lowQualScore                  :                                             222222222222222                                                                   22222                         444444444444444444444444444444               33333333                  1111111111111111111111                1111111          1111111                                       
lowQualScore                  :          0 0 0   11 5555      0  0    0 1 0 000000000000000    1           0 0 111 11 1111 1 44  22 11     2 1 99 5555555 1   00000   222  444444444      1 666666666666666666666666666666    1  555     33333333         88 22    9999999999999999999999    5555  33 3  0000000          2222222 2    2    9           55      6 6     
lowQualScore                  :          . . .   .. ....      .  .    . . . ...............    .           . . ... .. .... . ..  .. ..     . . .. ....... .   .....   ...  .........      . ..............................    .  ...     ........         .. ..    ......................    ....  .. .  .......          ....... .    .    .           ..      . .     
lowQualScore                  :          5 5 5   22 0000      5  5    5 1 5 000000000000000    0           5 6 222 00 7777 6 55  44 22     7 0 66 0000000 1   00000   111  888888888      3 111111111111111111111111111111    5  333     88888888         77 66    6666666666666666666666    0000  22 9  1111111          8888888 5    7    2           55      7 7     
consensus                     : ATAAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCGC-GC-TTTG-A-A-C-----CG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-G---G--A----T-AA-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG-TGATGAATGAAG--ATGA-TTCACAT-AATAAGNC---G-TGTC----TA--TATTCA-A--NTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATNNTACAAC-T-ATTTT
Reference ( gi|128820 )       : ATAAGTTTT-T-A-TTT--AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-A-C-----AA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-G---G--A----T-AG-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG-TGATGAATGGAG--ATGA-TTCACAT-AATAAGTC---G-TGTC----TA--TATTCA-A--CTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
gi|128822                     : ATAAGTTTT-T-A-TTT--AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-A-C-----AA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-G---G--A----T-AG-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG-TGATGAATGGAG--ATGA-TTCACAT-AATAAGTC---G-TGTC----TG--TATTCA-A--CTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
gi|128823                     : ATAAGTTTT-T-A-TTT--AA---CCTCGC-GC-TTTG-A-A-C-----CA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-G---G--T----T-AA-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----AG-TGATGAATGAGG--ATAATTTCACTT-AATAAGAC---G-TGTC----AA--CATTGA-A--ACTTGAAGTTT-A-----T-CTTT-AATTAAGTT
gi|128824                     : ATAAGTTTT-T-A-TTT--AC---TGTCGC-GC-TTTG-A-A-T-----CA--------GTCA-TTTTAGCGAGC-A-G---G--A----T-AA-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-AGAT-GAT--TAATG-----AG-TGATGAATGAAG--ATA----------AATAAGAC---A-TGTT----GA--CATTCA-G--ATTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACAAAGTTGCATAATCATACAAC-T-ATTTT
gi|128825                     : ATAAATTTT-T-A-TTT--AC---TCTTGC-GC-TTTG-A-A-C-----TA--------GTCA-TTTTGGCGACC-A-G---G--A----T-AA-GA--T--AATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----AG-TGATGAATGAGG--ATGATTTCACAT-AATAAGAC---G-TGTC----GA--CCTTCA-A--ACTTGAAGTTT-A-----T-CTTT-AATT
gi|128826                     : ATAAATTTT-T-A-TTT--AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-A-C-----CA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-T---G--A----T-AA-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--C-ATAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-TGAT-GAA--TAATG-----AG-TGATGAATGAAG--ATGATTTCA-ATAAATAAGAA---G-AGTT----TG--CATTCA-A--ATTTGTAGCTT-A-----T-agatt
gi|128827                     : ATAAGTTTT-T-A-TTT--AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-A-C-----TA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-C-A---G--A----T-AA-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA----AAAA---AG---------ATAATTAA---T-----GT--ATAC------T---TG-TAGT-AAT--TGACG------A-TGATGGATGATG--ATGA------AT-GATGATTA---T-TATCTTTTTA--TATTTA-AGTATTTCTAGCTT-------T-TATTGAATTGAATTG
gi|128828                     : ATAAGTTCT-A-A-TTT--AT---CCTCAC-GC-TTTG-A-A-CT----GA--------GTCA-TTTTAGTGAGC-T-G---G--A----T-AA-GA--T--GATTA-T-TA-A-------A-AAA--A-TAAA---AG---------ATGATT-A---T-----AT--ATGT------A---GT-TGAT-GAT--T-ATG------A-TGATGACCGATG--ATTA-TTTACTT-G--AAGTTTAAG-TATT----TA--T-TT---A--TTTTTA--TTT-T-----T-TATT-GACT-AGTAGTTTA
gi|128829                     : ATAAGGTTT-T-A-TTT--AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-A-CT----GA--------GTCA-TTATGGCGAGC-C-G---G--A----T-AA-GA--C--GACTA-T-T--A-------A-AAA--A-TAAA---AG---------ATGATT-A---T-----A------T------T---TG----T-AGT--TGATG------A-TGAT-AATGATG--ATG-------AT-GATAACTG---A-TGAT----TA--T-TT---A--GTTTGAAGTTT-AAGTATT-TATT-TATT---TTGTT
gi|128830                     : ATAAGTATT-T-A-TTT--AC---CCCCGC-AC-TTTG-A-A-CT----AA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-C-G---G--A----T-AG-GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ATGATT-A---C-----atatttttttttgactactagtttagttgattattttaattactaatattt
gi|128832                     : ATAAGTATT-T-A-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-T-CT----AA--------GTCA-TTTTGGCAAGC-C-G---G--A----T-AG-GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ATGATT-A---C-----
gi|128834                     : ATAAGTATT-T-G-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-A-CT----AA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-C-G---G--A----T-AA-GA--T--GATTA-T-T--T-------A-AAA-----AAA---AG---------ACGACT---------------ATTTAAAA--CCAATGACGAT-GAT--GAAGA-----TGATGATGAAC---G--ATGA-TT
gi|128831                     : ATAAGTATT-T-G-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-A-CT----AA--------GTCA-TTTTTGCGAGC-C-G---G--A----T-AA-GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ACGATT---------------ATTTAAAAC-C---AA-TGAT-GA---TAATGAAGA-CGATGATGAACGATG--ATGA-TTattt
gi|128836                     : ATAAGTGTT-T-C-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-A-CT----AA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-C-G---G--A----T-AA-GA--T--GATTATT-T--A-------A-AAA-----ACA---GG---------ATGATT-G---C-----t
gi|128837                     : ATAAGTATT-T-G-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-A-CTATTTAA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-C-G---G--A----T-AA-GA--T--GATTATT-T--A-------A-AAA--T----A---AG---------ACGACT---------------ATTTAAAAACC---AA-TGAT-GATGATGATGAAGATTA-TGATGAAT---G--ATGA-TT
gi|128833                     : ATAAGTTTT-T-G-TTT--AC---CCTCAC-AC-TTTG-A-A-CT----AA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-C-G---G--A----T-AA-GG--T--GATTA-T-TG-A-------A-AAA--T----A---AG---------ATGACT-A--------------TTTAAAAC-CAA-TGATGAT-GAT--GAAGA-----TGATGATGAAC---G--ATGA-T--------------------------------TATTT--A--CTTTGGAGTTTAA-----T-TATC-AATT---TTATTTAattt
gi|128839                     : ATAAGTTTT-T-A-TTT--AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-A-C-----AA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-A---A--C----T-AT-GG--TGAGACT--T-T--A-------A--------TGAA---AG---------AT
gi|128840                     : ATAAATATT-T-A-TTT--AC---CCTCGC-GC-TTTG-A-A-CT----AA--------GTCA-TTTTGACGAGC-C-G---G--A----G-AA-GA--G--GATTA-T-T--T-------A-AAA--A-TATA---AG---------ATGATT-A---------A-----------------TG-T--T-GA----AATG---------------TGGAG--TTGA-T--A-AT-GATGA-CC---GTTGAT----TA--T-TT---A--CTTTGAAGTTT-AAGTATT-TATT-A
gi|128838                     : ATAAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTTGC-GC-TTTG-A-A-C-----CA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-A---A--A----TCAGTGACTT--GATTA-T-t
gi|128835                     : ATAAGTATT-T-G-TTT--AC---CCTCAC-ACCTTTG-A-A-CT----AA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-C-G---A--G----T-AG-GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ACGACT-A---------------------------TA-TAA--AAC--CAATGA----TGATGATGAACGATG--ATTA-TTTACTT-------TG---G-AGTT----TAAGTATTCA-----TTT----TTT-T-----T-TATT-Aa
gi|128821                     : ACAAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCGC-GC-ATTG-A-A-C-----CA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-ATG---G--A----T-
gi|128842                     : ATAAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCGT-GA-TTTG-A-A-T-----CA--------GTCA-ATTTGGCGAGC-A-G---
gi|128843                     : ATCAGTATT-T-A-TTT--AC---CCTCGT-GT-GTTG-A-A-C-----CC--------GTCA-TATTGGCAAGC-A-G---A--A----T-AA-GG--T--GATTA-A-T--A-------A-A
gi|128844                     : ATACGTTTT-T-A-TTA--AC---TCTCGC-AC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTTA-TTTTGGCGAGC-A-G---G--taagatatttca
gi|128845                     : ATAAGTTTT-A-A-TTC--AC---CCTCGC-GA-TTTG-A-T-T-----CA--------GTAA-TTTTGGCGAGC-A-G---
gi|128841                     : ATAAGTTTT-T-G-TTT--AC---CCTAAC-GC-TTTG-A-A-A-----TA--------GTAA-TTTTGGCGAGC-A-C---A--AAACAC-AA-AAGTT--GATTA-T-T--G-------T-AAT--T-T--A---TT---------ATGATT-G---------AT--A-----------------GAC-GAT--TGATG-----AC-TGAT---TGTAG--ATGA-TT
gi|128846                     : ATAATTTTT-T-A-TTT--AC---CATCGC-AC-TTTG-A-A-------------------CA-TTTTAGCGAGC-A-G---atttcttactaag
gi|128847                     : ATATGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCGC-----TTG-A-A-C-----CA--------GTCA-TTTTG
gi|128848                     :  TAAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCGG-GC-TTTG-A-A-A-----CA--------GTCA-TTTAGGTGAGC-A-G---A--T----T-AA-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--AAATG-----AG-TGATGAATGAAG--ATGATTTCAATT-AATAAGAC---G-AGTT----GA--CATTCA-A--ATTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTAAGTTGCATAATCATATAAC-T-ACTTT
gi|128850                     :  TGAGTTTT-T-G-TTT--AC---CCTCAC-AC-CATA-A-A-C-----TA--------GTCA-TTTTGTCGAGC-A-G---C--A----T-AA-GA--T--GATTA-T-T--G-------A-AAA--CAAAAA---AG---------ATGATT-ATTGT-----AA--ATTT------A---T----AT-GAT--TGATGA----TG--GATG-ATG--G--ATGA-TT
gi|128851                     :  TAATTATT-T-A-TTT--AC---CCTCGT-GC-TTTG-A-A-CC----AA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-C-G---G--A----T-AA-GA--G--GATTA-T-T--T-------A-AAA--A-TATA---AG---------ATGATT-----C-----A-----------------TG-T--T-GA----AATG---------------TGGAG--TTGA-T---GAT-GATGA-CC---GTTGAT----TA--T-TT---A--CTTTGAAGTTT-A-----
gi|128854                     :  TAAGTTGTGT-T-TTT--AC---CCTTGC-AC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TATTGGCGAGC-A-G---G--A----A-AA-GA--T--GATTA-T-TTGA-------A-AAA-----AAA---AGTCATTATGAATGAAT-A---C-----AG--AT---------------TGAT-GAagtatttaattatta
gi|128849                     :  TAAGTATT-T-A-TTTT-AT---CCTCAC-GC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-G---A--A----T-
gi|128856                     :  TAAGTTTT-T-A-TCT--AC---CCTCGT-GC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TTCTGGCGAGC-A-----G--A----T-A
gi|128855                     :  TAAGTTTT-T-A-TTT--AT---CCTTGC-GC-TTTG-A-A-C-----TG--------TTCA-TTTTGGCGAGC-A-A---G--A----A-AA-TA--G--AGTTA-TAT--ACAGAGCTA-ACA--T-TACATTCAG---------AGAATT-A---T-----ACAAATTT------G---TA-TTATGGAT----ATG-----TG-T
gi|128858                     :  TAAGTTTT-T-A-TTT--TC---CCTTGC-GC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTTA-TTTTGGCGAG
gi|128857                     :  TAAGATTA-T-AATTT--AC---CCTCGC-TT-TTTG-A-G-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-G---A--A------AA-GA--T--TATTA-G-T--C-------A-AAA--
gi|128860                     :  TATGTTTT-T-A-TTT--AC---CTTCAC-AC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAAC-A-
gi|128852                     :  TAAGTTTT-T-G-TTT--AC---CCTAGT-GC-TTTG-A-A-C-----TG--------GCCA-TTTTGGCAGGC-A-G---
gi|128859                     :  TAAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCAA-GC-TTTG-A-A-C-----TG--------GCCA-TTTTGGTGAAA-A-G---A--A----T-
gi|128853                     :  TAAGTTTA-T-G-TTT--AC---CCTTGC-GC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGTGATC-A-
gi|128861                     :  TGAGTTTT-A-A-TAT--AC---CCTCGC-GC-TTTG-A-C-C-----TG--------GTTG-TTTTGGCTAGC-A-G---GATA----T-AC-GA--T--GGTT
gi|128862                     :  TAAGTTTT-T-T-TTT--ATTTTCCTCAC-GC-TTTG-TTG-C-----AG--------G-CA-TTTTGGCGAGC-A-G---G--
gi|128863                     :  TAAGCGTT-T-C-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTGG-A-T-C-----TA--------GGCT-TTTTGGCGAGCAA-G---A--A----C-AG-AA-----GATTA-gcaaagcgttat
gi|128864                     :  TAAGTCTT-T---TTG--AC---CTTTTC-GC-GTTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-G---
gi|128865                     :   AAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTTA-TTTTGGCGAGC-A-T---G--A----A-CA-GA--T--G---C-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TG-TGACGAATtaacggtacattataa
gi|128866                     :   AAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-A-C-----TG--------TTCA-TTTTGGCGAGC-A-T---G--A----A-CA-GA--T--G---C-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TA-TGACGAAT
gi|128868                     :   AAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-A-A-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-C-T---G--A----A-CA-GA--T--G---C-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TA-TGACGAAT
gi|128867                     :   AGGTTTG-T-A-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-C---G--A----A-CA-AA--T--GATTA-A-A--A-------ACAAA--T-T-------G---------ATGATT-A-------------GTGTAAAG--C---TG-T-AT-GAA--TGATA-----TA-TGATGAGT-GAGTAGTGA-T--ATAG-AACGA-----------T----TA--TATACATA--TTTTCTAATTT-A-----CATATT-AATTAA
gi|128874                     :   AAGTTCT-T-A-TTT--AC---CGTCGC-GC-TTTA-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-ttaaatt
gi|128873                     :   AAGTTCT-T-A-TTT--AC---CGTCGC-GC-TTTA-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-
gi|128872                     :   AAGTTCT-T-A-TTT--AC---CGTCGC-GC-TTTA-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-
gi|128871                     :   AAGTTCT-T-A-TTT--AC---CGTCGC-GC-TTTA-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-
gi|128869                     :   AAGTTTT-T-C-TTT--AC---CCCCGC-GT-TTTGAA-A-C-----TA--------GGCA-TTTTGGCCAGC-A-G---G--G----T-AA-GC--T--GGTTA-
gi|128882                     :   AAGTTTT-TTA-TTT--AA---CCTCGT-GC-TTTG-A-G-C-----AG--------GTCA-TTTTGGCGAG
gi|128870                     :   AAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-A-C-----TT--------GCCA-TTCTGGCGAAC-A-T---G--A----A-CC-GA--C--G---C-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TA-TGACGGAT
gi|128875                     :   AAGTTCT-T-A-TTT--AC---CGTCGC-GC-TTTA-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGACGAGC-A-
gi|128876                     :   AAGTTTT-T-A-TTT--AC---CGTCAC-GC-TTTA-A-A-C-----TG--------ATCA-TTTTGGCGAGC-A-
gi|128877                     :   AAGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCGC-AC-TCTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGACAAAC-A-
gi|128878                     :   AAGTTCT-T-A-TTT--AC---CGTCGG-GC-TTTA-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-
gi|128880                     :   AAGTTTA-T-A-TTT--AT---CCTAGC-GC-TTTG-A-T-C-----TG--------GTCATTTTTGGCGAGC-A-
gi|128881                     :   AAGTTCT-T-A-TTT--AC---CGTCGC-GC-ATTT-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-
gi|128879                     :   AAGTTTT-T-A-TAT--AC---CATCGCAGC-TTTG-C-T-C-----TA--------GGCA-TTTTGGCGAGC-A-A---T--A----CAAA-GA--T--GATTA-T-
gi|128883                     :    AGTTTT-T-A-TTT--AC---CCTCAC-GC-TTTG-A-A-C-----CT--------GTCA-TTTTGGCAAGC-A-ATACA--A----T-GT-AA--T--GTTTACT-T--A-------A-AGA--
gi|128884                     :    AGTTTT-T-A-TTT--AT---CCTCAT-AC-TCTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGC
gi|128885                     :     GTTTT-T-G-TTA--AT---CCTCGC-GT-TTTG-A-A-C-----AG--------GTCATTTTTGGCGAGC-
gi|128886                     :     GTTTT-T-A-TTT--AT---CCTCGA-GC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TGTTAGCG
gi|128887                     :      TTTT-T-A-TTT--AC---CCTTGC-GC-TTTG-A-A-CC----GA--------GTCA-TTTTGGAGAGC-C-G---G--A----T-AA-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--A-TAAA---AG---------ATGATT-
gi|128888                     :      TTTT-T-A-TTT--A-----CT-GC-AT-TTTG-A-A-C-----AATATTAAAAGTCA-TTTTGGCAAGC-A-A---T--A----A-AA-AA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGAT
gi|128889                     :       TTT-T-C-TTT--AT---CCTTGC-AC-TTTG-ATA-C-----TT--------GTCA-TTTAGATGAGC-A-G---G--A----T-AG-GC--T--GATTA-
gi|128890                     :       TTT-T-G-TTT--AC---CCTC-C-GC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-
gi|128891                     :         T-T-C-TTT--AC---GCTCTT-GC-TTTG-A-AAC-----AA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-A---G--A----T-AA-GC--T--GGTTA-T-
gi|128892                     :          -T-A-TTTGCATGA-CCCTGC-AC-TTTA-A-A-C-----AG--------GTCA-TTTTGGCCATC-T-G---G--A----A-AA-CA--T--GATT--T-T--AAT-----A-AAA--T-TAAA---A
gi|128894                     :          -T-A-TTT--GC---TCTCGC-GT-CTTC-A-A-C-----TA--------GTCA-TTTTGGCGAGC-A-A---G--
gi|128893                     :          -T-A-GTC--AT---TCTCAC-AC-TTTG-A-A-C-----TG--------GTTA-TTTCGGCGAGC-A-G---G--A----
gi|128895                     :              -TTT--AC---CCTCTT-GC-TTTG-A-A-C-----TA--------GTCA-TGTTGGCAAGC-A-G---G--A----T-AA-GG--T--GATTA-aaaaa
gi|128896                     :              -TTA--AT---CCTCGC-AC-TTTG-A-T-CCTT--GA----------CA-TTTTGGCGAGT-A-G---G--A----T-AG-GC--T--GATTA-
gi|128897                     :                                                             TCA-TTTTGGCGAGC-A-A---G--A----T-AA-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAACAT-AAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--T-----------------AATGAAG--ATGATTTCAAAT-AATAAGAC---A-TGTC----GA--CATTCA-A--ACTTGAAGTTC-A-----T-CTTT-AACTAGGTTGCATTATCATACAACATAATTTT
gi|128898                     :                                                               A-TTTTGGCGAGC-A-G---G--A----T-AG-GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG-TGATGAATGGAG--ATGA-TTCACAT-AATAAGTC---G-TGTC----TA--TATTCA-A--CTTTGAAGTTT-G-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
gi|128899                     :                                                                                                                                                                                                                                                    C---G-TGTC----TA--TATTCA-A--CTTTGAAGTTT-G-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT

lowQualScore                  :                                            1111111111                                                                 11111                       3333333333333333333333333333333333             22222222                  1111111                                                 11111                                       
lowQualScore                  :           0 0 0   0  000      0  0    0 0  3333333333    0 0          1111 0    0 0 333  22 11     2 1 99 4444444 1   88888   222  444444444      7777777777777777777777777777777777  1  555     77777777          777     8888888 2  5555   44  4   55555   6  777 444          2 11111 2    2    7           22      5 5     
lowQualScore                  :           . . .   .  ...      .  .    . .  ..........    . .          .... .    . . ...  .. ..     . . .. ....... .   .....   ...  .........      ..................................  .  ...     ........          ...     ....... .  ....   ..  .   .....   .  ... ...          . ..... .    .    .           ..      . .     
lowQualScore                  :           5 5 5   5  999      5  5    5 5  1111111111    5 5          1111 5    8 8 444  22 11     6 0 33 9999999 1   99999   000  777777777      5555555555555555555555555555555555  4  444     66666666          999     4444444 5  3333   88  7   55555   8  555 222          4 88888 5    7    7           00      7 7     
consensus                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-GC-TTTG-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG-TGATGAATGA--NGATGA-TTCACAT-AA----TAAGNCG-TGTC----TATATTCA-A--NTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
Reference ( family-371 )      :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-GC-TTTG-A-ACCG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG-TGATGAATGA--AGATGA-TTCACAT-AA----TAAGNCG-TGTC----TATATTCA-A--NTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATNNTACAAC-T-ATTTT
gi|128820                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-ACAA--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-GGAT-A-G---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG-TGATGAATGG--AGATGA-TTCACAT-AA----TAAGTCG-TGTC----TATATTCA-A--CTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
gi|128821                     :  ACAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-GC-ATTG-A-ACCA--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----ATGGAT-
gi|128822                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-ACAA--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-GGAT-A-G---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG-TGATGAATGG--AGATGA-TTCACAT-AA----TAAGTCG-TGTC----TGTATTCA-A--CTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
gi|128823                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AA---CCTCGC-GC-TTTG-A-ACCA--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-GGTT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----AG-TGATGAATGA--GGATAATTTCACTT-AA----TAAGACG-TGTC----AACATTGA-A--ACTTGAAGTTT-A-----T-CTTT-AATTAAGTT
gi|128824                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AC---TGTCGC-GC-TTTG-A-ATCA--------GTCA-T-TTTAGCGAGC----A-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-AGAT-GAT--TAATG-----AG-TGATGAATGA--AGATA----------AA----TAAGACA-TGTT----GACATTCA-G--ATTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACAAAGTTGCATAATCATACAAC-T-ATTTT
gi|128825                     :  ATAAATTTT-T-A-TTT-AC---TCTTGC-GC-TTTG-A-ACTA--------GTCA-T-TTTGGCGACC----A-GGAT-A-A---GA--T--AATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----AG-TGATGAATGA--GGATGATTTCACAT-AA----TAAGACG-TGTC----GACCTTCA-A--ACTTGAAGTTT-A-----T-CTTT-AATT
gi|128826                     :  ATAAATTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-ACCA--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-TGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--C-ATAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-TGAT-GAA--TAATG-----AG-TGATGAATGA--AGATGATTTCA-ATAAA----TAAGAAG-AGTT----TGCATTCA-A--ATTTGTAGCTT-A-----T-agatt
gi|128827                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-ACTA--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----C-AGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA----AAAA---AG---------ATAATTAA---T-----GT--ATAC------T---TG-TAGT-AAT--TGACG------A-TGATGGATGA--TGATGA------AT-GA----TGATTAT-TATCTTTTTATATTTA-AGTATTTCTAGCTT-------T-TATTGAATTGAATTG
gi|128828                     :  ATAAGTTCT-A-A-TTT-AT---CCTCAC-GC-TTTG-A-ACTGA-------GTCA-T-TTTAGTGAGC----T-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-TA-A-------A-AAA--A-TAAA---AG---------ATGATT-A---T-----AT--ATGT------A---GT-TGAT-GAT--T-ATG------A-TGATGACCGA--TGATTA-TTTACTT-GAAGTTTAA---G-TATT----TAT-TT---A--TTTTTA--TTT-T-----T-TATT-GACT-AGTAGTTTA
gi|128829                     :  ATAAGGTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-ACTGA-------GTCA-T-TATGGCGAGC----C-GGAT-A-A---GA--C--GACTA-T-T--A-------A-AAA--A-TAAA---AG---------ATGATT-A---T-----A------T------T---TG----T-AGT--TGATG------A-TGAT-AATGA--TGATG-------AT-GA----TAACTGA-TGAT----TAT-TT---A--GTTTGAAGTTT-AAGTATT-TATT-TATT---TTGTT
gi|128830                     :  ATAAGTATT-T-A-TTT-AC---CCCCGC-AC-TTTG-A-ACTAA-------GTCA-T-TTTGGCGAGC----C-GGAT-A-G---GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ATGATT-A---C-----atatttttttttgactactagtttagttgattattttaattactaatattt
gi|128831                     :  ATAAGTATT-T-G-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-ACTAA-------GTCA-T-TTTTGCGAGC----C-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ACGATT---------------ATTTAAAAC-C---AA-TGAT-GA---TAATGAAGA-CGATGATGAACGA--TGATGA-TT
gi|128832                     :  ATAAGTATT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-TCTAA-------GTCA-T-TTTGGCAAGC----C-GGAT-A-G---GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ATGATT-A---C-----t
gi|128833                     :  ATAAGTTTT-T-G-TTT-AC---CCTCAC-AC-TTTG-A-ACTAA-------GTCA-T-TTTGGCGAGC----C-GGAT-A-A---GG--T--GATTA-T-TG-A-------A-AAA--T----A---AG---------ATGACT---------------ATTT---------------AA-AAC--CAATG------A-TGATG-ATGA--AGATG-------AT-GA----TGAACGA-TGAT----TAT-TT---A--CTTTGGAGTTTAA-----T-TATC-AATT---TTATTTA
gi|128834                     :  ATAAGTATT-T-G-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-ACTAA-------GTCA-T-TTTGGCGAGC----C-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--T-------A-AAA-----AAA---AG---------ACGACT---------------ATTTAAAA--CCAATGACGAT-GAT--GAAGA-----TGATGATGAACGA--TGATTA-TT
gi|128835                     :  ATAAGTATT-T-G-TTT-AC---CCTCAC-ACCTTTG-A-ACTAA-------GTCA-T-TTTGGCGAGC----C-GAGT-A-G---GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ACGACT-A---------------------------TA-TAA--AAC--CAATGA----TGATGATGAACGA--TGATTA-TTTACt
gi|128836                     :  ATAAGTGTT-T-C-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-ACTAA-------GTCA-T-TTTGGCGAGC----C-GGAT-A-A---GA--T--GATTATT-T--A-------A-AAA-----ACA---GG---------ATGATT-G---C-----tttggagtttaagtattcatttttttttatta
gi|128837                     :  ATAAGTATT-T-G-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-ACTATTTAA---GTCA-T-TTTGGCGAGC----C-GGAT-A-A---GA--T--GATTATT-T--A-------A-AAA--T----A---AG---------ACGACT---------------ATTTAAAAACC---AA-TGAT-GATGATGATGAAGATTA-TGATGAATGA--TGATTA-TT
gi|128838                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTTGC-GC-TTTG-A-ACCA--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-AAAT-C-AGT-GACTT--GATTA-T-t
gi|128839                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTG-A-ACAA--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-AACT-A-T---GG--TGAGACT--T-T--A-------A--------TGAA---AG---------ATa
gi|128840                     :  ATAAATATT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-GC-TTTG-A-ACTAA-------GTCA-T-TTTGACGAGC----C-GGAG-A-A---GA--G--GATTA-T-T--T-------A-AAA--A-TATA---AG---------ATGATT-A---------A-----------------TG-T--T-GA----AATG-----TG-----GAGT-------TGA-T--A-AT-GA----TGA-CCGTTGAT----TAT-TT---A--CTTTGAAGTTT-AAGTATT-TATT-A
gi|128841                     :  ATAAGTTTT-T-G-TTT-AC---CCTAAC-GC-TTTG-A-AATA--------GTAA-T-TTTGGCGAGCACAAA-ACAC-A-A---AAGTT--GATTA-T-T--G-------T-AAT--T-T--A---TT---------ATGATT-G---------AT--A-----------------GAC-GAT--TGATG-----AC-TGAT---TGT--AGATGA-TTt
gi|128842                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGT-GA-TTTG-A-ATCA--------GTCA-A-TTTGGCGAGC----A-Gatttcttactaag
gi|128843                     :  ATCAGTATT-T-A-TTT-AC---CCTCGT-GT-GTTG-A-ACCC--------GTCA-T-ATTGGCAAGC----A-GAAT-A-A---GG--T--GATTA-A-T--A-------A-A
gi|128844                     :  ATACGTTTT-T-A-TTA-AC---TCTCGC-AC-TTTG-A-ACTG--------GTTA-T-TTTGGCGAGC----A-GGtaagatatttca
gi|128845                     :  ATAAGTTTT-A-A-TTC-AC---CCTCGC-GA-TTTG-A-TTCA--------GTAA-T-TTTGGCGAGC----A-G
gi|128846                     :  ATAATTTTT-T-A-TTT-AC---CATCGC-AC-TTTG-A-A-------------CA-T-TTTAGCGAGC----A-G
gi|128847                     :  ATATGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-----TTG-A-ACCA--------GTCA-T-TTTG
gi|128848                     :   TAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGG-GC-TTTG-A-AACA--------GTCA-T-TTAGGTGAGC----A-GATT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--AAATG-----AG-TGATGAATGA--AGATGATTTCAATT-AA----TAAGACG-AGTT----GACATTCA-A--ATTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTAAGTTGCATAATCATATAAC-T-ACTTT
gi|128849                     :   TAAGTATT-T-A-TTTTAT---CCTCAC-GC-TTTG-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-GAAT-
gi|128850                     :   TGAGTTTT-T-G-TTT-AC---CCTCAC-AC-CATA-A-ACTA--------GTCA-T-TTTGTCGAGC----A-GCAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--G-------A-AAA--CAAAAA---AG---------ATGATT-ATTGT-----AA--ATTT------A---T----AT-GAT--TGA----------TGATGGATGAT-GGATGA-TT
gi|128851                     :   TAATTATT-T-A-TTT-AC---CCTCGT-GC-TTTG-A-ACCAA-------GTCA-T-TTTGGCGAGC----C-GGAT-A-A---GA--G--GATTA-T-T--T-------A-AAA--A-TATA---AG---------ATGATT-----C-----A-----------------TG-T--T-GA----AATG-----TG-GAGTTGATGA--TGATGA-------------------CCGTTGAT----TAT-TT---A--CTTTGAAGTTT-A-----
gi|128852                     :   TAAGTTTT-T-G-TTT-AC---CCTAGT-GC-TTTG-A-ACTG--------GCCA-T-TTTGGCAGGC----A-Gagtatttaattatta
gi|128853                     :   TAAGTTTA-T-G-TTT-AC---CCTTGC-GC-TTTG-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGTGATC----A-
gi|128854                     :   TAAGTTGTGT-T-TTT-AC---CCTTGC-AC-TTTG-A-ACTG--------GTCA-T-ATTGGCGAGC----A-GGAA-A-A---GA--T--GATTA-T-TTGA-------A-AAA-----AAA---AGTCATTATGAATGAAT-A---C-----AG--AT---------------TGAT-GA
gi|128855                     :   TAAGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTTGC-GC-TTTG-A-ACTG--------TTCA-T-TTTGGCGAGC----A-AGAA-A-A---TA--G--AGTTA-TAT--ACAGAGCTA-ACA--T-TACATTCAG---------AGAATT-A---T-----ACAAATTT------G---TA-TTATGGAT----ATG-----TG-T
gi|128856                     :   TAAGTTTT-T-A-TCT-AC---CCTCGT-GC-TTTG-A-ACTG--------GTCA-T-TCTGGCGAGC----A--GAT-A-
gi|128857                     :   TAAGATTA-T-AATTT-AC---CCTCGC-TT-TTTG-A-GCTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-GAA--A-A---GA--T--TATTA-G-T--C-------A-AAA--
gi|128858                     :   TAAGTTTT-T-A-TTT-TC---CCTTGC-GC-TTTG-A-ACTG--------GTTA-T-TTTGGCGAG
gi|128859                     :   TAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCAA-GC-TTTG-A-ACTG--------GCCA-T-TTTGGTGAAA----A-GAAT-
gi|128860                     :   TATGTTTT-T-A-TTT-AC---CTTCAC-AC-TTTG-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAAC----A-
gi|128861                     :   TGAGTTTT-A-A-TAT-AC---CCTCGC-GC-TTTG-A-CCTG--------GTTG-T-TTTGGCTAGC----A-GGAT-ATAC--GA--T--GGTT
gi|128862                     :   TAAGTTTT-T-T-TTT-ATTTTCCTCAC-GC-TTTG-T-TGCA--------GGCA-T-TTTGGCGAGC----A-GGGC-A-A---AG--C--G-TTA-T-
gi|128863                     :   TAAGCGTT-T-C-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTGG-A-TCTA--------GGCT-T-TTTGGCGAGC----A-AGAA-C-A---GA--A--GATTA-
gi|128864                     :   TAAGTCTT-T---TTG-AC---CTTTTC-GC-GTTG-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-G
gi|128865                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-ACTG--------GTTA-T-TTTGGCGAGC----A-TGAA-C-A---GA--T--G---C-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TG-TGACGAATtaacggtacattataa
gi|128866                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-ACTG--------TTCA-T-TTTGGCGAGC----A-TGAA-C-A---GA--T--G---C-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TA-TGACGAAT
gi|128867                     :    AGGTTTG-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-CGAA-C-A---AA--T--GATTA-A-A--A-------ACAAA--T-T-------G---------ATGATT-A-------------GTGTAAAG--C---TG-T-AT-GAA--TGATA-----TA-TGATGAGTGAGTAG-TGA-T--------A----TAGAACG--AT-----TATATACATA--TTTTCTAATTT-A-----CATATT-AATTAA
gi|128868                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-AATG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----C-TGAA-C-A---GA--T--G---C-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TA-TGACGAATttaaatt
gi|128869                     :    AAGTTTT-T-C-TTT-AC---CCCCGC-GT-TTTGAA-ACTA--------GGCA-T-TTTGGCCAGC----A-GGGT-A-A---GC--T--GGTTA-
gi|128870                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTG-A-ACTT--------GCCA-T-TCTGGCGAAC--------AT-G-A---AC--C--GACGC-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TA-TGACGGAT
gi|128871                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-TTTA-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-
gi|128872                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-TTTA-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-
gi|128873                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-TTTA-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-
gi|128874                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-TTTA-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-
gi|128875                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-TTTA-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGACGAGC----A-
gi|128876                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CGTCAC-GC-TTTA-A-ACTG--------ATCA-T-TTTGGCGAGC----A-
gi|128877                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TCTG-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGACAAAC----A-
gi|128878                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGG-GC-TTTA-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-
gi|128879                     :    AAGTTTT-T-A-TAT-AC---CATCGCAGC-TTTG-C-TCTA--------GGCA-T-TTTGGCGAGC----A-ATACAA-A---GA--T--GATTA-T-
gi|128880                     :    AAGTTTA-T-A-TTT-AT---CCTAGC-GC-TTTG-A-TCTG--------GTCATT-TTTGGCGAGC----A-
gi|128881                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-ATTT-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-
gi|128882                     :    AAGTTTT-TTA-TTT-AA---CCTCGT-GC-TTTG-A-GCAG--------GTCA-T-TTTGGCGAG
gi|128883                     :     AGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCAC-GC-TTTG-A-ACCT--------GTCA-T-TTTGGCAAGC----A-ATAC-A-ATGTAA--T--GTTTACT-T--A-------A-AGA--
gi|128884                     :     AGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCAT-AC-TCTG-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGC
gi|128885                     :      GTTTT-T-G-TTA-AT---CCTCGC-GT-TTTG-A-ACAG--------GTCA-TTTTTGGCGAGC----
gi|128886                     :      GTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGA-GC-TTTG-A-ACTG--------GTCA-T-GTTAGCG
gi|128887                     :       TTTT-T-A-TTT-AC---CCTTGC-GC-TTTG-A-ACCGA-------GTCA-T-TTTGGAGAGC----C-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--A-TAAA---AG---------ATGATT-
gi|128888                     :       TTTT-T-A-TTT-AC---T---GC-AT-TTTG-A-ACAATATTAAAAGTCA-T-TTTGGCAAGC----A-ATAA-A-A---AA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGAT
gi|128889                     :        TTT-T-C-TTT-AT---CCTTGC-AC-TTTG-ATACTT--------GTCA-T-TTAGATGAGC----A-GGAT-A-G---GC--T--GATTA-
gi|128890                     :        TTT-T-G-TTT-AC---CCTC-C-GC-TTTG-A-ACTG--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-
gi|128891                     :          T-T-C-TTT-AC---GCTCTT-GC-TTTG-A-AACAA-------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-AGAT-A-A---GC--T--GGTTA-T-
gi|128892                     :                   -AC---CCT-GC-AC-TTTA-A-ACAG--------GTCA-T-TTTGGCCATC----T-GGAA-A-A---CA--T--GATT--T-T--AAT-----A-AAA--T-TAAA---A
gi|128893                     : tatttgcatg-T-A-GTC-AT---TCTCAC-AC-TTTG-A-ACTG--------GTTA-T-TTCGGCGAGC----A-GGAA-A-A---AA--
gi|128894                     :           -T-A-TTT-GC---TCTCGC-GT-CTTC-A-ACTA--------GTCA-T-TTTGGCGAGC----A-AG
gi|128895                     :               -TTT-AC---CCTCTT-GC-TTTG-A-ACTA--------GTCA-T-GTTGGCAAGC----A-GGAT-A-A---GG--T--GATTA-
gi|128896                     :               -TTA-AT---CCTCGC-AC-TTTG-A-TCCTT-------GACA-T-TTTGGCGAGT----A-GGAT-A-G---GC--T--GATTA-
gi|128897                     :                                                       TCA-T-TTTGGCGAGC----A-AGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAACAT-AAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--T-----------------AATGA--AGATGATTTCAAAT-AA----TAAGACA-TGTC----GACATTCA-A--ACTTGAAGTTC-A-----T-CTTT-AACTAGGTTGCATTATCATACAACATAATTTT
gi|128898                     :                                                         A-T-TTTGGCGAGC----A-GGAT-A-G---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG-TGATGAATGG--AGATGA-TTCACAT-AA----TAAGTCG-TGTC----TATATTCA-A--CTTTGAAGTTT-G-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
gi|128899                     :                                                                                                                                                                                                                                                CG-TGTC----TATATTCA-A--CTTTGAAGTTT-G-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT

lowQualScore                  :                                                                                                                     11111                       3333333333333333333333333333333333             33333333333                     1111111                                                                                             
lowQualScore                  :           0 0 0   0  000      0  0     1 1 11111  99999    0 0           0    0 0 333  11 11     2 1 99 4444444 1   88888   222  444444444      4444444444444444444444444444444444  1  555     11111111111          22  7777   4444444 2  5555   22  2   55555   4  5 2 444          6666666 2    2    7           22      5 5     
lowQualScore                  :           . . .   .  ...      .  .     . . .....  .....    . .           .    . . ...  .. ..     . . .. ....... .   .....   ...  .........      ..................................  .  ...     ...........          ..  ....   ....... .  ....   ..  .   .....   .  . . ...          ....... .    .    .           ..      . .     
lowQualScore                  :           5 5 5   5  999      5  5     0 0 33333  22222    5 5           5    8 8 444  11 11     6 0 33 9999999 1   99999   000  777777777      8888888888888888888888888888888888  4  444     66666666666          88  5555   5555555 7  7777   44  5   44444   8  1 5 444          3333333 7    9    7           00      7 7     
consensus                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-GC-TTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG----TGATGAATGA-NGA----TGA-TTCACAT-AA----TAAGNCG-TGTC----TATATTCA-A--NTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
Reference ( family-371 )      :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-GC-TTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG----TGATGAATGA-NGA----TGA-TTCACAT-AA----TAAGNCG-TGTC----TATATTCA-A--NTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
gi|128820                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTGA-A-C-----AA-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-GGAT-A-G---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG----TGATGAATGG-AGA----TGA-TTCACAT-AA----TAAGTCG-TGTC----TATATTCA-A--CTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
gi|128821                     :  ACAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-GC-ATTGA-A-C-----CA-----GTCA-T-TTTGGCGAGCATGGAT-
gi|128822                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTGA-A-C-----AA-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-GGAT-A-G---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG----TGATGAATGG-AGA----TGA-TTCACAT-AA----TAAGTCG-TGTC----TGTATTCA-A--CTTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
gi|128823                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AA---CCTCGC-GC-TTTGA-A-C-----CA-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-GGTT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----AG----TGATGAATGA-GGA----TAATTTCACTT-AA----TAAGACG-TGTC----AACATTGA-A--ACTTGAAGTTT-A-----T-CTTT-AATTAAGTT
gi|128824                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AC---TGTCGC-GC-TTTGA-A-T-----CA-----GTCA-T-TTTAGCGAGCA-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-AGAT-GAT--TAATG-----AG----TGATGAATGA-AGA----TA----------AA----TAAGACA-TGTT----GACATTCA-G--ATTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACAAAGTTGCATAATCATACAAC-T-ATTTT
gi|128825                     :  ATAAATTTT-T-A-TTT-AC---TCTTGC-GC-TTTGA-A-C-----TA-----GTCA-T-TTTGGCGACCA-GGAT-A-A---GA--T--AATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----AG----TGATGAATGA-GGA----TGATTTCACAT-AA----TAAGACG-TGTC----GACCTTCA-A--ACTTGAAGTTT-A-----T-CTTT-AATT
gi|128826                     :  ATAAATTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTGA-A-C-----CA-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-TGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--C-ATAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-TGAT-GAA--TAATG-----AG----TGATGAATGA-AGA----TGATTTCA-ATAAA----TAAGAAG-AGTT----TGCATTCA-A--ATTTGTAGCTT-A-----T-agatt
gi|128827                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTGA-A-C-----TA-----GTCA-T-TTTGGCGAGCC-AGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA----AAAA---AG---------ATAATTAA---T-----GT--ATAC------T---TG-TAGT-AAT--TGACG------A----TGATGGATGA-TGA----TGA------AT-GA----TGATTAT-TATCTTTTTATATTTA-AGTATTTCTAGCTT-------T-TATTGAATTGAATTG
gi|128828                     :  ATAAGTTCT-A-A-TTT-AT---CCTCAC-GC-TTTGA-A-C-----TGA----GTCA-T-TTTAGTGAGCT-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-TA-A-------A-AAA--A-TAAA---AG---------ATGATT-A---T-----AT--ATGT------A---GT-TGAT-GAT--T-ATG------A----TGATGACCGA-TGA----TTA-TTTACTT-GAAGTTTAA---G-TATT----TAT-TT---A--TTTTTA--TTT-T-----T-TATT-GACT-AGTAGTTTA
gi|128829                     :  ATAAGGTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTGA-A-C-----TGA----GTCA-T-TATGGCGAGCC-GGAT-A-A---GA--C--GACTA-T-T--A-------A-AAA--A-TAAA---AG---------ATGATT-A---T-----A------T------T---TG----T-AGT--TGATG------A----TGAT-AATGA-TGA----TG-------AT-GA----TAACTGA-TGAT----TAT-TT---A--GTTTGAAGTTT-AAGTATT-TATT-TATT---TTGTT
gi|128830                     :  ATAAGTATT-T-A-TTT-AC---CCCCGC-AC-TTTGA-A-C-----TAA----GTCA-T-TTTGGCGAGCC-GGAT-A-G---GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ATGATT-A---C-----atatttttttttgactactagtttagttgattattttaattactaatattt
gi|128831                     :  ATAAGTATT-T-G-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTGA-A-C-----TAA----GTCA-T-TTTTGCGAGCC-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ACGATT---------------ATTTAAAAC-C---AA-TGAT-GA---TAATGAAGA-CGA---TGATGAACGA-TGA----TGA-TT
gi|128832                     :  ATAAGTATT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTGA-T-C-----TAA----GTCA-T-TTTGGCAAGCC-GGAT-A-G---GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ATGATT-A---C-----t
gi|128833                     :  ATAAGTTTT-T-G-TTT-AC---CCTCAC-AC-TTTGA-A-C-----TAA----GTCA-T-TTTGGCGAGCC-GGAT-A-A---GG--T--GATTA-T-TG-A-------A-AAA--T----A---AG---------ATGACT---------------ATTT---------------AA-AAC--CAATG------A----TGATG-ATGA-AGA----TG-------AT-GA----TGAACGA-TGAT----TAT-TT---A--CTTTGGAGTTTAA-----T-TATC-AATT---TTATTTA
gi|128834                     :  ATAAGTATT-T-G-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTGA-A-C-----TAA----GTCA-T-TTTGGCGAGCC-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--T-------A-AAA-----AAA---AG---------ACGACT---------------ATTTAAAA--CCAATGACGAT-GAT--GAAGA-----TGA---TGATGAACGA-TGA----TTA-TT
gi|128835                     :  ATAAGTATT-T-G-TTT-AC---CCTCAC-ACCTTTGA-A-C-----TAA----GTCA-T-TTTGGCGAGCC-GAGT-A-G---GA--T--GATTA-T-TTAA-------A-AAA--T----A---AG---------ACGACT-A---------------------------TA-TAA--AAC--CAATGA----TGA---TGATGAACGA-TGA----TTA-TTTACt
gi|128836                     :  ATAAGTGTT-T-C-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTGA-A-C-----TAA----GTCA-T-TTTGGCGAGCC-GGAT-A-A---GA--T--GATTATT-T--A-------A-AAA-----ACA---GG---------ATGATT-G---C-----tttggagtttaagtattcatttttttttatta
gi|128837                     :  ATAAGTATT-T-G-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTGA-A-C-----TATTTAAGTCA-T-TTTGGCGAGCC-GGAT-A-A---GA--T--GATTATT-T--A-------A-AAA--T----A---AG---------ACGACT---------------ATTTAAAAACC---AA-TGAT-GATGATGATGAAGATTA----TGATGAATGA-TGA----TTA-TT
gi|128838                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTTGC-GC-TTTGA-A-C-----CA-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-AAAT-C-AGT-GACTT--GATTA-T-t
gi|128839                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGC-GC-TTTGA-A-C-----AA-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-AACT-A-T---GG--TGAGACT--T-T--A-------A--------TGAA---AG---------ATa
gi|128840                     :  ATAAATATT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-GC-TTTGA-A-C-----TAA----GTCA-T-TTTGACGAGCC-GGAG-A-A---GA--G--GATTA-T-T--T-------A-AAA--A-TATA---AG---------ATGATT-A---------A-----------------TG-T--T-GA----AATG-----TGGAGTTGAT-AATGA-TGACCGTTGA-TT
gi|128841                     :  ATAAGTTTT-T-G-TTT-AC---CCTAAC-GC-TTTGA-A-A-----TA-----GTAA-T-TTTGGCGAGC----AC-A-A---AA--C--A-------C--A-------A-AAG--T-T-------G---------ATTATT-G---T-----A---ATT-----------TA-TTAT-GAT--TGATA------------GACGATTGA-TGAC---TGA-TTatttactttgaagtttaagtatttattat
gi|128842                     :  ATAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGT-GA-TTTGA-A-T-----CA-----GTCA-A-TTTGGCGAGCA-Ggtagatgattatttcttactaag
gi|128843                     :  ATCAGTATT-T-A-TTT-AC---CCTCGT-GT-GTTGA-A-C-----CC-----GTCA-T-ATTGGCAAGCA-GAAT-A-A---GG--T--GATTA-A-T--A-------A-A
gi|128844                     :  ATACGTTTT-T-A-TTA-AC---TCTCGC-AC-TTTGA-A-C-----TG-----GTTA-T-TTTGGCGAGCA-GGtaagatatttca
gi|128845                     :  ATAAGTTTT-A-A-TTC-AC---CCTCGC-GA-TTTGA-T-T-----CA-----GTAA-T-TTTGGCGAGCA-G
gi|128846                     :  ATAATTTTT-T-A-TTT-AC---CATCGC-AC-TTTGA-A----------------CA-T-TTTAGCGAGCA-G
gi|128847                     :  ATATGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-----TTGA-A-C-----CA-----GTCA-T-TTTG
gi|128848                     :   TAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGG-GC-TTTGA-A-A-----CA-----GTCA-T-TTAGGTGAGCA-GATT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--CATAAA---AG---------ATGATT-A---C-----GC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--AAATG-----AG----TGATGAATGA-AGA----TGATTTCAATT-AA----TAAGACG-AGTT----GACATTCA-A--ATTTGAAGTTT-A-----T-TATT-AACTAAGTTGCATAATCATATAAC-T-ACTTT
gi|128849                     :   TAAGTATT-T-A-TTTTAT---CCTCAC-GC-TTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-GAAT-
gi|128850                     :   TGAGTTTT-T-G-TTT-AC---CCTCAC-AC-CATAA-A-C-----TA-----GTCA-T-TTTGTCGAGCA-GCAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--G-------A-AAA--CAAAAA---AG---------ATGATT-ATTGT-----AA--ATTT------A---T----AT-GAT--TGA-------------TGATGGATGATGGA----TGA-TT
gi|128851                     :   TAATTATT-T-A-TTT-AC---CCTCGT-GC-TTTGA-A-C-----CAA----GTCA-T-TTTGGCGAGCC-GGAT-A-A---GA--G--GATTA-T-T--T-------A-AAA--A-TATA---AG---------ATGATT-----C-----A-----------------TG-T--T-GA----AATG-----TG----GAGTTGATGA-TGA----TGA-------------------CCGTTGAT----TAT-TT---A--CTTTGAAGTTT-A-----
gi|128852                     :   TAAGTTTT-T-G-TTT-AC---CCTAGT-GC-TTTGA-A-C-----TG-----GCCA-T-TTTGGCAGGCA-Gagtatttaattatta
gi|128853                     :   TAAGTTTA-T-G-TTT-AC---CCTTGC-GC-TTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGTGATCA-
gi|128854                     :   TAAGTTGTGT-T-TTT-AC---CCTTGC-AC-TTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-ATTGGCGAGCA-GGAA-A-A---GA--T--GATTA-T-TTGA-------A-AAA-----AAA---AGTCATTATGAATGAAT-A---C-----AG--AT---------------TGAT-GA
gi|128855                     :   TAAGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTTGC-GC-TTTGA-A-C-----TG-----TTCA-T-TTTGGCGAGCA-AGAA-A-A---TA--G--AGTTA-TAT--ACAGAGCTA-ACA--T-TACATTCAG---------AGAATT-A---T-----ACAAATTT------G---TA-TTATGGAT----ATG-----TG----T
gi|128856                     :   TAAGTTTT-T-A-TCT-AC---CCTCGT-GC-TTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TCTGGCGAGCA--GAT-A-
gi|128857                     :   TAAGATTA-T-AATTT-AC---CCTCGC-TT-TTTGA-G-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-GAA--A-A---GA--T--TATTA-G-T--C-------A-AAA--
gi|128858                     :   TAAGTTTT-T-A-TTT-TC---CCTTGC-GC-TTTGA-A-C-----TG-----GTTA-T-TTTGGCGAG
gi|128859                     :   TAAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCAA-GC-TTTGA-A-C-----TG-----GCCA-T-TTTGGTGAAAA-GAAT-
gi|128860                     :   TATGTTTT-T-A-TTT-AC---CTTCAC-AC-TTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAACA-
gi|128861                     :   TGAGTTTT-A-A-TAT-AC---CCTCGC-GC-TTTGA-C-C-----TG-----GTTG-T-TTTGGCTAGCA-GGAT-ATAC--GA--T--GGTT
gi|128862                     :   TAAGTTTT-T-T-TTT-ATTTTCCTCAC-GC-TTTG----T-----TGCA---GGCA-T-TTTGGCGAGCA-GGGC-A-A---AG--C--G-TTA-T-
gi|128863                     :   TAAGCGTT-T-C-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTGGA-T-C-----TA-----GGCT-T-TTTGGCGAGCA-AGAA-C-A---GA--A--GATTA-
gi|128864                     :   TAAGTCTT-T---TTG-AC---CTTTTC-GC-GTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-G
gi|128865                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTGA-A-C-----TG-----GTTA-T-TTTGGCGAGCA-TGAA-C-A---GA--T--G---C-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TG----TGACGAATtaacggtacattataa
gi|128866                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTGA-A-C-----TG-----TTCA-T-TTTGGCGAGCA-TGAA-C-A---GA--T--G---C-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TA----TGACGAAT
gi|128867                     :    AGGTTTG-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-CGAA-C-A---AA--T--GATTA-A-A--A-------ACAAA--T-T-------G---------ATGATT-A-------------GTGTAAAG--C---TG-T-AT-GAA--TGATA-----TA----TGATGAGTGA-GTAG---TGA-T--------A----TAGAACG--AT-----TATATACATA--TTTTCTAATTT-A-----CATATT-AATTAA
gi|128868                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTGA-A-A-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCC-TGAA-C-A---GA--T--G---C-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TA----TGACGAATttaaatt
gi|128869                     :    AAGTTTT-T-C-TTT-AC---CCCCGC-GT-TTTGA-AAC-----TA-----GGCA-T-TTTGGCCAGCA-GGGT-A-A---GC--T--GGTTA-
gi|128870                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TTTGA-A-C-----TT-----GCCA-T-TCTGGCGAAC----AT-G-A---AC--C--GACGC-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGATT-A---TGAATGAC--ATAT------G---AA-GGAT-GAA--TAATGATA--TA----TGACGGAT
gi|128871                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-TTTAA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|128872                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-TTTAA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|128873                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-TTTAA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|128874                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-TTTAA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|128875                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-TTTAA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGACGAGCA-
gi|128876                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CGTCAC-GC-TTTAA-A-C-----TG-----ATCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|128877                     :    AAGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCGC-AC-TCTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGACAAACA-
gi|128878                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGG-GC-TTTAA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|128879                     :    AAGTTTT-T-A-TAT-AC---CATCGCAGC-TTTGC-T-C-----TA-----GGCA-T-TTTGGCGAGCA-ATACAA-A---GA--T--GATTA-T-
gi|128880                     :    AAGTTTA-T-A-TTT-AT---CCTAGC-GC-TTTGA-T-C-----TG-----GTCATT-TTTGGCGAGCA-
gi|128881                     :    AAGTTCT-T-A-TTT-AC---CGTCGC-GC-ATTTA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|128882                     :    AAGTTTT-TTA-TTT-AA---CCTCGT-GC-TTTGA-G-C-----AG-----GTCA-T-TTTGGCGAG
gi|128883                     :     AGTTTT-T-A-TTT-AC---CCTCAC-GC-TTTGA-A-C-----CT-----GTCA-T-TTTGGCAAGCA-ATAC-A-ATGTAA--T--GTTTACT-T--A-------A-AGA--
gi|128884                     :     AGTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCAT-AC-TCTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGC
gi|128885                     :      GTTTT-T-G-TTA-AT---CCTCGC-GT-TTTGA-A-C-----AG-----GTCA-TTTTTGGCGAGC
gi|128886                     :      GTTTT-T-A-TTT-AT---CCTCGA-GC-TTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-GTTAGCG
gi|128887                     :       TTTT-T-A-TTT-AC---CCTTGC-GC-TTTGA-A-C-----CGA----GTCA-T-TTTGGAGAGCC-GGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--A-TAAA---AG---------ATGATT-
gi|128888                     :       TTTT-T-A-TTT-AC---T---GC-AT-TTTGA-A-CAATATTAAAA--GTCA-T-TTTGGCAAGCA-ATAA-A-A---AA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-AAAT---TG---------ATGAT
gi|128889                     :        TTT-T-C-TTT-AT---CCTTGC-AC-TTTGATA-C-----TT-----GTCA-T-TTAGATGAGCA-GGAT-A-G---GC--T--GATTA-
gi|128890                     :        TTT-T-G-TTT-AC---CCTC-C-GC-TTTGA-A-C-----TG-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|128891                     :          T-T-C-TTT-AC---GCTCTT-GC-TTTGA-AAC-----AA-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-AGAT-A-A---GC--T--GGTTA-T-
gi|128892                     :                   -AC---CCT-GC-AC-TTTAA-A-C-----AG-----GTCA-T-TTTGGCCATCT-GGAA-A-A---CA--T--GATT--T-T--AAT-----A-AAA--T-TAAA---A
gi|128893                     : tatttgcatg-T-A-GTC-AT---TCTCAC-AC-TTTGA-A-C-----TG-----GTTA-T-TTCGGCGAGCA-GGAA-A-A---AA--
gi|128894                     :           -T-A-TTT-GC---TCTCGC-GT-CTTCA-A-C-----TA-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-AG
gi|128895                     :               -TTT-AC---CCTCTT-GC-TTTGA-A-C-----TA-----GTCA-T-GTTGGCAAGCA-GGAT-A-A---GG--T--GATTA-
gi|128896                     :               -TTA-AT---CCTCGC-AC-TTTGATC-C-----TT-----GACA-T-TTTGGCGAGTA-GGAT-A-G---GC--T--GATTA-
gi|128897                     :                                                         TCA-T-TTTGGCGAGCA-AGAT-A-A---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAACAT-AAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--T--------------------AATGA-AGA----TGATTTCAAAT-AA----TAAGACA-TGTC----GACATTCA-A--ACTTGAAGTTC-A-----T-CTTT-AACTAGGTTGCATTATCATACAACATAATTTT
gi|128898                     :                                                           A-T-TTTGGCGAGCA-GGAT-A-G---GA--T--GATTA-T-T--A-------A-AAA--T-TAAA---AG---------ATGATT-A---C-----AC--ATTT------C---TG-TGAT-GAT--TAATG-----TG----TGATGAATGG-AGA----TGA-TTCACAT-AA----TAAGTCG-TGTC----TATATTCA-A--CTTTGAAGTTT-G-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT
gi|128899                     :                                                                                                                                                                                                                                                    CG-TGTC----TATATTCA-A--CTTTGAAGTTT-G-----T-TATT-AACTGAGTTGTTTAATACTACAAC-T-ATTTT