A---AA-TGTG--CCACC-T-TAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTTTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---
gi|20373 : agaAAAA--A---CGCC-A---AA-TGTG--CCTCC-T-GAAA-TTTAGAT-AAG--TGCC-CGTCGTCTCTCTTTATATGTCT--T-T--G--A--T
gi|20350 : AAAA--A---CGCC-A---AA-TATT--CCTTTAC-GAAA-TTTAGAC-AAG--TACC-TGCAGTTACC-----TGTCTCTG-TCT--AT-A--TGT--CT---CTG--G-T-TT---CATAT-T-A----CA-A----TA-A-T--CTAGGTACTG-AATT-TTTTT---TT-AA--TCGATATTT-TTacta
gi|20375 : aAAA--A---CGGC-A---AA-TGTT--CCACC-C-GCAA-TTTAGAC-AAG--CGTC-AGCAGTCACT-----TATCTCTG-T-T--T--ATCTGT--CT---AT---A-T-aatgaacaccgaactgacagcaagtctcggcttgatgaacagttgtgaaaaatgaaa
gi|20377 : AAA--ATACC----A---AA-TGTT--CCACT-C-GAAAATTTAGAC-ATG--CATC-TGAAGTCACT-----TATCTCTG-T-T--T--A--TATAACT---GTTAAGTT-TA---C-TTT-T-A-T--CA-A-A-CTG-A-TA-TT
gi|20374 : AAA--A---CGTC-A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--CACG-TGTAGTTG--C---GTATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-C-T
gi|20348 : AAA--A---CGCC-A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAAAC-AAG--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTG-T-T--C--A--GGC--CC---GTA--G-C-TA---C-T-C-T-G-TGGCACAGG-CAG-A-CA-C--TATATTT-A--T-TATTA---TT-A
gi|20376 : agAAA--A---CGCC-A---AA-TGTG--CTATC-C-GAAA-TTTATTC-AAA--TACC-TGAAGTTACTC---AATTCTCTGTT-T--GT-A--TAT--CT---CT---G-A-TA---T-TAA-T-A-
gi|20379 : AAA--A---CGCCAA---AA-TGTT--CCACC-C-GAAA-TTTAAAA-AAA--CACC-TTCAGTCACT----A-ATTTCTG-T-T--T--A--T
gi|20349 : AAA--A---CGTC-A---AA-CGTG--TCACC-T-GAAA-TCCAGAC-AAG--TGCC-CGCAGTTAC-C---A-ATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G----------TAT-T-G-C--CA-A-A-CTA-A-
gi|20387 : agAAA--ATGTC----A---GG-TGTG--CTACC-C-AAAA-TTTAGAC-AAG--TACC-TGCAGTTA--C---GTATCTGTG-T-T--AATA--TGT--CT---
gi|20384 : AAA--A---CGTC-A---GA-TGTG--CCAAC-C-GGAA-TTTGC-C-AAG--CACC-TAAAGTCACT-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-
gi|20378 : AAA--A---C----ACAAAA-TGTA--TCACC-T-AAAA-TTTAGAC-AAG--CACC-TGCAGTTACT-----TATCTTT-------------TGT--AT---AT---A-CATA---T-GAC-T-T-G--TA-AGATTTA-T-TA-ATGTATATGT-A-----AACA---TT-AAAGTTAG-ATTTACTT
gi|20382 : AAA--A---CGCC-A---AA-TGTG--CCAC--C-GTAA-TTTAGCC-AAG--CAGC-TGCTGCCAC-----ATATCTCTG-T-T--T--A--Ttt
gi|20365 : AAA--A---CGTA-A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTCAGAC-AAT--TGCC-TCCAGTTGC-C---G-ATCTCTG-T-T--------TG----T---AT---G-TCTG---C-TAT-A-A-C--CA-AG--CTA-
gi|20381 : agAAA--A---CGCT-A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TGTAGTTGCT-----TTTCTCTG-T-T----------T--AT---AT---G-T------C-T-C-T---------GGA-ATA-A-TA-CAAT-TA---------CATCT---T---------A-ACCT-TTTCA----AACAAAAGGACTTG-GCATGA--ACATATAATAAACTTATAAATGA
gi|20391 : AAA--A---C----GCAGAA-TGTG--TCACC-C-AAAA-GTAAGAC-GAA--AACC-TGCAGTTACT-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---TT---G-T-TG---C-CAT-G-G-T--TA-GAG-TTA-AGTA-CTATTTA
gi|20352 : AAA--A---CGCC-A---AA-TGCG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-GCCAATTACC-----TATCTCTGCT-T--AT-A--TGT--CT---CT---G-
gi|20392 : agAAA--A---CGCCAA---AA-TATG--CTATC-C-GAAA-C-------AAG--CACC-TTCACTCACTT---ATA--CCTG-T-T----------T--AT---AT---G-T-TA---C-T
gi|20356 : AAA--ATGCC----A---AA-TGTGCCACAT----GAAA-TTTTGAC-AAT--TGCC-TCCAGTTGCC-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-A-TA---G-TAC-
gi|20390 : agAAA--A---CGCTAA---AA-TGTG--ACACC-T-GAAA-TTTAGAG-ATG--TGTT-TGCAGCTGCCA---ATGTCTTTG-T-TTAC--A--TGT--CT---CT---G-G-TA---T-TGCTT-A-C--AACAGC-TTC-A-TA-TTCT-TTTTT-T--T-TATAT---TT-AATG-CAA-AT
gi|20364 : AAA--A---CGCC-A---AA-TGTG--CCGTC-T-GGAA-TTTAGGC-AAT--TGCC-TCCAGTTGCC-----TGCCTCTGCT-T--AT-A--TGT--CT---CT---G-T-
gi|20393 : ag---C----A---AA-TGTG--ACATT-T-GAAA-TTTATAT-AAG--CATC-TACAGTCACAC---ATATTTCTG-T-T--T--A--TTT--CT---AT---G-T-AA---C-TAC-C-A-C--CA-AGA-CTT-A-TA-CTATATATTT-A--T-CATCT---TTCAAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAAGAG--TTTACGTGTGATTGAACAGAATAAACTTATAAAAGACG----ATAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAGGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCAAAACTC---T--GCGCAG-ATCGTTTGCTTAAAAAATTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGC
gi|20347 : aaacac---C----A---AA-TGTA--CCACA-C-GAAA-TTTAAAC-ACT--CACC-TGCAGTCACT-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CTTCGAT---T-C-TA---C-T-C-T-A-C--
gi|20396 : agaaagcac---C----A---AA-TGTG--CCATC-C-GAAA-TTTAGAC-AAG--CAAA-TGCAATCACT-----TATCTCGG-T-
gi|20394 : gt---C----A---AA-TGTG--CAACC-C-GAAA-TTTTGAA-AAG--CACC-TTTAGTCACT-----TATCTCTG-T-T--T--A--TAT--atatggttctctgata
gi|20395 : aaacgt---C----A---AG-AGTG--CCACC-C-GAAA-TT--AAT-ACGTGCACC-TGCAGTCACT-----TATCTTTG-T-T--T--A--TGT--
gi|20397 : atgc---C----A---AA-TGTG--CCACC-T-AAAA-TTTAGAC-AAG--TGCC-TACAGTTGCC-----TATCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CC---CT---G-A-TA---------T-A-C--CA-
gi|20388 : c---C----A---AA-TGTG--CCAAC-C-GACA-TTTAGAC-AAT--CACG-TACCTTCACT-----TATCTCTG-T-T--T--A--TAT--
gi|20361 : aaagcgc---C----A---AA-TGTG--CCACC-T-GAAA-TTTAGAC-AGT--TTCC-TCCAGTTGCC-----TTTCTCTG-T-TTAT--A--TGT--CT---CT---G-T-TA---
gi|20385 : agaaatcgc---AA-TGTA--CCATT-T-TAAA-TTTAGAC-GAG--TACC-TGCAGTTGCT----A-ATCTTTG-T-TTAT--A--TGT--CT---TT---G-G-TA---
gi|20389 : agaacgcttA-TGTG--GCACC-C-ACAA-TTTAACC-ATG--TATC-TGCAGT--TTC---TTATCTCTG-T-T--T--A--TGT--CT---CT---G-C-TATGTT-CAC-T-ATC--CA-AAA-
gi|20380 : aaaacgtcagcatttt-C-GAAA-TTTAGAC-AGG--CACC-TGTAGTCACTT---ATATCTATT-T-A--G--A--TGT--CTC--AT---G-
gi|20398 : aaaacgccaaatatgccacccgaaaggaccATAAAAGACG----ATAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCTAAACTC---T--GCGA-GGATTGTCTGCTTAAAAATTTATATATCGT-CTGCCACAGGTAATCGCTATCGACAATATCCGGAATATAACGAGC
gi|20399 : taacacct-----TACCCATTACTC---TTTGCGC-GGATCGTCTGCTAAAAAGTCAATATTTCGT-ATGCTACAGGTAATCACTCTCGGGATTTGCCGGAAATTAACGAGC
gi|20400 : -----TGCCGATAACTCTTTA---CGC-GGATCGTCTGCT--AAAATCGATATTTCGT-CAGCTACAGTTAATAGATATCGG--ATATTCTGA
gi|20402 : GC-G-ATCGTCTGGTTAAAAAATTATATTTCGT-CTGTTACAGGTAATCGCTGTCGGAAATATCCAGAATATAACGAGC
gi|20401 : tct-CTGCTACAAGTAATCGTTATCGGGAATTGCCGGAAATTAACGAG
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20383 ): AAAATGTCAGATGTGTCACCCAAAGTTTAGACAAGCAACTGTAGTTACTTATTTCTGTTTATATGTCTCTG
Alignments
lowQualScore : 22 111111111 1111 1111 11111 11 222
lowQualScore : 0 77 66 1 1 333333333333 0 0 0 1 11 6666 11 11 0 222 66 111 7777 22 44444 4 0 2 2 2 2 0 3 3 666666 555 3 0 3 4 777777777 66 3 4 0000 2222 1 11111 55 66 333 0 2 4 2
lowQualScore : . .. .. . . ............ . . . . .. .... .. .. . ... .. ... .... .. ..... . . . . . . . . . ...... ... . . . . ......... .. . . .... .... . ..... .. .. ... . . . .
lowQualScore : 8 77 66 5 5 777777777777 7 7 7 9 00 3333 00 11 9 666 11 888 8888 33 77777 2 1 2 5 7 9 4 1 1 666666 444 1 5 3 0 888888888 11 6 0 6666 1111 7 11111 55 55 222 9 6 0 4
consensus : AAAA-ACG--CC-A-AA-TGTGCCACC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCGCC-TGCAGT--CGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-NT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGC-GGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
Reference ( family-437 ) : AAAA-ACG--C--A-AA-TGTGCCACC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCGCC-TGCAGT--CGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-NT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
gi|20343 : AAAA-ACG--CC-A-AA-TATGACATT-C----------GAAA-TTA-AAATAAGCACT-TGCAGT--CAC-T--CA--TATCT--TTGTGT---TCTA-T---G-TT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TTTG--T-AATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATATAAGACA----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCTTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGC-GGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20344 : aAAAA-CCG--CC-A-AA-TGTGACATT-C----------GAT--TTT-AAATAAGCACT-TGTAGT--CAC-TCATA--TCTCTGTTTAT--G--TTTA-T---G-TC---A---TCAC-TT-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TAAAT-TT-A--T-CCTCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------TAG--TTTACGCGTGATTGAACAGACTTA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----GGAGATGTATTCGGATAGTGTCGATAAGCAGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGC-GGATCGTCTGCTTAAAAACCTATATTTCGTCCTGCTACAGGAAATTGATATAGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20345 : aAAAA-ACG--CC-A-AA-TGTGACATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCACC-TGCAGT--CAC-TCTTA--TCTATGTTTAT--G--TCAA-T---G-CT---A---CTAC-TA-C--AA-AGA-CTAA-CA-CTA-TATAA-TT-A--TCTATCTTCCTT-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAT--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGATAGACAGAGATGTTTACCGAAACCGTCGATAAGCTATGAATGGCGAAACGATTACCCATAACTCTTT--GCAC-GGACCGTTTGCTTATATATCTATATTTTAT-CCGCTAC
gi|20346 : aAAAA-ACCACC--A-AA-TGTGACATT-T----------GAAA-TTG-ATATAAGCATC-TGCAGTTACAC-A--TA--TTTCTGTT-A-ATT--TCTA-T---T-TT---A---CTAT-TA-C--CA-AGA-TTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-CATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGACTGAACAGAATAG-ACTTTTA
gi|20347 : --C--A-AA-TGTACCACA-C----------GAAA-TTT-AAACACTCACC-TGCAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTT-C---G-AT---T---CTAC-T
gi|20348 : agaaagcacAAA-ACG--CC-A-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AAACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTCA---G--GCCCGTA--G-CT---A---CT-C-TG-TGGCACAGG-CAGA-CA-C---TATAT-TT-A--T-TATTAT---T-Actac
gi|20349 : agAAA-ACGT-C--A-AA-CGTGTCACC-T----------GAAA-TCC-AGACAAGTGCC-CGCAGT--TAC-C--AA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-----------TAT-TG-C--CA-A-A-CTAA-
gi|20350 : agAAAA-ACG--CC-A-AA-TATTCCTTTAC----------GAAA-TTT-AGACAAGTACC-TGCAGT--TAC-C--TG--TCTCTGTCTATATG--TCTC-T---G-GTTTCA----TAT-TA----CA-A----TAA-T--CTA-GGTAC-TG-AATT-TTTTTT---T-AA--TCGATATTT-TTAATGAACACCGAACTGACAGCAAG--TCTCGGCTTGA-TGAACAG--------TTGTGAAAAATG----AAA
gi|20351 : aAAAA-ATGA-C--A-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-CTT-AGACACAAACC-TGAAGT--TAC-T--TA--TCTCTGTTT-T-TG--TCT
gi|20352 : aAAA-ACG--CC-A-AA-TGCGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGCC-GCCAAT--TAC-C--TA--TCTCTGCTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20353 : agAAA-AAG--CCAA-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTAATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20354 : agAAAA-ACA-----A-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20355 : aAAA-AAG--CCAA-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTACC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTTTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20356 : agAAA-ATG--CC-A-AA-TGTGCCACA-T----------GAAA-TTT-TGACAATTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---GTAC-
gi|20357 : agAAA-AAG--CCAA-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCCCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20358 : agAAA-AAG--CCAA-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAATGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20359 : agAAA-AAG--CTAA-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20360 : agAAA-AAG--CCAA-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--ACTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20361 : agAAA-TCG--CC-A-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAGTTTCC-TCCAGT--TGC-C--TT--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-TT---A---
gi|20362 : agAAAA-GCC--A--A-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---AAAC-T---------GA-TCAA--A-TTA-GGTAC-TT-G--T-T-TCAT---T-AAGGACAA-
gi|20363 : aagAAA-AAG--CCAA-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20364 : agAAA-ACG--CC-A-AA-TGTGCCGTC-T----------GGAA-TTT-AGGCAATTGCC-TCCAGT--TGC-C--TG--CCTCTGCTTATATG--TCTC-T---G-aaattgatcaaattaggtacttttcttcattaaggacaa
gi|20365 : agAAA-ACG--T--A-AAATGTGCCACC-T----------GAAA-TTC-AGACAATTGCC-TCCAGT--TGC-C--GA--TCTCTGTTTGTATG----TC-T---G-CT---A----TA---A-C--CA-AG--CTAt
gi|20366 : agAAA-AAG--CTAA-AA-TGTGCAACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCT
gi|20367 : agAAA-AAG--CCAA-AA-TGTGCCACC-T----------TAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTTTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20368 : agAAAA-AC------A-AA-TGTGACATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCACC-TGCAGT--CAC-TCATA--TCTCTGTTGAT--G--TCTA-T---G-TT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TC-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCGGGGCAGCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACATAATAA-ACTGATAAAAGACG----AGAT----AGGGATGTATACGGAAATCGTCGATAAATTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--A--GCGC--GATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCAATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20369 : AAAA-GC---C--A-AA-TGTGTCATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCACA-TGCAGT--CAC-TCTTA--TCTCTGTTTAT--G--TCTT-T---G------------------C--CA-AGA-CTAA-TATCTA-TTTAT-CT-A--T-TTTCTT---T--AAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCTCAAA---------GAT--TTTACGTATGATTGAACAAAATAA-ACTTATAAAAGACGAGGTAGAC----AGAGATGTAT-CGGAAA
gi|20370 : aaAAAA-ACG--CC-A-AA-TGTGCCATA-C----------AAAA-TT--AGTGAAGCAGC-TACAGT--CAC-C--CA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-TT---
gi|20371 : AAAA-ATG--CC-A-AA-TGTGCCACT-C----------GAAA-TTTGAGTAAAACACGGTGCAGT--CTC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--T
gi|20372 : AAAA-ACGT-C--A-AA-TGTGCCTCC-A----------GAAA-TGT-AAACACGTATC-TGCAGT--CAC-T--TA--TCACTGTTTATATG--TCTat
gi|20373 : AAAA-ACG--CC-A-AA-TGTGCCTCC-T----------GAAA-TTT-AGATAAGTGCC-C---GT--CG---------TCTCTCTTTATATG--TCTT-T---G-AT---A---CTA
gi|20374 : AAA-ACGT-C--A-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGCACG-TGTAGT--TGC-G--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-CT---
gi|20375 : AAA-ACGG-C--A-AA-TGTTCCACC-C----------GCAA-TTT-AGACAAGCGTC-AGCAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATCTG--TCT
gi|20376 : AAA-ACG--CC-A-AA-TGTGCTATC-C----------GAAA-TTT-ATTCAAATACC-TGAAGT--TAC-T--CAATTCTCTGTTTGTATA--TCTC-T---G-AT---A---TTAA-TA-atat
gi|20377 : AAAATAC---C--A-AA-TGTTCCACT-C----------GAAAATTT-AGACATGCATC-TGAAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATA--ACTG-TTAAGTTT---A---CTTT-TA-T--CA-A-A-CTGA-TA-TT
gi|20378 : AAA-ACA--C--A-AAATGTATCACC-T----------AAAA-TTT-AGACAAGCACC-TGCAGT--TAC-T--TA--TCTTT-TGTATATA--CATA-T---G------------AC-TT-G--TA-AGATTTAT-TA-ATG-TATAT-GT-A-----AACAT---T-AAAGTTAG-ATTTACTTTT
gi|20379 : AAA-ACG--CCAA-AA-TGTTCCACC-C----------GAAA-TTT-AAAAAAACACC-TTCAGT--CAC-T--AA--TTTCTGTTTAT
gi|20380 : AAA-ACG--CC-A-AA-TATGCCACC-CGAAAGGACCCGAAA-TTT-AGACAGGCACC-TGTAGT--CAC-T--TA--TATCTATTTAGATG--TCTC-
gi|20381 : AAA-ACG--CT-A-AA-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TGTAGT--TGC-T--TT--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-------------------------GA-ATAA-TA-CAATTACATCTT-A-----ACCTT---T-----TCAA-A---------------CAA---------AAGGACTTG-GCATGA--ACATATAATAA-ACTTATAAATGAatg
gi|20382 : AAA-ACG--CC-A-AA-TGTGCCACC------------GTAA-TTT-AGCCAAGCAGC-TGCTGC--CAC-A--TA--TCTCTGTTTAT
gi|20383 : AAA-ATGT-C--A-GA-TGTGTCACC-C----------AAAG-TTT-AGACAAGCAAC-TGTAGT--TAC-T--TA--TTTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20384 : AAA-ACGT-C--A-GA-TGTGCCAAC-C----------GGAA-TTT--GCCAAGCACC-TAAAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20385 : AGA-ACG--C--TTAA-TGTACCATT-T----------TAAA-TTT-AGACGAGTACC-TGCAGT--TGC-T--AA--TCTTTGTTTATATG--TCTT-T---G-GT---A---
gi|20386 : AAA-AAG--CCAA-AA-TGTGCCACC-T----------TAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20387 : AAA-ATGT-C--A-GG-TGTGCTACC-C----------AAAA-TTT-AGACAAGTACC-TGCAGT--TAC-G--TA--TCTGTGTTAATATG--TCT
gi|20388 : AAA-GCG--CC-A-AA-TGTGCCAAC-C----------GACA-TTT-AGACAATCACG-TACCTT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATAT
gi|20389 : A-TGTGGCACC-C----------ACAA-TTT-AACCATGTATC-TGCAGT--TTC-T--TA--TCTCTGTT--TATG--TCTC-T---G-CT---ATGTTCAC-TATC--CA-AAA-
gi|20390 : aaaacgtcagcattttAAA-ACG--CTAA-AA-TGTGACACC-T----------GAAA-TTT-AGAGATGTGTT-TGCAGC--TGC-CAATG--TCTTTGTTTACATG--TCTC-T---G-GT---A---TTGCTTA-C--AACAGC-TTCA-TA-TTC-T-TTT-TT-T--T-TATATT---T-AATG-CAA-AT
gi|20391 : AAA-ACG--C--AGAA-TGTGTCACC-C----------AAAA-GTA-AGACGAAAACC-TGCAGT--TAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTT-T---G-TT---G---CCAT-GG-T--TA-GAG-TTAAGTA-CTA-TTTA
gi|20392 : AAA-ACG--CCAA-AA-TATGCTATC-C----------GAAA--------CAAGCACC-TTCACT--CAC-T--TA--TACCTGTTTATATG--T
gi|20393 : AA-ACA--CC-A-AA-TGTGACATT-T----------GAAA-TTT-ATATAAGCATC-TACAGT--CACACA-TA--TTTCTGTTTAT-T---TCTA-T---G-TA---A---CTAC-CA-C--CA-AGA-CTTA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-CATCTT---TCAAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGTGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----ATAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAGGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCAAAACTC--T--GCGC-AGATCGTTTGCTTAAAAAATTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCGtact
gi|20394 : AA-ACGT-C--A-AA-TGTGCAACC-C----------GAAA-TTT-TGAAAAGCACC-TTTAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATAT
gi|20395 : --C--A-AG-AGTGCCACC-C----------GAAA-TTA-ATACGTGCACC-TGCAGT--CAC-T--TA--TCTTTGTTTATGT
gi|20396 : atgc--C--A-AA-TGTGCCATC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCAAA-TGCAAT--CAC-T--TA--TCTCGG--TATATGGTTCTC-T---G-AT---A---
gi|20397 : gt--C--A-AA-TGTGCCACC-T----------AAAA-TTT-AGACAAGTGCC-TACAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCCC-T---G-AT---A--------TA-C--CA-
gi|20398 : cTAACACCTATAAAAGACG----ATAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCTAAACTC--T--GCG-AGGATTGTCTGCTTAAAAATTTATATATCGT-CTGCCACAGGTAATCGCTATCGACAATATCCGGAATATAACGAGCG
gi|20399 : -----TACCCATTACTC--TTTGCGCGG-ATCGTCTGCTAAAAAGTCAATATTTCGT-ATGCTACAGGTAATCACTCTCGGGATTTGCCGGAAATTAACGAGCG
gi|20400 : -----TGCCGATAACTC--TTTACGCGG-ATCGTCTGCT--AAAATCGATATTTCGT-CAGCTACAGTTAATAGATATCGG--ATATTCTGA
gi|20401 : -----TACCCATAACTC--TTTGCGCGG-ATCAT--------AAG-------------CTGCTACAAGTAATCGTTATCGGGAATTGCCGGAAATTAACGAG
gi|20402 : TC--T--GCG----ATCGTCTGGTTAAAAAATTATATTTCGT-CTGTTACAGGTAATCGCTGTCGGAAATATCCAGAATATAACGAGCG
Alignments
lowQualScore : 1 111111111 1111 1111 11111 11
lowQualScore : 222222 0 333333333333 0 0 0 1 11 6666 11 11 0 222 66 111 7777 22 44444 4 0 2 2 2 2 0 3 3 666666 555 3 0 3 4 777777777 66 3 4 0000 2222 1 11111 55 66 0 2 4 2
lowQualScore : ...... . ............ . . . . .. .... .. .. . ... .. ... .... .. ..... . . . . . . . . . ...... ... . . . . ......... .. . . .... .... . ..... .. .. . . . .
lowQualScore : 111111 2 777777777777 7 7 7 9 00 3333 00 11 9 666 11 888 8888 33 77777 2 1 2 5 7 9 4 1 1 666666 444 1 5 3 0 888888888 11 6 0 6666 1111 7 11111 55 55 9 6 0 4
consensus : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCGC-CTGCAGT--CGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-NT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
Reference ( family-437 ) : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCGC-CTGCAGT--CGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-NT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
gi|20343 : AAAAACGCCAA------A-TATGACATT-C----------GAAA-TTA-AAATAAGCAC-TTGCAGT--CAC-T--CA--TATCT--TTGTGT---TCTA-T---G-TT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TTTG--T-AATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATATAAGACA----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCTTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20344 : aAAAACCGCCAA------A-TGTGACATT-C----------GAT--TTT-AAATAAGCAC-TTGTAGT--CAC-TCATA--TCTCTGTTTAT--G--TTTA-T---G-TC---A---TCAC-TT-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TAAAT-TT-A--T-CCTCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------TAG--TTTACGCGTGATTGAACAGACTTA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----GGAGATGTATTCGGATAGTGTCGATAAGCAGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAACCTATATTTCGTCCTGCTACAGGAAATTGATATAGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20345 : aAAAAACGCCAA------A-TGTGACATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCAC-CTGCAGT--CAC-TCTTA--TCTATGTTTAT--G--TCAA-T---G-CT---A---CTAC-TA-C--AA-AGA-CTAA-CA-CTA-TATAA-TT-A--TCTATCTTCCTT-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAT--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGATAGACAGAGATGTTTACCGAAACCGTCGATAAGCTATGAATGGCGAAACGATTACCCATAACTCTTT--GCACGGACCGTTTGCTTATATATCTATATTTTAT-CCGCTAC
gi|20346 : aAAAACCACCAA------A-TGTGACATT-T----------GAAA-TTG-ATATAAGCAT-CTGCAGTTACAC-A--TA--TTTCTGTT-A-ATT--TCTA-T---T-TT---A---CTAT-TA-C--CA-AGA-TTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-CATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGACTGAACAGAATAG-ACTTTTA
gi|20347 : aAAAGCACCAA------A-TGTACCACA-C----------GAAA-TTT-AAACACTCAC-CTGCAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTT-C---G-AT---T---CTAC-T
gi|20348 : agAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AAACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTCA---G--GCCCGTA--G-CT---A---CT-C-TG-TGGCACAGG-CAGA-CA-C---TATAT-TT-A--T-TATTAT---T-Actac
gi|20349 : agAAAACGTCAA------A-CGTGTCACC-T----------GAAA-TCC-AGACAAGTGC-CCGCAGT--TAC-C--AA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-----------TAT-TG-C--CA-A-A-CTAA-
gi|20350 : agAAAAACGCCAA------A-TATTCCTTTAC----------GAAA-TTT-AGACAAGTAC-CTGCAGT--TAC-C--TG--TCTCTGTCTATATG--TCTC-T---G-GTTTCA----TAT-TA----CA-A----TAA-T--CTA-GGTAC-TG-AATT-TTTTTT---T-AA--TCGATATTT-TTAATGAACACCGAACTGACAGCAAG--TCTCGGCTTGA-TGAACAG--------TTGTGAAAAATG----AAA
gi|20351 : aAAAAATGACAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-CTT-AGACACAAAC-CTGAAGT--TAC-T--TA--TCTCTGTTT-T-TG--TCT
gi|20352 : aAAAACGCCAA------A-TGCGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CGCCAAT--TAC-C--TA--TCTCTGCTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20353 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTAATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20354 : agAAAAACA--AA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20355 : aAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTAC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTTTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20356 : agAAAATGCCAA------A-TGTGCCACA-T----------GAAA-TTT-TGACAATTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---GTAC-
gi|20357 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCCCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20358 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAATGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20359 : agAAAAAGCTAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20360 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--ACTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20361 : agAAATCGCCAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAGTTTC-CTCCAGT--TGC-C--TT--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-TT---A---
gi|20362 : agAGAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---AAAC-T---------GA-TCAA--A-TTA-GGTAC-TT-G--T-T-TCAT---T-AAGGACAA-
gi|20363 : aAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20364 : agAAAACGCCAA------A-TGTGCCGTC-T----------GGAA-TTT-AGGCAATTGC-CTCCAGT--TGC-C--TG--CCTCTGCTTATATG--TCTC-T---G-aaattgatcaaattaggtacttttcttcattaaggacaa
gi|20365 : agAAAACGTAAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTC-AGACAATTGC-CTCCAGT--TGC-C--GA--TCTCTGTTTGTATG----TC-T---G-CT---A----TA---A-C--CA-AG--CTAt
gi|20366 : agAAAAAGCTAA------AATGTGCAACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCT
gi|20367 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------TAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTTTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20368 : agAAAAAC---AA------A-TGTGACATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCAC-CTGCAGT--CAC-TCATA--TCTCTGTTGAT--G--TCTA-T---G-TT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TC-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCGGGGCAGCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACATAATAA-ACTGATAAAAGACG----AGAT----AGGGATGTATACGGAAATCGTCGATAAATTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--A--GCGC-GATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCAATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20369 : AAAAAAGCCAA------A-TGTGTCATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCAC-ATGCAGT--CAC-TCTTA--TCTCTGTTTAT--G--TCTT-T---G------------------C--CA-AGA-CTAA-TATCTA-TTTAT-CT-A--T-TTTCTT---T--AAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCTCAAA---------GAT--TTTACGTATGATTGAACAAAATAA-ACTTATAAAAGACGAGGTAGAC----AGAGATGTAT-CGGAAA
gi|20370 : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCATA-C----------AAAA-TT--AGTGAAGCAG-CTACAGT--CAC-C--CA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-TT---
gi|20371 : AAAAATGCCAA------A-TGTGCCACT-C----------GAAA-TTTGAGTAAAACACGGTGCAGT--CTC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--T
gi|20372 : AAAAACGTCAA------A-TGTGCCTCC-A----------GAAA-TGT-AAACACGTAT-CTGCAGT--CAC-T--TA--TCACTGTTTATATG--TCTat
gi|20373 : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCTCC-T----------GAAA-TTT-AGATAAGTGC-CC---GT--CG---------TCTCTCTTTATATG--TCTT-T---G-AT---A---CTA
gi|20374 : AAAACGTCAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGCAC-GTGTAGT--TGC-G--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-CT---
gi|20375 : AAAACGGCAA------A-TGTTCCACC-C----------GCAA-TTT-AGACAAGCGT-CAGCAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATCTG--TCT
gi|20376 : AAAACGCCAA------A-TGTGCTATC-C----------GAAA-TTT-ATTCAAATAC-CTGAAGT--TAC-T--CAATTCTCTGTTTGTATA--TCTC-T---G-AT---A---TTAA-TA-atat
gi|20377 : AAAATACCAA------A-TGTTCCACT-C----------GAAAATTT-AGACATGCAT-CTGAAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATA--ACTG-TTAAGTTT---A---CTTT-TA-T--CA-A-A-CTGA-TA-TT
gi|20378 : AAAACACAAA------A-TGTATCACC-T----------AAAA-TTT-AGACAAGCAC-CTGCAGT--TAC-T--TA--TCTTT-TGTATATA--CATA-T---G------------AC-TT-G--TA-AGATTTAT-TA-ATG-TATAT-GT-A-----AACAT---T-AAAGTTAG-ATTTACTTTT
gi|20379 : AAAACGCCAA------AATGTTCCACC-C----------GAAA-TTT-AAAAAAACAC-CTTCAGT--CAC-T--AA--TTTCTGTTTAT
gi|20380 : AAAACGCCAA------A-TATGCCACC-CGAAAGGACCCGAAA-TTT-AGACAGGCAC-CTGTAGT--CAC-T--TA--TATCTATTTAGATG--TCTC-
gi|20381 : AAAACGCTAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTGTAGT--TGC-T--TT--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-------------------------GA-ATAA-TA-CAATTACATCTT-A-----ACCTT---T-----TCAA-A---------------CAA---------AAGGACTTG-GCATGA--ACATATAATAA-ACTTATAAATGAatg
gi|20382 : AAAACGCCAA------A-TGTGCCACC------------GTAA-TTT-AGCCAAGCAG-CTGCTGC--CAC-A--TA--TCTCTGTTTAT
gi|20383 : AAAATGTCAG------A-TGTGTCACC-C----------AAAG-TTT-AGACAAGCAA-CTGTAGT--TAC-T--TA--TTTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20384 : AAAACGTCAG------A-TGTGCCAAC-C----------GGAA-TTT--GCCAAGCAC-CTAAAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20385 : AGAACGCTTA------A-TGTACCATT-T----------TAAA-TTT-AGACGAGTAC-CTGCAGT--TGC-T--AA--TCTTTGTTTATATG--TCTT-T---G-GT---A---
gi|20386 : AAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------TAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20387 : AAAATGTCAG------G-TGTGCTACC-C----------AAAA-TTT-AGACAAGTAC-CTGCAGT--TAC-G--TA--TCTGTGTTAATATG--TCT
gi|20388 : AAAGCGCCAA------A-TGTGCCAAC-C----------GACA-TTT-AGACAATCAC-GTACCTT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATAT
gi|20389 : AAAACGTCAGCATTTTA-TGTGGCACC-C----------ACAA-TTT-AACCATGTAT-CTGCAGT--TTC-T--TA--TCTCTGTT--TATG--TCTC-T---G-CT---ATGTTCAC-TATC--CA-AAA-
gi|20390 : AAAACGCTAA------AATGTGACACC-T----------GAAA-TTT-AGAGATGTGT-TTGCAGC--TGC-CAATG--TCTTTGTTTACATG--TCTC-T---G-GT---A---TTGCTTA-C--AACAGC-TTCA-TA-TTC-T-TTT-TT-T--T-TATATT---T-AATG-CAA-AT
gi|20391 : AAAACGCAGA------A-TGTGTCACC-C----------AAAA-GTA-AGACGAAAAC-CTGCAGT--TAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTT-T---G-TT---G---CCAT-GG-T--TA-GAG-TTAAGTA-CTA-TTTA
gi|20392 : AAAACGCCAA------AATATGCTATC-C----------GAAA--------CAAGCAC-CTTCACT--CAC-T--TA--TACCTGTTTATATG--T
gi|20393 : AAACACCAA------A-TGTGACATT-T----------GAAA-TTT-ATATAAGCAT-CTACAGT--CACACA-TA--TTTCTGTTTAT-T---TCTA-T---G-TA---A---CTAC-CA-C--CA-AGA-CTTA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-CATCTT---TCAAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGTGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----ATAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAGGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCAAAACTC--T--GCGCAGATCGTTTGCTTAAAAAATTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCGtact
gi|20394 : AAACGTCAA------A-TGTGCAACC-C----------GAAA-TTT-TGAAAAGCAC-CTTTAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATAT
gi|20395 : ATGCCAA------G-AGTGCCACC-C----------GAAA-TTA-ATACGTGCAC-CTGCAGT--CAC-T--TA--TCTTTGTTTATGT
gi|20396 : GTCAA------A-TGTGCCATC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCAA-ATGCAAT--CAC-T--TA--TCTCGG--TATATGGTTCTC-T---G-AT---A---
gi|20397 : CCAA------A-TGTGCCACC-T----------AAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTACAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCCC-T---G-AT---A--------TA-C--CA-
gi|20398 : TAACACCTATAAAAGACG----ATAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCTAAACTC--T--GCGAGGATTGTCTGCTTAAAAATTTATATATCGT-CTGCCACAGGTAATCGCTATCGACAATATCCGGAATATAACGAGCG
gi|20399 : -----TACCCATTACTC--TTTGCGCGGATCGTCTGCTAAAAAGTCAATATTTCGT-ATGCTACAGGTAATCACTCTCGGGATTTGCCGGAAATTAACGAGCG
gi|20400 : -----TGCCGATAACTC--TTTACGCGGATCGTCTGCT--AAAATCGATATTTCGT-CAGCTACAGTTAATAGATATCGG--ATATTCTGA
gi|20401 : -----TACCCATAACTC--TTTGCGCGGATCAT--------AAG-------------CTGCTACAAGTAATCGTTATCGGGAATTGCCGGAAATTAACGAG
gi|20402 : TC--T--GCG---ATCGTCTGGTTAAAAAATTATATTTCGT-CTGTTACAGGTAATCGCTGTCGGAAATATCCAGAATATAACGAGCG
Alignments
lowQualScore : 1 111111111 1111 1111 11111 11
lowQualScore : 222222 0 333333333333 0 0 0 1 11 6666 11 11 0 222 66 111 7777 22 44444 4 0 2 2 2 2 0 3 3 666666 555 3 0 3 4 777777777 66 3 4 0000 2222 1 11111 55 66 0 2 4 2
lowQualScore : ...... . ............ . . . . .. .... .. .. . ... .. ... .... .. ..... . . . . . . . . . ...... ... . . . . ......... .. . . .... .... . ..... .. .. . . . .
lowQualScore : 111111 2 777777777777 7 7 7 9 00 3333 00 11 9 666 11 888 8888 33 77777 2 1 2 5 7 9 4 1 1 666666 444 1 5 3 0 888888888 11 6 0 6666 1111 7 11111 55 55 9 6 0 4
consensus : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCGC-CTGCAGT--CGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-NT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
Reference ( family-437 ) : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCGC-CTGCAGT--CGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-NT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
gi|20343 : AAAAACGCCAA------A-TATGACATT-C----------GAAA-TTA-AAATAAGCAC-TTGCAGT--CAC-T--CA--TATCT--TTGTGT---TCTA-T---G-TT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TTTG--T-AATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATATAAGACA----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCTTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20344 : aAAAACCGCCAA------A-TGTGACATT-C----------GAT--TTT-AAATAAGCAC-TTGTAGT--CAC-TCATA--TCTCTGTTTAT--G--TTTA-T---G-TC---A---TCAC-TT-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TAAAT-TT-A--T-CCTCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------TAG--TTTACGCGTGATTGAACAGACTTA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----GGAGATGTATTCGGATAGTGTCGATAAGCAGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAACCTATATTTCGTCCTGCTACAGGAAATTGATATAGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20345 : aAAAAACGCCAA------A-TGTGACATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCAC-CTGCAGT--CAC-TCTTA--TCTATGTTTAT--G--TCAA-T---G-CT---A---CTAC-TA-C--AA-AGA-CTAA-CA-CTA-TATAA-TT-A--TCTATCTTCCTT-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAT--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGATAGACAGAGATGTTTACCGAAACCGTCGATAAGCTATGAATGGCGAAACGATTACCCATAACTCTTT--GCACGGACCGTTTGCTTATATATCTATATTTTAT-CCGCTAC
gi|20346 : aAAAACCACCAA------A-TGTGACATT-T----------GAAA-TTG-ATATAAGCAT-CTGCAGTTACAC-A--TA--TTTCTGTT-A-ATT--TCTA-T---T-TT---A---CTAT-TA-C--CA-AGA-TTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-CATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGACTGAACAGAATAG-ACTTTTA
gi|20347 : aAAAGCACCAA------A-TGTACCACA-C----------GAAA-TTT-AAACACTCAC-CTGCAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTT-C---G-AT---T---CTAC-T
gi|20348 : agAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AAACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTCA---G--GCCCGTA--G-CT---A---CT-C-TG-TGGCACAGG-CAGA-CA-C---TATAT-TT-A--T-TATTAT---T-Actac
gi|20349 : agAAAACGTCAA------A-CGTGTCACC-T----------GAAA-TCC-AGACAAGTGC-CCGCAGT--TAC-C--AA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-----------TAT-TG-C--CA-A-A-CTAA-
gi|20350 : agAAAAACGCCAA------A-TATTCCTTTAC----------GAAA-TTT-AGACAAGTAC-CTGCAGT--TAC-C--TG--TCTCTGTCTATATG--TCTC-T---G-GTTTCA----TAT-TA----CA-A----TAA-T--CTA-GGTAC-TG-AATT-TTTTTT---T-AA--TCGATATTT-TTAATGAACACCGAACTGACAGCAAG--TCTCGGCTTGA-TGAACAG--------TTGTGAAAAATG----AAA
gi|20351 : aAAAAATGACAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-CTT-AGACACAAAC-CTGAAGT--TAC-T--TA--TCTCTGTTT-T-TG--TCT
gi|20352 : aAAAACGCCAA------A-TGCGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CGCCAAT--TAC-C--TA--TCTCTGCTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20353 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTAATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20354 : agAAAAACA--AA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20355 : aAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTAC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTTTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20356 : agAAAATGCCAA------A-TGTGCCACA-T----------GAAA-TTT-TGACAATTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---GTAC-
gi|20357 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCCCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20358 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAATGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20359 : agAAAAAGCTAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20360 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--ACTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20361 : agAAATCGCCAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAGTTTC-CTCCAGT--TGC-C--TT--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-TT---A---
gi|20362 : agAGAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---AAAC-T---------GA-TCAA--A-TTA-GGTAC-TT-G--T-T-TCAT---T-AAGGACAA-
gi|20363 : aAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20364 : agAAAACGCCAA------A-TGTGCCGTC-T----------GGAA-TTT-AGGCAATTGC-CTCCAGT--TGC-C--TG--CCTCTGCTTATATG--TCTC-T---G-aaattgatcaaattaggtacttttcttcattaaggacaa
gi|20365 : agAAAACGTAAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTC-AGACAATTGC-CTCCAGT--TGC-C--GA--TCTCTGTTTGTATG----TC-T---G-CT---A----TA---A-C--CA-AG--CTAt
gi|20366 : agAAAAAGCTAA------AATGTGCAACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCT
gi|20367 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------TAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTTTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20368 : agAAAAAC---AA------A-TGTGACATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCAC-CTGCAGT--CAC-TCATA--TCTCTGTTGAT--G--TCTA-T---G-TT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TC-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCGGGGCAGCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACATAATAA-ACTGATAAAAGACG----AGAT----AGGGATGTATACGGAAATCGTCGATAAATTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--A--GCGC-GATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCAATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20369 : AAAAAAGCCAA------A-TGTGTCATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCAC-ATGCAGT--CAC-TCTTA--TCTCTGTTTAT--G--TCTT-T---G------------------C--CA-AGA-CTAA-TATCTA-TTTAT-CT-A--T-TTTCTT---T--AAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCTCAAA---------GAT--TTTACGTATGATTGAACAAAATAA-ACTTATAAAAGACGAGGTAGAC----AGAGATGTAT-CGGAAA
gi|20370 : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCATA-C----------AAAA-TT--AGTGAAGCAG-CTACAGT--CAC-C--CA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-TT---
gi|20371 : AAAAATGCCAA------A-TGTGCCACT-C----------GAAA-TTTGAGTAAAACACGGTGCAGT--CTC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--T
gi|20372 : AAAAACGTCAA------A-TGTGCCTCC-A----------GAAA-TGT-AAACACGTAT-CTGCAGT--CAC-T--TA--TCACTGTTTATATG--TCTat
gi|20373 : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCTCC-T----------GAAA-TTT-AGATAAGTGC-CC---GT--CG---------TCTCTCTTTATATG--TCTT-T---G-AT---A---CTA
gi|20374 : AAAACGTCAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGCAC-GTGTAGT--TGC-G--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-CT---
gi|20375 : AAAACGGCAA------A-TGTTCCACC-C----------GCAA-TTT-AGACAAGCGT-CAGCAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATCTG--TCT
gi|20376 : AAAACGCCAA------A-TGTGCTATC-C----------GAAA-TTT-ATTCAAATAC-CTGAAGT--TAC-T--CAATTCTCTGTTTGTATA--TCTC-T---G-AT---A---TTAA-TA-atat
gi|20377 : AAAATACCAA------A-TGTTCCACT-C----------GAAAATTT-AGACATGCAT-CTGAAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATA--ACTG-TTAAGTTT---A---CTTT-TA-T--CA-A-A-CTGA-TA-TT
gi|20378 : AAAACACAAA------A-TGTATCACC-T----------AAAA-TTT-AGACAAGCAC-CTGCAGT--TAC-T--TA--TCTTT-TGTATATA--CATA-T---G------------AC-TT-G--TA-AGATTTAT-TA-ATG-TATAT-GT-A-----AACAT---T-AAAGTTAG-ATTTACTTTT
gi|20379 : AAAACGCCAA------AATGTTCCACC-C----------GAAA-TTT-AAAAAAACAC-CTTCAGT--CAC-T--AA--TTTCTGTTTAT
gi|20380 : AAAACGCCAA------A-TATGCCACC-CGAAAGGACCCGAAA-TTT-AGACAGGCAC-CTGTAGT--CAC-T--TA--TATCTATTTAGATG--TCTC-
gi|20381 : AAAACGCTAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTGTAGT--TGC-T--TT--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-------------------------GA-ATAA-TA-CAATTACATCTT-A-----ACCTT---T-----TCAA-A---------------CAA---------AAGGACTTG-GCATGA--ACATATAATAA-ACTTATAAATGAatg
gi|20382 : AAAACGCCAA------A-TGTGCCACC------------GTAA-TTT-AGCCAAGCAG-CTGCTGC--CAC-A--TA--TCTCTGTTTAT
gi|20383 : AAAATGTCAG------A-TGTGTCACC-C----------AAAG-TTT-AGACAAGCAA-CTGTAGT--TAC-T--TA--TTTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20384 : AAAACGTCAG------A-TGTGCCAAC-C----------GGAA-TTT--GCCAAGCAC-CTAAAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20385 : AGAACGCTTA------A-TGTACCATT-T----------TAAA-TTT-AGACGAGTAC-CTGCAGT--TGC-T--AA--TCTTTGTTTATATG--TCTT-T---G-GT---A---
gi|20386 : AAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------TAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20387 : AAAATGTCAG------G-TGTGCTACC-C----------AAAA-TTT-AGACAAGTAC-CTGCAGT--TAC-G--TA--TCTGTGTTAATATG--TCT
gi|20388 : AAAGCGCCAA------A-TGTGCCAAC-C----------GACA-TTT-AGACAATCAC-GTACCTT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATAT
gi|20389 : AAAACGTCAGCATTTTA-TGTGGCACC-C----------ACAA-TTT-AACCATGTAT-CTGCAGT--TTC-T--TA--TCTCTGTT--TATG--TCTC-T---G-CT---ATGTTCAC-TATC--CA-AAA-
gi|20390 : AAAACGCTAA------AATGTGACACC-T----------GAAA-TTT-AGAGATGTGT-TTGCAGC--TGC-CAATG--TCTTTGTTTACATG--TCTC-T---G-GT---A---TTGCTTA-C--AACAGC-TTCA-TA-TTC-T-TTT-TT-T--T-TATATT---T-AATG-CAA-AT
gi|20391 : AAAACGCAGA------A-TGTGTCACC-C----------AAAA-GTA-AGACGAAAAC-CTGCAGT--TAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTT-T---G-TT---G---CCAT-GG-T--TA-GAG-TTAAGTA-CTA-TTTA
gi|20392 : AAAACGCCAA------AATATGCTATC-C----------GAAA--------CAAGCAC-CTTCACT--CAC-T--TA--TACCTGTTTATATG--T
gi|20393 : AAACACCAA------A-TGTGACATT-T----------GAAA-TTT-ATATAAGCAT-CTACAGT--CACACA-TA--TTTCTGTTTAT-T---TCTA-T---G-TA---A---CTAC-CA-C--CA-AGA-CTTA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-CATCTT---TCAAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGTGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----ATAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAGGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCAAAACTC--T--GCGCAGATCGTTTGCTTAAAAAATTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCGtact
gi|20394 : AAACGTCAA------A-TGTGCAACC-C----------GAAA-TTT-TGAAAAGCAC-CTTTAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATAT
gi|20395 : ATGCCAA------G-AGTGCCACC-C----------GAAA-TTA-ATACGTGCAC-CTGCAGT--CAC-T--TA--TCTTTGTTTATGT
gi|20396 : GTCAA------A-TGTGCCATC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCAA-ATGCAAT--CAC-T--TA--TCTCGG--TATATGGTTCTC-T---G-AT---A---
gi|20397 : CCAA------A-TGTGCCACC-T----------AAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTACAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCCC-T---G-AT---A--------TA-C--CA-
gi|20398 : TAACACCTATAAAAGACG----ATAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCTAAACTC--T--GCGAGGATTGTCTGCTTAAAAATTTATATATCGT-CTGCCACAGGTAATCGCTATCGACAATATCCGGAATATAACGAGCG
gi|20399 : -----TACCCATTACTC--TTTGCGCGGATCGTCTGCTAAAAAGTCAATATTTCGT-ATGCTACAGGTAATCACTCTCGGGATTTGCCGGAAATTAACGAGCG
gi|20400 : -----TGCCGATAACTC--TTTACGCGGATCGTCTGCT--AAAATCGATATTTCGT-CAGCTACAGTTAATAGATATCGG--ATATTCTGA
gi|20401 : -----TACCCATAACTC--TTTGCGCGGATCAT--------AAG-------------CTGCTACAAGTAATCGTTATCGGGAATTGCCGGAAATTAACGAG
gi|20402 : TC--T--GCG---ATCGTCTGGTTAAAAAATTATATTTCGT-CTGTTACAGGTAATCGCTGTCGGAAATATCCAGAATATAACGAGCG
blockSeqs : CATTTT A CGAAAGGACCC G TA TCA AT GT TAA TT TTC TGTT CT GTGG C T G T T C . ATTTT CCT C T A ACTGACAGC GA T C AGGT AGAC T ACGAT TT TT C C A
blockSeqs : . A AC G . TCT . . A T . T C ATC C . . . . . . TCTA . . . . . . T . . . A . . TT T . A
blockSeqs : . A C G . TCA . . . C . C C TC . . . . . . . TCC . . . . . . C . . . A . . TT T . A
blockSeqs : . A C G . TCT . . . T . C T AC . . . . . . . TCA . . . . . . T . . . A . . . A . C
blockSeqs : . A T C . CAA . . . A . C C AC . . . . . . . TTA . . . . . . T . . . A . . . T . G
blockSeqs : . A C G . ACA . . . C . C C GC . . . . . . . TTA . . . . . . T . . . . . . . T . G
blockSeqs : . A T G . A . . . G . G T AC . . . . . . . TTT . . . . . . . . . . . . T . A
blockSeqs : . A T G . T . . . A . A T AC . . . . . . . TTA . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . A T C . C . . . A . C C AT . . . . . . . TCA . . . . . . . . .
blockSeqs : . A T C . C . . . A . C C TG . . . . . . . TT . . .
blockSeqs : . A T C . C . . . A . T C AC . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . A T C . T . . . A . C A GT . . . . . . . A . .
blockSeqs : . A T C . C . . . A . T T AC . . . . .
blockSeqs : . A T C . C . . . A . C C AC . . . .
blockSeqs : . . T C . C . . . A . C C A . . .
blockSeqs : . . T C . C . . . T . . T C . .
blockSeqs : . . T C . C . . . A . . C . . .
blockSeqs : . . T C . C . . . A . . . . .
blockSeqs : . . T C . C . . . C . . .
blockSeqs : . . T C . C . . . A . . .
blockSeqs : . . T C . C . . . T . . .
blockSeqs : . . T C . C . . . T . .
blockSeqs : . . T C . C . . . A .
blockSeqs : . . T C . C . . . C .
blockSeqs : . . T G . C . . . A .
blockSeqs : . . C G . C . . . G .
blockSeqs : . . C A . C . . . A .
blockSeqs : . . C G . C . . . C .
blockSeqs : . . C G . C . . . G .
blockSeqs : . . A G . T . . . T .
blockSeqs : . . T G . T . . . T .
blockSeqs : . . T G . G . . . A .
blockSeqs : . . C G . T . . . A .
blockSeqs : . . C G . T . . . . .
blockSeqs : . . C T . T . . . . .
blockSeqs : . . T G . T . . . . .
blockSeqs : . . C G . T . . . . .
blockSeqs : . . T G . T . . .
blockSeqs : . . C G . T . . .
blockSeqs : . . C A . A . . .
blockSeqs : . . T G . T . . .
blockSeqs : . . T C . T . .
blockSeqs : . . C G . T . .
blockSeqs : . . C A . C . .
blockSeqs : . . C G . G . .
blockSeqs : . . T G . T . .
blockSeqs : . . C G . T . .
blockSeqs : . . C T . T . .
blockSeqs : . . T A . T . .
blockSeqs : . . C T . T .
blockSeqs : . . C G . T .
blockSeqs : . . C G . T .
blockSeqs : . . T A . C .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCGC-CTGCAGT--CGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-NT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
finalCons : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCGC-CTGCAGT--CGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-NT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
Alignments
lowQualScore : 1 111111111 1111 1111 11111 11
lowQualScore : 222222 0 333333333333 0 0 0 1 11 6666 11 11 0 222 66 111 7777 22 44444 4 0 2 2 2 2 0 3 3 666666 555 3 0 3 4 777777777 66 3 4 0000 2222 1 11111 55 66 0 2 4 2
lowQualScore : ...... . ............ . . . . .. .... .. .. . ... .. ... .... .. ..... . . . . . . . . . ...... ... . . . . ......... .. . . .... .... . ..... .. .. . . . .
lowQualScore : 111111 2 777777777777 7 7 7 9 00 3333 00 11 9 666 11 888 8888 33 77777 2 1 2 5 7 9 4 1 1 666666 444 1 5 3 0 888888888 11 6 0 6666 1111 7 11111 55 55 9 6 0 4
consensus : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCGC-CTGCAGT--CGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-NT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
Reference ( family-437 ) : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCGC-CTGCAGT--CGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-NT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCG
gi|20343 : AAAAACGCCAA------A-TATGACATT-C----------GAAA-TTA-AAATAAGCAC-TTGCAGT--CAC-T--CA--TATCT--TTGTGT---TCTA-T---G-TT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TTTG--T-AATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATATAAGACA----AGAT----AGAGATGTATACGGAAACCTTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20344 : aAAAACCGCCAA------A-TGTGACATT-C----------GAT--TTT-AAATAAGCAC-TTGTAGT--CAC-TCATA--TCTCTGTTTAT--G--TTTA-T---G-TC---A---TCAC-TT-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TAAAT-TT-A--T-CCTCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------TAG--TTTACGCGTGATTGAACAGACTTA-ACTTATAAAAGACG----AGAT----GGAGATGTATTCGGATAGTGTCGATAAGCAGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--T--GCGCGGATCGTCTGCTTAAAAACCTATATTTCGTCCTGCTACAGGAAATTGATATAGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20345 : aAAAAACGCCAA------A-TGTGACATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCAC-CTGCAGT--CAC-TCTTA--TCTATGTTTAT--G--TCAA-T---G-CT---A---CTAC-TA-C--AA-AGA-CTAA-CA-CTA-TATAA-TT-A--TCTATCTTCCTT-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAT--TTTACGCGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----AGATAGACAGAGATGTTTACCGAAACCGTCGATAAGCTATGAATGGCGAAACGATTACCCATAACTCTTT--GCACGGACCGTTTGCTTATATATCTATATTTTAT-CCGCTAC
gi|20346 : aAAAACCACCAA------A-TGTGACATT-T----------GAAA-TTG-ATATAAGCAT-CTGCAGTTACAC-A--TA--TTTCTGTT-A-ATT--TCTA-T---T-TT---A---CTAT-TA-C--CA-AGA-TTAA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-CATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGCGTGACTGAACAGAATAG-ACTTTTA
gi|20347 : aAAAGCACCAA------A-TGTACCACA-C----------GAAA-TTT-AAACACTCAC-CTGCAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTT-C---G-AT---T---CTAC-T
gi|20348 : agAAAACGCCAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AAACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTCA---G--GCCCGTA--G-CT---A---CT-C-TG-TGGCACAGG-CAGA-CA-C---TATAT-TT-A--T-TATTAT---T-Actac
gi|20349 : agAAAACGTCAA------A-CGTGTCACC-T----------GAAA-TCC-AGACAAGTGC-CCGCAGT--TAC-C--AA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-----------TAT-TG-C--CA-A-A-CTAA-
gi|20350 : agAAAAACGCCAA------A-TATTCCTTTAC----------GAAA-TTT-AGACAAGTAC-CTGCAGT--TAC-C--TG--TCTCTGTCTATATG--TCTC-T---G-GTTTCA----TAT-TA----CA-A----TAA-T--CTA-GGTAC-TG-AATT-TTTTTT---T-AA--TCGATATTT-TTAATGAACACCGAACTGACAGCAAG--TCTCGGCTTGA-TGAACAG--------TTGTGAAAAATG----AAA
gi|20351 : aAAAAATGACAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-CTT-AGACACAAAC-CTGAAGT--TAC-T--TA--TCTCTGTTT-T-TG--TCT
gi|20352 : aAAAACGCCAA------A-TGCGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CGCCAAT--TAC-C--TA--TCTCTGCTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20353 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTAATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20354 : agAAAAACA--AA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20355 : aAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTAC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTTTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20356 : agAAAATGCCAA------A-TGTGCCACA-T----------GAAA-TTT-TGACAATTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---GTAC-
gi|20357 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCCCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20358 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAATGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20359 : agAAAAAGCTAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20360 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--ACTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20361 : agAAATCGCCAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAGTTTC-CTCCAGT--TGC-C--TT--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-TT---A---
gi|20362 : agAGAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---AAAC-T---------GA-TCAA--A-TTA-GGTAC-TT-G--T-T-TCAT---T-AAGGACAA-
gi|20363 : aAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20364 : agAAAACGCCAA------A-TGTGCCGTC-T----------GGAA-TTT-AGGCAATTGC-CTCCAGT--TGC-C--TG--CCTCTGCTTATATG--TCTC-T---G-aaattgatcaaattaggtacttttcttcattaaggacaa
gi|20365 : agAAAACGTAAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTC-AGACAATTGC-CTCCAGT--TGC-C--GA--TCTCTGTTTGTATG----TC-T---G-CT---A----TA---A-C--CA-AG--CTAt
gi|20366 : agAAAAAGCTAA------AATGTGCAACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCT
gi|20367 : agAAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------TAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTTTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20368 : agAAAAAC---AA------A-TGTGACATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCAC-CTGCAGT--CAC-TCATA--TCTCTGTTGAT--G--TCTA-T---G-TT---A---CTAC-TA-C--CA-AGA-CTAA-TA-CTA-TATAT-TC-A--T-TATCTT---T-AAAGTCAA-ATTT-CTTCGGGGCAGCAA---------GAG--TTTACGCGTGATTGAACATAATAA-ACTGATAAAAGACG----AGAT----AGGGATGTATACGGAAATCGTCGATAAATTGTGAATGGCGAA-----TACCCATAACTC--A--GCGC-GATCGTCTGCTTAAAAATCTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCAATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGTG
gi|20369 : AAAAAAGCCAA------A-TGTGTCATT-C----------GAAA-TTT-AAATAAGCAC-ATGCAGT--CAC-TCTTA--TCTCTGTTTAT--G--TCTT-T---G------------------C--CA-AGA-CTAA-TATCTA-TTTAT-CT-A--T-TTTCTT---T--AAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCTCAAA---------GAT--TTTACGTATGATTGAACAAAATAA-ACTTATAAAAGACGAGGTAGAC----AGAGATGTAT-CGGAAA
gi|20370 : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCATA-C----------AAAA-TT--AGTGAAGCAG-CTACAGT--CAC-C--CA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-TT---
gi|20371 : AAAAATGCCAA------A-TGTGCCACT-C----------GAAA-TTTGAGTAAAACACGGTGCAGT--CTC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--T
gi|20372 : AAAAACGTCAA------A-TGTGCCTCC-A----------GAAA-TGT-AAACACGTAT-CTGCAGT--CAC-T--TA--TCACTGTTTATATG--TCTat
gi|20373 : AAAAACGCCAA------A-TGTGCCTCC-T----------GAAA-TTT-AGATAAGTGC-CC---GT--CG---------TCTCTCTTTATATG--TCTT-T---G-AT---A---CTA
gi|20374 : AAAACGTCAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGCAC-GTGTAGT--TGC-G--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-CT---
gi|20375 : AAAACGGCAA------A-TGTTCCACC-C----------GCAA-TTT-AGACAAGCGT-CAGCAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATCTG--TCT
gi|20376 : AAAACGCCAA------A-TGTGCTATC-C----------GAAA-TTT-ATTCAAATAC-CTGAAGT--TAC-T--CAATTCTCTGTTTGTATA--TCTC-T---G-AT---A---TTAA-TA-atat
gi|20377 : AAAATACCAA------A-TGTTCCACT-C----------GAAAATTT-AGACATGCAT-CTGAAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATA--ACTG-TTAAGTTT---A---CTTT-TA-T--CA-A-A-CTGA-TA-TT
gi|20378 : AAAACACAAA------A-TGTATCACC-T----------AAAA-TTT-AGACAAGCAC-CTGCAGT--TAC-T--TA--TCTTT-TGTATATA--CATA-T---G------------AC-TT-G--TA-AGATTTAT-TA-ATG-TATAT-GT-A-----AACAT---T-AAAGTTAG-ATTTACTTTT
gi|20379 : AAAACGCCAA------AATGTTCCACC-C----------GAAA-TTT-AAAAAAACAC-CTTCAGT--CAC-T--AA--TTTCTGTTTAT
gi|20380 : AAAACGCCAA------A-TATGCCACC-CGAAAGGACCCGAAA-TTT-AGACAGGCAC-CTGTAGT--CAC-T--TA--TATCTATTTAGATG--TCTC-
gi|20381 : AAAACGCTAA------A-TGTGCCACC-T----------GAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTGTAGT--TGC-T--TT--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-------------------------GA-ATAA-TA-CAATTACATCTT-A-----ACCTT---T-----TCAA-A---------------CAA---------AAGGACTTG-GCATGA--ACATATAATAA-ACTTATAAATGAatg
gi|20382 : AAAACGCCAA------A-TGTGCCACC------------GTAA-TTT-AGCCAAGCAG-CTGCTGC--CAC-A--TA--TCTCTGTTTAT
gi|20383 : AAAATGTCAG------A-TGTGTCACC-C----------AAAG-TTT-AGACAAGCAA-CTGTAGT--TAC-T--TA--TTTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20384 : AAAACGTCAG------A-TGTGCCAAC-C----------GGAA-TTT--GCCAAGCAC-CTAAAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-
gi|20385 : AGAACGCTTA------A-TGTACCATT-T----------TAAA-TTT-AGACGAGTAC-CTGCAGT--TGC-T--AA--TCTTTGTTTATATG--TCTT-T---G-GT---A---
gi|20386 : AAAAAGCCAA------AATGTGCCACC-T----------TAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTCCAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTC-T---G-AT---A---
gi|20387 : AAAATGTCAG------G-TGTGCTACC-C----------AAAA-TTT-AGACAAGTAC-CTGCAGT--TAC-G--TA--TCTGTGTTAATATG--TCT
gi|20388 : AAAGCGCCAA------A-TGTGCCAAC-C----------GACA-TTT-AGACAATCAC-GTACCTT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATAT
gi|20389 : AAAACGTCAGCATTTTA-TGTGGCACC-C----------ACAA-TTT-AACCATGTAT-CTGCAGT--TTC-T--TA--TCTCTGTT--TATG--TCTC-T---G-CT---ATGTTCAC-TATC--CA-AAA-
gi|20390 : AAAACGCTAA------AATGTGACACC-T----------GAAA-TTT-AGAGATGTGT-TTGCAGC--TGC-CAATG--TCTTTGTTTACATG--TCTC-T---G-GT---A---TTGCTTA-C--AACAGC-TTCA-TA-TTC-T-TTT-TT-T--T-TATATT---T-AATG-CAA-AT
gi|20391 : AAAACGCAGA------A-TGTGTCACC-C----------AAAA-GTA-AGACGAAAAC-CTGCAGT--TAC-T--TA--TCTCTGTTTATATG--TCTT-T---G-TT---G---CCAT-GG-T--TA-GAG-TTAAGTA-CTA-TTTA
gi|20392 : AAAACGCCAA------AATATGCTATC-C----------GAAA--------CAAGCAC-CTTCACT--CAC-T--TA--TACCTGTTTATATG--T
gi|20393 : AAACACCAA------A-TGTGACATT-T----------GAAA-TTT-ATATAAGCAT-CTACAGT--CACACA-TA--TTTCTGTTTAT-T---TCTA-T---G-TA---A---CTAC-CA-C--CA-AGA-CTTA-TA-CTA-TATAT-TT-A--T-CATCTT---TCAAAGTCAA-ATTT-CTTCTGGGCACCAA---------GAG--TTTACGTGTGATTGAACAGAATAA-ACTTATAAAAGACG----ATAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAGGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCAAAACTC--T--GCGCAGATCGTTTGCTTAAAAAATTATATTTCGT-CTGCTACAGGTAATCGCTATCGGAAATATCCGGAATATAACGAGCGtact
gi|20394 : AAACGTCAA------A-TGTGCAACC-C----------GAAA-TTT-TGAAAAGCAC-CTTTAGT--CAC-T--TA--TCTCTGTTTATAT
gi|20395 : ATGCCAA------G-AGTGCCACC-C----------GAAA-TTA-ATACGTGCAC-CTGCAGT--CAC-T--TA--TCTTTGTTTATGT
gi|20396 : GTCAA------A-TGTGCCATC-C----------GAAA-TTT-AGACAAGCAA-ATGCAAT--CAC-T--TA--TCTCGG--TATATGGTTCTC-T---G-AT---A---
gi|20397 : CCAA------A-TGTGCCACC-T----------AAAA-TTT-AGACAAGTGC-CTACAGT--TGC-C--TA--TCTCTGTTTATATG--TCCC-T---G-AT---A--------TA-C--CA-
gi|20398 : TAACACCTATAAAAGACG----ATAT----AGAGATGTATACGGAAACCGTCGATAAGCTGTGAATGGCGAA-----TACCCTAAACTC--T--GCGAGGATTGTCTGCTTAAAAATTTATATATCGT-CTGCCACAGGTAATCGCTATCGACAATATCCGGAATATAACGAGCG
gi|20399 : -----TACCCATTACTC--TTTGCGCGGATCGTCTGCTAAAAAGTCAATATTTCGT-ATGCTACAGGTAATCACTCTCGGGATTTGCCGGAAATTAACGAGCG
gi|20400 : -----TGCCGATAACTC--TTTACGCGGATCGTCTGCT--AAAATCGATATTTCGT-CAGCTACAGTTAATAGATATCGG--ATATTCTGA
gi|20401 : -----TACCCATAACTC--TTTGCGCGGATCAT--------AAG-------------CTGCTACAAGTAATCGTTATCGGGAATTGCCGGAAATTAACGAG
gi|20402 : TC--T--GCG---ATCGTCTGGTTAAAAAATTATATTTCGT-CTGTTACAGGTAATCGCTGTCGGAAATATCCAGAATATAACGAGCG