lowQualScore : 1 22 22222222222 11 1 555555555555555555 1 4444444444444444444444 1111111111 11111111111111111 1111111111111 222222222222222222 222222 2 1 1111 111111111 222222222222 1111111111 1 11111111 999999999999999999999999999999999999999999 1 111111111 222222222222222222 111 1111111 111 11 1 4444444444444444444 2222222222
lowQualScore : 5 4 0 11 99 77 11 222 22 88888888888 3 1 2 8 333 1 222 3333 2222 1 22 3333 3 2 444 22 2 444 2 6 8888888 77777 0 888888888888888888 1 2 7777777777777777777777 5555555555 7 7 6 44 5 555 3 33333333333333333 3 77777 1 5 2 6 33 88888888888 0 77777 7777777777777 222222222222222222 000 999999 2 777777 33 2 5 5555 5 6 2 33 3 0 6 0000 5 6 666666666 111111111111 1 7777777777 6 0 4 44444444 666666666666666666666666666666666666666666 99999 555 2 555 111111111 2 000000000000000000 22 9999999 3 1 5555 444 33 777 2 2 33 1 0 2 8 4 33 2 4 2 33 2 444 4 6 77777 0000000 4 333 11 6666 8 888 3 3 0000000000000000000 6 6666666666 888888 2 2 1 3 4
lowQualScore : . . . .. .. .. .. ... .. ........... . . . . ... . ... .... .... . .. .... . . ... .. . ... . . ....... ..... . .................. . . ...................... .......... . . . .. . ... . ................. . ..... . . . . .. ........... . ..... ............. .................. ... ...... . ...... .. . . .... . . . .. . . . .... . . ......... ............ . .......... . . . ........ .......................................... ..... ... . ... ......... . .................. .. ....... . . .... ... .. ... . . .. . . . . . .. . . . .. . ... . . ..... ....... . ... .. .... . ... . . ................... . .......... ...... . . . . .
lowQualScore : 2 5 9 00 33 00 66 000 77 55555555555 6 9 8 4 555 4 333 9999 8888 4 00 3333 3 7 777 99 7 777 9 1 7777777 77777 2 777777777777777777 8 9 7777777777777777777777 9999999999 6 2 7 22 7 444 3 22222222222222222 3 11111 1 7 5 0 77 44444444444 1 11111 1111111111111 222222222222222222 888 222222 7 777777 77 7 2 7777 9 6 9 99 7 4 0 6666 0 0 000000000 333333333333 1 5555555555 6 2 4 55555555 333333333333333333333333333333333333333333 11111 888 2 444 444444444 9 222222222222222222 88 3333333 4 7 3333 111 11 111 4 4 22 8 2 7 9 4 11 2 4 2 11 2 111 7 0 11111 0000000 7 888 11 5555 6 555 1 8 8888888888888888888 2 2222222222 888888 5 3 8 3 5
consensus : CGAGGATTGANCCGACAACTTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTG-A--C---G--ACA--A--C-CCTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATT---CATGCT-GTA-TTCAA---GCATA-AATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAA-----ATATG-----AC-----T-----AAATGTATATCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCNAGGA-CACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATGNACC-AACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-ATATATATGAAA------TATACAAT--CT-GGACATAAGTTCCCTTCAGTTC----TTGTCCAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAA--ACAAAATAGACAAAAAATATAGACCATGTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAG----------GCAGTCAGAAAGAGTAAGCATAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------TTT-----TAA---AAGAGA---ATAA---------TTTCATTAAAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCT-CTTTTC---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAANAG---AAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CA-C-------AGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
Reference ( gi|160917 ) : CGATGATTGATCCGACATTTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTA-A--C---A--ACA--A--C-CCTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATT---CATACT-TTA-TTCAA---GCATA-AATCGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAA-----ATATG-----AC-----C-----AAATGTATATGTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAATGTCTAGGA-CACAGGACTAAAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTTCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAACCCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-ATATATATGAAA------TATACAAT--CT-GGACATAGGTTCCCTTCAGTTC----TTGTCCAGACACTTCTACAATCTGGTCGTAATACTAAACAAG-ACAA--ACAGAATAGACAAAAAGTATAGACCGTGTATGATTATAAACTG----CAG-TCCATGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAG----------GCAGTCAGAAAGAGTAATCATAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------TTT-----TAA---AACAGA---ATAA---------TTTCATTAAAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCT-TTTTTC---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATGTTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAG---AAATCAA----TATTTATAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CA-A-------AGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCTTTTTTT
gi|160913 : CGAAGATTGATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTA-A--A---A--ACA--A--A-ACTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCAAAACACC-AGACATT---CATACT-GTA-TTCAA---GCATA-AATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAA-----ATATG-----ACTTAACC-----AAATGTATATTTCTGGA----------CA----------AA----------CATTGGAAACGTCTAGGA-CACAGGATTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GTCATGGCAGTAATTTGAACCTTCATCTCCCATGTACTA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CAAT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAACC-AACACATTTACTTAAGCTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-ATATATATGAAA------TATACAAT--CT-GGACATAGGTTCCCTTCAGTTC----TTGTCCAGACACTTCTACCATCTGGTTGTAATACTAAACAAG-ACAA--ACAAAGTAGACAAAAAATATAGACCATGTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAG----------GCAGTCAGAAAGAGTAAGCATAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTATAAAAAAATAT-A--------------C-AT-------TTT-----TAA---AAGAGA---ATAA---------TTTCATTAAAA-A--A---A--A--CA----AGACATT-------TTTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCT-CTTTTC---A-T-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTATTAAGATAATGGACTTAAAAATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAG---AAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CA-C-------AGCACT-ACA----TTT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATAAC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTTCTCCTTTTTT
gi|160916 : CGAGGATTGATCCGACAACTTTGGCAGCGAGAAGTAAATGGTTATTTG-A--CGACA--ACA--A--C-ACTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TT----AT-TCTAGACACC-CGACATT---CATACT-GTAATTCAA---GCATA-AATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAA-----ATATG-----AC-----TTAACTAAATGTATATTTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGA-CACAGGACCATAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GTGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTGATTTGAATCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACACAAACC-AACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGATGAGGCATCCAA-ATATATATGAAA------TATACAAT--CT-GGACATAAATTCCCTTCAGTTC----TTGTCCAGACACTTTTACAATCTGGTTATAATACTAAACAAG-ACAA--ACAAAATAGACAAAAAATATAGACGATGTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACAGAAA---------AAATAA-----------TTTTCGAATGTAAG----------GCAGTCAGAAAGAGTAAGCATAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTATAAAAAAATAT-A--------------C-AT-------TTT-----TAA---AAGAGA---ATAA---------TTTCATTAAAA-A--ATAAA--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCT-CTTTTC---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CATATTATCATGTTGTGCAATGAAAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGCAAAT-------TAATAG---AAATTAA----TATTTGACATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CA-C-------AGCACT-ACA----TGT--TTGTTTT-TAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCTACTCCTCCTTTTTT
gi|160914 : CGAGGATTGATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTG-A--C---A--ACA--A--C-ACTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATT---CATACT-GTA-TTCAA---GCATA-AATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAA-----ATGTG-----ACTTAACC-----AAATGTATATTTCTGCA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGA-CACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCATTGATTTGAACTTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGAATGCATACATAAACC-AACACATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATCGAA-ATATATATGAAA------TATACAAT--CT-GGACATATGTTCTCTTTAGTTC----TTGTCCAGACACTTCTACAATCTGATTGTAATACCAAACAAG-ACAA--ACAAAATAGACAAAAAATATAAATGATGTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAA-----------TTTTCGAATGTAAG----------GCAGTCAGAAAGAGTAAGAATAAGTAAGAAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTTATAAAAAAATATA--------------C-AT-------TTT-----TAA---AAGAGA---ATAA---------TTTCATTTAAA-A--ATAAA--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCAATT-CTTTTT---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTCGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCA---TGTACTAAGATAATGAGCTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAG---AAATTAA----TATTTGAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTGATGAAATGCACTTTTGTAA--------CA-C-------AGAACT-TCA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTCTTCCTTTTTT
gi|160915 : CGAGGAATGATCCGACAACTTCGGCAATGAGAAGTAAGTGGCTATTTG-A--C---A--ACA--A--C-ACTATGAACAAATATGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-T--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATT---CATATT-GCA-TTCAA---GCATA-AATTATGTTCTTGCAGCTTA-------AATGTTAAA-----ATGTG-----AC-----T-----TAAC---TAGG-CAGGGTCAAT-----CA----------AA----------TATTGAAAACGTCAAGGG-CACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------AA-TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ATA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAACC-AATACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGTTGAGGCATCAAT-ATATATATGAAA------TATACAAT--CT-GGACATAGGTTCCCTTCAGTTC----TTGTCCAGGCACTTCTACAATCTGGATGCAATACTAAACAAG-ACAA--ACAAAATAGACACAAACTATAGACCATGTATGATTATAAACTA----CAG-TCCACGAAAC---------ATATAC-----------TTTTCTAATGTAAG----------GCAGTCAGAAAGAGTAAGCATAAGTTA
gi|160920 : CGAGGATTGATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATAGTTATTTG-A--C---A--ACA--A--C-ACTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-ATACATT---CATACT-GTA-TTCAA---GCATA-AATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAC-----ATATGACTTAAC-----C-----AAATGTATATTTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGA-CACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------ACA-----A
gi|160923 : CGAGGATTGA-CCAACAATTTAAGCGGTGAGAAGTAAGTGGCCATTTG-A--C---A--ACA--C--CACCT-TTGACGACTCTGCCACCAAAAG---AGC---CA---TT----TAT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGGCATT---CATGCTGTTA--TCTA---GCATT-AGTAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAA-----CAACG-----ACTTAT-T-----AAATATATTTCTCTGGACAGGATTAATCA----------AA----------TGTTGGAAA-GTTCAGGGTCACTTGACTAGAA-AA-ACA-----A------T--ACAA-AAGA-----AGTCTTTG-GACACATCAGTAATTTTGATCTCCATCTCCAATGTACCA--AGG---A------ATA-----CTA-------------TATT-------T----A-----CATAAAAGCAT-----GACTGTACACATGTACTTAAATTCCCAAATTAGCAGCTGAAGTATCCAA-ATA
gi|160922 : CGAGGAATGAACCAACAACTTTGGCAGTGAGAAGTTAGTGGTGATTTG-A--C---A--ACA-------CCT-TGGACAACTCTGCC
gi|160927 : GAGGAATGAACCAACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTG-A--C---A--ACA--A--CACCT-TGGACAACTCCGCCTCAAAAAGT--AAC---CT---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAAACACC-AGTCATT---CATTCT-GTA-TTCAA---GCATA-AATAGAGTTCATGTTGTTTA-------AATATTAA
gi|160918 : GATTGATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGTGGTTCTTTG-A--C---A--ACA--A--C-ATTATGGACA---------CAGAAGG---AAC---TG---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATT---CATACT-GTA-TTCAA---GCATA-----GAGTTCTTGCAGTTAA-------AATGTTAAA-----ATATGACTTAAC-----T-----AAATATATATTTCACGA----------CA----------cagatttacttaagttcccaaat
gi|160919 : caagGATTGATCCGACAACGTTGGCAGTGAGAAGTAAGTGATTATTTG-A--C---A--ACA--A--C-ACTATGGATACCTCTGTCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATT---CATGCT-GTA-TTTAA---GCATA-AATAGAGTTCTTGCAGTTTAAATCATTAATGTTAAA-----ATATGACTTAAC-----C-----AAATGTATAATTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGA-CACAGGACTAGACAGA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AATCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCTCTGTACCA--AGA---A------gggttagtctgtggacatggcagtaatttgatcttccatctcccatgtaccaatagaaaaaaaaatcattgtgcatgactgcatccattaataaatccatttacttgagttccataataagcagctagggcatccaaatatatatgaaatatacaatctggacataaattcccatcagttcttgtcccgacacttctacaatcaggttgtaatacaaaacaagacaaacaaaatagacaaaacatatagaccatgtatgtttataaactgcagtccacggaaaatatacttttcgaatgtaaggcagtcagaaagagtaagcatgagtta
gi|160921 : caagGATTGATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGATTATTTG-A--C---A--ACA--A--C-ATTATGGACAAATCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TC
gi|160926 : caagATTGAACCTACGACCTTAGCAGTGAGAAGTAAATGAT--CTTG-A--T------ACG--G--CGCCT-TAGACCATTCTGCCAC-GGAGG---ACCCTTCA---TT----T------TA----AT-
gi|160934 : cggaaTTGATCCAACATCCTCAGTGGTGAGAAGTAAATGGCCATCTG-A--C---A--ACA--G-----TGATGGAGGACTC
gi|160933 : TTGAACCTACGACCTTAGCGGTGAGAGGTAAATGAT--TTTG-A------A--ACA--G--CACCT-TAGACCACTCGGCCGC-GGAGG---ATC---CA---TT----GTT-A--CA----ATGTCCAAA
gi|160935 : TCGAACCAACGACTTTAGCGGTGAGAGGTAAATGGTC-TTGAGA--C---G--GCA--A--C-T---TAGACCATTCGGCCAC-GAAGA---ACC---CT---TT----TCT-G--TG----GT-TTTATACA
gi|160937 : TCGAACCGACGACCTCAGCGGTGAGAAGTAAGTAGCCATTAG-G--T---T--ACA--G--C-GCTGT--ACCACTCAGCCAC-GGAGG---A-----CA---CT----T
gi|160936 : TCGAACCTACAACCTTGGTGATGAGAGGTAAGTGATC--TTA-ATAC---A--GCG--A--C-T---TAGACCACTTTGCCACAG-AGG---ACC---C----------TGT-G--TT----AT-T
gi|160938 : TGAACTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTG-A--C---A--ACA--A--CACCT-TGGACAACTCTGCCTAAAAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAATCACC-AGACATT---CATGCT-GTA-TTCAA---GCATA-AATAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATATTAAA-----ATAT
gi|160940 : ATCC-ACAACCTCGGCAGCGAGAGGTAAGTGATC-TTCAGA--C---A--GTG-------CCT-TGGACCTCTCGGCCTCAG-AGA---AAC---CC---TT----TAT-A--ttacttaagttcccaaat
gi|160941 : CCAACAACTTAAGTGGTGAGAAGTAAATGGTCATTTG-A--C---A--TCA--C--CACCT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AA------------------------------------ACAAC-AGACATT---CATGCT-GTA-GTCAA---GAATT-AGTAGAGTATTTGTGGTTTA-------AATTTTAAA-----CAATT-----AC-----TTATT-ACATGTATTTCTCTGGA----------CAGGATCAATCAAA----------TGTTGGAAACTTCAGGGT-CACTTTACTAGAA-AA-ACA-----A------T--TTCA-GAGC-----AGTCTTTG-GACACGTCCGGTATTTGGACCTCCATCTCCTATGTACCA--AGG---ATTTAGGAAT-----ACT-----ATACTTA-CATT------GT----AAAAACCATGACTGT-------------ACACATGTACATAAATTCCTAAATTAGCAGCGGAAGTATTCAA-A
gi|160925 : CCAACAATTTAAGCAGTTGGAAGTAAGTGGTCATTTG-T--C---A--ACA--C--CACCT-TGGACATCTTTGCCAC
gi|160942 : cggggatgtaaCCCACAACCTCAGCTGTAACAGATAAGTGGTCATTTA-A--C---A--ACA--A--TGCCT-TAGACCACTTGGCCACAG-AGG---AAC---CG---------TGT-A--TA----AT-tcatgaccactcagagtttttgtggtttaaatgttaaacaatgacttattaaatgtatttctctggacaaaaacaataaaatgttggaaacttcagggtcacttgactagaaaaaaaacaatttaattaagagaagtatttggacatatcagtaatttggacctcaatcgcccatgtaccaaggaatactatgacattttccccgtaaaagcatgactgcagacatgtaccattccatttaattaaattcccaaattaacggatgacgtatccaaataca
gi|160944 : CCGAAAACCTCAGCAGTGAGAGGTAAGTGGTCATTGG-A--C---GACACA--A--C-CTCA--AACTACTCGGCAACGGAGGACCTAAA---CA---TT-----------------AT-TTAAAACACT--GATGAT---TGTACT-TTC-TTCAA---
gi|160943 : CGACAT---CAGTGGTGCGAGGTAAGTGGTCAATAG-A--C---A--ACA--A--C-ACTTTATACGACATAACTACAG-AGG---AAC---CA---CT----TATGA--TA----A
gi|160928 : cccaTTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTA-A--T---G--ACA--G--TGTCT-TAGACCACTCGGCCACAGA
gi|160930 : gaggctcaaaccctcaacTCAACAGTGAGAGGTAAGCGGTC-TTCAGA--T---G--ACAG-A--A-CCT-TGGACCACTCGGCCAC-GGACG---ACC---CATACTC----TAT-A--CA----AT-TCT
gi|160929 : ggctcgaacccatgaccTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGATC--TTG-A------G--ACA--G--CGCCT-TAGACCACTCGGCCACAG-AGA---ACC---CA---TT----T
gi|160948 : gagactcgaacctgcgaccCAGCAGTGAGAGGTAAGTAGTCATTAG-A--C---C--ACA--G--C-ACTTTAGACCACGCTGCCACAG-AGG---ACC---C
gi|160931 : CAGCAGTGAGAGGTAAGTGATC-TTGAGA--C---G--ACA-------CCT-TAGACCACTCAGCTATGGAGGA---AAC---T----TT----TGT-
gi|160945 : ggactcgaacctacgacccGGCCGTGAGAGGTAAACGATC-TTTAGA--C---G--GCA-------CCT-TAGACCATTCTGCCACAG-GGG---ACC---CG---TTAGGATAT-A--TACAAGATGTATAAATACCTGGATATTATACATATT-TTG-TTAAAATGGTATATAAT----TTCT---AATTTC-------AA-GTTA
gi|160947 : cctacaacataGCAGTGAGAGGTAAATGACC--TTG-A------G--ACA--GTGC-CCCA--GACAACTCTGCCACAG--GG---GAC---C----TC----TGT-A--AT----AT-TATAAATA
gi|160932 : aacttaGCTGTGAGAGGTAAGTG---ATCTA----C---AG-ACA--A--CATCT-TGGACCACTTGGCCACAGAAG
gi|160939 : gggttaaactcacaacctaaCAATGAGAGGTAAATGGTCATTTG-G--T---G--ACAGCA--C-CATATG--TCACTCTGCCACGGAGGA---AAC--------TT----AAT-A--TA----A
gi|160924 : atccatgacctcaGTGAGAAGAAAGTGGTCATTTG-A--C---A--ACA--C--CACCT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AGC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACATC-AGACATT---CATGCT-GTA-TTCAA---GAATT-AGAAGAGTGTTTCTGGTTTA-------AATGTTAAA-----CAATG-----ACTTAT-T-----ACATGTATTTCTCTGGACAGGATCAATCA----------AA----------TGTTGGAAACTTC-AGGATCATTTGACTAGAA-AA-ACA-----A------T--TTAA-GAGA-----AGT-TTTA----AT--CAGTAATTTTGACCTCAATCTCCCATGTACCA--AGG---A------ATG-----CTATCTTTACATT-GTCATT------ATAAAAG-----CATGACTGT-------------ACACATGTACTTAAATTCCCATATTAGCAGCTGAAATATCCAA-A
gi|160946 : cggggacttaaccaataacttaagtgTGAGAAGTGAATGGTTGTTTA-A--C---A--ACA--------CCATAGACCACTTGGTCACAG-AGG---ATC---CA----T----GGT-AACTA----GT-TTTAAA
gi|160949 : acaacctcatcgtGACAACT--GCCGCTGCAGG---GCC---CA---TT----TGT-A--TA----TT-TTTAAACACT-GGTCATT---CATGTT-GTA-TTCAA---GCCTA-AATAAAGTTCTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAGTGACTTA-----AC-----C-----AAATGTATTTCTCTGGA----------CATGGTCGATCTAA----------TGTTCGAAACTTCAGGGC-CACAGGACTAGAA-TACA-A-----A------A--TTAA-GAGA-----AGTCTTTG-AACA-----------TGAACCTCCATCTCCAGTGT---A--AG----C------TAA-----ACA-----ATA---G-TATT------GT----G-----CACTACTACTCACACGTACC--ATTCATTTACTTAAGTTACCAAATAAGCAGCTGATGCATTCCA-ATATTTATAAAA------TATACAATAATTAAGATCTA---TCCCTTCATTTCTTGTTTGTTCAGACGCTCCTACACTCTGGTTGTAATACTAAACAAGAACGA--ACAAAATAGACAGA---TATATAC
gi|160925 : aaatgactgattcaaatcgctatataaGAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAA-----CAATG-----AC-----TTATT-AAATGTATTTCTCTGGA----------CA----------AAAACAATAAAATGTTGGAAACTTCAGGGT-CACTTGACTAGAA-AA-A-A-----AACAATTTAATTAA-GAGA-----AGTATTTG-GACATATCAGTAATTTGGACCTCAATCGCCCATGTACCA--AGG---A------ATA------CT-----ATG---A-CATTTTCCCCGTAAAAG-----CATGACTGCAGACATGTACC-ATTCCATTTAATTAAATTCCCAAATTAACGGATGACGTATCCAA-ATACA
gi|160918 : cggggatgtaaccaacaatttaagcagttggaagtaagtggtcatttgtcaacaccaccttggacatctttgccactcatgaccactcaAAATGT-TAAAA-TAT--GACTTAAC-TA-A-ATATATA------T--TTCACGACAGGGTTAGTCTGTG-GACATGGCAGTAATTTGATCTTCCATCTCCCATGTACCA--ATA---G------AAA-----AAA-----AAA---T-CATT------GT----G-----CATGACTGCATCCATTAATA-AATCCATTTACTTGAGTTCCATAATAAGCAGCTAGGGCATCCAA-ATATATATGAAA------TATACAAT--CT-GGACATAAATTCCCATCAGTTC----TTGTCCCGACACTTCTACAATCAGGTTGTAATACAAAACAAG-ACAA--ACAAAATAGACAAAACATATAGACCATGTATGTTTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAG----------GCAGTCAGAAAGAGTAAGCATGAGTTA
gi|160950 : caaggattgatctgacaacttcggcagtgagaagtaagtggttctttgacaacaacattatggacacagaaggaactgtttgtataattctaaacaccagacattcatactgtattcaagcatagagttcttgcagttaA-----AACCTATGTGACATGTCAGTATTTTGGACTTCCATCTCCCATG---------------------AA-----ACA-----TTG---G-CACC------ATAAAAG-----CACAACTGCACACATGTACC-ATCACATTTACTTAAATTCCTGAACTGGCAGCTGAAGTATCCAACATACA
gi|160951 : A-----AACCTATGTGACATGTCAGTAGTT-GGGCCTCCATCTCCCGTGTACCA--AGG---A------ATACTGTTACATTG--GCA---C-CATTA-----AA----G-----CATGACTGCACACATGTA-CCATTCCATTGACTTAAATTTCTGAACTGGCAGCTGAAATATCAAA-A-ATACA
gi|160952 : ACCAGTAGAGCTA------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAA-TCCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGTATCCAA-ATATATATGAAA------TATACAAT--CT-GGACATATGTTCCCTTCAG---------GTTCAGACA
gi|160953 : AACAGATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-ATATTTATGAAA------TATACAAT--CT-TGACTTCGGTTCCCTTCAGTTC----TTTTCCAGACTCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATAGGTACAA--ACAAAACAAACAAAAAATATAG
gi|160954 : AAAATATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATTCAA-ATATTTATGAAA------TATACAAT--CT-GGACTTCGGTTCCTTCCAGTTC----TTGTTCAGACTCTTCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATGGGTACAA--ACAAAACAAATAAAAAATATAG
gi|160938 : AAAATATTTACTTAAGTTCCCAAAT
gi|160927 : tgaactgacaacttcggcagtgagaagtaagaggtcatttgacaacaacaccttggacaactctgcctaaaaaggaaccatttgtataatgctaatcaccagacattcatgctgtattcaagcataaataaagtttttgtggtttaaatattAACAGATTTACTTAAGTTCCCAAAT
gi|160956 : gaggaatgaaccaacaacttcggcagtgagaagtaagaggtcatttgacaacaacaccttggacaactccgcctcaaaaagtaaccttttgtataatgctaaacaccagtcattcattctgtattcaagcataaatagagttcatgttgtttaaatattATATATGAAA------TCTACAAT--CT-GGGCA-AAGTTCCCATCAGTTC----TTGTCCAGTCTCTCCTACAATCTAGTTGCAAGACTAAACAGGAACAA--ACAAAGTAAACAAAAGATATAG
gi|160957 : ATAAATGAAA------TCTACAAT--CT-GGACATAAGTTTCCTTCAGTTC----TTGTCCAGACTCTCCTACAATC------TAAT-CTAAACAGGAACGA--ACAAAATAAACAAAAAATATAG
gi|160955 : ATAAATGAAATACATGTATACAAA--CT-AGACATAAGTTTTCTTCAGTTC----TTGTCCAGATTCTCCAACAATCTAGTTGTAATATTAAACAGGAACAA--ACAAAAAAGACAAAAAATATAG
gi|160958 : ATGAAA------TATACAAT--CT-GGACATAAGTTCCTTTCAGTTT----TTGTCCAGACTCTCCTACAATCTAGTTTTATTACTAAACAGGAACGA--ACAGAATAGACAAAA--TATA
gi|160959 : TGAAA------TACACAGT--CT-AGATATAATTTCCTTTCAATTC----TTGTCCAGATTCTTCTACAATCTAGTTTTCATACTAAACAGGAACAA--CCAAAATAGA-AAAAAATATA
gi|160960 : GGAA------TATACAAT--CT-GGACATAAGTTCCCTTCAGTTC----TTGTCCAAACTCTCCTACAATCTAGTTGTATTACTAAACAGG-A-AGGTACAGAATTGACAAAAA-TATAG
gi|160961 : GTAAGACTA-AAACTGTGAGCAGCTCAACAAAAA---------AT----------------TTTTGAACACA-G----------GTAATTGCAAGCAATAA---------AACAACATGTTGTC-AATGCAGCAAT--------AAAC----------------A--------------T-TA-------TTT-----AAA---AACATA----TAA-------------ATTATAA-A--TT--A--A--TTATAGAGATATT-------T-----------A-----ATTG---AAGCCATCG-CTTTTCT--A-T-GTT--GGTTGCAAATGCTGGGACTTGAATCCAGAAT-TTCAC-C--AAA-A-GT-GTAGATAAATTTGCCAGTT--ATACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTCCAATATTCACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------GAAAAGTT-AAA--AG----TATTTAAATTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAA--------CA-C-------A-CACTCACAGCAGCAC--ATGTTTTCTAA------TA------ATATGTAGTATAATATC-AAA-----------TAAACACCAGGTCTACTCATCCATTT
gi|160963 : aaaattagaacattaaaaATTGTAAACTG----CAG-TCCACGAAAATGTATATAAACATAT-----------TGTTTGAATGTATA----------GCAGTCAAAAAGAGCAGCCACAA---AATACCCTGATGACTCATAAAACTTT--------AAAT----------------A--------------------------TTAAAAGTAA---AATATATGTATAAATTATTATTTTTTAATAGAG-A--AT--A--A--T------GTCATTAAAAACATC-TTTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCTTTTCC---A-T-GTT--GTTTGCAAATGCTGGG-------------AT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACAACATAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATTGACTTTAATATTCACCAA-----ATCTAAATATGTAAAT-------T----G---AAATTAAATCGTATTTAAACTAGTCC-AT---T-TTCTATTTATATAATTCACTCTTGTAATACACATTCA-C-------AGCAGT-ACA----------TGTTTTCTAA------
gi|160962 : ATTGTAAACTG----CAG-CCCACGGAAA---------ATATATATAAAATATATTTTTTTAATATATA----------TCAGTCAGAAAGAGCAAGCACAA
gi|160964 : GAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCACTTAAAAGCAGTCAGAAAGAGTAAGCATAAGTTAGT
gi|160965 : AAA---------ATATAT-----------TTTGCAAATGTAAG----------GCAGTCAGAAAAAGAAAGCATAA
gi|160968 : TAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------ATTATAACAAATATAC-AT-------TTT-----TAA---AAGAGA---ATAA---------TTTCATTAAAA-A--GT--A--A---------AAC-TT-------TTTTTTTTCACCA----TATCT---TAGCCATCT-TTT-TC---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-AA---TATTATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ACCAAAATATGTAAAT-------TAATAG---AATTTAA----TATTTAAAATAGCCCACATTTT-TTTTATTAATAAAGTGCACTCTTGTAA--------CA-C-------ACCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAATACTCAGGTCGACTCCTCCTTTTT
gi|160966 : TAACATTTTGTC-CATGCAGCGGC--------AAAC----------------A--------------TTATAAAAAAATAT-----CAATCAAAGAGA---ATAA---------TTTCATTAAAA-A--AT--ACAA--C-----AGACTTT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCTATCT-CTTTTC---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-GTCTA-C--AAA-A-GT-GTA-ACGTGTTTGCCAGTT--ACATCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGAATTTAAATATTTACCAT-----TTCAAATTATATAAAT-------TAATAG---AAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTTA--------CA-C-------AGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAATACTATTACTATATACATTTAGTATAATATA-AAAAATTGCAAAATCAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160969 : ataaaatttatgtaatactggtaaatatagcaataaaaacattgcacTAGCATTTTATC-AAAGCAGCAATTTAAAAAAAAAA----------------A--------------C-AT-------TTT-----TAA---GA---G---ATTG---------TTTCATTAAAA-A--A---A--A--C-----AGAGGTT-------TCTTTTT-CACCA----TATTT---AAGCCATCT-TTTTT----A-T-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGTCTTAAATATTTATCAA-----ATAAACTTATGTAAA--------TA------------AA----TATTTAAAATAG-CCAAA---TATTCTATTTATAAAATACACTCTTGAAA--------CACACACTCACAGCACT-ACA----------TGTTTTCTAA------TACTACATGTATATAGAATAACATCTAATTTTTGCGAAATTAAAAATCAGATTTACCCCTTTTTT
gi|160970 : ATGTTGTC-CATGCAGCAAC--------AAAC----------------AT-------------C-A--------TTA-----AAA---AACA
gi|160970 : ATGCATTAA---------AAAT----------------A--------------G-AT-------ATT-----TAA---TAGAGA---ATAA---------TTTCATCAAAA-A--AC--A--G--C----------------------TTTTTCACTA----TATTG---AAGCCATCT-CCGTTC---AAT-GCT--GTTTGCAAATGCTGAGATTTGAACTAAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCATTTTAACACCATA-AAG-CA---AATCATTTTGTACTAAGATAATGGACTTCAATATTAACCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAAAAGTT-AAA--AG----TATATAGACTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAATACACACTCA-C-------AGCAGT-ACA----TGTACATGTTTTCTAA------TA--ATATA----TAGTATAGTATC-AAAtattatatatatatgcattaaaaatagatatttaatagagaataatttcatcaaaaaacagctttttcactatattgaagccatctccgttcaatgctgtttgcaaatgctgagatttgaactaagaatttctacaaaagtgtagatgtgtttgccattttaacaccataaagcaaatcattttgtactaagataatggacttcaatattaaccaaatcaaattatgtaattaaaagttaaaagtatatagactagtcccattttctatttataaaatacactcttgtaatacacactcacagcagtacatgtacatgttttctaataatatatagtatagtatcaaa
gi|160971 : atgttgtccatgcagcaacaaacatcattaaaaaacatattatatatatAT----------------A--------------C-AT-------TTT-----TAA---AAGAGA---ATAA---------TTTCATTAAAA-AGAAA--A--A--C-----AGACATT-------TCATTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCT-TTTTTC---A-C-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACACTACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGACTTAAATATATACCGA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAAT---AAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGTACTCTTGTAA--------CA-C-------AGCACT-ATA----T-T--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTTTAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAAACAGGTCCACTCCTCCCTTTTT
gi|160976 : aatattcataaaaaatA---AAGAGA---ATAA---------TGCCATTAAAA-G---C--A--C--C-----AGAATTT-------TCTTTTTCCACCG----TATTT---AAAACAT---TTTTTC---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTGGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-C-GT-GTAGATGTGTTTGCCTGTT--ACACCTTAGAAG-CA---AATCATGTTGTATTAAGATAATGGACATAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATTTAAACTACATTGTAATAG---AAATTCA----TATATAAAATAGCCCAAT---T-TTCTATTCATAATATACATTCTTGTAA--------CACACACTCACAGCACT-ACA----------TATTTTCTAA------AACAATA------TAGTATGATATC-AAATTTTATATAAT
gi|160975 : AGA---ATAA---------TTTCATTAAAATA--AT--A--AAAC-----AGACATT-------TCTTTTT-CACCA----TATCT---AAGCAATCT-TTTTTC---A-T-GTT-----TGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGT---ACTAAGATAATGAACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAAG---AAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CA-C-------AGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATGT--ATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTTGACTCTTCCTTTTTT
gi|160967 : atttgtataattcgAGA---ATAA---------TTTCATTAAAA-A--A---------C-----AAA--------------TGTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCT-CCTTTCC--A-T-GTT--GTTTGCAAATGTTGGGATTTGAACCCAAAAC-TTCTA-A--AAA-AAGT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGGTAATGGAATTCAATATTTCCCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAAAAGTTAAAAT-------TATTTA-AATAAGTCACAT--T-TTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTA--------CA-C-------A-CACTCACAACAGTAC--ATGTTTTCTAT------TA--ATATATAT----TATAATATC-----------AAATTAAAAACCAGGTCGACTCATCCTTTT
gi|160977 : taagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattgg---------TTTCATAAAAA-A--AA--C--A--C-----AACCATT-------TCAT--------A----CATTC---AAGCCATTT-CTTTTCCAGA-T-TTT--ACTC----TTGTCAGGATTTGAACCC-GAGTCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGAGCAAAGGAAATGGA-TTAAATAT
gi|160972 : TTTTTTGCCAATAATATTT---AAGTCATTT-CTTTTC---A-AAGTTAAGTTC-----TGCCAGGATTCGAACCCGGAAC-CTCCA-TTTAAACA-GT-G--GATGTGTTTTCCAGTT--ACACCACAGAAGTCT---TATTAT-CTGTACTAAAA-AATGGACTTAAATATTTG-CAACATCTATCAAATTAcataattttacc
gi|160973 : aaatatgaatttcaataacaattttaatatatataaaactattttatgatgA----CATTC---AAGTCATTT-CTTTTCCAAA-T-TTT--ACTC----TTGTCAGGGGTCGAACCT-GAGTCTTCTA-C--CAA-A-ATAGTAGATGTGTTAGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTACAGAGAAAATGGTCTTAAA
gi|160974 : atgtcaatttatgaaaattgaaaatctaattttctataacaataaaaaacaatATCTTTCAAGCCATTT-CTTTCCCAAA-T-TTT--ACTC----TTGTCGGGGATCGAACCC-GAGTCTTCTA-C--CAA-ATGA-GTAGATGTGTTAGCCAATT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTAC-AGAAAAATGatactaac
gi|160978 : aagttatgaaaatagaaaatcaattttctataacaatcaaaacaTGTCAGGATTTAAACC---AATCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGATTGCCAGCT--ACCCCACAAAAG-
Alignments
lowQualScore : 22222222222 6666666666 4444444444 1111111111 1111111111 111111111 1111111111111 2222 1 11111 111111111 111111111111 1111111111 11111111 888888888888888888888888888888888 111111111 111111111111111111 111 1111 44444444 2222222222
lowQualScore : 1 2 4 1 4 66666 66666666666 2 1 2 7 333 1 222 3333 2222 1 22 3333 3 2 0 2 0 8888888 0 4444444444 2 1 8888888888 3 3333333333 3333333333 1 4 44 777 3 9 333333333 0 5 1 0 33 444 777777 777777 3333333333333 888888 1111 77777 2 999 0 2 444 33 2 2 5555 1 4 44444 9999 4 444444444 888888888888 0 5555555555 3 1 4 33333333 222222222222222222222222222222222 9999999 2 444 888 2 444444444 2 8888888 2 2 333333333333333333 1 8888888888 1 5555 333 2 666 2 2 33 1 1 2 8 4 22 2 4 2 22 2 333 3 66666 9999999 3 77 1111 0 777 2 1 11111111 5 1111111111 888888 1 1 0 3
lowQualScore : . . . . . ..... ........... . . . . ... . ... .... .... . .. .... . . . . . ....... . .......... . . .......... . .......... .......... . . .. ... . . ......... . . . . .. ... ...... ...... ............. ...... .... ..... . ... . . ... .. . . .... . . ..... .... . ......... ............ . .......... . . . ........ ................................. ....... . ... ... . ......... . ....... . . .................. . .......... . .... ... . ... . . .. . . . . . .. . . . .. . ... . ..... ....... . .. .... . ... . . ........ . .......... ...... . . . .
lowQualScore : 5 4 2 3 4 00000 22222222222 1 6 4 9 444 1 222 5555 7777 4 00 1111 2 5 6 5 2 7777777 3 5555555555 2 9 1111111111 1 5555555555 5555555555 5 0 99 333 1 2 000000000 3 3 1 2 44 444 222222 444444 1111111111111 222222 1111 11111 9 222 4 4 111 44 5 0 3333 0 1 33333 4444 4 555555555 555555555555 2 9999999999 6 1 0 22222222 333333333333333333333333333333333 3333333 9 777 888 5 333333333 5 1111111 5 5 555555555555555555 2 3333333333 9 0000 999 2 111 2 2 11 1 8 1 4 2 99 1 2 1 99 1 999 9 77777 3333333 0 99 1111 4 999 9 0 44444444 7 6666666666 222222 5 4 8 1
consensus : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--AC--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATATGAC----TTAACCAAATGTATNTCTCTGGA----------C-A----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGA-CACAGGACTAGAC-TA-A-AA------T--TTAAGAGAAGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCAT-ACATGAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAG--AAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
Reference ( family-409 ) : CGAGGATT-GANCCGACAACTTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--AC--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATATGAC----T-----AAATGTATATCTCTGGA----------C-A----------AA----------TGTTGGAAACGTCNAGGA-CACAGGACTAGAC-TA-A-AA------T--TTAAGAGAAGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCAT-ACATGNA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAANAG--AAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160913 : CGAAGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTAAA-A--ACA--AA--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCAAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATATGAC----TTAACCAAATGTATATTTCTGGA----------C-A----------AA----------CATTGGAAACGTCTAGGA-CACAGGATTAGAC-TA-A-AA------T--TTAAGAGAAGTCTCTG-GTCATGGCAGTAATTTGAACCTTCATCTCCCATGTACTA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CAAT------GT----G-----CATGACTGCAT-ACATAAA-CCAACACATTTACTTAAGCTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACCATCTGGTTGTAATACTAAACAAG-ACAAACAAAGTAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTATAAAAAAATAT-A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--A---A--A--CA----AGACATT-------TTTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTATTAAGATAATGGACTTAAAAATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAG--AAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TTT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATAAC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTTCTCCTTTTTT
gi|160914 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTGAC-A--ACA--AC--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATGTGAC----TTAACCAAATGTATATTTCTGCA----------C-A----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGA-CACAGGACTAGAC-TA-A-AA------T--TTAAGAGAAGTCTCTG-GACATGGCATTGATTTGAACTTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGAATGCAT-ACATAAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATCGAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATATGTTCTCTTTAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACAATCTGATTGTAATACCAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAAAATATAAATGAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAA-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGAA-TAAGTAAGAAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTTATAAAAAAATATA--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TT-AAA-A--ATAAA--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCAATTCTTTT-T---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTCGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCA---TGTACTAAGATAATGAGCTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAG--AAATTAA----TATTTGAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTGATGAAATGCACTTTTGTAA--------CACAGAACT-TCA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTCTTCCTTTTTT
gi|160915 : CGAGGAAT-GATCCGACAACTTCGGCAATGAGAAGTAAGTGGCTATTTGAC-A--ACA--AC--A-CTATGAACAAATATGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-T--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATATTGCA-TTCAAGCATAAATTATGTTCTTGCAGCTTA-------AATGTTAAAATGTGAC----T-----TAAC-TAGG---CAGGGTCAAT-----C-A----------AA----------TATTGAAAACGTCAAGGG-CACAGGACTAGAC-TA-A-AA------AA-TTAAGAGAAGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ATA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCAT-ACATAAA-CCAATACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGTTGAGGCATCAAT-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGGCACTTCTACAATCTGGATGCAATACTAAACAAG-ACAAACAAAATAGACACAAACTATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTA----CAG-TCCACGAAAC---------ATATAC-----------TTTTCTAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTA
gi|160916 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTTGGCAGCGAGAAGTAAATGGTTATTTGAC-G--ACA--ACAACACTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TT----AT-TCTAGACACC-CGACATTCATACTGTAATTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATATGAC----TTAACTAAATGTATATTTCTGGA----------C-A----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGA-CACAGGACCATAC-TA-A-AA------T--TTAAGTGAAGTCTCTG-GACATGGCAGTGATTTGAATCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCAT-ACACAAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGATGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAATTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTTTACAATCTGGTTATAATACTAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACGAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACAGAAA---------AAATAA-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTATAAAAAAATAT-A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--ATAAA--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CATATTATCATGTTGTGCAATGAAAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGCAAAT-------TAATAG--AAATTAA----TATTTGACATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTT-TAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCTACTCCTCCTTTTTT
gi|160917 : CGATGATT-GATCCGACATTTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTAAC-A--ACA--AC--C-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTTTA-TTCAAGCATAAATCGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATATGAC----C-----AAATGTATATGTCTGGA----------C-A----------AA----------TGTTGGAAATGTCTAGGA-CACAGGACTAAAC-TA-A-AA------T--TTAAGAGAAGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTTCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCAT-ACATAAACCCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACAATCTGGTCGTAATACTAAACAAG-ACAAACAGAATAGACAAAAAGTATAGACCGT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCATGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAATCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---C-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTTTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATGTTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAG--AAATCAA----TATTTATAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CAAAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCTTTTTTT
gi|160918 : CAAGGATT-GATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGTGGTTCTTTGAC-A--ACA--AC--A-TTATGGAC---------ACAGAAGG---AAC---TG---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATA----GAGTTCTTGCAGT---------------TAAAATGT-------T-----AAA---ATATGACTTAA----------CTA----------AA----------TAT---ATATTTCACG----ACAGGGTTAG-----------------------------TCTGTG-GACATGGCAGTAATTTGATCTTCCATCTCCCATGTACCA--ATA---G------AAA-----AAA-----AAA---T-CATT------GT----G-----CATGACTGCAT-CCATTAA-TAAATCCATTTACTTGAGTTCCATAATAAGCAGCTAGGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAATTCCCATCAGTTCTTGTC----CCGACACTTCTACAATCAGGTTGTAATACAAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAACATATAGACCAT-----GTATGTTTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TGAGTTA
gi|160919 : CAAGGATT-GATCCGACAACGTTGGCAGTGAGAAGTAAGTGATTATTTGAC-A--ACA--AC--A-CTATGGATACCTCTGTCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATGCTGTA-TTTAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTAAATCATTAATGTTAAAATATGAC----TTAACCAAATGTATAATTCTGGA----------C-A----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGA-CACAGGACTAGACAGA-A-AA------T--TTAAGAGAAATCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCTCTGTACCA--AGA---A------
gi|160920 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATAGTTATTTGAC-A--ACA--AC--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-ATACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAACATATGAC----TTAACCAAATGTATATTTCTGGA----------C-A----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGA-CACAGGACTAGAC-TA-A-AA------T--TTAAGAGAAGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------ACA-----A
gi|160921 : CAAGGATT-GATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGATTATTTGAC-A--ACA--AC--A-TTATGGACAAATCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TC
gi|160922 : CGAGGAAT-GAACCAACAACTTTGGCAGTGAGAAGTTAGTGGTGATTTGAC-A--ACA------C-CT-TGGACAACTCTGCC
gi|160923 : CGAGGATT-GA-CCAACAATTTAAGCGGTGAGAAGTAAGTGGCCATTTGAC-A--ACA--CCA-C-CT-TTGACGACTCTGCCACCAAAAG---AGC---CA---TT----TAT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGGCATTCATGCTGTT-ATCTAGCATTAGTAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAACGACTTATT-----AAATATATTTCTCTGGACAGGATTAATC-A----------AA----------TGTTGGAAAGTTCAGGGT-CACTTGACTAGAA-AA-ACAA------T--ACAAAAGAAGTCTTTG-GACACATCAGTAATTTTGATCTCCATCTCCAATGTACCA--AGG---A------ATA-----CTA-------------TATT-------T----A-----CATAAAAGCATGAC-TGT-----ACACATGTACTTAAATTCCCAAATTAGCAGCTGAAGTATCCAA-AT---A
gi|160924 : CGGGGACT-TAACCAATAACTTAAGTGGTGAGAAGAAAGTGGTCATTTGAC-A--ACA--CCA-C-CT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AGC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACATC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGAATTAGAAGAGTGTTTCTGGTTTA-------AATGTTAAACAATGACTTATT-----ACATGTATTTCTCTGGACAGGATCAATC-A----------AA----------TGTTGGAAACTTC-AGGATCATTTGACTAGAA-AA-ACAA------T--TTAAGAGAAGT-TTTA----AT--CAGTAATTTTGACCTCAATCTCCCATGTACCA--AGG---A------ATG-----CTATCTTTACATT-GTCATT------ATAAAAG-----CATGACTGTAC-ACATG-------------TACTTAAATTCCCATATTAGCAGCTGAAATATCCAA-A
gi|160925 : CGGGGATG-TAACCAACAATTTAAGCAGTTGGAAGTAAGTGGTCATTTGTC-A--ACA--CCA-C-CT-TGGACATCTTTGCCAC
gi|160925 : AGAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAATGAC----TTATT-AAATGTATTTCTCTGGA----------C-A----------AAAACAATAAAATGTTGGAAACTTCAGGGT-CACTTGACTAGAA-AA-A-AAACAATTTAATTAAGAGAAGTATTTG-GACATATCAGTAATTTGGACCTCAATCGCCCATGTACCA--AGG---A------ATA------CT-----ATG---A-CATTTTCCCCGTAAAAG-----CATGACTGCAG-ACATGTA-CCATTCCATTTAATTAAATTCCCAAATTAACGGATGACGTATCCAA-AT---ACAtcatgaccactcagagtttttgtggtttaaatgttaaacaatgacttattaaatgtatttctctggacaaaaacaataaaatgttggaaacttcagggtcacttgactagaaaaaaaacaatttaattaagagaagtatttggacatatcagtaatttggacctcaatcgcccatgtaccaaggaatactatgacattttccccgtaaaagcatgactgcagacatgtaccattccatttaattaaattcccaaattaacggatgacgtatccaaataca
gi|160926 : cggggatgtaaccaacaatttaagcagttggaagtaagtggtcatttgtcaacaccaccttggacatctttgccactcatgaccactcCGGAAATT-GAACCTACGACCTTAGCAGTGAGAAGTAAATGATC--TTGAT----ACG--GCG-C-CT-TAGACCATTCTGCCAC-GGAGG---ACCCTTCA---TT----T------TA----AT-
gi|160927 : GAGGAAT-GAACCAACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTGAC-A--ACA--ACA-C-CT-TGGACAACTCCGCCTCAAAAAGT--AAC---CT---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAAACACC-AGTCATTCATTCTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCATGTTGTTTA-------AATATTAA
gi|160927 : AACAGATTTACTTAAGTTCCCAAATcagatttacttaagttcccaaat
gi|160928 : gaggaatgaaccaacaacttcggcagtgagaagtaagaggtcatttgacaacaacaccttggacaactccgcctcaaaaagtaaccttttgtataatgctaaacaccagtcattcattctgtattcaagcataaatagagttcatgttgtttaaatattGAGGCTC-AAACCCTCAACTTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTAAT-G--ACA--GTG-T-CT-TAGACCACTCGGCCACAGA
gi|160929 : GAGACTC-GAACCTGCGACCTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGATC--TTGA--G--ACA--GCG-C-CT-TAGACCACTCGGCCACAG-AGA---ACC---CA---TT----T
gi|160930 : GGCTC-GAACCCATGACCTCAACAGTGAGAGGTAAGCGGTCTTCAGAT-G--ACAG-AA--C-CT-TGGACCACTCGGCCAC-GGACG---ACC---CATACTC----TAT-A--CA----AT-TCT
gi|160931 : GGACTCGAACCTACGACCCCAGCAGTGAGAGGTAAGTGATC--TTGA--G--ACG--ACA-C-CT-TAGACCACTCAGCTATGGAGGA---AAC---T----TT----TGT-
gi|160932 : GGGTT-AAACTCACAACCTAAGCTGTGAGAGGTAAGTGATC-T---ACAG--ACA--ACA-T-CT-TGGACCACTTGGCCACAGAAG
gi|160933 : TT-GAACCTACGACCTTAGCGGTGAGAGGTAAATGAT--TTTGA--A--ACA--GCA-C-CT-TAGACCACTCGGCCGC-GGAGG---ATC---CA---TT----GTT-A--CA----ATGTCCAAA
gi|160934 : TT-GATCCAACATCCTCAGTGGTGAGAAGTAAATGGCCATCTGAC-A--ACA--G-----TGATGGAGGACTC
gi|160935 : TC-GAACCAACGACTTTAGCGGTGAGAGGTAAATGGTCTTGAGAC-G--GCA--AC--T----TAGACCATTCGGCCAC-GAAGA---ACC---CT---TT----TCT-G--TG----GT-TTTATACA
gi|160936 : TC-GAACCTACAACCTTGGTGATGAGAGGTAAGTGATC--TTAAT----ACA--GCGAC-TTA--GACCACTTTGCCACAG-AGG---ACC---C----------TGT-G--TT----AT-T
gi|160937 : TC-GAACCGACGACCTCAGCGGTGAGAAGTAAGTAGCCATTAGGT-T--ACA--GC--G-CTGT--ACCACTCAGCCAC-GGAGG---A-----CA---CT----T
gi|160938 : T-GAACTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTGAC-A--ACA--ACA-C-CT-TGGACAACTCTGCCTAAAAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAATCACC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGCATAAATAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATATTAAAATAT
gi|160938 : AAAATATTTACTTAAGTTCCCAAATttacttaagttcccaaat
gi|160939 : tgaactgacaacttcggcagtgagaagtaagaggtcatttgacaacaacaccttggacaactctgcctaaaaaggaaccatttgtataatgctaatcaccagacattcatgctgtattcaagcataaataaagtttttgtggtttaaatattTGAGAGGTAAATGGTCATTTGGT-G--ACAGCAC--C-ATATG--TCACTCTGCCACGGAGGA---AAC--------TT----AAT-A--TA----A
gi|160940 : atccatgacctcacaaATCC-ACAACCTCGGCAGCGAGAGGTAAGTGATC--TTCA--G--ACA--GTG-C-CT-TGGACCTCTCGGCCTCAG-AGA---AAC---CC---TT----TAT-A--
gi|160941 : CCAACAACTTAAGTGGTGAGAAGTAAATGGTCATTTGAC-A--TCA--CCA-C-CT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AA------------------------------------ACAAC-AGACATTCATGCTGTA-GTCAAGAATTAGTAGAGTATTTGTGGTTTA-------AATTTTAAACAATTACTTATT-----ACATGTATTTCTCTGGACAGGATCAATC-A----------AA----------TGTTGGAAACTTCAGGGT-CACTTTACTAGAA-AA-ACAA------T--TTCAGAGCAGTCTTTG-GACACGTCCGGTATTTGGACCTCCATCTCCTATGTACCA--AGG---ATTTAGGAAT-----ACT-----ATACTTA-CATT------GT----AAAAACCATGACTGTAC-ACATG-------------TACATAAATTCCTAAATTAGCAGCGGAAGTATTCAA-A
gi|160942 : CCCACAACCTCAGCTGTAACAGATAAGTGGTCATTTAAC-A--ACA--ATG-C-CT-TAGACCACTTGGCCACAG-AGG---AAC---CG---------TGT-A--TA----AT-
gi|160943 : CCCACGACATCAGTGGTGCGAGGTAAGTGGTCAATAGAC-A--ACA--AC--A-CTTTATACGACATAACTACAG-AGG---AAC---CA---CT----TATGA--TA----A
gi|160944 : CCGAAAACCTCAGCAGTGAGAGGTAAGTGGTCATTGGAC-GACACA--AC--C-TCA--AACTACTCGGCAACGGAGGACCTAAA---CA---TT-----------------AT-TTAAAACACT--GATGATTGTACTTTC-TTCAA
gi|160945 : CCTACAACATAGGCCGTGAGAGGTAAACGATCTTTAGAC-G--GCA------C-CT-TAGACCATTCTGCCACAG-GGG---ACC---CG---TTAGGATAT-A--TACAAGATGTATAAATACCTGGATATT-ATAC-ATA-TT
gi|160946 : ACAACCTCATCGTTGAGAAGTGAATGGTTGTTTAAC-A--ACA--------CCATAGACCACTTGGTCACAG-AGG---ATC---CA----T----GGT-AACTA----GT-TTTAAAttgttaaaatggtatataatttctaatttcaagtta
gi|160947 : AACTT-AGCAGTGAGAGGTAAATGACC--TTGA--G--ACAGTGC--C-CCA--GACAACTCTGCCACAG--GG---GAC---C----TC----TGT-A--AT----AT-TATAAATA
gi|160948 : CAGCAGTGAGAGGTAAGTAGTCATTAGAC-C--ACA--GC--A-CTTTAGACCACGCTGCCACAG-AGG---ACC---C
gi|160949 : GACAACT--GCCGCTGCAGG---GCC---CA---TT----TGT-A--TA----TT-TTTAAACACT-GGTCATTCATGTTGTA-TTCAAGCCTAAATAAAGTTCTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAGTGAC----TTAACCAAATGTATTTCTCTGGA----------C-ATGGTCGATCTAA----------TGTTCGAAACTTCAGGGC-CACAGGACTAGAA-TACA-AA------A--TTAAGAGAAGTCTTTG-AACATGA-----------ACCTCCATCTCCAGTGTA-----AGC---T------AAA------CA-----ATA---G-TATT------GT----G-----CACTACTACTC-ACACGTA-CCATT-CATTTACTTAAGTTACCAAATAAGCAGCTGATGCATTCCA-AT---ATTTATAAAATATACAATAATTAAGATCTA---TCCCTTCATTTCTTGTTTGTTCAGACGCTCCTACACTCTGGTTGTAATACTAAACAAGAACGAACAAAATAGAC---AGATATATAC
gi|160950 : aaatgactgattcaaatcgctatataaAAACCTATGTGACATGTCAGTATTTTGGACTTCCATCTCCCATG---------------------AA-----ACA-----TTG---G-CACC------ATAAAAG-----CACAACTGCAC-ACATGTA-CCATCACATTTACTTAAATTCCTGAACTGGCAGCTGAAGTATCCAACAT---ACA
gi|160951 : AAACCTATGTGACATGTCAGTAGTT-GGGCCTCCATCTCCCGTGTACCA--AGG---A------ATACTGTTACATTG--GCA---C-CATT------AAA---G-----CATGACTGCAC-ACATGTA-CCATTCCATTGACTTAAATTTCTGAACTGGCAGCTGAAATATCAAA-A----ATACA
gi|160952 : ACCAGTAGAGCTA------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCAT-ACATAAT-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGTATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATATGTTCCCTTCAG-----GTT----CAGAC
gi|160953 : AACAGATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATTTATGAAATATACAAT--CTT-GACTTCGGTTCCCTTCAGTTCTTTTC----CAGACTCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATAGGTACAAACAAAACAAACAAAAAATATAGa
gi|160954 : AAAATATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATTCAA-AT---ATTTATGAAATATACAAT--CTG-GACTTCGGTTCCTTCCAGTTCTTGTT----CAGACTCTTCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATGGGTACAAACAAAACAAATAAAAAATATAG
gi|160955 : AA-ATGAAATACATG---TATACAAA--CTA-GACATAAGTTTTCTTCAGTTCTTGTC----CAGATTCTCCAACAATCTAGTTGTAATATTAAACAGGAACAAACAAAAAAGACAAAAAATATAG
gi|160956 : at---ATATATGAAATCTACAAT--CTG-GGCA-AAGTTCCCATCAGTTCTTGTC----CAGTCTCTCCTACAATCTAGTTGCAAGACTAAACAGGAACAAACAAAGTAAACAAAAGATATAG
gi|160957 : ---ATAAATGAAATCTACAAT--CTG-GACATAAGTTTCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACTCTCCTACAATC------TAAT-CTAAACAGGAACGAACAAAATAAACAAAAAATATAG
gi|160958 : ATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCTTTCAGTTTTTGTC----CAGACTCTCCTACAATCTAGTTTTATTACTAAACAGGAACGAACAGAATAGACAAAATATA
gi|160959 : TGAAATACACAGT--CTA-GATATAATTTCCTTTCAATTCTTGTC----CAGATTCTTCTACAATCTAGTTTTCATACTAAACAGGAACAACCAAAATAGA-AAAAAATATA
gi|160960 : GGAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAAACTCTCCTACAATCTAGTTGTATTACTAAACAGGAAGGTACAGAATTGAC-AAAAATATAG
gi|160961 : AAAAT-TAGAACATTAAAAGTAAGACTA-AAACTGTGAGCAGCTCAACAAAAA---------AT----------------TTTTGAACACA-GGTA----------ATT-------GCAAGCAATAA---AACAACATGTTGTC-AATGCAGCAAT--------AAAC----------------A-----------------T-------TATTTAA---AA---A-CATAT---------AA-----AT-------TA-TAA-A--TT--A--A--TTATAGAGATATT-------T-----------A-----ATTG---AAGCCATCGCTTTT-CT--A-T-GTT--GGTTGCAAATGCTGGGACTTGAATCCAGAAT-TTCAC-C--AAA-A-GT-GTAGATAAATTTGCCAGTT--ATACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTCCAATATTCACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------GAAAAGTTAAA--AG----TATTTAAATTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAA--------CACA-CACTCACAGCAGCAC--ATGTTTTCTAA------TA------ATATGTAGTATAATATC-AAA-----------TAAACACCAGGTCTACTCATCCATTT
gi|160962 : ATTGTAAACTG----CAG-CCCACGGAAA---------ATATATATAAAATATATTTTTTTAATATATATCA----------GTCAGAAAGAGCAAGCA-CAA
gi|160963 : ATTGTAAACTG----CAG-TCCACGAAAATGTATATAAACATAT-----------TGTTTGAATGTATAGCA----------GTCAAAAAGAGCAGCCA-CAA---AATACCCTGATGACTCATAAAACTTT--------AAAT----------------A----------------------------TTAA---AA---GTAAAATATATGTATAAATTATTATTTTTTAATA-GAG-A--AT--A--A--T------GTCATTAAAAACATC-TTTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCTTTTCC---A-T-GTT--GTTTGCAAATGCTGGG-------------AT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACAACATAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATTGACTTTAATATTCACCAA-----ATCTAAATATGTAAAT-------T----G--AAATTAAATCGTATTTAAACTAGTCC-AT---T-TTCTATTTATATAATTCACTCTTGTAATACACATTCACAGCAGT-ACA----------TGTTTTCTAA------
gi|160964 : GAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCACTTAAAAGCAGTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGT
gi|160965 : AAA---------ATATAT-----------TTTGCAAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAAAGAAAGCA-TAA
gi|160966 : TAACATTTTGTC-CATGCAGCGGC--------AAAC----------------A--------------TTATAAAAAAAT-ATCAATCAAA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--ACAA--C-----AGACTTT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCTATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-GTCTA-C--AAA-A-GT-GTA-ACGTGTTTGCCAGTT--ACATCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGAATTTAAATATTTACCAT-----TTCAAATTATATAAAT-------TAATAG--AAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTTA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAATACTATTACTATATACATTTAGTATAATATA-AAAAATTGCAAAATCAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160967 : ataaaatttatgtaatactggtaaatatagcaataaaaacattgcac---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--A---------C-----AAA--------------TGTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCCTTT-CC--A-T-GTT--GTTTGCAAATGTTGGGATTTGAACCCAAAAC-TTCTA-A--AAA-AAGT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGGTAATGGAATTCAATATTTCCCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAAAAG-----TTAAAAT-TATTT-AAATAAGTCACAT--T-TTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTA--------CACA-CACTCACAACAGTAC--ATGTTTTCTAT------TA--ATATATAT----TATAATATC-----------AAATTAAAAACCAGGTCGACTCATCCTTTT
gi|160968 : taagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattgTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------ATTATAACAAATATAC-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--GT--A--A---------AAC-TT-------TTTTTTTTCACCA----TATCT---TAGCCATCT-TTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-AA---TATTATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ACCAAAATATGTAAAT-------TAATAG--AATTTAA----TATTTAAAATAGCCCACATTTT-TTTTATTAATAAAGTGCACTCTTGTAA--------CACACCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAATACTCAGGTCGACTCCTCCTTTTT
gi|160969 : TAGCATTTTATC-AAAGCAGCAATTTAAAAAAAAAA----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---GA---G-A---T---------TGTT-TCAT-------TA-AAA-A--A---A--A--C-----AGAGGTT-------TCTTTTT-CACCA----TATTT---AAGCCATCTTTTTT-----A-T-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGTCTTAAATATTTATCAA-----ATAAACTTATGTAAA--------TA-----------AA----TATTTAAAATAG-CCAAA---TATTCTATTTATAAAATACACTCTTGAAACACACACTCACAGCACT-ACA----------TGTTTTCTAA------TACTACATGTATATAGAATAACATCTAATTTTTGCGAAATTAAAAATCAGATTTACCCCTTTTTT
gi|160970 : ATGTTGTC-CATGCAGCAAC--------AAAC----------------AT-------------C-A-----------TTAA---AA---A-A
gi|160970 : ATGCATTAA---------AAAT----------------A--------------G-AT-------A-TTTAA---TA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------CA-AAA-A--AC--A--G--C----------------------TTTTTCACTA----TATTG---AAGCCATCTCCGTT-C---AAT-GCT--GTTTGCAAATGCTGAGATTTGAACTAAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCATTTTAACACCATA-AAG-CA---AATCATTTTGTACTAAGATAATGGACTTCAATATTAACCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAAAAGTTAAA--AG----TATATAGACTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAATACACACTCACAGCAGT-ACA----TGTACATGTTTTCTAA------TA--ATATA----TAGTATAGTATC-AAAcatattatatatatatgcattaaaaatagatatttaatagagaataatttcatcaaaaaacagctttttcactatattgaagccatctccgttcaatgctgtttgcaaatgctgagatttgaactaagaatttctacaaaagtgtagatgtgtttgccattttaacaccataaagcaaatcattttgtactaagataatggacttcaatattaaccaaatcaaattatgtaattaaaagttaaaagtatatagactagtcccattttctatttataaaatacactcttgtaatacacactcacagcagtacatgtacatgttttctaataatatatagtatagtatcaaa
gi|160971 : atgttgtccatgcagcaacaaacatcattaaaaaacatattatatatatAT----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-AGAAA--A--A--C-----AGACATT-------TCATTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTTTTTT-C---A-C-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACACTACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGACTTAAATATATACCGA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAAT--AAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGTACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ATA----T-T--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTTTAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAAACAGGTCCACTCCTCCCTTTTT
gi|160972 : aatattcataaaaaatTTTTTTGCCAATAATATTT---AAGTCATTTCTTTT-C---A-AAGTTAAGTTC-----TGCCAGGATTCGAACCCGGAAC-CTCCA-TTTAAACA-GT-G--GATGTGTTTTCCAGTT--ACACCACAGAAGTCT---TATTAT-CTGTACTAAAA-AATGGACTTAAATATTTG-CAACATCTATCAAATTA
gi|160973 : aaatatgaatttcaataacaattttaatatatataaaactattttatgatg-AT-------T-TATGA---AAATTG-AAAATCT-------AATT-TT-C-------TATAAC-A--AT--A--A--A-----AAACAAT-------------------A----CATTC---AAGTCATTTCTTTT-CCAAA-T-TTT--ACTC----TTGTCAGGGGTCGAACCT-GAGTCTTCTA-C--CAA-A-ATAGTAGATGTGTTAGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTACAGAGAAAATGGTCTTAAA
gi|160974 : atgtcaATCTTTCAAGCCATTTCTTTC-CCAAA-T-TTT--ACTC----TTGTCGGGGATCGAACCC-GAGTCTTCTA-C--CAA-ATGA-GTAGATGTGTTAGCCAATT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTAC-AGAAAAATGatactaac
gi|160975 : aagttatgaaaatagaaaatcaattttctataacaatcaaaaca-AT-------T-TGTAT---AATTCG-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAATA--AT--A--AAAC-----AGACATT-------TCTTTTT-CACCA----TATCT---AAGCAATCTTTTTT-C---A-T-GTT-----TGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGT---ACTAAGATAATGAACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAAG--AAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATGT--ATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTTGACTCTTCCTTTTTT
gi|160976 : A---AA---G-AGAAT---------AATG-CCAT-------TA-AAA-G---C--A--C--C-----AGAATTT-------TCTTTTTCCACCG----TATTT---AAAACATTT--TTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTGGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-C-GT-GTAGATGTGTTTGCCTGTT--ACACCTTAGAAG-CA---AATCATGTTGTATTAAGATAATGGACATAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATTTAAACTACATTGTAATAG--AAATTCA----TATATAAAATAGCCCAAT---T-TTCTATTCATAATATACATTCTTGTAACACACACTCACAGCACT-ACA----------TATTTTCTAA------AACAATA------TAGTATGATATC-AAATTTTATATAAT
gi|160977 : TT-TCAT-------AA-AAA-A--AA--C--A--C-----AACCATT-------TCAT--------A----CATTC---AAGCCATTTCTTTT-CCAGA-T-TTT--ACTC----TTGTCAGGATTTGAACCC-GAGTCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGAGCAAAGGAAATGGA-TTAAATAT
gi|160978 : TGTCAGGATTTAAACC---AATCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGATTGCCAGCT--ACCCCACAAAAG-cataattttacc
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 1111 4444444444 1111111111 1111111111 111111111 1111111111111 2222 1 11111 111111111 111111111111 1111111111 11111111 888888888888888888888888888888888 111111111 111111111111111111 111 2222 44444444 2222222222
lowQualScore : 1 2 4 1 4 66666 6666666666666 2 1 2 7 333 1 222 3333 2222 1 22 3333 3 2 2 0 8888888 1 5 2 1111 44 0000000000 3333333333 4444444444 1 3 33 3 9 77777 111111111 3 66666 0 5 1 0 33 444 777777 777777 3333333333333 888888 1111 77777 8 2 4444 2 444 33 2 2 5555 1 4 44444 9999 4 444444444 888888888888 0 5555555555 3 1 4 33333333 222222222222222222222222222222222 9999999 2 444 888 2 444444444 2 8888888 2 2 333333333333333333 1 8888888888 1 5555 333 2 666 2 2 33 1 1 2 8 4 22 2 4 2 22 2 333 3 66666 9999999 8 1111 0 777 2 1 11111111 5 1111111111 888888 1 1 0 3
lowQualScore : . . . . . ..... ............. . . . . ... . ... .... .... . .. .... . . . . ....... . . . .... .. .......... .......... .......... . . .. . . ..... ......... . ..... . . . . .. ... ...... ...... ............. ...... .... ..... . . .... . ... .. . . .... . . ..... .... . ......... ............ . .......... . . . ........ ................................. ....... . ... ... . ......... . ....... . . .................. . .......... . .... ... . ... . . .. . . . . . .. . . . .. . ... . ..... ....... . .... . ... . . ........ . .......... ...... . . . .
lowQualScore : 5 4 2 4 4 00000 2222222222222 1 6 4 9 444 1 222 5555 7777 4 00 1111 2 5 5 2 7777777 3 3 4 3333 11 4444444444 5555555555 6666666666 0 8 99 1 2 77777 222222222 1 77777 3 3 1 2 44 444 222222 444444 1111111111111 222222 1111 11111 9 9 2222 4 111 44 5 0 3333 0 1 33333 4444 4 555555555 555555555555 2 9999999999 6 1 0 22222222 333333333333333333333333333333333 3333333 9 777 888 5 333333333 5 1111111 5 5 555555555555555555 2 3333333333 9 0000 999 2 111 2 2 11 1 8 1 4 2 99 1 2 1 99 1 999 9 77777 3333333 6 1111 4 999 9 0 44444444 7 6666666666 222222 5 4 8 1
consensus : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--A--C--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATN-TCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGNCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCACACATGAA-CCA-ACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
Reference ( family-409 ) : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--A--C--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATN-TCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGACACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATGAA-CCA-ACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160913 : CGAAGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTAAA-A--ACA--A--A--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCAAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------CATTGGAAACGTCTAGGACACAGGATTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GTCATGGCAGTAATTTGAACCTTCATCTCCCATGTACTA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CAAT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAA-CCA-ACACATTTACTTAAGCTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACCATCTGGTTGTAATACTAAACAAG-ACAAACAAAGTAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTATAAAAAAATAT-A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--A---A--A--CA----AGACATT-------TTTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTATTAAGATAATGGACTTAAAAATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TTT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATAAC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTTCTCCTTTTTT
gi|160914 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATG-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGCA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCATTGATTTGAACTTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGAATGCATACATAAA-CCA-ACACATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATCGAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATATGTTCTCTTTAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACAATCTGATTGTAATACCAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAAAATATAAATGAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAA-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGAA-TAAGTAAGAAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTTATAAAAAAATATA--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TT-AAA-A--ATAAA--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCAATTCTTTT-T---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTCGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCA---TGTACTAAGATAATGAGCTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTGAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTGATGAAATGCACTTTTGTAA--------CACAGAACT-TCA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTCTTCCTTTTTT
gi|160915 : CGAGGAAT-GATCCGACAACTTCGGCAATGAGAAGTAAGTGGCTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGAACAAATATGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-T--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATATTGCA-TTCAAGCATAAATTATGTTCTTGCAGCTTA-------AATGTTAAAATG-TGACTTAA----CTAG--GCAGGGTCAAT-------------CA----------AA----------TATTGAAAACGTCAAGGGCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------AA-TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ATA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAA-CCA-ATACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGTTGAGGCATCAAT-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGGCACTTCTACAATCTGGATGCAATACTAAACAAG-ACAAACAAAATAGACACAAACTATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTA----CAG-TCCACGAAAC---------ATATAC-----------TTTTCTAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTA
gi|160916 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTTGGCAGCGAGAAGTAAATGGTTATTTGAC-G--ACA--A--CAACACTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TT----AT-TCTAGACACC-CGACATTCATACTGTAATTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CTAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACCATAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GTGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTGATTTGAATCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACACAAA-CCA-ACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGATGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAATTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTTTACAATCTGGTTATAATACTAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACGAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACAGAAA---------AAATAA-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTATAAAAAAATAT-A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--ATAAA--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CATATTATCATGTTGTGCAATGAAAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGCAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTGACATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTT-TAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCTACTCCTCCTTTTTT
gi|160917 : CGATGATT-GATCCGACATTTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTAAC-A--ACA--A--C--C-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTTTA-TTCAAGCATAAATCGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGAC---------CAAATGTATA-TGTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAATGTCTAGGACACAGGACTAAAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTTCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAACCCA-ACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACAATCTGGTCGTAATACTAAACAAG-ACAAACAGAATAGACAAAAAGTATAGACCGT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCATGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAATCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---C-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTTTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATGTTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATCAA----TATTTATAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CAAAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCTTTTTTT
gi|160918 : CAAGGATT-GATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGTGGTTCTTTGAC-A--ACA--A--C--A-TTATGGAC---------ACAGAAGG---AAC---TG---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGC----ATAGAGTTCTTGCAGTTAA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CTAAATATATA-TTTCACGA----------CA----------
gi|160918 : AAATGTTAAA---ATATGACTTAAC-TA-A-ATATATA------T--TTCACGACAGGGTTAGTCTGTG-GACATGGCAGTAATTTGATCTTCCATCTCCCATGTACCA--ATA---G------AAA-----AAA-----AAA---T-CATT------GT----G-----CATGACTGCATCCATTAA-TAA-ATCCATTTACTTGAGTTCCATAATAAGCAGCTAGGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAATTCCCATCAGTTCTTGTC----CCGACACTTCTACAATCAGGTTGTAATACAAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAACATATAGACCAT-----GTATGTTTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TGAGTTAgggttagtctgtggacatggcagtaatttgatcttccatctcccatgtaccaatagaaaaaaaaatcattgtgcatgactgcatccattaataaatccatttacttgagttccataataagcagctagggcatccaaatatatatgaaatatacaatctggacataaattcccatcagttcttgtcccgacacttctacaatcaggttgtaatacaaaacaagacaaacaaaatagacaaaacatatagaccatgtatgtttataaactgcagtccacggaaaatatacttttcgaatgtaaggcagtcagaaagagtaagcatgagtta
gi|160919 : caaggattgatctgacaacttcggcagtgagaagtaagtggttctttgacaacaacattatggacacagaaggaactgtttgtataattctaaacaccagacattcatactgtattcaagcatagagttcttgcagttaCAAGGATT-GATCCGACAACGTTGGCAGTGAGAAGTAAGTGATTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGGATACCTCTGTCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATGCTGTA-TTTAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTAAATCATTAATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-ATTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGACACAGGACTAGACAGA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AATCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCTCTGTACCA--AGA---A------
gi|160920 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATAGTTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-ATACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAACATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------ACA-----A
gi|160921 : CAAGGATT-GATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGATTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-TTATGGACAAATCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TC
gi|160922 : CGAGGAAT-GAACCAACAACTTTGGCAGTGAGAAGTTAGTGGTGATTTGAC-A--ACA--------C-CT-TGGACAACTCTGCC
gi|160923 : CGAGGATT-GA-CCAACAATTTAAGCGGTGAGAAGTAAGTGGCCATTTGAC-A--ACA--C--CA-C-CT-TTGACGACTCTGCCACCAAAAG---AGC---CA---TT----TAT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGGCATTCATGCTGTT-ATCTAGCATTAGTAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-CGACTT-A----TTAAATATATT-TCTCTGGACAGGATTAATCA----------AA----------TGTTGGAAAGTTCAGGGTCACTTGACTAGAA-AA-ACA-----A------T--ACAA-AAGA-----AGTCTTTG-GACACATCAGTAATTTTGATCTCCATCTCCAATGTACCA--AGG---A------ATA-----CTA-------------TATT-------T----A-----CATAA----AAGCATG-A-CTGTACACATGTACTTAAATTCCCAAATTAGCAGCTGAAGTATCCAA-AT---A
gi|160924 : CGGGGACT-TAACCAATAACTTAAGTGGTGAGAAGAAAGTGGTCATTTGAC-A--ACA--C--CA-C-CT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AGC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACATC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGAATTAGAAGAGTGTTTCTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-TGACTT-A----TTACATGTATT-TCTCTGGACAGGATCAATCA----------AA----------TGTTGGAAACTTCAGGATCATTTGACTAGAA-AA-ACA-----A------T--TTAA-GAGA-----AGT-TTTA----AT--CAGTAATTTTGACCTCAATCTCCCATGTACCA--AGG---A------ATG-----CTATCTTTACATT-GTCATT------ATAAAAG-----CATGACTGTACACATG--------------TACTTAAATTCCCATATTAGCAGCTGAAATATCCAA-A
gi|160925 : CGGGGATG-TAACCAACAATTTAAGCAGTTGGAAGTAAGTGGTCATTTGTC-A--ACA--C--CA-C-CT-TGGACATCTTTGCCAC
gi|160925 : AGAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-TGACTTA-----TTAAATGTATT-TCTCTGGA----------CA----------AAAACAATAAAATGTTGGAAACTTCAGGGTCACTTGACTAGAA-AA-A-A-----AACAATTTAATTAA-GAGA-----AGTATTTG-GACATATCAGTAATTTGGACCTCAATCGCCCATGTACCA--AGG---A------ATA------CT-----ATG---A-CATTTTCCCCGTAAAAG-----CATGACTGCAGACATGTA-CCA-TTCCATTTAATTAAATTCCCAAATTAACGGATGACGTATCCAA-AT---ACAtcatgaccactcagagtttttgtggtttaaatgttaaacaatgacttattaaatgtatttctctggacaaaaacaataaaatgttggaaacttcagggtcacttgactagaaaaaaaacaatttaattaagagaagtatttggacatatcagtaatttggacctcaatcgcccatgtaccaaggaatactatgacattttccccgtaaaagcatgactgcagacatgtaccattccatttaattaaattcccaaattaacggatgacgtatccaaataca
gi|160926 : cggggatgtaaccaacaatttaagcagttggaagtaagtggtcatttgtcaacaccaccttggacatctttgccactcatgaccactcCGGAAATT-GAACCTACGACCTTAGCAGTGAGAAGTAAATGATC--TTGAT----ACG--G--CG-C-CT-TAGACCATTCTGCCAC-GGAGG---ACCCTTCA---TT----T------TA----AT-
gi|160927 : GAGGAAT-GAACCAACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTGAC-A--ACA--A--CA-C-CT-TGGACAACTCCGCCTCAAAAAGT--AAC---CT---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAAACACC-AGTCATTCATTCTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCATGTTGTTTA-------AATATTAACAGATTTACTTAAGTTCCCAAAT
gi|160928 : GAGGCTC-AAACCCTCAACTTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTAAT-G--ACA--G--TG-T-CT-TAGACCACTCGGCCACAGA
gi|160929 : GAGACTC-GAACCTGCGACCTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGATC--TTGA--G--ACA--G--CG-C-CT-TAGACCACTCGGCCACAG-AGA---ACC---CA---TT----T
gi|160930 : GGCTC-GAACCCATGACCTCAACAGTGAGAGGTAAGCGGTCTTCAGAT-G--ACAG-A--A--C-CT-TGGACCACTCGGCCAC-GGACG---ACC---CATACTC----TAT-A--CA----AT-TCT
gi|160931 : GGACTCGAACCTACGACCCCAGCAGTGAGAGGTAAGTGATC--TTGA--G--ACG--A--CA-C-CT-TAGACCACTCAGCTATGGAGGA---AAC---T----TT----TGT-
gi|160932 : GGGTT-AAACTCACAACCTAAGCTGTGAGAGGTAAGTGATC-T---ACAG--ACA--A--CA-T-CT-TGGACCACTTGGCCACAGAAG
gi|160933 : TT-GAACCTACGACCTTAGCGGTGAGAGGTAAATGAT--TTTGA--A--ACA--G--CA-C-CT-TAGACCACTCGGCCGC-GGAGG---ATC---CA---TT----GTT-A--CA----ATGTCCAAA
gi|160934 : TT-GATCCAACATCCTCAGTGGTGAGAAGTAAATGGCCATCTGAC-A--ACA--G-------TGATGGAGGACTC
gi|160935 : TC-GAACCAACGACTTTAGCGGTGAGAGGTAAATGGTCTTGAGAC-G--GCA--A--C--T----TAGACCATTCGGCCAC-GAAGA---ACC---CT---TT----TCT-G--TG----GT-TTTATACA
gi|160936 : TC-GAACCTACAACCTTGGTGATGAGAGGTAAGTGATC--TTAAT----ACA--G--CGAC-TTA--GACCACTTTGCCACAG-AGG---ACC---C----------TGT-G--TT----AT-T
gi|160937 : TC-GAACCGACGACCTCAGCGGTGAGAAGTAAGTAGCCATTAGGT-T--ACA--G--C--G-CTGT--ACCACTCAGCCAC-GGAGG---A-----CA---CT----T
gi|160938 : T-GAACTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTGAC-A--ACA--A--CA-C-CT-TGGACAACTCTGCCTAAAAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAATCACC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGCATAAATAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATATTAAAATATTTACTTAAGTTCCCAAAT
gi|160939 : ACCTCA-CAATGAGAGGTAAATGGTCATTTGGT-G--ACAGCA--C--C-ATATG--TCACTCTGCCACGGAGGA---AAC--------TT----AAT-A--TA----A
gi|160940 : atccatgATCC-ACAACCTCGGCAGCGAGAGGTAAGTGATC--TTCA--G--ACA--G--TG-C-CT-TGGACCTCTCGGCCTCAG-AGA---AAC---CC---TT----TAT-A--
gi|160941 : CCAACAACTTAAGTGGTGAGAAGTAAATGGTCATTTGAC-A--TCA--C--CA-C-CT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AA------------------------------------ACAAC-AGACATTCATGCTGTA-GTCAAGAATTAGTAGAGTATTTGTGGTTTA-------AATTTTAAACAA-TTACTT-A----TTACATGTATT-TCTCTGGACAGGATCAATCA----------AA----------TGTTGGAAACTTCAGGGTCACTTTACTAGAA-AA-ACA-----A------T--TTCA-GAGC-----AGTCTTTG-GACACGTCCGGTATTTGGACCTCCATCTCCTATGTACCA--AGG---ATTTAGGAAT-----ACT-----ATACTTA-CATT------GT----AAAAACCATGACTGTACACATG--------------TACATAAATTCCTAAATTAGCAGCGGAAGTATTCAA-A
gi|160942 : CCCACAACCTCAGCTGTAACAGATAAGTGGTCATTTAAC-A--ACA--A--TG-C-CT-TAGACCACTTGGCCACAG-AGG---AAC---CG---------TGT-A--TA----AT-
gi|160943 : CCCACGACATCAGTGGTGCGAGGTAAGTGGTCAATAGAC-A--ACA--A--C--A-CTTTATACGACATAACTACAG-AGG---AAC---CA---CT----TATGA--TA----A
gi|160944 : CCGAAAACCTCAGCAGTGAGAGGTAAGTGGTCATTGGAC-GACACA--A--C--C-TCA--AACTACTCGGCAACGGAGGACCTAAA---CA---TT-----------------AT-TTAAAACACT--GATGATTGTACTTTC-TTCAA
gi|160945 : CCTACAACATAGGCCGTGAGAGGTAAACGATCTTTAGAC-G--GCA--------C-CT-TAGACCATTCTGCCACAG-GGG---ACC---CG---TTAGGATAT-A--TACAAGATGTATAAATACCTGGATATT-ATAC-ATA-TT
gi|160946 : ACAACCTCATCGTTGAGAAGTGAATGGTTGTTTAAC-A--ACA----------CCATAGACCACTTGGTCACAG-AGG---ATC---CA----T----GGT-AACTA----GT-TTTAAAttgttaaaatggtatataatttctaatttcaagtta
gi|160947 : CTTAGCAGTGAGAGGTAAATGACC--TTGA--G--ACA--GTGC--C-CCA--GACAACTCTGCCACAG--GG---GAC---C----TC----TGT-A--AT----AT-TATAAATA
gi|160948 : aaCAGCAGTGAGAGGTAAGTAGTCATTAGAC-C--ACA--G--C--A-CTTTAGACCACGCTGCCACAG-AGG---ACC---C
gi|160949 : GACAACT--GCCGCTGCAGG---GCC---CA---TT----TGT-A--TA----TT-TTTAAACACT-GGTCATTCATGTTGTA-TTCAAGCCTAAATAAAGTTCTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAG-TGACTTAA----CCAAATGTATT-TCTCTGGA----------CATGGTCGATCTAA----------TGTTCGAAACTTCAGGGCCACAGGACTAGAA-TACA-A-----A------A--TTAA-GAGA-----AGTCTTTG-AACATGA-----------ACCTCCATCTCCAGTGTA-----AGC---T------AAA------CA-----ATA---G-TATT------GT----G-----CACTACTACTCACACGTA-CCA-TT-CATTTACTTAAGTTACCAAATAAGCAGCTGATGCATTCCA-AT---ATTTATAAAATATACAATAATTAAGATCTA---TCCCTTCATTTCTTGTTTGTTCAGACGCTCCTACACTCTGGTTGTAATACTAAACAAGAACGAACAAAATAGAC---AGATATATAC
gi|160950 : aaatgactgattcaaatcgctatataaA-----AACCTATGTGACATGTCAGTATTTTGGACTTCCATCTCCCATG---------------------AA-----ACA-----TTG---G-CACC------ATAAAAG-----CACAACTGCACACATGTA-CCA-TCACATTTACTTAAATTCCTGAACTGGCAGCTGAAGTATCCAACAT---ACA
gi|160951 : A-----AACCTATGTGACATGTCAGTAGTT-GGGCCTCCATCTCCCGTGTACCA--AGG---A------ATACTGTTACATTG--GCA---C-CATT------AAA---G-----CATGACTGCACACATGTA-CCA-TTCCATTGACTTAAATTTCTGAACTGGCAGCTGAAATATCAAA-A----ATACA
gi|160952 : ACCAGTAGAGCTA------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAT-CCA-ACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGTATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATATGTTCCCTTCAG-----GTT----CAGAC
gi|160953 : A-ACAGATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATTTATGAAATATACAAT--CTT-GACTTCGGTTCCCTTCAGTTCTTTTC----CAGACTCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATAGGTACAAACAAAACAAACAAAAAATATAGa
gi|160954 : A-AAATATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATTCAA-AT---ATTTATGAAATATACAAT--CTG-GACTTCGGTTCCTTCCAGTTCTTGTT----CAGACTCTTCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATGGGTACAAACAAAACAAATAAAAAATATAG
gi|160955 : AA-ATGAAATACATG---TATACAAA--CTA-GACATAAGTTTTCTTCAGTTCTTGTC----CAGATTCTCCAACAATCTAGTTGTAATATTAAACAGGAACAAACAAAAAAGACAAAAAATATAG
gi|160956 : at---ATATATGAAATCTACAAT--CTG-GGCA-AAGTTCCCATCAGTTCTTGTC----CAGTCTCTCCTACAATCTAGTTGCAAGACTAAACAGGAACAAACAAAGTAAACAAAAGATATAG
gi|160957 : ---ATAAATGAAATCTACAAT--CTG-GACATAAGTTTCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACTCTCCTACAATC------TAAT-CTAAACAGGAACGAACAAAATAAACAAAAAATATAG
gi|160958 : ATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCTTTCAGTTTTTGTC----CAGACTCTCCTACAATCTAGTTTTATTACTAAACAGGAACGAACAGAATAGACAAAATATA
gi|160959 : TGAAATACACAGT--CTA-GATATAATTTCCTTTCAATTCTTGTC----CAGATTCTTCTACAATCTAGTTTTCATACTAAACAGGAACAACCAAAATAGA-AAAAAATATA
gi|160960 : GGAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAAACTCTCCTACAATCTAGTTGTATTACTAAACAGGAAGGTACAGAATTGAC-AAAAATATAG
gi|160961 : AAAAT-TAGAACATTAAAAGTAAGACTA-AAACTGTGAGCAGCTCAACAAAAA---------AT----------------TTTTGAACACA-GGTA----------ATT-------GCAAGCAATAA---AACAACATGTTGTC-AATGCAGCAAT--------AAAC----------------A-----------------T-------TATTTAA---AA---A-CATAT---------AA-----AT-------TA-TAA-A--TT--A--A--TTATAGAGATATT-------T-----------A-----ATTG---AAGCCATCGCTTTT-CT--A-T-GTT--GGTTGCAAATGCTGGGACTTGAATCCAGAAT-TTCAC-C--AAA-A-GT-GTAGATAAATTTGCCAGTT--ATACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTCCAATATTCACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------GAA---AAGTTAAAAG-TATTTAAATTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAA--------CACA-CACTCACAGCAGCAC--ATGTTTTCTAA------TA------ATATGTAGTATAATATC-AAA-----------TAAACACCAGGTCTACTCATCCATTT
gi|160962 : ATTGTAAACTG----CAG-CCCACGGAAA---------ATATATATAAAATATATTTTTTTAATATATATCA----------GTCAGAAAGAGCAAGCA-CAA
gi|160963 : ATTGTAAACTG----CAG-TCCACGAAAATGTATATAAACATAT-----------TGTTTGAATGTATAGCA----------GTCAAAAAGAGCAGCCA-CAA---AATACCCTGATGACTCATAAAACTTT--------AAAT----------------A----------------------------TTAA---AA---GTAAAATATATGTATAAATTATTATTTTTTAATA-GAG-A--AT--A--A--T------GTCATTAAAAACATC-TTTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCTTTTCC---A-T-GTT--GTTTGCAAATGCTGGG-------------AT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACAACATAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATTGACTTTAATATTCACCAA-----ATCTAAATATGTAAAT-------T----GAAATTAAATCGTATTTAAACTAGTCC-AT---T-TTCTATTTATATAATTCACTCTTGTAATACACATTCACAGCAGT-ACA----------TGTTTTCTAA------
gi|160964 : GAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCACTTAAAAGCAGTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGT
gi|160965 : AAA---------ATATAT-----------TTTGCAAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAAAGAAAGCA-TAA
gi|160966 : TAACATTTTGTC-CATGCAGCGGC--------AAAC----------------A--------------TTATAAAAAAAT-ATCAATCAAA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--ACAA--C-----AGACTTT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCTATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-GTCTA-C--AAA-A-GT-GTA-ACGTGTTTGCCAGTT--ACATCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGAATTTAAATATTTACCAT-----TTCAAATTATATAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTTA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAATACTATTACTATATACATTTAGTATAATATA-AAAAATTGCAAAATCAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160967 : ataaaatttatgtaatactggtaaatatagcaataaaaacattgcac---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--A---------C-----AAA--------------TGTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCCTTT-CC--A-T-GTT--GTTTGCAAATGTTGGGATTTGAACCCAAAAC-TTCTA-A--AAA-AAGT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGGTAATGGAATTCAATATTTCCCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAA---AAGTTAAAAT-TATTT-AAATAAGTCACAT--T-TTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTA--------CACA-CACTCACAACAGTAC--ATGTTTTCTAT------TA--ATATATAT----TATAATATC-----------AAATTAAAAACCAGGTCGACTCATCCTTTT
gi|160968 : taagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattgTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------ATTATAACAAATATAC-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--GT--A--A---------AAC-TT-------TTTTTTTTCACCA----TATCT---TAGCCATCT-TTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-AA---TATTATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ACCAAAATATGTAAAT-------TAATAGAATTTAA----TATTTAAAATAGCCCACATTTT-TTTTATTAATAAAGTGCACTCTTGTAA--------CACACCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAATACTCAGGTCGACTCCTCCTTTTT
gi|160969 : TAGCATTTTATC-AAAGCAGCAATTTAAAAAAAAAA----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---GA---G-A---T---------TGTT-TCAT-------TA-AAA-A--A---A--A--C-----AGAGGTT-------TCTTTTT-CACCA----TATTT---AAGCCATCTTTTTT-----A-T-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGTCTTAAATATTTATCAA-----ATAAACTTATGTAAA--------TA---------AA----TATTTAAAATAG-CCAAA---TATTCTATTTATAAAATACACTCTTGAAACACACACTCACAGCACT-ACA----------TGTTTTCTAA------TACTACATGTATATAGAATAACATCTAATTTTTGCGAAATTAAAAATCAGATTTACCCCTTTTTT
gi|160970 : ATGTTGTC-CATGCAGCAAC--------AAAC----------------AT-------------C-A-----------TTAA---AA---A-A
gi|160970 : ATGCATTAA---------AAAT----------------A--------------G-AT-------A-TTTAA---TA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------CA-AAA-A--AC--A--G--C----------------------TTTTTCACTA----TATTG---AAGCCATCTCCGTT-C---AAT-GCT--GTTTGCAAATGCTGAGATTTGAACTAAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCATTTTAACACCATA-AAG-CA---AATCATTTTGTACTAAGATAATGGACTTCAATATTAACCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAA---AAGTTAAAAG-TATATAGACTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAATACACACTCACAGCAGT-ACA----TGTACATGTTTTCTAA------TA--ATATA----TAGTATAGTATC-AAAcatattatatatatatgcattaaaaatagatatttaatagagaataatttcatcaaaaaacagctttttcactatattgaagccatctccgttcaatgctgtttgcaaatgctgagatttgaactaagaatttctacaaaagtgtagatgtgtttgccattttaacaccataaagcaaatcattttgtactaagataatggacttcaatattaaccaaatcaaattatgtaattaaaagttaaaagtatatagactagtcccattttctatttataaaatacactcttgtaatacacactcacagcagtacatgtacatgttttctaataatatatagtatagtatcaaa
gi|160971 : atgttgtccatgcagcaacaaacatcattaaaaaacatattatatatatAT----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-AGAAA--A--A--C-----AGACATT-------TCATTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTTTTTT-C---A-C-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACACTACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGACTTAAATATATACCGA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAATAAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGTACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ATA----T-T--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTTTAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAAACAGGTCCACTCCTCCCTTTTT
gi|160972 : aatattcataaaaaatTTTTTTGCCAATAATATTT---AAGTCATTTCTTTT-C---A-AAGTTAAGTTC-----TGCCAGGATTCGAACCCGGAAC-CTCCA-TTTAAACA-GT-G--GATGTGTTTTCCAGTT--ACACCACAGAAGTCT---TATTAT-CTGTACTAAAA-AATGGACTTAAATATTTG-CAACATCTATCAAATTA
gi|160973 : aaatatgaatttcaataacaattttaatatatataaaactattttatgatg-AT-------T-TATGA---AAATTG-AAAATCT-------AATT-TT-C-------TATAAC-A--AT--A--A--A-----AAACAAT-------------------A----CATTC---AAGTCATTTCTTTT-CCAAA-T-TTT--ACTC----TTGTCAGGGGTCGAACCT-GAGTCTTCTA-C--CAA-A-ATAGTAGATGTGTTAGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTACAGAGAAAATGGTCTTAAA
gi|160974 : atgtcaATCTTTCAAGCCATTTCTTTC-CCAAA-T-TTT--ACTC----TTGTCGGGGATCGAACCC-GAGTCTTCTA-C--CAA-ATGA-GTAGATGTGTTAGCCAATT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTAC-AGAAAAATGatactaac
gi|160975 : aagttatgaaaatagaaaatcaattttctataacaatcaaaaca-AT-------T-TGTAT---AATTCG-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAATA--AT--A--AAAC-----AGACATT-------TCTTTTT-CACCA----TATCT---AAGCAATCTTTTTT-C---A-T-GTT-----TGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGT---ACTAAGATAATGAACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATGT--ATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTTGACTCTTCCTTTTTT
gi|160976 : A---AA---G-AGAAT---------AATG-CCAT-------TA-AAA-G---C--A--C--C-----AGAATTT-------TCTTTTTCCACCG----TATTT---AAAACATTT--TTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTGGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-C-GT-GTAGATGTGTTTGCCTGTT--ACACCTTAGAAG-CA---AATCATGTTGTATTAAGATAATGGACATAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATTTAAACTACATTGTAATAGAAATTCA----TATATAAAATAGCCCAAT---T-TTCTATTCATAATATACATTCTTGTAACACACACTCACAGCACT-ACA----------TATTTTCTAA------AACAATA------TAGTATGATATC-AAATTTTATATAAT
gi|160977 : TT-TCAT-------AA-AAA-A--AA--C--A--C-----AACCATT-------TCAT--------A----CATTC---AAGCCATTTCTTTT-CCAGA-T-TTT--ACTC----TTGTCAGGATTTGAACCC-GAGTCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGAGCAAAGGAAATGGA-TTAAATAT
gi|160978 : TGTCAGGATTTAAACC---AATCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGATTGCCAGCT--ACCCCACAAAAG-cataattttacc
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 1111 3333333333333333333333 1111111111 111111111 11111 111 2222 1 11111 111111111 111111111111 1111111111 11111111 888888888888888888888888888888888 111111111 111111111111111111 111 2222 44444444 2222222222
lowQualScore : 1 2 4 1 4 66666 6666666666666 2 1 2 7 333 1 222 3333 2222 1 22 3333 3 2 2 0 8888888 1 5 1111 44 4444444444444444444444 4444444444 1 2 33 3 9 77777 111111111 3 66666 0 5 1 0 33 444 777777 999999 22222 333 2 888888 3333 77777 999 666 2 444 33 2 2 5555 1 4 44444 9999 4 444444444 888888888888 0 5555555555 3 1 4 33333333 222222222222222222222222222222222 9999999 2 444 888 2 444444444 2 8888888 2 2 333333333333333333 1 8888888888 1 5555 333 2 666 2 2 33 1 1 2 8 4 22 2 4 2 22 2 333 3 66666 9999999 8 1111 0 777 2 1 11111111 5 1111111111 888888 1 1 0 3
lowQualScore : . . . . . ..... ............. . . . . ... . ... .... .... . .. .... . . . . ....... . . .... .. ...................... .......... . . .. . . ..... ......... . ..... . . . . .. ... ...... ...... ..... ... . ...... .... ..... ... ... . ... .. . . .... . . ..... .... . ......... ............ . .......... . . . ........ ................................. ....... . ... ... . ......... . ....... . . .................. . .......... . .... ... . ... . . .. . . . . . .. . . . .. . ... . ..... ....... . .... . ... . . ........ . .......... ...... . . . .
lowQualScore : 5 4 2 4 4 00000 2222222222222 1 6 4 9 444 1 222 5555 7777 4 00 1111 2 5 5 2 7777777 3 3 3333 11 8888888888888888888888 6666666666 0 1 99 1 2 77777 222222222 1 77777 3 3 1 2 44 444 222222 111111 11111 999 9 222222 9999 11111 888 333 4 111 44 5 0 3333 0 1 33333 4444 4 555555555 555555555555 2 9999999999 6 1 0 22222222 333333333333333333333333333333333 3333333 9 777 888 5 333333333 5 1111111 5 5 555555555555555555 2 3333333333 9 0000 999 2 111 2 2 11 1 8 1 4 2 99 1 2 1 99 1 999 9 77777 3333333 6 1111 4 999 9 0 44444444 7 6666666666 222222 5 4 8 1
consensus : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--A--C--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATN-TCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGNCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCACACATGAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
Reference ( family-409 ) : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--A--C--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATN-TCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGNCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCACACATGAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160913 : CGAAGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTAAA-A--ACA--A--A--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCAAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------CATTGGAAACGTCTAGGACACAGGATTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GTCATGGCAGTAATTTGAACCTTCATCTCCCATGTACTA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CAAT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAA-CCAACACATTTACTTAAGCTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACCATCTGGTTGTAATACTAAACAAG-ACAAACAAAGTAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTATAAAAAAATAT-A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--A---A--A--CA----AGACATT-------TTTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTATTAAGATAATGGACTTAAAAATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TTT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATAAC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTTCTCCTTTTTT
gi|160914 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATG-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGCA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCATTGATTTGAACTTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGAATGCATACATAAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATCGAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATATGTTCTCTTTAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACAATCTGATTGTAATACCAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAAAATATAAATGAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAA-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGAA-TAAGTAAGAAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTTATAAAAAAATATA--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TT-AAA-A--ATAAA--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCAATTCTTTT-T---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTCGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCA---TGTACTAAGATAATGAGCTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTGAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTGATGAAATGCACTTTTGTAA--------CACAGAACT-TCA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTCTTCCTTTTTT
gi|160915 : CGAGGAAT-GATCCGACAACTTCGGCAATGAGAAGTAAGTGGCTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGAACAAATATGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-T--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATATTGCA-TTCAAGCATAAATTATGTTCTTGCAGCTTA-------AATGTTAAAATG-TGACTTAA----CTAG--GCAGGGTCAAT-------------CA----------AA----------TATTGAAAACGTCAAGGGCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------AA-TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ATA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAA-CCAATACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGTTGAGGCATCAAT-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGGCACTTCTACAATCTGGATGCAATACTAAACAAG-ACAAACAAAATAGACACAAACTATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTA----CAG-TCCACGAAAC---------ATATAC-----------TTTTCTAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTA
gi|160916 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTTGGCAGCGAGAAGTAAATGGTTATTTGAC-G--ACA--A--CAACACTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TT----AT-TCTAGACACC-CGACATTCATACTGTAATTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CTAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACCATAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GTGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTGATTTGAATCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACACAAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGATGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAATTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTTTACAATCTGGTTATAATACTAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACGAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACAGAAA---------AAATAA-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTATAAAAAAATAT-A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--ATAAA--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CATATTATCATGTTGTGCAATGAAAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGCAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTGACATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTT-TAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCTACTCCTCCTTTTTT
gi|160917 : CGATGATT-GATCCGACATTTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTAAC-A--ACA--A--C--C-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTTTA-TTCAAGCATAAATCGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGAC---------CAAATGTATA-TGTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAATGTCTAGGACACAGGACTAAAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTTCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAACCCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACAATCTGGTCGTAATACTAAACAAG-ACAAACAGAATAGACAAAAAGTATAGACCGT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCATGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAATCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---C-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTTTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATGTTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATCAA----TATTTATAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CAAAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCTTTTTTT
gi|160918 : CAAGGATT-GATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGTGGTTCTTTGAC-A--ACA--A--C--A-TTATGGAC---------ACAGAAGG---AAC---TG---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGC----ATAGAGTTCTTGCAGTTAA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CTAAATATATA-TTTCACGA----------CA----------
gi|160918 : AAATGTTAAA---ATATGACTTAAC-TA-A-ATATATA------T--TTCACGACAGGGTTAGTCTGTG-GACATGGCAGTAATTTGATCTTCCATCTCCCATGTACCA--ATA---G------AAA-----AAA-----AAA---T-CATT------GT----G-----CATGACTGCATCCATTAA-TAAATCCATTTACTTGAGTTCCATAATAAGCAGCTAGGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAATTCCCATCAGTTCTTGTC----CCGACACTTCTACAATCAGGTTGTAATACAAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAACATATAGACCAT-----GTATGTTTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TGAGTTAgggttagtctgtggacatggcagtaatttgatcttccatctcccatgtaccaatagaaaaaaaaatcattgtgcatgactgcatccattaataaatccatttacttgagttccataataagcagctagggcatccaaatatatatgaaatatacaatctggacataaattcccatcagttcttgtcccgacacttctacaatcaggttgtaatacaaaacaagacaaacaaaatagacaaaacatatagaccatgtatgtttataaactgcagtccacggaaaatatacttttcgaatgtaaggcagtcagaaagagtaagcatgagtta
gi|160919 : caaggattgatctgacaacttcggcagtgagaagtaagtggttctttgacaacaacattatggacacagaaggaactgtttgtataattctaaacaccagacattcatactgtattcaagcatagagttcttgcagttaCAAGGATT-GATCCGACAACGTTGGCAGTGAGAAGTAAGTGATTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGGATACCTCTGTCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATGCTGTA-TTTAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTAAATCATTAATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-ATTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGACACAGGACTAGACAGA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AATCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCTCTGTACCA--AGA---A------
gi|160920 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATAGTTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-ATACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAACATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------ACA-----A
gi|160921 : CAAGGATT-GATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGATTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-TTATGGACAAATCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TC
gi|160922 : CGAGGAAT-GAACCAACAACTTTGGCAGTGAGAAGTTAGTGGTGATTTGAC-A--ACA--------C-CT-TGGACAACTCTGCC
gi|160923 : CGAGGATT-GA-CCAACAATTTAAGCGGTGAGAAGTAAGTGGCCATTTGAC-A--ACA--C--CA-C-CT-TTGACGACTCTGCCACCAAAAG---AGC---CA---TT----TAT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGGCATTCATGCTGTT-ATCTAGCATTAGTAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-CGACTTA-----TTAAATATATT-TCTCTGGA----------CAGGATTAATCAAA----------TGTTGGAAAGTTCAGGGTCACTTGACTAGAA-AA-ACA-----A------T--ACAA-AAGA-----AGTCTTTG-GACACATCAGTAATTTTGATCTCCATCTCCAATGTACCA--AGG---A------ATA------CT-----ATATTTA-CATA------AAA---G-----CATGACTGTACACATG-------------TACTTAAATTCCCAAATTAGCAGCTGAAGTATCCAA-AT---A
gi|160924 : CGGGGACT-TAACCAATAACTTAAGTGGTGAGAAGAAAGTGGTCATTTGAC-A--ACA--C--CA-C-CT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AGC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACATC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGAATTAGAAGAGTGTTTCTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-TGACTT-A----TTACATGTATT-TCTCTGGACAGGATCAATCA----------AA----------TGTTGGAAACTTCAGGATCATTTGACTAGAA-AA-ACA-----A------T--TTAA-GAGA-----AGT-TTTA----AT--CAGTAATTTTGACCTCAATCTCCCATGTACCA--AGG---A------ATG-----CTATCTTTACATT-GTCATT------ATAAAAG-----CATGACTGTACACATG-------------TACTTAAATTCCCATATTAGCAGCTGAAATATCCAA-A
gi|160925 : CGGGGATG-TAACCAACAATTTAAGCAGTTGGAAGTAAGTGGTCATTTGTC-A--ACA--C--CA-C-CT-TGGACATCTTTGCCAC
gi|160925 : AGAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-TGACTTA-----TTAAATGTATT-TCTCTGGA----------CA----------AAAACAATAAAATGTTGGAAACTTCAGGGTCACTTGACTAGAA-AA-A-A-----AACAATTTAATTAA-GAGA-----AGTATTTG-GACATATCAGTAATTTGGACCTCAATCGCCCATGTACCA--AGG---A------ATA------CT-----ATG---A-CATTTTCCCCGTAAAAG-----CATGACTGCAGACATGTA-CCATTCCATTTAATTAAATTCCCAAATTAACGGATGACGTATCCAA-AT---ACAtcatgaccactcagagtttttgtggtttaaatgttaaacaatgacttattaaatgtatttctctggacaaaaacaataaaatgttggaaacttcagggtcacttgactagaaaaaaaacaatttaattaagagaagtatttggacatatcagtaatttggacctcaatcgcccatgtaccaaggaatactatgacattttccccgtaaaagcatgactgcagacatgtaccattccatttaattaaattcccaaattaacggatgacgtatccaaataca
gi|160926 : cggggatgtaaccaacaatttaagcagttggaagtaagtggtcatttgtcaacaccaccttggacatctttgccactcatgaccactcCGGAAATT-GAACCTACGACCTTAGCAGTGAGAAGTAAATGATC--TTGAT----ACG--G--CG-C-CT-TAGACCATTCTGCCAC-GGAGG---ACCCTTCA---TT----T------TA----AT-
gi|160927 : GAGGAAT-GAACCAACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTGAC-A--ACA--A--CA-C-CT-TGGACAACTCCGCCTCAAAAAGT--AAC---CT---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAAACACC-AGTCATTCATTCTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCATGTTGTTTA-------AATATTAACAGATTTACTTAAGTTCCCAAAT
gi|160928 : GAGGCTC-AAACCCTCAACTTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTAAT-G--ACA--G--TG-T-CT-TAGACCACTCGGCCACAGA
gi|160929 : GAGACTC-GAACCTGCGACCTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGATC--TTGA--G--ACA--G--CG-C-CT-TAGACCACTCGGCCACAG-AGA---ACC---CA---TT----T
gi|160930 : GGCTC-GAACCCATGACCTCAACAGTGAGAGGTAAGCGGTCTTCAGAT-G--ACAG-A--A--C-CT-TGGACCACTCGGCCAC-GGACG---ACC---CATACTC----TAT-A--CA----AT-TCT
gi|160931 : GGACTCGAACCTACGACCCCAGCAGTGAGAGGTAAGTGATC--TTGA--G--ACG--A--CA-C-CT-TAGACCACTCAGCTATGGAGGA---AAC---T----TT----TGT-
gi|160932 : GGGTT-AAACTCACAACCTAAGCTGTGAGAGGTAAGTGATC-T---ACAG--ACA--A--CA-T-CT-TGGACCACTTGGCCACAGAAG
gi|160933 : TT-GAACCTACGACCTTAGCGGTGAGAGGTAAATGAT--TTTGA--A--ACA--G--CA-C-CT-TAGACCACTCGGCCGC-GGAGG---ATC---CA---TT----GTT-A--CA----ATGTCCAAA
gi|160934 : TT-GATCCAACATCCTCAGTGGTGAGAAGTAAATGGCCATCTGAC-A--ACA--G-------TGATGGAGGACTC
gi|160935 : TC-GAACCAACGACTTTAGCGGTGAGAGGTAAATGGTCTTGAGAC-G--GCA--A--C--T----TAGACCATTCGGCCAC-GAAGA---ACC---CT---TT----TCT-G--TG----GT-TTTATACA
gi|160936 : TC-GAACCTACAACCTTGGTGATGAGAGGTAAGTGATC--TTAAT----ACA--G--CGAC-TTA--GACCACTTTGCCACAG-AGG---ACC---C----------TGT-G--TT----AT-T
gi|160937 : TC-GAACCGACGACCTCAGCGGTGAGAAGTAAGTAGCCATTAGGT-T--ACA--G--C--G-CTGT--ACCACTCAGCCAC-GGAGG---A-----CA---CT----T
gi|160938 : T-GAACTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTGAC-A--ACA--A--CA-C-CT-TGGACAACTCTGCCTAAAAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAATCACC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGCATAAATAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATATTAAAATATTTACTTAAGTTCCCAAAT
gi|160939 : ACCTCA-CAATGAGAGGTAAATGGTCATTTGGT-G--ACAGCA--C--C-ATATG--TCACTCTGCCACGGAGGA---AAC--------TT----AAT-A--TA----A
gi|160940 : atccatgATCC-ACAACCTCGGCAGCGAGAGGTAAGTGATC--TTCA--G--ACA--G--TG-C-CT-TGGACCTCTCGGCCTCAG-AGA---AAC---CC---TT----TAT-A--
gi|160941 : CCAACAACTTAAGTGGTGAGAAGTAAATGGTCATTTGAC-A--TCA--C--CA-C-CT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AA------------------------------------ACAAC-AGACATTCATGCTGTA-GTCAAGAATTAGTAGAGTATTTGTGGTTTA-------AATTTTAAACAA-TTACTT-A----TTACATGTATT-TCTCTGGACAGGATCAATCA----------AA----------TGTTGGAAACTTCAGGGTCACTTTACTAGAA-AA-ACA-----A------T--TTCA-GAGC-----AGTCTTTG-GACACGTCCGGTATTTGGACCTCCATCTCCTATGTACCA--AGG---ATTTAGGAAT-----ACT-----ATACTTA-CATT------GT----AAAAACCATGACTGTACACATG-------------TACATAAATTCCTAAATTAGCAGCGGAAGTATTCAA-A
gi|160942 : CCCACAACCTCAGCTGTAACAGATAAGTGGTCATTTAAC-A--ACA--A--TG-C-CT-TAGACCACTTGGCCACAG-AGG---AAC---CG---------TGT-A--TA----AT-
gi|160943 : CCCACGACATCAGTGGTGCGAGGTAAGTGGTCAATAGAC-A--ACA--A--C--A-CTTTATACGACATAACTACAG-AGG---AAC---CA---CT----TATGA--TA----A
gi|160944 : CCGAAAACCTCAGCAGTGAGAGGTAAGTGGTCATTGGAC-GACACA--A--C--C-TCA--AACTACTCGGCAACGGAGGACCTAAA---CA---TT-----------------AT-TTAAAACACT--GATGATTGTACTTTC-TTCAA
gi|160945 : CCTACAACATAGGCCGTGAGAGGTAAACGATCTTTAGAC-G--GCA--------C-CT-TAGACCATTCTGCCACAG-GGG---ACC---CG---TTAGGATAT-A--TACAAGATGTATAAATACCTGGATATT-ATAC-ATA-TT
gi|160946 : ACAACCTCATCGTTGAGAAGTGAATGGTTGTTTAAC-A--ACA----------CCATAGACCACTTGGTCACAG-AGG---ATC---CA----T----GGT-AACTA----GT-TTTAAAttgttaaaatggtatataatttctaatttcaagtta
gi|160947 : CTTAGCAGTGAGAGGTAAATGACC--TTGA--G--ACA--GTGC--C-CCA--GACAACTCTGCCACAG--GG---GAC---C----TC----TGT-A--AT----AT-TATAAATA
gi|160948 : aaCAGCAGTGAGAGGTAAGTAGTCATTAGAC-C--ACA--G--C--A-CTTTAGACCACGCTGCCACAG-AGG---ACC---C
gi|160949 : GACAACT--GCCGCTGCAGG---GCC---CA---TT----TGT-A--TA----TT-TTTAAACACT-GGTCATTCATGTTGTA-TTCAAGCCTAAATAAAGTTCTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAG-TGACTTAA----CCAAATGTATT-TCTCTGGA----------CATGGTCGATCTAA----------TGTTCGAAACTTCAGGGCCACAGGACTAGAA-TACA-A-----A------A--TTAA-GAGA-----AGTCTTTG-AACATGA-----------ACCTCCATCTCCAGTGTA-----AGC---T------AAA------CA-----ATA---G-TATT------GT----G-----CACTACTACTCACACGTA-CCATT-CATTTACTTAAGTTACCAAATAAGCAGCTGATGCATTCCA-AT---ATTTATAAAATATACAATAATTAAGATCTA---TCCCTTCATTTCTTGTTTGTTCAGACGCTCCTACACTCTGGTTGTAATACTAAACAAGAACGAACAAAATAGAC---AGATATATAC
gi|160950 : aaatgactgattcaaatcgctatataaA-----AACCTATGTGACATGTCAGTATTTTGGACTTCCATCTCCCATG---------------------AA-----ACA-----TTG---G-CACC------ATAAAAG-----CACAACTGCACACATGTA-CCATCACATTTACTTAAATTCCTGAACTGGCAGCTGAAGTATCCAACAT---ACA
gi|160951 : A-----AACCTATGTGACATGTCAGTAGTT-GGGCCTCCATCTCCCGTGTACCA--AGG---A------ATACTGTTACATTG--GCA---C-CATT------AAA---G-----CATGACTGCACACATGTA-CCATTCCATTGACTTAAATTTCTGAACTGGCAGCTGAAATATCAAA-A----ATACA
gi|160952 : ACCAGTAGAGCTA------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAT-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGTATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATATGTTCCCTTCAG-----GTT----CAGAC
gi|160953 : AACAGATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATTTATGAAATATACAAT--CTT-GACTTCGGTTCCCTTCAGTTCTTTTC----CAGACTCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATAGGTACAAACAAAACAAACAAAAAATATAGa
gi|160954 : AAAATATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATTCAA-AT---ATTTATGAAATATACAAT--CTG-GACTTCGGTTCCTTCCAGTTCTTGTT----CAGACTCTTCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATGGGTACAAACAAAACAAATAAAAAATATAG
gi|160955 : AA-ATGAAATACATG---TATACAAA--CTA-GACATAAGTTTTCTTCAGTTCTTGTC----CAGATTCTCCAACAATCTAGTTGTAATATTAAACAGGAACAAACAAAAAAGACAAAAAATATAG
gi|160956 : at---ATATATGAAATCTACAAT--CTG-GGCA-AAGTTCCCATCAGTTCTTGTC----CAGTCTCTCCTACAATCTAGTTGCAAGACTAAACAGGAACAAACAAAGTAAACAAAAGATATAG
gi|160957 : ---ATAAATGAAATCTACAAT--CTG-GACATAAGTTTCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACTCTCCTACAATC------TAAT-CTAAACAGGAACGAACAAAATAAACAAAAAATATAG
gi|160958 : ATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCTTTCAGTTTTTGTC----CAGACTCTCCTACAATCTAGTTTTATTACTAAACAGGAACGAACAGAATAGACAAAATATA
gi|160959 : TGAAATACACAGT--CTA-GATATAATTTCCTTTCAATTCTTGTC----CAGATTCTTCTACAATCTAGTTTTCATACTAAACAGGAACAACCAAAATAGA-AAAAAATATA
gi|160960 : GGAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAAACTCTCCTACAATCTAGTTGTATTACTAAACAGGAAGGTACAGAATTGAC-AAAAATATAG
gi|160961 : AAAAT-TAGAACATTAAAAGTAAGACTA-AAACTGTGAGCAGCTCAACAAAAA---------AT----------------TTTTGAACACA-GGTA----------ATT-------GCAAGCAATAA---AACAACATGTTGTC-AATGCAGCAAT--------AAAC----------------A-----------------T-------TATTTAA---AA---A-CATAT---------AA-----AT-------TA-TAA-A--TT--A--A--TTATAGAGATATT-------T-----------A-----ATTG---AAGCCATCGCTTTT-CT--A-T-GTT--GGTTGCAAATGCTGGGACTTGAATCCAGAAT-TTCAC-C--AAA-A-GT-GTAGATAAATTTGCCAGTT--ATACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTCCAATATTCACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------GAA---AAGTTAAAAG-TATTTAAATTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAA--------CACA-CACTCACAGCAGCAC--ATGTTTTCTAA------TA------ATATGTAGTATAATATC-AAA-----------TAAACACCAGGTCTACTCATCCATTT
gi|160962 : ATTGTAAACTG----CAG-CCCACGGAAA---------ATATATATAAAATATATTTTTTTAATATATATCA----------GTCAGAAAGAGCAAGCA-CAA
gi|160963 : ATTGTAAACTG----CAG-TCCACGAAAATGTATATAAACATAT-----------TGTTTGAATGTATAGCA----------GTCAAAAAGAGCAGCCA-CAA---AATACCCTGATGACTCATAAAACTTT--------AAAT----------------A----------------------------TTAA---AA---GTAAAATATATGTATAAATTATTATTTTTTAATA-GAG-A--AT--A--A--T------GTCATTAAAAACATC-TTTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCTTTTCC---A-T-GTT--GTTTGCAAATGCTGGG-------------AT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACAACATAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATTGACTTTAATATTCACCAA-----ATCTAAATATGTAAAT-------T----GAAATTAAATCGTATTTAAACTAGTCC-AT---T-TTCTATTTATATAATTCACTCTTGTAATACACATTCACAGCAGT-ACA----------TGTTTTCTAA------
gi|160964 : GAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCACTTAAAAGCAGTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGT
gi|160965 : AAA---------ATATAT-----------TTTGCAAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAAAGAAAGCA-TAA
gi|160966 : TAACATTTTGTC-CATGCAGCGGC--------AAAC----------------A--------------TTATAAAAAAAT-ATCAATCAAA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--ACAA--C-----AGACTTT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCTATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-GTCTA-C--AAA-A-GT-GTA-ACGTGTTTGCCAGTT--ACATCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGAATTTAAATATTTACCAT-----TTCAAATTATATAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTTA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAATACTATTACTATATACATTTAGTATAATATA-AAAAATTGCAAAATCAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160967 : ataaaatttatgtaatactggtaaatatagcaataaaaacattgcac---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--A---------C-----AAA--------------TGTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCCTTT-CC--A-T-GTT--GTTTGCAAATGTTGGGATTTGAACCCAAAAC-TTCTA-A--AAA-AAGT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGGTAATGGAATTCAATATTTCCCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAA---AAGTTAAAAT-TATTT-AAATAAGTCACAT--T-TTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTA--------CACA-CACTCACAACAGTAC--ATGTTTTCTAT------TA--ATATATAT----TATAATATC-----------AAATTAAAAACCAGGTCGACTCATCCTTTT
gi|160968 : taagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattgTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------ATTATAACAAATATAC-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--GT--A--A---------AAC-TT-------TTTTTTTTCACCA----TATCT---TAGCCATCT-TTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-AA---TATTATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ACCAAAATATGTAAAT-------TAATAGAATTTAA----TATTTAAAATAGCCCACATTTT-TTTTATTAATAAAGTGCACTCTTGTAA--------CACACCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAATACTCAGGTCGACTCCTCCTTTTT
gi|160969 : TAGCATTTTATC-AAAGCAGCAATTTAAAAAAAAAA----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---GA---G-A---T---------TGTT-TCAT-------TA-AAA-A--A---A--A--C-----AGAGGTT-------TCTTTTT-CACCA----TATTT---AAGCCATCTTTTTT-----A-T-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGTCTTAAATATTTATCAA-----ATAAACTTATGTAAA--------TA---------AA----TATTTAAAATAG-CCAAA---TATTCTATTTATAAAATACACTCTTGAAACACACACTCACAGCACT-ACA----------TGTTTTCTAA------TACTACATGTATATAGAATAACATCTAATTTTTGCGAAATTAAAAATCAGATTTACCCCTTTTTT
gi|160970 : ATGTTGTC-CATGCAGCAAC--------AAAC----------------AT-------------C-A-----------TTAA---AA---A-A
gi|160970 : ATGCATTAA---------AAAT----------------A--------------G-AT-------A-TTTAA---TA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------CA-AAA-A--AC--A--G--C----------------------TTTTTCACTA----TATTG---AAGCCATCTCCGTT-C---AAT-GCT--GTTTGCAAATGCTGAGATTTGAACTAAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCATTTTAACACCATA-AAG-CA---AATCATTTTGTACTAAGATAATGGACTTCAATATTAACCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAA---AAGTTAAAAG-TATATAGACTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAATACACACTCACAGCAGT-ACA----TGTACATGTTTTCTAA------TA--ATATA----TAGTATAGTATC-AAAcatattatatatatatgcattaaaaatagatatttaatagagaataatttcatcaaaaaacagctttttcactatattgaagccatctccgttcaatgctgtttgcaaatgctgagatttgaactaagaatttctacaaaagtgtagatgtgtttgccattttaacaccataaagcaaatcattttgtactaagataatggacttcaatattaaccaaatcaaattatgtaattaaaagttaaaagtatatagactagtcccattttctatttataaaatacactcttgtaatacacactcacagcagtacatgtacatgttttctaataatatatagtatagtatcaaa
gi|160971 : atgttgtccatgcagcaacaaacatcattaaaaaacatattatatatatAT----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-AGAAA--A--A--C-----AGACATT-------TCATTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTTTTTT-C---A-C-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACACTACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGACTTAAATATATACCGA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAATAAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGTACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ATA----T-T--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTTTAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAAACAGGTCCACTCCTCCCTTTTT
gi|160972 : aatattcataaaaaatTTTTTTGCCAATAATATTT---AAGTCATTTCTTTT-C---A-AAGTTAAGTTC-----TGCCAGGATTCGAACCCGGAAC-CTCCA-TTTAAACA-GT-G--GATGTGTTTTCCAGTT--ACACCACAGAAGTCT---TATTAT-CTGTACTAAAA-AATGGACTTAAATATTTG-CAACATCTATCAAATTA
gi|160973 : aaatatgaatttcaataacaattttaatatatataaaactattttatgatg-AT-------T-TATGA---AAATTG-AAAATCT-------AATT-TT-C-------TATAAC-A--AT--A--A--A-----AAACAAT-------------------A----CATTC---AAGTCATTTCTTTT-CCAAA-T-TTT--ACTC----TTGTCAGGGGTCGAACCT-GAGTCTTCTA-C--CAA-A-ATAGTAGATGTGTTAGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTACAGAGAAAATGGTCTTAAA
gi|160974 : atgtcaATCTTTCAAGCCATTTCTTTC-CCAAA-T-TTT--ACTC----TTGTCGGGGATCGAACCC-GAGTCTTCTA-C--CAA-ATGA-GTAGATGTGTTAGCCAATT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTAC-AGAAAAATGatactaac
gi|160975 : aagttatgaaaatagaaaatcaattttctataacaatcaaaaca-AT-------T-TGTAT---AATTCG-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAATA--AT--A--AAAC-----AGACATT-------TCTTTTT-CACCA----TATCT---AAGCAATCTTTTTT-C---A-T-GTT-----TGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGT---ACTAAGATAATGAACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATGT--ATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTTGACTCTTCCTTTTTT
gi|160976 : A---AA---G-AGAAT---------AATG-CCAT-------TA-AAA-G---C--A--C--C-----AGAATTT-------TCTTTTTCCACCG----TATTT---AAAACATTT--TTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTGGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-C-GT-GTAGATGTGTTTGCCTGTT--ACACCTTAGAAG-CA---AATCATGTTGTATTAAGATAATGGACATAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATTTAAACTACATTGTAATAGAAATTCA----TATATAAAATAGCCCAAT---T-TTCTATTCATAATATACATTCTTGTAACACACACTCACAGCACT-ACA----------TATTTTCTAA------AACAATA------TAGTATGATATC-AAATTTTATATAAT
gi|160977 : TT-TCAT-------AA-AAA-A--AA--C--A--C-----AACCATT-------TCAT--------A----CATTC---AAGCCATTTCTTTT-CCAGA-T-TTT--ACTC----TTGTCAGGATTTGAACCC-GAGTCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGAGCAAAGGAAATGGA-TTAAATAT
gi|160978 : TGTCAGGATTTAAACC---AATCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGATTGCCAGCT--ACCCCACAAAAG-cataattttacc
Alignments
lowQualScore : 2222222222222 1111 3333333333333333333333 1111111111 111111111 11111 111 2222 1 11111 111111111 111111111111 1111111111 11111111 888888888888888888888888888888888 111111111 111111111111111111 111 2222 44444444 2222222222
lowQualScore : 1 2 4 1 4 66666 6666666666666 2 1 2 7 333 1 222 3333 2222 1 22 3333 3 2 2 0 8888888 1 5 1111 44 4444444444444444444444 4444444444 1 2 33 3 9 77777 111111111 3 66666 0 5 1 0 33 444 777777 999999 22222 333 2 888888 3333 77777 999 666 2 444 33 2 2 5555 1 4 44444 9999 4 444444444 888888888888 0 5555555555 3 1 4 33333333 222222222222222222222222222222222 9999999 2 444 888 2 444444444 2 8888888 2 2 333333333333333333 1 8888888888 1 5555 333 2 666 2 2 33 1 1 2 8 4 22 2 4 2 22 2 333 3 66666 9999999 8 1111 0 777 2 1 11111111 5 1111111111 888888 1 1 0 3
lowQualScore : . . . . . ..... ............. . . . . ... . ... .... .... . .. .... . . . . ....... . . .... .. ...................... .......... . . .. . . ..... ......... . ..... . . . . .. ... ...... ...... ..... ... . ...... .... ..... ... ... . ... .. . . .... . . ..... .... . ......... ............ . .......... . . . ........ ................................. ....... . ... ... . ......... . ....... . . .................. . .......... . .... ... . ... . . .. . . . . . .. . . . .. . ... . ..... ....... . .... . ... . . ........ . .......... ...... . . . .
lowQualScore : 5 4 2 4 4 00000 2222222222222 1 6 4 9 444 1 222 5555 7777 4 00 1111 2 5 5 2 7777777 3 3 3333 11 8888888888888888888888 6666666666 0 1 99 1 2 77777 222222222 1 77777 3 3 1 2 44 444 222222 111111 11111 999 9 222222 9999 11111 888 333 4 111 44 5 0 3333 0 1 33333 4444 4 555555555 555555555555 2 9999999999 6 1 0 22222222 333333333333333333333333333333333 3333333 9 777 888 5 333333333 5 1111111 5 5 555555555555555555 2 3333333333 9 0000 999 2 111 2 2 11 1 8 1 4 2 99 1 2 1 99 1 999 9 77777 3333333 6 1111 4 999 9 0 44444444 7 6666666666 222222 5 4 8 1
consensus : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--A--C--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATN-TCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGNCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCACACATGAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
Reference ( family-409 ) : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--A--C--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATN-TCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGNCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCACACATGAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160913 : CGAAGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTAAA-A--ACA--A--A--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCAAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------CATTGGAAACGTCTAGGACACAGGATTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GTCATGGCAGTAATTTGAACCTTCATCTCCCATGTACTA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CAAT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAA-CCAACACATTTACTTAAGCTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACCATCTGGTTGTAATACTAAACAAG-ACAAACAAAGTAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTATAAAAAAATAT-A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--A---A--A--CA----AGACATT-------TTTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTATTAAGATAATGGACTTAAAAATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TTT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATAAC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTTCTCCTTTTTT
gi|160914 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATG-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGCA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCATTGATTTGAACTTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGAATGCATACATAAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATCGAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATATGTTCTCTTTAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACAATCTGATTGTAATACCAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAAAATATAAATGAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAA-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGAA-TAAGTAAGAAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTTATAAAAAAATATA--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TT-AAA-A--ATAAA--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCAATTCTTTT-T---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTCGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCA---TGTACTAAGATAATGAGCTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTGAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTGATGAAATGCACTTTTGTAA--------CACAGAACT-TCA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTCTTCCTTTTTT
gi|160915 : CGAGGAAT-GATCCGACAACTTCGGCAATGAGAAGTAAGTGGCTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGAACAAATATGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-T--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATATTGCA-TTCAAGCATAAATTATGTTCTTGCAGCTTA-------AATGTTAAAATG-TGACTTAA----CTAG--GCAGGGTCAAT-------------CA----------AA----------TATTGAAAACGTCAAGGGCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------AA-TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ATA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAA-CCAATACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGTTGAGGCATCAAT-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGGCACTTCTACAATCTGGATGCAATACTAAACAAG-ACAAACAAAATAGACACAAACTATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTA----CAG-TCCACGAAAC---------ATATAC-----------TTTTCTAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTA
gi|160916 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTTGGCAGCGAGAAGTAAATGGTTATTTGAC-G--ACA--A--CAACACTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TT----AT-TCTAGACACC-CGACATTCATACTGTAATTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CTAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACCATAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GTGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTGATTTGAATCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACACAAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGATGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAATTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTTTACAATCTGGTTATAATACTAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACGAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACAGAAA---------AAATAA-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATTATAAAAAAATAT-A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--ATAAA--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CATATTATCATGTTGTGCAATGAAAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGCAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTGACATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTT-TAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCTACTCCTCCTTTTTT
gi|160917 : CGATGATT-GATCCGACATTTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTAAC-A--ACA--A--C--C-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTTTA-TTCAAGCATAAATCGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGAC---------CAAATGTATA-TGTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAATGTCTAGGACACAGGACTAAAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTTCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAACCCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACAATCTGGTCGTAATACTAAACAAG-ACAAACAGAATAGACAAAAAGTATAGACCGT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCATGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAATCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---C-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTTTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATGTTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATCAA----TATTTATAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CAAAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCTTTTTTT
gi|160918 : CAAGGATT-GATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGTGGTTCTTTGAC-A--ACA--A--C--A-TTATGGAC---------ACAGAAGG---AAC---TG---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGC----ATAGAGTTCTTGCAGTTAA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CTAAATATATA-TTTCACGA----------CA----------
gi|160918 : AAATGTTAAA---ATATGACTTAAC-TA-A-ATATATA------T--TTCACGACAGGGTTAGTCTGTG-GACATGGCAGTAATTTGATCTTCCATCTCCCATGTACCA--ATA---G------AAA-----AAA-----AAA---T-CATT------GT----G-----CATGACTGCATCCATTAA-TAAATCCATTTACTTGAGTTCCATAATAAGCAGCTAGGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAATTCCCATCAGTTCTTGTC----CCGACACTTCTACAATCAGGTTGTAATACAAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAACATATAGACCAT-----GTATGTTTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TGAGTTAgggttagtctgtggacatggcagtaatttgatcttccatctcccatgtaccaatagaaaaaaaaatcattgtgcatgactgcatccattaataaatccatttacttgagttccataataagcagctagggcatccaaatatatatgaaatatacaatctggacataaattcccatcagttcttgtcccgacacttctacaatcaggttgtaatacaaaacaagacaaacaaaatagacaaaacatatagaccatgtatgtttataaactgcagtccacggaaaatatacttttcgaatgtaaggcagtcagaaagagtaagcatgagtta
gi|160919 : caaggattgatctgacaacttcggcagtgagaagtaagtggttctttgacaacaacattatggacacagaaggaactgtttgtataattctaaacaccagacattcatactgtattcaagcatagagttcttgcagttaCAAGGATT-GATCCGACAACGTTGGCAGTGAGAAGTAAGTGATTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGGATACCTCTGTCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATGCTGTA-TTTAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTAAATCATTAATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-ATTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGACACAGGACTAGACAGA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AATCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCTCTGTACCA--AGA---A------
gi|160920 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATAGTTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-ATACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAACATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------ACA-----A
gi|160921 : CAAGGATT-GATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGATTATTTGAC-A--ACA--A--C--A-TTATGGACAAATCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TC
gi|160922 : CGAGGAAT-GAACCAACAACTTTGGCAGTGAGAAGTTAGTGGTGATTTGAC-A--ACA--------C-CT-TGGACAACTCTGCC
gi|160923 : CGAGGATT-GA-CCAACAATTTAAGCGGTGAGAAGTAAGTGGCCATTTGAC-A--ACA--C--CA-C-CT-TTGACGACTCTGCCACCAAAAG---AGC---CA---TT----TAT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGGCATTCATGCTGTT-ATCTAGCATTAGTAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-CGACTTA-----TTAAATATATT-TCTCTGGA----------CAGGATTAATCAAA----------TGTTGGAAAGTTCAGGGTCACTTGACTAGAA-AA-ACA-----A------T--ACAA-AAGA-----AGTCTTTG-GACACATCAGTAATTTTGATCTCCATCTCCAATGTACCA--AGG---A------ATA------CT-----ATATTTA-CATA------AAA---G-----CATGACTGTACACATG-------------TACTTAAATTCCCAAATTAGCAGCTGAAGTATCCAA-AT---A
gi|160924 : CGGGGACT-TAACCAATAACTTAAGTGGTGAGAAGAAAGTGGTCATTTGAC-A--ACA--C--CA-C-CT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AGC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACATC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGAATTAGAAGAGTGTTTCTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-TGACTT-A----TTACATGTATT-TCTCTGGACAGGATCAATCA----------AA----------TGTTGGAAACTTCAGGATCATTTGACTAGAA-AA-ACA-----A------T--TTAA-GAGA-----AGT-TTTA----AT--CAGTAATTTTGACCTCAATCTCCCATGTACCA--AGG---A------ATG-----CTATCTTTACATT-GTCATT------ATAAAAG-----CATGACTGTACACATG-------------TACTTAAATTCCCATATTAGCAGCTGAAATATCCAA-A
gi|160925 : CGGGGATG-TAACCAACAATTTAAGCAGTTGGAAGTAAGTGGTCATTTGTC-A--ACA--C--CA-C-CT-TGGACATCTTTGCCAC
gi|160925 : AGAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-TGACTTA-----TTAAATGTATT-TCTCTGGA----------CA----------AAAACAATAAAATGTTGGAAACTTCAGGGTCACTTGACTAGAA-AA-A-A-----AACAATTTAATTAA-GAGA-----AGTATTTG-GACATATCAGTAATTTGGACCTCAATCGCCCATGTACCA--AGG---A------ATA------CT-----ATG---A-CATTTTCCCCGTAAAAG-----CATGACTGCAGACATGTA-CCATTCCATTTAATTAAATTCCCAAATTAACGGATGACGTATCCAA-AT---ACAtcatgaccactcagagtttttgtggtttaaatgttaaacaatgacttattaaatgtatttctctggacaaaaacaataaaatgttggaaacttcagggtcacttgactagaaaaaaaacaatttaattaagagaagtatttggacatatcagtaatttggacctcaatcgcccatgtaccaaggaatactatgacattttccccgtaaaagcatgactgcagacatgtaccattccatttaattaaattcccaaattaacggatgacgtatccaaataca
gi|160926 : cggggatgtaaccaacaatttaagcagttggaagtaagtggtcatttgtcaacaccaccttggacatctttgccactcatgaccactcCGGAAATT-GAACCTACGACCTTAGCAGTGAGAAGTAAATGATC--TTGAT----ACG--G--CG-C-CT-TAGACCATTCTGCCAC-GGAGG---ACCCTTCA---TT----T------TA----AT-
gi|160927 : GAGGAAT-GAACCAACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTGAC-A--ACA--A--CA-C-CT-TGGACAACTCCGCCTCAAAAAGT--AAC---CT---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAAACACC-AGTCATTCATTCTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCATGTTGTTTA-------AATATTAACAGATTTACTTAAGTTCCCAAAT
gi|160928 : GAGGCTC-AAACCCTCAACTTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTAAT-G--ACA--G--TG-T-CT-TAGACCACTCGGCCACAGA
gi|160929 : GAGACTC-GAACCTGCGACCTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGATC--TTGA--G--ACA--G--CG-C-CT-TAGACCACTCGGCCACAG-AGA---ACC---CA---TT----T
gi|160930 : GGCTC-GAACCCATGACCTCAACAGTGAGAGGTAAGCGGTCTTCAGAT-G--ACAG-A--A--C-CT-TGGACCACTCGGCCAC-GGACG---ACC---CATACTC----TAT-A--CA----AT-TCT
gi|160931 : GGACTCGAACCTACGACCCCAGCAGTGAGAGGTAAGTGATC--TTGA--G--ACG--A--CA-C-CT-TAGACCACTCAGCTATGGAGGA---AAC---T----TT----TGT-
gi|160932 : GGGTT-AAACTCACAACCTAAGCTGTGAGAGGTAAGTGATC-T---ACAG--ACA--A--CA-T-CT-TGGACCACTTGGCCACAGAAG
gi|160933 : TT-GAACCTACGACCTTAGCGGTGAGAGGTAAATGAT--TTTGA--A--ACA--G--CA-C-CT-TAGACCACTCGGCCGC-GGAGG---ATC---CA---TT----GTT-A--CA----ATGTCCAAA
gi|160934 : TT-GATCCAACATCCTCAGTGGTGAGAAGTAAATGGCCATCTGAC-A--ACA--G-------TGATGGAGGACTC
gi|160935 : TC-GAACCAACGACTTTAGCGGTGAGAGGTAAATGGTCTTGAGAC-G--GCA--A--C--T----TAGACCATTCGGCCAC-GAAGA---ACC---CT---TT----TCT-G--TG----GT-TTTATACA
gi|160936 : TC-GAACCTACAACCTTGGTGATGAGAGGTAAGTGATC--TTAAT----ACA--G--CGAC-TTA--GACCACTTTGCCACAG-AGG---ACC---C----------TGT-G--TT----AT-T
gi|160937 : TC-GAACCGACGACCTCAGCGGTGAGAAGTAAGTAGCCATTAGGT-T--ACA--G--C--G-CTGT--ACCACTCAGCCAC-GGAGG---A-----CA---CT----T
gi|160938 : T-GAACTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTGAC-A--ACA--A--CA-C-CT-TGGACAACTCTGCCTAAAAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAATCACC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGCATAAATAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATATTAAAATATTTACTTAAGTTCCCAAAT
gi|160939 : ACCTCA-CAATGAGAGGTAAATGGTCATTTGGT-G--ACAGCA--C--C-ATATG--TCACTCTGCCACGGAGGA---AAC--------TT----AAT-A--TA----A
gi|160940 : atccatgATCC-ACAACCTCGGCAGCGAGAGGTAAGTGATC--TTCA--G--ACA--G--TG-C-CT-TGGACCTCTCGGCCTCAG-AGA---AAC---CC---TT----TAT-A--
gi|160941 : CCAACAACTTAAGTGGTGAGAAGTAAATGGTCATTTGAC-A--TCA--C--CA-C-CT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AA------------------------------------ACAAC-AGACATTCATGCTGTA-GTCAAGAATTAGTAGAGTATTTGTGGTTTA-------AATTTTAAACAA-TTACTT-A----TTACATGTATT-TCTCTGGACAGGATCAATCA----------AA----------TGTTGGAAACTTCAGGGTCACTTTACTAGAA-AA-ACA-----A------T--TTCA-GAGC-----AGTCTTTG-GACACGTCCGGTATTTGGACCTCCATCTCCTATGTACCA--AGG---ATTTAGGAAT-----ACT-----ATACTTA-CATT------GT----AAAAACCATGACTGTACACATG-------------TACATAAATTCCTAAATTAGCAGCGGAAGTATTCAA-A
gi|160942 : CCCACAACCTCAGCTGTAACAGATAAGTGGTCATTTAAC-A--ACA--A--TG-C-CT-TAGACCACTTGGCCACAG-AGG---AAC---CG---------TGT-A--TA----AT-
gi|160943 : CCCACGACATCAGTGGTGCGAGGTAAGTGGTCAATAGAC-A--ACA--A--C--A-CTTTATACGACATAACTACAG-AGG---AAC---CA---CT----TATGA--TA----A
gi|160944 : CCGAAAACCTCAGCAGTGAGAGGTAAGTGGTCATTGGAC-GACACA--A--C--C-TCA--AACTACTCGGCAACGGAGGACCTAAA---CA---TT-----------------AT-TTAAAACACT--GATGATTGTACTTTC-TTCAA
gi|160945 : CCTACAACATAGGCCGTGAGAGGTAAACGATCTTTAGAC-G--GCA--------C-CT-TAGACCATTCTGCCACAG-GGG---ACC---CG---TTAGGATAT-A--TACAAGATGTATAAATACCTGGATATT-ATAC-ATA-TT
gi|160946 : ACAACCTCATCGTTGAGAAGTGAATGGTTGTTTAAC-A--ACA----------CCATAGACCACTTGGTCACAG-AGG---ATC---CA----T----GGT-AACTA----GT-TTTAAAttgttaaaatggtatataatttctaatttcaagtta
gi|160947 : CTTAGCAGTGAGAGGTAAATGACC--TTGA--G--ACA--GTGC--C-CCA--GACAACTCTGCCACAG--GG---GAC---C----TC----TGT-A--AT----AT-TATAAATA
gi|160948 : aaCAGCAGTGAGAGGTAAGTAGTCATTAGAC-C--ACA--G--C--A-CTTTAGACCACGCTGCCACAG-AGG---ACC---C
gi|160949 : GACAACT--GCCGCTGCAGG---GCC---CA---TT----TGT-A--TA----TT-TTTAAACACT-GGTCATTCATGTTGTA-TTCAAGCCTAAATAAAGTTCTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAG-TGACTTAA----CCAAATGTATT-TCTCTGGA----------CATGGTCGATCTAA----------TGTTCGAAACTTCAGGGCCACAGGACTAGAA-TACA-A-----A------A--TTAA-GAGA-----AGTCTTTG-AACATGA-----------ACCTCCATCTCCAGTGTA-----AGC---T------AAA------CA-----ATA---G-TATT------GT----G-----CACTACTACTCACACGTA-CCATT-CATTTACTTAAGTTACCAAATAAGCAGCTGATGCATTCCA-AT---ATTTATAAAATATACAATAATTAAGATCTA---TCCCTTCATTTCTTGTTTGTTCAGACGCTCCTACACTCTGGTTGTAATACTAAACAAGAACGAACAAAATAGAC---AGATATATAC
gi|160950 : aaatgactgattcaaatcgctatataaA-----AACCTATGTGACATGTCAGTATTTTGGACTTCCATCTCCCATG---------------------AA-----ACA-----TTG---G-CACC------ATAAAAG-----CACAACTGCACACATGTA-CCATCACATTTACTTAAATTCCTGAACTGGCAGCTGAAGTATCCAACAT---ACA
gi|160951 : A-----AACCTATGTGACATGTCAGTAGTT-GGGCCTCCATCTCCCGTGTACCA--AGG---A------ATACTGTTACATTG--GCA---C-CATT------AAA---G-----CATGACTGCACACATGTA-CCATTCCATTGACTTAAATTTCTGAACTGGCAGCTGAAATATCAAA-A----ATACA
gi|160952 : ACCAGTAGAGCTA------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAT-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGTATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATATGTTCCCTTCAG-----GTT----CAGAC
gi|160953 : AACAGATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATTTATGAAATATACAAT--CTT-GACTTCGGTTCCCTTCAGTTCTTTTC----CAGACTCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATAGGTACAAACAAAACAAACAAAAAATATAGa
gi|160954 : AAAATATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATTCAA-AT---ATTTATGAAATATACAAT--CTG-GACTTCGGTTCCTTCCAGTTCTTGTT----CAGACTCTTCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATGGGTACAAACAAAACAAATAAAAAATATAG
gi|160955 : AA-ATGAAATACATG---TATACAAA--CTA-GACATAAGTTTTCTTCAGTTCTTGTC----CAGATTCTCCAACAATCTAGTTGTAATATTAAACAGGAACAAACAAAAAAGACAAAAAATATAG
gi|160956 : at---ATATATGAAATCTACAAT--CTG-GGCA-AAGTTCCCATCAGTTCTTGTC----CAGTCTCTCCTACAATCTAGTTGCAAGACTAAACAGGAACAAACAAAGTAAACAAAAGATATAG
gi|160957 : ---ATAAATGAAATCTACAAT--CTG-GACATAAGTTTCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACTCTCCTACAATC------TAAT-CTAAACAGGAACGAACAAAATAAACAAAAAATATAG
gi|160958 : ATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCTTTCAGTTTTTGTC----CAGACTCTCCTACAATCTAGTTTTATTACTAAACAGGAACGAACAGAATAGACAAAATATA
gi|160959 : TGAAATACACAGT--CTA-GATATAATTTCCTTTCAATTCTTGTC----CAGATTCTTCTACAATCTAGTTTTCATACTAAACAGGAACAACCAAAATAGA-AAAAAATATA
gi|160960 : GGAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAAACTCTCCTACAATCTAGTTGTATTACTAAACAGGAAGGTACAGAATTGAC-AAAAATATAG
gi|160961 : AAAAT-TAGAACATTAAAAGTAAGACTA-AAACTGTGAGCAGCTCAACAAAAA---------AT----------------TTTTGAACACA-GGTA----------ATT-------GCAAGCAATAA---AACAACATGTTGTC-AATGCAGCAAT--------AAAC----------------A-----------------T-------TATTTAA---AA---A-CATAT---------AA-----AT-------TA-TAA-A--TT--A--A--TTATAGAGATATT-------T-----------A-----ATTG---AAGCCATCGCTTTT-CT--A-T-GTT--GGTTGCAAATGCTGGGACTTGAATCCAGAAT-TTCAC-C--AAA-A-GT-GTAGATAAATTTGCCAGTT--ATACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTCCAATATTCACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------GAA---AAGTTAAAAG-TATTTAAATTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAA--------CACA-CACTCACAGCAGCAC--ATGTTTTCTAA------TA------ATATGTAGTATAATATC-AAA-----------TAAACACCAGGTCTACTCATCCATTT
gi|160962 : ATTGTAAACTG----CAG-CCCACGGAAA---------ATATATATAAAATATATTTTTTTAATATATATCA----------GTCAGAAAGAGCAAGCA-CAA
gi|160963 : ATTGTAAACTG----CAG-TCCACGAAAATGTATATAAACATAT-----------TGTTTGAATGTATAGCA----------GTCAAAAAGAGCAGCCA-CAA---AATACCCTGATGACTCATAAAACTTT--------AAAT----------------A----------------------------TTAA---AA---GTAAAATATATGTATAAATTATTATTTTTTAATA-GAG-A--AT--A--A--T------GTCATTAAAAACATC-TTTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCTTTTCC---A-T-GTT--GTTTGCAAATGCTGGG-------------AT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACAACATAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATTGACTTTAATATTCACCAA-----ATCTAAATATGTAAAT-------T----GAAATTAAATCGTATTTAAACTAGTCC-AT---T-TTCTATTTATATAATTCACTCTTGTAATACACATTCACAGCAGT-ACA----------TGTTTTCTAA------
gi|160964 : GAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCACTTAAAAGCAGTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGT
gi|160965 : AAA---------ATATAT-----------TTTGCAAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAAAGAAAGCA-TAA
gi|160966 : TAACATTTTGTC-CATGCAGCGGC--------AAAC----------------A--------------TTATAAAAAAAT-ATCAATCAAA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--ACAA--C-----AGACTTT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCTATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-GTCTA-C--AAA-A-GT-GTA-ACGTGTTTGCCAGTT--ACATCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGAATTTAAATATTTACCAT-----TTCAAATTATATAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTTA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAATACTATTACTATATACATTTAGTATAATATA-AAAAATTGCAAAATCAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160967 : ataaaatttatgtaatactggtaaatatagcaataaaaacattgcac---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--A---------C-----AAA--------------TGTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCCTTT-CC--A-T-GTT--GTTTGCAAATGTTGGGATTTGAACCCAAAAC-TTCTA-A--AAA-AAGT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGGTAATGGAATTCAATATTTCCCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAA---AAGTTAAAAT-TATTT-AAATAAGTCACAT--T-TTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTA--------CACA-CACTCACAACAGTAC--ATGTTTTCTAT------TA--ATATATAT----TATAATATC-----------AAATTAAAAACCAGGTCGACTCATCCTTTT
gi|160968 : taagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattgTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------ATTATAACAAATATAC-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--GT--A--A---------AAC-TT-------TTTTTTTTCACCA----TATCT---TAGCCATCT-TTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-AA---TATTATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ACCAAAATATGTAAAT-------TAATAGAATTTAA----TATTTAAAATAGCCCACATTTT-TTTTATTAATAAAGTGCACTCTTGTAA--------CACACCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAATACTCAGGTCGACTCCTCCTTTTT
gi|160969 : TAGCATTTTATC-AAAGCAGCAATTTAAAAAAAAAA----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---GA---G-A---T---------TGTT-TCAT-------TA-AAA-A--A---A--A--C-----AGAGGTT-------TCTTTTT-CACCA----TATTT---AAGCCATCTTTTTT-----A-T-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGTCTTAAATATTTATCAA-----ATAAACTTATGTAAA--------TA---------AA----TATTTAAAATAG-CCAAA---TATTCTATTTATAAAATACACTCTTGAAACACACACTCACAGCACT-ACA----------TGTTTTCTAA------TACTACATGTATATAGAATAACATCTAATTTTTGCGAAATTAAAAATCAGATTTACCCCTTTTTT
gi|160970 : ATGTTGTC-CATGCAGCAAC--------AAAC----------------AT-------------C-A-----------TTAA---AA---A-A
gi|160970 : ATGCATTAA---------AAAT----------------A--------------G-AT-------A-TTTAA---TA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------CA-AAA-A--AC--A--G--C----------------------TTTTTCACTA----TATTG---AAGCCATCTCCGTT-C---AAT-GCT--GTTTGCAAATGCTGAGATTTGAACTAAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCATTTTAACACCATA-AAG-CA---AATCATTTTGTACTAAGATAATGGACTTCAATATTAACCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAA---AAGTTAAAAG-TATATAGACTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAATACACACTCACAGCAGT-ACA----TGTACATGTTTTCTAA------TA--ATATA----TAGTATAGTATC-AAAcatattatatatatatgcattaaaaatagatatttaatagagaataatttcatcaaaaaacagctttttcactatattgaagccatctccgttcaatgctgtttgcaaatgctgagatttgaactaagaatttctacaaaagtgtagatgtgtttgccattttaacaccataaagcaaatcattttgtactaagataatggacttcaatattaaccaaatcaaattatgtaattaaaagttaaaagtatatagactagtcccattttctatttataaaatacactcttgtaatacacactcacagcagtacatgtacatgttttctaataatatatagtatagtatcaaa
gi|160971 : atgttgtccatgcagcaacaaacatcattaaaaaacatattatatatatAT----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-AGAAA--A--A--C-----AGACATT-------TCATTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTTTTTT-C---A-C-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACACTACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGACTTAAATATATACCGA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAATAAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGTACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ATA----T-T--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTTTAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAAACAGGTCCACTCCTCCCTTTTT
gi|160972 : aatattcataaaaaatTTTTTTGCCAATAATATTT---AAGTCATTTCTTTT-C---A-AAGTTAAGTTC-----TGCCAGGATTCGAACCCGGAAC-CTCCA-TTTAAACA-GT-G--GATGTGTTTTCCAGTT--ACACCACAGAAGTCT---TATTAT-CTGTACTAAAA-AATGGACTTAAATATTTG-CAACATCTATCAAATTA
gi|160973 : aaatatgaatttcaataacaattttaatatatataaaactattttatgatg-AT-------T-TATGA---AAATTG-AAAATCT-------AATT-TT-C-------TATAAC-A--AT--A--A--A-----AAACAAT-------------------A----CATTC---AAGTCATTTCTTTT-CCAAA-T-TTT--ACTC----TTGTCAGGGGTCGAACCT-GAGTCTTCTA-C--CAA-A-ATAGTAGATGTGTTAGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTACAGAGAAAATGGTCTTAAA
gi|160974 : atgtcaATCTTTCAAGCCATTTCTTTC-CCAAA-T-TTT--ACTC----TTGTCGGGGATCGAACCC-GAGTCTTCTA-C--CAA-ATGA-GTAGATGTGTTAGCCAATT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTAC-AGAAAAATGatactaac
gi|160975 : aagttatgaaaatagaaaatcaattttctataacaatcaaaaca-AT-------T-TGTAT---AATTCG-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAATA--AT--A--AAAC-----AGACATT-------TCTTTTT-CACCA----TATCT---AAGCAATCTTTTTT-C---A-T-GTT-----TGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGT---ACTAAGATAATGAACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATGT--ATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTTGACTCTTCCTTTTTT
gi|160976 : A---AA---G-AGAAT---------AATG-CCAT-------TA-AAA-G---C--A--C--C-----AGAATTT-------TCTTTTTCCACCG----TATTT---AAAACATTT--TTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTGGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-C-GT-GTAGATGTGTTTGCCTGTT--ACACCTTAGAAG-CA---AATCATGTTGTATTAAGATAATGGACATAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATTTAAACTACATTGTAATAGAAATTCA----TATATAAAATAGCCCAAT---T-TTCTATTCATAATATACATTCTTGTAACACACACTCACAGCACT-ACA----------TATTTTCTAA------AACAATA------TAGTATGATATC-AAATTTTATATAAT
gi|160977 : TT-TCAT-------AA-AAA-A--AA--C--A--C-----AACCATT-------TCAT--------A----CATTC---AAGCCATTTCTTTT-CCAGA-T-TTT--ACTC----TTGTCAGGATTTGAACCC-GAGTCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGAGCAAAGGAAATGGA-TTAAATAT
gi|160978 : TGTCAGGATTTAAACC---AATCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGATTGCCAGCT--ACCCCACAAAAG-cataattttacc
blockSeqs : C T G A A CGAC ACAACACTA A T A A CCT A CTT ATAC AGGA G AC CAAG G T A AATCATT T T GTTC GG CAGGATTAATCA AACAATAAAA T A AG C C TATAT ACAATTTAA C GGGTT T G GT GCT TTTAGG CTGTTA TCTTT TTT T TTCCCC AAAA AAAAC AAC ACA C GAA AA A T TGTT A A TAAAA TGAG C TGTATATAA TATAAAATATAT CTTAAAAGCA A G T TTAAAAAA ATTTATAAAAAAATATAC AAAAAAA A TCA ATT T ATATGTATA A TTTTTAA T T TTAATTATAG A AAAAACATC T ATAA TTC C CAA A A AA G T A C A TT C A A TA T TAT G CATCT TACATTG T ATCG TTT A G TACACATT C GCAGCACA TACTAT C C T
blockSeqs : . T G A A CAG GCGACTTA A T A A T A . A . . . . G . . . T T GTTC A CAGGATCAATCA . A G T . C . AA . . T G . . . A TTG CTT . . AAAA . AA ATA . . . . G . A T . . . . A . . G . . ATTATAAAAAAATATAC . . . TTC . CT . . . . ATAAAAC A TCT T . . . CAA . . . G T A C A . . T . . . . G . . T AAG T . A CACACACT C ACAGTACA . C C .
blockSeqs : . T G A A CA GCACCATA A T A A . A . A . . . . . . . . T . . A CAGGATCAATCA . T A T . C . T . . . G . . . A . TT . . AAAA . AA ACA . . . . A . A T . . . . C . . G . . ATTATAACAAATATAC . . . . . . . . . . ATAAAAC A TCT T . . . CAG . . . G T A C . . . . . . . . G . . T AAT . . A TACACACT . TGTACA . C C .
blockSeqs : . T G A A CA GTGCCCCA A T A A . A . A . . . . . . . . T . . A CATGGTCGATCT . T A T . . . T . . . G . . . A . . . . A . AA ACA . . . . G . A A . . . . A . . G . . ATT . . . . . . . . . . ATACAAC A TCT T . . . T . . . G T A C . . . . . . . . G . . T AAG . . T CACACACT . TGTT . C T .
blockSeqs : . T G A C CG ACACTA A T A A . A . A . . . . . . . . T . . A CA . A A T . . . T . . . G . . . A . . . . A . AA ATC . . . . A . A A . . . . C . . G . . ATC . . . . . . . . . . GAAAAAC A TCT T . . . C . . . G T A . . . . . . . . . G . . T . . . T . . TGTT . C C .
blockSeqs : . T G A A CA ACACTA A T A A . A . G . . . . . . . . T . . A CA . A A T . . . T . . . G . . . A . . . . . . TA TTC . . . . T . G A . . . . C . . G . . AC . . . . . . . . . . ATAAAAC T TTT T . . . . . . . G T A . . . . . . . . . G . . A . . . A . . TGTT . C T .
blockSeqs : . T G A A CA ACCCTA A T A A . A . A . . . . . . . . T . . A CA . T T T . . . T . . . G . . . A . . . . . . TA TCA . . . . G . T A . . . T . . . . . AC . . . . . . . . . . ATAAC G TCT T . . . . . . . G T A . . . . . . . . . G . . A . . . C . . TGTT . C C .
blockSeqs : . T G A A CA ACATTA A T A A . A . A . . . . . . . . A . . T CA . A T A . . . T . . . T . . . C . . . . . . TA TTC . . . . G . T A . . . C . . . . . AG . . . . . . . . . . ATAAT A TCA T . . . . . . . G T A . . . . . . . . . G . . T . . . A . . TGTT . C T .
blockSeqs : . A A A A CA ACACTA G T C A . G . A . . . . . . . . A . . T CA . A T A . . . T . . . T . . . A . . . . . . TA ACA . . . . A . T A . T . . . . AC . . . . . . . . . . ACAGC A TCT T . . . . . . . G T A . . . . . . . . . T . . . . . . T . . TGTT . C C .
blockSeqs : . A A G A CA ACACTA A T C C . G . A . . . . . . . . A . . T CA . A T A . . . T . . . T . . . A . . . . . . AT ACA . . . . A . T . . . . . . A . . . . . . . . . . ATAAA A TCT T . . . . . . . G T A . . . . . . . . . G . . . . . . T . . TTT . . . .
blockSeqs : . A A G A CA ACATTA A T A G . C . A . . . . . . . . G . . T CA . A C A . . . T . . . A . . . A . . . . . . . AAA . . . . A . T . A . . . . . . . . . . AACAC T TCA C . . . . . . . G T G . . . . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . A A A A CA CCACCT C T A A . A . A . . . . . . . . T . . T CA A . T . . . A . . . T . . . . . . . . . . . TT . . . . A . T . . . . . . . . . . . GTAA A T . . . . . . . . G C A . . . . . . . . . G . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . A T A A CA CCACCT A C A A . C . T . . . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . AAAC . . . . . . . . . . G C A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . A A A A CA CCACCT C G G G . C . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . CACC . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A C G T CA GCGCCT C G A A . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A T G A TG ACACCT C G A A . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A C A T TG GTGTCT C A A G . C . A . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A T A A CA GCGCCT C G G A . C . A . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . A C T A CG GAACCT C G A G . A . C . . . . .
blockSeqs : . T T G A TT ACACCT G G C A . A . G . . . . .
blockSeqs : . A A G A CA ACATCT C T A A . A . A . . . . .
blockSeqs : . A A G A TG GCACCT C A A C . A . A . . . . .
blockSeqs : . A T G A CA GCGCTG C T G A . A . G . . . . .
blockSeqs : . A G G A CA ACACCT A T A C . A . A . . . . .
blockSeqs : . T G A T CA GTGCCT C G A . . A . A . . . .
blockSeqs : . A A G CG CCACCT C T A . . C . . . . . .
blockSeqs : C A A CA ATGCCT A G A . . T . . . . .
blockSeqs : C G . CC ACACTT C A T . . A . . . .
blockSeqs : G T . T ACCTCA G G . . . C . . .
blockSeqs : T G . G GCACTT T T . . . C . . .
blockSeqs : . A . G GTGA C G . . . . .
blockSeqs : C . A CCT C T . .
blockSeqs : G . T ACT A T . .
blockSeqs : A . G CCT C .
blockSeqs : A . G CCA A .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ATC******************************
originalCons : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--A--C--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATN-TCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGNCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCACACATGAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAAC----------------A--------------C-AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
finalCons : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--A--C--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATN-TCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGNCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCACACATGAA-CCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC--------AAACATC------------------------------AT-------T-TTTAA---AA---G-AGAAT---------AATT-TCAT-------TA-AAA-A--AT--A--A--C-----AGACATT-------TCTTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---A-T-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
Alignments
lowQualScore : 22222222222 1111 3333333333333333333333 1111111111 111111111 11111 111 2222 1 11111 111111111 111111111111 1111111111 1111111 9999999999999999 1111111 111111111 222222222222222222222222 1111111111111111111111 111 2222 44444444 2222222222
lowQualScore : 1 2 4 1 4 66666 66666666666 2 1 2 7 333 1 222 3333 2222 1 22 3333 3 2 2 0 8888888 1 5 1111 44 4444444444444444444444 4444444444 1 2 33 3 9 77777 111111111 3 66666 0 5 1 0 33 444 777777 999999 22222 333 2 888888 3333 77777 8 2 666 2 444 33 2 2 5555 1 0 44444 9999 4 444444444 888888888888 0 5555555555 3 1 4 1111111 1111111111111111 0000000 555 999 2 8888 444444444 2 444 2 8888888 2 2 222222222222222222222222 5555 7777777777777777777777 1 5555 333 2 888 2 33 1 1 2 8 4 22 2 4 2 22 2 333 3 66666 9999999 8 1111 0 777 2 1 11111111 5 1111111111 888888 1 1 0 3
lowQualScore : . . . . . ..... ........... . . . . ... . ... .... .... . .. .... . . . . ....... . . .... .. ...................... .......... . . .. . . ..... ......... . ..... . . . . .. ... ...... ...... ..... ... . ...... .... ..... . . ... . ... .. . . .... . . ..... .... . ......... ............ . .......... . . . ....... ................ ....... ... ... . .... ......... . ... . ....... . . ........................ .... ...................... . .... ... . ... . .. . . . . . .. . . . .. . ... . ..... ....... . .... . ... . . ........ . .......... ...... . . . .
lowQualScore : 5 4 2 4 4 00000 22222222222 1 6 4 9 444 1 222 5555 7777 4 00 1111 2 5 5 2 7777777 3 3 3333 11 8888888888888888888888 6666666666 0 1 99 1 2 77777 222222222 1 77777 3 3 1 2 44 444 222222 111111 11111 999 9 222222 9999 11111 9 5 333 4 111 44 5 0 3333 0 8 33333 4444 4 555555555 555555555555 2 9999999999 6 1 0 8888888 4444444444444444 0000000 000 333 7 3333 333333333 7 444 5 1111111 5 5 333333333333333333333333 3333 5555555555555555555555 9 0000 999 2 333 2 11 1 8 1 4 2 99 1 2 1 99 1 999 9 77777 3333333 6 1111 4 999 9 0 44444444 7 6666666666 222222 5 4 8 1
consensus : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--AC--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATN-TCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGNCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCACACATGAACC-AACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC-------AAACAT---------------CAT-------TTTTAA---AA---G-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TA-AAA-A--A------T--A--A--C-----AGA----CATT-------TC------------TTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---AT-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
Reference ( family-409 ) : CGAGGATT-GANCCGACAACCTCGGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTGAC-G--ACA--AC--C-CTATGGACNACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCGGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATN-TCTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGNCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGGACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCACACATGAACC-AACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACNCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAACAGGAACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC-------AAACAT---------------CAT-------TTTTAA---AA---G-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TA-AAA-A--A------T--A--A--C-----AGA----CATT-------TC------------TTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---AT-GTT--GTTCGCAACTGCCGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTNATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160913 : CGAAGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTAAA-A--ACA--AA--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCAAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------CATTGGAAACGTCTAGGACACAGGATTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GTCATGGCAGTAATTTGAACCTTCATCTCCCATGTACTA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CAAT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAACC-AACACATTTACTTAAGCTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACCATCTGGTTGTAATACTAAACAAG-ACAAACAAAGTAGACAAAAAATATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC-------AAACATTATAAAAAAATATA-CAT-------TTTTAA---AA---G-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TA-AAA-A--A---------A--A--CA----AGA----CATT-------TT------------TTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---AT-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTATTAAGATAATGGACTTAAAAATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TTT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATAAC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTTCTCCTTTTTT
gi|160914 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTGAC-A--ACA--AC--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATG-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGCA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCATTGATTTGAACTTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGAATGCATACATAAACC-AACACATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATCGAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATATGTTCTCTTTAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACAATCTGATTGTAATACCAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAAAATATAAATGAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAA-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGAA-TAAGTAAGAAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC-------AAACATTTATAAAAAAATATACAT-------TTTTAA---AA---G-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TT-AAA-A--A------TAAA--A--C-----AGA----CATT-------TC------------TTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCAATTCTTTT-T---AT-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAC-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTCGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCA---TGTACTAAGATAATGAGCTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTGAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTGATGAAATGCACTTTTGTAA--------CACAGAACT-TCA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCGACTCTTCCTTTTTT
gi|160915 : CGAGGAAT-GATCCGACAACTTCGGCAATGAGAAGTAAGTGGCTATTTGAC-A--ACA--AC--A-CTATGAACAAATATGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-T--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATATTGCA-TTCAAGCATAAATTATGTTCTTGCAGCTTA-------AATGTTAAAATG-TGACTTAA----CTAG--GCAGGGTCAAT-------------CA----------AA----------TATTGAAAACGTCAAGGGCACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------AA-TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ATA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAACC-AATACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGTTGAGGCATCAAT-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGGCACTTCTACAATCTGGATGCAATACTAAACAAG-ACAAACAAAATAGACACAAACTATAGACCAT-----GTATGATTATAAACTA----CAG-TCCACGAAAC---------ATATAC-----------TTTTCTAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTA
gi|160916 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTTGGCAGCGAGAAGTAAATGGTTATTTGAC-G--ACA--ACAACACTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TT----AT-TCTAGACACC-CGACATTCATACTGTAATTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CTAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACCATAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GTGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTGATTTGAATCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACACAAACC-AACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGATGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAATTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTTTACAATCTGGTTATAATACTAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAAAATATAGACGAT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCACAGAAA---------AAATAA-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC-------AAACATTATAAAAAAATATA-CAT-------TTTTAA---AA---G-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TA-AAA-A--A------TAAA--A--C-----AGA----CATT-------TC------------TTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTCTTTT-C---AT-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGTTGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CATATTATCATGTTGTGCAATGAAAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGCAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTGACATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTT-TAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGATCTACTCCTCCTTTTTT
gi|160917 : CGATGATT-GATCCGACATTTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGGTTATTTAAC-A--ACA--AC--C-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTTTA-TTCAAGCATAAATCGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAAAATA-TGAC---------CAAATGTATA-TGTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAATGTCTAGGACACAGGACTAAAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTTCCATGTACCA--AGA---A------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAAACCCAACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAGGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACACTTCTACAATCTGGTCGTAATACTAAACAAGA-CAAACAGAATAGACAAAAAGTATAGACCGT-----GTATGATTATAAACTG----CAG-TCCATGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAATCA-TAAGTTAGTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC-------AAACA----------------CAT-------TTTTAA---AA---C-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TA-AAA-A--A------T--A--A--C-----AGA----CATT-------TC------------TTTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTTTTTT-C---AT-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATGTTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAATAGAAATCAA----TATTTATAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CAAAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTCGACTCCTCTTTTTTT
gi|160918 : CAAGGATT-GATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGTGGTTCTTTGAC-A--ACA--AC--A-TTATGGAC---------ACAGAAGG---AAC---TG---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATACTGTA-TTCAAGC----ATAGAGTTCTTGCAGTTAA-------AATGTTAAAATA-TGACTTAA----CTAAATATATA-TTTCACGA----------CA----------
gi|160918 : AAATGTTAAA---ATATGACTTAAC-TA-A-ATATATA------T--TTCACGACAGGGTTAGTCTGTG-GACATGGCAGTAATTTGATCTTCCATCTCCCATGTACCA--ATA---G------AAA-----AAA-----AAA---T-CATT------GT----G-----CATGACTGCATCCATTAATA-AATCCATTTACTTGAGTTCCATAATAAGCAGCTAGGGCATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAATTCCCATCAGTTCTTGTC----CCGACACTTCTACAATCAGGTTGTAATACAAAACAAG-ACAAACAAAATAGACAAAACATATAGACCAT-----GTATGTTTATAAACTG----CAG-TCCACGGAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAGAGTAAGCA-TGAGTTAgggttagtctgtggacatggcagtaatttgatcttccatctcccatgtaccaatagaaaaaaaaatcattgtgcatgactgcatccattaataaatccatttacttgagttccataataagcagctagggcatccaaatatatatgaaatatacaatctggacataaattcccatcagttcttgtcccgacacttctacaatcaggttgtaatacaaaacaagacaaacaaaatagacaaaacatatagaccatgtatgtttataaactgcagtccacggaaaatatacttttcgaatgtaaggcagtcagaaagagtaagcatgagtta
gi|160919 : caaggattgatctgacaacttcggcagtgagaagtaagtggttctttgacaacaacattatggacacagaaggaactgtttgtataattctaaacaccagacattcatactgtattcaagcatagagttcttgcagttaCAAGGATT-GATCCGACAACGTTGGCAGTGAGAAGTAAGTGATTATTTGAC-A--ACA--AC--A-CTATGGATACCTCTGTCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGACATTCATGCTGTA-TTTAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTAAATCATTAATGTTAAAATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-ATTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCAAGGACACAGGACTAGACAGA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AATCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCTCTGTACCA--AGA---A------
gi|160920 : CGAGGATT-GATCCGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATAGTTATTTGAC-A--ACA--AC--A-CTATGGACAACTCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACACC-ATACATTCATACTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCTTGCAGTTTA-------AATGTTAACATA-TGACTTAA----CCAAATGTATA-TTTCTGGA----------CA----------AA----------TGTTGGAAACGTCTAGGACACAGGACTAGAC-TA-A-A-----A------T--TTAA-GAGA-----AGTCTCTG-GACATGGCAGTAATTTGAACCTCCATCTCCCATGTACCA--AGA---A------ACA-----A
gi|160921 : CAAGGATT-GATCTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAATGATTATTTGAC-A--ACA--AC--A-TTATGGACAAATCTGCCACAGAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TC
gi|160922 : CGAGGAAT-GAACCAACAACTTTGGCAGTGAGAAGTTAGTGGTGATTTGAC-A--ACA------C-CT-TGGACAACTCTGCC
gi|160923 : CGAGGATT-GA-CCAACAATTTAAGCGGTGAGAAGTAAGTGGCCATTTGAC-A--ACA--CCA-C-CT-TTGACGACTCTGCCACCAAAAG---AGC---CA---TT----TAT-A--TA----AT-TCTAAACACC-AGGCATTCATGCTGTT-ATCTAGCATTAGTAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-CGACTTA-----TTAAATATATT-TCTCTGGA----------CAGGATTAATCAAA----------TGTTGGAAAGTTCAGGGTCACTTGACTAGAA-AA-ACA-----A------T--ACAA-AAGA-----AGTCTTTG-GACACATCAGTAATTTTGATCTCCATCTCCAATGTACCA--AGG---A------ATA------CT-----ATATTTA-CATA------AAA---G-----CATGACTGTACACATG-------------TACTTAAATTCCCAAATTAGCAGCTGAAGTATCCAA-AT---A
gi|160924 : CGGGGACT-TAACCAATAACTTAAGTGGTGAGAAGAAAGTGGTCATTTGAC-A--ACA--CCA-C-CT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AGC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-TCTAAACATC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGAATTAGAAGAGTGTTTCTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-TGACTT-A----TTACATGTATT-TCTCTGGACAGGATCAATCA----------AA----------TGTTGGAAACTTCAGGATCATTTGACTAGAA-AA-ACA-----A------T--TTAA-GAGA-----AGT-TTTA----AT--CAGTAATTTTGACCTCAATCTCCCATGTACCA--AGG---A------ATG-----CTATCTTTACATT-GTCATT------ATAAAAG-----CATGACTGTACACATG-------------TACTTAAATTCCCATATTAGCAGCTGAAATATCCAA-A
gi|160925 : CGGGGATG-TAACCAACAATTTAAGCAGTTGGAAGTAAGTGGTCATTTGTC-A--ACA--CCA-C-CT-TGGACATCTTTGCCAC
gi|160925 : AGAGTTTTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAA-TGACTTA-----TTAAATGTATT-TCTCTGGA----------CA----------AAAACAATAAAATGTTGGAAACTTCAGGGTCACTTGACTAGAA-AA-A-A-----AACAATTTAATTAA-GAGA-----AGTATTTG-GACATATCAGTAATTTGGACCTCAATCGCCCATGTACCA--AGG---A------ATA------CT-----ATG---A-CATTTTCCCCGTAAAAG-----CATGACTGCAGACATGTACC-ATTCCATTTAATTAAATTCCCAAATTAACGGATGACGTATCCAA-AT---ACAtcatgaccactcagagtttttgtggtttaaatgttaaacaatgacttattaaatgtatttctctggacaaaaacaataaaatgttggaaacttcagggtcacttgactagaaaaaaaacaatttaattaagagaagtatttggacatatcagtaatttggacctcaatcgcccatgtaccaaggaatactatgacattttccccgtaaaagcatgactgcagacatgtaccattccatttaattaaattcccaaattaacggatgacgtatccaaataca
gi|160926 : cggggatgtaaccaacaatttaagcagttggaagtaagtggtcatttgtcaacaccaccttggacatctttgccactcatgaccactcCGGAAATT-GAACCTACGACCTTAGCAGTGAGAAGTAAATGATC--TTGAT----ACG--GCG-C-CT-TAGACCATTCTGCCAC-GGAGG---ACCCTTCA---TT----T------TA----AT-
gi|160927 : GAGGAAT-GAACCAACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTGAC-A--ACA--ACA-C-CT-TGGACAACTCCGCCTCAAAAAGT--AAC---CT---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAAACACC-AGTCATTCATTCTGTA-TTCAAGCATAAATAGAGTTCATGTTGTTTA-------AATATTAACAGATTTACTTAAGTTCCCAAAT
gi|160928 : GAGGCTC-AAACCCTCAACTTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGGTCATTTAAT-G--ACA--GTG-T-CT-TAGACCACTCGGCCACAGA
gi|160929 : GAGACTC-GAACCTGCGACCTCAGCGGTGAGAGGTAAGTGATC--TTGA--G--ACA--GCG-C-CT-TAGACCACTCGGCCACAG-AGA---ACC---CA---TT----T
gi|160930 : GGCTC-GAACCCATGACCTCAACAGTGAGAGGTAAGCGGTCTTCAGAT-G--ACAG-AA--C-CT-TGGACCACTCGGCCAC-GGACG---ACC---CATACTC----TAT-A--CA----AT-TCT
gi|160931 : GGACTCGAACCTACGACCCCAGCAGTGAGAGGTAAGTGATC--TTGA--G--ACG--ACA-C-CT-TAGACCACTCAGCTATGGAGGA---AAC---T----TT----TGT-
gi|160932 : GGGTT-AAACTCACAACCTAAGCTGTGAGAGGTAAGTGATC-T---ACAG--ACA--ACA-T-CT-TGGACCACTTGGCCACAGAAG
gi|160933 : TT-GAACCTACGACCTTAGCGGTGAGAGGTAAATGAT--TTTGA--A--ACA--GCA-C-CT-TAGACCACTCGGCCGC-GGAGG---ATC---CA---TT----GTT-A--CA----ATGTCCAAA
gi|160934 : TT-GATCCAACATCCTCAGTGGTGAGAAGTAAATGGCCATCTGAC-A--ACA--G-----TGATGGAGGACTC
gi|160935 : TC-GAACCAACGACTTTAGCGGTGAGAGGTAAATGGTCTTGAGAC-G--GCA--AC--T----TAGACCATTCGGCCAC-GAAGA---ACC---CT---TT----TCT-G--TG----GT-TTTATACA
gi|160936 : TC-GAACCTACAACCTTGGTGATGAGAGGTAAGTGATC--TTAAT----ACA--GCGAC-TTA--GACCACTTTGCCACAG-AGG---ACC---C----------TGT-G--TT----AT-T
gi|160937 : TC-GAACCGACGACCTCAGCGGTGAGAAGTAAGTAGCCATTAGGT-T--ACA--GC--G-CTGT--ACCACTCAGCCAC-GGAGG---A-----CA---CT----T
gi|160938 : T-GAACTGACAACTTCGGCAGTGAGAAGTAAGAGGTCATTTGAC-A--ACA--ACA-C-CT-TGGACAACTCTGCCTAAAAAGG---AAC---CA---TT----TGT-A--TA----AT-GCTAATCACC-AGACATTCATGCTGTA-TTCAAGCATAAATAAAGTTTTTGTGGTTTA-------AATATTAAAATATTTACTTAAGTTCCCAAAT
gi|160939 : ACCTCA-CAATGAGAGGTAAATGGTCATTTGGT-G--ACAGCAC--C-ATATG--TCACTCTGCCACGGAGGA---AAC--------TT----AAT-A--TA----A
gi|160940 : atccatgATCC-ACAACCTCGGCAGCGAGAGGTAAGTGATC--TTCA--G--ACA--GTG-C-CT-TGGACCTCTCGGCCTCAG-AGA---AAC---CC---TT----TAT-A--
gi|160941 : CCAACAACTTAAGTGGTGAGAAGTAAATGGTCATTTGAC-A--TCA--CCA-C-CT-TGGACAACTCTGCCACCGCAAG---AA------------------------------------ACAAC-AGACATTCATGCTGTA-GTCAAGAATTAGTAGAGTATTTGTGGTTTA-------AATTTTAAACAA-TTACTT-A----TTACATGTATT-TCTCTGGACAGGATCAATCA----------AA----------TGTTGGAAACTTCAGGGTCACTTTACTAGAA-AA-ACA-----A------T--TTCA-GAGC-----AGTCTTTG-GACACGTCCGGTATTTGGACCTCCATCTCCTATGTACCA--AGG---ATTTAGGAAT-----ACT-----ATACTTA-CATT------GT----AAAAACCATGACTGTACACATG-------------TACATAAATTCCTAAATTAGCAGCGGAAGTATTCAA-A
gi|160942 : CCCACAACCTCAGCTGTAACAGATAAGTGGTCATTTAAC-A--ACA--ATG-C-CT-TAGACCACTTGGCCACAG-AGG---AAC---CG---------TGT-A--TA----AT-
gi|160943 : CCCACGACATCAGTGGTGCGAGGTAAGTGGTCAATAGAC-A--ACA--AC--A-CTTTATACGACATAACTACAG-AGG---AAC---CA---CT----TATGA--TA----A
gi|160944 : CCGAAAACCTCAGCAGTGAGAGGTAAGTGGTCATTGGAC-GACACA--AC--C-TCA--AACTACTCGGCAACGGAGGACCTAAA---CA---TT-----------------AT-TTAAAACACT--GATGATTGTACTTTC-TTCAA
gi|160945 : CCTACAACATAGGCCGTGAGAGGTAAACGATCTTTAGAC-G--GCA------C-CT-TAGACCATTCTGCCACAG-GGG---ACC---CG---TTAGGATAT-A--TACAAGATGTATAAATACCTGGATATT-ATAC-ATA-TT
gi|160946 : ACAACCTCATCGTTGAGAAGTGAATGGTTGTTTAAC-A--ACA--------CCATAGACCACTTGGTCACAG-AGG---ATC---CA----T----GGT-AACTA----GT-TTTAAAttgttaaaatggtatataatttctaatttcaagtta
gi|160947 : CTTAGCAGTGAGAGGTAAATGACC--TTGA--G--ACAGTGC--C-CCA--GACAACTCTGCCACAG--GG---GAC---C----TC----TGT-A--AT----AT-TATAAATA
gi|160948 : aaCAGCAGTGAGAGGTAAGTAGTCATTAGAC-C--ACA--GC--A-CTTTAGACCACGCTGCCACAG-AGG---ACC---C
gi|160949 : GACAACT--GCCGCTGCAGG---GCC---CA---TT----TGT-A--TA----TT-TTTAAACACT-GGTCATTCATGTTGTA-TTCAAGCCTAAATAAAGTTCTTGTGGTTTA-------AATGTTAAACAG-TGACTTAA----CCAAATGTATT-TCTCTGGA----------CATGGTCGATCTAA----------TGTTCGAAACTTCAGGGCCACAGGACTAGAA-TACA-A-----A------A--TTAA-GAGA-----AGTCTTTG-AACATGA-----------ACCTCCATCTCCAGTGTA-----AGC---T------AAA------CA-----ATA---G-TATT------GT----G-----CACTACTACTCACACGTACC-ATT-CATTTACTTAAGTTACCAAATAAGCAGCTGATGCATTCCA-AT---ATTTATAAAATATACAATAATTAAGATCTA---TCCCTTCATTTCTTGTTTGTTCAGACGCTCCTACACTCTGGTTGTAATACTAAACAAGAACGAACAAAATAGAC---AGATATATAC
gi|160950 : aaatgactgattcaaatcgctatataaA-----AACCTATGTGACATGTCAGTATTTTGGACTTCCATCTCCCATG---------------------AA-----ACA-----TTG---G-CACC------ATAAAAG-----CACAACTGCACACATGTACC-ATCACATTTACTTAAATTCCTGAACTGGCAGCTGAAGTATCCAACAT---ACA
gi|160951 : A-----AACCTATGTGACATGTCAGTAGTT-GGGCCTCCATCTCCCGTGTACCA--AGG---A------ATACTGTTACATTG--GCA---C-CATT------AAA---G-----CATGACTGCACACATGTACC-ATTCCATTGACTTAAATTTCTGAACTGGCAGCTGAAATATCAAA-A----ATACA
gi|160952 : ACCAGTAGAGCTA------AAA-----ACA-----ACA---G-CATT------GT----G-----CATGACTGCATACATAATCC-AACACATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGTATCCAA-AT---ATATATGAAATATACAAT--CTG-GACATATGTTCCCTTCAG-----GTT----CAGAC
gi|160953 : -AACAGATTTACTTAAGTTCCCAAATTAGCAGCTGAGGCATCCAA-AT---ATTTATGAAATATACAAT--CTT-GACTTCGGTTCCCTTCAGTTCTTTTC----CAGACTCTCCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATAGGTACAAACAAAACAAACAAAAAATATAGa
gi|160954 : -AAAATATTTACTTAAGTTCCCAAATAAGCAGCTGAGGCATTCAA-AT---ATTTATGAAATATACAAT--CTG-GACTTCGGTTCCTTCCAGTTCTTGTT----CAGACTCTTCTACAATCTGGTTGTAATACTAAATGGGTACAAACAAAACAAATAAAAAATATAG
gi|160955 : AA-ATGAAATACATG---TATACAAA--CTA-GACATAAGTTTTCTTCAGTTCTTGTC----CAGATTCTCCAACAATCTAGTTGTAATATTAAACAGGAACAAACAAAAAAGACAAAAAATATAG
gi|160956 : at---ATATATGAAATCTACAAT--CTG-GGCA-AAGTTCCCATCAGTTCTTGTC----CAGTCTCTCCTACAATCTAGTTGCAAGACTAAACAGGAACAAACAAAGTAAACAAAAGATATAG
gi|160957 : ---ATAAATGAAATCTACAAT--CTG-GACATAAGTTTCCTTCAGTTCTTGTC----CAGACTCTCCTACAATC------TAAT-CTAAACAGGAACGAACAAAATAAACAAAAAATATAG
gi|160958 : ATGAAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCTTTCAGTTTTTGTC----CAGACTCTCCTACAATCTAGTTTTATTACTAAACAGGAACGAACAGAATAGACAAAATATA
gi|160959 : TGAAATACACAGT--CTA-GATATAATTTCCTTTCAATTCTTGTC----CAGATTCTTCTACAATCTAGTTTTCATACTAAACAGGAACAACCAAAATAGA-AAAAAATATA
gi|160960 : GGAATATACAAT--CTG-GACATAAGTTCCCTTCAGTTCTTGTC----CAAACTCTCCTACAATCTAGTTGTATTACTAAACAGGAAGGTACAGAATTGAC-AAAAATATAG
gi|160961 : AAAAT-TAGAACATTAAAAGTAAGACTA-AAACTGTGAGCAGCTCAACAAAAA---------AT----------------TTTTGAACACA-GGTA----------ATT-------GCAAGCAATAA---AACAACATGTTGTC-AATGCAGCAAT-------AAACAT---------------TAT-------TT---A---AA---A-ACAT---AT---------A-A--------AT-------TA-TAA-A--T------T--A--A--TTATAGAGA----TATT-------T-----------------------A-----ATTG---AAGCCATCGCTTTT-CT--AT-GTT--GGTTGCAAATGCTGGGACTTGAATCCAGAAT-TTCAC-C--AAA-A-GT-GTAGATAAATTTGCCAGTT--ATACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGGACTCCAATATTCACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------GAA---AAGTTAAAAG-TATTTAAATTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAA--------CACA-CACTCACAGCAGCAC--ATGTTTTCTAA------TA------ATATGTAGTATAATATC-AAA-----------TAAACACCAGGTCTACTCATCCATTT
gi|160962 : ATTGTAAACTG----CAG-CCCACGGAAA---------ATATATATAAAATATATTTTTTTAATATATATCA----------GTCAGAAAGAGCAAGCA-CAA
gi|160963 : ATTGTAAACTG----CAG-TCCACGAAAATGTATATAAACATAT-----------TGTTTGAATGTATAGCA----------GTCAAAAAGAGCAGCCA-CAA---AATACCCTGATGACTCATAAAACTTT-------AAATA----------------------------TTAA---AA---GTAAA----ATATATGTATAA-AT---TATTATTTTTTAATA-GAG-A--A------T--A--A--T------GT----CATTAAAAACATC-------------TTTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCTTTTCC---AT-GTT--GTTTGCAAATGCTGGG-------------AT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACAACATAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATTGACTTTAATATTCACCAA-----ATCTAAATATGTAAAT-------T----GAAATTAAATCGTATTTAAACTAGTCC-AT---T-TTCTATTTATATAATTCACTCTTGTAATACACATTCACAGCAGT-ACA----------TGTTTTCTAA------
gi|160964 : GAAA---------ATATAC-----------TTTTCGAATGTAAGGCACTTAAAAGCAGTCAGAAAGAGTAAGCA-TAAGTTAGT
gi|160965 : AAA---------ATATAT-----------TTTGCAAATGTAAGGCA----------GTCAGAAAAAGAAAGCA-TAA
gi|160966 : TAACATTTTGTC-CATGCAGCGGC-------AAACAT---------------TATAAAAAAATATCAATCAAA---G-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TA-AAA-A--A------T--ACAA--C-----AGA----CTTT-------TC------------TTTTTTCACCA----TATCT---AAGCTATCTCTTTT-C---AT-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTTGAACCCAGAAT-GTCTA-C--AAA-A-GT-GTA-ACGTGTTTGCCAGTT--ACATCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGATAATGAATTTAAATATTTACCAT-----TTCAAATTATATAAAT-------TAATAGAAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTTA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAATACTATTACTATATACATTTAGTATAATATA-AAAAATTGCAAAATCAAAAATCAGGTCGACTCCTCCTTTTTT
gi|160967 : ataaaatttatgtaatactggtaaatatagcaataaaaacattgcac---G-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TA-AAA-A--A---------------C-----AAA------------------------------TGTTTCACCA----TATTG---AAGCCATCTCCTTT-CC--AT-GTT--GTTTGCAAATGTTGGGATTTGAACCCAAAAC-TTCTA-A--AAA-AAGT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAGGTAATGGAATTCAATATTTCCCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAA---AAGTTAAAAT-TATTT-AAATAAGTCACAT--T-TTCTATTCATAAAATACACTCTTGTTA--------CACA-CACTCACAACAGTAC--ATGTTTTCTAT------TA--ATATATAT----TATAATATC-----------AAATTAAAAACCAGGTCGACTCATCCTTTT
gi|160968 : taagcaataaaaaaatatgttgtacatgcagcaacaattatcttaaagaaacatattatttatatgtgtgttaatcatagagataattattgTAGCATTTTGTC-CATGCAGCAGC-------AAACATTATAACAAATATA--CAT-------TTTTAA---AA---G-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TA-AAA-A--G------T--A--A---------AA----C-TT-------TT------------TTTTTTCACCA----TATCT---TAGCCATCT-TTTT-C---AT-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-AA---TATTATGTTGTACTAAGATAATGGACTTAAATATTTACCAA-----ACCAAAATATGTAAAT-------TAATAGAATTTAA----TATTTAAAATAGCCCACATTTT-TTTTATTAATAAAGTGCACTCTTGTAA--------CACACCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAATACTCAGGTCGACTCCTCCTTTTT
gi|160969 : TAGCATTTTATC-AAAGCAGCAATTTAAAAAAAAAAA---------------CAT-------TTTTAA---GA---G-A-------T---------T-GT---T-TCAT-------TA-AAA-A--A---------A--A--C-----AGA----GGTT-------TC------------TTTTT-CACCA----TATTT---AAGCCATCTTTTTT-----AT-GTT--GTTTGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGTCTTAAATATTTATCAA-----ATAAACTTATGTAAA--------TA---------AA----TATTTAAAATAG-CCAAA---TATTCTATTTATAAAATACACTCTTGAAACACACACTCACAGCACT-ACA----------TGTTTTCTAA------TACTACATGTATATAGAATAACATCTAATTTTTGCGAAATTAAAAATCAGATTTACCCCTTTTTT
gi|160970 : ATGTTGTC-CATGCAGCAAC-------AAACAT---------------CA----------TTAA---AA---A-ACATATTAT---------ATATATAT-GCAT-------TA-AAA-AT-AGATATTT--A--A--T-----AGAGAATAATT-------TCATCAAAAAACAGCTTTTTCACTA----TATTG---AAGCCATCTCCGTT-CA--AT-GCT--GTTTGCAAATGCTGAGATTTGAACTAAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCATTTTAACACCATA-AAG-CA---AATCATTTTGTACTAAGATAATGGACTTCAATATTAACCAA-----ATCAAATTATGT-AAT-------TAA---AAGTTAAAAG-TATATAGACTAGTCCCAT---T-TTCTATTTATAAAATACACTCTTGTAATACACACTCACAGCAGT-ACA----TGTACATGTTTTCTAA------TA--ATATA----TAGTATAGTATC-AAA
gi|160971 : -------AAATATA--------------CAT-------TTTTAA---AA---G-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TA-AAA-AGAA------A--A--A--C-----AGA----CATT-------TC------------ATTTTTCACCA----TATCT---AAGCCATCTTTTTT-C---AC-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTTTA-C--AAA-A-GT-GTAAATGTGTTTGCCAGTT--ACACTACAGAAG-CA---TATCATGTTGTACTAAAATAATGGACTTAAATATATACCGA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAATAAATTAA----TATTTTAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGTACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ATA----T-T--TTGTTTTCTAA------TACTATATACATGTAGTTTAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAAACAGGTCCACTCCTCCCTTTTT
gi|160972 : aatattcataaaTTTTTTGCCAATAATATTT---AAGTCATTTCTTTT-C---AAAGTTAAGTTC-----TGCCAGGATTCGAACCCGGAAC-CTCCA-TTTAAACA-GT-G--GATGTGTTTTCCAGTT--ACACCACAGAAGTCT---TATTAT-CTGTACTAAAA-AATGGACTTAAATATTTG-CAACATCTATCAAATTA
gi|160973 : aaatatgaatttcaataacaattttaatatatataaaactattttatgatgAT-------TTATGA---AAATTG-AAA----ATCT-------A-AT---T-TT-C-------TATAAC-A--A------T--A--A--A-----AAA----CAAT-------------------------------A----CATTC---AAGTCATTTCTTTT-CCAAAT-TTT--ACTC----TTGTCAGGGGTCGAACCT-GAGTCTTCTA-C--CAA-A-ATAGTAGATGTGTTAGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTACAGAGAAAATGGTCTTAAA
gi|160974 : atgtcaATCTTTCAAGCCATTTCTTTC-CCAAAT-TTT--ACTC----TTGTCGGGGATCGAACCC-GAGTCTTCTA-C--CAA-ATGA-GTAGATGTGTTAGCCAATT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGTAC-AGAAAAATGatactaac
gi|160975 : aagttatgaaaatagaaaatcaattttctataacaatcaaaacaAT-------TTGTAT---AATTCG-AGA----AT---------A-AT---T-TCAT-------TA-AAATA--A------T--A--AAAC-----AGA----CATT-------TC------------TTTTT-CACCA----TATCT---AAGCAATCTTTTTT-C---AT-GTT-----TGCAACTGCTGGGATTCGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-A-GT-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAGAAG-CA---TATCATGT---ACTAAGATAATGAACTTAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATGTAAAT-------TAAAAGAAATTAA----TATTTAAAATAGCCCAAA---T-TTCTATTAATAAAATGCACTCTTGTAA--------CACAGCACT-ACA----TGT--TTGTTTTCTAA------TACTATGT--ATGTAGTATAATATC-AAATTTTGTGAAATTAAAAATCAGGTTGACTCTTCCTTTTTT
gi|160976 : A---AA---G-AGA----AT---------A-AT---G-CCAT-------TA-AAA-G---------C--A--C--C-----AGA----ATTT-------TC------------TTTTTCCACCG----TATTT---AAAACATTT--TTT-C---AT-GTT--GTTCGCAACTGCTGGGATTGGAACCCAGAAT-TTCTA-C--AAA-C-GT-GTAGATGTGTTTGCCTGTT--ACACCTTAGAAG-CA---AATCATGTTGTATTAAGATAATGGACATAAATATTTACCAA-----ATCAAATTATTTAAACTACATTGTAATAGAAATTCA----TATATAAAATAGCCCAAT---T-TTCTATTCATAATATACATTCTTGTAACACACACTCACAGCACT-ACA----------TATTTTCTAA------AACAATA------TAGTATGATATC-AAATTTTATATAAT
gi|160977 : T---T-TCAT-------AA-AAA-A--A------A--C--A--C-----AAC----CATT-------TC------------AT--------A----CATTC---AAGCCATTTCTTTT-CCAGAT-TTT--ACTC----TTGTCAGGATTTGAACCC-GAGTCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGTTTGCCAGTT--ACACCACAAAAG-TC---TAAAAT-TTGAGCAAAGGAAATGGA-TTAAATAT
gi|160978 : TGTCAGGATTTAAACC---AATCTTCTAAC--AAA-A-GA-GTAGATGTGATTGCCAGCT--ACCCCACAAAAG-cataattttacc