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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|158534 : ACAG--CAAC------TATGCTATGTAGG---------AATG-TAT---CAAC---ATC----GGCT----------GT--AA----G--AGT--A-T-AC-G-C--TT--A--AACTT-TACCGA-T-------TACAC--GG-A------------TT------------TAA--TCG--CTAATGCCCGGAA-A------------ATTCCGTA------A-----AC------G---G---AT--A---T--TAC------------T---AC-------TAGAT
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gi|158537 : TAA--CCAC------TGTACTATGCAGG---------AATT-TTA---CAAT---GTA----AAAG----------GT--AT----A----T--T-T-ATTG-T--TT--ATAAACCT-AATCAC-T-------TACCC--AG-GCTGTCACATA--TT------------TAAAATTG--ACAATGCCAGGAA-A------------TT-CTGAA------CG-TTTGC------G---A---AT--A---T--AAC------------T---G---------AGATCA
gi|158538 : AA--ACAC------TGTGCTATGTAGG---------AGTA-TAA---CAAG---ATC----GGCC----------GT--AT----C--AAT--A-T-AA-A-T--TT--T--AACTT-AACCGC-T-------TACCC--GT-G------------CT------------TAA--TCG--ATGATTCCCGGAA-A------------TTTTCAGT------CG-TTAAC------G---A---AT--A---T--AA
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gi|158541 : ATGTAGG---------AATA-AAA---CAAG---ATC----AGCC----------AT--AT----A--AAT--C-T-AA-A-C--TT--A--AACTT-GACT-T-T-------TACTC--GG-G------------TT------------TAA--TTG--AAAATGCCCGAAA-A------------TTTCCAAA------CT-TTTAT------G---G---AT--A---T--
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gi|158545 : GCTATATAGG---------AATA-TTA---CATC---GTC----AAAA----------GT--AT----A--AAC--C----A-A-TCATT--A--AATT------GCAT-------T----------------------TT------------TAA--CCG--ATGATACCCGGAA-A------------TTTCTGAA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--A
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gi|158549 : ---------AATA-TAT---CAAA---TTC----GGCA----------GT--ACGTCAA--AAT--C-T-AA-C-T--GG--A--GACTT-AACCAA-T-------CACCC--GG-A------------TT------------TAA--TCG--ATGAT--------------------------------------------------G---G---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAAAT
gi|158550 : ----------GT--AT----A----T--C-T-AA-C-T--TT--A--AA-TT-AACTGC-T-------TATCC--TG-G------------TT------------TAA--TCG--AGAATGCTCGGAA-A------------TTTCCAAA------TA-TTTAC------G---G---AT--C---T--AA-----------------AC-------TAGATCA
gi|158551 : T--AT----A--AA---C-T-TA-C-T--TC--A--AACTA-AACCGC-T-------TACCC--GG-ATCGGTGTACATTTT------------CAA--TCG--ATGATGCCCGAAA-A------------TTTCCGAA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAC------------
gi|158552 : --AAT--CCT-AA-G-T--TT--A--AACTT-TACCGC-T-------TAGTC--TA-G------------CT------------TAA--ACG--ATGATGCCGGGTA-A------------TTTCCGGA------CG-TTGAC------T---G---AT--A---T--TAC------------
gi|158553 : -T-AA-T-T--TT--A--AGCCT-AACTGC-T-------TTTGC--GG-G------------TT------------TAA--ACG--ATGATACACGGAA-A------------TTTCCGAA------CG-GTTGT------G---G---AT--A---T--AAC------------T---
gi|158554 : -------TGCCC--GG-T------------TT------------CAG--TCG--TTGATGCCCGGAA-A------------TATCCGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---
gi|158555 : T------------TAA--TCG--ATGATGCCCTGAA-A------------TTTCCAAA------CA-TTTAC------G---A---AT------C--GAT------------T---AC-------TGA
gi|158556 : ac--TCG--ATGATGCCCAGAA-A------------TTGCCGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAT------------T---AC-------
gi|158557 : GCTCGGAA-A------------TTTACGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAGATCA
gi|158558 : GCCCTGAA-A------------TTTCCGGA------CG-TTTAC------G---A---AT--A---T--AAC------------C---AT-------TTAATCA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|158531 : TATAA--CCGC------TATGCCACATAGG---------AATA-TAT---TAAG---ATC----AGTG----------GT--AT----A--AAT--C-C-AA-G-T--TG--A--A-ACTT-AACCCC-T-------TATCC--GG-A------------TT------------TAA--TAA--TTGATGGCTGGAA-T------------TTCCCAAA------CA-TTTAC------A---A---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAAATCA
gi|158532 : TATAA--CCAC------TATGCTATGTAGG---------AATA-TAT---CAAG---GTC----GACA----------GT--AT----A--AAC--C-T-AT-G-T--TG--A--A-ACTA-AACCGT-C-------TATCC--GG-A------------TT------------TGA--TCG--ATGATGTCCGGAC-A------------TTTCC
gi|158533 : TATGA--TCAC------TG-GCTATGAAGGCATATATATAATA-TAA---CAAG---ATC----GGCT----------GT--AT----A--AAT--C-T----G-TA-TT--A--A-TCTT-TACAGC-T-------TGCTC--GA-G------------TT------------TAA--TTG--ATGATGTCTGGAA-A------------TTTCTGAA------CG-TCTAC------G---G---AT--A---T--AAT------------T---
gi|158534 : ACAG--CAAC------TATGCTATGTAGG---------AATG-TAT---CAAC---ATC----GGCT----------GT--AA----G--AGT--A-T-AC-G-C--TT--A--A-ACTT-TACCGA-T-------TACAC--GG-A------------TT------------TAA--TCG--CTAATGCCCGGAA-A------------ATTCCGTA------A-----AC------G---G---AT--A---T--TAC------------T---AC-------TAGAT
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gi|158537 : TAA--CCAC------TGTACTATGCAGG---------AATT-TTA---CAAT---GTA----AAAG----------GT--AT----A----T--T-T-ATTG-T--TT--ATAA-ACCT-AATCAC-T-------TACCC--AG-GCTGTCACATA--TT------------TAAAATTG--ACAATGCCAGGAA-A------------TT-CTGAA------CG-TTTGC------G---A---AT--A---T--AAC------------T---G---------AGATCA
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gi|158542 : ctataGCAATGTAGG---------AATA-TCA---CAAT---ATT----GGAC----------AT--AT----A--AAT--C-T-AA-G-T--TT--A--A-ACTT-AACCGA-T-------TACTC--AG-G------------TT------------TAA--TCA--ATATTGCCTGGAA-A------------TGTCCAAA------TG-TTTAC------A---GATTAT--A---T--GTT------------T---GC-------AAAATCA
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gi|158545 : GCTATATAGG---------AATA-TTA---CATC---GTC----AAAA----------GT--AT----A--AAC--C----A-A-TCATT--A--A-ATT------GCAT-------T----------------------TT------------TAA--CCG--ATGATACCCGGAA-A------------TTTCTGAA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--A
gi|158546 : CTATATAGG---------AATA-CAA---CAAG---ATG----GCCA----------AT--AT----T--TCT--T-T-A----T--TT--A--A-ACTT-AATCGT-T-------TACCC--GT-G------------TT------------TTA--TCG--ATGATGCACAGAA-A------------TATCCGGA------CG-TTTAC------G---G---
gi|158547 : CTACGCAGG---------AATA-TTA---CAAGTTGATT----GGTG----------TT-------------T--T-T-A--------T--A--T-ACCT-AACCGC-T-------TACC---GG-G------------CTGCCGCGCATTTATAA--TCG--ATGATACCTGGAA-A------------CTTTCAAA------CG-TTTACCTATATGGCCG---AT--A---T--AACTTA---------T---GC-------TAAACCA
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gi|158552 : --AAT--CCT-AA-G-T--TT--A--A-ACTT-TACCGC-T-------TAGTC--TA-G------------CT------------TAA--ACG--ATGATGCCGGGTA-A------------TTTCCGGA------CG-TTGAC------T---G---AT--A---T--TAC------------
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gi|158518 : AGATATGA--CCAC------TGTGCCATGTGGG---------AATA-TCA---CAAT---ATA----GACC----------AT--AT----A--AAT--T-T-AA-G-T--TT--T--A-ACTT-AACTGC-T-------TACTC--AG-G------------TT------------TAA--T----ACAAT---------A------------TTTTTGGT------AA-TTTAC------G---G---AT--A---A--AAC------------
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gi|158527 : ATTTAA--CCAC------TATGCCATGTAGA---------AATA-TCA---TAAG---TTC----GGTC----------GT--AT----A--AAT--C-T-AT-G-T--TT--A--A-ACTT-AATCGC-T-------TACTC--GA-G------------TA------------TAA--TCA--A--ATACCCGGAA-A-------------GTGTGAA------TG-TTTAC------G---G---ATG-A---C--AAC------------
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gi|158529 : ATATAAAGCCAC------CA-GCCATGCATA---------AATA-TAA---CAAGTT-AT-----GGCG----------TA--AT----T--AAT--C-A-TA-C-T--AT--A--A-ACTT-AACCAC-T--------ACTT--GG-G------------TT------------TAA--CCG--ATGATGCCAGGAA-A------------TTTCCGAA------TG-TTTAC------A---G---AT--T---T--AA
gi|158530 : ATGTAA--TCAC------TGTTCTATGTATG---------AATA-TAG---TAAG---ATA----TGCG----------GT--GT----A--ATT--C-T-AA-C-T--TA--A--A-AATT-AACCGC-T-------TACAC--GT-G------------AT------------TAA--TTG--AT
gi|158531 : TATAA--CCGC------TATGCCACATAGG---------AATA-TAT---TAAG---ATC----AGTG----------GT--AT----A--AAT--C-C-AA-G-T--TG--A--A-ACTT-AACCCC-T-------TATCC--GG-A------------TT------------TAA--TAA--TTGATGGCTGGAA-T------------TTCCCAAA------CA-TTTAC------A---A---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAAATCA
gi|158532 : TATAA--CCAC------TATGCTATGTAGG---------AATA-TAT---CAAG---GTC----GACA----------GT--AT----A--AAC--C-T-AT-G-T--TG--A--A-ACTA-AACCGT-C-------TATCC--GG-A------------TT------------TGA--TCG--ATGATGTCCGGAC-A------------TTTCC
gi|158533 : TATGA--TCAC------TG-GCTATGAAGGCATATATATAATA-TAA---CAAG---ATC----GGCT----------GT--AT----A--AAT--C-T----G-TA-TT--A--A-TCTT-TACAGC-T-------TGCTC--GA-G------------TT------------TAA--TTG--ATGATGTCTGGAA-A------------TTTCTGAA------CG-TCTAC------G---G---AT--A---T--AAT------------T---
gi|158534 : ACAG--CAAC------TATGCTATGTAGG---------AATG-TAT---CAAC---ATC----GGCT----------GT--AA----G--AGT--A-T-AC-G-C--TT--A--A-ACTT-TACCGA-T-------TACAC--GG-A------------TT------------TAA--TCG--CTAATGCCCGGAA-A------------ATTCCGTA------A-----AC------G---G---AT--A---T--TAC------------T---AC-------TAGAT
gi|158535 : ATGA--CCAC------CGCGCTATGCAGG---------ATTA-TAA---CAAA---AAC----G-TA----------GT--AT----A--AAT--C-T-AA-C-T--TT--A--A-ACTT-AATCAC-T-------TACTC--CG-G------------TT------------CAA--TTG--AT
gi|158536 : TGA--CCAT------TGCGCCATGTAAG---------ACAA-TAT---CAAG---ATC----GGCT----------GT--AT----C--AAT--C-T-AA-C-T--TT--A--A-ACTC-GACCGC-T-------TATTT--GG-G------------TT------------TAA--TC------ATGCCCAGAA-A------------TATCCGGT------CG-TTGAT------G---A---AT--ATATT--AAC------------T---AC-------TAAATC
gi|158537 : TAA--CCAC------TGTACTATGCAGG---------AATT-TTA---CAAT---GTA----AAAG----------GT--AT----A----T--T-T-ATTG-T--TT--ATAA-ACCT-AATCAC-T-------TACCC--AG-GCTGTCACATA--TT------------TAAAATTG--ACAATGCCAGGAA-A------------TT-CTGAA------CG-TTTGC------G---A---AT--A---T--AAC------------T---G---------AGATCA
gi|158538 : AA--ACAC------TGTGCTATGTAGG---------AGTA-TAA---CAAG---ATC----GGCC----------GT--AT----C--AAT--A-T-AA-A-T--TT--T--A-ACTT-AACCGC-T-------TACCC--GT-G------------CT------------TAA--TCG--ATGATTCCCGGAA-A------------TTTTCAGT------CG-TTAAC------G---A---AT--A---T--AA
gi|158539 : AA--CAAC------TGTGCTATATAGG---------ATTA-TAA---CAAA---AGC----AGCT----------GT--AT----A--ACTA-T-T-AT-G-T--TT--A--A--CTT-AATCCT-T-------TACTC--GG-G------------TT------------TAA--TCG--ATGATGCCAGGAA-A------------TGTCCGAA------AT-TTTAT------G---G---ATG-G---T--AAC------------T---AC-------
gi|158540 : AC------AACGCTATGTAGG---------AATA-AAA---CAAG---ATT----ATTG----------AT--AT----ATAGAT--C-T-AA-C-T--TT--A--A-ACTT-AACCGC-T-------TACCC--AGAG------------TT------------TAA--CCA--ATGATACCCGGAA-A------------CTTCAAGA------TA-TTTAC------A---G---AT--A---T--
gi|158541 : ATGTAGG---------AATA-AAA---CAAG---ATC----AGCC----------AT--AT----A--AAT--C-T-AA-A-C--TT--A--A-ACTT-GACT-T-T-------TACTC--GG-G------------TT------------TAA--TTG--AAAATGCCCGAAA-A------------TTTCCAAA------CT-TTTAT------G---G---AT--A---T--
gi|158542 : ctataGCAATGTAGG---------AATA-TCA---CAAT---ATT----GGAC----------AT--AT----A--AAT--C-T-AA-G-T--TT--A--A-ACTT-AACCGA-T-------TACTC--AG-G------------TT------------TAA--TCA--ATATTGCCTGGAA-A------------TGTCCAAA------TG-TTTAC------A---GATTAT--A---T--GTT------------T---GC-------AAAATCA
gi|158543 : GCTATGTAGG---------AATA-TAA---CAAA---ATC----GG------------GT--A-----A--AAC--A-T-G--G-T--TT--A--A-ACTT-AACCGT-T-------TACCC--GT--------------TT------------TAA--TCG--ACGATGTCCGGAT-A------------TTTTCGGA------CG-TTT
gi|158544 : GCCATGCAGG---------AATA-TAA---CATG---TTT----GGTC----------AT--AC----A--AAT--CTT-AA-G-T--TT--A--A-TCTC-AACTGC-T-------TACTC---T-G------------TT------------TAG--TTG--ATGATGCCTGGAA-A------------TTTACAAA------CA-TTTAT------C---G---CT--A---T--AAC------------T---
gi|158545 : GCTATATAGG---------AATA-TTA---CATC---GTC----AAAA----------GT--AT----A--AAC--C----A-A-TCATT--A--A-ATT------GCAT-------T----------------------TT------------TAA--CCG--ATGATACCCGGAA-A------------TTTCTGAA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--A
gi|158546 : CTATATAGG---------AATA-CAA---CAAG---ATG----GCCA----------AT--AT----T--TCT--T-T-A----T--TT--A--A-ACTT-AATCGT-T-------TACCC--GT-G------------TT------------TTA--TCG--ATGATGCACAGAA-A------------TATCCGGA------CG-TTTAC------G---G---
gi|158547 : CTACGCAGG---------AATA-TTA---CAAGTTGATT----GGTG----------TT-------------T--T-T-A--------T--A--T-ACCT-AACCGC-T-------TACC---GG-G------------CTGCCGCGCATTTATAA--TCG--ATGATACCTGGAA-A------------CTTTCAAA------CG-TTTACCTATATGGCCG---AT--A---T--AACTTA---------T---GC-------TAAACCA
gi|158548 : TATGTAGG---------AATA-TAT---CAAG---ATC----GGCG----------GT--AT----A--AAT--C-C-AA-G-T--TG--A--A-ACTG-AACCGC-T-------TACCC--GG-A------------TT------------TAA--TTG--ATGAAGCCCGGAA-A------------TTTCCTGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---C--A
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gi|158550 : ----------GT--AT----A----T--C-T-AA-C-T--TT--A--A-A-TT-AACTGC-T-------TATCC--TG-G------------TT------------TAA--TCG--AGAATGCTCGGAA-A------------TTTCCAAA------TA-TTTAC------G---G---AT--C---T--AA-----------------AC-------TAGATCA
gi|158551 : T--AT----A--AA---C-T-TA-C-T--TC--A--A-ACTA-AACCGC-T-------TACCC--GG-ATCGGTGTACATTTT------------CAA--TCG--ATGATGCCCGAAA-A------------TTTCCGAA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAC------------
gi|158552 : --AAT--CCT-AA-G-T--TT--A--A-ACTT-TACCGC-T-------TAGTC--TA-G------------CT------------TAA--ACG--ATGATGCCGGGTA-A------------TTTCCGGA------CG-TTGAC------T---G---AT--A---T--TAC------------
gi|158553 : -T-AA-T-T--TT--A--A-GCCT-AACTGC-T-------TTTGC--GG-G------------TT------------TAA--ACG--ATGATACACGGAA-A------------TTTCCGAA------CG-GTTGT------G---G---AT--A---T--AAC------------T---
gi|158554 : -------TGCCC--GG-T------------TT------------CAG--TCG--TTGATGCCCGGAA-A------------TATCCGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---
gi|158555 : T------------TAA--TCG--ATGATGCCCTGAA-A------------TTTCCAAA------CA-TTTAC------G---A---AT------C--GAT------------T---AC-------TGA
gi|158556 : ac--TCG--ATGATGCCCAGAA-A------------TTGCCGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAT------------T---AC-------
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originalCons : CAGATATAA--CCAC------TACGCTATGTAGG---------AATA-TAN---CAAG---ATC----GGCG----------GT--AT----A--AAT--C-T-AA-G-T--TT--A--A-ACTT-AACCGC-T-------TACCC--GG-G------------TT------------TAA--TCG--ATGATGCCCGGAA-A------------TTTCCGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAAATCA
finalCons : CAGATATAA--CCAC------TACGCTATGTAGG---------AATA-TAN---CAAG---ATC----GGCG----------GT--AT----A--AAT--C-T-AA-G-T--TT--A--A-ACTT-AACCGC-T-------TACCC--GG-G------------TT------------TAA--TCG--ATGATGCCCGGAA-A------------TTTCCGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAAATCA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|158520 ): AAATATTACTGTTGCGCCATGTAGGAATTCTATTATATCTTCAGTATAAATATAAGTTTCAACTTAACCTCTTACTCGGGTTTCATCGA
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consensus : CAGATATAA--CCAC------TACGCTATGTAGG---------AATA-TAN---CAAG---ATC----GGCG----------GT--AT----A--AAT--C-T-AA-G-T--TT--A--A-ACTT-AACCGC-T-------TACCC--GG-G------------TT------------TAA--TCG--ATGATGCCCGGAA-A------------TTTCCGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAAATCA
Reference ( family-395 ) : CAGATATAA--CCAC------TACGCTATGTAGG---------AATA-TAN---CAAG---ATC----GGCG----------GT--AT----A--AAT--C-T-AA-G-T--TT--A--A-ACTT-AACCGC-T-------TACCC--GG-G------------TT------------TAA--TCG--ATGATGCCCGGAA-A------------TTTCCGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAAATCA
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gi|158494 : CATATATAA--CCAC------TATGCTATGCAGG---------AATA-TAT---CAAG---ATC----TGTG----------GA--AT----A--AAT--C-TTGA-G-T--TT--A--A-ACTT-AACAGC-T-------TATCT--AG-A------------TT------------TAA--TCA--ATGATGCCTAGAA-A------------TTTCCTGACT----CA-TTTAC------
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gi|158498 : CATATATAA--CCAC------TATGCTATGTAGG---------AATA-C--------------------------------------T----A--AAT--C-T-AA-G-T--TG--G--A-ACTT-AACATC-T-------CACCT--GG-A------------TT------------TAA--TCG--ATGATGCCTGGAA-A------------TATCCGGA------TG-TTTAT------C---A---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAAATCA
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gi|158500 : CAGAAATAA--CCAC------TATGTTATGAAGG---------AATG-TAT---CACA---ATC----GGCT----------GT--AT----A--AAA--A-T-AA-T-T--TG--A--A-ACTA-AACCAC-T-------TACTC--TA-A-------------T------------TAA--TTG--ATGATGCATGGAA-A------------GTCACGGA------GG-TTT-C------G---C---AT--A---T--AAT------------T---AC-------TAAATCA
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gi|158521 : -------TATCC--GG-G------------CT------------GTA--TCG--ATGATGCCCGGAA-A------------TTTCCGAA------T-----------------G---AT--A---T--AAC------------ccgggctgtatcgatgatgcccggaaatttccgaatgatataac
gi|158522 : agatctaaccaccacaagtacgctatacaggaatataacaagatcgacggGATAAAT--CCAC------TATGCTACGTACA---------AATA-AAT---CAAA---GAC----GGCG----------GT--AA----A--AAT--C-T-AA---T--CT--A--AGACTT-GACCGC-T-------TACCA--AG-A------------TT------------TAA--TCG--ATGATGCACGAAA-A------------TTTCCGTA------TG-TTTAC------A---A---CT--G---T--AAC------------T---A
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gi|158528 : ATATGA--CTAC------TGCGTTATGTAGG---------AATA-TAA---CATA---TTT----GGCC----------GT--TT----T--AAT--C-T-TA-A-C--TT--T--A-ACTT-AACCAC-T-------TACTA--AG-G------------TT------------TAA--TCG--ATGCTGACCGGAA-A------------TTTTCGAA------CA-ATTAC------G---T---TT--A---T--ATC------------T---A---------AAATCA
gi|158529 : ATATAAAGCCAC------CA-GCCATGCATA---------AATA-TAA---CAAGTT-AT-----GGCG----------TA--AT----T--AAT--C-A-TA-C-T--AT--A--A-ACTT-AACCAC-T--------ACTT--GG-G------------TT------------TAA--CCG--ATGATGCCAGGAA-A------------TTTCCGAA------TG-TTTAC------A---G---AT--T---T--AA
gi|158530 : ATGTAA--TCAC------TGTTCTATGTATG---------AATA-TAG---TAAG---ATA----TGCG----------GT--GT----A--ATT--C-T-AA-C-T--TA--A--A-AATT-AACCGC-T-------TACAC--GT-G------------AT------------TAA--TTG--AT
gi|158531 : TATAA--CCGC------TATGCCACATAGG---------AATA-TAT---TAAG---ATC----AGTG----------GT--AT----A--AAT--C-C-AA-G-T--TG--A--A-ACTT-AACCCC-T-------TATCC--GG-A------------TT------------TAA--TAA--TTGATGGCTGGAA-T------------TTCCCAAA------CA-TTTAC------A---A---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAAATCA
gi|158532 : TATAA--CCAC------TATGCTATGTAGG---------AATA-TAT---CAAG---GTC----GACA----------GT--AT----A--AAC--C-T-AT-G-T--TG--A--A-ACTA-AACCGT-C-------TATCC--GG-A------------TT------------TGA--TCG--ATGATGTCCGGAC-A------------TTTCC
gi|158533 : TATGA--TCAC------TG-GCTATGAAGGCATATATATAATA-TAA---CAAG---ATC----GGCT----------GT--AT----A--AAT--C-T----G-TA-TT--A--A-TCTT-TACAGC-T-------TGCTC--GA-G------------TT------------TAA--TTG--ATGATGTCTGGAA-A------------TTTCTGAA------CG-TCTAC------G---G---AT--A---T--AAT------------T---
gi|158534 : ACAG--CAAC------TATGCTATGTAGG---------AATG-TAT---CAAC---ATC----GGCT----------GT--AA----G--AGT--A-T-AC-G-C--TT--A--A-ACTT-TACCGA-T-------TACAC--GG-A------------TT------------TAA--TCG--CTAATGCCCGGAA-A------------ATTCCGTA------A-----AC------G---G---AT--A---T--TAC------------T---AC-------TAGAT
gi|158535 : ATGA--CCAC------CGCGCTATGCAGG---------ATTA-TAA---CAAA---AAC----G-TA----------GT--AT----A--AAT--C-T-AA-C-T--TT--A--A-ACTT-AATCAC-T-------TACTC--CG-G------------TT------------CAA--TTG--AT
gi|158536 : TGA--CCAT------TGCGCCATGTAAG---------ACAA-TAT---CAAG---ATC----GGCT----------GT--AT----C--AAT--C-T-AA-C-T--TT--A--A-ACTC-GACCGC-T-------TATTT--GG-G------------TT------------TAA--TC------ATGCCCAGAA-A------------TATCCGGT------CG-TTGAT------G---A---AT--ATATT--AAC------------T---AC-------TAAATC
gi|158537 : TAA--CCAC------TGTACTATGCAGG---------AATT-TTA---CAAT---GTA----AAAG----------GT--AT----A----T--T-T-ATTG-T--TT--ATAA-ACCT-AATCAC-T-------TACCC--AG-GCTGTCACATA--TT------------TAAAATTG--ACAATGCCAGGAA-A------------TT-CTGAA------CG-TTTGC------G---A---AT--A---T--AAC------------T---G---------AGATCA
gi|158538 : AA--ACAC------TGTGCTATGTAGG---------AGTA-TAA---CAAG---ATC----GGCC----------GT--AT----C--AAT--A-T-AA-A-T--TT--T--A-ACTT-AACCGC-T-------TACCC--GT-G------------CT------------TAA--TCG--ATGATTCCCGGAA-A------------TTTTCAGT------CG-TTAAC------G---A---AT--A---T--AA
gi|158539 : AA--CAAC------TGTGCTATATAGG---------ATTA-TAA---CAAA---AGC----AGCT----------GT--AT----A--ACTA-T-T-AT-G-T--TT--A--A--CTT-AATCCT-T-------TACTC--GG-G------------TT------------TAA--TCG--ATGATGCCAGGAA-A------------TGTCCGAA------AT-TTTAT------G---G---ATG-G---T--AAC------------T---AC-------
gi|158540 : AC------AACGCTATGTAGG---------AATA-AAA---CAAG---ATT----ATTG----------AT--AT----ATAGAT--C-T-AA-C-T--TT--A--A-ACTT-AACCGC-T-------TACCC--AGAG------------TT------------TAA--CCA--ATGATACCCGGAA-A------------CTTCAAGA------TA-TTTAC------A---G---AT--A---T--
gi|158541 : ATGTAGG---------AATA-AAA---CAAG---ATC----AGCC----------AT--AT----A--AAT--C-T-AA-A-C--TT--A--A-ACTT-GACT-T-T-------TACTC--GG-G------------TT------------TAA--TTG--AAAATGCCCGAAA-A------------TTTCCAAA------CT-TTTAT------G---G---AT--A---T--
gi|158542 : ctataGCAATGTAGG---------AATA-TCA---CAAT---ATT----GGAC----------AT--AT----A--AAT--C-T-AA-G-T--TT--A--A-ACTT-AACCGA-T-------TACTC--AG-G------------TT------------TAA--TCA--ATATTGCCTGGAA-A------------TGTCCAAA------TG-TTTAC------A---GATTAT--A---T--GTT------------T---GC-------AAAATCA
gi|158543 : GCTATGTAGG---------AATA-TAA---CAAA---ATC----GG------------GT--A-----A--AAC--A-T-G--G-T--TT--A--A-ACTT-AACCGT-T-------TACCC--GT--------------TT------------TAA--TCG--ACGATGTCCGGAT-A------------TTTTCGGA------CG-TTT
gi|158544 : GCCATGCAGG---------AATA-TAA---CATG---TTT----GGTC----------AT--AC----A--AAT--CTT-AA-G-T--TT--A--A-TCTC-AACTGC-T-------TACTC---T-G------------TT------------TAG--TTG--ATGATGCCTGGAA-A------------TTTACAAA------CA-TTTAT------C---G---CT--A---T--AAC------------T---
gi|158545 : GCTATATAGG---------AATA-TTA---CATC---GTC----AAAA----------GT--AT----A--AAC--C----A-A-TCATT--A--A-ATT------GCAT-------T----------------------TT------------TAA--CCG--ATGATACCCGGAA-A------------TTTCTGAA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--A
gi|158546 : CTATATAGG---------AATA-CAA---CAAG---ATG----GCCA----------AT--AT----T--TCT--T-T-A----T--TT--A--A-ACTT-AATCGT-T-------TACCC--GT-G------------TT------------TTA--TCG--ATGATGCACAGAA-A------------TATCCGGA------CG-TTTAC------G---G---
gi|158547 : CTACGCAGG---------AATA-TTA---CAAGTTGATT----GGTG----------TT-------------T--T-T-A--------T--A--T-ACCT-AACCGC-T-------TACC---GG-G------------CTGCCGCGCATTTATAA--TCG--ATGATACCTGGAA-A------------CTTTCAAA------CG-TTTACCTATATGGCCG---AT--A---T--AACTTA---------T---GC-------TAAACCA
gi|158548 : TATGTAGG---------AATA-TAT---CAAG---ATC----GGCG----------GT--AT----A--AAT--C-C-AA-G-T--TG--A--A-ACTG-AACCGC-T-------TACCC--GG-A------------TT------------TAA--TTG--ATGAAGCCCGGAA-A------------TTTCCTGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---C--A
gi|158549 : ---------AATA-TAT---CAAA---TTC----GGCA----------GT--ACGTCAA--AAT--C-T-AA-C-T--GG--A--G-ACTT-AACCAA-T-------CACCC--GG-A------------TT------------TAA--TCG--ATGAT--------------------------------------------------G---G---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAAAT
gi|158550 : ----------GT--AT----A----T--C-T-AA-C-T--TT--A--A-A-TT-AACTGC-T-------TATCC--TG-G------------TT------------TAA--TCG--AGAATGCTCGGAA-A------------TTTCCAAA------TA-TTTAC------G---G---AT--C---T--AA-----------------AC-------TAGATCA
gi|158551 : T--AT----A--AA---C-T-TA-C-T--TC--A--A-ACTA-AACCGC-T-------TACCC--GG-ATCGGTGTACATTTT------------CAA--TCG--ATGATGCCCGAAA-A------------TTTCCGAA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAC------------
gi|158552 : --AAT--CCT-AA-G-T--TT--A--A-ACTT-TACCGC-T-------TAGTC--TA-G------------CT------------TAA--ACG--ATGATGCCGGGTA-A------------TTTCCGGA------CG-TTGAC------T---G---AT--A---T--TAC------------
gi|158553 : -T-AA-T-T--TT--A--A-GCCT-AACTGC-T-------TTTGC--GG-G------------TT------------TAA--ACG--ATGATACACGGAA-A------------TTTCCGAA------CG-GTTGT------G---G---AT--A---T--AAC------------T---
gi|158554 : -------TGCCC--GG-T------------TT------------CAG--TCG--TTGATGCCCGGAA-A------------TATCCGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---
gi|158555 : T------------TAA--TCG--ATGATGCCCTGAA-A------------TTTCCAAA------CA-TTTAC------G---A---AT------C--GAT------------T---AC-------TGA
gi|158556 : ac--TCG--ATGATGCCCAGAA-A------------TTGCCGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAT------------T---AC-------
gi|158557 : GCTCGGAA-A------------TTTACGGA------CG-TTTAC------G---G---AT--A---T--AAC------------T---AC-------TAGATCA
gi|158558 : GCCCTGAA-A------------TTTCCGGA------CG-TTTAC------G---A---AT--A---T--AAC------------C---AT-------TTAATCA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|158520 ): AAATATTACTGTTGCGCCATGTAGGAATTCTATTATATCTTCAGTATAAATATAAGTTTCAACTTAACCTCTTACTCGGGTTTCATCGA