lowQualScore : 4 77777777 33 1 22222222222 0 55 0 0 111 1111 11 111111 0 0 1 1111 11 0 111111 00 0 1111 0
lowQualScore : . ........ .. . ........... . .. . . ... .... .. ...... . . . .... .. . ...... .. . .... .
lowQualScore : 6 00000000 77 2 88888888888 6 99 5 5 555 1111 33 444444 6 6 7 2222 55 6 777777 99 6 5555 7
consensus : ACTCGTGA-------GAATATN-ACTTT-T-----------GGT-GATCACTNGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
Reference ( gi|42625 ) : ACTTGTGG-------GAATATG-ATTTT-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42628 : ACTTGTGA-------GAATATG-ACTTT-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GAGCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AT--T-A----TCCTC-TAT
gi|42631 : ATTCGTGG-------CAATATG-ATTTT-T-----------GGT-GATCGCTTGGTG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42627 : ACTCGTGA-------GAATATG-AGTTT-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTC-T
gi|42629 : ACTCGTGA-------TAATATG-ATTTT-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAA---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42626 : ACTCGTGA-------GAATATG-ACTTT-T-----------GGT-GATCACTTGATC-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TTCTC-TAT
gi|42634 : ACTCGTGA-------GAATATC-ATTTG-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--CTC-----AATTTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42636 : ACTTGTGA-------G--TATG-ACTTT-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TCC-----GATCTTAC-AC-C-A----AGTC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42630 : ACTCGTGA-------GAATATG-ACTTT-T-----------GGT-GATCGCTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTA-----GATCTTAC-GC-C-A----AAGC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42637 : ACTCGTGGCAAGCCAGAATATG-ACTTT-T-----------GCT-GATCACTCGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATTTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------GA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42633 : ACTCATGA-------GAATATG-ACTTT-T-----------GGT-GATTACCTTATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----TATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-CAT
gi|42632 : ACTCGTAA-------AAATATG-ACTTT-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----CAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-G----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCATA-TAT
gi|42638 : ACTCGTGA-------GAATATT-TCTGT-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTG-----GATCTTAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42639 : ATTCGTGA-------GAATATG-ACTTT-T-----------TTT-GATCACTTGATG-A-AAA---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AATC------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42641 : ACTCCTGA-------GAATACC-ACTTT-T-----------AGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----AATCTTAC-AA-C-A----AAAC--A-AATA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42648 : ACTTGTGT-------GAATATG-ACTTT-T-----------GGT-GACCACGAGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-G-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TC
gi|42640 : ACTCGTGA-------GAATATA-ACTTT-T-----------AGT-GATCACTTGGTA-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----
gi|42642 : ACTCATGA-------GAATATG-ACTTT-G-----------GGT-GATCAATTGATG-A-AAT---A----CAA--TTT-----GACCTTAC-AC-C-AAAACAAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42643 : ACTCGTGA-------GAATGTG-ACTTT-T-----------CGA-GATCACTTGCTG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ATAA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42645 : ACTCATGA-------GAATATG-ACTTT-T-----------GGT-GATCACTTGGTG-A-TAT---A----TAA--TTC-----AATCTTAC-AC-C-A----------A-AACA------AA--T-A----TCCTT-TAT
gi|42647 : ACTCGTAA-------GAAT-----CTTT-T-----------GGT-GATCACTCGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GACCTTAC-AC-C-A----AAACAAA-AACA------AA--T-A----TCGTC-TAT
gi|42649 : ACTCGTAA-------GAATATG-CCTTT-T-----------GGT-TATCACTTAATA-A-AAT---A----TAT--TTC-----GAGCTTAA-AC-C-A----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTG-TAT
gi|42635 : ACTCGTGA-------AAATATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACGAAATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42646 : ACTAGTGA-------GAACATC-ATTGT-T-----------GGT-GATCACAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----ATAC--A-CACA------AA--T-
gi|42644 : ATTCGTGA-------GAATATA-AATTT-T-----------GG-------------A-A-AGT---A----TCA--TTC-----GATCTTAC-AC-CAA----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTC-
gi|42652 : ACTCGTGA-------AAATATG-ACTTT-T-----------GGT-AATCACTGGAT
gi|42654 : CTAGTGA-------GAATATG-ACTTT-T-----------GGT-GATCAATTGATG-A-AAT---T----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTCATAT
gi|42655 : CTTGTGA-------GAATCTG-AATTT-T-----------GGT-GATCTTTTAAAG-A-AAT---A----TAG--TCT-----GATCTTAC-AT-C-A----AAACAAA-AAAA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42653 : CTCGTGA-------GAGTATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTAAC-AC-A-A----AAAC--A-AACA------CA--T-
gi|42662 : GTGA-------GAATATG-ACTTT-C-----------GGT-GATCTCTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAA-AC-C-A----AGAT--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42661 : GTAA-------GAATATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAGC--A-AACA------CA--T-T----TTCTT-TAT
gi|42667 : GTGA-------GATTATG-AGTTT-T-----------GGT-GATCACGACATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-CAA----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42659 : GTGA-------GAATAAC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACGAGATG-A-AAT---A----TGA--TTT-----CATCTTAC-AT-T-G----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42657 : GTGG-------GAATATC-ATTTT-G-----------GGT-GATCACAAGATG-A-AATATCA----TAAATTTT-----GATTTTTC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42663 : GTGA-------GAATATC-ATTTTTT-----------GGT-GATCAAAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42660 : GTGA-------ACATATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTTC-AC-C-A----AAAC--ATAACA------
gi|42668 : GTGG-------GAATATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACGAGATG-A-AAC---T----TCA--TTT-----GATCTTAC-AT-T-C----AAAC--A-AAGA------A
gi|42669 : GTGA-------AAATATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACGAGATGAA-AAT---A----TCA--TTCATTTTGATCTTTC-AC-A-G----AGAC--A-GACA------AA--T-
gi|42658 : GTGA-------GAATATC--TTTT-TATGTGACACGAGAT-AATCAGAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AATA------AA----A----T-TTC-TAT
gi|42666 : GTGA-------GAATATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TT-------ATCTT
gi|42656 : TGA-------AAATATG-ACTTT-T-----------GGT-GATCACTTGTTG-A-AAT---A----TAA--TTT-----AATATTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AT--T-A----TCCTC-TAT
gi|42671 : tcaTGA-------AAATATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCGCGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAT-AC-C-A----AAAC--A-A--A------AA--C-A----TTTTC-T
gi|42674 : TGA-------GAATATC-ATTTT-T-----------TGT-GATCATGAGATG-A-AAT---G----TAA--TTT-----GATCTGAC-AC-TAA----AAAC--A-AACA------A
gi|42675 : TGA-------AAATACA-ACTTT-T-----------GGT-GTTCACTCAATG-A-AAT---A----AAA--ATC-----GATCTCTC-AT-T-G----CAAC--A-ATCA------AA--T-A----TCCAC-TAT
gi|42676 : TGA-------GAATATG-ACTTA-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAC---A----TAA--TT----------------------------C--A-AACA------GA--T-A----TCCCC-TA
gi|42672 : TGA-------GAATATC-ATTTT-T-----------GCT-GATCAC-----G-A-GAT---A----TCT--TTT-----AATCTTGC-AC-C-T----AAAC--A-AACA------
gi|42673 : G-------AAATATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCATAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42678 : t-------GAATTAG-ACTTT-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----GAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACAAAAATTAA--T-G----TTCTC-TAT
gi|42679 : a-------GAATAAG-ACTTT-T-----------GGT-GATCACTTGATA-A-AAT---A----CAA--TTC-----GATCTGAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AAATT-AATTTTTCTC-TAT
gi|42664 : a-------GAATATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACAAGATG-A-AAT---ATCATTAAT-TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--TAA----TCTTT-TA
gi|42680 : gtta-------GAATATC-ATTTT-T-----------GGG-GATCACAAGATG-A-AAT---A----TTA--TTT-----GATCTTAC-A--C-A----AAAC--A-AATA------A
gi|42685 : a-------GAATATC-ATTTT-T-----------GGG-GATCACAAGATG-A-AAT---A----T
gi|42665 : a-------GAATATCTAGTTT-T-----------G-T-GACCACGAGATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GAACTTCG-AC-C-A----AAAC--A-AAC--------A--T-A----TTTTC-Ttatcttacaccaaaacaaacaaatatcctctat
gi|42681 : gttaAATATT-ACTAT-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GACCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-GACA------AA--T-A----TCATC-TAT
gi|42683 : AAAATG-ATATTAT-----------AGT-GATCACTTAATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCC
gi|42684 : AATATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACAAGATG-A-AAT---A----TTT--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ACCA------AA--T-
gi|42682 : AATATT-ATTTT-T-----------GGT-GATCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTGG-AC-C-A----AAAC--A-AACA------
gi|42686 : ATATG-ATTTT-T-----------GGT-GATCACTTAATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AAT-------AA--T-A----TCCTC-T
gi|42688 : ACATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ACCA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42687 : ATATC-AATTC-T-----------GGT-GGTAACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-ATAT-A----AAAA--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42689 : ATG-ACTTT-T-----------GGT-GATCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTAGA-AC-C-A----AAAC--A-AAC-----------T-A----TTCTA-TAT
gi|42677 : ATC-ATTTT-T-----------GGT-GATCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42691 : gagag-ATTTT-T-----------GGT-GATCACGAGATG-G-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTACTAA-A-A----AAAC--A-AGCT------AA--T-T----TTCTT-TAT
gi|42693 : TT-T-----------AGTTGATCATATGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-C----AAGC--A-AGTA------AA--T-A----TCTTC-TAT
gi|42694 : cT-T-----------GGT-GATCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTGC-AC-C-A----AAAC--A-GACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42695 : T-T-----------GGT-GATCACGAGATG-A-AAT---G----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------CA--T-T----TTCTT-T
gi|42670 : T-T-----------GGT-GATCACGAGATA-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42690 : tgagaataacaaaT-T-----------GGT-GATCACTTGATA-A-ATT---A----TAA--TTC-----GATATTCA-AC-T-A----AAAT--A-AACA------CA--T-
gi|42696 : acta-T-----------GGT-GATCATTTGATG-A-AAT---A----TAT--CTC-----GATCTTGT-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42685 : GT-GATC-CCCAA---A-AATG--A----TA---TTC-----TATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42697 : aatatttcatctt-GATCACTTGACG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42698 : ATTACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCTTC-TAT
gi|42650 : ATCTCTTGATG-A-AAT---A----CAA--TTC-----GACCTAAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42651 : acgcgtgagaatTCACTCGATG-A-AAT---G----AAA--T-C-----GATCTTTC-AC-T-G----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-T
gi|42699 : actcctgagaataaaaatgtccttccCACTTGGGG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAG-AC-C------AGAC--A-ACCA------AA--T-A----TCCTT-TAT
gi|42692 : CACTTG-TG-AGAAT---A----CAA--TTG-----GATCTTCA-AC-A-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
Alignments
lowQualScore : 2222222 33 333333333333 0 33 0 0 111 1111 11 11111 0 0 1 1111 11 0 111111 00 0 1111 0
lowQualScore : ....... .. ............ . .. . . ... .... .. ..... . . . .... .. . ...... .. . .... .
lowQualScore : 3333333 00 444444444444 5 66 5 5 555 1111 33 44444 5 5 6 2222 55 5 777777 99 6 5555 7
consensus : ACTCGTG-------AGAATATN-ACTTTT------------GGTGA-TCACTNGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
Reference ( family-387 ) : ACTCGTG-------AGAATATN-ACTTTT------------GGTGA-TCACTNGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42625 : ACTTGTG-------GGAATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42626 : ACTCGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATC-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TTCTC-TAT
gi|42627 : ACTCGTG-------AGAATATG-AGTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTC-T
gi|42628 : ACTTGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GAGCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AT--T-A----TCCTC-TAT
gi|42629 : ACTCGTG-------ATAATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAA---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42630 : ACTCGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCGCTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTA-----GATCTTAC-GC-C-A----AAGC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42631 : ATTCGTG-------GCAATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCGCTTGGTG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42632 : ACTCGTA-------AAAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----CAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-G----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCATA-TAT
gi|42633 : ACTCATG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TTACCTTATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----TATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-CAT
gi|42634 : ACTCGTG-------AGAATATC-ATTTGT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--CTC-----AATTTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42635 : ACTCGTG-------AAAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAAATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42636 : ACTTGTG-------AG--TATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TCC-----GATCTTAC-AC-C-A----AGTC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42637 : ACTCGTGGCAAGCCAGAATATG-ACTTTT------------GCTGA-TCACTCGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATTTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------GA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42638 : ACTCGTG-------AGAATATT-TCTGTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTG-----GATCTTAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42639 : ATTCGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------TTTGA-TCACTTGATG-A-AAA---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AATC------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42640 : ACTCGTG-------AGAATATA-ACTTTT------------AGTGA-TCACTTGGTA-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----
gi|42641 : ACTCCTG-------AGAATACC-ACTTTT------------AGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----AATCTTAC-AA-C-A----AAAC--A-AATA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42642 : ACTCATG-------AGAATATG-ACTTTG------------GGTGA-TCAATTGATG-A-AAT---A----CAA--TTT-----GACCTTAC-AC-C-AAAACAAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42643 : ACTCGTG-------AGAATGTG-ACTTTT------------CGAGA-TCACTTGCTG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ATAA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42644 : ATTCGTG-------AGAATATA-AATTTT------------GG-------------A-A-AGT---A----TCA--TTC-----GATCTTAC-AC-CAA----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTC-
gi|42645 : ACTCATG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGGTG-A-TAT---A----TAA--TTC-----AATCTTAC-AC-C-A----------A-AACA------AA--T-A----TCCTT-TAT
gi|42646 : ACTAGTG-------AGAACATC-ATTGTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----ATAC--A-CACA------AA--T-
gi|42647 : ACTCGTA-------AGAAT-----CTTTT------------GGTGA-TCACTCGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GACCTTAC-AC-C-A----AAACAAA-AACA------AA--T-A----TCGTC-TAT
gi|42648 : ACTTGTG-------TGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-CCACGAGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-G-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TC
gi|42649 : ACTCGTA-------AGAATATG-CCTTTT------------GGTTA-TCACTTAATA-A-AAT---A----TAT--TTC-----GAGCTTAA-AC-C-A----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTG-TAT
gi|42650 : ACGCGTG-------AGAATAT---CT------------------------CTTGATG-A-AAT---A----CAA--TTC-----GACCTAAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42651 : ACTCCTG-------AGAATAAA-AATGTC------------CTTCC-TCACTCGATG-A-AAT---G----AAA--T-C-----GATCTTTC-AC-T-G----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-T
gi|42652 : ACTCGTG-------AAAATATG-ACTTTT------------GGTAA-TCACTGGAT
gi|42653 : CTCGTG-------AGAGTATC-ATTTTT------------GGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTAAC-AC-A-A----AAAC--A-AACA------CA--T-
gi|42654 : CTAGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCAATTGATG-A-AAT---T----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTCATAT
gi|42655 : CTTGTG-------AGAATCTG-AATTTT------------GGTGA-TCTTTTAAAG-A-AAT---A----TAG--TCT-----GATCTTAC-AT-C-A----AAACAAA-AAAA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42656 : TCATG-------AAAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGTTG-A-AAT---A----TAA--TTT-----AATATTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AT--T-A----TCCTC-TAT
gi|42657 : GTG-------GGAATATC-ATTTTG------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AATATCA----TAAATTTT-----GATTTTTC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42658 : GTG-------AGAATAT---CTTTTTATGTGACACGAGATAA-TCAGAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AATA------AA----A----T-TTC-TAT
gi|42659 : GTG-------AGAATAAC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TGA--TTT-----CATCTTAC-AT-T-G----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42660 : GTG-------AACATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTTC-AC-C-A----AAAC--ATAACA------
gi|42661 : GTA-------AGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAGC--A-AACA------CA--T-T----TTCTT-TAT
gi|42662 : GTG-------AGAATATG-ACTTTC------------GGTGA-TCTCTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAA-AC-C-A----AGAT--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42663 : GTG-------AGAATATC-ATTTTTT-----------GGTGA-TCAAAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42664 : GTT-------AGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---ATCATTAAT-TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--TAA----TCTTT-TA
gi|42665 : GTT-------AGAATATCTAGTTTT------------G-TGA-CCACGAGATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GAACTTCG-AC-C-A----AAAC--A-AAC--------A--T-A----TTTTC-T
gi|42666 : GTG-------AGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TT-------ATCTT
gi|42667 : GTG-------AGATTATG-AGTTTT------------GGTGA-TCACGACATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-CAA----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42668 : GTG-------GGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAC---T----TCA--TTT-----GATCTTAC-AT-T-C----AAAC--A-AAGA------A
gi|42669 : GTG-------AAAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATGAA-AAT---A----TCA--TTCATTTTGATCTTTC-AC-A-G----AGAC--A-GACA------AA--T-
gi|42670 : TG-------AGAATAAC-AAATT-------------GGTGA-TCACGAGATA-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42671 : TG-------AAAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCGCGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAT-AC-C-A----AAAC--A-A--A------AA--C-A----TTTTC-T
gi|42672 : TG-------AGAATATC-ATTTTT------------GCTGA-TCAC-----G-A-GAT---A----TCT--TTT-----AATCTTGC-AC-C-T----AAAC--A-AACA------
gi|42673 : TG-------A-AATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCATAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42674 : TG-------AGAATATC-ATTTTT------------TGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---G----TAA--TTT-----GATCTGAC-AC-TAA----AAAC--A-AACA------A
gi|42675 : TG-------AAAATACA-ACTTTT------------GGTGT-TCACTCAATG-A-AAT---A----AAA--ATC-----GATCTCTC-AT-T-G----CAAC--A-ATCA------AA--T-A----TCCAC-TAT
gi|42676 : TG-------AGAATATG-ACTTAT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAC---A----TAA--TT----------------------------C--A-AACA------GA--T-A----TCCCC-TA
gi|42677 : G-------AGAG-ATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42678 : -------AGAATTAG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----GAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACAAAAATTAA--T-G----TTCTC-TAT
gi|42679 : -------AGAATAAG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATA-A-AAT---A----CAA--TTC-----GATCTGAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AAATT-AATTTTTCTC-TAT
gi|42680 : -------AGAATATC-ATTTTT------------GGGGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TTA--TTT-----GATCTTAC-A--C-A----AAAC--A-AATA------A
gi|42681 : AATATT-ACTATT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GACCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-GACA------AA--T-A----TCATC-TAT
gi|42682 : AATATT-ATTTTT------------GGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTGG-AC-C-A----AAAC--A-AACA------
gi|42683 : ATATT-A----T------------AGTGA-TCACTTAATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCC
gi|42684 : aaaatgAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TTT--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ACCA------AA--T-
gi|42685 : AATATT-TCATCT------------TGTGA-TC-CCCAA---A-AATG--A----TA---TTC-----TATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42686 : ATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCACTTAATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AAT-------AA--T-A----TCCTC-T
gi|42687 : ATATC-AATTCT------------GGTGG-TAACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-ATAT-A----AAAA--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42688 : ACATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ACCA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42689 : ATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTAGA-AC-C-A----AAAC--A-AAC-----------T-A----TTCTA-TAT
gi|42690 : -ACTATT------------GGTGA-TCACTTGATA-A-ATT---A----TAA--TTC-----GATATTCA-AC-T-A----AAAT--A-AACA------CA--T-
gi|42691 : -ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-G-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTACTAA-A-A----AAAC--A-AGCT------AA--T-T----TTCTT-TAT
gi|42692 : -ACTCGT------------GGCAAGCCACTTG-TG-AGAAT---A----CAA--TTG-----GATCTTCA-AC-A-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42693 : CTTTA------------GTTGA-TCATATGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-C----AAGC--A-AGTA------AA--T-A----TCTTC-TAT
gi|42694 : TT------------GGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTGC-AC-C-A----AAAC--A-GACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42695 : TT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---G----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------CA--T-T----TTCTT-T
gi|42696 : T------------GGTGA-TCATTTGATG-A-AAT---A----TAT--CTC-----GATCTTGT-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42697 : GA-TCACTTGACG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42698 : A-TTACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCTTC-TAT
gi|42699 : CACTTGGGG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAG-AC-C------AGAC--A-ACCA------AA--T-A----TCCTT-TAT
Alignments
lowQualScore : 2222222 33 333333333333 0 33 0 0 111 1111 11 11111 0 0 1 1111 11 0 111111 00 0 1111 0
lowQualScore : ....... .. ............ . .. . . ... .... .. ..... . . . .... .. . ...... .. . .... .
lowQualScore : 3333333 00 444444444444 5 66 5 5 555 1111 33 44444 5 5 6 2222 55 5 777777 99 6 5555 7
consensus : ACTCGTG-------AGAATATN-ACTTTT------------GGTGA-TCACTNGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
Reference ( family-387 ) : ACTCGTG-------AGAATATN-ACTTTT------------GGTGA-TCACTNGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42625 : ACTTGTG-------GGAATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42626 : ACTCGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATC-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TTCTC-TAT
gi|42627 : ACTCGTG-------AGAATATG-AGTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTC-T
gi|42628 : ACTTGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GAGCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AT--T-A----TCCTC-TAT
gi|42629 : ACTCGTG-------ATAATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAA---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42630 : ACTCGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCGCTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTA-----GATCTTAC-GC-C-A----AAGC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42631 : ATTCGTG-------GCAATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCGCTTGGTG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42632 : ACTCGTA-------AAAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----CAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-G----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCATA-TAT
gi|42633 : ACTCATG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TTACCTTATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----TATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-CAT
gi|42634 : ACTCGTG-------AGAATATC-ATTTGT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--CTC-----AATTTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42635 : ACTCGTG-------AAAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAAATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42636 : ACTTGTG-------AG--TATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TCC-----GATCTTAC-AC-C-A----AGTC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42637 : ACTCGTGGCAAGCCAGAATATG-ACTTTT------------GCTGA-TCACTCGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATTTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------GA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42638 : ACTCGTG-------AGAATATT-TCTGTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTG-----GATCTTAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42639 : ATTCGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------TTTGA-TCACTTGATG-A-AAA---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AATC------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42640 : ACTCGTG-------AGAATATA-ACTTTT------------AGTGA-TCACTTGGTA-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----
gi|42641 : ACTCCTG-------AGAATACC-ACTTTT------------AGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----AATCTTAC-AA-C-A----AAAC--A-AATA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42642 : ACTCATG-------AGAATATG-ACTTTG------------GGTGA-TCAATTGATG-A-AAT---A----CAA--TTT-----GACCTTAC-AC-C-AAAACAAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42643 : ACTCGTG-------AGAATGTG-ACTTTT------------CGAGA-TCACTTGCTG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ATAA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42644 : ATTCGTG-------AGAATATA-AATTTT------------GG-------------A-A-AGT---A----TCA--TTC-----GATCTTAC-AC-CAA----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTC-
gi|42645 : ACTCATG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGGTG-A-TAT---A----TAA--TTC-----AATCTTAC-AC-C-A----------A-AACA------AA--T-A----TCCTT-TAT
gi|42646 : ACTAGTG-------AGAACATC-ATTGTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----ATAC--A-CACA------AA--T-
gi|42647 : ACTCGTA-------AGAAT-----CTTTT------------GGTGA-TCACTCGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GACCTTAC-AC-C-A----AAACAAA-AACA------AA--T-A----TCGTC-TAT
gi|42648 : ACTTGTG-------TGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-CCACGAGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-G-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TC
gi|42649 : ACTCGTA-------AGAATATG-CCTTTT------------GGTTA-TCACTTAATA-A-AAT---A----TAT--TTC-----GAGCTTAA-AC-C-A----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTG-TAT
gi|42650 : ACGCGTG-------AGAATAT---CT------------------------CTTGATG-A-AAT---A----CAA--TTC-----GACCTAAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42651 : ACTCCTG-------AGAATAAA-AATGTC------------CTTCC-TCACTCGATG-A-AAT---G----AAA--T-C-----GATCTTTC-AC-T-G----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-T
gi|42652 : ACTCGTG-------AAAATATG-ACTTTT------------GGTAA-TCACTGGAT
gi|42653 : CTCGTG-------AGAGTATC-ATTTTT------------GGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTAAC-AC-A-A----AAAC--A-AACA------CA--T-
gi|42654 : CTAGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCAATTGATG-A-AAT---T----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTCATAT
gi|42655 : CTTGTG-------AGAATCTG-AATTTT------------GGTGA-TCTTTTAAAG-A-AAT---A----TAG--TCT-----GATCTTAC-AT-C-A----AAACAAA-AAAA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42656 : TCATG-------AAAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGTTG-A-AAT---A----TAA--TTT-----AATATTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AT--T-A----TCCTC-TAT
gi|42657 : GTG-------GGAATATC-ATTTTG------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AATATCA----TAAATTTT-----GATTTTTC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42658 : GTG-------AGAATAT---CTTTTTATGTGACACGAGATAA-TCAGAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AATA------AA----A----T-TTC-TAT
gi|42659 : GTG-------AGAATAAC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TGA--TTT-----CATCTTAC-AT-T-G----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42660 : GTG-------AACATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTTC-AC-C-A----AAAC--ATAACA------
gi|42661 : GTA-------AGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAGC--A-AACA------CA--T-T----TTCTT-TAT
gi|42662 : GTG-------AGAATATG-ACTTTC------------GGTGA-TCTCTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAA-AC-C-A----AGAT--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42663 : GTG-------AGAATATC-ATTTTTT-----------GGTGA-TCAAAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42664 : GTT-------AGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---ATCATTAAT-TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--TAA----TCTTT-TA
gi|42665 : GTT-------AGAATATCTAGTTTT------------G-TGA-CCACGAGATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GAACTTCG-AC-C-A----AAAC--A-AAC--------A--T-A----TTTTC-T
gi|42666 : GTG-------AGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TT-------ATCTT
gi|42667 : GTG-------AGATTATG-AGTTTT------------GGTGA-TCACGACATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-CAA----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42668 : GTG-------GGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAC---T----TCA--TTT-----GATCTTAC-AT-T-C----AAAC--A-AAGA------A
gi|42669 : GTG-------AAAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATGAA-AAT---A----TCA--TTCATTTTGATCTTTC-AC-A-G----AGAC--A-GACA------AA--T-
gi|42670 : TG-------AGAATAAC-AAATT-------------GGTGA-TCACGAGATA-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42671 : TG-------AAAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCGCGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAT-AC-C-A----AAAC--A-A--A------AA--C-A----TTTTC-T
gi|42672 : TG-------AGAATATC-ATTTTT------------GCTGA-TCAC-----G-A-GAT---A----TCT--TTT-----AATCTTGC-AC-C-T----AAAC--A-AACA------
gi|42673 : TG-------A-AATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCATAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42674 : TG-------AGAATATC-ATTTTT------------TGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---G----TAA--TTT-----GATCTGAC-AC-TAA----AAAC--A-AACA------A
gi|42675 : TG-------AAAATACA-ACTTTT------------GGTGT-TCACTCAATG-A-AAT---A----AAA--ATC-----GATCTCTC-AT-T-G----CAAC--A-ATCA------AA--T-A----TCCAC-TAT
gi|42676 : TG-------AGAATATG-ACTTAT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAC---A----TAA--TT----------------------------C--A-AACA------GA--T-A----TCCCC-TA
gi|42677 : G-------AGAG-ATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42678 : -------AGAATTAG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----GAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACAAAAATTAA--T-G----TTCTC-TAT
gi|42679 : -------AGAATAAG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATA-A-AAT---A----CAA--TTC-----GATCTGAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AAATT-AATTTTTCTC-TAT
gi|42680 : -------AGAATATC-ATTTTT------------GGGGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TTA--TTT-----GATCTTAC-A--C-A----AAAC--A-AATA------A
gi|42681 : AATATT-ACTATT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GACCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-GACA------AA--T-A----TCATC-TAT
gi|42682 : AATATT-ATTTTT------------GGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTGG-AC-C-A----AAAC--A-AACA------
gi|42683 : ATATT-A----T------------AGTGA-TCACTTAATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCC
gi|42684 : aaaatgAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TTT--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ACCA------AA--T-
gi|42685 : AATATT-TCATCT------------TGTGA-TC-CCCAA---A-AATG--A----TA---TTC-----TATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42686 : ATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCACTTAATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AAT-------AA--T-A----TCCTC-T
gi|42687 : ATATC-AATTCT------------GGTGG-TAACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-ATAT-A----AAAA--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42688 : ACATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ACCA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42689 : ATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTAGA-AC-C-A----AAAC--A-AAC-----------T-A----TTCTA-TAT
gi|42690 : -ACTATT------------GGTGA-TCACTTGATA-A-ATT---A----TAA--TTC-----GATATTCA-AC-T-A----AAAT--A-AACA------CA--T-
gi|42691 : -ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-G-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTACTAA-A-A----AAAC--A-AGCT------AA--T-T----TTCTT-TAT
gi|42692 : -ACTCGT------------GGCAAGCCACTTG-TG-AGAAT---A----CAA--TTG-----GATCTTCA-AC-A-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42693 : CTTTA------------GTTGA-TCATATGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-C----AAGC--A-AGTA------AA--T-A----TCTTC-TAT
gi|42694 : TT------------GGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTGC-AC-C-A----AAAC--A-GACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42695 : TT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---G----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------CA--T-T----TTCTT-T
gi|42696 : T------------GGTGA-TCATTTGATG-A-AAT---A----TAT--CTC-----GATCTTGT-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42697 : GA-TCACTTGACG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42698 : A-TTACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCTTC-TAT
gi|42699 : CACTTGGGG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAG-AC-C------AGAC--A-ACCA------AA--T-A----TCCTT-TAT
blockSeqs : GCAAGCC CT TATGTGACACGA TT ATC TCAT AT ATTTT A AAAC AA AAAATT ATTT
blockSeqs : . G T TT G . T . A . AA . .
blockSeqs : . G . TT . . . . A . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . CT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TC . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TC . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . TC . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TG . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TC . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : C . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : T . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : G . CC . . . . . . . .
blockSeqs : C . TT . . . . . . . .
blockSeqs : C . GA . . . . . . . .
blockSeqs : G . GA . . . . . . . .
blockSeqs : . . TT . . . . . . . .
blockSeqs : . . TT . . . . . . . .
blockSeqs : . . GA . . . . . . . .
blockSeqs : . TT . . . . . . . .
blockSeqs : . AT . . . . . . . .
blockSeqs : . GA . . . . . . . .
blockSeqs : . GA . . . . . . . .
blockSeqs : . TT . . . . . . .
blockSeqs : . TT . . . . . . .
blockSeqs : . TT . . . . . . .
blockSeqs : TT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : ACTCGTG-------AGAATATN-ACTTTT------------GGTGA-TCACTNGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
finalCons : ACTCGTG-------AGAATATN-ACTTTT------------GGTGA-TCACTNGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
Alignments
lowQualScore : 2222222 33 333333333333 0 33 0 0 111 1111 11 11111 0 0 1 1111 11 0 111111 00 0 1111 0
lowQualScore : ....... .. ............ . .. . . ... .... .. ..... . . . .... .. . ...... .. . .... .
lowQualScore : 3333333 00 444444444444 5 66 5 5 555 1111 33 44444 5 5 6 2222 55 5 777777 99 6 5555 7
consensus : ACTCGTG-------AGAATATN-ACTTTT------------GGTGA-TCACTNGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
Reference ( family-387 ) : ACTCGTG-------AGAATATN-ACTTTT------------GGTGA-TCACTNGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42625 : ACTTGTG-------GGAATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42626 : ACTCGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATC-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TTCTC-TAT
gi|42627 : ACTCGTG-------AGAATATG-AGTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTC-T
gi|42628 : ACTTGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GAGCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AT--T-A----TCCTC-TAT
gi|42629 : ACTCGTG-------ATAATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAA---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42630 : ACTCGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCGCTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTA-----GATCTTAC-GC-C-A----AAGC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42631 : ATTCGTG-------GCAATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCGCTTGGTG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42632 : ACTCGTA-------AAAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----CAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-G----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCATA-TAT
gi|42633 : ACTCATG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TTACCTTATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----TATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-CAT
gi|42634 : ACTCGTG-------AGAATATC-ATTTGT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--CTC-----AATTTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42635 : ACTCGTG-------AAAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAAATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42636 : ACTTGTG-------AG--TATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TCC-----GATCTTAC-AC-C-A----AGTC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42637 : ACTCGTGGCAAGCCAGAATATG-ACTTTT------------GCTGA-TCACTCGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATTTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------GA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42638 : ACTCGTG-------AGAATATT-TCTGTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTG-----GATCTTAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-G----TCCTC-TAT
gi|42639 : ATTCGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------TTTGA-TCACTTGATG-A-AAA---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AATC------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42640 : ACTCGTG-------AGAATATA-ACTTTT------------AGTGA-TCACTTGGTA-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----
gi|42641 : ACTCCTG-------AGAATACC-ACTTTT------------AGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----AATCTTAC-AA-C-A----AAAC--A-AATA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42642 : ACTCATG-------AGAATATG-ACTTTG------------GGTGA-TCAATTGATG-A-AAT---A----CAA--TTT-----GACCTTAC-AC-C-AAAACAAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42643 : ACTCGTG-------AGAATGTG-ACTTTT------------CGAGA-TCACTTGCTG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ATAA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42644 : ATTCGTG-------AGAATATA-AATTTT------------GG-------------A-A-AGT---A----TCA--TTC-----GATCTTAC-AC-CAA----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTC-
gi|42645 : ACTCATG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGGTG-A-TAT---A----TAA--TTC-----AATCTTAC-AC-C-A----------A-AACA------AA--T-A----TCCTT-TAT
gi|42646 : ACTAGTG-------AGAACATC-ATTGTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----ATAC--A-CACA------AA--T-
gi|42647 : ACTCGTA-------AGAAT-----CTTTT------------GGTGA-TCACTCGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GACCTTAC-AC-C-A----AAACAAA-AACA------AA--T-A----TCGTC-TAT
gi|42648 : ACTTGTG-------TGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-CCACGAGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-G-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TC
gi|42649 : ACTCGTA-------AGAATATG-CCTTTT------------GGTTA-TCACTTAATA-A-AAT---A----TAT--TTC-----GAGCTTAA-AC-C-A----AAAC--A-AACA------CA--T-A----TCCTG-TAT
gi|42650 : ACGCGTG-------AGAATAT---CT------------------------CTTGATG-A-AAT---A----CAA--TTC-----GACCTAAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42651 : ACTCCTG-------AGAATAAA-AATGTC------------CTTCC-TCACTCGATG-A-AAT---G----AAA--T-C-----GATCTTTC-AC-T-G----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-T
gi|42652 : ACTCGTG-------AAAATATG-ACTTTT------------GGTAA-TCACTGGAT
gi|42653 : CTCGTG-------AGAGTATC-ATTTTT------------GGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTAAC-AC-A-A----AAAC--A-AACA------CA--T-
gi|42654 : CTAGTG-------AGAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCAATTGATG-A-AAT---T----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTCATAT
gi|42655 : CTTGTG-------AGAATCTG-AATTTT------------GGTGA-TCTTTTAAAG-A-AAT---A----TAG--TCT-----GATCTTAC-AT-C-A----AAACAAA-AAAA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42656 : TCATG-------AAAATATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGTTG-A-AAT---A----TAA--TTT-----AATATTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AT--T-A----TCCTC-TAT
gi|42657 : GTG-------GGAATATC-ATTTTG------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AATATCA----TAAATTTT-----GATTTTTC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42658 : GTG-------AGAATAT---CTTTTTATGTGACACGAGATAA-TCAGAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AATA------AA----A----T-TTC-TAT
gi|42659 : GTG-------AGAATAAC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TGA--TTT-----CATCTTAC-AT-T-G----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42660 : GTG-------AACATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTTC-AC-C-A----AAAC--ATAACA------
gi|42661 : GTA-------AGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAGC--A-AACA------CA--T-T----TTCTT-TAT
gi|42662 : GTG-------AGAATATG-ACTTTC------------GGTGA-TCTCTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAA-AC-C-A----AGAT--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42663 : GTG-------AGAATATC-ATTTTTT-----------GGTGA-TCAAAAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42664 : GTT-------AGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---ATCATTAAT-TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--TAA----TCTTT-TA
gi|42665 : GTT-------AGAATATCTAGTTTT------------G-TGA-CCACGAGATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GAACTTCG-AC-C-A----AAAC--A-AAC--------A--T-A----TTTTC-T
gi|42666 : GTG-------AGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TT-------ATCTT
gi|42667 : GTG-------AGATTATG-AGTTTT------------GGTGA-TCACGACATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-CAA----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42668 : GTG-------GGAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAC---T----TCA--TTT-----GATCTTAC-AT-T-C----AAAC--A-AAGA------A
gi|42669 : GTG-------AAAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATGAA-AAT---A----TCA--TTCATTTTGATCTTTC-AC-A-G----AGAC--A-GACA------AA--T-
gi|42670 : TG-------AGAATAAC-AAATT-------------GGTGA-TCACGAGATA-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42671 : TG-------AAAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCGCGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAT-AC-C-A----AAAC--A-A--A------AA--C-A----TTTTC-T
gi|42672 : TG-------AGAATATC-ATTTTT------------GCTGA-TCAC-----G-A-GAT---A----TCT--TTT-----AATCTTGC-AC-C-T----AAAC--A-AACA------
gi|42673 : TG-------A-AATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCATAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42674 : TG-------AGAATATC-ATTTTT------------TGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---G----TAA--TTT-----GATCTGAC-AC-TAA----AAAC--A-AACA------A
gi|42675 : TG-------AAAATACA-ACTTTT------------GGTGT-TCACTCAATG-A-AAT---A----AAA--ATC-----GATCTCTC-AT-T-G----CAAC--A-ATCA------AA--T-A----TCCAC-TAT
gi|42676 : TG-------AGAATATG-ACTTAT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAC---A----TAA--TT----------------------------C--A-AACA------GA--T-A----TCCCC-TA
gi|42677 : G-------AGAG-ATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AA
gi|42678 : -------AGAATTAG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----GAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACAAAAATTAA--T-G----TTCTC-TAT
gi|42679 : -------AGAATAAG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATA-A-AAT---A----CAA--TTC-----GATCTGAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AAATT-AATTTTTCTC-TAT
gi|42680 : -------AGAATATC-ATTTTT------------GGGGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TTA--TTT-----GATCTTAC-A--C-A----AAAC--A-AATA------A
gi|42681 : AATATT-ACTATT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GACCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-GACA------AA--T-A----TCATC-TAT
gi|42682 : AATATT-ATTTTT------------GGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTGG-AC-C-A----AAAC--A-AACA------
gi|42683 : ATATT-A----T------------AGTGA-TCACTTAATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCC
gi|42684 : aaaatgAATATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACAAGATG-A-AAT---A----TTT--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ACCA------AA--T-
gi|42685 : AATATT-TCATCT------------TGTGA-TC-CCCAA---A-AATG--A----TA---TTC-----TATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42686 : ATATG-ATTTTT------------GGTGA-TCACTTAATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AAT-------AA--T-A----TCCTC-T
gi|42687 : ATATC-AATTCT------------GGTGG-TAACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-ATAT-A----AAAA--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42688 : ACATC-ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-ACCA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42689 : ATG-ACTTTT------------GGTGA-TCACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTT-----GATCTAGA-AC-C-A----AAAC--A-AAC-----------T-A----TTCTA-TAT
gi|42690 : -ACTATT------------GGTGA-TCACTTGATA-A-ATT---A----TAA--TTC-----GATATTCA-AC-T-A----AAAT--A-AACA------CA--T-
gi|42691 : -ATTTTT------------GGTGA-TCACGAGATG-G-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTACTAA-A-A----AAAC--A-AGCT------AA--T-T----TTCTT-TAT
gi|42692 : -ACTCGT------------GGCAAGCCACTTG-TG-AGAAT---A----CAA--TTG-----GATCTTCA-AC-A-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42693 : CTTTA------------GTTGA-TCATATGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-C----AAGC--A-AGTA------AA--T-A----TCTTC-TAT
gi|42694 : TT------------GGTGA-TCATGAGATG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTGC-AC-C-A----AAAC--A-GACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42695 : TT------------GGTGA-TCACGAGATG-A-AAT---G----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-T-A----AAAC--A-AACA------CA--T-T----TTCTT-T
gi|42696 : T------------GGTGA-TCATTTGATG-A-AAT---A----TAT--CTC-----GATCTTGT-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCCTC-TAT
gi|42697 : GA-TCACTTGACG-A-AAT---A----TCA--TTT-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-T----TTCTT-T
gi|42698 : A-TTACTTGATG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAC-AC-C-A----AAAC--A-AACA------AA--T-A----TCTTC-TAT
gi|42699 : CACTTGGGG-A-AAT---A----TAA--TTC-----GATCTTAG-AC-C------AGAC--A-ACCA------AA--T-A----TCCTT-TAT