lowQualScore : 11 111 1 1 111111
lowQualScore : 99 222 1 2 0 11 4 00 1 00 1111 1111 00 00 0 0 00 111111 00 111 0 2 33333 0 0 444444 11
lowQualScore : .. ... . . . .. . .. . .. .... .... .. .. . . .. ...... .. ... . . ..... . . ...... ..
lowQualScore : 88 222 6 3 8 00 1 99 3 99 4444 4444 99 99 3 7 99 999999 99 222 7 0 11111 7 7 777777 00
consensus : ATTGAATCGGAAA-T-T-TT-A-CGAT--AATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AT-----TACTGATC--AGTA
Reference ( gi|117481 ) : ATTGAATCACAAA-G-T-TT-A-CGAT--ACTTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTTA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AT-----AACTGATC--AGTA
gi|117483 : ATTGAAT-AGAAA-G-T-TTTA-CGAT--AATTTCCAT--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTTA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AC-----TATTGATC--AGT
gi|117484 : ATTGAATAATAAA-T-T-TT-A-TGAT--AATTTCCAT--CAGT-G--AA----G----C--G--GCTAA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GATAT------ATTGATC--AGTAcaat
gi|117479 : ATTGAATTGGAAA-T-T-TT-C-CTAT--AATTTCCGT--CTGT-G--GA----A----C--A--GCTAA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AT-----AACTGACC--AGTAaat
gi|117482 : ATTTAATCAGTAA-T-T-TT-A-CAAT--TATTTCCAT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AT-----TACTGATT--TGTAaat
gi|117480 : ATTGAATCGGAAA-T-T-TT-A-CGAT--AATTTCCGT--CAGC-C--AA----G----C--A--TTTAA-T--T------TG--TT---TA-T-T-----A-GA-AG-----TACTGATC--AGTaat
gi|117485 : ATTGAATGA-AAA-T-T-TT-A-TGAT--AATATC-GT--CAGC-A--AA----G----C--A--GTTAA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AA-----CACTGATC--AGTAtaat
gi|117494 : ATTGAATCGAAAC-A-T-TT-A-CGAT--AAGTTCT-----AGC-G--AA----G----C--A--GCTAC-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-CA-AT-----AACTGATA--AGTAaat
gi|117486 : ATTAAATCAGACA-T-T-TT-A-TGAA--AATCTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T--T------TG--CT---TA-T-T-----A-GA-TT-----TATTGCTC--AGTAaat
gi|117492 : ATTAAATCGGAAT-G-T-TT-A-CGAT--AATTTCCGC--CAGC-G--AA----A----C--A--GCCAA-T--T------TG--CA---TT-T-T------------------ACTGATC--AGaat
gi|117521 : ATTGAAT---------T-TT-A-TGAT--CATTTCCTT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCCTT-T--T------TG--CA---TT-T-T-----A-GA-AT-----TACTGATC--AGaattactga
gi|117497 : ATTGAATCA-AAA-GTT-TT-A-TGAT--AACTTCCGT--CATT-G--GA----A----C--A--ACTTA-T--T------CA--CA---TA-T-C-----A-AA-AT-----TACTGATC--gaaat
gi|117493 : ATTGAATCCGAAC-T-T-TT-A-CGAC--AATTTCTAT--CAGT-G--GA----A----C--A--GCTTA-T--T------TG--CA---TA-C-A-----A-GA-AT-----TATTAATC--GGTAccaaat
gi|117490 : ATTGAATCGGAAT-A-T-TT-A-CAAT--AATTTACGT--CAAC-G--AA----A----G--G--GTAAA-T--T------T---CA---TA-T-T-----A-GA-AT-----TACTGATC--AGTAaat
gi|117488 : ATTGAATAGGACA-T-T-TT-A-CGAT--AATTTCAGT--CAGC-T--TA----G----C--A--GCTAT-T--T------TG--CA---TT-T-T-----A-GA-AT-----TACTGATC--TGTaat
gi|117499 : ATTAAATTGGAAA-T-T-TT-A-TGAT--AATTTCCGT--CAGC-T--GA----A----T--A--CCGTA-T--T------TG--CA---AA-T-T-----A-AC-AT-----AACTGTTC--AGTtaaa
gi|117487 : ATTTAATGGGAAA-T-T-TT-A-CAAT--AATTTCTGTGTCAGA-GCTAA----G----C--A--GCTAA-T--A------TG--CA---TT-T-T-----A-GA-AT-----TACTGATC--AGTA
gi|117489 : ATTGAATTGGAAG-T-T-TT-A-CGGT--AATCTCCGA--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTAA-T--T------TG--CA---TA-T-C-----A-GA-Aaa
gi|117498 : ATTTAATCAGAAG-T-T-TT-A-TGAT--GATTTTTAT--CAGC-A--AA----G----C--A--GCTAATT--T------TG--CA---TA-TATA----A-GA-ATTACTAAACTGATA--AGTA
gi|117495 : ATTGAATAGGAAA-T-G-TT-A-CTAT--AATTTCCGC--CAGC-G--AA----T----A--A--ACTAA-T--T------TG--TA---TA-TATA----A-GA-AT-----AAATAATC--AATAaat
gi|117501 : ATTAAATCAGAAATA-T-TT-T-CGAT--AATTTCCGT--CAGA-G--AT----G----G--A--GC-TA-TTGT------TA--AA---TG-T-T-----A-AA-AT-----TACTGATC--aat
gi|117500 : ATTATATCGGAAA-G-T-TA-A-CAAT--AATATTTGT--CAGC-C--AA----G----C--A--ACAAA-A--T------TG--CA---TA-T-C-----A-TA-AT-----TATTGATC--AGTA
gi|117496 : ATTGAATAGGAAA-T-G-TT-A-CTAT--AATTTCCGC--CAGC-G--AA----T----A--A--GCTAA-T--T------TG--TA---TA-TATATATAA-GA-AT-----AAATAATC--aat
gi|117503 : ACTGAATCAGATA-T-T-GT-A-CAAT--AATTTCAAT--CAGC-A--AA----G----C--A--GCTAA-T--T------TG--CC---CA-T-T-----A-TA-AT-----acaaat
gi|117502 : ATTGAAGCG-AAA-T-T-TT-A-TGAT--AACTTTCGC--CAAC-G--A------------------TAA-G--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AT-----TACTGAAC--AGCAt
gi|117504 : ATTGAACCAGAAA-T-T-TA-A-CGGT--AATTCCCGT--CAGC-G--TA----G----A--A--GCTcat
gi|117505 : ATTGAATCG-AAG-G-T-TTTA-CAAA--AAATACGAC--CAGC-G--CA----A----C--A--GTTTT-A--C------TG--CA---TA-T-T-----A-TA-GT-----TACTGATC--TGTAaa
gi|117507 : TTAAATTGGAAC-A-T-TT-A-CAAT--AATTTTCTT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTTA-T--C------TG--CG---TA-T-T-----A-GA-AT-----TACCAACC--AGTaat
gi|117508 : TTGAATTGGAAA---T-TT-A-CAAT--AATTTCCGT--CAGT-G--AA----G----C--A--GCTtaat
gi|117509 : TGAATCGGAAA---T-TT-A-CGAT--AATTTCCGT--CAGC-G--TA----GAGTGC--A--GATAA-T--C------TG--CA---TA-T-C-----A-GA-AT-----TACTGATC--AGTAa
gi|117510 : TGAATAGGAAA-T-T-AT-G-CAAC--AATTTCTGT--CAGC-G--AA----G----T--A--GCTAA-T--T------TG--TA---TA-T-T-----A-GA-AT-----TACTGATCTTAGTAtat
gi|117512 : TGAATCG-GAA-T-TATT-A-CGAA--AAATGCCAT--CAGC-G--AA----T----C--A--GCTAA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AG-----TAGTGATC--AGTtat
gi|117515 : GAATCAGATG-T-T-TT-G-CGAT--AATTTCCAT--CAGC-G--AC----T----C--A--GC-----------------------TG-T-T-----A-GA-AT-----TACAGAAC--AGcaa
gi|117518 : ATCGAAAA-T-T-TT-A-CAAT--AATTTCCGC--CAGC-A--GA----A----C--A--GCTAA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AT-----TACTAATC--AGTA
gi|117520 : ATCGGAAA-T-G-TT-A-CTAT--AATTTCCGT--CACT-G--AA----G----C--A--GCTGA-T--T------TG--CA---CA-T-T-----A-GA-AT-----GACTGATC--AATAaat
gi|117528 : ATCGGAAA-G-T-TT-G-AGAT--AATTT--GT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTTA-T--T------T--------------------------------ACTGATC--AGTcat
gi|117527 : ATCAGAAA-T-T-TT-A-CGAT--AAATTCTGT--AAAC-A--AA----G----C--ATGAATTA-T--T------TG--TA----A-T-A-----A-GA-AT-----TACTGATC--
gi|117525 : ATCGGAAA-T-T-TT-A-AGCT--AATTTCCGT--AAAC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T--T------TA--Ctttaat
gi|117531 : AAA-G-T-TT-A-CGAC--AATTTCCGT--CAGC-G--GACATGA----C--A--GCTTA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AT-----TACTGATC--AGTAtgatgagtaaat
gi|117519 : AAA-T-T-TT-A-CGAT--AATTTCCGT--CAGT-G--AA----G----C--A--GCTAG-T--T------TG--CA---TA-T-A-----C-GT-AT-----TACTGGCC--AGTAaat
gi|117511 : attggAAA-T-T-TT-G-AGAT--AATTTTCCT--CAGC-A--GA----G----T--A--GCTAA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GG-AT-----TAATGATC--AGTgat
gi|117526 : tgaaatggAAA-A-TGTT-A-TGAT--ACGTTTCGT--CAAC-A--GA----G----C--A--GCTAA-C--T------TG--CA---TA-G-T-----A-GA-AC-----AAATTTTC--AGTA
gi|117530 : attaAAA-T-T-TT-A-C-ATTTATTTTCTTT----GCAG--AA----G----C---------------------TG--CA---TT-T-T-----A-GA-AT-----TACTGATC--AGTAaat
gi|117517 : gAA-G-T-TTTA-CGAT--AATAACCGC--TAGA-G--GA----A----C--A--GCCTA-T--C------AGAACAGCCTA-T-T-----A-GA-AT-----TACCTATC--AGTAaat
gi|117529 : aatttg-T-TT-A-CGGT--TATTTCTGT--CAGC-G--AA----A----C--C--GCTCA-T--T------TG--CA---TA-T-G-----A-CA-AT-----TACTGATaat
gi|117522 : ggaatt-T-TT-A-CAAT--ATTTTCCTT--CAAT-G--AA----G----C--A--GCTAA-T--TTATACATG--TA---TA-T-C-----G-GA-AT-----TACTAATC--AGTaggcaa
gi|117516 : attggacat-T-TT-T-CAAT--AATTTCTGT--CAGC-A--GG----G----C--A--GCTAA-C--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AT-----gaat
gi|117523 : aatctgatat-T-TT-A-CAAT--AATGTTCAT--CTGC-G--GG----G----C--A--GCTAA-T--T------TG--CA---GA-A-T-----T-GT-AT-----TACTGATC--AGTtaagtaaat
gi|117513 : atcgaacat-T-TT-AACGAT--ATTTTCCGT--CAAC-G--A--------------------A-T--T------TG--CA---TT-T-C-----A-GG-AT-----TACTGTTC--AATAtaat
gi|117524 : taaatcggac-T-TT-A-TGAT--GATTTTCGT--CGAC-----A----G----CTTA--GCCAA-T--T------TG--CC---TA-T-A-----A-GA-AG-----TACTGATC--AGTAaat
gi|117534 : actgaatat-TT-A-CGAT--AATTTCCGT--TTGA-G--GA----G----T------CTAA-T--T------TG--CA---TA-A-T-----A-AA-AT-----TACTGATC--AGTAa
gi|117514 : T-A-CGAT--AACTTTCGT--TAGCTG--AA----G----C--A--GCT-A-T--T------TG--CA---TACT-T-----A-AA-TT-----AATT-ATC--TGTAaa
gi|117535 : gaattggcggaatacaT-A-CGAT-----TTTCGT--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTAA-T--T------AG--CT---AA-T-T-----A-GA-AT-----TACTGaat
gi|117532 : -A-CAAT--AATTTTCGT--CAGC-A--AA----G----C--A--G-----T--T------TA--CA---TA-T-T-----A--A-AT-----AACTGATC--AGT
gi|117537 : aaatgtaGAT--AATTATCGT--CAGT-G--AA----G----A--A--GCTAA-T--T------CA--CA---TT-T-T-----A-CA-AT-----TACTGATC--AGTAgaat
gi|117538 : GGT--AATTTCTGC--TAGT-G--AA----G----C--G--GCTAC-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AC-----TTCTGATC--AATa
gi|117539 : AT--AACTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTTAA-T--T------TG--CA---TG-T-A-----A-GA-AT-----TACTGATC--TGTAcaat
gi|117536 : TTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTTAA-T--T------TA--CA---TA-T-T-----ATAA-AT-----TACTGATC--AGTAaat
gi|117533 : gatcaTTTCTGT--CAAT-T--AA----G----C--A--GCTTA-T--T------TG--CA---TA-T-A-----A-GA-AT-----TACTGATT--AGTa
gi|117540 : attttaatgtcaTTCTGT--CAGT-A--AA----G----C--A--AGTCA-T--T------TG--TA---TA-T-T-----A-GA-AT-----TCATAATC--AGTAgaat
gi|117491 : CGT--CAGC-G--GA----G----C--A--GCTAA-T--T------TG--CA---CA-T-C-----A-TA-AT-----TAATGATC--AGTAaat
gi|117506 : attaaataggaaatgttattataaatatA----G----T--A--GCTTA-T--T------TG--TA---TA-T-T-----A-G--AT-----TACTAATC--AGTAaat
gi|117541 : attgaatcggaagtttttaaataaatacct--GCTTA-T--T------TG--CA---TA-T-T-----A-GA-AT-----TACTGATC--AGTAaat
Alignments
lowQualScore : 0 00 1 00 1111 1111 00 00 0 0 0 222222 00 111 2222222 2 33333 0 11111 11
lowQualScore : . .. . .. .... .... .. .. . . . ...... .. ... ....... . ..... . ..... ..
lowQualScore : 7 99 3 99 4444 4444 99 99 4 6 7 888888 99 222 2222222 0 00000 7 77777 00
consensus : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
Reference ( family-424 ) : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117479 : ATTGAATTGGAAAT-TTTCCTATAATTTCCGT--CTGT-G--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATA-----ACTGACC--AGTA
gi|117480 : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-C--AA----G----C--A--TTTAA-T-T------TG--TT---T-------AT-T-----A-GAAGT-----ACTGATC--AGTaat
gi|117481 : ATTGAATCACAAAG-TTTACGATACTTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATA-----ACTGATC--AGTAtaat
gi|117482 : ATTTAATCAGTAAT-TTTACAATTATTTCCAT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATT--TGTA
gi|117483 : ATTGAATAGAAAGT-TTTACGATAATTTCCAT--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAACT-----ATTGATC--AGTaat
gi|117484 : ATTGAATAATAAAT-TTTATGATAATTTCCAT--CAGT-G--AA----G----C--G--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GATAT-----ATTGATC--AGTAcaat
gi|117485 : ATTGAAT-GAAAAT-TTTATGATAATATC-GT--CAGC-A--AA----G----C--A--GTTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAAC-----ACTGATC--AGTAaat
gi|117486 : ATTAAATCAGACAT-TTTATGAAAATCTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CT---T-------AT-T-----A-GATTT-----ATTGCTC--AGTAaat
gi|117487 : ATTTAATGGGAAAT-TTTACAATAATTTCTGTGTCAGA-GCTAA----G----C--A--GCTAA-T-A------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaat
gi|117488 : ATTGAATAGGACAT-TTTACGATAATTTCAGT--CAGC-T--TA----G----C--A--GCTAT-T-T------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--TGTaa
gi|117489 : ATTGAATTGGAAGT-TTTACGGTAATCTCCGA--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-C-----A-GAAtaaa
gi|117490 : ATTGAATCGGAATA-TTTACAATAATTTACGT--CAAC-G--AA----A----G--G--GTAAA-T-T------T---CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117491 : ATTAAATAGGAAAT-GTTATTATAAATATCGT--CAGC-G--GA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---C-------AT-C-----A-TAATT-----AATGATC--AGTAaat
gi|117492 : ATTAAATCGGAATG-TTTACGATAATTTCCGC--CAGC-G--AA----A----C--A--GCCAA-T-T------TG--CA---TTTTACTGAT-C-----A-GAATT-----ACTGAaat
gi|117493 : ATTGAATCCGAACT-TTTACGACAATTTCTAT--CAGT-G--GA----A----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AC-A-----A-GAATT-----ATTAATC--GGTA
gi|117494 : ATTGAATCGAAACA-TTTACGATAAGTTCT-----AGC-G--AA----G----C--A--GCTAC-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-CAATA-----ACTGATA--AGTAaat
gi|117495 : ATTGAATAGGAAAT-GTTACTATAATTTCCGC--CAGC-G--AA----T----A--A--ACTAA-T-T------TG--TA---T-------ATATA----A-GAATA-----AATAATC--AATAaat
gi|117496 : ATTGAATAGGAAAT-GTTACTATAATTTCCGC--CAGC-G--AA----T----A--A--GCTAA-T-T------TG--TA---T-------ATATATATAA-GAATA-----AATAATC--aat
gi|117497 : ATTGAATCAAAAGT-TTTATGATAACTTCCGT--CATT-G--GA----A----C--A--ACTTA-T-T------CA--CA---T-------AT-C-----A-AAATT-----ACTGATC--acaaat
gi|117498 : ATTTAATCAGAAGT-TTTATGATGATTTTTAT--CAGC-A--AA----G----C--A--GCTAATT-T------TG--CA---T-------ATATA----A-GAATTACTAAACTGATA--AGTAccaaat
gi|117499 : ATTAAATTGGAAAT-TTTATGATAATTTCCGT--CAGC-T--GA----A----T--A--CCGTA-T-T------TG--CA---A-------AT-T-----A-ACATA-----ACTGTTC--AGTaat
gi|117500 : ATTATATCGGAAAG-TTAACAATAATATTTGT--CAGC-C--AA----G----C--A--ACAAA-A-T------TG--CA---T-------AT-C-----A-TAATT-----ATTGATC--AGTA
gi|117501 : ATTAAATCAGAAATATTTTCGATAATTTCCGT--CAGA-G--AT----G----G--A--GCTAT-TGT------TA--AA---T-------GT-T-----A-AAATT-----ACTGATC--aat
gi|117502 : ATTGAAGCG-AAAT-TTTATGATAACTTTCGC--CAAC-G--A------------------TAA-G-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGAAC--AGCA
gi|117503 : ACTGAATCAGATAT-TGTACAATAATTTCAAT--CAGC-A--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CC---C-------AT-T-----A-TAATT-----cat
gi|117504 : ATTGAACCAGAAAT-TTAACGGTAATTCCCGT--CAGC-G--TA----G----A--A--GCTAA-
gi|117505 : ATTGAATCGAAGGT-TTTACAAAAAATACGAC--CAGC-G--CA----A----C--A--GTT---T-TAC----TG--CA---T-------AT-T-----A-TAGTT-----ACTGATC--TGTA
gi|117506 : ATTGAATCGGAAGT-TTTTAAATAAATACC-T-----------A----G----T--A--GCTTA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-G-ATT-----ACTAATC--AGTAaat
gi|117507 : TTAAATTGGAACA-TTTACAATAATTTTCTT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTTA-T-C------TG--CG---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACCAACC--AGTaat
gi|117508 : TTGAATTGGAAAT-TT-ACAATAATTTCCGT--CAGT-G--AA----G----C--A--GCTAtaat
gi|117509 : TGAATCGGAAAT-TT-ACGATAATTTCCGT--CAGC-G--TA----GAGTGC--A--GATAA-T-C------TG--CA---T-------AT-C-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117510 : TGAATAGGAAAT-TATGCAACAATTTCTGT--CAGC-G--AA----G----T--A--GCTAA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATCTTAGTAtat
gi|117511 : TGAAATGGAAAT-TTTGAGATAATTTTCCT--CAGC-A--GA----G----T--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GGATT-----AATGATC--AGTtat
gi|117512 : TGAATCGGAATT-ATTACGAAAAATGCCAT--CAGC-G--AA----T----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAGT-----AGTGATC--AGT
gi|117513 : TAAATCGGAC-T-TTAACGATATTTTCCGT--CAAC-G--AA---------------------T-T------TG--CA---T-------TT-C-----A-GGATT-----ACTGTTC--AATAcaa
gi|117514 : TACGATAACTTTCGT--TAGCTG--AA----G----C--A--GCTA--T-T------TG--CA---T-------AC-T-----T-AAATT-----AATTATC--TGTAaat
gi|117515 : gaattggcggaatacaGAATCAGATGT-TTTGCGATAATTTCCAT--CAGC-G--AC----T----C--A--GC----------------------T-------GT-T-----A-GAATT-----ACAGAAC--AGaat
gi|117516 : AATCTGATAT-TTTTCAATAATTTCTGT--CAGC-A--GG----G----C--A--GCTAA-C-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----A
gi|117517 : AATTTGAAGT-TTTACGATAATAACCGC--TAGA-G--GA----A----C--A--GCCTA-T-C------AGAACAGCCT-------AT-T-----A-GAATT-----ACCTATC--AGTAagtaaat
gi|117518 : ATCGAAAAT-TTTACAATAATTTCCGC--CAGC-A--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTAATC--AGTAaat
gi|117519 : ATTGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGT-G--AA----G----C--A--GCTAG-T-T------TG--CA---T-------AT-A-----C-GTATT-----ACTGGCC--AGTAaat
gi|117520 : ATCGGAAAT-GTTACTATAATTTCCGT--CACT-G--AA----G----C--A--GCTGA-T-T------TG--CA---C-------AT-T-----A-GAATG-----ACTGATC--AATAgat
gi|117521 : AAT-TTTATGATCATTTCCTT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCCTT-T-T------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGcat
gi|117522 : attgATTGGACAT-TTTACAATATTTTCCTT--CAAT-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-TTATACATG--TA---T-------AT-C-----G-GAATT-----ACTAATC--AGTgaaat
gi|117523 : ATCGAACAT-TTTACAATAATGTTCAT--CTGC-G--GG----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---G-------AA-T-----T-GTATT-----ACTGATC--AGTgaat
gi|117524 : ACTGAAT-----AT-TTTATGATGATTTTCGT--CGAC-----A----G----CTTA--GCCAA-T-T------TG--CC---T-------AT-A-----A-GAAGT-----ACTGATC--AGTAtaat
gi|117525 : ATCGGAAAT-TTTAAGCTAATTTCCGT--AAAC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TA--Ca
gi|117526 : AAAT-GTTATGATACGTTTCGT--CAAC-A--GA----G----C--A--GCTAA-C-T------TG--CA---T-------AG-T-----A-GAACA-----AATTTTC--AGTAtgatgagtaaat
gi|117527 : attaaATCAGAAAT-TTTACGATAAATTCTGT--AAAC-A--AA----G----C--ATGAATTA-T-T------TG--TA-----------AT-A-----A-GAATT-----ACTGATC--aat
gi|117528 : ATCGGAAAG-TTTGAGATAATTT--GT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCT---------------------T-------AT------------TT-----ACTGATC--AGTtttaat
gi|117529 : GGAATT-TTTACGGTTATTTCTGT--CAGC-G--AA----A----C--C--GCTCA-T-T------TG--CA---T-------AT-G-----A-CAATT-----ACTGAT
gi|117530 : GAAAT-TTTACATTTATTTTCTT--T-GCAG--AA----G----C--------------------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaggcaa
gi|117531 : AAAG-TTTACGACAATTTCCGT--CAGC-G--GACATGA----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaat
gi|117532 : AAAT-GTAACAATAATTTTCGT--CAGC-A--AA----G----C--A--G-----T-T------TA--CA---T-------AT-T-----A--AATA-----ACTGATC--AGTaat
gi|117533 : AT-TTTAATGTCATTTCTGT--CAAT-T--AA----G----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-A-----A-GAATT-----ACTGATT--AGTgaat
gi|117534 : TTACGATAATTTCCGT--TTGA-G--GA----G----T------CTAA-T-T------TG--CA---T-------AA-T-----A-AAATT-----ACTGATC--AGTAgaat
gi|117535 : TACGAT---TTTCGT--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------AG--CT---A-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGaa
gi|117536 : GATCATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTTAA-T-T------TA--CA---T-------AT-T-----ATAAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117537 : GATAATTATCGT--CAGT-G--AA----G----A--A--GCTAA-T-T------CA--CA---T-------TT-T-----A-CAATT-----ACTGATC--AGTAa
gi|117538 : GGTAATTTCTGC--TAGT-G--AA----G----C--G--GCTAC-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAACT-----TCTGATC--AATa
gi|117539 : ATAACTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTTAA-T-T------TG--CA---T-------GT-A-----A-GAATT-----ACTGATC--TGTAcaat
gi|117540 : TTCTGT--CAGT-A--AA----G----C--A--AGTCA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GAATT-----CATAATC--AGTAaat
gi|117541 : --GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaat
Alignments
lowQualScore : 0 00 1 00 1111 1111 00 00 0 0 0 222222 00 111 2222222 2 33333 0 11111 11
lowQualScore : . .. . .. .... .... .. .. . . . ...... .. ... ....... . ..... . ..... ..
lowQualScore : 7 99 3 99 4444 4444 99 99 4 6 7 888888 99 222 2222222 0 00000 7 77777 00
consensus : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
Reference ( family-424 ) : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117479 : ATTGAATTGGAAAT-TTTCCTATAATTTCCGT--CTGT-G--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATA-----ACTGACC--AGTA
gi|117480 : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-C--AA----G----C--A--TTTAA-T-T------TG--TT---T-------AT-T-----A-GAAGT-----ACTGATC--AGTaat
gi|117481 : ATTGAATCACAAAG-TTTACGATACTTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATA-----ACTGATC--AGTAtaat
gi|117482 : ATTTAATCAGTAAT-TTTACAATTATTTCCAT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATT--TGTA
gi|117483 : ATTGAATAGAAAGT-TTTACGATAATTTCCAT--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAACT-----ATTGATC--AGTaat
gi|117484 : ATTGAATAATAAAT-TTTATGATAATTTCCAT--CAGT-G--AA----G----C--G--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GATAT-----ATTGATC--AGTAcaat
gi|117485 : ATTGAAT-GAAAAT-TTTATGATAATATC-GT--CAGC-A--AA----G----C--A--GTTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAAC-----ACTGATC--AGTAaat
gi|117486 : ATTAAATCAGACAT-TTTATGAAAATCTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CT---T-------AT-T-----A-GATTT-----ATTGCTC--AGTAaat
gi|117487 : ATTTAATGGGAAAT-TTTACAATAATTTCTGTGTCAGA-GCTAA----G----C--A--GCTAA-T-A------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaat
gi|117488 : ATTGAATAGGACAT-TTTACGATAATTTCAGT--CAGC-T--TA----G----C--A--GCTAT-T-T------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--TGTaa
gi|117489 : ATTGAATTGGAAGT-TTTACGGTAATCTCCGA--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-C-----A-GAAtaaa
gi|117490 : ATTGAATCGGAATA-TTTACAATAATTTACGT--CAAC-G--AA----A----G--G--GTAAA-T-T------T---CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117491 : ATTAAATAGGAAAT-GTTATTATAAATATCGT--CAGC-G--GA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---C-------AT-C-----A-TAATT-----AATGATC--AGTAaat
gi|117492 : ATTAAATCGGAATG-TTTACGATAATTTCCGC--CAGC-G--AA----A----C--A--GCCAA-T-T------TG--CA---TTTTACTGAT-C-----A-GAATT-----ACTGAaat
gi|117493 : ATTGAATCCGAACT-TTTACGACAATTTCTAT--CAGT-G--GA----A----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AC-A-----A-GAATT-----ATTAATC--GGTA
gi|117494 : ATTGAATCGAAACA-TTTACGATAAGTTCT-----AGC-G--AA----G----C--A--GCTAC-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-CAATA-----ACTGATA--AGTAaat
gi|117495 : ATTGAATAGGAAAT-GTTACTATAATTTCCGC--CAGC-G--AA----T----A--A--ACTAA-T-T------TG--TA---T-------ATATA----A-GAATA-----AATAATC--AATAaat
gi|117496 : ATTGAATAGGAAAT-GTTACTATAATTTCCGC--CAGC-G--AA----T----A--A--GCTAA-T-T------TG--TA---T-------ATATATATAA-GAATA-----AATAATC--aat
gi|117497 : ATTGAATCAAAAGT-TTTATGATAACTTCCGT--CATT-G--GA----A----C--A--ACTTA-T-T------CA--CA---T-------AT-C-----A-AAATT-----ACTGATC--acaaat
gi|117498 : ATTTAATCAGAAGT-TTTATGATGATTTTTAT--CAGC-A--AA----G----C--A--GCTAATT-T------TG--CA---T-------ATATA----A-GAATTACTAAACTGATA--AGTAccaaat
gi|117499 : ATTAAATTGGAAAT-TTTATGATAATTTCCGT--CAGC-T--GA----A----T--A--CCGTA-T-T------TG--CA---A-------AT-T-----A-ACATA-----ACTGTTC--AGTaat
gi|117500 : ATTATATCGGAAAG-TTAACAATAATATTTGT--CAGC-C--AA----G----C--A--ACAAA-A-T------TG--CA---T-------AT-C-----A-TAATT-----ATTGATC--AGTA
gi|117501 : ATTAAATCAGAAATATTTTCGATAATTTCCGT--CAGA-G--AT----G----G--A--GCTAT-TGT------TA--AA---T-------GT-T-----A-AAATT-----ACTGATC--aat
gi|117502 : ATTGAAGCG-AAAT-TTTATGATAACTTTCGC--CAAC-G--A------------------TAA-G-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGAAC--AGCA
gi|117503 : ACTGAATCAGATAT-TGTACAATAATTTCAAT--CAGC-A--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CC---C-------AT-T-----A-TAATT-----cat
gi|117504 : ATTGAACCAGAAAT-TTAACGGTAATTCCCGT--CAGC-G--TA----G----A--A--GCTAA-
gi|117505 : ATTGAATCGAAGGT-TTTACAAAAAATACGAC--CAGC-G--CA----A----C--A--GTT---T-TAC----TG--CA---T-------AT-T-----A-TAGTT-----ACTGATC--TGTA
gi|117506 : ATTGAATCGGAAGT-TTTTAAATAAATACC-T-----------A----G----T--A--GCTTA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-G-ATT-----ACTAATC--AGTAaat
gi|117507 : TTAAATTGGAACA-TTTACAATAATTTTCTT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTTA-T-C------TG--CG---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACCAACC--AGTaat
gi|117508 : TTGAATTGGAAAT-TT-ACAATAATTTCCGT--CAGT-G--AA----G----C--A--GCTAtaat
gi|117509 : TGAATCGGAAAT-TT-ACGATAATTTCCGT--CAGC-G--TA----GAGTGC--A--GATAA-T-C------TG--CA---T-------AT-C-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117510 : TGAATAGGAAAT-TATGCAACAATTTCTGT--CAGC-G--AA----G----T--A--GCTAA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATCTTAGTAtat
gi|117511 : TGAAATGGAAAT-TTTGAGATAATTTTCCT--CAGC-A--GA----G----T--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GGATT-----AATGATC--AGTtat
gi|117512 : TGAATCGGAATT-ATTACGAAAAATGCCAT--CAGC-G--AA----T----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAGT-----AGTGATC--AGT
gi|117513 : TAAATCGGAC-T-TTAACGATATTTTCCGT--CAAC-G--AA---------------------T-T------TG--CA---T-------TT-C-----A-GGATT-----ACTGTTC--AATAcaa
gi|117514 : TACGATAACTTTCGT--TAGCTG--AA----G----C--A--GCTA--T-T------TG--CA---T-------AC-T-----T-AAATT-----AATTATC--TGTAaat
gi|117515 : gaattggcggaatacaGAATCAGATGT-TTTGCGATAATTTCCAT--CAGC-G--AC----T----C--A--GC----------------------T-------GT-T-----A-GAATT-----ACAGAAC--AGaat
gi|117516 : AATCTGATAT-TTTTCAATAATTTCTGT--CAGC-A--GG----G----C--A--GCTAA-C-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----A
gi|117517 : AATTTGAAGT-TTTACGATAATAACCGC--TAGA-G--GA----A----C--A--GCCTA-T-C------AGAACAGCCT-------AT-T-----A-GAATT-----ACCTATC--AGTAagtaaat
gi|117518 : ATCGAAAAT-TTTACAATAATTTCCGC--CAGC-A--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTAATC--AGTAaat
gi|117519 : ATTGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGT-G--AA----G----C--A--GCTAG-T-T------TG--CA---T-------AT-A-----C-GTATT-----ACTGGCC--AGTAaat
gi|117520 : ATCGGAAAT-GTTACTATAATTTCCGT--CACT-G--AA----G----C--A--GCTGA-T-T------TG--CA---C-------AT-T-----A-GAATG-----ACTGATC--AATAgat
gi|117521 : AAT-TTTATGATCATTTCCTT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCCTT-T-T------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGcat
gi|117522 : attgATTGGACAT-TTTACAATATTTTCCTT--CAAT-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-TTATACATG--TA---T-------AT-C-----G-GAATT-----ACTAATC--AGTgaaat
gi|117523 : ATCGAACAT-TTTACAATAATGTTCAT--CTGC-G--GG----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---G-------AA-T-----T-GTATT-----ACTGATC--AGTgaat
gi|117524 : ACTGAAT-----AT-TTTATGATGATTTTCGT--CGAC-----A----G----CTTA--GCCAA-T-T------TG--CC---T-------AT-A-----A-GAAGT-----ACTGATC--AGTAtaat
gi|117525 : ATCGGAAAT-TTTAAGCTAATTTCCGT--AAAC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TA--Ca
gi|117526 : AAAT-GTTATGATACGTTTCGT--CAAC-A--GA----G----C--A--GCTAA-C-T------TG--CA---T-------AG-T-----A-GAACA-----AATTTTC--AGTAtgatgagtaaat
gi|117527 : attaaATCAGAAAT-TTTACGATAAATTCTGT--AAAC-A--AA----G----C--ATGAATTA-T-T------TG--TA-----------AT-A-----A-GAATT-----ACTGATC--aat
gi|117528 : ATCGGAAAG-TTTGAGATAATTT--GT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCT---------------------T-------AT------------TT-----ACTGATC--AGTtttaat
gi|117529 : GGAATT-TTTACGGTTATTTCTGT--CAGC-G--AA----A----C--C--GCTCA-T-T------TG--CA---T-------AT-G-----A-CAATT-----ACTGAT
gi|117530 : GAAAT-TTTACATTTATTTTCTT--T-GCAG--AA----G----C--------------------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaggcaa
gi|117531 : AAAG-TTTACGACAATTTCCGT--CAGC-G--GACATGA----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaat
gi|117532 : AAAT-GTAACAATAATTTTCGT--CAGC-A--AA----G----C--A--G-----T-T------TA--CA---T-------AT-T-----A--AATA-----ACTGATC--AGTaat
gi|117533 : AT-TTTAATGTCATTTCTGT--CAAT-T--AA----G----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-A-----A-GAATT-----ACTGATT--AGTgaat
gi|117534 : TTACGATAATTTCCGT--TTGA-G--GA----G----T------CTAA-T-T------TG--CA---T-------AA-T-----A-AAATT-----ACTGATC--AGTAgaat
gi|117535 : TACGAT---TTTCGT--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------AG--CT---A-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGaa
gi|117536 : GATCATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTTAA-T-T------TA--CA---T-------AT-T-----ATAAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117537 : GATAATTATCGT--CAGT-G--AA----G----A--A--GCTAA-T-T------CA--CA---T-------TT-T-----A-CAATT-----ACTGATC--AGTAa
gi|117538 : GGTAATTTCTGC--TAGT-G--AA----G----C--G--GCTAC-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAACT-----TCTGATC--AATa
gi|117539 : ATAACTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTTAA-T-T------TG--CA---T-------GT-A-----A-GAATT-----ACTGATC--TGTAcaat
gi|117540 : TTCTGT--CAGT-A--AA----G----C--A--AGTCA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GAATT-----CATAATC--AGTAaat
gi|117541 : --GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaat
blockSeqs : T CATG AGTG TATACA GCC TTTACTG A ATATA ACTAA TT
blockSeqs : A . . AC . . A A . .
blockSeqs : . . . . . . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
finalCons : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
Alignments
lowQualScore : 0 00 1 00 1111 1111 00 00 0 0 0 222222 00 111 2222222 2 33333 0 11111 11
lowQualScore : . .. . .. .... .... .. .. . . . ...... .. ... ....... . ..... . ..... ..
lowQualScore : 7 99 3 99 4444 4444 99 99 4 6 7 888888 99 222 2222222 0 00000 7 77777 00
consensus : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
Reference ( family-424 ) : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117479 : ATTGAATTGGAAAT-TTTCCTATAATTTCCGT--CTGT-G--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATA-----ACTGACC--AGTA
gi|117480 : ATTGAATCGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGC-C--AA----G----C--A--TTTAA-T-T------TG--TT---T-------AT-T-----A-GAAGT-----ACTGATC--AGTaat
gi|117481 : ATTGAATCACAAAG-TTTACGATACTTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATA-----ACTGATC--AGTAtaat
gi|117482 : ATTTAATCAGTAAT-TTTACAATTATTTCCAT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATT--TGTA
gi|117483 : ATTGAATAGAAAGT-TTTACGATAATTTCCAT--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAACT-----ATTGATC--AGTaat
gi|117484 : ATTGAATAATAAAT-TTTATGATAATTTCCAT--CAGT-G--AA----G----C--G--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GATAT-----ATTGATC--AGTAcaat
gi|117485 : ATTGAAT-GAAAAT-TTTATGATAATATC-GT--CAGC-A--AA----G----C--A--GTTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAAC-----ACTGATC--AGTAaat
gi|117486 : ATTAAATCAGACAT-TTTATGAAAATCTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CT---T-------AT-T-----A-GATTT-----ATTGCTC--AGTAaat
gi|117487 : ATTTAATGGGAAAT-TTTACAATAATTTCTGTGTCAGA-GCTAA----G----C--A--GCTAA-T-A------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaat
gi|117488 : ATTGAATAGGACAT-TTTACGATAATTTCAGT--CAGC-T--TA----G----C--A--GCTAT-T-T------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--TGTaa
gi|117489 : ATTGAATTGGAAGT-TTTACGGTAATCTCCGA--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-C-----A-GAAtaaa
gi|117490 : ATTGAATCGGAATA-TTTACAATAATTTACGT--CAAC-G--AA----A----G--G--GTAAA-T-T------T---CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117491 : ATTAAATAGGAAAT-GTTATTATAAATATCGT--CAGC-G--GA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---C-------AT-C-----A-TAATT-----AATGATC--AGTAaat
gi|117492 : ATTAAATCGGAATG-TTTACGATAATTTCCGC--CAGC-G--AA----A----C--A--GCCAA-T-T------TG--CA---TTTTACTGAT-C-----A-GAATT-----ACTGAaat
gi|117493 : ATTGAATCCGAACT-TTTACGACAATTTCTAT--CAGT-G--GA----A----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AC-A-----A-GAATT-----ATTAATC--GGTA
gi|117494 : ATTGAATCGAAACA-TTTACGATAAGTTCT-----AGC-G--AA----G----C--A--GCTAC-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-CAATA-----ACTGATA--AGTAaat
gi|117495 : ATTGAATAGGAAAT-GTTACTATAATTTCCGC--CAGC-G--AA----T----A--A--ACTAA-T-T------TG--TA---T-------ATATA----A-GAATA-----AATAATC--AATAaat
gi|117496 : ATTGAATAGGAAAT-GTTACTATAATTTCCGC--CAGC-G--AA----T----A--A--GCTAA-T-T------TG--TA---T-------ATATATATAA-GAATA-----AATAATC--aat
gi|117497 : ATTGAATCAAAAGT-TTTATGATAACTTCCGT--CATT-G--GA----A----C--A--ACTTA-T-T------CA--CA---T-------AT-C-----A-AAATT-----ACTGATC--acaaat
gi|117498 : ATTTAATCAGAAGT-TTTATGATGATTTTTAT--CAGC-A--AA----G----C--A--GCTAATT-T------TG--CA---T-------ATATA----A-GAATTACTAAACTGATA--AGTAccaaat
gi|117499 : ATTAAATTGGAAAT-TTTATGATAATTTCCGT--CAGC-T--GA----A----T--A--CCGTA-T-T------TG--CA---A-------AT-T-----A-ACATA-----ACTGTTC--AGTaat
gi|117500 : ATTATATCGGAAAG-TTAACAATAATATTTGT--CAGC-C--AA----G----C--A--ACAAA-A-T------TG--CA---T-------AT-C-----A-TAATT-----ATTGATC--AGTA
gi|117501 : ATTAAATCAGAAATATTTTCGATAATTTCCGT--CAGA-G--AT----G----G--A--GCTAT-TGT------TA--AA---T-------GT-T-----A-AAATT-----ACTGATC--aat
gi|117502 : ATTGAAGCG-AAAT-TTTATGATAACTTTCGC--CAAC-G--A------------------TAA-G-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGAAC--AGCA
gi|117503 : ACTGAATCAGATAT-TGTACAATAATTTCAAT--CAGC-A--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CC---C-------AT-T-----A-TAATT-----cat
gi|117504 : ATTGAACCAGAAAT-TTAACGGTAATTCCCGT--CAGC-G--TA----G----A--A--GCTAA-
gi|117505 : ATTGAATCGAAGGT-TTTACAAAAAATACGAC--CAGC-G--CA----A----C--A--GTT---T-TAC----TG--CA---T-------AT-T-----A-TAGTT-----ACTGATC--TGTA
gi|117506 : ATTGAATCGGAAGT-TTTTAAATAAATACC-T-----------A----G----T--A--GCTTA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-G-ATT-----ACTAATC--AGTAaat
gi|117507 : TTAAATTGGAACA-TTTACAATAATTTTCTT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCTTA-T-C------TG--CG---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACCAACC--AGTaat
gi|117508 : TTGAATTGGAAAT-TT-ACAATAATTTCCGT--CAGT-G--AA----G----C--A--GCTAtaat
gi|117509 : TGAATCGGAAAT-TT-ACGATAATTTCCGT--CAGC-G--TA----GAGTGC--A--GATAA-T-C------TG--CA---T-------AT-C-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117510 : TGAATAGGAAAT-TATGCAACAATTTCTGT--CAGC-G--AA----G----T--A--GCTAA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATCTTAGTAtat
gi|117511 : TGAAATGGAAAT-TTTGAGATAATTTTCCT--CAGC-A--GA----G----T--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GGATT-----AATGATC--AGTtat
gi|117512 : TGAATCGGAATT-ATTACGAAAAATGCCAT--CAGC-G--AA----T----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAGT-----AGTGATC--AGT
gi|117513 : TAAATCGGAC-T-TTAACGATATTTTCCGT--CAAC-G--AA---------------------T-T------TG--CA---T-------TT-C-----A-GGATT-----ACTGTTC--AATAcaa
gi|117514 : TACGATAACTTTCGT--TAGCTG--AA----G----C--A--GCTA--T-T------TG--CA---T-------AC-T-----T-AAATT-----AATTATC--TGTAaat
gi|117515 : gaattggcggaatacaGAATCAGATGT-TTTGCGATAATTTCCAT--CAGC-G--AC----T----C--A--GC----------------------T-------GT-T-----A-GAATT-----ACAGAAC--AGaat
gi|117516 : AATCTGATAT-TTTTCAATAATTTCTGT--CAGC-A--GG----G----C--A--GCTAA-C-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----A
gi|117517 : AATTTGAAGT-TTTACGATAATAACCGC--TAGA-G--GA----A----C--A--GCCTA-T-C------AGAACAGCCT-------AT-T-----A-GAATT-----ACCTATC--AGTAagtaaat
gi|117518 : ATCGAAAAT-TTTACAATAATTTCCGC--CAGC-A--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTAATC--AGTAaat
gi|117519 : ATTGGAAAT-TTTACGATAATTTCCGT--CAGT-G--AA----G----C--A--GCTAG-T-T------TG--CA---T-------AT-A-----C-GTATT-----ACTGGCC--AGTAaat
gi|117520 : ATCGGAAAT-GTTACTATAATTTCCGT--CACT-G--AA----G----C--A--GCTGA-T-T------TG--CA---C-------AT-T-----A-GAATG-----ACTGATC--AATAgat
gi|117521 : AAT-TTTATGATCATTTCCTT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCCTT-T-T------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGcat
gi|117522 : attgATTGGACAT-TTTACAATATTTTCCTT--CAAT-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-TTATACATG--TA---T-------AT-C-----G-GAATT-----ACTAATC--AGTgaaat
gi|117523 : ATCGAACAT-TTTACAATAATGTTCAT--CTGC-G--GG----G----C--A--GCTAA-T-T------TG--CA---G-------AA-T-----T-GTATT-----ACTGATC--AGTgaat
gi|117524 : ACTGAAT-----AT-TTTATGATGATTTTCGT--CGAC-----A----G----CTTA--GCCAA-T-T------TG--CC---T-------AT-A-----A-GAAGT-----ACTGATC--AGTAtaat
gi|117525 : ATCGGAAAT-TTTAAGCTAATTTCCGT--AAAC-G--AA----G----C--A--GCTAA-T-T------TA--Ca
gi|117526 : AAAT-GTTATGATACGTTTCGT--CAAC-A--GA----G----C--A--GCTAA-C-T------TG--CA---T-------AG-T-----A-GAACA-----AATTTTC--AGTAtgatgagtaaat
gi|117527 : attaaATCAGAAAT-TTTACGATAAATTCTGT--AAAC-A--AA----G----C--ATGAATTA-T-T------TG--TA-----------AT-A-----A-GAATT-----ACTGATC--aat
gi|117528 : ATCGGAAAG-TTTGAGATAATTT--GT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCT---------------------T-------AT------------TT-----ACTGATC--AGTtttaat
gi|117529 : GGAATT-TTTACGGTTATTTCTGT--CAGC-G--AA----A----C--C--GCTCA-T-T------TG--CA---T-------AT-G-----A-CAATT-----ACTGAT
gi|117530 : GAAAT-TTTACATTTATTTTCTT--T-GCAG--AA----G----C--------------------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaggcaa
gi|117531 : AAAG-TTTACGACAATTTCCGT--CAGC-G--GACATGA----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaat
gi|117532 : AAAT-GTAACAATAATTTTCGT--CAGC-A--AA----G----C--A--G-----T-T------TA--CA---T-------AT-T-----A--AATA-----ACTGATC--AGTaat
gi|117533 : AT-TTTAATGTCATTTCTGT--CAAT-T--AA----G----C--A--GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-A-----A-GAATT-----ACTGATT--AGTgaat
gi|117534 : TTACGATAATTTCCGT--TTGA-G--GA----G----T------CTAA-T-T------TG--CA---T-------AA-T-----A-AAATT-----ACTGATC--AGTAgaat
gi|117535 : TACGAT---TTTCGT--CAGC-G--GA----A----C--A--GCTAA-T-T------AG--CT---A-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGaa
gi|117536 : GATCATTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTTAA-T-T------TA--CA---T-------AT-T-----ATAAATT-----ACTGATC--AGTA
gi|117537 : GATAATTATCGT--CAGT-G--AA----G----A--A--GCTAA-T-T------CA--CA---T-------TT-T-----A-CAATT-----ACTGATC--AGTAa
gi|117538 : GGTAATTTCTGC--TAGT-G--AA----G----C--G--GCTAC-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAACT-----TCTGATC--AATa
gi|117539 : ATAACTTCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTTAA-T-T------TG--CA---T-------GT-A-----A-GAATT-----ACTGATC--TGTAcaat
gi|117540 : TTCTGT--CAGT-A--AA----G----C--A--AGTCA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GAATT-----CATAATC--AGTAaat
gi|117541 : --GCTTA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAATT-----ACTGATC--AGTAaat