lowQualScore : 11 111111111111
lowQualScore : 0 0 11 22 1111 3 888888888888 444444 0 88888 0 1 333333 11 22222222 555555 88 222222
lowQualScore : . . .. .. .... . ............ ...... . ..... . . ...... .. ........ ...... .. ......
lowQualScore : 7 7 88 22 5555 5 333333333333 555555 7 77777 7 3 888888 00 66666666 222222 11 888888
consensus : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATCTC--GA--A----T-TC-C--G-N----GGGA------CC-G-C--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCG-----AANTTC------GATTTATCAGGAGTCT
Reference ( gi|80486 ) : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATTTC--GA--A----T-TC-T--G-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCG-----GACTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80488 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTACTTC--GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCG-----GACTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80496 : ATAC-AGTCGAACATCG-TTATTTC--GA--A----T-TC-T--G-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCTG-----GACTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80487 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATTT---GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CC-A-T--AAAA-ATGA----T-T--CGA--------AATATCCG-----GACTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80491 : ATAC-AATCGAAACTCG-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CC-A-T--AAAA-ATAA----T-T--CAA--------AATATCCG-----GATTTC------GATTTATCAGAAGTCT
gi|80525 : ATA--AATCGAACTTCGGTTATTTC--GA--ATTATT-TT-T--A-C----GGTC------CC-A-T--GG-----AA----T-T--CGA--------AATA-ACG-----AGTTTC------GACT
gi|80494 : tacATAC-AGTCGAAACTCG-TTATTTA--GA--A----T-TC-C--T-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCG-----AAGTTC------GATTTATCAGGAGTCTcaggagtct
gi|80492 : ATAC-AGTCAAAACTCG-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CC-T-T--GAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCG-----AAGTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80489 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCG-----AAGTTT------GATTTATCAG
gi|80495 : ATAC-AGTCAAAACTCG-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CC-T-T--GAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCG-----AAGTTC------GATTAATCAGGAGTCT
gi|80504 : ATAC-AGTCGAAACACT-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--T-T----GGGA------CCAG-T---TAA-ATAA----T-T--TGA--------AGTATCCG-----GATTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80493 : ATAC-AGTCAAAACTCG-TTATTTC--GA--A----A-TC-C--G-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCG-----AAGTTC------AATT
gi|80499 : ATAC-AGTCAAAACTCG-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CT-G-T--AAAA-ATAAT---T-T--CGA--------AATATCAA-----AAGTTT------GATTTATCAG
gi|80510 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATTTC--AA--A----T-TC-C--A-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--TGA--------ATAAACCG-----GAATTC------TATTTATCAG
gi|80502 : ATAA-AGTCGAAACTCG-TTGTTTC--GA--A----T-TC-T--G-T----GAGA------CC-G-T--AAAA-ACAA----T-T--CGA--------AATATCAA-----AAATTT------GATTTAT
gi|80490 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATCTC--GAT-A----T-T--G--G-A----GGGA------CT-G-C--CAAA-AAAA----C-T--CGA--------GATATCCG-----AATATC------GA
gi|80497 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATTTC--GAT-A----T-T--G--G-A----GGGA------CT-GCC--AAAA-AAAA----C-T--TGA--------GATATCCG-----AATATC------GAcaaagatgttgtct
gi|80507 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATATC--GAT-A----T-TC-T--A------GGGA------CT-G-C--CAAA-AAAA----C-T--CAA--------GATATCCAATATCGACATA------GATTTcatagattttgtct
gi|80521 : ATAC-AGTCGAACCTCG-TTATTTTTTAA--A----T-GC-C--A-C----GAGG------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-A--CGA--------AATATCtgtct
gi|80500 : ATAC-AGTCGAAA-TCG-TTATTTC--GAT-A----T-TG----G-A----GGGA------AT-G-CC-AAAA-ATAA----CCT--CGA--------AATATCCG-----AATATC------GAgaat
gi|80498 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATCTC--GAT-A----T-T--G--G-A----GGAA------CT-GCC--AAAA-ACA-------T--CGA--------GATATCCG-----AATATC------GAcatagattttgtct
gi|80503 : ATAC-AGTCGAAACTCT-TTATCTC--GAT-A----T-T--G--G-A----GGGA------CT-G-C--CAAA-AGAA----C-T--CGA--------AAT
gi|80513 : ATAC-AGTC-AAACTCG-TTATTTC--GAT-A----T-T--G--G-A----GGGA------CT-G-CCAAAAA-AAAA----A-T--GGA--------GATATTTG-----AA
gi|80508 : ATAC-AGTCGAAACTCA-TTAACTC--G--------T-TA-TTGG-A----GGGA------CT-G-CCAAAAA-ACA-------T--TGA--------GATATCCG-----AAtatcaacatagattttgtct
gi|80505 : ATAC-AGTTGAAACTTG-TTATCTC--GAT-A----T-T--G--G-A----GGAA------CT-G-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAGATTACTGAATATC-------GACATA------GATTTtatcaa
gi|80512 : ATAC-AGTTGAAACTCG-TTATCTC--G-----------C-T--A-TTGGAGGGAATG---CC-A----AAAA-ATA-------T--TGA--------GATATCtgtct
gi|80501 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATCTC--GA--aaaatattga
gi|80514 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATCTC--GA--tatcg
gi|80518 : ATAC-AGTCAAAACTCG-TTATCT---AA--A----T-AT-T--A-TA---GGGAATG---CC-A-A--AAAA-ATA-------T--TGA--------GATATCtatcgctcggatcgatattccggttattcgatattt
gi|80520 : ATAC-AGTCGAAACTCG-TTATCTT--GAT-A----T----T--G-T----TGAA------TC-G-
gi|80509 : ATAT-AGTCGAAACTCA-TTATCAT--GAT-A----T-T--G--G-A----GGGA------CT-G-CCAAAAA-ACA-------T--CAA--------GATATCAG-----AATATC------GAatattctggtaatgtcgatattttttgcaagtt
gi|80506 : ATAC-AGTCGAAACTCA-TTATCTC--GA--
gi|80511 : ATAC-AGTCGAAACTCT-TTATCTT--GAT-A----T-T--G--G-A----AGGG------CT-G-CCAAAAA-ATA-------T--TGA--------GATATCtatcgcttgagccgttattcaggtaatgtcgatat
gi|80516 : ATAC-AGTCGAAACACG-TTATCTC---A--A----TATT-G--G-A----GGGAATAATGCC-A----AAAA-ACA-------T--TGA--------GATATCagaat
gi|80515 : ATAC-AACCGAAACTCG-TTATCAC---A--A----TATT-G--G-A----GGGA------CT-G-C--CAAA-AAAC----T-T--AAG--------AATATCaaaatatcgtcatagattttgtct
gi|80517 : ATAC-AGTCGAAACTCA-TTATCTCCATA--A----T----A--G-A----GGGA------CT-GCC--AAAA-AACA----T-TACCCA--------AATAT
gi|80519 : ATAC-AGTTGAAACTGG-TTATCTC--G
gi|80525 : TAC-AGTCGAAACTCG-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--A-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATAACCG-----AAGTTC------GATTTATCAGGAGTCTttattggaggagggactgccagaaaatatcaatatttctgtatattgacatagattttgtct
gi|80524 : TAC-AGTCGAAACTCG-TTATTTC--AA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATAACCG-----AAGTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80528 : TAC-AGTCGAAACTCG-TATTTTC--GA--A----T-TT-C--G-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCA-----GACTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80523 : TAC-AGTCGAAACTCG-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCG-----AAGTTC------GATTTATCAG
gi|80526 : TAC-AGTTGAAACTCG-TTATTTC--GA--G----T-TT-C--G-T----GGGA------CT-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCTG-----AAGATC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80529 : TAC-AGTTGAAACTCA-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CT-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCA-----AAGTTT------GATTTATCAG
gi|80531 : TACTAGTCGAAACTCT-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCTG-----AAGTTC------AATTTAT
gi|80530 : TAC-AGTCCAAACTCT-TTATTTG--GA--A----T-TC-C--G-T----GGGA------CC-G-T--AAAA-ATAA----T-T--CGA--------AATATCCG-----AAGTTC------GATTCAT
gi|80534 : TAC-AGTCGCAACTCC-TTGTTTC--AA--A----A-TAAT--T-T----GGGA------CC-A-C--AAAA-ATAA----T-T--TGA--------AATATCCG-----AAATTC------GATTTATCAGGAGTCTa
gi|80539 : TAC-AAACAAAACTCG-TTATTTC--GA--A----T-TC-C--A-T----GGGA------CC-T-T--TAAA-AGAA----A-T--CGA--------AATATCGG-----AAATTT------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80540 : TAC-AGTCGAAACTCG-TTATTCC--GA--A----T-TT-TC-A-C----GGGA------CT-A-T--CAAA-CTAA----T-T--CGA--------ATTATCAG-----TATTTC------AA
gi|80527 : TAC-AGTCGATACTCG-TTATCTC--GAT-A----T-T--G--G-A----GGGA------CT-G-C--CAAA-AGAA----C-T--GGA--------GATATCCG-----AATTTC------GAataa
gi|80533 : TAC-AGTTTAAACTCG-TTATCTC--GA--T----A-TA-T--G-A----GGGA------CT-G-C--CAAA-AAAA----C-T--CGA--------GATATCCG-----AATATC------GAaatagattttgtct
gi|80522 : TAC-AGTCGAAACTCG-TTATCTC---A--A----TATT-G--G-A----GGGA------CT-G-C--CAAA-AAAA----C-T--CCA--------GATATCCG-----AATATC------GA
gi|80532 : TAC-AGTCGAAACTCA-TTATCTC---A--A----TATT-G--G-A----GGGA------CT-A-C--CAAA-AAAA----C-T--CGA--------TATATCCG-----AAcatagattttgtct
gi|80535 : TAC-GGTTGAAACTCG-TTATCTC---A--A----TATT-G--G-A----GGGA------CT-G-C--CAAA-AAAA----C-T--TAA--------GATATCCtataaacatatattttgtc
gi|80542 : TAC-AGTTGAAACTCG-TTATCTT--GA--T----A-TC-G--G-A----GGGA------CT-G-T---TAT-GTAA----CAT--CGA--------GGTATCCaagtatcaacatagattttgtct
gi|80538 : TAC-AGTCACAACTTG-GTGTCTC--TAT-A----T-TG----G-A----GGGA------CT-G-C--CAAATATA-------T--CGA--------AATATCCG-----AATATC------GAttatatcgaaatagattttgtct
gi|80536 : TAC-AGTCACAACTCT-TTGTCTT--GAT-A----T-T--G--G-A----GGGA------CT-G-C--CAAA-AAAC----C-T--CGA--------GATATCCG-----AATATCAACACAGATTTAT
gi|80537 : TAA-AGTCGAAACTCG-TTATCTC---A--A----T-AT-T--GCT----GGAA------TC-G-a
gi|80541 : TAC-AGTTAAAACTC----ATCTC--GATAA----T-G-----G-A----GGGA------CT-G-C--CAAA-AAAA----C-T--CTG--------GATATCCG-----AATATC------GA
gi|80543 : AC-TGTCAAAACTCG-TTATTTC--AA--A----T-TC-A--G-T----AAGA------CT-G-T--AAAA-ATAA----T-T--TGA--------ATTATCAG-----AAATCG------AATTTAT
gi|80544 : -AATCGAAACTCA-TTATCTC--GAT-A----T-T--G--G-A----GGGA------CA-GCC--AAAA-AAAAGCCCC-T--CAA--------GATATCCA-----AATATC------GA
gi|80545 : AAACTCG-TTACCTC--GAT-A----T----T--G-G----AGGA------CT-G-C--CAAA-AC-A----C-T--CGA--------TATATCCG-----AATATC------GA
gi|80546 : CTGG-TTATCTC--GAT-A----T-TG----G-A----GGGA------CT-G-C--CAAA-ACAA----C-T--TAA--------GATATCCG-----AAcataggttttgtct
Alignments
lowQualScore : 11 1111
lowQualScore : 0 11 1 33 2222 4 6666 1 222222 99999 0 1 444444 11 33 222222
lowQualScore : . .. . .. .... . .... . ...... ..... . . ...... .. .. ......
lowQualScore : 7 88 3 44 2222 1 0000 0 000000 11111 7 1 333333 00 33 555555
consensus : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAANNTC------GATTTATCAGGAGTCT
Reference ( family-434 ) : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAANTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80486 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CTGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGGACTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80487 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTT---G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCA-T--AAAA-ATGA----T-T--CGAAATATCCGGACTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80488 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTACTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGGACTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80489 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTT------GATTTATCAG
gi|80490 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAGATATCCGAATATC------GA
gi|80491 : ATAC-AATCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCA-T--AAAA-ATAA----T-T--CAAAATATCCGGATTTC------GATTTATCAGAAGTCTcaaagatgttgtct
gi|80492 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCT-T--GAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80493 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----A-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------AATT
gi|80494 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTA--G-A--A----T-T--CCTTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80495 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCT-T--GAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------GATTAATCAGGAGTCT
gi|80496 : ATAC-AGTCGAACATCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CTGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCTGGACTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80497 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTGCC--AAAA-AAAA----C-T--TGAGATATCCGAATATC------GA
gi|80498 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGAA------CTGCC--AAAA-ACA-------T--CGAGATATCCGAATATC------GAcatagattttgtct
gi|80499 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAAT---T-T--CGAAATATCAAAAGTTT------GATTTATCAG
gi|80500 : ATAC-AGTCGAAA-TCGTTATTTC--G-AT-A----T-T--G-GAGGGA------ATG-CC-AAAA-ATAA----CCT--CGAAATATCCGAATATC------GA
gi|80501 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80502 : ATAA-AGTCGAAACTCGTTGTTTC--G-A--A----T-T--CTGTGAGA------CCG-T--AAAA-ACAA----T-T--CGAAATATCAAAAATTT------GATTTATtatcg
gi|80503 : ATAC-AGTCGAAACTCTTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AGAA----C-T--CGAAAT
gi|80504 : ATAC-AGTCGAAACACTTTATTTC--G-A--A----T-T--CCTTGGGA------CCA-G--TTAA-ATAA----T-T--TGAAGTATCCGGATTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80505 : ATAC-AGTTGAAACTTGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGAA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAGATTACTGAATATC------GA
gi|80506 : ATAC-AGTCGAAACTCATTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80507 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATATC--G-AT-A----T-T--CT-AGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CAAGATATCC-AATATC------GAtatcgcttgagccgttattcaggtaatgtcgatat
gi|80508 : ATAC-AGTCGAAACTCATTAACTC--GTT--A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-ACA-------T--TGAGATATCCGAATATC------AAcatagattttgtct
gi|80509 : ATAT-AGTCGAAACTCATTATCAT--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-ACA-------T--CAAGATATCAGAATATC------GA
gi|80510 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CCATGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--TGAATAAACCGGAATTC------TATTTATCAG
gi|80511 : ATAC-AGTCGAAACTCTTTATCTT--G-AT-A----T-T---GGAAGGG------CTG-CCAAAAA-ATA-------T--TGAGATATCAGAA
gi|80512 : ATAC-AGTTGAAACTCGTTATCTC--G-CT-A----T-T---GGAGGGA------ATG-CCAAAAA-ATA-------T--TGAGATATCAAAATATT------GAt
gi|80513 : ATAC-AGTC-AAACTCGTTATTTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-AAAA----A-T--GGAGATATTTGAATATC------AA
gi|80514 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80515 : ATAC-AACCGAAACTCGTTATCAC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAC----T-T--AAGAATATCtatcgctcggatcgatattccggttattcgatattt
gi|80516 : ATAC-AGTCGAAACACGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGAATAATGCCA----AAAA-ACA-------T--TGAGATATCAAAATATC------
gi|80517 : ATAC-AGTCGAAACTCATTATCTCCAT-A--A----T-----AGAGGGA------CTGCC--AAAA-AACA----T-TACCCAAATATtcatagattttgtct
gi|80518 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATCT---A-A--A----TAT--TATAGGGA------ATG-C--CAAA-AAAA----TAT--TGAGATATC
gi|80519 : ATAC-AGTTGAAACTGGTTATCTC--GTT--A----T-TGGAGGAGGGA------CTG-CCAGAAA-ATA-------T--C--AATAT
gi|80520 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTT--G-AT-A----T-T--ttctgtatattgacatagattttgtct
gi|80521 : ATAC-AGTCGAACCTCGTTATTTTTTA-A--A----T-G--CCACGAGG------CCG-T--AAAA-ATAA----T-A--CGAAATAT-CGAAgttgaatcgatattctggtaatgtcgatattttttgcaagtt
gi|80522 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CCAGATATCCGAATATC------GAt
gi|80523 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------GATTTATCAGcatagattttgtct
gi|80524 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATAACCGAAGTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80525 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCATGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATAACCGAAGTTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80526 : TAC-AGTTGAAACTCGTTATTTC--G-A--G----T-T--TCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCTGAAGATC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80527 : TAC-AGTCGATACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AGAA----C-T--GGAGATATCCGAATTTC------GA
gi|80528 : TAC-AGTCGAAACTCGTATTTTC--G-A--A----T-T--TCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCAGACTTC------GATTTATCAGGAGTCTaatagattttgtct
gi|80529 : TAC-AGTTGAAACTCATTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCAAAGTTT------GATTTATCAG
gi|80530 : TAC-AGTCCAAACTCTTTATTTG--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------GATTCAT
gi|80531 : TACTAGTCGAAACTCTTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCTGAAGTTC------AATTTATa
gi|80532 : TAC-AGTCGAAACTCATTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTA-C--CAAA-AAAA----C-T--CGATATATCCGAA
gi|80533 : TAC-AGTTTAAACTCGTTATCTC--G-A--T----A-T--ATGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAGATATCCGAATATC------GAtataaacatatattttgtc
gi|80534 : TAC-AGTCGCAACTCCTTGTTTC--A-A--AATAAT-T-----TGGGA------CCA-C--AAAA-ATAA----T-T--TGAAATATCCGAAATTC------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80535 : TAC-GGTTGAAACTCGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--TAAGATATCCAA
gi|80536 : TAC-AGTCACAACTCTTTGTCTT--G-AT-A----T-T--G-GAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAC----C-T--CGAGATATCCGAATATCAACACAGATTTATgtatcaacatagattttgtct
gi|80537 : TAA-AGTCGAAACTCGTTATCTC--A-AT-A----T-T--GC-TGGAA------TCG-a
gi|80538 : TAC-AGTCACAACTTGGTGTCTC--T-AT-A----T-T--G-GAGGGA------CTG-C--CAAATATA-------T--CGAAATATCCGAATATC------GA
gi|80539 : TAC-AAACAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCATGGGA------CCT-T--TAAA-AGAA----A-T--CGAAATATCGGAAATTT------GATTTATCAGGAGTCT
gi|80540 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTCC--G-A--AT---T-T--TCACGGGA------CTA-T--CAAA-CTAA----T-T--CGAATTATCAGTATTTC------AA
gi|80541 : TAC-AGTTAAAACTC---ATCTC--G-ATAA----T-G----GAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CTGGATATCCGAATATC------GAataa
gi|80542 : TAC-AGTTGAAACTCGTTATCTT--G-A--T----A-T--CGGAGGGA------CTG-T---TAT-GTAA----CAT--CGAGGTATCC
gi|80543 : AC-TGTCAAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CAGTAAGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--TGAATTATCAGAAATCG------AATTTATttatatcgaaatagattttgtct
gi|80544 : -AATCGAAACTCATTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CAGCC--AAAA-AAAAGCCCC-T--CAAGATATCCAAATATC------GA
gi|80545 : AAACTCGTTACCTC--G-AT-A----T-T----GGAGGA------CTG-C--CAAA-AC-A----C-T--CGATATATCCGAATATC------GA
gi|80546 : CTGGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-ACAA----C-T--TAAGATATCCGAATATT------GAcataggttttgtct
Alignments
lowQualScore : 11 1111
lowQualScore : 0 11 1 33 2222 4 6666 1 222222 99999 0 1 444444 11 22 222222 0
lowQualScore : . .. . .. .... . .... . ...... ..... . . ...... .. .. ...... .
lowQualScore : 7 88 3 44 2222 1 0000 0 000000 11111 7 1 333333 00 88 333333 8
consensus : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAATNTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
Reference ( family-434 ) : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAANNTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80486 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CTGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80487 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTT---G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCA-T--AAAA-ATGA----T-T--CGAAATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80488 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTACTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80489 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80490 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAGATATCCGAATATC------G-A
gi|80491 : ATAC-AATCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCA-T--AAAA-ATAA----T-T--CAAAATATCCGGATTTC------G-ATTTATCAGAAGTCTcaaagatgttgtct
gi|80492 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCT-T--GAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80493 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----A-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------A-ATT
gi|80494 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTA--G-A--A----T-T--CCTTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80495 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCT-T--GAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------G-ATTAATCAGGAGTCT
gi|80496 : ATAC-AGTCGAACATCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CTGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCTGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80497 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTGCC--AAAA-AAAA----C-T--TGAGATATCCGAATATC------G-A
gi|80498 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGAA------CTGCC--AAAA-ACA-------T--CGAGATATCCGAATATC------G-Acatagattttgtct
gi|80499 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAAT---T-T--CGAAATATCAAAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80500 : ATAC-AGTCGAAA-TCGTTATTTC--G-AT-A----T-T--G-GAGGGA------ATG-CC-AAAA-ATAA----CCT--CGAAATATCCGAATATC------G-A
gi|80501 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80502 : ATAA-AGTCGAAACTCGTTGTTTC--G-A--A----T-T--CTGTGAGA------CCG-T--AAAA-ACAA----T-T--CGAAATATCAAAAATTT------G-ATTTATtatcg
gi|80503 : ATAC-AGTCGAAACTCTTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AGAA----C-T--CGAAAT
gi|80504 : ATAC-AGTCGAAACACTTTATTTC--G-A--A----T-T--CCTTGGGA------CCA-G--TTAA-ATAA----T-T--TGAAGTATCCGGATTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80505 : ATAC-AGTTGAAACTTGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGAA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAGATTACTGAATATC------G-A
gi|80506 : ATAC-AGTCGAAACTCATTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80507 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATATC--G-AT-A----T-T--CT-AGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CAAGATATCC-AATATC------G-Atatcgcttgagccgttattcaggtaatgtcgatat
gi|80508 : ATAC-AGTCGAAACTCATTAACTC--GTT--A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-ACA-------T--TGAGATATCCGAATATC------A-Acatagattttgtct
gi|80509 : ATAT-AGTCGAAACTCATTATCAT--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-ACA-------T--CAAGATATCAGAATATC------G-A
gi|80510 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CCATGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--TGAATAAACCGGAATTC------T-ATTTATCAG
gi|80511 : ATAC-AGTCGAAACTCTTTATCTT--G-AT-A----T-T---GGAAGGG------CTG-CCAAAAA-ATA-------T--TGAGATATCAGAA
gi|80512 : ATAC-AGTTGAAACTCGTTATCTC--G-CT-A----T-T---GGAGGGA------ATG-CCAAAAA-ATA-------T--TGAGATATCAAAATATT------G-At
gi|80513 : ATAC-AGTC-AAACTCGTTATTTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-AAAA----A-T--GGAGATATTTGAATATC------A-A
gi|80514 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80515 : ATAC-AACCGAAACTCGTTATCAC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAC----T-T--AAGAATATCtatcgctcggatcgatattccggttattcgatattt
gi|80516 : ATAC-AGTCGAAACACGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGAATAATGCCA----AAAA-ACA-------T--TGAGATATCAAAATATC------G-
gi|80517 : ATAC-AGTCGAAACTCATTATCTCCAT-A--A----T-----AGAGGGA------CTGCC--AAAA-AACA----T-TACCCAAATATtcatagattttgtct
gi|80518 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATCT---A-A--A----TAT--TATAGGGA------ATG-C--CAAA-AAAA----TAT--TGAGATATC
gi|80519 : ATAC-AGTTGAAACTGGTTATCTC--GTT--A----T-TGGAGGAGGGA------CTG-CCAGAAA-ATA-------T--CAATATTTCTGTATATT------G-A
gi|80520 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTT--G-AT-A----T-T--catagattttgtct
gi|80521 : ATAC-AGTCGAACCTCGTTATTTTTTA-A--A----T-G--CCACGAGG------CCG-T--AAAA-ATAA----T-A--CGAAATAT-CGAAgttgaatcgatattctggtaatgtcgatattttttgcaagtt
gi|80522 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CCAGATATCCGAATATC------G-At
gi|80523 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGcatagattttgtct
gi|80524 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATAACCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80525 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCATGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATAACCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80526 : TAC-AGTTGAAACTCGTTATTTC--G-A--G----T-T--TCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCTGAAGATC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80527 : TAC-AGTCGATACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AGAA----C-T--GGAGATATCCGAATTTC------G-A
gi|80528 : TAC-AGTCGAAACTCGTATTTTC--G-A--A----T-T--TCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCAGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCTaatagattttgtct
gi|80529 : TAC-AGTTGAAACTCATTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCAAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80530 : TAC-AGTCCAAACTCTTTATTTG--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCCGAAGTTC------G-ATTCAT
gi|80531 : TACTAGTCGAAACTCTTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAAATATCTGAAGTTC------A-ATTTATa
gi|80532 : TAC-AGTCGAAACTCATTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTA-C--CAAA-AAAA----C-T--CGATATATCCGAATAT
gi|80533 : TAC-AGTTTAAACTCGTTATCTC--G-A--T----A-T--ATGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAGATATCCGAATATC------G-Aaaacatatattttgtc
gi|80534 : TAC-AGTCGCAACTCCTTGTTTC--A-A--AATAAT-T-----TGGGA------CCA-C--AAAA-ATAA----T-T--TGAAATATCCGAAATTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80535 : TAC-GGTTGAAACTCGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--TAAGATATCCAAGTATC------A-A
gi|80536 : TAC-AGTCACAACTCTTTGTCTT--G-AT-A----T-T--G-GAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAC----C-T--CGAGATATCCGAATATCAACACAG-ATTTATcatagattttgtct
gi|80537 : TAA-AGTCGAAACTCGTTATCTC--A-AT-A----T-T--GC-TGGAA------TCG-a
gi|80538 : TAC-AGTCACAACTTGGTGTCTC--T-AT-A----T-T--G-GAGGGA------CTG-C--CAAATATA-------T--CGAAATATCCGAATATC------G-A
gi|80539 : TAC-AAACAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCATGGGA------CCT-T--TAAA-AGAA----A-T--CGAAATATCGGAAATTT------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80540 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTCC--G-A--AT---T-T--TCACGGGA------CTA-T--CAAA-CTAA----T-T--CGAATTATCAGTATTTC------A-A
gi|80541 : TAC-AGTTAAAACTC---ATCTC--G-ATAA----T-G----GAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CTGGATATCCGAATATC------G-Aataa
gi|80542 : TAC-AGTTGAAACTCGTTATCTT--G-A--T----A-T--CGGAGGGA------CTG-T---TAT-GTAA----CAT--CGAGGTATCCTTATATC------G-A
gi|80543 : AC-TGTCAAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CAGTAAGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--TGAATTATCAGAA-ATC------GAATTTATaatagattttgtct
gi|80544 : -AATCGAAACTCATTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CAGCC--AAAA-AAAAGCCCC-T--CAAGATATCCAAATATC------G-A
gi|80545 : AAACTCGTTACCTC--G-AT-A----T-T----GGAGGA------CTG-C--CAAA-ACA-----C-T--CGATATATCCGAATATC------G-A
gi|80546 : CTGGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-ACAA----C-T--TAAGATATCCGAATATT------G-Acataggttttgtct
Alignments
lowQualScore : 11 1111
lowQualScore : 0 11 1 33 2222 4 6666 1 222222 99999 0 1 444444 11 0 22 222222 0
lowQualScore : . .. . .. .... . .... . ...... ..... . . ...... .. . .. ...... .
lowQualScore : 7 88 3 44 2222 1 0000 0 000000 11111 7 1 333333 00 7 77 333333 8
consensus : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAATNTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
Reference ( family-434 ) : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAATNTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80486 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CTGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80487 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTT---G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCA-T--AAAA-ATGA----T-T--CGAA-ATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80488 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTACTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80489 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80490 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAG-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80491 : ATAC-AATCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCA-T--AAAA-ATAA----T-T--CAAA-ATATCCGGATTTC------G-ATTTATCAGAAGTCTcaaagatgttgtct
gi|80492 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCT-T--GAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80493 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----A-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------A-ATT
gi|80494 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTA--G-A--A----T-T--CCTTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80495 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCT-T--GAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTAATCAGGAGTCT
gi|80496 : ATAC-AGTCGAACATCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CTGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCTGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80497 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTGCC--AAAA-AAAA----C-T--TGAG-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80498 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGAA------CTGCC--AAAA-ACA-------T--CGAG-ATATCCGAATATC------G-Acatagattttgtct
gi|80499 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAAT---T-T--CGAA-ATATCAAAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80500 : ATAC-AGTCGAAA-TCGTTATTTC--G-AT-A----T-T--G-GAGGGA------ATG-CC-AAAA-ATAA----CCT--CGAA-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80501 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80502 : ATAA-AGTCGAAACTCGTTGTTTC--G-A--A----T-T--CTGTGAGA------CCG-T--AAAA-ACAA----T-T--CGAA-ATATCAAAAATTT------G-ATTTATtatcg
gi|80503 : ATAC-AGTCGAAACTCTTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AGAA----C-T--CGAA-AT
gi|80504 : ATAC-AGTCGAAACACTTTATTTC--G-A--A----T-T--CCTTGGGA------CCA-G--TTAA-ATAA----T-T--TGAA-GTATCCGGATTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80505 : ATAC-AGTTGAAACTTGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGAA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAG-ATTACTGAATATC------G-A
gi|80506 : ATAC-AGTCGAAACTCATTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80507 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATATC--G-AT-A----T-T--CT-AGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CAAG-ATATCC-AATATC------G-Atatcgcttgagccgttattcaggtaatgtcgatat
gi|80508 : ATAC-AGTCGAAACTCATTAACTC--GTT--A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-ACA-------T--TGAG-ATATCCGAATATC------A-Acatagattttgtct
gi|80509 : ATAT-AGTCGAAACTCATTATCAT--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-ACA-------T--CAAG-ATATCAGAATATC------G-A
gi|80510 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CCATGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--TGAATAAACCGGAAT-TC------T-ATTTATCAG
gi|80511 : ATAC-AGTCGAAACTCTTTATCTT--G-AT-A----T-T---GGAAGGG------CTG-CCAAAAA-ATA-------T--TGAG-ATATCAGAAT
gi|80512 : ATAC-AGTTGAAACTCGTTATCTC--G-CT-A----T-T---GGAGGGA------ATG-CCAAAAA-ATA-------T--TGAG-ATATCAAAATATT------G-A
gi|80513 : ATAC-AGTC-AAACTCGTTATTTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-AAAA----A-T--GGAG-ATATTTGAATATC------A-A
gi|80514 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80515 : ATAC-AACCGAAACTCGTTATCAC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAC----T-T--AAGA-ATATCtatcgctcggatcgatattccggttattcgatattt
gi|80516 : ATAC-AGTCGAAACACGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGAATAATGCCA----AAAA-ACA-------T--TGAG-ATATCAAAATATC------G-
gi|80517 : ATAC-AGTCGAAACTCATTATCTCCAT-A--A----T-----AGAGGGA------CTGCC--AAAA-AACA----T-TACCCAA-ATATtcatagattttgtct
gi|80518 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATCT---A-A--A----TAT--TATAGGGA------ATG-C--CAAA-AAAA----TAT--TGAG-ATATC
gi|80519 : ATAC-AGTTGAAACTGGTTATCTC--GTT--A----T-TGGAGGAGGGA------CTG-CCAGAAA-ATA-------T--CAAT-ATTTCTGTATATT------G-A
gi|80520 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTT--G-AT-A----T-T--catagattttgtct
gi|80521 : ATAC-AGTCGAACCTCGTTATTTTTTA-A--A----T-G--CCACGAGG------CCG-T--AAAA-ATAA----T-A--CGAA-ATAT-CGAATgttgaatcgatattctggtaatgtcgatattttttgcaagtt
gi|80522 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CCAG-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80523 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGcatagattttgtct
gi|80524 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATAACCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80525 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCATGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATAACCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80526 : TAC-AGTTGAAACTCGTTATTTC--G-A--G----T-T--TCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCTGAAGATC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80527 : TAC-AGTCGATACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AGAA----C-T--GGAG-ATATCCGAATTTC------G-A
gi|80528 : TAC-AGTCGAAACTCGTATTTTC--G-A--A----T-T--TCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCAGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCTaatagattttgtct
gi|80529 : TAC-AGTTGAAACTCATTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCAAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80530 : TAC-AGTCCAAACTCTTTATTTG--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTCAT
gi|80531 : TACTAGTCGAAACTCTTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCTGAAGTTC------A-ATTTATa
gi|80532 : TAC-AGTCGAAACTCATTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTA-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAT-ATATCCGAATAT
gi|80533 : TAC-AGTTTAAACTCGTTATCTC--G-A--T----A-T--ATGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAG-ATATCCGAATATC------G-Aaaacatatattttgtc
gi|80534 : TAC-AGTCGCAACTCCTTGTTTC--A-A--AATAAT-T-----TGGGA------CCA-C--AAAA-ATAA----T-T--TGAA-ATATCCGAAATTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80535 : TAC-GGTTGAAACTCGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--TAAG-ATATCCAAGTATC------A-A
gi|80536 : TAC-AGTCACAACTCTTTGTCTT--G-AT-A----T-T--G-GAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAC----C-T--CGAG-ATATCCGAATATCAACACAG-ATTTATcatagattttgtct
gi|80537 : TAA-AGTCGAAACTCGTTATCTC--A-AT-A----T-T--GC-TGGAA------TCG-a
gi|80538 : TAC-AGTCACAACTTGGTGTCTC--T-AT-A----T-T--G-GAGGGA------CTG-C--CAAATATA-------T--CGAA-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80539 : TAC-AAACAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCATGGGA------CCT-T--TAAA-AGAA----A-T--CGAA-ATATCGGAAATTT------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80540 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTCC--G-A--AT---T-T--TCACGGGA------CTA-T--CAAA-CTAA----T-T--CGAA-TTATCAGTATTTC------A-A
gi|80541 : TAC-AGTTAAAACTC---ATCTC--G-ATAA----T-G----GAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CTGG-ATATCCGAATATC------G-Aataa
gi|80542 : TAC-AGTTGAAACTCGTTATCTT--G-A--T----A-T--CGGAGGGA------CTG-T---TAT-GTAA----CAT--CGAG-GTATCCTTATATC------G-A
gi|80543 : AC-TGTCAAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CAGTAAGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--TGAA-TTATCAGAA-ATC------GAATTTATaatagattttgtct
gi|80544 : -AATCGAAACTCATTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CAGCC--AAAA-AAAAGCCCC-T--CAAG-ATATCCAAATATC------G-A
gi|80545 : AAACTCGTTACCTC--G-AT-A----T-T----GGAGGA------CTG-C--CAAA-ACA-----C-T--CGAT-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80546 : CTGGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-ACAA----C-T--TAAG-ATATCCGAATATT------G-Acataggttttgtct
Alignments
lowQualScore : 11 1111
lowQualScore : 0 11 1 33 2222 4 6666 1 222222 99999 0 1 444444 11 0 22 222222 0
lowQualScore : . .. . .. .... . .... . ...... ..... . . ...... .. . .. ...... .
lowQualScore : 7 88 3 44 2222 1 0000 0 000000 11111 7 1 333333 00 7 77 333333 8
consensus : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAATNTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
Reference ( family-434 ) : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAATNTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80486 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CTGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80487 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTT---G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCA-T--AAAA-ATGA----T-T--CGAA-ATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80488 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTACTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80489 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80490 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAG-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80491 : ATAC-AATCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCA-T--AAAA-ATAA----T-T--CAAA-ATATCCGGATTTC------G-ATTTATCAGAAGTCTcaaagatgttgtct
gi|80492 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCT-T--GAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80493 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----A-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------A-ATT
gi|80494 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTA--G-A--A----T-T--CCTTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80495 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCT-T--GAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTAATCAGGAGTCT
gi|80496 : ATAC-AGTCGAACATCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CTGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCTGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80497 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTGCC--AAAA-AAAA----C-T--TGAG-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80498 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGAA------CTGCC--AAAA-ACA-------T--CGAG-ATATCCGAATATC------G-Acatagattttgtct
gi|80499 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAAT---T-T--CGAA-ATATCAAAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80500 : ATAC-AGTCGAAA-TCGTTATTTC--G-AT-A----T-T--G-GAGGGA------ATG-CC-AAAA-ATAA----CCT--CGAA-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80501 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80502 : ATAA-AGTCGAAACTCGTTGTTTC--G-A--A----T-T--CTGTGAGA------CCG-T--AAAA-ACAA----T-T--CGAA-ATATCAAAAATTT------G-ATTTATtatcg
gi|80503 : ATAC-AGTCGAAACTCTTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AGAA----C-T--CGAA-AT
gi|80504 : ATAC-AGTCGAAACACTTTATTTC--G-A--A----T-T--CCTTGGGA------CCA-G--TTAA-ATAA----T-T--TGAA-GTATCCGGATTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80505 : ATAC-AGTTGAAACTTGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGAA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAG-ATTACTGAATATC------G-A
gi|80506 : ATAC-AGTCGAAACTCATTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80507 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATATC--G-AT-A----T-T--CT-AGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CAAG-ATATCC-AATATC------G-Atatcgcttgagccgttattcaggtaatgtcgatat
gi|80508 : ATAC-AGTCGAAACTCATTAACTC--GTT--A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-ACA-------T--TGAG-ATATCCGAATATC------A-Acatagattttgtct
gi|80509 : ATAT-AGTCGAAACTCATTATCAT--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-ACA-------T--CAAG-ATATCAGAATATC------G-A
gi|80510 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CCATGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--TGAATAAACCGGAAT-TC------T-ATTTATCAG
gi|80511 : ATAC-AGTCGAAACTCTTTATCTT--G-AT-A----T-T---GGAAGGG------CTG-CCAAAAA-ATA-------T--TGAG-ATATCAGAAT
gi|80512 : ATAC-AGTTGAAACTCGTTATCTC--G-CT-A----T-T---GGAGGGA------ATG-CCAAAAA-ATA-------T--TGAG-ATATCAAAATATT------G-A
gi|80513 : ATAC-AGTC-AAACTCGTTATTTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-AAAA----A-T--GGAG-ATATTTGAATATC------A-A
gi|80514 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80515 : ATAC-AACCGAAACTCGTTATCAC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAC----T-T--AAGA-ATATCtatcgctcggatcgatattccggttattcgatattt
gi|80516 : ATAC-AGTCGAAACACGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGAATAATGCCA----AAAA-ACA-------T--TGAG-ATATCAAAATATC------G-
gi|80517 : ATAC-AGTCGAAACTCATTATCTCCAT-A--A----T-----AGAGGGA------CTGCC--AAAA-AACA----T-TACCCAA-ATATtcatagattttgtct
gi|80518 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATCT---A-A--A----TAT--TATAGGGA------ATG-C--CAAA-AAAA----TAT--TGAG-ATATC
gi|80519 : ATAC-AGTTGAAACTGGTTATCTC--GTT--A----T-TGGAGGAGGGA------CTG-CCAGAAA-ATA-------T--CAAT-ATTTCTGTATATT------G-A
gi|80520 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTT--G-AT-A----T-T--catagattttgtct
gi|80521 : ATAC-AGTCGAACCTCGTTATTTTTTA-A--A----T-G--CCACGAGG------CCG-T--AAAA-ATAA----T-A--CGAA-ATAT-CGAATgttgaatcgatattctggtaatgtcgatattttttgcaagtt
gi|80522 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CCAG-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80523 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGcatagattttgtct
gi|80524 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATAACCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80525 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCATGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATAACCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80526 : TAC-AGTTGAAACTCGTTATTTC--G-A--G----T-T--TCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCTGAAGATC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80527 : TAC-AGTCGATACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AGAA----C-T--GGAG-ATATCCGAATTTC------G-A
gi|80528 : TAC-AGTCGAAACTCGTATTTTC--G-A--A----T-T--TCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCAGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCTaatagattttgtct
gi|80529 : TAC-AGTTGAAACTCATTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCAAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80530 : TAC-AGTCCAAACTCTTTATTTG--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTCAT
gi|80531 : TACTAGTCGAAACTCTTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCTGAAGTTC------A-ATTTATa
gi|80532 : TAC-AGTCGAAACTCATTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTA-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAT-ATATCCGAATAT
gi|80533 : TAC-AGTTTAAACTCGTTATCTC--G-A--T----A-T--ATGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAG-ATATCCGAATATC------G-Aaaacatatattttgtc
gi|80534 : TAC-AGTCGCAACTCCTTGTTTC--A-A--AATAAT-T-----TGGGA------CCA-C--AAAA-ATAA----T-T--TGAA-ATATCCGAAATTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80535 : TAC-GGTTGAAACTCGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--TAAG-ATATCCAAGTATC------A-A
gi|80536 : TAC-AGTCACAACTCTTTGTCTT--G-AT-A----T-T--G-GAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAC----C-T--CGAG-ATATCCGAATATCAACACAG-ATTTATcatagattttgtct
gi|80537 : TAA-AGTCGAAACTCGTTATCTC--A-AT-A----T-T--GC-TGGAA------TCG-a
gi|80538 : TAC-AGTCACAACTTGGTGTCTC--T-AT-A----T-T--G-GAGGGA------CTG-C--CAAATATA-------T--CGAA-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80539 : TAC-AAACAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCATGGGA------CCT-T--TAAA-AGAA----A-T--CGAA-ATATCGGAAATTT------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80540 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTCC--G-A--AT---T-T--TCACGGGA------CTA-T--CAAA-CTAA----T-T--CGAA-TTATCAGTATTTC------A-A
gi|80541 : TAC-AGTTAAAACTC---ATCTC--G-ATAA----T-G----GAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CTGG-ATATCCGAATATC------G-Aataa
gi|80542 : TAC-AGTTGAAACTCGTTATCTT--G-A--T----A-T--CGGAGGGA------CTG-T---TAT-GTAA----CAT--CGAG-GTATCCTTATATC------G-A
gi|80543 : AC-TGTCAAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CAGTAAGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--TGAA-TTATCAGAA-ATC------GAATTTATaatagattttgtct
gi|80544 : -AATCGAAACTCATTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CAGCC--AAAA-AAAAGCCCC-T--CAAG-ATATCCAAATATC------G-A
gi|80545 : AAACTCGTTACCTC--G-AT-A----T-T----GGAGGA------CTG-C--CAAA-ACA-----C-T--CGAT-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80546 : CTGGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-ACAA----C-T--TAAG-ATATCCGAATATT------G-Acataggttttgtct
blockSeqs : CA T TA ATAA A GGAG T ATAATG CCAA T GCCCC CT AACACA
blockSeqs : TT T T T A CC T . CCAA T TT CT .
blockSeqs : . . T . A CC T . CCAA T CC GT .
blockSeqs : . . T . A CC A . CCAA A TA TA .
blockSeqs : . . T . A CC T . CCAA T CA TT .
blockSeqs : . . T . A CC T . CCAG T T GT .
blockSeqs : . . T . . CC T . CCA T T GT .
blockSeqs : . . T . . CC T . CCA T T GT .
blockSeqs : . . T . . CC T . CCA T C GT .
blockSeqs : . . T . . CT T . CCA T T CT .
blockSeqs : . . T . . CC A . CCA A T TA .
blockSeqs : . . T . . CT A . TA C T TA .
blockSeqs : . . T . . CC T . TA T T GT .
blockSeqs : . . T . . CT A . TA T T TA .
blockSeqs : . . T . . CC T . CC C T AT .
blockSeqs : . . T . . TG A . TA G C TT .
blockSeqs : . . T . . TG T . TG T T TA .
blockSeqs : . . T . . TA A . TA A C TA .
blockSeqs : . . T . . CC A . TA A T TA .
blockSeqs : . . T . . TG A . TG C C TA .
blockSeqs : . . . . . CC A . TA C C TA .
blockSeqs : . . . . . CC T . TA T T TA .
blockSeqs : . . . . . CC A . TA T A TA .
blockSeqs : . . . . . TC A . CC T T TA .
blockSeqs : . . . . . TC A . GT A T TA .
blockSeqs : . . . . . CC A . CC A T GT .
blockSeqs : . . . . . CC A . CC C C GT .
blockSeqs : . . . . . CC A . TA A T GT .
blockSeqs : . . . . . TG A . CC A T GA .
blockSeqs : . . . . . AT A . CC T T TT .
blockSeqs : . . . . . TG C . TA T T CT .
blockSeqs : . . . . . GC A . CC A C GT .
blockSeqs : . . . . . CC T . TA T T GT .
blockSeqs : . . . . . TC T . TA T T GT .
blockSeqs : . . . . . CG T . TA T T TA .
blockSeqs : . . . . . CA T . TA T T TA .
blockSeqs : . . . . . G A . CC G C AT .
blockSeqs : . . . . . G T . TA T C TA .
blockSeqs : . . . . . G T . TA T T TA .
blockSeqs : . . . . . G T . TA T C TA .
blockSeqs : . . . . . G T . TA T C AT .
blockSeqs : . . . . . G A . CC A A TT .
blockSeqs : . . . . . G A . CC A T TA .
blockSeqs : . . . . . G T . CA T C TA .
blockSeqs : . . . . . G A . CC A T TA .
blockSeqs : . . . . . G A . CC A C TA .
blockSeqs : . . . . . G T . CC T C TA .
blockSeqs : . . . . . A A . TT G . T .
blockSeqs : . . . . . G T . TC T . A
blockSeqs : . . . . . G C . CC A .
blockSeqs : . . . . . G A . TA T .
blockSeqs : . . . . . G A . CC T .
blockSeqs : . . . . . G T . CC A .
blockSeqs : . . . . . . A . A C .
blockSeqs : . . . . . . G . T C .
blockSeqs : . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAATNTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
finalCons : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAATNTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
Alignments
lowQualScore : 11 1111
lowQualScore : 0 11 1 33 2222 4 6666 1 222222 99999 0 1 444444 11 0 22 222222 0
lowQualScore : . .. . .. .... . .... . ...... ..... . . ...... .. . .. ...... .
lowQualScore : 7 88 3 44 2222 1 0000 0 000000 11111 7 1 333333 00 7 77 333333 8
consensus : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAATNTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
Reference ( family-434 ) : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--A----T-T--CCGNGGGA------CCG-C--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAATNTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80486 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CTGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80487 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTT---G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCA-T--AAAA-ATGA----T-T--CGAA-ATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80488 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTACTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80489 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80490 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAG-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80491 : ATAC-AATCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCA-T--AAAA-ATAA----T-T--CAAA-ATATCCGGATTTC------G-ATTTATCAGAAGTCTcaaagatgttgtct
gi|80492 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCT-T--GAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80493 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----A-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------A-ATT
gi|80494 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTA--G-A--A----T-T--CCTTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80495 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCT-T--GAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTAATCAGGAGTCT
gi|80496 : ATAC-AGTCGAACATCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CTGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCTGGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80497 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTGCC--AAAA-AAAA----C-T--TGAG-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80498 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGAA------CTGCC--AAAA-ACA-------T--CGAG-ATATCCGAATATC------G-Acatagattttgtct
gi|80499 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAAT---T-T--CGAA-ATATCAAAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80500 : ATAC-AGTCGAAA-TCGTTATTTC--G-AT-A----T-T--G-GAGGGA------ATG-CC-AAAA-ATAA----CCT--CGAA-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80501 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80502 : ATAA-AGTCGAAACTCGTTGTTTC--G-A--A----T-T--CTGTGAGA------CCG-T--AAAA-ACAA----T-T--CGAA-ATATCAAAAATTT------G-ATTTATtatcg
gi|80503 : ATAC-AGTCGAAACTCTTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AGAA----C-T--CGAA-AT
gi|80504 : ATAC-AGTCGAAACACTTTATTTC--G-A--A----T-T--CCTTGGGA------CCA-G--TTAA-ATAA----T-T--TGAA-GTATCCGGATTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80505 : ATAC-AGTTGAAACTTGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGAA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAG-ATTACTGAATATC------G-A
gi|80506 : ATAC-AGTCGAAACTCATTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80507 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATATC--G-AT-A----T-T--CT-AGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CAAG-ATATCC-AATATC------G-Atatcgcttgagccgttattcaggtaatgtcgatat
gi|80508 : ATAC-AGTCGAAACTCATTAACTC--GTT--A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-ACA-------T--TGAG-ATATCCGAATATC------A-Acatagattttgtct
gi|80509 : ATAT-AGTCGAAACTCATTATCAT--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-ACA-------T--CAAG-ATATCAGAATATC------G-A
gi|80510 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CCATGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--TGAATAAACCGGAAT-TC------T-ATTTATCAG
gi|80511 : ATAC-AGTCGAAACTCTTTATCTT--G-AT-A----T-T---GGAAGGG------CTG-CCAAAAA-ATA-------T--TGAG-ATATCAGAAT
gi|80512 : ATAC-AGTTGAAACTCGTTATCTC--G-CT-A----T-T---GGAGGGA------ATG-CCAAAAA-ATA-------T--TGAG-ATATCAAAATATT------G-A
gi|80513 : ATAC-AGTC-AAACTCGTTATTTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-CCAAAAA-AAAA----A-T--GGAG-ATATTTGAATATC------A-A
gi|80514 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC--G-A--catagattttgtct
gi|80515 : ATAC-AACCGAAACTCGTTATCAC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAC----T-T--AAGA-ATATCtatcgctcggatcgatattccggttattcgatattt
gi|80516 : ATAC-AGTCGAAACACGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGAATAATGCCA----AAAA-ACA-------T--TGAG-ATATCAAAATATC------G-
gi|80517 : ATAC-AGTCGAAACTCATTATCTCCAT-A--A----T-----AGAGGGA------CTGCC--AAAA-AACA----T-TACCCAA-ATATtcatagattttgtct
gi|80518 : ATAC-AGTCAAAACTCGTTATCT---A-A--A----TAT--TATAGGGA------ATG-C--CAAA-AAAA----TAT--TGAG-ATATC
gi|80519 : ATAC-AGTTGAAACTGGTTATCTC--GTT--A----T-TGGAGGAGGGA------CTG-CCAGAAA-ATA-------T--CAAT-ATTTCTGTATATT------G-A
gi|80520 : ATAC-AGTCGAAACTCGTTATCTT--G-AT-A----T-T--catagattttgtct
gi|80521 : ATAC-AGTCGAACCTCGTTATTTTTTA-A--A----T-G--CCACGAGG------CCG-T--AAAA-ATAA----T-A--CGAA-ATAT-CGAATgttgaatcgatattctggtaatgtcgatattttttgcaagtt
gi|80522 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CCAG-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80523 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTTATCAGcatagattttgtct
gi|80524 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATAACCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80525 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCATGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATAACCGAAGTTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80526 : TAC-AGTTGAAACTCGTTATTTC--G-A--G----T-T--TCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCTGAAGATC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80527 : TAC-AGTCGATACTCGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-AGAA----C-T--GGAG-ATATCCGAATTTC------G-A
gi|80528 : TAC-AGTCGAAACTCGTATTTTC--G-A--A----T-T--TCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCAGACTTC------G-ATTTATCAGGAGTCTaatagattttgtct
gi|80529 : TAC-AGTTGAAACTCATTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCAAAGTTT------G-ATTTATCAG
gi|80530 : TAC-AGTCCAAACTCTTTATTTG--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCCGAAGTTC------G-ATTCAT
gi|80531 : TACTAGTCGAAACTCTTTATTTC--G-A--A----T-T--CCGTGGGA------CCG-T--AAAA-ATAA----T-T--CGAA-ATATCTGAAGTTC------A-ATTTATa
gi|80532 : TAC-AGTCGAAACTCATTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTA-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAT-ATATCCGAATAT
gi|80533 : TAC-AGTTTAAACTCGTTATCTC--G-A--T----A-T--ATGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CGAG-ATATCCGAATATC------G-Aaaacatatattttgtc
gi|80534 : TAC-AGTCGCAACTCCTTGTTTC--A-A--AATAAT-T-----TGGGA------CCA-C--AAAA-ATAA----T-T--TGAA-ATATCCGAAATTC------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80535 : TAC-GGTTGAAACTCGTTATCTC----A--A----TAT--TGGAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--TAAG-ATATCCAAGTATC------A-A
gi|80536 : TAC-AGTCACAACTCTTTGTCTT--G-AT-A----T-T--G-GAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAC----C-T--CGAG-ATATCCGAATATCAACACAG-ATTTATcatagattttgtct
gi|80537 : TAA-AGTCGAAACTCGTTATCTC--A-AT-A----T-T--GC-TGGAA------TCG-a
gi|80538 : TAC-AGTCACAACTTGGTGTCTC--T-AT-A----T-T--G-GAGGGA------CTG-C--CAAATATA-------T--CGAA-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80539 : TAC-AAACAAAACTCGTTATTTC--G-A--A----T-T--CCATGGGA------CCT-T--TAAA-AGAA----A-T--CGAA-ATATCGGAAATTT------G-ATTTATCAGGAGTCT
gi|80540 : TAC-AGTCGAAACTCGTTATTCC--G-A--AT---T-T--TCACGGGA------CTA-T--CAAA-CTAA----T-T--CGAA-TTATCAGTATTTC------A-A
gi|80541 : TAC-AGTTAAAACTC---ATCTC--G-ATAA----T-G----GAGGGA------CTG-C--CAAA-AAAA----C-T--CTGG-ATATCCGAATATC------G-Aataa
gi|80542 : TAC-AGTTGAAACTCGTTATCTT--G-A--T----A-T--CGGAGGGA------CTG-T---TAT-GTAA----CAT--CGAG-GTATCCTTATATC------G-A
gi|80543 : AC-TGTCAAAACTCGTTATTTC--A-A--A----T-T--CAGTAAGA------CTG-T--AAAA-ATAA----T-T--TGAA-TTATCAGAA-ATC------GAATTTATaatagattttgtct
gi|80544 : -AATCGAAACTCATTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CAGCC--AAAA-AAAAGCCCC-T--CAAG-ATATCCAAATATC------G-A
gi|80545 : AAACTCGTTACCTC--G-AT-A----T-T----GGAGGA------CTG-C--CAAA-ACA-----C-T--CGAT-ATATCCGAATATC------G-A
gi|80546 : CTGGTTATCTC--G-AT-A----T-T---GGAGGGA------CTG-C--CAAA-ACAA----C-T--TAAG-ATATCCGAATATT------G-Acataggttttgtct