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consensus                     : TAGGCTTA--G-TCCATN-CAA-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GTGA-C-AN--------G-------T-GA-AATC-A--------G-G-----T-GA-GC-----GAC--TT-A-GG-C---C-CAT--------TT---------TGGG-CCTC-TTGTT
Reference ( gi|130211 )       : TAGGCTTA--G-TCCATA-CAA-AATTT-G---AAA-G-GAA--------GTGA-C-AT--------G-------T-GA-AACC-A--------G-A-----T-GA-GC-----AAC--TT-T-GG-C---C-CAC--------TT---------TGGG-CCTC-TTGTT
gi|130212                     : TAGGCTTA--G-TCCATA-CAC-AATTT-G---AAA-G-GAA--------GTGA-C-AT--------T-------T-GA-AACC-A--------G-G-----T-GC-GC-----GAC--TT-A-GG-C---C-CAT--------CT---------TGGG-CCTC-TTGTT
gi|130215                     : TAGGTTTA--G-TCCATA-CAA-AATTT-G---AAA-G-GAA--------GTGA-C-----------G-------T-GA-AACC-A--------G-A-----T-AA-GC-----GAC--TT-G-GG-C---C-AAC---------T---------TGGG-CCTCTTTGTT
gi|130213                     : TATGCTTA--G-CCCATA-CAA-AATTT-G---AAA-G-GAA--------GTGA-C-AT--------G-------T-GA-AACC-A--------G-A-----T-GAGGT-----GTC--TT-A-TG-T---C-CAT--------CT---------TGGG-CCTC-TTGTT
gi|130214                     : TAGGCTTA--G-TTGATA-CAA-AATTT-G---AAA-G-GAA--------TTGA-C-TT--------G-------T-GA-AACC-A--------G-A-----T-GA-GT-----GAC--TT-A-GG-T---C-CAT--------CT---------TTGG-CCTC-TTGTT
gi|130218                     : TAGGCTTA--C-TCCATA-CAA-AATTT-G---AAA-G-GAA--------GTGA-C-AT--------G-------T-GA-AACC-A--------G-A-----T-GA-GC-----AAT--TT-
gi|130216                     : TAGGCTCA--G-TCCATA-CAA-AATTT-G---AAA-G-GAA--------GTAA-C-AT--------G-------T-GA-AGCC-A--------G-A-----T-GA-GC-----GAC--TT-G-GG-C---
gi|130217                     : TAGGCTTA--G-TCCATA-CAA-AATTT-G---AAA-G-------------TGA-C-AT--------G-------T-GA-AGCA-A--------G-A-----T-GA-G--------------T-G---------AC--------TT---------AGGG-CCTC-TTG
gi|130219                     : TATGCTTAAAG-TCGATT-CAA-AATTT-G---TAA-A-GAA--------ATGA-C-AA--------G-------T-GA-AATC-A--------G-A-----T-GA-GC-----GAC--CT-A-GG-T---C-CAA---------T---------TGGA-CCTC-TTGTT
gi|130220                     : TAGGCTTA--C-TCAATG-CAA-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GTGA-C-AG--------G-------T-GA-ATCG-A--------G-T-----T-GA-GC-----AAC--TT-A-GA-A---C-CA---------TT---------TCAA-CCTC-TT
gi|130224                     : TAAGCTTA--G-TCCATT-AAG-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GTGA-C-AA--------G-------T-GATGATC-A--------G-G-----T-GA-GC-----AAC--TT-T-GA-----------------------------TAGG-CCTT-TTGT
gi|130221                     : TAGGCTTA--A-TCTATT-CAA-TATTT-G---AAA-A-GAT--------ATAA-C-AG--------G-------T-AA-AACA-A--------G-G-----T-GA-GC-----TTC--TT-A-AG-C---C-CAC---------T---------TGGG-CTTC-TTGT
gi|130222                     : TGGGCTTA--A-CCCATT-CAA-AATTA-G---AAA-A-GAA--------ATGA-C-AG--------T-------T-GA-TATC-A--------G-G-----T-GA-GC-----AGC--TT-A-AG-C---A-CA---------TT---------TGGG-CCT
gi|130223                     : TAGGTTTA--G-TTCATT-CAA-AATCT-G---AAA-T-GAA--------GTGA-C-AG--------G-------T-----ATC-A--------G-G-----T-GA-G-----------TT-A-GG-C---C-CA---------TT---------TGGG-C
gi|130225                     : TAGGCTGA--G-TGCATT-CAACAATTT-T---AAA-G-TAA--------AGG--------------G-------T-GA-AATC-A--------G-G-----T-GA-GC-----AAC--TT-A-GG-C---C-CA---------GT---------TGAA-CCTC-TT
gi|130228                     : TAGGCTTA--G-TCCATA-CAA-AATGT-G---AAA-A-GAA--------AT---C-A-------------------------C-A--------G-A-----T-GC-GT-----GAC--TT-T-GA-T---C-CA---------TT---------AGGG-CTTT-TT
gi|130231                     : TAGGCTTA--G-TTCAGT-CAA-AATTT-G---AAA-A-GAG--------GTGA-C-GA--------G-------T-TC-AATC-A--------G-G-----T-GA-GC-----AAC--TT-
gi|130226                     : TAGGCTTA--T-TCCATT-CAA-AATTT-G---AAA-A-TAA--------TTGA-C-AG--------C-------T-GA-AATT-A--------G-G-----T-GA-GC-----GAC--TT-
gi|130233                     : TAGGTTTA--G-TCTATT-CAA-AATTT-GTTGAAA-A-TAA--------GTGA-C-TG--------G-------T-GA-AATC-A--------G-G-----T-GA-GC-----AAC--
gi|130229                     : TATGCTTG--G-TCCATT-CAA-AACTG-G---GAA-A-GAA--------GGGATC-A---------G-------T-GA-AATC-A--------G-G-----T-AA-GT-----GA---TG-T-AG-A---C-CTT--------TT---------TGAGATCTC-TTGTT
gi|130232                     : TAGGCTTA--G-TCCATA-CAC-A---T-A---AAA----------------------T--------G-------T-GA-AACC-A--------G-A-----T-GA-GC-----AAC--TT-
gi|130237                     : TAGACATA--G-TCCATT-CAC-AATTTTG---AAA-A-GAA--------GTGA-C-AG--------A-------T-GA-AATC-C--------G-T-----T-TA-GC-----AAC--TT-ggatctcttg
gi|130230                     : TATGCTTA--G-TCCTTT-CAA-AATGT-A---AAA-A-GA------------A-C--T--------G-------T----AATC-T--------G-G-----T-GA-GC-----CAC--TA-A-GG-C---C-CA---------TC---------TGAA-CCTC-TTGTTa
gi|130227                     : TAGGCTAA--G-T----A-AAA-AATT--G---AAA-A-GAA--------GTTA-C-AC--------T-------A-GG-AATC-A--------A-G-----T-GA-AC-----GAC--TT-A-GA-A---C-CA---------TC---------TGGG-CCTC-TTCTT
gi|130235                     : TAAGCTTA--C-TCTATT-TAA-AATTT-G---GAA-A-GGT--------GTGA-T-AG--------G-------T-GA-AGTC-A--------G-T-----T-GA-GC------AT--TT-T-AG-C---C-
gi|130236                     : TAGGTTTA--G-TCCTTT-CAA-AA-TC-A---AAA-G-GAG--------ATGA-C-CG--------G-------T-AA-AATC-A--------G-G-----T-GA-TCACTTGAACGATT-A-AG-C---CACAA--------AT---------GGGG-CCTT-TTGTTacatgtcgtgc
gi|130234                     : TAGGCTTG--A-TCTATT-TAA-AATTT-G---GAA-A-GGT--------GTGA-T-AG--------G-------T-GA-AGTC-A--------A-G-----T-GA-GC-----ATT--TT-A-GG-C---A-CA
gi|130239                     :  AGGTTTA--G-TACATA-CAA-AATTT-G---AAA-AAGAA--------GTGA-C-AT--------G-------T-GA-AACC-A--------G-A-----T-GA-AC-----AAC--TT-A-GG-C---C-CAT--------CT---------TGGG-CCTC-TTGTTtgtcgtgc
gi|130240                     :  AGGCTTA--G-TCCATA-TAA-AATTT-G---AAA-G-GAA--------GTGA-C-----------G-------T-AA-AACC-A--------G-A-----T-GA-GC-----GAC--TT-A-GG-CAGGG-CAT--------CT---------TGGG-ACTC-TTGTT
gi|130241                     :  AGGTTTA--G-TCTA-A-TCA-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GCGA-C-AA--------G-------T-GA-AACC-T--------G-G-----T-GA-GG-----GAC-----T-AG-C---C-AAA---------T---------TGGA-CCTC-TTGTT
gi|130242                     :  AGGCTTA--GCTTGATT-CAA-GATTT-G---AAA-A-GAA--------GGGG-C-AG--------G-------T-GA-AA-C-A--------G-G-----T-GA-AC-----AAC--TT-
gi|130243                     :   GGCTTA--G-TCCATA-CAA-AATTT-G---AAA-G-GAA--------GTGA-T-AT--------G-------T-AA-AACC-A--------G-A-----T-TG-GC-----GGC--TT-A-GG-C---C-CAT--------AT---------TGGA-CCTC-TTGTTa
gi|130244                     :   GACTTA--G-TCCATA-CAA-A-TTT-G---AAA-G-GAA--------GTGA-C-AT--------G-------T-GA-AGTC-A--------A-A-----T-GA-GC-----GAC--TT-
gi|130245                     :   GGCTTG--G-TCTTTT-CAA-AATTT-G---AAA-A-TAA--------GTGA-C-ATATGTCGCCA-------T-GA-AATC-G--------G-A-----T-GG-AC-----GTC--TT-T-TG-C---C-TA---------TT---------TGGG-CATC-GCGTTa
gi|130246                     :    GCTTA--A-TCCTTT-CAA-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GTGA-C-CA--------G-------T--A-AACTGA--------A-A-----T-GA-GT-----GAC--TT-
gi|130247                     :     CTTA--G-TCCTTT-CAA-AATTT-G---ATT-T-GAA--------GTGA-C-CG--------G-------T-GA-AATC-A--------G-G-----T-GA-GC-----GAT--TT-T-GG-T---C-CATTTGATCCATT---------TGGA-TCTC-TTG
gi|130248                     :      TTA--G-TCTATT-CAA-TATTA-T---AAA-G-GAA--------GTGA-A-AT-------------------A-AA--------------G-----T-GA-AT-----GAC--TT-A-GG-C---C-CA---------TT---------TGGG-TCTC-TTGTT
gi|130249                     :      TTA--A-TCCATT-CAA-AGTTT-G---AAA-T-GAA--------GTGA-C-AT--------G-------T-TG-AATC-A--------A-G-----T-GA-GC-----TAC--T
gi|130250                     :      TTA--A-TCCATT-CAA-AATTT-G---AAA-C-GAA--------GTGA-C-AT--------G-------T-TG-AATT-A--------A-G-----T-GA-GC-----TAC--T
gi|130251                     :       TA--G-TCCATT-CAA-AATTT-G---GTA-A-GAA--------GTGA-C-AA--------G-------A-GA-AATC-A--------G-T-----T-GA-AC-----ATC--TC-A-GG-T---C-CA---------TT---------CGGG-CCTC-TTGTT
gi|130252                     :       TA--G-TTCATT-CAG-AATTT-C---AAA-A-GAA--------GGAA-C-AG--------G-------A-TA-GACA-A--------G-A-----T-GG-GC-----AAC--TT-A-GG-C---T-CA---------GT---------TGGG-CCTC-TTGTT
gi|130253                     :       TA--G-CCCATT-CAT-CATTT-A---AAA-A-GAA--------GTGA-T-AG--------A-------T-GA-AATC-A--------G-A-----C-GA-GT-----GAC--TT-T-GG-C---C-C
gi|130254                     :       TA--G-TTCATT-CAA-TATTT-G---AAA-G-AAA----------GA-C-AT--------G-------T-GA-AAGA-AAAGAC---G-A-----T-GA-GC-----GAC--TT-
gi|130255                     :        A--G-TTCATA-CAA-AATAT-G---AAA-G-GAA--------GTGA-C-AT--------G-------T-GA----C-A--------G-A-----T-GA-GC-----GAC--TTAA-AG-T---C-CAT--------CT---------TGGG-AATT-TTGTTa
gi|130256                     :        A--G-TCCATT-CAA-AATTT-A---AAA-A-GAA--------ATGA-C-AG--------G-------T-TA-AGTC-A--------G-G-----T-AA-GC-----GAC--TT-G-GGGC---C-CAA--------TT---------TTG--CCTC-TTGTT
gi|130258                     :               CATA-GAAGAATTT-C---AAA----AA--------GTGC-T-AT--------GGCCACTAT-GA-G-TC-A--------G-A-----A-GA-GC-----GTC--CT-CAGG-C---C-CTC--------TT----------GGG-CCTC-TTGTT
gi|130257                     :               CATAGTAA-AATTT-T---AAA----AA--------GTGC-T-AT--------G---------GA-CACC-AT-------G-AGTCAGTAGA-GC-----GTC--CT-CAGG-C---C-CTC--------TT----------GGG-CCTC-TTGTT
gi|130259                     :               CATAGTAG-AATTT-C---AAA----AA--------GTGC-T-AT--------GGCCACTTT-GA-G-TC-A--------GTA-----T-GA-GC-----GTC--CT-CAGG-C---C-CTC--------TT----------GGG-CCTC-TTGTT
gi|130260                     :                ATA-TCA-AATTT-G---AAA-G-AAA--------GTGG-C-AT--------G-------G-GA-AACC-A--------G-A-----C-GC-AC-----GAC--TT-T-GG-T---C-CAT--------CT---------TGGG-CCTG-TAGTT
gi|130261                     :                ATT-CAA-AATTT-G---AAA-A-GTG--------ATGA-C-AA--------G-------T-GG-AACA-A--------G-A-----T-GA-GT-----GAA--TA-A-GG-C---C-CAT--------TT---------T-GG-CCTC-TTGTT
gi|130262                     :                   -CAA-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GTGA-C-AT--------GT------T-GA-AATC-A--------G-A-----C-GA-GC-----AAC--TT-G-GG-C---C-CA---------TT---------TGGG-CCTC-TTGTT
gi|130267                     :                   -CAA-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GTGA-A-A---------G-------T-GA-AATC-A--------T-G-----T-GA-GC-----AAC--TT-T-GG-----C-CAA--------TT---------TGAT-CCTA-TTGCT
gi|130264                     :                   -CAA-AATTT-G---A-----GAA--------GTGA-C-AG--------G-------T-GA-AATC-A--------G-A-----T-GA-GC-----GAC--TT-A-GG-C---C-CA
gi|130265                     :                   -CAA-AATTT-G---AGA-A-GAA--------ATGA-C-AG--------A-------T-GA-AATC-A--------G-G-----T-GA-AT-----GAC--TA-A-GG-----C-CAA--------GT---------TGAG-CCTC-TTGTT
gi|130266                     :                   -CAA-AATTG-G---AAA-A-GAA--------ATGA-C-A---------G-------T-GA-AATC-A--------G-G-----T-GA-GT-----GAC--CT-A-GG-C---C-CA
gi|130269                     :                   -CAA-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GTGA-C-AA--------G-------T-GA-AATC-A--------G-A-----T-GA-t
gi|130263                     :                   -CAA-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GTTA-CAAG--------G-------T-GA-AATC-AGGTACCTCG-G-----T-AA-GT-----GAC--TT-A-GG-C---T-TG---------TT---------TGGG--CTC-TTGTT
gi|130268                     :                   -CAC-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GTGA-A-AG--------G-------C-G--AATC-A--------G-G-----T-GA-AC-----GAC--TT-G-GG-C---C-C-C--------TT---------
gi|130270                     :                     AA-AGTTT-G---AAA-A-CAA--------TTGA-C-ATG-------G-------TGGA-AATA-A--------G-A-----T-GA-AT-----GAC--TT-G-GG-C---A-C-T--------TT---------TGGC-CCTC-TTGTTg
gi|130271                     :                      A-AATTT-G---AAA-A-GAA--------GTGA-T-AT--------G-------T-GA-AACA-A--------G-A-----T-GA-GC-----GAC--TT-A-AG-T---C-CAT--------CT---------AGGG-CCTC-TTTTT
gi|130272                     :                      A-AATTT-G---ATA-A-GAA--------GTGA-C-AG--------A-------T-GA-AATC-A--------G-G-----T-GA-GC-----GAC--TT-A-GG-A---C-CAT--------TTCAGACTAAATGGG-CATC-TTGTT
gi|130273                     :                      A-AATTT-A---AAA-T-AAATCACATTAGTGA-C-AT--------A-------T-GA-AAGC-A--------G-G-----T-GA-GC-----GAC--TT----A-C---T-CAC--------TT---------AGGT-CCTT-TTG
gi|130274                     :                          TTT-G---AAAAG-GAG--------GCAA-C-TT--------T-------T-AA----C-A--------G-G-----T-GA-GC-----GAT--TT-A-GG-G---C-CAT--------CA---------TGGC-CCTC-TTGTT
gi|130275                     :                               ---AAA-A-GAA--------GTGA-C-AT--------A-------T-GA-AATT-G--------G-G-----T-TA-GC-----ATC--TT-A-AA-C---C-CA---------TT---------TGGG-CCTC-TTGTT
gi|130276                     :                                          A--------GTGG-C-AT--------G-------T-GA-AACA-G--------G-A-----T-GA-GC-----AAC--TT-A-GG-T---C-CAT--------AT---------TGGG-TCTC-TTGTT
gi|130277                     :                                                       -C-AT--------G-------T-GA-AACC-A--------G-A-----T-GA-GC-----GAC--TA-C-CG-C---C-CAT--------CT---------TGGG-CCTA-TTAT
gi|130278                     :                                                           T--------G-------T-GA-TACA-A--------G-A-----T-AA-GC-----GAC--TT-A-GG-C---C-CAA--------TC---------TGGG-CCTC-ATGTT
gi|130280                     :                                                                               A-AGTC-A--------G-G-----T-GA-GC-----GAT--AT-A-GG-G---C-CAT--------CT---------TGGC-CCTC-TTGTT
gi|130279                     :                                                                               A-AGTC-A--------G-G-----T-GA-GC-----GAT--AT-A-GG-G---C-CAT--------CT---------TGGC-CCTC-TTGTT
gi|130281                     :                                                                                    C-A--------G-A-----T-GA-GC-----GAT--GT-A-GG-G---C-CAT--------CT---------TGGC-CCTC-TTGTT
gi|130282                     :                                                                                    C-A--------G-A-----T-GA-GC-----GAT--AT-A-GG-G---C-CAT--------CT---------TGGC-CCTC-TTGTT
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Unaligned ( gi|130238 ): TAGACTTTATCCATTAAAAATGAATGACAGGTGAAAAAGGTGAGCGATTTAGGCTTTGTTGTGCCCCTTGTT






Alignments
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lowQualScore                  :         11 0     1   1     0 111   0 0  2222222  1  111111  0 6666666666 3333333 1  0    0 33333333 0 22222222   0   1   1111 0   0 111 0  33333333333 333333333  0      0     
lowQualScore                  :         .. .     .   .     . ...   . .  .......  .  ......  . .......... ....... .  .    . ........ . ........   .   .   .... .   . ... .  ........... .........  .      .     
lowQualScore                  :         22 9     3   3     6 111   6 6  0000000  2  777777  6 3333333333 8888888 2  6    6 44444444 6 66666666   6   7   2222 6   7 222 7  44444444444 000000000  7      8     
consensus                     : TAGGCTTA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------N-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACT----T-AGG-C---C-CA-T--------CT---------TG-GGCCTC-TTGTT
Reference ( family-396 )      : TAGGCTTA--G-TCCATNCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------N-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACT----T-AGG-C---C-CA-T--------TT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130211                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ACT----T-TGG-C---C-CA-C--------TT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130212                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAC-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-T-------T-GA-AACC-A--------G-G--------TGC-GCG-ACT----T-AGG-C---C-CA-T--------CT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130213                     : TATGCTTA--G-CCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGAGGTG-TCT----T-ATG-T---C-CA-T--------CT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130214                     : TAGGCTTA--G-TTGATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AT-TG------AC-T--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GTG-ACT----T-AGG-T---C-CA-T--------CT---------TT-GGCCTC-TTGTT
gi|130215                     : TAGGTTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC------------G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TAA-GCG-ACT----T-GGG-C---C-AA----------CT---------TG-GGCCTCTTTGTT
gi|130216                     : TAGGCTCA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TA------AC-A--------T-G-------T-GA-AGCC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACT----T-GGG-C---
gi|130217                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---A------A-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AGCA-A--------G-A--------TGA-GTG-ACT----T-AGG-G---C-C--T--------CT---------TG-
gi|130218                     : TAGGCTTA--C-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ATT----T-
gi|130219                     : TATGCTTAAAG-TCGATTCAA-AATTT-G---TAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACC----T-AGG-T---C-CA----------AT---------TG-GACCTC-TTGTT
gi|130220                     : TAGGCTTA--C-TCAATGCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-G--AATCGA--------G-T--------TGA-GCA-ACT----T-AGA-A---C-CA-T--------TT---------C--AACCTC-TT
gi|130221                     : TAGGCTTA--A-TCTATTCAA-TATTT-G---AAA-A-GA-------TA-TA------AC-A--------G-G-------T-AA-AACA-A--------G-G--------TGA-GCT-TCT----T-AAG-C---C-CA----------CT---------TG-GGCTTC-TTGT
gi|130222                     : TGGGCTTA--A-CCCATTCAA-AATTA-G---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-T-------T-GA-TATC-A--------G-G--------TGA-GCA-GCT----T-AAG-C---A-CA----------TT---------TG-GGCCT
gi|130223                     : TAGGTTTA--G-TTCATTCAA-AATCT-G---AAA-T-GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-----ATC-A--------G-G--------TGA-G-----T----T-AGG-C---C-CA----------TT---------TG-GGC
gi|130224                     : TAAGCTTA--G-TCCATTAAG-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------T-GATGATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACTTTGAT-AGG-C---C----T--------TT---------TG-
gi|130225                     : TAGGCTGA--G-TGCATTCAACAATTT-T---AAA-------------G-TA------AA-G--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACT----T-AGG-C---C-CA----------GT---------TG-AACCTC-TTt
gi|130226                     : TAGGCTTA--T-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-TA-------AT-TG------AC-A--------G-C-------T-GA-AATT-A--------G-G--------TGA-GCG-ACT----T-
gi|130227                     : TAGGCTAA--G-T--A---AA-AAATT-G---AAA-A-GA-------AG-TT------AC-A--------C-T-------A-GG-AATC-A--------A-G--------TGA-ACG-ACT----T-AGA-A---C-CA----------TC---------TG-GGCCTC-TTCTT
gi|130228                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATGT-G---AAA-A-GA-------AA-T--------C-A--------------------------C-A--------G-A--------TGC-GTG-ACT----T-TGA-T---C-CA----------TT---------AG-GGCTTT-TT
gi|130229                     : TATGCTTG--G-TCCATTCAA-AACTG-G---GAA-A-GA-------AG-GG------AT-C--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TAA-GTG-ATG----T-AGA-C---C-T--T--------TT---------TGAGATCTC-TTGTT
gi|130230                     : TATGCTTA--G-TCCTTTCAA-AATGT-A---AAA-A-GA-------AC-T---------------------G-------T----AATC-T--------G-G--------TGA-GCC-ACT----A-AGG-C---C-CA----------TC---------TG-AACCTC-TTGTT
gi|130231                     : TAGGCTTA--G-TTCAGTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------GG-TG------AC-G--------A-G-------T-TC-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACT----T-
gi|130232                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAC-A---T-A---AA---------------------------A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ACT----T-GG
gi|130233                     : TAGGTTTA--G-TCTATTCAA-AATTT-GTTGAAA-A-TA-------AG-TG------AC-T--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACatctcttg
gi|130234                     : TAGGCTTG--A-TCTATTTAA-AATTT-G---GAA-A-GG-------TG-TG------AT-A--------G-G-------T-GA-AGTC-A--------A-G--------TGA-GCA-TTT----T-AGG-C---A-CA-T--------GT---------CG-TGC
gi|130235                     : TAAGCTTA--C-TCTATTTAA-AATTT-G---GAA-A-GG-------TG-TG------AT-A--------G-G-------T-GA-AGTC-A--------G-T--------TGA-GCA-TTT----T-AGC-C---A-CA-T--------GT---------CG-TGC
gi|130236                     : TAGGTTTA--G-TCCTTTCAA-AATC------AAA-A-GG-------AGATG------AC-C--------G-G-------T-AA-AATC-A--------G-GTGATCACTTGA-ACG-A-T----T-AAG-C---CACA-A--------AT---------GG-GGCCTT-TTGTT
gi|130237                     : TAGACATA--G-TCCATTCAC-AATTTTG---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-C--------G-T--------TTA-GCA-ACT----T-A
gi|130238                     : TAGACTTT--A-TCCATTAAA-AAT-------------GA-------A--TG------AC-A--------G-G-------T-GA-AA-A-A--------G-G--------TGA-GCG-ATT----T-AGG-C---T-T--T--------GT---------TG-TGCCCC-TTGTT
gi|130239                     :  AGGTTTA--G-TACATACAA-AATTT-G---AAA-AAGA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-ACA-ACT----T-AGG-C---C-CA-T--------CT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130240                     :  AGGCTTA--G-TCCATATAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC------------G-------T-AA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACT----T-AGG-CAGGG-CA-T--------CT---------TG-GGACTC-TTGTT
gi|130241                     :  AGGTTTA--G-TCTAATCAA-A-TTT-G---AAA-A-GA-------AG-CG------AC-A--------A-G-------T-GA-AACC-T--------G-G--------TGA-GGG-AC-----T-AG------C-CA-A--------AT---------TG-GACCTC-TTGTT
gi|130242                     :  AGGCTTA--GCTTGATTCAA-GATTT-G---AAA-A-GA-------AG-GG------GC-A--------G-G-------T-GA-AA-C-A--------G-G--------TGA-ACA-ACT----T-A
gi|130243                     :   GGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AT-A--------T-G-------T-AA-AACC-A--------G-A--------TTG-GCG-GCT----T-AGG-C---C-CA-T--------AT---------TG-GACCTC-TTGTT
gi|130244                     :   GACTTA--G-TCCATACAA-A-TTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AGTC-A--------A-A--------TGA-GCG-ACT----T-A
gi|130245                     :   GGCTTG--G-TCTTTTCAA-AATTT-G---AAA-A-TA-------AG-TG------AC-ATATGTCGCC-A-------T-GA-AATC-G--------G-A--------TGG-ACG-TCT----T-TTG-C---C-TA----------TT---------TG-GGCATC-GCGTT
gi|130246                     :    GCTTA--A-TCCTTTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-C--------A-G-------T-AA-ACTG-A--------A-A--------TGA-GTG-ACT----T-
gi|130247                     :     CTTA--G-TCCTTTCAA-AATTT-G---ATT-T-GA-------AG-TG------AC-C--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATT----T-TGG-T---C-CA-TTTGATCCATT---------TG-GATCTC-TTG
gi|130248                     :      TTA--G-TCTATTCAA-TATTA-T---AAA-G-GA-------AG-TG------A--------------------------AATA-A--------A-G--------TGA-ATG-ACT----T-AGG-C---C-CA----------TT---------TG-GGTCTC-TTGTT
gi|130249                     :      TTA--A-TCCATTCAA-AGTTT-G---AAA-T-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-TG-AATC-A--------A-G--------TGA-GCT-ACT----
gi|130250                     :      TTA--A-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-C-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-TG-AATT-A--------A-G--------TGA-GCT-ACT----
gi|130251                     :       TA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---GTA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------A-GA-AATC-A--------G-T--------TGA-ACA-TCT----C-AGG-T---C-CA----------TT---------CG-GGCCTC-TTGTT
gi|130252                     :       TA--G-TTCATTCAG-AATTT-C---AAA-A-GA-------AG-GA------AC-A--------G-G-------A-TA-GACA-A--------G-A--------TGG-GCA-ACT----T-AGG-C---T-CA----------GT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130253                     :       TA--G-CCCATTCAT-CATTT-A---AAA-A-GA-------AG-TG------AT-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-A--------CGA-GTG-ACT----T-TGG-C---C-C
gi|130254                     :       TA--G-TTCATTCAA-TATTT-G---AAA-G-AA-------A---G------AC-A--------T-G-------T-GA-AAGA-AAAGAC---G-A--------TGA-GCG-ACT----T-A
gi|130255                     :        A--G-TTCATACAA-AATAT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA----C-A--------G-A--------TGA-GCG-ACT----TAAAG-T---C-CA-T--------CT---------TG-GGAATT-TTGTT
gi|130256                     :        A--G-TCCATTCAA-AATTT-A---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-G-------T-TA-AGTC-A--------G-G--------TAA-GCG-ACT----T-GGGGC---C-CAAT--------TT---------TG---CCTC-TTGTT
gi|130257                     :                    AA-AATTT-T---AAA-A----------AG-TGCTATGGAC-A--------CCA-------T-GA-G-TC-A--------G-T--------AGA-GCGTCCT----C-AGG-C---C-C--T--------CT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130258                     :         catagtCATAGAAGAATTT-C---AAA-A----------AG-TG------CT-A--------T-GGCCACTAT-GA-G-TC-A--------G-A--------AGA-GCGTCCT----C-AGG-C---C-C--T--------CT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130259                     :                    AG-AATTT-C---AAA-A----------AG-TG------CT-A--------T-GGCCACTTT-GA-G-TC-A--------GTA--------TGA-GCGTCCT----C-AGG-C---C-C--T--------CT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130260                     :               catagtA-AATTT-G---AAA-G-AA-------AG-TG------GC-A--------T-G-------G-GA-AACC-A--------G-A--------CGC-ACG-ACT----T-TGG-T---C-CA-T--------CT---------TG-GGCCTG-TAGTT
gi|130261                     :           atatcATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GT-------GA-TG------AC-A--------A-G-------T-GG-AACA-A--------G-A--------TGA-GTG-AAT----A-AGG-C---C-CA-T--------TT---------T--GGCCTC-TTGTT
gi|130262                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------TTGA-AATC-A--------G-A--------CGA-GCA-ACT----T-GGG-C---C-CA----------TT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130263                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TT------ACAA--------G-G-------T-GA-AATC-AGGTACCTCG-G--------TAA-GTG-ACT----T-AGG-C---T-TG----------TT---------TG-GG-CTC-TTGTT
gi|130264                     :                   CAA-AATTT-G---A-----GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACT----T-AGG-C---C-CA-
gi|130265                     :                   CAA-AATTT-G---AGA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-ATG-ACT----A-AGG-C---C-AA----------GT---------TG-AGCCTC-TTGTT
gi|130266                     :                   CAA-AATTG-G---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A----------G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GTG-ACC----T-AGG-C---C-CA-T--------
gi|130267                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------A--A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------T-G--------TGA-GCA-ACT----T-TGG-C---C-AA----------TT---------TG-ATCCTA-TTGCT
gi|130268                     :                   CAC-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AA-A--------G-G-------C-GA-A-TC-A--------G-G--------TGA-ACG-ACT----T-GGG-C---C-CC-T--------T
gi|130269                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-g
gi|130270                     :                    AA-AGTTT-G---AAA-A-CA-------AT-TG------AC-AT-------G-G-------TGGA-AATA-A--------G-A--------TGA-ATG-ACT----T-GGG-C---A-C--T--------TT---------TG-GCCCTC-TTGTT
gi|130271                     :                     A-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AT-A--------T-G-------T-GA-AACA-A--------G-A--------TGA-GCG-ACT----T-AAG-T---C-CA-T--------CT---------AG-GGCCTC-TTTTT
gi|130272                     :                     A-AATTT-G---ATA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACT----T-AGG-A---C-CA-T--------TTCAGACTAAATG-GGCATC-TTGTT
gi|130273                     :                     A-AATTT-A---AAATA-AATCACATTAG-TG------AC-A--------T-A-------T-GA-AAGC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACT----T-A---C---T-CA-C--------TT---------AG-GTCCTT-TTG
gi|130274                     :                         TTT-G---AAA-A-GG-------AGGCA------AC-T--------T-T-------T-AA----C-A--------G-G--------TGA-GCG-ATT----T-AGG-G---C-CA-T--------CA---------TG-GCCCTC-TTGTT
gi|130275                     :                              ---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------T-A-------T-GA-AATT-G--------G-G--------TTA-GCA-TCT----T-AAA-C---C-CA----------TT---------TG-GGCCTC-TTGTT
gi|130276                     :                                         -------AG-TG------GC-A--------T-G-------T-GA-AA-C-A--------G-GA-------TGA-GCA-ACT----T-AGG-T---C-CA-T--------AT---------TG-GGTCTC-TTGTT
gi|130277                     :                                                            C-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACT----A-CCG-C---C-CA-T--------CT---------TG-GGCCTA-TTAT
gi|130278                     :                                                                        -G-------T-GA-TACA-A--------G-A--------TAA-GCG-ACT----T-AGG-C---C-CA-A--------TC---------TG-GGCCTC-ATGTT
gi|130279                     :                                                                                   tA-AGTC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATA----T-AGG-G---C-CA-T--------CT---------TG-GCCCTC-TTGTT
gi|130280                     :                                                                                    A-AGTC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATA----T-AGG-G---C-CA-T--------CT---------TG-GCCCTC-TTGTT
gi|130281                     :                                                                                         C-A--------G-A--------TGA-GCG-ATG----T-AGG-G---C-CA-T--------CT---------TG-GCCCTC-TTGTT
gi|130282                     :                                                                                         C-A--------G-A--------TGA-GCG-ATA----T-AGG-G---C-CA-T--------CT---------TG-GCCCTC-TTGTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                         111111111                          
lowQualScore                  :         11 0     0   0     0 111   0 0  2222222  1  111111  0 6666666666 3333333 1  0    0 33333333 0 22222222   0   1    1    111 0 0  000000000 222222222  0  0    0     
lowQualScore                  :         .. .     .   .     . ...   . .  .......  .  ......  . .......... ....... .  .    . ........ . ........   .   .    .    ... . .  ......... .........  .  .    .     
lowQualScore                  :         22 9     3   6     6 111   6 6  0000000  2  777777  6 3333333333 8888888 2  6    6 44444444 6 66666666   6   7    2    222 7 7  000000000 999999999  7  8    8     
consensus                     : TAGGCTTA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------N-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
Reference ( family-396 )      : TAGGCTTA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------N-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130211                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ACTT-TGGC---C-C-AC--------TT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130212                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAC-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-T-------T-GA-AACC-A--------G-G--------TGC-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130213                     : TATGCTTA--G-CCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGAGGTG-TCTT-ATGT---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130214                     : TAGGCTTA--G-TTGATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AT-TG------AC-T--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GTG-ACTT-AGGT---C-C-AT--------CT---------TT-GG-CCTC-TTGTT
gi|130215                     : TAGGTTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC------------G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TAA-GCG-ACTT-GGGC---C-A-A---------CT---------TG-GG-CCTCTTTGTT
gi|130216                     : TAGGCTCA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TA------AC-A--------T-G-------T-GA-AGCC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-GGGC---
gi|130217                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---A------A-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AGCA-A--------G-A--------TGA-GTG-ACTT-AGGG---C-C--T--------CT---------TG-
gi|130218                     : TAGGCTTA--C-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ATTT-
gi|130219                     : TATGCTTAAAG-TCGATTCAA-AATTT-G---TAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACCT-AGGT---C-C-A---------AT---------TG-GA-CCTC-TTGTT
gi|130220                     : TAGGCTTA--C-TCAATGCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-G--AATCGA--------G-T--------TGA-GCA-ACTT-AGAA---C-C-AT---------T---------TC-AA-CCTC-TT
gi|130221                     : TAGGCTTA--A-TCTATTCAA-TATTT-G---AAA-A-GA-------TA-TA------AC-A--------G-G-------T-AA-AACA-A--------G-G--------TGA-GCT-TCTT-AAGC---C-C-A---------CT---------TG-GG-CTTC-TTGT
gi|130222                     : TGGGCTTA--A-CCCATTCAA-AATTA-G---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-T-------T-GA-TATC-A--------G-G--------TGA-GCA-GCTT-AAGC---A-C-AT---------T---------TG-GG-CCT
gi|130223                     : TAGGTTTA--G-TTCATTCAA-AATCT-G---AAA-T-GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-----ATC-A--------G-G--------TGA-G-----TT-AGGC---C-C-AT---------T---------TG-GG-C
gi|130224                     : TAAGCTTA--G-TCCATTAAG-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------T-GATGATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACTT-TGA-----------------------------TA-GG-CCTT-TTGT
gi|130225                     : TAGGCTGA--G-TGCATTCAACAATTT-T---AAA-------------G-TA------AA-G--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACTT-AGGC---C-C-A---------GT---------TG-AA-CCTC-TT
gi|130226                     : TAGGCTTA--T-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-TA-------AT-TG------AC-A--------G-C-------T-GA-AATT-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-
gi|130227                     : TAGGCTAA--G-T--A---AA-AAATT-G---AAA-A-GA-------AG-TT------AC-A--------C-T-------A-GG-AATC-A--------A-G--------TGA-ACG-ACTT-AGAA---C-C-AT--------C----------TG-GG-CCTC-TTCTT
gi|130228                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATGT-G---AAA-A-GA-------AA-T--------C-A--------------------------C-A--------G-A--------TGC-GTG-ACTT-TGAT---C-C-AT---------T---------AG-GG-CTTT-TT
gi|130229                     : TATGCTTG--G-TCCATTCAA-AACTG-G---GAA-A-GA-------AG-GG------AT-C--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TAA-GTG-ATGT-AGAC---C-T--T--------TT---------TGAGA-TCTC-TTGTT
gi|130230                     : TATGCTTA--G-TCCTTTCAA-AATGT-A---AAA-A-GA-------AC-T---------------------G-------T----AATC-T--------G-G--------TGA-GCC-ACTA-AGGC---C-C-AT--------C----------TG-AA-CCTC-TTGTT
gi|130231                     : TAGGCTTA--G-TTCAGTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------GG-TG------AC-G--------A-G-------T-TC-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACTT-
gi|130232                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAC-A---T-A---AA---------------------------A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ACTT-GGAT---C----T--------CT---------TG-
gi|130233                     : TAGGTTTA--G-TCTATTCAA-AATTT-GTTGAAA-A-TA-------AG-TG------AC-T--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-AC
gi|130234                     : TAGGCTTG--A-TCTATTTAA-AATTT-G---GAA-A-GG-------TG-TG------AT-A--------G-G-------T-GA-AGTC-A--------A-G--------TGA-GCA-TTTT-AGGC---A-C-AT--------GT---------CG-TG-C
gi|130235                     : TAAGCTTA--C-TCTATTTAA-AATTT-G---GAA-A-GG-------TG-TG------AT-A--------G-G-------T-GA-AGTC-A--------G-T--------TGA-GCA-TTTT-AGCC---A-C-AT--------GT---------CG-TG-C
gi|130236                     : TAGGTTTA--G-TCCTTTCAA-AATC------AAA-A-GG-------AGATG------AC-C--------G-G-------T-AA-AATC-A--------G-GTGATCACTTGA-ACG-A-TT-AAGC---CAC-AA--------AT---------GG-GG-CCTT-TTGTT
gi|130237                     : TAGACATA--G-TCCATTCAC-AATTTTG---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-C--------G-T--------TTA-GCA-ACTT-A
gi|130238                     : TAGACTTT--A-TCCATTAAA-AAT-------------GA-------A--TG------AC-A--------G-G-------T-GA-AA-A-A--------G-G--------TGA-GCG-ATTT-AGGC---T-T--T--------GT---------TG-TG-CCCC-TTGTT
gi|130239                     :  AGGTTTA--G-TACATACAA-AATTT-G---AAA-AAGA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-ACA-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130240                     :  AGGCTTA--G-TCCATATAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC------------G-------T-AA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-AGGCAGGG-C-AT--------CT---------TG-GG-ACTC-TTGTT
gi|130241                     :  AGGTTTA--G-TCTAATCAA-A-TTT-G---AAA-A-GA-------AG-CG------AC-A--------A-G-------T-GA-AACC-T--------G-G--------TGA-GGG-AC-T-AG-----C-C-AA--------AT---------TG-GA-CCTC-TTGTT
gi|130242                     :  AGGCTTA--GCTTGATTCAA-GATTT-G---AAA-A-GA-------AG-GG------GC-A--------G-G-------T-GA-AA-C-A--------G-G--------TGA-ACA-ACTT-A
gi|130243                     :   GGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AT-A--------T-G-------T-AA-AACC-A--------G-A--------TTG-GCG-GCTT-AGGC---C-C-AT--------AT---------TG-GA-CCTC-TTGTT
gi|130244                     :   GACTTA--G-TCCATACAA-A-TTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AGTC-A--------A-A--------TGA-GCG-ACTT-A
gi|130245                     :   GGCTTG--G-TCTTTTCAA-AATTT-G---AAA-A-TA-------AG-TG------AC-ATATGTCGCC-A-------T-GA-AATC-G--------G-A--------TGG-ACG-TCTT-TTGC---C-T-AT---------T---------TG-GG-CATC-GCGTT
gi|130246                     :    GCTTA--A-TCCTTTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-C--------A-G-------T-AA-ACTG-A--------A-A--------TGA-GTG-ACTT-
gi|130247                     :     CTTA--G-TCCTTTCAA-AATTT-G---ATT-T-GA-------AG-TG------AC-C--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATTT-TGGT---C-C-ATTTGATCCATT---------TG-GA-TCTC-TTG
gi|130248                     :      TTA--G-TCTATTCAA-TATTA-T---AAA-G-GA-------AG-TG------A--------------------------AATA-A--------A-G--------TGA-ATG-ACTT-AGGC---C-C-AT---------T---------TG-GG-TCTC-TTGTT
gi|130249                     :      TTA--A-TCCATTCAA-AGTTT-G---AAA-T-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-TG-AATC-A--------A-G--------TGA-GCT-ACT
gi|130250                     :      TTA--A-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-C-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-TG-AATT-A--------A-G--------TGA-GCT-ACT
gi|130251                     :       TA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---GTA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------A-GA-AATC-A--------G-T--------TGA-ACA-TCTC-AGGT---C-C-AT---------T---------CG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130252                     :       TA--G-TTCATTCAG-AATTT-C---AAA-A-GA-------AG-GA------AC-A--------G-G-------A-TA-GACA-A--------G-A--------TGG-GCA-ACTT-AGGC---T-C-A---------GT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130253                     :       TA--G-CCCATTCAT-CATTT-A---AAA-A-GA-------AG-TG------AT-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-A--------CGA-GTG-ACTT-TGGC---C-C-
gi|130254                     :       TA--G-TTCATTCAA-TATTT-G---AAA-G-AA-------A---G------AC-A--------T-G-------T-GA-AAGA-AAAGAC---G-A--------TGA-GCG-ACTT-A
gi|130255                     :        A--G-TTCATACAA-AATAT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA----C-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTTAAAGT---C-C-AT--------CT---------TG-GG-AATT-TTGTT
gi|130256                     :        A--G-TCCATTCAA-AATTT-A---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-G-------T-TA-AGTC-A--------G-G--------TAA-GCG-ACTTGGGGC---C-CAAT--------TT---------T---G-CCTC-TTGTT
gi|130257                     :                    AA-AATTT-T---AAA-A----------AG-TGCTATGGAC-A--------CCA-------T-GA-G-TC-A--------G-T--------AGA-GCGTCCTC-AGGC---C-C--T--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130258                     :              catagtAG-AATTT-C---AAA-A----------AG-TG------CT-A--------T-GGCCACTAT-GA-G-TC-A--------G-A--------AGA-GCGTCCTC-AGGC---C-C--T--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130259                     :              catagaAG-AATTT-C---AAA-A----------AG-TG------CT-A--------T-GGCCACTTT-GA-G-TC-A--------GTA--------TGA-GCGTCCTC-AGGC---C-C--T--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130260                     :               catagtA-AATTT-G---AAA-G-AA-------AG-TG------GC-A--------T-G-------G-GA-AACC-A--------G-A--------CGC-ACG-ACTT-TGGT---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTG-TAGTT
gi|130261                     :           atatcATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GT-------GA-TG------AC-A--------A-G-------T-GG-AACA-A--------G-A--------TGA-GTG-AATA-AGGC---C-C-AT--------TT---------T--GG-CCTC-TTGTT
gi|130262                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------TTGA-AATC-A--------G-A--------CGA-GCA-ACTT-GGGC---C-C-AT---------T---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130263                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TT------ACAA--------G-G-------T-GA-AATC-AGGTACCTCG-G--------TAA-GTG-ACTT-AGGC---T-T-GT---------T---------TG-GG--CTC-TTGTT
gi|130264                     :                   CAA-AATTT-G---A-----GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-A
gi|130265                     :                   CAA-AATTT-G---AGA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-ATG-ACTA-AGGC---C-A-A---------GT---------TG-AG-CCTC-TTGTT
gi|130266                     :                   CAA-AATTG-G---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A----------G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GTG-ACCT-AGGC---C-C-AT--------
gi|130267                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------A--A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------T-G--------TGA-GCA-ACTT-TGGC---C-A-AT---------T---------TG-AT-CCTA-TTGCT
gi|130268                     :                   CAC-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AA-A--------G-G-------C-G--AATC-A--------G-G--------TGA-ACG-ACTT-GGGC---C-C-----------CT---------TG-
gi|130269                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-
gi|130270                     :                    AA-AGTTT-G---AAA-A-CA-------AT-TG------AC-AT-------G-G-------TGGA-AATA-A--------G-A--------TGA-ATG-ACTT-GGGC---A-C--T--------TT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130271                     :                     A-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AT-A--------T-G-------T-GA-AACA-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-AAGT---C-C-AT--------CT---------AG-GG-CCTC-TTTTT
gi|130272                     :                     A-AATTT-G---ATA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGA---C-C-AT--------TTCAGACTAAATG-GG-CATC-TTGTT
gi|130273                     :                     A-AATTT-A---AAATA-AATCACATTAG-TG------AC-A--------T-A-------T-GA-AAGC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-A--C---T-C-A---------CT---------TA-GGTCCTT-TTG
gi|130274                     :                         TTT-G---AAA-A-GG-------AGGCA------AC-T--------T-T-------T-AA----C-A--------G-G--------TGA-GCG-ATTT-AGGG---C-C-AT--------CA---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130275                     :                              ---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------T-A-------T-GA-AATT-G--------G-G--------TTA-GCA-TCTT-AAAC---C-C-AT---------T---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130276                     :                                         -------AG-TG------GC-A--------T-G-------T-GA-AA-C-A--------G-GA-------TGA-GCA-ACTT-AGGT---C-C-AT--------AT---------TG-GG-TCTC-TTGTT
gi|130277                     :                                                            C-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTA-CCGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTA-TTAT
gi|130278                     :                                                                        -G-------T-GA-TACA-A--------G-A--------TAA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AA--------TC---------TG-GG-CCTC-ATGTT
gi|130279                     :                                                                                   tA-AGTC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATAT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130280                     :                                                                                    A-AGTC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATAT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130281                     :                                                                                         C-A--------G-A--------TGA-GCG-ATGT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130282                     :                                                                                         C-A--------G-A--------TGA-GCG-ATAT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                         111111111                          
lowQualScore                  :         11 0     0   0     0 111   0 0  2222222  1  111111  0 6666666666 3333333 1  0    0 33333333 0 22222222   0   1    1    111 0 0  000000000 222222222  0  0    0     
lowQualScore                  :         .. .     .   .     . ...   . .  .......  .  ......  . .......... ....... .  .    . ........ . ........   .   .    .    ... . .  ......... .........  .  .    .     
lowQualScore                  :         22 9     3   6     6 111   6 6  0000000  2  777777  6 3333333333 8888888 2  6    6 44444444 6 66666666   6   7    2    222 7 7  000000000 999999999  7  8    8     
consensus                     : TAGGCTTA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------N-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
Reference ( family-396 )      : TAGGCTTA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------N-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130211                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ACTT-TGGC---C-C-AC--------TT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130212                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAC-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-T-------T-GA-AACC-A--------G-G--------TGC-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130213                     : TATGCTTA--G-CCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGAGGTG-TCTT-ATGT---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130214                     : TAGGCTTA--G-TTGATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AT-TG------AC-T--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GTG-ACTT-AGGT---C-C-AT--------CT---------TT-GG-CCTC-TTGTT
gi|130215                     : TAGGTTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC------------G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TAA-GCG-ACTT-GGGC---C-A-A---------CT---------TG-GG-CCTCTTTGTT
gi|130216                     : TAGGCTCA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TA------AC-A--------T-G-------T-GA-AGCC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-GGGC---
gi|130217                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---A------A-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AGCA-A--------G-A--------TGA-GTG-ACTT-AGGG---C-C--T--------CT---------TG-
gi|130218                     : TAGGCTTA--C-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ATTT-
gi|130219                     : TATGCTTAAAG-TCGATTCAA-AATTT-G---TAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACCT-AGGT---C-C-A---------AT---------TG-GA-CCTC-TTGTT
gi|130220                     : TAGGCTTA--C-TCAATGCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-G--AATCGA--------G-T--------TGA-GCA-ACTT-AGAA---C-C-AT---------T---------TC-AA-CCTC-TT
gi|130221                     : TAGGCTTA--A-TCTATTCAA-TATTT-G---AAA-A-GA-------TA-TA------AC-A--------G-G-------T-AA-AACA-A--------G-G--------TGA-GCT-TCTT-AAGC---C-C-A---------CT---------TG-GG-CTTC-TTGT
gi|130222                     : TGGGCTTA--A-CCCATTCAA-AATTA-G---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-T-------T-GA-TATC-A--------G-G--------TGA-GCA-GCTT-AAGC---A-C-AT---------T---------TG-GG-CCT
gi|130223                     : TAGGTTTA--G-TTCATTCAA-AATCT-G---AAA-T-GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-----ATC-A--------G-G--------TGA-G-----TT-AGGC---C-C-AT---------T---------TG-GG-C
gi|130224                     : TAAGCTTA--G-TCCATTAAG-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------T-GATGATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACTT-TGA-----------------------------TA-GG-CCTT-TTGT
gi|130225                     : TAGGCTGA--G-TGCATTCAACAATTT-T---AAA-------------G-TA------AA-G--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACTT-AGGC---C-C-A---------GT---------TG-AA-CCTC-TT
gi|130226                     : TAGGCTTA--T-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-TA-------AT-TG------AC-A--------G-C-------T-GA-AATT-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-
gi|130227                     : TAGGCTAA--G-T--A---AA-AAATT-G---AAA-A-GA-------AG-TT------AC-A--------C-T-------A-GG-AATC-A--------A-G--------TGA-ACG-ACTT-AGAA---C-C-AT--------C----------TG-GG-CCTC-TTCTT
gi|130228                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATGT-G---AAA-A-GA-------AA-T--------C-A--------------------------C-A--------G-A--------TGC-GTG-ACTT-TGAT---C-C-AT---------T---------AG-GG-CTTT-TT
gi|130229                     : TATGCTTG--G-TCCATTCAA-AACTG-G---GAA-A-GA-------AG-GG------AT-C--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TAA-GTG-ATGT-AGAC---C-T--T--------TT---------TGAGA-TCTC-TTGTT
gi|130230                     : TATGCTTA--G-TCCTTTCAA-AATGT-A---AAA-A-GA-------AC-T---------------------G-------T----AATC-T--------G-G--------TGA-GCC-ACTA-AGGC---C-C-AT--------C----------TG-AA-CCTC-TTGTT
gi|130231                     : TAGGCTTA--G-TTCAGTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------GG-TG------AC-G--------A-G-------T-TC-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACTT-
gi|130232                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAC-A---T-A---AA---------------------------A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ACTT-GGAT---C----T--------CT---------TG-
gi|130233                     : TAGGTTTA--G-TCTATTCAA-AATTT-GTTGAAA-A-TA-------AG-TG------AC-T--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-AC
gi|130234                     : TAGGCTTG--A-TCTATTTAA-AATTT-G---GAA-A-GG-------TG-TG------AT-A--------G-G-------T-GA-AGTC-A--------A-G--------TGA-GCA-TTTT-AGGC---A-C-AT--------GT---------CG-TG-C
gi|130235                     : TAAGCTTA--C-TCTATTTAA-AATTT-G---GAA-A-GG-------TG-TG------AT-A--------G-G-------T-GA-AGTC-A--------G-T--------TGA-GCA-TTTT-AGCC---A-C-AT--------GT---------CG-TG-C
gi|130236                     : TAGGTTTA--G-TCCTTTCAA-AATC------AAA-A-GG-------AGATG------AC-C--------G-G-------T-AA-AATC-A--------G-GTGATCACTTGA-ACG-A-TT-AAGC---CAC-AA--------AT---------GG-GG-CCTT-TTGTT
gi|130237                     : TAGACATA--G-TCCATTCAC-AATTTTG---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-C--------G-T--------TTA-GCA-ACTT-A
gi|130238                     : TAGACTTT--A-TCCATTAAA-AAT-------------GA-------A--TG------AC-A--------G-G-------T-GA-AA-A-A--------G-G--------TGA-GCG-ATTT-AGGC---T-T--T--------GT---------TG-TG-CCCC-TTGTT
gi|130239                     :  AGGTTTA--G-TACATACAA-AATTT-G---AAA-AAGA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-ACA-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130240                     :  AGGCTTA--G-TCCATATAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC------------G-------T-AA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-AGGCAGGG-C-AT--------CT---------TG-GG-ACTC-TTGTT
gi|130241                     :  AGGTTTA--G-TCTAATCAA-A-TTT-G---AAA-A-GA-------AG-CG------AC-A--------A-G-------T-GA-AACC-T--------G-G--------TGA-GGG-AC-T-AG-----C-C-AA--------AT---------TG-GA-CCTC-TTGTT
gi|130242                     :  AGGCTTA--GCTTGATTCAA-GATTT-G---AAA-A-GA-------AG-GG------GC-A--------G-G-------T-GA-AA-C-A--------G-G--------TGA-ACA-ACTT-A
gi|130243                     :   GGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AT-A--------T-G-------T-AA-AACC-A--------G-A--------TTG-GCG-GCTT-AGGC---C-C-AT--------AT---------TG-GA-CCTC-TTGTT
gi|130244                     :   GACTTA--G-TCCATACAA-A-TTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AGTC-A--------A-A--------TGA-GCG-ACTT-A
gi|130245                     :   GGCTTG--G-TCTTTTCAA-AATTT-G---AAA-A-TA-------AG-TG------AC-ATATGTCGCC-A-------T-GA-AATC-G--------G-A--------TGG-ACG-TCTT-TTGC---C-T-AT---------T---------TG-GG-CATC-GCGTT
gi|130246                     :    GCTTA--A-TCCTTTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-C--------A-G-------T-AA-ACTG-A--------A-A--------TGA-GTG-ACTT-
gi|130247                     :     CTTA--G-TCCTTTCAA-AATTT-G---ATT-T-GA-------AG-TG------AC-C--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATTT-TGGT---C-C-ATTTGATCCATT---------TG-GA-TCTC-TTG
gi|130248                     :      TTA--G-TCTATTCAA-TATTA-T---AAA-G-GA-------AG-TG------A--------------------------AATA-A--------A-G--------TGA-ATG-ACTT-AGGC---C-C-AT---------T---------TG-GG-TCTC-TTGTT
gi|130249                     :      TTA--A-TCCATTCAA-AGTTT-G---AAA-T-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-TG-AATC-A--------A-G--------TGA-GCT-ACT
gi|130250                     :      TTA--A-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-C-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-TG-AATT-A--------A-G--------TGA-GCT-ACT
gi|130251                     :       TA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---GTA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------A-GA-AATC-A--------G-T--------TGA-ACA-TCTC-AGGT---C-C-AT---------T---------CG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130252                     :       TA--G-TTCATTCAG-AATTT-C---AAA-A-GA-------AG-GA------AC-A--------G-G-------A-TA-GACA-A--------G-A--------TGG-GCA-ACTT-AGGC---T-C-A---------GT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130253                     :       TA--G-CCCATTCAT-CATTT-A---AAA-A-GA-------AG-TG------AT-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-A--------CGA-GTG-ACTT-TGGC---C-C-
gi|130254                     :       TA--G-TTCATTCAA-TATTT-G---AAA-G-AA-------A---G------AC-A--------T-G-------T-GA-AAGA-AAAGAC---G-A--------TGA-GCG-ACTT-A
gi|130255                     :        A--G-TTCATACAA-AATAT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA----C-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTTAAAGT---C-C-AT--------CT---------TG-GG-AATT-TTGTT
gi|130256                     :        A--G-TCCATTCAA-AATTT-A---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-G-------T-TA-AGTC-A--------G-G--------TAA-GCG-ACTTGGGGC---C-CAAT--------TT---------T---G-CCTC-TTGTT
gi|130257                     :                    AA-AATTT-T---AAA-A----------AG-TGCTATGGAC-A--------CCA-------T-GA-G-TC-A--------G-T--------AGA-GCGTCCTC-AGGC---C-C--T--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130258                     :              catagtAG-AATTT-C---AAA-A----------AG-TG------CT-A--------T-GGCCACTAT-GA-G-TC-A--------G-A--------AGA-GCGTCCTC-AGGC---C-C--T--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130259                     :              catagaAG-AATTT-C---AAA-A----------AG-TG------CT-A--------T-GGCCACTTT-GA-G-TC-A--------GTA--------TGA-GCGTCCTC-AGGC---C-C--T--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130260                     :               catagtA-AATTT-G---AAA-G-AA-------AG-TG------GC-A--------T-G-------G-GA-AACC-A--------G-A--------CGC-ACG-ACTT-TGGT---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTG-TAGTT
gi|130261                     :           atatcATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GT-------GA-TG------AC-A--------A-G-------T-GG-AACA-A--------G-A--------TGA-GTG-AATA-AGGC---C-C-AT--------TT---------T--GG-CCTC-TTGTT
gi|130262                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------TTGA-AATC-A--------G-A--------CGA-GCA-ACTT-GGGC---C-C-AT---------T---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130263                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TT------ACAA--------G-G-------T-GA-AATC-AGGTACCTCG-G--------TAA-GTG-ACTT-AGGC---T-T-GT---------T---------TG-GG--CTC-TTGTT
gi|130264                     :                   CAA-AATTT-G---A-----GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-A
gi|130265                     :                   CAA-AATTT-G---AGA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-ATG-ACTA-AGGC---C-A-A---------GT---------TG-AG-CCTC-TTGTT
gi|130266                     :                   CAA-AATTG-G---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A----------G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GTG-ACCT-AGGC---C-C-AT--------
gi|130267                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------A--A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------T-G--------TGA-GCA-ACTT-TGGC---C-A-AT---------T---------TG-AT-CCTA-TTGCT
gi|130268                     :                   CAC-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AA-A--------G-G-------C-G--AATC-A--------G-G--------TGA-ACG-ACTT-GGGC---C-C-----------CT---------TG-
gi|130269                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-
gi|130270                     :                    AA-AGTTT-G---AAA-A-CA-------AT-TG------AC-AT-------G-G-------TGGA-AATA-A--------G-A--------TGA-ATG-ACTT-GGGC---A-C--T--------TT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130271                     :                     A-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AT-A--------T-G-------T-GA-AACA-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-AAGT---C-C-AT--------CT---------AG-GG-CCTC-TTTTT
gi|130272                     :                     A-AATTT-G---ATA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGA---C-C-AT--------TTCAGACTAAATG-GG-CATC-TTGTT
gi|130273                     :                     A-AATTT-A---AAATA-AATCACATTAG-TG------AC-A--------T-A-------T-GA-AAGC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-A--C---T-C-A---------CT---------TA-GGTCCTT-TTG
gi|130274                     :                         TTT-G---AAA-A-GG-------AGGCA------AC-T--------T-T-------T-AA----C-A--------G-G--------TGA-GCG-ATTT-AGGG---C-C-AT--------CA---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130275                     :                              ---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------T-A-------T-GA-AATT-G--------G-G--------TTA-GCA-TCTT-AAAC---C-C-AT---------T---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130276                     :                                         -------AG-TG------GC-A--------T-G-------T-GA-AA-C-A--------G-GA-------TGA-GCA-ACTT-AGGT---C-C-AT--------AT---------TG-GG-TCTC-TTGTT
gi|130277                     :                                                            C-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTA-CCGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTA-TTAT
gi|130278                     :                                                                        -G-------T-GA-TACA-A--------G-A--------TAA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AA--------TC---------TG-GG-CCTC-ATGTT
gi|130279                     :                                                                                   tA-AGTC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATAT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130280                     :                                                                                    A-AGTC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATAT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130281                     :                                                                                         C-A--------G-A--------TGA-GCG-ATGT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130282                     :                                                                                         C-A--------G-A--------TGA-GCG-ATAT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT


blockSeqs                     :         AA                   TTG        TCACATT  A  CTATGG    TATGTCGCC  GCCACTA T         GGTACCTC   TGATCACT       T    A    AGG      TTGATCCAT CAGACTAAA
blockSeqs                     :         .                    .          .        G  .         CC         GCCACTT G         AAGAC      A              T    G    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         TG         .       .         .          .              T    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        A         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        G         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         A          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        T         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        G         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         A          .       .         .          .              .    .    .        G         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        A         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        G         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         C          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         A          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         A          .       .         .          .              .    .    .        A         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        A         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        G         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        T         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         A          .       .         .          .              .    .    .        T         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        G         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        T         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         A          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        T         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         A          .       .         .          .              .    .    .        A         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        T         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        C         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :         .                    .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         A          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         A          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         A          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         G          .       .         .          .              .    .    .        .         .        
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .                           
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .                           
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .                           
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .    .                           
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         T          .       .         .          .              .    .                                
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         .          .       .         .          .              .    .                                
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         .          .       .         .          .              .    .                                
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         .          .       .         .          .              .    .                                
blockSeqs                     :                              .          .        .  .         .          .       .         .          .              .    .                                
blockSeqs                     :                                         .        .  .         .          .       .         .          .              .    .                                
blockSeqs                     :                                                               .          .       .         .          .              .    .                                
blockSeqs                     :                                                                          .       .         .          .              .    .                                
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blockSeqs                     :                                                                                            .          .                                                    


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TAGGCTTA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------N-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
finalCons                     : TAGGCTTA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------N-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT





Alignments
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lowQualScore                  :         .. .     .   .     . ...   . .  .......  .  ......  . .......... ....... .  .    . ........ . ........   .   .    .    ... . .  ......... .........  .  .    .     
lowQualScore                  :         22 9     3   6     6 111   6 6  0000000  2  777777  6 3333333333 8888888 2  6    6 44444444 6 66666666   6   7    2    222 7 7  000000000 999999999  7  8    8     
consensus                     : TAGGCTTA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------N-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
Reference ( family-396 )      : TAGGCTTA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------N-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130211                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ACTT-TGGC---C-C-AC--------TT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130212                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAC-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-T-------T-GA-AACC-A--------G-G--------TGC-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130213                     : TATGCTTA--G-CCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGAGGTG-TCTT-ATGT---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130214                     : TAGGCTTA--G-TTGATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AT-TG------AC-T--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GTG-ACTT-AGGT---C-C-AT--------CT---------TT-GG-CCTC-TTGTT
gi|130215                     : TAGGTTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC------------G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TAA-GCG-ACTT-GGGC---C-A-A---------CT---------TG-GG-CCTCTTTGTT
gi|130216                     : TAGGCTCA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TA------AC-A--------T-G-------T-GA-AGCC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-GGGC---
gi|130217                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---A------A-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AGCA-A--------G-A--------TGA-GTG-ACTT-AGGG---C-C--T--------CT---------TG-
gi|130218                     : TAGGCTTA--C-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ATTT-
gi|130219                     : TATGCTTAAAG-TCGATTCAA-AATTT-G---TAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACCT-AGGT---C-C-A---------AT---------TG-GA-CCTC-TTGTT
gi|130220                     : TAGGCTTA--C-TCAATGCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-G--AATCGA--------G-T--------TGA-GCA-ACTT-AGAA---C-C-AT---------T---------TC-AA-CCTC-TT
gi|130221                     : TAGGCTTA--A-TCTATTCAA-TATTT-G---AAA-A-GA-------TA-TA------AC-A--------G-G-------T-AA-AACA-A--------G-G--------TGA-GCT-TCTT-AAGC---C-C-A---------CT---------TG-GG-CTTC-TTGT
gi|130222                     : TGGGCTTA--A-CCCATTCAA-AATTA-G---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-T-------T-GA-TATC-A--------G-G--------TGA-GCA-GCTT-AAGC---A-C-AT---------T---------TG-GG-CCT
gi|130223                     : TAGGTTTA--G-TTCATTCAA-AATCT-G---AAA-T-GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-----ATC-A--------G-G--------TGA-G-----TT-AGGC---C-C-AT---------T---------TG-GG-C
gi|130224                     : TAAGCTTA--G-TCCATTAAG-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------T-GATGATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACTT-TGA-----------------------------TA-GG-CCTT-TTGT
gi|130225                     : TAGGCTGA--G-TGCATTCAACAATTT-T---AAA-------------G-TA------AA-G--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACTT-AGGC---C-C-A---------GT---------TG-AA-CCTC-TT
gi|130226                     : TAGGCTTA--T-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-A-TA-------AT-TG------AC-A--------G-C-------T-GA-AATT-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-
gi|130227                     : TAGGCTAA--G-T--A---AA-AAATT-G---AAA-A-GA-------AG-TT------AC-A--------C-T-------A-GG-AATC-A--------A-G--------TGA-ACG-ACTT-AGAA---C-C-AT--------C----------TG-GG-CCTC-TTCTT
gi|130228                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAA-AATGT-G---AAA-A-GA-------AA-T--------C-A--------------------------C-A--------G-A--------TGC-GTG-ACTT-TGAT---C-C-AT---------T---------AG-GG-CTTT-TT
gi|130229                     : TATGCTTG--G-TCCATTCAA-AACTG-G---GAA-A-GA-------AG-GG------AT-C--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TAA-GTG-ATGT-AGAC---C-T--T--------TT---------TGAGA-TCTC-TTGTT
gi|130230                     : TATGCTTA--G-TCCTTTCAA-AATGT-A---AAA-A-GA-------AC-T---------------------G-------T----AATC-T--------G-G--------TGA-GCC-ACTA-AGGC---C-C-AT--------C----------TG-AA-CCTC-TTGTT
gi|130231                     : TAGGCTTA--G-TTCAGTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------GG-TG------AC-G--------A-G-------T-TC-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-ACTT-
gi|130232                     : TAGGCTTA--G-TCCATACAC-A---T-A---AA---------------------------A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCA-ACTT-GGAT---C----T--------CT---------TG-
gi|130233                     : TAGGTTTA--G-TCTATTCAA-AATTT-GTTGAAA-A-TA-------AG-TG------AC-T--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCA-AC
gi|130234                     : TAGGCTTG--A-TCTATTTAA-AATTT-G---GAA-A-GG-------TG-TG------AT-A--------G-G-------T-GA-AGTC-A--------A-G--------TGA-GCA-TTTT-AGGC---A-C-AT--------GT---------CG-TG-C
gi|130235                     : TAAGCTTA--C-TCTATTTAA-AATTT-G---GAA-A-GG-------TG-TG------AT-A--------G-G-------T-GA-AGTC-A--------G-T--------TGA-GCA-TTTT-AGCC---A-C-AT--------GT---------CG-TG-C
gi|130236                     : TAGGTTTA--G-TCCTTTCAA-AATC------AAA-A-GG-------AGATG------AC-C--------G-G-------T-AA-AATC-A--------G-GTGATCACTTGA-ACG-A-TT-AAGC---CAC-AA--------AT---------GG-GG-CCTT-TTGTT
gi|130237                     : TAGACATA--G-TCCATTCAC-AATTTTG---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-C--------G-T--------TTA-GCA-ACTT-A
gi|130238                     : TAGACTTT--A-TCCATTAAA-AAT-------------GA-------A--TG------AC-A--------G-G-------T-GA-AA-A-A--------G-G--------TGA-GCG-ATTT-AGGC---T-T--T--------GT---------TG-TG-CCCC-TTGTT
gi|130239                     :  AGGTTTA--G-TACATACAA-AATTT-G---AAA-AAGA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-ACA-ACTT-AGGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130240                     :  AGGCTTA--G-TCCATATAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC------------G-------T-AA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-AGGCAGGG-C-AT--------CT---------TG-GG-ACTC-TTGTT
gi|130241                     :  AGGTTTA--G-TCTAATCAA-A-TTT-G---AAA-A-GA-------AG-CG------AC-A--------A-G-------T-GA-AACC-T--------G-G--------TGA-GGG-AC-T-AG-----C-C-AA--------AT---------TG-GA-CCTC-TTGTT
gi|130242                     :  AGGCTTA--GCTTGATTCAA-GATTT-G---AAA-A-GA-------AG-GG------GC-A--------G-G-------T-GA-AA-C-A--------G-G--------TGA-ACA-ACTT-A
gi|130243                     :   GGCTTA--G-TCCATACAA-AATTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AT-A--------T-G-------T-AA-AACC-A--------G-A--------TTG-GCG-GCTT-AGGC---C-C-AT--------AT---------TG-GA-CCTC-TTGTT
gi|130244                     :   GACTTA--G-TCCATACAA-A-TTT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA-AGTC-A--------A-A--------TGA-GCG-ACTT-A
gi|130245                     :   GGCTTG--G-TCTTTTCAA-AATTT-G---AAA-A-TA-------AG-TG------AC-ATATGTCGCC-A-------T-GA-AATC-G--------G-A--------TGG-ACG-TCTT-TTGC---C-T-AT---------T---------TG-GG-CATC-GCGTT
gi|130246                     :    GCTTA--A-TCCTTTCAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-C--------A-G-------T-AA-ACTG-A--------A-A--------TGA-GTG-ACTT-
gi|130247                     :     CTTA--G-TCCTTTCAA-AATTT-G---ATT-T-GA-------AG-TG------AC-C--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATTT-TGGT---C-C-ATTTGATCCATT---------TG-GA-TCTC-TTG
gi|130248                     :      TTA--G-TCTATTCAA-TATTA-T---AAA-G-GA-------AG-TG------A--------------------------AATA-A--------A-G--------TGA-ATG-ACTT-AGGC---C-C-AT---------T---------TG-GG-TCTC-TTGTT
gi|130249                     :      TTA--A-TCCATTCAA-AGTTT-G---AAA-T-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-TG-AATC-A--------A-G--------TGA-GCT-ACT
gi|130250                     :      TTA--A-TCCATTCAA-AATTT-G---AAA-C-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-TG-AATT-A--------A-G--------TGA-GCT-ACT
gi|130251                     :       TA--G-TCCATTCAA-AATTT-G---GTA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------A-GA-AATC-A--------G-T--------TGA-ACA-TCTC-AGGT---C-C-AT---------T---------CG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130252                     :       TA--G-TTCATTCAG-AATTT-C---AAA-A-GA-------AG-GA------AC-A--------G-G-------A-TA-GACA-A--------G-A--------TGG-GCA-ACTT-AGGC---T-C-A---------GT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130253                     :       TA--G-CCCATTCAT-CATTT-A---AAA-A-GA-------AG-TG------AT-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-A--------CGA-GTG-ACTT-TGGC---C-C-
gi|130254                     :       TA--G-TTCATTCAA-TATTT-G---AAA-G-AA-------A---G------AC-A--------T-G-------T-GA-AAGA-AAAGAC---G-A--------TGA-GCG-ACTT-A
gi|130255                     :        A--G-TTCATACAA-AATAT-G---AAA-G-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------T-GA----C-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTTAAAGT---C-C-AT--------CT---------TG-GG-AATT-TTGTT
gi|130256                     :        A--G-TCCATTCAA-AATTT-A---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-G-------T-TA-AGTC-A--------G-G--------TAA-GCG-ACTTGGGGC---C-CAAT--------TT---------T---G-CCTC-TTGTT
gi|130257                     :                    AA-AATTT-T---AAA-A----------AG-TGCTATGGAC-A--------CCA-------T-GA-G-TC-A--------G-T--------AGA-GCGTCCTC-AGGC---C-C--T--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130258                     :              catagtAG-AATTT-C---AAA-A----------AG-TG------CT-A--------T-GGCCACTAT-GA-G-TC-A--------G-A--------AGA-GCGTCCTC-AGGC---C-C--T--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130259                     :              catagaAG-AATTT-C---AAA-A----------AG-TG------CT-A--------T-GGCCACTTT-GA-G-TC-A--------GTA--------TGA-GCGTCCTC-AGGC---C-C--T--------CT---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130260                     :               catagtA-AATTT-G---AAA-G-AA-------AG-TG------GC-A--------T-G-------G-GA-AACC-A--------G-A--------CGC-ACG-ACTT-TGGT---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTG-TAGTT
gi|130261                     :           atatcATTCAA-AATTT-G---AAA-A-GT-------GA-TG------AC-A--------A-G-------T-GG-AACA-A--------G-A--------TGA-GTG-AATA-AGGC---C-C-AT--------TT---------T--GG-CCTC-TTGTT
gi|130262                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------T-G-------TTGA-AATC-A--------G-A--------CGA-GCA-ACTT-GGGC---C-C-AT---------T---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130263                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TT------ACAA--------G-G-------T-GA-AATC-AGGTACCTCG-G--------TAA-GTG-ACTT-AGGC---T-T-GT---------T---------TG-GG--CTC-TTGTT
gi|130264                     :                   CAA-AATTT-G---A-----GA-------AG-TG------AC-A--------G-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-A
gi|130265                     :                   CAA-AATTT-G---AGA-A-GA-------AA-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-ATG-ACTA-AGGC---C-A-A---------GT---------TG-AG-CCTC-TTGTT
gi|130266                     :                   CAA-AATTG-G---AAA-A-GA-------AA-TG------AC-A----------G-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GTG-ACCT-AGGC---C-C-AT--------
gi|130267                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------A--A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------T-G--------TGA-GCA-ACTT-TGGC---C-A-AT---------T---------TG-AT-CCTA-TTGCT
gi|130268                     :                   CAC-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AA-A--------G-G-------C-G--AATC-A--------G-G--------TGA-ACG-ACTT-GGGC---C-C-----------CT---------TG-
gi|130269                     :                   CAA-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------A-G-------T-GA-AATC-A--------G-A--------TGA-
gi|130270                     :                    AA-AGTTT-G---AAA-A-CA-------AT-TG------AC-AT-------G-G-------TGGA-AATA-A--------G-A--------TGA-ATG-ACTT-GGGC---A-C--T--------TT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130271                     :                     A-AATTT-G---AAA-A-GA-------AG-TG------AT-A--------T-G-------T-GA-AACA-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTT-AAGT---C-C-AT--------CT---------AG-GG-CCTC-TTTTT
gi|130272                     :                     A-AATTT-G---ATA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------G-A-------T-GA-AATC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-AGGA---C-C-AT--------TTCAGACTAAATG-GG-CATC-TTGTT
gi|130273                     :                     A-AATTT-A---AAATA-AATCACATTAG-TG------AC-A--------T-A-------T-GA-AAGC-A--------G-G--------TGA-GCG-ACTT-A--C---T-C-A---------CT---------TA-GGTCCTT-TTG
gi|130274                     :                         TTT-G---AAA-A-GG-------AGGCA------AC-T--------T-T-------T-AA----C-A--------G-G--------TGA-GCG-ATTT-AGGG---C-C-AT--------CA---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130275                     :                              ---AAA-A-GA-------AG-TG------AC-A--------T-A-------T-GA-AATT-G--------G-G--------TTA-GCA-TCTT-AAAC---C-C-AT---------T---------TG-GG-CCTC-TTGTT
gi|130276                     :                                         -------AG-TG------GC-A--------T-G-------T-GA-AA-C-A--------G-GA-------TGA-GCA-ACTT-AGGT---C-C-AT--------AT---------TG-GG-TCTC-TTGTT
gi|130277                     :                                                            C-A--------T-G-------T-GA-AACC-A--------G-A--------TGA-GCG-ACTA-CCGC---C-C-AT--------CT---------TG-GG-CCTA-TTAT
gi|130278                     :                                                                        -G-------T-GA-TACA-A--------G-A--------TAA-GCG-ACTT-AGGC---C-C-AA--------TC---------TG-GG-CCTC-ATGTT
gi|130279                     :                                                                                   tA-AGTC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATAT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130280                     :                                                                                    A-AGTC-A--------G-G--------TGA-GCG-ATAT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130281                     :                                                                                         C-A--------G-A--------TGA-GCG-ATGT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT
gi|130282                     :                                                                                         C-A--------G-A--------TGA-GCG-ATAT-AGGG---C-C-AT--------CT---------TG-GC-CCTC-TTGTT