lowQualScore                  :                                                       4444444444444444444444444444444444444444444444                               777777777777777777777                  
lowQualScore                  :                                            0    22222 1111111111111111111111111111111111111111111111  00 1   0000      0000  000   999999999999999999999         0        
lowQualScore                  :                                            .    ..... ..............................................  .. .   ....      ....  ...   .....................         .        
lowQualScore                  :                                            5    00000 7777777777777777777777777777777777777777777777  55 0   8888      8888  666   222222222222222222222         4        
consensus                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---AGA-ATTAACA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCGA-TCAA-AA-T---------GGGTAGTCA-AAATCCCC
Reference ( gi|101862 )       :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCAA---C---AGA-ATTAAAA-----------A-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CTTGG-TCAA-AA-T--A-GA-A-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101832                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---T---AGA-ATTAAAA-----------A-------GG--TGGTC----AACATC----CC---CTTGT-TTAA-AA-T--A-GA-G-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101850                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---AGA-ATTAAGA-----------A-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CTTGG-TCAA-CA-T--A-GA-G-GGGTAGTCA-AAAT
gi|101824                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---AGA-ATAAACA-----------G-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101844                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----T-----TCAA---C---AGA-ATTAACA-----------G-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CTTGG-T-----------------GGGTAGTTA-ATATCCCC
gi|101863                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCAA---C---CAA-AATGATA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCGA-CCAA-AA-T--A-AT-A-GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101836                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----A-----TCGA---C---AGA-ATTAACA-----------G-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTAGTCA-AAATCTCC
gi|101838                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---CAA-AATAATA-----------G-------GG--TATTC----AAAATC----CC---CTCGA-CCAA-AA-T--G-AT-A-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101823                     :                                 gGTGGTCAAAA-TCCC-----C-----TTGGT--C---AAA-A-TAGAA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101841                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCAA---C---CAA-AATGTTA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCGA-CCAA-AA-T--G-TT-A-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101828                     :                                 gGTGGTCAAAA-TCCC-----C-----TTGGT--C---AAA-A-TAGAG-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTAGTCA-AAATCC
gi|101885                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCAA---C---AGA-ATTAAAA-----------A-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---C
gi|101881                     : tggtcaaaatccccttggctcaaaaatgacaaaGTCGTCAAAAATCCC-----C-----TTGA---C---CGA---TAATA-----------G-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CAAGG-TCAA-AA-C--A-GA-G-GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101847                     :                                  GTAGTGAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---AGA-ATTAACA-----------G-------AG--TGGTC----AAAATT----CC---CTTGA-T-----------------GGGCAGTCA-AAATCC
gi|101840                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---CAA-AATGTTA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCGA-CCAA-AT-T--G-TT-A-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101888                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---AGA-ATTAAGA-----------A-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---C
gi|101867                     : tggtcaaaatccccatggttaaaaaatgtcaagGTTGTCAAAT-TCCC-----C-----TCGA---C---ATA-ATTATCA-----------G-------GG--TGGTC----AAAATC----CC--------------AA-T--A-GA-G-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101830                     :                                  GTAGTCAAAA-TACC-----C-----TCGA---T---AGA-ATAAATA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-TC-----------------GGTACTCA-AAATCCCC
gi|101845                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TTGA---C---AGA-ATTAACA-----------G-------GG--TGGTC----ACAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTACTCA-AAA
gi|101865                     :                                 gGTAGTTAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---AGA-ATTAAAA-----------G-------GA--TGGTC-----AAATT----TC---CTTG--------A-T--A-------AGTAGTCA-AAATCTCC
gi|101829                     :                                  GTGGTCAACA-TCCC-----C-----TTGT---T---TAA-AATAGAG-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101894                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---T---AGA-ATTAAAA-----------A-------GG--TGGTC----AACATC----CC---C
gi|101887                     :    tcaaaatccccatggctcaaaattgacaagGTAGTCAAAA-TCCC-----T-----TCAA---C---AGA-ATTAACA-----------G-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---C
gi|101848                     : tggtcgaaatccccatgactcaaaaattacatgGTGGTCAAAA-TCCC-----CTTGG-TCAA---C---A-----TAGAG-----------G-------GG--TAGTC----AAAATG----CT---CTTGA-T-----------------GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101846                     :                                 gGTAATCATAA-ACCC-----C-----TAGA---T---AGA-ATTAAAA-----------A-------GG--TGGTC----ACAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTAGTTG-AAATCTCC
gi|101860                     :                                 gGTGGTCAAAA-TCCC------------CAAGGTC---AAA-A-CAGAG-----------G-------GG--TATTC----AAAATC----CC---CTC--------AA-T---------GGGAAGTAA-ACATCTCC
gi|101895                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----A-----TCGA---C---AGA-ATTAACA-----------G-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---C
gi|101884                     :    tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---AGA-ATAAACA-----------G-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---C
gi|101859                     : tggtcaaaatcccattggctcaaaaatgacatgGTGGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---AGA-ATTAATA-----------G-------GG--TGATC----AAAATCCCTTCC---CTT---TT----A-T--A-------TGCAGTCA-AAATCCTC
gi|101896                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TTGA---C---AGA-ATTAACA-----------G-------GG--TGGTC----ACAATC----CC---C
gi|101852                     :    tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TC-----------A-ATTA-----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---CTT-A-TTAA----------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101889                     :                                 gGTAGTGAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---AGA-ATTAACA-----------G-------AG--TGGTC----AAAATT----CC---C
gi|101839                     : tagtcgaaatccccatggctcaacaatgacatgGTATTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---CAA-AATGATA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTATTCA-TAATTC
gi|101842                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---C---CAA-ATTGTTA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CT
gi|101871                     :                                 gGTAGTCAATA-TCCC-----C-----TCA-------------TTAA----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---CTTAT-TTA-----------------GTAGTCA-AAATCCCCcaatagg
gi|101837                     :                                  GTAGTCAAAA-TCTC-----C-----ATAG---C---AAA-AATGATA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATT----CC---CTTGA-T-----------------GGGTATTCA-AAAT
gi|101869                     :                                 gGTAGTCAATA-TCCC-----C-----TC-------------ATTAA----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---CTCAA-TTA-----------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101851                     :                                  GTGGTCAAAA-TCCC-------------AA---T---AGA-G-----------------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTC--------AA-T---------GGGTAGTCA-AAATACC
gi|101875                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TC-----------A-ATTA-----------------------G--TTGTC----AAAATC----CC---CTTAT-TTA-----------------GTAGTCA-ATATCCCC
gi|101826                     :                                  GTGGTCAAAA-TCCC-----C-----TTGA---T-------------------------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CATGG--CAA-TA-T--T-GCTA-GTGTAGTCA-AAATTCCC
gi|101882                     :                                 gGTGATCAAAA-TCCC-----C-----TCAA---C---AGA-ATTAACACTCACTCACCTG-------GG--TAGT------GAATT----CC---CTC--------AA-T---------GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101843                     :                                  GTAGTTAATA-TCCC-----C-----ATGG---C---AAA-AATGATA-----------G-------AG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTACTCA-AAATCTCC
gi|101873                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TC-----------A-ATTA-----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---TTCAA-TTA-----------------GTTGTCA-AAATCCCC
gi|101877                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCAT------------TTA-----------------------G--TAGTC----AATATC----CC---CTTAT-TTA-----------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101876                     :                                  GTAGTCAATA-TCCC-----C-----TCAT------------TTA-----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---CTTAT-TTA-----------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101827                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TTGA---T-------------------------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CATGA-T
gi|101853                     :                                 gGTAGTCAAAA-TACCGAT--CA----TCGT---C---AAA-AT-AGAG-----------A-------AG--TAGTC----AAAATC----TC---CTC--------AA-T--T-GG-A-G----GTCA-AAATCCCC
gi|101899                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TC-----------A-ATTA-----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---C
gi|101834                     :         aaatccccatggtaaaaatgacaggGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TTGA---T---GGGTAGTCAAA-----------A-------TC--CGCTC----AAAATC----CC---CATGG-TCAA-AA-T--
gi|101868                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TTAT------------TTA-----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---CTCAA-TTA-----------------GTAGTCA-AAATCCCcccc
gi|101872                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TTAT------------TTA-----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---CTCAT-TTA-----------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101835                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TTGA---T-------------------------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---
gi|101857                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----ATGG---T---AAA-ACTGACC-----------A-------GA--TAGTC----AAAATC----CC---CTTaatgat
gi|101825                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----ATGG---C---AAT-ATTGCTA-----------G-------TG--TAGTC----AAAATT----CC---CTTGA-T-----------------GGGTACTCA-AAATCcttagnnnnnnnnnnaaatcccc
gi|101849                     :                                 gGCAGTCAAAA-TCCA-----C-----ATGG---C---AAA-AATGATG-----------G-------TG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGGAATCA-AAATCCCC
gi|101866                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCTC-----C-----ATGG---CA--AAA-AATGACA-----------G-------GG--TAGTC----AATATC----CC---CTC-----------------A-A-GGGAAGTGA-TAATCCCC
gi|101874                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TT-------------ATTAA----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---CTC-A-TTAA----------------GTAGTCA-ATATCTCC
gi|101870                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TTAT------------TTA-----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---CTCAA-TTA-----------------GTTGTCA-AAATCCCC
gi|101833                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TT-----------G-ATC-----------------------GG--TACTC----AAAATC----CC---CATGA-T
gi|101858                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----CA----TC--------------TT---------------A-------GG--TAGTA----AAAATC----CC---CTT---TT------T--A-GG-A-----AGTCA-AAATCCCCgggtgg
gi|101861                     :                                 gGTAGT--GAA-TTCC-----C-----TCAA---T---GG-----------------------------G--TGGTC----AAAATC----CC---CTT--------AA-T--T-GA------TGGTCA-AAATCCCC
gi|101855                     :                                 gGTAATCGAAA-TCCC-----C-----ATGG---T---AAA-ACTGACC-----------A-------GA--TAGTC----AAAATC----CC---CTT--------AA-T--A-------GGTGGTCATAAGTCCC
gi|101883                     :                                 gGTACTCAAAA-TCAC-----C--------A---T---GG---CTAAAATGTTA------G-------GG--TATTC----AAAATC----CC---CATGGTTCAA-AA-T--
gi|101864                     :                                  GTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TTGA---T-------------------------G-------GG--TACTC----AAAATC----TC---CATGA-Tcccc
gi|101856                     :                                  GTAGTCGATA-TCCC-----C-----ATGG---T---AAA-ACTGACC-----------A-------GT--TAGTC----AAAATC----CC---CTT-C-TTA----------------GGTAATCG-AAATCCCCgggtgg
gi|101879                     :                                 gGTAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCAT------------TTA-----------------------G--TAGTC----GAAATC----CC---C
gi|101880                     :            gtagtcaatatccccttatttaGCAGTCAAAA-TCC------------TCA--------------TGACA-----------A-------G---TAGTC----AAAATC----CC---CTT
gi|101885                     :                                   TGGTCAAAA-TCCC-----C-----TTGG---CTC-AAA-AATGACA-----------A-------AG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCAA--CAG-AATT--A-AA-A-AGGTGGTCA-AAATCCCCcatgggtaattataat
gi|101888                     :                                   TGGTCAAAA-TCCC-----C--------A---T---GG---TTAAAA-----------AATGTCAAGG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCGA--CAG-AA-TTAA-GA-A--GGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                   TGGTCGAAA-TCCC-----C-----ATGA---CTCAAAA-ATTACAT-------------------GG--TAGTC----AAAATC----CC---TTCAA--CAG-AATT--A-AC-A-GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101886                     :                                   TGGTCGAAA-TCCC-----CATGGCTCAA---------A-AATGACA-----------A-------GG--AAGTC----AAAATC----CC---CTCGA-TAGA-AT-T--A-AA-A-AGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101884                     :                                   TGGTCAAAA-TCCCATTGGC-----TCAA---------A-AATGACA-----------T-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCGA--CAG-AA-T--A-AACA-GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101889                     :                                   TAGTCGAAA-TCCC-----CATGGCTCAA---C---AA----TGACA-----------T-------GG--TAGTG----AAAATC----CC---CTCGA--CAG-AATT--A-AC-A-GAGTGGTCA-AAATTCCC
gi|101890                     :                                   TGGTCAAAA-TCCC-----CATGGCTCAA---------A-AATGACA-----------A-------GG--TAGCC----AAAATC----CC---CTT
gi|101831                     :                                    AGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---T---AGA-ATTAAAA-----------A-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CTTGG-TCAA-AA-T--A-GA-G-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101891                     :                                 ggaAGTCAAAA-TCCC-----C-----TCAC---CCTGAAA-AT-GATA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCAA-CCAA-AA-T--G-TT-A-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101892                     :                                    AGTCAAAA-TCCC-----C-----TCAC---C--------CTGAAA-----------ATGGCAT-AG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCAA-CCAA-AA-T--G-AT-A-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101886                     :                                    AGTCAAAA-TCCC-----C-----TCGA---T---AGA-ATTAAAA-----------A-------GG--TGGTC----AAAATC----CC---C
gi|101854                     : tggtcgaaatccccatggctcaaaaatgacaaggaAGTCAAAA-TCCC-----C-----ATGG---C---AAA-ACTGACC-----------A-------GA--TGGTC----AAAATC----CC---CTT-C-TTA----------------GGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101894                     :                                   ggaTCAAAA-TCCC-----CATGGCTCAA---------A-ATTGACA-----------A-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCGA-TAGA-AT-T--A-AA-A-AGGTGGTCA-ACATCCCC
gi|101895                     :                                      TCAAAA-TCCC-----CATGGCTCAA---------A-AATGACA-----------T-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---ATCGA--CAG-AATT--A-AC-A-GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101896                     :                                      TCAAAA-TCCC-----CATGGCTCAA---------A-AATGACA-----------T-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA--CAG-AATT--A-AC-A-GGGTGGTCA-CAATCCCC
gi|101893                     :                                      TCAAAA-TCCC-----CATGGTTCAA---------A-AATGACA-----------T-------GG--TAGTC----AAAATA----CC---CTCGA-T-AG-AA-T--A-AATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101898                     :                                      TCAAAA-TCCC-----C-----TCTA---C---AGA-ATTAACA-----------G-------TT--TGACC----AAAATC----CC---CTT--------AA-T---------GGGCAGTCA-AAA
gi|101897                     :                                      TCAAAA-TCCC-----C-----ATGA---C--------TCAAAA-----------AT------GGCCTAGTCGTCAAAAATC----CC---CTTGA-CCGATAA-T--A-G-----GGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                       CAAAA-TCCC-----C-----TCAA------------TTA-----------------------G--TAGTC----AAAATC----CC---CTTAT-TTA-----------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101899                     :       gtagtcaaaatccccttatttagtnnnnnnnnnnAAA-TCCC-----C-----ATGG---T---AAA-AATGACA-----------G-------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCAA-TTA-----------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101900                     :                                         AAA-TCCC-----C-----ATGG---T---AAA-ACTGACC-----------A-------GA--TAGTC----AAAATC----CC---CTT-C-TTA----------------GGTAGTCG-ATATCCCC
gi|101823                     :                                                                                              -------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CTTGG-TCAA-AA-T--A-GA-A-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101828                     :                                                                                              -------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CTTGG-TCAA-AA-T--A-GA-G-GGGTAGTCA-AAATCCCCttgatgggtagtcaaaatcccc
gi|101829                     :                                                                                              -------GG--TGGTC----AACATC----CC---CTTGT-TTAA-AA-T--A-GA-G-GGGTAGTCA-AAATCCCCttgatgggtagtcaaaatcc
gi|101848                     :                                                                                              -------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CTTGG-TCAA-CA-T--A-GA-G-GGGTAGTCA-AAATttgatgggtagtcaaaatccc
gi|101860                     :                                                                                              -------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CAAGG-TCAA-AA-C--A-GA-G-GGGTATTCA-AAATCCCCgctcttgatgggtattcaaaatcccc
gi|101839                     :                                                                                              -------GG--TATTC----AAAATC----CC---CTCGA-CCAA-AA-T--G-AT-A-GGGTAGTCA-AAATCCCCtcaatgggaagtaaacatctcc
gi|101842                     :                                                                                              -------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTCGA-CCAA-AT-T--G-TT-A-GGGTAGTCA-AAATCCCCttgatgggtattcataattc
gi|101851                     :                                                                                              -------GG--TGGTC----AAAATC----CC--------------AA-T--A-GA-G-GGGTAGTCA-AAATCCCCtcaatagg
gi|101826                     :                                                                                              -------GG--TGGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTAGTCA-AAATCCCCtcaatgggtagtcaaaatacc
gi|101827                     :                                                                                              -------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTAGTCA-AAATCCCCatggcaatattgctagtgtagtcaaaattccc
gi|101853                     :                                                                                              -------GG--TAGTC----AAAATA----CCGATCATCG-TCAA-AA-T--A-GA-G-AAGTAGTCA-AAATCTCCatgat
gi|101834                     :                                                                                              -------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTAGTCA-AAATCCtcaattggaggtcaaaatcccc
gi|101835                     :                                                                                              -------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTAGTCA-AAATCCCgctcaaaatccccatggtcaaaatcccc
gi|101857                     :                                                                                              -------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CATGG-T-AA-AA-C--T-GACC-AGATAGTCA-AAATCCCCaatgat
gi|101833                     :                                                                                              -------GG--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-TC-----------------GGTACTCA-AAATCCCCttcttagnnnnnnnnnnaaatcccc
gi|101866                     :                                                                                                      G--TAGTC----AAAATC----TC---CATGG--CAA-AA-A--ATGACA-GGGTAGTCA-ATATCCCCatgatgggtgg
gi|101864                     :                                                                                                      G--TAGTC----AAAATC----CC---CTTGA-T-----------------GGGTACTCA-AAATCTCCtcaagggaagtgataatcccc
gi|101879                     :                                                                                                      G--TAGTC----AATATC----CC---CTTAT-TTA-----------------GTAGTCA-AAATCCCCatgatgggtgg
gi|101890                     :                                                                                                       --TGGTC----AAAATC----CC---CATGGCTCAA-AA-A--T-GACA-AGGTAGCCA-AAATCCCCtcatttagtagtcgaaatcccc
gi|101880                     :                                                                                                           GTC----AAAATC----CT---CATGA--CAA----------------GTAGTCA-AAATCCCCtt
gi|101883                     :                                                                                                         gcaTC----AAAATC----AC---CATGG-CTAA-AA-T--G-TT-A-GGGTATTCA-AAATCCCCttcatgggtaattataat
gi|101899                     :                                                                                                               gtacAAATC----CC---CATGG-TAAA-AA-T--G-AC-A-GGGTAGTCA-AAATCCCCatggttcaaaatcccc
gi|101900                     :                                                                                                                   AAATC----CC---CATGG-T-AA-AA-C--T-GA-CCAGATAGTCA-AAATCCCCtcaattagtagtcaaaatcccc





Alignments
lowQualScore                  :                                                      1111111111111111111      11111111111111111                   77777777777777777                  
lowQualScore                  :                                             0    000 7777777777777777777  22  11111111111111111 0          0      66666666666666666         0        
lowQualScore                  :                                             .    ... ...................  ..  ................. .          .      .................         .        
lowQualScore                  :                                             5    999 9999999999999999999  99  11111111111111111 5          5      33333333333333333         5        
consensus                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCGATCA--A-AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
Reference ( family-377 )      :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCGATCAA-A-AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101823                     :                                   GTGGTCAAAA-TCCC---C-----TT--GGT-C---AAAA--TA--GAA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101824                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---AGAAT-AA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101825                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----AT--GG--C---AATAT-TG--CTA-----------GT-GTAGTCAAAA-TTCCCTTG--------AT-----GGGTACTCA-AAATC
gi|101826                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TT--GA--T---------------------------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCATGG-CAA-T-ATTGCTAGTGTAGTCA-AAATTCCC
gi|101827                     :                                                                                               gG-GTAGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101828                     :                                   GTGGTCAAAA-TCCC---C-----TT--GGT-C---AAAA--TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCatgat
gi|101829                     :                                  gGTGGTCAACA-TCCC---C-----TT--GT--T---TAAAA-TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101830                     :                                  gGTAGTCAAAA-TACC---C-----TC--GA--T---AGAAT-AA--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTTGATC-------------GGTACTCA-AAATCCCC
gi|101831                     :                                    gAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCCTTGGTCAA-A-ATAGAG-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101832                     :                                ggaGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAACA-TCCCCTTGTTTAA-A-ATAGAG-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101833                     :                                                                                               gG-GTAGTCAAAA-TCCCCTTGATC-------------GGTACTCA-AAATCCCC
gi|101834                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT--GA--T---------------------------GG-GTAGTCAAAA-TC----CGCTCAA-A-ATCC---CCATGGTCA-AAATCCCCatgatgggtgg
gi|101835                     :                                                                                               gG-GTAGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101836                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---A-----TC--GA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTAGTCA-AAATCTCCaatgat
gi|101837                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCTC---C-----AT--AG--C---AAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TTCCCTTG--------AT-----GGGTATTCA-AAAT
gi|101838                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---CAAAA-TA--ATA-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCCTCGACCAA-A-ATGATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101839                     :                                  gGTATTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---CAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTATTCA-TAATTC
gi|101840                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---CAAAA-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCGACCAA-A-TTGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101841                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--AA--C---CAAAA-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCGACCAA-A-ATGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101842                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---CAAAT-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCAAT
gi|101843                     :                                  gGTAGTTAATA-TCCC---C-----AT--GG--C---AAAAA-TG--ATA-----------GA-GTAGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTACTCA-AAATCTCCagg
gi|101844                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---T-----TC--AA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCTTG--------GT-----GGGTAGTTA-ATATCCCC
gi|101845                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT--GA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCACAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTACTCA-AAA
gi|101846                     :                                  gGTAATCATAA-ACCC---C-----TA--GA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCACAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTAGTTG-AAATCTCC
gi|101847                     :                                  gGTAGTGAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GA-GTGGTCAAAA-TTCCCTTG--------AT-----GGGCAGTCA-AAATCC
gi|101848                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TT--G----------GT-CA--ACATAGAG------GG-GTAGTCAAAA-TGCTCTTG--------AT-----GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101849                     :                                  gGCAGTCAAAA-TCCA---C-----AT--GG--C---AAAAA-TG--ATG-----------GT-GTAGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGGAATCA-AAATCCCC
gi|101850                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---AGAAT-TA--AGA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCCTTGGTCAA-C-ATAGAG-GGGTAGTCA-AAAT
gi|101851                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC-------------AA--T---AGAG--------------------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-------A-AT-----GGGTAGTCA-AAATACC
gi|101852                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC------------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTT-ATTAA------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101853                     :                                  gGTAGTCAAAA-TACCGATCA----TC--GT--C---AAAAT-----AGA-----------GAAGTAGTCAAAA-TCTCCTC-------A-AT-----TGGAGGTCA-AAATCCCC
gi|101854                     :                                    gAGTCAAAA-TCCC---C-----AT--GG--C---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATGGTCAAAA-TCCCCT---TC-----TT-----AGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101855                     :                                ggaGTAATCGAAA-TCCC---C-----AT--GG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCCTT-------A-AT-----AGGTGGTCATAAGTCCC
gi|101856                     :                                  gGTAGTCGATA-TCCC---C-----AT--GG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-TTAGTCAAAA-TCCCCT---TC-----TT-----AGGTAATCG-AAATCCCC
gi|101857                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----AT--GG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCCT---TCTT-A-GN-----NNNNNNNNN-AAATCCCC
gi|101858                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---CA----TC--------------T-TA-----------------G-GTAGTAAAAA-TCCCCTT--TT------T-----AGGAAGTCA-AAATCCCC
gi|101859                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---AGAAT-TA--ATA-----------GG-GTGATCAAAA-TCCCTTCCCTTTT-ATAT-----G--CAGTCA-AAATCCTC
gi|101860                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---CAAGG-TCAAAA--C---AGA---------G-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCCTC-------A-AT-----GGGAAGTAA-ACATCTCC
gi|101861                     :                                  gGTAGT--GAA-TTCC---C-----TC------------AAT-------------------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCTT-------A-AT-----TGATGGTCA-AAATCCCC
gi|101862                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--AA--C---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCCTTGGTCAA-A-ATAGAA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101863                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--AA--C---CAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCGACCAA-A-ATAATA-GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101864                     :                                                                                                 -GTAGTCAAAA-TCCCCTTG--------AT-----GGGTACTCA-AAATCTCC
gi|101865                     :                                   GTAGTTAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---AGAAT-TA--AAA-----------GG-ATGGTC-AAA-TTTCCTTGAT-AA------------GTAGTCA-AAATCTCCatgatgggtgg
gi|101866                     :                                   GTAGTCAAAA-TCTC---C-----AT--GG--C---AAAAAATG--ACA-----------GG-GTAGTCAATA-TCCCCTCAA--------------GGGAAGTGA-TAATCCCC
gi|101867                     :                                   GTTGTCAAAT-TCCC---C-----TC--GA--C---ATAAT-TA--TCA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCC---CAAT--A-G-AG-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101868                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT------------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTCAATTA-------------GTAGTCA-AAATCCC
gi|101869                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-------------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCCTCAATTA-------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101870                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT------------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTCAATTA-------------GTTGTCA-AAATCCCC
gi|101871                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-------------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCCTTATTTA-------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101872                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT------------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTCATTTA-------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101873                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC------------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCTTCAATTA-------------GTTGTCA-AAATCCCC
gi|101874                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT-------------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCCTC-ATTAA------------GTAGTCA-ATATCTCC
gi|101875                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC------------AAT-TA-------------------GTTGTCAAAA-TCCCCTTATTTA-------------GTAGTCA-ATATCCCC
gi|101876                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-------------AT-TT--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCCTTATTTA-------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101877                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC------------ATT-TA-------------------GTAGTCAATA-TCCCCTTATTTA-------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT------------ATT-TAGTNNN-----------NN-NNNNNCAAAA-TCCCCTCAATTA-------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                        CAAAA-TCCC---C-----TC------------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTTATTTA-------------GTAGTCA-AAATCCCCttatttagtagtcaaaatcccc
gi|101879                     : gtagtcaaaatccccttatttagtnnnnnnnnnnGTAGTCAATA-TCCC---C-----TT------------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTCATTTA-------------GTAGTCG-AAATCCCC
gi|101880                     :                                   GCAGTCAAAA-TCCT---C-----AT--GA--C---AA-------------------------GTAGTCAAAA-TCCCCT---TC-----AT-----GGGTAATTA-TAAT
gi|101881                     :                                   GTCGTCAAAAATCCC---C-----TT--GA--C---CGA---TA--ATA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCAAGGTCAA-A-ACAGAG-GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101882                     :                                   GTGATCAAAA-TCCC---C-----TC--AA--C---AGAAT-TA--ACACTCACTCACCTGG-GTAGT--GAA-TTCCCTC-------A-AT-----GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101883                     :                                   GTACTCAAAA-TCAC---C-----AT--GG--C---TAAAA-TG--TTA-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC---AT--------------GGT--TCA-AAATCCCC
gi|101884                     :                                    TGGTCAAAA-TCCC---A-----TT--GG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCGA-CAG-A-ATAAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101885                     :                                    TGGTCAAAA-TCCC---C-----TT--GG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AA-GTAGTCAAAA-TCCCCTCAA-CAG-A-ATTAAAAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101886                     :                                    TGGTCGAAA-TCCC---C-----AT--GG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AG-GAAGTCAAAA-TCCCCTCGAT-AG-A-ATTAAAAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                    TGGTCGAAA-TCCC---C-----AT--GA--CTCAAAAAT-TA---CA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCTTCAA-CAG-A-ATTAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---T-----TC--AA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC
gi|101888                     :   tggtcgaaatccccatgactcaaaaattacatgTGGTCAAAA-TCCC---C-----AT--GG--TTA-AAAAA-TG--TCA-----------AG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCGA-CAG-A-ATTAAGAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101888                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---AGAAT-TA--AGA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC
gi|101889                     :   tggtcaaaatccccatggttaaaaaatgtcaagTAGTCGAAA-TCCC---CATGGCTC--AA--C---AA----TG--ACA-----------TG-GTAGTGAAAA-TCCCCTCGA-CAG-A-ATTAACAGAGTGGTCA-AAATTCCC
gi|101889                     :                                   GTAGTGAAAA-TCCC---C-----TC--GA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GA-GTGGTCAAAA-TTCCC
gi|101890                     :   tagtcgaaatccccatggctcaacaatgacatgTGGTCAAAA-TCCC---C-----AT--GG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AG-GTAGCCAAAA-TCCCCT
gi|101891                     :                                     AGTCAAAA-TCCC---C-----TC--AC--CCTGAAAAT--G--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCAACCAA-A-ATGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCCt
gi|101892                     :                                     AGTCAAAA-TCCC---C-----TC--AC--CCTGAAAAT--G--GCA-----------TA-GTAGTCAAAA-TCCCCTCAACCAA-A-ATGATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101893                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----AT--GGTTC---AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TACCCTCGAT-AG-A-ATAAATAGGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101894                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----AT--GG--CTC-AAAAT-TG--ACA-----------AG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCGAT-AG-A-ATTAAAAAGGTGGTCA-ACATCCCC
gi|101895                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----AT--GG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCATCGA-CAG-A-ATTAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101895                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---A-----TC--GA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC
gi|101896                     :         tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgTCAAAA-TCCC---C-----AT--GG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCCTTGA-CAG-A-ATTAACAGGGTGGTCA-CAATCCCC
gi|101896                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT--GA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCACAA-TCCCC
gi|101897                     :         tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgTCAAAA-TCCC---C-----AT--GA--CTC-AAAAA-TG--GCC-----------TA-GTCGTCAAAAATCCCCTTGACCGATA-ATA----GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101898                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----TC--TA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GT-TTGACCAAAA-TCCCCTT-------A-AT-----GGGCAGTCA-AAA
gi|101899                     :                                          AAA-TCCC---C-----AT--GG--T---AAAAA-TG--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTCAATTA-------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101900                     :                                          AAA-TCCC---C-----AT--GG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCCT---TC-----TT-----AGGTAGTCG-ATATCCCC





Alignments
lowQualScore                  :                                                             111111111111111111111111111111111                   77777777777777777777777777777                  
lowQualScore                  :                                             0    000 22222  666666666666666666666666666666666 0          0      33333333333333333333333333333         0        
lowQualScore                  :                                             .    ... .....  ................................. .          .      .............................         .        
lowQualScore                  :                                             5    999 22222  555555555555555555555555555555555 5          5      00000000000000000000000000000         5        
consensus                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----GAT------AA-----AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
Reference ( family-377 )      :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----GAT----C-AA-----AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101823                     :                                   GTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AAAA--TA--GAA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101824                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-AA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101825                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--C---AATAT-TG--CTA-----------GT-GTAGTCAAAA-TTCCCTT-----G---------------AT-----GGGTACTCA-AAATC
gi|101826                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCAT-----GG-----C-AAT----ATTGCTAGTGTAGTCA-AAATTCCC
gi|101827                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101828                     :                                   GTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AAAA--TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCatgat
gi|101829                     :                                  gGTGGTCAACA-TCCC---C-----TTGT--T---TAAAA-TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101830                     :                                  gGTAGTCAAAA-TACC---C-----TCGA--T---AGAAT-AA--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----GAT----C----------------GGTACTCA-AAATCCCC
gi|101831                     :                                    gAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCCTT-----GGT----CAAA-----ATAGAG-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101832                     :                                ggaGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAACA-TCCCCTT-----GTT----TAAA-----ATAGAG-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101833                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----GAT----C----------------GGTACTCA-AAATCCCC
gi|101833                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T--------------C-------------G-GTACTCAAAA-TCCCC--------AT-------G-----AT-----GGGTGGatgatgggtgg
gi|101834                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTAGTCAAAA-TCCGCTC-----AA-------AATCCCCAT-----G----GTCA-AAATCCCC
gi|101835                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101836                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---A-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCTCCaatgat
gi|101837                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCTC---C-----ATAG--C---AAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TTCCCTT-----G---------------AT-----GGGTATTCA-AAAT
gi|101838                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TA--ATA-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCCTC-----GAC----CAAA-----ATGATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101839                     :                                  gGTATTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTATTCA-TAATTC
gi|101840                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----GAC----C-AA-----ATTGTTAGGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101841                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---CAAAA-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----GAC----CAAA-----ATGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101842                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAT-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----AAT----
gi|101843                     :                                  gGTAGTTAATA-TCCC---C-----ATGG--C---AAAAA-TG--ATA-----------GA-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTACTCA-AAATCTCCagg
gi|101844                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---T-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------GT-----GGGTAGTTA-ATATCCCC
gi|101845                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCACAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTACTCA-AAA
gi|101846                     :                                  gGTAATCATAA-ACCC---C-----TAGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCACAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTAGTTG-AAATCTCC
gi|101847                     :                                  gGTAGTGAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GA-GTGGTCAAAA-TTCCCTT-----G---------------AT-----GGGCAGTCA-AAATCC
gi|101848                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AACA--TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TGCTCTT-----G---------------AT-----GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101849                     :                                  gGCAGTCAAAA-TCCA---C-----ATGG--C---AAAAA-TG--ATG-----------GT-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGGAATCA-AAATCCCC
gi|101850                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AGA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCCTT-----GGT----C-AAC----ATAGAG-GGGTAGTCA-AAAT
gi|101851                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---------------------AAT--A--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC---------------A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATACC
gi|101852                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTT------AT----T-AA--------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101853                     :                                  gGTAGTCAAAA-TACCGATCA----TCGT--C---AAAAT-----AGA-----------GAAGTAGTCAAAA-TCTCCTC---------------A-----AT-----TGGAGGTCA-AAATCCCC
gi|101854                     :                                    gAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--C---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATGGTCAAAA-TCCCCT--------T----C--------TT-----AGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101855                     :                                ggaGTAATCGAAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCCTT---------------A-----AT-----AGGTGGTCATAAGTCCC
gi|101856                     :                                  gGTAGTCGATA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-TTAGTCAAAA-TCCCCT--------T----C--------TT-----AGGTAATCG-AAATCCCC
gi|101857                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCCT--------T----CTTA-----GN-----NNNNNNNNN-AAATCCCC
gi|101858                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---CA----TC------------T-TA-----------------G-GTAGTAAAAA-TCCCCTT-------T----T---------T-----AGGAAGTCA-AAATCCCC
gi|101859                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ATA-----------GG-GTGATCAAAA-TCCCTTC-----CCT----T-TT-----AT-----ATGCAGTCA-AAATCCTC
gi|101860                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----AAGGT-C---AAAA--CA--GAG-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCCTC---------------A-----AT-----GGGAAGTAA-ACATCTCC
gi|101861                     :                                  gGTAGT--GAA-TTCC---C-----TC----------AAT-------------------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCTT---------------A-----AT-----TGATGGTCA-AAATCCCC
gi|101862                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCCTT-----GGT----CAAA-----ATAGAA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101863                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---CAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----GAC----CAAA-----ATAATA-GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101864                     :                                                                                               -GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----G---------------AT-----GGGTACTCA-AAATCTCC
gi|101864                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTACTCAAAA-TCTCC--------AT-------G-----AT-----GGGTGGatgatgggtgg
gi|101865                     :                                   GTAGTTAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AAA-----------GG-ATGGTC-AAA-TTTCCTT-----GAT------AA--------------GTAGTCA-AAATCTCC
gi|101866                     :                                   GTAGTCAAAA-TCTC---C-----ATGG--C---AAAAAATG--ACA-----------GG-GTAGTCAATA-TCCCCTC-----AA---------------------GGGAAGTGA-TAATCCCC
gi|101867                     :                                   GTTGTCAAAT-TCCC---C-----TCGA--C---ATAAT-TA--TCA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCC---C-----AAT------AG-----AG-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101868                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----AAT----T-A---------------GTAGTCA-AAATCCC
gi|101869                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----AAT----T-A---------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101870                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----AAT----T-A---------------GTTGTCA-AAATCCCC
gi|101871                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----ATT----T-A---------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101872                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----ATT----T-A---------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101873                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCTTC-----AAT----T-A---------------GTTGTCA-AAATCCCC
gi|101874                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCCTC------AT----T-AA--------------GTAGTCA-ATATCTCC
gi|101875                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTTGTCAAAA-TCCCCTT-----ATT----T-A---------------GTAGTCA-ATATCCCC
gi|101876                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TT--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----ATT----T-A---------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101877                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------ATT-TA-------------------GTAGTCAATA-TCCCCTT-----ATT----T-A---------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TAGTNNN-----------NN-NNNNNCAAAA-TCCCCTC-----AAT----T-A---------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                        CAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----ATT----T-A---------------GTAGTCA-AAATCCCCttatttagtagtcaaaatcccc
gi|101879                     : gtagtcaaaatccccttatttagtnnnnnnnnnnGTAGTCAATA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----ATT----T-A---------------GTAGTCG-AAATCCCC
gi|101880                     :                                   GCAGTCAAAA-TCCT---C-----ATGA--C---AA-------------------------GTAGTCAAAA-TCCCCT--------T----C--------AT-----GGGTAATTA-TAAT
gi|101881                     :                                   GTCGTCAAAAATCCC---C-----TTGA--C---CGA---TA--ATA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCAA-----GGT----C-AAAACAGAG-----GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101882                     :                                   GTGATCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACACTCACTCACCTGG-GTAGT--GAA-TTCCCTC---------------A-----AT-----GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101883                     :                                   GTACTCAAAA-TCAC---C-----ATGG--C---TAAAA-TG--TTA-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC--------AT---------------------GGT--TCA-AAATCCCC
gi|101884                     :                                    TGGTCAAAA-TCCC---A-----TTGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----GAC----A-GA-----ATAAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101885                     :                                    TGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AA-GTAGTCAAAA-TCCCCTCAACAGAAT----T-AA-----AA-----AGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101886                     :                                    TGGTCGAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AG-GAAGTCAAAA-TCCCCTC-----GAT----A-GA-----ATTAAAAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                    TGGTCGAAA-TCCC---C-----ATGA--CTCAAAAAT-TA---CA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCTTC-----AAC----A-GA-----ATTAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---T-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC
gi|101888                     :   tggtcgaaatccccatgactcaaaaattacatgTGGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--TTA-AAAAA-TG--TCA-----------AG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----GAC----A-GA-----ATTAAGAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101888                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AGA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC
gi|101889                     :   tggtcaaaatccccatggttaaaaaatgtcaagTAGTCGAAA-TCCC---CATGGCTCAA--C---AA----TG--ACA-----------TG-GTAGTGAAAA-TCCCCTC-----GAC----A-GA-----ATTAACAGAGTGGTCA-AAATTCCC
gi|101889                     :                                   GTAGTGAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GA-GTGGTCAAAA-TTCCC
gi|101890                     :   tagtcgaaatccccatggctcaacaatgacatgTGGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AG-GTAGCCAAAA-TCCCCT
gi|101891                     :                                     AGTCAAAA-TCCC---C-----TCAC--CCTGAAAAT--G--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----AAC----CAAA-----ATGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCCt
gi|101892                     :                                     AGTCAAAA-TCCC---C-----TCAC--CCTGAAAAT--G--GCA-----------TA-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----AAC----CAAA-----ATGATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101893                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGGTTC---AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TACCCTC-----GATAGAAT-AA-----ATA----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101894                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAT-TG--ACA-----------AG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----GAT----A-GA-----ATTAAAAAGGTGGTCA-ACATCCCC
gi|101895                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCATC-----GAC----A-GA-----ATTAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101895                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---A-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC
gi|101896                     :         tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCCTT-----GAC----A-GA-----ATTAACAGGGTGGTCA-CAATCCCC
gi|101896                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCACAA-TCCCC
gi|101897                     :         tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgTCAAAA-TCCC---C-----ATGA--CTC-AAAAA-TG--GCC-----------TA-GTCGTCAAAAATCCCCTT-----GAC----C-GATA---ATA----GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101898                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----TCTA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GT-TTGACCAAAA-TCCCCTT---------------A-----AT-----GGGCAGTCA-AAA
gi|101899                     :                                          AAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAA-TG--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCCTC-----AAT----T-A---------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101900                     :                                          AAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCCT--------T----C--------TT-----AGGTAGTCG-ATATCCCC





Alignments
lowQualScore                  :                                                             111111111111111111111111111111111                            6666666666666666666666666666666666                  
lowQualScore                  :                                             0    000 22222  666666666666666666666666666666666 0          0     1111 1111 7777777777777777777777777777777777         0        
lowQualScore                  :                                             .    ... .....  ................................. .          .     .... .... ..................................         .        
lowQualScore                  :                                             5    999 22222  555555555555555555555555555555555 5          5     9999 0000 1111111111111111111111111111111111         5        
consensus                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--A-A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
Reference ( family-377 )      :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--A-A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101823                     :                                   GTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AAAA--TA--GAA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101824                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-AA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101825                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--C---AATAT-TG--CTA-----------GT-GTAGTCAAAA-TTCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAATC
gi|101826                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----A----T--G------G------C--A-AT----ATTGCTAGTGTAGTCA-AAATTCCC
gi|101827                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101828                     :                                   GTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AAAA--TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCatgat
gi|101829                     :                                  gGTGGTCAACA-TCCC---C-----TTGT--T---TAAAA-TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101830                     :                                  gGTAGTCAAAA-TACC---C-----TCGA--T---AGAAT-AA--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----CGGTACTCA-AAATCCCC
gi|101831                     :                                    gAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------G------TCAA-A-----ATAGAG-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101832                     :                                ggaGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAACA-TCCCC----T----T--GTTTAAAA------T--A-G-----AG-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101833                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----CGGTACTCA-AAATCCCC
gi|101833                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T--------------C-------------G-GTACTCAAAA-TCCCC----A----T--G------A------T--G-G-----GT-----GGatgatgggtgg
gi|101834                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTAGTCAAAA-TCCGC----T----C--A------A---------A-ATCCCCAT-----G----GTCA-AAATCCCC
gi|101835                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101836                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---A-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCTCCaatgat
gi|101837                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCTC---C-----ATAG--C---AAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TTCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTATTCA-AAAT
gi|101838                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TA--ATA-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------CCAA-A-----ATGATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101839                     :                                  gGTATTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTATTCA-TAATTC
gi|101840                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------AC-----C--A-A-----ATTGTTAGGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101841                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---CAAAA-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------CCAA-A-----ATGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101842                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAT-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------A------T--A-
gi|101843                     :                                  gGTAGTTAATA-TCCC---C-----ATGG--C---AAAAA-TG--ATA-----------GA-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAATCTCCgg
gi|101844                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---T-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------GT-----GGGTAGTTA-ATATCCCC
gi|101845                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCACAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAA
gi|101846                     :                                  gGTAATCATAA-ACCC---C-----TAGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCACAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTTG-AAATCTCC
gi|101847                     :                                  gGTAGTGAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GA-GTGGTCAAAA-TTCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGCAGTCA-AAATCC
gi|101848                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AACA--TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TGCTC----T----T--G------------------------AT-----GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101849                     :                                  gGCAGTCAAAA-TCCA---C-----ATGG--C---AAAAA-TG--ATG-----------GT-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGGAATCA-AAATCCCC
gi|101850                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AGA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--GGTCAACA------T--A-G-----AG-----GGGTAGTCA-AAAT
gi|101851                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---------------------AAT--A--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATACC
gi|101852                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--A------T------T--A-A--------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101853                     :                                  gGTAGTCAAAA-TACCGATCA----TCGT--C---AAAAT-----AGA-----------GAAGTAGTCAAAA-TCTCC----T----C---------------------A-----AT-----TGGAGGTCA-AAATCCCC
gi|101854                     :                                    gAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--C---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATGGTCAAAA-TCCCC----T----T--C------T------T--A---------------GGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101855                     :                                ggaGTAATCGAAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------------------A-----AT-----AGGTGGTCATAAGTCCC
gi|101856                     :                                  gGTAGTCGATA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-TTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--C------T------T--A---------------GGTAATCG-AAATCCCC
gi|101857                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCCT---T----C----------------T--T-A-----GN-----NNNNNNNNN-AAATCCCC
gi|101858                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---CA----TC------------T-TA-----------------G-GTAGTAAAAA-TCCCC----T----T--T------T------T--A---------------GGAAGTCA-AAATCCCC
gi|101859                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ATA-----------GG-GTGATCAAAA-TCCCT----T----C--C------CTTT---T--A-T-----AT-------GCAGTCA-AAATCCTC
gi|101860                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----AAGGT-C---AAAA--CA--GAG-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----GGGAAGTAA-ACATCTCC
gi|101861                     :                                  gGTAGT--GAA-TTCC---C-----TC----------AAT-------------------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T---------------------A-----AT-----TGATGGTCA-AAATCCCC
gi|101862                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------G------TCAA-A-----ATAGAA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101863                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---CAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------CCAA-A-----ATAATA-GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101864                     :                                                                                               -GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAATCTCC
gi|101864                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTACTCAAAA-TCTCC----A----T--G------A------T--G-G-----GT-----GGatgatgggtgg
gi|101865                     :                                   GTAGTTAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AAA-----------GG-ATGGTC-AAA-TTTCC----T----T--G------A------T--A-A--------------GTAGTCA-AAATCTCC
gi|101866                     :                                   GTAGTCAAAA-TCTC---C-----ATGG--C---AAAAAATG--ACA-----------GG-GTAGTCAATA-TCCCC----T----C--A------A------------------------GGGAAGTGA-TAATCCCC
gi|101867                     :                                   GTTGTCAAAT-TCCC---C-----TCGA--C---ATAAT-TA--TCA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCC-----------C--A------A------T--A-G-----AG-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101868                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCC
gi|101869                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101870                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTTGTCA-AAATCCCC
gi|101871                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101872                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101873                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCT----T----C---------------------A-----AT-----TAGTTGTCA-AAATCCCC
gi|101874                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------T------T--A-A--------------GTAGTCA-ATATCTCC
gi|101875                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTTGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-ATATCCCC
gi|101876                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TT--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101877                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------ATT-TA-------------------GTAGTCAATA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TAGTNNN-----------NN-NNNNNCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                        CAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCCttatttagtagtcaaaatcccc
gi|101879                     : gtagtcaaaatccccttatttagtnnnnnnnnnnGTAGTCAATA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------A------T-----------T-----TAGTAGTCG-AAATCCCC
gi|101880                     :                                   GCAGTCAAAA-TCCT---C-----ATGA--C---AA-------------------------GTAGTCAAAA-TCCCCT---T----C---------------------------AT-----GGGTAATTA-TAAT
gi|101881                     :                                   GTCGTCAAAAATCCC---C-----TTGA--C---CGA---TA--ATA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCAAGGT----CAAA------A------C--A-G-----AG-----GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101882                     :                                   GTGATCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACACTCACTCACCTGG-GTAGT--GAA-TTCCC----T----C---------------------A-----AT-----GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101883                     :                                   GTACTCAAAA-TCAC---C-----ATGG--C---TAAAA-TG--TTA-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC-------------------A------T------------------GGT--TCA-AAATCCCC
gi|101884                     :                                    TGGTCAAAA-TCCC---A-----TTGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------C--AGA-----ATAAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101885                     :                                    TGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AA-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------ACAGAATT--A-A-----AA-----AGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101886                     :                                    TGGTCGAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AG-GAAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--AGA-----ATTAAAAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                    TGGTCGAAA-TCCC---C-----ATGA--CTCAAAAAT-TA---CA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCT----T----C--A------A------C--AGA-----ATTAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---T-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----
gi|101888                     :   tggtcgaaatccccatgactcaaaaattacatgTGGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--TTA-AAAAA-TG--TCA-----------AG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------C--AGA-----ATTAAGAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101888                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AGA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----
gi|101889                     :   tggtcaaaatccccatggttaaaaaatgtcaagTAGTCGAAA-TCCC---CATGGCTCAA--C---AA----TG--ACA-----------TG-GTAGTGAAAA-TCCCC----T----C--G------A------C--AGA-----ATTAACAGAGTGGTCA-AAATTCCC
gi|101889                     :                                   GTAGTGAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GA-GTGGTCAAAA-TTCCC----
gi|101890                     :   tagtcgaaatccccatggctcaacaatgacatgTGGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AG-GTAGCCAAAA-TCCCC----T----
gi|101891                     :                                     AGTCAAAA-TCCC---C-----TCAC--CCTGAAAAT--G--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------A------CCAA-A-----ATGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCCt
gi|101892                     :                                     AGTCAAAA-TCCC---C-----TCAC--CCTGAAAAT--G--GCA-----------TA-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------A------CCAA-A-----ATGATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101893                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGGTTC---AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TACCC----T----C--G------A------T--AGA-----ATAAATAGGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101894                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAT-TG--ACA-----------AG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--AGA-----ATTAAAAAGGTGGTCA-ACATCCCC
gi|101895                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCA----T----C--G------A------C--AGA-----ATTAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101895                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---A-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----
gi|101896                     :         tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------A------C--AGA-----ATTAACAGGGTGGTCA-CAATCCCC
gi|101896                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCACAA-TCCCC----
gi|101897                     :         tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgTCAAAA-TCCC---C-----ATGA--CTC-AAAAA-TG--GCC-----------TA-GTCGTCAAAAATCCCC----TTGACC--G------A------T--A-A-----TA-----GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101898                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----TCTA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GT-TTGACCAAAA-TCCCC----T----T---------------------A-----AT-----GGGCAGTCA-AAA
gi|101899                     :                                          AAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAA-TG--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101900                     :                                          AAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCC----T----T--C------T------T--A---------------GGTAGTCG-ATATCCCC





Alignments
lowQualScore                  :                                                             111111111111111111111111111111111                            6666666666666666666666666666666666                  
lowQualScore                  :                                             0    000 22222  666666666666666666666666666666666 0          0     1111 1111 7777777777777777777777777777777777         0        
lowQualScore                  :                                             .    ... .....  ................................. .          .     .... .... ..................................         .        
lowQualScore                  :                                             5    999 22222  555555555555555555555555555555555 5          5     9999 0000 1111111111111111111111111111111111         5        
consensus                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--A-A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
Reference ( family-377 )      :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--A-A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101823                     :                                   GTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AAAA--TA--GAA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101824                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-AA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101825                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--C---AATAT-TG--CTA-----------GT-GTAGTCAAAA-TTCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAATC
gi|101826                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----A----T--G------G------C--A-AT----ATTGCTAGTGTAGTCA-AAATTCCC
gi|101827                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101828                     :                                   GTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AAAA--TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCatgat
gi|101829                     :                                  gGTGGTCAACA-TCCC---C-----TTGT--T---TAAAA-TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101830                     :                                  gGTAGTCAAAA-TACC---C-----TCGA--T---AGAAT-AA--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----CGGTACTCA-AAATCCCC
gi|101831                     :                                    gAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------G------TCAA-A-----ATAGAG-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101832                     :                                ggaGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAACA-TCCCC----T----T--GTTTAAAA------T--A-G-----AG-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101833                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----CGGTACTCA-AAATCCCC
gi|101833                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T--------------C-------------G-GTACTCAAAA-TCCCC----A----T--G------A------T--G-G-----GT-----GGatgatgggtgg
gi|101834                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTAGTCAAAA-TCCGC----T----C--A------A---------A-ATCCCCAT-----G----GTCA-AAATCCCC
gi|101835                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101836                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---A-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCTCCaatgat
gi|101837                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCTC---C-----ATAG--C---AAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TTCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTATTCA-AAAT
gi|101838                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TA--ATA-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------CCAA-A-----ATGATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101839                     :                                  gGTATTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTATTCA-TAATTC
gi|101840                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------AC-----C--A-A-----ATTGTTAGGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101841                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---CAAAA-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------CCAA-A-----ATGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101842                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAT-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------A------T--A-
gi|101843                     :                                  gGTAGTTAATA-TCCC---C-----ATGG--C---AAAAA-TG--ATA-----------GA-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAATCTCCgg
gi|101844                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---T-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------GT-----GGGTAGTTA-ATATCCCC
gi|101845                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCACAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAA
gi|101846                     :                                  gGTAATCATAA-ACCC---C-----TAGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCACAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTTG-AAATCTCC
gi|101847                     :                                  gGTAGTGAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GA-GTGGTCAAAA-TTCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGCAGTCA-AAATCC
gi|101848                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AACA--TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TGCTC----T----T--G------------------------AT-----GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101849                     :                                  gGCAGTCAAAA-TCCA---C-----ATGG--C---AAAAA-TG--ATG-----------GT-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGGAATCA-AAATCCCC
gi|101850                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AGA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--GGTCAACA------T--A-G-----AG-----GGGTAGTCA-AAAT
gi|101851                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---------------------AAT--A--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATACC
gi|101852                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--A------T------T--A-A--------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101853                     :                                  gGTAGTCAAAA-TACCGATCA----TCGT--C---AAAAT-----AGA-----------GAAGTAGTCAAAA-TCTCC----T----C---------------------A-----AT-----TGGAGGTCA-AAATCCCC
gi|101854                     :                                    gAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--C---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATGGTCAAAA-TCCCC----T----T--C------T------T--A---------------GGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101855                     :                                ggaGTAATCGAAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------------------A-----AT-----AGGTGGTCATAAGTCCC
gi|101856                     :                                  gGTAGTCGATA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-TTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--C------T------T--A---------------GGTAATCG-AAATCCCC
gi|101857                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCCT---T----C----------------T--T-A-----GN-----NNNNNNNNN-AAATCCCC
gi|101858                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---CA----TC------------T-TA-----------------G-GTAGTAAAAA-TCCCC----T----T--T------T------T--A---------------GGAAGTCA-AAATCCCC
gi|101859                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ATA-----------GG-GTGATCAAAA-TCCCT----T----C--C------CTTT---T--A-T-----AT-------GCAGTCA-AAATCCTC
gi|101860                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----AAGGT-C---AAAA--CA--GAG-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----GGGAAGTAA-ACATCTCC
gi|101861                     :                                  gGTAGT--GAA-TTCC---C-----TC----------AAT-------------------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T---------------------A-----AT-----TGATGGTCA-AAATCCCC
gi|101862                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------G------TCAA-A-----ATAGAA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101863                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---CAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------CCAA-A-----ATAATA-GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101864                     :                                                                                               -GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAATCTCC
gi|101864                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTACTCAAAA-TCTCC----A----T--G------A------T--G-G-----GT-----GGatgatgggtgg
gi|101865                     :                                   GTAGTTAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AAA-----------GG-ATGGTC-AAA-TTTCC----T----T--G------A------T--A-A--------------GTAGTCA-AAATCTCC
gi|101866                     :                                   GTAGTCAAAA-TCTC---C-----ATGG--C---AAAAAATG--ACA-----------GG-GTAGTCAATA-TCCCC----T----C--A------A------------------------GGGAAGTGA-TAATCCCC
gi|101867                     :                                   GTTGTCAAAT-TCCC---C-----TCGA--C---ATAAT-TA--TCA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCC-----------C--A------A------T--A-G-----AG-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101868                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCC
gi|101869                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101870                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTTGTCA-AAATCCCC
gi|101871                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101872                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101873                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCT----T----C---------------------A-----AT-----TAGTTGTCA-AAATCCCC
gi|101874                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------T------T--A-A--------------GTAGTCA-ATATCTCC
gi|101875                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTTGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-ATATCCCC
gi|101876                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TT--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101877                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------ATT-TA-------------------GTAGTCAATA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TAGTNNN-----------NN-NNNNNCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                        CAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCCttatttagtagtcaaaatcccc
gi|101879                     : gtagtcaaaatccccttatttagtnnnnnnnnnnGTAGTCAATA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------A------T-----------T-----TAGTAGTCG-AAATCCCC
gi|101880                     :                                   GCAGTCAAAA-TCCT---C-----ATGA--C---AA-------------------------GTAGTCAAAA-TCCCCT---T----C---------------------------AT-----GGGTAATTA-TAAT
gi|101881                     :                                   GTCGTCAAAAATCCC---C-----TTGA--C---CGA---TA--ATA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCAAGGT----CAAA------A------C--A-G-----AG-----GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101882                     :                                   GTGATCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACACTCACTCACCTGG-GTAGT--GAA-TTCCC----T----C---------------------A-----AT-----GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101883                     :                                   GTACTCAAAA-TCAC---C-----ATGG--C---TAAAA-TG--TTA-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC-------------------A------T------------------GGT--TCA-AAATCCCC
gi|101884                     :                                    TGGTCAAAA-TCCC---A-----TTGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------C--AGA-----ATAAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101885                     :                                    TGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AA-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------ACAGAATT--A-A-----AA-----AGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101886                     :                                    TGGTCGAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AG-GAAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--AGA-----ATTAAAAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                    TGGTCGAAA-TCCC---C-----ATGA--CTCAAAAAT-TA---CA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCT----T----C--A------A------C--AGA-----ATTAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---T-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----
gi|101888                     :   tggtcgaaatccccatgactcaaaaattacatgTGGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--TTA-AAAAA-TG--TCA-----------AG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------C--AGA-----ATTAAGAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101888                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AGA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----
gi|101889                     :   tggtcaaaatccccatggttaaaaaatgtcaagTAGTCGAAA-TCCC---CATGGCTCAA--C---AA----TG--ACA-----------TG-GTAGTGAAAA-TCCCC----T----C--G------A------C--AGA-----ATTAACAGAGTGGTCA-AAATTCCC
gi|101889                     :                                   GTAGTGAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GA-GTGGTCAAAA-TTCCC----
gi|101890                     :   tagtcgaaatccccatggctcaacaatgacatgTGGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AG-GTAGCCAAAA-TCCCC----T----
gi|101891                     :                                     AGTCAAAA-TCCC---C-----TCAC--CCTGAAAAT--G--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------A------CCAA-A-----ATGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCCt
gi|101892                     :                                     AGTCAAAA-TCCC---C-----TCAC--CCTGAAAAT--G--GCA-----------TA-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------A------CCAA-A-----ATGATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101893                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGGTTC---AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TACCC----T----C--G------A------T--AGA-----ATAAATAGGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101894                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAT-TG--ACA-----------AG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--AGA-----ATTAAAAAGGTGGTCA-ACATCCCC
gi|101895                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCA----T----C--G------A------C--AGA-----ATTAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101895                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---A-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----
gi|101896                     :         tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------A------C--AGA-----ATTAACAGGGTGGTCA-CAATCCCC
gi|101896                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCACAA-TCCCC----
gi|101897                     :         tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgTCAAAA-TCCC---C-----ATGA--CTC-AAAAA-TG--GCC-----------TA-GTCGTCAAAAATCCCC----TTGACC--G------A------T--A-A-----TA-----GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101898                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----TCTA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GT-TTGACCAAAA-TCCCC----T----T---------------------A-----AT-----GGGCAGTCA-AAA
gi|101899                     :                                          AAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAA-TG--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101900                     :                                          AAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCC----T----T--C------T------T--A---------------GGTAGTCG-ATATCCCC


blockSeqs                     :                                                      ATGGC  AACAGAATTAACACTCACTCACCTG                          AAGG TGAC GGCAATATTGCTA                     
blockSeqs                     :                                                      A      GGCTCAAAAATGACAT                                   T    .    GGTCAAAATAGAG                     
blockSeqs                     :                                                      A      GGCTCAAAAATGACAA                                   T    .    GTTTAAAATAGAG                     
blockSeqs                     :                                                      .      GGCTCAAAAATGACAA                                   .    .    GACCAAAATGATA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GACTCAAAAATTACAT                                   .    .    GACCAAATTGTTA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GGTTAAAAAATGTCAA                                   .    .    GACCAAAATGTTA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GGCTCAAAAATGACAA                                   .    .    GGTCAACATAGAG                     
blockSeqs                     :                                                      .      ACCCTGAAAATGATAG                                   .    .    GGTCAAAATAGAA                     
blockSeqs                     :                                                      .      ACCCTGAAAATGGCAT                                   .    .    GACCAAAATAATA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GGTTCAAAAATGACAT                                   .    .    GACAGAATAAACA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GGCTCAAAATTGACAA                                   .    .    AACAGAATTAAAA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GGCTCAAAAATGACAT                                   .    .    GATAGAATTAAAA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GGCTCAAAAATGACAT                                   .    .    AACAGAATTAACA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GACTCAAAAATGGCCT                                   .    .    GACAGAATTAAGA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GGCAAAAAATGACAG                                    .    .    GACAGAATTAACA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATAAACAG                                     .    .    AACCAAAATGTTA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GGCAATATTGCTAG                                     .    .    AACCAAAATGATA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GGTCAAAATAGAGG                                     .    .    GATAGAATAAATA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GTTTAAAATAGAGG                                     .    .    GATAGAATTAAAA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GATAGAATAAATAG                                     .    .    GACAGAATTAACA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GATAGAATTAAAAA                                     .    .    GACAGAATTAACA                     
blockSeqs                     :                                                      .      GATAGAATTAAAAA                                     .    .    AAAATCCCCAT                       
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATTAACAG                                     .    .    CCTTTTATAT                        
blockSeqs                     :                                                      .      AGCAAAAATGATAG                                     .    .    AAAACAGAG                         
blockSeqs                     :                                                      .      GACCAAAATAATAG                                     .    .    GATGGGT                           
blockSeqs                     :                                                      .      GACCAAAATGATAG                                     .    .    GATGGGT                           
blockSeqs                     :                                                      .      GACCAAAATGTTAG                                     .    .    AATAGAG                           
blockSeqs                     :                                                      .      AACCAAAATGTTAG                                     .    .    GATAATA                           
blockSeqs                     :                                                      .      GACCAAATTGTTAG                                     .    .    ATTAA                             
blockSeqs                     :                                                      .      GGCAAAAATGATAG                                     .    .    TTAGN                             
blockSeqs                     :                                                      .      AACAGAATTAACAG                                     .    .    GATAA                             
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATTAACAG                                     .    .    ATTAA                             
blockSeqs                     :                                                      .      GATAGAATTAAAAA                                     .    .    CTTA                              
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATTAACAG                                     .    .    CTTA                              
blockSeqs                     :                                                      .      GGTCAACATAGAGG                                     .    .    TTTA                              
blockSeqs                     :                                                      .      GGCAAAAATGATGG                                     .    .    CTTA                              
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATTAAGAA                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GGCAAAACTGACCA                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GGTAAAACTGACCA                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GGTAAAACTGACCA                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GGTAAAACTGACCA                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATTAATAG                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GGTCAAAACAGAGG                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      AACAGAATTAAAAA                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      AACCAAAATGATAG                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATTAAAAG                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GACATAATTATCAG                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GGCTAAAATGTTAG                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      AACAGAATTAACAG                                     .    .    GGT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATTAAGAA                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATTAACAG                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATTAACAG                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GACAGAATTAACAG                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      TACAGAATTAACAG                                     .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GGTAAAAATGACAG                                     .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GGTAAAACTGACCA                                     .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GTCAAAATAGAG                                       .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GACCGATAATAG                                       .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      ATTTAGTNNNN                                        .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      AACAATGACAT                                        .    .    GAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      AATAGAGG                                           .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      AATTA                                              .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      ATTTA                                              .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      ATTAA                                              .    .    ATT                               
blockSeqs                     :                                                      .      ATTTA                                              .    .    ATT                               
blockSeqs                     :                                                      .      ATTAA                                              .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      ATTTA                                              .    .    ATT                               
blockSeqs                     :                                                      .      AATTA                                              .    .    ATT                               
blockSeqs                     :                                                      .      ATTAA                                              .    .    ATT                               
blockSeqs                     :                                                      .      AATTA                                              .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      ATTTA                                              .    .    ATT                               
blockSeqs                     :                                                      .      ATTTA                                              .    .    ATT                               
blockSeqs                     :                                                      .      AATTA                                              .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      ATTTA                                              .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GACAA                                              .    .    AAT                               
blockSeqs                     :                                                      .      GATG                                               .    .    AA                                
blockSeqs                     :                                                      .      GATC                                               .    .    AT                                
blockSeqs                     :                                                      .      GATG                                               .    .    AT                                
blockSeqs                     :                                                      .      AATG                                               .    .                                      
blockSeqs                     :                                                      .      GATG                                               .    .                                      
blockSeqs                     :                                                      .      TTA                                                .                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                .                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                .                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                .                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                .                                           


blockSeqCons                  :                                   
originalCons                  :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--A-A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
finalCons                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--A-A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC





Alignments
lowQualScore                  :                                                             111111111111111111111111111111111                            6666666666666666666666666666666666                  
lowQualScore                  :                                             0    000 22222  666666666666666666666666666666666 0          0     1111 1111 7777777777777777777777777777777777         0        
lowQualScore                  :                                             .    ... .....  ................................. .          .     .... .... ..................................         .        
lowQualScore                  :                                             5    999 22222  555555555555555555555555555555555 5          5     9999 0000 1111111111111111111111111111111111         5        
consensus                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--A-A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
Reference ( family-377 )      :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AAAAT-TA--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--A-A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101823                     :                                   GTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AAAA--TA--GAA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101824                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-AA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101825                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--C---AATAT-TG--CTA-----------GT-GTAGTCAAAA-TTCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAATC
gi|101826                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----A----T--G------G------C--A-AT----ATTGCTAGTGTAGTCA-AAATTCCC
gi|101827                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101828                     :                                   GTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AAAA--TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCatgat
gi|101829                     :                                  gGTGGTCAACA-TCCC---C-----TTGT--T---TAAAA-TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101830                     :                                  gGTAGTCAAAA-TACC---C-----TCGA--T---AGAAT-AA--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----CGGTACTCA-AAATCCCC
gi|101831                     :                                    gAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------G------TCAA-A-----ATAGAG-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101832                     :                                ggaGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAACA-TCCCC----T----T--GTTTAAAA------T--A-G-----AG-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101833                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----CGGTACTCA-AAATCCCC
gi|101833                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T--------------C-------------G-GTACTCAAAA-TCCCC----A----T--G------A------T--G-G-----GT-----GGatgatgggtgg
gi|101834                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTAGTCAAAA-TCCGC----T----C--A------A---------A-ATCCCCAT-----G----GTCA-AAATCCCC
gi|101835                     :                                                                                             gG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCCC
gi|101836                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---A-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTCA-AAATCTCCaatgat
gi|101837                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCTC---C-----ATAG--C---AAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TTCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTATTCA-AAAT
gi|101838                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TA--ATA-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------CCAA-A-----ATGATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101839                     :                                  gGTATTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTATTCA-TAATTC
gi|101840                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAA-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------AC-----C--A-A-----ATTGTTAGGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101841                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---CAAAA-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------CCAA-A-----ATGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101842                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---CAAAT-TG--TTA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------A------T--A-
gi|101843                     :                                  gGTAGTTAATA-TCCC---C-----ATGG--C---AAAAA-TG--ATA-----------GA-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAATCTCCgg
gi|101844                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---T-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------GT-----GGGTAGTTA-ATATCCCC
gi|101845                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCACAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAA
gi|101846                     :                                  gGTAATCATAA-ACCC---C-----TAGA--T---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCACAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTAGTTG-AAATCTCC
gi|101847                     :                                  gGTAGTGAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GA-GTGGTCAAAA-TTCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGCAGTCA-AAATCC
gi|101848                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGGT-C---AACA--TA--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TGCTC----T----T--G------------------------AT-----GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101849                     :                                  gGCAGTCAAAA-TCCA---C-----ATGG--C---AAAAA-TG--ATG-----------GT-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGGAATCA-AAATCCCC
gi|101850                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AGA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--GGTCAACA------T--A-G-----AG-----GGGTAGTCA-AAAT
gi|101851                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---------------------AAT--A--GAG-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----GGGTAGTCA-AAATACC
gi|101852                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--A------T------T--A-A--------------GTAGTCA-AAATCCCC
gi|101853                     :                                  gGTAGTCAAAA-TACCGATCA----TCGT--C---AAAAT-----AGA-----------GAAGTAGTCAAAA-TCTCC----T----C---------------------A-----AT-----TGGAGGTCA-AAATCCCC
gi|101854                     :                                    gAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--C---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATGGTCAAAA-TCCCC----T----T--C------T------T--A---------------GGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101855                     :                                ggaGTAATCGAAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------------------A-----AT-----AGGTGGTCATAAGTCCC
gi|101856                     :                                  gGTAGTCGATA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-TTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--C------T------T--A---------------GGTAATCG-AAATCCCC
gi|101857                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCCT---T----C----------------T--T-A-----GN-----NNNNNNNNN-AAATCCCC
gi|101858                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---CA----TC------------T-TA-----------------G-GTAGTAAAAA-TCCCC----T----T--T------T------T--A---------------GGAAGTCA-AAATCCCC
gi|101859                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ATA-----------GG-GTGATCAAAA-TCCCT----T----C--C------CTTT---T--A-T-----AT-------GCAGTCA-AAATCCTC
gi|101860                     :                                  gGTGGTCAAAA-TCCC---C-----AAGGT-C---AAAA--CA--GAG-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----GGGAAGTAA-ACATCTCC
gi|101861                     :                                  gGTAGT--GAA-TTCC---C-----TC----------AAT-------------------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T---------------------A-----AT-----TGATGGTCA-AAATCCCC
gi|101862                     :                                  gGTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---AGAAT-TA--AAA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------G------TCAA-A-----ATAGAA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101863                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---CAAAA-TG--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------CCAA-A-----ATAATA-GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101864                     :                                                                                               -GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------------------------AT-----GGGTACTCA-AAATCTCC
gi|101864                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--T---------------------------GG-GTACTCAAAA-TCTCC----A----T--G------A------T--G-G-----GT-----GGatgatgggtgg
gi|101865                     :                                   GTAGTTAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AAA-----------GG-ATGGTC-AAA-TTTCC----T----T--G------A------T--A-A--------------GTAGTCA-AAATCTCC
gi|101866                     :                                   GTAGTCAAAA-TCTC---C-----ATGG--C---AAAAAATG--ACA-----------GG-GTAGTCAATA-TCCCC----T----C--A------A------------------------GGGAAGTGA-TAATCCCC
gi|101867                     :                                   GTTGTCAAAT-TCCC---C-----TCGA--C---ATAAT-TA--TCA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCC-----------C--A------A------T--A-G-----AG-----GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101868                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCC
gi|101869                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101870                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTTGTCA-AAATCCCC
gi|101871                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101872                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101873                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCT----T----C---------------------A-----AT-----TAGTTGTCA-AAATCCCC
gi|101874                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT-----------AT-TA--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------T------T--A-A--------------GTAGTCA-ATATCTCC
gi|101875                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTTGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-ATATCCCC
gi|101876                     :                                   GTAGTCAATA-TCCC---C-----TC-----------AT-TT--A----------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101877                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TC----------ATT-TA-------------------GTAGTCAATA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TT----------ATT-TAGTNNN-----------NN-NNNNNCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101878                     :                                        CAAAA-TCCC---C-----TC----------AAT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T---------A------T-----------T-----TAGTAGTCA-AAATCCCCttatttagtagtcaaaatcccc
gi|101879                     : gtagtcaaaatccccttatttagtnnnnnnnnnnGTAGTCAATA-TCCC---C-----TT----------ATT-TA-------------------GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------A------T-----------T-----TAGTAGTCG-AAATCCCC
gi|101880                     :                                   GCAGTCAAAA-TCCT---C-----ATGA--C---AA-------------------------GTAGTCAAAA-TCCCCT---T----C---------------------------AT-----GGGTAATTA-TAAT
gi|101881                     :                                   GTCGTCAAAAATCCC---C-----TTGA--C---CGA---TA--ATA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCCAAGGT----CAAA------A------C--A-G-----AG-----GGGTATTCA-AAATCCCC
gi|101882                     :                                   GTGATCAAAA-TCCC---C-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACACTCACTCACCTGG-GTAGT--GAA-TTCCC----T----C---------------------A-----AT-----GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101883                     :                                   GTACTCAAAA-TCAC---C-----ATGG--C---TAAAA-TG--TTA-----------GG-GTATTCAAAA-TCCCC-------------------A------T------------------GGT--TCA-AAATCCCC
gi|101884                     :                                    TGGTCAAAA-TCCC---A-----TTGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------C--AGA-----ATAAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101885                     :                                    TGGTCAAAA-TCCC---C-----TTGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AA-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------ACAGAATT--A-A-----AA-----AGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101886                     :                                    TGGTCGAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AG-GAAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--AGA-----ATTAAAAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                    TGGTCGAAA-TCCC---C-----ATGA--CTCAAAAAT-TA---CA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCT----T----C--A------A------C--AGA-----ATTAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101887                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---T-----TCAA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----
gi|101888                     :   tggtcgaaatccccatgactcaaaaattacatgTGGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--TTA-AAAAA-TG--TCA-----------AG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------C--AGA-----ATTAAGAAGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101888                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--AGA-----------AG-GTGGTCAAAA-TCCCC----
gi|101889                     :   tggtcaaaatccccatggttaaaaaatgtcaagTAGTCGAAA-TCCC---CATGGCTCAA--C---AA----TG--ACA-----------TG-GTAGTGAAAA-TCCCC----T----C--G------A------C--AGA-----ATTAACAGAGTGGTCA-AAATTCCC
gi|101889                     :                                   GTAGTGAAAA-TCCC---C-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GA-GTGGTCAAAA-TTCCC----
gi|101890                     :   tagtcgaaatccccatggctcaacaatgacatgTGGTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------AG-GTAGCCAAAA-TCCCC----T----
gi|101891                     :                                     AGTCAAAA-TCCC---C-----TCAC--CCTGAAAAT--G--ATA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------A------CCAA-A-----ATGTTA-GGGTAGTCA-AAATCCCCt
gi|101892                     :                                     AGTCAAAA-TCCC---C-----TCAC--CCTGAAAAT--G--GCA-----------TA-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--A------A------CCAA-A-----ATGATA-GGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101893                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGGTTC---AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TACCC----T----C--G------A------T--AGA-----ATAAATAGGGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101894                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAT-TG--ACA-----------AG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C--G------A------T--AGA-----ATTAAAAAGGTGGTCA-ACATCCCC
gi|101895                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCA----T----C--G------A------C--AGA-----ATTAACAGGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101895                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---A-----TCGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCAAAA-TCCCC----
gi|101896                     :         tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgTCAAAA-TCCC---C-----ATGG--CTC-AAAAA-TG--ACA-----------TG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----T--G------A------C--AGA-----ATTAACAGGGTGGTCA-CAATCCCC
gi|101896                     :                                   GTAGTCAAAA-TCCC---C-----TTGA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GG-GTGGTCACAA-TCCCC----
gi|101897                     :         tcaaaatccccatggctcaaaaatgacatgTCAAAA-TCCC---C-----ATGA--CTC-AAAAA-TG--GCC-----------TA-GTCGTCAAAAATCCCC----TTGACC--G------A------T--A-A-----TA-----GGGTGGTCA-AAATCCCC
gi|101898                     :                                       TCAAAA-TCCC---C-----TCTA--C---AGAAT-TA--ACA-----------GT-TTGACCAAAA-TCCCC----T----T---------------------A-----AT-----GGGCAGTCA-AAA
gi|101899                     :                                          AAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAA-TG--ACA-----------GG-GTAGTCAAAA-TCCCC----T----C---------------------A-----AT-----TAGTAGTCA-AAATCCCC
gi|101900                     :                                          AAA-TCCC---C-----ATGG--T---AAAAC-TG--ACC-----------AG-ATAGTCAAAA-TCCCC----T----T--C------T------T--A---------------GGTAGTCG-ATATCCCC