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lowQualScore                  :       .      .   ... .  ......    .    . ...       . ..   ..       .    ..       . ...    .  ........        ...........       .. ..      . .......  ...............    ....     ... ... .    ......     .  . ..................   ... .  .  .  .   .     .   
lowQualScore                  :       1      3   444 3  333333    6    4 999       0 77   77       5    88       5 888    5  77777777        33333333333       77 77      5 8888888  666666666666666    2222     000 555 2    888888     6  2 888888888888888888   000 8  2  8  4   7     6   
consensus                     : ATATAT-TGTATA-TGT--AA-AA--CA-CTGAAACAACTT---AGAATGT-G-GAAGGGTATCCAG-CTGT--GATAAAC-T--GTGCG-TG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---TGTG-AA-GTTAGT-GCATATATT
Reference ( gi|103163 )       : ATATAT-TGTATA-TGT--CA-AA--CA-TTGAAACAACGT---AGAATGT-G-AAAGACTATCCAG-CTGT--GATAAAC-T--ATGCA-TG--------CTGGTACAGGA-TTATTT-CAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CTGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---TGTG-AA-GTAAGT-GCATATATT
gi|103164                     : ATATAT-CGTAAA-TGT---A-GA--CA-TTGAAATAGCGT---TGAATGT-G-AAAGGGTATCAAG-CTGA--GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTGGTAGAGGA-TAATTT-CAACTAT--A--GATCTA-T-------TT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---
gi|103140                     :  TATACATGTATA-------A-AA--C---TGAA-CAACTT---AGAATGT-A-AAAGGATATCCAG-CATT--GATAAAC-T--GTATA-TG--------TTGGTACAAG-----------ACTAT--A--GATCCA-T-------T-------------------A----ACAAG--AA---CTGGTA------TATTA-TCAT-----------A------TGA---TTTGTAG-GT-AGT-GCATA-ATT
gi|103141                     :  TATATGTGTATA-------A-AA--C---TGAA-CAACTT---TGAATGT-A-GAAGGATATCTAG-CATT--GATAAAC-T--GTATG-TG--------TTGGTACAAG-----------ACTGT--A--GATCCA-T-------T-------------------A----ACAAG--AA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTTG-AACGT-AGT-GCATA-ATT
gi|103144                     :  TATATATGTATA-T-------AA--C---TGAA-CAACTT---AGAATGT-A-GAAGGATATTCAG-TATT--GATAAAC-T--GTATG-TG--------TTGGTACAAG-----------ACTAT--A--GATCAA-T-------T-------------------A----ACAAG--AA---CTGGTA------TATGA-CCAT-----------A------TGA---TTTG-AA-GGTAGT-GCATA-ATT
gi|103142                     :  TATATATGTATA-------A-AA--C---TGAA-CAACTT---AGAATGT-A-GAAGGATATTAAG-CATT--GATAAAC-T--GTATG-TG--------TTGGAACAAG-----------ACTAC--A--GATCCA-T-------T-------------------A----ACAAG--AA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTCG-AA-GGTAGT-GCATA-ATT
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gi|103154                     :  TATAT-TGTATA-TG-----------------AACAACTT---ACAATGTTG-ATGGA-TATCCAG-CATT--GATAAAC-T--GTATG-TG--------TTGGTA-------------CAACACT--A--GAACCA-T-------TT---A---A-------AAAA----ACTGG-----------TA------TATTA-TCAT-----------A------TGA---TCTG-AA-G
gi|103159                     :       -TGTATA-TGT--AA-AA--CA-TTGAAACAATGT---AGAATGT-G-AAAGGGTATTCAG-CTGG--GATAACC-T--ATGCA-TG--------CTGGTACAAGA-TTGTTT-CAACTAT--A--GATCAA-T-------TT---T---C-------ATGAACTCACTGG--TA---CTGATA------AATTG-CCCT-----------A------TAA---TGTG-AA-gtatagcata
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gi|103169                     :       -TATATG-TGT--AA-AA--CA-TTGAAACAACAT---AGAATGT-G-AAAAGGTATCCAG-CTCT--GATAAAC-----TGCA-TG--------CTGTTACAAGA-TTATTT-CAACTAT--A--AA
gi|103143                     :       -TGCATG-TAT--AA-AA--C---TGAA-CAACTT---AGAATAT-A-GAAGGATATTCAG-CATT--GATAAAC-T--GTATG-TG--------TTGGTACAA-----------AACTAT--A--GATCCA-T-------T-------------------A----ACAAG--AA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTTG-AA-GTTAGT-GCATA-ATTacttatatattgc
gi|103139                     :     ta-TATATA-TGTA-CA-AA---A-CTGAA-CAGCTT---AGAATGT-A-GAAGGATATCCAG-CATT--GATAAAC-T--GTGTG-TA--------TTGGTACAAG-----------ACTAT--A--GATACA-T-------T-------------------A----ACAAG--AA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTTG-AA-GGTAGT-GCATA-ATT
gi|103156                     :       -TGTATA-TGT--AA-AA--AAACTGAAACAACTT---AGAATTT-G-GAAGTGTATCCAG-CTGT--GATAAAC-TACATGTA-TG--------CCGGTACAAGA-TTAT
gi|103147                     :       -TATATA-TGTATTA-AA------TGAAACAATTT---AGAATGT-A-GAAGGATATCCAG-CATT--GATAAGC-T--GTATG-TG--------TTGTTACAAG-----------ACTAA--A--GATCCA-T-------T-------------------A----ACAGA--TA---CTGGTA------GATTA-CTGT-----------A------TGA---TTTG-AA-GATAGT-GCATA
gi|103153                     :       -TGTATA-TGT--AA-AA--TA-CTGTA-CAACAT---AGAATATTG-AAGGA-TATCCAG-CATT--GATAAAC-T--GTATG-TG--------TTGATACAAG-----------ACTAT--A--GATCCA-T-------TT---A---T-------AAGA----ACTGGTTTA---TTACT-------TAATG-ATTT-----------A------TAAAACTTTG-AA-GGTAGT-GCATAat
gi|103146                     :       -TGTATA-TGTA-TA-AA--C--CTGAA-CTACTT---AGAATAT-A-GAAGGATACTCTG-CATT--GATAAAC-T--TCGTG-TG--------TTGGTACAAG-----------ACTAT--A--GATCC---------------------------ATGA----ACAAA--AA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTTG-AA-GGTAGT-GCATA-ATT
gi|103151                     :       -TGTATA-TTT--AA-AAAACC-TTGAAATAACTT---GAAATGT-GGAAAGA-TATACAG-CATT--GATAAAC-T--GTATG-TG--------TTGCTACAAG-----------ACCAT--A--GATCCA-T-------TT---A---C-------AAAA----ACTAG--TA----TGATA------------CCAT-----------A------TGA---TTTG-AA-GGTAGT-ACATA
gi|103149                     :       -TATATA-TGT--AA-AA--AA-CTGAAACAATTT---A-----T-G-GAAGAATATCCAG-CATT--GATAAAC-T--GTATG-TG--------TTGGTACAAG-----------ACTAT--A--GAACCA-T-------TT---A---C-------AAGA----ACTG---------TTATA-------ATTA-CCAT-----------ACATGTGTGA---TTTG-AA-GGTAGT-GCATA
gi|103148                     :       -TATATA-TAT---A-AA--GA-ACGGAACAACTT---GTAATTT-G-GAAGGATATCCAG-CATT--GATAAAC-T--GTATG-TG--------TTGATACAAG-----------ACTGC--A--GATCCA-T-------TT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATGA-CCAT-----------A------TGA---TTTT-AAGGTAA-T-GCACA
gi|103167                     :       -TGTATA-------A-AA--C---TGAA-CAACTT---AGAATGTTG-AAAGA-TATCCAG-AATT--TATAAAC-T--TTAGG-TG--------TTG-TACAA----TATT-------AT--A--GATCCA-T-------T-------------------A----ACAAG--AA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGG---GTTG-AA-GGTAGT-GCAT
gi|103165                     :   taga-TGTATA-TAT--AA-GA--TA-CTGAAACAAT--------ATG--G-AAAGA-TATCAAG-CATT--GATAAAC-C--GTATG-TG--------TTGGCAC-------ATTT----CTAC--A--GATCCA-G-------T-------------------A----ACAAG--AA---CTGGTA------TATTA-CTAT-----------A------CAC---TTTG-AA-GGTAGT-GCATA
gi|103160                     :       -TATAAA-TGT--AA-AA---A-CTGACAAAACTT---AGAATGT-G-GAAGGATATCCAG-C
gi|103150                     :          TATA-TAT--AATAA--CA-TTGAAACAGTGT---AGTATGT-G-GAAGGGTACCCAT-TTAT--GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTGGTACATAA-TTATTT-CAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTT-CCAT-----------A------TGA---TGTG-atgaata
gi|103172                     :          TATG-TAT--AA-AA--C---TGAA-CAATTT---AGAATGC-A-GAAG----------------GATAAAC-T--CTGTG-TG--------TTGGTACA----TTATT-------AT--A--GATCCA-T-------TT---A---C-------AAGA----ACTAG--TA---------------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TGTG-AA-GTAAGT-GCATA
gi|103166                     :          TATA-TGT--AT-AA--AA-CTGAA-CAATTT---AGAATGT-A-GAAGGATATCCGG-CATT--GATAAAC-T--GTATG-TA--------TTGGTACA--A-T--------ACTAT--A--GATCC---------------------------ATAA----ACAAG--AA---TTGGTA------TATTA-CAAT-----------A------TGA---TTTT-AA-TGCAGT-GCATA-ATT
gi|103171                     :          TATG-TAT--AA-AA--C---TGAA-CAACTT---AGAATGC-A-GAAG----------------GGTAAAC-T--CTGTG-TG--------TTGGTACATGA-TTAT------------A--GATCCA-T-------TT---A---C-------AAGA----ACTAG--TA---------------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTTG-AA-GGTAGT-GCATA
gi|103158                     :          TATAATGT--GA-AA--AA-CTGAAACAAC-------AATGT-G-GAAGG------AA-CTGT--AA-------------G-TG--------TCGGTACA-----------CGAGTAC--A--GATCCA-T-------TT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TAGTGACCAT-----------A------TGA---Tat
gi|103168                     :          TATA-TGT--TA-AC--AA-CTG-AACAACTT---ATAATGT-G-GAAGGATA-CAAGACTATA-GAT-CAC-T--TTACA-AGAA------CTGGTATAt
gi|103155                     :            TA-TGT--AA-AA--CT-TTGAAACAACAG---AGAATGT-G-AAAGGGTATCTAG-CTGT--GATAAAC-T--TTGCA-TG--------CTGGTTCAAGA-TTATTT-CAACTAT--A--GATCCG-T-------TT---T---C-------ATAA----ACTGG--TA---CCAATA------TAATG-TCCC-----------A------TGA---TTTG-AC-ATTAGT-GCATA-ATTttaccatatcatttgaa
gi|103173                     :    tgtataatTA-TGT--AA-AA--AAACTGAA-CAACTT---AGGAT------------ATCCAG-CATT--GATACAC-T--GTATG-TG--------TTGATAC------TAT-----ACTGT--A--GTTCCA----------T---T---G-------ACAA----A-------A---CTGGTT------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T
gi|103180                     :                     A-AA--CA-TTGAAACCA-GT---AGAATGT-G----------------------ATAAAC-T--GCCCA-TG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTAT--A--GATCAA-T-------TT---T---C-------ATGT----ACTTG--TA---CTGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---TGTG------AAGT-GCATATATt
gi|103170                     :                         atgtaaTGAAAACACGT---AGAATGT-G-GAAGGGTATCCAG-CTAT--GATAAAC-T--GTCCA-TG--------CTTATAGATGA-TTATTT-TATGTAT--A--AATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CGGATACGTT--TATTG-CCCT-----------T------TGA---TGTG-AA-GTTGGT-GCATcaaggtagtgcataatt
gi|103176                     :                               ataAACA-CGT---AGAATGT-G-AAAGGATATCCAA-CTGT--GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTAT--T--GATCCA-T-------TT---T---CATGTTTAATGA----ACCGT--CA---CCAATA------TATTG-GCCT-----------A------TAA---TGTT-AA-GTTGGT-GCATA
gi|103175                     :                                  AACAAATT---AAAATGT-A-GAAGGGTATCCAG-CATT--GATAAAC-T--GTATG-TG--------TTGGTACAAG-----------ACTAC--A--GATCCA-T-------T-------------------A----ACAAG--AA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTTG-AA-GGTGGT-GCATA-ATT
gi|103177                     :                                 tgACAAC-C---ACAATGT-G-AAAGGGTATCCAG-CTGT--GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTTGTACAAGA-TTATAG-CAACTGT--A--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----ACTGG--TACCCCCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGC---TGAG-AG---AAAT-GTAT
gi|103178                     :                                          ---AGAATGTTG-AAGGA-TATTCAG-CATT--GATAAAC-T--GTATA-TG--------TTGATACAAGA---------AA--AT--A--GAT-CA-T-------TG---TA--C-------AAGA----ACTGG--T-----T----------TATTG-CCAT-----------A------TGA---T----AA-ATAA
gi|103181                     :                                                ATGT----AAGGGTATCTAG-CTGA--GATTAAC-T--GTGCA-TG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTAC--T--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----TCTAG--TT---CCGACAGACTAGTATTG-CCCT-----------A------TGC---TGTGAAA-GT-AGT-GCATAaattttgaaagtagtttatatatt
gi|103179                     :                                                ATGT-G-AAGGA-TAACCAG-CACT--GATAAGC-T--GTATG-TG--------TTGATAGAAGA-----------CTAT--A--GATCCA-T-------TT---A---C-------AAGA----ACTGG--T-----T----------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T
gi|103157                     :                                                ATGT-A-AAAAATGA-ACAA-CTGGAGGATAAATGT--ATG---TG--------TTGATACAAGG-----------CTAT--A--AATCCA-T-------TT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TGTTG-CCAT-----------G------TGA---TATtaagaaaactttgaaggttgtgcata
gi|103182                     :                                              tgtatT-A-AAAGGGTATCCAG-CTGTT-GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---A-------ATGA----ACTG----------AAT-------TATTA-CCCT-----------C------CGA---TGTG-AA-GTTAGT-Gcgagggctaatagatgat
gi|103184                     :                                                      -AAAGGGTATCCAG-CTGT--GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTG-----------ATTT-CAGCTAT--A--GATTCA-T-------TT---T---C-------GTGA----ACTGG--AA---CCGATA------TATTG--CCT-----------A------TGA---TGTG-AA-ATTAAT-GCATATATT
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gi|103205                     :                                                        AAGGGTATCCAG-CTGT--AATAAAC-T----GCA-TG--------CTGGTACAAGA-TTTTTTTCAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---GGTG-AA-GTGAGT-GCATA
gi|103188                     :                                                        AAGGGTATCCAG-CTGT--GATAAAC-T--GTTCA-TG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----GCTGG--TA---CCGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---TGTG-AA-GTTAGT-G
gi|103199                     :                                                        AAGAGTATCCAG-CTGT--GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTAT--A--AGTCCA-T-------TT---T---T-------ATGA----ACTAG--AA---CCATTA------GATTG-CCCT-----------A------TGA---TGTG-AA-GTCAGTGGCATA
gi|103210                     :                                                        AAGGGTATCAAG-CGGT--GATAAGC-T--ATGCA-TG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTAA--A--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---GGTG-AA-ACAAGT-GCATA
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gi|103190                     :                                                        AAGGGTATCCAG-CTGG--GATAAAC-T--GTACA-TG--------CTGGTACAAGA-CTATTT-CAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---ACGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---TGTG-AA-GTTAGT-G
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gi|103195                     :                                                        AAGGGTATCCAG-CTGT--GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTGGTACAAGA-TTATCT-CAACTAG--A--GGTCAA-T-------TT---T---TC------ATTA----ACTGG--TA---CCGAAA------TATTG-TCCT-----------A------TGA---TATG-AA-GTTAGT-GCATA
gi|103191                     :                                                        AAGGATATCCAG-CTGT--GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTGGCACAAGA-TTATTT-CAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----A-TGG--TA---CCGAAA------TATTG-ACCT-----------C------AGA---TGTG-AA-GTTAGT-G
gi|103209                     :                                                        AAGGGTATCTAA-CTGT--GATAAAC-T--GTTCA-TG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTAT--A--ATTCCA-T-------TT---A---G-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---GGTT-AA-GTTAGT-GCATA
gi|103211                     :                                                        AAGGGTATTCAG-CTGT--GATAAAC-----TGCA-TG--------CTGGTCCAAGATTTTTTT-CAACTAT--A--GATCCATT-------TT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCTATA------TATTG-CCCT-----------C------TGT---GGTG-AA-GTTAGT-GCATA
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gi|103215                     :                                                        AAGGGTATCCAG-CTGT--GATACAG-T--GTGCA-TG--------CTGGTACACAC-TTATTT-CAACTAT--A--GATCCA-A-------TT---A---G-------ATGA----ACTGA--TA---CCGCTA------TACTG-TCCT-----------C------TGA---GGTG-AA-GTTAGT-GCA
gi|103208                     :                                                        AAGGGTATCCAG-CTAT--GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTAT--T--GATCAA-T-------TT---T---CATGTTTAATGA----ACTGT--TA---CCAATA------TATTA-CCCT-----------A------TAA---TATG-AA-GTTGGT-GCATAgaa
gi|103214                     :                                                        AAGGATATCCAG-CTGT--GATAAAC-T--GTGCA-TT--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTAT--A--GAATCA-A-------TT---T---G-------ATGA----TCTGG--TA---CCGATA------TATTG-CC
gi|103196                     :                                                        AAGGGTATCCAG-CTGT--GATAAAC-T--ATACA-TGGCATGATGCTGGTACAAGA-T-------AACTAT--TTTGATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CTGATA------TTTTG-CCCCGGATGATGAGGA------TGA---TGTG-AA-GTTTGT-GCATATATT
gi|103192                     :                                                        AAGGGTACCCAG-CTGT--GATAAAC-T--------------------GGTACAAGA-TTAATT-CAACTTT--A--AATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----GCTGT--TA---CTGATA------TATTG-CCCC-----------A------TGA---TGTG-AA-G
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gi|103187                     :                                                        AAGGGTATCTAG-CTTT--GATAAAC-T--GTGTA-TG--------CTGGTACAATA-TTATTC-CAACTAT-----GATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---tttgaa
gi|103198                     :                                                        AAGGGTATCCAG-CTGA--GATAAAC-T--GCATA-TG--------CTGGTATAAGA-TTATTT-CAATTAT--A--GATCCA-T-------T
gi|103186                     :                                                             TATCCAG-CTGT--GATAAAG-T--GTGCA-TG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTAC--A--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATAA----ACTGA--TA---CTGATA------TATTT-CTCT-----------C------TGA---GGTG-AA-GTTAGT-GCATA
gi|103183                     :                                                       gaggggTATCCAG-CTGT--GATAA-C-T--GTGCA-TG--------CTGGTACACAA-TTATTT-CAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---GGTG-AA-GTTTGT-GCA
gi|103217                     :                                                     taaatgggTATCTAT-CTGT--GATAAAC-T--GTGCA-TG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATTT----ACTGG--CA---CTGATA------TATTA-CCCC-----------A------TAA---TGTG-AA-GT
gi|103185                     :                                                             TATACAG-CTGT--GATAAAC-T----GCA-TG--------CTGGTACATGA-TTATTT-CAACTAT--A--GATCCA-TTTTCATGTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCAACA------TATTG-TGCT-----------A------TGA---TTTG-AA-GTTAAT-GCATATATTgta
gi|103202                     :                                                       gaatgggATCCAG-CTGT--GATAAGC-T--GTGCA-TG--------CTGGTACAAGA-TAATTT-CAACTAT--A--GATCCA-T-------TT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CAGATA------GATTG-CCCC-----------A------TAA---TGTG-AA-GGTATT-GTATA
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|103162 ): TATATCATGTATAAAACTGAACAACTTAAAATGCAGAAGGATA
Unaligned ( gi|103174 ): ATGTAAAAAGCTGAACAACTTAAAGAGTGGACTGATATCCAGCATTGATCACCATGTA






Alignments
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Reference ( family-367 )      :                                       ATATATTGTAT-A-TGTA--A-AA-CA-C--TGAAACAACTT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCGTG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-GCATATATT
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gi|103141                     :                                             TATAT-G-TGTA--T-AA-AA-C--TGAA-CAACTT---TGAATGTAGAA-GGATATCTAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTG--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAACGTAGT-GCATA-ATT
gi|103142                     :                                             TATAT-A-TGTA--T-AA-AA-C--TGAA-CAACTT---AGAATGTAGAA-GGATATTAAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGAACAAG-----------ACTA--CA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------CGAAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103143                     :                                             TGCAT-G-TATA--A-AA-C-----TGAA-CAACTT---AGAATATAGAA-GGATATTCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAA-----------AACTA--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGTTAGT-GCATA-ATT
gi|103144                     :                                           taTATAT-A-TGTA--T-AT-AA-C--TGAA-CAACTT---AGAATGTAGAA-GGATATTCAGTATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATCAA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATGA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103145                     :                                             TATAT-A-TGTA--T-AA-AA-C--TGAA-CAACTTTAAAAAATGTAGAA-GAATATCCTGCATT-GATTAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATCAA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-TCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGATAGT-GCAT-TATT
gi|103146                     :                                             TGTAT-A-TGTAT-A-AA-C--C--TGAA-CTACTT---AGAATATAGAA-GGATACTCTGCATT-GATAAACT--TCGTGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATC-------------C-------ATGA----ACAAA--AA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103147                     :                                             TATAT-A-TGTATTA-AA-------TGAAACAATTT---AGAATGTAGAA-GGATATCCAGCATT-GATAAGCT--GTATGTG--------TTGTTACAAG-----------ACTA--AA--GATCCA-TT-------------------A----ACAGA--TA---CTGGTA------GATTA-CTGT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGATAGT-GCATA
gi|103148                     :                                             TATAT-A-TATA--A-AG-AA-C---GGAACAACTT---GTAATTTGGAA-GGATATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGATACAAG-----------ACTG--CA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATGA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TTAAGGTAAT-GCACAat
gi|103149                     :                                             TATAT-A-TGTA--A-AA-AA-C--TGAAACAATTT---A-----TGGAA-GAATATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GAACCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGT--T-------ATA-------ATTA-CCAT-----------ACATGTGTGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103150                     :                                               TAT-A-TATA--ATAA-CA-T--TGAAACAGTGT---AGTATGTGGAA-GGGTACCCATTTAT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACATAA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTT-CCAT-----------A------TGA---T---G----------TG
gi|103151                     :                                             TGTAT-A-TTTA--A-AA-AA-CCTTGAAATAACTT---GAAATGTGGAA-AGATATACAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGCTACAAG-----------ACCA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAAA----ACTAG--TA----TGATA------------CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-ACATA
gi|103152                     :                                             TGTAT-A-TGTA--A-AA-CA-T--TGAAACAATGT---AGCATTTGAAA-GGGTATTAAGCTGT-GTTAC-CT--GTACATG--------CTCGTACGAGA-TTATTT-TATTTT--TA--GATCCA-TTT---T---C-------AGGA----ACAGG--TT---CCAATA------TATTG-CCCT-----------A------TAA---T---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103153                     :                                             TGTAT-A-TGTA--A-AA-TA-C--TGTA-CAACAT---AGAATATTGAA-GGATATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGATACAAG-----------ACTA--TA--GATCCA-TTT---A---T-------AAGA----ACTGGTTTA---TTACT-------TAATG-ATTT-----------A------TAAAACT---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103154                     :                                        TATATTGTAT-A-TG------------------AACAACTT---ACAATGTTGAT-GGATATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAA----------C-AC----TA--GAACCA-TTT---A---A-------AAAA----ACTGG-----------TA------TATTA-TCAT-----------A------TGA---T---C----------TGAAGGTATA-GCATA
gi|103155                     :                                                 T-A-TGTA--A-AA-CT-T--TGAAACAACAG---AGAATGTGAAA-GGGTATCTAGCTGT-GATAAACT--TTGCATG--------CTGGTTCAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCG-TTT---T---C-------ATAA----ACTGG--TA---CCAATA------TAATG-TCCC-----------A------TGA---T---T----------TGACATTAGT-GCATA-ATT
gi|103156                     :                                     tgtataatTGTAT-A-TGTA--A-AA-AAAC--TGAAACAACTT---AGAATTTGGAA-GTGTATCCAGCTGT-GATAAACTACATGTATG--------CCGGTACAAGA-TTAT
gi|103157                     :                                             TGTAT-A-TGTA--A-AA-AA----TGAA-CAACT------------GGA-GG--------------ATAAA-T--GTATGTG--------TTGATACAAGG-----------CTA--TA--AATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TGTTG-CCAT-----------G------TGA---T---A----------T
gi|103158                     :                                               TAT-AATGTG--A-AA-AA-C--TGAAACAAC-------AATGTGGAA-GG-----------------AACT--GTAAGTG--------TCGGTACA-----------CGAGTA--CA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TAGTGACCAT-----------A------TGA---T---cgagggctaatagatgat
gi|103159                     :                                             TGTAT-A-TGTA--A-AA-CA-T--TGAAACAATGT---AGAATGTGAAA-GGGTATTCAGCTGG-GATAACCT--ATGCATG--------CTGGTACAAGA-TTGTTT-CAACTA--TA--GATCAA-TTT---T---C-------ATGAACTCACTGG--TA---CTGATA------AATTG-CCCT-----------A------TAA---T---G----------TGAAt
gi|103160                     :                                             TATAA-A-TGTA--A-AA--A-C--TGACAAAACTT---AGAATGTGGAA-GGATATCCAGC
gi|103161                     :                                                                                                                                         TGGTACAAGA-----------CTA--TA--GATCCA-TTT---atgaata
gi|103162                     :     tacatatgtataaaactgaacaacatagactatataaggaTATATCA-TGTA--T-AA-AA-C--TGAA-CAACTT---AAAATGCAGAA-GGATAaaactaaactaacaagaactgtta
gi|103163                     :                                       ATATATTGTAT-A-TGTC--A-AA-CA-T--TGAAACAACGT---AGAATGTGAAA-GACTATCCAGCTGT-GATAAACT--ATGCATG--------CTGGTACAGGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CTGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTAAGT-GCATATATT
gi|103164                     :                                       ATATATCGTAA-A-TGTA--G-A--CA-T--TGAAATAGCGT---TGAATGTGAAA-GGGTATCAAGCTGA-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTAGAGGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCTA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---
gi|103165                     :                                             TGTAT-A-TATA--A-GA-TA-C--TGAAACAA----------TATGGAA-AGATATCAAGCATT-GATAAACC--GTATGTG--------TTGGCAC-------ATTT----CTA--CA--GATCCA-GTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CTAT-----------A------CAC---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103166                     :                                               TAT-A-TGTA--T-AA-AA-C--TGAA-CAATTT---AGAATGTAGAA-GGATATCCGGCATT-GATAAACT--GTATGTA--------TTGGTACA--A-T--------ACTA--TA--GATCCA-TAA---A---C-------AAGA----ATTGG-----------TA------TATTA-CAAT-----------A------TGA---T---T----------TTAATGCAGT-GCATA-ATT
gi|103167                     :                                               TAG-A-TGTA--T-AA-AA-C--TGAA-CAACTT---AGAATGTTGAA-AGATATCCAGAATT-TATAAACT--TTAGGTG--------TT-GTACAA----TAT-------TA--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGG---G---T----------TGAAGGTAGT-GCAT
gi|103168                     :                                               TAT-A-TGTT--A-AC-AA-C--TGAA-CAACTT---ATAATGTGGAA-GGATA
gi|103168                     :                                                                                                                                                             ACTA--TA--GATCAC-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TCA---T---T----------TGAAcaagactatagatcactttacaagaactggtatattaccatatcatttgaa
gi|103169                     : tatatgttaacaactgaacaacttataatgtggaaggatacaagTATAT-G-TGTA--A-AA-CA-T--TGAAACAACAT---AGAATGTGAAA-AGGTATCCAGCTCT-GATAAAC----TGCATG--------CTGTTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--AA
gi|103170                     :                                                                    --TGAAAACACGT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTAT-GATAAACT--GTCCATG--------CTTATAGATGA-TTATTT-TATGTA--TA--AATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CGGATACGTT--TATTG-CCCT-----------T------TGA---T---G----------TGAAGTTGGT-GCATacttatatattgc
gi|103171                     :                                              ataT-A-TGTA--T-AA-AA-C--TGAA-CAACTT---AGAATGCAGAA-GGG--------------TAAACT--CTGTGTG--------TTGGTACATGA-T----------TA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTAG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103172                     :                                                 T-A-TGTA--T-AA-AA-C--TGAA-CAATTT---AGAATGCAGAA-G--------------GATAAACT--CTGTGTG--------TTGGTAC---A-TTAT-------TA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTAG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTAAGT-GCATAat
gi|103173                     :                                                 T-A-TGTA--A-AA-AAAC--TGAA-CAACTT---AG-----------GATATCCAGCATT-GATACACT--GTATGTG--------TTGATAC------TAT-----ACTG--TA--GTTCCA-TTG---A---C-------A-AA----ACTGG--T--------T-------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---
gi|103174                     :                                                  -A-TGTA--A-AA-AG-C--TGAA-CAACTT---AAAGAGTGGAC-TGATATCCAGCATT-GATt
gi|103175                     :                                                                         AACAAATT---AAAATGTAGAA-GGGTATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--CA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTGGT-GCATA-ATTcaccatgta
gi|103176                     :                                                                       tgAACA-CGT---AGAATGTGAAA-GGATATCCAACTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTA--TT--GATCCA-TTT---T---CATGTTTAATGA----ACCGT--CA---CCAATA------TATTG-GCCT-----------A------TAA---T---G----------TTAAGTTGGT-GCATA
gi|103177                     :                                                                          ACAACC----ACAATGTGAAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTTGTACAAGA-TTATAG-CAACTG--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TACCCCCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGC---T---G----------AGA
gi|103178                     :                                                                                 ---AGAATGTTGAA-GGATATTCAGCATT-GATAAACT--GTATATG--------TTGATACAAGA---------AA--A--TA--GAT-CA-TTG---TA--C-------AAGA----ACTGG--T--------T-------TATTG-CCAT-----------A------TGA---T---AAATAAAATTTTGAAAGTAGT-TTATATATTgaaatgtat
gi|103179                     :                                                                                       ATGTG-AA-GGATAACCAGCACT-GATAAGCT--GTATGTG--------TTGATAGAAGA-----------CTA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG--T--------T-------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTAAGAAAACTT---TGAAGGTTGT-GCATA
gi|103180                     :                                                  -A-TGTA--A-AAACA-T--TGAAACCA-----------GTAGAA------------TGT-GATAAACT--GCCCATG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCAA-TTT---T---C-------ATGT----ACTTG--TA---CTGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGA----AGT-GCATATAT
gi|103181                     :                                                                                       ATGT--AA-GGGTATCTAGCTGA-GATTAACT--GTGCATG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTA--CT--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----TCTAG--TT---CCGACAGACTAGTATTG-CCCT-----------A------TGC---T---G----------TGAAAGTAGT-GCATAcaaggtagtgcataatt
gi|103182                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGTTGATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---A-------ATGA----ACTG----------AAT-------TATTA-CCCT-----------C------CGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103183                     :                                                                                            taa-GGGTATCCAGCTGT-GATAA-CT--GTGCATG--------CTGGTACACAA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---G---G----------TGAAGTTTGT-GCA
gi|103184                     :                                                                                        taaatAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTG-----------ATTT-CAGCTA--TA--GATTCA-TTT---T---C-------GTGA----ACTGG--AA---CCGATA------TATTG--CCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAATTAAT-GCATATATT
gi|103185                     :                                                                                          aaGAATGGGTATACAGCTGT-GATAAACT--G--CATG--------CTGGTACATGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---CATGTTTCATGA----ACTGG--TA---CCAACA------TATTG-TGCT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGTTAAT-GCATATATT
gi|103186                     :                                                                                            GAG-GGGTATCCAGCTGT-GATAAAGT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--CA--GATCCA-TTT---T---C-------ATAA----ACTGA--TA---CTGATA------TATTT-CTCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103187                     :                                                                                             AA-GGGTATCTAGCTTT-GATAAACT--GTGTATG--------CTGGTACAATA-TTATTC-CAACTA--T---GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---
gi|103188                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTTCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----GCTGG--TA---CCGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103189                     :                                                                                             AA-GGTTATCCAGCTGT-GATAACCT--GTGCATG--------CTGGTACCAGA-TTAGTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103190                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGG-GATAAACT--GTACATG--------CTGGTACAAGA-CTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---ACGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103191                     :                                                                                             AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGCACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----A-TGG--TA---CCGAAA------TATTG-ACCT-----------C------AGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103192                     :                                                                                             AA-GGGTACCCAGCTGT-GATAAACT--G-----------------GTACAAGA-TTAATT-CAACTT--TA--AATCCA-TTT---T---C-------ATGA----GCTGT--TA---CTGATA------TATTG-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TGAAG
gi|103193                     :                                                                                             AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAATT--ATGCATG--------CTGGTTCAAGA-TTATAA-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATAA----ACTGA--TA---CCAATg
gi|103194                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGAATG--------TTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--AA---CGGGTA------T-TTG-CCAG-----------A------TGC---G---G----------TGAAGTTGGT-GCATAtttgaa
gi|103195                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATCT-CAACTA--GA--GGTCAATTTT---T---C-------ATTA----ACTGG--TA---CCGAAA------TATTG-TCCT-----------A------TGA---T---A----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103196                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--ATACATGGCATGATGCTGGTACAAGA-T-------AACTA--TTTTGATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CTGATA------TTTTG-CCCCGGATGATGAGGA------TGA---T---G----------TGAAGTTTGT-GCATATATT
gi|103197                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-GATATACT--GGGCGTG--------CTGATGTAAGA-CTATTT-CAACTATTTA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---TCGATA------TATTG-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TTAAG
gi|103198                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGA-GATAAACT--GCATATG--------CTGGTATAAGA-TTATTT-CAATTA--TA--GATCCA-TT
gi|103199                     :                                                                                             AA-GAGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--AGTCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTAG--AA---CCATTA------GATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTCAGTGGCATA
gi|103200                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAATCT--GTACATA---------TGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GACCCA-TTA---A---G-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGCTAGT-GCA
gi|103201                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGTTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATGG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAAATAGT-GCATA
gi|103202                     :                                                                                             AA-GGGAATCCAGCTGT-GATAAGCT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CAGATA------GATTG-CCCC-----------A------TAA---T---G----------TGAAGGTATT-GTATA
gi|103203                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTACATG--------CTAGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCC-TTT---T---C-------ATGA----GCTGG--TA---CAAATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---A---G----------TAAAGTTAGT-GCATA
gi|103204                     :                                                                                             AA-GGGTTTCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTTAGATGAAG-------ATGA----ACTTG--TA---CCGATA------TATTA-ACCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103205                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-AATAAACT--G--CATG--------CTGGTACAAGA-TTTTTTTCAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTGAGT-GCATA
gi|103206                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGTTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACATGA-TTTTTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----CCTGG--TA---CGGATA------TATTG-CTCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103207                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTG-TACACGA-TTATTC-CAATTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTT-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTAAGT-GCATATATT
gi|103208                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTAT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTA--TT--GATCAA-TTT---T---CATGTTTAATGA----ACTGT--TA---CCAATA------TATTA-CCCT-----------A------TAA---T---A----------TGAAGTTGGT-GCATA
gi|103209                     :                                                                                             AA-GGGTATCTAACTGT-GATAAACT--GTTCATG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTA--TA--ATTCCA-TTT---A---G-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TTAAGTTAGT-GCATA
gi|103210                     :                                                                                             AA-GGGTATCAAGCGGT-GATAAGCT--ATGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--AA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---G---G----------TGAAACAAGT-GCATA
gi|103211                     :                                                                                             AA-GGGTATTCAGCTGT-GATAAAC----TGCATG--------CTGGTCCAAGATTTTTTT-CAACTA--TA--GATCCATTTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCTATA------TATTG-CCCT-----------C------TGT---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103212                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-G------------CATG--------CTGGTACAAGA-TGATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAAC-GCATA
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gi|103215                     :                                                                                             AA-GGGTATCCAGCTGT-GATACAGT--GTGCATG--------CTGGTACACAC-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-ATT---A---G-------ATGA----ACTGA--TA---CCGCTA------TACTG-TCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCA
gi|103216                     :                                                                                                     TTCAGCTGT-GATAAACT--GGGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTAG--TAC--CCAAAA------TATTG-CCTT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAAT-Ggaa
gi|103217                     :                                                                                                attTATCTATCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATTT----ACTGG--CA---CTGATA------TATTA-CCCC-----------A------TAA---T---G----------TGAAGT
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gi|103219                     :                                                                                                                                                                                                                 acaagGGTA------TCTTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103220                     :                                                                                                                                                                                                            aattA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGCAGT-GCATA





Alignments
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lowQualScore                  :                                                  1 1    66  1 1 1 55    6    2 888       5   5           2  5        77    9  00000000          333333333      77  77      1   7777777 3333333 9  2222     44444444444  888888     6  0 77777777777 666666   000 44444444444444     0    7     2   
consensus                     :                                       ATATATTGTAT-A-TGTAN-AA-A-A-C--TGAAACAACTT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCGTG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-GCATATATT
Reference ( family-367 )      :                                       ATATATTGTAT-A-TGTAA-AA-A-A-C--TGAAACAACTT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCGTG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-GCATATATT
gi|103139                     :                                             TATAT-A-TGTAC-AA-A-A-C--TGAA-CAGCTT---AGAATGTAGAA-GGATATCCAGCATT-GATAAACT--GTGTGTA--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATACA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103140                     :                                             TATAC-A-TGTAT-AA-A-A-C--TGAA-CAACTT---AGAATGTAAAA-GGATATCCAGCATT-GATAAACT--GTATATG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-TCAT-----------A------TGA---T---T----------TGTAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103141                     :                                             TATAT-G-TGTAT-AA-A-A-C--TGAA-CAACTT---TGAATGTAGAA-GGATATCTAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTG--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAACGTAGT-GCATA-ATT
gi|103142                     :                                             TATAT-A-TGTAT-AA-A-A-C--TGAA-CAACTT---AGAATGTAGAA-GGATATTAAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGAACAAG-----------ACTA--CA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------CGAAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103143                     :                                                  -A-TGTAT-AA-A-A-C--TGAA-CAACTT---AGAATATAGAA-GGATATTCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAA-----------AACTA--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGTTAGT-GCATA-ATT
gi|103144                     :                                        tatgcTATAT-A-TGTAT-AT-A-A-C--TGAA-CAACTT---AGAATGTAGAA-GGATATTCAGTATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATCAA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATGA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103145                     :                                             TATAT-A-TGTAT-AA-A-A-C--TGAA-CAACTTTAAAAAATGTAGAA-GAATATCCTGCATT-GATTAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATCAA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-TCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGATAGT-GCAT-TATT
gi|103146                     :                                             TGTAT-A-TGTAT-AA-A-C-C--TGAA-CTACTT---AGAATATAGAA-GGATACTCTGCATT-GATAAACT--TCGTGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATC-------------C-------ATGA----ACAAA--AA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103147                     :                                             TATAT-A-TGTAT-TA-A-A----TGAAACAATTT---AGAATGTAGAA-GGATATCCAGCATT-GATAAGCT--GTATGTG--------TTGTTACAAG-----------ACTA--AA--GATCCA-TT-------------------A----ACAGA--TA---CTGGTA------GATTA-CTGT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGATAGT-GCATA
gi|103148                     :                                             TATAT-A-TATAA-AG-A-A-C---GGAACAACTT---GTAATTTGGAA-GGATATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGATACAAG-----------ACTG--CA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATGA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TTAAGGTAAT-GCACAat
gi|103149                     :                                             TATAT-A-TGTAA-AA-A-A-C--TGAAACAATTT---A-----TGGAA-GAATATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GAACCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGT--T-------ATA-------ATTA-CCAT-----------ACATGTGTGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103150                     :                                               TAT-A-TATAATAA-C-A-T--TGAAACAGTGT---AGTATGTGGAA-GGGTACCCATTTAT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACATAA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTT-CCAT-----------A------TGA---T---G----------TG
gi|103151                     :                                             TGTAT-A-TTTAA-AA-A-A-CCTTGAAATAACTT---GAAATGTGGAA-AGATATACAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGCTACAAG-----------ACCA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAAA----ACTAG--TA----TGATA------------CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-ACATA
gi|103152                     :                                             TGTAT-A-TGTAA-AA-C-A-T--TGAAACAATGT---AGCATTTGAAA-GGGTATTAAGCTGT-GTTAC-CT--GTACATG--------CTCGTACGAGA-TTATTT-TATTTT--TA--GATCCA-TTT---T---C-------AGGA----ACAGG--TT---CCAATA------TATTG-CCCT-----------A------TAA---T---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103153                     :                                             TGTAT-A-TGTAA-AA-T-A-C--TGTA-CAACAT---AGAATATTGAA-GGATATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGATACAAG-----------ACTA--TA--GATCCA-TTT---A---T-------AAGA----ACTGGTTTA---TTACT-------TAATG-ATTT-----------A------TAAAACT---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103154                     :                                        TATATTGTAT-A-TG-----------------AACAACTT---ACAATGTTGAT-GGATATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAA----------C-AC----TA--GAACCA-TTT---A---A-------AAAA----ACTGG-----------TA------TATTA-TCAT-----------A------TGA---T---C----------TGAAGGTATA-GCATA
gi|103155                     :                                                 T-A-TGTAA-AA-C-T-T--TGAAACAACAG---AGAATGTGAAA-GGGTATCTAGCTGT-GATAAACT--TTGCATG--------CTGGTTCAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCG-TTT---T---C-------ATAA----ACTGG--TA---CCAATA------TAATG-TCCC-----------A------TGA---T---T----------TGACATTAGT-GCATA-ATT
gi|103156                     :                                     tgtataatTGTAT-A-TGTAA-AAAA-A-C--TGAAACAACTT---AGAATTTGGAA-GTGTATCCAGCTGT-GATAAACTACATGTATG--------CCGGTACAAGA-TTAT
gi|103157                     :                                             TGTAT-A-TGTAA-AA-A-A----TGAA-CAACT------------GGA-GG--------------ATAAA-T--GTATGTG--------TTGATACAAGG-----------CTA--TA--AATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TGTTG-CCAT-----------G------TGA---T---A----------T
gi|103158                     :                                               TAT-AATGTGA-AA-A-A-C--TGAAACAAC-------AATGTGGAA-GG-----------------AACT--GTAAGTG--------TCGGTACA-----------CGAGTA--CA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TAGTGACCAT-----------A------TGA---T---cgagggctaatagatgat
gi|103159                     :                                             TGTAT-A-TGTAA-AA-C-A-T--TGAAACAATGT---AGAATGTGAAA-GGGTATTCAGCTGG-GATAACCT--ATGCATG--------CTGGTACAAGA-TTGTTT-CAACTA--TA--GATCAA-TTT---T---C-------ATGAACTCACTGG--TA---CTGATA------AATTG-CCCT-----------A------TAA---T---G----------TGAAt
gi|103160                     :                                             TATAA-A-TGTAA-AA-A---C--TGACAAAACTT---AGAATGTGGAA-GGATATCCAGC
gi|103162                     :                                             TATATCA-TGTAT-AA-A-A-C--TGAA-CAACTT---AAAATGCAGAA-GGATAatgaata
gi|103163                     :                                       ATATATTGTAT-A-TGTCA-AA-C-A-T--TGAAACAACGT---AGAATGTGAAA-GACTATCCAGCTGT-GATAAACT--ATGCATG--------CTGGTACAGGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CTGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTAAGT-GCATATATT
gi|103164                     :                                       ATATATCGTAA-A-TGTAG-AC-A---T--TGAAATAGCGT---TGAATGTGAAA-GGGTATCAAGCTGA-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTAGAGGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCTA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---
gi|103165                     :                                             TGTAT-A-TATAA-GA-T-A-C--TGAAACAA----------TATGGAA-AGATATCAAGCATT-GATAAACC--GTATGTG--------TTGGCAC-------ATTT----CTA--CA--GATCCA-GTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CTAT-----------A------CAC---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103166                     :                                               TAT-A-TGTAT-AA-A-A-C--TGAA-CAATTT---AGAATGTAGAA-GGATATCCGGCATT-GATAAACT--GTATGTA--------TTGGTACA--A-T--------ACTA--TA--GATCCA-TAA---A---C-------AAGA----ATTGG-----------TA------TATTA-CAAT-----------A------TGA---T---T----------TTAATGCAGT-GCATA-ATT
gi|103167                     :                                               TAG-A-TGTAT-AA-A-A-C--TGAA-CAACTT---AGAATGTTGAA-AGATATCCAGAATT-TATAAACT--TTAGGTG--------TT-GTACAA----TAT-------TA--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGG---G---T----------TGAAGGTAGT-GCAT
gi|103168                     :                                               TAT-A-TGTTA-AC-A-A-C--TGAA-CAACTT---ATAATGTGGAA-GGATA
gi|103168                     :                                                                                                                                                            ACTA--TA--GATCAC-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TCA---T---T----------TGAAcaagactatagatcactttacaagaactggtatattaccatatcatttgaa
gi|103169                     : tatatgttaacaactgaacaacttataatgtggaaggatacaagTATAT-G-TGTAA-AA-C-A-T--TGAAACAACAT---AGAATGTGAAA-AGGTATCCAGCTCT-GATAAAC----TGCATG--------CTGTTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--AA
gi|103170                     :                                                                   --TGAAAACACGT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTAT-GATAAACT--GTCCATG--------CTTATAGATGA-TTATTT-TATGTA--TA--AATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CGGATACGTT--TATTG-CCCT-----------T------TGA---T---G----------TGAAGTTGGT-GCATacttatatattgc
gi|103171                     :                                              ataT-A-TGTAT-AA-A-A-C--TGAA-CAACTT---AGAATGCAGAA-GGG--------------TAAACT--CTGTGTG--------TTGGTACATGA-T----------TA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTAG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103172                     :                                                 T-A-TGTAT-AA-A-A-C--TGAA-CAATTT---AGAATGCAGAA-G--------------GATAAACT--CTGTGTG--------TTGGTAC---A-TTAT-------TA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTAG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTAAGT-GCATAat
gi|103173                     :                                                 T-A-TGTAA-AA-A-AAC--TGAA-CAACTT---AG-----------GATATCCAGCATT-GATACACT--GTATGTG--------TTGATAC------TAT-----ACTG--TA--GTTCCA-TTG---A---C-------A-AA----ACTGG--T--------T-------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---
gi|103174                     :                                                  -A-TGTAA-AA-A-G-C--TGAA-CAACTT---AAAGAGTGGAC-TGATATCCAGCATT-GATt
gi|103175                     :                                                                        AACAAATT---AAAATGTAGAA-GGGTATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--CA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTGGT-GCATA-ATTcaccatgta
gi|103176                     :                                                                      tgAACA-CGT---AGAATGTGAAA-GGATATCCAACTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTA--TT--GATCCA-TTT---T---CATGTTTAATGA----ACCGT--CA---CCAATA------TATTG-GCCT-----------A------TAA---T---G----------TTAAGTTGGT-GCATA
gi|103177                     :                                                                         ACAACC----ACAATGTGAAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTTGTACAAGA-TTATAG-CAACTG--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TACCCCCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGC---T---G----------AGA
gi|103178                     :                                                                                ---AGAATGTTGAA-GGATATTCAGCATT-GATAAACT--GTATATG--------TTGATACAAGA---------AA--A--TA--GAT-CA-TTG---TA--C-------AAGA----ACTGG--T--------T-------TATTG-CCAT-----------A------TGA---T---AAATAAAATTTTGAAAGTAGT-TTATATATTgaaatgtat
gi|103179                     :                                                                                      ATGTG-AA-GGATAACCAGCACT-GATAAGCT--GTATGTG--------TTGATAGAAGA-----------CTA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG--T--------T-------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTAAGAAAACTT---TGAAGGTTGT-GCATA
gi|103180                     :                                                  -A-TGTAA-AA-ACA-T--TGAAACCA-----------GTAGAA------------TGT-GATAAACT--GCCCATG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCAA-TTT---T---C-------ATGT----ACTTG--TA---CTGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGA----AGT-GCATATAT
gi|103181                     :                                                                                      ATGT--AA-GGGTATCTAGCTGA-GATTAACT--GTGCATG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTA--CT--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----TCTAG--TT---CCGACAGACTAGTATTG-CCCT-----------A------TGC---T---G----------TGAAAGTAGT-GCATAcaaggtagtgcataatt
gi|103182                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGTTGATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---A-------ATGA----ACTG----------AAT-------TATTA-CCCT-----------C------CGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103183                     :                                                                                           taa-GGGTATCCAGCTGT-GATAA-CT--GTGCATG--------CTGGTACACAA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---G---G----------TGAAGTTTGT-GCA
gi|103184                     :                                                                                       taaatAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTG-----------ATTT-CAGCTA--TA--GATTCA-TTT---T---C-------GTGA----ACTGG--AA---CCGATA------TATTG--CCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAATTAAT-GCATATATT
gi|103185                     :                                                                                         aaGAATGGGTATACAGCTGT-GATAAACT--G--CATG--------CTGGTACATGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---CATGTTTCATGA----ACTGG--TA---CCAACA------TATTG-TGCT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGTTAAT-GCATATATT
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gi|103188                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTTCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----GCTGG--TA---CCGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
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gi|103194                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGAATG--------TTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--AA---CGGGTA------T-TTG-CCAG-----------A------TGC---G---G----------TGAAGTTGGT-GCATAtttgaa
gi|103195                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATCT-CAACTA--GA--GGTCAATTTT---T---C-------ATTA----ACTGG--TA---CCGAAA------TATTG-TCCT-----------A------TGA---T---A----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103196                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--ATACATGGCATGATGCTGGTACAAGA-T-------AACTA--TTTTGATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CTGATA------TTTTG-CCCCGGATGATGAGGA------TGA---T---G----------TGAAGTTTGT-GCATATATT
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gi|103199                     :                                                                                            AA-GAGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--AGTCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTAG--AA---CCATTA------GATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTCAGTGGCATA
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gi|103202                     :                                                                                            AA-GGGAATCCAGCTGT-GATAAGCT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CAGATA------GATTG-CCCC-----------A------TAA---T---G----------TGAAGGTATT-GTATA
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gi|103204                     :                                                                                            AA-GGGTTTCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTTAGATGAAG-------ATGA----ACTTG--TA---CCGATA------TATTA-ACCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103205                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-AATAAACT--G--CATG--------CTGGTACAAGA-TTTTTTTCAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTGAGT-GCATA
gi|103206                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGTTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACATGA-TTTTTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----CCTGG--TA---CGGATA------TATTG-CTCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
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gi|103215                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATACAGT--GTGCATG--------CTGGTACACAC-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-ATT---A---G-------ATGA----ACTGA--TA---CCGCTA------TACTG-TCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|103161 ): TACATATGTATAAAACTGAACAACATAGACTATATAAGGATGGTACAAGACTATAGATCCATTTAAACTAAACTAACAAGAACTGTTA






Alignments
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Reference ( family-367 )      :                                     ATATATTGTAT-A--TGTAN-AAA-A-C--T--GAAACAACTT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCGTG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-GCATATATT
gi|103139                     :                                           TATAT-A--TGTAC-AAA-A-C--T--GAA-CAGCTT---AGAATGTAGAA-GGATATCCAGCATT-GATAAACT--GTGTGTA--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATACA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103140                     :                                           TATAC-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAACTT---AGAATGTAAAA-GGATATCCAGCATT-GATAAACT--GTATATG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-TCAT-----------A------TGA---T---T----------TGTAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103141                     :                                           TATAT-G--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAACTT---TGAATGTAGAA-GGATATCTAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTG--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAACGTAGT-GCATA-ATT
gi|103142                     :                                           TATAT-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAACTT---AGAATGTAGAA-GGATATTAAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGAACAAG-----------ACTA--CA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------CGAAGGTAGT-GCATA-ATT
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gi|103144                     :                                      tatgcTATAT-A--TGTAT-ATA-A-C--T--GAA-CAACTT---AGAATGTAGAA-GGATATTCAGTATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATCAA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATGA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA-ATT
gi|103145                     :                                           TATAT-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAACTTTAAAAAATGTAGAA-GAATATCCTGCATT-GATTAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--TA--GATCAA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-TCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGATAGT-GCAT-TATT
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gi|103156                     :                                           TGTAT-A--TGTAA-AAA-AAC--T--GAAACAACTT---AGAATTTGGAA-GTGTATCCAGCTGT-GATAAACTACATGTATG--------CCGGTACAAGA-TTAT
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gi|103158                     :                                             TAT-AA-TGTGA-AAA-A-C--T--GAAACAAC-------AATGTGGAA-GG-----------------AACT--GTAAGTG--------TCGGTACA-----------CGAGTA--CA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TAGTGACCAT-----------A------TGA---T---cgagggctaatagatgat
gi|103159                     :                                           TGTAT-A--TGTAA-AAC-A-T--T--GAAACAATGT---AGAATGTGAAA-GGGTATTCAGCTGG-GATAACCT--ATGCATG--------CTGGTACAAGA-TTGTTT-CAACTA--TA--GATCAA-TTT---T---C-------ATGAACTCACTGG--TA---CTGATA------AATTG-CCCT-----------A------TAA---T---G----------TGAAt
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gi|103162                     :                                           TATATCA--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAACTT---AAAATGCAGAA-GGATAatgaata
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gi|103164                     :                                     ATATATCGTAA-A--TGTAG-ACA---T--T--GAAATAGCGT---TGAATGTGAAA-GGGTATCAAGCTGA-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTAGAGGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCTA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---
gi|103165                     :                                           TGTAT-A--TATAA-GAT-A-C--T--GAAACAA----------TATGGAA-AGATATCAAGCATT-GATAAACC--GTATGTG--------TTGGCAC-------ATTT----CTA--CA--GATCCA-GTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CTAT-----------A------CAC---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103166                     :                                             TAT-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAATTT---AGAATGTAGAA-GGATATCCGGCATT-GATAAACT--GTATGTA--------TTGGTACA--A-T--------ACTA--TA--GATCCA-TAA---A---C-------AAGA----ATTGG-----------TA------TATTA-CAAT-----------A------TGA---T---T----------TTAATGCAGT-GCATA-ATT
gi|103167                     :                                             TAG-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAACTT---AGAATGTTGAA-AGATATCCAGAATT-TATAAACT--TTAGGTG--------TT-GTACAA----TAT-------TA--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGG---G---T----------TGAAGGTAGT-GCAT
gi|103168                     :                                             TAT-A--TGTTA-ACA-A-C--T--GAA-CAACTT---ATAATGTGGAA-GGATA
gi|103168                     :                                                                                                                                                            ACTA--TA--GATCAC-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TCA---T---T----------TGAAcaagactatagatcactttacaagaactggtatattaccatatcatttgaa
gi|103169                     : tatatgttaacaactgaacaacttataatgtggaaggatacaagTAT-A--TGTGT-AAA-A-CATT--GAAACAACAT---AGAATGTGAAA-AGGTATCCAGCTCT-GATAAAC----TGCATG--------CTGTTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--AA
gi|103170                     :                                                                 --T--GAAAACACGT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTAT-GATAAACT--GTCCATG--------CTTATAGATGA-TTATTT-TATGTA--TA--AATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CGGATACGTT--TATTG-CCCT-----------T------TGA---T---G----------TGAAGTTGGT-GCATacttatatattgc
gi|103171                     :                                            ataT-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAACTT---AGAATGCAGAA-GGG--------------TAAACT--CTGTGTG--------TTGGTACATGA-T----------TA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTAG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103172                     :                                               T-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAATTT---AGAATGCAGAA-G--------------GATAAACT--CTGTGTG--------TTGGTAC---A-TTAT-------TA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTAG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTAAGT-GCATAat
gi|103173                     :                                               T-A--TGTAA-AAA-AAC--T--GAA-CAACTT---AG-----------GATATCCAGCATT-GATACACT--GTATGTG--------TTGATAC------TAT-----ACTG--TA--GTTCCA-TTG---A---C-------A-AA----ACTGG--T--------T-------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---
gi|103174                     :                                                -A--TGTAA-AAA-G-C--T--GAA-CAACTT---AAAGAGTGGAC-TGATATCCAGCATT-GATt
gi|103175                     :                                                                        AACAAATT---AAAATGTAGAA-GGGTATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--CA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTGGT-GCATA-ATTcaccatgta
gi|103176                     :                                                                      tgAACA-CGT---AGAATGTGAAA-GGATATCCAACTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTA--TT--GATCCA-TTT---T---CATGTTTAATGA----ACCGT--CA---CCAATA------TATTG-GCCT-----------A------TAA---T---G----------TTAAGTTGGT-GCATA
gi|103177                     :                                                                         ACAACC----ACAATGTGAAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTTGTACAAGA-TTATAG-CAACTG--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TACCCCCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGC---T---G----------AGA
gi|103178                     :                                                                                ---AGAATGTTGAA-GGATATTCAGCATT-GATAAACT--GTATATG--------TTGATACAAGA---------AA--A--TA--GAT-CA-TTG---TA--C-------AAGA----ACTGG--T--------T-------TATTG-CCAT-----------A------TGA---T---AAATAAAATTTTGAAAGTAGT-TTATATATTgaaatgtat
gi|103179                     :                                                                                      ATGTG-AA-GGATAACCAGCACT-GATAAGCT--GTATGTG--------TTGATAGAAGA-----------CTA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG--T--------T-------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTAAGAAAACTT---TGAAGGTTGT-GCATA
gi|103180                     :                                                -A--TGTAA-AAACA-T--T--GAAACCA-----------GTAGAA------------TGT-GATAAACT--GCCCATG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCAA-TTT---T---C-------ATGT----ACTTG--TA---CTGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGA----AGT-GCATATAT
gi|103181                     :                                                                                      ATGT--AA-GGGTATCTAGCTGA-GATTAACT--GTGCATG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTA--CT--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----TCTAG--TT---CCGACAGACTAGTATTG-CCCT-----------A------TGC---T---G----------TGAAAGTAGT-GCATAcaaggtagtgcataatt
gi|103182                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGTTGATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---A-------ATGA----ACTG----------AAT-------TATTA-CCCT-----------C------CGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103183                     :                                                                                           taa-GGGTATCCAGCTGT-GATAA-CT--GTGCATG--------CTGGTACACAA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---G---G----------TGAAGTTTGT-GCA
gi|103184                     :                                                                                       taaatAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTG-----------ATTT-CAGCTA--TA--GATTCA-TTT---T---C-------GTGA----ACTGG--AA---CCGATA------TATTG--CCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAATTAAT-GCATATATT
gi|103185                     :                                                                                         aaGAATGGGTATACAGCTGT-GATAAACT--G--CATG--------CTGGTACATGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---CATGTTTCATGA----ACTGG--TA---CCAACA------TATTG-TGCT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGTTAAT-GCATATATT
gi|103186                     :                                                                                           GAG-GGGTATCCAGCTGT-GATAAAGT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--CA--GATCCA-TTT---T---C-------ATAA----ACTGA--TA---CTGATA------TATTT-CTCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103187                     :                                                                                            AA-GGGTATCTAGCTTT-GATAAACT--GTGTATG--------CTGGTACAATA-TTATTC-CAACTA--T---GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---
gi|103188                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTTCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----GCTGG--TA---CCGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103189                     :                                                                                            AA-GGTTATCCAGCTGT-GATAACCT--GTGCATG--------CTGGTACCAGA-TTAGTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103190                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGG-GATAAACT--GTACATG--------CTGGTACAAGA-CTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---ACGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103191                     :                                                                                            AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGCACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----A-TGG--TA---CCGAAA------TATTG-ACCT-----------C------AGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103192                     :                                                                                            AA-GGGTACCCAGCTGT-GATAAACT--G-----------------GTACAAGA-TTAATT-CAACTT--TA--AATCCA-TTT---T---C-------ATGA----GCTGT--TA---CTGATA------TATTG-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TGAAG
gi|103193                     :                                                                                            AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAATT--ATGCATG--------CTGGTTCAAGA-TTATAA-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATAA----ACTGA--TA---CCAATg
gi|103194                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGAATG--------TTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--AA---CGGGTA------T-TTG-CCAG-----------A------TGC---G---G----------TGAAGTTGGT-GCATAtttgaa
gi|103195                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATCT-CAACTA--GA--GGTCAATTTT---T---C-------ATTA----ACTGG--TA---CCGAAA------TATTG-TCCT-----------A------TGA---T---A----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103196                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--ATACATGGCATGATGCTGGTACAAGA-T-------AACTA--TTTTGATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CTGATA------TTTTG-CCCCGGATGATGAGGA------TGA---T---G----------TGAAGTTTGT-GCATATATT
gi|103197                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATATACT--GGGCGTG--------CTGATGTAAGA-CTATTT-CAACTATTTA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---TCGATA------TATTG-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TTAAG
gi|103198                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGA-GATAAACT--GCATATG--------CTGGTATAAGA-TTATTT-CAATTA--TA--GATCCA-TT
gi|103199                     :                                                                                            AA-GAGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--AGTCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTAG--AA---CCATTA------GATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTCAGTGGCATA
gi|103200                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAATCT--GTACATA---------TGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GACCCA-TTA---A---G-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGCTAGT-GCA
gi|103201                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGTTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATGG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAAATAGT-GCATA
gi|103202                     :                                                                                            AA-GGGAATCCAGCTGT-GATAAGCT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CAGATA------GATTG-CCCC-----------A------TAA---T---G----------TGAAGGTATT-GTATA
gi|103203                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTACATG--------CTAGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCC-TTT---T---C-------ATGA----GCTGG--TA---CAAATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---A---G----------TAAAGTTAGT-GCATA
gi|103204                     :                                                                                            AA-GGGTTTCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTTAGATGAAG-------ATGA----ACTTG--TA---CCGATA------TATTA-ACCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103205                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-AATAAACT--G--CATG--------CTGGTACAAGA-TTTTTTTCAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTGAGT-GCATA
gi|103206                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGTTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACATGA-TTTTTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----CCTGG--TA---CGGATA------TATTG-CTCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103207                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTG-TACACGA-TTATTC-CAATTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTT-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTAAGT-GCATATATT
gi|103208                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTAT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTA--TT--GATCAA-TTT---T---CATGTTTAATGA----ACTGT--TA---CCAATA------TATTA-CCCT-----------A------TAA---T---A----------TGAAGTTGGT-GCATA
gi|103209                     :                                                                                            AA-GGGTATCTAACTGT-GATAAACT--GTTCATG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTA--TA--ATTCCA-TTT---A---G-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TTAAGTTAGT-GCATA
gi|103210                     :                                                                                            AA-GGGTATCAAGCGGT-GATAAGCT--ATGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--AA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---G---G----------TGAAACAAGT-GCATA
gi|103211                     :                                                                                            AA-GGGTATTCAGCTGT-GATAAAC----TGCATG--------CTGGTCCAAGATTTTTTT-CAACTA--TA--GATCCATTTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCTATA------TATTG-CCCT-----------C------TGT---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103212                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-G------------CATG--------CTGGTACAAGA-TGATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAAC-GCATA
gi|103213                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAACTGT-GATAAACT--ATGCATG--------CTAGTACAAGA-TTATTT-CAACTT--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TT---CCGGTA------TG-TG-TCCT-----------C------TGC---A---G----------TGAAGTTGGT-GCATA
gi|103214                     :                                                                                            AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATT--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GAATCA-ATT---T---G-------ATGA----TCTGG--TA---CCGATA------TATTG-CC
gi|103215                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATACAGT--GTGCATG--------CTGGTACACAC-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-ATT---A---G-------ATGA----ACTGA--TA---CCGCTA------TACTG-TCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCA
gi|103216                     :                                                                                                    TTCAGCTGT-GATAAACT--GGGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTAG--TAC--CCAAAA------TATTG-CCTT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAAT-Ggaa
gi|103217                     :                                                                                               attTATCTATCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATTT----ACTGG--CA---CTGATA------TATTA-CCCC-----------A------TAA---T---G----------TGAAGT
gi|103218                     :                                                                                                                                                           AATCA--TA--G--CGA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG--TA-------TA------TA--A-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAAGTAGT-GCATAgta
gi|103219                     :                                                                                                                                                                                                                acaagGGTA------TCTTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103220                     :                                                                                                                                                                                                           aattA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGCAGT-GCATA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|103161 ): TACATATGTATAAAACTGAACAACATAGACTATATAAGGATGGTACAAGACTATAGATCCATTTAAACTAAACTAACAAGAACTGTTA






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lowQualScore                  :                                                1 77    77   1 3 11 55   6    2 888       5   5           2  5        77    9  00000000          333333333      77  77      1   7777777 3333333 9  2222     44444444444  888888     6  0 77777777777 666666   000 44444444444444     0    7     2   
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Reference ( family-367 )      :                                     ATATATTGTAT-A--TGTAN-AAA-A-C--T--GAAACAACTT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCGTG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-GCATATATT
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gi|103167                     :                                             TAG-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAACTT---AGAATGTTGAA-AGATATCCAGAATT-TATAAACT--TTAGGTG--------TT-GTACAA----TAT-------TA--TA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGG---G---T----------TGAAGGTAGT-GCAT
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gi|103168                     :                                                                                                                                                            ACTA--TA--GATCAC-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TCA---T---T----------TGAAcaagactatagatcactttacaagaactggtatattaccatatcatttgaa
gi|103169                     : tatatgttaacaactgaacaacttataatgtggaaggatacaagTAT-A--TGTGT-AAA-A-CATT--GAAACAACAT---AGAATGTGAAA-AGGTATCCAGCTCT-GATAAAC----TGCATG--------CTGTTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--AA
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gi|103171                     :                                            ataT-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAACTT---AGAATGCAGAA-GGG--------------TAAACT--CTGTGTG--------TTGGTACATGA-T----------TA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTAG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103172                     :                                               T-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAATTT---AGAATGCAGAA-G--------------GATAAACT--CTGTGTG--------TTGGTAC---A-TTAT-------TA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTAG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTAAGT-GCATAat
gi|103173                     :                                               T-A--TGTAA-AAA-AAC--T--GAA-CAACTT---AG-----------GATATCCAGCATT-GATACACT--GTATGTG--------TTGATAC------TAT-----ACTG--TA--GTTCCA-TTG---A---C-------A-AA----ACTGG--T--------T-------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---
gi|103174                     :                                                -A--TGTAA-AAA-G-C--T--GAA-CAACTT---AAAGAGTGGAC-TGATATCCAGCATT-GATt
gi|103175                     :                                                                        AACAAATT---AAAATGTAGAA-GGGTATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--CA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTGGT-GCATA-ATTcaccatgta
gi|103176                     :                                                                      tgAACA-CGT---AGAATGTGAAA-GGATATCCAACTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTA--TT--GATCCA-TTT---T---CATGTTTAATGA----ACCGT--CA---CCAATA------TATTG-GCCT-----------A------TAA---T---G----------TTAAGTTGGT-GCATA
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gi|103178                     :                                                                                ---AGAATGTTGAA-GGATATTCAGCATT-GATAAACT--GTATATG--------TTGATACAAGA---------AA--A--TA--GAT-CA-TTG---TA--C-------AAGA----ACTGG--T--------T-------TATTG-CCAT-----------A------TGA---T---AAATAAAATTTTGAAAGTAGT-TTATATATTgaaatgtat
gi|103179                     :                                                                                      ATGTG-AA-GGATAACCAGCACT-GATAAGCT--GTATGTG--------TTGATAGAAGA-----------CTA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG--T--------T-------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTAAGAAAACTT---TGAAGGTTGT-GCATA
gi|103180                     :                                                -A--TGTAA-AAACA-T--T--GAAACCA-----------GTAGAA------------TGT-GATAAACT--GCCCATG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCAA-TTT---T---C-------ATGT----ACTTG--TA---CTGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGA----AGT-GCATATAT
gi|103181                     :                                                                                      ATGT--AA-GGGTATCTAGCTGA-GATTAACT--GTGCATG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTA--CT--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----TCTAG--TT---CCGACAGACTAGTATTG-CCCT-----------A------TGC---T---G----------TGAAAGTAGT-GCATAcaaggtagtgcataatt
gi|103182                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGTTGATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---A-------ATGA----ACTG----------AAT-------TATTA-CCCT-----------C------CGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103183                     :                                                                                           taa-GGGTATCCAGCTGT-GATAA-CT--GTGCATG--------CTGGTACACAA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---G---G----------TGAAGTTTGT-GCA
gi|103184                     :                                                                                       taaatAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTG-----------ATTT-CAGCTA--TA--GATTCA-TTT---T---C-------GTGA----ACTGG--AA---CCGATA------TATTG--CCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAATTAAT-GCATATATT
gi|103185                     :                                                                                         aaGAATGGGTATACAGCTGT-GATAAACT--G--CATG--------CTGGTACATGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---CATGTTTCATGA----ACTGG--TA---CCAACA------TATTG-TGCT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGTTAAT-GCATATATT
gi|103186                     :                                                                                           GAG-GGGTATCCAGCTGT-GATAAAGT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--CA--GATCCA-TTT---T---C-------ATAA----ACTGA--TA---CTGATA------TATTT-CTCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103187                     :                                                                                            AA-GGGTATCTAGCTTT-GATAAACT--GTGTATG--------CTGGTACAATA-TTATTC-CAACTA--T---GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---
gi|103188                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTTCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----GCTGG--TA---CCGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103189                     :                                                                                            AA-GGTTATCCAGCTGT-GATAACCT--GTGCATG--------CTGGTACCAGA-TTAGTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103190                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGG-GATAAACT--GTACATG--------CTGGTACAAGA-CTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---ACGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103191                     :                                                                                            AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGCACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----A-TGG--TA---CCGAAA------TATTG-ACCT-----------C------AGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103192                     :                                                                                            AA-GGGTACCCAGCTGT-GATAAACT--G-----------------GTACAAGA-TTAATT-CAACTT--TA--AATCCA-TTT---T---C-------ATGA----GCTGT--TA---CTGATA------TATTG-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TGAAG
gi|103193                     :                                                                                            AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAATT--ATGCATG--------CTGGTTCAAGA-TTATAA-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATAA----ACTGA--TA---CCAATg
gi|103194                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGAATG--------TTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--AA---CGGGTA------T-TTG-CCAG-----------A------TGC---G---G----------TGAAGTTGGT-GCATAtttgaa
gi|103195                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATCT-CAACTA--GA--GGTCAATTTT---T---C-------ATTA----ACTGG--TA---CCGAAA------TATTG-TCCT-----------A------TGA---T---A----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103196                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--ATACATGGCATGATGCTGGTACAAGA-T-------AACTA--TTTTGATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CTGATA------TTTTG-CCCCGGATGATGAGGA------TGA---T---G----------TGAAGTTTGT-GCATATATT
gi|103197                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATATACT--GGGCGTG--------CTGATGTAAGA-CTATTT-CAACTATTTA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---TCGATA------TATTG-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TTAAG
gi|103198                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGA-GATAAACT--GCATATG--------CTGGTATAAGA-TTATTT-CAATTA--TA--GATCCA-TT
gi|103199                     :                                                                                            AA-GAGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--AGTCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTAG--AA---CCATTA------GATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTCAGTGGCATA
gi|103200                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAATCT--GTACATA---------TGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GACCCA-TTA---A---G-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGCTAGT-GCA
gi|103201                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGTTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATGG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAAATAGT-GCATA
gi|103202                     :                                                                                            AA-GGGAATCCAGCTGT-GATAAGCT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CAGATA------GATTG-CCCC-----------A------TAA---T---G----------TGAAGGTATT-GTATA
gi|103203                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTACATG--------CTAGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCC-TTT---T---C-------ATGA----GCTGG--TA---CAAATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---A---G----------TAAAGTTAGT-GCATA
gi|103204                     :                                                                                            AA-GGGTTTCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTTAGATGAAG-------ATGA----ACTTG--TA---CCGATA------TATTA-ACCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103205                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-AATAAACT--G--CATG--------CTGGTACAAGA-TTTTTTTCAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTGAGT-GCATA
gi|103206                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGTTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACATGA-TTTTTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----CCTGG--TA---CGGATA------TATTG-CTCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103207                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTG-TACACGA-TTATTC-CAATTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTT-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTAAGT-GCATATATT
gi|103208                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTAT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTA--TT--GATCAA-TTT---T---CATGTTTAATGA----ACTGT--TA---CCAATA------TATTA-CCCT-----------A------TAA---T---A----------TGAAGTTGGT-GCATA
gi|103209                     :                                                                                            AA-GGGTATCTAACTGT-GATAAACT--GTTCATG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTA--TA--ATTCCA-TTT---A---G-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TTAAGTTAGT-GCATA
gi|103210                     :                                                                                            AA-GGGTATCAAGCGGT-GATAAGCT--ATGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--AA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---G---G----------TGAAACAAGT-GCATA
gi|103211                     :                                                                                            AA-GGGTATTCAGCTGT-GATAAAC----TGCATG--------CTGGTCCAAGATTTTTTT-CAACTA--TA--GATCCATTTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCTATA------TATTG-CCCT-----------C------TGT---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103212                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-G------------CATG--------CTGGTACAAGA-TGATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAAC-GCATA
gi|103213                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAACTGT-GATAAACT--ATGCATG--------CTAGTACAAGA-TTATTT-CAACTT--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TT---CCGGTA------TG-TG-TCCT-----------C------TGC---A---G----------TGAAGTTGGT-GCATA
gi|103214                     :                                                                                            AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATT--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GAATCA-ATT---T---G-------ATGA----TCTGG--TA---CCGATA------TATTG-CC
gi|103215                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATACAGT--GTGCATG--------CTGGTACACAC-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-ATT---A---G-------ATGA----ACTGA--TA---CCGCTA------TACTG-TCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCA
gi|103216                     :                                                                                                    TTCAGCTGT-GATAAACT--GGGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTAG--TAC--CCAAAA------TATTG-CCTT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAAT-Ggaa
gi|103217                     :                                                                                               attTATCTATCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATTT----ACTGG--CA---CTGATA------TATTA-CCCC-----------A------TAA---T---G----------TGAAGT
gi|103218                     :                                                                                                                                                           AATCA--TA--G--CGA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG--TA-------TA------TA--A-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAAGTAGT-GCATAgta
gi|103219                     :                                                                                                                                                                                                                acaagGGTA------TCTTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103220                     :                                                                                                                                                                                                           aattA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGCAGT-GCATA


blockSeqs                     :                                                C AT    AT   C A CT TT   A      TAA                                            GCATGATG          ATTTTTTT                   T   AGATGAA ATGTTTA    ACTC     TACCCCCGA    GACTAG        A GGATGATGAGG CATGTG       AAATAAAATTT        G          T
blockSeqs                     :                                                . A     T    . A AT .    A      .                                              .                 ATTTTTTT                   T   TA      ATGTTTC    .        TTTATTAC     CGTT          A .           .            TAAGAAAACTT        G          T
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       ATGTTTA    .        TACCCAA      .             A .           .            T                  G          T
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        AACTGG       .             A .           .            T                  T          T
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        TACTGG       .             A .           .            T                  G          T
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    A      .                                              .                 ATTGTTT                    .   A       .          .        TACCGA       .             A .           .            T                  A          T
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        TTCCAA       .             A .           .            T                  G          T
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    A      .                                              .                 ATAATTT                    .   A       .          .        TACCAA       .             G .           .            T                  A          T
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        TACTGA       .             A .           .            T                  G          .
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        TACTGA       .             A .           .            T                  G          .
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATGT                    .   T       .          .        TACGGA       .             A .           .            T                  G          .
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATAG                    .   A       .          .        CACCAA       .             A .           .            T                  T          .
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   T       .          .        TACTGA       .             C .           .            G                  G          .
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        TTCCGA       .             T .           .            T                  G          .
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    A      .                                              .                 ATCATTT                    .   A       .          .        TACCGA       .             A .           .            G                  T          .
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   T       .          .        AACCGA       .             C .           .            T                  T          .
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        TACCAA       .             A .           .            C                  G          .
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        TACTGA       .             A .           .            T                  G           
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTC                    .   T       .          .        TACCGA       .             C .           .            A                  G           
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    A      .                                              .                 ATTATTT                    .   T       .          .        TACCGA       .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    A      .                                              .                 ATTAGTT                    .   T       .          .        TAACGA       .             A .           .            G                  G           
blockSeqs                     :                                                . .     G    . . .  .    .      .                                              .                 ACTATTT                    .   A       .          .        TACCGA       .             A .           .            T                  T           
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    .      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        TACTGA       .             A .           .            T                  G           
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    .      .                                              .                 ATTAATT                    .   A       .          .        TACCAA       .             A .           .            T                  T           
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    .      .                                              .                 ATTATAA                    .   A       .          .        AACGGG       .             C .           .            T                  G           
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    .      .                                              .                 ATTATTT                    .   T       .          .        TACCGA       .             A .           .            G                  G           
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    .      .                                              .                 ATTATCT                    .   A       .          .        TACTGA       .             A .           .            T                  G           
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    .      .                                              .                 ACTATTT                    .   A       .          .        TATCGA       .             A .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                . .     T    . . .  .    .      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        AACCAT       .             A .           .            T                  T           
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    .      .                                              .                 ATTATTT                    .   A       .          .        TACCGA       .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    .      .                                              .                 ATTATTT                    .   T       .          .        TACCGA       .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                . .     A    . . .  .    .      .                                              .                 ATAATTT                    .   T       .          .        TACAGA       .             A .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                . .     .    . . .  .    .      .                                              .                 ATAATTT                    .   A       .          .        TACAAA       .             A .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                . .     .    . . .  .    .      .                                              .                 ATTATTT                    .   T       .          .        TACCGA       .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                 .  .    .      .                                              .                 ATTATTT                    .   T       .          .        TACCGA       .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                         .      .                                              .                 ATTTTTT                    .   T       .          .        TACGGA       .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                         .      .                                              .                 ATTATTC                    .   T       .          .        TACCGA       .             C .           .            T                  T           
blockSeqs                     :                                                                         .      .                                              .                 ATTATGT                    .   T       .          .        TACCAA       .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                .                                              .                 ATCATTT                    .   T       .          .        TACCGA       .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 ATTATTT                    .   T       .          .        TACCGA       .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 ATGATTT                    .   T       .          .        TACCTA       .             C .           .            G                  C           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 ATTATTT                    .   T       .          .        TACCGA       .             C .           .            G                  A           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 ATTATTT                    .   T       .          .        TTCCGG       .             C .           .            G                  G           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 CTTATTT                    .   T       .          .        TACCGA       .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 ATTATTT                    .   T       .          .        TACCGC       .             C .           .            A                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 ATTATTT                    .   T       .          .        CACTGA       .             A .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 ATTAT                      .   T       .          .        TATGA        .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 ATTT                       .   T       .          .        TA           .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 ATTT                       .   T       .          .        AA           .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 TAT                        .   T       .          .        TA           .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 TAT                        .   T       .          .        T            .             C .           .            G                  C           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 AT                         .   T       .          .        T            .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 AT                         .   A       .          .        T            .             C .           .            G                  T           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 AT                         .   T       .          .        .            .             C .           .            G                  T           
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blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 .                          .   T       .          .        .            .             C .           .            G                  G           
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blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 .                          .   T       .          .        .            .             C .           .            G                              
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 .                          .   T       .          .        .            .             C .           .            G                              
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blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 .                          .   A       .          .        .            .             C .           .            T                              
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 .                          .   T       .          .        .            .             A .           .            T                              
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 .                          .   T       .          .        .            .             A .           .                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 .                          .   A       .          .        .            .             A .           .                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 .                          .   .       .          .                     .                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                 .                          .   .       .          .                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                               .                                            .                                                                                                                    


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                 ATTATTT**                                                  TACCGA*****
originalCons                  :                                     ATATATTGTAT-A--TGTAN-AAA-A-C--T--GAAACAACTT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCGTG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-GCATATATT
finalCons                     :                                     ATATATTGTAT-A--TGTAN-AAA-A-C--T--GAAACAACTT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCGTG--------CTGGTACAAGATTATTT--CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGGTACCGA-----TA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-GCATATATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|103161 ): TACATATGTATAAAACTGAACAACATAGACTATATAAGGATGGTACAAGACTATAGATCCATTTAAACTAAACTAACAAGAACTGTTA






Alignments
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lowQualScore                  :                                                1 77    77   1 3 11 55   6    2 888       5   5           2  5        77    9  00000000          333333333      77  77      1   7777777 3333333 9  2222     44444444444  888888     6  0 77777777777 666666   000 44444444444444     0    7     2   
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Reference ( family-367 )      :                                     ATATATTGTAT-A--TGTAN-AAA-A-C--T--GAAACAACTT---AGAATGTGGAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCGTG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-GCATATATT
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gi|103168                     :                                                                                                                                                            ACTA--TA--GATCAC-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TCA---T---T----------TGAAcaagactatagatcactttacaagaactggtatattaccatatcatttgaa
gi|103169                     : tatatgttaacaactgaacaacttataatgtggaaggatacaagTAT-A--TGTGT-AAA-A-CATT--GAAACAACAT---AGAATGTGAAA-AGGTATCCAGCTCT-GATAAAC----TGCATG--------CTGTTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--AA
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gi|103171                     :                                            ataT-A--TGTAT-AAA-A-C--T--GAA-CAACTT---AGAATGCAGAA-GGG--------------TAAACT--CTGTGTG--------TTGGTACATGA-T----------TA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTAG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
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gi|103173                     :                                               T-A--TGTAA-AAA-AAC--T--GAA-CAACTT---AG-----------GATATCCAGCATT-GATACACT--GTATGTG--------TTGATAC------TAT-----ACTG--TA--GTTCCA-TTG---A---C-------A-AA----ACTGG--T--------T-------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---
gi|103174                     :                                                -A--TGTAA-AAA-G-C--T--GAA-CAACTT---AAAGAGTGGAC-TGATATCCAGCATT-GATt
gi|103175                     :                                                                        AACAAATT---AAAATGTAGAA-GGGTATCCAGCATT-GATAAACT--GTATGTG--------TTGGTACAAG-----------ACTA--CA--GATCCA-TTA---A---C-------AAGA----ACTGG-----------TA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTGGT-GCATA-ATTcaccatgta
gi|103176                     :                                                                      tgAACA-CGT---AGAATGTGAAA-GGATATCCAACTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTA--TT--GATCCA-TTT---T---CATGTTTAATGA----ACCGT--CA---CCAATA------TATTG-GCCT-----------A------TAA---T---G----------TTAAGTTGGT-GCATA
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gi|103178                     :                                                                                ---AGAATGTTGAA-GGATATTCAGCATT-GATAAACT--GTATATG--------TTGATACAAGA---------AA--A--TA--GAT-CA-TTG---TA--C-------AAGA----ACTGG--T--------T-------TATTG-CCAT-----------A------TGA---T---AAATAAAATTTTGAAAGTAGT-TTATATATTgaaatgtat
gi|103179                     :                                                                                      ATGTG-AA-GGATAACCAGCACT-GATAAGCT--GTATGTG--------TTGATAGAAGA-----------CTA--TA--GATCCA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG--T--------T-------TATTA-CCAT-----------A------TGA---TTAAGAAAACTT---TGAAGGTTGT-GCATA
gi|103180                     :                                                -A--TGTAA-AAACA-T--T--GAAACCA-----------GTAGAA------------TGT-GATAAACT--GCCCATG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCAA-TTT---T---C-------ATGT----ACTTG--TA---CTGATA------TATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGA----AGT-GCATATAT
gi|103181                     :                                                                                      ATGT--AA-GGGTATCTAGCTGA-GATTAACT--GTGCATG--------CTGGAACAAGA-TTATTT-CAACTA--CT--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----TCTAG--TT---CCGACAGACTAGTATTG-CCCT-----------A------TGC---T---G----------TGAAAGTAGT-GCATAcaaggtagtgcataatt
gi|103182                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGTTGATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---A-------ATGA----ACTG----------AAT-------TATTA-CCCT-----------C------CGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103183                     :                                                                                           taa-GGGTATCCAGCTGT-GATAA-CT--GTGCATG--------CTGGTACACAA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---G---G----------TGAAGTTTGT-GCA
gi|103184                     :                                                                                       taaatAA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTG-----------ATTT-CAGCTA--TA--GATTCA-TTT---T---C-------GTGA----ACTGG--AA---CCGATA------TATTG--CCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAATTAAT-GCATATATT
gi|103185                     :                                                                                         aaGAATGGGTATACAGCTGT-GATAAACT--G--CATG--------CTGGTACATGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---CATGTTTCATGA----ACTGG--TA---CCAACA------TATTG-TGCT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGTTAAT-GCATATATT
gi|103186                     :                                                                                           GAG-GGGTATCCAGCTGT-GATAAAGT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--CA--GATCCA-TTT---T---C-------ATAA----ACTGA--TA---CTGATA------TATTT-CTCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103187                     :                                                                                            AA-GGGTATCTAGCTTT-GATAAACT--GTGTATG--------CTGGTACAATA-TTATTC-CAACTA--T---GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---
gi|103188                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTTCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----GCTGG--TA---CCGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103189                     :                                                                                            AA-GGTTATCCAGCTGT-GATAACCT--GTGCATG--------CTGGTACCAGA-TTAGTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103190                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGG-GATAAACT--GTACATG--------CTGGTACAAGA-CTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---ACGAAA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103191                     :                                                                                            AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGCACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----A-TGG--TA---CCGAAA------TATTG-ACCT-----------C------AGA---T---G----------TGAAGTTAGT-G
gi|103192                     :                                                                                            AA-GGGTACCCAGCTGT-GATAAACT--G-----------------GTACAAGA-TTAATT-CAACTT--TA--AATCCA-TTT---T---C-------ATGA----GCTGT--TA---CTGATA------TATTG-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TGAAG
gi|103193                     :                                                                                            AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAATT--ATGCATG--------CTGGTTCAAGA-TTATAA-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATAA----ACTGA--TA---CCAATg
gi|103194                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGAATG--------TTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--AA---CGGGTA------T-TTG-CCAG-----------A------TGC---G---G----------TGAAGTTGGT-GCATAtttgaa
gi|103195                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATCT-CAACTA--GA--GGTCAATTTT---T---C-------ATTA----ACTGG--TA---CCGAAA------TATTG-TCCT-----------A------TGA---T---A----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103196                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--ATACATGGCATGATGCTGGTACAAGA-T-------AACTA--TTTTGATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CTGATA------TTTTG-CCCCGGATGATGAGGA------TGA---T---G----------TGAAGTTTGT-GCATATATT
gi|103197                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATATACT--GGGCGTG--------CTGATGTAAGA-CTATTT-CAACTATTTA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---TCGATA------TATTG-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TTAAG
gi|103198                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGA-GATAAACT--GCATATG--------CTGGTATAAGA-TTATTT-CAATTA--TA--GATCCA-TT
gi|103199                     :                                                                                            AA-GAGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--AGTCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTAG--AA---CCATTA------GATTG-CCCT-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTCAGTGGCATA
gi|103200                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAATCT--GTACATA---------TGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GACCCA-TTA---A---G-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGCTAGT-GCA
gi|103201                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGTTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATGG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAAATAGT-GCATA
gi|103202                     :                                                                                            AA-GGGAATCCAGCTGT-GATAAGCT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TAATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CAGATA------GATTG-CCCC-----------A------TAA---T---G----------TGAAGGTATT-GTATA
gi|103203                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTACATG--------CTAGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCC-TTT---T---C-------ATGA----GCTGG--TA---CAAATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---A---G----------TAAAGTTAGT-GCATA
gi|103204                     :                                                                                            AA-GGGTTTCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTTAGATGAAG-------ATGA----ACTTG--TA---CCGATA------TATTA-ACCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103205                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-AATAAACT--G--CATG--------CTGGTACAAGA-TTTTTTTCAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTGAGT-GCATA
gi|103206                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGTTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACATGA-TTTTTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----CCTGG--TA---CGGATA------TATTG-CTCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103207                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTG-TACACGA-TTATTC-CAATTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTT-CCCC-----------A------TGA---T---G----------TGAAGTAAGT-GCATATATT
gi|103208                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTAT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAATA-TTATGT-CCACTA--TT--GATCAA-TTT---T---CATGTTTAATGA----ACTGT--TA---CCAATA------TATTA-CCCT-----------A------TAA---T---A----------TGAAGTTGGT-GCATA
gi|103209                     :                                                                                            AA-GGGTATCTAACTGT-GATAAACT--GTTCATG--------CTGGTACAAGA-TCATTT-CAACTA--TA--ATTCCA-TTT---A---G-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TTAAGTTAGT-GCATA
gi|103210                     :                                                                                            AA-GGGTATCAAGCGGT-GATAAGCT--ATGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--AA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGG---G---G----------TGAAACAAGT-GCATA
gi|103211                     :                                                                                            AA-GGGTATTCAGCTGT-GATAAAC----TGCATG--------CTGGTCCAAGATTTTTTT-CAACTA--TA--GATCCATTTT---T---T-------ATGA----ACTGG--TA---CCTATA------TATTG-CCCT-----------C------TGT---G---G----------TGAAGTTAGT-GCATA
gi|103212                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-G------------CATG--------CTGGTACAAGA-TGATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TA---CCGATA------TATTG-CCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAAC-GCATA
gi|103213                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAACTGT-GATAAACT--ATGCATG--------CTAGTACAAGA-TTATTT-CAACTT--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTGG--TT---CCGGTA------TG-TG-TCCT-----------C------TGC---A---G----------TGAAGTTGGT-GCATA
gi|103214                     :                                                                                            AA-GGATATCCAGCTGT-GATAAACT--GTGCATT--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GAATCA-ATT---T---G-------ATGA----TCTGG--TA---CCGATA------TATTG-CC
gi|103215                     :                                                                                            AA-GGGTATCCAGCTGT-GATACAGT--GTGCATG--------CTGGTACACAC-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-ATT---A---G-------ATGA----ACTGA--TA---CCGCTA------TACTG-TCCT-----------C------TGA---G---G----------TGAAGTTAGT-GCA
gi|103216                     :                                                                                                    TTCAGCTGT-GATAAACT--GGGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATGA----ACTAG--TAC--CCAAAA------TATTG-CCTT-----------C------TGA---T---G----------TGAAGTTAAT-Ggaa
gi|103217                     :                                                                                               attTATCTATCTGT-GATAAACT--GTGCATG--------CTGGTACAAGA-TTATTT-CAACTA--TA--GATCCA-TTT---T---C-------ATTT----ACTGG--CA---CTGATA------TATTA-CCCC-----------A------TAA---T---G----------TGAAGT
gi|103218                     :                                                                                                                                                           AATCA--TA--G--CGA-TTT---A---C-------AAGA----ACTGG--TA-------TA------TA--A-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAAGTAGT-GCATAgta
gi|103219                     :                                                                                                                                                                                                                acaagGGTA------TCTTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGTAGT-GCATA
gi|103220                     :                                                                                                                                                                                                           aattA---CTGGTA------TATTA-CCAT-----------A------TGA---T---T----------TGAAGGCAGT-GCATA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|103161 ): TACATATGTATAAAACTGAACAACATAGACTATATAAGGATGGTACAAGACTATAGATCCATTTAAACTAAACTAACAAGAACTGTTA