lowQualScore : 1111 22222222222222222 11 22222 1111111 2222222222222222222222222222222222 1111111
lowQualScore : 5555 2 22 99999999999999999 33 2 33 4 222 3333 0 222 22222 11111 55 333 2 333333 2 111 77777 2 3333333 66666666666666666 1 6666666 11 2 22 3333333 0 444444 0 333 11 6666666666666666666666666666666666 2 0 111 111 222222222 3333 6666666666 333333333 77777 11111 1111111 3 0 00 7777777777 00 1 1111 11
lowQualScore : .... . .. ................. .. . .. . ... .... . ... ..... ..... .. ... . ...... . ... ..... . ....... ................. . ....... .. . .. ....... . ...... . ... .. .................................. . . ... ... ......... .... .......... ......... ..... ..... ....... . . .. .......... .. . .... ..
lowQualScore : 7777 2 99 33333333333333333 00 0 33 3 999 3333 7 333 99999 22222 44 444 0 888888 9 777 33333 0 2222222 66666666666666666 0 2222222 22 6 33 4444444 8 666666 7 555 00 2222222222222222222222222222222222 6 6 111 000 444444444 8888 7777777777 444444444 99999 55555 4444444 9 9 88 7777777777 88 2 9999 55
consensus : AAAAT--G-AT-AT--ATATA----TA--TAT------GTTA-T-CAT-ATTTCATGTACAATCAA---TTTGCTTGCAATG----CTTAAAAT---GTT-----TTN----ATTT--T---G-T------T-T---TGC---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTTT-----T--A-AAT--A-----ATATG-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--N--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTGGGCT--AC---------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
Reference ( gi|98378 ) : AAAAT--G-AT-AT--ATATA----TA--TATT-----GTTT-T-CAT-ATTTTATGTACAATCAA---TTTGCTTGCAATG----CTTAAAAT---GTT-----TTA----ATTT--T---G-T------T-T---TAC---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTCT-----T--A-AAT--A-----ACATG-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--A--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------GTTGGGCT--AT---------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98370 : AAAAT--G-AT-AT--ATATA----TG--TA-------GTTA-T-CAT-ATTTCACATACAATCAA---TTTGCTTGCAATG----CTTAAACT---GTT-----TTA----ATTT------G-T------T-T---TGA---T-A-------A--TG-----------T-A-TTTTG-----T--A-AAT--A-----ATATA-AA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--A--A------GAGAACCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----TTA------ATTGGGCT--AC---------CC--GCTTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98367 : aaAAAAT-----T-AT--GTATA----TG--TA-------GTTA-T-TAT-ATTTCATATACAATCAA---TTTGCTTGCCATG----CTTAAAAT---GTT-----TTT----ATTT--T---G-T------T-T---TGC---TTA-------T--TG-----------T-T-TTTTG-----T--A-AAT--A-----ATATG-TAGGGAAAA-T---GT--A---------TT---------AT--T--A------GAGGGCCCC-AAAGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTGGGCT--AC---------CC--TTTTT-AGATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98368 : aaAAAATTTG-AT-AT--ATATAAT--TA--TGTA-----GTTA-T-CAT-ATTTCATGTACAATGAA---TTTGCTTGCAATGAATGCTTAAATT---GTT-----TTT----ATTT--T---G-T------T-T---TGC---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTTG-----T--A-AAT--A-----ATATG-TA-----AA-T---GT--G---------TT---------AT--T--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------A----T----------T---------T---CAAA-----CTT------ATTGGGCG--AC---------CC--TCTTT-CAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98381 : aAAAAT--A-ATGAT--GTATA----TG--TA-------GTTA-T-CAT-ATTTCATGTATAATCAA---TTTGCTTGCAACG----CTTATTTT---TTT-----TTA------TT--T---G-T------T-T---TGT---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTTG-----T--A-AAT--A-----ACATG-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--T--A------CAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTTGACT--AC---------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----T--ACATTCCAT
gi|98369 : AAAATA-G-AT-AT--ACATA----TA---ATT-----AT-----CAT-TTTTCATGTACAATCAA---TTTGCTTGCAATG----CTTAAATT---GTT-----TTT----ATTT--T---G-T------T-T---TAC---T-G-------T--TG-----------T-A-ATTTG-----T--A-AAT--A-----ATGTA-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------TT--T--A------GGGGACCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTGGGCT--AC---------CT--TCTTT-AAATAATGGCT----T--TCATTC
gi|98379 : aaAAAAT--ATAT-AT--ATATA----TA--TATA-----GTTA-T-CAT-ATTCCATGTACAATCAA---TTTGCTTGCAATG----CTTAAAAT---GCT-----ATT----GTTT--T---G-T------T-T---TG--------------------------------------------T--A-AAT--A-----ATAGG-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--T--A------GAGGGCCTC-ACGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ACTGGGCT--AC---------CT--TCTTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCa
gi|98373 : AAAAT--G-AT-AT--ATATG----T------T-----GTTC-T-CAT-ATTTCATGTACAATTAA---TTTGCTTGCATTG----CTTAAAAT---GTT-----TTT----ATTT--G---G-T------T-T---TAC---T-A-------T--TA-----------C-ACCTTAT-----G--A-AAT--A-----ACATG-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--T--A------AAGGGCCCT-AAGGA---ATTTT---A---------G----T----------A---------T---AAAA-----TTA------ATTGGGCT--A----------CCAATTTTT-AAAGATAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98372 : aaAAAAT-----T-AT--ATATA----TA--TATA-----GTTA-T-CAT-ATTTCATGTACAATCAA---TTGGCTTGTAATG----CTTAAAAT---GTT-----TT-----ATTT--T---G-T------T-T---TGC---T-A-------T--TGT----------T-A-TGT-G-----T--A-AAT--A-----ATATG-TA-----AA---------G---------TC---------AT--T--A------GAGAGTCCC-AATGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------AATGGGCT--AC---------CC--TCTTTAAAAAAAAGACT----T--TCATTCAAT
gi|98375 : aaAAAATT-G-AT-AT--GCATG----TA-----------GTTA-T-CAT-TGATCAACTACAATCAT---ATTGCTTGCAATG----CTTAAAA----GTT-----TTT----ATTT--T---G-T------T-T---TGC---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTTC-----T--A-AAT--A-----ACTTG-TA-----AA-T---GT--A---------TA---------AT--T--T------AAGGGCCCC-AAGTA----GATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTT------ATTGAGCT--AC---------CC--TCTTTTAAATAAAGACT----T--ACATTC
gi|98376 : aaAAAATT-G-AT-AT--TCATG----TA-----------GTTG-T-CAT-TTATCATGTACAGTCAT---TTTGCTTGCAATG----CTTAAAAT---GGT-----TTT----ATTT--C---G-T------T-T---TAC---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTTG-----T--A-AAT--A-----ACATG-TA-----CA-T---GT--T---------TC---------TT--T--A------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTGAGCT--Aa
gi|98382 : aaAAAAT--A-TT-ATTCATTTA----AA--TACC-----ATTT-TTCAT-GTATAATCAATAATCAA---TTTGCTTGCAATG----CTTAAACT---GTT-----TTA-----CTT--T---G-T------T-T---TGC---T-A-------T--TG-----------A-A-TTTGG-----T--A-AAT--A-----AATTG-AT-----AA-T---GT--A---------TT---------TT--C--A------GAGGCCACC-AAGGACGAAGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTTGTCT--AT---------CC--TCTTT-CAATAAAGACT----T--TCATTC
gi|98383 : AAAT--G-AT-AT--ATATG----TA---ATT-----AT-----CAT-ATTCCATGTACAATCAA---TTTGCTTGCAATG----CTTAAAAT---GTTGTTGTTT------TTT--T---G-T------T-T---TGC---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTTG-----T--A-AAT--A-----ATATG-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--T--A------AAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------A---CAAA-----CTA------ATTGGGCT--AT---------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCATa
gi|98384 : AAAT--T-AT--T--ATTTA----AAATTATC-----ATTTAT-CAT-GTAGTAC-TACAATCTA---TTAGCTTGAAATG----CTTAAAAT---GTT-----TTT----ATTT--T---G-T------T-T---TGC---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTGT--------A-GAT--A-----ATATG-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--T--A------GAGGGCCCC-GAGGA---AGATC---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTGGGCT--AC---------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----T--TCATTCCAT
gi|98377 : AAAT--C-AT-AT--ATATA----TG--TA-------GTTA-T-CAT-ATTTCATGTATAATCAA---TTTGCTTGCAGTG----CTTAATAT---GTT-----TTT----A-TT--T---G-T------T-T---T
gi|98385 : aacAAT--G-AT-A---ATA-A----TG--TA-------GTTA-T-CAC-TTTTTATGTACAATCAA---ATTGCTTGCAATG----CTTAAAAA---AAT------------ATTT--T---G-T------G-T---TGC---T-A-------T--TG-----------TTA-TTTGT-----T--A-AG---------ACATG-TA-----AA-T---GT--A---------TA---------TT--T--A------GAGGACCCC-AACGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTA------ATAAGGCA--AT---------CC--TCTTT-AAAT
gi|98380 : --G-AT-AT--ATATAATTGTA--TGTA-----GTTA-T-CAT-ATTTCATGTACAATCAA---TTTGCTTGCAATG----CTTGAAAT---ATT-----TTT----ATGT--T---G-T------T-T---TGC---T-A-------T--TG-----------C-A-TATTG-----T--A-AAT--A-----ATATA-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--A--A------GAGGGCCCC-AAGGA---ACATT---A---------G----T----------G---------T---CAAA-----CTA------CTTGGGCT--AC---------CC--TCTTT-AAATCAAGATT----T--CCATTCCAT
gi|98371 : aa-AT-AC--ATGTA----CA--TGTA-----GTTA-T-CAC-CTGTAATGTACAATCAA---TTTGCTTGCAATG----CTTAAAAT---GTT-----TTT----ATTT--T---G-T------T-T---TGC---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTTG-----T--A-AAT--G-----AAATG-TA-----AA-T---GT--A----------C---------TT--T--A------GAGGGCCCA-AAGAA---AGATC---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTGAGCT--AC---------CC--TCTTT-AAATAAAGAGT----T--TCATTC
gi|98386 : aaaaagtat-AT--GTATA----TA---ATTATGAAGTTT-T-CAT-ATTTCATGCATGATTAA---TTTGCCTGCAATG----CTTAAAAT---GTT-----TTT----ATTT--T---G-T------T-T---TAT---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTTG-----T--A-AAT--G-----ATATG-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--T--A------GAGGGCCCC-AATGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTAGGCT--Aa
gi|98387 : --ATATA----CA--TGTA-----GTTA-T-CAT--TTTCATGTACAATCAA---TGTGCTTGCAATG----CTTAAA-T---GTT-----TTT----ATTT--T---GCT------T-T---TGA---T-A-------T--TG-----------A-A-CTTTT-----G--ACAAT--A-----ATATG-TA-----AA-T---GT--A---------CC---------TT--A--C------GAGGACTCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------C---CAAA-----TTA------ATTGGGCT--AC---------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----T--TCATTCcgacttct
gi|98389 : -----GTTT-T-TGTCATTGCATTTATAAACAT---TATG--TG-AATG----CTT--------GTT-----TTAT---ATTT--TAATG-T------T-TGATTAC-----A-------T--TG-----------T-------------T--G-AAT--T-----TCATG-TT-----CA-TT--GT--A---------TG---------AT--T--GTT----GAGGGCCAC-AGGGA---AGATT---A---------G----T----------G---------T-----AA-----CTA------ACTGTGTT--AC---------CC--TCATT-AAATAAAGa
gi|98391 : aTTATGTA------A---TTTGGT-GTAATG----G--AGAATTTTGTT-----TTATAATATTA--T---G-TGCAATGT-T---TAT---T---------TCATA-----------T-A-TTTCT-----T--A-AAT--ATATATATGTG-TA-----AA-T---AT------------TG---------AT--AT-ATTT---GAGGGCCGC-AAGGG---AGATT---A---------G----TGACTACTGAGT---------C---TGTA-----CTA------ATTGTTTT--AC---------CC--TCTTG-AAATAAAGTCT----T--
gi|98390 : tatctgtaTATATAC---CAAAACTTTGCTTATAATG----CTTAA--------------TTG----ATTT--T---G-T------T-T---TGC---C-A-------T--GG-----------T-A-TTGTA-----T--A-AAT--A-----ACATG-TA-----AA-T---GC--A---------TT----------T--A--A------GAAAGCCCA-AATAT---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CAA------ATCGGGCT--AT---------CC--T-TTA-AAATAAATTCT----T--TCATTC
gi|98392 : tgtaATGTACAATCAA---TTTCTTTGCAATG----CTTAACAT---GTT-----TTG-------------------------------C---T-A-------T--TG-----------T-A-TTTTG-----T--A-AAT--G-----ATATG-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------TT--T--A------GAGGGCCCC-AGGGA---AGATA---A---------G----T----------T---------T---CAAC-----CTA------ATTGGGCT--AC---------CC--TTTTT-AAAT-AAGACT----T--CCATTCCATa
gi|98374 : atgTACAATCAA---TTTGCTTACAATG----CTTAAAAT---ATT-----TTTT---ATTT--T---G-T------T-T---TCA---A-A-------T--TG-----------T-A-TTTTG-----T--C-AAT--A-----ATATG-TA-----AA-T---GT--A---------AC---------TT--T--A------GAGAGCCCT-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATGGGGCT--AC---------CC--TTTTT-AAATAAAGACTTTAAT--CCATTCCAT
gi|98394 : aaaaaattgatttatatagtaataataatAATG----CTTG---T---TTT-----TTA-----TTTAAT---G-T------T-T----A------A-------T--TA-----------T-A-TTG-T-----T--G-AAT--T-----TCATG-TT-----AA-TT--GT--A---------TG---------AT--T--GTT----GAGGGCCAC-AGGGA---AAATT---A---------A----T----------G---------T-----AA-----CTA------GCTGTGTT--AC---------CC--TCATT-AAATAAAGAAT----T--
gi|98395 : AATG----CTT--------GTT-----TTAT---ATTT--T---AATG-----T-T---TA------A-------T--TA-----------C-A-TTG-T-----T--G-AAT--T-----TTATG-TT-----CA-TT--GT--A---------TG---------AT--T--GTT----GAGGGCCAC-AAGGA---AGATT---A---------G-------------------------T---GATA-----TTA------ACTGTGTT--AC---------CC--TCATT-AAATAAAG
gi|98397 : TTAAAAT----TA-----TAA----ATTA--T---T-T------T-T---GAA---T-A-------TAAGG-----------T-A-TTGTT-----C--A---T--A-----ACAGG-TA-----CA-T-------A---------TC---------TT--T--G------GAGGACACA-AAGAT---AGATT---C---------T----T----------T---------T---CAAA-----CTA------TTTGCGCT--AC---------TC--TATTT-AGATAAAGACT----T--TCGCTC
gi|98399 : TAAAAT-----T-----CT------TTT--T---G-T------T-T-----------A-----------G-----------T-A-GTT-T-----T--ATGAT--A-----AAATG-T-------------GT--T---------TA---------AT--A---------GAGAGCCAC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TTAC-----CTAAATAT-GTT---TT--AC---------CC--TCTTT-AAATAAAG
gi|98402 : T---GTT-----GTATAT-ATTT--T---G-T------TAT---TAC---TCA-------C--T----------------TTTGT-----T--A-G-----------CATG-TA--------T---AT--A---------TA---------AT--A---------GAGGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------G----TGATTG-----T---------T---CCAA-----CTGT-----GTT--------T---------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----TTATCATT
gi|98403 : aatttT---GTT-----GTATAT-ATTT--T---G-T------TAT---TAC---T-------------------------C-A-CTTTG-----T------T--A-----GCATG-TA-------------T--A---------TA---------A---A--A------GAGGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------G------------------------------AAATTATTCTA------ACTGTGTT--A----------CC--TCTTT-AAATAAAGATT----T--
gi|98396 : aatttT---GTT-----TTAT---ATTT--TAATG-T------T-T---AAT---T-A-------A--TA-----------C-A-TTG-T-----T--G-AATTTA-----ATGT--TC-----AT-T---GT--A---------TG---------AT--T--GTT----GAGGGCCAC-AGGGA---AGATT---A---------G----T----------G---------T-----AA-----CTA------ACTGTGTT--AC---------TC--TCATT-AAATAAAG
gi|98400 : aatgccTT-----TTAC---ATTTGAT---A-T------T-T---TACATAT-AAAATTGTT--TG-----------T-A-TATTT----------AAT--A------CATG-TA-----CA-T---GT--A---------TT---------GT--A--AATAATAGAGGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTA------AATGTGTA--AC---------CC--TCTGT-AAATAAAGACT----
gi|98401 : agtTT-----TTAC---ATTTGAT---A-T------T-T---TACA--T-A-------T--TAAATGGTTTGTAT-A-TTTAT-----T--A-A-T--A------CATG-TA-----T--T---GT--A----------A---------AT--ATTA------GAGGGCCTC-ATGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTA------AATATGTA--AC---------CC--TCTGT-GAATAAAGACT----
gi|98398 : agtTT-----TTAC---ATTTGAT---A-C------T-T---TACA--T-A-------T--TA-----------A-A-TTGTT-----TGCA-AATTTA-----ATAT----------A-T---GT--A---------TT---------GT--A--AATAATAGAGGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTA------AATGTGTA--ACCCTCAAAGGCC--TCTGT-AAATAAAGACT----
gi|98404 : taacagtT-----TTA-----TTT--T---T-T------T-T---T-C---C-A-------T--TT-----------A-A-ATTTTGAGTGT--A-AAT--A-----ATAT----------A-T---GT--TCT-------TC---------ATG-A--A------GAGGGCCCC-AAGGG---AGATT---A---------G----TAC--------T---------T---T-GA-----TTA------ATCGATGT--GA---------CT--TCTCT-AAATTAAGATT----T--TTATTC
gi|98407 : attta----ATTT--T---G-T------TAT---TAC---T-------------------------C-A-CTTTT----------ATT--A-----ACATG-TA-------------T--A---------TA---------AT--A---------GAGGACTAC-AGGGA---AGATT---A---------GAGAATA---------T---------T---CCAA-----CTGT-----GTT------------------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----T--a
gi|98408 : tT--T---G-C------T-T-----C---T-A-------T--TG-----------C-A-TTTTG-----T--A-AAT--A-----ATATG-TA-----AA-T---GT--A---------TC---------AT--T--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTGGGCT--AT---------GC--TTTTT-AAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98409 : T--T---A-T------T-T---T-C---T-A-------T--C----------------TTTTT-----G--A-AA-----------ATG-TA-----TA-T---TT--A---------TTTATTTGTTTAT--A--C------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCA------ATTGAGTA--AC---------CT--TTTTT-AAATAAAGA
gi|98410 : --T---A-T------T-T---T-C---T-A-------T-----------------A-TTTTT-----G--A-AA-----------ATG-TA-----CA-T---GT--ACTTGTTTGTTT---------AT--A--C------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCA------ATTGAGTT--AC---------CC--TCTTT-AAATAAAGA
gi|98411 : --T---A-T------T-T---T-C---T-A-------T-----------------A-TTTTT-----G--A-AA-----------ATG-TA-----TA-T---GT--ACTTGTTTGTTT---------AT--A--C------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCA------ATTGAGTT--AC---------CT--TCTTT-AAATAAAGA
gi|98412 : --T---A-T------T-T---T-C---T-A-------T--C----------------TTTTT-----G--A-AA-----------ATG-TA-----TA-T---GT--ACTTGTTTGTTT---------AT--A--C------GAGG-CCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------------AA-----CCA------TTTGAGTT--AC---------CC--TCTTT-AAGTAAAGA
gi|98414 : ---T-A-------T--TG-----------T-A-TTT-T-----T--ATAGC--A-----AGAGG-TA-----AA-T---AT--T---------TA---------ATTTG--A------GAGGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------GAGATTG---------T---------T---CAAA-----CTGT-----GTT--------T---------CC--TCTTT-AAATAAA
gi|98406 : -TTTCC-----T--G-AAT--A-----ATGTGATA-----AAAC---GA--A---------TC---------TT--A-----------------C-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTT------ATTGGGCT--AC---------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98417 : ttattttgataataaatgttgaatttatttTTTT-----T--A-AAT--A-----AGAAC-TA-----TA-T---GA--A---------T----------AT--T---------GAGGGCCTC-AATGA---AGATT---A--------------T----------T---------T---CAA------CTA------ATTGAGCT--AC---------CC--TCTTT-AAAAAAAGACT----T--TCATT
gi|98413 : a-----T--A-AAT--G-----ATATG-CA-----AA-T---GT--A---------TG---------TT--T--A------GAGCGTCCCAAAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---AAAA-----AAA------CATAAA-T--AC---------CC--TCTCT-AAAT-AAGTCA----T--TCATTCtaat
gi|98419 : tattgaatataatg-----T--A-AAT--A-----ATGTA-TA-----TA-T---GT--T---------T------------------------GAGGGCCTT-GTGGA---AGATT---A---------A----C----------T---------TGTTCAAA------TG------ATT----T--AT---------CC--TGTT--AAATAAAGACT----T--a
gi|98415 : tg-AAT--A-----TTATG-TA-----CT-T---GT--T---------T-----------T--A--A------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---T---------G----C----------TTTG------T---CAAT-----CAA------GT-----C--AC---------CC--TTTAT-AAATAAAGATT----
gi|98418 : ttgtggactttgt--A-----AAATG-TA-----TA-T---GT--A---------TTTATTTGTTTAT--A--C------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCA------ATTGAGTT--AC---------AT--TCTTT-AAATAAAGA
gi|98405 : ttttgATG-TA-----TA-TCTTGTTAA---------TA---------AT--A--A-------AGGGCCGT-ATGAA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----ATA------AATGTGTT--AC---------CT--TCTAT-AAATAAAG
gi|98421 : tttatttcatttTG-TA-----AA-T---A------------------------AT--A---------GAGGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTA------AATGTGTA--AC---------CC--TCCGT-AAATAAAGACT----
gi|98422 : TG-TA-----AA-T----------------------------AA--A--A------GAGGGCCGC-ATAGA---AGATT---T---------G----T--------------------------AA-----CTA------AATGTGTT--AC---------AC--TCTGT-AAATGAAGACT----
gi|98423 : -TA-----TA-T---GT--A---------T----------AT--T--T------GAGAGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAAC---ATT---CT--AT---------CC--TCTGT-AAATAAAGACT----
gi|98424 : A-----AA-T---GC--A---------TG---------TT--T--A------GAGGGCCGC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTT------AATGTGTC--AC---------GA--TCTAT-AAATAAAG
gi|98425 : A-----AA-T---G---A---------CC---------AT--T--T------GAAAGCGTC-ATCAA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTT------AATGTGTC--AC---------CC--TCTAT-AAATAAAG
gi|98393 : -T---GT--A---------TC---------A-------------GAGGGCCGC-GTGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTA------AATGTGTC--AC---------CC--TCTTT-AAATAAA
gi|98427 : atcatcaaacaattgcatgaatttttaatttggctatttgtttccatggtaacagaaaaaataataaaaatgaaaactcactC---------AT--T--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATCGGGCT--AC---------CC--TCTTT-AGATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98420 : C---------AT--A--G------G--GGCACC-AAGGA---AGAGT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTA------ATTGGGCT--AC---------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98416 : tagtatgtatatgctttttaaa--A--A------GAGGACCTC-AATGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T---T--A-----CCA------ATTCGGTC--AC---------CT--TCTAT-CAATAAA
gi|98430 : tgttctttgtaattagatatatttgtttc--A------GAGGGCCGC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTA------AATGTGTC--A----------CC--TCTAT-AAATAAAG
gi|98428 : t--A------GAGGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------GAGATTG---------T---------T---CCAA-----CTGT-----GTT--------T---------CC--TCTTT-AAATAAAGACT----T--
gi|98429 : act--A------GAGGGCAGC-AAGGC---AGATT---A---------G----T----------TACTGATGTAT---TATA-----CTA------ATTGTGTT--AC---------CT--TCTTG-AAATAAAG
gi|98388 : t------GAGGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTA------AATGTGTA--AC---------CC--TCTGT-AAATAAAGACT----
gi|98431 : tggttttatatgtcatttttgtacagtcacgttttgtttgtatggattttttgcgccttttcttcaacatgattacacaagttcatttattt------GAGGGCCTC-AAGAA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCA------ATTGAGTTTCCC---------CC--TCTTT-AAATAAAGA
gi|98432 : ------GAGGGCCTC-AAGGG---AGATT---AGTGACTGCTG----T----------T---------T---TATA-----CTT------ATTGTGTT--AA---------CC--CCTTG-AAATAAAG--T----T--TTATT
gi|98426 : ------GAGGGCCAC-AAGGA---CAATTGATA---------G----T----------G---------T-----AA-----CTA------ACTGTGTT--AC---------TC--TCATT-AAATAAAG
gi|98433 : tgtataattgttAGGACCGC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTG------CATGTGTC--AT---------CC--TTTGT-AAATAAAG
gi|98434 : -AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CGAA-----CTA------ATTGGGCG--AC---------CC--TCTTT-AAA
gi|98385 : ATT---A---------G----T----------T---------T---AAAA-----CTAATCTTCGTTGGG----GT---------CC--TC--T-AAATATACATT----T--ACAT
gi|98435 : aatgataataatgtagttatcactttttatgtacaatcaaattgcttgcaatgcttaaaaaaatattttgtgttgctattgttatttgttaagacTTGGACT--AC---------CC--TCTTT-AAATAAAGACG----T--CCATTCCATaaggcaatcctctttaaat
Alignments
lowQualScore : 1111 22222222222 11111111111 22222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 3333 2 99999999999 333 4 444444 222 555 5555555 3333 1 99 2 11 7777777 1 333 1 11 55 11 22222222222 0 0 11 44444 0 1111 0 0 333333 222222 333 11 00000000000000000000000000000000000000 2 0 111 111 222222222 3333 6666666666 222222222 99999 11111 0 111 3 00 00 333333333 0 0 0 1111 11
lowQualScore : .... . ........... ... . ...... ... ... ....... .... . .. . .. ....... . ... . .. .. .. ........... . . .. ..... . .... . . ...... ...... ... .. ...................................... . . ... ... ......... .... .......... ......... ..... ..... . ... . .. .. ......... . . . .... ..
lowQualScore : 7777 0 00000000000 000 1 666666 888 000 2222222 1111 5 44 5 44 2222222 0 777 0 22 55 11 22222222222 8 8 88 88888 8 5555 7 7 888888 666666 222 99 11111111111111111111111111111111111111 4 6 000 000 444444444 8888 7777777777 444444444 55555 55555 6 000 9 88 88 222222222 6 6 6 9999 55
consensus : AAAAT--G-AT-ATATATA----TAT-AT-GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTTT-AT-TT--T---G---T-TTTGC-T-AT--TGT--ATTT--T-T-----T---A-A-AT--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATT--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTGNG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
Reference ( family-403 ) : AAAAT--G-AT-ATATATA----TAT-AT-GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTTN-AT-TT--T---G---T-TTTGC-T-AT--TGT--ATTT--T-T-----T---A-A-AT--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATN--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98367 : AAAAT-----T-ATGTATA----TGT-A--GT---TATTATATTTCATATA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCCATG----CTTAAAATGTTTTT-AT-TT--T---G---T-TTTGC-TTAT--TGT--TTTT--T-G-----T---A-A-AT--A-----AT-A----T-G-TAGGGAAAA------T---GT--A---------T------T---------ATT--A------GAGGGCCCC-AAAGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AGATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98368 : aaAAAATTTG-AT-ATATATAAT--TAT-GTAGT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATGAA---T-------TTGCTTGCAATGAATGCTTAAATTGTTTTT-AT-TT--T---G---T-TTTGC-T-AT--TGT--ATTT--T-G-----T---A-A-AT--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T---GT--G---------T------T---------ATT--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------A----T----------T---------T---CAAA-----C-TT---ATTGGG--CG--AC---------C-CTC-TTT-CAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98369 : aAAAATA-G-AT-ATACATA----TA-----AT---TATCATTTTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAATTGTTTTT-AT-TT--T---G---T-TTTAC-T-GT--TGT--AATT--T-G-----T---A-A-AT--A-----AT-G----T-A-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------TTT--A------GGGGACCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTGGG--CT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAATGGCT----T--TCATTC
gi|98370 : aaAAAAT--G-AT-ATATATA----TGT-A--GT---TATCATATTTCACATA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAACTGTTTTA-AT-TT------G---T-TTTGA-T-AA--TGT--ATTT--T-G-----T---A-A-AT--A-----AT-A----T-A-AA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATA--A------GAGAACCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----T-TA---ATTGGG--CT--AC---------C-CGC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCATa
gi|98371 : aaAAAAG--T-AT-ATACATG----TAC-AT-GTAGTTATCACCTGTAATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTTT-AT-TT--T---G---T-TTTGC-T-AT--TGT--ATTT--T-G-----T---A-A-AT--G-----AA-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A----------------C---------TTT--A------GAGGGCCCA-AAGAA---AGATC---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTGAG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGAGT----T--TCATTC
gi|98372 : aAAAAT--T-AT-ATATATA----TAT-A--GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TGGCTTGTAATG----CTTAAAATGTTTT--AT-TT--T---G---T-TTTGC-T-AT--TGT--TATG--T-G-----T---A-A-AT--A-----AT-A----T-G-TA-----AA--------------G---------T------C---------ATT--A------GAGAGTCCC-AATGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---AATGGG--CT--AC---------C-CTC-TTTAAAAAAAAGACT----T--TCATTCAATa
gi|98373 : aaAAAAT--G-AT-ATATATG----T----T-GT---TCTCATATTTCATGTA------CA---ATTAA---T-------TTGCTTGCATTG----CTTAAAATGTTTTT-AT-TT--G---G---T-TTTAC-T-AT--TAC--ACCT--TAT-----G---A-A-AT--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATT--A------AAGGGCCCT-AAGGA---ATTTT---A---------G----T----------A---------T---AAAA-----T-TA---ATTGGG--CT--AC---------CAATT-TTT-AAAGATAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98374 : aaAAAATT-G-AT-TTATATA-----------GT---AATAATA----AT-TA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTACAATG----CTTAAAATATTTTTTAT-TT--T---G---T-TTTCA-A-AT--TGT--ATTT--T-G-----T---C-A-AT--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------A------C---------TTT--A------GAGAGCCCT-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATGGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AAATAAAGACTTTAAT--CCATTCCAT
gi|98375 : aaAAAATT-G-AT-ATGCATG----TA-----GT---TATCATTGATCAACTA------CA---ATCAT---A-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAA-GTTTTT-AT-TT--T---G---T-TTTGC-T-AT--TGT--ATTT--T-C-----T---A-A-AT--A-----AC-T----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------A---------ATT--T------AAGGGCCCC-AAGT----AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TT---ATTGAG--CT--AC---------C-CTCTTTT-AAATAAAGACT----T--ACATTC
gi|98376 : aaAAAATT-G-AT-ATTCATG----TA-----GT---TGTCATTTATCATGTA------CA---GTCAT---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGGTTTT-AT-TT--C---G---T-TTTAC-T-AT--TGT--ATTT--T-G-----T---A-A-AT--A-----AC-A----T-G-TA-----CA------T---GT--T---------T------C---------TTT--A------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTGAG--CT--Aa
gi|98377 : aaAAAT--C-AT-ATATATA----TGT-A--GT---TATCATATTTCATGTA------TA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAGTG----CTTAATATGTTTTT-A--TT--T---G---T-TTT
gi|98378 : aacAAAAT--G-AT-ATATATA----TAT-ATTGT---TTTCATATTTTATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTTA-AT-TT--T---G---T-TTTAC-T-AT--TGT--ATTT--C-T-----T---A-A-AT--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATA--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---GTTGGG--CT--AT---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98379 : AAAAT--ATAT-ATATATA----TAT-ATAGT---TATCATATTCCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGCTATT-GT-TT--T---G---T-TTTG---------------------------T---A-A-AT--A-----AT-A----G-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATT--A------GAGGGCCTC-ACGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ACTGGG--CT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98380 : --G-AT-ATATATAATTGTAT-GTAGT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTGAAATATTTTT-AT-GT--T---G---T-TTTGC-T-AT--TGC--ATAT--T-G-----T---A-A-AT--A-----AT-A----T-A-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATA--A------GAGGGCCCC-AAGGA---ACATT---A---------G----T----------G---------T---CAAA-----C-TA---CTTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATCAAGATT----T--CCATTCCAT
gi|98381 : aaAAAAT--A-ATGATGTATA----TGT-A--GT---TATCATATTTCATGTA------TA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAACG----CTTA---TTTTTTT-TTATT--T---G---T-TTTGT-T-AT--TGT--ATTT--T-G-----T---A-A-AT--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATT--A------CAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTTGA--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--ACATTCCAT
gi|98382 : AAAAT--A-TT-ATTCATT----TAA-AT-------ACCATTTTTCATGTA------TA---ATCAA---TAATCAATTTGCTTGCAATG----CTTAAACTGTTTT--AC-TT--T---G---T-TTTGC-T-AT--TGA--ATTT--G-G-----T---A-A-AT--A-----AA-T----T-G-AT-----AA------T---GT--A---------T------T---------TTC--A------GAGGCCACC-AAGGACGAAGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTTGT--CT--AT---------C-CTC-TTT-CAATAAAGACT----T--TCATTC
gi|98383 : AAAT--G-AT-ATATATG----TA-----AT---TATCATATTCCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTGTT-GT-TT--TTTTG---T-TTTGC-T-AT--TGT--ATTT--T-G-----T---A-A-AT--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATT--A------AAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------A---CAAA-----C-TA---ATTGGG--CT--AT---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCATa
gi|98384 : T---TATCATTTATCATGTAGTACTACA---ATCTA---T-------TAGCTTGAAATG----CTTAAAATGTTTTT-AT-TT--T---G---T-TTTGC-T-AT--TGT--ATTT--G-T---------A-G-AT--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATT--A------GAGGGCCCC-GAGGA---AGATC---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--TCATTCCAT
gi|98385 : aaattattatttaaaaAAT--G-AT-A-ATA-A----TGT-A--GT---TATCACTTTTTATGTA------CA---ATCAA---A-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAAAAAT----AT-TT--T---G---T-GTTGC-T-AT--TGTT-ATTT--G-T-----T---A-A-G---------AC-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------A---------TTT--A------GAGGACCCC-AACGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----C-TA---ATAAGG--CA--AT---------C-CTC-TTT-AAAT
gi|98386 : -AT-GTATATAAT--TATGAA-GT---TTTCATATTTCATGCA------TG---ATTAA---T-------TTGCCTGCAATG----CTTAAAATGTTTTT-AT-TT--T---G---T-TTTAT-T-AT--TGT--ATTT--T-G-----T---A-A-AT--G-----AT-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATT--A------GAGGGCCCC-AATGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTAGG--CT--ACGA-------C-TTC-T
gi|98387 : -ATATACA----TGT-A--GT---TATCAT-TTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------GTGCTTGCAATG----CTTAAA-TGTTTTT-AT-TT--T---GC--T-TTTGA-T-AT--TGA--ACTT--T-T-----G---ACA-AT--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------C------C---------TTA--C------GAGGACTCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------C---CAAA-----T-TA---ATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--TCATTC
gi|98388 : ----TAT-AT-GT---CAT----TTT--TGTA------CA---GTCACGT-T-------TTGTTTGTA--------------TG----G-AT-TT--T-------T-TGCGC-C--T--T-----TTC--T-T-----C---A-ACAT--G-----ATTA----C-A-CA-----AG------T---TC--A---------T------TT--------ATT--T------GAGGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----C-TA---AATGTG--TA--AC---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----a
gi|98389 : tggtttT---TGTCAT--TGCATTTA------TA---AACAT---T-------ATG--TG-AATG----CTT-----GTTTTATAT-TT--T---AA--TGTTTG----AT--TAC--ATTG--T-T---------G-A-AT--T-----TC-A----T-G-TT-----CA------TT--GT--A---------T------G---------ATT--GTT----GAGGGCCAC-AGGGA---AGATT---A---------G----T----------G---------T-----AA-----C-TA---ACTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98390 : agtttTGTA------TATATACCAAAACT-------TTGCTTATAATG----CTTAA------TTG-AT-TT--T---G---T-TTTGC-C-AT--GGT--ATTG--T-A-----T---A-A-AT--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T---GC--A---------T------T----------TA--A------GAAAGCCCA-AATAT---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-AA---ATCGGG--CT--AT---------C-CT--TTA-AAATAAATTCT----T--TCATTC
gi|98391 : --TAT--ATTT--C-T-----T---A-A-AT--ATATATAT-G----T-G-TA-----AA------T---ATTGA---------TA-----T---------ATT--T------GAGGGCCGC-AAGGG---AGATT---A---------G----TGACTACTGAGT---------C---TGTA-----C-TA---ATTGTT--TT--AC---------C-CTC-TTG-AAATAAAGTCT----T--a
gi|98392 : tatctgtattatgtaatttggtgtaatggagaattttgttttataatattatgtgcaatgtttatttcaATGTA------CA---ATCAA---T-------TTCTTTGCAATG----CTTAACATGTT----------------------TTGC-T-AT--TGT--ATTT--T-G-----T---A-A-AT--G-----AT-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------TTT--A------GAGGGCCCC-AGGGA---AGATA---A---------G----T----------T---------T---CAAC-----C-TA---ATTGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AAAT-AAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98393 : atg---A-A-AT--A-----AT-AAAAAT-G-AA-----AACTCACTT---GT--A---------T------C---------A-----------GAGGGCCGC-GTGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----C-TA---AATGTG--TC--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAA
gi|98394 : atcatcaaacaattgcatgaatttttaatttggctatttgtttccatggtaacagaaaAATG----CTTG---T-TTTTT-AT-TTAAT---G---T-TTA-----AT--TAT--ATTG--T-T---------G-A-AT--T-----TC-A----T-G-TT-----AA------TT--GT--A---------T------G---------ATT--GTT----GAGGGCCAC-AGGGA---AAATT---A---------A----T----------G---------T-----AA-----C-TA---GCTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAGAAT----T--
gi|98395 : AATG----CTT-----GTTTTATAT-TT--TAATG---T-TTA-----AT--TAC--ATTG--T-T---------G-A-AT--T-----TT-A----T-G-TT-----CA------TT--GT--A---------T------G---------ATT--GTT----GAGGGCCAC-AAGGA---AGATT---A---------G-------------------------T---GATA-----T-TA---ACTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98396 : TGTTTTATAT-TT--TAATG---T-TTAAT-T-AA--TAC--ATTG--T-T-----G---A-A-TTT-A-----AT-G----T---TC-----AT------T---GT--A---------T------G---------ATT--GTT----GAGGGCCAC-AGGGA---AGATT---A---------G----T----------G---------T-----AA-----C-TA---ACTGTG--TT--AC---------T-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98397 : aatgccTTAAAAT-TATAA-AT-TA--T-------T-TTTGAAT-ATAAGGT--ATTG--T-T-----C---A----T--A-----AC-A----G-G-TA-----CA------T-------A---------T------C---------TTT--G------GAGGACACA-AAGAT---AGATT---C---------T----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---TTTGCG--CT--AC---------T-CTA-TTT-AGATAAAGACT----T--TCGCTC
gi|98398 : GTTTTT-ACATT--T---GATAC-TTTACAT-AT--TAA--ATTG--T-T-----TGC-A-A-ATTTA-----AT-A----T-----------A------T---GT--A---------T------T---------GTA--AATAATAGAGGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----C-TA---AATGTG--TA--ACCCTCAAAGGC-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98399 : taaca-AT-TC--T-------T-TTTGT-T--T--AGT--AGTT--T-T-------------AT--G-----AT-A---------A-----AA------T---GT--G---------T------TT--------AAT--A------GAGAGCCAC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TTAC-----C-TA---AATATGTTTT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAG
gi|98400 : taaaT--TGT--ATAT--T-T-----------A-AT--A------C-A----T-G-TA-----CA------T---GT--A---------T------T---------GTA--AATAATAGAGGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----C-TA---AATGTG--TA--AC---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98401 : agtttttacatttgatattttacatataaaattgtT--TGT--ATAT--T-TA----T---T-A-AT--ACAT--GT-A----TTG-TA-----AA------T----------------------------------ATT--A------GAGGGCCTC-ATGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T---GTAA-----C-TA---AATATG--TA--AC---------C-CTC-TGT-GAATAAAGACT----
gi|98402 : agtttttacatttgatattttacatattaaatggt--T---A---T-TTTGT-T-AT--TACTCACTT--T-TG----T--------T--A-----GC-A----T-G-TA-------------T---AT--A---------T------A---------AT---A------GAGGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------G----TGATTG-----T---------T---CCAA-----C-T-------GTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----TTATCATT
gi|98403 : aattttgttgtata--T---A---T-TTTGT-T-AT--TACTCACTT--T-G-----T--------T--A-----GC-A----T-G-TA------------------T--A---------T------A---------A-A--A------GAGGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------G------------------------------AAATTATTC-TA---ACTGTG--TT--AC---------C--TC-TTT-AAATAAAGATT----T--
gi|98404 : aattttgttgtataTTT-AT-TT--T---T---T-TTT-C-C-AT--TTA--AATT--T-TGAGTGT---A-A-AT--A-----AT-A----T-----------A------T---GT--TCT-------T------C---------ATG--AA-----GAGGGCCCC-AAGGG---AGATT---A---------G----TAC--------T---------T---T-GA-----T-TA---ATCGAT--GT--GA---------C-TTC-TCT-AAATTAAGATT----T--TTATTC
gi|98405 : atttaT-A----T-G-TA-----TA------TCTTGTTAA---------T------A---------ATA--A-------AGGGCCGT-ATGAA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----A-TA---AATGTG--TT--AC---------C-TTC-TAT-AAATAAAGa
gi|98406 : tttatttcatt-AT--T-T--ATTT--T-T-----TCCTG-A-AT--A-----AT-G----T-GATA-----AAA-----C---GA--A---------T------C----------TT--A--------------C-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TT---ATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98407 : ttattttgataataaatgttga--T---A---T-TTTGT-T-AT--TACTCACTT--T-T-----------A-TT--A-----AC-A----T-G-TA------------------T--A---------T------A---------AT---A------GAGGACTAC-AGGGA---AGATT---A---------GAGAATA---------T---------T---CCAA-----C-T-------GTG--TT-------------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--
gi|98408 : T--T---G---C-TT--C-T-AT--TGC--ATTT--T-G-----T---A-A-AT--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T---GT--A---------T------C---------ATT--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTGGG--CT--AT---------G-CTT-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98409 : T--T---A---T-TTT-C-T-AT--C-----TTT--T-T-----G---A-A-A------------A----T-G-TA-----TA------T---TT--A---------T------TTATTTGTTTATA--C------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----C-CA---ATTGAG--TA--AC---------C-TTT-TTT-AAATAAAGA
gi|98410 : --T---A---T-TTT-C-T-AT-------ATTT--T-T-----G---A-A-A------------A----T-G-TA-----CA------T---GT--ACTTGTTTGTT------T---------ATA--C------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----C-CA---ATTGAG--TT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98411 : --T---A---T-TTT-C-T-AT-------ATTT--T-T-----G---A-A-A------------A----T-G-TA-----TA------T---GT--ACTTGTTTGTT------T---------ATA--C------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----C-CA---ATTGAG--TT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98412 : T--TCT--ATCT--T-T-----TTGAA-A-AT--GT----AT-A----T-G-TA-----CT------T---GT--T---------TGTT---T---------ATA--C------GAGG-CCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------------AA-----C-CA---TTTGAG--TT--AC---------C-CTC-TTT-AAGTAAAGA
gi|98413 : tatt-T-AT--TGA--ATATAAT-G-----T---A-A-AT--G-----AT-A----T-G-CA-----AA------T---GT--A---------T------G---------TTT--A------GAGCGTCCCAAAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------TAAAAAAA-----CATA---A-------AT--AC---------C-CTC-TCT-AAAT-AAGTCA----T--TCATTC
gi|98414 : -T-AT--TGT--ATTT--T-T-----A---T-A-GC--A-----AG-A----G-G-TA-----AA------T---AT--T---------T------A---------ATTTGA------GAGGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------GAGATTG---------T---------T---CAAA-----C-T-------GTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAa
gi|98415 : T--TGTGGACTT--T-G-----T---A-A--T--A-----TT-A----T-G-TA-----CT------T---GT--T---------T-----------------TA--A------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---T---------G----C----------T---------T---T--G-----T-CA---ATCAAG--TC--AC---------C-CTT-TAT-AAATAAAGATT----
gi|98416 : --TGT--TCTT--T-G-----T---A-A-TT--AG----AT-A----T-A-TT-------------T---GT--T---------T------C---------A----A------GAGGACCTC-AATGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T---T--A-----C-CA---ATTCGG--TC--AC---------C-TTC-TAT-CAATAAA
gi|98417 : TT--T-T-----T---A-A-AT--A-----AG-A----A-C-TA-----TA------T---GA--A---------T----------------ATT---------GAGGGCCTC-AATGA---AGATT---A--------------T----------T---------T---CAA------C-TA---ATTGAG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAAAAAAGACT----T--TCATT
gi|98418 : aTT--T-T-----G---A-A-A------------A----T-G-TA-----TA------T---GT--A---------T------TTATTTGTTTATA--C------GAGGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----C-CA---ATTGAG--TT--AC---------A-TTC-TTT-AAATAAAGAtaat
gi|98419 : -----T---A-A-AT--A-----AT-G----T-A-TA-----TA------T---GT--T---------T----------------------------GAGGGCCTT-GTGGA---AGATT---A---------A----C----------T---------TGTTCAAA-------TG---ATT------T--AT---------C-CTG-TT--AAATAAAGACT----T--
gi|98420 : tgT--A-----GT-A----T-G-TA-----TA------T---GC--T---------TTTTAAAC---------AT---A------G-GGGCACC-AAGGA---AGAGT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98421 : ----T-G-TA-----AA------T---A------------------------------AT---A------GAGGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----C-TA---AATGTG--TA--AC---------C-CTC-CGT-AAATAAAGACT----
gi|98422 : ----T-G-TA-----AA------T----------------------------------AAA--A------GAGGGCCGC-ATAGA---AGATT---T---------G----T--------------------------AA-----C-TA---AATGTG--TT--AC---------A-CTC-TGT-AAATGAAGACT----
gi|98423 : -TA-----TA------T---GT--A---------T----------------ATT--T------GAGAGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----C-TAAACATT-----CT--AT---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98424 : A-----AA------T---GC--A---------T------G---------TTT--A------GAGGGCCGC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----C-TT---AATGTG--TC--AC---------G-ATC-TAT-AAATAAAG
gi|98425 : A-----AA------T---G---A---------C------C---------ATT--T------GAAAGCGTC-ATCAA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----C-TT---AATGTG--TC--AC---------C-CTC-TAT-AAATAAAG
gi|98426 : ------T---GT--A---------T------A---------ATT--GTT----GAGGGCCAC-AAGGA---CAATTGATA---------G----T----------G---------T-----AA-----C-TA---ACTGTG--TT--AC---------T-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98427 : ------C---------ATT--A------GAGGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----C-TA---ATCGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AGATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98428 : ---------ACT--A------GAGGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------GAGATTG---------T---------T---CCAA-----C-T-------GTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--
gi|98429 : --A------GAGGGCAGC-AAGGC---AGATT---A---------G----T----------TACTGATGTAT---TATA-----C-TA---ATTGTG--TT--AC---------C-TTC-TTG-AAATAAAG
gi|98430 : t--A------GAGGGCCGC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----C-TA---AATGTG--TC--A----------C-CTC-TAT-AAATAAAG
gi|98431 : t------GAGGGCCTC-AAGAA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----C-CA---ATTGAG--TTTCCC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98432 : ------GAGGGCCTC-AAGGG---AGATT---AGTGACTGCTG----T----------T---------T---TATA-----C-TT---ATTGTG--TT--AA---------C-CCC-TTG-AAATAAAG--T----T--TTATT
gi|98433 : AGGACCGC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----C-TG---CATGTG--TC--AT---------C-CTT-TGT-AAATAAAG
gi|98434 : -AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CGAA-----C-TA---ATTGGG--CG--AC---------C-CTC-TTT-AAA
gi|98435 : ---ATTGGA--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACG----T--CCATTCCAT
Alignments
lowQualScore : 11 333333333333333 11111111111 11111111111111111111111
lowQualScore : 22 2 111111111111111 333 4 444444 222 555 5555555 3333 1 4 4 11 7777777 1 44 111 66666666666666666 22 11 22222222222 0 0 0 11 55555 0 1111 0 0 333333 222222 2 00 333333333 55555555555555555555555 11111 2 0 111 111 222222222 3333 6666666666 222222222 88888 11111 1 00 00 333333333 0 0 0 1111 11
lowQualScore : .. . ............... ... . ...... ... ... ....... .... . . . .. ....... . .. ... ................. .. .. ........... . . . .. ..... . .... . . ...... ...... . .. ......... ....................... ..... . . ... ... ......... .... .......... ......... ..... ..... . .. .. ......... . . . .... ..
lowQualScore : 66 0 999999999999999 000 1 666666 888 000 2222222 1111 9 4 3 33 4444444 0 33 777 44444444444444444 00 11 22222222222 8 8 8 88 66666 8 6666 7 7 222222 777777 1 99 777777777 33333333333333333333333 55555 4 6 000 000 444444444 6666 9999999999 444444444 55555 55555 2 88 88 222222222 6 6 6 9999 55
consensus : AAAAT--GAT-ATATATA----TAT-AT-----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGNG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
Reference ( family-403 ) : AAAAT--GAT-ATATATA----TAT-AT-----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGNG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98367 : AAAAT----T-ATGTATA----TGT-A------GT---TATTATATTTCATATA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCCATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----TT-A-------TTGT--TTTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TAGGGAAAA------T-GT--A---------T-T-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAAGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AGATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98368 : aaAAAATTTGAT-ATATATAAT--TAT-GTA----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATGAA---T-------TTGCTTGCAATGAATGCTTAAATTGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--G---------T-T-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------A----T----------T---------T---CAAA-----CTTATTGGG--CG--AC---------C-CTC-TTT-CAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98369 : aAAAATA-GAT-ATACATA----TA---------AT---TATCATTTTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAATTGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TAC----T--G-------TTGT--AATT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-G----T-A-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-TT------T-------A---GG-----GGACCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAATGGCT----T--TCATTC
gi|98370 : aaAAAAT--GAT-ATATATA----TGT-A------GT---TATCATATTTCACATA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAACTGTTTT-AAT-TT------G---T-T--T---TGA----T--A-------ATGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-A-AA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------A-------A---GA-----GAACCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----TTAATTGGG--CT--AC---------C-CGC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCATa
gi|98371 : aaAAAAG--TAT-ATACATG----TAC-AT-----GTAGTTATCACCTGTAATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--G-----AA-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A-----------C-TT------T-------A---GA-----GGGCCCA-AAGAA---AGATC---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGAG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGAGT----T--TCATTC
gi|98372 : aAAAAT--TAT-ATATATA----TAT-A------GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TGGCTTGTAATG----CTTAAAATGTTTT--AT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--TATG--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------------G---------T-C-AT------T-------A---GA-----GAGTCCC-AATGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAAATGGG--CT--AC---------C-CTC-TTTAAAAAAAAGACT----T--TCATTCAATa
gi|98373 : aaAAAAT--GAT-ATATATG----T----T-----GT---TCTCATATTTCATGTA------CA---ATTAA---T-------TTGCTTGCATTG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--G---G---T-T--T---TAC----T--A-------TTAC--ACCT--TAT-----G---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---AA-----GGGCCCT-AAGGA---ATTTT---A---------G----T----------A---------T---AAAA-----TTAATTGGG--CT--AC---------CAATT-TTT-AAAGATAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98374 : aaAAAATT-GAT-TTATATA---------------GT---AATAATA----AT-TA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTACAATG----CTTAAAATATTTTTTAT-TT--T---G---T-T--T---TCA----A--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---C-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------A-C-TT------T-------A---GA-----GAGCCCT-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATGGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AAATAAAGACTTTAAT--CCATTCCAT
gi|98375 : aaAAAATT-GAT-ATGCATG----TA---------GT---TATCATTGATCAACTA------CA---ATCAT---A-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAA-GTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-C-----T---A-A-A-T--A-----AC-T----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-A-AT------T-------T---AA-----GGGCCCC-AAGT----AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTTATTGAG--CT--AC---------C-CTCTTTT-AAATAAAGACT----T--ACATTC
gi|98376 : aaAAAATT-GAT-ATTCATG----TA---------GT---TGTCATTTATCATGTA------CA---GTCAT---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGGTTT-TAT-TT--C---G---T-T--T---TAC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----CA------T-GT--T---------T-C-TT------T-------A---GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGAG--CT--Aa
gi|98377 : aaAAAT--CAT-ATATATA----TGT-A------GT---TATCATATTTCATGTA------TA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAGTG----CTTAATATGTTTT-TA--TT--T---G---T-T--T---T
gi|98378 : aacAAAAT--GAT-ATATATA----TAT-ATT----GT---TTTCATATTTTATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-AAT-TT--T---G---T-T--T---TAC----T--A-------TTGT--ATTT--C-T-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------A-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAGTTGGG--CT--AT---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98379 : AT-ATATATA----TAT-ATATATAGT---TATCATATTCCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGCTAT-TGT-TT--T---G---T-T--T---TG------------------------------------T---A-A-A-T--A-----AT-A----G-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCTC-ACGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAACTGGG--CT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98380 : aaa--GAT-ATATATAATTGTAT-GTA----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTGAAATATTTT-TAT-GT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGC--ATAT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-A-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------A-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---ACATT---A---------G----T----------G---------T---CAAA-----CTACTTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATCAAGATT----T--CCATTCCAT
gi|98381 : aaAAAAT--AATGATGTATA----TGT-A------GT---TATCATATTTCATGTA------TA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAACG----CTTA---TTTTTT-TTTATT--T---G---T-T--T---TGT----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---CA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTTGA--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--ACATTCCAT
gi|98382 : AAAAT--ATT-ATTCATT----TAA-AT-----------ACCATTTTTCATGTA------TA---ATCAA---TAATCAATTTGCTTGCAATG----CTTAAACTGTTTT--AC-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGA--ATTT--G-G-----T---A-A-A-T--A-----AA-T----T-G-AT-----AA------T-GT--A---------T-T-TT------C-------A---GA-----GGCCACC-AAGGACGAAGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTTGT--CT--AT---------C-CTC-TTT-CAATAAAGACT----T--TCATTC
gi|98383 : AAAT--GAT-ATATATG----TA---------AT---TATCATATTCCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTGT-TGT-TT--TTTTG---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---AA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------A---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AT---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCATa
gi|98384 : T---TATCATTTATCATGTAGTACTACA---ATCTA---T-------TAGCTTGAAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--G-T---------A-G-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-GAGGA---AGATC---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--TCATTCCAT
gi|98385 : aaattattatttaaaaAAT--GAT-A-ATA-A----TGT-A------GT---TATCACTTTTTATGTA------CA---ATCAA---A-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAAAAAT----AT-TT--T---G---T-G--T---TGC----T--A-------TTGTT-ATTT--G-T-----T---A-A-G----------AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-A-TT------T-------A---GA-----GGACCCC-AACGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTAATAAGG--CA--AT---------C-CTC-TTT-AAAT
gi|98386 : AT-GTATATAAT--TATGAA-----GT---TTTCATATTTCATGCA------TG---ATTAA---T-------TTGCCTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TAT----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--G-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AATGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTAGG--CT--ACGA-------C-TTC-T
gi|98387 : -ATATACA----TGT-A------GT---TATCAT-TTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------GTGCTTGCAATG----CTTAAA-TGTTTT-TAT-TT--T---GC--T-T--T---TGA----T--A-------TTGA--ACTT--T-T-----G---ACA-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------C-C--T------T-------AC--GA-----GGACTCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------C---CAAA-----TTAATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--TCATTC
gi|98388 : ----TAT-AT-----GT---CAT----TTT--TGTA------CA---GTCACGT-T-------TTGTTTGTA-TG------------G------AT-TT--T-------T-T--G---CGC----C----------TT-----TTC--T-T-----C---A-ACA-T--G-----ATTA----C-A-CA-----AG------T-TC--A---------T-TTAT------T-------T---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--AC---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----a
gi|98389 : tggtttT---TGTCAT--TGCATTTA------TA---AACAT---T-------ATG--TG-AATG----CTT-----GTTTTATAT-TT--T---AA--TGT--T---TG--------A-------TTAC--ATTG--T-T---------G-A-A-T--T-----TC-A----T-G-TT-----CA------TTGT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AGGGA---AGATT---A---------G----T----------G---------T-----AA-----CTAACTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98390 : agtttTGTA------TATATACCAAAACT-------TTGCTTATAATG----CTTAA------TT-GAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----C--A-------TGGT--ATTG--T-A-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GC--A---------T----T------TA------A---GA-----AAGCCCA-AATAT---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CAAATCGGG--CT--AT---------C-CT--TTA-AAATAAATTCT----T--TCATTC
gi|98391 : TAT--ATTT--C-T-----T---A-A-A-T--ATATATAT-G----T-G-TA-----AA------T-ATTGA---------TAT-AT------T-------T---GA-----GGGCCGC-AAGGG---AGATT---A---------G----TGACTACTGAGT---------C---TGTA-----CTAATTGTT--TT--AC---------C-CTC-TTG-AAATAAAGTCT----T--a
gi|98392 : tatctgtattatgtaatttggtgtaatggagaattttgttttataatattatgtgcaatgtttatttcaATGTA------CA---ATCAA---T-------TTCTTTGCAATG----CTTAACATGTT------------------------T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--G-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-TT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AGGGA---AGATA---A---------G----T----------T---------T---CAAC-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AAAT-AAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98393 : atg---A-A-A-T--A-----AT-AAAAAT-G-AA-----AACTCACTT-GT--A---------T-C-A-------------------GA-----GGGCCGC-GTGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTAAATGTG--TC--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAA
gi|98394 : atcatcaaacaattgcatgaatttttaatttggctatttgtttccatggtaacagaaaAATG----CTTG---T-TTTT-TAT-TTAAT---G---T-T--T---A---------A-------TTAT--ATTG--T-T---------G-A-A-T--T-----TC-A----T-G-TT-----AA------TTGT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AGGGA---AAATT---A---------A----T----------G---------T-----AA-----CTAGCTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAGAAT----T--
gi|98395 : AATG----CTT-----GTTTTATAT-TT--TAATG---T-T--T---A---------A-------TTAC--ATTG--T-T---------G-A-A-T--T-----TT-A----T-G-TT-----CA------TTGT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AAGGA---AGATT---A---------G-------------------------T---GATA-----TTAACTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98396 : TGTTTTATAT-TT--TAATG---T-T--T---AAT----T--A-------ATAC--ATTG--T-T-----G---A-A-T-TT-A-----AT-G----T---TC-----AT------T-GT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AGGGA---AGATT---A---------G----T----------G---------T-----AA-----CTAACTGTG--TT--AC---------T-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98397 : aatgccGT--ATTG--T-T-----C---A-----T--A-----AC-A----G-G-TA-----CA------T-----A---------T-C-TT------T-------G---GA-----GGACACA-AAGAT---AGATT---C---------T----T----------T---------T---CAAA-----CTATTTGCG--CT--AC---------T-CTA-TTT-AGATAAAGACT----T--TCGCTC
gi|98398 : ttaaaattataaattatttttgaatataagGTTTT-TACATT--T---GATAC-T--T---TACA---T--A-------TTAA--ATTG--T-T-----TGC-A-A-A-TTTA-----AT-A----T-----------A------T-GT--A---------T-T-GTAAATAAT-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--ACCCTCAAAGGC-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98399 : taacaAT-TC--T-------T-T--T---TGT----T----------TAGT--AGTT--T-T-------------A-T--G-----AT-A---------A-----AA------T-GT--G---------T-TTAA------T-------A---GA-----GAGCCAC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TTAC-----CTAAATATGTTTT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAG
gi|98400 : taaaGTTTT-TACATT--T---GATAT-T--T---TACATA-T--AAAATTGTTTGT--ATAT--T-T-----------A-A-T--A------C-A----T-G-TA-----CA------T-GT--A---------T-T-GTAAATAAT-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--AC---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98401 : aGTTTT-TACATT--T---GATAT-T--T---TACATATT--AAATGGT-TTGT--ATAT--T-TA----T---T-A-A-T--ACAT--GT-A----TTG-TA-----AA------T-------------------AT------T-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATATG--TA--AC---------C-CTC-TGT-GAATAAAGACT----
gi|98402 : aTGTATA-TAT-TT--T---G---T-TA-T---TAC----T-------------C--ACTT--T-TG----T---------T--A-----GC-A----T-G-TA-------------T-AT--A---------T-A-AT--------------A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------G----TGATTG-----T---------T---CCAA-----CT----GTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----TTATCATT
gi|98403 : aattttgtTGTATA-TAT-TT--T---G---T-TA-T---TAC----T-------------C--ACTT--T-G-----T---------T--A-----GC-A----T-G-TA-----TA------T-AA--A-----------------------------A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------G------------------------------AAATTATTCTAACTGTG--TT--AC---------C--TC-TTT-AAATAAAGATT----T--
gi|98404 : aattttgtTT-TAT-TT--T---T---T-T--T---T-C----C--A-------TTTA--AATT--T-TGAGTGT---A-A-A-T--A-----AT-A----T-----------A------T-GT--TCT-------T-C-AT------G-------AA--GA-----GGGCCCC-AAGGG---AGATT---A---------G----TAC--------T---------T---T-GA-----TTAATCGAT--GT--GA---------C-TTC-TCT-AAATTAAGATT----T--TTATTC
gi|98405 : attta------T-------A---AA-----GGGCCGT-ATGAA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----ATAAATGTG--TT--AC---------C-TTC-TAT-AAATAAAGa
gi|98406 : tttatttcatttatgtatatcttgttaataaT-TAT-TT--T---G---A-TAATAAATGT----TGAA-------TT-T--ATTT--T-T-----TCCTG-A-A-T--A-----AT-G----T-GATA-----AAA-----C-GA--A---------T-C--T------T-------A----------------C-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTTATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98407 : -TAT-TT--T---G---T-TA-T---TAC----T-------------C--ACTT--T-T-----------A-T-T--A-----AC-A----T-G-TA----------------T--A---------T-A-AT--------------A---GA-----GGACTAC-AGGGA---AGATT---A---------GAGAATA---------T---------T---CCAA-----CT----GTG--TT-------------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--
gi|98408 : T--T---G---C-T--T-----C----T--A-------TTGC--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AT---------G-CTT-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98409 : T--T---A---T-T--T---T-C----T--A-------TC-----TTT--T-T-----G---A-A-A-------------A----T-G-TA-----TA------T-TT--A---------T-TTAT------TTGTTTATAC--GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TA--AC---------C-TTT-TTT-AAATAAAGA
gi|98410 : --T---A---T-T--T---T-C----T--A-------T-----ATTT--T-T-----G---A-A-A-------------A----T-G-TA-----CA------T-GT--ACTTGTTTGTT-T-AT------A-------C---GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98411 : --T---A---T-T--T---T-C----T--A-------T-----ATTT--T-T-----G---A-A-AAT--GT----AT-A----T-G-TA-----CT------T-GT--T---------T-G-TT------T-------ATACGA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98412 : -------TTCT--ATCT--T-T-----TTGAA-A-A-T--GT----AT-A----T-G-TA-----CT------T-GT--T---------T-G-TT------T-------ATACGA-----GG-CCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------------AA-----CCATTTGAG--TT--AC---------C-CTC-TTT-AAGTAAAGA
gi|98413 : tatt----T--A-------TTGA--ATATAAT-G-----T---A-A-A-T--G-----AT-A----T-G-CA-----AA------T-GT--A---------T-G-TT------T-------A---GA-----GCGTCCCAAAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---AAAA-----A-AACATAA--AT--AC---------C-CTC-TCT-AAAT-AAGTCA----T--TCATTC
gi|98414 : ----T--A-------TTGT--ATTT--T-T-----A---T-A-G-C--A-----AG-A----G-G-TA-----AA------T-AT--T---------T-A-AT------TTG-----A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------GAGA-TTG--------T---------T---CAAA-----C----TGTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAa
gi|98415 : -------TTGTGGACTT--T-G-----T---A-A---T--A-----TT-A----T-G-TA-----CT------T-GT--T---------T-T-A---------------A---GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---T---------G----C----------T---------T---T--G-----TCAATCAAG--TC--AC---------C-CTT-TAT-AAATAAAGATT----
gi|98416 : TGT--TCTT--T-G-----T---A-A-T-T--AG----AT-A----T-A-TT-------------T-GT--T---------T-C-A---------------A---GA-----GGACCTC-AATGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T---T--A-----CCAATTCGG--TC--AC---------C-TTC-TAT-CAATAAA
gi|98417 : TT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AG-A----A-C-TA-----TA------T-GA--A---------T---AT------T-----------GA-----GGGCCTC-AATGA---AGATT---A--------------T----------T---------T---CAA------CTAATTGAG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAAAAAAGACT----T--TCATT
gi|98418 : aTT--T-T-----G---A-A-A-------------A----T-G-TA-----TA------T-GT--A---------T-TTAT------TTGTTTATAC--GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TT--AC---------A-TTC-TTT-AAATAAAGAtaat
gi|98419 : -----T---A-A-A-T--A-----AT-G----T-A-TA-----TA------T-GT-----------------T------T-----------GA-----GGGCCTT-GTGGA---AGATT---A---------A----C----------T---------TGTTCAAA------TGATT------T--AT---------C-CTG-TT--AAATAAAGACT----T--
gi|98420 : tg-T--A-----GT-A----T-G-TA-----TA------T-GC--T---------T-T--T------T-------A---AACATAGGGGCACC-AAGGA---AGAGT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98421 : ----T-G-TA-----AA------T-------------------AA------T-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--AC---------C-CTC-CGT-AAATAAAGACT----
gi|98422 : ----T-G-TA-----AA------T-AA--A-----------------------------A---GA-----GGGCCGC-ATAGA---AGATT---T---------G----T--------------------------AA-----CTAAATGTG--TT--AC---------A-CTC-TGT-AAATGAAGACT----
gi|98423 : -TA-----TA------T-GT--A---------T---AT------T-------T---GA-----GAGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAACATT--CT--AT---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98424 : A-----AA------T-GC--A---------T-G-TT------T-------A---GA-----GGGCCGC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTTAATGTG--TC--AC---------G-ATC-TAT-AAATAAAG
gi|98425 : A-----AA------T-G---A---------C-C-AT------T-------T---GA-----AAGCGTC-ATCAA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTTAATGTG--TC--AC---------C-CTC-TAT-AAATAAAG
gi|98426 : ------T-GT--A---------T-A-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AAGGA---CAATTGATA---------G----T----------G---------T-----AA-----CTAACTGTG--TT--AC---------T-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98427 : -C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATCGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AGATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98428 : -AC------T-------A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------GAGATTG---------T---------T---CCAA-----CT----GTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--
gi|98429 : ------T-------A---GA-----GGGCAGC-AAGGC---AGATT---A---------G----T----------TACTGATGTAT---TATA-----CTAATTGTG--TT--AC---------C-TTC-TTG-AAATAAAG
gi|98430 : ------T-------A---GA-----GGGCCGC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTAAATGTG--TC--A----------C-CTC-TAT-AAATAAAG
gi|98431 : ---GA-----GGGCCTC-AAGAA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TTTCCC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98432 : ---GA-----GGGCCTC-AAGGG---AGATT---AGTGACTGCTG----T----------T---------T---TATA-----CTTATTGTG--TT--AA---------C-CCC-TTG-AAATAAAG--T----T--TTATT
gi|98433 : A-----GGACCGC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTGCATGTG--TC--AT---------C-CTT-TGT-AAATAAAG
gi|98434 : -AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CGAA-----CTAATTGGG--CG--AC---------C-CTC-TTT-AAA
gi|98435 : ATTGGA--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACG----T--CCATTCCAT
Alignments
lowQualScore : 11 333333333333333 11111111111 11111111111111111111111
lowQualScore : 22 2 111111111111111 333 4 444444 222 555 5555555 3333 1 4 4 11 7777777 1 44 111 66666666666666666 22 11 22222222222 0 0 0 11 55555 0 1111 0 0 333333 222222 2 00 333333333 55555555555555555555555 11111 2 0 111 111 222222222 3333 6666666666 222222222 88888 11111 1 00 00 333333333 0 0 0 1111 11
lowQualScore : .. . ............... ... . ...... ... ... ....... .... . . . .. ....... . .. ... ................. .. .. ........... . . . .. ..... . .... . . ...... ...... . .. ......... ....................... ..... . . ... ... ......... .... .......... ......... ..... ..... . .. .. ......... . . . .... ..
lowQualScore : 66 0 999999999999999 000 1 666666 888 000 2222222 1111 9 4 3 33 4444444 0 33 777 44444444444444444 00 11 22222222222 8 8 8 88 66666 8 6666 7 7 222222 777777 1 99 777777777 33333333333333333333333 55555 4 6 000 000 444444444 6666 9999999999 444444444 55555 55555 2 88 88 222222222 6 6 6 9999 55
consensus : AAAAT--GAT-ATATATA----TAT-AT-----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGNG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
Reference ( family-403 ) : AAAAT--GAT-ATATATA----TAT-AT-----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGNG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98367 : AAAAT----T-ATGTATA----TGT-A------GT---TATTATATTTCATATA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCCATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----TT-A-------TTGT--TTTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TAGGGAAAA------T-GT--A---------T-T-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAAGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AGATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98368 : aaAAAATTTGAT-ATATATAAT--TAT-GTA----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATGAA---T-------TTGCTTGCAATGAATGCTTAAATTGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--G---------T-T-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------A----T----------T---------T---CAAA-----CTTATTGGG--CG--AC---------C-CTC-TTT-CAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98369 : aAAAATA-GAT-ATACATA----TA---------AT---TATCATTTTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAATTGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TAC----T--G-------TTGT--AATT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-G----T-A-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-TT------T-------A---GG-----GGACCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAATGGCT----T--TCATTC
gi|98370 : aaAAAAT--GAT-ATATATA----TGT-A------GT---TATCATATTTCACATA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAACTGTTTT-AAT-TT------G---T-T--T---TGA----T--A-------ATGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-A-AA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------A-------A---GA-----GAACCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----TTAATTGGG--CT--AC---------C-CGC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCATa
gi|98371 : aaAAAAG--TAT-ATACATG----TAC-AT-----GTAGTTATCACCTGTAATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--G-----AA-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A-----------C-TT------T-------A---GA-----GGGCCCA-AAGAA---AGATC---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGAG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGAGT----T--TCATTC
gi|98372 : aAAAAT--TAT-ATATATA----TAT-A------GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TGGCTTGTAATG----CTTAAAATGTTTT--AT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--TATG--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------------G---------T-C-AT------T-------A---GA-----GAGTCCC-AATGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAAATGGG--CT--AC---------C-CTC-TTTAAAAAAAAGACT----T--TCATTCAATa
gi|98373 : aaAAAAT--GAT-ATATATG----T----T-----GT---TCTCATATTTCATGTA------CA---ATTAA---T-------TTGCTTGCATTG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--G---G---T-T--T---TAC----T--A-------TTAC--ACCT--TAT-----G---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---AA-----GGGCCCT-AAGGA---ATTTT---A---------G----T----------A---------T---AAAA-----TTAATTGGG--CT--AC---------CAATT-TTT-AAAGATAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98374 : aaAAAATT-GAT-TTATATA---------------GT---AATAATA----AT-TA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTACAATG----CTTAAAATATTTTTTAT-TT--T---G---T-T--T---TCA----A--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---C-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------A-C-TT------T-------A---GA-----GAGCCCT-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATGGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AAATAAAGACTTTAAT--CCATTCCAT
gi|98375 : aaAAAATT-GAT-ATGCATG----TA---------GT---TATCATTGATCAACTA------CA---ATCAT---A-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAA-GTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-C-----T---A-A-A-T--A-----AC-T----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-A-AT------T-------T---AA-----GGGCCCC-AAGT----AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTTATTGAG--CT--AC---------C-CTCTTTT-AAATAAAGACT----T--ACATTC
gi|98376 : aaAAAATT-GAT-ATTCATG----TA---------GT---TGTCATTTATCATGTA------CA---GTCAT---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGGTTT-TAT-TT--C---G---T-T--T---TAC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----CA------T-GT--T---------T-C-TT------T-------A---GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGAG--CT--Aa
gi|98377 : aaAAAT--CAT-ATATATA----TGT-A------GT---TATCATATTTCATGTA------TA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAGTG----CTTAATATGTTTT-TA--TT--T---G---T-T--T---T
gi|98378 : aacAAAAT--GAT-ATATATA----TAT-ATT----GT---TTTCATATTTTATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-AAT-TT--T---G---T-T--T---TAC----T--A-------TTGT--ATTT--C-T-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------A-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAGTTGGG--CT--AT---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98379 : AT-ATATATA----TAT-ATATATAGT---TATCATATTCCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGCTAT-TGT-TT--T---G---T-T--T---TG------------------------------------T---A-A-A-T--A-----AT-A----G-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCTC-ACGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAACTGGG--CT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98380 : aaa--GAT-ATATATAATTGTAT-GTA----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTGAAATATTTT-TAT-GT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGC--ATAT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-A-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------A-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---ACATT---A---------G----T----------G---------T---CAAA-----CTACTTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATCAAGATT----T--CCATTCCAT
gi|98381 : aaAAAAT--AATGATGTATA----TGT-A------GT---TATCATATTTCATGTA------TA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAACG----CTTA---TTTTTT-TTTATT--T---G---T-T--T---TGT----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---CA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTTGA--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--ACATTCCAT
gi|98382 : AAAAT--ATT-ATTCATT----TAA-AT-----------ACCATTTTTCATGTA------TA---ATCAA---TAATCAATTTGCTTGCAATG----CTTAAACTGTTTT--AC-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGA--ATTT--G-G-----T---A-A-A-T--A-----AA-T----T-G-AT-----AA------T-GT--A---------T-T-TT------C-------A---GA-----GGCCACC-AAGGACGAAGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTTGT--CT--AT---------C-CTC-TTT-CAATAAAGACT----T--TCATTC
gi|98383 : AAAT--GAT-ATATATG----TA---------AT---TATCATATTCCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTGT-TGT-TT--TTTTG---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---AA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------A---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AT---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCATa
gi|98384 : T---TATCATTTATCATGTAGTACTACA---ATCTA---T-------TAGCTTGAAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--G-T---------A-G-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-GAGGA---AGATC---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--TCATTCCAT
gi|98385 : aaattattatttaaaaAAT--GAT-A-ATA-A----TGT-A------GT---TATCACTTTTTATGTA------CA---ATCAA---A-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAAAAAT----AT-TT--T---G---T-G--T---TGC----T--A-------TTGTT-ATTT--G-T-----T---A-A-G----------AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-A-TT------T-------A---GA-----GGACCCC-AACGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTAATAAGG--CA--AT---------C-CTC-TTT-AAAT
gi|98386 : AT-GTATATAAT--TATGAA-----GT---TTTCATATTTCATGCA------TG---ATTAA---T-------TTGCCTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TAT----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--G-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AATGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTAGG--CT--ACGA-------C-TTC-T
gi|98387 : -ATATACA----TGT-A------GT---TATCAT-TTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------GTGCTTGCAATG----CTTAAA-TGTTTT-TAT-TT--T---GC--T-T--T---TGA----T--A-------TTGA--ACTT--T-T-----G---ACA-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------C-C--T------T-------AC--GA-----GGACTCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------C---CAAA-----TTAATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--TCATTC
gi|98388 : ----TAT-AT-----GT---CAT----TTT--TGTA------CA---GTCACGT-T-------TTGTTTGTA-TG------------G------AT-TT--T-------T-T--G---CGC----C----------TT-----TTC--T-T-----C---A-ACA-T--G-----ATTA----C-A-CA-----AG------T-TC--A---------T-TTAT------T-------T---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--AC---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----a
gi|98389 : tggtttT---TGTCAT--TGCATTTA------TA---AACAT---T-------ATG--TG-AATG----CTT-----GTTTTATAT-TT--T---AA--TGT--T---TG--------A-------TTAC--ATTG--T-T---------G-A-A-T--T-----TC-A----T-G-TT-----CA------TTGT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AGGGA---AGATT---A---------G----T----------G---------T-----AA-----CTAACTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98390 : agtttTGTA------TATATACCAAAACT-------TTGCTTATAATG----CTTAA------TT-GAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----C--A-------TGGT--ATTG--T-A-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GC--A---------T----T------TA------A---GA-----AAGCCCA-AATAT---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CAAATCGGG--CT--AT---------C-CT--TTA-AAATAAATTCT----T--TCATTC
gi|98391 : TAT--ATTT--C-T-----T---A-A-A-T--ATATATAT-G----T-G-TA-----AA------T-ATTGA---------TAT-AT------T-------T---GA-----GGGCCGC-AAGGG---AGATT---A---------G----TGACTACTGAGT---------C---TGTA-----CTAATTGTT--TT--AC---------C-CTC-TTG-AAATAAAGTCT----T--a
gi|98392 : tatctgtattatgtaatttggtgtaatggagaattttgttttataatattatgtgcaatgtttatttcaATGTA------CA---ATCAA---T-------TTCTTTGCAATG----CTTAACATGTT------------------------T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--G-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-TT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AGGGA---AGATA---A---------G----T----------T---------T---CAAC-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AAAT-AAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98393 : atg---A-A-A-T--A-----AT-AAAAAT-G-AA-----AACTCACTT-GT--A---------T-C-A-------------------GA-----GGGCCGC-GTGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTAAATGTG--TC--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAA
gi|98394 : atcatcaaacaattgcatgaatttttaatttggctatttgtttccatggtaacagaaaAATG----CTTG---T-TTTT-TAT-TTAAT---G---T-T--T---A---------A-------TTAT--ATTG--T-T---------G-A-A-T--T-----TC-A----T-G-TT-----AA------TTGT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AGGGA---AAATT---A---------A----T----------G---------T-----AA-----CTAGCTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAGAAT----T--
gi|98395 : AATG----CTT-----GTTTTATAT-TT--TAATG---T-T--T---A---------A-------TTAC--ATTG--T-T---------G-A-A-T--T-----TT-A----T-G-TT-----CA------TTGT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AAGGA---AGATT---A---------G-------------------------T---GATA-----TTAACTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98396 : TGTTTTATAT-TT--TAATG---T-T--T---AAT----T--A-------ATAC--ATTG--T-T-----G---A-A-T-TT-A-----AT-G----T---TC-----AT------T-GT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AGGGA---AGATT---A---------G----T----------G---------T-----AA-----CTAACTGTG--TT--AC---------T-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98397 : aatgccGT--ATTG--T-T-----C---A-----T--A-----AC-A----G-G-TA-----CA------T-----A---------T-C-TT------T-------G---GA-----GGACACA-AAGAT---AGATT---C---------T----T----------T---------T---CAAA-----CTATTTGCG--CT--AC---------T-CTA-TTT-AGATAAAGACT----T--TCGCTC
gi|98398 : ttaaaattataaattatttttgaatataagGTTTT-TACATT--T---GATAC-T--T---TACA---T--A-------TTAA--ATTG--T-T-----TGC-A-A-A-TTTA-----AT-A----T-----------A------T-GT--A---------T-T-GTAAATAAT-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--ACCCTCAAAGGC-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98399 : taacaAT-TC--T-------T-T--T---TGT----T----------TAGT--AGTT--T-T-------------A-T--G-----AT-A---------A-----AA------T-GT--G---------T-TTAA------T-------A---GA-----GAGCCAC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TTAC-----CTAAATATGTTTT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAG
gi|98400 : taaaGTTTT-TACATT--T---GATAT-T--T---TACATA-T--AAAATTGTTTGT--ATAT--T-T-----------A-A-T--A------C-A----T-G-TA-----CA------T-GT--A---------T-T-GTAAATAAT-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--AC---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98401 : aGTTTT-TACATT--T---GATAT-T--T---TACATATT--AAATGGT-TTGT--ATAT--T-TA----T---T-A-A-T--ACAT--GT-A----TTG-TA-----AA------T-------------------AT------T-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATATG--TA--AC---------C-CTC-TGT-GAATAAAGACT----
gi|98402 : aTGTATA-TAT-TT--T---G---T-TA-T---TAC----T-------------C--ACTT--T-TG----T---------T--A-----GC-A----T-G-TA-------------T-AT--A---------T-A-AT--------------A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------G----TGATTG-----T---------T---CCAA-----CT----GTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----TTATCATT
gi|98403 : aattttgtTGTATA-TAT-TT--T---G---T-TA-T---TAC----T-------------C--ACTT--T-G-----T---------T--A-----GC-A----T-G-TA-----TA------T-AA--A-----------------------------A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------G------------------------------AAATTATTCTAACTGTG--TT--AC---------C--TC-TTT-AAATAAAGATT----T--
gi|98404 : aattttgtTT-TAT-TT--T---T---T-T--T---T-C----C--A-------TTTA--AATT--T-TGAGTGT---A-A-A-T--A-----AT-A----T-----------A------T-GT--TCT-------T-C-AT------G-------AA--GA-----GGGCCCC-AAGGG---AGATT---A---------G----TAC--------T---------T---T-GA-----TTAATCGAT--GT--GA---------C-TTC-TCT-AAATTAAGATT----T--TTATTC
gi|98405 : attta------T-------A---AA-----GGGCCGT-ATGAA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----ATAAATGTG--TT--AC---------C-TTC-TAT-AAATAAAGa
gi|98406 : tttatttcatttatgtatatcttgttaataaT-TAT-TT--T---G---A-TAATAAATGT----TGAA-------TT-T--ATTT--T-T-----TCCTG-A-A-T--A-----AT-G----T-GATA-----AAA-----C-GA--A---------T-C--T------T-------A----------------C-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTTATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98407 : -TAT-TT--T---G---T-TA-T---TAC----T-------------C--ACTT--T-T-----------A-T-T--A-----AC-A----T-G-TA----------------T--A---------T-A-AT--------------A---GA-----GGACTAC-AGGGA---AGATT---A---------GAGAATA---------T---------T---CCAA-----CT----GTG--TT-------------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--
gi|98408 : T--T---G---C-T--T-----C----T--A-------TTGC--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AT---------G-CTT-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98409 : T--T---A---T-T--T---T-C----T--A-------TC-----TTT--T-T-----G---A-A-A-------------A----T-G-TA-----TA------T-TT--A---------T-TTAT------TTGTTTATAC--GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TA--AC---------C-TTT-TTT-AAATAAAGA
gi|98410 : --T---A---T-T--T---T-C----T--A-------T-----ATTT--T-T-----G---A-A-A-------------A----T-G-TA-----CA------T-GT--ACTTGTTTGTT-T-AT------A-------C---GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98411 : --T---A---T-T--T---T-C----T--A-------T-----ATTT--T-T-----G---A-A-AAT--GT----AT-A----T-G-TA-----CT------T-GT--T---------T-G-TT------T-------ATACGA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98412 : -------TTCT--ATCT--T-T-----TTGAA-A-A-T--GT----AT-A----T-G-TA-----CT------T-GT--T---------T-G-TT------T-------ATACGA-----GG-CCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------------AA-----CCATTTGAG--TT--AC---------C-CTC-TTT-AAGTAAAGA
gi|98413 : tatt----T--A-------TTGA--ATATAAT-G-----T---A-A-A-T--G-----AT-A----T-G-CA-----AA------T-GT--A---------T-G-TT------T-------A---GA-----GCGTCCCAAAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---AAAA-----A-AACATAA--AT--AC---------C-CTC-TCT-AAAT-AAGTCA----T--TCATTC
gi|98414 : ----T--A-------TTGT--ATTT--T-T-----A---T-A-G-C--A-----AG-A----G-G-TA-----AA------T-AT--T---------T-A-AT------TTG-----A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------GAGA-TTG--------T---------T---CAAA-----C----TGTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAa
gi|98415 : -------TTGTGGACTT--T-G-----T---A-A---T--A-----TT-A----T-G-TA-----CT------T-GT--T---------T-T-A---------------A---GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---T---------G----C----------T---------T---T--G-----TCAATCAAG--TC--AC---------C-CTT-TAT-AAATAAAGATT----
gi|98416 : TGT--TCTT--T-G-----T---A-A-T-T--AG----AT-A----T-A-TT-------------T-GT--T---------T-C-A---------------A---GA-----GGACCTC-AATGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T---T--A-----CCAATTCGG--TC--AC---------C-TTC-TAT-CAATAAA
gi|98417 : TT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AG-A----A-C-TA-----TA------T-GA--A---------T---AT------T-----------GA-----GGGCCTC-AATGA---AGATT---A--------------T----------T---------T---CAA------CTAATTGAG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAAAAAAGACT----T--TCATT
gi|98418 : aTT--T-T-----G---A-A-A-------------A----T-G-TA-----TA------T-GT--A---------T-TTAT------TTGTTTATAC--GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TT--AC---------A-TTC-TTT-AAATAAAGAtaat
gi|98419 : -----T---A-A-A-T--A-----AT-G----T-A-TA-----TA------T-GT-----------------T------T-----------GA-----GGGCCTT-GTGGA---AGATT---A---------A----C----------T---------TGTTCAAA------TGATT------T--AT---------C-CTG-TT--AAATAAAGACT----T--
gi|98420 : tg-T--A-----GT-A----T-G-TA-----TA------T-GC--T---------T-T--T------T-------A---AACATAGGGGCACC-AAGGA---AGAGT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98421 : ----T-G-TA-----AA------T-------------------AA------T-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--AC---------C-CTC-CGT-AAATAAAGACT----
gi|98422 : ----T-G-TA-----AA------T-AA--A-----------------------------A---GA-----GGGCCGC-ATAGA---AGATT---T---------G----T--------------------------AA-----CTAAATGTG--TT--AC---------A-CTC-TGT-AAATGAAGACT----
gi|98423 : -TA-----TA------T-GT--A---------T---AT------T-------T---GA-----GAGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAACATT--CT--AT---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98424 : A-----AA------T-GC--A---------T-G-TT------T-------A---GA-----GGGCCGC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTTAATGTG--TC--AC---------G-ATC-TAT-AAATAAAG
gi|98425 : A-----AA------T-G---A---------C-C-AT------T-------T---GA-----AAGCGTC-ATCAA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTTAATGTG--TC--AC---------C-CTC-TAT-AAATAAAG
gi|98426 : ------T-GT--A---------T-A-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AAGGA---CAATTGATA---------G----T----------G---------T-----AA-----CTAACTGTG--TT--AC---------T-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98427 : -C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATCGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AGATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98428 : -AC------T-------A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------GAGATTG---------T---------T---CCAA-----CT----GTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--
gi|98429 : ------T-------A---GA-----GGGCAGC-AAGGC---AGATT---A---------G----T----------TACTGATGTAT---TATA-----CTAATTGTG--TT--AC---------C-TTC-TTG-AAATAAAG
gi|98430 : ------T-------A---GA-----GGGCCGC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTAAATGTG--TC--A----------C-CTC-TAT-AAATAAAG
gi|98431 : ---GA-----GGGCCTC-AAGAA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TTTCCC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98432 : ---GA-----GGGCCTC-AAGGG---AGATT---AGTGACTGCTG----T----------T---------T---TATA-----CTTATTGTG--TT--AA---------C-CCC-TTG-AAATAAAG--T----T--TTATT
gi|98433 : A-----GGACCGC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTGCATGTG--TC--AT---------C-CTT-TGT-AAATAAAG
gi|98434 : -AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CGAA-----CTAATTGGG--CG--AC---------C-CTC-TTT-AAA
gi|98435 : ATTGGA--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACG----T--CCATTCCAT
blockSeqs : TT G TATATATATA AGT A GTACTA TAT AAC AATCAAT AATG T T A AA TTTG AA AAA ACATATAAAATTGT GG AA TGAGTGT TT TATAT AAAA A CTCACT T CTTGTTTGT TTATTTGTTTATAC CATAG C CGA GAT GTGACTGCT AGAA GACTACTGAG ACTGATGTA GTTCA TTATT G CCTCAAAGG TTAA TA
blockSeqs : A . ATTGTATGTA . T . . GT . . T A A . AATG A . ACATATTAAATGGT T . TTCCT T CAT . A A T CT TTATTTGTTTATAC . C . . . AGAT GATTG . CA . G GA . .
blockSeqs : T . ATTATGTA . A . . . . . C A A . AATG A . GTTGAA . . TTTGA . T . A . T . TGTAAATAATA . C . . . AGA AC . CA . G . . .
blockSeqs : T . ATTATGAA . C . . . . . A A A . GATA A . ACATA . . TTGC . T . A . . . TGTAAATAATA . C . . . . TG . CA . A . . .
blockSeqs : T . TATATT . A . . . . . A . . . GATA . . GCTA . . ATG . G . A . . . GTTTATAC . C . . . . A . CA . G . . .
blockSeqs : . . TACAT . A . . . . . A . . . GATA . . ACTG . . TAT . . . A . . . GTTTATAC . C . . . . G . CA . G . . .
blockSeqs : . . TAAAT . A . . . . . A . . . GC . . GATA . . TGT . . . A . . . GATTGTT . C . . . . . . AA . G . . .
blockSeqs : . . TATAT . T . . . . . A . . . AA . . GCTA . . GT . . . A . . . GATTGTT . C . . . . . . CA . A . . .
blockSeqs : . . TGTA . T . . . . . A . . . G . . GCTA . . GT . . . C . . . GATTGTT . T . . . . . . CA . A . . .
blockSeqs : . . TATA . A . . . . . A . . . G . . ACTA . . GT . . . A . . . GATTGTT . C . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . . TGTA . A . . . . . A . . . G . . CAAA . . GT . . . A . . . AATTTGA . T . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . . TGTA . A . . . . . A . . . G . . GCTA . . GT . . . A . . . AATTGTT . C . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . . TGTA . A . . . . . A . . . G . . ACTA . . GT . . . A . . . TTATTT . C . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . . TGTA . A . . . . . C . . . G . . ACTA . . CT . . . A . . . ATATTT . C . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . . TA . T . . . . . A . . . G . . GCTA . . GT . . . A . . . TTAATA . C . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . . TT . A . . . . . A . . . G . . GTTA . . TT . . . A . . . CATGAA . C . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . TA . T . . . . . A . . . G . . GCTA . . GT . . . A . . . TATTA . C . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . TA . T . . . . . A . . . G . . GCTA . . GT . . . A . . . CTTTA . C . . . . . . TA . G . . .
blockSeqs : . TA . A . . . . . A . . . G . . GCTA . . GT . . . A . . . CATAA . C . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . GCTA . . GT . . . A . . . CTTTA . T . . . . . . CA . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . ATTA . . TT . . . C . . . CATTA . A . . . . . . GT . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . GATA . . GT . . . A . . . CATTA . C . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . GCCA . . TG . . . A . . . CTTTA . G . . . . . . TG . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . GCTA . . TC . . . A . . . AATTT . C . . . . . . CA . G . . .
blockSeqs : . . . . . G . . ATTA . . AT . . . A . . . CTTTA . G . . . . . . GA . T . . .
blockSeqs : . . . . . G . . GCC . . TT . . . A . . . CATAA . A . . . . . . CA . T . . .
blockSeqs : . . . G . . GTT . . GT . . . C . . . CATTA . A . . . . . . GT . T . . .
blockSeqs : . . . G . . ACT . . TG . . . A . . . CATAA . A . . . . . . TT . T . . .
blockSeqs : . . . G . . ACT . . TC . . . C . . . CATTA . C . . . . . . GT . C . . .
blockSeqs : . . . G . . CCA . . GT . . . A . . . TTTCA . T . . . . . . GT . T . . .
blockSeqs : . . . T . . ACT . . GT . . . C . . . CATTA . A . . . . . . CC . T . . .
blockSeqs : . . . G . . CTA . . TG . . . A . . . CATTA . T . . . . . . TA . T . . .
blockSeqs : . . . G . . CTA . . TG . . . T . . . ATTTA . T . . . . . . CA . T . . .
blockSeqs : . . . G . . CTA . . TG . . . A . . . CATTA . A . . . . . . CC . T . . .
blockSeqs : . . . A . . CTA . . GT . . . A . . . CTTAC . A . . . . . . CA . T . . .
blockSeqs : . . A . . GA . . TA . . . T . . . CTTTA . C . . . . . . AA . A . .
blockSeqs : . A . . G . . GT . . . C . . . CTTTG . G . . . . . . CA . T . .
blockSeqs : . . . . A . . GT . . . C . . . CATTA . A . . . . . . CA . G . .
blockSeqs : . . . . A . . TT . . . C . . . TATAC . C . . . . . . CA . T . .
blockSeqs : . . . . . . TG . . . A . . . GTTTA . T . . . . . . GT . G . .
blockSeqs : . . T . . . A . . . GTTTA . T . . . . . . GT . A . .
blockSeqs : . . T . . . C . . . CATTT . T . . . . . . TA . A . .
blockSeqs : . . T . . . T . . . CATTA . T . . . . . . CA . A . .
blockSeqs : . . T . . . T . . . TTAA . C . . . . . . CC . A .
blockSeqs : . . T . . . T . . . ATTA . A . . . . . . TA . A .
blockSeqs : . . T . . . T . . . AATA . T . . . . . . TA . T .
blockSeqs : . T . . . A . . . CTTA . T . . . . . . TA . A .
blockSeqs : . T . . . A . . . AATA . T . . . . . . CG . G .
blockSeqs : . . . T . . . TTTA . T . . . . . . A . A .
blockSeqs : . . . A . . . AATA . T . . . . . . A . A .
blockSeqs : . . . A . . . ATTT . C . . . . . . T . G .
blockSeqs : . . . . . TAA . T . . . . . . T . T .
blockSeqs : . . . . . CAA . G . . . . . . T . T .
blockSeqs : . . . . ATT . T . . . . . . A . T .
blockSeqs : . . . . CA . G . . . . . . A . T .
blockSeqs : . . . . TT . T . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . A . A . . . . . . . . T .
blockSeqs : A . C . . . . . . . . G .
blockSeqs : . A . . . . . . . . T .
blockSeqs : . G . . . . . . . . T .
blockSeqs : . G . . . . . . . . T .
blockSeqs : . T . . . . . . . . A .
blockSeqs : . T . . . . . . . . T .
blockSeqs : . G . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . G .
blockSeqs : .
blockSeqCons : GCTA************* A*****
originalCons : AAAAT--GAT-ATATATA----TAT-AT-----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGNG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
finalCons : AAAAT--GAT-ATATATA----TAT-AT-----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGCTA-------------TTGT--ATTT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TAA-----A------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGNG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
Alignments
lowQualScore : 11 333333333333333 11111111111 11111111111111111111111
lowQualScore : 22 2 111111111111111 333 4 444444 222 555 5555555 3333 1 4 4 11 7777777 1 44 111 66666666666666666 22 11 22222222222 0 0 0 11 55555 0 1111 0 0 333333 222222 2 00 333333333 55555555555555555555555 11111 2 0 111 111 222222222 3333 6666666666 222222222 88888 11111 1 00 00 333333333 0 0 0 1111 11
lowQualScore : .. . ............... ... . ...... ... ... ....... .... . . . .. ....... . .. ... ................. .. .. ........... . . . .. ..... . .... . . ...... ...... . .. ......... ....................... ..... . . ... ... ......... .... .......... ......... ..... ..... . .. .. ......... . . . .... ..
lowQualScore : 66 0 999999999999999 000 1 666666 888 000 2222222 1111 9 4 3 33 4444444 0 33 777 44444444444444444 00 11 22222222222 8 8 8 88 66666 8 6666 7 7 222222 777777 1 99 777777777 33333333333333333333333 55555 4 6 000 000 444444444 6666 9999999999 444444444 55555 55555 2 88 88 222222222 6 6 6 9999 55
consensus : AAAAT--GAT-ATATATA----TAT-AT-----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGNG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
Reference ( family-403 ) : AAAAT--GAT-ATATATA----TAT-AT-----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGNG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98367 : AAAAT----T-ATGTATA----TGT-A------GT---TATTATATTTCATATA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCCATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----TT-A-------TTGT--TTTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TAGGGAAAA------T-GT--A---------T-T-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAAGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AGATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98368 : aaAAAATTTGAT-ATATATAAT--TAT-GTA----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATGAA---T-------TTGCTTGCAATGAATGCTTAAATTGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--G---------T-T-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------A----T----------T---------T---CAAA-----CTTATTGGG--CG--AC---------C-CTC-TTT-CAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98369 : aAAAATA-GAT-ATACATA----TA---------AT---TATCATTTTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAATTGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TAC----T--G-------TTGT--AATT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-G----T-A-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-TT------T-------A---GG-----GGACCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAATGGCT----T--TCATTC
gi|98370 : aaAAAAT--GAT-ATATATA----TGT-A------GT---TATCATATTTCACATA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAACTGTTTT-AAT-TT------G---T-T--T---TGA----T--A-------ATGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-A-AA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------A-------A---GA-----GAACCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----TTAATTGGG--CT--AC---------C-CGC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCATa
gi|98371 : aaAAAAG--TAT-ATACATG----TAC-AT-----GTAGTTATCACCTGTAATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--G-----AA-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A-----------C-TT------T-------A---GA-----GGGCCCA-AAGAA---AGATC---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGAG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGAGT----T--TCATTC
gi|98372 : aAAAAT--TAT-ATATATA----TAT-A------GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TGGCTTGTAATG----CTTAAAATGTTTT--AT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--TATG--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------------G---------T-C-AT------T-------A---GA-----GAGTCCC-AATGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAAATGGG--CT--AC---------C-CTC-TTTAAAAAAAAGACT----T--TCATTCAATa
gi|98373 : aaAAAAT--GAT-ATATATG----T----T-----GT---TCTCATATTTCATGTA------CA---ATTAA---T-------TTGCTTGCATTG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--G---G---T-T--T---TAC----T--A-------TTAC--ACCT--TAT-----G---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---AA-----GGGCCCT-AAGGA---ATTTT---A---------G----T----------A---------T---AAAA-----TTAATTGGG--CT--AC---------CAATT-TTT-AAAGATAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98374 : aaAAAATT-GAT-TTATATA---------------GT---AATAATA----AT-TA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTACAATG----CTTAAAATATTTTTTAT-TT--T---G---T-T--T---TCA----A--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---C-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------A-C-TT------T-------A---GA-----GAGCCCT-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATGGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AAATAAAGACTTTAAT--CCATTCCAT
gi|98375 : aaAAAATT-GAT-ATGCATG----TA---------GT---TATCATTGATCAACTA------CA---ATCAT---A-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAA-GTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-C-----T---A-A-A-T--A-----AC-T----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-A-AT------T-------T---AA-----GGGCCCC-AAGT----AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTTATTGAG--CT--AC---------C-CTCTTTT-AAATAAAGACT----T--ACATTC
gi|98376 : aaAAAATT-GAT-ATTCATG----TA---------GT---TGTCATTTATCATGTA------CA---GTCAT---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGGTTT-TAT-TT--C---G---T-T--T---TAC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----CA------T-GT--T---------T-C-TT------T-------A---GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGAG--CT--Aa
gi|98377 : aaAAAT--CAT-ATATATA----TGT-A------GT---TATCATATTTCATGTA------TA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAGTG----CTTAATATGTTTT-TA--TT--T---G---T-T--T---T
gi|98378 : aacAAAAT--GAT-ATATATA----TAT-ATT----GT---TTTCATATTTTATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-AAT-TT--T---G---T-T--T---TAC----T--A-------TTGT--ATTT--C-T-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------A-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAGTTGGG--CT--AT---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98379 : AT-ATATATA----TAT-ATATATAGT---TATCATATTCCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGCTAT-TGT-TT--T---G---T-T--T---TG------------------------------------T---A-A-A-T--A-----AT-A----G-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCTC-ACGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAACTGGG--CT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98380 : aaa--GAT-ATATATAATTGTAT-GTA----GT---TATCATATTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTGAAATATTTT-TAT-GT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGC--ATAT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-A-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------A-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---ACATT---A---------G----T----------G---------T---CAAA-----CTACTTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATCAAGATT----T--CCATTCCAT
gi|98381 : aaAAAAT--AATGATGTATA----TGT-A------GT---TATCATATTTCATGTA------TA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAACG----CTTA---TTTTTT-TTTATT--T---G---T-T--T---TGT----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---CA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTTGA--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--ACATTCCAT
gi|98382 : AAAAT--ATT-ATTCATT----TAA-AT-----------ACCATTTTTCATGTA------TA---ATCAA---TAATCAATTTGCTTGCAATG----CTTAAACTGTTTT--AC-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGA--ATTT--G-G-----T---A-A-A-T--A-----AA-T----T-G-AT-----AA------T-GT--A---------T-T-TT------C-------A---GA-----GGCCACC-AAGGACGAAGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTTGT--CT--AT---------C-CTC-TTT-CAATAAAGACT----T--TCATTC
gi|98383 : AAAT--GAT-ATATATG----TA---------AT---TATCATATTCCATGTA------CA---ATCAA---T-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAATGTTGT-TGT-TT--TTTTG---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---AA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------A---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AT---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCATa
gi|98384 : T---TATCATTTATCATGTAGTACTACA---ATCTA---T-------TAGCTTGAAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--G-T---------A-G-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-GAGGA---AGATC---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--TCATTCCAT
gi|98385 : aaattattatttaaaaAAT--GAT-A-ATA-A----TGT-A------GT---TATCACTTTTTATGTA------CA---ATCAA---A-------TTGCTTGCAATG----CTTAAAAAAAT----AT-TT--T---G---T-G--T---TGC----T--A-------TTGTT-ATTT--G-T-----T---A-A-G----------AC-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-A-TT------T-------A---GA-----GGACCCC-AACGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTAATAAGG--CA--AT---------C-CTC-TTT-AAAT
gi|98386 : AT-GTATATAAT--TATGAA-----GT---TTTCATATTTCATGCA------TG---ATTAA---T-------TTGCCTGCAATG----CTTAAAATGTTTT-TAT-TT--T---G---T-T--T---TAT----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--G-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AATGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTAGG--CT--ACGA-------C-TTC-T
gi|98387 : -ATATACA----TGT-A------GT---TATCAT-TTTCATGTA------CA---ATCAA---T-------GTGCTTGCAATG----CTTAAA-TGTTTT-TAT-TT--T---GC--T-T--T---TGA----T--A-------TTGA--ACTT--T-T-----G---ACA-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------C-C--T------T-------AC--GA-----GGACTCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------C---CAAA-----TTAATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--TCATTC
gi|98388 : ----TAT-AT-----GT---CAT----TTT--TGTA------CA---GTCACGT-T-------TTGTTTGTA-TG------------G------AT-TT--T-------T-T--G---CGC----C----------TT-----TTC--T-T-----C---A-ACA-T--G-----ATTA----C-A-CA-----AG------T-TC--A---------T-TTAT------T-------T---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--AC---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----a
gi|98389 : tggtttT---TGTCAT--TGCATTTA------TA---AACAT---T-------ATG--TG-AATG----CTT-----GTTTTATAT-TT--T---AA--TGT--T---TG--------A-------TTAC--ATTG--T-T---------G-A-A-T--T-----TC-A----T-G-TT-----CA------TTGT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AGGGA---AGATT---A---------G----T----------G---------T-----AA-----CTAACTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98390 : agtttTGTA------TATATACCAAAACT-------TTGCTTATAATG----CTTAA------TT-GAT-TT--T---G---T-T--T---TGC----C--A-------TGGT--ATTG--T-A-----T---A-A-A-T--A-----AC-A----T-G-TA-----AA------T-GC--A---------T----T------TA------A---GA-----AAGCCCA-AATAT---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CAAATCGGG--CT--AT---------C-CT--TTA-AAATAAATTCT----T--TCATTC
gi|98391 : TAT--ATTT--C-T-----T---A-A-A-T--ATATATAT-G----T-G-TA-----AA------T-ATTGA---------TAT-AT------T-------T---GA-----GGGCCGC-AAGGG---AGATT---A---------G----TGACTACTGAGT---------C---TGTA-----CTAATTGTT--TT--AC---------C-CTC-TTG-AAATAAAGTCT----T--a
gi|98392 : tatctgtattatgtaatttggtgtaatggagaattttgttttataatattatgtgcaatgtttatttcaATGTA------CA---ATCAA---T-------TTCTTTGCAATG----CTTAACATGTT------------------------T---TGC----T--A-------TTGT--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--G-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-TT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AGGGA---AGATA---A---------G----T----------T---------T---CAAC-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTT-TTT-AAAT-AAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98393 : atg---A-A-A-T--A-----AT-AAAAAT-G-AA-----AACTCACTT-GT--A---------T-C-A-------------------GA-----GGGCCGC-GTGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTAAATGTG--TC--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAA
gi|98394 : atcatcaaacaattgcatgaatttttaatttggctatttgtttccatggtaacagaaaAATG----CTTG---T-TTTT-TAT-TTAAT---G---T-T--T---A---------A-------TTAT--ATTG--T-T---------G-A-A-T--T-----TC-A----T-G-TT-----AA------TTGT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AGGGA---AAATT---A---------A----T----------G---------T-----AA-----CTAGCTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAGAAT----T--
gi|98395 : AATG----CTT-----GTTTTATAT-TT--TAATG---T-T--T---A---------A-------TTAC--ATTG--T-T---------G-A-A-T--T-----TT-A----T-G-TT-----CA------TTGT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AAGGA---AGATT---A---------G-------------------------T---GATA-----TTAACTGTG--TT--AC---------C-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98396 : TGTTTTATAT-TT--TAATG---T-T--T---AAT----T--A-------ATAC--ATTG--T-T-----G---A-A-T-TT-A-----AT-G----T---TC-----AT------T-GT--A---------T-G-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AGGGA---AGATT---A---------G----T----------G---------T-----AA-----CTAACTGTG--TT--AC---------T-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98397 : aatgccGT--ATTG--T-T-----C---A-----T--A-----AC-A----G-G-TA-----CA------T-----A---------T-C-TT------T-------G---GA-----GGACACA-AAGAT---AGATT---C---------T----T----------T---------T---CAAA-----CTATTTGCG--CT--AC---------T-CTA-TTT-AGATAAAGACT----T--TCGCTC
gi|98398 : ttaaaattataaattatttttgaatataagGTTTT-TACATT--T---GATAC-T--T---TACA---T--A-------TTAA--ATTG--T-T-----TGC-A-A-A-TTTA-----AT-A----T-----------A------T-GT--A---------T-T-GTAAATAAT-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--ACCCTCAAAGGC-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98399 : taacaAT-TC--T-------T-T--T---TGT----T----------TAGT--AGTT--T-T-------------A-T--G-----AT-A---------A-----AA------T-GT--G---------T-TTAA------T-------A---GA-----GAGCCAC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TTAC-----CTAAATATGTTTT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAG
gi|98400 : taaaGTTTT-TACATT--T---GATAT-T--T---TACATA-T--AAAATTGTTTGT--ATAT--T-T-----------A-A-T--A------C-A----T-G-TA-----CA------T-GT--A---------T-T-GTAAATAAT-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--AC---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98401 : aGTTTT-TACATT--T---GATAT-T--T---TACATATT--AAATGGT-TTGT--ATAT--T-TA----T---T-A-A-T--ACAT--GT-A----TTG-TA-----AA------T-------------------AT------T-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATATG--TA--AC---------C-CTC-TGT-GAATAAAGACT----
gi|98402 : aTGTATA-TAT-TT--T---G---T-TA-T---TAC----T-------------C--ACTT--T-TG----T---------T--A-----GC-A----T-G-TA-------------T-AT--A---------T-A-AT--------------A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------G----TGATTG-----T---------T---CCAA-----CT----GTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----TTATCATT
gi|98403 : aattttgtTGTATA-TAT-TT--T---G---T-TA-T---TAC----T-------------C--ACTT--T-G-----T---------T--A-----GC-A----T-G-TA-----TA------T-AA--A-----------------------------A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------G------------------------------AAATTATTCTAACTGTG--TT--AC---------C--TC-TTT-AAATAAAGATT----T--
gi|98404 : aattttgtTT-TAT-TT--T---T---T-T--T---T-C----C--A-------TTTA--AATT--T-TGAGTGT---A-A-A-T--A-----AT-A----T-----------A------T-GT--TCT-------T-C-AT------G-------AA--GA-----GGGCCCC-AAGGG---AGATT---A---------G----TAC--------T---------T---T-GA-----TTAATCGAT--GT--GA---------C-TTC-TCT-AAATTAAGATT----T--TTATTC
gi|98405 : attta------T-------A---AA-----GGGCCGT-ATGAA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----ATAAATGTG--TT--AC---------C-TTC-TAT-AAATAAAGa
gi|98406 : tttatttcatttatgtatatcttgttaataaT-TAT-TT--T---G---A-TAATAAATGT----TGAA-------TT-T--ATTT--T-T-----TCCTG-A-A-T--A-----AT-G----T-GATA-----AAA-----C-GA--A---------T-C--T------T-------A----------------C-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTTATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98407 : -TAT-TT--T---G---T-TA-T---TAC----T-------------C--ACTT--T-T-----------A-T-T--A-----AC-A----T-G-TA----------------T--A---------T-A-AT--------------A---GA-----GGACTAC-AGGGA---AGATT---A---------GAGAATA---------T---------T---CCAA-----CT----GTG--TT-------------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--
gi|98408 : T--T---G---C-T--T-----C----T--A-------TTGC--ATTT--T-G-----T---A-A-A-T--A-----AT-A----T-G-TA-----AA------T-GT--A---------T-C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AT---------G-CTT-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTC
gi|98409 : T--T---A---T-T--T---T-C----T--A-------TC-----TTT--T-T-----G---A-A-A-------------A----T-G-TA-----TA------T-TT--A---------T-TTAT------TTGTTTATAC--GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TA--AC---------C-TTT-TTT-AAATAAAGA
gi|98410 : --T---A---T-T--T---T-C----T--A-------T-----ATTT--T-T-----G---A-A-A-------------A----T-G-TA-----CA------T-GT--ACTTGTTTGTT-T-AT------A-------C---GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98411 : --T---A---T-T--T---T-C----T--A-------T-----ATTT--T-T-----G---A-A-AAT--GT----AT-A----T-G-TA-----CT------T-GT--T---------T-G-TT------T-------ATACGA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TT--AC---------C-TTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98412 : -------TTCT--ATCT--T-T-----TTGAA-A-A-T--GT----AT-A----T-G-TA-----CT------T-GT--T---------T-G-TT------T-------ATACGA-----GG-CCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------------AA-----CCATTTGAG--TT--AC---------C-CTC-TTT-AAGTAAAGA
gi|98413 : tatt----T--A-------TTGA--ATATAAT-G-----T---A-A-A-T--G-----AT-A----T-G-CA-----AA------T-GT--A---------T-G-TT------T-------A---GA-----GCGTCCCAAAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---AAAA-----A-AACATAA--AT--AC---------C-CTC-TCT-AAAT-AAGTCA----T--TCATTC
gi|98414 : ----T--A-------TTGT--ATTT--T-T-----A---T-A-G-C--A-----AG-A----G-G-TA-----AA------T-AT--T---------T-A-AT------TTG-----A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------GAGA-TTG--------T---------T---CAAA-----C----TGTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAa
gi|98415 : -------TTGTGGACTT--T-G-----T---A-A---T--A-----TT-A----T-G-TA-----CT------T-GT--T---------T-T-A---------------A---GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---T---------G----C----------T---------T---T--G-----TCAATCAAG--TC--AC---------C-CTT-TAT-AAATAAAGATT----
gi|98416 : TGT--TCTT--T-G-----T---A-A-T-T--AG----AT-A----T-A-TT-------------T-GT--T---------T-C-A---------------A---GA-----GGACCTC-AATGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T---T--A-----CCAATTCGG--TC--AC---------C-TTC-TAT-CAATAAA
gi|98417 : TT--T-T-----T---A-A-A-T--A-----AG-A----A-C-TA-----TA------T-GA--A---------T---AT------T-----------GA-----GGGCCTC-AATGA---AGATT---A--------------T----------T---------T---CAA------CTAATTGAG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAAAAAAGACT----T--TCATT
gi|98418 : aTT--T-T-----G---A-A-A-------------A----T-G-TA-----TA------T-GT--A---------T-TTAT------TTGTTTATAC--GA-----GGGCCTC-AAGGA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TT--AC---------A-TTC-TTT-AAATAAAGAtaat
gi|98419 : -----T---A-A-A-T--A-----AT-G----T-A-TA-----TA------T-GT-----------------T------T-----------GA-----GGGCCTT-GTGGA---AGATT---A---------A----C----------T---------TGTTCAAA------TGATT------T--AT---------C-CTG-TT--AAATAAAGACT----T--
gi|98420 : tg-T--A-----GT-A----T-G-TA-----TA------T-GC--T---------T-T--T------T-------A---AACATAGGGGCACC-AAGGA---AGAGT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATTGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98421 : ----T-G-TA-----AA------T-------------------AA------T-------A---GA-----GGGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAATGTG--TA--AC---------C-CTC-CGT-AAATAAAGACT----
gi|98422 : ----T-G-TA-----AA------T-AA--A-----------------------------A---GA-----GGGCCGC-ATAGA---AGATT---T---------G----T--------------------------AA-----CTAAATGTG--TT--AC---------A-CTC-TGT-AAATGAAGACT----
gi|98423 : -TA-----TA------T-GT--A---------T---AT------T-------T---GA-----GAGCCTC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---GTAA-----CTAAACATT--CT--AT---------C-CTC-TGT-AAATAAAGACT----
gi|98424 : A-----AA------T-GC--A---------T-G-TT------T-------A---GA-----GGGCCGC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTTAATGTG--TC--AC---------G-ATC-TAT-AAATAAAG
gi|98425 : A-----AA------T-G---A---------C-C-AT------T-------T---GA-----AAGCGTC-ATCAA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTTAATGTG--TC--AC---------C-CTC-TAT-AAATAAAG
gi|98426 : ------T-GT--A---------T-A-AT------T-------GTT-GA-----GGGCCAC-AAGGA---CAATTGATA---------G----T----------G---------T-----AA-----CTAACTGTG--TT--AC---------T-CTC-ATT-AAATAAAG
gi|98427 : -C-AT------T-------A---GA-----GGGCCCC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CAAA-----CTAATCGGG--CT--AC---------C-CTC-TTT-AGATAAAGACT----T--CCATTCCAT
gi|98428 : -AC------T-------A---GA-----GGACCAC-AGGGA---AGATT---G---------GAGATTG---------T---------T---CCAA-----CT----GTG--TT---T---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACT----T--
gi|98429 : ------T-------A---GA-----GGGCAGC-AAGGC---AGATT---A---------G----T----------TACTGATGTAT---TATA-----CTAATTGTG--TT--AC---------C-TTC-TTG-AAATAAAG
gi|98430 : ------T-------A---GA-----GGGCCGC-ATGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T----AAA-----CTAAATGTG--TC--A----------C-CTC-TAT-AAATAAAG
gi|98431 : ---GA-----GGGCCTC-AAGAA---AGATT---G---------G----T----------T---------T------A-----CCAATTGAG--TTTCCC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGA
gi|98432 : ---GA-----GGGCCTC-AAGGG---AGATT---AGTGACTGCTG----T----------T---------T---TATA-----CTTATTGTG--TT--AA---------C-CCC-TTG-AAATAAAG--T----T--TTATT
gi|98433 : A-----GGACCGC-AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---TAAA-----CTGCATGTG--TC--AT---------C-CTT-TGT-AAATAAAG
gi|98434 : -AAGGA---AGATT---A---------G----T----------T---------T---CGAA-----CTAATTGGG--CG--AC---------C-CTC-TTT-AAA
gi|98435 : ATTGGA--CT--AC---------C-CTC-TTT-AAATAAAGACG----T--CCATTCCAT