lowQualScore : 1
lowQualScore : 11111 11 1111 1 00 111 00 00 0 00
lowQualScore : ..... .. .... . .. ... .. .. . ..
lowQualScore : 55555 44 7777 2 88 000 88 88 0 88
consensus : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
Reference ( gi|25121 ) : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25124 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25131 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TATGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25132 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCCTTAGGTT
gi|25133 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAC--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25122 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTA--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25137 : TGTTAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATTCTTTAGATT
gi|25120 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTA
gi|25123 : TGTCAGAACTTTAA-----TCGCCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAAAT
gi|25135 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-C--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAA--A-A--AGGCTTTAGATT
gi|25130 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTTAAA
gi|25127 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGA-ATTTG--A---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25157 : TGTCAGAGCTTTAA-----TCACCCA--CTC-T--TATGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25129 : TATCAGAACTTCAA-----TAACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---AATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25134 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGTG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25126 : TGTCAGAACTTCAA-----TCATCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAAATT
gi|25158 : TGTCAGAACTTCTA-----TCACCCA--CTC-T--TTGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-T--ATGCTTTAGATT
gi|25152 : TGTCAGAACTTTAC-----TCACCCA--CCT-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25146 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25145 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25144 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25142 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25148 : TGTTAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--AAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTTGATT
gi|25153 : TATCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTA--T---TATGAG--AAG--A-A--ATGCTTTAGA
gi|25159 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGTG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAA
gi|25162 : TGTCAGAACTTCAG-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25161 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--G-A--ATGATTCAAATT
gi|25160 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGGG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25167 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATAAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25165 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25163 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACTCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25138 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTG-T--TAGTG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25150 : TGTCAGAACTTTAA-----TCACCC-------T--TAGGA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25136 : TGTCA-AACTTCAA-----TCACCCA--CTT-T--TAGGT-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTA
gi|25156 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-------TTTTAAAT
gi|25139 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTA-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25164 : TGTCTGAACTTCAA-----TCAACCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25169 : TGTCAGAACTTCAT-----TCACCCA--CTG-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGGTTTAAATT
gi|25149 : TGTCAGAACTTCAA-----TCATCAA--CTC-T--TAGTG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25168 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGAG--CAG--A-A--A
gi|25147 : TGTCAAAATCTCAA-----ATACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CGG--A-A--ATGCTTTAat
gi|25115 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TGGGG-ATTCG--C---TATGAG--CAG--ACA--ATGCTATAGATT
gi|25125 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--T---TAGAAG--TAG--ACATTATGCTTTAGATT
gi|25166 : TGTCAGAACTTCGA-----TCACCAA--CTAAT--T---G-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25118 : TGTCATAACTTCAA-----CCATCCA--CTC-A--TAGGG-ATCTG--C---TATGAG--CAG--ACA--ATGCTTTATATT
gi|25155 : TGTCAAAACATCAA-----CTACTCA--CTC-----AGAG-ATTTG--C---TACGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25141 : TGTCAAAACTTTAA-----TCACCTA--CTC-A--TTGGG-ATTTG--C---TATAAG--CAG--ATC--ATGCTTGAGATT
gi|25143 : TGTTAAAACTTCAA-----CCACCAA--CAC-A--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--TGG--ACA--ATGCTATAGATT
gi|25112 : TGTCCAAACTTCAA-----TTGCCCA--TTC-A--TAGGGAATTCG--C---TATTAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25111 : TGTCCAAACTTCAA-----TTGCCCA--TTC-A--TAGGGAATTCG--C---TATTAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25154 : TGTCACAACTTTAACGTGATCACCCT--ATC-A--TAGGG-ACTTG--T---TATGTG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25140 : TGTCAAAACTTCAA-----CC-CCCA--CTC-G--TAGGG-ATTTGCTT---TATAAAATAAG--ACA--ATGCTTTAAAT
gi|25117 : TGTCCAAACTTCAA------AACTCG--CTC-A--T-GGG-ATATG--T---TATGAG--CAG--ACA--ATGTTTTAAATT
gi|25114 : TGTCCAAACTTCAA-----TCTCCCA--CTA-A--TATAG-ATTTG--T---TATGGT--CAG--ACA--GTGCTTTTAATT
gi|25116 : TGTCCAAACTTCAA------AATTCA--CTC-A--TGGAG-ATTTG--C---TATGAA--CAG--ACA--ATGTTTTAAACT
gi|25113 : TGTCCAAACTTCAA-----T--CTCA--ATT-TAATAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CTG--ATA--ATGCTTCA
gi|25151 : TGTCAAATCTTCAA-----TTA-------------TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--GCA--ATGTTTa
gi|25170 : GTCAAAACTTCAA-----TAACCCA--CTC-A--TAGG--ACTTG--C---TATGAG--TAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25119 : TCA-AACTTCAA-----TACCCCA--CTC-A--AAATG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-C--AT-TTTTA
gi|25174 : tgtAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--TAG--A-A--ATGCTTTAGATTtgcttt
gi|25173 : AACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25175 : AACTTTAA-----TCACCTA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25171 : AACTTCAA-----TTACCCA--CTT-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGA
gi|25172 : caAACTTCAA-----TCACCCA--CTT-A--TAGGG-ATTTG--TTAATATGAG--CTG--ACA--AAGCTTTAGATTatt
gi|25128 : aAACTTCAA-----TCACCCAA-TTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--A
gi|25177 : tatctaACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATTa
gi|25176 : ACTTCAG-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAGATA-A--ATGCTTTAGA
gi|25179 : CCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAT--CAG--ACA--ATGCTTTATATatt
gi|25178 : tCCCAGCCCC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATAAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
Alignments
lowQualScore : 11111 11 1111 1 00 111 00 00 9 00
lowQualScore : ..... .. .... . .. ... .. .. . ..
lowQualScore : 55555 44 5555 2 88 000 88 88 9 88
consensus : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
Reference ( family-404 ) : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25111 : TGTCCAAACTTCAA-----TTGCCCA--TTC-A--TAGGGAATTCG--C---TATTAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25112 : TGTCCAAACTTCAA-----TTGCCCA--TTC-A--TAGGGAATTCG--C---TATTAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25113 : TGTCCAAACTTCAA-----T--CTCA--ATT-TAATAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CTG--ATA--ATGCTTCA
gi|25114 : TGTCCAAACTTCAA-----TCTCCCA--CTA-A--TATAG-ATTTG--T---TATGGT--CAG--ACA--GTGCTTTTAATTa
gi|25115 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TGGGG-ATTCG--C---TATGAG--CAG--ACA--ATGCTATAGATT
gi|25116 : TGTCCAAACTTCAA------AATTCA--CTC-A--TGGAG-ATTTG--C---TATGAA--CAG--ACA--ATGTTTTAAACT
gi|25117 : TGTCCAAACTTCAA------AACTCG--CTC-A--T-GGG-ATATG--T---TATGAG--CAG--ACA--ATGTTTTAAATT
gi|25118 : TGTCATAACTTCAA-----CCATCCA--CTC-A--TAGGG-ATCTG--C---TATGAG--CAG--ACA--ATGCTTTATATT
gi|25119 : TCA-AACTTCAA-----TACCCCA--CTC-A--AAATG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-C--AT-TTTTA
gi|25120 : tgtTGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAtgcttt
gi|25121 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25122 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTA--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25123 : TGTCAGAACTTTAA-----TCGCCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAAAT
gi|25124 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25125 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--T---TAGAAG--TAG--ACATTATGCTTTAGATT
gi|25126 : TGTCAGAACTTCAA-----TCATCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAAATT
gi|25127 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGA-ATTTG--A---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25128 : AACTTCAA-----TCACCCAA-TTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--A
gi|25129 : tatctaTATCAGAACTTCAA-----TAACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---AATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATTa
gi|25130 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTTAAA
gi|25131 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TATGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25132 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCCTTAGGTT
gi|25133 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAC--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25134 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGTG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25135 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-C--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAA--A-A--AGGCTTTAGATT
gi|25136 : TGTCA-AACTTCAA-----TCACCCA--CTT-T--TAGGT-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTA
gi|25137 : TGTTAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATTCTTTAGATT
gi|25138 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTG-T--TAGTG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25139 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTA-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25140 : TGTCAAAACTTCAA-----CC-CCCA--CTC-G--TAGGG-ATTTGCTT---TATAAAATAAG--ACA--ATGCTTTAAAT
gi|25141 : TGTCAAAACTTTAA-----TCACCTA--CTC-A--TTGGG-ATTTG--C---TATAAG--CAG--ATC--ATGCTTGAGATT
gi|25142 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25143 : TGTTAAAACTTCAA-----CCACCAA--CAC-A--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--TGG--ACA--ATGCTATAGATT
gi|25144 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25145 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25146 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25147 : TGTCAAAATCTCAA-----ATACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CGG--A-A--ATGCTTTA
gi|25148 : TGTTAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--AAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTTGATT
gi|25149 : TGTCAGAACTTCAA-----TCATCAA--CTC-T--TAGTG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25150 : TGTCAGAACTTTAA-----TCACCC-------T--TAGGA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25151 : TGTCAAATCTTCAA-----TTA-------------TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--GCA--ATGTTT
gi|25152 : TGTCAGAACTTTAC-----TCACCCA--CCT-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25153 : TATCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTA--T---TATGAG--AAG--A-A--ATGCTTTAGA
gi|25154 : TGTCACAACTTTAACGTGATCACCCT--ATC-A--TAGGG-ACTTG--T---TATGTG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25155 : TGTCAAAACATCAA-----CTACTCA--CTC-----AGAG-ATTTG--C---TACGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25156 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-------TTTTAAAT
gi|25157 : TGTCAGAGCTTTAA-----TCACCCA--CTC-T--TATGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25158 : TGTCAGAACTTCTA-----TCACCCA--CTC-T--TTGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-T--ATGCTTTAGATT
gi|25159 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGTG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAA
gi|25160 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGGG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25161 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--G-A--ATGATTCAAATT
gi|25162 : TGTCAGAACTTCAG-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25163 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACTCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25164 : TGTCTGAACTTCAA-----TCAACCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25165 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25166 : TGTCAGAACTTCGA-----TCACCAA--CTAAT--T---G-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25167 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATAAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25168 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGAG--CAG--A-A--A
gi|25169 : TGTCAGAACTTCAT-----TCACCCA--CTG-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGGTTTAAATTat
gi|25170 : GTCAAAACTTCAA-----TAACCCA--CTC-A--TAGG--ACTTG--C---TATGAG--TAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25171 : AACTTCAA-----TTACCCA--CTT-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGA
gi|25172 : caAACTTCAA-----TCACCCA--CTT-A--TAGGG-ATTTG--TTAATATGAG--CTG--ACA--AAGCTTTAGATTatt
gi|25173 : aAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25174 : AACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--TAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25175 : AACTTTAA-----TCACCTA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25176 : ACTTCAG-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAGATA-A--ATGCTTTAGA
gi|25177 : ACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATTatt
gi|25178 : CCCAGCCCC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATAAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25179 : acatCCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAT--CAG--ACA--ATGCTTTATAT
Alignments
lowQualScore : 11111 11 1111 1 00 111 00 00 9 00
lowQualScore : ..... .. .... . .. ... .. .. . ..
lowQualScore : 55555 44 5555 2 88 000 88 88 9 88
consensus : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
Reference ( family-404 ) : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25111 : TGTCCAAACTTCAA-----TTGCCCA--TTC-A--TAGGGAATTCG--C---TATTAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25112 : TGTCCAAACTTCAA-----TTGCCCA--TTC-A--TAGGGAATTCG--C---TATTAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25113 : TGTCCAAACTTCAA-----T--CTCA--ATT-TAATAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CTG--ATA--ATGCTTCA
gi|25114 : TGTCCAAACTTCAA-----TCTCCCA--CTA-A--TATAG-ATTTG--T---TATGGT--CAG--ACA--GTGCTTTTAATTa
gi|25115 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TGGGG-ATTCG--C---TATGAG--CAG--ACA--ATGCTATAGATT
gi|25116 : TGTCCAAACTTCAA------AATTCA--CTC-A--TGGAG-ATTTG--C---TATGAA--CAG--ACA--ATGTTTTAAACT
gi|25117 : TGTCCAAACTTCAA------AACTCG--CTC-A--T-GGG-ATATG--T---TATGAG--CAG--ACA--ATGTTTTAAATT
gi|25118 : TGTCATAACTTCAA-----CCATCCA--CTC-A--TAGGG-ATCTG--C---TATGAG--CAG--ACA--ATGCTTTATATT
gi|25119 : TCA-AACTTCAA-----TACCCCA--CTC-A--AAATG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-C--AT-TTTTA
gi|25120 : tgtTGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAtgcttt
gi|25121 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25122 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTA--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25123 : TGTCAGAACTTTAA-----TCGCCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAAAT
gi|25124 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25125 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--T---TAGAAG--TAG--ACATTATGCTTTAGATT
gi|25126 : TGTCAGAACTTCAA-----TCATCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAAATT
gi|25127 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGA-ATTTG--A---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25128 : AACTTCAA-----TCACCCAA-TTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--A
gi|25129 : tatctaTATCAGAACTTCAA-----TAACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---AATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATTa
gi|25130 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTTAAA
gi|25131 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TATGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25132 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCCTTAGGTT
gi|25133 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAC--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25134 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGTG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25135 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-C--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAA--A-A--AGGCTTTAGATT
gi|25136 : TGTCA-AACTTCAA-----TCACCCA--CTT-T--TAGGT-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTA
gi|25137 : TGTTAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATTCTTTAGATT
gi|25138 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTG-T--TAGTG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25139 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTA-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25140 : TGTCAAAACTTCAA-----CC-CCCA--CTC-G--TAGGG-ATTTGCTT---TATAAAATAAG--ACA--ATGCTTTAAAT
gi|25141 : TGTCAAAACTTTAA-----TCACCTA--CTC-A--TTGGG-ATTTG--C---TATAAG--CAG--ATC--ATGCTTGAGATT
gi|25142 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25143 : TGTTAAAACTTCAA-----CCACCAA--CAC-A--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--TGG--ACA--ATGCTATAGATT
gi|25144 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25145 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25146 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25147 : TGTCAAAATCTCAA-----ATACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CGG--A-A--ATGCTTTA
gi|25148 : TGTTAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--AAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTTGATT
gi|25149 : TGTCAGAACTTCAA-----TCATCAA--CTC-T--TAGTG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25150 : TGTCAGAACTTTAA-----TCACCC-------T--TAGGA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25151 : TGTCAAATCTTCAA-----TTA-------------TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--GCA--ATGTTT
gi|25152 : TGTCAGAACTTTAC-----TCACCCA--CCT-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25153 : TATCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTA--T---TATGAG--AAG--A-A--ATGCTTTAGA
gi|25154 : TGTCACAACTTTAACGTGATCACCCT--ATC-A--TAGGG-ACTTG--T---TATGTG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25155 : TGTCAAAACATCAA-----CTACTCA--CTC-----AGAG-ATTTG--C---TACGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25156 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-------TTTTAAAT
gi|25157 : TGTCAGAGCTTTAA-----TCACCCA--CTC-T--TATGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25158 : TGTCAGAACTTCTA-----TCACCCA--CTC-T--TTGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-T--ATGCTTTAGATT
gi|25159 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGTG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAA
gi|25160 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGGG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25161 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--G-A--ATGATTCAAATT
gi|25162 : TGTCAGAACTTCAG-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25163 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACTCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25164 : TGTCTGAACTTCAA-----TCAACCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25165 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25166 : TGTCAGAACTTCGA-----TCACCAA--CTAAT--T---G-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25167 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATAAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25168 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGAG--CAG--A-A--A
gi|25169 : TGTCAGAACTTCAT-----TCACCCA--CTG-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGGTTTAAATTat
gi|25170 : GTCAAAACTTCAA-----TAACCCA--CTC-A--TAGG--ACTTG--C---TATGAG--TAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25171 : AACTTCAA-----TTACCCA--CTT-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGA
gi|25172 : caAACTTCAA-----TCACCCA--CTT-A--TAGGG-ATTTG--TTAATATGAG--CTG--ACA--AAGCTTTAGATTatt
gi|25173 : aAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25174 : AACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--TAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25175 : AACTTTAA-----TCACCTA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25176 : ACTTCAG-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAGATA-A--ATGCTTTAGA
gi|25177 : ACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATTatt
gi|25178 : CCCAGCCCC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATAAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25179 : acatCCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAT--CAG--ACA--ATGCTTTATAT
blockSeqs : CGTGA GC TAA A TAA C
blockSeqs : . A AT . . T
blockSeqs : . . A . . C
blockSeqs : . . A . . C
blockSeqs : . . A . . C
blockSeqs : . . A . . C
blockSeqs : . . A . . C
blockSeqs : . . A . . C
blockSeqs : . . A . . C
blockSeqs : . . T . . T
blockSeqs : . . T . . C
blockSeqs : . . T . . C
blockSeqs : . . T . . C
blockSeqs : . . T . . C
blockSeqs : . . A . . C
blockSeqs : . . T . . C
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . C . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . G . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
finalCons : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
Alignments
lowQualScore : 11111 11 1111 1 00 111 00 00 9 00
lowQualScore : ..... .. .... . .. ... .. .. . ..
lowQualScore : 55555 44 5555 2 88 000 88 88 9 88
consensus : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
Reference ( family-404 ) : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25111 : TGTCCAAACTTCAA-----TTGCCCA--TTC-A--TAGGGAATTCG--C---TATTAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25112 : TGTCCAAACTTCAA-----TTGCCCA--TTC-A--TAGGGAATTCG--C---TATTAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25113 : TGTCCAAACTTCAA-----T--CTCA--ATT-TAATAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CTG--ATA--ATGCTTCA
gi|25114 : TGTCCAAACTTCAA-----TCTCCCA--CTA-A--TATAG-ATTTG--T---TATGGT--CAG--ACA--GTGCTTTTAATTa
gi|25115 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TGGGG-ATTCG--C---TATGAG--CAG--ACA--ATGCTATAGATT
gi|25116 : TGTCCAAACTTCAA------AATTCA--CTC-A--TGGAG-ATTTG--C---TATGAA--CAG--ACA--ATGTTTTAAACT
gi|25117 : TGTCCAAACTTCAA------AACTCG--CTC-A--T-GGG-ATATG--T---TATGAG--CAG--ACA--ATGTTTTAAATT
gi|25118 : TGTCATAACTTCAA-----CCATCCA--CTC-A--TAGGG-ATCTG--C---TATGAG--CAG--ACA--ATGCTTTATATT
gi|25119 : TCA-AACTTCAA-----TACCCCA--CTC-A--AAATG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-C--AT-TTTTA
gi|25120 : tgtTGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAtgcttt
gi|25121 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25122 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTA--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25123 : TGTCAGAACTTTAA-----TCGCCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAAAT
gi|25124 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25125 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--T---TAGAAG--TAG--ACATTATGCTTTAGATT
gi|25126 : TGTCAGAACTTCAA-----TCATCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAAATT
gi|25127 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGA-ATTTG--A---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25128 : AACTTCAA-----TCACCCAA-TTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--A
gi|25129 : tatctaTATCAGAACTTCAA-----TAACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---AATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATTa
gi|25130 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTTAAA
gi|25131 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TATGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25132 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCCTTAGGTT
gi|25133 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAC--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25134 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGTG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25135 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-C--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAA--A-A--AGGCTTTAGATT
gi|25136 : TGTCA-AACTTCAA-----TCACCCA--CTT-T--TAGGT-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTA
gi|25137 : TGTTAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATTCTTTAGATT
gi|25138 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTG-T--TAGTG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25139 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTA-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25140 : TGTCAAAACTTCAA-----CC-CCCA--CTC-G--TAGGG-ATTTGCTT---TATAAAATAAG--ACA--ATGCTTTAAAT
gi|25141 : TGTCAAAACTTTAA-----TCACCTA--CTC-A--TTGGG-ATTTG--C---TATAAG--CAG--ATC--ATGCTTGAGATT
gi|25142 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25143 : TGTTAAAACTTCAA-----CCACCAA--CAC-A--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--TGG--ACA--ATGCTATAGATT
gi|25144 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25145 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25146 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25147 : TGTCAAAATCTCAA-----ATACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CGG--A-A--ATGCTTTA
gi|25148 : TGTTAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--AAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTTGATT
gi|25149 : TGTCAGAACTTCAA-----TCATCAA--CTC-T--TAGTG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25150 : TGTCAGAACTTTAA-----TCACCC-------T--TAGGA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25151 : TGTCAAATCTTCAA-----TTA-------------TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--GCA--ATGTTT
gi|25152 : TGTCAGAACTTTAC-----TCACCCA--CCT-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25153 : TATCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTA--T---TATGAG--AAG--A-A--ATGCTTTAGA
gi|25154 : TGTCACAACTTTAACGTGATCACCCT--ATC-A--TAGGG-ACTTG--T---TATGTG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25155 : TGTCAAAACATCAA-----CTACTCA--CTC-----AGAG-ATTTG--C---TACGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25156 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-------TTTTAAAT
gi|25157 : TGTCAGAGCTTTAA-----TCACCCA--CTC-T--TATGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGAT
gi|25158 : TGTCAGAACTTCTA-----TCACCCA--CTC-T--TTGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-T--ATGCTTTAGATT
gi|25159 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGTG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAA
gi|25160 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGGG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25161 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--G-A--ATGATTCAAATT
gi|25162 : TGTCAGAACTTCAG-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25163 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACTCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25164 : TGTCTGAACTTCAA-----TCAACCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25165 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25166 : TGTCAGAACTTCGA-----TCACCAA--CTAAT--T---G-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25167 : TGTCAGAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGCG-ATTTG--T---TATAAG--CAG--A-A--ATGATTCAAATT
gi|25168 : TGTCAAAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TAAGAG--CAG--A-A--A
gi|25169 : TGTCAGAACTTCAT-----TCACCCA--CTG-T--TAGCA-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGGTTTAAATTat
gi|25170 : GTCAAAACTTCAA-----TAACCCA--CTC-A--TAGG--ACTTG--C---TATGAG--TAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25171 : AACTTCAA-----TTACCCA--CTT-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGA
gi|25172 : caAACTTCAA-----TCACCCA--CTT-A--TAGGG-ATTTG--TTAATATGAG--CTG--ACA--AAGCTTTAGATTatt
gi|25173 : aAACTTCAA-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25174 : AACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--TAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25175 : AACTTTAA-----TCACCTA--TTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATT
gi|25176 : ACTTCAG-----TCACCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAG--CAGATA-A--ATGCTTTAGA
gi|25177 : ACTTCAA-----TCACCCA--CTC-T--TAGGG-ATTTG--T---TATGAG--CAG--A-A--ATGCTTTAGATTatt
gi|25178 : CCCAGCCCC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATAAG--CAG--ACA--ATGCTTTAGATT
gi|25179 : acatCCCA--CTC-A--TAGGG-ATTTG--C---TATGAT--CAG--ACA--ATGCTTTATAT