lowQualScore : 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 222222222222222222 333 1111111111111 1
lowQualScore : 2 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 44 1111 4444444444 1111 1 7777777777777 0 33 11 0 3333 0 111 888888888888888888 222 1111 00 111 99999999999 777 666666666666 111 000 111 888888 00 111 0000000000000 44444444444 1 777 111 0 3333333333 22222222 00 2222222222 22222222 888888 555555 222222 22222 1 111111 0 1 4444444 111 22222 1 55555 00 33333 111111 333333 66666 11111 00 00 111 2222 11 44 2222222 0 4 0 0 7777777 11 0 111 2 0 44 1 1 1
lowQualScore : . . ................................................................................................. .. .... .......... .... . ............. . .. .. . .... . ... .................. ... .... .. ... ........... ... ............ ... ... ... ...... .. ... ............. ........... . ... ... . .......... ........ .. .......... ........ ...... ...... ...... ..... . ...... . . ....... ... ..... . ..... .. ..... ...... ...... ..... ..... .. .. ... .... .. .. ....... . . . . ....... .. . ... . . .. . . .
lowQualScore : 2 9 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 44 7777 3333333333 7777 6 9999999999999 7 22 88 7 1111 7 222 999999999999999999 222 4444 99 111 88888888888 222 444444444444 999 222 111 777777 88 000 7777777777777 00000000000 4 333 000 6 1111111111 11111111 88 5555555555 88888888 444444 333333 444444 00000 7 777777 6 2 1111111 111 66666 8 00000 88 99999 888888 333333 22222 77777 99 99 333 2222 00 77 4444444 8 1 8 8 3333333 88 8 333 4 9 44 0 5 9
consensus : TTTTCCC-CAATTGA-GC--AA-AA--A----A-------A-----------------T------T------------T--TTN---A---AA--------------A----TTTTT-CT----TA----------C----A-T-T-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---AA------CC--CA----A-C---TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TANTGGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--C---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---C-T--T----AAA------A------AA-AT--T-----CCC--A--ATT---TC----CCC--T--C-------AATC-GCGC-T-G-T-----T--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
Reference ( gi|40081 ) : TTTTCCC-CAATTGATGC-CAA-AA--A----A-------A-----------------T------T------------T--CCC---A---AA--------------G----TTTTT-AT----TA----------C----A-T-T-A-----A---G-G--G--A-T----A-AAA---AA------CC--CA----A-C---TGGATA----T--GA---A--A--------T---A------------T---T---G---T------AAT--A---TCTGATG------------AT-----------TAGTGGTTAA--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----C-TA--T---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---T-T--T----AAA------A------AA-AT--T-----CCC--A--ATT---TC----CCC--T--C-------AATC-ACGC-T-G-T-----T--TTTT-T---CCCA-ATCTC-AAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40082 : TTTTTCC-CAATTAATGC-AAA-AA--A----A-------A-----------------C------C------------C--ACC---A---AAAATTAAAAAAATATG----TTTTTCAT----CA---------------A-T-T-A-----G---A-G--G--A-T----A-AAA---AC------CC--CA----A-C---TGGATA----T--GACGTA--T--------T---A------------T---T---G---T------AAT--A---TCTGATA------------GT-----------TACTGGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------TTA--AA----------C--------AATA----T-TA--T---GC------T-----TTA-GTTTCA------A-GTTTGC-TAA-----A---A-----AG-T---G-T--T----AAT------A------AA-AT--T-----CCC--A--ATT---TC----CCC--T--C-------AACT-GCGC-T-G-------T--TTTT-C---CCCA-ATCTC-AATGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40076 : TTTTCCC-CAAATGA-----AA-AAC-A----A-------A-----------------T------TAT----------T--TTG---AGGGAA--------------A----TTATT-CT----TA----------C----A-T-T-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---AAAT----CT--CA-----------GGATA----T--GT---A--A--------T---A------------T---T---G---TTGT---AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TAATTGTTAG--A---AC-ATT----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----C-TG--C---AC------T-----TTA-TTTCCC------A-GTTTGG-T-------A---A-----AA-T---C-T--T----AAA------A------AA-----T-----CCC--A--ATT---TC----CAC--TGAC-------AATC-AT-T-T-G-T-----T--ATTT-C---CC-------T-GAAGGCTT-
gi|40077 : TTTTCCC-CAAATGA-----AA-AAC-A----A-------A-----------------T------T------------A--TTT---G---AG--------------GGATATTATT-CT----TA----------C----A-T-T-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---AATT----CT--CA-----------GGATA----T--GT---A--A--------T---A------------T---T---G---TTGT---AAA--A---TTTGATA------------AT-----------TAATTGTTAG--A---AC-ATT----------AT--------CTT--AA----------T--------AGTG----C-TG--C---AC------T-----TTA-TTTTCT------A-GTTTTT-T-------A---A-----AA-C---C-T--T----AAA------A------AA-----T-----CCC--A--ATT---TC----CCC--TGAC-------AATC-AC-C-T-G-T-----T--ATTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCACAATATCCAGGAT-AAAcgtaatatccaggataaa
gi|40078 : TTTTCCC-CAAATAA-----AA-AAC-A----A-------A-----------------T------TAT----------T--TTG---AGGGAA--------------A----TTATT-CT----TA----------T----A-T-A-A-----G---G-G--G--A-T----G-AAA---AAAT----CT--CA-----------GGATA----T--GA---A--A--------T---A------------T---T---G---TTGT---AAT--A---TCTTATG------------AT-----------TAATTGTTAG--A---AC-ATT----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----C-TG--C---AC------T-----TCA-TTTCCC------A-GTTTGG-T-------A---A-----AT-C---C-T--T----AAA------A------AA-----T-----CCA--A--ATT---TC----CAC--TGAC-------AATC-AC-C-T-G-T-----T--ATTT-T---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCTAATATTCAGGAT-AAA
gi|40080 : TTTTCCC-AAATTGA-----AA-AAC-A----A-------A-----------------T------TA-----------T--TTG---AGGGAA--------------A----TTATT-CT----TA----------C----A-T-T-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---AATT----CT--CA-----------GGATA----T--GA---A--T--------TTTTG------------T---T---G---T------AAT--A---TTTGATA------------AT-----------TAATTGTAAG--A---AC-ATT----------AT--------CTA--AA----------C--------AGTG----C-TG--G---AC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---T-----AA-C---C-T--T------A------A------CA-AT--T-----CCA--A--ATT---TC----CACAGA--C-------AATC-AC-C-T-G-T-----T--ATTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCCAATATCCAGGA
gi|40092 : tTTTTTCT-CAATTGAGGC--AA-AA--A----A-------G-----------------T------T------------T------------AA--------------T----TTTTT-TT----TA----------C----A-T-C-A-----------G--G--A-T----A-AAA---AA------AA--CA----A-CAATTGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AC-----------TGTTGGTTAG--A---AC-CTG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--C---AC------T-----TTA-TTTTCA------A-GTTTGT-TA------A---A-----AG-T---C-T--T----AAA------A------tgaa
gi|40083 : ttcccaataaaaaaaaaaaaatttcTTTTCCC-CAATTGAAGT-AAA-AA--A----AAAATTTTA-----------------T------T------------T--TTT---A---AA--------------T----CTTTT-TT----TAATTTTTCCTGC----A-T-T-A-----G---A-G--G--A-T----A-AAA---------------------------CGCATA----A--GA---A--G--------T---A------------T---T---A---TTGG---AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TA-TAGTTAG--A---CC-AAG----------AT--------CTT--AA----------C--------AATG----A-TA--C---ACTTTATTT-----TTA-TTTTCG------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---C-T--T----AAA------A------AA-TT--A-----CCC--A--ACT---TC----CTC--T--C-------AAGC-AC-----A-T-----T--TTTA-T---GCCA----TT-AAAGGCT
gi|40079 : TTTTCTC-CAAATGA-----AA-AACAA----ATT-----A-----------------T------T------------T--GTG---AG--AA--------------A----TTATT-CT----TA----------C----A-T-T-A-----G---G-G--G--T-T----A-AAA---AA------TC--TC----A-T-----GATA----T--GT---A--A--------T---A------------T---T---G---T------TGTTAA---TCTGACA------------AT-----------TAATTGTTAG--A---AC-ATT----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----C-TG--C---AT------T-----TTA-ATTGTA------A-GTTTGG-T-------A---A-----AA-C---C-T--T----AAA------A------AA-----T-----CCA--A--ATT---TC----CAC--TGAC-------AATC-AC-C-T-G-T-----T--GTTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCCAATATCCAGGAT-AAA
gi|40086 : TTTTCCCGCAATAGAGGC--AA-AT--A----A-------A-----------------T------T------------TTTCTC---A---AA--------------A----T--------------------------------------------G-G--A--AGC----A-AAA---AA-----------A----A-A---TGGACA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCGGATA------------AA-----------TATTGGTTAG--T---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AATA----T-TA--TTTAGC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---ATTT--AG-C---C-T--T----AAA------A------AA-AT--T-----CCC--A--A
gi|40088 : TTTTTCC-AAATTGAGGC-CAA-AA--A----A-------A-----------------T------T---------------CAC---A---AA--------------A----T----------------------------------------------G--G--A--------AAT---AA------T----A----A-C---TTGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---T---A---T--------T--A---TC-------------------------------------------------AT-----------AT--------CTT--AA----------T--------AGTG----T-TA--T---GC------T-----A-A-CTTTCC------A-ATTTGA-T-------A---A-----AG-C---C-T--T----AAA------A-------A-AT--T-----CCC--A--ATT---TC----CCC--T--C-------AA-----------------------TT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-a
gi|40084 : tttccaattaaaaaatcatatcaaatttttTTTTCCC-C--TTAATGAGCAA-AA--A----A-------AAA---------------T------T------------T---------------------------------TTTTT-CT----TA----------C----A-T---A-----T---G-GC-G--A-T----A-AAA---AA------AT--------A-C------ATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------ATT--A---TCTGATA------------AT-----------TATTGGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TG--C---GC------T-----TTT-TTTTCC------A-GTTTGc
gi|40085 : TTTCCCC-CAACTGAGAC-CAA-AA--A----A-------AAAATTCTAAAATGGAAAT------T------------T--TGG---G---AA--------------T----TTTTT-CT----TA----------C----A-T-A-A-----A---G-G--A--A-T----A-AAA---A--------C--C-------C---TGGATA----T--GA---A--A--------T---AATG---------T---T---A---T------AAT--A---TCTGATC------------AT-----------TAATGGTTAG--A---AT-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGCG----T-TT--C---GC------T-----T
gi|40087 : TTTCCC-AAA---ATGG-AAA-AA--A----A-------AAATAG------------T------T------------T--T----------A--------------A----TTTTT-CT----TA----------C----A-T-T-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---CC------CC--CA----A-C---TGGATA----T--GA---C--A--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTAATC------------AT-----------TTTTGGTTAG--A---AC-ATG------------------------------------------------TG----T-TG--C---AC------T-----TTA-TTTTCC------A-ATTTGC-T-------G---A-----AG-T---C-G--T----AAA------A------AA-ATA-T-----CCC--T--ATT---TC----CCC--T--C-------AAAT-GCAC-T-G-T-----T--TTTT-T---CCTA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCATAAA-
gi|40096 : TTCCC-AAATTGG-----AA-AA--A----A-------A-----------------T------TGTTGTTGTTTTTT--TGT---G---AA--------------A----TTTTC--T----TA----------C----A-G-A-A-----G---G-G--G--A-T----G-AAA---AA------C---------A-C---TGGATA----T--GA---A--A--------T---A------------T---TATAG---T------AAT--A---CCTGGTA------------AG-----------AAATGGTTAG--A---AC-ATG----------TT--------CTT--AT----------C--------AGTG----T-TA--C---TC------T-----CT--TTTT--------A-GTTTGC-T-------ATTGA-----AG-A---T-T--T----AAA------A------AT-AT--C-----CCC--A--ATT---TC----CCA--TG-C-------AATC-ACGC-----T-----T--TTTC-C---CCCA-ATCTC-GACGGCTT-AGGCCTC-TTCCCAATTTACAGGGA-AAA
gi|40095 : TCCC-AAAATGAAAT-AAA-AA--ACTATA-------T-----------------T------T------------T--TTT---A---AA--------------A----TTGTT-CT----TA----------C----A-T-T-C-----G---G-T--G--A-T----A-AAA---GAAGAAGTTG--CA----A-C---TGAATA----T--AA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAC--A---TCTGATA------------GT-----------TATTGGGTAT--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGCA----T-TG--G---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-ATTT
gi|40098 : TCCC-CAAATGA-----AA-AAT-A----A-------A-----------------TATTTTTT------------T--TTT---A---GA--------------A----TTTTT-CT----TC----------C----A-T-T-T-----A---G-GA-G--A-T----A-AAA---CT------CC--CA------C---TGGATG----T--GG---A-----------T---A------------T---T---G---T------AAT--A---GCGGATA------------ATAAATAGTTAATTAATGGTTAG--A---AC-TTG----------AA--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--C---CC------T-----TCG-TT
gi|40099 : CCC-AAATTGAGGC-AAACAA--A----A-------A-----------------T------T------------C--CCT----------------------------TTTTT-ATGTCTTA---------------A-T-T-A-----G---A-G--G--A-T----A-AAA---AA------ACAACA----A-T---AAGATA----T--TA---A--ACTTTATATT---A------------T---T---G---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------CATTGGTTAG--A---AC-ACG----------ATATAAATTTCTT--CA----------C--------AGCA----T-TA--T---GC------TA----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---C-T--T----AAA------A------AA-A---T-----CCC--A--ATT---TC----CCT--T--T-------AATT-ACAC-----------T--TTAT-C---CCCA-ACATCGGAGGGCTT-
gi|40094 : cCC-CAA--AATGA-AAA-AA--A----A-------AATTTTTTT---------T------T------------T--TTT---A---A--------------------TTTTT-CT----TA----------C----A-T-T-A-----G---A-G--G--A-T----A-AAA---AA------AA--CA----A-C---TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TATTGGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C----------------------T---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AG-C---T-TGTT----AAGTTTGTTA------AA-AT--T-----CCT--G--ATT---AC----CCC--T--C-------AATC-TTGC-T-G-T-----T--TTTT-T---CCTA-ATCTT-AAAGGCTT-
gi|40103 : tAA-AG--G----A-------A-----------------A------T------------T--GCA---G---GA--------------A----TTTTT-CT----TA----------C----AGT-T-T-----T---G-G--G--A-T----A-AAT---CA------CC--------A-C---TGGATA----T--GA---T--G--------T---A------------T---TACTG---T------TAT--A---TTGGATT------------AT-----------TATTGGTTTG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--A-----------C--------TTTA----T-TT--C---GC------T-----TTA-TTTTCTTCAGTGA-GTTTGC-TTTGTAACA---G-----AG-C---T-C--TCTTCAAA------A------TA-GT--T-----CTA--A--ATT---TC----ATC--T--C-------GCTC-AATT-T-C-T-----T--TTTT-T---TTCATATTTC-AAAAGCTT-GGGCGTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
gi|40102 : aA-AA--A----A-------A-----------------T----------------------CCC---A---AAATGAGA--------G----TTTTT-CT----TA----------C----A-T-C-ATGTACATGTG-GCAG--A-T----A-AAA---AC------CCTGCAGTATA-G---TGGATA----T--GA---G-----------T---A------------T---TACAG---T------GTT--A---TCTG-TA------------AC-----------TATTTGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TG--T---GC------T-----ATG-TTTACC------A-GTTTGC---------A---ACAGCCAG-C---C-T--T----AAA------A------AT-GT--T-----CCC--A--ATT---TCCACTCCC--T--C-------AATC-ACGC-T-A-T-----T--TCTT-T---CGAA-A-CTC-AAAGGCTT-GAGCCTC-
gi|40097 : gA-AA--A----G-------A-----------------T------T------------T--TTTTTGA---GA--------------A----TTTTT-CT----TA----------C----ATT-T-A-----G---G-G--G--A-T------AGA---AA------CC--TC----A-C---TGGATC----T--GA---A--G--------T---ACAGTCTGTATTGT---T---G---T------AAT--A---TCTGATA------------AC-----------AAATCGTGGG--A---AC-ATG----------AT--------CTA--AA----------C--------AGTG-----------------------------TA-TTTTCC------A-GTTTGC-C-------A---A-----AG-C---C-T--T---------------------A-AT-----------------TT---TC----CCC--T--C-------GATT-GCAC-T-G-T-----T--TTTT-C---Ccataggataaa
gi|40093 : tcccagagtgaat------T------------T--TTC---A---AA--------------------TTTT-CT----TA----------C----A-T-A-A-----G---A-G--G--A-T----A-AAA------------C--CA----A-C---TGGATG----TAAGA---A--G--------T---TGCT---------T---T---G---T------GAT--A---TCTGATA------------AT-----------TATTGGTTAG--G---AC-ACG----------AT--------CTG--AA----------C--------AGTG----T-TA--C---GG------T-----TTA-TTTTCA------A-GTTTGC-T-------G---A-----AG-C---C-T--T----AAA------
gi|40101 : ttcccaaaatcaaaaaaataattatattttatta---A---GA--------------A----TTTTT-CC----CA----------C----A-TAT-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAC---TA------GC--CA------C---TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGATA------------GT-----------TAG---------A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-CA--C---AC------T-----TTA-TT
gi|40105 : ccaaatataataaacatttttatttttttg---AA--------------A----TCTTC-CT----TA----------C----A-T-A-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---AA------C---------A-C---TGGATA----T--GA---A--ATAT-----T---A------------T---T---G---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TAATGG--AATGA---AC-ATG----------AT--------CAT--AA----------C--------AGTG----T-GA--C---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------G---A-----AG-C---T-T--T------A------A------AA-AT--T-----CTT--A--ATT---CC----CCC--T--C-------AATC-ATGC-T-G-------T--TTTT-T---CCCA-ATCTT-GAAGGCTTGGGGCCTC-TTCCCAATTTATAGGAT-AAA
gi|40113 : ttttttgtgtgtA--------------A----TTTTT-CT----TA----------C----A-T-C-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---AA------AC--CA----A-C---TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------GAT--A---TCTGATA------------AT-----------TAATGGTTAG--A---AC-GTG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--C---AC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---C-T--T-----AA------A------AA-CT--T-----CCA--A--ATT---TA----CCC--T--C-------AATA-TCAT-T---T-----T--TTTT-C---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40089 : A--------------A----TTTTT-AT----TA----------C----A-T-C-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---AA------TA--CA----C-C---TGGATA----T--GA---A--G--------TTTTA------------T---T---G---T------AAT--C---TCTGATA------------AT-----------TATTTGTTAG--A---AC-AAG----------AT--------ATT--AT----------C--------AGTG----C-TC--C---AC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---G-----AA-C---C-T--TA---AAA------A------AA-AT--T-----CCC--A--ACT---TC----CCC--T--C-------AATC-AAGC-T-G-------T--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGATT-GGGCCT--TTCCCAATTTCAAGAAA-AA
gi|40114 : ttcccaaaaggaaaaacaatttttttaattttttttttA--------------A----TTTTT-CT----TA----------C----A-T-T-G-----A---A-G--G--A-T----A-AAA---AA------CAA-CA----A-C---TGAATA----T-------------------T---A------------T---T---G---T------AAT--T---TCTGATA------------AT-----------TATTGGTAAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGCG----T-AA--C---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-TTTTGC-T-------T---A-----AG-C---C-A--T----AAA------A------AA-----T-----CCC--A--ATT---TC----CCC--T--T-------AATC-GCGC-T-G-T-----T--TTTT-T---CCAA-AT-TT-GAAGGCTT-GGACCTT-TTCCCAATTTCCAGAAC-AAA
gi|40108 : A--------------A----TTTTT-CT----TA----------C----A-T-T-T-----A---G-G--G--A-A----A-AAA---TA------CT--CA------C---TGGATA----T--GA---T--G--------T---A------------T---TACTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TATTGGTTAG--A---AC-ATG----------GT--------CTT--AA----------C--------TGTG----T-CA--T---AT------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---C-----AG-C---C-T--T----AAA------A------AT-AT--T-----CCC--A--ATT---TC----CCT--T--T-------GATC-GCGT-T-G---------------------------------------GGGTCTC-TTCCCAATTTCCAGAAG-AAA
gi|40111 : ggggggA--------------G----TTTTC--T----TA----------A----A-T---A-----A---G-GC-G--A-T----A-AAA---AA------C---------A-C---TGGATA----T--TA---A--C--------TTTTA------------T---T---G---T------AAA--A---TCTGATA------------AC-----------TATTGGACAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TT--T---TC------T-----TTA-TTTTGC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---T-T--T--------------------GA-AT--TTTCCCCCC--A--ATT---TC----CCG--A--C-------AACC-ATGCTT-G-G-----T--TTTT-T---CC----------------T-GGATCTCTTTCCCAATTTATAGGAATAAA
gi|40100 : gggA--------------A----TTTTT-CT----TAA---------C----A-A-T-A-----G---G-T--T--A-T----A-AAA---AA------AA--C-----A-C---TGGATA----T--GT---A--C--------T---A------------TTAAT---G---T------AAT--A---TCAGATA------------AT-----------TAATGGTCAG--A---AC-ATG----------TT--------CTT--AA----------C--------CGTG----T-TG--C---AC------T-----TCA-TTTTAC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C-----C--T----AAA------A------AG-AT--
gi|40107 : cccaaataatttcaaaatgtgggttgggA--------------A----TCTTT-CT----CA----------C----A-A-T-A-----G---G-G--G--A-T----T-AAA---AA------C---------A-T---TGGATA----T--GA---ATAA--------TT--A------------T---T---G---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TA-TGGTTAG--A---AC-ACG----------AC--------CTC--AA----------TATAATGAAAGTA----A-TG--T---GC------T-----T---TTTTTC------A-GTTTGC-T-------A---T-----TG-C---C-T--T----AAA------A------A
gi|40122 : ttcgatgtg----TTTTT-CT----TA----------C----A-T-T-G-----G---A-G--A--G-T----A-AAA---AG------CC--CA----A-C---TAGATA----T--GA---A--G--------T---ACTA---------T---T---G---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TATTAGTTAG--A---AT-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGCG------TA--T---GT------A-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AT-C---C-T--T----AAA------A------TA-AT--T-----CCT--A--ATT---T-----CCC--T--C-------AATT-GCCT-T-G-------A--TTTT-T---CCCA-ATCTA-GAAAAATT-GGGCCTC-TTCCAAATTCCCAGATA-AAgcaaa
gi|40109 : ----TTTTT-CT----TA----------C----A-T-A-A-----A---G-G--A--T-T----A-AAA---AA------AC--------A-C---TAGGTA----T--GA---A--A--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AT------------AATGGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------ATT--AG----------C--------AGTG----T-TT--T---GC------T-----ATA-TTTTTA------A-GTTTGC-A-------A---A-----AG-C---T-T--TTT--AAA------A------AA-AT--C-----CCC--A--ATT---TC----CTC--C--T-------GATC-AAAC-T-G-T-----T--TTTT-C---TCCA-ATAT-------CTT-GGACCTC-TTCCCAATTTCC
gi|40090 : gagggga----TTTTT-CT----TA----------T----A-T-T-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---A-------CC--CA----A-A---TGGATA----T--GA---A--G--------TGTTA------------T---T---G---G------AAT--A---ACTGAAA------------AT-----------TATTAGT-AA--G---ACGATG----------AT--------ATA--AA----------C--------AATG----T-TA--C---AC------T-----TTA-TTTTCG------A-GTTTGC-T-------A---G-----AG-C---C-T--T----AAA------A------AA-TT--T-----CCC--A--ATT---TC----CTC--T--C-------AATA-ACAC-T-G-----------TTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-tgga
gi|40123 : ttcccaaaataaccattta----TTTTT-CT----AA----------C----A-T-T-A-----C---A-G--A--A-T----A-AATTTTAA------CC--CA----AAC---TGGTTA----T--GA---A--G--------T---A------------T---T---A---TTGG---AAT--A---TATGACA------------AT-----------TATAAATTAG--A---AC-ATA----------AT--------CTT--AA----------CTT------GTTA----CATA--T---GC------T-------A-TT---------------------------A---A-----AG-CCT-T-T--T----AAA------A------AATATAAT-----CAC--A--ATT---TCT---CCC--T--T-------AATC-A-GC-T-G-T-----T--TTTC-----CCCA-ATCTC-CAAGGCAT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40104 : ----TTTTT-CT----TA----------CGTGAA-T-T-T-----A---G-G--G----TGGGGA-AAA---AA------GT--TA------C---TAGATAATTAT--GA---A--A--------T---A------------T---T---A---TTTT---AAT--A---TCTGATA------------AA-----------TAATGGTTAG--A---AC-ATGG---------AT--------CTT--AA----------C--------AG-----------------C------T-----TTG-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---A-T--T----AAG------A------GA-AT--T-----TCC--A--ATT---TT----CTC--T--T-------GATT-GCAC-T-G-------T--TTTT-T---CCCA-ATCTT-GAAGACT
gi|40119 : aaaacaaaaatgagga----TTTTC-CT----TA----------C----A-T-A-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA------------T--CA------C---TGTACA----T--GA---A--A--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TTATGGTTGG--A---AC-ATGTCGGGTCATAAT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-AA--C---GC------T-----TTA-TTTTCC------T-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---T-T--T-------------G------AT-TT--T-----TTC--ACCATT---TC----CGC--C--C-------AGTC-ACAC-T-G-T-----T--TTTTCT---CAAA-ATGTT-GAAGACTT-
gi|40117 : ----TTTTC-AT-----A----------C----A-----A-----G---G-A--G--A-T----A-AAC-----------CC--CC----A-C---TGTAAG----T--GA---T--G--------T---A------------T---TACTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TCATGGTTAT--A---AC-ATG----------AA--------GTT--AA----------A--------AGTG----C-TA--T---GC------T-----TTATTTTTCC------A-GTC----------------------AG-C---C-T--A----AAA------A------AT-AA--T-----CCA--A--ATT---TT----TGC--T--C-------GATT-ACAA-T-G-T-----T--TTTT-T---CCCA-ATCAC-GAAGACTT-
gi|40118 : at----TTTTT-CT----GA----------C----A-T-A-C-----T---G-G--G--A-T----A-AAA---AA------T---------A-C---TGAATA----T--GA---A--ATAT-----T---A------------T---T---G---T------AAT--A---TATGATA------------AT-----------TATTGGTTAG--A---GC-ATG----------AT--------CTT--TA----------T--------AGTG----T-TA--C---AC--------------A-TT----------A-GTTTGCTT-------A---A-----CC-C---T-T--T----Ac
gi|40124 : a----TTTTT-CT----TA----------C----A-T-T-A-----G---G-G--G--A-T----A-A-------------------------C---TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TAATG-------------------------------------CTT---------------------------------TA--T----------------------TTTTC------A-GTTTGC-T-------G---A-----AG-----T-C--T----AAA------A------GA-Actccatagatacacgttttcacgcaccaatcac
gi|40116 : TTTT-CT----TA----------C----A-T-T-A-----G---A-A--G--A-T----A-AAA---CC------CC--CA----A-C---TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---T---G---T------TGT--AGTTTCTGATA------------AT-----------GATTAGTTGA--ATAAAC-ATG----------AT--------CAT--AA----------C--------AGTG------TA--TC--AC------T-----TTA-TTTTCA------A-TTTTAC-T-------A---A-----AG-T---C-T--T----AAA------A------AA-A---T-----CCA--A--ATT---TC----CCC--T--C-------AATC-ATGC-T-G-T-----T--TTTT-T---CCaaat
gi|40121 : aacTTC-AT----TA----------C----A-T-T-A-----A---G-G--A--A-T----A-AAA---AAA-----CT--CA----A-C---TGGATA----T--GA---A--GCAT-----T---A------------T---T---G---T------TAT--A---TCTGATA------------AC-----------TATTGGTTAG--A---AC-ATA----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-CA--C---AC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGCC---T-T--T----AAA------A------AA-----T-----CCC--A--ATT---TT----CCC--T--C-------AATC-ATGC-T-G-T-----T--TTAT-T---CCCA-ATTTC-
gi|40127 : tcaT----TA----------C----A-T-A-A-----G---A-G--G--A-T----A-AAA---AA------GC--CA----A-C---TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATGG---C------AAT--A---TCAGATA------------AT-----------TATTGGTTAT--A---AC--TG----------GT--------CTT--AA----------C--------AGTA----T-TG--C---CC------T-----TTA-TTTTCT------A-GTTTGC-T-------A---A-----AATC---G-T--T----AAA------A------GT-AT--T-----CCC--A--ATT---TC----CCC--T--C-------AATC--TGC-T-G-T-----T--TT-T-T---CCCA-ATCAC-AAAGGTTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCTAGcagaaaaaa
gi|40125 : cT----TA----------C----A-T-T-T-----T---G-G--G--A-T----ATAAA---AA------C----A----A-C---TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCCAATA------------AT-----------TATTGGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AG----------C--------AGTG----T-TG--T---ACAC----T-----TTA-TTTTCC------C-TTTTGT-T-------A---A-----TG-C---C-T--T----AAA------A------AA-AG--T-----CAA--A--ATT---TC----CCC--T--C-------AATC-ACAC-T-G-T-----T--TTTT-T---CC
gi|40120 : tcT----TA----------C----C-T-T-A-----G---G-G--G--A-TTACAA-AAA---AA-----------A----A-C---TCAATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------CATTGGTTAC--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--T---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---C-T--T----TAA------A------AA-AT--T-----CCC--A--A
gi|40128 : ttatttgacT----TA----------C----A-T-TTA-----G---G-G--G--A-T----A-GAA-----------------------C---TGGATA----T--GA---A--G--------TTTTA------------C---T---A---T------GAT--A---TTTGATG------------AT-----------TAATGGTTAG--A---AC-ATG----------AA--------CTT--GA----------C--------AGCG----T-CA------GC------T-----TTA-TTGTCC------A-GTTTGC----------------------C---T-T--T-----AA------A------AA-AT--T-----CCA--A--AAA---TC----TCA--T--C-------AATC-AC-------------------------------TCTC-GAAGGTTT-TGGCCTC-ATTCCAATTTCCAAGAA-AAA
gi|40110 : T----TG----------T----A-T-A-A-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---AA------AT--AA----A-----TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAA--A---TCTGATA------------AT-----------TATTGGTTAG--A---AC-TTG----------AT--------CTT--TA----------C--------AGTT----T-TA--C---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---C-T--T----AAA------AT-----AA-AT--T-----CTC--A--ATT---TC----
gi|40126 : gggaaaaaaatcT----CA----------C----A-T---A-----A---GTG--G--A-T----A-AAA---AA------AC--------A-C---TGGCTA----T--CA---A--A--------T---A------------C----------------------------CTGAT-------------ATG----------TAATGGTAAG--A---AC-ACG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGC--------A--T-----------T-----TTA-GTTTCC------A-ATTT---------------A-----AG-C---T-T--T----AAA------A------AA-----T-----CCC--A--ATT---TG----CCC--T--C-------AATC-GCGC-T-G-T-----T--TTTC-T---C
gi|40106 : tcT----TA----------C----A-T-G-A-----G---G-G--G--A-T----T-AAA---AA------C---------A-C---TGGATG----T--GA---A--A--------T---A------------T---T---A---TTATTATAAT--A---TCTTATACTTACTTGTTACATG----------TAATGGTAAG--A---AT-ATG----------AT--------CTT--AAATTACAATAAC--------AGTG----T-TACAT---GG------T-----T-G-TTTTCC------A-CATTGC-T-------G---A-----AG-G---T-T--TTA--AAA------A------AA-AA--T-----CCA--A--ATT---TA----CCC--T--C-------AATT-GCTC-T-G-T-----T--TTTT-C---CCt
gi|40115 : ttttttggtagtgaatatctcA----------C----A-T-G-C-----G---G-G--G--A-T----A-AAA---AA------C---------A-C---TGGATA----T--GA---A--A--------T---A------------T---T---A---TT-----AAC--A---TCTGATA------------AT-----------TAATTGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGAG----T-AA--C---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AG-C---T-T--T----AAA------A------AA-AA--T-----CC------------TC----CC------C-------AATC-ACAC-T---T-----TAATTTT-T---CCt
gi|40129 : aatttttcaa-T-T-A-----A---A-G--GT-A-T----A-AAA---AA------AA--CA------C---TGGATA----T--GA---A--ATAT-----T---A------------T---T---G---T------AAT--A---TCTGATG------------GA-----------TAATGGTTTT--A---AC--------------AT--------CTT--AC----------C--------AGTG----T-TA--C---TC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTTC-T-------A---A-----AG-C---T-T--T----AAA------A------GA-AT--T-----TCC--A--
gi|40112 : -A-----A---G-G--G--G-G----G-GAA---AA------GC--------A-C---TGGATA----T--GT---A--A--------T---A------------T---TTTTG---T------AAT--A---TTGGATT------------AT-----------TAATGGTAAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTT----T-TC--A---GC------C-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-CTTTT-T--T----AAA------A------AA-----T-----CCC--A--ATT---TC----CCA--T--C-------AATC-GCGC-T-G-T-----T--TTTT-C---CC
gi|40130 : aaaatattctaaacatggaaaa-----A---G-G--GGTA-T----A-AAA---AA------AC--CA------T---TGGATA----T--GG---A--A--------T---A------------T---TACTG---T------TAT--A---TCTGATT------------AT-----------TGATGGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGCG----T-TA--TTATGT------TACACGTTA-TTTTCT------A-GTTTGC-C-------G---C-----AGTC---T-T--A----AAA------A------AA-AA--T-----CCC--A--ATTAATTT----CCC--T--T-------AATTTGCAC-T-G-T-----T--TTTT-T---CC-A-ATCTC-GAAGGTTT-GAGCCTC-TTCCCAAATTCCAGGAA-AAA
gi|40131 : ---G-G--G--A-T----G-AAA---AA-----------A----A-TAT-TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---T---TCTTT------ATT--A---TCTGATA------------TT-----------TGATGGTTAT--A---A---TG----------AT--------CCT--AA----------C--------AGTT----T-TA--T---GC------T-----TTA-TTTTCT------A-GTTTGC-T-------A---C-----GG-T---C-T--T------A------A------AA-AT--T-----CCC--A--ATT---TC----CCC--T--
gi|40134 : ----A-AAA---AA------TC--AA----A-C---TGGATA----T--GA---A--A--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGAGA------------AT-----------TATTAGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C----------TG----T-TT--C---TC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTCGT-T-------T---A-----AG-C---C-T--T-----AA------A------AA-AT--T-----CCC--A--TTT---TC----CTG--T--C-------AGTC-GCGC-T-G-------C--TTTT-T---CCCA-ATCTC-AAAGGCTT-tgac
gi|40132 : -AAA---AA-----------A----A-T---TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------TAT--A---TCTATTA------------AT-----------TATTGGTTAG--A---AC-ATA----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTA----T-TA--C---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AA-C---C-T--T----AAA-------------------------------A--ATT---TC----CTC--T--G-------AATT-GTGC-TGG-T-----T--TTTT-T---CCCA-GTCTT-GAAGGCCT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40091 : A------TC--CA----A-C---TGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TATTGGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------T--------AGTGAACAT-TA--T---GC------T-----TTA-TCTTCC------A-GTTTGCAT-------G---A-----AG-C---C-T--T----AAA------A------AC-AT--------CCC--A--AAT---TC----CCC--T--C-------AATC-ACAC-T-G-------T--TTTT-T---CCCA-ATTTC-CAA
gi|40135 : ttcccaaaatggaaaaaaaaattcttacattGGATA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------CAT--A---TCTGATA------------AT---------------GGTTAG--A---AT-ATA----------AT--------TTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--C---GC------T-----TTA-TTTTTC------ACGTTTGC-T-------A---C-----TG-T---C-T--T----GAA------A------AA-AT--T-----CCC--A--ATT---TC----CCC--T--T-------AATC-GCAC-T-G-------T--TTAT-T---CCCG-ATCTC-GAAAGTTT-attca
gi|40136 : GATA----T--GA---A--G--------TTTCA------------T---T---G---T------CAT--A---TCTGATA------------AT-----------TATTGGATAG--A---AA-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TG--C---AC------A-----TTA-TTTCCC------A-GTTTGC-T-------A---G-----AG-C-----C--T----AAA------A------AA-TT--T-----CCC--A--ATT---TC----CCG--T--C-------AATC-ACAT-T-GTT-----T--TTTT-T---CCCA-ACCTC-GAAG
gi|40137 : GATG----T--AA---A--A--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCCGAAA------------AC-----------TAAAGGTAAG--A---AC-ATA----------AT--------CTTTTAA----------C--------AGTA----T-TA--C---GT------T-----TTA-ATATTC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AG-C---C-T--T-------------A------AA-AT--T-----TCCTAA--ATT---TC----CCC--T--CATTGTTTAATC-GCGA-T-G-------A--TTTT-T---CCCA-ATGT--AGAGGCTT-TCACCTA-CTCCAAATTTCCAGGAA-AAAat
gi|40133 : ATG----T--GA---G--A--------T---G------------TAG-T---T---T------GAT--A---T--GATGTAAT--------AT-----------TA----TTAG--A---A--ATG----------AT--------CTT--AA----------T--------AGTG----T-TA--C---AC------T-----TTA-TTTTGT------A-GTTTGT-T-------A---A-----AA-C---C-A--T----AAA------A------AG-G---------CCC--A--AAT---TC----TCC--T--C-------AATC-CTGC-T-G-TGTTTTT--TTTC-T---CCCA-ATTTT-GAAGACTT-GGACCTC-TTCCCAATTTCCAG
gi|40138 : aaaagagtatcggtatatacA----T--GA---A--G--------T---A------------T---TATTG---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TACTGGTTAG--A---AC-ATG----------AG--------CTT--AA----------C--------AGTG----G-TA--C---CC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------T---A--------C---TGG--T----AAA------ACTGGTCAA-TT--T-----CCA--A--ATT---TC----CCA--A--A-------AATC-GCGC-T-G----------TTTT-T---CCCA-ACCTC-AAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40139 : ---A--A--------T---A------------T---T---G---C------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TAATGATTGA--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--T---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTAAC-T-------A---A-----AG-C---T-T--T----AAA------AAT----AA-ATAAT-----CCC--A--ATT---TC----CCC--T--C-------AATC-CCAC-T-GAT-----T--TTTT-C---CCCA-ATCTC-CAAGAC
gi|40140 : taat---A------------T---C---G---T------TAT--A---TCTGATA------------AT-----------TTATGGTTAG--A---AC-ATA----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TG--C---GC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---T-T--T----AAA------A------AA-A----------AG--A--ATT---GC----TCC--T--C-------AATA-GTGC-T-G-T-----T--TTTT-T---TCCA-ATCTT-GAAGGCTT-cctgaat
gi|40141 : ------------T---T---T---T------AAT--A---TCTGTTA------------GT-----------TATTGGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--C---GC------T-----TTA-TTTACC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---C-T--T----AAA------A------AA-AA--T-----CTC--A--ATT---TC----CCC--T--C-------AATC-ACAA-T-G-T-----T--GTTT-
gi|40142 : ---T------AAT--A---TCTGATA------------AT-----------TAATGGTTGG--A---AC-ATG----------AT--------GTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--G---GC------T-----TTATTTTTCC------A-ATTTGC-T-------A---A-----AT-C---T-T--T----TAA------A------AA-A---T-----CCC--A--ATT---TG----CCC--T--C-------AAT
gi|40143 : --A---TCTGATA------------AT-----------TAATGGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------TTT--AA----------C--------AGT-------TA--C---AC------T-----TTA-TTTTCC------A-GTT
gi|40144 : -----------TAGTTGTTAG--A---AC-ATG----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--C---GC------T-----TTA-TTTTCT------A-GTTTGC-TA------A---A-----AG-C---C-T--T----AAA------A------GA-TT--T-----TCC--A--ATT---TC----CTC--T--A-------AATC-AAGC-----T-----T--TTTT-T---CCAA-ATCTC-AAAGACTT-GGGCCTC-TTCCCAAT
gi|40146 : --A---AC-ATG----------AT--------CTT--GG----------C--------TGTG----T-TA--C---AC------T-----TTATTTTTCC------T-GTTTGC-T-------A---C-----AG-C---C-T--T-----AA------A------AA-GT--T-----CCA--A--ATT---AT----TTC--T--T-------GATC-ACGC-T-G-T-----T--TTTT-TTCCCCCA-ATGTC-AAAGGTTT--GGCCTC-GTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
gi|40145 : TA----------AT--------CTT--AA----------C--------AGTG----T-TA--T---GC------T-----TTA-TTT-CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AG-C---C-T--T----AGA------A------AA-AT--T-----CCC--A--GTT---TC----CCC--T--C-------ATTT-GTGC-T-G-T-----T--TTTT-----------TCTC-GAAGGCTT-
gi|40147 : gttacatcatttttg--------AGTG----T-CA--T---AC------T-----TTA-TTTTTC------A-GTTTGC-T-------A---C-----AG-T---C-T--T----AAA------A------AT-AT--T-----CCC--A--ATT---TC----CCC--T----------GTTC-A----T-A-T-----TC-TTTT-T---TCCA-ATCTC-GAAGGCTT-
Alignments
lowQualScore : 222222 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222222222222222
lowQualScore : 5555 66 777777 22 1 1 555 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6666666666 0 0 0 5555555 222222222 0 11 1 1111 0 111 777777777777777777 00 1111 00 11111 0 222222222 111 00 333333333333 33333333333 2 111 3333333333 22222222 00 2222222222 22222222 22222222 1111 00 111 1 1 111111 111111 0 0 4444444 111 22222 333 11 00 444 111111 333333 0 66666 11111 00 00 111 3333 11 44 2222222 0 2 3 0 0 777777 11 0 111 0 0 0 1 1 1
lowQualScore : .... .. ...... .. . . ... .............................................................. .......... . . . ....... ......... . .. . .... . ... .................. .. .... .. ..... . ......... ... .. ............ ........... . ... .......... ........ .. .......... ........ ........ .... .. ... . . ...... ...... . . ....... ... ..... ... .. .. ... ...... ...... . ..... ..... .. .. ... .... .. .. ....... . . . . . ...... .. . ... . . . . . .
lowQualScore : 7777 33 777777 22 6 6 000 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4444444444 8 8 8 6666666 999999999 7 00 4 5555 7 222 888888888888888888 99 3333 99 66666 6 555555555 000 88 000000000000 33333333333 7 000 0000000000 00000000 88 5555555555 00000000 00000000 2222 88 000 1 7 777777 777777 6 6 0000000 111 66666 000 44 88 444 888888 333333 6 22222 77777 99 99 222 7777 00 66 4444444 7 0 7 7 7 999999 88 7 333 3 9 9 0 4 8
consensus : TTTTCCC-C--AA-NTGA-G--C-AAA--A-A-A---A---------T------T-----------T---------T----TG--A---A----------AA----------TTTTTC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TANTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
Reference ( family-393 ) : TTTTCCC-C--AA-TTGA-G--C-AAA--A-A-A---A---------T------T-----------T---------T----TN--A---A----------AA----------TTTTTC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TANTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
gi|40076 : TTTTCCC-C--AA-ATGA-A----AAA--C-A-A---A---------T------TAT---------T---------T----TG--AGGGA----------AA----------TTATTC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AAAT----CT--CA----------GGATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TTA-TTTC------CC------A-GTTTGG-T-------A---A-----AAT---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAT-T-T-G-----TT--ATTT-C---CCT--------GAAGGCTT-CG----------TAATATCCAGGAT-AAA
gi|40077 : TTTTCCC-C--AA-ATGA-A----AAA--C-A-A---A---------T------TA----------T---------T----TG--AGGGA----------TA----------TTATTC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AATT----CT--CA----------GGATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---AAAATTTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTTT-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCACAATATCCAGGAT-AAA
gi|40078 : TTTTCCC-C--AA-ATAA-A----AAA--C-A-A---A---------T------TAT---------T---------T----TG--AGGGA----------AA----------TTATTC-TT-ATA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----G-AAA---AAAT----CT--CA----------GGATA----T--GAAA-----T-A---------TTGTTGT---AATATCTTAT--G------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TCA-TTTC------CC------A-GTTTGG-T-------A---A-----ATC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCA--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-T---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCTAATATTCAGGAT-AAA
gi|40079 : TTTTCTC-C--AA-ATGA-A--A-AAC--A-A-ATT-A---------T------T-----------T---------G----TG--AG--A----------AA----------TTATTC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-TT----A-AAA---AA------TC--TC----A-T----GATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---TA-ATCTGAC--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ATT-TTA-ATTG------TA------A-GTTTGG-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCA--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--GTTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCCAATATCCAGGAT-AAA
gi|40080 : TTTTCCC-A--AA-TTGA-A----AAA--C-A-A---A---------T------TA----------T---------T----TG--AGGGA----------AA----------TTATTC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AATT----CT--CA----------GGATA----T--GAAT-----T-T---------TTGTTGT---AATATTTGAT--A------------AT-----------TAATTGTAA---GAACATT----------AT--------C--TAAA----------C--------AG--------TG----C--TGG---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---T-----AAC---C--T--T----A------A------C-A-AT--T-----CCA--A--AT---TTC----CACAGA--C-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCCAATATCCAGGA
gi|40081 : tTTTTCCC-C--AA-TTGATG--CCAAA--A-A-A---A---------T------T-----------T---------C----CC--A---A----------AG----------TTTTTA-TT-ACA-T-----T-A---------AG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TT---GT---AATATCTGAT--G------------AT-----------TAGTGGTTA---AAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-AAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAAtgaa
gi|40082 : TTTTTCC-C--AA-TTAATG--C-AAA--A-A-A---A---------A------C-----------CCACCAAAAAT----TA--A---A----------AAAATATG----TTTTTC-AT-CAA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GACG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------GT-----------TACTGGTTA---GAACATG----------AT--------T--TAAA----------C--------AA--------TA----T--TAT---GCT-TTA-GTTT------CA------A-GTTTGC-TAA-----A---A-----AGT---G--T--T--AAT------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-CTGCGC-T-G------T--TTTT-C---CCCA-ATCTC-AATGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40083 : TTTTCCC-C--AA-TTGAAG--T-AAA--A-A-A---AAAATTTTATT------T-----------T---------T----TA--A---ATCTTTTTTT-AA----------TTTTTC-CT-GCA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---CG------C-----------------ATA----A--GAAG-----T-A---------TTATTGG---AATATCTGAT--A------------AT-----------TA-TAGTTA---GACCAAG----------AT--------C--TTAA----------C--------AA--------TG----A--TAC---ACT-TTA-TTTTTATTTTCG------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-TT--A-----CCC--A--AC---TTC----CTC--T--C-------AA---GCAC---A-----TT--TTTA-T---GCCA----TT-AAAGGCT
gi|40084 : TTTTCCC-CTTAA-T-GA-G--C-AAA--A-A-A---A---------A------A-----------T---------T----T------------------------------TTTTTC-TT-ACA-T-----A-T---------GG-C--G-AT----A-AAA---AA------AT--------A-C-----ATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---ATTATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---GCT-TTT-TTTT------CC------A-GTTTG
gi|40085 : TTTCCCC-C--AA-CTGA-GACC-AAA--A-A-AAAAA---------T------T-----------C---------TAAAATG--G---A----------AATTTTGGGAATTTTTTC-TT-ACA-T-----A-A---------AG-G--A-AT------AAA---AA------CC----------C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------ATGTTAT---AATATCTGAT--C------------AT-----------TAATGGTTA---GAATATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG----T--TTC---GCT-T
gi|40086 : TTTTCCCGC--AA-TAGA-GG-C-AAA--T-A-A---A---------T------T-----------T---------T----TCTCA---A----------AA----------T-------------------------------GG-A--A-GC----A-AAA---AA-----------A----A-A--TGGACA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCGGAT--A------------AA-----------TATTGGTTA---GTACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AA--------TA----T--TATTTAGCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---ATTT--AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--A
gi|40087 : TTTCCC-A--AAATGGA-A--A-AAA--A-A-A---A---------TAG----T-----------T---------T----T------------------AA----------TTTTTC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---CC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GACA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTAAT--C------------AT-----------TTTTGGTTA---GAACAT------------------------------------------------G--------TG----T--TGC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-ATTTGC-T-------G---A-----AGT---C--G--T--AAA------A------A-A-ATA-T-----CCC--T--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-ATGCAC-T-G-----TT--TTTT-T---CCTA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAa
gi|40088 : TTTTTCC-A--AA-TTGA-GGCC-AAA--A-A-A---A---------T------T-----------C---------A-----C--A---A----------AA----------T-------------------------------GG-A--A-AT----A-A-----------------TA----A-C--TTGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTAT--------------------------------------------------------CAT-----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----T--TAT---GCT-A-A-CTTT------CC------A-ATTTGA-T-------A---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA----------------------TT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-taaa
gi|40089 : tttccaattaaaaaatcatatcaaatttttTTCCC-A--AA----A-G--G-AAA--A-ACA---A---------T------T-----------T---------T----TTT-A---ATTTTTTTTTTAA----------TTTTTA-TT-ACA-T-----C-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------TA--CA----C-C--TGGATA----T--GAAG-----T-T---------TTATTGT---AATCTCTGAT--A------------AT-----------TATTTGTTA---GAACAAG----------AT--------A--TTAT----------C--------AG--------TG----C--TCC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---G-----AAC---C--T--TA-AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AC---TTC----CCC--T--C-------AA-TCAAGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGATT-GGGCCT--TTCCCAATTTCAAGAAA-AAc
gi|40090 : A----------TTTTTC-TT-ATA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---A-------CC--CA----A-A--TGGATA----T--GAAG-----T-G---------TTATTGG---AATAACTGAA--A------------AT-----------TATTAGTAA---GACGATG----------AT--------A--TAAA----------C--------AA--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CG------A-GTTTGC-T-------A---G-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-TT--T-----CCC--A--AT---TTC----CTC--T--C-------AA-TAACAC-T-G----------TTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-
gi|40091 : ttcccaaaataaccatttTTCCC-A--AA-ATGG-A--A-AAA--A-A-A---A---------T------T--------------------------------------------------------------C-TT-ACA-T-----T-A---------------------------------------TC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TGAACAT--TAT---GCT-TTA-TCTT------CC------A-GTTTGCAT-------G---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-C-A---T-----CCC--A--AA---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATTTC-CAA
gi|40092 : TTTTTCT-C--AA-TTGA-GG-C-AAA--A-A-A---G---------T------T-----------T----------------------A----------AT----------TTTTTT-TT-ACA-T-----C-A---------GG-A--T-AA----A-AAA---AA------CAA-CA----A-T--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AC-----------TGTTGGTTA---GAACCTG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CA------A-GTTTGT-TA------A---A-----AGT---C--T--T--AAA------A------attca
gi|40093 : ttcccaataaaaaaaaaaaaatttc------T-----------T---------T----TC--A---A----------A------------TTTTC-TT-ACA-T-----A-A---------GA-G--G-AT----A-AAA------------C--CA----A-C--TGGATG----TAAGAAG-----TTG---------CT-TTGT---GATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GGACACG----------AT--------C--TGAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GGT-TTA-TTTT------CA------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGC---C--T--T--AAA------
gi|40094 : ttcccaaaatcaaaaaaataattatattttattaTCCC-A--AA-ATGA-A--A-AAA--A-A-A---A---------T------T-----------T---------T----TT--T---TTTTTT-----AA----------TTTTTC-TT-ACA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------AA--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C-----------------------------T---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---TTGT--T--AAGTTTGTTA------A-A-AT--T-----CCT--G--AT---TAC----CCC--T--C-------AA-TCTTGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCTA-ATCTT-AAAGGCTT-
gi|40095 : TCCC-A--AA-ATGA-A--A-TAA--A-A-A---ACTATAT---T------T-----------T---------T----TT--A---A----------AA----------TTGTTC-TT-ACA-T-----T-C---------GG-T--G-AT----A-AAA---GAAGAAGTTG--CA----A-C--TGAATA----T--AAAG-----T-A---------TTATTGT---AACATCTGAT--A------------GT-----------TATTGGGTA---TAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CA----T--TGG---GCT-TTA-TTTT------CC------A-ATTT
gi|40096 : TTCCC-A--AA-TTGG------AAA--A-A-A---A---------T------TGTTGTTGTTTTT---------T----TG--T---G----------AA----------ATTTTC-TT-ACA-G-----A-A---------GG-G--G-AT----G-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATAGT---AATACCTGGT--A------------AG-----------AAATGGTTA---GAACATG----------TT--------C--TTAT----------C--------AG--------TG----T--TAC---TCT-CT--TTTT--------------A-GTTTGC-T-------ATTGA-----AGA---T--T--T--AAA------A------A-T-AT--C-----CCC--A--AT---TTC----CCA--TG-C-------AA-TCACGC---------TT--TTTC-C---CCCA-ATCTC-GACGGCTT-AGGCCTC-TTCCCAATTTACAGGGA-AAA
gi|40097 : TCCC-A--GA-GTGA-A--T-AAA--A-G-A---T---------T------T-----------T---------T----TTTGA---G----------AA----------TTTTTC-TT-ACA-T-----TTA---------GG-G--G-AT----A-GAA---AC------CT--CA------C--TGGATC----T--GAAG-----T-ACAGTCTGTATTGTTGT---AATATCTGAT--A------------AC-----------AAATCGTGG---GAACATG----------AT--------C--TAAA----------C--------AG--------TG------------------TA-TTTT------CC------A-GTTTGC-C-------A---A-----AGC---C--T--T--------------------A-AT-----------------T---TTC----CCC--T--C-------GA-TTGCAC-T-G-----TT--TTTT-C---C
gi|40098 : TCCC-C--AA-ATGA------AAA--ATA-A---A---------TATTTTTT-----------T---------T----TT--A---G----------AA----------TTTTTC-TT-CCA-T-----TTA---------GG-A--G-AT----A-AAA---CT------CC--CA------C--TGGATG----T--GGA-------------------TATTGT---AATAGCGGAT--A------------ATAAATAGTTAATTAATGGTTA---GAACTTG----------AA--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---CCT-TCG-TT
gi|40099 : CCC-A--AA-TTGA-GG-C-AAACAA-A-A---A---------T------TCCCTT------T---------T----TT--A----------------------------TGTC-TT-A-A-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------ACAACA----A-T--AAGATA----T--TAAACTTTAT-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------CATTGGTTA---GAACACG----------ATATAAATTTC--TTCA----------C--------AG--------CA----T--TAT---GCTATTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTC----CCT--T--T-------AA-TTACAC----------T--TTAT-C---CCCA-ACATCGGAGGGCTT-
gi|40100 : c--A-A-A---A---------T------G-----------TGGG------T----TG--G---G----------AA----------TTTTTC-TTAACA-A-----T-A---------GG-T--T-AT----A-AAA---AA------AA--C-----A-C--TGGATA----T--GTAC-----T-A---------TTAATGT---AATATCAGAT--A------------AT-----------TAATGGTCA---GAACATG----------TT--------C--TTAA----------C--------CG--------TG----T--TGC---ACT-TCA-TTTT------AC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C-----T--AAA------A------A-G-AT--
gi|40101 : cccaaataatttc---------T------T-----------T---------T----TG--A---G----------AA----------TTTTTC-CC-ACA-TA----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAC---TA------GC--CA------C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------------------------GTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--CAC---ACT-TTA-TT
gi|40102 : ccaaatataataaacatttttattAA--A-A-A---A---------T------C-----------C---------CAAAATG--A---G----------AG----------TTTTTC-TT-ACA-T-----C-ATGTACATGTGGCA--G-AT----A-AAA---AC------CCTGCAGTATA-G--TGGATA----T--GA-G-----T-A---------TTACAGT---GTTATCTG-T--A------------AC-----------TATTTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGT---GCT-ATG-TTTA------CC------A-GTTTGC---------A---ACAGCCAGC---C--T--T--AAA------A------A-T-GT--T-----CCC--A--AT---TTCCACTCCC--T--C-------AA-TCACGC-T-A-----TT--TCTT-T---CGAA-A-CTC-AAAGGCTT-GAGCCTC-
gi|40103 : g----------AA----------TTTTTC-TT-ACAGT-----T-T---------TG-G--G-AT----A-AAT---CA------CC--------A-C--TGGATA----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---TATATTGGAT--T------------AT-----------TATTGGTTT---GAACATG----------AT--------C--TT-A----------C--------TT--------TA----T--TTC---GCT-TTA-TTTT------CTTCAGTGA-GTTTGC-TTTGTAACA---G-----AGCTCTC--T--T--CAA------A------ATA-GT--T-----CTA--A--AT---TTCATCTCGC--T--C-------AA-TTTC-----------TT--TTTT-T---TTCATATTTC-AAAAGCTT-GGGCGTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAAcataggataaa
gi|40104 : aaaaggaaattgcaggA-A--C-AAA--A-A-------------------------------------------------TG--A---G----------GA----------TTTTTC-TT-ACG-TGAATTT-A---------GG-GTGG-GG----A-AAA---AA------GT--TA------C--TAGATAATTAT--GAAA-----T-A---------TTATTTT---AATATCTGAT--A------------AA-----------TAATGGTTA---GAACATGG---------AT--------C--TTAA----------C--------AG------------------------CT-TTG-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---A--T--T--AAG------A------G-A-AT--T-----TCC--A--AT---TTT----CTC--T--T-------GA-TTGCAC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTT-GAAGACT
gi|40105 : aa---A----------AA----------TCTTCC-TT-ACA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGAAT---GAACATG----------AT--------C--ATAA----------C--------AG--------TG----T--GAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGC---T--T--T----A------A------A-A-AT--T-----CTT--A--AT---TCC----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTT-GAAGGCTTGGGGCCTC-TTCCCAATTTATAGGAT-AAA
gi|40106 : ttttttgtgtgt----------AA----------TATCTC-TT-ACA-T-----G-A---------GG-G--G-AT----T-AAA---AA------C---------A-C--TGGATG----T--GAAA-----T-A---------TTATTATTATAATATCTTAT--ACTTACTTGTTACATG----------TAATGGTAA---GAATATG----------AT--------C--TTAAATTACAATAAC--------AG--------TG----T--TAC---ATGGTTG-TTTT------CC------A-CATTGC-T-------G---A-----AGG---T--T--TTAAAA------A------A-A-AA--T-----CCA--A--AT---TTA----CCC--T--C-------AA-TTGCTC-T-G-----TT--TTTT-C---CC
gi|40107 : ttttttggtagtg----------AA----------TCTTTC-TC-ACA-A-----T-A---------GG-G--G-AT----T-AAA---AA------C---------A-T--TGGATA----T--GAAT-----A-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TA-TGGTTA---GAACACG----------AC--------C--TCAA----------TATAATGAAAG--------TA----A--TGT---GCT-T---TTTT------TC------A-GTTTGC-T-------A---T-----TGC---C--T--T--AAA------A------A-t
gi|40108 : ttcgatgtg----------AA----------TTTTTC-TT-ACA-T-----T-T---------AG-G--G-AA----A-AAA---TA------CT--CA------C--TGGATA----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------GT--------C--TTAA----------C--------TG--------TG----T--CAT---ATT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---C-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCT--T--T-------GA-TCGCGT-T-G--------------------------------------GGGTCTC-TTCCCAATTTCCAGAAG-AAAgcaaa
gi|40109 : ggggggA----------TTTTTC-TT-ACA-T-----A-A---------AG-G--A-TT----A-AAA---AA------AC--------A-C--TAGGTA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT------------AATGGTTA---GAACATG----------AT--------A--TTAG----------C--------AG--------TG----T--TTT---GCT-ATA-TTTT------TA------A-GTTTGC-A-------A---A-----AGCTT-T--T--T--AAA------A------A-A-AT--C-----CCC--A--AT---TTC----CTC--C--T-------GA-TCAAAC-T-G-----TT--TTTT-C---TCCA-ATAT-------CTT-GGACCTC-TTCCCAATTTCCTGGA
gi|40110 : gaggggTC-TT-GTA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------AT--AA----A----TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AAAATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACTTG----------AT--------C--TTTA----------C--------AG--------TT----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------AT-----A-A-AT--T-----CTC--A--AT---TTC----
gi|40111 : gggaaaaaaaTTTTC-TT-AAA-T-----A-A---------GG-C--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--TAAC-----T-T---------TTATTGT---AAAATCTGAT--A------------AC-----------TATTGGACA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TTT---TCT-TTA-TTTT------GC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T------------------G-A-AT--TTTCCCCCC--A--AT---TTC----CCG--A--C-------AA-CCATGCTT-G-----GT--TTTT-T---CC----------------T-GGATCTCTTTCCCAATTTATAGGAATAAA
gi|40112 : gggag-A---------GG-G--G-GG----G-AAA---AG------C---------A-C--TGGATA----T--GTAA-----T-A---------TTTTTGT---AATATTGGAT--T------------AT-----------TAATGGTAA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TT----T--TCA---GCC-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGCTTTT--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCA--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-C---CC
gi|40113 : aaaatattctaaacatggaaaaa----------AA----------TTTTTC-TT-ACA-T-----C-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------AC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---GATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTA---GAACGTG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-CT--T-----CCA--A--AT---TTA----CCC--T--C-------AA-TATCAT-T-------TT--TTTT-C---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40114 : ----------AA----------TTTTTC-TT-ACA-T-----T-G---------AA-G--G-AT----A-AAA---AA------CAA-CA----A-C--TGAATA----T------------------------TATTGT---AATTTCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTAA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-TTTTGC-T-------T---A-----AGC---C--A--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--T-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCAA-AT-TT-GAAGGCTT-GGACCTT-TTCCCAATTTCCAGAAC-AAA
gi|40115 : ----------AA----------TTTTTC-AA-ACA-T-----G-C---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATT-----AACATCTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------AG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-AA--T-----CC------------TC----CC------C-------AA-TCACAC-T-------TTAATTTT-T---CC
gi|40116 : ----------AA----------CTTTTC-TT-ACA-T-----T-A---------GA-A--G-AT----A-AAA---CC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTGTTGT---AGTTTCTGAT--A------------AT-----------GATTAGTTGAATAAACATG----------AT--------C--ATAA----------C--------AG--------TG----T--ATC---ACT-TTA-TTTT------CA------A-TTTTAC-T-------A---A-----AGT---C--T--T--AAA------A------A-A-A---T-----CCA--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G-----TT--TTTT-T---CC
gi|40117 : A----------TTTTTC-AT-ACA---------A---------GG-A--G-AT----A-AAC-----------CC--CC----A-C--TGTAAG----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TCATGGTTA---TAACATG----------AA--------G--TTAA----------A--------AG--------TG----C--TAT---GCT-TTATTTTT------CC------A-GTC----------------------AGC---C--T--A--AAA------A------A-T-AA--T-----CCA--A--AT---TTT----TGC--T--C-------GA-TTACAA-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCAC-GAAGACTT-
gi|40118 : A----------TTTTTC-TG-ACA-T-----A-C---------TG-G--G-AT----A-AAA---AA------T---------A-C--TGAATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATATGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAGCATG----------AT--------C--TTTA----------T--------AG--------TG----T--TAC---AC----A-TT----------------A-GTTTGC-T-------T---A-----ACC---C--T--T--c
gi|40119 : ----------TTTTCC-TT-ACA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA------------T--CA------C--TGTACA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TTATGGTTG---GAACATGTCGGGTCATAAT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------T-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T-----------G------A-T-TT--T-----TTC--ACCAT---TTC----CGC--C--C-------AG-TCACAC-T-G-----TT--TTTTCT---CAAA-ATGTT-GAAGACTT-tactccatagatacacgttttcacgcaccaatcac
gi|40120 : A----------TTTGAC-TT-ACC-T-----T-A---------GG-G--G-ATTACAA-AAA---AA-----------A----A-C--TCAATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------CATTGGTTA---CAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--TAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--A
gi|40121 : ttTTCATT-ACA-T-----T-A---------AG-G--A-AT----A-AAA---AAA-----CT--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----C-A---------TTATTGT---TATATCTGAT--A------------AC-----------TATTGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--CAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--TAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTT----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G-----TT--TTAT-T---CCCA-ATTTC-
gi|40122 : tca----------TTTTTC-TT-ACA-T-----T-G---------GA-G--A-GT----A-AAA---AG------CC--CA----A-C--TAGATA----T--GAAG-----T-A---------CTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTAGTTA---GAATATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG-------TAT---GTA-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----ATC---C--T--T--AAA------A------T-A-AT--T-----CCT--A--AT---TT-----CCC--T--C-------AA-TTGCCT-T-G------A--TTTT-T---CCCA-ATCTA-GAAAAATT-GGGCCTC-TTCCAAATTCCCAGATA-AAcagaaaaaa
gi|40123 : ----------TTTTTC-TA-ACA-T-----T-A---------CA-G--A-AT----A-AATTTTAA------CC--CA----AAC--TGGTTA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGG---AATATATGAC--A------------AT-----------TATAAATTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C---------T--------TG----T--TAC---A----TA-T-------------------GCT-AT-T-------A---A-----AGC---C--T--TTTAAA------A------A-ATATAAT-----CAC--A--AT---TTCT---CCC--T--T-------AA-TCA-GC-T-G-----TT--TTTC-----CCCA-ATCTC-CAAGGCAT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40124 : ----------TTTTTC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-A-------------------------C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATG----------------------------------C--T--------------------------------------T--TA------T-TT-----T------TC------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGT---C--T--A--AAA------G------A-A-A
gi|40125 : TC-TT-ACA-T-----T-T---------TG-G--G-AT----ATAAA---AA------C----A----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCCAAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAG----------C--------AG--------TG----TTGTAC---ACT-TTA-TTTT------CC------C-TTTTGT-T-------A---A-----TGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AG--T-----CAA--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAC-T-G-----TT--TTTT-T---CCaat
gi|40126 : TC-TC-ACA-T-----A-A---------GT-G--G-AT----A-AAA---AA------AC--------A-C--TGGCTA----T--CA-----------------------------AATACCTGAT--A------------TG-----------TAATGGTAA---GAACACG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG-------------------C---ATT-TTA-GTTT------CC------A-ATTT---------------A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTG----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTC-T---C
gi|40127 : C-TT-ACA-T-----A-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------GC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATGGC---AATATCAGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---TAAC-TG----------GT--------C--TTAA----------C--------AG--------TA----T--TGC---CCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-T-------A---A-----AAT---CG-T--T--AAA------A------G-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TC-TGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCAC-AAAGGTTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCTAGt
gi|40128 : -TT-ACA-T-----TTA---------GG-G--G-AT----A-GAA-----------------------C--TGGATA----T--GAAG-----T-T---------TTACTAT---GATATTTGAT--G------------AT-----------TAATGGTTA---GAACATG----------AA--------C--TTGA----------C--------AG--------CG----T--CA----GCT-TTA-TTGT------CC------A-GTTT----------------------GC---C--T--T--TAA------A------A-A-AT--T-----CCA--A--AA---ATC----TCA--T--C-------AA-TCAC------------------------------TCTC-GAAGGTTT-TGGCCTC-ATTCCAATTTCCAAGAA-AAA
gi|40129 : -T-----T-A---------AA-G--GTAT----A-AAA---AA------AA--CA------C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--G------------GA-----------TAATGGTTT---TAACAT---------------------C--TTAC----------C--------AG--------TG----T--TAC---TCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTTC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------G-A-AT--T-----TCC--A--
gi|40130 : -A---------GG-G--GTAT----A-AAA---AA------AC--CA------T--TGGATA----T--GGAA-----T-A---------TTACTGT---TATATCTGAT--T------------AT-----------TGATGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AGCGTTATTATG----T--TAC---ACG-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-C-------G---C-----AGT---C--T--TA-AAA------A------A-A-AA--T-----CCC--A--ATTAATTT----CCC--T--T-------AATTTGCAC-T-G-----TT--TTTT-T----CCA-ATCTC-GAAGGTTT-GAGCCTC-TTCCCAAATTCCAGGAA-AAA
gi|40131 : G-G--G-AT----G-AAA---AA-----------A----A-TATTGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTTCTTT---ATTATCTGAT--A------------TT-----------TGATGGTTA---TAA--TG----------AT--------C--CTAA----------C--------AG--------TT----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-T-------A---C-----GGT---C--T--T----A------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--
gi|40132 : -AAA---AA-----------A----A-T--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---TATATCTATT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TA----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA--------------------------------A--AT---TTC----CTC--T--G-------AA-TTGTGC-TGG-----TT--TTTT-T---CCCA-GTCTT-GAAGGCCT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAAtgac
gi|40133 : ATG----T--GAGA-----T-G---------TAGTT-T---GATAT--GATGTA------------AT------------ATTA-TTA---GAA-ATG----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------GT------A-GTTTGT-T-------A---A-----AAC---C--A--T--AAA------A------A-G-G---------CCC--A--AA---TTC----TCC--T--C-------AA-TCCTGC-T-GTGTTTTT--TTTC-T---CCCA-ATTTT-GAAGACTT-GGACCTC-TTCCCAATTTCCAG
gi|40134 : aaaagagtatcggtatatac----A-AAA---AA------TC--AA----A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAG--A------------AT-----------TATTAGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C------------------TG----T--TTC---TCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTCGT-T-------T---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--TT---TTC----CTG--T--C-------AG-TCGCGC-T-G------C--TTTT-T---CCCA-ATCTC-AAAGGCTT-
gi|40135 : GGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---CATATCTGAT--A------------AT---------------GGTTA---GAATATA----------AT--------T--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------TC------ACGTTTGC-T-------A---C-----TGT---C--T--T--GAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--T-------AA-TCGCAC-T-G------T--TTAT-T---CCCG-ATCTC-GAAAGTTT-
gi|40136 : GATA----T--GAAG-----T-T---------TCATTGT---CATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGATA---GAAAATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---ACA-TTA-TTTC------CC------A-GTTTGC-T-------A---G-----AGC---C-----T--AAA------A------A-A-TT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCG--T--C-------AA-TCACAT-T-GT----TT--TTTT-T---CCCA-ACCTC-GAAG
gi|40137 : GATG----T--AAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCCGAA--A------------AC-----------TAAAGGTAA---GAACATA----------AT--------CTTTTAA----------C--------AG--------TA----T--TAC---GTT-TTA-ATAT------TC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---C--T--T-----------A------A-A-AT--T-----TCCTAA--AT---TTC----CCC--T--CATTGTTTAA-TCGCGA-T-G------A--TTTT-T---CCCA-ATGTA-G-AGGCTT-TCACCTA-CTCCAAATTTCCAGGAA-AAAat
gi|40138 : A----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TACTGGTTA---GAACATG----------AG--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----G--TAC---CCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------T---A-----------C--TGGT--AAA------ACTGGTCA-A-TT--T-----CCA--A--AT---TTC----CCA--A--A-------AA-TCGCGC-T-G---------TTTT-T---CCCA-ACCTC-AAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40139 : AA-----T-A---------ATATTGC---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGATTG---AAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTAAC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------AAT----A-A-ATAAT-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCCCAC-T-GA----TT--TTTT-C---CCCA-ATCTC-CAAGAC
gi|40140 : tATCGT---TATATCTGAT--A------------AT-----------TTATGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-A----------AG--A--AT---TGC----TCC--T--C-------AA-TAGTGC-T-G-----TT--TTTT-T---TCCA-ATCTT-GAAGGCTT-cctgaat
gi|40141 : TTTT---AATATCTGTT--A------------GT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTA------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AA--T-----CTC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAA-T-G-----TT--GTTT-
gi|40142 : T---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTG---GAACATG----------AT--------G--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAG---GCT-TTATTTTT------CC------A-ATTTGC-T-------A---A-----ATC---T--T--T--TAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTG----CCC--T--C-------AA-T
gi|40143 : ATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTA---GAACATG----------AT--------T--TTAA----------C--------A----------G----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTT
gi|40144 : -----------TAGTTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-TA------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------G-A-TT--T-----TCC--A--AT---TTC----CTC--T--A-------AA-TCAAGC---------TT--TTTT-T---CCAA-ATCTC-AAAGACTT-GGGCCTC-TTCCCAAT
gi|40145 : TA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTT-------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AGA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--GT---TTC----CCC--T--C-------AT-TTGTGC-T-G-----TT--TTTT-----------TCTC-GAAGGCTT-
gi|40146 : gttacatcatttttgAACATG----------AT--------C--TTGG----------C--------TG--------TG----T--TAC---ACT-TTATTTTT------CC------T-GTTTGC-T-------A---C-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-GT--T-----CCA--A--AT---TAT----TTC--T--T-------GA-TCACGC-T-G-----TT--TTTT-TTCCCCCA-ATGTC-AAAGGTTT--GGCCTC-GTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
gi|40147 : --------AG--------TG----T--CAT---ACT-TTA-TTTT------TC------A-GTTTGC-T-------A---C-----AGT---C--T--T--AAA------A------A-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T----------GT-TCA----T-A-----TTC-TTTT-T---TCCA-ATCTC-GAAGGCTT-
Alignments
lowQualScore : 222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222222222222222
lowQualScore : 33 1 1 1 888888 22 1 444 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6666666666 111 0 0 0 5555555 222222222 0 11 1 1111 0 111 777777777777777777 00 1111 00 11111 0 222222222 111 00 333333333333 33333333333 2 111 3333333333 22222222 00 2222222222 22222222 22222222 1111 00 111 1 1 111111 111111 0 0 4444444 111 22222 333 11 00 444 111111 333333 0 66666 11111 00 00 111 3333 11 44 2222222 0 2 3 0 0 777777 11 0 111 0 0 0 1 1 1
lowQualScore : .. . . . ...... .. . ... ......................................................................... .......... ... . . . ....... ......... . .. . .... . ... .................. .. .... .. ..... . ......... ... .. ............ ........... . ... .......... ........ .. .......... ........ ........ .... .. ... . . ...... ...... . . ....... ... ..... ... .. .. ... ...... ...... . ..... ..... .. .. ... .... .. .. ....... . . . . . ...... .. . ... . . . . . .
lowQualScore : 77 7 0 7 999999 11 5 888 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4444444444 444 8 8 8 1111111 999999999 7 00 4 5555 7 222 888888888888888888 99 3333 99 66666 6 555555555 000 88 000000000000 33333333333 7 000 0000000000 00000000 88 5555555555 00000000 00000000 2222 88 000 1 7 777777 777777 6 6 0000000 111 66666 000 44 88 444 888888 333333 6 22222 77777 99 99 222 7777 00 66 4444444 7 0 7 7 7 999999 88 7 333 3 9 9 0 4 8
consensus : TTTTCCC-CA-ANTG-A-G--C-AAA--A-AA---A---------T---------------T-----------T---------T----T--G-A----A----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TANTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
Reference ( family-393 ) : TTTTCCC-CA-ANTG-A-G--C-AAA--A-AA---A---------T---------------T-----------T---------T----T--G-A----A----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TANTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
gi|40076 : TTTTCCC-CA-AATG-A-A----AAA--C-AA---A---------T---------------TAT---------T---------T----T--G-AGGG-A----------AA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AAAT----CT--CA----------GGATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TTA-TTTC------CC------A-GTTTGG-T-------A---A-----AAT---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAT-T-T-G-----TT--ATTT-C---CCT--------GAAGGCTT-CG----------TAATATCCAGGAT-AAA
gi|40077 : TTTTCCC-CA-AATG-A-A----AAA--C-AA---A---------T---------------TA----------T---------T----T--G-AGGG-A----------TA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AATT----CT--CA----------GGATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---AAAATTTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTTT-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCACAATATCCAGGAT-AAA
gi|40078 : TTTTCCC-CA-AATA-A-A----AAA--C-AA---A---------T---------------TAT---------T---------T----T--G-AGGG-A----------AA----------TTAT---TC-TT-ATA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----G-AAA---AAAT----CT--CA----------GGATA----T--GAAA-----T-A---------TTGTTGT---AATATCTTAT--G------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TCA-TTTC------CC------A-GTTTGG-T-------A---A-----ATC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCA--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-T---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCTAATATTCAGGAT-AAA
gi|40079 : TTTTCTC-CA-AATG-A-A--A-AAC--A-AATT-A---------T---------------T-----------T---------G----T--G-AG---A----------AA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-TT----A-AAA---AA------TC--TC----A-T----GATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---TA-ATCTGAC--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ATT-TTA-ATTG------TA------A-GTTTGG-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCA--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--GTTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCCAATATCCAGGAT-AAA
gi|40080 : TTTTCCC-AA-ATTG-A-A----AAA--C-AA---A---------T---------------TA----------T---------T----T--G-AGGG-A----------AA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AATT----CT--CA----------GGATA----T--GAAT-----T-T---------TTGTTGT---AATATTTGAT--A------------AT-----------TAATTGTAA---GAACATT----------AT--------C--TAAA----------C--------AG--------TG----C--TGG---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---T-----AAC---C--T--T----A------A------C-A-AT--T-----CCA--A--AT---TTC----CACAGA--C-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCCAATATCCAGGA
gi|40081 : tTTTTCCC-CA-ATTG-ATG--CCAAA--A-AA---A---------T---------------T-----------T---------C----C--C-A----A----------AG----------TTTT---TA-TT-ACA-T-----T-A---------AG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TT---GT---AATATCTGAT--G------------AT-----------TAGTGGTTA---AAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-AAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAAtgaa
gi|40082 : TTTTTCC-CA-ATTA-ATG--C-AAA--A-AA---A---------A---------------C-----------CCACCAAAAAT----T--A-A----A----------AAAATATG----TTTT---TC-AT-CAA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GACG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------GT-----------TACTGGTTA---GAACATG----------AT--------T--TAAA----------C--------AA--------TA----T--TAT---GCT-TTA-GTTT------CA------A-GTTTGC-TAA-----A---A-----AGT---G--T--T--AAT------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-CTGCGC-T-G------T--TTTT-C---CCCA-ATCTC-AATGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40083 : TTTTCCC-CA-ATTG-AAG--T-AAA--A-AA---AAAATTTTATT---------------T-----------T---------T----T--A-A----ATCTTTTTTT-AA----------TTTT---TC-CT-GCA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---CG------C-----------------ATA----A--GAAG-----T-A---------TTATTGG---AATATCTGAT--A------------AT-----------TA-TAGTTA---GACCAAG----------AT--------C--TTAA----------C--------AA--------TG----A--TAC---ACT-TTA-TTTTTATTTTCG------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-TT--A-----CCC--A--AC---TTC----CTC--T--C-------AA---GCAC---A-----TT--TTTA-T---GCCA----TT-AAAGGCT
gi|40084 : TTTTCCC-CTTAATG-A-G--C-AAA--A-AA---A---------A---------------A-----------T---------T----T--------------------------------TTTT---TC-TT-ACA-T-----A-T---------GG-C--G-AT----A-AAA---AA------AT--------A-C-----ATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---ATTATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---GCT-TTT-TTTT------CC------A-GTTTG
gi|40085 : TTTCCCC-CA-ACTG-A-GACC-AAA--A-AAAAAA---------T---------------T-----------C---------TAAAAT--G-G----A----------AATTTTGGGAATTTTT---TC-TT-ACA-T-----A-A---------AG-G--A-AT------AAA---AA------CC----------C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------ATGTTAT---AATATCTGAT--C------------AT-----------TAATGGTTA---GAATATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG----T--TTC---GCT-T
gi|40086 : TTTTCCCGCA-ATAG-A-GG-C-AAA--------------------------------------------------------------T---------A----------AA----------TTTT---TC-TC-AAA-A-----T-G---------GA-A--G--C----A-AAA---AA-----------A----A-A--TGGACA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCGGAT--A------------AA-----------TATTGGTTA---GTACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AA--------TA----T--TATTTAGCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---ATTT--AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--A
gi|40087 : TTTCCC-AA-AATGGA-A--A-AAA--A-AA---A---------TAG-------------T-----------T---------T----T--------------------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---CC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GACA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTAAT--C------------AT-----------TTTTGGTTA---GAACAT------------------------------------------------G--------TG----T--TGC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-ATTTGC-T-------G---A-----AGT---C--G--T--AAA------A------A-A-ATA-T-----CCC--T--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-ATGCAC-T-G-----TT--TTTT-T---CCTA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAa
gi|40088 : TTTTTCC-AA-ATTG-A-GGCC-AAA--A-AA---A---------T---------------T-----------C---------A----C----A----A----------AA----------T----------------------------------GG-A--A-AT----A-A-----------------TA----A-C--TTGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTAT--------------------------------------------------------CAT-----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----T--TAT---GCT-A-A-CTTT------CC------A-ATTTGA-T-------A---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA----------------------TT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-taaa
gi|40089 : tttccaattaaaaaatcatatcaaatttttTTCCC-AA-AAGG-A------AAA--A-CA---A---------T---------------T-----------T---------T----T--TTA----ATTTTTTTTTTAA----------TTTT---TA-TT-ACA-T-----C-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------TA--CA----C-C--TGGATA----T--GAAG-----T-T---------TTATTGT---AATCTCTGAT--A------------AT-----------TATTTGTTA---GAACAAG----------AT--------A--TTAT----------C--------AG--------TG----C--TCC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---G-----AAC---C--T--TA-AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AC---TTC----CCC--T--C-------AA-TCAAGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGATT-GGGCCT--TTCCCAATTTCAAGAAA-AAc
gi|40090 : A----------TTTT---TC-TT-ATA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---A-------CC--CA----A-A--TGGATA----T--GAAG-----T-G---------TTATTGG---AATAACTGAA--A------------AT-----------TATTAGTAA---GACGATG----------AT--------A--TAAA----------C--------AA--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CG------A-GTTTGC-T-------A---G-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-TT--T-----CCC--A--AT---TTC----CTC--T--C-------AA-TAACAC-T-G----------TTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-
gi|40091 : ttcccaaaataaccatttTTCCC-AA-AATG-G-A--A-AAA--A-AA---A---------T---------------T-------------------------------------------------------------------C-TT-ACA-T-----T-A---------------------------------------TC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TGAACAT--TAT---GCT-TTA-TCTT------CC------A-GTTTGCAT-------G---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-C-A---T-----CCC--A--AA---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATTTC-CAA
gi|40092 : TTTTTCT-CA-ATTG-A-GG-C-AAA--A-AA---G---------T---------------T-----------T------------------------A----------AT----------TTTT---TT-TT-ACA-T-----C-A---------GG-A--T-AA----A-AAA---AA------CAA-CA----A-T--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AC-----------TGTTGGTTA---GAACCTG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CA------A-GTTTGT-TA------A---A-----AGT---C--T--T--AAA------A------attca
gi|40093 : ttcccaataaaaaaaaaaaaatttcTTCCC-AA-AAT-------C-AAA--A-AA---A---------TAATTATATTTTATTAT-----------T---------T----T--C-A----A----------A------------TTT---TC-TT-ACA-T-----A-A---------GA-G--G-AT----A-AAA------------C--CA----A-C--TGGATG----TAAGAAG-----TTG---------CT-TTGT---GATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GGACACG----------AT--------C--TGAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GGT-TTA-TTTT------CA------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGC---C--T--T--AAA------
gi|40094 : TCCC-AA-AATG-A-A--A-AAA--A-AA---A---------T---------------T-----------T---------T----T--T-T----TTTTTT-----AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------AA--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C-----------------------------T---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---TTGT--T--AAGTTTGTTA------A-A-AT--T-----CCT--G--AT---TAC----CCC--T--C-------AA-TCTTGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCTA-ATCTT-AAAGGCTT-
gi|40095 : TCCC-AA-AATG-A-A--A-TAA--A-AA---ACTATAT---T---------------T-----------T---------T----T--T-A----A----------AA----------TTGT---TC-TT-ACA-T-----T-C---------GG-T--G-AT----A-AAA---GAAGAAGTTG--CA----A-C--TGAATA----T--AAAG-----T-A---------TTATTGT---AACATCTGAT--A------------GT-----------TATTGGGTA---TAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CA----T--TGG---GCT-TTA-TTTT------CC------A-ATTT
gi|40096 : TTCCC-AA-ATTG-G------AAA--A-AA---A---------T---------------TGTTGTTGTTTTT---------T----T--G-T----G----------AA----------ATTT---TC-TT-ACA-G-----A-A---------GG-G--G-AT----G-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATAGT---AATACCTGGT--A------------AG-----------AAATGGTTA---GAACATG----------TT--------C--TTAT----------C--------AG--------TG----T--TAC---TCT-CT--TTTT--------------A-GTTTGC-T-------ATTGA-----AGA---T--T--T--AAA------A------A-T-AT--C-----CCC--A--AT---TTC----CCA--TG-C-------AA-TCACGC---------TT--TTTC-C---CCCA-ATCTC-GACGGCTT-AGGCCTC-TTCCCAATTTACAGGGA-AAA
gi|40097 : TCCC-AG-AGTG-A-A--T-AAA--A-GA---T---------T---------------T-----------T---------T----TTTG-A----G----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----TTA---------GG-G--G-AT----A-GAA---AC------CT--CA------C--TGGATC----T--GAAG-----T-ACAGTCTGTATTGTTGT---AATATCTGAT--A------------AC-----------AAATCGTGG---GAACATG----------AT--------C--TAAA----------C--------AG--------TG------------------TA-TTTT------CC------A-GTTTGC-C-------A---A-----AGC---C--T--T--------------------A-AT-----------------T---TTC----CCC--T--C-------GA-TTGCAC-T-G-----TT--TTTT-C---C
gi|40098 : TCCC-CA-AATG-A------AAA--ATAA---A---------TATTTTT---------T-----------T---------T----T--T-A----G----------AA----------TTTT---TC-TT-CCA-T-----TTA---------GG-A--G-AT----A-AAA---CT------CC--CA------C--TGGATG----T--GGA-------------------TATTGT---AATAGCGGAT--A------------ATAAATAGTTAATTAATGGTTA---GAACTTG----------AA--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---CCT-TCG-TT
gi|40099 : CCC-AA-ATTG-A-GG-C-AAACAA-AA---A---------T---------------T-----------CCC-------T----T--------------------------------TTTTATGTC-TT-A-A-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------ACAACA----A-T--AAGATA----T--TAAACTTTAT-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------CATTGGTTA---GAACACG----------ATATAAATTTC--TTCA----------C--------AG--------CA----T--TAT---GCTATTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTC----CCT--T--T-------AA-TTACAC----------T--TTAT-C---CCCA-ACATCGGAGGGCTT-
gi|40100 : c--A-AA---A---------T---------------G-----------TGGG------T----T--G-G----G----------AA----------TTTT---TC-TTAACA-A-----T-A---------GG-T--T-AT----A-AAA---AA------AA--C-----A-C--TGGATA----T--GTAC-----T-A---------TTAATGT---AATATCAGAT--A------------AT-----------TAATGGTCA---GAACATG----------TT--------C--TTAA----------C--------CG--------TG----T--TGC---ACT-TCA-TTTT------AC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C-----T--AAA------A------A-G-AT--
gi|40101 : cccaaataatttc---------T---------------T-----------T---------T----T--G-A----G----------AA----------TTTT---TC-CC-ACA-TA----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAC---TA------GC--CA------C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------------------------GTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--CAC---ACT-TTA-TT
gi|40102 : ccaaatataataaacatttttattAA--A-AA---A---------T---------------C-----------C---------CAAAAT--G-A----G----------AG----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----C-ATGTACATGTGGCA--G-AT----A-AAA---AC------CCTGCAGTATA-G--TGGATA----T--GA-G-----T-A---------TTACAGT---GTTATCTG-T--A------------AC-----------TATTTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGT---GCT-ATG-TTTA------CC------A-GTTTGC---------A---ACAGCCAGC---C--T--T--AAA------A------A-T-GT--T-----CCC--A--AT---TTCCACTCCC--T--C-------AA-TCACGC-T-A-----TT--TCTT-T---CGAA-A-CTC-AAAGGCTT-GAGCCTC-
gi|40103 : g----------AA----------TTTT---TC-TT-ACAGT-----T-T---------TG-G--G-AT----A-AAT---CA------CC--------A-C--TGGATA----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---TATATTGGAT--T------------AT-----------TATTGGTTT---GAACATG----------AT--------C--TT-A----------C--------TT--------TA----T--TTC---GCT-TTA-TTTT------CTTCAGTGA-GTTTGC-TTTGTAACA---G-----AGCTCTC--T--T--CAA------A------ATA-GT--T-----CTA--A--AT---TTCATCTCGC--T--C-------AA-TTTC-----------TT--TTTT-T---TTCATATTTC-AAAAGCTT-GGGCGTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAAcataggataaa
gi|40104 : aaaaggaaattgcagg-A-A--C-AAA--A-A---------------------------------------------------------T--G-A----G----------GA----------TTTT---TC-TT-ACG-TGAATTT-A---------GG-GTGG-GG----A-AAA---AA------GT--TA------C--TAGATAATTAT--GAAA-----T-A---------TTATTTT---AATATCTGAT--A------------AA-----------TAATGGTTA---GAACATGG---------AT--------C--TTAA----------C--------AG------------------------CT-TTG-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---A--T--T--AAG------A------G-A-AT--T-----TCC--A--AT---TTT----CTC--T--T-------GA-TTGCAC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTT-GAAGACT
gi|40105 : aa---------T---------------T-----------T---------TGTG-T--G-T----A----------AA----------TCTT---CC-TT-ACA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGAAT---GAACATG----------AT--------C--ATAA----------C--------AG--------TG----T--GAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGC---T--T--T----A------A------A-A-AT--T-----CTT--A--AT---TCC----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTT-GAAGGCTTGGGGCCTC-TTCCCAATTTATAGGAT-AAA
gi|40106 : tt---------T---------------T-----------T---------T----T--G-GTAGTG----------AA----------TATC---TC-TT-ACA-T-----G-A---------GG-G--G-AT----T-AAA---AA------C---------A-C--TGGATG----T--GAAA-----T-A---------TTATTATTATAATATCTTAT--ACTTACTTGTTACATG----------TAATGGTAA---GAATATG----------AT--------C--TTAAATTACAATAAC--------AG--------TG----T--TAC---ATGGTTG-TTTT------CC------A-CATTGC-T-------G---A-----AGG---T--T--TTAAAA------A------A-A-AA--T-----CCA--A--AT---TTA----CCC--T--C-------AA-TTGCTC-T-G-----TT--TTTT-C---CC
gi|40107 : t----------AA----------TCTT---TC-TC-ACA-A-----T-A---------GG-G--G-AT----T-AAA---AA------C---------A-T--TGGATA----T--GAAT-----A-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TA-TGGTTA---GAACACG----------AC--------C--TCAA----------TATAATGAAAG--------TA----A--TGT---GCT-T---TTTT------TC------A-GTTTGC-T-------A---T-----TGC---C--T--T--AAA------A------A-t
gi|40108 : ttcgatgtg----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-T---------AG-G--G-AA----A-AAA---TA------CT--CA------C--TGGATA----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------GT--------C--TTAA----------C--------TG--------TG----T--CAT---ATT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---C-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCT--T--T-------GA-TCGCGT-T-G--------------------------------------GGGTCTC-TTCCCAATTTCCAGAAG-AAAgcaaa
gi|40109 : ggggggA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----A-A---------AG-G--A-TT----A-AAA---AA------AC--------A-C--TAGGTA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT------------AATGGTTA---GAACATG----------AT--------A--TTAG----------C--------AG--------TG----T--TTT---GCT-ATA-TTTT------TA------A-GTTTGC-A-------A---A-----AGCTT-T--T--T--AAA------A------A-A-AT--C-----CCC--A--AT---TTC----CTC--C--T-------GA-TCAAAC-T-G-----TT--TTTT-C---TCCA-ATAT-------CTT-GGACCTC-TTCCCAATTTCCTGGA
gi|40110 : gagggg---TC-TT-GTA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------AT--AA----A----TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AAAATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACTTG----------AT--------C--TTTA----------C--------AG--------TT----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------AT-----A-A-AT--T-----CTC--A--AT---TTC----
gi|40111 : gggaaaaaaaTTT---TC-TT-AAA-T-----A-A---------GG-C--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--TAAC-----T-T---------TTATTGT---AAAATCTGAT--A------------AC-----------TATTGGACA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TTT---TCT-TTA-TTTT------GC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T------------------G-A-AT--TTTCCCCCC--A--AT---TTC----CCG--A--C-------AA-CCATGCTT-G-----GT--TTTT-T---CC----------------T-GGATCTCTTTCCCAATTTATAGGAATAAA
gi|40112 : gggag-A---------GG-G--G-GG----G-AAA---AG------C---------A-C--TGGATA----T--GTAA-----T-A---------TTTTTGT---AATATTGGAT--T------------AT-----------TAATGGTAA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TT----T--TCA---GCC-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGCTTTT--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCA--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-C---CC
gi|40113 : aaaatattctaaacatggaaaaa----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----C-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------AC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---GATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTA---GAACGTG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-CT--T-----CCA--A--AT---TTA----CCC--T--C-------AA-TATCAT-T-------TT--TTTT-C---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40114 : ----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-G---------AA-G--G-AT----A-AAA---AA------CAA-CA----A-C--TGAATA----T------------------------TATTGT---AATTTCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTAA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-TTTTGC-T-------T---A-----AGC---C--A--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--T-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCAA-AT-TT-GAAGGCTT-GGACCTT-TTCCCAATTTCCAGAAC-AAA
gi|40115 : ----------AA----------TTTT---TC-AA-ACA-T-----G-C---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATT-----AACATCTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------AG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-AA--T-----CC------------TC----CC------C-------AA-TCACAC-T-------TTAATTTT-T---CC
gi|40116 : ----------AA----------CTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GA-A--G-AT----A-AAA---CC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTGTTGT---AGTTTCTGAT--A------------AT-----------GATTAGTTGAATAAACATG----------AT--------C--ATAA----------C--------AG--------TG----T--ATC---ACT-TTA-TTTT------CA------A-TTTTAC-T-------A---A-----AGT---C--T--T--AAA------A------A-A-A---T-----CCA--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G-----TT--TTTT-T---CC
gi|40117 : A----------TTTT---TC-AT-ACA---------A---------GG-A--G-AT----A-AAC-----------CC--CC----A-C--TGTAAG----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TCATGGTTA---TAACATG----------AA--------G--TTAA----------A--------AG--------TG----C--TAT---GCT-TTATTTTT------CC------A-GTC----------------------AGC---C--T--A--AAA------A------A-T-AA--T-----CCA--A--AT---TTT----TGC--T--C-------GA-TTACAA-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCAC-GAAGACTT-
gi|40118 : A----------TTTT---TC-TG-ACA-T-----A-C---------TG-G--G-AT----A-AAA---AA------T---------A-C--TGAATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATATGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAGCATG----------AT--------C--TTTA----------T--------AG--------TG----T--TAC---AC----A-TT----------------A-GTTTGC-T-------T---A-----ACC---C--T--T--c
gi|40119 : ----------TTTT---CC-TT-ACA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA------------T--CA------C--TGTACA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TTATGGTTG---GAACATGTCGGGTCATAAT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------T-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T-----------G------A-T-TT--T-----TTC--ACCAT---TTC----CGC--C--C-------AG-TCACAC-T-G-----TT--TTTTCT---CAAA-ATGTT-GAAGACTT-tactccatagatacacgttttcacgcaccaatcac
gi|40120 : A----------TTTG---AC-TT-ACC-T-----T-A---------GG-G--G-ATTACAA-AAA---AA-----------A----A-C--TCAATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------CATTGGTTA---CAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--TAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--A
gi|40121 : ttT---TCATT-ACA-T-----T-A---------AG-G--A-AT----A-AAA---AAA-----CT--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----C-A---------TTATTGT---TATATCTGAT--A------------AC-----------TATTGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--CAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--TAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTT----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G-----TT--TTAT-T---CCCA-ATTTC-
gi|40122 : tca----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-G---------GA-G--A-GT----A-AAA---AG------CC--CA----A-C--TAGATA----T--GAAG-----T-A---------CTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTAGTTA---GAATATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG-------TAT---GTA-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----ATC---C--T--T--AAA------A------T-A-AT--T-----CCT--A--AT---TT-----CCC--T--C-------AA-TTGCCT-T-G------A--TTTT-T---CCCA-ATCTA-GAAAAATT-GGGCCTC-TTCCAAATTCCCAGATA-AAcagaaaaaa
gi|40123 : ----------TTTT---TC-TA-ACA-T-----T-A---------CA-G--A-AT----A-AATTTTAA------CC--CA----AAC--TGGTTA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGG---AATATATGAC--A------------AT-----------TATAAATTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C---------T--------TG----T--TAC---A----TA-T-------------------GCT-AT-T-------A---A-----AGC---C--T--TTTAAA------A------A-ATATAAT-----CAC--A--AT---TTCT---CCC--T--T-------AA-TCA-GC-T-G-----TT--TTTC-----CCCA-ATCTC-CAAGGCAT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40124 : ----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-A-------------------------C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATG----------------------------------C--T--------------------------------------T--TA------T-TT-----T------TC------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGT---C--T--A--AAA------G------A-A-A
gi|40125 : ---TC-TT-ACA-T-----T-T---------TG-G--G-AT----ATAAA---AA------C----A----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCCAAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAG----------C--------AG--------TG----TTGTAC---ACT-TTA-TTTT------CC------C-TTTTGT-T-------A---A-----TGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AG--T-----CAA--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAC-T-G-----TT--TTTT-T---CCaat
gi|40126 : ---TC-TC-ACA-T-----A-A---------GT-G--G-AT----A-AAA---AA------AC--------A-C--TGGCTA----T--CA-----------------------------AATACCTGAT--A------------TG-----------TAATGGTAA---GAACACG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG-------------------C---ATT-TTA-GTTT------CC------A-ATTT---------------A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTG----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTC-T---C
gi|40127 : C-TT-ACA-T-----A-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------GC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATGGC---AATATCAGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---TAAC-TG----------GT--------C--TTAA----------C--------AG--------TA----T--TGC---CCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-T-------A---A-----AAT---CG-T--T--AAA------A------G-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TC-TGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCAC-AAAGGTTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCTAGt
gi|40128 : -TT-ACA-T-----TTA---------GG-G--G-AT----A-GAA-----------------------C--TGGATA----T--GAAG-----T-T---------TTACTAT---GATATTTGAT--G------------AT-----------TAATGGTTA---GAACATG----------AA--------C--TTGA----------C--------AG--------CG----T--CA----GCT-TTA-TTGT------CC------A-GTTT----------------------GC---C--T--T--TAA------A------A-A-AT--T-----CCA--A--AA---ATC----TCA--T--C-------AA-TCAC------------------------------TCTC-GAAGGTTT-TGGCCTC-ATTCCAATTTCCAAGAA-AAA
gi|40129 : -T-----T-A---------AA-G--GTAT----A-AAA---AA------AA--CA------C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--G------------GA-----------TAATGGTTT---TAACAT---------------------C--TTAC----------C--------AG--------TG----T--TAC---TCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTTC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------G-A-AT--T-----TCC--A--
gi|40130 : -A---------GG-G--GTAT----A-AAA---AA------AC--CA------T--TGGATA----T--GGAA-----T-A---------TTACTGT---TATATCTGAT--T------------AT-----------TGATGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AGCGTTATTATG----T--TAC---ACG-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-C-------G---C-----AGT---C--T--TA-AAA------A------A-A-AA--T-----CCC--A--ATTAATTT----CCC--T--T-------AATTTGCAC-T-G-----TT--TTTT-T----CCA-ATCTC-GAAGGTTT-GAGCCTC-TTCCCAAATTCCAGGAA-AAA
gi|40131 : G-G--G-AT----G-AAA---AA-----------A----A-TATTGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTTCTTT---ATTATCTGAT--A------------TT-----------TGATGGTTA---TAA--TG----------AT--------C--CTAA----------C--------AG--------TT----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-T-------A---C-----GGT---C--T--T----A------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--
gi|40132 : -AAA---AA-----------A----A-T--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---TATATCTATT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TA----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA--------------------------------A--AT---TTC----CTC--T--G-------AA-TTGTGC-TGG-----TT--TTTT-T---CCCA-GTCTT-GAAGGCCT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAAtgac
gi|40133 : ATG----T--GAGA-----T-G---------TAGTT-T---GATAT--GATGTA------------AT------------ATTA-TTA---GAA-ATG----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------GT------A-GTTTGT-T-------A---A-----AAC---C--A--T--AAA------A------A-G-G---------CCC--A--AA---TTC----TCC--T--C-------AA-TCCTGC-T-GTGTTTTT--TTTC-T---CCCA-ATTTT-GAAGACTT-GGACCTC-TTCCCAATTTCCAG
gi|40134 : aaaagagtatcggtatatac----A-AAA---AA------TC--AA----A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAG--A------------AT-----------TATTAGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C------------------TG----T--TTC---TCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTCGT-T-------T---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--TT---TTC----CTG--T--C-------AG-TCGCGC-T-G------C--TTTT-T---CCCA-ATCTC-AAAGGCTT-
gi|40135 : GGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---CATATCTGAT--A------------AT---------------GGTTA---GAATATA----------AT--------T--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------TC------ACGTTTGC-T-------A---C-----TGT---C--T--T--GAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--T-------AA-TCGCAC-T-G------T--TTAT-T---CCCG-ATCTC-GAAAGTTT-
gi|40136 : GATA----T--GAAG-----T-T---------TCATTGT---CATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGATA---GAAAATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---ACA-TTA-TTTC------CC------A-GTTTGC-T-------A---G-----AGC---C-----T--AAA------A------A-A-TT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCG--T--C-------AA-TCACAT-T-GT----TT--TTTT-T---CCCA-ACCTC-GAAG
gi|40137 : GATG----T--AAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCCGAA--A------------AC-----------TAAAGGTAA---GAACATA----------AT--------CTTTTAA----------C--------AG--------TA----T--TAC---GTT-TTA-ATAT------TC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---C--T--T-----------A------A-A-AT--T-----TCCTAA--AT---TTC----CCC--T--CATTGTTTAA-TCGCGA-T-G------A--TTTT-T---CCCA-ATGTA-G-AGGCTT-TCACCTA-CTCCAAATTTCCAGGAA-AAAat
gi|40138 : A----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TACTGGTTA---GAACATG----------AG--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----G--TAC---CCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------T---A-----------C--TGGT--AAA------ACTGGTCA-A-TT--T-----CCA--A--AT---TTC----CCA--A--A-------AA-TCGCGC-T-G---------TTTT-T---CCCA-ACCTC-AAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40139 : AA-----T-A---------ATATTGC---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGATTG---AAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTAAC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------AAT----A-A-ATAAT-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCCCAC-T-GA----TT--TTTT-C---CCCA-ATCTC-CAAGAC
gi|40140 : tATCGT---TATATCTGAT--A------------AT-----------TTATGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-A----------AG--A--AT---TGC----TCC--T--C-------AA-TAGTGC-T-G-----TT--TTTT-T---TCCA-ATCTT-GAAGGCTT-cctgaat
gi|40141 : TTTT---AATATCTGTT--A------------GT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTA------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AA--T-----CTC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAA-T-G-----TT--GTTT-
gi|40142 : T---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTG---GAACATG----------AT--------G--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAG---GCT-TTATTTTT------CC------A-ATTTGC-T-------A---A-----ATC---T--T--T--TAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTG----CCC--T--C-------AA-T
gi|40143 : ATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTA---GAACATG----------AT--------T--TTAA----------C--------A----------G----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTT
gi|40144 : -----------TAGTTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-TA------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------G-A-TT--T-----TCC--A--AT---TTC----CTC--T--A-------AA-TCAAGC---------TT--TTTT-T---CCAA-ATCTC-AAAGACTT-GGGCCTC-TTCCCAAT
gi|40145 : TA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTT-------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AGA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--GT---TTC----CCC--T--C-------AT-TTGTGC-T-G-----TT--TTTT-----------TCTC-GAAGGCTT-
gi|40146 : gttacatcatttttgAACATG----------AT--------C--TTGG----------C--------TG--------TG----T--TAC---ACT-TTATTTTT------CC------T-GTTTGC-T-------A---C-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-GT--T-----CCA--A--AT---TAT----TTC--T--T-------GA-TCACGC-T-G-----TT--TTTT-TTCCCCCA-ATGTC-AAAGGTTT--GGCCTC-GTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
gi|40147 : --------AG--------TG----T--CAT---ACT-TTA-TTTT------TC------A-GTTTGC-T-------A---C-----AGT---C--T--T--AAA------A------A-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T----------GT-TCA----T-A-----TTC-TTTT-T---TCCA-ATCTC-GAAGGCTT-
Alignments
lowQualScore : 222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222222222222222
lowQualScore : 33 1 1 1 888888 22 1 444 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6666666666 111 0 0 0 5555555 222222222 0 11 1 1111 0 111 777777777777777777 00 1111 00 11111 0 222222222 111 00 333333333333 33333333333 2 111 3333333333 22222222 00 2222222222 22222222 22222222 1111 00 111 1 1 111111 111111 0 0 4444444 111 22222 333 11 00 444 111111 333333 0 66666 11111 00 00 111 3333 11 44 2222222 0 2 3 0 0 777777 11 0 111 0 0 0 1 1 1
lowQualScore : .. . . . ...... .. . ... ......................................................................... .......... ... . . . ....... ......... . .. . .... . ... .................. .. .... .. ..... . ......... ... .. ............ ........... . ... .......... ........ .. .......... ........ ........ .... .. ... . . ...... ...... . . ....... ... ..... ... .. .. ... ...... ...... . ..... ..... .. .. ... .... .. .. ....... . . . . . ...... .. . ... . . . . . .
lowQualScore : 77 7 0 7 999999 11 5 888 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4444444444 444 8 8 8 1111111 999999999 7 00 4 5555 7 222 888888888888888888 99 3333 99 66666 6 555555555 000 88 000000000000 33333333333 7 000 0000000000 00000000 88 5555555555 00000000 00000000 2222 88 000 1 7 777777 777777 6 6 0000000 111 66666 000 44 88 444 888888 333333 6 22222 77777 99 99 222 7777 00 66 4444444 7 0 7 7 7 999999 88 7 333 3 9 9 0 4 8
consensus : TTTTCCC-CA-ANTG-A-G--C-AAA--A-AA---A---------T---------------T-----------T---------T----T--G-A----A----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TANTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
Reference ( family-393 ) : TTTTCCC-CA-ANTG-A-G--C-AAA--A-AA---A---------T---------------T-----------T---------T----T--G-A----A----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TANTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
gi|40076 : TTTTCCC-CA-AATG-A-A----AAA--C-AA---A---------T---------------TAT---------T---------T----T--G-AGGG-A----------AA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AAAT----CT--CA----------GGATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TTA-TTTC------CC------A-GTTTGG-T-------A---A-----AAT---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAT-T-T-G-----TT--ATTT-C---CCT--------GAAGGCTT-CG----------TAATATCCAGGAT-AAA
gi|40077 : TTTTCCC-CA-AATG-A-A----AAA--C-AA---A---------T---------------TA----------T---------T----T--G-AGGG-A----------TA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AATT----CT--CA----------GGATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---AAAATTTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTTT-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCACAATATCCAGGAT-AAA
gi|40078 : TTTTCCC-CA-AATA-A-A----AAA--C-AA---A---------T---------------TAT---------T---------T----T--G-AGGG-A----------AA----------TTAT---TC-TT-ATA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----G-AAA---AAAT----CT--CA----------GGATA----T--GAAA-----T-A---------TTGTTGT---AATATCTTAT--G------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TCA-TTTC------CC------A-GTTTGG-T-------A---A-----ATC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCA--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-T---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCTAATATTCAGGAT-AAA
gi|40079 : TTTTCTC-CA-AATG-A-A--A-AAC--A-AATT-A---------T---------------T-----------T---------G----T--G-AG---A----------AA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-TT----A-AAA---AA------TC--TC----A-T----GATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---TA-ATCTGAC--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ATT-TTA-ATTG------TA------A-GTTTGG-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCA--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--GTTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCCAATATCCAGGAT-AAA
gi|40080 : TTTTCCC-AA-ATTG-A-A----AAA--C-AA---A---------T---------------TA----------T---------T----T--G-AGGG-A----------AA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AATT----CT--CA----------GGATA----T--GAAT-----T-T---------TTGTTGT---AATATTTGAT--A------------AT-----------TAATTGTAA---GAACATT----------AT--------C--TAAA----------C--------AG--------TG----C--TGG---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---T-----AAC---C--T--T----A------A------C-A-AT--T-----CCA--A--AT---TTC----CACAGA--C-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCCAATATCCAGGA
gi|40081 : tTTTTCCC-CA-ATTG-ATG--CCAAA--A-AA---A---------T---------------T-----------T---------C----C--C-A----A----------AG----------TTTT---TA-TT-ACA-T-----T-A---------AG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TT---GT---AATATCTGAT--G------------AT-----------TAGTGGTTA---AAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-AAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAAtgaa
gi|40082 : TTTTTCC-CA-ATTA-ATG--C-AAA--A-AA---A---------A---------------C-----------CCACCAAAAAT----T--A-A----A----------AAAATATG----TTTT---TC-AT-CAA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GACG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------GT-----------TACTGGTTA---GAACATG----------AT--------T--TAAA----------C--------AA--------TA----T--TAT---GCT-TTA-GTTT------CA------A-GTTTGC-TAA-----A---A-----AGT---G--T--T--AAT------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-CTGCGC-T-G------T--TTTT-C---CCCA-ATCTC-AATGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40083 : TTTTCCC-CA-ATTG-AAG--T-AAA--A-AA---AAAATTTTATT---------------T-----------T---------T----T--A-A----ATCTTTTTTT-AA----------TTTT---TC-CT-GCA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---CG------C-----------------ATA----A--GAAG-----T-A---------TTATTGG---AATATCTGAT--A------------AT-----------TA-TAGTTA---GACCAAG----------AT--------C--TTAA----------C--------AA--------TG----A--TAC---ACT-TTA-TTTTTATTTTCG------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-TT--A-----CCC--A--AC---TTC----CTC--T--C-------AA---GCAC---A-----TT--TTTA-T---GCCA----TT-AAAGGCT
gi|40084 : TTTTCCC-CTTAATG-A-G--C-AAA--A-AA---A---------A---------------A-----------T---------T----T--------------------------------TTTT---TC-TT-ACA-T-----A-T---------GG-C--G-AT----A-AAA---AA------AT--------A-C-----ATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---ATTATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---GCT-TTT-TTTT------CC------A-GTTTG
gi|40085 : TTTCCCC-CA-ACTG-A-GACC-AAA--A-AAAAAA---------T---------------T-----------C---------TAAAAT--G-G----A----------AATTTTGGGAATTTTT---TC-TT-ACA-T-----A-A---------AG-G--A-AT------AAA---AA------CC----------C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------ATGTTAT---AATATCTGAT--C------------AT-----------TAATGGTTA---GAATATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG----T--TTC---GCT-T
gi|40086 : TTTTCCCGCA-ATAG-A-GG-C-AAA--------------------------------------------------------------T---------A----------AA----------TTTT---TC-TC-AAA-A-----T-G---------GA-A--G--C----A-AAA---AA-----------A----A-A--TGGACA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCGGAT--A------------AA-----------TATTGGTTA---GTACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AA--------TA----T--TATTTAGCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---ATTT--AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--A
gi|40087 : TTTCCC-AA-AATGGA-A--A-AAA--A-AA---A---------TAG-------------T-----------T---------T----T--------------------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---CC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GACA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTAAT--C------------AT-----------TTTTGGTTA---GAACAT------------------------------------------------G--------TG----T--TGC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-ATTTGC-T-------G---A-----AGT---C--G--T--AAA------A------A-A-ATA-T-----CCC--T--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-ATGCAC-T-G-----TT--TTTT-T---CCTA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAa
gi|40088 : TTTTTCC-AA-ATTG-A-GGCC-AAA--A-AA---A---------T---------------T-----------C---------A----C----A----A----------AA----------T----------------------------------GG-A--A-AT----A-A-----------------TA----A-C--TTGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTAT--------------------------------------------------------CAT-----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----T--TAT---GCT-A-A-CTTT------CC------A-ATTTGA-T-------A---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA----------------------TT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-taaa
gi|40089 : tttccaattaaaaaatcatatcaaatttttTTCCC-AA-AAGG-A------AAA--A-CA---A---------T---------------T-----------T---------T----T--TTA----ATTTTTTTTTTAA----------TTTT---TA-TT-ACA-T-----C-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------TA--CA----C-C--TGGATA----T--GAAG-----T-T---------TTATTGT---AATCTCTGAT--A------------AT-----------TATTTGTTA---GAACAAG----------AT--------A--TTAT----------C--------AG--------TG----C--TCC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---G-----AAC---C--T--TA-AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AC---TTC----CCC--T--C-------AA-TCAAGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGATT-GGGCCT--TTCCCAATTTCAAGAAA-AAc
gi|40090 : A----------TTTT---TC-TT-ATA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---A-------CC--CA----A-A--TGGATA----T--GAAG-----T-G---------TTATTGG---AATAACTGAA--A------------AT-----------TATTAGTAA---GACGATG----------AT--------A--TAAA----------C--------AA--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CG------A-GTTTGC-T-------A---G-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-TT--T-----CCC--A--AT---TTC----CTC--T--C-------AA-TAACAC-T-G----------TTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-
gi|40091 : ttcccaaaataaccatttTTCCC-AA-AATG-G-A--A-AAA--A-AA---A---------T---------------T-------------------------------------------------------------------C-TT-ACA-T-----T-A---------------------------------------TC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TGAACAT--TAT---GCT-TTA-TCTT------CC------A-GTTTGCAT-------G---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-C-A---T-----CCC--A--AA---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATTTC-CAA
gi|40092 : TTTTTCT-CA-ATTG-A-GG-C-AAA--A-AA---G---------T---------------T-----------T------------------------A----------AT----------TTTT---TT-TT-ACA-T-----C-A---------GG-A--T-AA----A-AAA---AA------CAA-CA----A-T--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AC-----------TGTTGGTTA---GAACCTG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CA------A-GTTTGT-TA------A---A-----AGT---C--T--T--AAA------A------attca
gi|40093 : ttcccaataaaaaaaaaaaaatttcTTCCC-AA-AAT-------C-AAA--A-AA---A---------TAATTATATTTTATTAT-----------T---------T----T--C-A----A----------A------------TTT---TC-TT-ACA-T-----A-A---------GA-G--G-AT----A-AAA------------C--CA----A-C--TGGATG----TAAGAAG-----TTG---------CT-TTGT---GATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GGACACG----------AT--------C--TGAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GGT-TTA-TTTT------CA------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGC---C--T--T--AAA------
gi|40094 : TCCC-AA-AATG-A-A--A-AAA--A-AA---A---------T---------------T-----------T---------T----T--T-T----TTTTTT-----AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------AA--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C-----------------------------T---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---TTGT--T--AAGTTTGTTA------A-A-AT--T-----CCT--G--AT---TAC----CCC--T--C-------AA-TCTTGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCTA-ATCTT-AAAGGCTT-
gi|40095 : TCCC-AA-AATG-A-A--A-TAA--A-AA---ACTATAT---T---------------T-----------T---------T----T--T-A----A----------AA----------TTGT---TC-TT-ACA-T-----T-C---------GG-T--G-AT----A-AAA---GAAGAAGTTG--CA----A-C--TGAATA----T--AAAG-----T-A---------TTATTGT---AACATCTGAT--A------------GT-----------TATTGGGTA---TAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CA----T--TGG---GCT-TTA-TTTT------CC------A-ATTT
gi|40096 : TTCCC-AA-ATTG-G------AAA--A-AA---A---------T---------------TGTTGTTGTTTTT---------T----T--G-T----G----------AA----------ATTT---TC-TT-ACA-G-----A-A---------GG-G--G-AT----G-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATAGT---AATACCTGGT--A------------AG-----------AAATGGTTA---GAACATG----------TT--------C--TTAT----------C--------AG--------TG----T--TAC---TCT-CT--TTTT--------------A-GTTTGC-T-------ATTGA-----AGA---T--T--T--AAA------A------A-T-AT--C-----CCC--A--AT---TTC----CCA--TG-C-------AA-TCACGC---------TT--TTTC-C---CCCA-ATCTC-GACGGCTT-AGGCCTC-TTCCCAATTTACAGGGA-AAA
gi|40097 : TCCC-AG-AGTG-A-A--T-AAA--A-GA---T---------T---------------T-----------T---------T----TTTG-A----G----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----TTA---------GG-G--G-AT----A-GAA---AC------CT--CA------C--TGGATC----T--GAAG-----T-ACAGTCTGTATTGTTGT---AATATCTGAT--A------------AC-----------AAATCGTGG---GAACATG----------AT--------C--TAAA----------C--------AG--------TG------------------TA-TTTT------CC------A-GTTTGC-C-------A---A-----AGC---C--T--T--------------------A-AT-----------------T---TTC----CCC--T--C-------GA-TTGCAC-T-G-----TT--TTTT-C---C
gi|40098 : TCCC-CA-AATG-A------AAA--ATAA---A---------TATTTTT---------T-----------T---------T----T--T-A----G----------AA----------TTTT---TC-TT-CCA-T-----TTA---------GG-A--G-AT----A-AAA---CT------CC--CA------C--TGGATG----T--GGA-------------------TATTGT---AATAGCGGAT--A------------ATAAATAGTTAATTAATGGTTA---GAACTTG----------AA--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---CCT-TCG-TT
gi|40099 : CCC-AA-ATTG-A-GG-C-AAACAA-AA---A---------T---------------T-----------CCC-------T----T--------------------------------TTTTATGTC-TT-A-A-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------ACAACA----A-T--AAGATA----T--TAAACTTTAT-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------CATTGGTTA---GAACACG----------ATATAAATTTC--TTCA----------C--------AG--------CA----T--TAT---GCTATTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTC----CCT--T--T-------AA-TTACAC----------T--TTAT-C---CCCA-ACATCGGAGGGCTT-
gi|40100 : c--A-AA---A---------T---------------G-----------TGGG------T----T--G-G----G----------AA----------TTTT---TC-TTAACA-A-----T-A---------GG-T--T-AT----A-AAA---AA------AA--C-----A-C--TGGATA----T--GTAC-----T-A---------TTAATGT---AATATCAGAT--A------------AT-----------TAATGGTCA---GAACATG----------TT--------C--TTAA----------C--------CG--------TG----T--TGC---ACT-TCA-TTTT------AC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C-----T--AAA------A------A-G-AT--
gi|40101 : cccaaataatttc---------T---------------T-----------T---------T----T--G-A----G----------AA----------TTTT---TC-CC-ACA-TA----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAC---TA------GC--CA------C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------------------------GTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--CAC---ACT-TTA-TT
gi|40102 : ccaaatataataaacatttttattAA--A-AA---A---------T---------------C-----------C---------CAAAAT--G-A----G----------AG----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----C-ATGTACATGTGGCA--G-AT----A-AAA---AC------CCTGCAGTATA-G--TGGATA----T--GA-G-----T-A---------TTACAGT---GTTATCTG-T--A------------AC-----------TATTTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGT---GCT-ATG-TTTA------CC------A-GTTTGC---------A---ACAGCCAGC---C--T--T--AAA------A------A-T-GT--T-----CCC--A--AT---TTCCACTCCC--T--C-------AA-TCACGC-T-A-----TT--TCTT-T---CGAA-A-CTC-AAAGGCTT-GAGCCTC-
gi|40103 : g----------AA----------TTTT---TC-TT-ACAGT-----T-T---------TG-G--G-AT----A-AAT---CA------CC--------A-C--TGGATA----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---TATATTGGAT--T------------AT-----------TATTGGTTT---GAACATG----------AT--------C--TT-A----------C--------TT--------TA----T--TTC---GCT-TTA-TTTT------CTTCAGTGA-GTTTGC-TTTGTAACA---G-----AGCTCTC--T--T--CAA------A------ATA-GT--T-----CTA--A--AT---TTCATCTCGC--T--C-------AA-TTTC-----------TT--TTTT-T---TTCATATTTC-AAAAGCTT-GGGCGTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAAcataggataaa
gi|40104 : aaaaggaaattgcagg-A-A--C-AAA--A-A---------------------------------------------------------T--G-A----G----------GA----------TTTT---TC-TT-ACG-TGAATTT-A---------GG-GTGG-GG----A-AAA---AA------GT--TA------C--TAGATAATTAT--GAAA-----T-A---------TTATTTT---AATATCTGAT--A------------AA-----------TAATGGTTA---GAACATGG---------AT--------C--TTAA----------C--------AG------------------------CT-TTG-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---A--T--T--AAG------A------G-A-AT--T-----TCC--A--AT---TTT----CTC--T--T-------GA-TTGCAC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTT-GAAGACT
gi|40105 : aa---------T---------------T-----------T---------TGTG-T--G-T----A----------AA----------TCTT---CC-TT-ACA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGAAT---GAACATG----------AT--------C--ATAA----------C--------AG--------TG----T--GAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGC---T--T--T----A------A------A-A-AT--T-----CTT--A--AT---TCC----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTT-GAAGGCTTGGGGCCTC-TTCCCAATTTATAGGAT-AAA
gi|40106 : tt---------T---------------T-----------T---------T----T--G-GTAGTG----------AA----------TATC---TC-TT-ACA-T-----G-A---------GG-G--G-AT----T-AAA---AA------C---------A-C--TGGATG----T--GAAA-----T-A---------TTATTATTATAATATCTTAT--ACTTACTTGTTACATG----------TAATGGTAA---GAATATG----------AT--------C--TTAAATTACAATAAC--------AG--------TG----T--TAC---ATGGTTG-TTTT------CC------A-CATTGC-T-------G---A-----AGG---T--T--TTAAAA------A------A-A-AA--T-----CCA--A--AT---TTA----CCC--T--C-------AA-TTGCTC-T-G-----TT--TTTT-C---CC
gi|40107 : t----------AA----------TCTT---TC-TC-ACA-A-----T-A---------GG-G--G-AT----T-AAA---AA------C---------A-T--TGGATA----T--GAAT-----A-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TA-TGGTTA---GAACACG----------AC--------C--TCAA----------TATAATGAAAG--------TA----A--TGT---GCT-T---TTTT------TC------A-GTTTGC-T-------A---T-----TGC---C--T--T--AAA------A------A-t
gi|40108 : ttcgatgtg----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-T---------AG-G--G-AA----A-AAA---TA------CT--CA------C--TGGATA----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------GT--------C--TTAA----------C--------TG--------TG----T--CAT---ATT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---C-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCT--T--T-------GA-TCGCGT-T-G--------------------------------------GGGTCTC-TTCCCAATTTCCAGAAG-AAAgcaaa
gi|40109 : ggggggA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----A-A---------AG-G--A-TT----A-AAA---AA------AC--------A-C--TAGGTA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT------------AATGGTTA---GAACATG----------AT--------A--TTAG----------C--------AG--------TG----T--TTT---GCT-ATA-TTTT------TA------A-GTTTGC-A-------A---A-----AGCTT-T--T--T--AAA------A------A-A-AT--C-----CCC--A--AT---TTC----CTC--C--T-------GA-TCAAAC-T-G-----TT--TTTT-C---TCCA-ATAT-------CTT-GGACCTC-TTCCCAATTTCCTGGA
gi|40110 : gagggg---TC-TT-GTA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------AT--AA----A----TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AAAATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACTTG----------AT--------C--TTTA----------C--------AG--------TT----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------AT-----A-A-AT--T-----CTC--A--AT---TTC----
gi|40111 : gggaaaaaaaTTT---TC-TT-AAA-T-----A-A---------GG-C--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--TAAC-----T-T---------TTATTGT---AAAATCTGAT--A------------AC-----------TATTGGACA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TTT---TCT-TTA-TTTT------GC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T------------------G-A-AT--TTTCCCCCC--A--AT---TTC----CCG--A--C-------AA-CCATGCTT-G-----GT--TTTT-T---CC----------------T-GGATCTCTTTCCCAATTTATAGGAATAAA
gi|40112 : gggag-A---------GG-G--G-GG----G-AAA---AG------C---------A-C--TGGATA----T--GTAA-----T-A---------TTTTTGT---AATATTGGAT--T------------AT-----------TAATGGTAA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TT----T--TCA---GCC-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGCTTTT--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCA--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-C---CC
gi|40113 : aaaatattctaaacatggaaaaa----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----C-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------AC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---GATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTA---GAACGTG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-CT--T-----CCA--A--AT---TTA----CCC--T--C-------AA-TATCAT-T-------TT--TTTT-C---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40114 : ----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-G---------AA-G--G-AT----A-AAA---AA------CAA-CA----A-C--TGAATA----T------------------------TATTGT---AATTTCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTAA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-TTTTGC-T-------T---A-----AGC---C--A--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--T-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCAA-AT-TT-GAAGGCTT-GGACCTT-TTCCCAATTTCCAGAAC-AAA
gi|40115 : ----------AA----------TTTT---TC-AA-ACA-T-----G-C---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATT-----AACATCTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------AG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-AA--T-----CC------------TC----CC------C-------AA-TCACAC-T-------TTAATTTT-T---CC
gi|40116 : ----------AA----------CTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GA-A--G-AT----A-AAA---CC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTGTTGT---AGTTTCTGAT--A------------AT-----------GATTAGTTGAATAAACATG----------AT--------C--ATAA----------C--------AG--------TG----T--ATC---ACT-TTA-TTTT------CA------A-TTTTAC-T-------A---A-----AGT---C--T--T--AAA------A------A-A-A---T-----CCA--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G-----TT--TTTT-T---CC
gi|40117 : A----------TTTT---TC-AT-ACA---------A---------GG-A--G-AT----A-AAC-----------CC--CC----A-C--TGTAAG----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TCATGGTTA---TAACATG----------AA--------G--TTAA----------A--------AG--------TG----C--TAT---GCT-TTATTTTT------CC------A-GTC----------------------AGC---C--T--A--AAA------A------A-T-AA--T-----CCA--A--AT---TTT----TGC--T--C-------GA-TTACAA-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCAC-GAAGACTT-
gi|40118 : A----------TTTT---TC-TG-ACA-T-----A-C---------TG-G--G-AT----A-AAA---AA------T---------A-C--TGAATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATATGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAGCATG----------AT--------C--TTTA----------T--------AG--------TG----T--TAC---AC----A-TT----------------A-GTTTGC-T-------T---A-----ACC---C--T--T--c
gi|40119 : ----------TTTT---CC-TT-ACA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA------------T--CA------C--TGTACA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TTATGGTTG---GAACATGTCGGGTCATAAT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------T-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T-----------G------A-T-TT--T-----TTC--ACCAT---TTC----CGC--C--C-------AG-TCACAC-T-G-----TT--TTTTCT---CAAA-ATGTT-GAAGACTT-tactccatagatacacgttttcacgcaccaatcac
gi|40120 : A----------TTTG---AC-TT-ACC-T-----T-A---------GG-G--G-ATTACAA-AAA---AA-----------A----A-C--TCAATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------CATTGGTTA---CAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--TAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--A
gi|40121 : ttT---TCATT-ACA-T-----T-A---------AG-G--A-AT----A-AAA---AAA-----CT--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----C-A---------TTATTGT---TATATCTGAT--A------------AC-----------TATTGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--CAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--TAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTT----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G-----TT--TTAT-T---CCCA-ATTTC-
gi|40122 : tca----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-G---------GA-G--A-GT----A-AAA---AG------CC--CA----A-C--TAGATA----T--GAAG-----T-A---------CTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTAGTTA---GAATATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG-------TAT---GTA-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----ATC---C--T--T--AAA------A------T-A-AT--T-----CCT--A--AT---TT-----CCC--T--C-------AA-TTGCCT-T-G------A--TTTT-T---CCCA-ATCTA-GAAAAATT-GGGCCTC-TTCCAAATTCCCAGATA-AAcagaaaaaa
gi|40123 : ----------TTTT---TC-TA-ACA-T-----T-A---------CA-G--A-AT----A-AATTTTAA------CC--CA----AAC--TGGTTA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGG---AATATATGAC--A------------AT-----------TATAAATTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C---------T--------TG----T--TAC---A----TA-T-------------------GCT-AT-T-------A---A-----AGC---C--T--TTTAAA------A------A-ATATAAT-----CAC--A--AT---TTCT---CCC--T--T-------AA-TCA-GC-T-G-----TT--TTTC-----CCCA-ATCTC-CAAGGCAT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40124 : ----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-A-------------------------C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATG----------------------------------C--T--------------------------------------T--TA------T-TT-----T------TC------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGT---C--T--A--AAA------G------A-A-A
gi|40125 : ---TC-TT-ACA-T-----T-T---------TG-G--G-AT----ATAAA---AA------C----A----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCCAAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAG----------C--------AG--------TG----TTGTAC---ACT-TTA-TTTT------CC------C-TTTTGT-T-------A---A-----TGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AG--T-----CAA--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAC-T-G-----TT--TTTT-T---CCaat
gi|40126 : ---TC-TC-ACA-T-----A-A---------GT-G--G-AT----A-AAA---AA------AC--------A-C--TGGCTA----T--CA-----------------------------AATACCTGAT--A------------TG-----------TAATGGTAA---GAACACG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG-------------------C---ATT-TTA-GTTT------CC------A-ATTT---------------A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTG----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTC-T---C
gi|40127 : C-TT-ACA-T-----A-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------GC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATGGC---AATATCAGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---TAAC-TG----------GT--------C--TTAA----------C--------AG--------TA----T--TGC---CCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-T-------A---A-----AAT---CG-T--T--AAA------A------G-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TC-TGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCAC-AAAGGTTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCTAGt
gi|40128 : -TT-ACA-T-----TTA---------GG-G--G-AT----A-GAA-----------------------C--TGGATA----T--GAAG-----T-T---------TTACTAT---GATATTTGAT--G------------AT-----------TAATGGTTA---GAACATG----------AA--------C--TTGA----------C--------AG--------CG----T--CA----GCT-TTA-TTGT------CC------A-GTTT----------------------GC---C--T--T--TAA------A------A-A-AT--T-----CCA--A--AA---ATC----TCA--T--C-------AA-TCAC------------------------------TCTC-GAAGGTTT-TGGCCTC-ATTCCAATTTCCAAGAA-AAA
gi|40129 : -T-----T-A---------AA-G--GTAT----A-AAA---AA------AA--CA------C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--G------------GA-----------TAATGGTTT---TAACAT---------------------C--TTAC----------C--------AG--------TG----T--TAC---TCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTTC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------G-A-AT--T-----TCC--A--
gi|40130 : -A---------GG-G--GTAT----A-AAA---AA------AC--CA------T--TGGATA----T--GGAA-----T-A---------TTACTGT---TATATCTGAT--T------------AT-----------TGATGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AGCGTTATTATG----T--TAC---ACG-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-C-------G---C-----AGT---C--T--TA-AAA------A------A-A-AA--T-----CCC--A--ATTAATTT----CCC--T--T-------AATTTGCAC-T-G-----TT--TTTT-T----CCA-ATCTC-GAAGGTTT-GAGCCTC-TTCCCAAATTCCAGGAA-AAA
gi|40131 : G-G--G-AT----G-AAA---AA-----------A----A-TATTGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTTCTTT---ATTATCTGAT--A------------TT-----------TGATGGTTA---TAA--TG----------AT--------C--CTAA----------C--------AG--------TT----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-T-------A---C-----GGT---C--T--T----A------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--
gi|40132 : -AAA---AA-----------A----A-T--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---TATATCTATT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TA----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA--------------------------------A--AT---TTC----CTC--T--G-------AA-TTGTGC-TGG-----TT--TTTT-T---CCCA-GTCTT-GAAGGCCT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAAtgac
gi|40133 : ATG----T--GAGA-----T-G---------TAGTT-T---GATAT--GATGTA------------AT------------ATTA-TTA---GAA-ATG----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------GT------A-GTTTGT-T-------A---A-----AAC---C--A--T--AAA------A------A-G-G---------CCC--A--AA---TTC----TCC--T--C-------AA-TCCTGC-T-GTGTTTTT--TTTC-T---CCCA-ATTTT-GAAGACTT-GGACCTC-TTCCCAATTTCCAG
gi|40134 : aaaagagtatcggtatatac----A-AAA---AA------TC--AA----A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAG--A------------AT-----------TATTAGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C------------------TG----T--TTC---TCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTCGT-T-------T---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--TT---TTC----CTG--T--C-------AG-TCGCGC-T-G------C--TTTT-T---CCCA-ATCTC-AAAGGCTT-
gi|40135 : GGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---CATATCTGAT--A------------AT---------------GGTTA---GAATATA----------AT--------T--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------TC------ACGTTTGC-T-------A---C-----TGT---C--T--T--GAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--T-------AA-TCGCAC-T-G------T--TTAT-T---CCCG-ATCTC-GAAAGTTT-
gi|40136 : GATA----T--GAAG-----T-T---------TCATTGT---CATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGATA---GAAAATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---ACA-TTA-TTTC------CC------A-GTTTGC-T-------A---G-----AGC---C-----T--AAA------A------A-A-TT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCG--T--C-------AA-TCACAT-T-GT----TT--TTTT-T---CCCA-ACCTC-GAAG
gi|40137 : GATG----T--AAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCCGAA--A------------AC-----------TAAAGGTAA---GAACATA----------AT--------CTTTTAA----------C--------AG--------TA----T--TAC---GTT-TTA-ATAT------TC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---C--T--T-----------A------A-A-AT--T-----TCCTAA--AT---TTC----CCC--T--CATTGTTTAA-TCGCGA-T-G------A--TTTT-T---CCCA-ATGTA-G-AGGCTT-TCACCTA-CTCCAAATTTCCAGGAA-AAAat
gi|40138 : A----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TACTGGTTA---GAACATG----------AG--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----G--TAC---CCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------T---A-----------C--TGGT--AAA------ACTGGTCA-A-TT--T-----CCA--A--AT---TTC----CCA--A--A-------AA-TCGCGC-T-G---------TTTT-T---CCCA-ACCTC-AAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40139 : AA-----T-A---------ATATTGC---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGATTG---AAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTAAC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------AAT----A-A-ATAAT-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCCCAC-T-GA----TT--TTTT-C---CCCA-ATCTC-CAAGAC
gi|40140 : tATCGT---TATATCTGAT--A------------AT-----------TTATGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-A----------AG--A--AT---TGC----TCC--T--C-------AA-TAGTGC-T-G-----TT--TTTT-T---TCCA-ATCTT-GAAGGCTT-cctgaat
gi|40141 : TTTT---AATATCTGTT--A------------GT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTA------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AA--T-----CTC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAA-T-G-----TT--GTTT-
gi|40142 : T---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTG---GAACATG----------AT--------G--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAG---GCT-TTATTTTT------CC------A-ATTTGC-T-------A---A-----ATC---T--T--T--TAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTG----CCC--T--C-------AA-T
gi|40143 : ATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTA---GAACATG----------AT--------T--TTAA----------C--------A----------G----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTT
gi|40144 : -----------TAGTTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-TA------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------G-A-TT--T-----TCC--A--AT---TTC----CTC--T--A-------AA-TCAAGC---------TT--TTTT-T---CCAA-ATCTC-AAAGACTT-GGGCCTC-TTCCCAAT
gi|40145 : TA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTT-------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AGA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--GT---TTC----CCC--T--C-------AT-TTGTGC-T-G-----TT--TTTT-----------TCTC-GAAGGCTT-
gi|40146 : gttacatcatttttgAACATG----------AT--------C--TTGG----------C--------TG--------TG----T--TAC---ACT-TTATTTTT------CC------T-GTTTGC-T-------A---C-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-GT--T-----CCA--A--AT---TAT----TTC--T--T-------GA-TCACGC-T-G-----TT--TTTT-TTCCCCCA-ATGTC-AAAGGTTT--GGCCTC-GTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
gi|40147 : --------AG--------TG----T--CAT---ACT-TTA-TTTT------TC------A-GTTTGC-T-------A---C-----AGT---C--T--T--AAA------A------A-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T----------GT-TCA----T-A-----TTC-TTTT-T---TCCA-ATCTC-GAAGGCTT-
blockSeqs : GC T A G TGCC CA T AAA AAATTTTATTTTTTAAATCTTTTTTT TTTTGGGAAT ATG GAATTT TGTACATGT T TACA TTT AGAAGTTGCAA ATTA CTTTA CAGTCTGTA TAT CTTACTTGTTAC AAATAGTTAAT A AAT TCGGGTCATA ATAAATTT ATTACAATAA ATAATGAA CGTTATTA AACA A T TATTTT TCAGTG TTGTAAC TTG CAGCC TCT TG TAA TTTGTT CTGGTC TATAA TTCCC TAA CACT GA ATTGTTT A G TGTTTT AA TCC G T T
blockSeqs : C . A . GACC . . TT TAATTATATTTTATTATTTTCAA AATATG . TT . T . . CCTGCAGTATA . . . . . G A . G . . . . . G T . . AA . TTT TTT G TTA . AT ATAA . . ATCT GA . A G TT C . . . .
blockSeqs : C . A . GGCC . . . TTTTTTTAATTTTTTTTTT . . TT . . . . ACAACAA . . . . . . A . . . . . . . . T . . A . . TT . AA . T ATA . . T GA . A A AT . . . . .
blockSeqs : C . T . TGC . . . TTGTTGTTGTTTTTTTGTG . . AT . . . . TTCTCA . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . AA . . AT . . . G . A A T . . . . .
blockSeqs : A . T . AGT . . . ACCCACCAAAAATTAAA . . TT . . . . ATCTCA . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . A G T . . . . .
blockSeqs : C . T . GGC . . . CTATATTTTTTTAA . . T . . . . TTCTCA . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . G A T . . . . .
blockSeqs : C . T . GGC . . . TATTTTTTTTTTAG . . A . . . . CAACAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . TT . . . . . G A T . . . . .
blockSeqs : C . A . GGC . . . TTATTTTGAGGGA . . T . . . . CAACAA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . G G T . . . . .
blockSeqs : C . C . AA . . . TTTTTTTTTTTTT . . T . . . . ACTCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . A G T . . . . .
blockSeqs : C . T . GC . . . TTATTTGAGGGA . . T . . . . CCCAAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . A A T . . . . .
blockSeqs : A . A . AA . . . TTATTTGAGGGA . . T . . . . TCTCA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . TT . . . . . A A T . . . . .
blockSeqs : A . T . AA . . . TTCTAAAATGGA . . T . . . . CCCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . T G T . . . . .
blockSeqs : A . A . AA . . . TCCCAAAATGAG . . A . . . . CCCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . A A T . . . . .
blockSeqs : A . A . AA . . . TTTTTGGTAGTG . . A . . . . CCCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . G G T . . . . .
blockSeqs : C . T . AT . . . TGTGGGTTGGG . . T . . . . TACAC . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . A T T . . . . .
blockSeqs : A . A . AC . . . TTTTGTGTGTA . . T . . . . CCCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . GT . . . . . A G T . . . . .
blockSeqs : A . A . A . . . TTTTTTTGAG . . C . . . . TCCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . GT . . . . . T A T . . . . .
blockSeqs : A . A . A . . . TTTGTGAGA . . T . . . . AACAA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . G G G . . . . .
blockSeqs : A . T . A . . . TTTCCCAA . . T . . . . ATAAA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . A G T . . . . .
blockSeqs : A . G . C . . . TTTTTGAG . . C . . . . ACCAA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AA . . . . . G A T . . . . .
blockSeqs : C . A . . . . . TAGTTTT . . A . . . . CCCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . G G T . . . . .
blockSeqs : A . T . . . . . TTCACAA . . T . . . . CCCCA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . AT . . . . . A A T . . . .
blockSeqs : . . . . . TTCCCTT . . T . . . . CCCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . A G T . . . .
blockSeqs : . . . AATTT . . A . . . . GCCAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . G A T . . . .
blockSeqs : . . . TTTA . . T . . . . TCAAA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . CT . . . . . T A T . . . .
blockSeqs : TGAG . . T . . . . CCAA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AA . . . . . G G T . . . .
blockSeqs : TA . . C . . . . CTCA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AA . . . . . A C T . . . .
blockSeqs : TT . . T . . . . CCCA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . TT . . . . . A G T . . . .
blockSeqs : . . A . . . . AACA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . A A T . . .
blockSeqs : . . G . . . . GCCA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . A G T . . .
blockSeqs : . . T . . . . GTTA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AG . . . . . A G T . . .
blockSeqs : . . T . . . . CTCA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . G A T . . .
blockSeqs : . . A . . . . AACA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . AT . . . . . A G T . . .
blockSeqs : . . A . . . . ACCA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . AT . . . . . A G T . . .
blockSeqs : . . A . . . . ATA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AA . . . . . G G T . . .
blockSeqs : . . C . . . . TAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . A A T . . .
blockSeqs : . . T . . . . CCA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . G A T . . .
blockSeqs : . . G . . . . ACA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . G G . . . .
blockSeqs : . . T . . . . TCA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . TT . . . . . C G . . . .
blockSeqs : . . A . . . . CAA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . AT . . . . . G A . . .
blockSeqs : . . A . . . . ACA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . TT . . . . . G G . . .
blockSeqs : . . T . . . . CC . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AA . . . . . A A . . .
blockSeqs : . . T . . . . AA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . TT . . . . . G G . . .
blockSeqs : . . T . . . . CA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . AT . . . . . G G . . .
blockSeqs : . T . . . . CA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . GT . . . . . C G . . .
blockSeqs : . T . . . . CA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AT . . . . . G . . . .
blockSeqs : . T . . . . CA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . A . . . .
blockSeqs : . A . . . . CA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . A . . . .
blockSeqs : . A . . . . CA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . G . . . .
blockSeqs : T . . . . CA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . A . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . TA . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . G . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . AA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . AA . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : AC**** CCCAA************* AT*** **
originalCons : TTTTCCC-CA-ANTG-A-G--C-AAA--A-AA---A---------T---------------T-----------T---------T----T--G-A----A----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TANTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
finalCons : TTTTCCC-CA-ANTG-AAC----AAA--A-AA---A---------T---------------T-----------T---------T----T--G-A----A----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AACCCAA-------------C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TANTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-AAT---T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
Alignments
lowQualScore : 2222222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222222222222222222
lowQualScore : 2 1 1 1 5555555555 22 22 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6666666666 111 0 0 0 5555555 222222222 0 11 1 1111 0 111 777777777777777777 00 1111 00 11111 0 222222222 111 00 333333333333 33333333333 2 111 3333333333 22222222 00 2222222222 22222222 22222222 1111 00 111 1 1 111111 111111 0 0 4444444 111 22222 333 11 00 444 111111 333333 0 66666 11111 00 00 111 3333 11 44 2222222 0 2 3 0 0 777777 11 0 111 0 0 0 1 1 1
lowQualScore : . . . . .......... .. .. ................................................................ .......... ... . . . ....... ......... . .. . .... . ... .................. .. .... .. ..... . ......... ... .. ............ ........... . ... .......... ........ .. .......... ........ ........ .... .. ... . . ...... ...... . . ....... ... ..... ... .. .. ... ...... ...... . ..... ..... .. .. ... .... .. .. ....... . . . . . ...... .. . ... . . . . . .
lowQualScore : 5 8 0 7 6666666666 22 22 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4444444444 444 8 8 8 1111111 999999999 7 00 4 5555 7 222 888888888888888888 99 3333 99 66666 6 555555555 000 88 000000000000 33333333333 7 000 0000000000 00000000 88 5555555555 00000000 00000000 2222 88 000 1 7 777777 777777 6 6 0000000 111 66666 000 44 88 444 888888 333333 6 22222 77777 99 99 222 7777 00 66 4444444 7 0 7 7 7 999999 88 7 333 3 9 9 0 4 8
consensus : TTTTCCCNA-ANTG-A--A--C----AAA--AAA--A---------T------T------------T---------T----T--GA----A----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TANTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
Reference ( family-393 ) : TTTTCCCCA-ANTG-A--A--C----AAA--AAA--A---------T------T------------T---------T----T--GA----A----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TANTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
gi|40076 : TTTTCCCCA-AATG-A--A-------AAA--CAA--A---------T------TAT----------T---------T----T--GAGGG-A----------AA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AAAT----CT--CA----------GGATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TTA-TTTC------CC------A-GTTTGG-T-------A---A-----AAT---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAT-T-T-G-----TT--ATTT-C---CCT--------GAAGGCTT-CG----------TAATATCCAGGAT-AAA
gi|40077 : TTTTCCCCA-AATG-A--A-------AAA--CAA--A---------T------TA-----------T---------T----T--GAGGG-A----------TA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AATT----CT--CA----------GGATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---AAAATTTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTTT-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCACAATATCCAGGAT-AAA
gi|40078 : TTTTCCCCA-AATA-A--A-------AAA--CAA--A---------T------TAT----------T---------T----T--GAGGG-A----------AA----------TTAT---TC-TT-ATA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----G-AAA---AAAT----CT--CA----------GGATA----T--GAAA-----T-A---------TTGTTGT---AATATCTTAT--G------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ACT-TCA-TTTC------CC------A-GTTTGG-T-------A---A-----ATC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCA--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-T---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCTAATATTCAGGAT-AAA
gi|40079 : TTTTCTCCA-AATG-A--A--A----AAC--AAATTA---------T------T------------T---------G----T--GAG---A----------AA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-TT----A-AAA---AA------TC--TC----A-T----GATA----T--GTAA-----T-A---------TTGTTGT---TA-ATCTGAC--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATT----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TGC---ATT-TTA-ATTG------TA------A-GTTTGG-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCA--A--AT---TTC----CAC--TGAC-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--GTTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCCAATATCCAGGAT-AAA
gi|40080 : TTTTCCCAA-ATTG-A--A-------AAA--CAA--A---------T------TA-----------T---------T----T--GAGGG-A----------AA----------TTAT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AATT----CT--CA----------GGATA----T--GAAT-----T-T---------TTGTTGT---AATATTTGAT--A------------AT-----------TAATTGTAA---GAACATT----------AT--------C--TAAA----------C--------AG--------TG----C--TGG---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---T-----AAC---C--T--T----A------A------C-A-AT--T-----CCA--A--AT---TTC----CACAGA--C-------AA-TCAC-C-T-G-----TT--ATTT-C---CC-------T-GAAGG----------C-TTCCCAATATCCAGGA
gi|40081 : tTTTTCCCCA-ATTG-ATGC--C----AAA--AAA--A---------T------T------------T---------C----C--CA----A----------AG----------TTTT---TA-TT-ACA-T-----T-A---------AG-G--G-AT----A-AAA---AA------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TT---GT---AATATCTGAT--G------------AT-----------TAGTGGTTA---AAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----C--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCTC-AAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAAtgaa
gi|40082 : TTTTTCCCA-ATTA-AT-G--C----AAA--AAA--A---------A------C------------CCACCAAAAAT----T--AA----A----------AAAATATG----TTTT---TC-AT-CAA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GACG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------GT-----------TACTGGTTA---GAACATG----------AT--------T--TAAA----------C--------AA--------TA----T--TAT---GCT-TTA-GTTT------CA------A-GTTTGC-TAA-----A---A-----AGT---G--T--T--AAT------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-CTGCGC-T-G------T--TTTT-C---CCCA-ATCTC-AATGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40083 : TTTTCCCCA-ATTG-A--AG-T----AAA--AAA--AAAATTTTATT------T------------T---------T----T--AA----ATCTTTTTTT-AA----------TTTT---TC-CT-GCA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---CG------C-----------------ATA----A--GAAG-----T-A---------TTATTGG---AATATCTGAT--A------------AT-----------TA-TAGTTA---GACCAAG----------AT--------C--TTAA----------C--------AA--------TG----A--TAC---ACT-TTA-TTTTTATTTTCG------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-TT--A-----CCC--A--AC---TTC----CTC--T--C-------AA---GCAC---A-----TT--TTTA-T---GCCA----TT-AAAGGCT
gi|40084 : TTTTCCCCTTAATG-A--G--C----AAA--AAA--A---------A------A------------T---------T----T-------------------------------TTTT---TC-TT-ACA-T-----A-T---------GG-C--G-AT----A-AAA---AA------AT--------A-C-----ATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---ATTATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---GCT-TTT-TTTT------CC------A-GTTTG
gi|40085 : TTTCCCCCA-ACTG-AG-A--CCAAAAAA--AAA--A---------T------T------------C---------TAAAAT--GG----A----------AATTTTGGGAATTTTT---TC-TT-ACA-T-----A-A---------AG-G--A-AT------AAA---AA------CC----------C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------ATGTTAT---AATATCTGAT--C------------AT-----------TAATGGTTA---GAATATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG----T--TTC---GCT-T
gi|40086 : ----A----------AA----------TTTT---TC-TC-AAA-A-----T-G---------GA-A--G--C----A-AAA---AA-----------A----A-A--TGGACA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCGGAT--A------------AA-----------TATTGGTTA---GTACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AA--------TA----T--TATTTAGCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---ATTT--AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--A
gi|40087 : ttttcccgcaatagaggcaaatTTTCCCAA-AATGGA--A--A----AAA--AAA--A---------TAG----T------------T---------T----T-------------------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---CC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GACA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTAAT--C------------AT-----------TTTTGGTTA---GAACAT------------------------------------------------G--------TG----T--TGC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-ATTTGC-T-------G---A-----AGT---C--G--T--AAA------A------A-A-ATA-T-----CCC--T--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-ATGCAC-T-G-----TT--TTTT-T---CCTA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAa
gi|40088 : TTTTTCCAA-ATTG-A--GGCC----AAA--AAA--A---------T------T------------C---------A----C---A----A----------AA----------T----------------------------------GG-A--A-AT----A-A-----------------TA----A-C--TTGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTAT--------------------------------------------------------CAT-----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----T--TAT---GCT-A-A-CTTT------CC------A-ATTTGA-T-------A---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA----------------------TT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-taaa
gi|40089 : tttccaattaaaaaatcatatcaaatttttTTCCCAA-AAGG-A--A-------AAA--CAA--T---------T------T------------T---------T----T--TA----ATTTTTTTTTTAA----------TTTT---TA-TT-ACA-T-----C-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------TA--CA----C-C--TGGATA----T--GAAG-----T-T---------TTATTGT---AATCTCTGAT--A------------AT-----------TATTTGTTA---GAACAAG----------AT--------A--TTAT----------C--------AG--------TG----C--TCC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---G-----AAC---C--T--TA-AAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AC---TTC----CCC--T--C-------AA-TCAAGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGATT-GGGCCT--TTCCCAATTTCAAGAAA-AAc
gi|40090 : A----------TTTT---TC-TT-ATA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---A-------CC--CA----A-A--TGGATA----T--GAAG-----T-G---------TTATTGG---AATAACTGAA--A------------AT-----------TATTAGTAA---GACGATG----------AT--------A--TAAA----------C--------AA--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CG------A-GTTTGC-T-------A---G-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-TT--T-----CCC--A--AT---TTC----CTC--T--C-------AA-TAACAC-T-G----------TTT-T---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-
gi|40091 : ttcccaaaataaccatttTTCCCAA-AATG-G--A--A----AAA--AAA--A---------T------T-------------------------------------------------------------------C-TT-ACA-T-----T-A---------------------------------------TC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TGAACAT--TAT---GCT-TTA-TCTT------CC------A-GTTTGCAT-------G---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-C-A---T-----CCC--A--AA---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATTTC-CAA
gi|40092 : TTTTTCTCA-ATTG-A--GG-C----AAA--AAA--G---------T------T------------T-----------------------A----------AT----------TTTT---TT-TT-ACA-T-----C-A---------GG-A--T-AA----A-AAA---AA------CAA-CA----A-T--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AC-----------TGTTGGTTA---GAACCTG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CA------A-GTTTGT-TA------A---A-----AGT---C--T--T--AAA------A------attca
gi|40093 : ttcccaataaaaaaaaaaaaatttcTTCCCAA-AATC-A--A--A----AAA--ATA--A---------T------TATATTTTATTATT---------T----T--CA----A----------A------------TTT---TC-TT-ACA-T-----A-A---------GA-G--G-AT----A-AAA------------C--CA----A-C--TGGATG----TAAGAAG-----TTG---------CT-TTGT---GATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GGACACG----------AT--------C--TGAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GGT-TTA-TTTT------CA------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGC---C--T--T--AAA------
gi|40094 : TCCCAA-AATG-A--A--A----AAA--AAA--A---------T------T------------T---------T----T--TT----TTTTTT-----AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------AA--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C-----------------------------T---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---TTGT--T--AAGTTTGTTA------A-A-AT--T-----CCT--G--AT---TAC----CCC--T--C-------AA-TCTTGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCTA-ATCTT-AAAGGCTT-
gi|40095 : TCCCAA-AATG-A--A--A----TAA--AAA--ACTATAT---T------T------------T---------T----T--TA----A----------AA----------TTGT---TC-TT-ACA-T-----T-C---------GG-T--G-AT----A-AAA---GAAGAAGTTG--CA----A-C--TGAATA----T--AAAG-----T-A---------TTATTGT---AACATCTGAT--A------------GT-----------TATTGGGTA---TAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CA----T--TGG---GCT-TTA-TTTT------CC------A-ATTT
gi|40096 : TTCCCAA-ATTG-G--A--------AA--AAA--A---------T------TGTTGTTGTTTT-T---------T----T--GT----G----------AA----------ATTT---TC-TT-ACA-G-----A-A---------GG-G--G-AT----G-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATAGT---AATACCTGGT--A------------AG-----------AAATGGTTA---GAACATG----------TT--------C--TTAT----------C--------AG--------TG----T--TAC---TCT-CT--TTTT--------------A-GTTTGC-T-------ATTGA-----AGA---T--T--T--AAA------A------A-T-AT--C-----CCC--A--AT---TTC----CCA--TG-C-------AA-TCACGC---------TT--TTTC-C---CCCA-ATCTC-GACGGCTT-AGGCCTC-TTCCCAATTTACAGGGA-AAA
gi|40097 : TCCCAG-AGTG-A--A--T----AAA--AGA--T---------T------T------------T---------T----TTTGA----G----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----TTA---------GG-G--G-AT----A-GAA---AC------CT--CA------C--TGGATC----T--GAAG-----T-ACAGTCTGTATTGTTGT---AATATCTGAT--A------------AC-----------AAATCGTGG---GAACATG----------AT--------C--TAAA----------C--------AG--------TG------------------TA-TTTT------CC------A-GTTTGC-C-------A---A-----AGC---C--T--T--------------------A-AT-----------------T---TTC----CCC--T--C-------GA-TTGCAC-T-G-----TT--TTTT-C---C
gi|40098 : TCCCCA-AATG-A--A-------AAA--TAA--A---------TATTTTTT------------T---------T----T--TA----G----------AA----------TTTT---TC-TT-CCA-T-----TTA---------GG-A--G-AT----A-AAA---CT------CC--CA------C--TGGATG----T--GGA-------------------TATTGT---AATAGCGGAT--A------------ATAAATAGTTAATTAATGGTTA---GAACTTG----------AA--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---CCT-TCG-TT
gi|40099 : CCCAA-ATTG-A--GG-C----AAACAAAA--A---------T------T------------CCC-------T----T-------------------------------TTTTATGTC-TT-A-A-T-----T-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------ACAACA----A-T--AAGATA----T--TAAACTTTAT-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------CATTGGTTA---GAACACG----------ATATAAATTTC--TTCA----------C--------AG--------CA----T--TAT---GCTATTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTC----CCT--T--T-------AA-TTACAC----------T--TTAT-C---CCCA-ACATCGGAGGGCTT-
gi|40100 : c--AAA--A---------T------G------------TGGG------T----T--GG----G----------AA----------TTTT---TC-TTAACA-A-----T-A---------GG-T--T-AT----A-AAA---AA------AA--C-----A-C--TGGATA----T--GTAC-----T-A---------TTAATGT---AATATCAGAT--A------------AT-----------TAATGGTCA---GAACATG----------TT--------C--TTAA----------C--------CG--------TG----T--TGC---ACT-TCA-TTTT------AC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C-----T--AAA------A------A-G-AT--
gi|40101 : cccaaataatttc---------T------T------------T---------T----T--GA----G----------AA----------TTTT---TC-CC-ACA-TA----T-A---------GG-G--G-AT----A-AAC---TA------GC--CA------C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------------------------GTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--CAC---ACT-TTA-TT
gi|40102 : ccaaatataataaacatttttattAA--AAA--A---------T------C------------C---------CAAAAT--GA----G----------AG----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----C-ATGTACATGTGGCA--G-AT----A-AAA---AC------CCTGCAGTATA-G--TGGATA----T--GA-G-----T-A---------TTACAGT---GTTATCTG-T--A------------AC-----------TATTTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGT---GCT-ATG-TTTA------CC------A-GTTTGC---------A---ACAGCCAGC---C--T--T--AAA------A------A-T-GT--T-----CCC--A--AT---TTCCACTCCC--T--C-------AA-TCACGC-T-A-----TT--TCTT-T---CGAA-A-CTC-AAAGGCTT-GAGCCTC-
gi|40103 : g----------AA----------TTTT---TC-TT-ACAGT-----T-T---------TG-G--G-AT----A-AAT---CA------CC--------A-C--TGGATA----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---TATATTGGAT--T------------AT-----------TATTGGTTT---GAACATG----------AT--------C--TT-A----------C--------TT--------TA----T--TTC---GCT-TTA-TTTT------CTTCAGTGA-GTTTGC-TTTGTAACA---G-----AGCTCTC--T--T--CAA------A------ATA-GT--T-----CTA--A--AT---TTCATCTCGC--T--C-------AA-TTTC-----------TT--TTTT-T---TTCATATTTC-AAAAGCTT-GGGCGTC-TTCCCAATTTCCAGGAA-AAAcataggataaa
gi|40104 : aaaaggaaattgcagg-A--A--C----AAA--AA------------------------------------------------T--GA----G----------GA----------TTTT---TC-TT-ACG-TGAATTT-A---------GG-GTGG-GG----A-AAA---AA------GT--TA------C--TAGATAATTAT--GAAA-----T-A---------TTATTTT---AATATCTGAT--A------------AA-----------TAATGGTTA---GAACATGG---------AT--------C--TTAA----------C--------AG------------------------CT-TTG-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---A--T--T--AAG------A------G-A-AT--T-----TCC--A--AT---TTT----CTC--T--T-------GA-TTGCAC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTT-GAAGACT
gi|40105 : aa---------T------T------------T---------TGTG-T--GT----A----------AA----------TCTT---CC-TT-ACA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGAAT---GAACATG----------AT--------C--ATAA----------C--------AG--------TG----T--GAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGC---T--T--T----A------A------A-A-AT--T-----CTT--A--AT---TCC----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCTT-GAAGGCTTGGGGCCTC-TTCCCAATTTATAGGAT-AAA
gi|40106 : tt---------T------T------------T---------T----T--GGTAGTG----------AA----------TATC---TC-TT-ACA-T-----G-A---------GG-G--G-AT----T-AAA---AA------C---------A-C--TGGATG----T--GAAA-----T-A---------TTATTATTATAATATCTTAT--ACTTACTTGTTACATG----------TAATGGTAA---GAATATG----------AT--------C--TTAAATTACAATAAC--------AG--------TG----T--TAC---ATGGTTG-TTTT------CC------A-CATTGC-T-------G---A-----AGG---T--T--TTAAAA------A------A-A-AA--T-----CCA--A--AT---TTA----CCC--T--C-------AA-TTGCTC-T-G-----TT--TTTT-C---CC
gi|40107 : t----------AA----------TCTT---TC-TC-ACA-A-----T-A---------GG-G--G-AT----T-AAA---AA------C---------A-T--TGGATA----T--GAAT-----A-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TA-TGGTTA---GAACACG----------AC--------C--TCAA----------TATAATGAAAG--------TA----A--TGT---GCT-T---TTTT------TC------A-GTTTGC-T-------A---T-----TGC---C--T--T--AAA------A------A-t
gi|40108 : ttcgatgtg----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-T---------AG-G--G-AA----A-AAA---TA------CT--CA------C--TGGATA----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------GT--------C--TTAA----------C--------TG--------TG----T--CAT---ATT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---C-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCT--T--T-------GA-TCGCGT-T-G--------------------------------------GGGTCTC-TTCCCAATTTCCAGAAG-AAAgcaaa
gi|40109 : ggggggA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----A-A---------AG-G--A-TT----A-AAA---AA------AC--------A-C--TAGGTA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT------------AATGGTTA---GAACATG----------AT--------A--TTAG----------C--------AG--------TG----T--TTT---GCT-ATA-TTTT------TA------A-GTTTGC-A-------A---A-----AGCTT-T--T--T--AAA------A------A-A-AT--C-----CCC--A--AT---TTC----CTC--C--T-------GA-TCAAAC-T-G-----TT--TTTT-C---TCCA-ATAT-------CTT-GGACCTC-TTCCCAATTTCCTGGA
gi|40110 : gagggg---TC-TT-GTA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------AT--AA----A----TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AAAATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACTTG----------AT--------C--TTTA----------C--------AG--------TT----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------AT-----A-A-AT--T-----CTC--A--AT---TTC----
gi|40111 : gggaaaaaaaTTT---TC-TT-AAA-T-----A-A---------GG-C--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--TAAC-----T-T---------TTATTGT---AAAATCTGAT--A------------AC-----------TATTGGACA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TTT---TCT-TTA-TTTT------GC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T------------------G-A-AT--TTTCCCCCC--A--AT---TTC----CCG--A--C-------AA-CCATGCTT-G-----GT--TTTT-T---CC----------------T-GGATCTCTTTCCCAATTTATAGGAATAAA
gi|40112 : gggag-A---------GG-G--G-GG----G-AAA---AG------C---------A-C--TGGATA----T--GTAA-----T-A---------TTTTTGT---AATATTGGAT--T------------AT-----------TAATGGTAA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TT----T--TCA---GCC-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGCTTTT--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCA--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-C---CC
gi|40113 : aaaatattctaaacatggaaaaa----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----C-A---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------AC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---GATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTA---GAACGTG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-CT--T-----CCA--A--AT---TTA----CCC--T--C-------AA-TATCAT-T-------TT--TTTT-C---CCCA-ATCTC-GAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40114 : ----------AA----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-G---------AA-G--G-AT----A-AAA---AA------CAA-CA----A-C--TGAATA----T------------------------TATTGT---AATTTCTGAT--A------------AT-----------TATTGGTAA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-TTTTGC-T-------T---A-----AGC---C--A--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--T-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTT-T---CCAA-AT-TT-GAAGGCTT-GGACCTT-TTCCCAATTTCCAGAAC-AAA
gi|40115 : ----------AA----------TTTT---TC-AA-ACA-T-----G-C---------GG-G--G-AT----A-AAA---AA------C---------A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATT-----AACATCTGAT--A------------AT-----------TAATTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------AG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-AA--T-----CC------------TC----CC------C-------AA-TCACAC-T-------TTAATTTT-T---CC
gi|40116 : ----------AA----------CTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GA-A--G-AT----A-AAA---CC------CC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTGTTGT---AGTTTCTGAT--A------------AT-----------GATTAGTTGAATAAACATG----------AT--------C--ATAA----------C--------AG--------TG----T--ATC---ACT-TTA-TTTT------CA------A-TTTTAC-T-------A---A-----AGT---C--T--T--AAA------A------A-A-A---T-----CCA--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G-----TT--TTTT-T---CC
gi|40117 : A----------TTTT---TC-AT-ACA---------A---------GG-A--G-AT----A-AAC-----------CC--CC----A-C--TGTAAG----T--GATG-----T-A---------TTACTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TCATGGTTA---TAACATG----------AA--------G--TTAA----------A--------AG--------TG----C--TAT---GCT-TTATTTTT------CC------A-GTC----------------------AGC---C--T--A--AAA------A------A-T-AA--T-----CCA--A--AT---TTT----TGC--T--C-------GA-TTACAA-T-G-----TT--TTTT-T---CCCA-ATCAC-GAAGACTT-
gi|40118 : A----------TTTT---TC-TG-ACA-T-----A-C---------TG-G--G-AT----A-AAA---AA------T---------A-C--TGAATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATATGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAGCATG----------AT--------C--TTTA----------T--------AG--------TG----T--TAC---AC----A-TT----------------A-GTTTGC-T-------T---A-----ACC---C--T--T--c
gi|40119 : ----------TTTT---CC-TT-ACA-T-----A-A---------GG-G--G-AT----A-AAA------------T--CA------C--TGTACA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TTATGGTTG---GAACATGTCGGGTCATAAT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--AAC---GCT-TTA-TTTT------CC------T-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T-----------G------A-T-TT--T-----TTC--ACCAT---TTC----CGC--C--C-------AG-TCACAC-T-G-----TT--TTTTCT---CAAA-ATGTT-GAAGACTT-tactccatagatacacgttttcacgcaccaatcac
gi|40120 : A----------TTTG---AC-TT-ACC-T-----T-A---------GG-G--G-ATTACAA-AAA---AA-----------A----A-C--TCAATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------CATTGGTTA---CAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--TAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--A
gi|40121 : ttT---TCATT-ACA-T-----T-A---------AG-G--A-AT----A-AAA---AAA-----CT--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----C-A---------TTATTGT---TATATCTGAT--A------------AC-----------TATTGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--CAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--TAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTT----CCC--T--C-------AA-TCATGC-T-G-----TT--TTAT-T---CCCA-ATTTC-
gi|40122 : tca----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-G---------GA-G--A-GT----A-AAA---AG------CC--CA----A-C--TAGATA----T--GAAG-----T-A---------CTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TATTAGTTA---GAATATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------CG-------TAT---GTA-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----ATC---C--T--T--AAA------A------T-A-AT--T-----CCT--A--AT---TT-----CCC--T--C-------AA-TTGCCT-T-G------A--TTTT-T---CCCA-ATCTA-GAAAAATT-GGGCCTC-TTCCAAATTCCCAGATA-AAcagaaaaaa
gi|40123 : ----------TTTT---TC-TA-ACA-T-----T-A---------CA-G--A-AT----A-AATTTTAA------CC--CA----AAC--TGGTTA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGG---AATATATGAC--A------------AT-----------TATAAATTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C---------T--------TG----T--TAC---A----TA-T-------------------GCT-AT-T-------A---A-----AGC---C--T--TTTAAA------A------A-ATATAAT-----CAC--A--AT---TTCT---CCC--T--T-------AA-TCA-GC-T-G-----TT--TTTC-----CCCA-ATCTC-CAAGGCAT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40124 : ----------TTTT---TC-TT-ACA-T-----T-A---------GG-G--G-AT----A-A-------------------------C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATG----------------------------------C--T--------------------------------------T--TA------T-TT-----T------TC------A-GTTTGC-T-------G---A-----AGT---C--T--A--AAA------G------A-A-A
gi|40125 : ---TC-TT-ACA-T-----T-T---------TG-G--G-AT----ATAAA---AA------C----A----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCCAAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAG----------C--------AG--------TG----TTGTAC---ACT-TTA-TTTT------CC------C-TTTTGT-T-------A---A-----TGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AG--T-----CAA--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAC-T-G-----TT--TTTT-T---CCaat
gi|40126 : ---TC-TC-ACA-T-----A-A---------GT-G--G-AT----A-AAA---AA------AC--------A-C--TGGCTA----T--CA-----------------------------AATACCTGAT--A------------TG-----------TAATGGTAA---GAACACG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG-------------------C---ATT-TTA-GTTT------CC------A-ATTT---------------A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-----T-----CCC--A--AT---TTG----CCC--T--C-------AA-TCGCGC-T-G-----TT--TTTC-T---C
gi|40127 : C-TT-ACA-T-----A-A---------GA-G--G-AT----A-AAA---AA------GC--CA----A-C--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATGGC---AATATCAGAT--A------------AT-----------TATTGGTTA---TAAC-TG----------GT--------C--TTAA----------C--------AG--------TA----T--TGC---CCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-T-------A---A-----AAT---CG-T--T--AAA------A------G-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TC-TGC-T-G------T--TTTT-T---CCCA-ATCAC-AAAGGTTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCTAGt
gi|40128 : -TT-ACA-T-----TTA---------GG-G--G-AT----A-GAA-----------------------C--TGGATA----T--GAAG-----T-T---------TTACTAT---GATATTTGAT--G------------AT-----------TAATGGTTA---GAACATG----------AA--------C--TTGA----------C--------AG--------CG----T--CA----GCT-TTA-TTGT------CC------A-GTTT----------------------GC---C--T--T--TAA------A------A-A-AT--T-----CCA--A--AA---ATC----TCA--T--C-------AA-TCAC------------------------------TCTC-GAAGGTTT-TGGCCTC-ATTCCAATTTCCAAGAA-AAA
gi|40129 : -T-----T-A---------AA-G--GTAT----A-AAA---AA------AA--CA------C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--G------------GA-----------TAATGGTTT---TAACAT---------------------C--TTAC----------C--------AG--------TG----T--TAC---TCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTTC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------G-A-AT--T-----TCC--A--
gi|40130 : -A---------GG-G--GTAT----A-AAA---AA------AC--CA------T--TGGATA----T--GGAA-----T-A---------TTACTGT---TATATCTGAT--T------------AT-----------TGATGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AGCGTTATTATG----T--TAC---ACG-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-C-------G---C-----AGT---C--T--TA-AAA------A------A-A-AA--T-----CCC--A--ATTAATTT----CCC--T--T-------AATTTGCAC-T-G-----TT--TTTT-T----CCA-ATCTC-GAAGGTTT-GAGCCTC-TTCCCAAATTCCAGGAA-AAA
gi|40131 : G-G--G-AT----G-AAA---AA-----------A----A-TATTGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTTCTTT---ATTATCTGAT--A------------TT-----------TGATGGTTA---TAA--TG----------AT--------C--CTAA----------C--------AG--------TT----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-T-------A---C-----GGT---C--T--T----A------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--
gi|40132 : -AAA---AA-----------A----A-T--TGGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---TATATCTATT--A------------AT-----------TATTGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TA----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AAC---C--T--T--AAA--------------------------------A--AT---TTC----CTC--T--G-------AA-TTGTGC-TGG-----TT--TTTT-T---CCCA-GTCTT-GAAGGCCT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAAtgac
gi|40133 : ATG----T--GAGA-----T-G---------TAGTT-T---GATAT--GATGTA------------AT------------ATTA-TTA---GAA-ATG----------AT--------C--TTAA----------T--------AG--------TG----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------GT------A-GTTTGT-T-------A---A-----AAC---C--A--T--AAA------A------A-G-G---------CCC--A--AA---TTC----TCC--T--C-------AA-TCCTGC-T-GTGTTTTT--TTTC-T---CCCA-ATTTT-GAAGACTT-GGACCTC-TTCCCAATTTCCAG
gi|40134 : aaaagagtatcggtatatac----A-AAA---AA------TC--AA----A-C--TGGATA----T--GAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAG--A------------AT-----------TATTAGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C------------------TG----T--TTC---TCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTCGT-T-------T---A-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--TT---TTC----CTG--T--C-------AG-TCGCGC-T-G------C--TTTT-T---CCCA-ATCTC-AAAGGCTT-
gi|40135 : GGATA----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---CATATCTGAT--A------------AT---------------GGTTA---GAATATA----------AT--------T--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------TC------ACGTTTGC-T-------A---C-----TGT---C--T--T--GAA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--T-------AA-TCGCAC-T-G------T--TTAT-T---CCCG-ATCTC-GAAAGTTT-
gi|40136 : GATA----T--GAAG-----T-T---------TCATTGT---CATATCTGAT--A------------AT-----------TATTGGATA---GAAAATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---ACA-TTA-TTTC------CC------A-GTTTGC-T-------A---G-----AGC---C-----T--AAA------A------A-A-TT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCG--T--C-------AA-TCACAT-T-GT----TT--TTTT-T---CCCA-ACCTC-GAAG
gi|40137 : GATG----T--AAAA-----T-A---------TTATTGT---AATATCCGAA--A------------AC-----------TAAAGGTAA---GAACATA----------AT--------CTTTTAA----------C--------AG--------TA----T--TAC---GTT-TTA-ATAT------TC------A-GTTTGT-T-------A---A-----AGC---C--T--T-----------A------A-A-AT--T-----TCCTAA--AT---TTC----CCC--T--CATTGTTTAA-TCGCGA-T-G------A--TTTT-T---CCCA-ATGTA-G-AGGCTT-TCACCTA-CTCCAAATTTCCAGGAA-AAAat
gi|40138 : A----T--GAAG-----T-A---------TTATTGT---AATATCTGAT--A------------AT-----------TACTGGTTA---GAACATG----------AG--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----G--TAC---CCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------T---A-----------C--TGGT--AAA------ACTGGTCA-A-TT--T-----CCA--A--AT---TTC----CCA--A--A-------AA-TCGCGC-T-G---------TTTT-T---CCCA-ACCTC-AAAGGCTT-GGGCCTC-TTCCCAATTTCCAGAAA-AAA
gi|40139 : AA-----T-A---------ATATTGC---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGATTG---AAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTAAC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------AAT----A-A-ATAAT-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCCCAC-T-GA----TT--TTTT-C---CCCA-ATCTC-CAAGAC
gi|40140 : tATCGT---TATATCTGAT--A------------AT-----------TTATGGTTA---GAACATA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TGC---GCT-TTA-TTTT------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---T--T--T--AAA------A------A-A-A----------AG--A--AT---TGC----TCC--T--C-------AA-TAGTGC-T-G-----TT--TTTT-T---TCCA-ATCTT-GAAGGCTT-cctgaat
gi|40141 : TTTT---AATATCTGTT--A------------GT-----------TATTGGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTA------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------A-A-AA--T-----CTC--A--AT---TTC----CCC--T--C-------AA-TCACAA-T-G-----TT--GTTT-
gi|40142 : T---AATATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTG---GAACATG----------AT--------G--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAG---GCT-TTATTTTT------CC------A-ATTTGC-T-------A---A-----ATC---T--T--T--TAA------A------A-A-A---T-----CCC--A--AT---TTG----CCC--T--C-------AA-T
gi|40143 : ATCTGAT--A------------AT-----------TAATGGTTA---GAACATG----------AT--------T--TTAA----------C--------A----------G----T--TAC---ACT-TTA-TTTT------CC------A-GTT
gi|40144 : -----------TAGTTGTTA---GAACATG----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAC---GCT-TTA-TTTT------CT------A-GTTTGC-TA------A---A-----AGC---C--T--T--AAA------A------G-A-TT--T-----TCC--A--AT---TTC----CTC--T--A-------AA-TCAAGC---------TT--TTTT-T---CCAA-ATCTC-AAAGACTT-GGGCCTC-TTCCCAAT
gi|40145 : TA----------AT--------C--TTAA----------C--------AG--------TG----T--TAT---GCT-TTA-TTT-------CC------A-GTTTGC-T-------A---A-----AGC---C--T--T--AGA------A------A-A-AT--T-----CCC--A--GT---TTC----CCC--T--C-------AT-TTGTGC-T-G-----TT--TTTT-----------TCTC-GAAGGCTT-
gi|40146 : gttacatcatttttgAACATG----------AT--------C--TTGG----------C--------TG--------TG----T--TAC---ACT-TTATTTTT------CC------T-GTTTGC-T-------A---C-----AGC---C--T--T---AA------A------A-A-GT--T-----CCA--A--AT---TAT----TTC--T--T-------GA-TCACGC-T-G-----TT--TTTT-TTCCCCCA-ATGTC-AAAGGTTT--GGCCTC-GTCCCAATTTCCAGGAA-AAA
gi|40147 : --------AG--------TG----T--CAT---ACT-TTA-TTTT------TC------A-GTTTGC-T-------A---C-----AGT---C--T--T--AAA------A------A-T-AT--T-----CCC--A--AT---TTC----CCC--T----------GT-TCA----T-A-----TTC-TTTT-T---TCCA-ATCTC-GAAGGCTT-