lowQualScore : 11111111111111
lowQualScore : 0 0 0 11 77 0 1 55555555555555 33333 1 3333333 2222222 33333 5555555 222 2 4 222 333333 0 0 1 1 22 7
lowQualScore : . . . .. .. . . .............. ..... . ....... ....... ..... ....... ... . . ... ...... . . . . .. .
lowQualScore : 8 6 6 88 88 7 9 99999999999999 55555 3 3333333 9999999 11111 8888888 111 8 4 666 222222 8 8 0 0 44 2
consensus : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TTTGCCGCTT-C-CG-----------G-----C-CGAC-------C-------C-----A------AAACAAT---C-CCG-CCG-GTC--AG-GAAA-A-AT-T-TT--TGGGGTGT
Reference ( gi|157978 ) : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-CTTGCCGCTT-C-TT-----------G-----C-CGAC-------C-------C-----A------AAACAAT---C-CCG-CTG-GTC--AG-GAAA-A-AT-T-TT--TGAGGTGT
gi|157982 : GGT-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TTTGCCACTT-C-CA-----------G-----C-CGAC-------C-------C-----A------AAACAAT---C-CTG-CTG-GTCAAAA-AAAA-A-AT-T-TT--T
gi|157984 : GGC-CTGAATTAAAATAT-TA-TTT--G-TTTGCCGCTT-T-CA-----------G-----C-CGAC-------C-------C------------AAACAAT---C-CTG-CCG-GTC--AT-GAAA-A-GT-T-TT--t
gi|157979 : GGC-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--GGTTTGCCGCTT-T-CC-----------G-----C-CGAC-------C-------C-----A------AAACAAT---C-CTG-GCG-GTC--AG-GAAC-A-TT-T-TT--Tgcggg
gi|157991 : GGC-TTAAATTAAAATAT-TG-TTT--A-TTTGCTGCTT-C-TG-----------G-----C-TGAC-------C-------C-----A------CAACAAT---C-CTG-ACA-GTT--AT-GAAA-A-AT-T-TT--AGGGGT
gi|157983 : GGC-CTAAACTAAAAAAT-TG-TTT--G-TTTGCTGCTT-C-CG-----------G-----C-TGAC-------C-------C-----A------AAACAAT---C-CCACCTGAGAC--AG-GAAC-A-TT-T-TT--TGGGGGGT
gi|157989 : GGC-CTAAAATTAAATAT-TG-TTT--G-TTTGCTGCTT-C-CG-----------G-----T-TGAC-------A-------C-----A------AAACAAT---C-CTG-CTG-GTT--GG-GAAATA-AT-T-TTA-TGGGGT
gi|157985 : GGC-CCAAATTATAATAT-TG-TTT--G-TTTGCTGCTT-C-CG-----------G-----C-CAAC-------C-------CAA---A------AAACAAT---C-CCG-CCA-GTC--AG-GAAA-A-
gi|157988 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TCTGCCGCTT-C-TG-----------G-----C-TGAT-------C-------CA----A------AAACAAT---C-CTG-CCA-GTA--GG-GAAA-A-tgttcatggg
gi|157980 : GGC-CTAAATTAAAGAAT-TG-TTT--G-TTTGTCGCTT-C-CG-----------G-----T-CAAC-------C-------C-----A------AAACGAT---T-ATG-CCA-GTC--AG-CAAA-A-TT-T-TT--TCAGGTGT
gi|157999 : GGC-TTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TTTG--------------------------------AC-------C-------C-----A------AAACAAT---C-CCA-CTG-GTC--AT-GAAA-A-AT-T-TT--TTGGGTGT
gi|157986 : GGC-CAAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TTGGCCACTT-C-CA-----------G-----C-TGAC-------C-------T-----A------AAACAAT---C-CTG-CCG-GTC--AG-G------AT-T-TT--T
gi|158000 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTA--G-TTTGCTGTTT-C-TG-----------G-----C-TGAC-------C-------A-----A------CAATAAT---C-TCA-CTG-GTC--AG-GAAA-tt
gi|157981 : GGC-CTAAATTAAAAAAA-TG-TTT--G-TTTGCCTCTT-C-CG-----------A-----C-CGAC-------C-------C-----A------AAACAAT---C-CGG-CCG-TTC--AG-GATA-T-TT-T-TT--TG-GATGT
gi|157990 : GGC-CAAAATTGAAATAT-TA-TTT--G-TTTGCCACTT-C-CG-----------G-----C-CGAC-------C-------C-----A------CAACAAC---C-CCC-CCA-TTC--AG-GAAA-ATAT-T-TT--
gi|157998 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TTGGCTGCTT-C-CG-----------G-----C-CGACG------CAAAACAAC-----A------AAACAAT---C-TCA-TCA-GTT--GG-GAAA-A-AT-A-TT--TGGGGgtggat
gi|157987 : GGC-CTTAATTTAGTTAT-TG-TTT--G-TTTGCTGCTT-C-CG-----------G-----G-CGAC-------C-------C-----A------AAACAAT---C-CTG-CTG-ATC--AG-G----A-AT-T-TT--T
gi|157992 : GGA-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TTTGCCACTC-C-CA-----------G-----C-CGAC-------C-------C-----A------CAACGAA---C-TTG-CCT-GTC--AG-TAAA-A-TT-G-TTGGTGGGGTGttttggtgt
gi|157994 : GGC-CTTAATTAAAATAT-TG-TTT--A-TTTGCCACTT-C-AG-----------G-----C-CGAC-------C-------C-----A------CTACAAT---C-TCG-CCA-GTC--A--GAAT-T-GT-T-TT--TG
gi|157993 : GGC-TTAATTTAAACTAT-TG-TTT--G-TTTGTCACTT-C-TG-----------G-----C-CATC-------A-------C-----T------AAACAAT---C-CTA-CCT-GTC--GG-GAAA-A-TA-T-TT--TGGGGTGT
gi|157995 : GGC-TTAAATTAAAATAT-AG-TTT--G-TTTGTCGCTT-C-TA-----------G-----C-TGAC-------C-------C-----A------GAACAAT---C-GTA-CCA-GTC--AG-
gi|157996 : GAC-CTAAATTAAAATAC-TG-TTT--G--TTAGCGCTT-C-CG-----------G-----T-CAAC-------C-------C-----A------AAGTAAT---C-CCG-CTG-GTT--GG------A-AT-T-TT--Tagtttattatttttggtgt
gi|158002 : GAC-CTAAATTAAAATAG-TG-TTT--C-TTTGCTGCTT-A-CT-----------G-----C-GGAC-------C-------A-----G------TAACAAT---C-CCG-TCG-GTT--AG---AA-A-AT-TGTT--TGGGGttg
gi|158001 : GGT-CTAAATTAAAACAT-TG-TTT--G-TTTGCCACTT-T-TG-----------G-----C-CTAC-------A-------T-----A------AAACAAT---C-CC----------------AA-A-AT-T-TT--TGTGGAGT
gi|158007 : GGC-CGAAGTTAAAATAT-TG-TTT--G-TTTGCCGCTT-C-TG-----------G-----C---AC-----------------------------AACAAT---C-CCA-ACG-GTT--AT-GAAA-T-AT-T-Tg
gi|158008 : GGC-TTAAATTACAAAAT-TGTTTT--G-TTTGC--CTT-T-TT-----------C-----C-TGAC-------C-------
gi|158004 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TTTGCCACTT-C-AG-----------A-----T-TGAC-------C-------A-----A------CAACCAT---C-TC----G-GTC-------AA-C-TT-T-TT--TGAggcgggattgtttttgttggccagaggcggccaacaaaaacaatcccgccggtcaggaaaaagtttttaggtg
gi|157997 : GGC-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G--TTG----------------------A-----C-CAAC-------C-------CTGGTGA------AAACAAT---T-CCT-CTG-GTC--GG-GGAA-A-TT-T-TT--T
gi|158005 : GGC-CTAAATTAAAATGT-TG-T-------TTGCAGCTT-C-CG-----------G-----C-CAAC-------C-------C-----A------AAACAAT---t
gi|158009 : GAC-CTAAATTAAAATAA-TG-CTT--G-TTTGCCGCAT-C-TG-----------T-----C-CAAA-------C-------C-----A------CAATAAT---C-CAG-CCA-GTC--TG-AAA
gi|158003 : GGC-CAAAATTAAAATAT-T--TTT--G-TATGCTGCTT-C-TG-----------G-----C-CAGC-------C-------A-----A------CAACAAT---C-TTG-TAG-ATC--AG------A-AT-T-TT--Tctgtgtttg
gi|158017 : GGC-ATAAATTAAATTAT-TG-TTT--G-TTTGCCGCTA-C-TA-----------G-----C-TGACT------C-------C-----A------AAACttttgtgt
gi|158006 : GGC-CTTTATTAAAATAG-AG-TTT--G-TTTGCCACTT-C-CG-----------G-----C-CAAC-------C-------C-----A------AAACAAT---
gi|158011 : GGA-CTTAATTAAAGCAT-TG-TTT--G-TTTGCTGCTT-C-TG-----------G-----C-CGAC-------A-------T-----A------CAACAATTA-C-CCC-C---ATC--AG-AAA
gi|158012 : GGC-CTAATTTAAAATAT-TG-TT----------------C-TG-----------G-----C-CGAC-------A-------C-----A------AAACAAT---C-CTG-GCA-GGC--GG-AAAC-A-AT-T-TT--T
gi|158020 : GGC-CTAATATAAAATAT-TG-TTT--G-CTTGACACTT-C-AG-----------A-----C-CGAC-------C-------C-----A------CAACtt
gi|158010 : GGC-CTGAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TTT-CCCCTTGC-TT-----------GA----C-CGAC-------CAA-----C-----G------AAAAAAG---CACCGACT----------GAAA-A-CT-T-TT--T
gi|158013 : GGCACTAAATTAAAATAG-TG-TTT--G-TTTGCCACTT-C-CA-----------G-----C-TGAC-------C-------C-----tggg
gi|158014 : GGC-CCAAGTTAAAATAT-TT-TTT--G-TTTGTTTCTT-C-CA-----------G-----C-TGAC-------C-------C-----A------CAACAGT---C-
gi|158015 : GGC-CAAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TTT-CCGCTTGC-GC-----------GA----C-CGAC-------C-------C-----ACG----AAAAAAG---CACCGACTG------------A-A-AT-T-TT--Tatactatcgggtca
gi|158018 : GGC-CTAAATAAAAATAG-TG-TTT--G-TTTACC-----C-TT-----------GCGCGAC-CGAC-------C-------C-----ACG----AAAAAAG---CACCGACTG-G---------AA-A-AT-T-TC--Tttt
gi|158016 : GGC-CTAAATAAAAATAG-TG-TTT--G-TTT-CCACTTGC-GC-----------GA----C-CGAC-------C-------C-----ACG----AAAAAAG---CACCGACT--------G-AAAA-A-AT-T-TT--
gi|158021 : GGC-CCAAATTAGAATAT-TG-TTT--G-TTTCCC-----C-TT-----------G-----TGCGAC-------C-------C-----ACCTACGAAAAAGT---A-CCGACT--------A-AAAA-A-AT-T-TT--attggg
gi|158019 : GGC-ATAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TTTCCC-----C-TT-----------G-----CACAACTGAGCCAC-------C-----A------AAAAAG-------CA-CTG-ACT-----GAAA-A-AT-T-TT--atttgg
gi|158022 : GC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-ATTGCCACTT-C-TG-----------G-----G-CAAC-------T-------C-----A------AAATAAT---C-CCA-CTA-GCC--GG-GAAA-G-TT-T-TT--Tattggg
gi|158023 : GT-CTAAATTAAAACAT-TG-TTT--G-TTTGTCGCTT-C-TG-----------A-----C-CAAC-------C-------C-----G------CACCAAT---C-CTG-CGA-GTC--AG----A-A-AT-T-TT--Ttg
gi|158025 : GC-CTAAGTTACTATAT-TG-TTT--G-TTTGCCACTT-T-GG-----------G-----C-CAA--------C-------C-----A------A---AAT---C-TTG-CCG-GTC--AG-AAAA-A-
gi|158024 : GC-TTAGATTGAAATAT-TG-TTT--G-TTTGCTGCTC-C-AG-----------G-----C-CAAC-------C-------C-----A------CACCAAT-----CTG-TCG-ATC--AG-AAA
gi|158026 : GC-CTAAATTA-----T-TG-TTT--G-TTTGTTGCTT-C-TTTGTTGCTTCCGA-----C-TGAC-------C-------C-----A------CAACAAT---A-CCA-CTG-GTC--AG-AAActtctattg
gi|158027 : GC-TTAAATTATAAT---TG-TTT--G-TTTACCGCTT-C-CA-----------G-----A-CGA--------C-------C-----A------CAACAA-------CG-CTG-CTC------ACA-A-AC-T-TT--Tccttttcg
gi|158028 : -CTACATTAAAAT---TG-TTT--G-TTTGCAGCTT-C-TG-----------T-----C-TGAC-------C-------T-----A------AAACAAT---C-CCG-CTG-GTC--GA-GAAA-A-
gi|158030 : -CCAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TTTGTCGCTT-C-TA-----------G-----C-CGAC-------C-------C-----CT-----CAACAGT---C-CCA-TCT-GTC--A
gi|158029 : -CTAAATTAAAATAC-TG-TTT--G-TTTGCCATTT-C-CG-----------G-----C-CAAC-------T-------C-----A------CGACAATTCCT-CCT-CCA-GTC--AG-CAAC-A-TT-T-TT--T
gi|158031 : -CTGAAATAAAATAT-TG-TTT--G-TTTACCACTT-T-CA-----------A-----C-TGAC-------C-------C-----A------TAACAAT---C-
gi|158032 : TAAATTAAAATAT-TA-TTT--G-TTTGCCACTT-C-TG-----------G-----C-CAAC-------C-------C-----A------CAACAAT---C-CTT-CT----------GAAA-T-AT-T-TT--Tatgc
gi|158033 : TAAATTAAAATAT-AA-TTT--G-TTTGCCACTT-C-TG-----------G-----C-CAAC-------C-------C-----A------CAACt
gi|158034 : AAATTCAAATAT-TG-TTT--G-TTCCCCACTT-C-TG-----------A-----C-CGAC-------C-------C-----A------AAATAAT---C-TTG-CCA-GTT-----GAAA-A-A
gi|158035 : AATTAAAATGGGTG-TTT--G-CTTGTTGTTT-C-CG-----------G-----C-TGAC-------C-------T-----G------CAACGAT---C-CTG-TTG-GGT--AG------A-AT-T-TT--Ta
gi|158036 : TCAAAATAT-TG-TTT--G-TCTGCCGCTT-C-CG-----------G-----C-TGAC-------C-------C-----A------AAACATT---T-CCA-TTG------AA-AAAA-A-AT-T-tttttgtgtgt
gi|158037 : AAAA-AT-TG-TTT--G-TTTGCCACTT-CCTT-----------G-----C--AAC-------C-------C-----A------AAACAAT---C-CTG-CCA-GTC--AGAAAAA-A-AA-A-TT--TG-GGTGTatgttttg
gi|158008 : AT-TG-TTTTTG-TTGGCCGCCT-C-TG-----------G-----C-CAAC-------A-------------A------AAACAAT---C-CCG-CCG-GTC--AG-GAAA-A-A
gi|158038 : ggcttaaattacaaaattgttttgtttgccAT-TG-TTTTTG-TTGGCCGCCT-C-TG-----------G-----C-CAAC-------A-------------A------AAACAAT---C-CCG-CCG-GTC--AG-GAAA-A-cccgccggtcaggaaaaagtttttaggtg
gi|158039 : T-TG-TT-------TGCCACAT-A-TG-----------A-----C-CAAC-------C-------C-----A------CAATAAT---C-CCA-CCG-GTC--A--GAAA-A-ATAT-TC--TCAGTTGT
gi|158008 : t-----------G-----C-CAAC-------A-------------A------AAACAAT---C-CCG-CCG-GTC--AG-GAAA-A-AG-T-TT--TTAGGTG
gi|158040 : ggcttaaattacaaaattgttttgtttgcctttttcctgaccggcgggattgtttttgttggccagaggcgAC-------C-------C-----A------AAACAAT---C-CTG-GCG-GTC--AG-GAAC-A-TT-T-TT--TTGGGTGT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 22 0 2222222 111 00 2 2 1 3333333 33333 444 111 1 0 11 11 3333 111 0 2 0 22 33
lowQualScore : . . . .. . ....... ... .. . . . ....... ..... ... ... . . .. .. .... ... . . . .. ..
lowQualScore : 7 6 6 66 6 0000000 111 99 5 5 2 7777777 00000 666 222 4 7 00 00 2222 333 8 4 9 66 33
consensus : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGGGGTGT
Reference ( family-426 ) : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGGGGTGT
gi|157978 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-CT-------TGCC---GCT--T-C-TTGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CT--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGAGGTGT
gi|157979 : GGC-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--GGTT-------TGCC---GCT--T-T-CCGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-GC--GGTC--AG---GA---AC-A-TTT-T--T--
gi|157980 : GGC-CTAAATTAAAGAAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-CGGTCAAC-C-------C-----A--AAACGAT---T-ATG-CC--AGTC--AG---CA---AA-A-TTT-T--T--TCAGGTGT
gi|157981 : GGC-CTAAATTAAAAAAA-TG-TTT--G-TT-------TGCC---TCT--T-C-CGACCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CGG-CC--GTTC--AG---GA---TA-T-TTT-T--T--TGG
gi|157982 : GGT-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CAGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CT--GGTCAAAA---AA---AA-A-ATT-T--T--atgt
gi|157983 : GGC-CTAAACTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGCTGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCA-CCTGAGAC--AG---GA---AC-A-TTT-T--T--TGGGGGGTt
gi|157984 : GGC-CTGAATTAAAATAT-TA-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-T-CAGCCGAC-C-------C--------AAACAAT---C-CTG-CC--GGTC--AT---GA---AA-A-GTT-T--T--
gi|157985 : GGC-CCAAATTATAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGCCAAC-C-------CAA---A--AAACAAT---C-CCG-CC--AGTC--AG---GA---AA-ATGTT-C--A--TGGGgcggg
gi|157986 : GGC-CAAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------GGCC---ACT--T-C-CAGCTGAC-C-------T-----A--AAACAAT---C-CTG-CC--GGTC--AG---G---------ATT-T--T--
gi|157987 : GGC-CTTAATTTAGTTAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGGCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CT--GATC--AG---G-------A-ATT-T--T--tt
gi|157988 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TC-------TGCC---GCT--T-C-TGGCTGAT-C-------CA----A--AAACAAT---C-CTG-CC--AGTA--GG---GA---AA-A-ttttggtgt
gi|157989 : GGC-CTAAAATTAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGTTGAC-A-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CT--GGTT--GG---GA---AATA-ATT-T--TA-TGGGGT
gi|157990 : GGC-CAAAATTGAAATAT-TA-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--CAACAAC---C-CCC-CC--ATTC--AG---GA---AA-ATATT-T--TG-TGG
gi|157991 : GGC-TTAAATTAAAATAT-TG-TTT--A-TT-------TGCT---GCT--T-C-TGGCTGAC-C-------C-----A--CAACAAT---C-CTG-AC--AGTT--AT---GA---AA-A-ATT-T--T--AGGGGTat
gi|157992 : GGA-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--C-C-CAGCCGAC-C-------C-----A--CAACGAA---C-TTG-CC--TGTC--AG---TA---AA-A-TTG-T--TGGTGGGGTG
gi|157993 : GGC-TTAATTTAAACTAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---ACT--T-C-TGGCCATC-A-------C-----T--AAACAAT---C-CTA-CC--TGTC--GG---GA---AA-A-TAT-T--T--TGGGGTGT
gi|157994 : GGC-CTTAATTAAAATAT-TG-TTT--A-TT-------TGCC---ACT--T-C-AGGCCGAC-C-------C-----A--CTACAAT---C-TCG-CC--AGTC--A----GA---AT-T-GTT-T--T--TG
gi|157995 : GGC-TTAAATTAAAATAT-AG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-TAGCTGAC-C-------C-----A--GAACAAT---C-GTA-CC--AGTC--AG---AGTTTAT-T-ATT-T--T--TGGTGT
gi|157996 : GAC-CTAAATTAAAATAC-TG-TTT--G-TT-------AGC----GCT--T-C-CGGTCAAC-C-------C-----A--AAGTAAT---C-CCG-CT--GGTT--GG-----------A-ATT-T--T--
gi|157997 : GGC-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT------------------------GACCAAC-C-------CTGGTGA--AAACAAT---T-CCT-CT--GGTC--GG---GG---AA-A-TTT-T--T--ttg
gi|157998 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------GGCT---GCT--T-C-CGGCCGACGCAAAACAAC-----A--AAACAAT---C-TCA-TC--AGTT--GG---GA---AA-A-ATA-T--T--TGGGGt
gi|157999 : GGC-TTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TG--------------------AC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCA-CT--GGTC--AT---GA---AA-A-ATT-T--T--TTGGGTGT
gi|158000 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTA--G-TT-------TGCT---GTT--T-C-TGGCTGAC-C-------A-----A--CAATAAT---C-TCA-CT--GGTC--AG---GA---AA-
gi|158001 : GGT-CTAAATTAAAACAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-T-TGGCCTAC-A-------T-----A--AAACAAT---C-CC----------------------AA-A-ATT-T--T--TGTGGAGT
gi|158002 : GAC-CTAAATTAAAATAG-TG-TTT--C-TT-------TGCT---GCT--T-A-CTGCGGAC-C-------A-----G--TAACAAT---C-CCG-TC--GGTT--AG--------AA-A-ATTGT--T--TGGGGg
gi|158003 : GGC-CAAAATTAAAATAT-T--TTT--G-TA-------TGCT---GCT--T-C-TGGCCAGC-C-------A-----A--CAACAAT---C-TTG-TA--GATC--AG-----------A-ATT-T--T--
gi|158004 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-AGATTGAC-C-------A-----A--CAACCAT---C-----TC--GGTC--Attttgtgt
gi|158005 : GGC-CTAAATTAAAATGT-TG-TTT--G------------CA---GCT--T-C-CGGCCAAC-C-------C-----A--AAACAAT---acttttttgag
gi|158006 : GGC-CTTTATTAAAATAG-AG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CGGCCAAC-C-------C-----A--AAACAAT---
gi|158007 : GGC-CGAAGTTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-TGGC--AC-------------------AACAAT---C-CCA-AC--GGTT--AT---GA---AA-T-ATT-T--
gi|158008 : GGC-TTAAATTACAAAAT-TGTTTT--G-TT-------TGCC---TTT--T-T-C--CTGAC-C-------
gi|158008 : AT-TG-TTTTTG-TT-------GGCC---GCC--T-C-TGGCCAAC-A-------------A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-Aggcgggattgtttttgttggccagaggcggccaacaaaaacaatcccgccggtcaggaaaaagtttttaggtg
gi|158008 : ggcttaaattacaaaattgttttgtttgccAT-TG-TTTTTG-TT-------GGCC---AGA--G-G-CGGCCAAC-A-------------A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-AGT-T--T--TTAGGTGcccgccggtcaggaaaaagtttttaggtg
gi|158009 : ggcttaaattacaaaattgttttgtttgcctttttcctgaccggcgggGAC-CTAAATTAAAATAA-TG-CTT--G-TT-------TGCC---GCA--T-C-TGTCCAAA-C-------C-----A--CAATAAT---C-CAG-CC--AGTC--TG---AA---A
gi|158010 : GGC-CTGAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TCCCCTTGCT--T----GACCGAC-CAA-----C-----G--AAAAAA------GCA-CC--GACT-------GA---AA-A-CTT-T--T--TTGGGctgtgtttg
gi|158011 : GGA-CTTAATTAAAGCAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-TGGCCGAC-A-------T-----A--CAACAAT---T-ACC-CC--CATC--AG---AA---A
gi|158012 : GGC-CTAATTTAAAATAT-TG-TT----------------------------C-TGGCCGAC-A-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-GC--AGGC--GG---AA---AC-A-ATT-T--T--
gi|158013 : GGCACTAAATTAAAATAG-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CAGCTGAC-C-------C-----tt
gi|158014 : GGC-CCAAGTTAAAATAT-TT-TTT--G-TT-------TGTT---TCT--T-C-CAGCTGAC-C-------C-----A--CAACAGT---C-
gi|158015 : GGC-CAAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------T-CC---GCT--TGCGCGACCGAC-C-------C-----ACGAAAAAAG---CACCG-AC--TG---------------A-A-ATT-T--T--atactatcgggtca
gi|158016 : GGC-CTAAATAAAAATAG-TG-TTT--G-TT-------T-CC---ACT--TGCGCGACCGAC-C-------C-----ACGAAAAAA------GCA-CC--GA-C--TG---AA---AA-A-ATT-TTAT--TGGGttt
gi|158017 : GGC-ATAAATTAAATTAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--A-C-TAGCTGACTC-------C-----A--AAAC
gi|158018 : GGC-CTAAATAAAAATAG-TG-TTT--G-TT-------TACC----CT--TGCGCGACCGAC-C-------C-----ACGAAAAAAG---CACCGACT--GG--------------AA-A-ATT-T--C--
gi|158019 : GGC-ATAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT-------T-CC---CCT--TGCACAACTGAG-C-------C-----ACCAAAAAA------GCA-CT--GACT-------GA---AA-A-ATT-TTAT--TGGG
gi|158020 : GGC-CTAATATAAAATAT-TG-TTT--G-CT-------TGAC---ACT--T-C-AGACCGAC-C-------C-----A--CAAC
gi|158021 : GGC-CCAAATTAGAATAT-TG-TTT--G-TT-------T-CC---CCTTGT-G-CGACCCAC-CTA-----C-----G--AAAAAGT---A-CCG-AC----TA--A-----A---AA-A-ATT-T--T--
gi|158022 : GC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-AT-------TGCC---ACT--T-C-TGGGCAAC-T-------C-----A--AAATAAT---C-CCA-CT--AGCC--GG---GA---AA-G-TTT-T--T--atttgg
gi|158023 : GT-CTAAATTAAAACAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-TGACCAAC-C-------C-----G--CACCAAT---C-CTG-CG--AGTC--AG---------A-A-ATT-T--T--tg
gi|158024 : GC-TTAGATTGAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--C-C-AGGCCAAC-C-------C-----A--CACCAAT-----CTG-TC--GATC--AG---AA---A
gi|158025 : GC-CTAAGTTACTATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-T-GGGCCAA--C-------C-----A--A---AAT---C-TTG-CC--GGTC--AG---AA---AA-A-cttctattg
gi|158026 : GC-CTAAATTATTGT-T-TG-TTT--G-TTGCTTCTTTGTT---GCT--T-C-CGACTGAC-C-------C-----A--CAACAAT---A-CCA-CT--GGTC--AG---AA---A
gi|158027 : GC-TTAAATTATAAT---TG-TTT--G-TT-------TACC---GCT--T-C-CAGACGA--C-------C-----A--CAACAA-------CG-CT--GCTC--------A---CA-A-ACT-T--T--ccttttcg
gi|158028 : -CTACATTAAAAT---TG-TTT--G-TT-------TGCA---GCT--T-C-TGTCTGAC-C-------T-----A--AAACAAT---C-CCG-CT--GGTC--GA---GA---AA-A-
gi|158029 : -CTAAATTAAAATAC-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ATT--T-C-CGGCCAAC-T-------C-----A--CGACAATTCCT-CCT-CC--AGTC--AG---CA---AC-A-TTT-T--T--
gi|158030 : -CCAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-TAGCCGAC-C-------C-----CT-CAACAGT---C-CCA-TC--TGTC--A
gi|158031 : -CTGAAATAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TACC---ACT--T-T-CAACTGAC-C-------C-----A--TAACAAT---C-
gi|158032 : TAAATTAAAATAT-TA-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-TGGCCAAC-C-------C-----A--CAACAAT---C-CTT-CT-------------GA---AA-T-ATT-T--T--atgc
gi|158033 : TAAATTAAAATAT-AA-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-TGGCCAAC-C-------C-----A--CAACt
gi|158034 : AAATTCAAATAT-TG-TTT--G-TT-------CCCC---ACT--T-C-TGACCGAC-C-------C-----A--AAATAAT---C-TTG-CC--AGTT-------GA---AA-A-A
gi|158035 : AATTAAAATGGGTG-TTT--G-CT-------TGTT---GTT--T-C-CGGCTGAC-C-------T-----G--CAACGAT---C-CTG-TT--GGGT--AG-----------A-ATT-T--T--a
gi|158036 : TCAAAATAT-TG-TTT--G-TC-------TGCC---GCT--T-C-CGGCTGAC-C-------C-----A--AAACATT---T-CCA-TT--G-----AA---AA---AA-A-ATT-tttttgtgtgt
gi|158037 : AAAA-AT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CTTGCAAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CC--AGTC--AGAAAAA---AA-A-ATT-T-------GGGTGTatgttttg
gi|158038 : AT-TG-TTTTTG-TT-------GGCC---GCC--T-C-TGGCCAAC-A-------------A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-
gi|158039 : -TTT--G-TT-------TGCC---ACA--T-A-TGACCAAC-C-------C-----A--CAATAAT---C-CCA-CC--GGTC--AG---AA---AA-ATATT-C--T--
gi|158040 : AC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-GC--GGTC--AG---GA---AC-A-TTT-T--T--TTGGGTGTcagttgt
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 22 0 2222222 111 00 2 2 1 3333333 33333 444 111 1 0 11 11 3333 111 0 2 0 22 33
lowQualScore : . . . .. . ....... ... .. . . . ....... ..... ... ... . . .. .. .... ... . . . .. ..
lowQualScore : 7 6 6 66 6 0000000 111 99 5 5 2 7777777 00000 666 222 4 7 00 00 2222 333 8 4 9 66 33
consensus : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGGGGTGT
Reference ( family-426 ) : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGGGGTGT
gi|157978 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-CT-------TGCC---GCT--T-C-TTGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CT--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGAGGTGT
gi|157979 : GGC-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--GGTT-------TGCC---GCT--T-T-CCGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-GC--GGTC--AG---GA---AC-A-TTT-T--T--
gi|157980 : GGC-CTAAATTAAAGAAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-CGGTCAAC-C-------C-----A--AAACGAT---T-ATG-CC--AGTC--AG---CA---AA-A-TTT-T--T--TCAGGTGT
gi|157981 : GGC-CTAAATTAAAAAAA-TG-TTT--G-TT-------TGCC---TCT--T-C-CGACCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CGG-CC--GTTC--AG---GA---TA-T-TTT-T--T--TGG
gi|157982 : GGT-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CAGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CT--GGTCAAAA---AA---AA-A-ATT-T--T--atgt
gi|157983 : GGC-CTAAACTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGCTGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCA-CCTGAGAC--AG---GA---AC-A-TTT-T--T--TGGGGGGTt
gi|157984 : GGC-CTGAATTAAAATAT-TA-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-T-CAGCCGAC-C-------C--------AAACAAT---C-CTG-CC--GGTC--AT---GA---AA-A-GTT-T--T--
gi|157985 : GGC-CCAAATTATAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGCCAAC-C-------CAA---A--AAACAAT---C-CCG-CC--AGTC--AG---GA---AA-ATGTT-C--A--TGGGgcggg
gi|157986 : GGC-CAAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------GGCC---ACT--T-C-CAGCTGAC-C-------T-----A--AAACAAT---C-CTG-CC--GGTC--AG---G---------ATT-T--T--
gi|157987 : GGC-CTTAATTTAGTTAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGGCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CT--GATC--AG---G-------A-ATT-T--T--tt
gi|157988 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TC-------TGCC---GCT--T-C-TGGCTGAT-C-------CA----A--AAACAAT---C-CTG-CC--AGTA--GG---GA---AA-A-ttttggtgt
gi|157989 : GGC-CTAAAATTAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGTTGAC-A-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CT--GGTT--GG---GA---AATA-ATT-T--TA-TGGGGT
gi|157990 : GGC-CAAAATTGAAATAT-TA-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--CAACAAC---C-CCC-CC--ATTC--AG---GA---AA-ATATT-T--TG-TGG
gi|157991 : GGC-TTAAATTAAAATAT-TG-TTT--A-TT-------TGCT---GCT--T-C-TGGCTGAC-C-------C-----A--CAACAAT---C-CTG-AC--AGTT--AT---GA---AA-A-ATT-T--T--AGGGGTat
gi|157992 : GGA-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--C-C-CAGCCGAC-C-------C-----A--CAACGAA---C-TTG-CC--TGTC--AG---TA---AA-A-TTG-T--TGGTGGGGTG
gi|157993 : GGC-TTAATTTAAACTAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---ACT--T-C-TGGCCATC-A-------C-----T--AAACAAT---C-CTA-CC--TGTC--GG---GA---AA-A-TAT-T--T--TGGGGTGT
gi|157994 : GGC-CTTAATTAAAATAT-TG-TTT--A-TT-------TGCC---ACT--T-C-AGGCCGAC-C-------C-----A--CTACAAT---C-TCG-CC--AGTC--A----GA---AT-T-GTT-T--T--TG
gi|157995 : GGC-TTAAATTAAAATAT-AG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-TAGCTGAC-C-------C-----A--GAACAAT---C-GTA-CC--AGTC--AG---AGTTTAT-T-ATT-T--T--TGGTGT
gi|157996 : GAC-CTAAATTAAAATAC-TG-TTT--G-TT-------AGC----GCT--T-C-CGGTCAAC-C-------C-----A--AAGTAAT---C-CCG-CT--GGTT--GG-----------A-ATT-T--T--
gi|157997 : GGC-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT------------------------GACCAAC-C-------CTGGTGA--AAACAAT---T-CCT-CT--GGTC--GG---GG---AA-A-TTT-T--T--ttg
gi|157998 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------GGCT---GCT--T-C-CGGCCGACGCAAAACAAC-----A--AAACAAT---C-TCA-TC--AGTT--GG---GA---AA-A-ATA-T--T--TGGGGt
gi|157999 : GGC-TTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TG--------------------AC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCA-CT--GGTC--AT---GA---AA-A-ATT-T--T--TTGGGTGT
gi|158000 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTA--G-TT-------TGCT---GTT--T-C-TGGCTGAC-C-------A-----A--CAATAAT---C-TCA-CT--GGTC--AG---GA---AA-
gi|158001 : GGT-CTAAATTAAAACAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-T-TGGCCTAC-A-------T-----A--AAACAAT---C-CC----------------------AA-A-ATT-T--T--TGTGGAGT
gi|158002 : GAC-CTAAATTAAAATAG-TG-TTT--C-TT-------TGCT---GCT--T-A-CTGCGGAC-C-------A-----G--TAACAAT---C-CCG-TC--GGTT--AG--------AA-A-ATTGT--T--TGGGGg
gi|158003 : GGC-CAAAATTAAAATAT-T--TTT--G-TA-------TGCT---GCT--T-C-TGGCCAGC-C-------A-----A--CAACAAT---C-TTG-TA--GATC--AG-----------A-ATT-T--T--
gi|158004 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-AGATTGAC-C-------A-----A--CAACCAT---C-----TC--GGTC--Attttgtgt
gi|158005 : GGC-CTAAATTAAAATGT-TG-TTT--G------------CA---GCT--T-C-CGGCCAAC-C-------C-----A--AAACAAT---acttttttgag
gi|158006 : GGC-CTTTATTAAAATAG-AG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CGGCCAAC-C-------C-----A--AAACAAT---
gi|158007 : GGC-CGAAGTTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-TGGC--AC-------------------AACAAT---C-CCA-AC--GGTT--AT---GA---AA-T-ATT-T--
gi|158008 : GGC-TTAAATTACAAAAT-TGTTTT--G-TT-------TGCC---TTT--T-T-C--CTGAC-C-------
gi|158008 : AT-TG-TTTTTG-TT-------GGCC---GCC--T-C-TGGCCAAC-A-------------A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-Aggcgggattgtttttgttggccagaggcggccaacaaaaacaatcccgccggtcaggaaaaagtttttaggtg
gi|158008 : ggcttaaattacaaaattgttttgtttgccAT-TG-TTTTTG-TT-------GGCC---AGA--G-G-CGGCCAAC-A-------------A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-AGT-T--T--TTAGGTGcccgccggtcaggaaaaagtttttaggtg
gi|158009 : ggcttaaattacaaaattgttttgtttgcctttttcctgaccggcgggGAC-CTAAATTAAAATAA-TG-CTT--G-TT-------TGCC---GCA--T-C-TGTCCAAA-C-------C-----A--CAATAAT---C-CAG-CC--AGTC--TG---AA---A
gi|158010 : GGC-CTGAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TCCCCTTGCT--T----GACCGAC-CAA-----C-----G--AAAAAA------GCA-CC--GACT-------GA---AA-A-CTT-T--T--TTGGGctgtgtttg
gi|158011 : GGA-CTTAATTAAAGCAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-TGGCCGAC-A-------T-----A--CAACAAT---T-ACC-CC--CATC--AG---AA---A
gi|158012 : GGC-CTAATTTAAAATAT-TG-TT----------------------------C-TGGCCGAC-A-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-GC--AGGC--GG---AA---AC-A-ATT-T--T--
gi|158013 : GGCACTAAATTAAAATAG-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CAGCTGAC-C-------C-----tt
gi|158014 : GGC-CCAAGTTAAAATAT-TT-TTT--G-TT-------TGTT---TCT--T-C-CAGCTGAC-C-------C-----A--CAACAGT---C-
gi|158015 : GGC-CAAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------T-CC---GCT--TGCGCGACCGAC-C-------C-----ACGAAAAAAG---CACCG-AC--TG---------------A-A-ATT-T--T--atactatcgggtca
gi|158016 : GGC-CTAAATAAAAATAG-TG-TTT--G-TT-------T-CC---ACT--TGCGCGACCGAC-C-------C-----ACGAAAAAA------GCA-CC--GA-C--TG---AA---AA-A-ATT-TTAT--TGGGttt
gi|158017 : GGC-ATAAATTAAATTAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--A-C-TAGCTGACTC-------C-----A--AAAC
gi|158018 : GGC-CTAAATAAAAATAG-TG-TTT--G-TT-------TACC----CT--TGCGCGACCGAC-C-------C-----ACGAAAAAAG---CACCGACT--GG--------------AA-A-ATT-T--C--
gi|158019 : GGC-ATAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT-------T-CC---CCT--TGCACAACTGAG-C-------C-----ACCAAAAAA------GCA-CT--GACT-------GA---AA-A-ATT-TTAT--TGGG
gi|158020 : GGC-CTAATATAAAATAT-TG-TTT--G-CT-------TGAC---ACT--T-C-AGACCGAC-C-------C-----A--CAAC
gi|158021 : GGC-CCAAATTAGAATAT-TG-TTT--G-TT-------T-CC---CCTTGT-G-CGACCCAC-CTA-----C-----G--AAAAAGT---A-CCG-AC----TA--A-----A---AA-A-ATT-T--T--
gi|158022 : GC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-AT-------TGCC---ACT--T-C-TGGGCAAC-T-------C-----A--AAATAAT---C-CCA-CT--AGCC--GG---GA---AA-G-TTT-T--T--atttgg
gi|158023 : GT-CTAAATTAAAACAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-TGACCAAC-C-------C-----G--CACCAAT---C-CTG-CG--AGTC--AG---------A-A-ATT-T--T--tg
gi|158024 : GC-TTAGATTGAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--C-C-AGGCCAAC-C-------C-----A--CACCAAT-----CTG-TC--GATC--AG---AA---A
gi|158025 : GC-CTAAGTTACTATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-T-GGGCCAA--C-------C-----A--A---AAT---C-TTG-CC--GGTC--AG---AA---AA-A-cttctattg
gi|158026 : GC-CTAAATTATTGT-T-TG-TTT--G-TTGCTTCTTTGTT---GCT--T-C-CGACTGAC-C-------C-----A--CAACAAT---A-CCA-CT--GGTC--AG---AA---A
gi|158027 : GC-TTAAATTATAAT---TG-TTT--G-TT-------TACC---GCT--T-C-CAGACGA--C-------C-----A--CAACAA-------CG-CT--GCTC--------A---CA-A-ACT-T--T--ccttttcg
gi|158028 : -CTACATTAAAAT---TG-TTT--G-TT-------TGCA---GCT--T-C-TGTCTGAC-C-------T-----A--AAACAAT---C-CCG-CT--GGTC--GA---GA---AA-A-
gi|158029 : -CTAAATTAAAATAC-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ATT--T-C-CGGCCAAC-T-------C-----A--CGACAATTCCT-CCT-CC--AGTC--AG---CA---AC-A-TTT-T--T--
gi|158030 : -CCAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-TAGCCGAC-C-------C-----CT-CAACAGT---C-CCA-TC--TGTC--A
gi|158031 : -CTGAAATAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TACC---ACT--T-T-CAACTGAC-C-------C-----A--TAACAAT---C-
gi|158032 : TAAATTAAAATAT-TA-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-TGGCCAAC-C-------C-----A--CAACAAT---C-CTT-CT-------------GA---AA-T-ATT-T--T--atgc
gi|158033 : TAAATTAAAATAT-AA-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-TGGCCAAC-C-------C-----A--CAACt
gi|158034 : AAATTCAAATAT-TG-TTT--G-TT-------CCCC---ACT--T-C-TGACCGAC-C-------C-----A--AAATAAT---C-TTG-CC--AGTT-------GA---AA-A-A
gi|158035 : AATTAAAATGGGTG-TTT--G-CT-------TGTT---GTT--T-C-CGGCTGAC-C-------T-----G--CAACGAT---C-CTG-TT--GGGT--AG-----------A-ATT-T--T--a
gi|158036 : TCAAAATAT-TG-TTT--G-TC-------TGCC---GCT--T-C-CGGCTGAC-C-------C-----A--AAACATT---T-CCA-TT--G-----AA---AA---AA-A-ATT-tttttgtgtgt
gi|158037 : AAAA-AT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CTTGCAAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CC--AGTC--AGAAAAA---AA-A-ATT-T-------GGGTGTatgttttg
gi|158038 : AT-TG-TTTTTG-TT-------GGCC---GCC--T-C-TGGCCAAC-A-------------A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-
gi|158039 : -TTT--G-TT-------TGCC---ACA--T-A-TGACCAAC-C-------C-----A--CAATAAT---C-CCA-CC--GGTC--AG---AA---AA-ATATT-C--T--
gi|158040 : AC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-GC--GGTC--AG---GA---AC-A-TTT-T--T--TTGGGTGTcagttgt
blockSeqs : TT GCTTCTT CTT G G G AAAACAA TGGTG CGA TCC A AAAA TTT T TA GG
blockSeqs : TT . . G G T AA AA CGA . A G . T TA A
blockSeqs : TT . . G G . TA A CGA . . C . T . G
blockSeqs : . . . G A . . . CCA . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TC . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGGGGTGT
finalCons : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGGGGTGT
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 22 0 2222222 111 00 2 2 1 3333333 33333 444 111 1 0 11 11 3333 111 0 2 0 22 33
lowQualScore : . . . .. . ....... ... .. . . . ....... ..... ... ... . . .. .. .... ... . . . .. ..
lowQualScore : 7 6 6 66 6 0000000 111 99 5 5 2 7777777 00000 666 222 4 7 00 00 2222 333 8 4 9 66 33
consensus : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGGGGTGT
Reference ( family-426 ) : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGGGGTGT
gi|157978 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-CT-------TGCC---GCT--T-C-TTGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCG-CT--GGTC--AG---GA---AA-A-ATT-T--T--TGAGGTGT
gi|157979 : GGC-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--GGTT-------TGCC---GCT--T-T-CCGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-GC--GGTC--AG---GA---AC-A-TTT-T--T--
gi|157980 : GGC-CTAAATTAAAGAAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-CGGTCAAC-C-------C-----A--AAACGAT---T-ATG-CC--AGTC--AG---CA---AA-A-TTT-T--T--TCAGGTGT
gi|157981 : GGC-CTAAATTAAAAAAA-TG-TTT--G-TT-------TGCC---TCT--T-C-CGACCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CGG-CC--GTTC--AG---GA---TA-T-TTT-T--T--TGG
gi|157982 : GGT-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CAGCCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CT--GGTCAAAA---AA---AA-A-ATT-T--T--atgt
gi|157983 : GGC-CTAAACTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGCTGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCA-CCTGAGAC--AG---GA---AC-A-TTT-T--T--TGGGGGGTt
gi|157984 : GGC-CTGAATTAAAATAT-TA-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-T-CAGCCGAC-C-------C--------AAACAAT---C-CTG-CC--GGTC--AT---GA---AA-A-GTT-T--T--
gi|157985 : GGC-CCAAATTATAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGCCAAC-C-------CAA---A--AAACAAT---C-CCG-CC--AGTC--AG---GA---AA-ATGTT-C--A--TGGGgcggg
gi|157986 : GGC-CAAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------GGCC---ACT--T-C-CAGCTGAC-C-------T-----A--AAACAAT---C-CTG-CC--GGTC--AG---G---------ATT-T--T--
gi|157987 : GGC-CTTAATTTAGTTAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGGCGAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CT--GATC--AG---G-------A-ATT-T--T--tt
gi|157988 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TC-------TGCC---GCT--T-C-TGGCTGAT-C-------CA----A--AAACAAT---C-CTG-CC--AGTA--GG---GA---AA-A-ttttggtgt
gi|157989 : GGC-CTAAAATTAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-CGGTTGAC-A-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CT--GGTT--GG---GA---AATA-ATT-T--TA-TGGGGT
gi|157990 : GGC-CAAAATTGAAATAT-TA-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CGGCCGAC-C-------C-----A--CAACAAC---C-CCC-CC--ATTC--AG---GA---AA-ATATT-T--TG-TGG
gi|157991 : GGC-TTAAATTAAAATAT-TG-TTT--A-TT-------TGCT---GCT--T-C-TGGCTGAC-C-------C-----A--CAACAAT---C-CTG-AC--AGTT--AT---GA---AA-A-ATT-T--T--AGGGGTat
gi|157992 : GGA-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--C-C-CAGCCGAC-C-------C-----A--CAACGAA---C-TTG-CC--TGTC--AG---TA---AA-A-TTG-T--TGGTGGGGTG
gi|157993 : GGC-TTAATTTAAACTAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---ACT--T-C-TGGCCATC-A-------C-----T--AAACAAT---C-CTA-CC--TGTC--GG---GA---AA-A-TAT-T--T--TGGGGTGT
gi|157994 : GGC-CTTAATTAAAATAT-TG-TTT--A-TT-------TGCC---ACT--T-C-AGGCCGAC-C-------C-----A--CTACAAT---C-TCG-CC--AGTC--A----GA---AT-T-GTT-T--T--TG
gi|157995 : GGC-TTAAATTAAAATAT-AG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-TAGCTGAC-C-------C-----A--GAACAAT---C-GTA-CC--AGTC--AG---AGTTTAT-T-ATT-T--T--TGGTGT
gi|157996 : GAC-CTAAATTAAAATAC-TG-TTT--G-TT-------AGC----GCT--T-C-CGGTCAAC-C-------C-----A--AAGTAAT---C-CCG-CT--GGTT--GG-----------A-ATT-T--T--
gi|157997 : GGC-CTAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT------------------------GACCAAC-C-------CTGGTGA--AAACAAT---T-CCT-CT--GGTC--GG---GG---AA-A-TTT-T--T--ttg
gi|157998 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------GGCT---GCT--T-C-CGGCCGACGCAAAACAAC-----A--AAACAAT---C-TCA-TC--AGTT--GG---GA---AA-A-ATA-T--T--TGGGGt
gi|157999 : GGC-TTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TG--------------------AC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CCA-CT--GGTC--AT---GA---AA-A-ATT-T--T--TTGGGTGT
gi|158000 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTA--G-TT-------TGCT---GTT--T-C-TGGCTGAC-C-------A-----A--CAATAAT---C-TCA-CT--GGTC--AG---GA---AA-
gi|158001 : GGT-CTAAATTAAAACAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-T-TGGCCTAC-A-------T-----A--AAACAAT---C-CC----------------------AA-A-ATT-T--T--TGTGGAGT
gi|158002 : GAC-CTAAATTAAAATAG-TG-TTT--C-TT-------TGCT---GCT--T-A-CTGCGGAC-C-------A-----G--TAACAAT---C-CCG-TC--GGTT--AG--------AA-A-ATTGT--T--TGGGGg
gi|158003 : GGC-CAAAATTAAAATAT-T--TTT--G-TA-------TGCT---GCT--T-C-TGGCCAGC-C-------A-----A--CAACAAT---C-TTG-TA--GATC--AG-----------A-ATT-T--T--
gi|158004 : GGC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-AGATTGAC-C-------A-----A--CAACCAT---C-----TC--GGTC--Attttgtgt
gi|158005 : GGC-CTAAATTAAAATGT-TG-TTT--G------------CA---GCT--T-C-CGGCCAAC-C-------C-----A--AAACAAT---acttttttgag
gi|158006 : GGC-CTTTATTAAAATAG-AG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CGGCCAAC-C-------C-----A--AAACAAT---
gi|158007 : GGC-CGAAGTTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--T-C-TGGC--AC-------------------AACAAT---C-CCA-AC--GGTT--AT---GA---AA-T-ATT-T--
gi|158008 : GGC-TTAAATTACAAAAT-TGTTTT--G-TT-------TGCC---TTT--T-T-C--CTGAC-C-------
gi|158008 : AT-TG-TTTTTG-TT-------GGCC---GCC--T-C-TGGCCAAC-A-------------A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-Aggcgggattgtttttgttggccagaggcggccaacaaaaacaatcccgccggtcaggaaaaagtttttaggtg
gi|158008 : ggcttaaattacaaaattgttttgtttgccAT-TG-TTTTTG-TT-------GGCC---AGA--G-G-CGGCCAAC-A-------------A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-AGT-T--T--TTAGGTGcccgccggtcaggaaaaagtttttaggtg
gi|158009 : ggcttaaattacaaaattgttttgtttgcctttttcctgaccggcgggGAC-CTAAATTAAAATAA-TG-CTT--G-TT-------TGCC---GCA--T-C-TGTCCAAA-C-------C-----A--CAATAAT---C-CAG-CC--AGTC--TG---AA---A
gi|158010 : GGC-CTGAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TCCCCTTGCT--T----GACCGAC-CAA-----C-----G--AAAAAA------GCA-CC--GACT-------GA---AA-A-CTT-T--T--TTGGGctgtgtttg
gi|158011 : GGA-CTTAATTAAAGCAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--T-C-TGGCCGAC-A-------T-----A--CAACAAT---T-ACC-CC--CATC--AG---AA---A
gi|158012 : GGC-CTAATTTAAAATAT-TG-TT----------------------------C-TGGCCGAC-A-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-GC--AGGC--GG---AA---AC-A-ATT-T--T--
gi|158013 : GGCACTAAATTAAAATAG-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CAGCTGAC-C-------C-----tt
gi|158014 : GGC-CCAAGTTAAAATAT-TT-TTT--G-TT-------TGTT---TCT--T-C-CAGCTGAC-C-------C-----A--CAACAGT---C-
gi|158015 : GGC-CAAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------T-CC---GCT--TGCGCGACCGAC-C-------C-----ACGAAAAAAG---CACCG-AC--TG---------------A-A-ATT-T--T--atactatcgggtca
gi|158016 : GGC-CTAAATAAAAATAG-TG-TTT--G-TT-------T-CC---ACT--TGCGCGACCGAC-C-------C-----ACGAAAAAA------GCA-CC--GA-C--TG---AA---AA-A-ATT-TTAT--TGGGttt
gi|158017 : GGC-ATAAATTAAATTAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---GCT--A-C-TAGCTGACTC-------C-----A--AAAC
gi|158018 : GGC-CTAAATAAAAATAG-TG-TTT--G-TT-------TACC----CT--TGCGCGACCGAC-C-------C-----ACGAAAAAAG---CACCGACT--GG--------------AA-A-ATT-T--C--
gi|158019 : GGC-ATAAATTAAAAAAT-TG-TTT--G-TT-------T-CC---CCT--TGCACAACTGAG-C-------C-----ACCAAAAAA------GCA-CT--GACT-------GA---AA-A-ATT-TTAT--TGGG
gi|158020 : GGC-CTAATATAAAATAT-TG-TTT--G-CT-------TGAC---ACT--T-C-AGACCGAC-C-------C-----A--CAAC
gi|158021 : GGC-CCAAATTAGAATAT-TG-TTT--G-TT-------T-CC---CCTTGT-G-CGACCCAC-CTA-----C-----G--AAAAAGT---A-CCG-AC----TA--A-----A---AA-A-ATT-T--T--
gi|158022 : GC-CTAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-AT-------TGCC---ACT--T-C-TGGGCAAC-T-------C-----A--AAATAAT---C-CCA-CT--AGCC--GG---GA---AA-G-TTT-T--T--atttgg
gi|158023 : GT-CTAAATTAAAACAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-TGACCAAC-C-------C-----G--CACCAAT---C-CTG-CG--AGTC--AG---------A-A-ATT-T--T--tg
gi|158024 : GC-TTAGATTGAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCT---GCT--C-C-AGGCCAAC-C-------C-----A--CACCAAT-----CTG-TC--GATC--AG---AA---A
gi|158025 : GC-CTAAGTTACTATAT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-T-GGGCCAA--C-------C-----A--A---AAT---C-TTG-CC--GGTC--AG---AA---AA-A-cttctattg
gi|158026 : GC-CTAAATTATTGT-T-TG-TTT--G-TTGCTTCTTTGTT---GCT--T-C-CGACTGAC-C-------C-----A--CAACAAT---A-CCA-CT--GGTC--AG---AA---A
gi|158027 : GC-TTAAATTATAAT---TG-TTT--G-TT-------TACC---GCT--T-C-CAGACGA--C-------C-----A--CAACAA-------CG-CT--GCTC--------A---CA-A-ACT-T--T--ccttttcg
gi|158028 : -CTACATTAAAAT---TG-TTT--G-TT-------TGCA---GCT--T-C-TGTCTGAC-C-------T-----A--AAACAAT---C-CCG-CT--GGTC--GA---GA---AA-A-
gi|158029 : -CTAAATTAAAATAC-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ATT--T-C-CGGCCAAC-T-------C-----A--CGACAATTCCT-CCT-CC--AGTC--AG---CA---AC-A-TTT-T--T--
gi|158030 : -CCAAATTAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TGTC---GCT--T-C-TAGCCGAC-C-------C-----CT-CAACAGT---C-CCA-TC--TGTC--A
gi|158031 : -CTGAAATAAAATAT-TG-TTT--G-TT-------TACC---ACT--T-T-CAACTGAC-C-------C-----A--TAACAAT---C-
gi|158032 : TAAATTAAAATAT-TA-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-TGGCCAAC-C-------C-----A--CAACAAT---C-CTT-CT-------------GA---AA-T-ATT-T--T--atgc
gi|158033 : TAAATTAAAATAT-AA-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-TGGCCAAC-C-------C-----A--CAACt
gi|158034 : AAATTCAAATAT-TG-TTT--G-TT-------CCCC---ACT--T-C-TGACCGAC-C-------C-----A--AAATAAT---C-TTG-CC--AGTT-------GA---AA-A-A
gi|158035 : AATTAAAATGGGTG-TTT--G-CT-------TGTT---GTT--T-C-CGGCTGAC-C-------T-----G--CAACGAT---C-CTG-TT--GGGT--AG-----------A-ATT-T--T--a
gi|158036 : TCAAAATAT-TG-TTT--G-TC-------TGCC---GCT--T-C-CGGCTGAC-C-------C-----A--AAACATT---T-CCA-TT--G-----AA---AA---AA-A-ATT-tttttgtgtgt
gi|158037 : AAAA-AT-TG-TTT--G-TT-------TGCC---ACT--T-C-CTTGCAAC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-CC--AGTC--AGAAAAA---AA-A-ATT-T-------GGGTGTatgttttg
gi|158038 : AT-TG-TTTTTG-TT-------GGCC---GCC--T-C-TGGCCAAC-A-------------A--AAACAAT---C-CCG-CC--GGTC--AG---GA---AA-A-
gi|158039 : -TTT--G-TT-------TGCC---ACA--T-A-TGACCAAC-C-------C-----A--CAATAAT---C-CCA-CC--GGTC--AG---AA---AA-ATATT-C--T--
gi|158040 : AC-C-------C-----A--AAACAAT---C-CTG-GC--GGTC--AG---GA---AC-A-TTT-T--T--TTGGGTGTcagttgt