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consensus                     : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
Reference ( gi|88597 )        : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88598                      : CAGTTGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGCCATGTG-CCT-AC-A-CT---T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CG-A-AAAA
gi|88600                      : CAGTGAC-GTA------GCTTC-CT--AT---G--G-GC--AC-TA------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C--------TTT----T--T-----C--A---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
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gi|88626                      : CAGGGGT-GTA------GTTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-TCT-AC-A-C----T---TTC----T--T-----C--T---G--AGA
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gi|88627                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC--------------------ATA-CTT-GC-A-T----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------AATTTTCTGTCA---AAA-A-TG---T-AATA-AAAA
gi|88631                      : CGGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AC---A--G-G----C-T-----------------CGTG-T----C-A-C----T---TTT----T--C-----C--T---G--AGAATTTGA---AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-TA-A-AAA
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gi|88644                      :  AGGGGC-GTA------TCTTT-CT--CA---A--G-GT--AC-TG------T----AGGCACATG-TCT-ACAA-C----T---TTT----T--C-----C--A---G--AGAAATAG----AA--A--A-----A---------A----------G---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
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gi|88650                      :    TGAC-ATA------GCTTC-AT--GT---A--G-GC--AC-TGCAGACCC----AGGCCCAGG-CCT-GC-A-C----T---TTT----T--T-----T--------------TCG----GA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88652                      :     GGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTT-TCT-AC-A-C----T---CTT----T--T-----C--T---A--AAAAATCT-----A--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---T-Caaa
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gi|88657                      :      GT-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----TAGTACGTG-CCT-AC-A-CTTTTT---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--GTAAC-A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
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gi|88659                      :      GC-GTA------GTTTT-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-GC-A-C----T---TTT----T--TG----C--T---A--AGAAA-AG----AA--ATGC-----A---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88660                      :      GC-ATA------GCTTC-AC--AT---A--G-GC--AC-TG------C----AGGCCCGGA-CCA-GC-T-C----T---TTT----TC-T-----C--CA--G--AAAAATT------A--A--A-----A---------A---------CA---AA
gi|88661                      :        -GTA------GCTCC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----ATGCATGTG-CCT-TC-A-C----G---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATAA----AA--A--AAATGCA---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88662                      :           A------ACTGC-CC--AT---AAAG-GC--AC-TG------T----ACGCACGTG-CCT-AT-A-T----T---TTT----T--T-----CC-T---G--AGAAATTG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-AA-A-AAAA
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gi|88664                      :                         T--AT---A--G-GC--AC-TG------T----CGGCAAGTG-TCT-AC-A-C----T---TTTTTTCT--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--AT----A---------A---------AA---GAA-A-TG---C-CA-A-AAA
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gi|88666                      :                             T---A--GCGC--AT-TG------T----ATGCAAGTG-GTT-GC-A-T----T---TTT----T--C-----CCCT---G--AAATATCG----AA--A--A-----T---------G---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88667                      :                                     -GC--AT-TG------T----ATGCAAGTG-GTT-GC-A-T----T---TTT----T--C-----CCCT---G--AAATATCG----AA--A--A-----T---------G---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88648                      :                                       C--AA-TG------T----AGGCACGTG-TCT-AC-A-
gi|88653                      :                  tggcgtagcttcctacaggcac--AT-TG------T----AGGCACATG-CCT-AC-A-tttttactaaaatttgaaaaaaggaaactgccaaaaa
gi|88620                      :                   ggcgtagcttcctattggcac--AT-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-tttttctgagaaatcaaaaaata
gi|88668                      :           cagggtcgtagtttcataaaggcactgtc--AT-TG------C----AGGCATGTG-CCT-AC-A-C----C---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATcaaaaataaataaaaatgcca
gi|88619                      :                                           C-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-
gi|88600                      :                   cagtggcatagcttcctatagccgc-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AT-A-ctttttctgagaaaaaatagaaatacaaaaaga
gi|88599                      :                   cagtgacgtagcttcctatgggcac-TG------T----AGGCACGTG-TCT-AC-A-ctttttcagagaaatcgaaaaaataaaaatgccaaaaaa
gi|88608                      :                   cagtggcgtagcttcctataggcac-TG------T----AGGCACATG-CCT-AC-A-ttttttttctgagaaatcgaaaaaaaaaaatcccaaagaa
gi|88610                      :                   cagtggcgtatctgcctataggtac-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-cctttttctgagaaatcgaaaacaaatgaaaatgcaaaaaaa
gi|88612                      :                   caatggcgtagcttcctatatgcac-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-catttttctgaaaaatcgagagaaaaaaagccaaaa
gi|88614                      :                   cagtagcgtagcttcctacaggcac-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-cctttttttctataaaatcgaaaaaattaaactaccaga
gi|88658                      :                    cagtggaataccttctttaggtac-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-ctttttttctgagtaattgcaaaaaatagaaatgccaaaaaa
gi|88625                      :                        gcgtagcttactataggcac-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-cattttttttcctgagaaatcaaaa
gi|88659                      :                   cagtggtgtagcttcctataggcac-TG------C----AGGCACGTG-CCT-AC-A-ccatttttataataaaaatcga
gi|88626                      :                        gcgtagttttctataggcac-TG------T----AGACACGTG-CCT-AC-A-cttttttgctaagaaaagaaatgcaataaaaat
gi|88670                      :                   caggggtgtagtttcctataggcac-TG------T----AGGCACGTG-CCT-Actttcttctgaga
gi|88651                      :                                            -TG------T----AGACACGTG-CCT-AC-A-ctttttttctgagaaatcgaaaaaaaaaatagaaatgctaaaaaa
gi|88669                      :                      ggctgtagcatcctaaaggcat-TG------C----AGGGGCGTGACCT-AC-A-C----T---TTT----T--TTTCTTC--T---T--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---T-CG-A-AAAActttttttcagaaacaaatgaaaatgcaataaa
gi|88604                      :                                              G------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-
gi|88611                      :                      cagcggcgtagcttcctacatgcac------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-tttttctgagaattcgaaaaaataaaaatgccaaaa
gi|88670                      :                      caggggcataacttcctgtaggcac------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTTT---T--T-----C--T---G--AGAAATCGAAAAAA--A--A-----A---------A---------TA---GAA-A-TG---C-TA-A-AAAAaactttcttctgagaaatcgaaaataaaaaatgcaaaaaa
gi|88671                      :                                                                 TG-CCT-AC-A-C----T---TGT----T--T-----A--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-CG---C-CA-A-AAA
gi|88672                      :                                                                                       TT----T--T-----C--T---G--AGAAATCGA---AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA





Alignments
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lowQualScore                  :    .   .   ......     .  ..  ... .. .  ..  .  ...... ....         .   .  . . .... ...   .... .. ..... .. ... ..      . ....  .. .. ..... ......... .........  ...   . .  ... .  . .    
lowQualScore                  :    6   6   777777     6  88  000 88 6  88  5  666666 1111         1   5  5 5 4444 111   4444 66 11111 00 555 77      5 9999  88 44 44444 444444444 444444444  111   6 6  222 7  8 8    
consensus                     : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
Reference ( family-385 )      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88597                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88598                      : CAGTTGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGCCATGTG-CCT-AC-A-CT---T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CG-A-AAAA
gi|88599                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGACACGTG-CCT-AC-ATT----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A----------A---AAA-A-TC---C-CA-A-AGAA
gi|88600                      : CAGTGAC-GTA------GCTTC-CT--AT---G--G-GC--AC-TA------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C--------TTT----T--T-----C--A---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88601                      : CAGAGGC-GTA------GCTTC-CT--GT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCATGTG-CCT-GC-A-C----T---TTT----T--T-----T--T---G--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88602                      : CAGCGGG-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-AC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CAT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---A--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TT---C-CA-A-AAA
gi|88603                      : CAGTGAC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-AC--AC-TG------T----AAACACGTG-CCT-AC-A-CT---T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCT----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-TG-A-AAAA
gi|88604                      : CAGCGGC-GTA------GCTTC-CT--AC---A--T-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC------------TTT----T--T-----C--T---G--AGAATTCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88605                      : CAGGGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----ATGCACGTG-CCT-AC-A-C----C---TTT----T--T-----C--A---G--AGGAATTG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-TA-A-AAA
gi|88606                      : CAGGGGC-GTA------GCTTC-CT--AA---G--G-GC--AC-TA------T----AGGCACGTG-CCT-AT-A-CTTT-T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TGCCCC-CA-A-AAA
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gi|88608                      : CAGTGGC-GTA------TCTGC-CT--AT---A--G-GT--AC-TG------T----AGGCATGTG-CCT-AC-A-C----C---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--AACA-----A---------A---------TG---AAA-A-TG---C-AA-A-AAAA
gi|88609                      : CAGAGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----ACGCACGTG-CCT-TT-A-C----C---TTT----T--T-----C--T---G--ATAAACTG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
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gi|88611                      : CAGGGGC-ATA------ACTTC-CT--GT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AA-A-C----T---TTC----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----T---------A----------A---AAA-A-TG---C-AA-A-AAA
gi|88612                      : CAGTAGC-GTA------GCTTC-CT--AC---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-CCT--T---TTT----T--T-----C--T---A--TAAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TT---AAA-C-TA---C-CA-G-A
gi|88613                      : CAGGGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-AC--AC-AG------T----AGGCAGGTG-CCT-AC-A-C--------TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--T-----G---------A---------CA---AAA-A-TG---A-CA-A-AAAA
gi|88614                      : CAGTGGA-ATA------CCTTC-TT---T---A--G-GT--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-CT---T---TTT----T--T-----C--T---G--AGTAATTGC---AA--A--A-----A---------A---------TA---GAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88615                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-TT--AT---A--G-GC--AC--------------------GTG-CCT-AT-A-C----T---TTT-------T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88616                      : CAGGGGC-GTA------GCTTA-CT--AT---A--G-GC--AC-TA------G----AGGCACGTG-TCT-AC-A-T----T---TCT----T--T-----T--T---G--AGAAATCG----CA--A--A-----A---------A---------TA---CAT-A-CA---C-CA-A-AA
gi|88617                      : CAGTGGC-GTACATGTAGCTCC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----TGGCACGTG-CCTGAC---C----T---TTT----T--T-----C--T---G--TTAAATCG----AG--A--A-----A---------A---------AA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88618                      : CAGTGGC-GTA------GCATC-CT--GT---G--G-AC--AC-TA------T----AGGCATGTG-CCT-AC-A-T----T---TTT----TCCC-----C--T---G--AGAAATCG-----A--A--A-----C---------A---------TT---TAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88619                      : CAGTGGC-ATA------GCTTC-CT--AT---A--G-CC--GC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-G----C---TTT----T--T-----C--T---G--A------G----AA--A--A-----A---------A---------TA---GAA-A-TA---C-AA-A-AAGA
gi|88620                      : CAGGGTC-GTA------GTTTC-AT--AA---A--G-GC--AC-TG------TCTGTAGGCACGTG-CCT-AC-----------------------------------------AATCA----AA--AATA-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-
gi|88621                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC--------------------GTG-CAT-AC-A-C----T---TTT----T--TTT---C--T---G--AAAATTCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-ATAAAA
gi|88622                      : CAGGGTC-GTA------GCTTG-CTTAATTAAA--G-GC--AC-TG------T----TTGCACGTA-CCT-AC-A-T----T---TTT----T--C-----C--T---T--AGAAATCG----AA--G--A-----G---------A---------TA---AAA-A-AG---C-CA-A-AA
gi|88623                      : CAGTGAC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCAC--------AC-A-A---------TT----T--T-----C--T---G--AAAAGTTG----AA--A--A-----ATATTATGATA---------TA---AAA-A-T
gi|88624                      : CAGGGGT-GAA------GCTTC-TT--AT---A--G-GC--AC--------------------GTG-TCT-GC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCA----AA--C--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88625                      : CAGTGGT-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----CA--TTT----T--T-----A--T---AATAAAAATCG----A
gi|88626                      : CAGGGGT-GTA------GTTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-TCT-AC-A-C----T---TTC----T--T-----C--T---G--AGA
gi|88627                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC--------------------ATA-CTT-GC-A-T----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------AATTTTCTGTCA---AAA-A-TG---T-AATA-AAAA
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gi|88631                      : CGGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AC---A--G-G----C-T-----------------CGTG-T----C-A-C----T---TTT----T--C-----C--T---G--AGAATTTGA---AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-TA-A-AAA
gi|88632                      : CAGGGGC-GTA------GCTGC-CT--TT---A--G-GC--TG-TG------T----AAGCCTGGA-CCT-GC-A-C----T---TTT----C--T-----C--C---G--AAATAT-G----AAACA--A-----A---------A---------TA---AAA-A-CG---C-CA-A-AAA
gi|88633                      : CAGGAGT-GTA------GCTTC-------------------A--TG------C----AGGCACATG-CCT-AC-A-C----T---GTT----T--T-----A--T---G--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------A---------TA---CAA-A-TG---
gi|88634                      : CAGAAGC-GTG------GCTTC-CT--ATTATA--G-GC--AC-TG------T----A------TG-C-T-AC-A-CC---T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAAT-------A--A--A-----A---------A---------CA---AAA-
gi|88635                      : CAGGGGT-GTA------ACTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-CG------T----AGGCACGTG-C-----------------TTT----G--T-----C--T---G--AGGA
gi|88636                      : CAGTGGC-GTA------A-----------------------AC-TG------T----CGGCACGTG-TCT-AC-A-C----TTTTTTT----T--T-----C--T---G--CGAAATAG----AA--A--A-----A---------A---------
gi|88637                      : CAGAGGC-ATA------GCTGC-CT---T---A--A-GG--ACATA------T----AGGCCCGGG-CCT-AC-A-C----C---TTC----C--T-----A--C---G--AAAAACGG----AA--T--A-----T---------A----------A---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88638                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-TT--AT---A------------------------------------------------T---TTT----CG-T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TG---AAA-A-CG---C-AA-A-AAAA
gi|88639                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----A
gi|88640                      : CAGTGGC-GTA------GCTAC-TT--TT---A--G-GCCAAA-TA------T----A--C-CGGG-CCT-AT-A-C----A---TCA----T--T-----T--T---G--AAAAATGT----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-GG---C-C
gi|88641                      : CAGAGGT-GTA------CCTGC-CT--TA---A--G-GC--CG-TG------T----AGGCCCGGG-CCT-AC-A------T---ATT----T--C-----C--C---G--AAAAATGA----AA--A--A-----A---------A---------GA---AAA-A-
gi|88642                      :  AATGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AT-TG------A----AGGAACGTG-CCT-AC-A-C--------TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------G---------TG---AAA-A-TG---G-CA-
gi|88643                      :  AGGGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCAAGTG-TCT-AC-A-A----T---TTT----T--TTAC--C--G---G--AGAAATTG----CA--A--A-----A---------T---------TA---ACA-A-TG---C-
gi|88644                      :  AGGGGC-GTA------TCTTT-CT--CA---A--G-GT--AC-TG------T----AGGCACATG-TCT-ACAA-C----T---TTT----T--C-----C--A---G--AGAAATAG----AA--A--A-----A---------A----------G---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88645                      :  AGTG-T-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TA------T----AGGTACGGG-CCT-AC-A-C----T---TTT----C-----------------------------------------------------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88646                      :  AGTG-C-GTA------GCTGC-CT--TA---A--G-GC--AC-TG------T----AAGCACGTG-CCT-AC-
gi|88647                      :    TAGC-ATG------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGATACGTG-TCT-AC-A-CTTGTT---TTT----T--T-----C--T---A--ATAAACCA----AA--A--C-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88648                      :    TGGC-GTA------GCTTC-CT--AC---A--G-GC--AC-TG------T----AGACACGTG-CCT-AC-A-T----TG--TTT----T--TA----C--T------AAAATTTG----AA--A--A-----A---------A---------GG---AAA-C-TG---C-CA-A-AAA
gi|88649                      :    TGGC-GTA------GCTTC-AC--AT---A--G-GC--GC-TG------T----AGACACGTG-CCT-AA-A-C----T---TT-----------------T---G--AGATATC-----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88650                      :    TGAC-ATA------GCTTC-AT--GT---A--G-GC--AC-TGCAGACCC----AGGCCCAGG-CCT-GC-A-C----T---TTT----T--T-----T--------------TCG----GA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88651                      :     GGCTGTA------GCATC-CT--AA---A--G-GC--AT-TG------T----AGGCACGTG-TCT-AC-A-C----T---TTT----T--T--------T---C--AGAAAC-------------A-----A---------A---------TG---AAA-A-TG---C-AA-T-AAAaaa
gi|88652                      :     GGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTT-TCT-AC-A-C----T---CTT----T--T-----C--T---A--AAAAATCT-----A--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---T-C
gi|88653                      :     GGC-GTA------GCTTC-CT--AT---T--G-GC--AC-TG------T----AGGCATGTG-CCT-AC-A-A----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATC-----AA--A--A-----A---------A---------TA---
gi|88654                      :     GGC-GGA------GCTTC-CT--AT---A--G--C--AC--G------T----AAGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--C---G--AGAAAT-G----AA--A--A--------------------------A---AAA-A-TG---CATA-A-AAA
gi|88655                      :     GGC-GTA------GCTAC-AC--GT---A--G-GC--AC-TG------C----AGGC-TTTGACCT-GC-A-T----T---TTT----T--T-----C--CAGGG--AAAAATTG----AA--A--
gi|88656                      :     GGC-ATA------GTTACACT---T---A--G-GT--AC-TG------T----CGGCACGGG-CCT-GC---T----T---TTTGC--T--T-----C--C---G--AAAAAT----------A--A-----A---------A---------TGTTGAAA-A-TG---C-
gi|88657                      :      GT-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----TAGTACGTG-CCT-AC-A-CTTTTT---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--GTAAC-A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88658                      :      GC-GTA------GCTTA-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-CATTTT---TTT----T--C-----C--T---G--AGAAATCA----AA--A--
gi|88659                      :      GC-GTA------GTTTT-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-GC-A-C----T---TTT----T--TG----C--T---A--AGAAA-AG----AA--ATGC-----A---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88660                      :      GC-ATA------GCTTC-AC--AT---A--G-GC--AC-TG------C----AGGCCCGGA-CCA-GC-T-C----T---TTT----TC-T-----C--CA--G--AAAAATT------A--A--A-----A---------A---------CA---AA
gi|88661                      :        -GTA------GCTCC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----ATGCATGTG-CCT-TC-A-C----G---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATAA----AA--A--AAATGCA---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88662                      :           A------ACTGC-CC--AT---AAAG-GC--AC-TG------T----ACGCACGTG-CCT-AT-A-T----T---TTT----T--T-----CC-T---G--AGAAATTG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-AA-A-AAAA
gi|88663                      :                      C-CT--A---------GC--AT-TG------C----AGGCATGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--A-----T--T---G--AGGAATTA----AA--A--G-----A---------A---------TG---AAA-A-TG---A-CA-A-AAAA
gi|88664                      :                         T--AT---A--G-GC--AC-TG------T----CGGCAAGTG-TCT-AC-A-C----T---TTTTTTCT--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--AT----A---------A---------AA---GAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88665                      :                          --AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCAC-TA-CTT------T----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAA--------------A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-AA-A-AAAA
gi|88666                      :                             T---A--GCGC--AT-TG------T----ATGCAAGTG-GTT-GC-A-T----T---TTT----T--C-----CCCT---G--AAATATCG----AA--A--A-----T---------G---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88667                      :                                     -GC--AT-TG------T----ATGCAAGTG-GTT-GC-A-T----T---TTT----T--C-----CCCT---G--AAATATCG----AA--A--A-----T---------G---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88668                      :                                        --AT-TG------C----AGGCATGTG-CCT-AC-A-C----C---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAAT
gi|88669                      :                                            -TG------C----AGGGGCGTGACCT-AC-A-C----T---TTT----T--TTTCTTC--T---T--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---T-CG-A-AAAA
gi|88670                      :                                               ------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTTT---T--T-----C--T---G--AGAAATCGAAAAAA--A--A-----A---------A---------TA---GAA-A-TG---C-TA-A-AAAA
gi|88671                      :                                                                 TG-CCT-AC-A-C----T---TGT----T--T-----A--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-CG---C-CA-A-AAA
gi|88672                      :                                                                                       TT----T--T-----C--T---G--AGAAATCGA---AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA





Alignments
lowQualScore                  :    1   0   111111     0  00  222 00 0  00  0  111111 1111         1   0  0 0 7777 222   2222 22 44444 22 111 00      0 2222  00 22 33333 222222222 222222222  111   0 0  111 0  0 0    
lowQualScore                  :    .   .   ......     .  ..  ... .. .  ..  .  ...... ....         .   .  . . .... ...   .... .. ..... .. ... ..      . ....  .. .. ..... ......... .........  ...   . .  ... .  . .    
lowQualScore                  :    6   6   777777     6  88  000 88 6  88  5  666666 1111         1   5  5 5 4444 111   4444 66 11111 00 555 77      5 9999  88 44 44444 444444444 444444444  111   6 6  222 7  8 8    
consensus                     : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
Reference ( family-385 )      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88597                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88598                      : CAGTTGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGCCATGTG-CCT-AC-A-CT---T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CG-A-AAAA
gi|88599                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGACACGTG-CCT-AC-ATT----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A----------A---AAA-A-TC---C-CA-A-AGAA
gi|88600                      : CAGTGAC-GTA------GCTTC-CT--AT---G--G-GC--AC-TA------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C--------TTT----T--T-----C--A---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88601                      : CAGAGGC-GTA------GCTTC-CT--GT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCATGTG-CCT-GC-A-C----T---TTT----T--T-----T--T---G--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88602                      : CAGCGGG-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-AC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CAT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---A--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TT---C-CA-A-AAA
gi|88603                      : CAGTGAC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-AC--AC-TG------T----AAACACGTG-CCT-AC-A-CT---T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCT----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-TG-A-AAAA
gi|88604                      : CAGCGGC-GTA------GCTTC-CT--AC---A--T-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC------------TTT----T--T-----C--T---G--AGAATTCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88605                      : CAGGGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----ATGCACGTG-CCT-AC-A-C----C---TTT----T--T-----C--A---G--AGGAATTG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-TA-A-AAA
gi|88606                      : CAGGGGC-GTA------GCTTC-CT--AA---G--G-GC--AC-TA------T----AGGCACGTG-CCT-AT-A-CTTT-T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TGCCCC-CA-A-AAA
gi|88607                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCATATG-CCT-AC-A-C----T---TTT----A--T-----C--T---G--AGAAATCG-----------A-----A---------A---------TA---AAATA-TG---C-AA-A-AAAA
gi|88608                      : CAGTGGC-GTA------TCTGC-CT--AT---A--G-GT--AC-TG------T----AGGCATGTG-CCT-AC-A-C----C---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--AACA-----A---------A---------TG---AAA-A-TG---C-AA-A-AAAA
gi|88609                      : CAGAGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----ACGCACGTG-CCT-TT-A-C----C---TTT----T--T-----C--T---G--ATAAACTG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88610                      : CAATGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--T-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----A---TTT----T--T-----C--T---G--AAAAATCG----AG--A--G-----A---------A----------A---AAA-A--G---C-CA-A-AA
gi|88611                      : CAGGGGC-ATA------ACTTC-CT--GT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AA-A-C----T---TTC----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----T---------A----------A---AAA-A-TG---C-AA-A-AAA
gi|88612                      : CAGTAGC-GTA------GCTTC-CT--AC---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-CCT--T---TTT----T--T-----C--T---A--TAAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TT---AAA-C-TA---C-CA-G-A
gi|88613                      : CAGGGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-AC--AC-AG------T----AGGCAGGTG-CCT-AC-A-C--------TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--T-----G---------A---------CA---AAA-A-TG---A-CA-A-AAAA
gi|88614                      : CAGTGGA-ATA------CCTTC-TT---T---A--G-GT--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-CT---T---TTT----T--T-----C--T---G--AGTAATTGC---AA--A--A-----A---------A---------TA---GAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88615                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-TT--AT---A--G-GC--AC--------------------GTG-CCT-AT-A-C----T---TTT-------T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88616                      : CAGGGGC-GTA------GCTTA-CT--AT---A--G-GC--AC-TA------G----AGGCACGTG-TCT-AC-A-T----T---TCT----T--T-----T--T---G--AGAAATCG----CA--A--A-----A---------A---------TA---CAT-A-CA---C-CA-A-AA
gi|88617                      : CAGTGGC-GTACATGTAGCTCC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----TGGCACGTG-CCTGAC---C----T---TTT----T--T-----C--T---G--TTAAATCG----AG--A--A-----A---------A---------AA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88618                      : CAGTGGC-GTA------GCATC-CT--GT---G--G-AC--AC-TA------T----AGGCATGTG-CCT-AC-A-T----T---TTT----TCCC-----C--T---G--AGAAATCG-----A--A--A-----C---------A---------TT---TAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88619                      : CAGTGGC-ATA------GCTTC-CT--AT---A--G-CC--GC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-G----C---TTT----T--T-----C--T---G--A------G----AA--A--A-----A---------A---------TA---GAA-A-TA---C-AA-A-AAGA
gi|88620                      : CAGGGTC-GTA------GTTTC-AT--AA---A--G-GC--AC-TG------TCTGTAGGCACGTG-CCT-AC-----------------------------------------AATCA----AA--AATA-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-
gi|88621                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC--------------------GTG-CAT-AC-A-C----T---TTT----T--TTT---C--T---G--AAAATTCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-ATAAAA
gi|88622                      : CAGGGTC-GTA------GCTTG-CTTAATTAAA--G-GC--AC-TG------T----TTGCACGTA-CCT-AC-A-T----T---TTT----T--C-----C--T---T--AGAAATCG----AA--G--A-----G---------A---------TA---AAA-A-AG---C-CA-A-AA
gi|88623                      : CAGTGAC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCAC--------AC-A-A---------TT----T--T-----C--T---G--AAAAGTTG----AA--A--A-----ATATTATGATA---------TA---AAA-A-T
gi|88624                      : CAGGGGT-GAA------GCTTC-TT--AT---A--G-GC--AC--------------------GTG-TCT-GC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCA----AA--C--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88625                      : CAGTGGT-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----CA--TTT----T--T-----A--T---AATAAAAATCG----A
gi|88626                      : CAGGGGT-GTA------GTTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-TCT-AC-A-C----T---TTC----T--T-----C--T---G--AGA
gi|88627                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC--------------------ATA-CTT-GC-A-T----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------AATTTTCTGTCA---AAA-A-TG---T-AATA-AAAA
gi|88628                      : CAGGGGC-GTA------GCTAC-AT--GT---A--A-GT--AC-GT------T----AGGCATGTG-TCT-GC-G-C----T---TTT----TATT-----C--T---G--AGAAATTG----AA--A--A-----A---------A---------TC---AAT-A-TG---T-CA-A-AAA
gi|88629                      : CAGAGGT-GTA------GCTTC-C-----------------A---G------T----AGGCATGTG-TTT-GC-A-C----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAAT-G----AA--A--A-----A---------A---------AA---AAA-ATTG---C-CA-A-AA
gi|88630                      : CAGGGGC-CTA------ATTTC-CT--AT---A--G-GC--TC-TC------T----AGGCATGTG-CAA-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--A---G--AGAAATCG----AA--A--
gi|88631                      : CGGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AC---A--G-G----C-T-----------------CGTG-T----C-A-C----T---TTT----T--C-----C--T---G--AGAATTTGA---AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-TA-A-AAA
gi|88632                      : CAGGGGC-GTA------GCTGC-CT--TT---A--G-GC--TG-TG------T----AAGCCTGGA-CCT-GC-A-C----T---TTT----C--T-----C--C---G--AAATAT-G----AAACA--A-----A---------A---------TA---AAA-A-CG---C-CA-A-AAA
gi|88633                      : CAGGAGT-GTA------GCTTC-------------------A--TG------C----AGGCACATG-CCT-AC-A-C----T---GTT----T--T-----A--T---G--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------A---------TA---CAA-A-TG---
gi|88634                      : CAGAAGC-GTG------GCTTC-CT--ATTATA--G-GC--AC-TG------T----A------TG-C-T-AC-A-CC---T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAAT-------A--A--A-----A---------A---------CA---AAA-
gi|88635                      : CAGGGGT-GTA------ACTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-CG------T----AGGCACGTG-C-----------------TTT----G--T-----C--T---G--AGGA
gi|88636                      : CAGTGGC-GTA------A-----------------------AC-TG------T----CGGCACGTG-TCT-AC-A-C----TTTTTTT----T--T-----C--T---G--CGAAATAG----AA--A--A-----A---------A---------
gi|88637                      : CAGAGGC-ATA------GCTGC-CT---T---A--A-GG--ACATA------T----AGGCCCGGG-CCT-AC-A-C----C---TTC----C--T-----A--C---G--AAAAACGG----AA--T--A-----T---------A----------A---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88638                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-TT--AT---A------------------------------------------------T---TTT----CG-T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TG---AAA-A-CG---C-AA-A-AAAA
gi|88639                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----A
gi|88640                      : CAGTGGC-GTA------GCTAC-TT--TT---A--G-GCCAAA-TA------T----A--C-CGGG-CCT-AT-A-C----A---TCA----T--T-----T--T---G--AAAAATGT----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-GG---C-C
gi|88641                      : CAGAGGT-GTA------CCTGC-CT--TA---A--G-GC--CG-TG------T----AGGCCCGGG-CCT-AC-A------T---ATT----T--C-----C--C---G--AAAAATGA----AA--A--A-----A---------A---------GA---AAA-A-
gi|88642                      :  AATGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AT-TG------A----AGGAACGTG-CCT-AC-A-C--------TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------G---------TG---AAA-A-TG---G-CA-
gi|88643                      :  AGGGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCAAGTG-TCT-AC-A-A----T---TTT----T--TTAC--C--G---G--AGAAATTG----CA--A--A-----A---------T---------TA---ACA-A-TG---C-
gi|88644                      :  AGGGGC-GTA------TCTTT-CT--CA---A--G-GT--AC-TG------T----AGGCACATG-TCT-ACAA-C----T---TTT----T--C-----C--A---G--AGAAATAG----AA--A--A-----A---------A----------G---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88645                      :  AGTG-T-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TA------T----AGGTACGGG-CCT-AC-A-C----T---TTT----C-----------------------------------------------------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88646                      :  AGTG-C-GTA------GCTGC-CT--TA---A--G-GC--AC-TG------T----AAGCACGTG-CCT-AC-
gi|88647                      :    TAGC-ATG------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGATACGTG-TCT-AC-A-CTTGTT---TTT----T--T-----C--T---A--ATAAACCA----AA--A--C-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88648                      :    TGGC-GTA------GCTTC-CT--AC---A--G-GC--AC-TG------T----AGACACGTG-CCT-AC-A-T----TG--TTT----T--TA----C--T------AAAATTTG----AA--A--A-----A---------A---------GG---AAA-C-TG---C-CA-A-AAA
gi|88649                      :    TGGC-GTA------GCTTC-AC--AT---A--G-GC--GC-TG------T----AGACACGTG-CCT-AA-A-C----T---TT-----------------T---G--AGATATC-----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88650                      :    TGAC-ATA------GCTTC-AT--GT---A--G-GC--AC-TGCAGACCC----AGGCCCAGG-CCT-GC-A-C----T---TTT----T--T-----T--------------TCG----GA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88651                      :     GGCTGTA------GCATC-CT--AA---A--G-GC--AT-TG------T----AGGCACGTG-TCT-AC-A-C----T---TTT----T--T--------T---C--AGAAAC-------------A-----A---------A---------TG---AAA-A-TG---C-AA-T-AAAaaa
gi|88652                      :     GGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTT-TCT-AC-A-C----T---CTT----T--T-----C--T---A--AAAAATCT-----A--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---T-C
gi|88653                      :     GGC-GTA------GCTTC-CT--AT---T--G-GC--AC-TG------T----AGGCATGTG-CCT-AC-A-A----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATC-----AA--A--A-----A---------A---------TA---
gi|88654                      :     GGC-GGA------GCTTC-CT--AT---A--G--C--AC--G------T----AAGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--C---G--AGAAAT-G----AA--A--A--------------------------A---AAA-A-TG---CATA-A-AAA
gi|88655                      :     GGC-GTA------GCTAC-AC--GT---A--G-GC--AC-TG------C----AGGC-TTTGACCT-GC-A-T----T---TTT----T--T-----C--CAGGG--AAAAATTG----AA--A--
gi|88656                      :     GGC-ATA------GTTACACT---T---A--G-GT--AC-TG------T----CGGCACGGG-CCT-GC---T----T---TTTGC--T--T-----C--C---G--AAAAAT----------A--A-----A---------A---------TGTTGAAA-A-TG---C-
gi|88657                      :      GT-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----TAGTACGTG-CCT-AC-A-CTTTTT---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--GTAAC-A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88658                      :      GC-GTA------GCTTA-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-CATTTT---TTT----T--C-----C--T---G--AGAAATCA----AA--A--
gi|88659                      :      GC-GTA------GTTTT-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-GC-A-C----T---TTT----T--TG----C--T---A--AGAAA-AG----AA--ATGC-----A---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88660                      :      GC-ATA------GCTTC-AC--AT---A--G-GC--AC-TG------C----AGGCCCGGA-CCA-GC-T-C----T---TTT----TC-T-----C--CA--G--AAAAATT------A--A--A-----A---------A---------CA---AA
gi|88661                      :        -GTA------GCTCC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----ATGCATGTG-CCT-TC-A-C----G---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATAA----AA--A--AAATGCA---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88662                      :           A------ACTGC-CC--AT---AAAG-GC--AC-TG------T----ACGCACGTG-CCT-AT-A-T----T---TTT----T--T-----CC-T---G--AGAAATTG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-AA-A-AAAA
gi|88663                      :                      C-CT--A---------GC--AT-TG------C----AGGCATGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--A-----T--T---G--AGGAATTA----AA--A--G-----A---------A---------TG---AAA-A-TG---A-CA-A-AAAA
gi|88664                      :                         T--AT---A--G-GC--AC-TG------T----CGGCAAGTG-TCT-AC-A-C----T---TTTTTTCT--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--AT----A---------A---------AA---GAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88665                      :                          --AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCAC-TA-CTT------T----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAA--------------A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-AA-A-AAAA
gi|88666                      :                             T---A--GCGC--AT-TG------T----ATGCAAGTG-GTT-GC-A-T----T---TTT----T--C-----CCCT---G--AAATATCG----AA--A--A-----T---------G---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88667                      :                                     -GC--AT-TG------T----ATGCAAGTG-GTT-GC-A-T----T---TTT----T--C-----CCCT---G--AAATATCG----AA--A--A-----T---------G---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88668                      :                                        --AT-TG------C----AGGCATGTG-CCT-AC-A-C----C---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAAT
gi|88669                      :                                            -TG------C----AGGGGCGTGACCT-AC-A-C----T---TTT----T--TTTCTTC--T---T--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---T-CG-A-AAAA
gi|88670                      :                                               ------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTTT---T--T-----C--T---G--AGAAATCGAAAAAA--A--A-----A---------A---------TA---GAA-A-TG---C-TA-A-AAAA
gi|88671                      :                                                                 TG-CCT-AC-A-C----T---TGT----T--T-----A--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-CG---C-CA-A-AAA
gi|88672                      :                                                                                       TT----T--T-----C--T---G--AGAAATCGA---AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA


blockSeqs                     :    T       CATGTA            TAA              CAGACC CTGT         A          TTGT TTT   TTTC CC TTCTT CC AGG           AAAA     AC AATGC TATTATGAT ATTTTCTGT  TTG        CCC
blockSeqs                     :    T       .                 TAT              .      .            A          TTTT A     GC   AT TAC   CC A             C        AT TAAC  .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          ATTT G     T    G  TT    C  .             A        TG T     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    A       .                 .                .      .            .          TTT  .     .    C  A     .  .             A        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    C       .                 .                .      .            .          CT   .     .    .  G     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          T    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    C       .                 .                .      .            .          T    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          T    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          C    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    A       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    A       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    A       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    A       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    A       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    G       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :    T       .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :            .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :            .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :            .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :            .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .          .  
blockSeqs                     :            .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .             
blockSeqs                     :            .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .             
blockSeqs                     :            .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .             
blockSeqs                     :            .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .             
blockSeqs                     :            .                 .                .      .            .          .    .     .    .  .     .  .             .        .  .     .         .          .             
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gi|88618                      : CAGTGGC-GTA------GCATC-CT--GT---G--G-AC--AC-TA------T----AGGCATGTG-CCT-AC-A-T----T---TTT----TCCC-----C--T---G--AGAAATCG-----A--A--A-----C---------A---------TT---TAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88619                      : CAGTGGC-ATA------GCTTC-CT--AT---A--G-CC--GC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-G----C---TTT----T--T-----C--T---G--A------G----AA--A--A-----A---------A---------TA---GAA-A-TA---C-AA-A-AAGA
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gi|88621                      : CAGTGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC--------------------GTG-CAT-AC-A-C----T---TTT----T--TTT---C--T---G--AAAATTCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-ATAAAA
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gi|88635                      : CAGGGGT-GTA------ACTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-CG------T----AGGCACGTG-C-----------------TTT----G--T-----C--T---G--AGGA
gi|88636                      : CAGTGGC-GTA------A-----------------------AC-TG------T----CGGCACGTG-TCT-AC-A-C----TTTTTTT----T--T-----C--T---G--CGAAATAG----AA--A--A-----A---------A---------
gi|88637                      : CAGAGGC-ATA------GCTGC-CT---T---A--A-GG--ACATA------T----AGGCCCGGG-CCT-AC-A-C----C---TTC----C--T-----A--C---G--AAAAACGG----AA--T--A-----T---------A----------A---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
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gi|88640                      : CAGTGGC-GTA------GCTAC-TT--TT---A--G-GCCAAA-TA------T----A--C-CGGG-CCT-AT-A-C----A---TCA----T--T-----T--T---G--AAAAATGT----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-GG---C-C
gi|88641                      : CAGAGGT-GTA------CCTGC-CT--TA---A--G-GC--CG-TG------T----AGGCCCGGG-CCT-AC-A------T---ATT----T--C-----C--C---G--AAAAATGA----AA--A--A-----A---------A---------GA---AAA-A-
gi|88642                      :  AATGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AT-TG------A----AGGAACGTG-CCT-AC-A-C--------TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------G---------TG---AAA-A-TG---G-CA-
gi|88643                      :  AGGGGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCAAGTG-TCT-AC-A-A----T---TTT----T--TTAC--C--G---G--AGAAATTG----CA--A--A-----A---------T---------TA---ACA-A-TG---C-
gi|88644                      :  AGGGGC-GTA------TCTTT-CT--CA---A--G-GT--AC-TG------T----AGGCACATG-TCT-ACAA-C----T---TTT----T--C-----C--A---G--AGAAATAG----AA--A--A-----A---------A----------G---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88645                      :  AGTG-T-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TA------T----AGGTACGGG-CCT-AC-A-C----T---TTT----C-----------------------------------------------------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88646                      :  AGTG-C-GTA------GCTGC-CT--TA---A--G-GC--AC-TG------T----AAGCACGTG-CCT-AC-
gi|88647                      :    TAGC-ATG------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGATACGTG-TCT-AC-A-CTTGTT---TTT----T--T-----C--T---A--ATAAACCA----AA--A--C-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88648                      :    TGGC-GTA------GCTTC-CT--AC---A--G-GC--AC-TG------T----AGACACGTG-CCT-AC-A-T----TG--TTT----T--TA----C--T------AAAATTTG----AA--A--A-----A---------A---------GG---AAA-C-TG---C-CA-A-AAA
gi|88649                      :    TGGC-GTA------GCTTC-AC--AT---A--G-GC--GC-TG------T----AGACACGTG-CCT-AA-A-C----T---TT-----------------T---G--AGATATC-----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AA
gi|88650                      :    TGAC-ATA------GCTTC-AT--GT---A--G-GC--AC-TGCAGACCC----AGGCCCAGG-CCT-GC-A-C----T---TTT----T--T-----T--------------TCG----GA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88651                      :     GGCTGTA------GCATC-CT--AA---A--G-GC--AT-TG------T----AGGCACGTG-TCT-AC-A-C----T---TTT----T--T--------T---C--AGAAAC-------------A-----A---------A---------TG---AAA-A-TG---C-AA-T-AAAaaa
gi|88652                      :     GGC-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTT-TCT-AC-A-C----T---CTT----T--T-----C--T---A--AAAAATCT-----A--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---T-C
gi|88653                      :     GGC-GTA------GCTTC-CT--AT---T--G-GC--AC-TG------T----AGGCATGTG-CCT-AC-A-A----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATC-----AA--A--A-----A---------A---------TA---
gi|88654                      :     GGC-GGA------GCTTC-CT--AT---A--G--C--AC--G------T----AAGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--T-----C--C---G--AGAAAT-G----AA--A--A--------------------------A---AAA-A-TG---CATA-A-AAA
gi|88655                      :     GGC-GTA------GCTAC-AC--GT---A--G-GC--AC-TG------C----AGGC-TTTGACCT-GC-A-T----T---TTT----T--T-----C--CAGGG--AAAAATTG----AA--A--
gi|88656                      :     GGC-ATA------GTTACACT---T---A--G-GT--AC-TG------T----CGGCACGGG-CCT-GC---T----T---TTTGC--T--T-----C--C---G--AAAAAT----------A--A-----A---------A---------TGTTGAAA-A-TG---C-
gi|88657                      :      GT-GTA------GCTTC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----TAGTACGTG-CCT-AC-A-CTTTTT---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--GTAAC-A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88658                      :      GC-GTA------GCTTA-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-CATTTT---TTT----T--C-----C--T---G--AGAAATCA----AA--A--
gi|88659                      :      GC-GTA------GTTTT-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCACGTG-CCT-GC-A-C----T---TTT----T--TG----C--T---A--AGAAA-AG----AA--ATGC-----A---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88660                      :      GC-ATA------GCTTC-AC--AT---A--G-GC--AC-TG------C----AGGCCCGGA-CCA-GC-T-C----T---TTT----TC-T-----C--CA--G--AAAAATT------A--A--A-----A---------A---------CA---AA
gi|88661                      :        -GTA------GCTCC-CT--AT---A--G-GC--AC-TG------T----ATGCATGTG-CCT-TC-A-C----G---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAATAA----AA--A--AAATGCA---------A---------TA---AAA-A-T
gi|88662                      :           A------ACTGC-CC--AT---AAAG-GC--AC-TG------T----ACGCACGTG-CCT-AT-A-T----T---TTT----T--T-----CC-T---G--AGAAATTG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-AA-A-AAAA
gi|88663                      :                      C-CT--A---------GC--AT-TG------C----AGGCATGTG-CCT-AC-A-C----T---TTT----T--A-----T--T---G--AGGAATTA----AA--A--G-----A---------A---------TG---AAA-A-TG---A-CA-A-AAAA
gi|88664                      :                         T--AT---A--G-GC--AC-TG------T----CGGCAAGTG-TCT-AC-A-C----T---TTTTTTCT--T-----C--T---G--AGAAATCG----AA--A--AT----A---------A---------AA---GAA-A-TG---C-CA-A-AAA
gi|88665                      :                          --AT---A--G-GC--AC-TG------T----AGGCAC-TA-CTT------T----T---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAA--------------A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-AA-A-AAAA
gi|88666                      :                             T---A--GCGC--AT-TG------T----ATGCAAGTG-GTT-GC-A-T----T---TTT----T--C-----CCCT---G--AAATATCG----AA--A--A-----T---------G---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88667                      :                                     -GC--AT-TG------T----ATGCAAGTG-GTT-GC-A-T----T---TTT----T--C-----CCCT---G--AAATATCG----AA--A--A-----T---------G---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAAA
gi|88668                      :                                        --AT-TG------C----AGGCATGTG-CCT-AC-A-C----C---TTT----T--T-----C--T---G--AGAAAT
gi|88669                      :                                            -TG------C----AGGGGCGTGACCT-AC-A-C----T---TTT----T--TTTCTTC--T---T--AGAAATCA----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---T-CG-A-AAAA
gi|88670                      :                                               ------T----AGGCACGTG-CCT-AC-A-C----T---TTTT---T--T-----C--T---G--AGAAATCGAAAAAA--A--A-----A---------A---------TA---GAA-A-TG---C-TA-A-AAAA
gi|88671                      :                                                                 TG-CCT-AC-A-C----T---TGT----T--T-----A--T---G--AGAAATCG----AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-CG---C-CA-A-AAA
gi|88672                      :                                                                                       TT----T--T-----C--T---G--AGAAATCGA---AA--A--A-----A---------A---------TA---AAA-A-TG---C-CA-A-AAA