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gi|14176 : TTTA-TGATCATT---TCCTT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCC-------TT-T-T------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAAT-T-----A-C-TGATC--AG
gi|14177 : TTTA-CGATAATA---ACCGC--TAGA-G--GA----A----C--A--GCC-------TA-T-C------AGAACAGCCT-------AT-T-----A-GAAT-T-----A-C-CTATC--AGT-AAA-T------ATGAA-TT--TA-A-A----A----C-ACGATTTATT
gi|14178 : TTTA-CAATAATG---TTCAT--CTGC-G--GG----G----C--A--GCT-------AA-T-T------TG--CA---G-------AA-T-----T-GTAT-T-----A-C-TGATC--AGT-TAA-T-----T-TGAA-TT--T--A-A----A----C-ACAATTTATT
gi|14179 : TTTA-TGATAACT---TCCGT--CATT-G--GA----A----C--A--ACT-------TA-T-T------CA--CA---T-------AT-C-----A-AAAT-T-----A-C-TGATC--ACC-AAA-T-----T-CAGA-TT--GA-A-A----A----C-AAGATTTTTT
gi|14180 : TTAA-CAATAATA---TTTGT--CAGC-C--AA----G----C--A--ACA-------AA-A-T------TG--CA---T-------AT-C-----A-TAAT-T-----A-T-TGATC--AGT-AAA-------TGTAGA-TT--T--A-A----A----C-ACGATTT
gi|14181 : TTTA-CGATAATT---TCAGT--CAGC-T--TA----G----C--A--GCT-------AT-T-T------TG--CA---T-------TT-T-----A-GAAT-T-----A-C-TGATC--TGT-TAA-
gi|14182 : TTTA-CGATAAAT---TCTGT--AAAC-A--AA----G----C--ATGAAT-------TA-T-T------TG--TA-----------AT-A-----A-GAAT-T-----A-C-TGATC--ATT-TAA-T-----T-TAGA-TT--AA-A-A----C----C-ACAATGTATT
gi|14183 : TTTT-CGATAATT---TCCGT--CAGA-G--AT----G----G--A--GCT-------AT-TGT------TA--AA---T-------GT-T-----A-AAAT-T-----A-C-TGATC----------------TATATA-TC--TA-A-A----A----C-ACGATTTGTT
gi|14184 : TTTA-CAATATTT---TCCTT--CAAT-G--AA----G----C--A--GCT-------AA-T-TTATACATG--TA---T-------AT-C-----G-GAAT-T-----A-C-TAATC--AGT-GAA-TA----TTTA----T--TA-A-A----ACACGC-ACGATTTAT
gi|14185 : TTTA-T-ATAATTGAATCCGT--CAGT-G--GA----A----C--A--CCT-------TA-T-T------TG--CA---T-------AT-C-----A-TAAT-T-----G-C-CGTTT--AGT-TAC-T-----T-TAGA-TA--TA-A-A----A----G-ACGATTT
gi|14186 : TTTA-CGATAATT---TCCGC--CAGC-G--AA----A----C--A--GCC-------AA-T-T------TG--CA---TTTTACTGAT-C-----A-GAAT-T-----A-C-TGA
gi|14187 : TTTA-CGATAAGT---TCT-----AGC-G--AA----G----C--A--GCT-------AC-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-CAAT-A-----A-C-TGATA--AGT-AAA-T-----T-TAGA-TT--TA-cgaatta
gi|14188 : TTTA-CAAAAAAT---ACGAC--CAGC-G--CA----A----C--A--GTT----------T-TAC----TG--CA---T-------AT-T-----A-TAGT-T-----A-C-TGATC--TGT-AAA-T-----T-TAGA-TT--TA-A-A----A----C-GCGATTTATT
gi|14189 : TTTT-CAATAATT---TCTGT--CAGC-A--GG----G----C--A--GCT-------AA-C-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAT-T-----A----------AGT-AAA-------TATAAA-CT--TA-A-A----A----
gi|14190 : TTTA-CGGTTATT---TCTGT--CAGC-G--AA----A----C--C--GCT-------CA-T-T------TG--CA---T-------AT-G-----A-CAAT-T-----A-C-TGAT
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gi|14192 : tttacatttattttctttTTTA-TGATAATT---TCCGT--CAGC-T--GA----A----T--A--CCG-------TA-T-T------TG--CA---A-------AT-T-----A-ACAT-A-----A-C-TGTTC--AGT-----T-----TATA
gi|14193 : TTTA-TGATAACT---TTCGC--CAAC-G--A------------------T-------AA-G-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAT-T-----A-C-TGAAC--AGC-ACA-T-----T-TCGA-TT--TA-A-A----G----C-CTGATTTATTtggagtt
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gi|14198 : TTA-TTATAAAT---ATCGT--CAGC-G--GA----G----C--A--GCT-------AA-T-T------TG--CA---C-------AT-C-----A-TAAT-T-----A-A-TGATC--AGT-AAA-------TATAGA-TT--TA-ATATACTA----T-ACGATTTATT
gi|14199 : TTA-CGATAATT---TCCGT--TTGA-G--GA----G----T------CT-------AA-T-T------TG--CA---T-------AA-T-----A-AAAT-T-----A-C-TGATC--AGT-AAA-------GATAAT-TT--TA-A-A----A----C-ACG-TTTA
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gi|14206 : TA-CAATAATT---TCAAT--CAGC-A--AA----G----C--A--GCT-------AA-T-T------TG--CC---C-------AT-T-----A-TAAT-T-----------------GT-ACA-T-----T-TAGA-TT--TA-A-A----A----C-ACATTTCATT
gi|14207 : A-CAATAATT---TTCGT--CAGC-A--AA----G----C--A--G------------T-T------TA--CA---T-------AT-T-----A--AAT-A-----A-C-TGATC--AGT-GAA-T-----AAC-TA-TT--TA-A-A----A----T-ATGAT
gi|14208 : GGTAATT---TCTGC--TAGT-G--AA----G----C--G--GCT-------AC-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAC-T-----T-C-TGATC--AAT-CAA-T-----T-TACA-TT--TA-A-A----A----C-ATGATTTATT
gi|14209 : GATCATT---TCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTT-------AA-T-T------TA--CA---T-------AT-T-----ATAAAT-T-----A-C-TGATC--AGT-AAC-T-----T-TATC-TT--AG-A-A----A----C-ACAGTTTATT
gi|14210 : GATAATT---ATCGT--CAGT-G--AA----G----A--A--GCT-------AA-T-T------CA--CA---T-------TT-T-----A-CAAT-T-----A-C-TGATC--AGT-AA--------CA-AGA-TT--TA-
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gi|14216 : --CGGC-G--AA----G----C--A--GCT-------AC-T-T------TA--CA---T-------AT-T----------T---------C-TGATC--AGT-AAA-------TATATA-TT--TA-A-A----A----C-ACTATTTATT
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gi|14218 : A----G----T--A--GCT-------TA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GA-T-T-----A-C-TAATC--AGT-AAA-T-----T-TAGGTTT--TA-A-C----A----C-ACAATTTAT
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Alignments
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lowQualScore : . ... .. . .. .... .... .. .. ....... . . ...... .. ... ....... . ..... . . ..... . . .. . ......... . . .. . . .... .... .
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Reference ( family-407 ) : TTTA-CGATAATT---TCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCT-------AA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAT-T-----A-C-TGATC--AGT-AAA-T-----TATAGA-TT--TA-A-A----A----C-ACGATTTATT
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gi|14158 : TTTA-CGATACTT---TCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCT-------TA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAT-A-----A-C-TGATC--AGT---A-T-----TGTGGA-TT--TA-A-A----A----C-ACGATTTATT
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gi|14201 : TTA-TGATACGT---TTCGT--CAAC-A--GA----G----C--A--GCT-------AA-C-T------TG--CA---T-------AG-T-----A-GAAC-A-----A-A-TTTTC--AGT-AAA-------TATACA-TT--T--A-A----A----C-ACAATTAATT
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gi|14203 : TTA-CTATAATT---TCCGC--CAGC-G--AA----T----A--A--GCT-------AA-T-T------TG--TA---T-------ATATATATAA-GAAT-A-----A-A-TAATC--AAC-AAA-T-----T-TAAA-TTGATA-A-T----A----CGATGATTTAT
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gi|14208 : GGTAATT---TCTGC--TAGT-G--AA----G----C--G--GCT-------AC-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAC-T-----T-C-TGATC--AAT-CAA-T-----T-TACA-TT--TA-A-A----A----C-ATGATTTATT
gi|14209 : GATCATT---TCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTT-------AA-T-T------TA--CA---T-------AT-T-----ATAAAT-T-----A-C-TGATC--AGT-AAC-T-----T-TATC-TT--AG-A-A----A----C-ACAGTTTATT
gi|14210 : GATAATT---ATCGT--CAGT-G--AA----G----A--A--GCT-------AA-T-T------CA--CA---T-------TT-T-----A-CAAT-T-----A-C-TGATC--AGT-AA--------CA-AGA-TT--TA-
gi|14211 : ATAACT---TCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTT-------AA-T-T------TG--CA---T-------GT-A-----A-GAAT-T-----A-C-TGATC--TGT-AAA-TA----TATA
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gi|14215 : T---TCTGT--CAGT-A--AA----G----C--A--AGT-------CA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GAAT-T-----C-A-TAATC--AGT-AAA-T-----T-TAGA-TT--TA-A-A----A----T-GTGATTTATT
gi|14216 : --CGGC-G--AA----G----C--A--GCT-------AC-T-T------TA--CA---T-------AT-T----------T---------C-TGATC--AGT-AAA-------TATATA-TT--TA-A-A----A----C-ACTATTTATT
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gi|14218 : A----G----T--A--GCT-------TA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GA-T-T-----A-C-TAATC--AGT-AAA-T-----T-TAGGTTT--TA-A-C----A----C-ACAATTTAT
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gi|14220 : ----G----C--A--ACT-------AT-A-T------TG--CA---T-------GT-T-----A-AAAT-G-----A-C-TGATC--AGT-AAA--------ATACA-TT--TA-A-A----A----C-ATGATTTATT
gi|14221 : --A--GCT-------AA-T-T------TG--CA---T-------AG-A-----A-GATT-T-----A-C-TGATC--AGT-AAA-T-----T-TAAA-TT--TA-A-A----A----C-ACGATATATT
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Reference ( family-407 ) : TTTA-CGATAATT---TCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GCT-------AA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAT-T-----A-C-TGATC--AGT-AAA-T-----TATAGA-TT--TA-A-A----A----C-ACGATTTATT
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gi|14203 : TTA-CTATAATT---TCCGC--CAGC-G--AA----T----A--A--GCT-------AA-T-T------TG--TA---T-------ATATATATAA-GAAT-A-----A-A-TAATC--AAC-AAA-T-----T-TAAA-TTGATA-A-T----A----CGATGATTTAT
gi|14204 : TG-CAACAATT---TCTGT--CAGC-G--AA----G----T--A--GCT-------AA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GAAT-T-----A-C-TGATCTTAGT-ATA-TA----TATA
gi|14205 : TA-CGATAACT---TTCGT--TAGCTG--AA----G----C--A--GCT-------A--T-T------TG--CA---T-------AC-T-----T-AAAT-T-----A-A-TTATC--TGT-AAA-TA----TAT----TC--TATA-A----A----C-ATAATTTA
gi|14206 : TA-CAATAATT---TCAAT--CAGC-A--AA----G----C--A--GCT-------AA-T-T------TG--CC---C-------AT-T-----A-TAAT-T-----------------GT-ACA-T-----T-TAGA-TT--TA-A-A----A----C-ACATTTCATT
gi|14207 : A-CAATAATT---TTCGT--CAGC-A--AA----G----C--A--G------------T-T------TA--CA---T-------AT-T-----A--AAT-A-----A-C-TGATC--AGT-GAA-T-----AAC-TA-TT--TA-A-A----A----T-ATGAT
gi|14208 : GGTAATT---TCTGC--TAGT-G--AA----G----C--G--GCT-------AC-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAC-T-----T-C-TGATC--AAT-CAA-T-----T-TACA-TT--TA-A-A----A----C-ATGATTTATT
gi|14209 : GATCATT---TCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTT-------AA-T-T------TA--CA---T-------AT-T-----ATAAAT-T-----A-C-TGATC--AGT-AAC-T-----T-TATC-TT--AG-A-A----A----C-ACAGTTTATT
gi|14210 : GATAATT---ATCGT--CAGT-G--AA----G----A--A--GCT-------AA-T-T------CA--CA---T-------TT-T-----A-CAAT-T-----A-C-TGATC--AGT-AA--------CA-AGA-TT--TA-
gi|14211 : ATAACT---TCCGT--CAGC-G--AA----G----C--A--GTT-------AA-T-T------TG--CA---T-------GT-A-----A-GAAT-T-----A-C-TGATC--TGT-AAA-TA----TATA
gi|14212 : ATT---TCTGT--CAAT-T--AA----G----C--A--GCT-------TA-T-T------TG--CA---T-------AT-A-----A-GAAT-T-----A-C-TGATT--AGT-GAA-T-----T-TAGA-TT--TA-A-A----A----C-AAAATGTATTtaccgtatcttaaatgattcatt
gi|14213 : ACT---TCCAT--CAAC-G--AA----G----C------CTCATATAAAA-T-TATC---TG--CA---T-------AG-T-----T-GAAT-T-----G-C-TCACC--AGC-AAA-T-----AAAAAT-TT--TA-A-A----A----C-AAGATTTATT
gi|14214 : TT---TTTGT--CAGC---------------C--A--GCT-------A--C-T------TG--CA---T-------AT-A-----A-GAATAT-----AAC-TGATC--AGT-AAA-T-----T-TAGA-TT--TA-A-A----A----C-ATCATTAATT
gi|14215 : T---TCTGT--CAGT-A--AA----G----C--A--AGT-------CA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GAAT-T-----C-A-TAATC--AGT-AAA-T-----T-TAGA-TT--TA-A-A----A----T-GTGATTTATT
gi|14216 : --CGGC-G--AA----G----C--A--GCT-------AC-T-T------TA--CA---T-------AT-T----------T---------C-TGATC--AGT-AAA-------TATATA-TT--TA-A-A----A----C-ACTATTTATT
gi|14217 : GC-G--AA----G----C--A--GTT-------AA-T-T------TG--CA---TG------AT-T-----A-GATT-G-----A-TATGTTC--AGT-AAA-------TATATA-TC--TA-A-A----G----C-ACAATTAATT
gi|14218 : A----G----T--A--GCT-------TA-T-T------TG--TA---T-------AT-T-----A-GA-T-T-----A-C-TAATC--AGT-AAA-T-----T-TAGGTTT--TA-A-C----A----C-ACAATTTAT
gi|14219 : ----G----C--A--GCT-------AA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GCGT-T-----A-C-TGGTC--AAT-GAA-------TATAGA-TT--TG-A-A----A----C-ACGATTTATT
gi|14220 : ----G----C--A--ACT-------AT-A-T------TG--CA---T-------GT-T-----A-AAAT-G-----A-C-TGATC--AGT-AAA--------ATACA-TT--TA-A-A----A----C-ATGATTTATT
gi|14221 : --A--GCT-------AA-T-T------TG--CA---T-------AG-A-----A-GATT-T-----A-C-TGATC--AGT-AAA-T-----T-TAAA-TT--TA-A-A----A----C-ACGATATATT
gi|14222 : --GCT-------TA-T-T------TG--CA---T-------AT-T-----A-GAAT-T-----A-C-TGATC--AGT-AAA-T-----T-TAAA-TT--TA-A-A----A----C-ACGATCTATT
gi|14223 : A-T-T------CG--CA---T-------AC-T-----A-GAAT-T-----A-C-CTATC--AGT-AAA-------TATAAA-TT--TA-A-A----A----C-ATAATT