lowQualScore : 0 00 00 00
lowQualScore : . .. .. ..
lowQualScore : 6 99 99 99
consensus : AATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
Reference ( gi|11687 ) : AATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11641 : AATGACTTTTTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11640 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11645 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCATACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11648 : cAATGGCTTTCTATTGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11688 : cAATGACTTTCTATAGATTATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11651 : AATGACTTTTTATAAGTAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACCTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11650 : cAATGACTTTCTATAGATGATTGGTATGTCAGACAA-AGCA--AACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11652 : cAATGACTTTCTATAGCTAATTGGTACGTCAGACCA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11654 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTTTAGA
gi|11656 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ACAACTTT--CTATAGA
gi|11655 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTGAGACAA-GGCA--AATTTGTCA--ATGACTTT--CTGTAGA
gi|11649 : cAATGACATTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGTA--GACTTGCCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11657 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-AGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--TTATAGA
gi|11646 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGAA--GACTCGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11661 : cAGTGACATTCTATAGATAACTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GTCTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11660 : cAATGGCTTTCTTTTGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11647 : cAATGACTTTGTATAGATAATTGGTATGTTAGACCA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11663 : cAATCACTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTAA--ATGACTTT--TTATAGA
gi|11662 : cAATGACTGTCTATAGAAAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GATTTGTCA--ATGACATT--CTATAGA
gi|11664 : cAATGACTTTCTAAAGATAATTGTTATGTCAGACAA-GGCA--GATTTGTCA--ATGGCTTT--CCATAGA
gi|11653 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGAGAA-GACA--AACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11690 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GAATTGTCA--ATGACATT--TTATAAA
gi|11689 : AATGACTTTCTATAGATAAATGGTATGACAGACAA-GGTA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CAATGGA
gi|11668 : AATGGCTTTCTATAGATAATCTGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CT
gi|11667 : cAATGACTTTCTAAAGGTGATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--AACTTGTCA--ATGGCTTT--ATATAGA
gi|11666 : cAATGACTTTCTATAGATAACTGGTATATCAGACAA-TGCA--GACTAGTCA--ATGACTTT--CTAAAG
gi|11635 : cAATGACTTTCTATAGATAATAGGTATGTCAGACAA-GAAT--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11634 : aacAATGACTTTCTATAGATAATAGGTATGTCAGACAA-GAAT--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11665 : aacAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTAAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGC
gi|11636 : cAATGATTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--GATTAGTCA--ATGACTGT--CTATAGAatacttgtcaatgactttgtataga
gi|11644 : aacAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACA---GTAGTGACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11637 : cAGTAACGTTCTGTAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11639 : aacAATTGCTCTCTATAGATAATTGGTATTACAGACAA-GGCA--GAGTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11659 : atAATGACTTTCTATAGATAATTTGTATATCAGACAA-TGGA--AACTTGTCA--ATGACTTT--CTAAAGA
gi|11691 : cAATGATTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGTA--GACTTGTCA--ATGACT
gi|11678 : AATGACTTTCTGTAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--GTAACGTT--CTGTAGA
gi|11677 : cAATGGCTTTATATAGATAATTTGTATGACAAACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--TTATA
gi|11681 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--GTAACGTT--CTGTAGA
gi|11680 : cAATGACTTTCAATGGAAAATTGGTTTGTCATACAA-GGCA--GACTTTTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11679 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCATTCAA-GGCA--CACATGTAA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11672 : cAATGACTTTATTTAGATAATTGGTATGTCATACAA-GACA--AACTTGTAA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11642 : cAACAACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--GACTAGTCA--ATGACTGT--CTTTAGA
gi|11643 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--AACTTGTTA--ATGG-TGT--CTATAGA
gi|11638 : cAGTAACGTTCTGTAGATATTTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11675 : aacAATGACTGTCTATAGATATATGGTATGTCAGAGAA-GACA--AACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11669 : cAATGACTTTCTTTAGATAATTGGTATGTAAGACAA-GGCA--GACTTGCCA--ATGGTTGT--CT
gi|11658 : cAATGACTGTCTATAGATAATTGGTATGTCATACAG-TACT--GACTTATCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11693 : cAATGATTTTCTATAGACAACTGGTATCTCAGATTA-GGCA--CACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11674 : AATGACTTTCTATAGATAATTGTTATGTTAGACAA-TGTA--GACTTGTCA--ATGAC
gi|11676 : cAATGGCTTTCCATAGATA-TTGGAATGTCATACAA-GACA--GACTTGTCA--GTGACATT--CTATAGA
gi|11684 : cAATGCTTTTCTATAGATAAGTGTTATATTAGACAA-AGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATTGA
gi|11685 : cAATGACTTTAAATGGAAAATTGGTTTGTCATACAA-TGCA--GACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11671 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-TACA--TACTTGTCA--ACAGATAT--CTATAAA
gi|11692 : cAATGACTTTTTATAGATAATTGATAAGTCAGACAGTGGT---GACTTATCA--ATGCTTTT--CTATAGA
gi|11673 : AATGACTTTCTATAGATATTTTGTATGTTAGACAA-GGTG--GATTTGTCA--ATGGCTGTCACTATA
gi|11686 : cAATGACATTTTATAAATAATTGGTATGAAAGACAC-GGCA--GAATTGTCA--ATGACTTT--ATTTAGA
gi|11683 : cAATGACTGTCTTTAGATAATTGATATGTCATACAG-TACT--GATTCATCT--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11682 : cAATGACTGTCTATAGATATTTTGCACGTCAGACAA-AGTT--GATTTGTCA--ATGGCTAT--CTGT
gi|11694 : cATGGCTTTCTATAGATAATCGGTATATCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11670 : CTGTCTATATATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11695 : caatggctatTCTATAAATAATTGGTATGTCAGACAA-TACC--AACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11696 : TCTATAGATAATTTGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11697 : AGATAATTGGTATGTCAGGCAA-GGCT--GACTTGTCAATATGTCTGT--CTATAGA
Alignments
lowQualScore : 0 00 00 00
lowQualScore : . .. .. ..
lowQualScore : 6 99 99 99
consensus : AATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
Reference ( family-423 ) : AATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11634 : AATGACTTTCTATAGATAATAGGTATGTCAGACAA-GAAT--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11635 : aacAATGACTTTCTATAGATAATAGGTATGTCAGACAA-GAAT--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11636 : aacAATGATTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--GATTAGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11637 : aacAGTAACGTTCTGTAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11638 : aacAGTAACGTTCTGTAGATATTTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11639 : aacAATTGCTCTCTATAGATAATTGGTATTACAGACAA-GGCA--GAGTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11640 : atAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11641 : cAATGACTTTTTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11642 : cAACAACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--GACTAGTCA--ATGACTGT--CTTTAGA
gi|11643 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--AACTTGTTA--ATGG-TGT--CTATAGA
gi|11644 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACA---GTAGTGACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11645 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCATACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11646 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGAA--GACTCGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11647 : cAATGACTTTGTATAGATAATTGGTATGTTAGACCA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11648 : cAATGGCTTTCTATTGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11649 : cAATGACATTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGTA--GACTTGCCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11650 : cAATGACTTTCTATAGATGATTGGTATGTCAGACAA-AGCA--AACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11651 : cAATGACTTTTTATAAGTAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACCTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11652 : cAATGACTTTCTATAGCTAATTGGTACGTCAGACCA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11653 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGAGAA-GACA--AACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11654 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTTTAGA
gi|11655 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTGAGACAA-GGCA--AATTTGTCA--ATGACTTT--CTGTAGA
gi|11656 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ACAACTTT--CTATAGA
gi|11657 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-AGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--TTATAGA
gi|11658 : cAATGACTGTCTATAGATAATTGGTATGTCATACAG-TACT--GACTTATCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11659 : cAATGACTTTCTATAGATAATTTGTATATCAGACAA-TGGA--AACTTGTCA--ATGACTTT--CTAAAGA
gi|11660 : cAATGGCTTTCTTTTGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11661 : cAGTGACATTCTATAGATAACTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GTCTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11662 : cAATGACTGTCTATAGAAAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GATTTGTCA--ATGACATT--CTATAGA
gi|11663 : cAATCACTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTAA--ATGACTTT--TTATAGA
gi|11664 : cAATGACTTTCTAAAGATAATTGTTATGTCAGACAA-GGCA--GATTTGTCA--ATGGCTTT--CCATAGA
gi|11665 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTAAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGC
gi|11666 : cAATGACTTTCTATAGATAACTGGTATATCAGACAA-TGCA--GACTAGTCA--ATGACTTT--CTAAAGatacttgtcaatgactttgtataga
gi|11667 : cAATGACTTTCTAAAGGTGATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--AACTTGTCA--ATGGCTTT--ATATAGA
gi|11668 : cAATGGCTTTCTATAGATAATCTGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CT
gi|11669 : cAATGACTTTCTTTAGATAATTGGTATGTAAGACAA-GGCA--GACTTGCCA--ATGGTTGT--CT
gi|11670 : cCTGTCTATATATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11671 : caatggctatAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-TACA--TACTTGTCA--ACAGATAT--CTATAAA
gi|11672 : cAATGACTTTATTTAGATAATTGGTATGTCATACAA-GACA--AACTTGTAA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11673 : cAATGACTTTCTATAGATATTTTGTATGTTAGACAA-GGTG--GATTTGTCA--ATGGCTGTCACTATA
gi|11674 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGTTATGTTAGACAA-TGTA--GACTTGTCA--ATGAC
gi|11675 : cAATGACTGTCTATAGATATATGGTATGTCAGAGAA-GACA--AACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11676 : cAATGGCTTTCCATAGATA-TTGGAATGTCATACAA-GACA--GACTTGTCA--GTGACATT--CTATAGA
gi|11677 : cAATGGCTTTATATAGATAATTTGTATGACAAACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--TTATA
gi|11678 : cAATGACTTTCTGTAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--GTAACGTT--CTGTAGA
gi|11679 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCATTCAA-GGCA--CACATGTAA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11680 : cAATGACTTTCAATGGAAAATTGGTTTGTCATACAA-GGCA--GACTTTTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11681 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--GTAACGTT--CTGTAGA
gi|11682 : cAATGACTGTCTATAGATATTTTGCACGTCAGACAA-AGTT--GATTTGTCA--ATGGCTAT--CTGT
gi|11683 : cAATGACTGTCTTTAGATAATTGATATGTCATACAG-TACT--GATTCATCT--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11684 : cAATGCTTTTCTATAGATAAGTGTTATATTAGACAA-AGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATTGA
gi|11685 : cAATGACTTTAAATGGAAAATTGGTTTGTCATACAA-TGCA--GACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11686 : cAATGACATTTTATAAATAATTGGTATGAAAGACAC-GGCA--GAATTGTCA--ATGACTTT--ATTTAGA
gi|11687 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11688 : AATGACTTTCTATAGATTATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11689 : AATGACTTTCTATAGATAAATGGTATGACAGACAA-GGTA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CAATGGA
gi|11690 : AATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GAATTGTCA--ATGACATT--TTATAAA
gi|11691 : AATGATTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGTA--GACTTGTCA--ATGACT
gi|11692 : AATGACTTTTTATAGATAATTGATAAGTCAGACAGTGGT---GACTTATCA--ATGCTTTT--CTATAGA
gi|11693 : AATGATTTTCTATAGACAACTGGTATCTCAGATTA-GGCA--CACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11694 : ATGGCTTTCTATAGATAATCGGTATATCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11695 : TCTATAAATAATTGGTATGTCAGACAA-TACC--AACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11696 : TCTATAGATAATTTGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11697 : AGATAATTGGTATGTCAGGCAA-GGCT--GACTTGTCAATATGTCTGT--CTATAGA
Alignments
lowQualScore : 0 00 00 00
lowQualScore : . .. .. ..
lowQualScore : 6 99 99 99
consensus : AATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
Reference ( family-423 ) : AATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11634 : AATGACTTTCTATAGATAATAGGTATGTCAGACAA-GAAT--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11635 : aacAATGACTTTCTATAGATAATAGGTATGTCAGACAA-GAAT--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11636 : aacAATGATTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--GATTAGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11637 : aacAGTAACGTTCTGTAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11638 : aacAGTAACGTTCTGTAGATATTTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11639 : aacAATTGCTCTCTATAGATAATTGGTATTACAGACAA-GGCA--GAGTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11640 : atAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11641 : cAATGACTTTTTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11642 : cAACAACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--GACTAGTCA--ATGACTGT--CTTTAGA
gi|11643 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--AACTTGTTA--ATGG-TGT--CTATAGA
gi|11644 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACA---GTAGTGACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11645 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCATACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11646 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGAA--GACTCGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11647 : cAATGACTTTGTATAGATAATTGGTATGTTAGACCA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11648 : cAATGGCTTTCTATTGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11649 : cAATGACATTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGTA--GACTTGCCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11650 : cAATGACTTTCTATAGATGATTGGTATGTCAGACAA-AGCA--AACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11651 : cAATGACTTTTTATAAGTAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACCTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11652 : cAATGACTTTCTATAGCTAATTGGTACGTCAGACCA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11653 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGAGAA-GACA--AACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11654 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTTTAGA
gi|11655 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTGAGACAA-GGCA--AATTTGTCA--ATGACTTT--CTGTAGA
gi|11656 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ACAACTTT--CTATAGA
gi|11657 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-AGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--TTATAGA
gi|11658 : cAATGACTGTCTATAGATAATTGGTATGTCATACAG-TACT--GACTTATCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11659 : cAATGACTTTCTATAGATAATTTGTATATCAGACAA-TGGA--AACTTGTCA--ATGACTTT--CTAAAGA
gi|11660 : cAATGGCTTTCTTTTGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11661 : cAGTGACATTCTATAGATAACTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GTCTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11662 : cAATGACTGTCTATAGAAAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GATTTGTCA--ATGACATT--CTATAGA
gi|11663 : cAATCACTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTAA--ATGACTTT--TTATAGA
gi|11664 : cAATGACTTTCTAAAGATAATTGTTATGTCAGACAA-GGCA--GATTTGTCA--ATGGCTTT--CCATAGA
gi|11665 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTAAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGC
gi|11666 : cAATGACTTTCTATAGATAACTGGTATATCAGACAA-TGCA--GACTAGTCA--ATGACTTT--CTAAAGatacttgtcaatgactttgtataga
gi|11667 : cAATGACTTTCTAAAGGTGATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--AACTTGTCA--ATGGCTTT--ATATAGA
gi|11668 : cAATGGCTTTCTATAGATAATCTGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CT
gi|11669 : cAATGACTTTCTTTAGATAATTGGTATGTAAGACAA-GGCA--GACTTGCCA--ATGGTTGT--CT
gi|11670 : cCTGTCTATATATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11671 : caatggctatAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-TACA--TACTTGTCA--ACAGATAT--CTATAAA
gi|11672 : cAATGACTTTATTTAGATAATTGGTATGTCATACAA-GACA--AACTTGTAA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11673 : cAATGACTTTCTATAGATATTTTGTATGTTAGACAA-GGTG--GATTTGTCA--ATGGCTGTCACTATA
gi|11674 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGTTATGTTAGACAA-TGTA--GACTTGTCA--ATGAC
gi|11675 : cAATGACTGTCTATAGATATATGGTATGTCAGAGAA-GACA--AACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11676 : cAATGGCTTTCCATAGATA-TTGGAATGTCATACAA-GACA--GACTTGTCA--GTGACATT--CTATAGA
gi|11677 : cAATGGCTTTATATAGATAATTTGTATGACAAACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--TTATA
gi|11678 : cAATGACTTTCTGTAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--GTAACGTT--CTGTAGA
gi|11679 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCATTCAA-GGCA--CACATGTAA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11680 : cAATGACTTTCAATGGAAAATTGGTTTGTCATACAA-GGCA--GACTTTTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11681 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--GTAACGTT--CTGTAGA
gi|11682 : cAATGACTGTCTATAGATATTTTGCACGTCAGACAA-AGTT--GATTTGTCA--ATGGCTAT--CTGT
gi|11683 : cAATGACTGTCTTTAGATAATTGATATGTCATACAG-TACT--GATTCATCT--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11684 : cAATGCTTTTCTATAGATAAGTGTTATATTAGACAA-AGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATTGA
gi|11685 : cAATGACTTTAAATGGAAAATTGGTTTGTCATACAA-TGCA--GACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11686 : cAATGACATTTTATAAATAATTGGTATGAAAGACAC-GGCA--GAATTGTCA--ATGACTTT--ATTTAGA
gi|11687 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11688 : AATGACTTTCTATAGATTATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11689 : AATGACTTTCTATAGATAAATGGTATGACAGACAA-GGTA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CAATGGA
gi|11690 : AATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GAATTGTCA--ATGACATT--TTATAAA
gi|11691 : AATGATTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGTA--GACTTGTCA--ATGACT
gi|11692 : AATGACTTTTTATAGATAATTGATAAGTCAGACAGTGGT---GACTTATCA--ATGCTTTT--CTATAGA
gi|11693 : AATGATTTTCTATAGACAACTGGTATCTCAGATTA-GGCA--CACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11694 : ATGGCTTTCTATAGATAATCGGTATATCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11695 : TCTATAAATAATTGGTATGTCAGACAA-TACC--AACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11696 : TCTATAGATAATTTGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11697 : AGATAATTGGTATGTCAGGCAA-GGCT--GACTTGTCAATATGTCTGT--CTATAGA
blockSeqCons :
originalCons : AATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
finalCons : AATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
Alignments
lowQualScore : 0 00 00 00
lowQualScore : . .. .. ..
lowQualScore : 6 99 99 99
consensus : AATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
Reference ( family-423 ) : AATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11634 : AATGACTTTCTATAGATAATAGGTATGTCAGACAA-GAAT--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11635 : aacAATGACTTTCTATAGATAATAGGTATGTCAGACAA-GAAT--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11636 : aacAATGATTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--GATTAGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11637 : aacAGTAACGTTCTGTAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11638 : aacAGTAACGTTCTGTAGATATTTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11639 : aacAATTGCTCTCTATAGATAATTGGTATTACAGACAA-GGCA--GAGTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11640 : atAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11641 : cAATGACTTTTTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11642 : cAACAACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--GACTAGTCA--ATGACTGT--CTTTAGA
gi|11643 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GACT--AACTTGTTA--ATGG-TGT--CTATAGA
gi|11644 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACA---GTAGTGACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11645 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCATACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11646 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGAA--GACTCGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11647 : cAATGACTTTGTATAGATAATTGGTATGTTAGACCA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTGT--CTATAGA
gi|11648 : cAATGGCTTTCTATTGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11649 : cAATGACATTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGTA--GACTTGCCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11650 : cAATGACTTTCTATAGATGATTGGTATGTCAGACAA-AGCA--AACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11651 : cAATGACTTTTTATAAGTAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACCTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11652 : cAATGACTTTCTATAGCTAATTGGTACGTCAGACCA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11653 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGAGAA-GACA--AACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11654 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTTTAGA
gi|11655 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTGAGACAA-GGCA--AATTTGTCA--ATGACTTT--CTGTAGA
gi|11656 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ACAACTTT--CTATAGA
gi|11657 : cAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-AGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--TTATAGA
gi|11658 : cAATGACTGTCTATAGATAATTGGTATGTCATACAG-TACT--GACTTATCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11659 : cAATGACTTTCTATAGATAATTTGTATATCAGACAA-TGGA--AACTTGTCA--ATGACTTT--CTAAAGA
gi|11660 : cAATGGCTTTCTTTTGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11661 : cAGTGACATTCTATAGATAACTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GTCTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11662 : cAATGACTGTCTATAGAAAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GATTTGTCA--ATGACATT--CTATAGA
gi|11663 : cAATCACTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTAA--ATGACTTT--TTATAGA
gi|11664 : cAATGACTTTCTAAAGATAATTGTTATGTCAGACAA-GGCA--GATTTGTCA--ATGGCTTT--CCATAGA
gi|11665 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTAAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGC
gi|11666 : cAATGACTTTCTATAGATAACTGGTATATCAGACAA-TGCA--GACTAGTCA--ATGACTTT--CTAAAGatacttgtcaatgactttgtataga
gi|11667 : cAATGACTTTCTAAAGGTGATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--AACTTGTCA--ATGGCTTT--ATATAGA
gi|11668 : cAATGGCTTTCTATAGATAATCTGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CT
gi|11669 : cAATGACTTTCTTTAGATAATTGGTATGTAAGACAA-GGCA--GACTTGCCA--ATGGTTGT--CT
gi|11670 : cCTGTCTATATATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11671 : caatggctatAATGGCTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-TACA--TACTTGTCA--ACAGATAT--CTATAAA
gi|11672 : cAATGACTTTATTTAGATAATTGGTATGTCATACAA-GACA--AACTTGTAA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11673 : cAATGACTTTCTATAGATATTTTGTATGTTAGACAA-GGTG--GATTTGTCA--ATGGCTGTCACTATA
gi|11674 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGTTATGTTAGACAA-TGTA--GACTTGTCA--ATGAC
gi|11675 : cAATGACTGTCTATAGATATATGGTATGTCAGAGAA-GACA--AACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11676 : cAATGGCTTTCCATAGATA-TTGGAATGTCATACAA-GACA--GACTTGTCA--GTGACATT--CTATAGA
gi|11677 : cAATGGCTTTATATAGATAATTTGTATGACAAACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--TTATA
gi|11678 : cAATGACTTTCTGTAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--GTAACGTT--CTGTAGA
gi|11679 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCATTCAA-GGCA--CACATGTAA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11680 : cAATGACTTTCAATGGAAAATTGGTTTGTCATACAA-GGCA--GACTTTTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11681 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--GTAACGTT--CTGTAGA
gi|11682 : cAATGACTGTCTATAGATATTTTGCACGTCAGACAA-AGTT--GATTTGTCA--ATGGCTAT--CTGT
gi|11683 : cAATGACTGTCTTTAGATAATTGATATGTCATACAG-TACT--GATTCATCT--ATGGCTTT--CTATAGA
gi|11684 : cAATGCTTTTCTATAGATAAGTGTTATATTAGACAA-AGCA--GACTTGTCA--ATGGCTTT--CTATTGA
gi|11685 : cAATGACTTTAAATGGAAAATTGGTTTGTCATACAA-TGCA--GACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11686 : cAATGACATTTTATAAATAATTGGTATGAAAGACAC-GGCA--GAATTGTCA--ATGACTTT--ATTTAGA
gi|11687 : cAATGACTTTCTATAGATAATTGGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11688 : AATGACTTTCTATAGATTATTGGTATGACAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11689 : AATGACTTTCTATAGATAAATGGTATGACAGACAA-GGTA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CAATGGA
gi|11690 : AATGACTTTCTATAGATAATTGATATGTCAGACAA-GGCA--GAATTGTCA--ATGACATT--TTATAAA
gi|11691 : AATGATTTTCTATAGATAATTGGTATGACAGACAA-GGTA--GACTTGTCA--ATGACT
gi|11692 : AATGACTTTTTATAGATAATTGATAAGTCAGACAGTGGT---GACTTATCA--ATGCTTTT--CTATAGA
gi|11693 : AATGATTTTCTATAGACAACTGGTATCTCAGATTA-GGCA--CACTTGTAA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11694 : ATGGCTTTCTATAGATAATCGGTATATCAGACAA-GGCA--GACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11695 : TCTATAAATAATTGGTATGTCAGACAA-TACC--AACTTGTCA--ATGACTTT--CTATAGA
gi|11696 : TCTATAGATAATTTGTATGTCAGACAA-GGCA--GACTCAACA--ATGATTTT--CTATAGA
gi|11697 : AGATAATTGGTATGTCAGGCAA-GGCT--GACTTGTCAATATGTCTGT--CTATAGA