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gi|44715                      :                                                                                                                     TAGTTTAAATA--TGTTTTATTCA-----C-A-AAT---A--GTA-TACAATT-A-CAT----T-----GA-----A-CACCTC--------A---CATATT---A----G-------T--------A-A-------A--------------------CACATG--T--G---TAT-AC------------CAT--GATGAA--A--GG-GG---TTCCA--CAGAAA--------CC--TTA--C-AGCTTG-GT----GAATGT-G-TCTCT--CTAA-T-GT-TATTcaaa
gi|44716                      :                                                                                                                     TAGTTTAAACA-TTATATTATTCAGAAGTC-G-TA--------TA-CAAT--T-A-CAT----T-----GAAAAACG-C-----------------CAG-TTACCA----A-------T--------T-A-------A-C--------------A---CATTCG--A--G---T---AC---AAT------TA-----TGAA--A--GG-GATTTT---A--CAG---AA---AG-CT--T----A-AGCTTTTGT----GAATCT-GTCCTCC---TAA-agat
gi|44718                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AAT------CAT--G----A--A--AG-GTGT-T---A---AGAAGAA---AG-CT--T---GT-AGCGTTTGT----GAATCT-C-TCTCC--GTAA-aatcgataaatta
gi|44723                      : tagcttagatatattttattcacaaattgtatacagttacaatggaaaatatcacaatgtcatattaattaacacatgcgtatacaattaccagtgactaaataacgggatactgcTAGTTTAAACA-ATATTTTATTCA-----C-A-TA----A--GTA-CA----T-A-TAT----T-----TG-----G-CA---T--------A---CAT-TTAACA----A-------T--------A-ACGCATAAA-G--------------T---CATACG--T--T---TA--AC--GAAT------TGT--G-TGGA--A--AG-GA---T---A--CAGAAAAA---AG-CT--TTA-GA-AGCTTGTGT----AAATCT-G-CTTCC--ATAA-aatagattgaataaacat
gi|44724                      :                                                                                                                     TAGTTTAAACA-ATATTTTATTCA-----C-A-TC----A--GTA-CA----T-A-TAC----T-----TA-----G-CA---T--------A---CAT-TTAACA----A-------T--------A-A-------A-GCATAAAG-------T---CATTCG--T--T---TA--AC--AAGT------TAT--G-TGGA--A--AG-GA---T---A--CAGAAAAA---AG-CT--TTA-AA-AGCTTGTGT----AAATCT-G-TTTCC--
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gi|44730                      :                                                                                                                     TAGTTTAAACA-GTATTGTATTCA-----T-T-CA----A--ATA-CA----T-A-TA---------------------A---T--------A-------TTATCA----A-------T--------A--------------------------T---CACAA----------TA--ACAAGAGTACA---CAT----TGAA--A--GG-GA---T---G--CAAAAGTA---AG--T--CTATGA---CTTTTTTTTTAGAATCT-G-TGTCC--
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blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . A  ACT          CAAT   .   A    .      A        .   A        .     .  A   .    .       GAAGCAATAAAG                        .        .  TCG     T   C     ACA      .  T    .  .      .   T             .       .  TA             .         . T     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . A  ACT          CAAT   .   .    .      A        .   A        .     .  G   .    .       AACGCATAAAG                         .        .  G       T   G     .        .  T    .  .      .   T             .       .  TA             .         . T     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                G            .     . A  ACT          CAAT   .   .    .      A        .   .        .     .  A   .    .       AAAGCATAAAG                         .        .  G       T   A     .        .  T    .  .      .   T             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . A  ATT          TAG    .   .    .      A        .   .        .     .  A   .    .       AAAGCATACAG                         .        .  G       .   G     .        .  T    .  .      .   T             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  TA           AT     .   .    .      A        .   .        .     .  A   .    .       AAAGCATAAAG                         .        .  G       .   A     .        .  T    .  .      .   T             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  TA           .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAGCATTAAG                         .        .  G       .   A     .        .  T    .  .      .   T             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                G            .     . T  TA           .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAGCATAAAG                         .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TT             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  TA           .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       TAAGCATAAAG                         .        .  G       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  TA           .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       TCATAAAAG                           .        .  G       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                G            .     . T  AA           .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       ATTAG                               .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                G            .     . T  TA           .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAATG                               .        .  T       .   A     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       TAGT                                .        .  T       .   A     .        .  T    .  .      .   C             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . C  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       TAAC                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   C             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  T   .    .       ATAA                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       ATAA                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   G             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . G  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  C       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       ATAG                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   T             .       .  TG             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TT             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AGAG                                .        .  T       .   A     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                C            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TT             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                G            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   A     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                T            .     . T  A            .      .   .    .      A        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   T     .        .  T    .  .      .   A             .       .  GA             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   A     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AATC                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  AA             .         . .     .     .     
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . G  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       AAAG                                .        .  T       .   T     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .           
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . A  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       CAAT                                .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   A             .       .  TA             .         . .     .           
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      G        .   .        .     .  A   .    .       TAA                                 .        .  C       .   C     .        .  T    .  .      .   A             .       .  AT             .         . .     .           
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  A            .      .   .    .      T        .   .        .     .  G   .    .       TAA                                 .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   T             .       .  TA             .         . .     .           
blockSeqs                     :                                                                                                                                C            .     . T  A            .      .   .    .      T        .   .        .     .  .   .    .       AAA                                 .        .  C       .   C     .        .  T    .  .      .   G             .       .  T              .         . .     .           
blockSeqs                     :                                                                                                                                A            .     . T  C            .      .   .    .      A        .   .        .     .  .   .    .       ACA                                 .        .  T       .   G     .        .  T    .  .      .   T             .       .  T              .         . .     .           
blockSeqs                     :                                                                                                                                .            .     . C  T            .      .   .    .      T        .   .        .     .  .   .    .       ATA                                 .        .  C       .   .     .        .  T    .  .      .   A             .       .  T              .         . .     .           
blockSeqs                     :                                                                                                                                .            .     . T  A            .      .   .    .      .        .   .        .     .  .   .    .       AA                                  .        .  C       .   .     .        .  T    .  .      .   A             .       .  T              .         . .     .           
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8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-428 )      :                                                                                                                     TAGTTTAAACA-ATATTTTATTCA-----C-A-TA----A--GTA-CA----T-A-TAT----T-----TA-----G-CA---T--------A---CAT-TTAACA----A-------T--------A-A-------A-G--------------T---CATACG--T--T---TA--AC--GAAT------TAT--G-TGGA--A--AG-GA---T---A--CAGAAAAA---AG-CT--TTA-GA-AGCTTGTGT----GAATCT-G-CTTCC--ATAA-CAGT-TATT
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