lowQualScore : 11111111
lowQualScore : 1111 0 0 0 1 1111 00 333333333333 55555555555555 33333 22 0 0 111 111 00 222222222 1 4 00000000 0 1 6 1 44 0 0 0 00 2222222 000 0 0 111 11 0 00 0
lowQualScore : .... . . . . .... .. ............ .............. ..... .. . . ... ... .. ......... . . ........ . . . . .. . . . .. ....... ... . . ... .. . .. .
lowQualScore : 3333 6 6 6 2 3333 88 888888888888 55555555555555 44444 00 6 6 666 000 88 333333333 1 8 44444444 5 1 8 6 99 5 5 5 77 3333333 999 5 5 555 33 6 88 6
consensus : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
Reference ( gi|43521 ) : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATT----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43526 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------A-TATG----A--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-GA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43524 : TTTATTT----TATG-CTT-TT--G-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTTG---A---TT--AT---------T-TATA----G--T-A-A-T-C--T-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43528 : TTT-TTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG---A---TT--AT---------C-TATG----G--T-A-A-T-T--C-A-C-TCT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43532 : TTTATGT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-TTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-T-T-C--C-A-C-TGT--TT------TAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43522 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TT------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TTTG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TAT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43523 : TTTATTT----TATG-TTT-TT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--A----------T-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAACAA
gi|43525 : TTTATTT----TAGG-CTT-TT-TTTATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43527 : TTTATTT----CATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----TT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------TAA---A-CA-G---TT--G-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43529 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----ACC--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-TTAG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--G-AGAAAA
gi|43530 : TTTATTT----CATG-TTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A-A-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---CG--A-AATTATG--G-AA
gi|43531 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-AG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTAG---A---TA--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------GAA---A-CA-G---TA--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43538 : TTTATTG----TATG-CTT-TT--G-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-TTCA-GTGG---A---GT--AT---------T-TATT----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------TAA---A-TA-G---AG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43540 : TTTATTT----TATG-CTA-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TCG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--A-A-A-T-C--C-A----GT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATGCCA-AAAA
gi|43539 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AGT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GCGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A----GT--TT------CAA---A-CA-G---AG--A-AATTCAG--A-AAAA
gi|43541 : TTTTTTT----TTTG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------CAG--------------AG----AT--TT-TTCA-GCGG---A---TA--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-C--T-A-T-TGT--TT------GAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43543 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--GC---------T-CATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA------------TA--A-AATTAAA--A-AAAAAA
gi|43542 : TTTATTT-----ATT-CTT-TT-TG-ATG----AAT--CA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTAA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TA--A-AATAATG--
gi|43537 : TTTATTT----GGTG-CTT-TT-TG-ATA----AAT--TG------------TAG--------------GT----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AG---------T-TATTG---G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------TAA---A-GA-G---TG--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43534 : TTTATGT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AGT--TA------------TAT--------------AG----ATATTT-ATCA-GTGG---A---TT--AG---------T-TATG----G--A-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-CG-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAA
gi|43533 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--AA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGA---A---TA--AT---------T-TATG----G--TGA-A-T-C--A-A-A-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAACAA
gi|43535 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTC---------A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------C-A---A-CA-G---TG--G-AA-TATG--A-AAAAGA
gi|43544 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GT-G---A---CT--ATTCATATAAGT-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A----GT--TT------CGA---A-CA-G---TG--A-ATTTACG--A-AAAAAA
gi|43549 : TTTATTT----CATG-TTT-TT-TT-ATA----AAA--AA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-G-A-T-C--C-A-T-TGA--TA------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAA
gi|43536 : TTTATTT----TATG-GTT-TT-TGGATG----AAT--TA------------TGG--------------AT----AT--TT-CATA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A--------A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAA
gi|43546 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATA----AAA--TA------------TAT--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATA----T--T-A-A-T-C--C-A-C-TTG--TT------CTA---A-CA-G---TA--A-AAATATG--A-AAAAAA
gi|43545 : TTTATTT----TATG-CTT-TA-TG-ATG----AAT--TC------------TAG--------------AA----TT--TT-CTCA-GTGA---A---TT--GT---------T-TGTG----G--T-A-A-T-C--A-A-T-TCT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AGTTATG--A-ACAAAA
gi|43547 : TTCATTG----TATG-CTT-AT-TG-ATG----AAT--TA------------AAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--A-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-C-------------ATTATG--A-AAA
gi|43548 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-GG-ATG----AGT--TA------------CAC--------------AT----AT--TG-CTCA-GCGG---A---TT--AT---------C-TATG----G--T-A-G-T-C--C-C-C-TGT--TC------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTACG--A-
gi|43552 : TTTATTT----CTTG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TACTGGACCAGGTATAG--------------GT----AT--TT-CTAA-GTGG---A---AT--AT---------T-TATT----G--T-A-A-T-C--A-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-A---TG--A-AATTATG--G-AGAGAA
gi|43550 : TCTATTT----TATG-CTG-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-----------------------------------ATG----G--T-A-A-T-C--A-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43551 : TTTATTT----TAAG-TTT-TT-TC-ATG----AAT--TA------------GTG--------------AA----AT--TT-TTCA-TTGA---A---TT--AT---------T-TTTG----G--T-A-ATT-T--C-A-C-TGT--TT------GAA---A-TA-A---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43555 : TTTATTT----TATG-ATA-CT-TG-ATT----AAT--TA------------TTG--------------AG----AT--TT-CCTT-GTGA---A---TT--AT---------T-TTTT----GA-T-A-ATT-T--C-A-C-TG---TT------AAA---A-TA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43553 : TCTATTT----CTTG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TG------------TGG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA---A---TT--AT---------T-TGCG----G--T-A-A-TAT--C-A-G-TTTAATT------AAA---A-TA-G---TG--A-AATTA
gi|43561 : TTTGTTC----TATGTCTT-TT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTG-GTGG---A---TT--A----------T-CATT----GA-T-A-ATT-T--C-A-C-TG----------------------A---TG--A-AATTATG--A-A
gi|43557 : TTTATTT----AACA-CGT-TT-TG-ATG----AAT--TACA----------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA---A---TT--AT---------T-T-TT----GA-T-A-ATT-T--C-A-C-TGT--T--------AA---A-CA-
gi|43556 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TT-ATG----AAA--TC------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-TTGA---A---TT--AT---------T-T-TT----GA-T-A-A-T-T--C-A-C-ACT--TT------AAT---A-AA-G---TG--A-ACTTGT
gi|43562 : TTTATTTATGATATG-CGT-TT-TG-ATGGATAAAT--TA------------TAA--------------GG----AG--TT-CTCA-GTGACTTA---TT--AT---------T-TGTT----A--T-----T-T--C-A-C-TGT--TT------AAA---G-TT-G---TG--G-AATTATG--A-
gi|43560 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TA------------TAATTGTTTTTTTATACAG----AT--TT-CTCA-GAAC---A---TT--AT---------C-T-TT----GA-T-A-ATT-T--C-A-C-TGT--TA------TAA---A-TG-G---TG--A-AAATATA--A-A
gi|43564 : TTTGTTT----TATA-CTT-TT-TG-ATG----AAT--T------------------------------------AT--TT-CTTA-GTGA---A---TT--AT---------T-TTTTA---A--T-A-A-T-CA-C-A-C-TG---TT------GAA---A-AA-G---TA--A-AGT
gi|43559 : TTTATTT----CATG-TTT-CT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------TG----AT--TC-CTCA-GTAA---A---TT--AT---------T-T-TT----GA-T-A-A-T-T--T-A----AT--TGGAAAAAAAA---A-CA-T---TG--A-AATTATA--A-AA
gi|43565 : TTTATAT----TATG-TTT-TC-TG-AAG----A----TA------------AAA--------------AG----AG--TT-CTTA-GTGA---A---TT--GT---------T-TCTA----A--T-A-A-T-A--T-AAC-TGT--TT------CAA---T-CA-T---TA--A-AATTATA--A-A
gi|43567 : TTAATTT----TGTG-CTT-TT-TG-ACG----AAT--TA------------T----------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA---A---TT--AT---------T-T-TT----G--T-
gi|43554 : TTTATTT----GATG-CTT-TT-TG-GTG----AAT--TG------------TGG--------------AT----AT--AT-CTCA-GTGA---A---GC--AG---------T-T-TT----GA-T-A-ATT-T--C-A-C-TG---TT------AAA---G-AA-G---TA--A-AAtcatt
gi|43558 : TTTTTTT----TATT-CTTGTT-TT-ATG----ACT--TA------------TA---------------AG----AT--TT-TTCCCGTGA---A---TT--AA---------T-TTTG----G--T-A-A-A-CG-C-G-C-TGT--TA------CAA---G-CA-G---TG--A-AAT------A-AAAAAA
gi|43563 : TTTGTTT----TACG-CTT-TT-TG-ATA----AATTGTA------------TAGATAT----------AG----AT--AT-TTTA-GTGAT--G---TT--CT---------T-T-TG----G--T-A-ATT-T--C-A-C-TGT--TT-------AA---A--A-G---TG--A-CATTATA--A-A
gi|43566 : TTTTTTT----TATG-GTT-TT-TG-ATG----GCT--AA------------TAG--------------AATGATAT--TT-CTCA-GTGA---A---TT--GT---------T---CT----GA-C-A-ACT-CT-C-A-A-TAT--TT------ATA---A-AA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43569 : TTATTT----CATG-TTA-TA-TG-ATG----AAT--TA------------TAA--------------AT----AT--TT-ATCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----A--T-A-A-T-C--C-A----GT--TT------CAC---A-CA-G---TG--A-AATTTTG--A-AAAAAA
gi|43571 : TCATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAT--------------AA----AT--TT-CTCA-GT-G---ATTTTT--AT---------T-TTTT----C--T-A-T-T-T--C-A-G-TG---TT------AGA---A-TA-A---AG--A-AATTATG--A-AA
gi|43572 : TTGTTT----T--G-CGA-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------A------T--TT-CTCA-GTGA---A---AT--AT---------T-TTTT----G--T-A-CTT-C--C-A-C-TGT--TT------GAA---A-TA-G---AG--A-AATTA----A-AAA
gi|43570 : TTATTT----TATG---T-TT-TG-ATA----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GCGA---A---TT--AT---------T-T-TT----GA-T-ATT-T-T--C-A-C-TGT--TG------CAA---A-TATG---TGTTA-AGTTA
gi|43573 : TTGTTT----TGCA-CTT-GG-TG-ATG----AAT--TA------------CAA--------------AT----AG--TT-GTCA-GTGG--------T--AG---------T-T--T----G--T-A-A-T-TT-C-A-C-TGT--TT------GGA---A-TA-G---TG--A-AATTGTG--A-A
gi|43568 : TTATTT----TTTG-CGT-TTGTA-AGA----AAA--TA------------TAG--------------AA----GT--TT-CTCA-GTTA---A---AT--AT---------A-TTTG----G--T-A-A-T-TTTC-A-T-T-T--TT------CAA---AACA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43574 : TATTT----TATG-CCT-TT-TG-ATG----ACA--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG---G---TT--AT---------T-TATA----G--T-A-A-T-C--A-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-A---T
gi|43575 : TATTT----TACG-TTT-AT-TA-ATG----ATT--TT------------TGG--------------AG----AT--GT-CTCC-GTGA---A---TT--AT---------TATATT---------A-A-T-T--TTA-A-TGT--TT------AAA---A-TA-G---AG--A-AATTATG--A-A
gi|43576 : TATTT----TATG-ATT-TT--G-GTG----ATT--TG------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTAA---A---TT---C---------T-TATTA---A--T-A-GTT-T--C-A-C-TG---TT------CAATATA-CA-AAATTG--GCAATTATG--
gi|43577 : ATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-T--C-C-T-TCT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AA
gi|43578 : ATTT----TGTG-CTT-TT-TG-TTG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AA--TT-CTCA-GTGA---A---TT--AT---------T-TCTG----A--T-A-T-T-T--C-C-C-TGT--T
gi|43579 : ATTT----T-----TT-TT-TT-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--AT-CCCT-GTGA---A---TTAGAT---------T-TG------A--T-A-ATT-T--C-A-C-TGC--TT------GAA---A-CA-G---TG--A-AATTA----A-AAA
gi|43580 : TTT----TATG-CTG-TT-TC-ATA----AAT--TT------------TAGAT------------AA----ATC-TT-ATCA-GTGA---A---TT--AT---------T-TTTA----A--T-A-ATT-T--C-A-C-TGT--TG------AAA---A-AA-GT--TG--A-AATTGTA--A-A
gi|43581 : TT----TATT-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAA--------------AT----AT--TTTCTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-AAGAGA
gi|43582 : TT----TA---CCT-TT-TA-ATG----AAA--TG------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA---A---TT--AT---------T-T-TT----GA-T-A-A-TAT--C-A-C-TGT--TA------AAA---A-CA-----TT--A-CATTA-G--A-AA
gi|43583 : T----CATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----ATG-TT-TTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-CATG----G--T-A-A-T-C--C-A-C-TGT--TT------CAA---A-C------TG--A-AATTATG--G-AAAAAA
gi|43584 : T----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------C----------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA---A---TT--AT---------T-TA-----------A--------C-A-A-TAT--TT------AAA---A-AA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43585 : TT-TT-TG-ATA----AAT--TA------------CAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GCTG---A---TT--AT---------T-GATA----G--T-A-A-T-C--A-A-C-TGT--TT------CAA---A-TA-G---TG--A-AATT
gi|43586 : -TT-TG-ATA----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTGA-GCGT---A---TT--AT---------T-T-TT----GA-T-ATT-T-T--C-A-C-TGT--TG------CAA---A-TA-
gi|43587 : -TG-ATA----AAT--TA------------TTG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA---A---TT--AT---------G-T-TT----GATC-A-T-T-T--T-A-T-TGT--TG------AAG---A-CA-G---TGA-A-AATTATG--A-A
gi|43588 : TG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA---A---TT--AT---------T-TGTC----A--T-A-ATT-T--C-A-C-TGT--TT------AAA---A-TA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43589 : ------------TAG--------------AA----AT--TT-CTCA-GTGG---A---TT--AT---------T-TATTAATGA--T-T-A-T-C--C-C-C-TG---TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATCATG--ATAAAGAA
gi|43590 : G----AT--TT-CTCA-GTGA---A---AT--AC---------T-TATG----A--T-G-A-T-T--T-A-TGTAT--TT------GAA---A-CA-G---TG--A-AATAATA--A-AAAAAA
gi|43526 : gatCA-GTGG---A---TT--AT---------CATA-T----A--T-A-A-T-C--C-A-C-TG
gi|43588 : tttattttatgctttttgatgaattatagagatttctTT----A--T-A-A-T-TT-C-A-C-TAT--TT------TAA---A-CA-G---TG--A-AATTATG--A-CAAAtttcaaagagtgaaattatgaaaaaaa
gi|43551 : tgaattatagagatttctcagtgaattaTT----A--T-A-A-T-TT-C-A-T-TAT--TT------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTACC--A-AAAAa
gi|43555 : tttattttaagttttttcatgaattagtgaaatttttcattgaattaTT----A--T-A-A-T-TT-C-A-C-TAT--TT------TAA-----CA-G---TG--A-AATTATC--A-AAAAAa
gi|43579 : tttattttatgatacttgattaattattgagatttccttgtgaattaTT----T--T-A-A-T-TT-C-A-C-TGT--TT------CAA---G-CA-G---TG--A-AATTATC--A-AAa
gi|43563 : attttttttttatgaattatagagatatccctgtgaattagaTT----A--T-A-A-TGT--C-A-C-T----TT------TAA---A-CA-G---TG--A-AATTACC--A-AAAGAAa
gi|43573 : tttgttttacgctttttgataaattgtatagatatagatattttagtgatg-T-T--C-A-C-TAT--TC------CAA---A-CA-G---TG--A-AATTACA--A-Aa
gi|43580 : ttgttttgcacttggtgatgaattacaaatagttgtcagtggtag-T-C--A-A-C-TTT--TT------TCA---A-CA-G---TG--A-AATTATT--A-AAAAattgtgaa
Alignments
lowQualScore : 1111 0 0 0 1 1111 00 333333333333 55555555555555 33333 11 0 0 0 222 1 222222222 1 444444 0 1 77 1 2 0 0 0 00 33333333 111 0 111 11 0 00 0
lowQualScore : .... . . . . .... .. ............ .............. ..... .. . . . ... . ......... . ...... . . .. . . . . . .. ........ ... . ... .. . .. .
lowQualScore : 3333 6 6 6 2 2222 88 888888888888 44444444444444 22222 99 6 6 6 000 7 333333333 1 444444 6 2 88 7 3 6 6 6 88 00000000 000 6 777 55 6 99 7
consensus : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
Reference ( family-398 ) : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43521 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TTGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43522 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TT------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----T-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TAT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43523 : TTTATTT----TATG-TTT-TT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-----------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAACAA
gi|43524 : TTTATTT----TATG-CTT-TT--G-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTTG-A---TTA-T---------T-T----A-TAGT-A-A--T-C-T-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43525 : TTTATTT----TAGG-CTT-TT-TTTATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43526 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------A-T----A-TGAT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---AGA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43527 : TTTATTT----CATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----TT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---ACA-G---TT--G-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43528 : TTT-TTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG-A---TTA-T---------C-T----A-TGGT-A-A--T-T-C-A-C-TCT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43529 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----ACC--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-TTAG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--G-AGAAAA
gi|43530 : TTTATTT----CATG-TTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--A-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---CG--A-AATTATG--G-AA
gi|43531 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-AG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTAG-A---TAA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------G-AA---ACA-G---TA--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43532 : TTTATGT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-TTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-T--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43533 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--AA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TAA-T---------T-T----A-TGGTGA-A--T-C-A-A-A-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAACAA
gi|43534 : TTTATGT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AGT--TA------------TAT--------------AG----ATATTT-ATCA-GTGG-A---TTA-G---------T-T----A-TGGA-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACG-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAA
gi|43535 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTC-------A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C--A---ACA-G---TG--G-AA-TATG--A-AAAAGA
gi|43536 : TTTATTT----TATG-GTT-TT-TGGATG----AAT--TA------------TGG--------------AT----AT--TT-CATA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--------A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAA
gi|43537 : TTTATTT----GGTG-CTT-TT-TG-ATA----AAT--TG------------TAG--------------GT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-G---------T-T----ATTGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---AGA-G---TG--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43538 : TTTATTG----TATG-CTT-TT--G-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-TTCA-GTGG-A---GTA-T---------T-T----A-TTGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---ATA-G---AG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43539 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AGT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GCGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-AA---ACA-G---AG--A-AATTCAG--A-AAAA
gi|43540 : TTTATTT----TATG-CTA-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TCG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGA-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATGCCA-AAAA
gi|43541 : TTTTTTT----TTTG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------CAG--------------AG----AT--TT-TTCA-GCGG-A---TAA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-T-A-T-TGT--TT------G-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43542 : TTTATTT-----ATT-CTT-TT-TG-ATG----AAT--CA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTAA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TA--A-AATAATG--
gi|43543 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTG-C---------T-C----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA-----------TA--A-AATTAAA--A-AAAAAA
gi|43544 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GT-G-A---CTA-TTCATATAAGT-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-GA---ACA-G---TG--A-ATTTACG--A-AAAAAA
gi|43545 : TTTATTT----TATG-CTT-TA-TG-ATG----AAT--TC------------TAG--------------AA----TT--TT-CTCA-GTGA-A---TTG-T---------T-T----G-TGGT-A-A--T-C-A-A-T-TCT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AGTTATG--A-ACAAAA
gi|43546 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATA----AAA--TA------------TAT--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TATT-A-A--T-C-C-A-C-TTG--TT------C-TA---ACA-G---TA--A-AAATATG--A-AAAAAA
gi|43547 : TTCATTG----TATG-CTT-AT-TG-ATG----AAT--TA------------AAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGA-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---AC-------------ATTATG--A-AAA
gi|43548 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-GG-ATG----AGT--TA------------CAC--------------AT----AT--TG-CTCA-GCGG-A---TTA-T---------C-T----A-TGGT-A-G--T-C-C-C-C-TGT--TC------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTACG--A-
gi|43549 : TTTATTT----CATG-TTT-TT-TT-ATA----AAA--AA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-G-A--T-C-C-A-T-TGA--TA------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAA
gi|43550 : TCTATTT----TATG-CTG-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT------------------------------------A-TGGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43551 : TTTATTT----TAAG-TTT-TT-TC-ATG----AAT--TA------------GTG--------------AA----AT--TT-TTCA-TTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGGT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TT------G-AA---ATA-A---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43552 : TTTATTT----CTTG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TACTGGACCAGGTATAG--------------GT----AT--TT-CTAA-GTGG-A---ATA-T---------T-T----A-TTGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-A---TG--A-AATTATG--G-AGAGAA
gi|43553 : TCTATTT----CTTG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TG------------TGG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----G-CGGT-A-A--TAT-C-A-G-TTTAATT------A-AA---ATA-G---TG--A-AATTA
gi|43554 : TTTATTT----GATG-CTT-TT-TG-GTG----AAT--TG------------TGG--------------AT----AT--AT-CTCA-GTGA-A---GCA-G---------T-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TG---TT------A-AA---GAA-G---TA--A-AA
gi|43555 : TTTATTT----TATG-ATA-CT-TG-ATT----AAT--TA------------TTG--------------AG----AT--TT-CCTT-GTGA-A---TTATT---------T-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TG---TT------A-AA---ATA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43556 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TT-ATG----AAA--TC------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-TTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-A--T-T-C-A-C-ACT--TT------A-AT---AAA-G---TG--A-ACTTGT
gi|43557 : TTTATTT----AACA-CGT-TT-TG-ATG----AAT--TACA----------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--T---------AA---ACA-
gi|43558 : TTTTTTT----TATT-CTTGTT-TT-ATG----ACT--TA------------TA---------------AG----AT--TT-TTCCCGTGA-A---TTA-A---------T-T----T-TGGT-A-A--A-CGC-G-C-TGT--TA------C-AA---GCA-G---TG--A-AAT------A-AAAAAA
gi|43559 : TTTATTT----CATG-TTT-CT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------TG----AT--TC-CTCA-GTAA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-A--T-T-T-A----AT--TGGAAAAAA-AA---ACA-T---TG--A-AATTATA--A-AA
gi|43560 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TA------------TAATTGTTTTTTTATACAG----AT--TT-CTCA-GAAC-A---TTA-T---------C-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TA------T-AA---ATG-G---TG--A-AAATATA--A-A
gi|43561 : TTTGTTC----TATGTCTT-TT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTG-GTGG-A---TTA-T---------C-A----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TG----------------------A---TG--A-AATTATG--A-A
gi|43562 : TTTATTTATGATATG-CGT-TT-TG-ATGGATAAAT--TA------------TAA--------------GG----AG--TT-CTCA-GTGA-C---TTA-T---------TAT----T-TGTT-A-T--T-T-C-A-C-TGT--TT------A-AA---GTT-G---TG--G-AATTATG--A-
gi|43563 : TTTGTTT----TACG-CTT-TT-TG-ATA----AATTGTA------------TAGATAT----------AG----AT--AT-TTTA-GTGATG---TTC-T---------T-T------TGGT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TT--------AA---A-A-G---TG--A-CATTATA--A-A
gi|43564 : TTTGTTT----TATA-CTT-TT-TG-ATG----AAT--T------------------------------------AT--TT-CTTA-GTGA-A---TTATT---------T-T----T-TAAT-A-A--T-CAC-A-C-TG---TT------G-AA---AAA-G---TA--A-AGT
gi|43565 : TTTATAT----TATG-TTT-TC-TG-AAG----A----TA------------AAA--------------AG----AG--TT-CTTA-GTGA-A---TTG-T---------T-T----C-TAAT-A-A--T-A-T-AAC-TGT--TT------C-AA---TCA-T---TA--A-AATTATA--A-A
gi|43566 : TTTTTTT----TATG-GTT-TT-TG-ATG----GCT--AA------------TAG--------------AATGATAT--TT-CTCA-GTGA-A---TTG-T---------T-C------TGAC-A-AC-T-CTC-A-A-TAT--TT------A-TA---AAA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43567 : TTAATTT----TGTG-CTT-TT-TG-ACG----AAT--TA------------T----------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TG
gi|43568 : TTATTT----TTTG-CGT-TTGTA-AGA----AAA--TA------------TAG--------------AA----GT--TT-CTCA-GTTA-A---ATA-T---------A-T----T-TGGT-A-ATTT-T-C-A-T-T-T--TT------CAAA---ACA-G---TG--A-AATTATA--A-Attcatt
gi|43569 : TTATTT----CATG-TTA-TA-TG-ATG----AAT--TA------------TAA--------------AT----AT--TT-ATCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGAT-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-AC---ACA-G---TG--A-AATTTTG--A-AAAAAA
gi|43570 : TTATTT----TATG---T-TT-TG-ATA----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GCGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-ATT--T-T-C-A-C-TGT--TG------C-AA---ATATG---TGTTA-AGTTA
gi|43571 : TCATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAT--------------AA----AT--TT-CTCA-GT-G-ATTTTTA-T---------T-T----T-TTCT-A-T--T-T-C-A-G-TG---TT------A-GA---ATA-A---AG--A-AATTATG--A-AA
gi|43572 : TTGTTT----T--G-CGA-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------A------T--TT-CTCA-GTGA-A---ATA-T---------T-T----T-TTGT-A-C--TTC-C-A-C-TGT--TT------G-AA---ATA-G---AG--A-AATTA----A-AAA
gi|43573 : TTGTTT----TGCA-CTT-GG-TG-ATG----AAT--TA------------CAA--------------AT----AG--TT-GTCA-GTGG------TAGT---------T-T--------GT-A-A--T-TTC-A-C-TGT--TT------G-GA---ATA-G---TG--A-AATTGTG--A-A
gi|43574 : TATTT----TATG-CCT-TT-TG-ATG----ACA--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-G---TTA-T---------T-T----A-TAGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-A---T
gi|43575 : TATTT----TACG-TTT-AT-TA-ATG----ATT--TT------------TGG--------------AG----AT--GT-CTCC-GTGA-A---TTA-T---------TAT----A-T--T-A-A--T-T-TTA-A-TGT--TT------A-AA---ATA-G---AG--A-AATTATG--A-A
gi|43576 : TATTT----TATG-ATT-TT--G-GTG----ATT--TG------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTAA-ATTCTTA-T---------T-A----A-TAGT------T-T-C-A-C-TG---TT------C-AATATACA-AAATTG--GCAATTATG--
gi|43577 : ATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-T-C-C-T-TCT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AA
gi|43578 : ATTT----TGTG-CTT-TT-TG-TTG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AA--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----C-TGAT-A-T--T-T-C-C-C-TGT--T
gi|43579 : ATTT----T-----TT-TT-TT-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--AT-CCCT-GTGA-A---TTA-G---------A-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGC--TT------G-AA---ACA-G---TG--A-AATTA----A-AAA
gi|43580 : TTT----TATG-CTG-TT-TC-ATA----AAT--TT------------TAGAT------------AA----ATC-TT-ATCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TAAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TG------A-AA---AAA-GT--TG--A-AATTGTA--A-A
gi|43581 : TT----TATT-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAA--------------AT----AT--TTTCTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAGAGA
gi|43582 : TT----TA---CCT-TT-TA-ATG----AAA--TG------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-A--TAT-C-A-C-TGT--TA------A-AA---ACA-----TT--A-CATTA-G--A-AA
gi|43583 : T----CATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----ATG-TT-TTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-C----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---AC------TG--A-AATTATG--G-AAAAAA
gi|43584 : T----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------C----------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------T-T----A------A--------C-A-A-TAT--TT------A-AA---AAA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43585 : TT-TT-TG-ATA----AAT--TA------------CAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GCTG-A---TTA-T---------T-G----A-TAGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ATA-G---TG--A-AATT
gi|43586 : -TT-TG-ATA----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTGA-GCGT-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-ATT--T-T-C-A-C-TGT--TG------C-AA---ATA-
gi|43587 : -TG-ATA----AAT--TA------------TTG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------G-T----T-TGAT-C-AT-T-T-T-A-T-TGT--TG------A-AG---ACA-G---TGA-A-AATTATG--A-A
gi|43588 : TG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----G-TCAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TT------A-AA---ATA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43589 : ------------TAG--------------AA----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-TATTAA-TGAT-T-A--T-C-C-C-C-TG---TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATCATG--ATAAAGAA
gi|43590 : G----AT--TT-CTCA-GTGA-A---ATA-C---------T-T----A-TGAT-G-A--T-T-T-A-TGTAT--TT------G-AA---ACA-G---TG--A-AATAATA--A-AAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1111 0 0 0 1 1111 00 333333333333 55555555555555 33333 11 0 0 0 222 1 222222222 1 444444 0 1 77 1 2 0 0 0 00 33333333 111 0 111 11 0 00 0
lowQualScore : .... . . . . .... .. ............ .............. ..... .. . . . ... . ......... . ...... . . .. . . . . . .. ........ ... . ... .. . .. .
lowQualScore : 3333 6 6 6 2 2222 88 888888888888 44444444444444 22222 99 6 6 6 000 7 333333333 1 444444 6 2 88 7 3 6 6 6 88 00000000 000 6 777 55 6 99 7
consensus : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
Reference ( family-398 ) : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43521 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TTGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43522 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TT------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----T-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TAT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43523 : TTTATTT----TATG-TTT-TT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-----------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAACAA
gi|43524 : TTTATTT----TATG-CTT-TT--G-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTTG-A---TTA-T---------T-T----A-TAGT-A-A--T-C-T-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43525 : TTTATTT----TAGG-CTT-TT-TTTATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43526 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------A-T----A-TGAT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---AGA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43527 : TTTATTT----CATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----TT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---ACA-G---TT--G-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43528 : TTT-TTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG-A---TTA-T---------C-T----A-TGGT-A-A--T-T-C-A-C-TCT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43529 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----ACC--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-TTAG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--G-AGAAAA
gi|43530 : TTTATTT----CATG-TTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--A-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---CG--A-AATTATG--G-AA
gi|43531 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-AG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTAG-A---TAA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------G-AA---ACA-G---TA--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43532 : TTTATGT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-TTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-T--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43533 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--AA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TAA-T---------T-T----A-TGGTGA-A--T-C-A-A-A-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAACAA
gi|43534 : TTTATGT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AGT--TA------------TAT--------------AG----ATATTT-ATCA-GTGG-A---TTA-G---------T-T----A-TGGA-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACG-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAA
gi|43535 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTC-------A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C--A---ACA-G---TG--G-AA-TATG--A-AAAAGA
gi|43536 : TTTATTT----TATG-GTT-TT-TGGATG----AAT--TA------------TGG--------------AT----AT--TT-CATA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--------A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAA
gi|43537 : TTTATTT----GGTG-CTT-TT-TG-ATA----AAT--TG------------TAG--------------GT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-G---------T-T----ATTGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---AGA-G---TG--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43538 : TTTATTG----TATG-CTT-TT--G-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-TTCA-GTGG-A---GTA-T---------T-T----A-TTGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---ATA-G---AG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43539 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AGT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GCGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-AA---ACA-G---AG--A-AATTCAG--A-AAAA
gi|43540 : TTTATTT----TATG-CTA-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TCG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGA-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATGCCA-AAAA
gi|43541 : TTTTTTT----TTTG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------CAG--------------AG----AT--TT-TTCA-GCGG-A---TAA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-T-A-T-TGT--TT------G-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43542 : TTTATTT-----ATT-CTT-TT-TG-ATG----AAT--CA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTAA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TA--A-AATAATG--
gi|43543 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTG-C---------T-C----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA-----------TA--A-AATTAAA--A-AAAAAA
gi|43544 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GT-G-A---CTA-TTCATATAAGT-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-GA---ACA-G---TG--A-ATTTACG--A-AAAAAA
gi|43545 : TTTATTT----TATG-CTT-TA-TG-ATG----AAT--TC------------TAG--------------AA----TT--TT-CTCA-GTGA-A---TTG-T---------T-T----G-TGGT-A-A--T-C-A-A-T-TCT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AGTTATG--A-ACAAAA
gi|43546 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATA----AAA--TA------------TAT--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TATT-A-A--T-C-C-A-C-TTG--TT------C-TA---ACA-G---TA--A-AAATATG--A-AAAAAA
gi|43547 : TTCATTG----TATG-CTT-AT-TG-ATG----AAT--TA------------AAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGA-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---AC-------------ATTATG--A-AAA
gi|43548 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-GG-ATG----AGT--TA------------CAC--------------AT----AT--TG-CTCA-GCGG-A---TTA-T---------C-T----A-TGGT-A-G--T-C-C-C-C-TGT--TC------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTACG--A-
gi|43549 : TTTATTT----CATG-TTT-TT-TT-ATA----AAA--AA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-G-A--T-C-C-A-T-TGA--TA------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAA
gi|43550 : TCTATTT----TATG-CTG-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT------------------------------------A-TGGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43551 : TTTATTT----TAAG-TTT-TT-TC-ATG----AAT--TA------------GTG--------------AA----AT--TT-TTCA-TTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGGT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TT------G-AA---ATA-A---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43552 : TTTATTT----CTTG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TACTGGACCAGGTATAG--------------GT----AT--TT-CTAA-GTGG-A---ATA-T---------T-T----A-TTGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-A---TG--A-AATTATG--G-AGAGAA
gi|43553 : TCTATTT----CTTG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TG------------TGG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----G-CGGT-A-A--TAT-C-A-G-TTTAATT------A-AA---ATA-G---TG--A-AATTA
gi|43554 : TTTATTT----GATG-CTT-TT-TG-GTG----AAT--TG------------TGG--------------AT----AT--AT-CTCA-GTGA-A---GCA-G---------T-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TG---TT------A-AA---GAA-G---TA--A-AA
gi|43555 : TTTATTT----TATG-ATA-CT-TG-ATT----AAT--TA------------TTG--------------AG----AT--TT-CCTT-GTGA-A---TTATT---------T-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TG---TT------A-AA---ATA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43556 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TT-ATG----AAA--TC------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-TTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-A--T-T-C-A-C-ACT--TT------A-AT---AAA-G---TG--A-ACTTGT
gi|43557 : TTTATTT----AACA-CGT-TT-TG-ATG----AAT--TACA----------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--T---------AA---ACA-
gi|43558 : TTTTTTT----TATT-CTTGTT-TT-ATG----ACT--TA------------TA---------------AG----AT--TT-TTCCCGTGA-A---TTA-A---------T-T----T-TGGT-A-A--A-CGC-G-C-TGT--TA------C-AA---GCA-G---TG--A-AAT------A-AAAAAA
gi|43559 : TTTATTT----CATG-TTT-CT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------TG----AT--TC-CTCA-GTAA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-A--T-T-T-A----AT--TGGAAAAAA-AA---ACA-T---TG--A-AATTATA--A-AA
gi|43560 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TA------------TAATTGTTTTTTTATACAG----AT--TT-CTCA-GAAC-A---TTA-T---------C-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TA------T-AA---ATG-G---TG--A-AAATATA--A-A
gi|43561 : TTTGTTC----TATGTCTT-TT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTG-GTGG-A---TTA-T---------C-A----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TG----------------------A---TG--A-AATTATG--A-A
gi|43562 : TTTATTTATGATATG-CGT-TT-TG-ATGGATAAAT--TA------------TAA--------------GG----AG--TT-CTCA-GTGA-C---TTA-T---------TAT----T-TGTT-A-T--T-T-C-A-C-TGT--TT------A-AA---GTT-G---TG--G-AATTATG--A-
gi|43563 : TTTGTTT----TACG-CTT-TT-TG-ATA----AATTGTA------------TAGATAT----------AG----AT--AT-TTTA-GTGATG---TTC-T---------T-T------TGGT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TT--------AA---A-A-G---TG--A-CATTATA--A-A
gi|43564 : TTTGTTT----TATA-CTT-TT-TG-ATG----AAT--T------------------------------------AT--TT-CTTA-GTGA-A---TTATT---------T-T----T-TAAT-A-A--T-CAC-A-C-TG---TT------G-AA---AAA-G---TA--A-AGT
gi|43565 : TTTATAT----TATG-TTT-TC-TG-AAG----A----TA------------AAA--------------AG----AG--TT-CTTA-GTGA-A---TTG-T---------T-T----C-TAAT-A-A--T-A-T-AAC-TGT--TT------C-AA---TCA-T---TA--A-AATTATA--A-A
gi|43566 : TTTTTTT----TATG-GTT-TT-TG-ATG----GCT--AA------------TAG--------------AATGATAT--TT-CTCA-GTGA-A---TTG-T---------T-C------TGAC-A-AC-T-CTC-A-A-TAT--TT------A-TA---AAA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43567 : TTAATTT----TGTG-CTT-TT-TG-ACG----AAT--TA------------T----------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TG
gi|43568 : TTATTT----TTTG-CGT-TTGTA-AGA----AAA--TA------------TAG--------------AA----GT--TT-CTCA-GTTA-A---ATA-T---------A-T----T-TGGT-A-ATTT-T-C-A-T-T-T--TT------CAAA---ACA-G---TG--A-AATTATA--A-Attcatt
gi|43569 : TTATTT----CATG-TTA-TA-TG-ATG----AAT--TA------------TAA--------------AT----AT--TT-ATCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGAT-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-AC---ACA-G---TG--A-AATTTTG--A-AAAAAA
gi|43570 : TTATTT----TATG---T-TT-TG-ATA----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GCGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-ATT--T-T-C-A-C-TGT--TG------C-AA---ATATG---TGTTA-AGTTA
gi|43571 : TCATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAT--------------AA----AT--TT-CTCA-GT-G-ATTTTTA-T---------T-T----T-TTCT-A-T--T-T-C-A-G-TG---TT------A-GA---ATA-A---AG--A-AATTATG--A-AA
gi|43572 : TTGTTT----T--G-CGA-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------A------T--TT-CTCA-GTGA-A---ATA-T---------T-T----T-TTGT-A-C--TTC-C-A-C-TGT--TT------G-AA---ATA-G---AG--A-AATTA----A-AAA
gi|43573 : TTGTTT----TGCA-CTT-GG-TG-ATG----AAT--TA------------CAA--------------AT----AG--TT-GTCA-GTGG------TAGT---------T-T--------GT-A-A--T-TTC-A-C-TGT--TT------G-GA---ATA-G---TG--A-AATTGTG--A-A
gi|43574 : TATTT----TATG-CCT-TT-TG-ATG----ACA--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-G---TTA-T---------T-T----A-TAGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-A---T
gi|43575 : TATTT----TACG-TTT-AT-TA-ATG----ATT--TT------------TGG--------------AG----AT--GT-CTCC-GTGA-A---TTA-T---------TAT----A-T--T-A-A--T-T-TTA-A-TGT--TT------A-AA---ATA-G---AG--A-AATTATG--A-A
gi|43576 : TATTT----TATG-ATT-TT--G-GTG----ATT--TG------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTAA-ATTCTTA-T---------T-A----A-TAGT------T-T-C-A-C-TG---TT------C-AATATACA-AAATTG--GCAATTATG--
gi|43577 : ATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-T-C-C-T-TCT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AA
gi|43578 : ATTT----TGTG-CTT-TT-TG-TTG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AA--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----C-TGAT-A-T--T-T-C-C-C-TGT--T
gi|43579 : ATTT----T-----TT-TT-TT-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--AT-CCCT-GTGA-A---TTA-G---------A-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGC--TT------G-AA---ACA-G---TG--A-AATTA----A-AAA
gi|43580 : TTT----TATG-CTG-TT-TC-ATA----AAT--TT------------TAGAT------------AA----ATC-TT-ATCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TAAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TG------A-AA---AAA-GT--TG--A-AATTGTA--A-A
gi|43581 : TT----TATT-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAA--------------AT----AT--TTTCTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAGAGA
gi|43582 : TT----TA---CCT-TT-TA-ATG----AAA--TG------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-A--TAT-C-A-C-TGT--TA------A-AA---ACA-----TT--A-CATTA-G--A-AA
gi|43583 : T----CATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----ATG-TT-TTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-C----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---AC------TG--A-AATTATG--G-AAAAAA
gi|43584 : T----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------C----------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------T-T----A------A--------C-A-A-TAT--TT------A-AA---AAA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43585 : TT-TT-TG-ATA----AAT--TA------------CAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GCTG-A---TTA-T---------T-G----A-TAGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ATA-G---TG--A-AATT
gi|43586 : -TT-TG-ATA----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTGA-GCGT-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-ATT--T-T-C-A-C-TGT--TG------C-AA---ATA-
gi|43587 : -TG-ATA----AAT--TA------------TTG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------G-T----T-TGAT-C-AT-T-T-T-A-T-TGT--TG------A-AG---ACA-G---TGA-A-AATTATG--A-A
gi|43588 : TG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----G-TCAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TT------A-AA---ATA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43589 : ------------TAG--------------AA----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-TATTAA-TGAT-T-A--T-C-C-C-C-TG---TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATCATG--ATAAAGAA
gi|43590 : G----AT--TT-CTCA-GTGA-A---ATA-C---------T-T----A-TGAT-G-A--T-T-T-A-TGTAT--TT------G-AA---ACA-G---TG--A-AATAATA--A-AAAAAA
blockSeqs : ATGA T GATA CTGGACCAGGTA TTGTTTTTTTATAC ATGAT AT TTT T TCATATAAG A ATTAA T TT A G GAAAAAA TAT AAT TT
blockSeqs : . G . CA ATAT T C TTC T . A AT T T T A CA . T A
blockSeqs : . . . . AT T G . G . . T . T A T C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . T . T C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . T . . T . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . C . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . T . . G . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . T . . T . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . G . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . T . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . G . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . T . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . C . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . T . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . T . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . T . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . T . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . C . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . T . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . T . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . A . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . T . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . T . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
finalCons : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1111 0 0 0 1 1111 00 333333333333 55555555555555 33333 11 0 0 0 222 1 222222222 1 444444 0 1 77 1 2 0 0 0 00 33333333 111 0 111 11 0 00 0
lowQualScore : .... . . . . .... .. ............ .............. ..... .. . . . ... . ......... . ...... . . .. . . . . . .. ........ ... . ... .. . .. .
lowQualScore : 3333 6 6 6 2 2222 88 888888888888 44444444444444 22222 99 6 6 6 000 7 333333333 1 444444 6 2 88 7 3 6 6 6 88 00000000 000 6 777 55 6 99 7
consensus : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
Reference ( family-398 ) : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43521 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TTGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43522 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TT------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----T-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TAT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43523 : TTTATTT----TATG-TTT-TT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-----------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAACAA
gi|43524 : TTTATTT----TATG-CTT-TT--G-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTTG-A---TTA-T---------T-T----A-TAGT-A-A--T-C-T-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43525 : TTTATTT----TAGG-CTT-TT-TTTATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43526 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------A-T----A-TGAT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---AGA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43527 : TTTATTT----CATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----TT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---ACA-G---TT--G-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43528 : TTT-TTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG-A---TTA-T---------C-T----A-TGGT-A-A--T-T-C-A-C-TCT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43529 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----ACC--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-TTAG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--G-AGAAAA
gi|43530 : TTTATTT----CATG-TTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--A-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---CG--A-AATTATG--G-AA
gi|43531 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-AG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTAG-A---TAA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------G-AA---ACA-G---TA--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43532 : TTTATGT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-TTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-T--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43533 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--AA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TAA-T---------T-T----A-TGGTGA-A--T-C-A-A-A-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAACAA
gi|43534 : TTTATGT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AGT--TA------------TAT--------------AG----ATATTT-ATCA-GTGG-A---TTA-G---------T-T----A-TGGA-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACG-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAA
gi|43535 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTC-------A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C--A---ACA-G---TG--G-AA-TATG--A-AAAAGA
gi|43536 : TTTATTT----TATG-GTT-TT-TGGATG----AAT--TA------------TGG--------------AT----AT--TT-CATA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--------A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAA
gi|43537 : TTTATTT----GGTG-CTT-TT-TG-ATA----AAT--TG------------TAG--------------GT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-G---------T-T----ATTGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---AGA-G---TG--A-AATTATG--A-GAAAAA
gi|43538 : TTTATTG----TATG-CTT-TT--G-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-TTCA-GTGG-A---GTA-T---------T-T----A-TTGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------T-AA---ATA-G---AG--A-AATTATG--A-AGAAAA
gi|43539 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AGT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GCGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-AA---ACA-G---AG--A-AATTCAG--A-AAAA
gi|43540 : TTTATTT----TATG-CTA-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TCG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGA-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATGCCA-AAAA
gi|43541 : TTTTTTT----TTTG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------CAG--------------AG----AT--TT-TTCA-GCGG-A---TAA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-T-A-T-TGT--TT------G-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43542 : TTTATTT-----ATT-CTT-TT-TG-ATG----AAT--CA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTAA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TA--A-AATAATG--
gi|43543 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTG-C---------T-C----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA-----------TA--A-AATTAAA--A-AAAAAA
gi|43544 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GT-G-A---CTA-TTCATATAAGT-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-GA---ACA-G---TG--A-ATTTACG--A-AAAAAA
gi|43545 : TTTATTT----TATG-CTT-TA-TG-ATG----AAT--TC------------TAG--------------AA----TT--TT-CTCA-GTGA-A---TTG-T---------T-T----G-TGGT-A-A--T-C-A-A-T-TCT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AGTTATG--A-ACAAAA
gi|43546 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATA----AAA--TA------------TAT--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TATT-A-A--T-C-C-A-C-TTG--TT------C-TA---ACA-G---TA--A-AAATATG--A-AAAAAA
gi|43547 : TTCATTG----TATG-CTT-AT-TG-ATG----AAT--TA------------AAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGA-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---AC-------------ATTATG--A-AAA
gi|43548 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-GG-ATG----AGT--TA------------CAC--------------AT----AT--TG-CTCA-GCGG-A---TTA-T---------C-T----A-TGGT-A-G--T-C-C-C-C-TGT--TC------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTACG--A-
gi|43549 : TTTATTT----CATG-TTT-TT-TT-ATA----AAA--AA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-G-A--T-C-C-A-T-TGA--TA------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAA
gi|43550 : TCTATTT----TATG-CTG-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT------------------------------------A-TGGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAAAAA
gi|43551 : TTTATTT----TAAG-TTT-TT-TC-ATG----AAT--TA------------GTG--------------AA----AT--TT-TTCA-TTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGGT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TT------G-AA---ATA-A---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43552 : TTTATTT----CTTG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TACTGGACCAGGTATAG--------------GT----AT--TT-CTAA-GTGG-A---ATA-T---------T-T----A-TTGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-A---TG--A-AATTATG--G-AGAGAA
gi|43553 : TCTATTT----CTTG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TG------------TGG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----G-CGGT-A-A--TAT-C-A-G-TTTAATT------A-AA---ATA-G---TG--A-AATTA
gi|43554 : TTTATTT----GATG-CTT-TT-TG-GTG----AAT--TG------------TGG--------------AT----AT--AT-CTCA-GTGA-A---GCA-G---------T-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TG---TT------A-AA---GAA-G---TA--A-AA
gi|43555 : TTTATTT----TATG-ATA-CT-TG-ATT----AAT--TA------------TTG--------------AG----AT--TT-CCTT-GTGA-A---TTATT---------T-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TG---TT------A-AA---ATA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43556 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TT-ATG----AAA--TC------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-TTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-A--T-T-C-A-C-ACT--TT------A-AT---AAA-G---TG--A-ACTTGT
gi|43557 : TTTATTT----AACA-CGT-TT-TG-ATG----AAT--TACA----------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--T---------AA---ACA-
gi|43558 : TTTTTTT----TATT-CTTGTT-TT-ATG----ACT--TA------------TA---------------AG----AT--TT-TTCCCGTGA-A---TTA-A---------T-T----T-TGGT-A-A--A-CGC-G-C-TGT--TA------C-AA---GCA-G---TG--A-AAT------A-AAAAAA
gi|43559 : TTTATTT----CATG-TTT-CT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------TG----AT--TC-CTCA-GTAA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-A--T-T-T-A----AT--TGGAAAAAA-AA---ACA-T---TG--A-AATTATA--A-AA
gi|43560 : TTTATTT----TATG-CTT-TT-TA-ATG----AAT--TA------------TAATTGTTTTTTTATACAG----AT--TT-CTCA-GAAC-A---TTA-T---------C-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TA------T-AA---ATG-G---TG--A-AAATATA--A-A
gi|43561 : TTTGTTC----TATGTCTT-TT-TG-ATG----AAT--TG------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTG-GTGG-A---TTA-T---------C-A----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TG----------------------A---TG--A-AATTATG--A-A
gi|43562 : TTTATTTATGATATG-CGT-TT-TG-ATGGATAAAT--TA------------TAA--------------GG----AG--TT-CTCA-GTGA-C---TTA-T---------TAT----T-TGTT-A-T--T-T-C-A-C-TGT--TT------A-AA---GTT-G---TG--G-AATTATG--A-
gi|43563 : TTTGTTT----TACG-CTT-TT-TG-ATA----AATTGTA------------TAGATAT----------AG----AT--AT-TTTA-GTGATG---TTC-T---------T-T------TGGT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TT--------AA---A-A-G---TG--A-CATTATA--A-A
gi|43564 : TTTGTTT----TATA-CTT-TT-TG-ATG----AAT--T------------------------------------AT--TT-CTTA-GTGA-A---TTATT---------T-T----T-TAAT-A-A--T-CAC-A-C-TG---TT------G-AA---AAA-G---TA--A-AGT
gi|43565 : TTTATAT----TATG-TTT-TC-TG-AAG----A----TA------------AAA--------------AG----AG--TT-CTTA-GTGA-A---TTG-T---------T-T----C-TAAT-A-A--T-A-T-AAC-TGT--TT------C-AA---TCA-T---TA--A-AATTATA--A-A
gi|43566 : TTTTTTT----TATG-GTT-TT-TG-ATG----GCT--AA------------TAG--------------AATGATAT--TT-CTCA-GTGA-A---TTG-T---------T-C------TGAC-A-AC-T-CTC-A-A-TAT--TT------A-TA---AAA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43567 : TTAATTT----TGTG-CTT-TT-TG-ACG----AAT--TA------------T----------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TG
gi|43568 : TTATTT----TTTG-CGT-TTGTA-AGA----AAA--TA------------TAG--------------AA----GT--TT-CTCA-GTTA-A---ATA-T---------A-T----T-TGGT-A-ATTT-T-C-A-T-T-T--TT------CAAA---ACA-G---TG--A-AATTATA--A-Attcatt
gi|43569 : TTATTT----CATG-TTA-TA-TG-ATG----AAT--TA------------TAA--------------AT----AT--TT-ATCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGAT-A-A--T-C-C-A----GT--TT------C-AC---ACA-G---TG--A-AATTTTG--A-AAAAAA
gi|43570 : TTATTT----TATG---T-TT-TG-ATA----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GCGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-ATT--T-T-C-A-C-TGT--TG------C-AA---ATATG---TGTTA-AGTTA
gi|43571 : TCATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAT--------------AA----AT--TT-CTCA-GT-G-ATTTTTA-T---------T-T----T-TTCT-A-T--T-T-C-A-G-TG---TT------A-GA---ATA-A---AG--A-AATTATG--A-AA
gi|43572 : TTGTTT----T--G-CGA-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------A------T--TT-CTCA-GTGA-A---ATA-T---------T-T----T-TTGT-A-C--TTC-C-A-C-TGT--TT------G-AA---ATA-G---AG--A-AATTA----A-AAA
gi|43573 : TTGTTT----TGCA-CTT-GG-TG-ATG----AAT--TA------------CAA--------------AT----AG--TT-GTCA-GTGG------TAGT---------T-T--------GT-A-A--T-TTC-A-C-TGT--TT------G-GA---ATA-G---TG--A-AATTGTG--A-A
gi|43574 : TATTT----TATG-CCT-TT-TG-ATG----ACA--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTGG-G---TTA-T---------T-T----A-TAGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-A---T
gi|43575 : TATTT----TACG-TTT-AT-TA-ATG----ATT--TT------------TGG--------------AG----AT--GT-CTCC-GTGA-A---TTA-T---------TAT----A-T--T-A-A--T-T-TTA-A-TGT--TT------A-AA---ATA-G---AG--A-AATTATG--A-A
gi|43576 : TATTT----TATG-ATT-TT--G-GTG----ATT--TG------------TAG--------------AT----AT--TT-CTCA-GTAA-ATTCTTA-T---------T-A----A-TAGT------T-T-C-A-C-TG---TT------C-AATATACA-AAATTG--GCAATTATG--
gi|43577 : ATTT----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTTA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-T-C-C-T-TCT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AA
gi|43578 : ATTT----TGTG-CTT-TT-TG-TTG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AA--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----C-TGAT-A-T--T-T-C-C-C-TGT--T
gi|43579 : ATTT----T-----TT-TT-TT-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--AT-CCCT-GTGA-A---TTA-G---------A-T----T-TGAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGC--TT------G-AA---ACA-G---TG--A-AATTA----A-AAA
gi|43580 : TTT----TATG-CTG-TT-TC-ATA----AAT--TT------------TAGAT------------AA----ATC-TT-ATCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----T-TAAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TG------A-AA---AAA-GT--TG--A-AATTGTA--A-A
gi|43581 : TT----TATT-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAA--------------AT----AT--TTTCTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-T----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATTATG--A-AAGAGA
gi|43582 : TT----TA---CCT-TT-TA-ATG----AAA--TG------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-A-A--TAT-C-A-C-TGT--TA------A-AA---ACA-----TT--A-CATTA-G--A-AA
gi|43583 : T----CATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------TAG--------------AT----ATG-TT-TTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-C----A-TGGT-A-A--T-C-C-A-C-TGT--TT------C-AA---AC------TG--A-AATTATG--G-AAAAAA
gi|43584 : T----TATG-CTT-TT-TG-ATG----AAT--TA------------C----------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------T-T----A------A--------C-A-A-TAT--TT------A-AA---AAA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43585 : TT-TT-TG-ATA----AAT--TA------------CAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GCTG-A---TTA-T---------T-G----A-TAGT-A-A--T-C-A-A-C-TGT--TT------C-AA---ATA-G---TG--A-AATT
gi|43586 : -TT-TG-ATA----AAT--TA------------TAG--------------AT----AT--TT-CTGA-GCGT-A---TTA-T---------T-T----T-TGAT-ATT--T-T-C-A-C-TGT--TG------C-AA---ATA-
gi|43587 : -TG-ATA----AAT--TA------------TTG--------------AG----AT--TT-CTCA-ATGA-A---TTA-T---------G-T----T-TGAT-C-AT-T-T-T-A-T-TGT--TG------A-AG---ACA-G---TGA-A-AATTATG--A-A
gi|43588 : TG----AAT--TA------------TAG--------------AG----AT--TT-CTCA-GTGA-A---TTA-T---------T-T----G-TCAT-A-AT-T-T-C-A-C-TGT--TT------A-AA---ATA-G---TG--A-AATTATA--A-A
gi|43589 : ------------TAG--------------AA----AT--TT-CTCA-GTGG-A---TTA-T---------T-TATTAA-TGAT-T-A--T-C-C-C-C-TG---TT------C-AA---ACA-G---TG--A-AATCATG--ATAAAGAA
gi|43590 : G----AT--TT-CTCA-GTGA-A---ATA-C---------T-T----A-TGAT-G-A--T-T-T-A-TGTAT--TT------G-AA---ACA-G---TG--A-AATAATA--A-AAAAAA