lowQualScore : 111111
lowQualScore : 0 11 0 0 0 888888 1111 0 1111 0 111 22222222 1 66 0 22 111111 333 00 55 0 0 00 9999 0 1 1 0 222 222 0 00 1111 00
lowQualScore : . .. . . . ...... .... . .... . ... ........ . .. . .. ...... ... .. .. . . .. .... . . . . ... ... . .. .... ..
lowQualScore : 7 55 6 6 6 777777 3333 6 2222 6 000 77777777 2 33 6 33 777777 111 99 55 6 6 99 8888 6 3 3 7 555 555 7 99 5555 99
consensus : CAG-GGC--TT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGCCG-AN-A-TT-CG------GC--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTTT
Reference ( gi|93984 ) : CAG-GGC--TT-T-T-T-G----ACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGCCG-AT-A-TT-TG------GT--GGCT--T-TCC-AA-T--T--G-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTTT
gi|93991 : CAG-GGC--TT-T-T-T------ACCTT------TTAAA----CA-G---A--------GGCCG-AC-A-TT-TG------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AA-C---G---T-G--T----T--TTTTT
gi|93979 : CAG-GGC--AT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGCCG-AC-A-TT-CA------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-C---T---T-T--T----T--TTTTT
gi|93986 : CAG-GGC--TT-T-T-T-TTTTTACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGATG-AA-A-TT-TG------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--A----T--TTTTT
gi|93993 : CAG-GGC--CT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTATA----CG-G---A--------GGCCG-AC-A-TT-GG------GT--GGCT--G-CCC-AA-T--T--C-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTT
gi|93992 : CAG-TGC--TT-T-T-T-T----ATCTT----A-TTAAA----CA-TCATA--------GGCCG-AC-A-TT-TG------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--TA-A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTTT
gi|93989 : CAG-TGC--CT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTATA----CA-G---A--------GGCCG-GC-A-TT-CG------GT--GGCT--G-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTT
gi|93985 : CAG-GGC--TT-G-T-T-T----ACTTT----A-TTGAA----CA-G---A--------GGCTG-AA-A-TT-CG------GT--GGCT--T-CCC-AA----T--A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTTT
gi|93990 : CAG-GGC--GT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTCAA----CA-G---A--------GGCCG-AA-A-TT-TG------GT--GGCT--T-CTA-AA-T--G--A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTT
gi|94006 : CAG-GAC--TT-T-T-T-T----ATCTT----A-CTAAA----CA-G---A--------GGCCG-AT-A-TT-CG------AC--TGCT--T-TAC-AA-T--T--G-A-AA-A-AC-C---A---T-G--C----T--TTTT
gi|93980 : CAG-GGC--TT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGCCA-AA-A-TT-TG------GT--GGCT--T-CCA-AA-T--T--A-A-AA-C-AA-A---A---T-T--T----T--TTTTT
gi|94000 : CAG-GGC--TT-T-T-T-T----ACCTTTGAAA-TTAAA----CA-G---A--------GGCCG-AC-A-TT-CG------GT--GGCT--T-TCT-AA-T--T----C-AA-A-AT-C---T---T-G--T----TGGTTTTT
gi|94003 : CAG-GGCA-TT-T-C-T-T----ACTTT----A-TTAAA----CT-G---A--------GGCCG-AT-A-TT-TG------GC--TACT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-T---A---T-G--T----T--GTTTT
gi|94005 : CAG-CGC--TT-T-T-T-T----ATCTT----G-TTAAA----CA-G---A--------GGCCG-AT-A-TT-AG------GC--TACT--T-CCC-TA-T--T--G-A-AA-A-AT-C---ATAGT-G--T----T--TTTTTtttt
gi|93987 : CAA-GGC--TT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGCTG-AT-T-TT-CA------GT--GGCT--T-CCT-AA-T--TC-A-A-AA-A-AT-C---A---T-t
gi|93982 : CAG-GGC--TT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----AA-G---A--------GACCA-AA-A-TT-CT------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--C--A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--G----T--GTTTT
gi|93981 : CAG-GAC--TT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGCCA-AA-A-TT-CA------GT--GGCT--T-CCC-AT-T--TA-A-A-AA-A-AA-A---A---T-G--T----T--TTTTTt
gi|94004 : CAG-GGC--TT-T-A-T-T----ACCTT----A-TTGGA----CA-G---A--------TGCCC-ATTA-TC-CG------AC--AGCT--T-CCC-AA-T--T--G-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTTTt
gi|93999 : CAT-GGC--TT-T-T-T-T----ACCAC----A-TTAAA----TA-G---A--------GGCCT-AC-ATTT-TG------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--TAAA-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----G--TTTTT
gi|93994 : CAG-TGC--TT-T-T-T-TT---ATCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGCCA-AC-A-TT-TG------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--T--C-A-AA-A-tt
gi|94009 : CAG-GAC--AT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CT-G---A--------GGCTG-AT-A-TT-CG------AC--AACTACT-TCCTAA-T--T--G-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--GTTTT
gi|94001 : CAG-GGC--AT-T-T-T-T----ACCTT----A----------CA-G---A--------GGTCG-AA-A-TT-TG------AT--GGCT--T-CCA-AA-T--T--C-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTT
gi|93998 : CAG-GGC--TT-T-T-C-A----TCCTT----A-TATAA----CA-G---A--------GGCCG-AT-A-TT-CG------GC--CACT--T-CCC-AA-T--T--G-A-AA-A-ATGC---GT--T-A--T----T--TTTT
gi|94002 : CAGTGAC--TT-T-T-T-A----AC-TT----A-TGAAA----CA-G---A--------GGTCA-AA-C-TG-TG------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AA-C---A---T-G--T----T--TTTT
gi|93988 : CAG-GGC--TT-T-T-T-A----ACCTT----A-TAAAA----CA-T---A-----------------A-TT-TG-------T--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----G--TTTTT
gi|94007 : CAA-GGC--TT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CT-T---A--------GGTCA-AT-A-TT-CA------GA--TACT--T-GCC-AA-T--T--T-T-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTTT
gi|93996 : CAG-GGC--TT-T-T-T-T----ATCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGGCG-AC-A-TT-CA------AT--AACT--T-CCT-GA-T--T--C-A-AA-A-AA-C---C---T-C--T----T--TTTTT
gi|93983 : CAG-GGC--TG-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CAGG---A--------TGCCA-AC-A-TT-CG------GC--TACT--T-CCT-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-T---A---T-T--T----T--GTTTT
gi|93997 : CAG-GGC--TT-T-T-T-TT---ATCTT----A-TTAAA----CA-A---A--------GGCCA-AC-A-TT-CA------TC--AACT--T-CCC-AA-T--T--C-A-GA-A-AT-T---A---T-GGAT----T--TTTTT
gi|94017 : CAG-GGT--T-------------ACCTT----A-ATAAA----CC-G---AAATTATTAGGCCG-AA-A-TT-TG------GT--GGCT--T-AAC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-A---A---T-G--T----T--TTTT
gi|94016 : CAG-GGT--TT-A-A-T-A----GCCTT----A-TCTAA----CT-G---A--------GGCCG-AA-A-TT-CG------GTTGAGTT--T-CCC-AA-T--T----A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTT
gi|94025 : CAG-GGA--AT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTTAA----AA-A---A--------GTCTG-AT-A-TT-CA------GC--TACT--T-TCA-AA-T--T--C-A-AA-A-GT-C---A---T-G--T----T--TTT
gi|94024 : CAG-GTC--TT-T-T-T-A----A---T----A---AAA----TA-G---A--------GGCCA-AT-A-TT-TA------GC--TACT--T-CCC-AA-T--T--C-A-GA-A-AT-T---A---T-G--G----T--TTTTT
gi|94008 : CAG-GGA--TT-T-T-T-T----AGCTT----A-TTAAA----C--------------------------TT-CA------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--A----T--TTTTT
gi|94020 : CAG-GGC--TT-T-T-T-T----ACCTT----A-TT-AA----CA-G---A--------GGCCG-AC-A-T
gi|94027 : CAG-AGC--GT-T-T-T-T----ACCTT----A-TAAAA----CA-G---A--------GGCTG-AC-A-TT-AG------GT--GGC
gi|94015 : CAG-GGC--TT-T-T-T-T----ACCC---------AAA----AA--------------------------T-TG------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-ACAT-C---A---T-G--T----T--TTTT
gi|94012 : CAG-GGC--TT-T-T-TTA----ACCTT----A-TTAAAATTTTA----------------TTA-AA-A-TT-CG------GT--TGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-TT-C---A---T-G--T----T--
gi|94010 : CAT-GGC--TTTT-T-T-T----ACCTG----A-TGAAA----CA-A---A--------GGCAG-AC-A-TT-CA------GT--GACT--T-CCC-AA-T--T--A-A-
gi|94026 : CAG-GGA--TA-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----TA-G-----------------------------------T--GGCT--T-CCC-AA-T--T--C-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----A--TTTTT
gi|94022 : CAG-GGT--TT-T-T-T------ACCTA----A-TTA------CA-G---A--------GGCCA-AT-A-TT-TG------TC--TATT--T-CCC-AA-A--T--A-A-AA-A-AT-----A---C-C--T----T--TTT
gi|94021 : CAG-GGC--GT-TAT-T-T----ACCTT----A-TAAAA----CA-G---A--------GGCCG-AT-A-TT-GG------G
gi|94018 : CAG-AGC--TT-T-TAT-T----ACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGCCG-AA-A-Tatacagtgtcgccagtgttaacaaatcactttttattt
gi|94013 : CAG-GACCTTT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGTCA-AT-T-TTCTGCTACCAGT---ACT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AACA-AT-
gi|93995 : CAA-GAC--TT-G-T-T-T----ACCTT----A-TGAAA----CA-A---A--------CTCCA-AA-A-TT-CA------GC--TACT--T-CCC-GA-T--T--A-A-AA-ATAT-C---A---T-T--T----T--TTTT
gi|94011 : CAG-GAC--TG-T-T-G-T----ACCTT----A-TTAAG----TG-G---A--------GATCA-AA-A-TT-CA------GC--TCCT--T-CAC-AA-T--T--C-A-AA------C---A---T-T--T----T--TTT
gi|94019 : CAG-GAC--TG-T-T-T-T----AC---------TGAAA----CA-G---A--------AGCCA-A--A-----G------CT--CACT--T-CCC-AA-C--T--A-A-AA-A-CT-T---A---TAA--T----T--TTTTT
gi|94028 : AG-CGC--TT-T-T-T-T----ACTTT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGCCA-GC-A-TT-TG------GT--AGCT--T-TCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-C---A---T-A--TCAAAT--TTTTT
gi|94030 : AG-GGT--TA-T-T-T------ACTGT----A-TTAAA----CA-G---A--------GGCTG-AT-A-TT-CG------GC--TTCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-C---G---T-G--T----T--TTTTTtt
gi|94029 : AG-GAC--TT-T-C-T-T----ATCTA----A-TTAAA----TG-G---A--------GGCCT-TA-A-TT-TG------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-TA--A---T-G--T----T--TT
gi|94031 : AG-GGC--TT-T-T-T-C----GCCTT----A-TTACA----CA-A---A--------GGCAG-AA-A-TT-TG------GC--AA-T--T-CCC-AA-TACA--A-A-AA-A-AA-C---A---T-G--T----T--TCTTT
gi|94032 : AG-GGA--TT-T-T-T-T----ACCCT----A-TTAAG----CA-G---TT-------GGCAA-AT-A------------------CT--T-CAT-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTT
gi|94033 : AA-GGC--TT-T-T-T-T----AACTT----G-TTAAA----CA-G---G--------TGCTA-AA-A-TT-AG------GT--TATT--TACCC-AATT--T--G-A-AA-A-A
gi|94036 : G-GGC--TT-T-T-T-T----ACCTT----G-TAAAA----CA-G---A--------GATCG-TT-A-TT-TG------GC--TACT--T-CCT-AG-T--T--G-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTT
gi|94034 : G-GGC--TT-T-T--------ACTGT----ACTTAAC----CA-G---A--------GGCCA-AA-A-TT-CG------AC--TACT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTTT
gi|94037 : G-GAC--GT-T-T-T-A----ACCTT----A-TTAAT----CA-G---A--------GACAG-AT-A-TT-CT------GC--CACT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AA-T---A---A-G--T----T--TTTT
gi|94035 : G-GGC--TT-T-T-T-T----ACTTT----A-CTAAA----TA-C---A--------GGCAG-AT-A-TT-CA------GC--TGCA--A-CCC-AA-T--T--A-ATAA-A-AA-C---A---T-G--T----T--TTTTT
gi|94014 : G-GTC--TT-T-T-T------ACCAT----A-TATAA----TA-G---A--------GGCCA-AC-A-TT-CA------GT--GACT--T-CGC-AG-T--C--GAA-AA-A-AA-C---AC--T-A--T----T--TTTTT
gi|94038 : cat-GAC--TT-C-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------CGCCGAAA-A-AT-CG------GT--GGCT--T-CTC-AA-T--T--G-A-GGCA-AT-CTCAA---T-T--T----T--TTTTT
gi|94039 : -GGC--TG-T-T-C-T----ACCTT----A-TTAAG----CA-G---A--------GATCA-AA-A-TT-CC------GC--TACT--T-CAA-AA-T--T--C-A-AA------C---A---T-T--T----T--TTCT
gi|94041 : --TT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTGAA----CA-G---A--------GGCCG-AT-A-TC-CG------AC--TACT--T-CCC-AA-T--T--G-A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTTT
gi|94040 : --TT-T-T-T-T----ACCTT----A-TTAAA----CA-G---A--------AGCCA-AA-A-TT-TC------GT--GGCT--T-CCC-AA-G--T--A-A-AA-A-AA-C---A---T-G--T----T--TTTTT
gi|94042 : --TT-T-T-T-T----ACCTC----A-TTAGA----TA-G---A--------GGCCG-AT-A-TT-TG------GC--TTCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AG-CG--A---T-G--T----T--TTTTT
gi|94044 : --TT-T-T-T-T----ACCTT----A-ATAAA----CA-G---A--------GGCTG-AT-A--T-TG------GT--AACA--T-TCC-AT-T--T--G-A-AA-A-AT-C------------T----T--TTTTT
gi|94043 : --TT-T-T-T-T----ACCTT----A-CTAAA----CA-G---A--------AGCCGAAT-A-TT-TA------GT--TACT--T-CAT-AG-T--A--A-T-AA-A-AT-C---G---T-G--T----T--TTTTt
gi|94045 : ----ATCTT----A-TTAAA----CA-A---A--------GGCCG-AC-A-TA-CA------GT--AGCT--T-CCC-AA-T--A--A-A-AA-A-A
gi|94046 : CCTG----A-TTAAA----CA-G---A--------TGCCG-AA-A-TT-CG------AT--GACT--T-CCC-AA-T--T----A-AA-A-AT-C---A---T-G--T----T--TTTaaaaaatttcttttt
gi|94047 : -TTAAA----CA-G---A--------GGTCA-AC-A-TT-CG------CT--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-AA-A-AG-C---A---T-T--T----T--TTTTT
gi|94048 : ----CA-G---A--------GGCCA-GC----T-CA------GT--GGCT--T-CCC-AA-T--T--A-A-TA-A-AC-C---A---T-G--T----T--TTTTT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|94023 ): CAGGACTGTTGTACCTTATTAAGAGAGATAAAAATTCAGCTACTTCACAAGTCAAACATTTTTTT
Alignments
lowQualScore : 11 0 1111 1 0 1111 0 1111 111 22222222 1 22 0 7777777777777 0 0 00 00 44 0 1 1 222 111 0 00 1111 11 0
lowQualScore : .. . .... . . .... . .... ... ........ . .. . ............. . . .. .. .. . . . ... ... . .. .... .. .
lowQualScore : 44 6 9999 8 6 2222 6 2222 666 66666666 1 22 6 0000000000000 6 6 88 88 00 6 2 2 444 888 6 99 4444 66 7
consensus : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AN-A-TTCGG---C-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
Reference ( family-399 ) : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AN-A-TTCGG---C-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93979 : CAGGGC--ATT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-TTCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---T---T-T--T----T--TT-TTT
gi|93980 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CAA--AT--T--AA-AA-C-AAA---A---T-T--T----T--TT-TTT
gi|93981 : CAGGAC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-AA-A-TTCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--TT--TA-AA-AA-A-AAA---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93982 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----AAG---A--------GACCA-AA-A-TTCTG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--C--AA-AA-A-ATC---A---T-G--G----T--GT-TTTt
gi|93983 : CAGGGC--TGT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAGG--A--------TGCCA-AC-A-TTCGG---C-----T---ACTT-C-CTA--AT--T--AA-AA-A-ATT---A---T-T--T----T--GT-TTTt
gi|93984 : CAGGGC--TTT-T----TG-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTTGG---T-----G---GCTT-T-CCA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93985 : CAGGGC--TTG-T----TT-A-CTTT----A-TTGAA----CAG---A--------GGCTG-AA-A-TTCGG---T-----G---GCTT-C-CCA--A---T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93986 : CAGGGC--TTT-TTTTTTT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGATG-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--A----T--TT-TTT
gi|93987 : CAAGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCTG-AT-T-TTCAG---T-----G---GCTT-C-CTA--AT--TC-AA-AA-A-ATC---A---T-
gi|93988 : CAGGGC--TTT-T----TA-A-CCTT----A-TAAAA----CAT---A-----------------A-TTTG----T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----G--TT-TTT
gi|93989 : CAGTGC--CTT-T----TT-A-CCTT----A-TTATA----CAG---A--------GGCCG-GC-A-TTCGG---T-----G---GCTG-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|93990 : CAGGGC--GTT-T----TT-A-CCTT----A-TTCAA----CAG---A--------GGCCG-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-TAA--AT--G--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|93991 : CAGGGC--TTT-T----T--A-CCTT------TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AAC---G---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93992 : CAGTGC--TTT-T----TT-A-TCTT----A-TTAAA----CATCATA--------GGCCG-AC-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--TA-AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93993 : CAGGGC--CTT-T----TT-A-CCTT----A-TTATA----CGG---A--------GGCCG-AC-A-TTGGG---T-----G---GCTG-C-CCA--AT--T--CA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|93994 : CAGTGC--TTT-T----TTTA-TCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-AC-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--CA-AA-A-
gi|93995 : CAAGAC--TTG-T----TT-A-CCTT----A-TGAAA----CAA---A--------CTCCA-AA-A-TTCAG---C-----T---ACTT-C-CCG--AT--T--AA-AA-ATATC---A---T-T--T----T--TT-TT
gi|93996 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-TCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGGCG-AC-A-TTCAA---T-----A---ACTT-C-CTG--AT--T--CA-AA-A-AAC---C---T-C--T----T--TT-TTT
gi|93997 : CAGGGC--TTT-T----TTTA-TCTT----A-TTAAA----CAA---A--------GGCCA-AC-A-TTCAT---C-----A---ACTT-C-CCA--AT--T--CA-GA-A-ATT---A---T-GGAT----T--TT-TTT
gi|93998 : CAGGGC--TTT-T----CA-T-CCTT----A-TATAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTCGG---C-----C---ACTT-C-CCA--AT--T--GA-AA-A-AT----G---C-G--T----TA-TT-TTT
gi|93999 : CATGGC--TTT-T----TT-A-CCAC----A-TTAAA----TAG---A--------GGCCT-AC-ATTTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--TAAAA-AA-A-ATC---A---T-G--T----G--TT-TTTt
gi|94000 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTTTGAAA-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-TTCGG---T-----G---GCTT-T-CTA--AT--T---C-AA-A-ATC---T---T-G--T----TGGTT-TTTtt
gi|94001 : CAGGGC--ATT-T----TT-A-CCTT----A----------CAG---A--------GGTCG-AA-A-TTTGA---T-----G---GCTT-C-CAA--AT--T--CA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94002 : CAGTGA--CTT-T----TT-A-ACTT----A-TGAAA----CAG---A--------GGTCA-AA-C-TGTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AAC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94003 : CAGGGCA-TTT-C----TT-A-CTTT----A-TTAAA----CTG---A--------GGCCG-AT-A-TTTGG---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATT---A---T-G--T----T--GT-TTT
gi|94004 : CAGGGC--TTT-A----TT-A-CCTT----A-TTGGA----CAG---A--------TGCCC-ATTA-TCCGA---C-----A---GCTT-C-CCA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTTtttt
gi|94005 : CAGCGC--TTT-T----TT-A-TCTT----G-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTAGG---C-----T---ACTT-C-CCT--AT--T--GA-AA-A-ATC---ATAGT-G--T----T--TT-TTT
gi|94006 : CAGGAC--TTT-T----TT-A-TCTT----A-CTAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTCGA---C-----T---GCTT-T-ACA--AT--T--GA-AA-A-ACC---A---T-G--C----T--TT-TTt
gi|94007 : CAAGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CTT---A--------GGTCA-AT-A-TTCAG---A-----T---ACTT-G-CCA--AT--T--TT-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94008 : CAGGGA--TTT-T----TT-A-GCTT----A-TTAAA----C-------------------------TTCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--A----T--TT-TTT
gi|94009 : CAGGAC--ATT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CTG---A--------GGCTG-AT-A-TTCGA---C-----AACTACTT-C-CTA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--GT-TTT
gi|94010 : CATGGC--TTT-T----TTTA-CCTG----A-TGAAA----CAA---A--------GGCAG-AC-A-TTCAG---T-----G---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-
gi|94011 : CAGGAC--TGT-T----GT-A-CCTT----A-TTAAG----TGG---A--------GATCA-AA-A-TTCAG---C-----T---CCTT-C-ACA--AT--T--CA-AA-----C---A---T-T--T----T--TT-T
gi|94012 : CAGGGC--TTT-T----TT-AACCTT----A-TTAAAATTTTA---------------TTA-AA-A-TTCGG---T-----T---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-TTC---A---T-G--T----T--
gi|94013 : CAGGACCTTTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGTCA-AT-T-TTCTG---CTACCAGT--ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AACA-AT
gi|94014 : CATGGT--CTT-T----TT-A-CCAT----A-TATAA----TAG---A--------GGCCA-AC-A-TTCAG---T-----G---ACTT-C-GCA--GT--CG-AA-AA-A-AAC---AC--T-A--T----T--TT-TTT
gi|94015 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CC-----------------CAA---A---------------A-A-TT-GG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-ACATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94016 : CAGGGT--TTA-A----TA-G-CCTT----A-TCTAA----CTG---A--------GGCCG-AA-A-TTCGG---TTG---A---GTTT-C-CCA--AT--T---A-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|94017 : CAGGG------------TT-A-CCTT----A-ATAAA----CCG---AAATTATTAGGCCG-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-A-ACA--AT--T--AA-AA-A-ATA---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94018 : CAGAGC--TTT-TA---TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AA-A-T
gi|94019 : CAGGAC--TGT-T----TT-A-C---------TGAAA----CAG---A--------AGCCA-AA-G-CTCA---------------CTT-C-CCA--AC--T--AA-AA-A-CTT---A---TAA--T----T--TT-TTT
gi|94020 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TT-AA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-T
gi|94021 : CAGGGC--GTTAT----TT-A-CCTT----A-TAAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTGGGATAC-----A---GTGT-CGCCAGTGT--T--AA-CA-A-ATC---A---C-T--T----T--TTATTT
gi|94022 : CAGGG---TTT-T----TT-A-CCTA----A-TTA------CAG---A--------GGCCA-AT-A-TTTGT---C-----T---ATTT-C-CCA--AA--T--AA-AA-A-AT----A---C-C--T----T--TT-T
gi|94023 : CAGGAC--TGT-T----GT-A-CCTT----A-TTAAG-----AG---A--------GATAA-AA-A-TTCAG---C-----T---ACTT-C-ACA--AG--T--CA-AA-----C---A---T-T--T----T--TT-T
gi|94024 : CAGGTC--TTT-T----TA-A----T----A---AAA----TAG---A--------GGCCA-AT-A-TTTAG---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--CA-GA-A-ATT---A---T-G--G----T--TT-TTT
gi|94025 : CAGGGA--ATT-T----TT-A-CCTT----A-TTTAA----AAA---A--------GTCTG-AT-A-TTCAG---C-----T---ACTT-T-CAA--AT--T--CA-AA-A-GTC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|94026 : CAGGGA--TAT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----TAG-------------------------------T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--CA-AA-A-ATC---A---T-G--T----A--TT-TTT
gi|94027 : CAGAGC--GTT-T----TT-A-CCTT----A-TAAAA----CAG---A--------GGCTG-AC-A-TTAGG---T-----G---GC
gi|94028 : AGCGC--TTT-T----TT-A-CTTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-GC-A-TTTGG---T-----A---GCTT-T-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-A--TCAAAT--TT-TTT
gi|94029 : AGGAC--TTT-C----TT-A-TCTA----A-TTAAA----TGG---A--------GGCCT-TA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATTA--A---T-G--T----T--TT-tt
gi|94030 : AGGG---TTA-T----TT-A-CTGT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCTG-AT-A-TTCGG---C-----T---TCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---G---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94031 : AGGGC--TTT-T----TC-G-CCTT----A-TTACA----CAA---A--------GGCAG-AA-A-TTTGG---C-----A---A-TT-C-CCA--ATACA--AA-AA-A-AAC---A---T-G--T----T--TC-TTT
gi|94032 : AGGGA--TTT-T----TT-A-CCCT----A-TTAAG----CAG---TT-------GGC---AA-A-T-----------------ACTT-C-ATA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94033 : AAGGC--TTT-T----TT-A-ACTT----G-TTAAA----CAG---G--------TGCTA-AA-A-TTAGG---T-----T---ATTTAC-CCA--AT--TTGAA-AA-A-
gi|94034 : GGGC--TTT-T-------A-CTGT----ACTTAAC----CAG---A--------GGCCA-AA-A-TTCGA---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94035 : GGGC--TTT-T----TT-A-CTTT----A-CTAAA----TAC---A--------GGCAG-AT-A-TTCAG---C-----T---GCAA-C-CCA--AT--T--AATAA-A-AAC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94036 : GGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----G-TAAAA----CAG---A--------GATCG-TT-A-TTTGG---C-----T---ACTT-C-CTA--GT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|94037 : GGAC--GTT-T----TA-A-CCTT----A-TTAAT----CAG---A--------GACAG-AT-A-TTCTG---C-----C---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AAT---A---A-G--T----T--TT-TT
gi|94038 : GAC--TTC-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------CGCCGAAA-A-ATCGG---T-----G---GCTT-C-TCA--AT--T--GA-GGCA-ATCTCAA---T-T--T----T--TT-TTT
gi|94039 : GGC--TGT-T----CT-A-CCTT----A-TTAAG----CAG---A--------GATCA-AA-A-TTCCG---C-----T---ACTT-C-AAA--AT--T--CA-AA-----C---A---T-T--T----T--TT-CT
gi|94040 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------AGCCA-AA-A-TTTCG---T-----G---GCTT-C-CCA--AG--T--AA-AA-A-AAC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94041 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTGAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TCCGA---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94042 : --TTT-T----TT-A-CCTC----A-TTAGA----TAG---A--------GGCCG-AT-A-TTTGG---C-----T---TCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AGCG--A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94043 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-CTAAA----CAG---A--------AGCCGAAT-A-TTTAG---T-----T---ACTT-C-ATA--GT--A--AT-AA-A-ATC---G---T-G--T----T--TT-TT
gi|94044 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-ATAAA----CAG---A--------GGCTG-AT-A-TT-GG---T-----A---ACAT-T-CCA--TT--T--GA-AA-A-ATC------------T----T--TT-TTT
gi|94045 : -A-TCTT----A-TTAAA----CAA---A--------GGCCG-AC-A-TACAG---T-----A---GCTT-C-CCA--AT--A--AA-AA-A-At
gi|94046 : -CCTG----A-TTAAA----CAG---A--------TGCCG-AA-A-TTCGA---T-----G---ACTT-C-CCA--AT--T---A-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-Taaaaaatttcttttt
gi|94047 : -TTAAA----CAG---A--------GGTCA-AC-A-TTCGC---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AGC---A---T-T--T----T--TT-TTT
gi|94048 : ----CAG---A--------GGCCA-GC----TCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-TA-A-ACC---A---T-G--T----T--TT-TTT
Alignments
lowQualScore : 11 0 1111 1 0 1111 0 1111 111 22222222 1 22 0 7777777777777 0 0 00 00 44 0 1 1 222 111 0 00 1111 11 0
lowQualScore : .. . .... . . .... . .... ... ........ . .. . ............. . . .. .. .. . . . ... ... . .. .... .. .
lowQualScore : 44 6 9999 8 6 2222 6 2222 666 66666666 1 22 6 0000000000000 6 6 88 88 00 6 2 2 444 888 6 99 4444 66 7
consensus : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AN-A-TTCGG---C-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
Reference ( family-399 ) : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AN-A-TTCGG---C-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93979 : CAGGGC--ATT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-TTCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---T---T-T--T----T--TT-TTT
gi|93980 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CAA--AT--T--AA-AA-C-AAA---A---T-T--T----T--TT-TTT
gi|93981 : CAGGAC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-AA-A-TTCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--TT--TA-AA-AA-A-AAA---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93982 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----AAG---A--------GACCA-AA-A-TTCTG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--C--AA-AA-A-ATC---A---T-G--G----T--GT-TTTt
gi|93983 : CAGGGC--TGT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAGG--A--------TGCCA-AC-A-TTCGG---C-----T---ACTT-C-CTA--AT--T--AA-AA-A-ATT---A---T-T--T----T--GT-TTTt
gi|93984 : CAGGGC--TTT-T----TG-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTTGG---T-----G---GCTT-T-CCA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93985 : CAGGGC--TTG-T----TT-A-CTTT----A-TTGAA----CAG---A--------GGCTG-AA-A-TTCGG---T-----G---GCTT-C-CCA--A---T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93986 : CAGGGC--TTT-TTTTTTT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGATG-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--A----T--TT-TTT
gi|93987 : CAAGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCTG-AT-T-TTCAG---T-----G---GCTT-C-CTA--AT--TC-AA-AA-A-ATC---A---T-
gi|93988 : CAGGGC--TTT-T----TA-A-CCTT----A-TAAAA----CAT---A-----------------A-TTTG----T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----G--TT-TTT
gi|93989 : CAGTGC--CTT-T----TT-A-CCTT----A-TTATA----CAG---A--------GGCCG-GC-A-TTCGG---T-----G---GCTG-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|93990 : CAGGGC--GTT-T----TT-A-CCTT----A-TTCAA----CAG---A--------GGCCG-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-TAA--AT--G--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|93991 : CAGGGC--TTT-T----T--A-CCTT------TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AAC---G---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93992 : CAGTGC--TTT-T----TT-A-TCTT----A-TTAAA----CATCATA--------GGCCG-AC-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--TA-AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93993 : CAGGGC--CTT-T----TT-A-CCTT----A-TTATA----CGG---A--------GGCCG-AC-A-TTGGG---T-----G---GCTG-C-CCA--AT--T--CA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|93994 : CAGTGC--TTT-T----TTTA-TCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-AC-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--CA-AA-A-
gi|93995 : CAAGAC--TTG-T----TT-A-CCTT----A-TGAAA----CAA---A--------CTCCA-AA-A-TTCAG---C-----T---ACTT-C-CCG--AT--T--AA-AA-ATATC---A---T-T--T----T--TT-TT
gi|93996 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-TCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGGCG-AC-A-TTCAA---T-----A---ACTT-C-CTG--AT--T--CA-AA-A-AAC---C---T-C--T----T--TT-TTT
gi|93997 : CAGGGC--TTT-T----TTTA-TCTT----A-TTAAA----CAA---A--------GGCCA-AC-A-TTCAT---C-----A---ACTT-C-CCA--AT--T--CA-GA-A-ATT---A---T-GGAT----T--TT-TTT
gi|93998 : CAGGGC--TTT-T----CA-T-CCTT----A-TATAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTCGG---C-----C---ACTT-C-CCA--AT--T--GA-AA-A-AT----G---C-G--T----TA-TT-TTT
gi|93999 : CATGGC--TTT-T----TT-A-CCAC----A-TTAAA----TAG---A--------GGCCT-AC-ATTTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--TAAAA-AA-A-ATC---A---T-G--T----G--TT-TTTt
gi|94000 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTTTGAAA-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-TTCGG---T-----G---GCTT-T-CTA--AT--T---C-AA-A-ATC---T---T-G--T----TGGTT-TTTtt
gi|94001 : CAGGGC--ATT-T----TT-A-CCTT----A----------CAG---A--------GGTCG-AA-A-TTTGA---T-----G---GCTT-C-CAA--AT--T--CA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94002 : CAGTGA--CTT-T----TT-A-ACTT----A-TGAAA----CAG---A--------GGTCA-AA-C-TGTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AAC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94003 : CAGGGCA-TTT-C----TT-A-CTTT----A-TTAAA----CTG---A--------GGCCG-AT-A-TTTGG---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATT---A---T-G--T----T--GT-TTT
gi|94004 : CAGGGC--TTT-A----TT-A-CCTT----A-TTGGA----CAG---A--------TGCCC-ATTA-TCCGA---C-----A---GCTT-C-CCA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTTtttt
gi|94005 : CAGCGC--TTT-T----TT-A-TCTT----G-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTAGG---C-----T---ACTT-C-CCT--AT--T--GA-AA-A-ATC---ATAGT-G--T----T--TT-TTT
gi|94006 : CAGGAC--TTT-T----TT-A-TCTT----A-CTAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTCGA---C-----T---GCTT-T-ACA--AT--T--GA-AA-A-ACC---A---T-G--C----T--TT-TTt
gi|94007 : CAAGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CTT---A--------GGTCA-AT-A-TTCAG---A-----T---ACTT-G-CCA--AT--T--TT-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94008 : CAGGGA--TTT-T----TT-A-GCTT----A-TTAAA----C-------------------------TTCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--A----T--TT-TTT
gi|94009 : CAGGAC--ATT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CTG---A--------GGCTG-AT-A-TTCGA---C-----AACTACTT-C-CTA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--GT-TTT
gi|94010 : CATGGC--TTT-T----TTTA-CCTG----A-TGAAA----CAA---A--------GGCAG-AC-A-TTCAG---T-----G---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-
gi|94011 : CAGGAC--TGT-T----GT-A-CCTT----A-TTAAG----TGG---A--------GATCA-AA-A-TTCAG---C-----T---CCTT-C-ACA--AT--T--CA-AA-----C---A---T-T--T----T--TT-T
gi|94012 : CAGGGC--TTT-T----TT-AACCTT----A-TTAAAATTTTA---------------TTA-AA-A-TTCGG---T-----T---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-TTC---A---T-G--T----T--
gi|94013 : CAGGACCTTTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGTCA-AT-T-TTCTG---CTACCAGT--ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AACA-AT
gi|94014 : CATGGT--CTT-T----TT-A-CCAT----A-TATAA----TAG---A--------GGCCA-AC-A-TTCAG---T-----G---ACTT-C-GCA--GT--CG-AA-AA-A-AAC---AC--T-A--T----T--TT-TTT
gi|94015 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CC-----------------CAA---A---------------A-A-TT-GG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-ACATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94016 : CAGGGT--TTA-A----TA-G-CCTT----A-TCTAA----CTG---A--------GGCCG-AA-A-TTCGG---TTG---A---GTTT-C-CCA--AT--T---A-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|94017 : CAGGG------------TT-A-CCTT----A-ATAAA----CCG---AAATTATTAGGCCG-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-A-ACA--AT--T--AA-AA-A-ATA---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94018 : CAGAGC--TTT-TA---TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AA-A-T
gi|94019 : CAGGAC--TGT-T----TT-A-C---------TGAAA----CAG---A--------AGCCA-AA-G-CTCA---------------CTT-C-CCA--AC--T--AA-AA-A-CTT---A---TAA--T----T--TT-TTT
gi|94020 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TT-AA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-T
gi|94021 : CAGGGC--GTTAT----TT-A-CCTT----A-TAAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTGGGATAC-----A---GTGT-CGCCAGTGT--T--AA-CA-A-ATC---A---C-T--T----T--TTATTT
gi|94022 : CAGGG---TTT-T----TT-A-CCTA----A-TTA------CAG---A--------GGCCA-AT-A-TTTGT---C-----T---ATTT-C-CCA--AA--T--AA-AA-A-AT----A---C-C--T----T--TT-T
gi|94023 : CAGGAC--TGT-T----GT-A-CCTT----A-TTAAG-----AG---A--------GATAA-AA-A-TTCAG---C-----T---ACTT-C-ACA--AG--T--CA-AA-----C---A---T-T--T----T--TT-T
gi|94024 : CAGGTC--TTT-T----TA-A----T----A---AAA----TAG---A--------GGCCA-AT-A-TTTAG---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--CA-GA-A-ATT---A---T-G--G----T--TT-TTT
gi|94025 : CAGGGA--ATT-T----TT-A-CCTT----A-TTTAA----AAA---A--------GTCTG-AT-A-TTCAG---C-----T---ACTT-T-CAA--AT--T--CA-AA-A-GTC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|94026 : CAGGGA--TAT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----TAG-------------------------------T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--CA-AA-A-ATC---A---T-G--T----A--TT-TTT
gi|94027 : CAGAGC--GTT-T----TT-A-CCTT----A-TAAAA----CAG---A--------GGCTG-AC-A-TTAGG---T-----G---GC
gi|94028 : AGCGC--TTT-T----TT-A-CTTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-GC-A-TTTGG---T-----A---GCTT-T-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-A--TCAAAT--TT-TTT
gi|94029 : AGGAC--TTT-C----TT-A-TCTA----A-TTAAA----TGG---A--------GGCCT-TA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATTA--A---T-G--T----T--TT-tt
gi|94030 : AGGG---TTA-T----TT-A-CTGT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCTG-AT-A-TTCGG---C-----T---TCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---G---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94031 : AGGGC--TTT-T----TC-G-CCTT----A-TTACA----CAA---A--------GGCAG-AA-A-TTTGG---C-----A---A-TT-C-CCA--ATACA--AA-AA-A-AAC---A---T-G--T----T--TC-TTT
gi|94032 : AGGGA--TTT-T----TT-A-CCCT----A-TTAAG----CAG---TT-------GGC---AA-A-T-----------------ACTT-C-ATA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94033 : AAGGC--TTT-T----TT-A-ACTT----G-TTAAA----CAG---G--------TGCTA-AA-A-TTAGG---T-----T---ATTTAC-CCA--AT--TTGAA-AA-A-
gi|94034 : GGGC--TTT-T-------A-CTGT----ACTTAAC----CAG---A--------GGCCA-AA-A-TTCGA---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94035 : GGGC--TTT-T----TT-A-CTTT----A-CTAAA----TAC---A--------GGCAG-AT-A-TTCAG---C-----T---GCAA-C-CCA--AT--T--AATAA-A-AAC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94036 : GGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----G-TAAAA----CAG---A--------GATCG-TT-A-TTTGG---C-----T---ACTT-C-CTA--GT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|94037 : GGAC--GTT-T----TA-A-CCTT----A-TTAAT----CAG---A--------GACAG-AT-A-TTCTG---C-----C---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AAT---A---A-G--T----T--TT-TT
gi|94038 : GAC--TTC-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------CGCCGAAA-A-ATCGG---T-----G---GCTT-C-TCA--AT--T--GA-GGCA-ATCTCAA---T-T--T----T--TT-TTT
gi|94039 : GGC--TGT-T----CT-A-CCTT----A-TTAAG----CAG---A--------GATCA-AA-A-TTCCG---C-----T---ACTT-C-AAA--AT--T--CA-AA-----C---A---T-T--T----T--TT-CT
gi|94040 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------AGCCA-AA-A-TTTCG---T-----G---GCTT-C-CCA--AG--T--AA-AA-A-AAC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94041 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTGAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TCCGA---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94042 : --TTT-T----TT-A-CCTC----A-TTAGA----TAG---A--------GGCCG-AT-A-TTTGG---C-----T---TCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AGCG--A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94043 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-CTAAA----CAG---A--------AGCCGAAT-A-TTTAG---T-----T---ACTT-C-ATA--GT--A--AT-AA-A-ATC---G---T-G--T----T--TT-TT
gi|94044 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-ATAAA----CAG---A--------GGCTG-AT-A-TT-GG---T-----A---ACAT-T-CCA--TT--T--GA-AA-A-ATC------------T----T--TT-TTT
gi|94045 : -A-TCTT----A-TTAAA----CAA---A--------GGCCG-AC-A-TACAG---T-----A---GCTT-C-CCA--AT--A--AA-AA-A-At
gi|94046 : -CCTG----A-TTAAA----CAG---A--------TGCCG-AA-A-TTCGA---T-----G---ACTT-C-CCA--AT--T---A-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-Taaaaaatttcttttt
gi|94047 : -TTAAA----CAG---A--------GGTCA-AC-A-TTCGC---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AGC---A---T-T--T----T--TT-TTT
gi|94048 : ----CAG---A--------GGCCA-GC----TCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-TA-A-ACC---A---T-G--T----T--TT-TTT
blockSeqs : CT TTTT T TGAA ATTT CAT AATTATTA A TT CTACCAGT AA C T TCA TAG CAAA GG
blockSeqs : A A T . . G T A A CAACT TG C C A C . A
blockSeqs : . . T . . . . . A ATACA A . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TTGA C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TG G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CC . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C CA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T AT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T CC . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TA . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T TA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A TG . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C TG . . .
blockSeqs : . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AN-A-TTCGG---C-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
finalCons : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AN-A-TTCGG---C-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
Alignments
lowQualScore : 11 0 1111 1 0 1111 0 1111 111 22222222 1 22 0 7777777777777 0 0 00 00 44 0 1 1 222 111 0 00 1111 11 0
lowQualScore : .. . .... . . .... . .... ... ........ . .. . ............. . . .. .. .. . . . ... ... . .. .... .. .
lowQualScore : 44 6 9999 8 6 2222 6 2222 666 66666666 1 22 6 0000000000000 6 6 88 88 00 6 2 2 444 888 6 99 4444 66 7
consensus : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AN-A-TTCGG---C-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
Reference ( family-399 ) : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AN-A-TTCGG---C-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93979 : CAGGGC--ATT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-TTCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---T---T-T--T----T--TT-TTT
gi|93980 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CAA--AT--T--AA-AA-C-AAA---A---T-T--T----T--TT-TTT
gi|93981 : CAGGAC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-AA-A-TTCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--TT--TA-AA-AA-A-AAA---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93982 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----AAG---A--------GACCA-AA-A-TTCTG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--C--AA-AA-A-ATC---A---T-G--G----T--GT-TTTt
gi|93983 : CAGGGC--TGT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAGG--A--------TGCCA-AC-A-TTCGG---C-----T---ACTT-C-CTA--AT--T--AA-AA-A-ATT---A---T-T--T----T--GT-TTTt
gi|93984 : CAGGGC--TTT-T----TG-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTTGG---T-----G---GCTT-T-CCA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93985 : CAGGGC--TTG-T----TT-A-CTTT----A-TTGAA----CAG---A--------GGCTG-AA-A-TTCGG---T-----G---GCTT-C-CCA--A---T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93986 : CAGGGC--TTT-TTTTTTT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGATG-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--A----T--TT-TTT
gi|93987 : CAAGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCTG-AT-T-TTCAG---T-----G---GCTT-C-CTA--AT--TC-AA-AA-A-ATC---A---T-
gi|93988 : CAGGGC--TTT-T----TA-A-CCTT----A-TAAAA----CAT---A-----------------A-TTTG----T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----G--TT-TTT
gi|93989 : CAGTGC--CTT-T----TT-A-CCTT----A-TTATA----CAG---A--------GGCCG-GC-A-TTCGG---T-----G---GCTG-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|93990 : CAGGGC--GTT-T----TT-A-CCTT----A-TTCAA----CAG---A--------GGCCG-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-TAA--AT--G--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|93991 : CAGGGC--TTT-T----T--A-CCTT------TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AAC---G---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93992 : CAGTGC--TTT-T----TT-A-TCTT----A-TTAAA----CATCATA--------GGCCG-AC-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--TA-AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|93993 : CAGGGC--CTT-T----TT-A-CCTT----A-TTATA----CGG---A--------GGCCG-AC-A-TTGGG---T-----G---GCTG-C-CCA--AT--T--CA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|93994 : CAGTGC--TTT-T----TTTA-TCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-AC-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--CA-AA-A-
gi|93995 : CAAGAC--TTG-T----TT-A-CCTT----A-TGAAA----CAA---A--------CTCCA-AA-A-TTCAG---C-----T---ACTT-C-CCG--AT--T--AA-AA-ATATC---A---T-T--T----T--TT-TT
gi|93996 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-TCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGGCG-AC-A-TTCAA---T-----A---ACTT-C-CTG--AT--T--CA-AA-A-AAC---C---T-C--T----T--TT-TTT
gi|93997 : CAGGGC--TTT-T----TTTA-TCTT----A-TTAAA----CAA---A--------GGCCA-AC-A-TTCAT---C-----A---ACTT-C-CCA--AT--T--CA-GA-A-ATT---A---T-GGAT----T--TT-TTT
gi|93998 : CAGGGC--TTT-T----CA-T-CCTT----A-TATAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTCGG---C-----C---ACTT-C-CCA--AT--T--GA-AA-A-AT----G---C-G--T----TA-TT-TTT
gi|93999 : CATGGC--TTT-T----TT-A-CCAC----A-TTAAA----TAG---A--------GGCCT-AC-ATTTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--TAAAA-AA-A-ATC---A---T-G--T----G--TT-TTTt
gi|94000 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTTTGAAA-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-TTCGG---T-----G---GCTT-T-CTA--AT--T---C-AA-A-ATC---T---T-G--T----TGGTT-TTTtt
gi|94001 : CAGGGC--ATT-T----TT-A-CCTT----A----------CAG---A--------GGTCG-AA-A-TTTGA---T-----G---GCTT-C-CAA--AT--T--CA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94002 : CAGTGA--CTT-T----TT-A-ACTT----A-TGAAA----CAG---A--------GGTCA-AA-C-TGTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AAC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94003 : CAGGGCA-TTT-C----TT-A-CTTT----A-TTAAA----CTG---A--------GGCCG-AT-A-TTTGG---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATT---A---T-G--T----T--GT-TTT
gi|94004 : CAGGGC--TTT-A----TT-A-CCTT----A-TTGGA----CAG---A--------TGCCC-ATTA-TCCGA---C-----A---GCTT-C-CCA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTTtttt
gi|94005 : CAGCGC--TTT-T----TT-A-TCTT----G-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTAGG---C-----T---ACTT-C-CCT--AT--T--GA-AA-A-ATC---ATAGT-G--T----T--TT-TTT
gi|94006 : CAGGAC--TTT-T----TT-A-TCTT----A-CTAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTCGA---C-----T---GCTT-T-ACA--AT--T--GA-AA-A-ACC---A---T-G--C----T--TT-TTt
gi|94007 : CAAGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CTT---A--------GGTCA-AT-A-TTCAG---A-----T---ACTT-G-CCA--AT--T--TT-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94008 : CAGGGA--TTT-T----TT-A-GCTT----A-TTAAA----C-------------------------TTCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--A----T--TT-TTT
gi|94009 : CAGGAC--ATT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CTG---A--------GGCTG-AT-A-TTCGA---C-----AACTACTT-C-CTA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--GT-TTT
gi|94010 : CATGGC--TTT-T----TTTA-CCTG----A-TGAAA----CAA---A--------GGCAG-AC-A-TTCAG---T-----G---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-
gi|94011 : CAGGAC--TGT-T----GT-A-CCTT----A-TTAAG----TGG---A--------GATCA-AA-A-TTCAG---C-----T---CCTT-C-ACA--AT--T--CA-AA-----C---A---T-T--T----T--TT-T
gi|94012 : CAGGGC--TTT-T----TT-AACCTT----A-TTAAAATTTTA---------------TTA-AA-A-TTCGG---T-----T---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-TTC---A---T-G--T----T--
gi|94013 : CAGGACCTTTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGTCA-AT-T-TTCTG---CTACCAGT--ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AACA-AT
gi|94014 : CATGGT--CTT-T----TT-A-CCAT----A-TATAA----TAG---A--------GGCCA-AC-A-TTCAG---T-----G---ACTT-C-GCA--GT--CG-AA-AA-A-AAC---AC--T-A--T----T--TT-TTT
gi|94015 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CC-----------------CAA---A---------------A-A-TT-GG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-ACATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94016 : CAGGGT--TTA-A----TA-G-CCTT----A-TCTAA----CTG---A--------GGCCG-AA-A-TTCGG---TTG---A---GTTT-C-CCA--AT--T---A-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|94017 : CAGGG------------TT-A-CCTT----A-ATAAA----CCG---AAATTATTAGGCCG-AA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-A-ACA--AT--T--AA-AA-A-ATA---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94018 : CAGAGC--TTT-TA---TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCG-AA-A-T
gi|94019 : CAGGAC--TGT-T----TT-A-C---------TGAAA----CAG---A--------AGCCA-AA-G-CTCA---------------CTT-C-CCA--AC--T--AA-AA-A-CTT---A---TAA--T----T--TT-TTT
gi|94020 : CAGGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----A-TT-AA----CAG---A--------GGCCG-AC-A-T
gi|94021 : CAGGGC--GTTAT----TT-A-CCTT----A-TAAAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TTGGGATAC-----A---GTGT-CGCCAGTGT--T--AA-CA-A-ATC---A---C-T--T----T--TTATTT
gi|94022 : CAGGG---TTT-T----TT-A-CCTA----A-TTA------CAG---A--------GGCCA-AT-A-TTTGT---C-----T---ATTT-C-CCA--AA--T--AA-AA-A-AT----A---C-C--T----T--TT-T
gi|94023 : CAGGAC--TGT-T----GT-A-CCTT----A-TTAAG-----AG---A--------GATAA-AA-A-TTCAG---C-----T---ACTT-C-ACA--AG--T--CA-AA-----C---A---T-T--T----T--TT-T
gi|94024 : CAGGTC--TTT-T----TA-A----T----A---AAA----TAG---A--------GGCCA-AT-A-TTTAG---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--CA-GA-A-ATT---A---T-G--G----T--TT-TTT
gi|94025 : CAGGGA--ATT-T----TT-A-CCTT----A-TTTAA----AAA---A--------GTCTG-AT-A-TTCAG---C-----T---ACTT-T-CAA--AT--T--CA-AA-A-GTC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|94026 : CAGGGA--TAT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----TAG-------------------------------T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--CA-AA-A-ATC---A---T-G--T----A--TT-TTT
gi|94027 : CAGAGC--GTT-T----TT-A-CCTT----A-TAAAA----CAG---A--------GGCTG-AC-A-TTAGG---T-----G---GC
gi|94028 : AGCGC--TTT-T----TT-A-CTTT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCCA-GC-A-TTTGG---T-----A---GCTT-T-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-A--TCAAAT--TT-TTT
gi|94029 : AGGAC--TTT-C----TT-A-TCTA----A-TTAAA----TGG---A--------GGCCT-TA-A-TTTGG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATTA--A---T-G--T----T--TT-tt
gi|94030 : AGGG---TTA-T----TT-A-CTGT----A-TTAAA----CAG---A--------GGCTG-AT-A-TTCGG---C-----T---TCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---G---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94031 : AGGGC--TTT-T----TC-G-CCTT----A-TTACA----CAA---A--------GGCAG-AA-A-TTTGG---C-----A---A-TT-C-CCA--ATACA--AA-AA-A-AAC---A---T-G--T----T--TC-TTT
gi|94032 : AGGGA--TTT-T----TT-A-CCCT----A-TTAAG----CAG---TT-------GGC---AA-A-T-----------------ACTT-C-ATA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TT
gi|94033 : AAGGC--TTT-T----TT-A-ACTT----G-TTAAA----CAG---G--------TGCTA-AA-A-TTAGG---T-----T---ATTTAC-CCA--AT--TTGAA-AA-A-
gi|94034 : GGGC--TTT-T-------A-CTGT----ACTTAAC----CAG---A--------GGCCA-AA-A-TTCGA---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94035 : GGGC--TTT-T----TT-A-CTTT----A-CTAAA----TAC---A--------GGCAG-AT-A-TTCAG---C-----T---GCAA-C-CCA--AT--T--AATAA-A-AAC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94036 : GGGC--TTT-T----TT-A-CCTT----G-TAAAA----CAG---A--------GATCG-TT-A-TTTGG---C-----T---ACTT-C-CTA--GT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-T
gi|94037 : GGAC--GTT-T----TA-A-CCTT----A-TTAAT----CAG---A--------GACAG-AT-A-TTCTG---C-----C---ACTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AAT---A---A-G--T----T--TT-TT
gi|94038 : GAC--TTC-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------CGCCGAAA-A-ATCGG---T-----G---GCTT-C-TCA--AT--T--GA-GGCA-ATCTCAA---T-T--T----T--TT-TTT
gi|94039 : GGC--TGT-T----CT-A-CCTT----A-TTAAG----CAG---A--------GATCA-AA-A-TTCCG---C-----T---ACTT-C-AAA--AT--T--CA-AA-----C---A---T-T--T----T--TT-CT
gi|94040 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTAAA----CAG---A--------AGCCA-AA-A-TTTCG---T-----G---GCTT-C-CCA--AG--T--AA-AA-A-AAC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94041 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-TTGAA----CAG---A--------GGCCG-AT-A-TCCGA---C-----T---ACTT-C-CCA--AT--T--GA-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94042 : --TTT-T----TT-A-CCTC----A-TTAGA----TAG---A--------GGCCG-AT-A-TTTGG---C-----T---TCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AGCG--A---T-G--T----T--TT-TTT
gi|94043 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-CTAAA----CAG---A--------AGCCGAAT-A-TTTAG---T-----T---ACTT-C-ATA--GT--A--AT-AA-A-ATC---G---T-G--T----T--TT-TT
gi|94044 : --TTT-T----TT-A-CCTT----A-ATAAA----CAG---A--------GGCTG-AT-A-TT-GG---T-----A---ACAT-T-CCA--TT--T--GA-AA-A-ATC------------T----T--TT-TTT
gi|94045 : -A-TCTT----A-TTAAA----CAA---A--------GGCCG-AC-A-TACAG---T-----A---GCTT-C-CCA--AT--A--AA-AA-A-At
gi|94046 : -CCTG----A-TTAAA----CAG---A--------TGCCG-AA-A-TTCGA---T-----G---ACTT-C-CCA--AT--T---A-AA-A-ATC---A---T-G--T----T--TT-Taaaaaatttcttttt
gi|94047 : -TTAAA----CAG---A--------GGTCA-AC-A-TTCGC---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-AA-A-AGC---A---T-T--T----T--TT-TTT
gi|94048 : ----CAG---A--------GGCCA-GC----TCAG---T-----G---GCTT-C-CCA--AT--T--AA-TA-A-ACC---A---T-G--T----T--TT-TTT