lowQualScore : 111 1111 1111 11111111 333333333333333 111 1111 1 11 2222222222 1111 4444444444444444 1111111 111111111 22222222
lowQualScore : 0 555555 5 222 2 88 444 0 2222222 0 5555 111 6666 1 66666666 1 0 111 5 55 777777777777777 7777777 0 77777777 444 111 22222222 111 00 44 222222 1111 2 0 88 0 0 0 33 3 44 11 3333333333 111 7777 1111 0000000000000000 44444 2 1 4 9 4 7777 1 7777777 5 0 222222222 1 4 1 5 22222222 888888 666666 444 99999 7
lowQualScore : . ...... . ... . .. ... . ....... . .... ... .... . ........ . . ... . .. ............... ....... . ........ ... ... ........ ... .. .. ...... .... . . .. . . . .. . .. .. .......... ... .... .... ................ ..... . . . . . .... . ....... . . ......... . . . . ........ ...... ...... ... ..... .
lowQualScore : 5 000000 9 333 9 66 666 7 1111111 6 0000 111 0000 2 77777777 8 6 000 9 66 222222222222222 6666666 6 99999999 333 000 22222222 000 88 44 444444 5555 8 7 66 7 7 7 99 6 11 00 0000000000 333 4444 7777 3333333333333333 11111 9 0 0 4 0 9999 6 7777777 4 5 666666666 3 5 3 1 66666666 222222 666666 666 44444 3
consensus : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCA-NTTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-AAAA-T---T-AT-TAAA---TTCAGA-C--A----A-N---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-AC------TAAA--GGTGCCAC-CCG-A-A-AT-TTC-AGCCGTGTA-TAT--TAN--------A---TTGNT--ATT----AGCCT--C----------G--CCGG---TCTCTGTAACG-ATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGCACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTA----T--TAA------A------T---A--T--CGGTGCACCG
Reference ( gi|24044 ) : GTTATTTAA------ACTT--GTCAACA-ATTA--T-A-------TCAG-CTTTA-A--TTTGGT---A---AC-ATAA-G---T-AT-TAAA---TTCAGA-C--A----T-T---A----TTT--A---A-A-A--A-A-TA--A---T--------T---AAAG--AAAT-GC------TAGG--GGTGCAAC-CCT-A-A-AT-TTG-AGCTGTGTG-TAT--TCA--------A---TTGGC--ATT----AGCCT-CC----------T--CCGA---TCTCTGCAACG-ATCTTGGAACGAAGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGCG-CACCGCTA----T--TAA------A------T---A--T--CGGTGGACCG
gi|24047 : GTTATTTAT------ACTT--GTCAACA-ATTA--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-ATAA-T---T-AT-TTAA---TTCAGA-T--A----T-T---A----TTTC-G---A-A-A--A-G-TT--A---T--------T---AAAG---AAT-AC------TAGG--AATGCGAC-CGT-T-A-AT-TTG-AGCTGTGCG-TAT--TCA--------A---TTGTT--GTT----AGCCT-CC----------T--CCGA---TCTCTGCAACACAT-TTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGAACAGCCGTGTGACG-------ATTGTGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-TGGTG-CACCGCTA----T--TTA------G------T---A--C--TGTTG
gi|24046 : GTTGTTTAA------ACTT--GTTAACA-ATTA--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-ATAA-T---T-AT-CCAA---TTCAGA-C--A----T-T---A----TTA--T---G-A-A--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAGT-GC------TAAG--TGTG--AC-CCT-A-A-GT-TTC-AACTGTGTA-TAT--T-A--------A---TTGTT--GTT----AGCCT-CC----------T--CCGA---TCTCTGTAATG-ATTTTGGAATGAGGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATTCTA----AGTGGTGTGACA-------ATTGCGATGGA-CGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTA----T--TAA------A------T---A--C--CAGTGGACCG
gi|24045 : GTTGTTTAA------ACTT--GTTAACA-ATTA--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-ATAA-T---T-AT-CCAA---TTCAGA-C--A----T-T---A----TTA--T---G-A-A--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAGT-GC------TAAG--TGTG--AC-CCT-A-A-GT-TTC-AACTGTGTA-TAT--T-A--------A---TTGTT--GTT----AGCCT-CC----------T--CCGA---TCTCTGTAATG-ATTTTGGAATGAGGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATTCTA----AGTGGTGTGACA-------ATTGCGATGGA-CGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTA----T--TAA------A------T---A--C--CAGTGGACCG
gi|24048 : GTTATTTAA------ACTT--GACACCA-ATTA--T-A-------TCAG-CTTAA-C--TTTGGT---A---CC-ATAA-T---T-AT-TGAA---TTCAGA-C--A----T-T---G----TTTC-G---A-A-A--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-GC------TAAA--AGTG--AC-CCT-A-A-AT-TTC-AACCTTGTG-TAT--T----------G---TT-GCTTGTT----AGCCT-CC----------T--CTGA---TCTTTGTAATG-ATTTTGGAACGAGGCTTTTGATTCGACCAAT
gi|24050 : GTTATTTAA------ACTT--GTCAATA-ATTA--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTGTGT---A---CC-ACAG-T---T-AT-TAAA---TTCAGA-C--A----T-T---G----TTA--AG--A-A-A--A-G-TT--A---T--------T---GAA---AAAT-GC------TAGG--GGTGCCACGCTT-A-A-A---TGCAACTGTGTG-TTT--TC--------------TGTA--ATT----A----------------------------------------TTTTGG-ATGAGGCTTCTGATT-GGCTatattttgcttaacggtgcaccgctattaaataccggtggactg
gi|24049 : GTTTTTTAA------ACTT--GACACCA-ATTA--T-A-------TCAT-CTTAA-C--TTTGGT---A---CC-ATAA-T---T-AT-TGAA---TTCAGA-C--A----T-T---G----TTTC-G---A-A-A--A-G-TT--A---T--------T---AGAG--AAA
gi|24051 : TCATTTAA------ACTT--GACAATA-AATA--T-AAAAATTATCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-ATAA-T---T-AT-TGAA---TTCAGA-C--A----T-T---G----TTTTGA---A-A-A--G-A-TA------T--------T---AAAG--AATT-GC------TAAG--TGTG--AC-CCT-T-A-AT-TTC-AACCGTGTG-TAT--T-G--------A---TTGTT--GTT----AGCCT-CG----------T--CCGA---TCTTTGTAATG-GTTTTGAAACGAGGCTTTTGATT-GGCTAACT---CCAAAGATCCTAGTACAGTGATGTGACG-------ATAGCAGTGGACCAATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTA----T--TAA------A------T---A--C--AGGTGGACCG
gi|24052 : TTATTTAA------ACAT--GTCAACA-ATTA--T-A-------TAAG-CTTTA-C--TTTGAT---A---CC-ATAA-T---T-AT-TAAA---TTCAGA-C--A----T-T---A----TTT--C---G----------TT--A---G--------T---ATAG--AAAT-GC------TAAG--TGTG--AC-CCT-A-A-AT-TTC-AACTGTGTG-TAT--T-G--------A---TTGTT--ATT----AGCCT-CCTCCGATCTCCT--CCGA---TCTCTGTAATG-ATTTTGGAAAGAAGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATCCTAGTACAGCAGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCG----ATTTTATT-T------AATCGGTG-CATCGATA-------AAA------A------T---A--TAGCGGTGCATCG
gi|24053 : TTATTTAA------AGTT--GTCAACA-ATTG--T-A-------TCAG-CTTTA-T--TTTGGT---A---CC-ATAA-T---T-AT-AAGA---TTCAGA-C--A----T-T---A----TTT--C---A-ATA--A-G-TT--G---T--------T---AAAG--AAAT-GA------TAGG--TGTGCCAC-CCT-A-A-AT-TTG-AGCTTTGTG-TAT--TCG--------T---ATGTC--ATT----AGCCT-AC----------T--CCGA---TCTCTGCAACA-ATTTTGAACCGAAGCTTCTGACT-GGCTAATC---CCCAAAA
gi|24054 : TTTTCTAA------A-TT--ATTAACA-ACCT--T-A-------TCAG-CTTTA-T--TGTGTT---C---TC-AAAT-T---T-AT-TAAA---TTCAAA-C--A----T-TG--G----TTC--A---A-A-T--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-AC------CAAA--GGTGCCAC-TCA-A-A-AT-GCC-AGCCGGGTT-TATACTGA--------A---TTGAT--ATT----AG-----C----------TGGCGGA---TCTCTGTAAaaaaaaaaaaaaaaaaaaattctatcttatttaacgtcgcaccgccattaaatatcggtgga
gi|24055 : TTATTGAA------AATT--GTCATCA---TAGTT-A-------TCAG-ATTTA-C--TCTGGT---A---CC-A-AA-T---G-AT-AAAA---TTCAGA-A--A----AAG---A----TTC--A---A-A-G--T-G-TC--A---T--------T---AAAG--CAAT-AC------TACA--GGTGCCAC-CCG-A-A-AT-TTA-TGCAGTGCA-TAT--TAT--------A---TTGAT--AAT----AGCCT------------------GAAAGTCTCTGCAA
gi|24056 : TTATTACA------AATA--GCCAACA-TTT---T-A-------ACAG-CTTTA-C--TTTGGT---A----C-AAAA-G---TTAT-TAAA---TTAAGG-C--A----AAG---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AACT-AC------TTAA--GGTTCCAC-CCA-A-A-AT-TTC-AG--GTGTA-TAT--TAC--------A---CTGAT--ATT----AACC
gi|24057 : TTATTGAA------A-TT--GTCATCA-GCTT--T-A-------TCAG-CTTTA-CTTTTTGGT---A---CC-A-AA-G---
gi|24058 : TATTTAATTCCTTACTTTTGTTAACA-GTTT--T-A-------TCTG-CTTTA-C--TTCGGT---A---TC-ATAA-C---T-AT-TATA---TTCAGA-C--A----------A----ATT--A---A-A-G--G-T-TA--A---A--------A---AAAG--AAAT-AC------TATA--TGTGTCAT-CCT-A-A-AT-TTC-AGGAACGTA-TAT--TAA--------A---TTagtaacttaagaaatactaaaggtgccactagaaatttcagccgtgtacattatattgctattagcctgccagtctctgta
gi|24060 : ATTGAA------AATA--GTCAATA-TCGG--T---------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-AAAA-G---T-AT-TAAG---TTCTGA-C--A----------AAGG-TTC--A---A-A-T--A-G-TT--A---G--------T---AAAA--AAAT-ACA-----TAAT--G-TGCAAC-CCG-A-A-AC-TTC-AGCCGTTTA-TGC--TTA--------A---TTGAT--ATT----AGCCT-------------G--TCAA---TCTCTATAAaattgt
gi|24061 : ATTGGA------AATA--GTCA-CA-GTTGC-T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-AAAA-T---T-AT-TTAA---TTTAGG-C--A----AAG---A----TTC--A---G-A-G--A-G-TT--A---A--------T---AAAT--GAAT-AC------TAAA--AGTGTCAC-CCG-A-A-AC-TTC-AGCCATGTA-TAT--TAC--------A---TTGAT--ATT----AGCCT-------------G--CCAA---TCTC
gi|24059 : ATTGGA------AATT---TCACCA-ATTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-AAAA-T---T-AT-TTCA---TTCAGA-CA-A----A-G---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--G---T--------A---AAAG--AATT-AC------TGAA--GGTGCCAC-CCA-A-A-AT-TTC-AGTTTTGCA-CAT--TAT--------A---CTGCT--ATT----A---T-CC----------TG-CCAG---TCTCT
gi|24062 : ATTGGA------ATTG--GTCATCA-TTTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGC---A---CC-AAAA-T---T-GT-TAAA---TTCAGACC--A----A-G---A----TTC--G---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---ATAG--AAAT-AC------TAAA--AGTGCA----------------------GTGGA-CAT--TAT--------A---TTGCT--ATT----AGCCT-------------T--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24064 : ATTGGA------ATTG--GTCATCA-TTTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGC---A---CC-AAAA-T---T-GT-TAAA---TTCAGACC--A----A-G---A----TTC--G---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---ATAG--AAAT-AC------TAAA--AGT----------------------GCCGTGGA-CAT--TAT--------A---TTGCT--ATT----AGCCT-------------G--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24063 : ATTGGA------ATTG--GTCATCA-TTTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGC-------AC-AAAACT---T-GT-TAAA---TTCAGACC--A----A-G---A----TTC--G---A-A-G-------A--G---T--------T---ATAG--AAAT-AC------TAAA--AGTGCA----------------------GTGGA-CAT--TAA--------A---TTGCT--ATT----AGCCT-------------G--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24067 : ATTGGA------ATTG--GTCATCA-TTTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT-------AC-AAAA-T---T-GT-TAAA---TTCAGG-CT-A----A-A---A----TTC--G---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---ATAG--AAAT-AC------TAAA--AGTGC
gi|24066 : ATTGGA------ATTG--GTCATCA-TTTT--A-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGC---A---CC-AAAA-T---T-GT-TAAA---TTCAGACC--A----A-G---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---ATAG--AAAT-AC------T----------------T-A-A-AG-T----GCCATGGA-CAT--TAA--------A---GTGCT--ATT----AGCCT-------------G--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24065 : ATTTGA------ATTG--GTCATCA-TTTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGC---A---CC-AAAA-T---T-GT-TAAA---TTCAGACC--A----A-G---A----TTC--G---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---ATAG--AAAT-AC------TA
gi|24068 : TTTAA------A-TA--GTCAACA-TTT---T-A-------ACAG-CTTTC-C--TTTGGT---ATCAAC-AT-------T-AT-TAAA---TTCAGA-C--A----------AAGG-TTC--A---A-A-G--A-G-TA--A---T--------T---TAAG--AAAT-AC------TAAA--GATACTAC-CCA-A-A-AT-TTC-TGCTGCGTA-TGT--TGA--------A---TTGAT--ATT----AGCCT-aaagcg
gi|24069 : TTTAA------ATTT--A--AAGA-A-------A-------TGAG-CTTTA-C--AATGGC---A---CC-AAAA-T---T-AT-TTTA---TTCAGA-C--A----CAT---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAA--------------------CA----CG-A-A-AT-TTC-AGCCATGTA-CAT--TT---------A---TTGCT--ATT----AGC---CC----------G--CCAG---TATCTGTAA
gi|24070 : TTAA------AATG--GTTATTA-TTTA--A-A-------TCAG-CTTTA-C--CTTGGT---A---CC-G-AA-A---TAAT-TAAA---ATCAGA-CA-A----A-G---A----TTT--------A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAA--CAAT-AC------TAAA--GGCGCTA--CCT-ATA-AC-TTC-AACCGTGTA-TAT--TAC--------A---TTG
gi|24071 : TAA------ACTT--ATTGATA---TA--T-A-------TTTTTCTTTA-C--TTTGGT---A---CC-ATAA-----------------TTCAGA-C--A----T-T---G----TTT--TT--A-A-A--A-G-TC--A---T--------T---GAAG--AAAT-GC------TCAG--GGTGCCAC-ACT-A-A-GT-TTC-AGCTGTATG-TAT--TAA--------A---TTGTT--GTTTAATAGCCT-CC----------G--CCAA---TCTCTGCAATG-ATTTTGAAACGAAGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTAGAGCGGTGTGATG-------ATAGCGGTGCACCGATATATTTTATT-TCGGGTCCA-TGATGACATCGCAA----T--TAA------A------cctgtcagtct
gi|24072 : TAAC-----ACAT--GTCAACA--TTG--TTG-------TCAG-CATTA-C--CTCGGT---A---CC-A-AA-G---TTAT-TGAA---TTCAGA-CA-A----T-G---G----TTC--A---A-A-G--C-G-TT--A---A--------T---AAAC--AAAA-AC------TAAA--TGTGCCAT-TTT-A-T-AT-T
gi|24073 : AA------AGTA--GTCATCATATT---T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGAT---A---CT-AAAA-T---T-AT-TCAA---TTCAGA-T--A----AAG---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---GAAG--CAAT-AC------TAAA--GGTGCCAC-CTG-A-A-AT-TTG-AGCCGTGTA-GAT--TAT--------A---TTGAT--TTT----AGCCT-------------G--CCAG---TCTCTG
gi|24074 : A------ATTG--GTCATCA-TTTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGC---A---CC-AGAA-T---T-GT-TAAA---TTCAGACC--A----A-G---A----TTC--G---A-G-T--T-A-TA--A---T--------------AG--AAAT-AC------TAAA--AGT----------------------GCCGTGGA-TAT--TAT--------A---TTGCT--ATT----AGCCT-------------G--CCAG---TTTCTGTAA
gi|24075 : A------ATTG--GTCATCT-TTTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGC---C---CC-AAAA-T---T-GT-TAAA---TTCAGACC--A----A-G---A----TTC--G---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---ATAG--AAAT-AC------TAAA--AGTGC
gi|24078 : T--GTCATTA-GTTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C----------------C-AAAA-T---T-AT-TTCA---TTCAGA-C--A----AAG---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-AC------TAAA--GGTGACAC-CCG-A-A-AT-TTC-AGCCATGTA-CAT--TAT--------A---TTGCT--ATT----AGCCT-
gi|24076 : T--GTCATCA-GTTC--T-A-------ACAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-AAAT-A---C-AT-TTCA---TTCAGA-C--A------------------------A-G-G--A-G-TA--A---T--------T---AAAG--AAAT-AA------CAAA--TATGCCAC-CCG-A-A-AT-TTC-AGCCGTGTA-CAT--T
gi|24077 : T--GTCAGCA-TTTT--T-A-------CCAG-CTT-A-A--CTT------A---CC-AAAA-A---T-ATGTAAA---C-CAGA-C--A----C-A---G----TTT--T---A-A-A--A-G-TGTTA---T--------T---TAAG--AAAT-GC------TATA--AGTGC--C-ACT-G-ATAG-TTC-AGCCATCT--TA-----A--------A---TTGAT--ATT----AGC----C----------T--CCGA---TCTCTGTAatattactctaagccttccagtc
gi|24080 : --GTCAACA-TTTT--T-A-------TCAG-CTTTG-C--TTTGGT---A---CC-A-AA-A---T-TT-TAAA---TTAA------A----T-C---AAAGGTTG--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-AC------TAAA--GGTGCCAC-TCG-A-A-AT-TTC-AGCTTTGTA-TAT--TAA--------A---TTGAT--ATT----AGCCT-------------T--ACAA---TGTCTGTAA
gi|24081 : --GTCAAAA-TTTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-A-AA-GT--T-AT-TAAA---TTCAGA-A--A----------AAGG-TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-GC------TGAA--GGTGCCAC-CTG-A-A-AT-TC--AGCTTTGTA-TAT--TGC--------A---TTGGT--ATT----AGC
gi|24083 : --GTCAGCA-ATTT--T-A-------TCAG-CTTTT-A--TCTGAT---A-------TAA-----------AAA---TTCAGA-C--A----------AAGG-TTC--A---G-A-G------TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-AC------TAAA--GGTGTCAC-CAG-T-A-AT-TTC-AGCTGTGTA-TAT--TGA--------A---TTGAT--ATT----AGCCT-------------G--CCAG---TCTTTGTAA
gi|24085 : --GTCAAAA-TTTC--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-AAAA-T---T-TT-CAAA---TTCAGA---------------------------------------------------------T---AAAG--GAAT-AC------TTAA--TGTGCCGC-CCG-A-A-AT-TTC-AGTCTTGTA-TAT--TGA--------A---TTGAA--ATT----AGCCT-GC----------T----GG---TCACTG
gi|24084 : --GTCATCA-TTTG--T-A-------TCAG-CATTA-C--GTTAGT---A---CC-AAAA-G---T-AT-AAGC---TTCAAA-C--A----GAG---A----TTC--A---A-A-T--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAA-TC------TGAA--GGTGCCAC-CTG-A-A-AT-TTC-AACCGTTTA-TAT--ACACGTATTGTA---TTGAT--ATT----AGCGT--G----------T--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24087 : --GTCATCA-TTTT--T-A-------TCAG-TTTTA-C--TTTGGT---A---CC-AAAG-G---T-AT-TTAA---TTCAGA-C--AAATTT-T---A----T--------A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-AC------TAAA--AGTG
gi|24088 : --GTCAACA-TCT---T-A-------TTAG-CCTTG-T--TTTGGT---A---TC-GGAA-C---T-AT-TAAA---TTCAGA-C---------T---A----TT---------A-A--G-G-T-------T--------C---AAAGAAAAAT-AC------TACA--GGTGCCAT-CCG-A-A-ATATTA-TGCC-T-TA-TAT--TCT--------G---TTG-----------AG--T-CT----------G--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24079 : --GTCATCA-TTTT--T-A-------TCAG-TTTTA-C--TTTGGT---T---CC-AAGA-T---C-AT-TAAA---CTCAGA-CC-A----A-A---A----TTT--A---A-A-G--G-G-TT--A---T--------T---AA-G--AAAT-TCTAAATTTAAA--GGTGCAAC-CCG-C-A-AT-TTC-AGCCNNNNN-NNN--NNA--------A---
gi|24089 : --GTTAATA-TTTG--T-G-------TTAG-GTTTC-A--CTT--T---A---CC-ACAA-AAATT-CT-TAAA---TTCTGA-C--AA---T-G---G----TTT--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-GC------TAAT--GGTGCCAT-CCG-A-A-TT-TTC-AACTACGTA-CAA--TAA--------A---TTG
gi|24086 : --GTAAACA-ATTT--C-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGAT---A---CC-AAAA-T---T-AT-CAAA---TTCTGA-C---------T---AAG--TTT-----------------CA--A---T--------G---AGAT--ACATAGT------TA-A--GTTCCCAT-CTC-A-A-AT-GTC-AGCCATGTA-TGA--TAA--------A---TCGGT--ATA----AGCCT-GA-------------CCAA---TCTATGCAA
gi|24090 : --GTCATCA-TTTT--T-A-------TCAG-CGTTA-T--TTTCAT---ATCAAC-AT-------T-AT-CAAA---TTCAGA-CA-A----A-T---A----TTC--A---A-A-A--A-G-TT--A---T--------A---AAAG--AAAA-TC------TAAA--GGTGC
gi|24092 : --GTCATCA-CTTT--T-A-------TCAG-CTT-A-C--TTTGGC---A---CC-AAAA-T---T-GT-TAAA---TTCAGACC--A----A-G---A----TTC--G---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---ATAG--AAAT-AC------TAAG--
gi|24082 : --GTCAACA-GTTT--T-A-------TCAG-CCTTA-C--ATTGGT---A---CC-AAAA-T---T-AT-TTAA---TTCAGA-C--A----A-A---G----GTT--A---A-A-AAGA-G-TT--A---T--------T---AAAC--AAAC-AC------TAtgc
gi|24091 : --GTCAACA-ATTG--T-A-------TCAG-CTTTACA--TT--GT---C---ACAATAA-T---T-GT-TAAA---TTCCAA-CA-A----A-T---A-----TT--A---A-A-G--G-T-TA--AAGGT--------T---AAAG--aattcaaatgaaatgcaattgtcctgttaaccttactccatttatgca
gi|24093 : TCAATA-TTT---T-A-------TCAG-GTATA-C--TTCGGT---A---GC-AAAA-T---T-AT-TAAA---TTCAGA-CAAA----G-T---A-----TC--A---A-A-G--A-G-TC--A---TCATTAAAAT---AAAG--AGAC-AT------TAAA--GGCACCGC-TCA-A-A-AT-TTC-AGGTGTGTA-TGT--TGA--------A---CTGAT--ATA----AACCT-------------G--CCGA---TCTCTGTAAccagaa
gi|24094 : TCAAAC-ATTT--T-A-------TCAT-TTTTA-C--GTTGGT---A---CC-AATA-T---T-AT-TAAA---TTCAGA-C--A----------AAGG-TTT--A---A-A-A--A-T-TT--T---T--------TAACAAAA--AAAT--C------T-----------AC-CTG-A-A-AT-TTA-AG--ACATG-TAT--TGA--------A---TTGAT--ATT----AGGCT-------------G--TCAA---TCTCTGCAA
gi|24095 : TCGACA-ATT---T-A-------TCAG-CTTTA-A--TTTGAT---T---CC-ATCC-T---T-AC-TAAA---TTCAGA-C--A----T-TG--A----TTG--A---A-A-T--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAA
gi|24096 : TCAACA-TTTT--T-G-------TCAG-CTTCA-C--TTTAGT---A---CC-AAAA-T---T-AT-TAAA---TTAAGAGC--A----T-T---
gi|24097 : CAACA-TTTT--T-A-------TTAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-ATAT-T---T-AT-TAAG---TTTAGA-
gi|24098 : AATA-ATGT--T-A-------ACAG-CTTTG-C--TTTGGT---A---TC-AAGA-T---T-AT-TGAA---TTCAGA-C--A----A-TGAAA----ATG--ACACA-A-A--A-G-TT--A---T--------A---AAAT--AAAT-GC------TATGATGGTGCCAC-CTG-A-A-AC-TTC-AGACATACA-TAC--TGA--------ATATTTGAT--ATG----AAC---CC----------G--TGGA---TCTCTGTAAaaaaaagtttcatcaaataag
gi|24099 : CA-ATTT--T-A-------TCTG-TTTTA-T--TTTGGT---A---CC-AATA-G---T-AT-TTAA---TTCAGA-C--A----AAG---A----TTC--G---A-A-G--A-A-TT--A---A--------T---AAAG--AAAT-AC------TAAA--AGTGCCAT-TAG-A-A-AT-TTC-AGCCGTGTA-TAT--TAC--------A---TTGAT--ATT----AGCCTGCC----------T-----G---TCTCTGTAA
gi|24100 : CA-TTTG--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTTAT---A---CC-ACAA-T---T-AT-CAAA---TTTAGA-A--A----A-G---A----TTC--A---A-A-T--A-C-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-AC------TATT--GATGCCAC-GCG-C-A-AT-TTC-AGC--CGTG-TAC--T----------------------TT----AGCCT-------------G--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24101 : CA-TTTT--T-A-------TCAG-TTTTA-C--TTTGGC---A---CC-AAAA-T---T-GT-TAAA---TTCAGACC--A----A-G---A----TTC--G---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---ATAG--AAAT-AC----------------CAAC-------A-GT------GCCGT-TGACAT--TAT--------A---TTGCT--ATT----AGCCT-------------G--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24103 : TTT--T-A-------TCAG-TTTTA-C--TTTGGT---A---CC-AAAA-T---T-AT-CAAA---TTCAGA-C--A----AAG---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-AC------TAAA--GGTGCCAC-CTG-A-A-AT-TTC-AGTCGTGCA-CAT--TAT--------A---CTGCT--ATT----ACCCT-------------G--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24102 : TTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGGT---A---CC-AAAT-T---T-AA-TAAA---TTCAAA-CA-A----A-G---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---C--------T---AAAT--AAAT-AC------TAGA--GGTGCCAC-CCT-G-A-AT-TTC-AGCCGTGTA-TA---TCAT-------A---TCG-----------AGCCT-------------G--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24104 : TTT--T-A-------TCAG-CTTTA-C--TTTGATGTCA---AC-AT-------T-AT-TATA---TTCAAA-C--A----C-C---T----GTG--A---ATA-A--A-G-TT--G---T--------T---AAAG--AAGT-AC------TAAA--GATGCCAA-CCT-A-A-AT-TTC-AGCCGTGTA-TGT--TGG--------A---TTG
gi|24105 : TTT--T-A-------TCAG--TTTA-AC-TTTGGT---A---CCGATTT-G---T--T-TAAA---TTTATA-C--A----AAG---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAGT-AC------TAAA--GGTGCCAG-CCG-G-A-AT-TTC-AGCTATGT
gi|24108 : -CTTTC-C--TTTGGT---A---CC-A-AA-GC--T-GT-TAAA---TTCAAA-C--A----------AAGG-TTC--A---A-A-A--A-G-TT--A---T--------T---AAAG--AAAT-AC------TAAA--GGTGTCAC-CCG-A-A-AT-CCC-AGTCTTTTA-TAT--TT---------A---TTGGT--ATT----AACCT-------------G--CCAT---TTTCTGTAA
gi|24109 : TTCA-C--TTTGGT---A---AC-AAAA-T---T-AT-TGAA---GTCAGA-C--A----A-T---G----GTT--G---G-A-A--ATG-TC--A---T--------T---AAAG--AAGT-TC------TAAA--GGAGCCGC-CCA-A-A-AT-TT--AGCCTTATT-TAT--TAA--------A---TTGAT--GGT----AGCCT--G----------T--CTG----TCTCT
gi|24106 : --TTTGGT---ACCAAC-AT-------T-GT-TAAA---TCCAGA-C--A----------AAGG-TTC--A---A-A-A--G-A-TT------T--------T---AAAG--AAAT-AC------TAAA--GGTGTCAT-CCG-A-A-AT-TTC-AGCAATGTA-TGT--TGC--------A---CTGAT--ATT----AGCCT--A----------T--CAG----TCTCTGC
gi|24107 : aactttatcatc--TTTGGT---A---CC-AAAA-T---T-GT-TAAA---TCCAGA-C--A----------AGGGTTCT--A---A-A-G--A-T-T-------T--------T---AAAG--AAAT-AC-------AAA--GTTGTCAT-CCG-A-A-AT-TTC-AGCCATGTA-TGT--TGC--------A---CTGAA--ATT----AGCCT-
gi|24110 : aactttatcatcAA-T---T-AT-TAAA---TTCAGA-C--A----A-A---AG---TTC--A---A-A-G--A-G-TT--G---T--------T---GAAG--AAAC-AC------TTGA--GGTGCCAC-ACG-G-A-CT-TTC-AGCCGTGTG-TGT--TTA--------A---TTGAT--ATT----AGCTT-------------G--CCAG---TCTCTGTAAC
gi|24111 : ---T-GT-TAAAGAGTACAGA-C--A----AAT---A----TTC--A---A-A-G--A-G-TT--A---A--------T---AAAG--AAAT-AC------AAAA--AGTGTCAC-CCA-A-A-AT-TTC-ATCCGTGCA-TAT--TAC--------A---TTGAT--ATT----AGCCT-------------G--CCAG---TCTCTGTAA
gi|24112 : tT-TTAA---TTCAGA-C--A----AAG---A----TTT--A---A-A-G--A-G-TT--A---T--------A---AAAG--AAAT-AC------TAAA--GGGGCCAC-CCGAA-A-AT-TTC-AGCCATGTA-CAT--TTAATAT----A---TTGTT--ATT----AGCCT-GC-------------CCG----TCTCTGTAA
gi|24113 : AGA-C--T----T-T--------TTT--A---A-A-A--A-AGTA--A---T--------T---TAAG--AAAT-GC------TAGG--GGTACCAC-CGT-A-A-AT-TTG-AGCTGTGTG-TAT--TCA--------A---TTGTC--GTT----AGCCT-CC----------T--CCGA---TCTCTGCAACG-ATTTTGGAACGAAGCCTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGTGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGCG-CACCGCTA----T--TAA------A------T---A--T--CGGTGGACCG
gi|24057 : --A---A-A-G--A-G-TA--A---C--------T---TAAG--AAAT-AC------TAAA--GGTGCCAC-TAG-A-A-AT-TTC-AGCCGTGTA-CAT--TAT--------A---TTGCT--ATT----AGCCT-------------G--CCAG---TCTCTGTA
gi|24114 : ttattgaaattgtcatcagctttatcagctttactttttggtaccTAATCGGGTCAAAGGCACCAGTAC--CGGTGCATCGTTATT--ATATCGGTACACTGATAT-TTTTGTT-TT-----AA-CGGTG-CACCGATA--------AA------A------T---A--
gi|24115 : AAAACCCAAATATAGCGGTTCATCGTTAAAATATAGCGGTGGACCGATAAA----ATA-T------AG-AGGTG-CACCGATA----T--TAT------A------T---A--G--CGGTGCACCG
gi|24115 : GTGCACCGCTAT-ATA-------ATATCGGTGCACCTCTATATTTTAT------------CGGTC-CACCGCTATATTT--TAA-----------------------CGATGAACCG
gi|24118 : aaaacccaaatatag-------ATATCGGTGGACCGTTAAA---TAAG-T------AA-CGGTG-CACCGcg
gi|24116 : -------ATAGTGGTGCACCGATTTATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCAATA----A--CAT------A------T---A--C--CGGTGCACCttaatagcggtgcgccg
gi|24114 : -------ATATCAGTGTACCGATATA----A---T------AA-CGATG-CACCGGTA----C--T
gi|24113 : taatcgggtcaaaggcaccCGGTCCACCGATAT---TTAAT--------AG-CGGTG-CGCCGTTA----AA-TAA------AATA---T---A--T--CGGTCCACCGttttgttttaacggtgcaccgataaaata
gi|24052 : agacttttttaaaaaagtaatttaagaaatgctaggggtaccaccgtaaatttgagctgtgtgtattcaattgtcgttagcctcctccgatctctgcaacgattttggaacgaagcctctgattggctaatcccaaagaccctagtacagtggtgtgacgatagCGATGCACCGCTATATT---TT-T------AT-CGATG-CACCG--A----T--TAA------A------TAAAA--T--CGGTCCACCG
gi|24118 : ttatttaaacatgtcaacaattatataagctttactttgataccataattattaaattcagacattatttcgttagtatagaaatgctaagtgtgaccctaaatttcaactgtgtgtattgattgttattagcctcctccgatctcctccgatctctgtaatgattttggaaagaagcttttgattggctaatgccaaagatcctagtacagcagtgtgacgatagCGGTGCACCGTTAC---TTATT-T------AA-CGGTC-CACCGATA----T--TTA------A------T---A--G--CGGTGCGCCG
gi|24120 : CGGTGCACCGATATATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCGATA----A--CAT------A------T---A--C--CGGTACACCG
gi|24120 : CGGTGTACCGGTATATGTTAT------------CGGTG-CACCGTTA--------AA------ACAAATAT---A--T--CGGTGCACCG
gi|24117 : CGGTGAACCGATATA-TTTATTGT------AA-CGGTG-CACCGATA----A--CAT------A------T---A--C--CGTTGCACCG
gi|24117 : CGGTGCAACGGTATATGTTAT------------CGGTG-CACCGTTA----CAATAA------A------T---ATAT--CGGTTCACCG
gi|24119 : CGATGCACCGATATATTTGTTT-T------AA-CAGTG-CACCGATA--------AA------A------T---A--TACCGTTGCACC
gi|24121 : CGGTGGACCGTTTTTTTTTGTT-TC-----AA-CGGTG-CACCGATA--------AA------A------T---A--TACCGGTG
gi|24116 : GGTGCACCGGTATATGTTATT------------GGTG-CACCGTTA----AAACAA------A------T---AAAT--CGGTGCACC
gi|24119 : atagtGGTGCAACGGTATATTTTAT------------CGGTG-CACTGTTA--------AAACAAATA------T---A--T--CGGTGCATCG
gi|24122 : GGTGCACTGATATATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCGATA--------AA------A------TAA-A--C--CAGTGCACC
gi|24122 : GGTGCACTGGTTTATTTTAT------------CGGTG-CACCGTTA--------AAACAAATA------T---A--T--CAGTGCACC
gi|24048 : GACCAATATATTTTGCT-T------AA-CGGTG-CACCGCTA----T--TAA------A------T---A--C--CGGTGGACTG
gi|24121 : gttatttaaacttgacaccaattatatcagcttaactttggtaccataattattgaattcagacattgtttcgaaaagttattaaagaaatgctaaaagtgaccctaaatttcaaccttgtgtattgttgcttgttagcctcctctgatctttgtaatgattttggaacgaggcttttgattcACCGGTATATTTTAT------------CGGTG-CACCGTT
gi|24053 : cggtggaccgtttttttttgtttcTATCTTATT-T------AA-CGTCG-CACCGCCA----T--TAA------A------T---A--T--CGGTGGg
gi|24114 : ttatttaaagttgtcaacaattgtatcagctttattttggtaccataattataagattcagacattatttcaataagttgttaaagaaatgataggtgtgccaccctaaatttgagctttgtgtattcgtatgtcattagcctactccgatctctgcaacaattttgaaccgaagcttctgactggctaatccccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaattcTATTTTAT------------CGGTG-CACCGTTAAAACA--AAA------A------T---A--T--CAGTGTACCG
gi|24118 : taatcgggtcaaaggcaccagtaccggtgcatcgttattatat-CGGCG-CACCGCTA----T--TAA------A------T---A--T--CGGTGGACCG
Alignments
lowQualScore : 1111111 33333333333333 2222222 111111 111
lowQualScore : 0 555555 5 222 1 55555 2222222 0 00 0 0 111 5 6666 1 7777777 0 1 33 1 0 0 1111 22222222 111111 00 0 22 0 11 22222222 1111 66 111 0 44 1111 22222222222222 1 3 777 1 0000000 4 2 000000 2 2 1 8 33 111 0
lowQualScore : . ...... . ... . ..... ....... . .. . . ... . .... . ....... . . .. . . . .... ........ ...... .. . .. . .. ........ .... .. ... . .. .... .............. . . ... . ....... . . ...... . . . . .. ... .
lowQualScore : 5 000000 4 333 7 77777 7777777 6 88 6 6 000 8 6666 8 2222222 6 7 66 7 6 6 3333 11111111 888888 88 7 22 7 00 66666666 5555 44 333 7 22 6666 77777777777777 9 6 000 6 9999999 7 1 333333 1 1 0 0 11 555 7
consensus : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCAN----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTCAGA-C----A-A-N-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TANA---T-TG-NTATT----AGCCT------G-------CCGGTCTCTGTAACGATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTATTAAAT--AC--CGGTGCACCG
Reference ( family-373 ) : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCAN----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTCAGA-C----A-A-N-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TANA---T-TG-NTATT----AGCCT-C----G-------CCGGTCTCTGTAACGATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGCACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTATTAAAT--AT--CGGTGCACCG
gi|24044 : GTTATTTAA------ACTT--GTCAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-AATTT--GGTAACATAAGTAT-T-AAA---TTCAGA-C----A-T-T-A---T-T-T--A-A-AAAATA-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--GGGGTGCAAC-CCT-AAATTTGA-GCTGTG--TG--------TAT----TCAA---T-TG-GCATT----AGCCT-C----CT------CCGATCTCTGCAACGATCTTGGAACGAAGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGCG-CACCGCTATTAAAT--AT--CGGTGGACCG
gi|24045 : GTTGTTTAA------ACTT--GTTAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-C-CAA---TTCAGA-C----A-T-T-A---T-T-A--T-G-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAGTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAGTTTCA-ACTGTG--TA--------TAT----TA-A---T-TG-TTGTT----AGCCTCC----T-------CCGATCTCTGTAATGATTTTGGAATGAGGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATTCTA----AGTGGTGTGACA-------ATTGCGATGGA-CGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAAAT--AC--CAGTGGACCG
gi|24046 : GTTGTTTAA------ACTT--GTTAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-C-CAA---TTCAGA-C----A-T-T-A---T-T-A--T-G-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAGTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAGTTTCA-ACTGTG--TA--------TAT----TA-A---T-TG-TTGTT----AGCCTCC----T-------CCGATCTCTGTAATGATTTTGGAATGAGGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATTCTA----AGTGGTGTGACA-------ATTGCGATGGA-CGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAAAT--AC--CAGTGGACCG
gi|24047 : GTTATTTAT------ACTT--GTCAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-TAA---TTCAGA-T----A-T-T-A---T-TTC--G-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAA-TAC------TA--GGAATGCGAC-CGT-TAATTTGA-GCTGTG--CG--------TAT----TCAA---T-TG-TTGTT----AGCCT-C----CT------CCGATCTCTGCAACACATTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGAACAGCCGTGTGACG-------ATTGTGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-TGGTG-CACCGCTATTTAGT--AC--TGTTG
gi|24048 : GTTATTTAA------ACTT--GACACCAA----TT-------ATATCAGCTTA-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAGA-C----A-T-T-GT--T-T-C--G-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--AAAGTG--AC-CCT-AAATTTCA-ACCTTG--TG--------TAT----T--G---T-TGCTTGTT----AGCCTCC----T-------CTGATCTTTGTAATGATTTTGGAACGAGGCTTTTGATTCGACCAAT
gi|24048 : ACCAATATATTTTGCT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAAAT--AC--CGGTGGACTGatattttgcttaacggtgcaccgctattaaataccggtggactg
gi|24049 : gttatttaaacttgacaccaattatatcagcttaactttggtaccataattattgaattcagacattgtttcgaaaagttattaaagaaatgctaaaagtgaccctaaatttcaaccttgtgtattgttgcttgttagcctcctctgatctttgtaatgattttggaacgaggcttttgattcgGTTTTTTAA------ACTT--GACACCAA----TT-------ATATCATCTTA-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAGA-C----A-T-T-GT--T-T-C--G-A-AAAGTT-A----T--------TAGAGAAA
gi|24050 : GTTATTTAA------ACTT--GTCAATAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTG--TGTACCACAGTTAT-T-AAA---TTCAGA-C----A-T-T-G---T-T-A--AGA-AAAGTT-A----T--------TGAA-AAATGC------TA--GGGGTGCCACGCTT-AAA-TGCA-ACTGTG--TG--------T--------------------------------------------------TTTCTGTAATTATTTTGG-ATGAGGCTTCTGATT-GGCT
gi|24051 : TCATTTAA------ACTT--GACAATAA----ATATAAAAATTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAGA-C----A-T-T-G---T-T-TT-G-A-AAAGAT-A----T--------TAAAGAATTGC------TA--AGTGTG--AC-CCT-TAATTTCA-ACCGTG--TG--------TAT----T-GA---T-TG-TTGTT----AGCCT-C----GT------CCGATCTTTGTAATGGTTTTGAAACGAGGCTTTTGATT-GGCTAACT---CCAAAGATCCTAGTACAGTGATGTGACG-------ATAGCAGTGGACCAATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAAAT--AC--AGGTGGACCG
gi|24052 : TTATTTAA------ACAT--GTCAACAA----TT-------ATATAAGCTTT-ACTTT--GATACCATAATTAT-T-AAA---TTCAGA-C----A-T-T-A---T-TTC---------GTT-A----G--------TATAGAAATGC------TA--AGTGTG--AC-CCT-AAATTTCA-ACTGTG--TG--------TAT----T-GA---T-TG-TTATT----AGCCT-CCTCCGATCTCCTCCGATCTCTGTAATGATTTTGGAAAGAAGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATCCTAGTACAGCAGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCG----ATTTTATT-T------AATCGGTG-CATCGATA-AAAAT--ATAGCGGTGCATCG
gi|24053 : TTATTTAA------AGTT--GTCAACAA----TT-------GTATCAGCTTT-ATTTT--GGTACCATAATTAT-A-AGA---TTCAGA-C----A-T-T-AT--T-T-C--A-A-TAAGTT-G----T--------TAAAGAAATGA------TA--GGTGTGCCAC-CCT-AAATTTGA-GCTTTG--TG--------TAT----T-CG---TATG-TCATT----AGCCTAC----T-------CCGATCTCTGCAACAATTTTGAACCGAAGCTTCTGACT-GGCTAATC---CCCAAAA
gi|24053 : TATCTTATT-T------AA-CGTCG-CACCGCCATTAAAT--AT--CGGTGaaaaaaaaaaaaaaaaaaattctatcttatttaacgtcgcaccgccattaaatatcggtgga
gi|24054 : ttatttaaagttgtcaacaattgtatcagctttattttggtaccataattataagattcagacattatttcaataagttgttaaagaaatgataggtgtgccaccctaaatttgagctttgtgtattcgtatgtcattagcctactccgatctctgcaacaattttgaaccgaagcttctgactggctaatccccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaattcTTTTCTAA------A-TT--ATTAACAA----CC-------TTATCAGCTTT-ATTGT--GTTCTCAAATTTAT-T-AAA---TTCAAA-C----A-T-T-GG--T-T-C--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------CA--AAGGTGCCAC-TCA-AAATGCCA-GCCGGGTTTA--------TAC----TGAA---T-TG-ATATT----AG-CT-G----G-------CGGATCTCTGTAAga
gi|24055 : TTATTGAA------AATT--GTCATCAT----AG-------TTATCAGATTT-ACTCT--GGTACCAAA-TGAT-A-AAA---TTCAGA-A----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGTGTC-A----T--------TAAAGCAATAC------TA--CAGGTGCCAC-CCG-AAATTTAT-GCAGTG--CA--------TAT----TATA---T-TG-ATAAT----AGCCT------G-------AAAGTCTCTGCAA
gi|24056 : TTATTACA------AATA--GCCAACA-----TT-------TTAACAGCTTT-ACTTT--GGTACAAAAGTTAT-T-AAA---TTAAGG-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAACTAC------TT--AAGGTTCCAC-CCA-AAATTTCA-G--GTG--TA--------TAT----TACA---C-TG-ATATT----AACC
gi|24057 : TTATTGAA------A-TT--GTCATCAG----CT-------TTATCAGCTTT-ACTTTTTGGTACCAAA------------------------------------------------GAGTA-A----C--------TTAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-TAG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT------G-------CCAGTCTCTGTA
gi|24058 : TATTTAATTCCTTACTTTTGTTAACAG----TT-------TTATCTGCTTT-ACTTC--GGTATCATAACTAT-T-ATA---TTCAGA-C----A-A---A---T-T----A-A-AG-GTTAA----A--------AAAAGAAATAC------TA--TATGTGTCAT-CCT-AAATTTCA-GGAACG--TA--------TAT----TAAA---T-TA-AT
gi|24059 : ATTGGA------AATT---TCACCAA----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-TCA---TTCAGA-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-G----T--------AAAAGAATTAC------TG--AAGGTGCCAC-CCA-AAATTTCA-GTTTTG--CA--------CAT----TATA---C-TG-CTATT----ATCCT------G-------CCAGTCTCTtgt
gi|24060 : ATTGAA------AATA--GTCAATAT----CG-------GT-TCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAAGTAT-T-AAG---TTCTGA-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-ATAGTT-A----G--------TAAAAAAATAC------AT--AATGTGCAAC-CCG-AAACTTCA-GCCGTT--TA--------TGC----TTAA---T-TG-ATATT----AGCCT------G-------TCAATCTCTATAA
gi|24061 : ATTGGA------AATA--GTCA-CAG----TTG------CTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-TAA---TTTAGG-C----A-A-AGA---T-T-C--A-G-AGAGTT-A----A--------TAAATGAATAC------TA--AAAGTGTCAC-CCG-AAACTTCA-GCCATG--TA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT------G-------CCAATCTC
gi|24062 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAGACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTG-CA------------------GTG--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-T------------CCAGTCTCTGTAA
gi|24063 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACAAAACTTGT-T-AAA---TTCAGACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T-----------AGAAATAC------TA--AAAGTG-CA------------------GTG--GA--------CAT----TAAA---T-TG-CTATT----AGCCT------G-------CCAGTCTCTGTAA
gi|24064 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAGACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGT-------------------GCCGTG--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT------G-------CCAGTCTCTGTAA
gi|24065 : ATTTGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAGACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGCG
gi|24066 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TAATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAGACC----A-A-G-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TT--AAAGTGCCA-------------------TG--GA--------CAT----TAAA---G-TG-CTATT----AGCCT------G-------CCAGTCTCTGTAA
gi|24067 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTA-CAAAATTGT-T-AAA---TTCAGG-CT---A-A-A-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTGC
gi|24068 : TTTAA------A-TA--GTCAACA-----TT-------TTAACAGCTTT-CCTTT--GGTATCAACATTAT-T-AAA---TTCAGA-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-AGAGTA-A----T--------TTAAGAAATAC------TA--AAGATACTAC-CCA-AAATTTCT-GCTGCG--TA--------TGT----TGAA---T-TG-ATATT----AGCCT-
gi|24069 : ATGAGCTTT-ACAAT--GGCACCAAAATTAT-T-TTA---TTCAGA-C----ACA-T-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAACA-----------------------CG-AAATTTCA-GCCATG--TA--------CAT----T-TA---T-TG-CTATT----AGCC--C----G-------CCAGTATCTGTAA
gi|24070 : tttaaatttaaagaaTTAA------AATG--GTTATTAT----TT-------AAATCAGCTTT-ACCTT--GGTACCGAAATAAT-T-AAA---ATCAGA-C----A-A-AGA---T-T-T--A----GAGTT-A----T--------TAAAACAATAC------TA--AAGGCGCTAC-CTA-TAACTTCA-ACCGTG--TA--------TAT----TACA---T-TGCCTGTC----AGTCT-
gi|24071 : TAA------ACTT--ATTGATATATATTT-------TT-----CTTT-ACTTT--GGTACCA--------T-AA----TTCAGA-C----A-T-T-G---T-T-TTTA-A-A-AGTC-A----T--------TGAAGAAATGC------TC--AGGGTGCCAC-ACT-AAGTTTCA-GCTGTA--TG--------TAT----TAAA---T-TG-TTGTTTAATAGCCT-CC---G-------CCAATCTCTGCAATGATTTTGAAACGAAGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTAGAGCGGTGTGATG-------ATAGCGGTGCACCGATATATTTTATT-TCGGGTCCA-TGATGACATCGCAATTAAA
gi|24072 : TAAC-----ACAT--GTCAACAT----TG-------TTGTCAGCATT-ACCTC--GGTACCAAAGTTAT-T-GAA---TTCAGA-C----A-ATG-G---T-T-C--A-A-AGCGTT-A----A--------TAAACAAAAAC------TA--AATGTGCCA
gi|24073 : AA------AGTA--GTCATCAT----AT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GATACTAAAATTAT-T-CAA---TTCAGA-T----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TGAAGCAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTGA-GCCGTG--TA--------GAT----TATA---T-TG-ATTTT----AGCCT------G-------CCAGTCTCTGttttatatt
gi|24074 : A------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAGAATTGT-T-AAA---TTCAGACC----A-A-G-A---T-T-C-------GAGTT-A----T--------AATAGAAATAC------TA--AAAGT-------------------GCCGTG--GA--------TAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT------G-------CCAGTTTCTGTAA
gi|24075 : A------ATTG--GTCATCTT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCCCCAAAATTGT-T-AAA---TTCAGACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTGC
gi|24076 : T--GTCATCAG----TT-------CTAACAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAATACAT-T-TCA---TTCAGA-C----A-A-G-----------------GAGTA-A----T--------TAAAGAAATAA------CA--AATATGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------CAT----TATA---T-TA-CTCTA----AGCCT-T------------CCAGTC
gi|24077 : T--GTCAGCAT----TT-------TTACCAGCTTA-ACTT------ACCAAAAATATGT-AAA---C-CAGA-C----A-C-A-G---T-T-TTAA-A-AGTGTT-A----T--------TTAAGAAATGC------TA--TAAGTGCCA--CTG-ATAGTTCA-GCC------A--------TCT----TAAA---T-TG-ATATT----AGCCT--------------CCGATCTCTGTA
gi|24078 : T--GTCATTAG----TT-------TTATCAGCTTT-AC----------CAAAATTAT-T-TCA---TTCAGA-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGACAC-CCG-AAATTTCA-GCCATG--TA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-
gi|24079 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTTCCAAGATCAT-T-AAA---CTCAGACC----A-A-A-A---T-T-T--A-A-AGGGTT-A----T--------T-AAGAAATTCTAAATTTA--AAGGTGCAAC-CCG-CAATTTCA-GCC
gi|24080 : --GTCAACAT----TT-------TTATCAGCTTT-GCTTT--GGTACCAAAATT-T-T-AAA---TTAAAT-CA---A-A-G-G---T-T-G--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-TCG-AAATTTCA-GCTTTG--TA--------TAT----TAAA---T-TG-ATATT----AGCCT-T----A--------CAATGTCTGTAAnnnnnnnnnnaa
gi|24081 : --GTCAAAAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAGTTAT-T-AAA---TTCAGA-A----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TG--AAGGTGCCAC-CTG-AAA-TTCA-GCTTTG--TA--------TAT----TGCA---T-TG-GTATT----AGC
gi|24082 : --GTCAACAG----TT-------TTATCAGCCTT-ACATT--GGTACCAAAATTAT-T-TAA---TTCAGA-C----A-A-A-G---G-T-TAAA-A-AGAGTT-A----T--------TAAACAAACAC------TA--AA
gi|24083 : --GTCAGCAA----TT-------TTATCAGCTTT-TATCT--GATAT---AA-------AAA---TTCAGA-C----A-A-A-GG--T-T-C--A----GAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAC-CAG-TAATTTCA-GCTGTG--TA--------TAT----TGAA---T-TG-ATATT----AGCCT------G-------CCAGTCTTTGTAAttcaaatgaaatgcaattgtcctgttaaccttactccatttatgca
gi|24084 : --GTCATCAT----TT-------GTATCAGCATT-ACGTT--AGTACCAAAAGTAT-A-AGC---TTCAAA-C----AGA-G-A---T-T-C--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAAATC------TG--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTCA-ACCGTT--TATATACACGTAT----TGTA---T-TG-ATATT----AGCGT-G----T-------CCAGTCTCTGTAA
gi|24085 : --GTCAAAAT----TT-------CTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTTT-C-AAA---TTCAGA------------------------------------------------TAAAGGAATAC------TT--AATGTGCCGC-CCG-AAATTTCA-GTCTTG--TA--------TAT----TGAA---T-TG-AAATT----AGCCT------G-------CTGGTCACTG
gi|24086 : --GTAAACAA----TT-------TCATCAGCTTT-ACTTT--GATACCAAAATTAT-C-AAA---TTCTGA-CT---A-A-G-T---T-T-C--A-A-TGAGAT-A----C---------------ATAG------TT--AAGTTCCCAT-CTC-AAATGTCA-GCCATG--TA--------TGA----TAAA---T-CG-GTATA----AGCCT-G----A-------CCAATCTATGCAA
gi|24087 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTACCAAAGGTAT-T-TAA---TTCAGA-C----A-A-A-T---T-T-T--ATA-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAAGTG
gi|24088 : --GTCAACA-----TC-------TTATTAGCCTT-GTTTT--GGTATCGGAACTAT-T-AAA---TTCAGA-CTATTA-A-G-G---T-T-C--A-A-AG----------------------AAAAATAC------TA--CAGGTGCCAT-CCG-AAATATTATGCC-T---TA--------TAT----TCTG---T-TG----------AGTCT------G-------CCAGTCTCTGTAA
gi|24089 : --GTTAATAT----TT-------GTGTTAGGTTTCACTTT--ACCACAAAAATTCT-T-AAA---TTCTGA-C----A-A-T-GG--T-T-T--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--ATGGTGCCAT-CCG-AATTTTCA-ACTACG--TA--------CAA----TAAA---T-TG-
gi|24090 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGCGTT-ATTTT--CATATCAACATTAT-C-AAA---TTCAGA-CA---A-A-T-A---T-T-C--A-A-AAAGTT-A----T--------AAAAGAAAATC------TA--AAGGTGC
gi|24091 : --GTCAACAA----TT-------GTATCAGCTTT-ACATT--GTCACAATAATTGT-T-AAA---TTCCAA-CA---A-A-T-A---T-T----A-A-AG-GTT-AAAGGT--------TAAAG
gi|24092 : --GTCATCAC----TT-------TTATCAGC-TT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAGACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--A--GTGCccagaa
gi|24093 : TCAATA-----TT-------TTATCAGGTAT-ACTTC--GGTAGCAAAATTAT-T-AAA---TTCAGA-C----A-A-A-G---TAT-C--A-A-AGAGTC-A----TCATTAAAATAAAGAGACAT------TA--AAGGCACCGC-TCA-AAATTTCA-GGTGTG--TA--------TGT----TGAA---C-TG-ATATA----AACCT------G-------CCGATCTCTGTAA
gi|24094 : AACA-----TT-------TTATCATTTTT-ACGTT--GGTACCAATATTAT-T-AAA---TTCAGA-CA---A-A-G-G---T-T-T--A-A-AAATTT-T----T--------TAACAAAA----------A--AA--T-CTAC-CTG-AAATTTAA-GACATG------------TAT----TGAA---T-TG-ATATT----AGGCT------G-------TCAATCTCTGCAA
gi|24095 : tcaTCGACAA----TT-------T-ATCAGCTTT-AATTT--GATTCCATCCTTAC-T-AAA---TTCAGA-C----ATT-G-A---T-T-G--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAA
gi|24096 : TCAACAT----TT-------TTGTCAGCTTC-ACTTT--AGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTAAGA-
gi|24097 : CAACAT----TT-------TTATTAGCTTT-ACTTT--GGTACCATATTTAT-T-AAG---TTTAGA-A----A-A-A-AAGTT-T-C--A-gcatt
gi|24098 : AATAA----TG-------TTAACAGCTTT-GCTTT--GGTATCAAGATTAT-T-GAA---TTCAGA-CAATGA-A-A-A---T-GAC--ACA-AAAGTT-A----T--------AAAATAAATGC------TATGATGGTGCCAC-CTG-AAACTTCA-GACATA--CA--------TAC----TGAATATT-TG-ATATG----AACC--C----G-------TGGATCTCTGTAAtcaaataag
gi|24099 : CAA----TT-------TTATCTGTTTT-ATTTT--GGTACCAATAGTAT-T-TAA---TTCAGA-C----A-A-AGA---T-T-C--G-A-AGAATT-A----A--------TAAAGAAATAC------TA--AAAGTGCCAT-TAG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT------G-------CCTGTCTCTGTAA
gi|24100 : CAT----TT-------GTATCAGCTTT-ACTTT--TATACCACAATTAT-C-AAA---TTTAGA-A----A-A-G-A---T-T-C--A-A-ATACTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--TTGATGCCAC-GCG-CAATTTCA-GCCGTG--TA---------------------------CT-TT----AGCCT------G-------CCAGTCTCTGTAA
gi|24101 : CAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAGACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------CA--ACAGT-------------------GCCGTT--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT------G-------CCAGTCTCTGTAA
gi|24102 : ----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAATTTAA-T-AAA---TTCAAA-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----C--------TAAATAAATAC------TA--GAGGTGCCAC-CCT-GAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----CATA---T-CG----------AGCCT------G-------CCAGTCTCTGTAA
gi|24103 : ----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-C-AAA---TTCAGA-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTCA-GTCGTG--CA--------CAT----TATA---C-TG-CTATT----ACCCT------G-------CCAGTCTCTGTAA
gi|24104 : ----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GATGTCAACATTAT-T-ATA---TTCAAA-C----A-C-C-T---G-T-G--A-ATAAAGTT-G----T--------TAAAGAAGTAC------TA--AAGATGCCAA-CCT-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TGT----TGGA---T-TG-
gi|24105 : ----TT-------TTATCAGTTTA-ACTTT--GGTACCGAT-TTGT-TTAAA---TTTATA-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAGTAC------TA--AAGGTGCCAG-CCG-GAATTTCA-GCTATG--T
gi|24106 : AA----CT-------TTATCA----T--CTTT--GGTACCAACATTGT-T-AAA---TCCAGA-CA---A-A-G-G---T-T-C--A-A-AAGATT------T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAT-CCG-AAATTTCA-GCAATG--TA--------TGT----TGCA---C-TG-ATATT----AGCCT------A-------TCAGTCTCTG
gi|24107 : AA----CT-------TTATCA----T--CTTT--GGTACCAAAATTGT-T-AAA---TCCAGA-C----A-AGG-G---T-T-CT-A-A-AGA-TT------T--------TAAAGAAATAC-------A--AAGTTGTCAT-CCG-AAATTTCA-GCCATG--TA--------TGT----TGCA---C-TG-AAATT----AGCCT-c
gi|24108 : CTTT-CCTTT--GGTACCAAAGCTGT-T-AAA---TTCAAA-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAC-CCG-AAATCCCA-GTCTTT--TA--------TAT----T-TA---T-TG-GTATT----AACCT------G-------CCATTTTCTGTAA
gi|24109 : TTC-ACTTT--GGTAACAAAATTAT-T-GAA---GTCAGA-C----A-ATG-G---T-T-G--G-A-AATGTC-A----T--------TAAAGAAGTTC------TA--AAGGAGCCGC-CCA-AAATTT-A-GCCTTA--TT--------TAT----TAAA---T-TG-ATGGT----AGCCT------G-------TCTGTCTCT
gi|24110 : AATTAT-T-AAA---TTCAGA-C----A-A-A-AG--T-T-C--A-A-AGAGTT-G----T--------TGAAGAAACAC------TT--GAGGTGCCAC-ACG-GACTTTCA-GCCGTG--TG--------TGT----TTAA---T-TG-ATATT----AG-CT-T----G-------CCAGTCTCTGTAAC
gi|24111 : TTGT-T-AAAGAGTACAGA-C----A-A-ATA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----A--------TAAAGAAATAC------AA--AAAGTGTCAC-CCA-AAATTTCA-TCCGTG--CA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT------G-------CCAGTCTCTGTAA
gi|24112 : T-T-TAA---TTCAGA-C----A-A-AGA---T-T-T--A-A-AGAGTT-A----T--------AAAAGAAATAC------TA--AAGGGGCCAC-CCGAAAATTTCA-GCCATG--TA--------CATTTAATATA---T-TG-TTATT----AGCCT------G-------CCCGTCTCTGTAA
gi|24113 : ---T-T-A--A-A-AAAGTA-A----T--------TTAAGAAATGC------TA--GGGGTACCAC-CGT-AAATTTGA-GCTGTG--TG--------TAT----TCAA---T-TG-TCGTT----AGCCT-C----CT------CCGATCTCTGCAACGATTTTGGAACGAAGCCTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGTGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGCG-CACCGCTATTAAAT--AT--CGGTGGACCG
gi|24114 : agacttttTAATCGGGTCAAAGGCACCAGTAC--CGGTGCATCGTTATT--ATATCGGTACACTGATAT-TTTTGTT-TT-----AA-CGGTG-CACCGATA--AAAT--A
gi|24115 : AAAACCCAAATATAGCGGTTCATCGTTAAAATATAGCGGTGGACCGATAAA----ATA-T------AG-AGGTG-CACCGATATTATAT--AG--CGGTGCACCG
gi|24116 : -------ATAGTGGTGCACCGATTTATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCAATAACATAT--AC--CGGTGCACC
gi|24117 : CGGTGAACCGATATA-TTTATTGT------AA-CGGTG-CACCGATAACATAT--AC--CGTTGCACCG
gi|24118 : CGGTGCACCGTTAC---TTATT-T------AA-CGGTC-CACCGATATTTAAT--AG--CGGTGCGCCG
gi|24119 : CGATGCACCGATATATTTGTTT-T------AA-CAGTG-CACCGATA--AAAT--ATACCGTTGCACC
gi|24120 : CGGTGCACCGATATATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCGATAACATAT--AC--CGGTACACCG
gi|24121 : CGGTGGACCGTTTTTTTTTGTT-TC-----AA-CGGTG-CACCGATA--AAAT--ATACCGGTG
gi|24122 : GGTGCACTGATATATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCGATA--AAATAAAC--CAGTGCACC
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111111111 2222222 111111
lowQualScore : 0 555555 5 222 1 55555 2222222 0 00 0 0 111 0 5 6666 1 7777777 0 1 33 1 0 0 1111 22222222 111111 00 0 22 0 11 22222222 1111 66 111 0 33 1111 0000000000000 33 3333 3 777 1 0000000 0 2 000000 2 2 1 4 2 33 0
lowQualScore : . ...... . ... . ..... ....... . .. . . ... . . .... . ....... . . .. . . . .... ........ ...... .. . .. . .. ........ .... .. ... . .. .... ............. .. .... . ... . ....... . . ...... . . . . . .. .
lowQualScore : 5 000000 4 333 7 77777 7777777 6 88 6 6 000 6 8 6666 8 8888888 6 2 00 7 6 6 3333 11111111 888888 88 7 22 7 00 66666666 5555 44 333 7 77 6666 2222222222222 55 5555 6 000 6 9999999 6 1 333333 1 1 0 4 1 11 7
consensus : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCAN----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-N-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TANA---T-TG-NTATT----AGCCT-----G-------C--C---GGTCTCTGTAACGATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTATTAA-AT--ACCGGTGCACCG
Reference ( family-373 ) : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCAN----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-N-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TANA---T-TG-NTATT----AGCCT-----G-------C--C---GGTCTCTGTAACGATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTATTAA-AT--ACCGGTGCACCG
gi|24044 : GTTATTTAA------ACTT--GTCAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-AATTT--GGTAACATAAGTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-T-T-A---T-T-T--A-A-AAAATA-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--GGGGTGCAAC-CCT-AAATTTGA-GCTGTG--TG--------TAT----TCAA---T-TG-GCATT----AGCCT-----C-------CTCC---GATCTCTGCAACGATCTTGGAACGAAGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGCG-CACCGCTATTAA-AT--ATCGGTGGACCG
gi|24045 : GTTGTTTAA------ACTT--GTTAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-C-CAA---TTCAG-A-C----A-T-T-A---T-T-A--T-G-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAGTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAGTTTCA-ACTGTG--TA--------TAT----TA-A---T-TG-TTGTT----AGCCTCC---T-------C--C---GATCTCTGTAATGATTTTGGAATGAGGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATTCTA----AGTGGTGTGACA-------ATTGCGATGGA-CGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACCAGTGGACCG
gi|24046 : GTTGTTTAA------ACTT--GTTAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-C-CAA---TTCAG-A-C----A-T-T-A---T-T-A--T-G-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAGTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAGTTTCA-ACTGTG--TA--------TAT----TA-A---T-TG-TTGTT----AGCCTCC---T-------C--C---GATCTCTGTAATGATTTTGGAATGAGGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATTCTA----AGTGGTGTGACA-------ATTGCGATGGA-CGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACCAGTGGACCG
gi|24047 : GTTATTTAT------ACTT--GTCAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-TAA---TTCAG-A-T----A-T-T-A---T-TTC--G-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAA-TAC------TA--GGAATGCGAC-CGT-TAATTTGA-GCTGTG--CG--------TAT----TCAA---T-TG-TTGTT----AGCCT-----C-------CTCC---GATCTCTGCAACACATTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGAACAGCCGTGTGACG-------ATTGTGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-TGGTG-CACCGCTATTTA-GT--ACTGTTG
gi|24048 : GTTATTTAA------ACTT--GACACCAA----TT-------ATATCAGCTTA-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-T-T-GT--T-T-C--G-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--AAAGTG--AC-CCT-AAATTTCA-ACCTTG--TG--------TAT----T--G---T-TGCTTGTT----AGCCT-------------C--CTCTGATCTTTGTAATGATTTTGGAACGAGGCTTTTGATTCGACCAAT
gi|24048 : GACCAATATATTTTGCT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACCGGTGGACTGatattttgcttaacggtgcaccgctattaaataccggtggactg
gi|24049 : gttatttaaacttgacaccaattatatcagcttaactttggtaccataattattgaattcagacattgtttcgaaaagttattaaagaaatgctaaaagtgaccctaaatttcaaccttgtgtattgttgcttgttagcctcctctgatctttgtaatgattttggaacgaggcttttgattcGTTTTTTAA------ACTT--GACACCAA----TT-------ATATCATCTTA-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-T-T-GT--T-T-C--G-A-AAAGTT-A----T--------TAGAGAAA
gi|24050 : GTTATTTAA------ACTT--GTCAATAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTG--TGTACCACAGTTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-T-T-G---T-T-A--AGA-AAAGTT-A----T--------TGAA-AAATGC------TA--GGGGTGCCACGCTT-AAA-TGCA-ACTGTG--TG--------T------------------------------------------------------TTTCTGTAATTATTTTGG-ATGAGGCTTCTGATT-GGCT
gi|24051 : TCATTTAA------ACTT--GACAATAA----ATATAAAAATTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-T-T-GT--T-T-T--G-A-AAAGAT-A----T--------TAAAGAATTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-TAATTTCA-ACCGTG--TG--------TAT----T-GA---T-TG-TTGTT----AGCCTC----GT------C--C---GATCTTTGTAATGGTTTTGAAACGAGGCTTTTGATT-GGCTAACT---CCAAAGATCCTAGTACAGTGATGTGACG-------ATAGCAGTGGACCAATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACAGGTGGACCG
gi|24052 : TTATTTAA------ACAT--GTCAACAA----TT-------ATATAAGCTTT-ACTTT--GATACCATAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-T-T-AT--T-T-C---------GTT-A----G--------TATAGAAATGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAATTTCA-ACTGTG--TG--------TAT----T-GA---T-TG-TTATT----AGCCTCCTCCGATCTCCTC--C---GATCTCTGTAATGATTTTGGAAAGAAGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATCCTAGTACAGCAGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCG----ATTTTATT-T------AATCGGTG-CATCGATAAAAATAT--AGCGGTGCATCG
gi|24053 : TTATTTAA------AGTT--GTCAACAA----TT-------GTATCAGCTTT-ATTTT--GGTACCATAATTAT-A-AGA---TTCAG-A-C----A-T-T-AT--T-T-C--A-A-TAAGTT-G----T--------TAAAGAAATGA------TA--GGTGTGCCAC-CCT-AAATTTGA-GCTTTG--TG--------TAT----T-CG---TATG-TCATT----AGCCT-----ACT-----C--C---GATCTCTGCAACAATTTTGAACCGAAGCTTCTGACT-GGCTAATC---CCCAAAA
gi|24053 : TATCTTATT-T------AA-CGTCG-CACCGCCATTAA-AT--ATCGGTGaaaaaaaaaaaaaaaaaaattctatcttatttaacgtcgcaccgccattaaatatcggtgga
gi|24054 : ttatttaaagttgtcaacaattgtatcagctttattttggtaccataattataagattcagacattatttcaataagttgttaaagaaatgataggtgtgccaccctaaatttgagctttgtgtattcgtatgtcattagcctactccgatctctgcaacaattttgaaccgaagcttctgactggctaatccccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaattcTTTTCTAA------A-TT--ATTAACAA----CC-------TTATCAGCTTT-ATTGT--GTTCTCAAATTTAT-T-AAA---TTCAA-A-C----A-T-T-GG--T-T-C--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------CA--AAGGTGCCAC-TCA-AAATGCCA-GCCGGGTTTA--------TAC----TGAA---T-TG-ATATT----AGCTG-----G-------C--G---GATCTCTGTAAga
gi|24055 : TTATTGAA------AATT--GTCATCAT----AG-------TTATCAGATTT-ACTCT--GGTACCAAA-TGAT-A-AAA---TTCAG-A-A----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGTGTC-A----T--------TAAAGCAATAC------TA--CAGGTGCCAC-CCG-AAATTTAT-GCAGTG--CA--------TAT----TATA---T-TG-ATAAT----AGCCT-----G-------A--A---AGTCTCTGCAA
gi|24056 : TTATTACA------AATA--GCCAACA-----TT-------TTAACAGCTTT-ACTTT--GGTACAAAAGTTAT-T-AAA---TTAAG-G-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAACTAC------TT--AAGGTTCCAC-CCA-AAATTTCA-G--GTG--TA--------TAT----TACA---C-TG-ATATT----AACC
gi|24057 : TTATTGAA------A-TT--GTCATCAG----CT-------TTATCAGCTTT-ACTTTTTGGTACCAAA-------------------------------------------------GAGTA-A----C--------TTAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-TAG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTA
gi|24058 : TATTTAATTCCTTACTTTTGTTAACAG----TT-------TTATCTGCTTT-ACTTC--GGTATCATAACTAT-T-ATA---TTCAG-A-C----A-A---A---T-T----A-A-AG-GTTAA----A--------AAAAGAAATAC------TA--TATGTGTCAT-CCT-AAATTTCA-GGAACG--TA--------TAT----TAAA---T-TA-AT
gi|24059 : ATTGGA------AATT---TCACCAA----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-TCA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-G----T--------AAAAGAATTAC------TG--AAGGTGCCAC-CCA-AAATTTCA-GTTTTG--CA--------CAT----TATA---C-TG-CTATT----ATCCT-----G-------C--C---AGTCTCTtgt
gi|24060 : ATTGAA------AATA--GTCAATAT----CG-------GT-TCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAAGTAT-T-AAG---TTCTG-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-ATAGTT-A----G--------TAAAAAAATAC------AT--AATGTGCAAC-CCG-AAACTTCA-GCCGTT--TA--------TGC----TTAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------T--C---AATCTCTATAA
gi|24061 : ATTGGA------AATA--GTCA-CAG----TTG------CTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-TAA---TTTAG-G-C----A-A-AGA---T-T-C--A-G-AGAGTT-A----A--------TAAATGAATAC------TA--AAAGTGTCAC-CCG-AAACTTCA-GCCATG--TA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---AATCTC
gi|24062 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTG-CA------------------GTG--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----T-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24063 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACAAAACTTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T-----------AGAAATAC------TA--AAAGTG-CA------------------GTG--GA--------CAT----TAAA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24064 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGT-------------------GCCGTG--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24065 : ATTTGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGCG
gi|24066 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TAATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TT--AAAGTGCCA-------------------TG--GA--------CAT----TAAA---G-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24067 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTA-CAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-G-CT---A-A-A-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTGC
gi|24068 : TTTAA------A-TA--GTCAACA-----TT-------TTAACAGCTTT-CCTTT--GGTATCAACATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-AGAGTA-A----T--------TTAAGAAATAC------TA--AAGATACTAC-CCA-AAATTTCT-GCTGCG--TA--------TGT----TGAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----
gi|24069 : ATGAGCTTT-ACAAT--GGCACCAAAATTAT-T-TTA---TTCAG-A-C----ACA-T-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAACAC-----------------------G-AAATTTCA-GCCATG--TA--------CAT----T-TA---T-TG-CTATT----AGCCC-----G-------C--C---AGTATCTGTAA
gi|24070 : tttaaatttaaagaaTTAA------AATG--GTTATTAT----TT-------AAATCAGCTTT-ACCTT--GGTACCGAAATAAT-T-AAA---ATCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-T--A----GAGTT-A----T--------TAAAACAATAC------TA--AAGGCGCTAC-CTA-TAACTTCA-ACCGTG--TA--------TAT----TACA---T-T------------GCCT-----G-------T--C---AGTCT
gi|24071 : TAA------ACTT--ATTGATATATATTT-------TT-----CTTT-ACTTT--GGTACCA--------T-AA----TTCAG-A-C----A-T-T-G---T-T-TTTA-A-A-AGTC-A----T--------TGAAGAAATGC------TC--AGGGTGCCAC-ACT-AAGTTTCA-GCTGTA--TG--------TAT----TAAA---T-TG-TTGTTTAATAGCCTCC---G-------C--C---AATCTCTGCAATGATTTTGAAACGAAGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTAGAGCGGTGTGATG-------ATAGCGGTGCACCGATATATTTTATT-TCGGGTCCA-TGATGACATCGCAATTAA-A
gi|24072 : TAAC-----ACAT--GTCAACAT----TG-------TTGTCAGCATT-ACCTC--GGTACCAAAGTTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-ATG-G---T-T-C--A-A-AGCGTT-A----A--------TAAACAAAAAC------TA--AATGTGCCA
gi|24073 : AA------AGTA--GTCATCAT----AT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GATACTAAAATTAT-T-CAA---TTCAG-A-T----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TGAAGCAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTGA-GCCGTG--TA--------GAT----TATA---T-TG-ATTTT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGttttatatt
gi|24074 : A------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAGAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C-------GAGTT-A----T--------AATAGAAATAC------TA--AAAGT-------------------GCCGTG--GA--------TAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTTTCTGTAA
gi|24075 : A------ATTG--GTCATCTT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCCCCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTGC
gi|24076 : T--GTCATCAG----TT-------CTAACAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAATACAT-T-TCA---TTCAG-A-C----A-A-G-----------------GAGTA-A----T--------TAAAGAAATAA------CA--AATATGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------CAT----TATA---T-TA-CTCTA----AGCCT-----T-------C--C---AGTC
gi|24077 : T--GTCAGCAT----TT-------TTACCAGCTTA-ACTT------ACCAAAAATATGT-AAA---C-CAG-A-C----A-C-A-G---T-T-TTAA-A-AGTGTT-A----T--------TTAAGAAATGC------TA--TAAGTGCCA--CTG-ATAGTTCA-GCC------A--------TCT----TAAA---T-TG-ATATT----AGCCT-------------C--C---GATCTCTGTA
gi|24078 : T--GTCATTAG----TT-------TTATCAGCTTT-AC----------CAAAATTAT-T-TCA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGACAC-CCG-AAATTTCA-GCCATG--TA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----
gi|24079 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTTCCAAGATCAT-T-AAA---CTCAG-ACC----A-A-A-A---T-T-T--A-A-AGGGTT-A----T--------T-AAGAAATTCTAAATTTA--AAGGTGCAAC-CCG-CAATTTCA-GCC
gi|24080 : --GTCAACAT----TT-------TTATCAGCTTT-GCTTT--GGTACCAAAATT-T-T-AAA---TTAAA-T-CA---A-A-G-G---T-T-G--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-TCG-AAATTTCA-GCTTTG--TA--------TAT----TAAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----T-------A--C---AATGTCTGTAAnnnnnnnnnnaa
gi|24081 : --GTCAAAAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAGTTAT-T-AAA---TTCAGAA-A----A-A-G-G---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TG--AAGGTGCCAC-CTG-AAA-TTCA-GCTTTG--TA--------TAT----TGCA---T-TG-GTATT----AGC
gi|24082 : --GTCAACAG----TT-------TTATCAGCCTT-ACATT--GGTACCAAAATTAT-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-A-G---G-T-TAAA-A-AGAGTT-A----T--------TAAACAAACAC------TA--AA
gi|24083 : --GTCAGCAA----TT-------TTATCAGCTTT-TATCT--GATAT---AA-------AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A----GAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAC-CAG-TAATTTCA-GCTGTG--TA--------TAT----TGAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTTTGTAAttcaaatgaaatgcaattgtcctgttaaccttactccatttatgca
gi|24084 : --GTCATCAT----TT-------GTATCAGCATT-ACGTT--AGTACCAAAAGTAT-A-AGC---TTCAA-A-C----AGA-G-A---T-T-C--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAAATC------TG--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTCA-ACCGTT--TATATACACGTAT----TGTA---T-TG-ATATT----AGCGT-----GT------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24085 : --GTCAAAAT----TT-------CTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTTT-C-AAA---TTCAG-A------------------------------------------------TAAAGGAATAC------TT--AATGTGCCGC-CCG-AAATTTCA-GTCTTG--TA--------TAT----TGAA---T-TG-AAATT----AGCCT-----G-------C--T---GGTCACTG
gi|24086 : --GTAAACAA----TT-------TCATCAGCTTT-ACTTT--GATACCAAAATTAT-C-AAA---TTCTG-A-CT---A-A-G-T---T-T-C--A-A-TGAGAT-A----C---------------ATAG------TT--AAGTTCCCAT-CTC-AAATGTCA-GCCATG--TA--------TGA----TAAA---T-CG-GTATA----AGCCT-----GA------C--C---AATCTATGCAA
gi|24087 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTACCAAAGGTAT-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-A-T---T-T-T--ATA-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAAGTG
gi|24088 : --GTCAACA-----TC-------TTATTAGCCTT-GTTTT--GGTATCGGAACTAT-T-AAA---TTCAG-A-CTATTA-A-G-G---T-T-C--A-A-AG----------------------AAAAATAC------TA--CAGGTGCCAT-CCG-AAATATTATGCC-T---TA--------TAT----TCTG---T-TG----------AGTCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24089 : --GTTAATAT----TT-------GTGTTAGGTTTCACTTT--ACCACAAAAATTCT-T-AAA---TTCTG-A-C----A-A-T-GG--T-T-T--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--ATGGTGCCAT-CCG-AATTTTCA-ACTACG--TA--------CAA----TAAA---T-TG-
gi|24090 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGCGTT-ATTTT--CATATCAACATTAT-C-AAA---TTCAG-A-CA---A-A-T-A---T-T-C--A-A-AAAGTT-A----T--------AAAAGAAAATC------TA--AAGGTGC
gi|24091 : --GTCAACAA----TT-------GTATCAGCTTT-ACATT--GTCACAATAATTGT-T-AAA---TTCCA-A-CA---A-A-T-A---T-T----A-A-AG-GTT-AAAGGT--------TAAAG
gi|24092 : --GTCATCAC----TT-------TTATCAGCTT--ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--A--GTGCccagaa
gi|24093 : TCAATA-----TT-------TTATCAGGTAT-ACTTC--GGTAGCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-G---TAT-C--A-A-AGAGTC-A----TCATTAAAATAAAGAGACAT------TA--AAGGCACCGC-TCA-AAATTTCA-GGTGTG--TA--------TGT----TGAA---C-TG-ATATA----AACCT-----G-------C--C---GATCTCTGTAA
gi|24094 : AACA-----TT-------TTATCATTTTT-ACGTT--GGTACCAATATTAT-T-AAA---TTCAG-A-CA---A-A-G-G---T-T-T--A-A-AAATTT-T----T--------TAACAAAA----------A--AA--T-CTAC-CTG-AAATTTAA-GACATG------------TAT----TGAA---T-TG-ATATT----AGGCT-----G-------T--C---AATCTCTGCAA
gi|24095 : tcaTCGACAA----TT-------T-ATCAGCTTT-AATTT--GATTCCATCCTTAC-T-AAA---TTCAG-A-C----ATT-G-A---T-T-G--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAA
gi|24096 : TCAACAT----TT-------TTGTCAGCTTC-ACTTT--AGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTAAG-A-
gi|24097 : CAACAT----TT-------TTATTAGCTTT-ACTTT--GGTACCATATTTAT-T-AAG---TTTAG-A-A----A-A-A-AAGTT-T-C--A-gcatt
gi|24098 : AATAA----TG-------TTAACAGCTTT-GCTTT--GGTATCAAGATTAT-T-GAA---TTCAG-A-CAATGA-A-A-A---T-GAC--ACA-AAAGTT-A----T--------AAAATAAATGC------TATGATGGTGCCAC-CTG-AAACTTCA-GACATA--CA--------TAC----TGAATATT-TG-ATATG----AACCC-----G-------T--G---GATCTCTGTAAtcaaataag
gi|24099 : CAA----TT-------TTATCTGTTTT-ATTTT--GGTACCAATAGTAT-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--G-A-AGAATT-A----A--------TAAAGAAATAC------TA--AAAGTGCCAT-TAG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---TGTCTCTGTAA
gi|24100 : CAT----TT-------GTATCAGCTTT-ACTTT--TATACCACAATTAT-C-AAA---TTTAG-A-A----A-A-G-A---T-T-C--A-A-ATACTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--TTGATGCCAC-GCG-CAATTTCA-GCCGTG--TA---------------------------CT-TT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24101 : CAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------CA--ACAGT-------------------GCCGTT--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24102 : ----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAATTTAA-T-AAA---TTCAA-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----C--------TAAATAAATAC------TA--GAGGTGCCAC-CCT-GAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----CATA---T-CG----------AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24103 : ----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-C-AAA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTCA-GTCGTG--CA--------CAT----TATA---C-TG-CTATT----ACCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24104 : ----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GATGTCAACATTAT-T-ATA---TTCAA-A-C----A-C-C-T---G-T-G--A-ATAAAGTT-G----T--------TAAAGAAGTAC------TA--AAGATGCCAA-CCT-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TGT----TGGA---T-TG-
gi|24105 : ----TT-------TTATCAGTTTA-ACTTT--GGTACCGAT-TTGT-TTAAA---TTTAT-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAGTAC------TA--AAGGTGCCAG-CCG-GAATTTCA-GCTATG--T
gi|24106 : AA----CT-------TTATCA----T--CTTT--GGTACCAACATTGT-T-AAA---TCCAG-A-CA---A-A-G-G---T-T-C--A-A-AAGATT------T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAT-CCG-AAATTTCA-GCAATG--TA--------TGT----TGCA---C-TG-ATATT----AGCCT-----A-------T--C---AGTCTCTG
gi|24107 : AA----CT-------TTATCA----T--CTTT--GGTACCAAAATTGT-T-AAA---TCCAG-A-C----A-A-G-GG--T-T-CT-A-A-AGA-TT------T--------TAAAGAAATAC-------A--AAGTTGTCAT-CCG-AAATTTCA-GCCATG--TA--------TGT----TGCA---C-TG-AAATT----AGCCT-----c
gi|24108 : CTTT-CCTTT--GGTACCAAAGCTGT-T-AAA---TTCAA-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAC-CCG-AAATCCCA-GTCTTT--TA--------TAT----T-TA---T-TG-GTATT----AACCT-----G-------C--C---ATTTTCTGTAA
gi|24109 : TTC-ACTTT--GGTAACAAAATTAT-T-GAA---GTCAG-A-C----A-ATG-G---T-T-G--G-A-AATGTC-A----T--------TAAAGAAGTTC------TA--AAGGAGCCGC-CCA-AAATTT-A-GCCTTA--TT--------TAT----TAAA---T-TG-ATGGT----AGCCT-----G-------T--C---TGTCTCT
gi|24110 : AATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-AG--T-T-C--A-A-AGAGTT-G----T--------TGAAGAAACAC------TT--GAGGTGCCAC-ACG-GACTTTCA-GCCGTG--TG--------TGT----TTAA---T-TG-ATATT----AGCTT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAAC
gi|24111 : TTGT-T-AAAGAGTACAG-A-C----A-A-ATA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----A--------TAAAGAAATAC------AA--AAAGTGTCAC-CCA-AAATTTCA-TCCGTG--CA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24112 : T-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-T--A-A-AGAGTT-A----T--------AAAAGAAATAC------TA--AAGGGGCCAC-CCGAAAATTTCA-GCCATG--TA--------CATTTAATATA---T-TG-TTATT----AGCCT-----G-------C--C---CGTCTCTGTAA
gi|24113 : ---T-T-A--A-A-AAAGTA-A----T--------TTAAGAAATGC------TA--GGGGTACCAC-CGT-AAATTTGA-GCTGTG--TG--------TAT----TCAA---T-TG-TCGTT----AGCCT-----C-------CTCC---GATCTCTGCAACGATTTTGGAACGAAGCCTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGTGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGCG-CACCGCTATTAA-AT--ATCGGTGGACCG
gi|24114 : agacttttTAATCGGGTCAAAGGCACCAGTAC--CGGTGCATCGTTATT--ATATCGGTACACTGATAT-TTTTGTT-TT-----AA-CGGTG-CACCGATA--AA-AT--
gi|24115 : AAAACCCAAATATAGCGGTTCATCGTTAAAATATAGCGGTGGACCGATAAA----ATA-T------AG-AGGTG-CACCGATATTAT-AT--AGCGGTGCACCG
gi|24116 : -------ATAGTGGTGCACCGATTTATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCAATAACAT-AT--ACCGGTGCACC
gi|24117 : CGGTGAACCGATATA-TTTATTGT------AA-CGGTG-CACCGATAACAT-AT--ACCGTTGCACCG
gi|24118 : CGGTGCACCGTTAC---TTATT-T------AA-CGGTC-CACCGATATTTA-AT--AGCGGTGCGCCG
gi|24119 : CGATGCACCGATATATTTGTTT-T------AA-CAGTG-CACCGATAAAAT-AT--ACCGTTGCACC
gi|24120 : CGGTGCACCGATATATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCGATAACAT-AT--ACCGGTACACCG
gi|24121 : CGGTGGACCGTTTTTTTTTGTT-TC-----AA-CGGTG-CACCGATAAAAT-AT--ACCGGTG
gi|24122 : GGTGCACTGATATATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCGATA--AA-ATAAACCAGTGCACC
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111111111 2222222 111111
lowQualScore : 0 555555 5 222 1 55555 2222222 0 00 0 0 111 0 5 6666 1 7777777 0 1 33 1 0 0 1111 22222222 111111 00 0 22 0 11 22222222 1111 66 111 0 33 1111 0000000000000 33 3333 3 777 1 0000000 0 2 000000 2 2 1 4 2 33 0
lowQualScore : . ...... . ... . ..... ....... . .. . . ... . . .... . ....... . . .. . . . .... ........ ...... .. . .. . .. ........ .... .. ... . .. .... ............. .. .... . ... . ....... . . ...... . . . . . .. .
lowQualScore : 5 000000 4 333 7 77777 7777777 6 88 6 6 000 6 8 6666 8 8888888 6 2 00 7 6 6 3333 11111111 888888 88 7 22 7 00 66666666 5555 44 333 7 77 6666 2222222222222 55 5555 6 000 6 9999999 6 1 333333 1 1 0 4 1 11 7
consensus : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCAN----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-N-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TANA---T-TG-NTATT----AGCCT-----G-------C--C---GGTCTCTGTAACGATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTATTAA-AT--ACCGGTGCACCG
Reference ( family-373 ) : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCAN----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-N-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TANA---T-TG-NTATT----AGCCT-----G-------C--C---GGTCTCTGTAACGATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTATTAA-AT--ACCGGTGCACCG
gi|24044 : GTTATTTAA------ACTT--GTCAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-AATTT--GGTAACATAAGTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-T-T-A---T-T-T--A-A-AAAATA-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--GGGGTGCAAC-CCT-AAATTTGA-GCTGTG--TG--------TAT----TCAA---T-TG-GCATT----AGCCT-----C-------CTCC---GATCTCTGCAACGATCTTGGAACGAAGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGCG-CACCGCTATTAA-AT--ATCGGTGGACCG
gi|24045 : GTTGTTTAA------ACTT--GTTAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-C-CAA---TTCAG-A-C----A-T-T-A---T-T-A--T-G-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAGTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAGTTTCA-ACTGTG--TA--------TAT----TA-A---T-TG-TTGTT----AGCCTCC---T-------C--C---GATCTCTGTAATGATTTTGGAATGAGGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATTCTA----AGTGGTGTGACA-------ATTGCGATGGA-CGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACCAGTGGACCG
gi|24046 : GTTGTTTAA------ACTT--GTTAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-C-CAA---TTCAG-A-C----A-T-T-A---T-T-A--T-G-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAGTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAGTTTCA-ACTGTG--TA--------TAT----TA-A---T-TG-TTGTT----AGCCTCC---T-------C--C---GATCTCTGTAATGATTTTGGAATGAGGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATTCTA----AGTGGTGTGACA-------ATTGCGATGGA-CGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACCAGTGGACCG
gi|24047 : GTTATTTAT------ACTT--GTCAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-TAA---TTCAG-A-T----A-T-T-A---T-TTC--G-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAA-TAC------TA--GGAATGCGAC-CGT-TAATTTGA-GCTGTG--CG--------TAT----TCAA---T-TG-TTGTT----AGCCT-----C-------CTCC---GATCTCTGCAACACATTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGAACAGCCGTGTGACG-------ATTGTGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-TGGTG-CACCGCTATTTA-GT--ACTGTTG
gi|24048 : GTTATTTAA------ACTT--GACACCAA----TT-------ATATCAGCTTA-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-T-T-GT--T-T-C--G-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--AAAGTG--AC-CCT-AAATTTCA-ACCTTG--TG--------TAT----T--G---T-TGCTTGTT----AGCCT-------------C--CTCTGATCTTTGTAATGATTTTGGAACGAGGCTTTTGATTCGACCAAT
gi|24048 : GACCAATATATTTTGCT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACCGGTGGACTGatattttgcttaacggtgcaccgctattaaataccggtggactg
gi|24049 : gttatttaaacttgacaccaattatatcagcttaactttggtaccataattattgaattcagacattgtttcgaaaagttattaaagaaatgctaaaagtgaccctaaatttcaaccttgtgtattgttgcttgttagcctcctctgatctttgtaatgattttggaacgaggcttttgattcGTTTTTTAA------ACTT--GACACCAA----TT-------ATATCATCTTA-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-T-T-GT--T-T-C--G-A-AAAGTT-A----T--------TAGAGAAA
gi|24050 : GTTATTTAA------ACTT--GTCAATAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTG--TGTACCACAGTTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-T-T-G---T-T-A--AGA-AAAGTT-A----T--------TGAA-AAATGC------TA--GGGGTGCCACGCTT-AAA-TGCA-ACTGTG--TG--------T------------------------------------------------------TTTCTGTAATTATTTTGG-ATGAGGCTTCTGATT-GGCT
gi|24051 : TCATTTAA------ACTT--GACAATAA----ATATAAAAATTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-T-T-GT--T-T-T--G-A-AAAGAT-A----T--------TAAAGAATTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-TAATTTCA-ACCGTG--TG--------TAT----T-GA---T-TG-TTGTT----AGCCTC----GT------C--C---GATCTTTGTAATGGTTTTGAAACGAGGCTTTTGATT-GGCTAACT---CCAAAGATCCTAGTACAGTGATGTGACG-------ATAGCAGTGGACCAATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACAGGTGGACCG
gi|24052 : TTATTTAA------ACAT--GTCAACAA----TT-------ATATAAGCTTT-ACTTT--GATACCATAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-T-T-AT--T-T-C---------GTT-A----G--------TATAGAAATGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAATTTCA-ACTGTG--TG--------TAT----T-GA---T-TG-TTATT----AGCCTCCTCCGATCTCCTC--C---GATCTCTGTAATGATTTTGGAAAGAAGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATCCTAGTACAGCAGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCG----ATTTTATT-T------AATCGGTG-CATCGATAAAAATAT--AGCGGTGCATCG
gi|24053 : TTATTTAA------AGTT--GTCAACAA----TT-------GTATCAGCTTT-ATTTT--GGTACCATAATTAT-A-AGA---TTCAG-A-C----A-T-T-AT--T-T-C--A-A-TAAGTT-G----T--------TAAAGAAATGA------TA--GGTGTGCCAC-CCT-AAATTTGA-GCTTTG--TG--------TAT----T-CG---TATG-TCATT----AGCCT-----ACT-----C--C---GATCTCTGCAACAATTTTGAACCGAAGCTTCTGACT-GGCTAATC---CCCAAAA
gi|24053 : TATCTTATT-T------AA-CGTCG-CACCGCCATTAA-AT--ATCGGTGaaaaaaaaaaaaaaaaaaattctatcttatttaacgtcgcaccgccattaaatatcggtgga
gi|24054 : ttatttaaagttgtcaacaattgtatcagctttattttggtaccataattataagattcagacattatttcaataagttgttaaagaaatgataggtgtgccaccctaaatttgagctttgtgtattcgtatgtcattagcctactccgatctctgcaacaattttgaaccgaagcttctgactggctaatccccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaattcTTTTCTAA------A-TT--ATTAACAA----CC-------TTATCAGCTTT-ATTGT--GTTCTCAAATTTAT-T-AAA---TTCAA-A-C----A-T-T-GG--T-T-C--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------CA--AAGGTGCCAC-TCA-AAATGCCA-GCCGGGTTTA--------TAC----TGAA---T-TG-ATATT----AGCTG-----G-------C--G---GATCTCTGTAAga
gi|24055 : TTATTGAA------AATT--GTCATCAT----AG-------TTATCAGATTT-ACTCT--GGTACCAAA-TGAT-A-AAA---TTCAG-A-A----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGTGTC-A----T--------TAAAGCAATAC------TA--CAGGTGCCAC-CCG-AAATTTAT-GCAGTG--CA--------TAT----TATA---T-TG-ATAAT----AGCCT-----G-------A--A---AGTCTCTGCAA
gi|24056 : TTATTACA------AATA--GCCAACA-----TT-------TTAACAGCTTT-ACTTT--GGTACAAAAGTTAT-T-AAA---TTAAG-G-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAACTAC------TT--AAGGTTCCAC-CCA-AAATTTCA-G--GTG--TA--------TAT----TACA---C-TG-ATATT----AACC
gi|24057 : TTATTGAA------A-TT--GTCATCAG----CT-------TTATCAGCTTT-ACTTTTTGGTACCAAA-------------------------------------------------GAGTA-A----C--------TTAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-TAG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTA
gi|24058 : TATTTAATTCCTTACTTTTGTTAACAG----TT-------TTATCTGCTTT-ACTTC--GGTATCATAACTAT-T-ATA---TTCAG-A-C----A-A---A---T-T----A-A-AG-GTTAA----A--------AAAAGAAATAC------TA--TATGTGTCAT-CCT-AAATTTCA-GGAACG--TA--------TAT----TAAA---T-TA-AT
gi|24059 : ATTGGA------AATT---TCACCAA----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-TCA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-G----T--------AAAAGAATTAC------TG--AAGGTGCCAC-CCA-AAATTTCA-GTTTTG--CA--------CAT----TATA---C-TG-CTATT----ATCCT-----G-------C--C---AGTCTCTtgt
gi|24060 : ATTGAA------AATA--GTCAATAT----CG-------GT-TCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAAGTAT-T-AAG---TTCTG-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-ATAGTT-A----G--------TAAAAAAATAC------AT--AATGTGCAAC-CCG-AAACTTCA-GCCGTT--TA--------TGC----TTAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------T--C---AATCTCTATAA
gi|24061 : ATTGGA------AATA--GTCA-CAG----TTG------CTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-TAA---TTTAG-G-C----A-A-AGA---T-T-C--A-G-AGAGTT-A----A--------TAAATGAATAC------TA--AAAGTGTCAC-CCG-AAACTTCA-GCCATG--TA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---AATCTC
gi|24062 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTG-CA------------------GTG--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----T-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24063 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACAAAACTTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T-----------AGAAATAC------TA--AAAGTG-CA------------------GTG--GA--------CAT----TAAA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24064 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGT-------------------GCCGTG--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24065 : ATTTGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGCG
gi|24066 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TAATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TT--AAAGTGCCA-------------------TG--GA--------CAT----TAAA---G-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24067 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTA-CAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-G-CT---A-A-A-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTGC
gi|24068 : TTTAA------A-TA--GTCAACA-----TT-------TTAACAGCTTT-CCTTT--GGTATCAACATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-AGAGTA-A----T--------TTAAGAAATAC------TA--AAGATACTAC-CCA-AAATTTCT-GCTGCG--TA--------TGT----TGAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----
gi|24069 : ATGAGCTTT-ACAAT--GGCACCAAAATTAT-T-TTA---TTCAG-A-C----ACA-T-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAACAC-----------------------G-AAATTTCA-GCCATG--TA--------CAT----T-TA---T-TG-CTATT----AGCCC-----G-------C--C---AGTATCTGTAA
gi|24070 : tttaaatttaaagaaTTAA------AATG--GTTATTAT----TT-------AAATCAGCTTT-ACCTT--GGTACCGAAATAAT-T-AAA---ATCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-T--A----GAGTT-A----T--------TAAAACAATAC------TA--AAGGCGCTAC-CTA-TAACTTCA-ACCGTG--TA--------TAT----TACA---T-T------------GCCT-----G-------T--C---AGTCT
gi|24071 : TAA------ACTT--ATTGATATATATTT-------TT-----CTTT-ACTTT--GGTACCA--------T-AA----TTCAG-A-C----A-T-T-G---T-T-TTTA-A-A-AGTC-A----T--------TGAAGAAATGC------TC--AGGGTGCCAC-ACT-AAGTTTCA-GCTGTA--TG--------TAT----TAAA---T-TG-TTGTTTAATAGCCTCC---G-------C--C---AATCTCTGCAATGATTTTGAAACGAAGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTAGAGCGGTGTGATG-------ATAGCGGTGCACCGATATATTTTATT-TCGGGTCCA-TGATGACATCGCAATTAA-A
gi|24072 : TAAC-----ACAT--GTCAACAT----TG-------TTGTCAGCATT-ACCTC--GGTACCAAAGTTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-ATG-G---T-T-C--A-A-AGCGTT-A----A--------TAAACAAAAAC------TA--AATGTGCCA
gi|24073 : AA------AGTA--GTCATCAT----AT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GATACTAAAATTAT-T-CAA---TTCAG-A-T----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TGAAGCAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTGA-GCCGTG--TA--------GAT----TATA---T-TG-ATTTT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGttttatatt
gi|24074 : A------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAGAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C-------GAGTT-A----T--------AATAGAAATAC------TA--AAAGT-------------------GCCGTG--GA--------TAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTTTCTGTAA
gi|24075 : A------ATTG--GTCATCTT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCCCCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTGC
gi|24076 : T--GTCATCAG----TT-------CTAACAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAATACAT-T-TCA---TTCAG-A-C----A-A-G-----------------GAGTA-A----T--------TAAAGAAATAA------CA--AATATGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------CAT----TATA---T-TA-CTCTA----AGCCT-----T-------C--C---AGTC
gi|24077 : T--GTCAGCAT----TT-------TTACCAGCTTA-ACTT------ACCAAAAATATGT-AAA---C-CAG-A-C----A-C-A-G---T-T-TTAA-A-AGTGTT-A----T--------TTAAGAAATGC------TA--TAAGTGCCA--CTG-ATAGTTCA-GCC------A--------TCT----TAAA---T-TG-ATATT----AGCCT-------------C--C---GATCTCTGTA
gi|24078 : T--GTCATTAG----TT-------TTATCAGCTTT-AC----------CAAAATTAT-T-TCA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGACAC-CCG-AAATTTCA-GCCATG--TA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----
gi|24079 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTTCCAAGATCAT-T-AAA---CTCAG-ACC----A-A-A-A---T-T-T--A-A-AGGGTT-A----T--------T-AAGAAATTCTAAATTTA--AAGGTGCAAC-CCG-CAATTTCA-GCC
gi|24080 : --GTCAACAT----TT-------TTATCAGCTTT-GCTTT--GGTACCAAAATT-T-T-AAA---TTAAA-T-CA---A-A-G-G---T-T-G--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-TCG-AAATTTCA-GCTTTG--TA--------TAT----TAAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----T-------A--C---AATGTCTGTAAnnnnnnnnnnaa
gi|24081 : --GTCAAAAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAGTTAT-T-AAA---TTCAGAA-A----A-A-G-G---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TG--AAGGTGCCAC-CTG-AAA-TTCA-GCTTTG--TA--------TAT----TGCA---T-TG-GTATT----AGC
gi|24082 : --GTCAACAG----TT-------TTATCAGCCTT-ACATT--GGTACCAAAATTAT-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-A-G---G-T-TAAA-A-AGAGTT-A----T--------TAAACAAACAC------TA--AA
gi|24083 : --GTCAGCAA----TT-------TTATCAGCTTT-TATCT--GATAT---AA-------AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A----GAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAC-CAG-TAATTTCA-GCTGTG--TA--------TAT----TGAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTTTGTAAttcaaatgaaatgcaattgtcctgttaaccttactccatttatgca
gi|24084 : --GTCATCAT----TT-------GTATCAGCATT-ACGTT--AGTACCAAAAGTAT-A-AGC---TTCAA-A-C----AGA-G-A---T-T-C--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAAATC------TG--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTCA-ACCGTT--TATATACACGTAT----TGTA---T-TG-ATATT----AGCGT-----GT------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24085 : --GTCAAAAT----TT-------CTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTTT-C-AAA---TTCAG-A------------------------------------------------TAAAGGAATAC------TT--AATGTGCCGC-CCG-AAATTTCA-GTCTTG--TA--------TAT----TGAA---T-TG-AAATT----AGCCT-----G-------C--T---GGTCACTG
gi|24086 : --GTAAACAA----TT-------TCATCAGCTTT-ACTTT--GATACCAAAATTAT-C-AAA---TTCTG-A-CT---A-A-G-T---T-T-C--A-A-TGAGAT-A----C---------------ATAG------TT--AAGTTCCCAT-CTC-AAATGTCA-GCCATG--TA--------TGA----TAAA---T-CG-GTATA----AGCCT-----GA------C--C---AATCTATGCAA
gi|24087 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTACCAAAGGTAT-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-A-T---T-T-T--ATA-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAAGTG
gi|24088 : --GTCAACA-----TC-------TTATTAGCCTT-GTTTT--GGTATCGGAACTAT-T-AAA---TTCAG-A-CTATTA-A-G-G---T-T-C--A-A-AG----------------------AAAAATAC------TA--CAGGTGCCAT-CCG-AAATATTATGCC-T---TA--------TAT----TCTG---T-TG----------AGTCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24089 : --GTTAATAT----TT-------GTGTTAGGTTTCACTTT--ACCACAAAAATTCT-T-AAA---TTCTG-A-C----A-A-T-GG--T-T-T--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--ATGGTGCCAT-CCG-AATTTTCA-ACTACG--TA--------CAA----TAAA---T-TG-
gi|24090 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGCGTT-ATTTT--CATATCAACATTAT-C-AAA---TTCAG-A-CA---A-A-T-A---T-T-C--A-A-AAAGTT-A----T--------AAAAGAAAATC------TA--AAGGTGC
gi|24091 : --GTCAACAA----TT-------GTATCAGCTTT-ACATT--GTCACAATAATTGT-T-AAA---TTCCA-A-CA---A-A-T-A---T-T----A-A-AG-GTT-AAAGGT--------TAAAG
gi|24092 : --GTCATCAC----TT-------TTATCAGCTT--ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--A--GTGCccagaa
gi|24093 : TCAATA-----TT-------TTATCAGGTAT-ACTTC--GGTAGCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-G---TAT-C--A-A-AGAGTC-A----TCATTAAAATAAAGAGACAT------TA--AAGGCACCGC-TCA-AAATTTCA-GGTGTG--TA--------TGT----TGAA---C-TG-ATATA----AACCT-----G-------C--C---GATCTCTGTAA
gi|24094 : AACA-----TT-------TTATCATTTTT-ACGTT--GGTACCAATATTAT-T-AAA---TTCAG-A-CA---A-A-G-G---T-T-T--A-A-AAATTT-T----T--------TAACAAAA----------A--AA--T-CTAC-CTG-AAATTTAA-GACATG------------TAT----TGAA---T-TG-ATATT----AGGCT-----G-------T--C---AATCTCTGCAA
gi|24095 : tcaTCGACAA----TT-------T-ATCAGCTTT-AATTT--GATTCCATCCTTAC-T-AAA---TTCAG-A-C----ATT-G-A---T-T-G--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAA
gi|24096 : TCAACAT----TT-------TTGTCAGCTTC-ACTTT--AGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTAAG-A-
gi|24097 : CAACAT----TT-------TTATTAGCTTT-ACTTT--GGTACCATATTTAT-T-AAG---TTTAG-A-A----A-A-A-AAGTT-T-C--A-gcatt
gi|24098 : AATAA----TG-------TTAACAGCTTT-GCTTT--GGTATCAAGATTAT-T-GAA---TTCAG-A-CAATGA-A-A-A---T-GAC--ACA-AAAGTT-A----T--------AAAATAAATGC------TATGATGGTGCCAC-CTG-AAACTTCA-GACATA--CA--------TAC----TGAATATT-TG-ATATG----AACCC-----G-------T--G---GATCTCTGTAAtcaaataag
gi|24099 : CAA----TT-------TTATCTGTTTT-ATTTT--GGTACCAATAGTAT-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--G-A-AGAATT-A----A--------TAAAGAAATAC------TA--AAAGTGCCAT-TAG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---TGTCTCTGTAA
gi|24100 : CAT----TT-------GTATCAGCTTT-ACTTT--TATACCACAATTAT-C-AAA---TTTAG-A-A----A-A-G-A---T-T-C--A-A-ATACTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--TTGATGCCAC-GCG-CAATTTCA-GCCGTG--TA---------------------------CT-TT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24101 : CAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------CA--ACAGT-------------------GCCGTT--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24102 : ----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAATTTAA-T-AAA---TTCAA-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----C--------TAAATAAATAC------TA--GAGGTGCCAC-CCT-GAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----CATA---T-CG----------AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24103 : ----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-C-AAA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTCA-GTCGTG--CA--------CAT----TATA---C-TG-CTATT----ACCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24104 : ----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GATGTCAACATTAT-T-ATA---TTCAA-A-C----A-C-C-T---G-T-G--A-ATAAAGTT-G----T--------TAAAGAAGTAC------TA--AAGATGCCAA-CCT-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TGT----TGGA---T-TG-
gi|24105 : ----TT-------TTATCAGTTTA-ACTTT--GGTACCGAT-TTGT-TTAAA---TTTAT-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAGTAC------TA--AAGGTGCCAG-CCG-GAATTTCA-GCTATG--T
gi|24106 : AA----CT-------TTATCA----T--CTTT--GGTACCAACATTGT-T-AAA---TCCAG-A-CA---A-A-G-G---T-T-C--A-A-AAGATT------T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAT-CCG-AAATTTCA-GCAATG--TA--------TGT----TGCA---C-TG-ATATT----AGCCT-----A-------T--C---AGTCTCTG
gi|24107 : AA----CT-------TTATCA----T--CTTT--GGTACCAAAATTGT-T-AAA---TCCAG-A-C----A-A-G-GG--T-T-CT-A-A-AGA-TT------T--------TAAAGAAATAC-------A--AAGTTGTCAT-CCG-AAATTTCA-GCCATG--TA--------TGT----TGCA---C-TG-AAATT----AGCCT-----c
gi|24108 : CTTT-CCTTT--GGTACCAAAGCTGT-T-AAA---TTCAA-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAC-CCG-AAATCCCA-GTCTTT--TA--------TAT----T-TA---T-TG-GTATT----AACCT-----G-------C--C---ATTTTCTGTAA
gi|24109 : TTC-ACTTT--GGTAACAAAATTAT-T-GAA---GTCAG-A-C----A-ATG-G---T-T-G--G-A-AATGTC-A----T--------TAAAGAAGTTC------TA--AAGGAGCCGC-CCA-AAATTT-A-GCCTTA--TT--------TAT----TAAA---T-TG-ATGGT----AGCCT-----G-------T--C---TGTCTCT
gi|24110 : AATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-AG--T-T-C--A-A-AGAGTT-G----T--------TGAAGAAACAC------TT--GAGGTGCCAC-ACG-GACTTTCA-GCCGTG--TG--------TGT----TTAA---T-TG-ATATT----AGCTT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAAC
gi|24111 : TTGT-T-AAAGAGTACAG-A-C----A-A-ATA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----A--------TAAAGAAATAC------AA--AAAGTGTCAC-CCA-AAATTTCA-TCCGTG--CA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24112 : T-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-T--A-A-AGAGTT-A----T--------AAAAGAAATAC------TA--AAGGGGCCAC-CCGAAAATTTCA-GCCATG--TA--------CATTTAATATA---T-TG-TTATT----AGCCT-----G-------C--C---CGTCTCTGTAA
gi|24113 : ---T-T-A--A-A-AAAGTA-A----T--------TTAAGAAATGC------TA--GGGGTACCAC-CGT-AAATTTGA-GCTGTG--TG--------TAT----TCAA---T-TG-TCGTT----AGCCT-----C-------CTCC---GATCTCTGCAACGATTTTGGAACGAAGCCTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGTGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGCG-CACCGCTATTAA-AT--ATCGGTGGACCG
gi|24114 : agacttttTAATCGGGTCAAAGGCACCAGTAC--CGGTGCATCGTTATT--ATATCGGTACACTGATAT-TTTTGTT-TT-----AA-CGGTG-CACCGATA--AA-AT--
gi|24115 : AAAACCCAAATATAGCGGTTCATCGTTAAAATATAGCGGTGGACCGATAAA----ATA-T------AG-AGGTG-CACCGATATTAT-AT--AGCGGTGCACCG
gi|24116 : -------ATAGTGGTGCACCGATTTATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCAATAACAT-AT--ACCGGTGCACC
gi|24117 : CGGTGAACCGATATA-TTTATTGT------AA-CGGTG-CACCGATAACAT-AT--ACCGTTGCACCG
gi|24118 : CGGTGCACCGTTAC---TTATT-T------AA-CGGTC-CACCGATATTTA-AT--AGCGGTGCGCCG
gi|24119 : CGATGCACCGATATATTTGTTT-T------AA-CAGTG-CACCGATAAAAT-AT--ACCGTTGCACC
gi|24120 : CGGTGCACCGATATATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCGATAACAT-AT--ACCGGTACACCG
gi|24121 : CGGTGGACCGTTTTTTTTTGTT-TC-----AA-CGGTG-CACCGATAAAAT-AT--ACCGGTG
gi|24122 : GGTGCACTGATATATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCGATA--AA-ATAAACCAGTGCACC
blockSeqs : TTCCTT C TTT A TATAT ATAAAAA GAG C TATT C AAAGT T TT G AAGG CATTAAAA TAAATT GA TATACACG TTAA CA TAT CT TAAT CCTCCGATCTCCT TC TCTG C GGG G TTAAAAT G CGGGTC T A C T T AA
blockSeqs : C C T A A G . C AATG G TGT A TA T . . . T . . GA . T . CCT TC G . . G TTATT . T . . C T . .
blockSeqs : . C T A A . . C T T TGT . AA C . . . T . . AT . T . CCT . G . . G . . C . . C T . .
blockSeqs : . C T C A . . C A . TGT . T . . . . T . . AC . T . CGT . G . . G . . . . . C T . .
blockSeqs : . C T C A . . C T . TAT . . . . . . T . . AT . T . ACT . G . . G . . . . . C T . .
blockSeqs : . C T A A . . C A . TAT . . . . . . T . . AA . T . CCG . G . . G . . . . . A A . .
blockSeqs : . C T A A . . C A . TGG . . . . . . T . . AT . T . GT . G . . A . . . . . C T . .
blockSeqs : . C T A A . . C A . AGA . . . . . . T . . TA . A . GA . G . . . . . . . . C T . .
blockSeqs : . G T A A . . C A . AGA . . . . . . T . . AC . A . C . A . . . . . . . . C T . .
blockSeqs : . A T A A . . C . . AGA . . . . . . A . . AT . A . G . A . . . . . . A T . .
blockSeqs : . A T T A . . . . . AGG . . . . . . G . . AA . C . G . A . . . . A A . .
blockSeqs : . C T A T . . . . . AGA . . . . . . A . . AT . A . G . A . . . . A A . .
blockSeqs : . A A T G . . . . . AGG . . . . . . G . . AA . C . G . A . . . . A T . .
blockSeqs : . A T A G . . . . . AGA . . . . . . T . . GA . A . G . A . . . . A A . .
blockSeqs : . A T C A . . . . . TGG . . . . . . A . . AC . A . G . A . . . . A A . .
blockSeqs : . T A A T . . . . . AGA . . . . . . G . . AA . C . T . A . . . . A A . .
blockSeqs : . T A T G . . . . . AGA . . . . . . G . . AT . C . G . A . . . . A . . .
blockSeqs : . T G T T . . . . . AGG . . . . . . A . . AT . C . G . A . . . . A . .
blockSeqs : . T G T T . . . . . TGG . . . . . . G . . AT . C . G . A
blockSeqs : . T G T T . . . . . AGA . . . . . . A . . AA . A . G . A
blockSeqs : . T G T T . . . . . AGA . . . . . . T . . AT . C . G . A
blockSeqs : . A G T T . . . . . AGA . . . . . . G . . AA . T . G . A
blockSeqs : . C G A T . . . . . AGA . . . . . . G . . GC . A . G . A
blockSeqs : . C A T T . . . . . GGG . . . . . . G . . GA . C . T . G
blockSeqs : . G G A T . . . . . AGG . . . . . . G . . GT . C . T . A
blockSeqs : . T T A T . . . . . TGG . . . . . . G . . GA . A . G . A
blockSeqs : . T T T T . . . . . AAG . . . . . . G . . AA . C . G . A
blockSeqs : . . A T T . . . . . ATA . . . . . . G . . CT . A . G . G
blockSeqs : . . G T G . . . . . AGA . . . . . . G . . AA . G . G . A
blockSeqs : . . G T T . . . . . TA . . . . . . G . . GA . A . G . A
blockSeqs : T G G . . . . . TA . . . . . . G . . GA . A . G . G
blockSeqs : T T T . . . . . TA . . . . . . C . . GA . A . G . A
blockSeqs : T T T . . . . . TG . . . . . . G . . AC . G . G . G
blockSeqs : A T . . . . . GA . . . . . . G . . AT . A . G . T
blockSeqs : A G . . . . . GA . . . . . . A . . AT . A . G . A
blockSeqs : A A . . . . . GA . . . . . . G . . AT . A . G . A
blockSeqs : G T . . . . . GA . . . . . . G . . GG . A . A . A
blockSeqs : T T . . . . . GA . . . . . . G . . GC . C . G . A
blockSeqs : A A . . . . . AA . . . . . . G . . GC . C . G . A
blockSeqs : A T . . . . . TA . . . . . . T . . AA . C . G . A
blockSeqs : T T . . . . . TG . . . . . . G . . TA . A . G . T
blockSeqs : A T . . . . . GA . . . . . . T . . AC . A . G . A
blockSeqs : A A . . . . . GA . . . . . . G . . AT . G . C . A
blockSeqs : T C . . . . . AG . . . . . . G . . CA . A . . . C
blockSeqs : A A . . . . . AA . . . . . . G . . A . A . . . G
blockSeqs : T T . . . . . GG . . . . . . G . . A . A . . . .
blockSeqs : A T . . . . . GG . . . . . . A . . G . T .
blockSeqs : A A . . . . . AG . . . . . . G . . G . T .
blockSeqs : A A . . . . . GA . . . . . . A . . C . . .
blockSeqs : A T . . . . . GT . . . . . . T . . T . . .
blockSeqs : A T . . . . . AT . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : A A . . . . . GG . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . TA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TA . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . GA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . AG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . GG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . GA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . CT . . . . . .
blockSeqs : . . . . GG . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : **
originalCons : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCAN----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-N-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TANA---T-TG-NTATT----AGCCT-----G-------C--C---GGTCTCTGTAACGATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTATTAA-AT--ACCGGTGCACCG
finalCons : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCAN----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-N-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TANA---T-TG-NTATT----AGCCT-----G-------C--C---GGTCTCTGTAACGATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTATTAA-AT--ACCGGTGCACCG
Alignments
lowQualScore : 1111111 1111111111111 2222222 111111
lowQualScore : 0 555555 5 222 1 55555 2222222 0 00 0 0 111 0 5 6666 1 7777777 0 1 33 1 0 0 1111 22222222 111111 00 0 22 0 11 22222222 1111 66 111 0 33 1111 0000000000000 33 3333 3 777 1 0000000 0 2 000000 2 2 1 4 2 33 0
lowQualScore : . ...... . ... . ..... ....... . .. . . ... . . .... . ....... . . .. . . . .... ........ ...... .. . .. . .. ........ .... .. ... . .. .... ............. .. .... . ... . ....... . . ...... . . . . . .. .
lowQualScore : 5 000000 4 333 7 77777 7777777 6 88 6 6 000 6 8 6666 8 8888888 6 2 00 7 6 6 3333 11111111 888888 88 7 22 7 00 66666666 5555 44 333 7 77 6666 2222222222222 55 5555 6 000 6 9999999 6 1 333333 1 1 0 4 1 11 7
consensus : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCAN----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-N-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TANA---T-TG-NTATT----AGCCT-----G-------C--C---GGTCTCTGTAACGATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTATTAA-AT--ACCGGTGCACCG
Reference ( family-373 ) : GTTATTTAA------ACTT--GTCANCAN----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-N-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TANA---T-TG-NTATT----AGCCT-----G-------C--C---GGTCTCTGTAACGATTTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGNTATTAA-AT--ACCGGTGCACCG
gi|24044 : GTTATTTAA------ACTT--GTCAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-AATTT--GGTAACATAAGTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-T-T-A---T-T-T--A-A-AAAATA-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--GGGGTGCAAC-CCT-AAATTTGA-GCTGTG--TG--------TAT----TCAA---T-TG-GCATT----AGCCT-----C-------CTCC---GATCTCTGCAACGATCTTGGAACGAAGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGCGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGCG-CACCGCTATTAA-AT--ATCGGTGGACCG
gi|24045 : GTTGTTTAA------ACTT--GTTAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-C-CAA---TTCAG-A-C----A-T-T-A---T-T-A--T-G-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAGTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAGTTTCA-ACTGTG--TA--------TAT----TA-A---T-TG-TTGTT----AGCCTCC---T-------C--C---GATCTCTGTAATGATTTTGGAATGAGGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATTCTA----AGTGGTGTGACA-------ATTGCGATGGA-CGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACCAGTGGACCG
gi|24046 : GTTGTTTAA------ACTT--GTTAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-C-CAA---TTCAG-A-C----A-T-T-A---T-T-A--T-G-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAGTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAGTTTCA-ACTGTG--TA--------TAT----TA-A---T-TG-TTGTT----AGCCTCC---T-------C--C---GATCTCTGTAATGATTTTGGAATGAGGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATTCTA----AGTGGTGTGACA-------ATTGCGATGGA-CGATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACCAGTGGACCG
gi|24047 : GTTATTTAT------ACTT--GTCAACAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-TAA---TTCAG-A-T----A-T-T-A---T-TTC--G-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAA-TAC------TA--GGAATGCGAC-CGT-TAATTTGA-GCTGTG--CG--------TAT----TCAA---T-TG-TTGTT----AGCCT-----C-------CTCC---GATCTCTGCAACACATTTGGAACGAGGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGAACAGCCGTGTGACG-------ATTGTGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-TGGTG-CACCGCTATTTA-GT--ACTGTTG
gi|24048 : GTTATTTAA------ACTT--GACACCAA----TT-------ATATCAGCTTA-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-T-T-GT--T-T-C--G-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--AAAGTG--AC-CCT-AAATTTCA-ACCTTG--TG--------TAT----T--G---T-TGCTTGTT----AGCCT-------------C--CTCTGATCTTTGTAATGATTTTGGAACGAGGCTTTTGATTCGACCAAT
gi|24048 : GACCAATATATTTTGCT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACCGGTGGACTGatattttgcttaacggtgcaccgctattaaataccggtggactg
gi|24049 : gttatttaaacttgacaccaattatatcagcttaactttggtaccataattattgaattcagacattgtttcgaaaagttattaaagaaatgctaaaagtgaccctaaatttcaaccttgtgtattgttgcttgttagcctcctctgatctttgtaatgattttggaacgaggcttttgattcGTTTTTTAA------ACTT--GACACCAA----TT-------ATATCATCTTA-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-T-T-GT--T-T-C--G-A-AAAGTT-A----T--------TAGAGAAA
gi|24050 : GTTATTTAA------ACTT--GTCAATAA----TT-------ATATCAGCTTT-ACTTG--TGTACCACAGTTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-T-T-G---T-T-A--AGA-AAAGTT-A----T--------TGAA-AAATGC------TA--GGGGTGCCACGCTT-AAA-TGCA-ACTGTG--TG--------T------------------------------------------------------TTTCTGTAATTATTTTGG-ATGAGGCTTCTGATT-GGCT
gi|24051 : TCATTTAA------ACTT--GACAATAA----ATATAAAAATTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCATAATTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-T-T-GT--T-T-T--G-A-AAAGAT-A----T--------TAAAGAATTGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-TAATTTCA-ACCGTG--TG--------TAT----T-GA---T-TG-TTGTT----AGCCTC----GT------C--C---GATCTTTGTAATGGTTTTGAAACGAGGCTTTTGATT-GGCTAACT---CCAAAGATCCTAGTACAGTGATGTGACG-------ATAGCAGTGGACCAATATATTTTATT-T------AA-CGGTG-CACCGCTATTAA-AT--ACAGGTGGACCG
gi|24052 : TTATTTAA------ACAT--GTCAACAA----TT-------ATATAAGCTTT-ACTTT--GATACCATAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-T-T-AT--T-T-C---------GTT-A----G--------TATAGAAATGC------TA--A--GTGTGAC-CCT-AAATTTCA-ACTGTG--TG--------TAT----T-GA---T-TG-TTATT----AGCCTCCTCCGATCTCCTC--C---GATCTCTGTAATGATTTTGGAAAGAAGCTTTTGATT-GGCTAATG---CCAAAGATCCTAGTACAGCAGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCG----ATTTTATT-T------AATCGGTG-CATCGATAAAAATAT--AGCGGTGCATCG
gi|24053 : TTATTTAA------AGTT--GTCAACAA----TT-------GTATCAGCTTT-ATTTT--GGTACCATAATTAT-A-AGA---TTCAG-A-C----A-T-T-AT--T-T-C--A-A-TAAGTT-G----T--------TAAAGAAATGA------TA--GGTGTGCCAC-CCT-AAATTTGA-GCTTTG--TG--------TAT----T-CG---TATG-TCATT----AGCCT-----ACT-----C--C---GATCTCTGCAACAATTTTGAACCGAAGCTTCTGACT-GGCTAATC---CCCAAAA
gi|24053 : TATCTTATT-T------AA-CGTCG-CACCGCCATTAA-AT--ATCGGTGaaaaaaaaaaaaaaaaaaattctatcttatttaacgtcgcaccgccattaaatatcggtgga
gi|24054 : ttatttaaagttgtcaacaattgtatcagctttattttggtaccataattataagattcagacattatttcaataagttgttaaagaaatgataggtgtgccaccctaaatttgagctttgtgtattcgtatgtcattagcctactccgatctctgcaacaattttgaaccgaagcttctgactggctaatccccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaattcTTTTCTAA------A-TT--ATTAACAA----CC-------TTATCAGCTTT-ATTGT--GTTCTCAAATTTAT-T-AAA---TTCAA-A-C----A-T-T-GG--T-T-C--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------CA--AAGGTGCCAC-TCA-AAATGCCA-GCCGGGTTTA--------TAC----TGAA---T-TG-ATATT----AGCTG-----G-------C--G---GATCTCTGTAAga
gi|24055 : TTATTGAA------AATT--GTCATCAT----AG-------TTATCAGATTT-ACTCT--GGTACCAAA-TGAT-A-AAA---TTCAG-A-A----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGTGTC-A----T--------TAAAGCAATAC------TA--CAGGTGCCAC-CCG-AAATTTAT-GCAGTG--CA--------TAT----TATA---T-TG-ATAAT----AGCCT-----G-------A--A---AGTCTCTGCAA
gi|24056 : TTATTACA------AATA--GCCAACA-----TT-------TTAACAGCTTT-ACTTT--GGTACAAAAGTTAT-T-AAA---TTAAG-G-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAACTAC------TT--AAGGTTCCAC-CCA-AAATTTCA-G--GTG--TA--------TAT----TACA---C-TG-ATATT----AACC
gi|24057 : TTATTGAA------A-TT--GTCATCAG----CT-------TTATCAGCTTT-ACTTTTTGGTACCAAA-------------------------------------------------GAGTA-A----C--------TTAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-TAG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTA
gi|24058 : TATTTAATTCCTTACTTTTGTTAACAG----TT-------TTATCTGCTTT-ACTTC--GGTATCATAACTAT-T-ATA---TTCAG-A-C----A-A---A---T-T----A-A-AG-GTTAA----A--------AAAAGAAATAC------TA--TATGTGTCAT-CCT-AAATTTCA-GGAACG--TA--------TAT----TAAA---T-TA-AT
gi|24059 : ATTGGA------AATT---TCACCAA----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-TCA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-G----T--------AAAAGAATTAC------TG--AAGGTGCCAC-CCA-AAATTTCA-GTTTTG--CA--------CAT----TATA---C-TG-CTATT----ATCCT-----G-------C--C---AGTCTCTtgt
gi|24060 : ATTGAA------AATA--GTCAATAT----CG-------GT-TCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAAGTAT-T-AAG---TTCTG-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-ATAGTT-A----G--------TAAAAAAATAC------AT--AATGTGCAAC-CCG-AAACTTCA-GCCGTT--TA--------TGC----TTAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------T--C---AATCTCTATAA
gi|24061 : ATTGGA------AATA--GTCA-CAG----TTG------CTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-T-TAA---TTTAG-G-C----A-A-AGA---T-T-C--A-G-AGAGTT-A----A--------TAAATGAATAC------TA--AAAGTGTCAC-CCG-AAACTTCA-GCCATG--TA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---AATCTC
gi|24062 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTG-CA------------------GTG--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----T-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24063 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACAAAACTTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T-----------AGAAATAC------TA--AAAGTG-CA------------------GTG--GA--------CAT----TAAA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24064 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGT-------------------GCCGTG--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24065 : ATTTGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGCG
gi|24066 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TAATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TT--AAAGTGCCA-------------------TG--GA--------CAT----TAAA---G-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24067 : ATTGGA------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTA-CAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-G-CT---A-A-A-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTGC
gi|24068 : TTTAA------A-TA--GTCAACA-----TT-------TTAACAGCTTT-CCTTT--GGTATCAACATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-AGAGTA-A----T--------TTAAGAAATAC------TA--AAGATACTAC-CCA-AAATTTCT-GCTGCG--TA--------TGT----TGAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----
gi|24069 : ATGAGCTTT-ACAAT--GGCACCAAAATTAT-T-TTA---TTCAG-A-C----ACA-T-A---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAACAC-----------------------G-AAATTTCA-GCCATG--TA--------CAT----T-TA---T-TG-CTATT----AGCCC-----G-------C--C---AGTATCTGTAA
gi|24070 : tttaaatttaaagaaTTAA------AATG--GTTATTAT----TT-------AAATCAGCTTT-ACCTT--GGTACCGAAATAAT-T-AAA---ATCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-T--A----GAGTT-A----T--------TAAAACAATAC------TA--AAGGCGCTAC-CTA-TAACTTCA-ACCGTG--TA--------TAT----TACA---T-T------------GCCT-----G-------T--C---AGTCT
gi|24071 : TAA------ACTT--ATTGATATATATTT-------TT-----CTTT-ACTTT--GGTACCA--------T-AA----TTCAG-A-C----A-T-T-G---T-T-TTTA-A-A-AGTC-A----T--------TGAAGAAATGC------TC--AGGGTGCCAC-ACT-AAGTTTCA-GCTGTA--TG--------TAT----TAAA---T-TG-TTGTTTAATAGCCTCC---G-------C--C---AATCTCTGCAATGATTTTGAAACGAAGCTTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTAGAGCGGTGTGATG-------ATAGCGGTGCACCGATATATTTTATT-TCGGGTCCA-TGATGACATCGCAATTAA-A
gi|24072 : TAAC-----ACAT--GTCAACAT----TG-------TTGTCAGCATT-ACCTC--GGTACCAAAGTTAT-T-GAA---TTCAG-A-C----A-ATG-G---T-T-C--A-A-AGCGTT-A----A--------TAAACAAAAAC------TA--AATGTGCCA
gi|24073 : AA------AGTA--GTCATCAT----AT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GATACTAAAATTAT-T-CAA---TTCAG-A-T----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TGAAGCAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTGA-GCCGTG--TA--------GAT----TATA---T-TG-ATTTT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGttttatatt
gi|24074 : A------ATTG--GTCATCAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCACCAGAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C-------GAGTT-A----T--------AATAGAAATAC------TA--AAAGT-------------------GCCGTG--GA--------TAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTTTCTGTAA
gi|24075 : A------ATTG--GTCATCTT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGCCCCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--AAAGTGC
gi|24076 : T--GTCATCAG----TT-------CTAACAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAATACAT-T-TCA---TTCAG-A-C----A-A-G-----------------GAGTA-A----T--------TAAAGAAATAA------CA--AATATGCCAC-CCG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------CAT----TATA---T-TA-CTCTA----AGCCT-----T-------C--C---AGTC
gi|24077 : T--GTCAGCAT----TT-------TTACCAGCTTA-ACTT------ACCAAAAATATGT-AAA---C-CAG-A-C----A-C-A-G---T-T-TTAA-A-AGTGTT-A----T--------TTAAGAAATGC------TA--TAAGTGCCA--CTG-ATAGTTCA-GCC------A--------TCT----TAAA---T-TG-ATATT----AGCCT-------------C--C---GATCTCTGTA
gi|24078 : T--GTCATTAG----TT-------TTATCAGCTTT-AC----------CAAAATTAT-T-TCA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGACAC-CCG-AAATTTCA-GCCATG--TA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----
gi|24079 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTTCCAAGATCAT-T-AAA---CTCAG-ACC----A-A-A-A---T-T-T--A-A-AGGGTT-A----T--------T-AAGAAATTCTAAATTTA--AAGGTGCAAC-CCG-CAATTTCA-GCC
gi|24080 : --GTCAACAT----TT-------TTATCAGCTTT-GCTTT--GGTACCAAAATT-T-T-AAA---TTAAA-T-CA---A-A-G-G---T-T-G--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-TCG-AAATTTCA-GCTTTG--TA--------TAT----TAAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----T-------A--C---AATGTCTGTAAnnnnnnnnnnaa
gi|24081 : --GTCAAAAT----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAGTTAT-T-AAA---TTCAGAA-A----A-A-G-G---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TG--AAGGTGCCAC-CTG-AAA-TTCA-GCTTTG--TA--------TAT----TGCA---T-TG-GTATT----AGC
gi|24082 : --GTCAACAG----TT-------TTATCAGCCTT-ACATT--GGTACCAAAATTAT-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-A-G---G-T-TAAA-A-AGAGTT-A----T--------TAAACAAACAC------TA--AA
gi|24083 : --GTCAGCAA----TT-------TTATCAGCTTT-TATCT--GATAT---AA-------AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A----GAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAC-CAG-TAATTTCA-GCTGTG--TA--------TAT----TGAA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTTTGTAAttcaaatgaaatgcaattgtcctgttaaccttactccatttatgca
gi|24084 : --GTCATCAT----TT-------GTATCAGCATT-ACGTT--AGTACCAAAAGTAT-A-AGC---TTCAA-A-C----AGA-G-A---T-T-C--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAAATC------TG--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTCA-ACCGTT--TATATACACGTAT----TGTA---T-TG-ATATT----AGCGT-----GT------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24085 : --GTCAAAAT----TT-------CTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTTT-C-AAA---TTCAG-A------------------------------------------------TAAAGGAATAC------TT--AATGTGCCGC-CCG-AAATTTCA-GTCTTG--TA--------TAT----TGAA---T-TG-AAATT----AGCCT-----G-------C--T---GGTCACTG
gi|24086 : --GTAAACAA----TT-------TCATCAGCTTT-ACTTT--GATACCAAAATTAT-C-AAA---TTCTG-A-CT---A-A-G-T---T-T-C--A-A-TGAGAT-A----C---------------ATAG------TT--AAGTTCCCAT-CTC-AAATGTCA-GCCATG--TA--------TGA----TAAA---T-CG-GTATA----AGCCT-----GA------C--C---AATCTATGCAA
gi|24087 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTACCAAAGGTAT-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-A-T---T-T-T--ATA-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAAGTG
gi|24088 : --GTCAACA-----TC-------TTATTAGCCTT-GTTTT--GGTATCGGAACTAT-T-AAA---TTCAG-A-CTATTA-A-G-G---T-T-C--A-A-AG----------------------AAAAATAC------TA--CAGGTGCCAT-CCG-AAATATTATGCC-T---TA--------TAT----TCTG---T-TG----------AGTCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24089 : --GTTAATAT----TT-------GTGTTAGGTTTCACTTT--ACCACAAAAATTCT-T-AAA---TTCTG-A-C----A-A-T-GG--T-T-T--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATGC------TA--ATGGTGCCAT-CCG-AATTTTCA-ACTACG--TA--------CAA----TAAA---T-TG-
gi|24090 : --GTCATCAT----TT-------TTATCAGCGTT-ATTTT--CATATCAACATTAT-C-AAA---TTCAG-A-CA---A-A-T-A---T-T-C--A-A-AAAGTT-A----T--------AAAAGAAAATC------TA--AAGGTGC
gi|24091 : --GTCAACAA----TT-------GTATCAGCTTT-ACATT--GTCACAATAATTGT-T-AAA---TTCCA-A-CA---A-A-T-A---T-T----A-A-AG-GTT-AAAGGT--------TAAAG
gi|24092 : --GTCATCAC----TT-------TTATCAGCTT--ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------TA--A--GTGCccagaa
gi|24093 : TCAATA-----TT-------TTATCAGGTAT-ACTTC--GGTAGCAAAATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-G---TAT-C--A-A-AGAGTC-A----TCATTAAAATAAAGAGACAT------TA--AAGGCACCGC-TCA-AAATTTCA-GGTGTG--TA--------TGT----TGAA---C-TG-ATATA----AACCT-----G-------C--C---GATCTCTGTAA
gi|24094 : AACA-----TT-------TTATCATTTTT-ACGTT--GGTACCAATATTAT-T-AAA---TTCAG-A-CA---A-A-G-G---T-T-T--A-A-AAATTT-T----T--------TAACAAAA----------A--AA--T-CTAC-CTG-AAATTTAA-GACATG------------TAT----TGAA---T-TG-ATATT----AGGCT-----G-------T--C---AATCTCTGCAA
gi|24095 : tcaTCGACAA----TT-------T-ATCAGCTTT-AATTT--GATTCCATCCTTAC-T-AAA---TTCAG-A-C----ATT-G-A---T-T-G--A-A-ATAGTT-A----T--------TAAAGAAA
gi|24096 : TCAACAT----TT-------TTGTCAGCTTC-ACTTT--AGTACCAAAATTAT-T-AAA---TTAAG-A-
gi|24097 : CAACAT----TT-------TTATTAGCTTT-ACTTT--GGTACCATATTTAT-T-AAG---TTTAG-A-A----A-A-A-AAGTT-T-C--A-gcatt
gi|24098 : AATAA----TG-------TTAACAGCTTT-GCTTT--GGTATCAAGATTAT-T-GAA---TTCAG-A-CAATGA-A-A-A---T-GAC--ACA-AAAGTT-A----T--------AAAATAAATGC------TATGATGGTGCCAC-CTG-AAACTTCA-GACATA--CA--------TAC----TGAATATT-TG-ATATG----AACCC-----G-------T--G---GATCTCTGTAAtcaaataag
gi|24099 : CAA----TT-------TTATCTGTTTT-ATTTT--GGTACCAATAGTAT-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--G-A-AGAATT-A----A--------TAAAGAAATAC------TA--AAAGTGCCAT-TAG-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---TGTCTCTGTAA
gi|24100 : CAT----TT-------GTATCAGCTTT-ACTTT--TATACCACAATTAT-C-AAA---TTTAG-A-A----A-A-G-A---T-T-C--A-A-ATACTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--TTGATGCCAC-GCG-CAATTTCA-GCCGTG--TA---------------------------CT-TT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24101 : CAT----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGCACCAAAATTGT-T-AAA---TTCAG-ACC----A-A-G-A---T-T-C--G-A-AGAGTT-A----T--------TATAGAAATAC------CA--ACAGT-------------------GCCGTT--GA--------CAT----TATA---T-TG-CTATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24102 : ----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GGTACCAAATTTAA-T-AAA---TTCAA-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----C--------TAAATAAATAC------TA--GAGGTGCCAC-CCT-GAATTTCA-GCCGTG--TA--------TAT----CATA---T-CG----------AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24103 : ----TT-------TTATCAGTTTT-ACTTT--GGTACCAAAATTAT-C-AAA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGCCAC-CTG-AAATTTCA-GTCGTG--CA--------CAT----TATA---C-TG-CTATT----ACCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24104 : ----TT-------TTATCAGCTTT-ACTTT--GATGTCAACATTAT-T-ATA---TTCAA-A-C----A-C-C-T---G-T-G--A-ATAAAGTT-G----T--------TAAAGAAGTAC------TA--AAGATGCCAA-CCT-AAATTTCA-GCCGTG--TA--------TGT----TGGA---T-TG-
gi|24105 : ----TT-------TTATCAGTTTA-ACTTT--GGTACCGAT-TTGT-TTAAA---TTTAT-A-C----A-A-AGA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----T--------TAAAGAAGTAC------TA--AAGGTGCCAG-CCG-GAATTTCA-GCTATG--T
gi|24106 : AA----CT-------TTATCA----T--CTTT--GGTACCAACATTGT-T-AAA---TCCAG-A-CA---A-A-G-G---T-T-C--A-A-AAGATT------T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAT-CCG-AAATTTCA-GCAATG--TA--------TGT----TGCA---C-TG-ATATT----AGCCT-----A-------T--C---AGTCTCTG
gi|24107 : AA----CT-------TTATCA----T--CTTT--GGTACCAAAATTGT-T-AAA---TCCAG-A-C----A-A-G-GG--T-T-CT-A-A-AGA-TT------T--------TAAAGAAATAC-------A--AAGTTGTCAT-CCG-AAATTTCA-GCCATG--TA--------TGT----TGCA---C-TG-AAATT----AGCCT-----c
gi|24108 : CTTT-CCTTT--GGTACCAAAGCTGT-T-AAA---TTCAA-A-C----A-A-A-GG--T-T-C--A-A-AAAGTT-A----T--------TAAAGAAATAC------TA--AAGGTGTCAC-CCG-AAATCCCA-GTCTTT--TA--------TAT----T-TA---T-TG-GTATT----AACCT-----G-------C--C---ATTTTCTGTAA
gi|24109 : TTC-ACTTT--GGTAACAAAATTAT-T-GAA---GTCAG-A-C----A-ATG-G---T-T-G--G-A-AATGTC-A----T--------TAAAGAAGTTC------TA--AAGGAGCCGC-CCA-AAATTT-A-GCCTTA--TT--------TAT----TAAA---T-TG-ATGGT----AGCCT-----G-------T--C---TGTCTCT
gi|24110 : AATTAT-T-AAA---TTCAG-A-C----A-A-A-AG--T-T-C--A-A-AGAGTT-G----T--------TGAAGAAACAC------TT--GAGGTGCCAC-ACG-GACTTTCA-GCCGTG--TG--------TGT----TTAA---T-TG-ATATT----AGCTT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAAC
gi|24111 : TTGT-T-AAAGAGTACAG-A-C----A-A-ATA---T-T-C--A-A-AGAGTT-A----A--------TAAAGAAATAC------AA--AAAGTGTCAC-CCA-AAATTTCA-TCCGTG--CA--------TAT----TACA---T-TG-ATATT----AGCCT-----G-------C--C---AGTCTCTGTAA
gi|24112 : T-T-TAA---TTCAG-A-C----A-A-AGA---T-T-T--A-A-AGAGTT-A----T--------AAAAGAAATAC------TA--AAGGGGCCAC-CCGAAAATTTCA-GCCATG--TA--------CATTTAATATA---T-TG-TTATT----AGCCT-----G-------C--C---CGTCTCTGTAA
gi|24113 : ---T-T-A--A-A-AAAGTA-A----T--------TTAAGAAATGC------TA--GGGGTACCAC-CGT-AAATTTGA-GCTGTG--TG--------TAT----TCAA---T-TG-TCGTT----AGCCT-----C-------CTCC---GATCTCTGCAACGATTTTGGAACGAAGCCTCTGATT-GGCTAATC---CCAAAGACCCTAGTACAGTGGTGTGACG-------ATAGCGGTGGACCGATATATTTTATT-T------AA-CGGCG-CACCGCTATTAA-AT--ATCGGTGGACCG
gi|24114 : agacttttTAATCGGGTCAAAGGCACCAGTAC--CGGTGCATCGTTATT--ATATCGGTACACTGATAT-TTTTGTT-TT-----AA-CGGTG-CACCGATA--AA-AT--
gi|24115 : AAAACCCAAATATAGCGGTTCATCGTTAAAATATAGCGGTGGACCGATAAA----ATA-T------AG-AGGTG-CACCGATATTAT-AT--AGCGGTGCACCG
gi|24116 : -------ATAGTGGTGCACCGATTTATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCAATAACAT-AT--ACCGGTGCACC
gi|24117 : CGGTGAACCGATATA-TTTATTGT------AA-CGGTG-CACCGATAACAT-AT--ACCGTTGCACCG
gi|24118 : CGGTGCACCGTTAC---TTATT-T------AA-CGGTC-CACCGATATTTA-AT--AGCGGTGCGCCG
gi|24119 : CGATGCACCGATATATTTGTTT-T------AA-CAGTG-CACCGATAAAAT-AT--ACCGTTGCACC
gi|24120 : CGGTGCACCGATATATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCGATAACAT-AT--ACCGGTACACCG
gi|24121 : CGGTGGACCGTTTTTTTTTGTT-TC-----AA-CGGTG-CACCGATAAAAT-AT--ACCGGTG
gi|24122 : GGTGCACTGATATATTTGTTT-T------AA-CGGTG-CACCGATA--AA-ATAAACCAGTGCACC