lowQualScore : 4444444444 22222222222
lowQualScore : 111 4 0 0 0 2222 9 222 0 0 22222 0 0 444 2222222222 2 1 2222222 1 44444444 0 1 22222222222 0 0 0 3333 0
lowQualScore : ... . . . . .... . ... . . ..... . . ... .......... . . ....... . ........ . . ........... . . . .... .
lowQualScore : 555 3 7 7 7 3333 7 888 7 7 44444 7 7 777 2222222222 0 3 2222222 3 88888888 7 3 66666666666 7 7 7 1111 9
consensus : ATAT---CTTCAAAA-GT-A-T----GGA---AGGG-A-AT-----C-C-A---A-CG-NG-A--CTTG-G-AAC-------ATGGA-TA--------G-A-GGG-------CA-A-TGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
Reference ( gi|155518 ) : ATAT---CTTTAAAA-GT-A-T----GTA---AGGG-A-AT-----C-C-A---A-AG-TG-C--CTTG-G-AAC-------ATGGA-TA--------G-A-GGT-------CT-A-TGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155519 : ATAT---GTCCAAAA-GT-A-T----GTA---AGGG-A-AT-----C-C-A---A-TG-GA-CA-CTTG-G-AAC-------ATGGA-TA--------A-A-GGA-------CA-A-TGT-G-T----GGA-GGTGCAGAG
gi|155533 : ATAT---CTTCAAAA-TT-A-T----GTA---AGGG-A-ATC----C-C-A---A-CA-TG-T--CTTG-G-AAC-------ATGGA-TA--------G-ATGGT-------AT---TGTCA-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155530 : ATAT---ATTCAAAA-GT-A-T----GTA---AGGG-A-AT-----C-C-A---A-CG-TG-A--TTTG-A-AAC-------ATTGA-TA--------G-A-CAG-------CA-A-TGT-G-G----GAA-AGTGCAGAG
gi|155522 : ATAT---CTTCAAAA-GT-A-T----GTA---AGGG-A-AT-----C-C-A---A-CA-CA-G--CTTG-G-AAC-------ATGGA-TA--------G-A-GG
gi|155520 : ATAT---CTTCAAAA-GT-A-T----GTA---AGGG-A-AT-----C-T-A---A-TG-TC-A--CTTA-G-AATATACAGAATAGA-TA--------G-A-AAG-------CC-A-TGT-G-T----GAA-AATGCAGAGgcagtgt
gi|155537 : ATAT---CTTCAAAACGT-A-T----GGG---AGGG-A-AT-----C-C-A---A-CG-CG-G--CTTG-G-AAC-------ATGAA-TA--------G-A-AGA-------CA-A-TTT-G-T----GGA-AG
gi|155524 : ATAT---TTTCAAAT-GT-A-T----GTA---AGGG-A-AT-----C-C-A---A-CG-CA-A--ATTG-T-AAT-------ATGGA-TA--------G-G-TGG-------CA-A-TGT-G-T----GGA-AGTTCAGAG
gi|155541 : ATAT---TTTCAAAA-GT-A-TACATGTAGA-ATAG-A-AC-----C-C-A---A----TG-CAACCTG-A-AAC-------ATGAA-TA--------G-A-GGG-------CT-A-TGT-G-T----GAA-AGTGCAGAG
gi|155534 : ATAT---CTTCATAG-AT-A-T----GTA---AGGG-T-AT-----C-C-T---G-TA-TG-C--ATTG-G-GAC-------ATAGA-TC--------G-A-GGG-------CA-A-TGT-G-T----GGA-AGTACAGAG
gi|155527 : ATAT---CTTCAAAA-CT-A-T----GTA---AGAA-A-AT-----C-C-A---A----TG-CAACTTG-G-AAC-------ACGGA-TA--------G-A-GAG-------CA-A-TAT-A-TGGA-GGA-AGTCTAGAG
gi|155528 : ATAT---CTTCAAAA-GTTA-T----G-A---AGGG-A-AT-----C-T-A---A-CA-AG-A--CTTG-G-AAC-------ACAGA-TA--------G-A-GGT-------CA-A-TGT-T-T----TTA-AGTGAAGAG
gi|155539 : ATAT---CTTCAAAA-AC-A-T----GGG---AGGA-A-AT-----C-C-A---A-AT-TGAC--CCTG---AAC-------ATGGA-TA--------G-A-GGA-------CA-A-TAA-G-T----GGG-AATGCAG
gi|155523 : ATAT---CTTAAAGA-GC-A-T----GGA---AGGG-GCAT-----C-A-A---A-CA-TA-A--CTTG-G-AAC-------ATGGA-TA--------A-A-GGG-------CA-A-TGT-G-T----GGA-AGTATCGAG
gi|155532 : ATAT---CTTCAGAA-GT-A-T----GGA---AGGG-A-AT-----C-C-A---A-CA-AG-A--CTCG-G-AAC-------ATAGA-TA--------G-A-GTT-------CA-A-TAT-G-T----
gi|155529 : ATAT---CTTTAAAA-AT-AAT----G-A---AATG-A-AT-----C-TTA---A-CT-TG-C--CTGG-G-AAC-------ATGGA-TA--------G-A-GTG-------CA-A-AGT-G-T----GGA-AGTGAAGAG
gi|155543 : ATAT---TCCCAAAA-GT-A-T----GGA---AGGA-C-GC-----C-T-A---A-AG----A--TTTG-G-TAC-------ATGGA-TA--------T-A-GGT-------CA-A-TGT-G-T----GGA-AGTGCA
gi|155521 : ATAT---ATTCAGAT-GT-A-T----GGG---AGGG-A-TT-----C-T-A---A-AG-GG-A--CTTG-G-AAC-------AAGGA-TA--------G-A-GG--------CA-A-TAT-A-T----AGA-TGTGCAGAG
gi|155538 : ATAT---CTTCAAAT-GT-A-T----GTA---CAGT-A-A--------C-A---A----------CTTG-G-AAC-------ATGGA-TA--------G-A-GGG-------C--A--GT-G-T----GGA-AGTGCATAG
gi|155525 : ATAT---CTTTAAAA-AT-A-T----GGA---AGTG-A-AT-----C-C-A---A-CG-TG-A--TTTG-A-AAC-------ATGGC-TA--------G-A-
gi|155526 : ATAT---CTTCAATA-AT-A-T----GGA---AGAA-A-AC-----C-C-A---A-CA-AG-A--CTTT-G-AAC-------ATGGA-TA--------G-A-GGG-------CA-T-TTT-G-T----GGA-AAAGCAGAGaagaaatgtattgaatacatag
gi|155545 : ATAT---CTTCAAAA-AT-A-T----GTA---AAGG-A-AT-----C-C-A---A-CC-AG-A--CTCG-G-AAC-------ATGGC-AA--------G-A-GGA-------CA-A-TGT-
gi|155535 : ATAG---CTCCAAAA-GT-A-C----AGA---AGAG-A-AT-----C-C-A---A-CG--A-CA-CTTG-T-AAC-------ATGGG-TA--------G-A-GGG-------CA-A-AAC-G-T----GTA-AGTGCAGAG
gi|155548 : ATAT---CTTCAAAA-AT-A-T----GGT---ATCA-A-AT-----C-C-A---A-TG-TG-A---TTG-G-AAT-------GTAGA-TA--------G-A-AGG-------CA-A-TGA-G-T----GAA-AGTGCAAA
gi|155544 : ATAT---CTTCCAAA-AT-A-T----GCA---AGGG-A-AT-------C-A---A-A--------CTC----AAC-------TTGA---A--------G-A-GCG-------CA-A-TGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155540 : ATTT---CTTTAAAA-AT-A-G----GAG---ATGG-A-AT-----C-C-A---A-CT-TG-A--CTGA-G-GAC-------ATGTA-TA--------T-A-GTG-------CA-A-TGT-G-TCGAAGGA-AGTGCAGA
gi|155546 : ATAT---CTTCAGAA-AT-A-T----GAT---AGAG-A-AT-----C-C-A---A-TG-AG-A--TTTATG-AAC-------ATGGA-AA--------G-A-GGA-------CA-A-TGT-G-
gi|155547 : ATAT---CTTCAGAA-AT-A-T----GAT---AGAG-A-AT-----C-C-A---A-TGATA-T--TTAT-G-AAC-------ATGGA-CA--------G-A-GGA-------CA-A-TGT-G-
gi|155551 : ATAT---CTTCAAAA-GT-C-T----GGA---AAGG-A-AT-----C-C-A---A-CA-AG-A--C-TG-G-AAT-------ATGGATTA--------A-A-GGC-------AT---TGT-G-
gi|155531 : ATTT---CTTGAAAA-GT-A-C----AGA---AGAA-A-AT-----T-C-T---G-GT-TA-A--TTTG-A-AAC-------ATGGA-CA--------G-A-GTG-------CA-A-TGC-G-T----GGA-AGTGAAAAG
gi|155552 : ATAT---CTTCAAAA-AT-A-T----GGA---TGAT-A-AT-----T-C-AGC-A-AG----A--CTTG-G-AAC-------ATAGA-AA--------G-A-GGG-------C--A-TAT-A-T----GGAGAGT
gi|155542 : ATATTTCCTTCAAAA-GC-A-T-----TAT--AGAG-A-AT-----C-C-ATT-C-AG-AG-----TTG-G-AAC-------ATGGA-TA----------A-GGT-------GC-ATTTT-A-T----GAA-ATTGCAGAG
gi|155549 : ATAT---CTTCAGTA-AT-A-T----GAT---AGAG-A-AT-----T-C-A---A-TG-AG-A--TTTATG-AAC-------ATGGA-AA--------G-A-GGA-------CA-A-TGT-G-
gi|155553 : ATAT---CTTCGAA--GT-A-T----ATATGGACGG-G-AT-----CTC-A---A-GA-AG-A--CTTT-G-AAC-------ATGGG-TT--------G-A-GGG-------CA-A-TGT-
gi|155550 : ATAT---CTTCAGTA-TT-A-T----GAT---AGAG-A-AT-----C-C-A---A-TG-AG-A--TTTATG-AAC-------ATGGA-CA--------G-A-AGG-------C--A-T-T-G-T----
gi|155554 : TAT---CTTCAAA--GT-A-C----GGA---AGGG-A-AT-----C-C-A---A-CA-AG-A--CTTG-G-AAC-------CTGGA-TG--------G-A-GGC-------CT-G-TGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155555 : TAT---TCTCAAAA-GT-A-T----GGA---AGGG-A-AT-----C---A---A-A--------CTTA-G-AAC-------CGAGA-TA--------C-A-GGT-------CA-A-TGT-G-T----GGA-AGTGCACAG
gi|155557 : TAT---CTTTAAAA-GT-G-A----GAA---AGAA-A-AT-----C-T-A---T-TG-TA-A--CTTG-GGAAC-------ATGAA-TA--------G-A-GAG-------CT-T-TGT-G-C----AGG-AGTGCAGAG
gi|155556 : TAA---CTTCAAAA-GT-A-T----GGA---AAGG-A-AT-----A-C-ATTTA----TA----CTTG-G-AAC-------TTGAA-GA--------G-A-AGG-------TA-A-TGT-G-T----GGA-TGTGCAGAG
gi|155558 : TAT---CTTCAAAT-TT-A-T----GTA---A-AG-A-ATCCCAAC-C-A---A-A--------CTTA-G-AAC-------ATAGA-TA--------G-A-GAG-------CA-A-TAT-G-T----
gi|155559 : AT---CTTCAAGA-GT-A-T----GGT---ACGG-A-AT-----C-C-A---A-CG-AG-A--CTTG-G-AAC-------ATGAA-TA--------G-A-GGT-------TA-A-TAT-G-T----AGA-AGTGCAG
gi|155560 : AT---CTTCAACA-GT-A-T----GGA---AGGG-A-AC-----C-C-AGC-A-AG----A--CTTG-G-ATC-------ATGGA-TA--------G-A-GGG-------CA-A-TGT-G-
gi|155563 : AT---CTTCAAGA-AC-A-T----GGA---AGTG------------C-A---A-TG-AG-A--CTTG-G-AAC-------ATGAA-TAATGCAGTAG-A-GGT-------CA-A-TGT-G-T----GGT-GGTGCAGAG
gi|155562 : AT---CTTCAAGA-AC-A-T----GGA---AGTG------------C-A---A-TG-AG-A--CTTG-G-AAC-------ATGAA-TAATGCAGTAG-A-GGT-------CA-A-TGT-G-T----GGT-GGTGCAGAG
gi|155561 : AT---CTTCAAA--GT-A-T----GAA---AGGG-A-AT-----A-C-A---A----------TTTG-G-AAC-------ATGGATTA--------A-A-GGC-------AT---TGT-G-
gi|155565 : T---CTTCAAGA-GT-A-T----G-G---ATGA-A-AT-----A-C-A---A-TG-AG-A--CTTG-GGAAC-------ATGGA-TA--------T-G-GGT-------AA-A-TGT-A-T----GGA-AGTGCA
gi|155566 : ---CTCCAAAG-GT-A-C----TAA---AAGG-A-AT-----C-C-A---A-AG--A-CA-CTTG-G-AAC-------ATGGA-TA--------G-A-GGG-------TA-A-TTT-G-C----GGA-AATGCAGAG
gi|155567 : TTTAAAA-GT-A-A----GGA---AGGT-A-AT-----C-C-A---A-AG-AG-A--CTTG-G-AAC-------ATGGA-TA--------G-A-GGG-------CA-A-AGT-G-T----TGA-AGTGCAGAG
gi|155571 : TTTAAAA-GT-A-T----GGA---AAGG-A-AT-----C-C-A---C-TG-AG-A--CTGG-G-AAC-------ATGGA-CG--------G-A-AGG-------CG-T-TAA-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155569 : TTCAAAA-GT-A------------AGGG-A-A--------C-AT--A-AG-GA-CA-CTTG-G-GAC-------ATGGA-TG--------G-A-GGG-------CT-T-TGT-A-T----GGA-AGTACAGAG
gi|155568 : TTCAAAA-GT-A-TT---GCA---AGGG-A-AT-----C-C-A---A----TGACA-CTTG-G-AAC-------ATAGA-TA--------G-A-GGG-------TA-A-TAG-G-A----GGA-AGT
gi|155564 : TATAA-GT-A-T----GGA---AGGGGA-AT-----C-C-A---A-CA-AA-A--CTTT-G-AAC-------ATGAA-TT--------G-A-CGT-------CA-A-TGT-G-T----TGA-AGTGTAGAG
gi|155575 : tctccaaaaAAAA-AA-A-T----GGA---AAGG-A-AT-----C-C-A---A-CG-TA-A--TTTG-G-AAC-------ATGGA-AA--------G-A-GGG-------CA-A-TGT-G-T----GTA-AGTGCAGAG
gi|155573 : AAAA-AT-A-T----CAA---AGGG-A-AT-----C-C-A---G-CG-TG-A--TTTG-G-AAC-------ATAGA-TA--------G-A-AGG-------CA-A-CAT-G-T----GAA-AG
gi|155570 : ttcaA-AT-A-T----GTA---AGGG-A-AT-----C-C-A---A-TA-TG-A--CTTG-G-GAC-------ATGGG-TA--------G-A-CGG-------CA-A-TAT-G-T----GGC-AGTGCAGAG
gi|155576 : ttcatA---AGGA-A-AT-----C-C-A---G-CG--G-CA-CTTG-G-AAC-------ACAGA-TG--------G-A-GGG-------TA-A-TGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155577 : ---AGGG-A-AT-----C-C-A---A----CG-A--CTTG-G-AAC-------ATGGG-TA--------GTA-AG--------CA-A-AGT-G-T----GGA-AGCGCAGA
gi|155578 : ---AGGG-A-AT-----C-C-A---A----TGACA-CTTG-G-AAC-------ATGGA-CA--------G-A-AGA-------GTAA-TGT-GTT----TGA-AGTGGAGAG
gi|155536 : ---AGGG-A-AT-----C-C-A---ACAA-CA----CTTG-G-AGT-------ATAGT-TA--------G-A-GAG-------CA-A-TGT-C-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155572 : atattttcatggattGG-A-AT-----C-C-A---A-GG-AA-A--CTTG-G-AAC-------ATGGA-TG--------G-G-GGGGGGGGGGCA-A-TGT-G-T----GAA-AGTGCA
gi|155574 : tccaaagatactgaca--CTTG-G-AAC-------ACGGA-TA--------G-ACGG---------T-A--AT-G-T----AGA-AGTGCAGAG
Alignments
lowQualScore : 111 3333333 22222222 00 0 0 0 0 44444 2 1 2222222 2222222 44444444 0 0 0 3333 0
lowQualScore : ... ....... ........ .. . . . . ..... . . ....... ....... ........ . . . .... .
lowQualScore : 444 7777777 22222222 99 7 7 7 7 55555 6 3 1111111 1111111 88888888 7 7 7 0000 8
consensus : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACGAG-ACTTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
Reference ( family-435 ) : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACGNG-ACTTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155518 : ATAT---CTTTAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AAAGTG-CCTTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-AGGTCTATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155519 : ATAT---GTCCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AATGGACACTTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------A-AGGACAATGT-G-T----GGA-GGTGCAGAG
gi|155520 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CT-AATGTC-ACTTA-G-AATATACAGAATAGAT-------A--------G-AAAGCCATGT-G-T----GAA-AATGCAGAG
gi|155521 : ATAT---ATTCAGAT-----G-TATG------G-G--AGGG-A-TT-CT-AAAGGG-ACTTG-G-AAC-------AAGGAT-------A--------G-A-GGCAATAT-A-T----AGA-TGTGCAGAG
gi|155522 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACACA-GCTTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-AGGGCAGTGT-
gi|155523 : ATAT---CTTAAAGA-----G-CATG------G-A--AGGG-GCAT-CA-AACATA-ACTTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------A-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTATCGAG
gi|155524 : ATAT---TTTCAAAT-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACGCA-AATTG-T-AAT-------ATGGAT-------A--------G-GTGGCAATGT-G-T----GGA-AGTTCAGAG
gi|155525 : ATAT---CTTTAAAA-----A-TATG------G-A--AGTG-A-AT-CC-AACGTG-ATTTG-A-AAC-------ATGGCT-------A--------G-AAAGAAATGT-A-T----TGA-A-TACATAG
gi|155526 : ATAT---CTTCAATA-----A-TATG------G-A--AGAA-A-AC-CC-AACAAG-ACTTT-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-AGGGCATTTT-G-T----GGA-AAAGCAGAG
gi|155527 : ATAT---CTTCAAAA-----C-TATG------T-A--AGAA-A-AT-CC-AATGCA-ACTTG-G-AAC-------ACGGAT-------A--------G-AGAGCAATAT-A-TGGA-GGA-AGTCTAGAG
gi|155528 : ATAT---CTTCAAAA-----GTTAT-------G-A--AGGG-A-AT-CT-AACAAG-ACTTG-G-AAC-------ACAGAT-------A--------G-AGGTCAATGT-T-T----TTA-AGTGAAGAG
gi|155529 : ATAT---CTTTAAAA-----A-TAAT------G-A--AATG-A-AT-CTTAACTTG-CCTGG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-AGTGCAAAGT-G-T----GGA-AGTGAAGAG
gi|155530 : ATAT---ATTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACGTG-ATTTG-A-AAC-------ATTGAT-------A--------G-ACAGCAATGT-G-G----GAA-AGTGCAGAG
gi|155531 : ATTT---CTTGAAAA-----G-TACA------G-A--AGAA-A-AT-TC-TGGTTA-ATTTG-A-AAC-------ATGGAC-------A--------G-AGTGCAATGC-G-T----GGA-AGTGAAAAG
gi|155532 : ATAT---CTTCAGAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACAAG-ACTCG-G-AAC-------ATAGAT-------A--------G-AGTTCAATAT-G-T----
gi|155533 : ATAT---CTTCAAAA-----T-TATG------T-A--AGGG-A-ATCCC-AACATG-TCTTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-ATGGTATTGTCA-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155534 : ATAT---CTTCATAG-----A-TATG------T-A--AGGG-T-AT-CC-TGTATG-CATTG-G-GAC-------ATAGAT-------C--------G-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTACAGAG
gi|155535 : ATAG---CTCCAAAA-----G-TACA------G-A--AGAG-A-AT-CC-AACGAC-ACTTG-T-AAC-------ATGGGT-------A--------G-AGGGCAAAAC-G-T----GTA-AGTGCAGAG
gi|155536 : ATAT---TTTCA------------TG------G-ATTAGGG-A-AT-CC-AACAAC-ACTTG-G-AGT-------ATAGTT-------A--------G-AGAGCAATGT-C-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155537 : ATAT---CTTCAAAAC----G-TATG------G-G--AGGG-A-AT-CC-AACGCG-GCTTG-G-AAC-------ATGAAT-------A--------G-AAGACAATTT-G-T----GGA-AG
gi|155538 : ATAT---CTTCAAAT-----G-TATG------T-A--CAGT-A-A---C-AAC------TTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-AGGGCA--GT-G-T----GGA-AGTGCATAG
gi|155539 : ATAT---CTTCAAAA-----A-CATG------G-G--AGGA-A-AT-CC-AAATTG-ACCCT-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-AGGACAATAA-G-T----GGG-AATGCAG
gi|155540 : ATTT---CTTTAAAA-----A-TAGG------A-G--ATGG-A-AT-CC-AACTTG-ACTGA-G-GAC-------ATGTAT-------A--------T-AGTGCAATGT-G-TCGAAGGA-AGTGCAGA
gi|155541 : ATAT---TTTCAAAA-----G-TATACATGTAG-A--ATAG-A-AC-CC-AATGCA-ACCTG-A-AAC-------ATGAAT-------A--------G-AGGGCTATGT-G-T----GAA-AGTGCAGAG
gi|155542 : ATATTTCCTTCAAAA-----G-CATT------A-T--AGAG-A-AT-CC-ATTCAG-AGTTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------A-GGTGCATTTT-A-T----GAA-ATTGCAGAG
gi|155543 : ATAT---TCCCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGA-C-GC-CT-AA--AG-ATTTG-G-TAC-------ATGGAT-------A--------T-AGGTCAATGT-G-T----GGA-AGTGCA
gi|155544 : ATAT---CTTCCAAA-----A-TATG------C-A--AGGG-A-AT-CA-AACTCA-ACTTG-A------------------------A--------G-AGCGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155545 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------T-A--AAGG-A-AT-CC-AACCAG-ACTCG-G-AAC-------ATGGCA-------A--------G-AGGACAATGT-
gi|155546 : ATAT---CTTCAGAA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATGAG-ATTTATG-AAC-------ATGGAA-------A--------G-AGGACAATGT-G-
gi|155547 : ATAT---CTTCAGAA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATGAT-ATTTATG-AAC-------ATGGAC-------A--------G-AGGACAATGT-G-
gi|155548 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------G-T--ATCA-A-AT-CC-AATGTG-A-TTG-G-AAT-------GTAGAT-------A--------G-AAGGCAATGA-G-T----GAA-AGTGCAAA
gi|155549 : ATAT---CTTCAGTA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-TC-AATGAG-ATTTATG-AAC-------ATGGAA-------A--------G-AGGACAATGT-G-
gi|155550 : ATAT---CTTCAGTA-----T-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATGAG-ATTTATG-AAC-------ATGGAC-------A--------G-AAGGCATTGT-G-
gi|155551 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TCTG------G-A--AAGG-A-AT-CC-AACAAG-AC-TG-G-AAT-------ATGGAT-------T--------A-AAGGCATTGT-G-
gi|155552 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------G-A--TGAT-A-AT-TC-AGCAAG-ACTTG-G-AAC-------ATAGAA-------A--------G-AGGGC-ATAT-A-T----GGAGAGT
gi|155553 : ATAT---CTTCGAAGTAT--A-TATG------G-A--CGGG-A-TC-TC-AAGAAG-ACTTT-G-AAC-------ATGGGT-------T--------G-AGGGCAATGT-
gi|155554 : TAT---CTTCAAA------G-TACG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACAAG-ACTTG-G-AAC-------CTGGAT-------G--------G-AGGCCTGTGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155555 : TAT---TCTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-C--AA-----ACTTA-G-AAC-------CGAGAT-------A--------C-AGGTCAATGT-G-T----GGA-AGTGCACAG
gi|155556 : TAA---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AAGG-A-AT-AC-ATTTAT-ACTTG-G-AAC-------TTGAAG-------A--------G-AAGGTAATGT-G-T----GGA-TGTGCAGAG
gi|155557 : TAT---CTTTAAAA-----G-TGAG------A-A--AGAA-A-AT-CT-ATTGTA-ACTTG-GGAAC-------ATGAAT-------A--------G-AGAGCTTTGT-G-C----AGG-AGTGCAGAG
gi|155558 : TAT---CTTCAAAT-----T-TATG------T-A--AAGA-A-TC-CC-AACCAA-ACTTA-G-AAC-------ATAGAT-------A--------G-AGAGCAATAT-G-T----
gi|155559 : AT---CTTCAAGA-----G-TATG------G-T--ACGG-A-AT-CC-AACGAG-ACTTG-G-AAC-------ATGAAT-------A--------G-AGGTTAATAT-G-T----AGA-AGTGCAG
gi|155560 : AT---CTTCAACA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AC-CC-AGCAAG-ACTTG-G-ATC-------ATGGAT-------A--------G-AGGGCAATGT-G-
gi|155561 : AT---CTTCAAA------G-TATG------A-A--AGGG-A-AT-AC-AAT------TTG-G-AAC-------ATGGAT-------T--------A-AAGGCATTGT-G-
gi|155562 : AT---CTTCAAGA-----A-CATG------G-A--AGTG-------C-AATGAG-ACTTG-G-AAC-------ATGAAT-------AATGCAGTAG-AGGTCAATGT-G-T----GGT-GGTGCAGAG
gi|155563 : AT---CTTCAAGA-----A-CATG------G-A--AGTG-------C-AATGAG-ACTTG-G-AAC-------ATGAAT-------AATGCAGTAG-AGGTCAATGT-G-T----GGT-GGTGCAGAG
gi|155564 : T---CTCCAAAATATAAG-TATG------G-A--AGGGGA-AT-CC-AACAAA-ACTTT-G-AAC-------ATGAAT-------T--------G-ACGTCAATGT-G-T----TGA-AGTGTAGAG
gi|155565 : T---CTTCAAGA-----G-TATG------G-A---TGA-A-AT-AC-AATGAG-ACTTG-GGAAC-------ATGGAT-------A--------T-GGGTAAATGT-A-T----GGA-AGTGCA
gi|155566 : ---CTCCAAAG-----G-TACT------A-A--AAGG-A-AT-CC-AAAGAC-ACTTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-AGGGTAATTT-G-C----GGA-AATGCAGAG
gi|155567 : TTTAAAA-----G-TAAG------G-A--AGGT-A-AT-CC-AAAGAG-ACTTG-G-AAC-------ATGGAT-------A--------G-AGGGCAAAGT-G-T----TGA-AGTGCAGAG
gi|155568 : TTCAAAA-----G-TATT------GCA--AGGG-A-AT-CC-AATGAC-ACTTG-G-AAC-------ATAGAT-------A--------G-AGGGTAATAG-G-A----GGA-AGT
gi|155569 : TTCAAAA-----G-TA-------------AGGG-A-AC-AT-AAGGAC-ACTTG-G-GAC-------ATGGAT-------G--------G-AGGGCTTTGT-A-T----GGA-AGTACAGAG
gi|155570 : TTCATAA-------TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AATATG-ACTTG-G-GAC-------ATGGGT-------A--------G-ACGGCAATAT-G-T----GGC-AGTGCAGAG
gi|155571 : TTTAAAA-----G-TATG------G-A--AAGG-A-AT-CC-ACTGAG-ACTGG-G-AAC-------ATGGAC-------G--------G-AAGGCGTTAA-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155572 : TCCAAAG-----A-TACT------G-A--CAGG-A-AT-CC-AAGGAA-ACTTG-G-AAC-------ATGGATGGGGGGGG--------G-GGGGCAATGT-G-T----GAA-AGTGCA
gi|155573 : TTCAAAA-----AATATC------A-A--AGGG-A-AT-CC-AGCGTG-ATTTG-G-AAC-------ATAGAT-------A--------G-AAGGCAACAT-G-T----GAA-AG
gi|155574 : TCCAAAA-----C-TATG------A-A--AAAT-A-AT-----------ACTTG-G-AAC-------ACGGAT-------A--------G-ACGGTAA--T-G-T----AGA-AGTGCAGAG
gi|155575 : AAAA-----A-AATG------G-A--AAGG-A-AT-CC-AACGTA-ATTTG-G-AAC-------ATGGAA-------A--------G-AGGGCAATGT-G-T----GTA-AGTGCAGAG
gi|155576 : -A--AGGA-A-AT-CC-AGCGGC-ACTTG-G-AAC-------ACAGAT-------G--------G-AGGGTAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155577 : --AGGG-A-AT-CC-AACG---ACTTG-G-AAC-------ATGGGT-------A--------G-TAAGCAAAGT-G-T----GGA-AGCGCAGA
gi|155578 : --AGGG-A-AT-CC-AATGAC-ACTTG-G-AAC-------ATGGAC-------A--------GAAGAGTAATGT-GTT----TGA-AGTGGAGAG
Alignments
lowQualScore : 111 3333333 22222222 00 0 0 0 0 444444 2 1 2222222 44444444 2222222 0 0 0 3333 0
lowQualScore : ... ....... ........ .. . . . . ...... . . ....... ........ ....... . . . .... .
lowQualScore : 444 7777777 22222222 99 7 7 7 7 000000 6 3 1111111 88888888 1111111 7 7 7 0000 8
consensus : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
Reference ( family-435 ) : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155518 : ATAT---CTTTAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AAAG-T--GCCTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGTCTATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155519 : ATAT---GTCCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AATGGA--CACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AA-AGGACAATGT-G-T----GGA-GGTGCAGAG
gi|155520 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CT-AATG-T--CACTTA-G-AATATACAGAATAGA--------T-------AG-AAAGCCATGT-G-T----GAA-AATGCAGAG
gi|155521 : ATAT---ATTCAGAT-----G-TATG------G-G--AGGG-A-TT-CT-AAAG-G--GACTTG-G-AAC-------AAGGA--------T-------AG-A-GGCAATAT-A-T----AGA-TGTGCAGAG
gi|155522 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACA-C--AGCTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAGTGT-
gi|155523 : ATAT---CTTAAAGA-----G-CATG------G-A--AGGG-GCAT-CA-AACA-T--AACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AA-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTATCGAG
gi|155524 : ATAT---TTTCAAAT-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-C--AAATTG-T-AAT-------ATGGA--------T-------AG-GTGGCAATGT-G-T----GGA-AGTTCAGAG
gi|155525 : ATAT---CTTTAAAA-----A-TATG------G-A--AGTG-A-AT-CC-AACG-T--GATTTG-A-AAC-------ATGGC--------T-------AG-AAAGAAATGT-A-T----TGA-A-TACATAG
gi|155526 : ATAT---CTTCAATA-----A-TATG------G-A--AGAA-A-AC-CC-AACA-A--GACTTT-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCATTTT-G-T----GGA-AAAGCAGAG
gi|155527 : ATAT---CTTCAAAA-----C-TATG------T-A--AGAA-A-AT-CC-AATG-C--AACTTG-G-AAC-------ACGGA--------T-------AG-AGAGCAATAT-A-TGGA-GGA-AGTCTAGAG
gi|155528 : ATAT---CTTCAAAA-----GTTAT-------G-A--AGGG-A-AT-CT-AACA-A--GACTTG-G-AAC-------ACAGA--------T-------AG-AGGTCAATGT-T-T----TTA-AGTGAAGAG
gi|155529 : ATAT---CTTTAAAA-----A-TAAT------G-A--AATG-A-AT-CTTAACT-T--GCCTGG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGTGCAAAGT-G-T----GGA-AGTGAAGAG
gi|155530 : ATAT---ATTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-T--GATTTG-A-AAC-------ATTGA--------T-------AG-ACAGCAATGT-G-G----GAA-AGTGCAGAG
gi|155531 : ATTT---CTTGAAAA-----G-TACA------G-A--AGAA-A-AT-TC---TG-GTTAATTTG-A-AAC-------ATGGA--------C-------AG-AGTGCAATGC-G-T----GGA-AGTGAAAAG
gi|155532 : ATAT---CTTCAGAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACA-A--GACTCG-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AGTTCAATAT-G-T----
gi|155533 : ATAT---CTTCAAAA-----T-TATG------T-A--AGGG-A-ATCCC-AACA-T--GTCTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-ATGGTATTGTCA-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155534 : ATAT---CTTCATAG-----A-TATG------T-A--AGGG-T-AT-CC-TGTA-T--GCATTG-G-GAC-------ATAGA--------T-------CG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTACAGAG
gi|155535 : ATAG---CTCCAAAA-----G-TACA------G-A--AGAG-A-AT-CC-AACG-A--CACTTG-T-AAC-------ATGGG--------T-------AG-AGGGCAAAAC-G-T----GTA-AGTGCAGAG
gi|155536 : ATAT---TTTCA------------TG------G-ATTAGGG-A-AT-CC-AACA-A--CACTTG-G-AGT-------ATAGT--------T-------AG-AGAGCAATGT-C-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155537 : ATAT---CTTCAAAAC----G-TATG------G-G--AGGG-A-AT-CC-AACG-C--GGCTTG-G-AAC-------ATGAA--------T-------AG-AAGACAATTT-G-T----GGA-AG
gi|155538 : ATAT---CTTCAAAT-----G-TATG------T-A--CAGT-A-A---C-AAC--------TTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCA--GT-G-T----GGA-AGTGCATAG
gi|155539 : ATAT---CTTCAAAA-----A-CATG------G-G--AGGA-A-AT-CC-AAAT-T--GACCCT-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGACAATAA-G-T----GGG-AATGCAG
gi|155540 : ATTT---CTTTAAAA-----A-TAGG------A-G--ATGG-A-AT-CC-AACT-T--GACTGA-G-GAC-------ATGTA--------T-------AT-AGTGCAATGT-G-TCGAAGGA-AGTGCAGA
gi|155541 : ATAT---TTTCAAAA-----G-TATACATGTAG-A--ATAG-A-AC-CC-AATG-C--AACCTG-A-AAC-------ATGAA--------T-------AG-AGGGCTATGT-G-T----GAA-AGTGCAGAG
gi|155542 : ATATTTCCTTCAAAA-----G-CATT------A-T--AGAG-A-AT-CC-ATTC-A--GAGTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AA-GGTGCATTTT-A-T----GAA-ATTGCAGAG
gi|155543 : ATAT---TCCCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGA-C-GC-CT-AA---A--GATTTG-G-TAC-------ATGGA--------T-------AT-AGGTCAATGT-G-T----GGA-AGTGCA
gi|155544 : ATAT---CTTCCAAA-----A-TATG------C-A--AGGG-A-AT-CA-AACT-C--AACTTG-A-A-------------------------------G-AGCGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155545 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------T-A--AAGG-A-AT-CC-AACC-A--GACTCG-G-AAC-------ATGGC--------A-------AG-AGGACAATGT-
gi|155546 : ATAT---CTTCAGAA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATG-A--GATTTATG-AAC-------ATGGA--------A-------AG-AGGACAATGT-G-
gi|155547 : ATAT---CTTCAGAA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATG-A--TATTTATG-AAC-------ATGGA--------C-------AG-AGGACAATGT-G-
gi|155548 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------G-T--ATCA-A-AT-CC-AATG-T--GA-TTG-G-AAT-------GTAGA--------T-------AG-AAGGCAATGA-G-T----GAA-AGTGCAAA
gi|155549 : ATAT---CTTCAGTA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-TC-AATG-A--GATTTATG-AAC-------ATGGA--------A-------AG-AGGACAATGT-G-
gi|155550 : ATAT---CTTCAGTA-----T-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATG-A--GATTTATG-AAC-------ATGGA--------C-------AG-AAGGCATTGT-G-
gi|155551 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TCTG------G-A--AAGG-A-AT-CC-AACA-A--GAC-TG-G-AAT-------ATGGA--------T-------TA-AAGGCATTGT-G-
gi|155552 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------G-A--TGAT-A-AT-TC-AGCA-A--GACTTG-G-AAC-------ATAGA--------A-------AG-AGGGC-ATAT-A-T----GGAGAGT
gi|155553 : ATAT---CTTCGAAGTAT--A-TATG------G-A--CGGG-A-TC-TC-AAGA-A--GACTTT-G-AAC-------ATGGG--------T-------TG-AGGGCAATGT-
gi|155554 : TAT---CTTCAAA------G-TACG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACA-A--GACTTG-G-AAC-------CTGGA--------T-------GG-AGGCCTGTGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155555 : TAT---TCTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-C-------A--AACTTA-G-AAC-------CGAGA--------T-------AC-AGGTCAATGT-G-T----GGA-AGTGCACAG
gi|155556 : TAA---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AAGG-A-AT-AC-ATTT-A--TACTTG-G-AAC-------TTGAA--------G-------AG-AAGGTAATGT-G-T----GGA-TGTGCAGAG
gi|155557 : TAT---CTTTAAAA-----G-TGAG------A-A--AGAA-A-AT-CT-ATTG-T--AACTTG-GGAAC-------ATGAA--------T-------AG-AGAGCTTTGT-G-C----AGG-AGTGCAGAG
gi|155558 : TAT---CTTCAAAT-----T-TATG------T-A--AAGA-A-TC-CC-AACC-A--AACTTA-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AGAGCAATAT-G-T----
gi|155559 : AT---CTTCAAGA-----G-TATG------G-T--ACGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGAA--------T-------AG-AGGTTAATAT-G-T----AGA-AGTGCAG
gi|155560 : AT---CTTCAACA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AC-CC-AGCA-A--GACTTG-G-ATC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-
gi|155561 : AT---CTTCAAA------G-TATG------A-A--AGGG-A-AT-AC-AAT--------TTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------TA-AAGGCATTGT-G-
gi|155562 : AT---CTTCAAGA-----A-CATG------G-A--AGTG-------C-AATG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGAATAATGCAGT-------AG-AGGTCAATGT-G-T----GGT-GGTGCAGAG
gi|155563 : AT---CTTCAAGA-----A-CATG------G-A--AGTG-------C-AATG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGAATAATGCAGT-------AG-AGGTCAATGT-G-T----GGT-GGTGCAGAG
gi|155564 : T---CTCCAAAATATAAG-TATG------G-A--AGGGGA-AT-CC-AACA-A--AACTTT-G-AAC-------ATGAA--------T-------TG-ACGTCAATGT-G-T----TGA-AGTGTAGAG
gi|155565 : T---CTTCAAGA-----G-TATG------G-A---TGA-A-AT-AC-AATG-A--GACTTG-GGAAC-------ATGGA--------T-------AT-GGGTAAATGT-A-T----GGA-AGTGCA
gi|155566 : ---CTCCAAAG-----G-TACT------A-A--AAGG-A-AT-CC-AAAG-A--CACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGTAATTT-G-C----GGA-AATGCAGAG
gi|155567 : TTTAAAA-----G-TAAG------G-A--AGGT-A-AT-CC-AAAG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAAAGT-G-T----TGA-AGTGCAGAG
gi|155568 : TTCAAAA-----G-TATT------GCA--AGGG-A-AT-CC-AATG-A--CACTTG-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AGGGTAATAG-G-A----GGA-AGT
gi|155569 : TTCAAAA-----G-TA-------------AGGG-A-AC-AT-AAGG-A--CACTTG-G-GAC-------ATGGA--------T-------GG-AGGGCTTTGT-A-T----GGA-AGTACAGAG
gi|155570 : TTCATAA-------TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AATA-T--GACTTG-G-GAC-------ATGGG--------T-------AG-ACGGCAATAT-G-T----GGC-AGTGCAGAG
gi|155571 : TTTAAAA-----G-TATG------G-A--AAGG-A-AT-CC-ACTG-A--GACTGG-G-AAC-------ATGGA--------C-------GG-AAGGCGTTAA-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155572 : TCCAAAG-----A-TACT------G-A--CAGG-A-AT-CC-AAGG-A--AACTTG-G-AAC-------ATGGA--------TGGGGGGGGG-GGGGCAATGT-G-T----GAA-AGTGCA
gi|155573 : TTCAAAA-----AATATC------A-A--AGGG-A-AT-CC-AGCG-T--GATTTG-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AAGGCAACAT-G-T----GAA-AG
gi|155574 : TCCAAAA-----C-TATG------A-A--AAAT-A-AT-------------ACTTG-G-AAC-------ACGGA--------T-------AG-ACGGTAA--T-G-T----AGA-AGTGCAGAG
gi|155575 : AAAA-----A-AATG------G-A--AAGG-A-AT-CC-AACG-T--AATTTG-G-AAC-------ATGGA--------A-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GTA-AGTGCAGAG
gi|155576 : -A--AGGA-A-AT-CC-AGCG-G--CACTTG-G-AAC-------ACAGA--------T-------GG-AGGGTAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155577 : --AGGG-A-AT-CC-AACG-A----CTTG-G-AAC-------ATGGG--------T-------AG-TAAGCAAAGT-G-T----GGA-AGCGCAGA
gi|155578 : --AGGG-A-AT-CC-AATG-A--CACTTG-G-AAC-------ATGGA--------C-------AGAAGAGTAATGT-GTT----TGA-AGTGGAGAG
Alignments
lowQualScore : 111 3333333 22222222 00 0 0 0 0 444444 2 1 2222222 44444444 2222222 0 0 0 3333 0
lowQualScore : ... ....... ........ .. . . . . ...... . . ....... ........ ....... . . . .... .
lowQualScore : 444 7777777 22222222 99 7 7 7 7 000000 6 3 1111111 88888888 1111111 7 7 7 0000 8
consensus : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
Reference ( family-435 ) : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155518 : ATAT---CTTTAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AAAG-T--GCCTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGTCTATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155519 : ATAT---GTCCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AATGGA--CACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AA-AGGACAATGT-G-T----GGA-GGTGCAGAG
gi|155520 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CT-AATG-T--CACTTA-G-AATATACAGAATAGA--------T-------AG-AAAGCCATGT-G-T----GAA-AATGCAGAG
gi|155521 : ATAT---ATTCAGAT-----G-TATG------G-G--AGGG-A-TT-CT-AAAG-G--GACTTG-G-AAC-------AAGGA--------T-------AG-A-GGCAATAT-A-T----AGA-TGTGCAGAG
gi|155522 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACA-C--AGCTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAGTGT-
gi|155523 : ATAT---CTTAAAGA-----G-CATG------G-A--AGGG-GCAT-CA-AACA-T--AACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AA-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTATCGAG
gi|155524 : ATAT---TTTCAAAT-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-C--AAATTG-T-AAT-------ATGGA--------T-------AG-GTGGCAATGT-G-T----GGA-AGTTCAGAG
gi|155525 : ATAT---CTTTAAAA-----A-TATG------G-A--AGTG-A-AT-CC-AACG-T--GATTTG-A-AAC-------ATGGC--------T-------AG-AAAGAAATGT-A-T----TGA-A-TACATAG
gi|155526 : ATAT---CTTCAATA-----A-TATG------G-A--AGAA-A-AC-CC-AACA-A--GACTTT-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCATTTT-G-T----GGA-AAAGCAGAG
gi|155527 : ATAT---CTTCAAAA-----C-TATG------T-A--AGAA-A-AT-CC-AATG-C--AACTTG-G-AAC-------ACGGA--------T-------AG-AGAGCAATAT-A-TGGA-GGA-AGTCTAGAG
gi|155528 : ATAT---CTTCAAAA-----GTTAT-------G-A--AGGG-A-AT-CT-AACA-A--GACTTG-G-AAC-------ACAGA--------T-------AG-AGGTCAATGT-T-T----TTA-AGTGAAGAG
gi|155529 : ATAT---CTTTAAAA-----A-TAAT------G-A--AATG-A-AT-CTTAACT-T--GCCTGG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGTGCAAAGT-G-T----GGA-AGTGAAGAG
gi|155530 : ATAT---ATTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-T--GATTTG-A-AAC-------ATTGA--------T-------AG-ACAGCAATGT-G-G----GAA-AGTGCAGAG
gi|155531 : ATTT---CTTGAAAA-----G-TACA------G-A--AGAA-A-AT-TC---TG-GTTAATTTG-A-AAC-------ATGGA--------C-------AG-AGTGCAATGC-G-T----GGA-AGTGAAAAG
gi|155532 : ATAT---CTTCAGAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACA-A--GACTCG-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AGTTCAATAT-G-T----
gi|155533 : ATAT---CTTCAAAA-----T-TATG------T-A--AGGG-A-ATCCC-AACA-T--GTCTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-ATGGTATTGTCA-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155534 : ATAT---CTTCATAG-----A-TATG------T-A--AGGG-T-AT-CC-TGTA-T--GCATTG-G-GAC-------ATAGA--------T-------CG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTACAGAG
gi|155535 : ATAG---CTCCAAAA-----G-TACA------G-A--AGAG-A-AT-CC-AACG-A--CACTTG-T-AAC-------ATGGG--------T-------AG-AGGGCAAAAC-G-T----GTA-AGTGCAGAG
gi|155536 : ATAT---TTTCA------------TG------G-ATTAGGG-A-AT-CC-AACA-A--CACTTG-G-AGT-------ATAGT--------T-------AG-AGAGCAATGT-C-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155537 : ATAT---CTTCAAAAC----G-TATG------G-G--AGGG-A-AT-CC-AACG-C--GGCTTG-G-AAC-------ATGAA--------T-------AG-AAGACAATTT-G-T----GGA-AG
gi|155538 : ATAT---CTTCAAAT-----G-TATG------T-A--CAGT-A-A---C-AAC--------TTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCA--GT-G-T----GGA-AGTGCATAG
gi|155539 : ATAT---CTTCAAAA-----A-CATG------G-G--AGGA-A-AT-CC-AAAT-T--GACCCT-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGACAATAA-G-T----GGG-AATGCAG
gi|155540 : ATTT---CTTTAAAA-----A-TAGG------A-G--ATGG-A-AT-CC-AACT-T--GACTGA-G-GAC-------ATGTA--------T-------AT-AGTGCAATGT-G-TCGAAGGA-AGTGCAGA
gi|155541 : ATAT---TTTCAAAA-----G-TATACATGTAG-A--ATAG-A-AC-CC-AATG-C--AACCTG-A-AAC-------ATGAA--------T-------AG-AGGGCTATGT-G-T----GAA-AGTGCAGAG
gi|155542 : ATATTTCCTTCAAAA-----G-CATT------A-T--AGAG-A-AT-CC-ATTC-A--GAGTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AA-GGTGCATTTT-A-T----GAA-ATTGCAGAG
gi|155543 : ATAT---TCCCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGA-C-GC-CT-AA---A--GATTTG-G-TAC-------ATGGA--------T-------AT-AGGTCAATGT-G-T----GGA-AGTGCA
gi|155544 : ATAT---CTTCCAAA-----A-TATG------C-A--AGGG-A-AT-CA-AACT-C--AACTTG-A-A-------------------------------G-AGCGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155545 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------T-A--AAGG-A-AT-CC-AACC-A--GACTCG-G-AAC-------ATGGC--------A-------AG-AGGACAATGT-
gi|155546 : ATAT---CTTCAGAA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATG-A--GATTTATG-AAC-------ATGGA--------A-------AG-AGGACAATGT-G-
gi|155547 : ATAT---CTTCAGAA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATG-A--TATTTATG-AAC-------ATGGA--------C-------AG-AGGACAATGT-G-
gi|155548 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------G-T--ATCA-A-AT-CC-AATG-T--GA-TTG-G-AAT-------GTAGA--------T-------AG-AAGGCAATGA-G-T----GAA-AGTGCAAA
gi|155549 : ATAT---CTTCAGTA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-TC-AATG-A--GATTTATG-AAC-------ATGGA--------A-------AG-AGGACAATGT-G-
gi|155550 : ATAT---CTTCAGTA-----T-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATG-A--GATTTATG-AAC-------ATGGA--------C-------AG-AAGGCATTGT-G-
gi|155551 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TCTG------G-A--AAGG-A-AT-CC-AACA-A--GAC-TG-G-AAT-------ATGGA--------T-------TA-AAGGCATTGT-G-
gi|155552 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------G-A--TGAT-A-AT-TC-AGCA-A--GACTTG-G-AAC-------ATAGA--------A-------AG-AGGGC-ATAT-A-T----GGAGAGT
gi|155553 : ATAT---CTTCGAAGTAT--A-TATG------G-A--CGGG-A-TC-TC-AAGA-A--GACTTT-G-AAC-------ATGGG--------T-------TG-AGGGCAATGT-
gi|155554 : TAT---CTTCAAA------G-TACG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACA-A--GACTTG-G-AAC-------CTGGA--------T-------GG-AGGCCTGTGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155555 : TAT---TCTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-C-------A--AACTTA-G-AAC-------CGAGA--------T-------AC-AGGTCAATGT-G-T----GGA-AGTGCACAG
gi|155556 : TAA---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AAGG-A-AT-AC-ATTT-A--TACTTG-G-AAC-------TTGAA--------G-------AG-AAGGTAATGT-G-T----GGA-TGTGCAGAG
gi|155557 : TAT---CTTTAAAA-----G-TGAG------A-A--AGAA-A-AT-CT-ATTG-T--AACTTG-GGAAC-------ATGAA--------T-------AG-AGAGCTTTGT-G-C----AGG-AGTGCAGAG
gi|155558 : TAT---CTTCAAAT-----T-TATG------T-A--AAGA-A-TC-CC-AACC-A--AACTTA-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AGAGCAATAT-G-T----
gi|155559 : AT---CTTCAAGA-----G-TATG------G-T--ACGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGAA--------T-------AG-AGGTTAATAT-G-T----AGA-AGTGCAG
gi|155560 : AT---CTTCAACA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AC-CC-AGCA-A--GACTTG-G-ATC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-
gi|155561 : AT---CTTCAAA------G-TATG------A-A--AGGG-A-AT-AC-AAT--------TTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------TA-AAGGCATTGT-G-
gi|155562 : AT---CTTCAAGA-----A-CATG------G-A--AGTG-------C-AATG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGAATAATGCAGT-------AG-AGGTCAATGT-G-T----GGT-GGTGCAGAG
gi|155563 : AT---CTTCAAGA-----A-CATG------G-A--AGTG-------C-AATG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGAATAATGCAGT-------AG-AGGTCAATGT-G-T----GGT-GGTGCAGAG
gi|155564 : T---CTCCAAAATATAAG-TATG------G-A--AGGGGA-AT-CC-AACA-A--AACTTT-G-AAC-------ATGAA--------T-------TG-ACGTCAATGT-G-T----TGA-AGTGTAGAG
gi|155565 : T---CTTCAAGA-----G-TATG------G-A---TGA-A-AT-AC-AATG-A--GACTTG-GGAAC-------ATGGA--------T-------AT-GGGTAAATGT-A-T----GGA-AGTGCA
gi|155566 : ---CTCCAAAG-----G-TACT------A-A--AAGG-A-AT-CC-AAAG-A--CACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGTAATTT-G-C----GGA-AATGCAGAG
gi|155567 : TTTAAAA-----G-TAAG------G-A--AGGT-A-AT-CC-AAAG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAAAGT-G-T----TGA-AGTGCAGAG
gi|155568 : TTCAAAA-----G-TATT------GCA--AGGG-A-AT-CC-AATG-A--CACTTG-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AGGGTAATAG-G-A----GGA-AGT
gi|155569 : TTCAAAA-----G-TA-------------AGGG-A-AC-AT-AAGG-A--CACTTG-G-GAC-------ATGGA--------T-------GG-AGGGCTTTGT-A-T----GGA-AGTACAGAG
gi|155570 : TTCATAA-------TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AATA-T--GACTTG-G-GAC-------ATGGG--------T-------AG-ACGGCAATAT-G-T----GGC-AGTGCAGAG
gi|155571 : TTTAAAA-----G-TATG------G-A--AAGG-A-AT-CC-ACTG-A--GACTGG-G-AAC-------ATGGA--------C-------GG-AAGGCGTTAA-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155572 : TCCAAAG-----A-TACT------G-A--CAGG-A-AT-CC-AAGG-A--AACTTG-G-AAC-------ATGGA--------TGGGGGGGGG-GGGGCAATGT-G-T----GAA-AGTGCA
gi|155573 : TTCAAAA-----AATATC------A-A--AGGG-A-AT-CC-AGCG-T--GATTTG-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AAGGCAACAT-G-T----GAA-AG
gi|155574 : TCCAAAA-----C-TATG------A-A--AAAT-A-AT-------------ACTTG-G-AAC-------ACGGA--------T-------AG-ACGGTAA--T-G-T----AGA-AGTGCAGAG
gi|155575 : AAAA-----A-AATG------G-A--AAGG-A-AT-CC-AACG-T--AATTTG-G-AAC-------ATGGA--------A-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GTA-AGTGCAGAG
gi|155576 : -A--AGGA-A-AT-CC-AGCG-G--CACTTG-G-AAC-------ACAGA--------T-------GG-AGGGTAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155577 : --AGGG-A-AT-CC-AACG-A----CTTG-G-AAC-------ATGGG--------T-------AG-TAAGCAAAGT-G-T----GGA-AGCGCAGA
gi|155578 : --AGGG-A-AT-CC-AATG-A--CACTTG-G-AAC-------ATGGA--------C-------AGAAGAGTAATGT-GTT----TGA-AGTGGAGAG
blockSeqs : TTC TATAAG CATGTAG TGGTT T G ATACAGA TAATGCAG GGGGGGG CGAA
blockSeqs : . TATA GC TGGA T G . TAATGCAG . GGA
blockSeqs : . GT T TGT T . . . . .
blockSeqs : . CG T AGG T . . . . .
blockSeqs : . AA G CAC . . . . . .
blockSeqs : . G T CAT . . . . . .
blockSeqs : . G G CGC . . . . . .
blockSeqs : . G T CGT . . . . . .
blockSeqs : . G G CAA . . . . . .
blockSeqs : . G G TGC . . . . . .
blockSeqs : . G T CAA . . . . . .
blockSeqs : . A G CTT . . . . . .
blockSeqs : . A G CGT . . . . . .
blockSeqs : . C T CAA . . . . . .
blockSeqs : . A G CAT . . . . . .
blockSeqs : . G G TAT . . . . . .
blockSeqs : . G T CGA . . . . . .
blockSeqs : . G T CAA . . . . . .
blockSeqs : . T G CGC . . . . . .
blockSeqs : . A G ATT . . . . . .
blockSeqs : . G G CTT . . . . . .
blockSeqs : . G T TGC . . . . . .
blockSeqs : . A G TCA . . . . . .
blockSeqs : . A A CTC . . . . . .
blockSeqs : . G A CCA . . . . . .
blockSeqs : . G G TGA . . . . . .
blockSeqs : . G C TGA . . . . . .
blockSeqs : . A T TGT . . . . . .
blockSeqs : . A A TGA . . . . . .
blockSeqs : . A A TGA . . . . . .
blockSeqs : . A G CAA . . . . . .
blockSeqs : . A A CAA . . . . . .
blockSeqs : . A A GAA . . . . . .
blockSeqs : . T G CAA . . . . . .
blockSeqs : . G G TTA . . . . . .
blockSeqs : . A G TGT . . . . . .
blockSeqs : . G G CCA . . . . . .
blockSeqs : . G G CGA . . . . . .
blockSeqs : . G G CAA . . . . . .
blockSeqs : . G A TGA . . . . . .
blockSeqs : . T T TGA . . . . . .
blockSeqs : . G G CAA . . . . . .
blockSeqs : . G G TGA . . . . . .
blockSeqs : . G A AGA . . . . . .
blockSeqs : . A G AGA . . . . . .
blockSeqs : . A G TGA . . . . . .
blockSeqs : . G G GGA . . . . . .
blockSeqs : . G G TAT . . . . . .
blockSeqs : G A TGA . . . . . .
blockSeqs : G G GGA . . . . . .
blockSeqs : G T CGT . . . . .
blockSeqs : G G CGT . . . . .
blockSeqs : A G CGG . . . . .
blockSeqs : C A CGA . . . . .
blockSeqs : A A TGA . . . . .
blockSeqs : . G C . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . .
blockSeqs : A . . . . .
blockSeqs : T . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
finalCons : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
Alignments
lowQualScore : 111 3333333 22222222 00 0 0 0 0 444444 2 1 2222222 44444444 2222222 0 0 0 3333 0
lowQualScore : ... ....... ........ .. . . . . ...... . . ....... ........ ....... . . . .... .
lowQualScore : 444 7777777 22222222 99 7 7 7 7 000000 6 3 1111111 88888888 1111111 7 7 7 0000 8
consensus : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
Reference ( family-435 ) : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155518 : ATAT---CTTTAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AAAG-T--GCCTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGTCTATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155519 : ATAT---GTCCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AATGGA--CACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AA-AGGACAATGT-G-T----GGA-GGTGCAGAG
gi|155520 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CT-AATG-T--CACTTA-G-AATATACAGAATAGA--------T-------AG-AAAGCCATGT-G-T----GAA-AATGCAGAG
gi|155521 : ATAT---ATTCAGAT-----G-TATG------G-G--AGGG-A-TT-CT-AAAG-G--GACTTG-G-AAC-------AAGGA--------T-------AG-A-GGCAATAT-A-T----AGA-TGTGCAGAG
gi|155522 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACA-C--AGCTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAGTGT-
gi|155523 : ATAT---CTTAAAGA-----G-CATG------G-A--AGGG-GCAT-CA-AACA-T--AACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AA-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTATCGAG
gi|155524 : ATAT---TTTCAAAT-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-C--AAATTG-T-AAT-------ATGGA--------T-------AG-GTGGCAATGT-G-T----GGA-AGTTCAGAG
gi|155525 : ATAT---CTTTAAAA-----A-TATG------G-A--AGTG-A-AT-CC-AACG-T--GATTTG-A-AAC-------ATGGC--------T-------AG-AAAGAAATGT-A-T----TGA-A-TACATAG
gi|155526 : ATAT---CTTCAATA-----A-TATG------G-A--AGAA-A-AC-CC-AACA-A--GACTTT-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCATTTT-G-T----GGA-AAAGCAGAG
gi|155527 : ATAT---CTTCAAAA-----C-TATG------T-A--AGAA-A-AT-CC-AATG-C--AACTTG-G-AAC-------ACGGA--------T-------AG-AGAGCAATAT-A-TGGA-GGA-AGTCTAGAG
gi|155528 : ATAT---CTTCAAAA-----GTTAT-------G-A--AGGG-A-AT-CT-AACA-A--GACTTG-G-AAC-------ACAGA--------T-------AG-AGGTCAATGT-T-T----TTA-AGTGAAGAG
gi|155529 : ATAT---CTTTAAAA-----A-TAAT------G-A--AATG-A-AT-CTTAACT-T--GCCTGG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGTGCAAAGT-G-T----GGA-AGTGAAGAG
gi|155530 : ATAT---ATTCAAAA-----G-TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AACG-T--GATTTG-A-AAC-------ATTGA--------T-------AG-ACAGCAATGT-G-G----GAA-AGTGCAGAG
gi|155531 : ATTT---CTTGAAAA-----G-TACA------G-A--AGAA-A-AT-TC---TG-GTTAATTTG-A-AAC-------ATGGA--------C-------AG-AGTGCAATGC-G-T----GGA-AGTGAAAAG
gi|155532 : ATAT---CTTCAGAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACA-A--GACTCG-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AGTTCAATAT-G-T----
gi|155533 : ATAT---CTTCAAAA-----T-TATG------T-A--AGGG-A-ATCCC-AACA-T--GTCTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-ATGGTATTGTCA-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155534 : ATAT---CTTCATAG-----A-TATG------T-A--AGGG-T-AT-CC-TGTA-T--GCATTG-G-GAC-------ATAGA--------T-------CG-AGGGCAATGT-G-T----GGA-AGTACAGAG
gi|155535 : ATAG---CTCCAAAA-----G-TACA------G-A--AGAG-A-AT-CC-AACG-A--CACTTG-T-AAC-------ATGGG--------T-------AG-AGGGCAAAAC-G-T----GTA-AGTGCAGAG
gi|155536 : ATAT---TTTCA------------TG------G-ATTAGGG-A-AT-CC-AACA-A--CACTTG-G-AGT-------ATAGT--------T-------AG-AGAGCAATGT-C-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155537 : ATAT---CTTCAAAAC----G-TATG------G-G--AGGG-A-AT-CC-AACG-C--GGCTTG-G-AAC-------ATGAA--------T-------AG-AAGACAATTT-G-T----GGA-AG
gi|155538 : ATAT---CTTCAAAT-----G-TATG------T-A--CAGT-A-A---C-AAC--------TTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCA--GT-G-T----GGA-AGTGCATAG
gi|155539 : ATAT---CTTCAAAA-----A-CATG------G-G--AGGA-A-AT-CC-AAAT-T--GACCCT-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGACAATAA-G-T----GGG-AATGCAG
gi|155540 : ATTT---CTTTAAAA-----A-TAGG------A-G--ATGG-A-AT-CC-AACT-T--GACTGA-G-GAC-------ATGTA--------T-------AT-AGTGCAATGT-G-TCGAAGGA-AGTGCAGA
gi|155541 : ATAT---TTTCAAAA-----G-TATACATGTAG-A--ATAG-A-AC-CC-AATG-C--AACCTG-A-AAC-------ATGAA--------T-------AG-AGGGCTATGT-G-T----GAA-AGTGCAGAG
gi|155542 : ATATTTCCTTCAAAA-----G-CATT------A-T--AGAG-A-AT-CC-ATTC-A--GAGTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AA-GGTGCATTTT-A-T----GAA-ATTGCAGAG
gi|155543 : ATAT---TCCCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGA-C-GC-CT-AA---A--GATTTG-G-TAC-------ATGGA--------T-------AT-AGGTCAATGT-G-T----GGA-AGTGCA
gi|155544 : ATAT---CTTCCAAA-----A-TATG------C-A--AGGG-A-AT-CA-AACT-C--AACTTG-A-A-------------------------------G-AGCGCAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155545 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------T-A--AAGG-A-AT-CC-AACC-A--GACTCG-G-AAC-------ATGGC--------A-------AG-AGGACAATGT-
gi|155546 : ATAT---CTTCAGAA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATG-A--GATTTATG-AAC-------ATGGA--------A-------AG-AGGACAATGT-G-
gi|155547 : ATAT---CTTCAGAA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATG-A--TATTTATG-AAC-------ATGGA--------C-------AG-AGGACAATGT-G-
gi|155548 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------G-T--ATCA-A-AT-CC-AATG-T--GA-TTG-G-AAT-------GTAGA--------T-------AG-AAGGCAATGA-G-T----GAA-AGTGCAAA
gi|155549 : ATAT---CTTCAGTA-----A-TATG------A-T--AGAG-A-AT-TC-AATG-A--GATTTATG-AAC-------ATGGA--------A-------AG-AGGACAATGT-G-
gi|155550 : ATAT---CTTCAGTA-----T-TATG------A-T--AGAG-A-AT-CC-AATG-A--GATTTATG-AAC-------ATGGA--------C-------AG-AAGGCATTGT-G-
gi|155551 : ATAT---CTTCAAAA-----G-TCTG------G-A--AAGG-A-AT-CC-AACA-A--GAC-TG-G-AAT-------ATGGA--------T-------TA-AAGGCATTGT-G-
gi|155552 : ATAT---CTTCAAAA-----A-TATG------G-A--TGAT-A-AT-TC-AGCA-A--GACTTG-G-AAC-------ATAGA--------A-------AG-AGGGC-ATAT-A-T----GGAGAGT
gi|155553 : ATAT---CTTCGAAGTAT--A-TATG------G-A--CGGG-A-TC-TC-AAGA-A--GACTTT-G-AAC-------ATGGG--------T-------TG-AGGGCAATGT-
gi|155554 : TAT---CTTCAAA------G-TACG------G-A--AGGG-A-AT-CC-AACA-A--GACTTG-G-AAC-------CTGGA--------T-------GG-AGGCCTGTGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155555 : TAT---TCTCAAAA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AT-C-------A--AACTTA-G-AAC-------CGAGA--------T-------AC-AGGTCAATGT-G-T----GGA-AGTGCACAG
gi|155556 : TAA---CTTCAAAA-----G-TATG------G-A--AAGG-A-AT-AC-ATTT-A--TACTTG-G-AAC-------TTGAA--------G-------AG-AAGGTAATGT-G-T----GGA-TGTGCAGAG
gi|155557 : TAT---CTTTAAAA-----G-TGAG------A-A--AGAA-A-AT-CT-ATTG-T--AACTTG-GGAAC-------ATGAA--------T-------AG-AGAGCTTTGT-G-C----AGG-AGTGCAGAG
gi|155558 : TAT---CTTCAAAT-----T-TATG------T-A--AAGA-A-TC-CC-AACC-A--AACTTA-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AGAGCAATAT-G-T----
gi|155559 : AT---CTTCAAGA-----G-TATG------G-T--ACGG-A-AT-CC-AACG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGAA--------T-------AG-AGGTTAATAT-G-T----AGA-AGTGCAG
gi|155560 : AT---CTTCAACA-----G-TATG------G-A--AGGG-A-AC-CC-AGCA-A--GACTTG-G-ATC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAATGT-G-
gi|155561 : AT---CTTCAAA------G-TATG------A-A--AGGG-A-AT-AC-AAT--------TTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------TA-AAGGCATTGT-G-
gi|155562 : AT---CTTCAAGA-----A-CATG------G-A--AGTG-------C-AATG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGAATAATGCAGT-------AG-AGGTCAATGT-G-T----GGT-GGTGCAGAG
gi|155563 : AT---CTTCAAGA-----A-CATG------G-A--AGTG-------C-AATG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGAATAATGCAGT-------AG-AGGTCAATGT-G-T----GGT-GGTGCAGAG
gi|155564 : T---CTCCAAAATATAAG-TATG------G-A--AGGGGA-AT-CC-AACA-A--AACTTT-G-AAC-------ATGAA--------T-------TG-ACGTCAATGT-G-T----TGA-AGTGTAGAG
gi|155565 : T---CTTCAAGA-----G-TATG------G-A---TGA-A-AT-AC-AATG-A--GACTTG-GGAAC-------ATGGA--------T-------AT-GGGTAAATGT-A-T----GGA-AGTGCA
gi|155566 : ---CTCCAAAG-----G-TACT------A-A--AAGG-A-AT-CC-AAAG-A--CACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGTAATTT-G-C----GGA-AATGCAGAG
gi|155567 : TTTAAAA-----G-TAAG------G-A--AGGT-A-AT-CC-AAAG-A--GACTTG-G-AAC-------ATGGA--------T-------AG-AGGGCAAAGT-G-T----TGA-AGTGCAGAG
gi|155568 : TTCAAAA-----G-TATT------GCA--AGGG-A-AT-CC-AATG-A--CACTTG-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AGGGTAATAG-G-A----GGA-AGT
gi|155569 : TTCAAAA-----G-TA-------------AGGG-A-AC-AT-AAGG-A--CACTTG-G-GAC-------ATGGA--------T-------GG-AGGGCTTTGT-A-T----GGA-AGTACAGAG
gi|155570 : TTCATAA-------TATG------T-A--AGGG-A-AT-CC-AATA-T--GACTTG-G-GAC-------ATGGG--------T-------AG-ACGGCAATAT-G-T----GGC-AGTGCAGAG
gi|155571 : TTTAAAA-----G-TATG------G-A--AAGG-A-AT-CC-ACTG-A--GACTGG-G-AAC-------ATGGA--------C-------GG-AAGGCGTTAA-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155572 : TCCAAAG-----A-TACT------G-A--CAGG-A-AT-CC-AAGG-A--AACTTG-G-AAC-------ATGGA--------TGGGGGGGGG-GGGGCAATGT-G-T----GAA-AGTGCA
gi|155573 : TTCAAAA-----AATATC------A-A--AGGG-A-AT-CC-AGCG-T--GATTTG-G-AAC-------ATAGA--------T-------AG-AAGGCAACAT-G-T----GAA-AG
gi|155574 : TCCAAAA-----C-TATG------A-A--AAAT-A-AT-------------ACTTG-G-AAC-------ACGGA--------T-------AG-ACGGTAA--T-G-T----AGA-AGTGCAGAG
gi|155575 : AAAA-----A-AATG------G-A--AAGG-A-AT-CC-AACG-T--AATTTG-G-AAC-------ATGGA--------A-------AG-AGGGCAATGT-G-T----GTA-AGTGCAGAG
gi|155576 : -A--AGGA-A-AT-CC-AGCG-G--CACTTG-G-AAC-------ACAGA--------T-------GG-AGGGTAATGT-G-T----GGA-AGTGCAGAG
gi|155577 : --AGGG-A-AT-CC-AACG-A----CTTG-G-AAC-------ATGGG--------T-------AG-TAAGCAAAGT-G-T----GGA-AGCGCAGA
gi|155578 : --AGGG-A-AT-CC-AATG-A--CACTTG-G-AAC-------ATGGA--------C-------AGAAGAGTAATGT-GTT----TGA-AGTGGAGAG