lowQualScore : 1 1111
lowQualScore : 2 0 77 55 0 0 111 1111 111 0 0 11 0 55 2222 000 8888 111 5555 22 222 1 3 00 0 0 0 6 3 111 0 6 00 0 5 0 0 6
lowQualScore : . . .. .. . . ... .... ... . . .. . .. .... ... .... ... .... .. ... . . .. . . . . . ... . . .. . . . . .
lowQualScore : 8 7 77 66 6 6 555 6666 999 5 5 22 5 44 0000 999 2222 444 6666 44 666 0 6 77 5 5 5 7 6 000 6 0 88 6 6 6 6 0
consensus : ATTTTT-GTTAAA-GTCTCA-TCCGAAAG-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AGG----A---GC--G-G---G--G-G--A---T-CGA--ACCTGCGACCC-C-T-GGGTTCGCAG---T-CCA--AGG-CCTT-AACC-ACTGGACCACTAATCCGCTC
Reference ( gi|90578 ) : ATATTT-GTTAAA-ATCCTA-TCCGAAAG-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AGG----A---GC--A-G---G--T-G--A---T-CAA--ACCTGCGACCC-C-T-GAGTTCACAG---T-CTA--AGG-CTTT-AACC-ACTGGACCACTAATCCACCC
gi|90583 : ATCTTT-GTTAAA-GTCCCA-TCCGAAAG-ACTG---TTGAGT----A---TT-TT----A-GTTGG--AGG----A---GA--G-G---G--G-G--A---T-CGA--ACCTGCGACCA-C-T-GAGCTCACAG---T-CTA--AGG-CCTTAAACC-ACTGGACCACTTATCCAC
gi|90581 : ATTTTT-GTTAAA-GTTTTA-TCCGAAAG-ACTG---ATTATT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AAG----A---GC--G-G---G--T-G--A---T-CGA--ACCTGCGACTT-C-T-TTGTTCGCAG---T-CCA--AGG-CGTT-AACC-ACTGGACCACTAATCCGCTt
gi|90587 : ATTTTT-GTTAAA-ATCTCA-TCTGAAAG-ACTG---ATAAGT----A---TTCTT-T--A-GTTTG--AGG----A---GT--G-G---G--G-G--A---T-CAA--ACCTGCGACCC-C-T-GGGTTTA-AG---T-CCA--GGG-CCTT-AACC-ACCAGACTACTAATCCACT
gi|90586 : ATTTTT-GTTAAA-ATCTCA-CCCGAAAG-ACTG---ATACAT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AGG----A---GC--G-G---G--T-G--C---T-CGA--ACCTGCAACCC-C-T-GGGTTCGCCG---T-CCA--AGG-GTTT-AATC-ACTGGATCACTAATGCGCT
gi|90577 : ATTTTT-GTTAAA-GTCTGA-CCCGAAAG-ACTG---ATTAGT----A---TT-TT-T--ATGTTGG--AAG----A---GC--G-G---G--G-G--A---G-CGA--ACCTGCGACCC-C-T-GGGTTCGCAG---T-CCA--ATG-CGTT-AACC-ACTGGTCCACTAATCCGCT
gi|90584 : ATTTTT-GTTAAA-GTCCCA-TCCGAAAG-ACTG---ATACGT----A---AT-TT-T--A-GTTGG--AGG----A---GCGTA-G--------G--G---T-CGA--ACCTGCGATCC-C-T-GGGTTCGCAG---T-CCA--AGG-CCTT-AACC-ACTCGAACACTAGTCAACT
gi|90590 : ATTTTT-GTTTAA-GTCTCA-TCCGAAAT-ACTG---ATAAAT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AGG----A---GC--G-G---G----G--AC--T-CGG--ACCTGCGATCC-CGT-G-GTTCGCAG---T-CTA--AGG-CCTT-AACC-ATTGGACCACTAGTTCAC
gi|90580 : ATTTTT-GTTAAA-GTCTCA-TCCGAAAG-TCTG---ATGAGT----A---TT-TT----A-GTTCG--AGG----A---GC--G-G---G--T-G--A---T-CGA--ACCTGCGATCC-C-T-GGGTTCGCAA---TCCCG--CGG-CTTT-AACC-ACTGGACCACTTATTCGCTt
gi|90579 : ATTTTT-GTTAAA-GTCCCA-TTCGAAAG-ACGG---ATTAGT----A---TT-TT-T--A-ATTGG--AAG----A---GC--G-A---C--A-G--A---T-CGA--GCCTGCGACTC-C-T-GGGTTCGCAG---T-CCA--AGG-CGTT-AACC-ACTGGACCACTTATCC
gi|90588 : ATTTTT-GTTAAA-GTCTCA-CCCAAACG-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT-T----GTTGG--AGG----A---GC--G-G---G--G-A--A---T-CGA--GCCTGCGACGC-C-C-GGGTTCGCAA---C-CGA--AGG-CCTT-AACC-ATTGGACCACTAATTCACTtctc
gi|90592 : ATTTTT-GCTAAA-GTCCCA-TCTGAAAG-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT-T--A-GCTTG--AGG----A---GG--G-G---A--G-G--A---T-CGA--ACCTGCAACCC-C-T-GGTTTGGCAG---T-CCA--AGG--TCT-AATCGACTGGACCACTAATCCACT
gi|90582 : ATTTTT-GTTTAA-GTCTTA-TCCGAAAG-ACTG---ATAAGT----A---TT-GA-G--A-GTGGG--CGG----A---GC--T-G---G--G-A--A---T-CGA--ACCTGCGACCC-A-T-GGGTTCGCAG---C-CCA--AGG-CCTT-AACC-ACTGGACCACTTATCCGC
gi|90591 : ATTTTT-GTTAAA-GTCTCA-TTCAAAAA-ATTG---ATAAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AAG----A---GC--G-G---G--A-G--A---T-CGA--GCCTGCGACCC-A-T-TGGTCTGCAG---T-CCA--AGG-TATT-AACC-ACTGGACCACTAAT
gi|90585 : ATTTTT-GTTAAA-GTCTCA-ACCGAAAG-AATG---ATAAGT----A---TT-CT-T--G-GTTGG--AGG----A---GC--G-G---G--G-GT-A---T-CGA--ACCTGGGATCCGC-T-G-GTTTGCAG---T-TCA--AGG-CCTT-AATC-ACTGGACCACTAATCCGCTacg
gi|90596 : ATATTT-GTTAAT-GTCTCA-TCCGAAAG-ACTG---ATGAAT----A---TT-TT----A-GTTGG--TGGTGAGA---GG--G-G---G--T-G--GGGGT-AAA--ATCTGTGACCC-C-T-GGGTTCGCAG---T-CCA--AGG-CCAT-AACC-ACTGGACCACTAATCCGCT
gi|90593 : ATTTTT-GTTAAA-CTCCCA-TCCGGAAG-CCTG---CTAAGT----A---TT-TT-T--A-ATTGG--AGG----A---GC--G-G--------G--G---T-CGA--ACCTGCGACCC-C-T-TGGTTCGCAT---T-CCA--AGG-CCGT-AACC-ACTAGACCACT
gi|90594 : ATTTTT-GGGAAA-GTCTCA-TCCGAAAG-ACTG---ATAATT----T---TT-TA-T--A-GTTTG--AGG----A---GC--G-A---G--G-G--A---T-CGA--ACCTGCGACTC-T-T-GGATTCGCAG---T-TCA--AGG-CTTT-AACA-TCTGGACCACTAATCCgtgtcc
gi|90609 : ATATTT-GTTAAA-GTCCCA-TCCGAAAG-ACTT---ATAAGT----A---TT----------TTAG--AGG----A---GC--A-T---G--T-G--A---T-CTA--ACCTGCGACCC-----AAGTTCACAG---T-GCA--ACG-CCTT-CACC-AATGGACCACTTATtctc
gi|90604 : ATTTTT-GTTAAA-GTC-TACTCCCAAAG-ACTG---ATGAGT----A---TT-CT-T--A-GTTGG--TGG----A---ACT-G-G---G--T-T--A---TACAAGAACCTGCTACCC-C-T-AGGTTTGCAG---T-TTA--AGG-CCTA-AACC-ACTGGACCACTAATCCGCT
gi|90595 : ATTTTT-GATAAA-GTCTTA-TCCGAAAG-ACAG---ATTAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--TGA----A---GC--G-G---G--G-T--A---T-CGA--ACCTGCGACCC-A-T-G-------GG---T-CCA--AGG-CGTT-AACC-ACTGGACCACTTATCCAC
gi|90599 : ATTTTT-GTT------CCCA-TCCGAAAA-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT----A-GTTGT--AGG----A---GC--G-G---A--A-A--A---T-CGA--ACCTGCAGTCC-C-T-AGGTTTGCAG---T-CCA--AGA-CCTT-GACC-ACTGGACCACTTATCC
gi|90598 : ATTTTT-GTTAG---TCTCA-TCCAAAAG-ACTG---ATAAGT----AT--TT-TT-T--A-GTT-G--AGG----G---GC--A-G---G----G--AT--T-CGA--ACCTTCAGCTC-C-T-AGGTTTGCAG---T-CCA--AGA-CCTT-AACC-ATTGGACCACTAATCTGCT
gi|90603 : ATTTTT-ATTAAA-GTCTCA-TCCGAAAG-ACTT---ATAATT----A---TT-TT----A-GTAGG--AGA----A---GC--G-A---C--G-G--A---C-CGA--ACATGCGACCC-C-T-GGCTTCACAG---T-CTG--AGG-CCTT-AACC-ACTGCACCAC
gi|90605 : ATTTTT-GTTAAA-GTCTCA-TCCGAAAG-ACTGA--AAAAAT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AGG----G---GC--G-G---G----GAAA---T-AGA--ACCTGCGG----------------AG---T-CCA--AGG-CTTT-AACC-ACTGGACCGCTAATCCGCT
gi|90601 : ATTTTTAGTTAAA-TTCTCA-TCCGAAAG-ACTG---TTAAGT----A---TT-TT-T--A-GTTTG--AGG----A---GC--G-G---G--G-G--A---T-GGA--ACCTGT------------GTTCGCAG---T-TCA--AGG-CCTT-AACC-GCTGGACGACAAATCCGCT
gi|90608 : ATTTTT-GTTAAA-GTCTCA-TCCGAAAG-ACTG---ATACGT----A---TT-TT-T--A-GATGT--AGG----A---GC--G-G---G--G-G--A---T-CAA--ACCTGCGACTC-C-T-GGGTTTAAAG---T-C
gi|90600 : ATTTTT-GTTAAA-GTTTTA-TCCAAAAG-ACTG---GTA------------T-TT-T--A-GTTCG--AGT----A---GC----G---G--T-G--G---TTCGA--ACTTGCGACCC-C-T-GTGTTCGTAG---T-CCA--AGG-TCTT-GTCC-ACTGGAACACTTATCCGCT
gi|90612 : ATATTT-GTTAAA-GTCTCG-ACCAAAAG-ACTG---ATAATT----A---TT-TT-T--A-GATGT--AGG----A---GC--A-G---G--G-G--A---T-CGA--ACCTGCGACTC-C-T-GGGTTCAAAG---T-C
gi|90602 : ATTTTT-GTTAGA-GTCTCA-TCCGAAAG-TCTT---ATAAGT----T---TT-TT-T----GTTGG--AGG----A---GC--G-A---G--G-G--A---T-CGA--ATCTGCGGCAC-C-T-GGATTCGCAG---T-A-A--AGGTTTTT-AACC-ACTCGATCACTTACCCGC
gi|90606 : ATTTTT-GTTAAA-GTCTCA-TCCGAAAG-ACTG---ATACGT----A---CT-TT-T--A-GATGT--AGG----A---GC--G-G---G--G-G--A---T-CGA--ACCTGCGACTC-C-T-GGGTTCGAAG---T-C
gi|90607 : ATTTTT-GTTAAA-GTCTCA-TCCGAAAG-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT-T--A-GATGT--ATG----A---GC--G-G---G--G-A--A---T-CGA--ACCTGCGACTC-C-T-GGATTCGAAG---T-C
gi|90610 : ATTTTT-GTGAAA-GTCTTA-TGCGATAG-ACTT---ATACGT----A---TT-TT-A--G-ATTGG--AGG----A---AC--A-G---T--G-G--A---T-TGA--ATCTGCGTTCC-C-T-GGGTTCGCAG---T-CCA--AGG-CTTT-AACG-ACT--ACTAC
gi|90616 : ATTTTT-GTTAAA-GTCACA-CCCGAAAT-AATG---ATAAAT----A----T-TA-T--A-GTTGG--AGA----A---GC--G-G---G----G--A--------------------C-C-T-GGGTTCGCAG---T-CAG--AGG-CTTT-AACC-ACT
gi|90617 : ATTTTT-GTTGAC-GTCTCA-TCTGAAAT-ACTG---ATGAGT----A---TT-TT-T--A-GTTCG--AGG----A---CC--G-G---G--G-A--A---A-CGA--ACC------------------------------A--ATG-CGTT-AAAC-ACTGGCCCACTAATCCGCTtatccgct
gi|90618 : ATTTTT-GTTAAA-AGCTTA-TCCGAAAG-ACTT---ATCAGT----A---TT-TA-G--A-GCTGG--AGG----A---GC--G-G---
gi|90629 : ATTT-ATTAAG--TCTCA-TCTAAAAA-ACTT---GTTAGT----A---TT-TT-TT-G-GTTGA--AGG----A---GC--G-G---G----G--A---T-CAA--ACCTGCGATCC-C-T-GGGTTAGCAG---T-CCA--AGA-CTTT-AACC-ACTGGACCATTAATCCACT
gi|90597 : ttttgttaATTT-TTTTAT-GTCTTA-TTCGAAAG-AC------TAAGT----AC--TT-TT-T--A-GTTGG--ATG----A---GC--A-G---G--G-GGTG---T-CGA--ACCTGCGATCC-C-T-TGTTTCGCAG---T-CCA--AGG-TTTG-AACT-ACTCGACCACTTATCC
gi|90589 : ATTT-TTTAAG--TCTCA-TCCAACAG-ATTG---TTCAGA----A---CT-TT-T--A-GTTTG--AGA----A---AC--G-G---G--G-G--A---T-CTA--ACCTGCAATCT-C-T-TGGTTCGCAG---T-CCA--ATG-CCTC-AATC-ACTAGACCACTTATcct
gi|90620 : TTT-ATTAAA-TTCTCA-TCCGAAAG-ACTG---ATAAAT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AGG----A---GT--G-G---G--G-G--A---T-CAA--ACCTGCATTCC-C-T-GGGTTTGCAT---A-TTA--AGG-CCTT-AACC-ACTGAACCACTAATACGCTacgttc
gi|90619 : ttTTT-GTTAAG--TCTCA-TCTGAAAT-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT-T--A-GTAAG--AGG----A---GT--G-A---G--G-G--A---T-CAA--ACCTATGACCC-C-T-GGGTTAGCAG---T-CCA--AGG-CCTT-AACC-ACTTGACCACTAATCTACT
gi|90627 : ttTTT-GATAAA-ATTTTA-TTCAAAAG-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT-A--A-GTTGG--AGG----A---GC--G-G---A--C-A--A---T-CGA--ACCTGCGATCC-C-A-GGGTTTGCAG---T-CCA--AGG-TCTT-AACC-ACTGAATCAC
gi|90628 : tTTT-GTTAAT-GTCTCA-TCTGAAAG-------------T----A---TT-TTTT--A-GTTGG--AGG----A---TC--A-G---G--G-A--A---T-CGA--ACCTGCAACCC-C-T-GGGTTCACAG---T-TCA--AGG-CCTT-AACC-ACTGGACCATTAATC
gi|90630 : tTTT-GTTAAA-GTCCCA-TCCGAAAT-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT-T--A-GTTAG--AGG----AATGGC--G-GGGCG--G-G--G---T-CGA--ACCTGCGACGC-C-T-TGGTTCGCGGCAAC-CTA--AGT-CGCT-AACC-ACTGGACCACTtgct
gi|90623 : TTT-GTTAAA-GTTTCA-TCCGAAAGTACT------------------TT-TT-T--A-ATTGG--AGG----A---GC--GTG---G--T----A---T-CAA--ACCTGCGACCC-C-T-GGGTTCGCAG---T-CTA--ATG-CCTT-AACC-AC
gi|90622 : ttTTT-GTTTAA-GTCTCA-TCCGAAAG-ACTT---GTCACT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AGG----A---GC--A-G---G--G-G--A---T-CGA--ACCTGTGACCC-C-T-GGGTTCGTAG---T-TCA--A
gi|90626 : ttTTT-GTTAAAGATCCT--TCCGTAAG-ACTG---ATAAGT----A---TT-TG-G--A-GTAGG--AGG----A---GC--T-G---G--G-G--A---T-CAG--GACTGCAACCC-C-T-TGGTTCGCAT---T-CCA--AGG-C
gi|90624 : tTTT-GTTAAA-GCTTCA-TGTAAAAT-ACTG---ATGGGT----A---TT-TT-C----GTATC--AGG----A---GC--G-GC--G--G-G--A-----CGA--ACCTGCGAACT-C-T-GGGTTCGCAG---T-CCA--AGG-CCTT-ACCT-ACTGGGCCACTGCTCCc
gi|90621 : ttTT-GTTGAA-GTCTTA-TCCGAAAT-ACTG---ATAAGT----G---TA-GT-T--A-GTTGG--AAG----A---GC--A-G---C--A-G--A---T-CGA--ACCTACGACCA-C-T-GGGTTCGCAG---T-CCA--AGG-ATGT-AACT-ACTGGACCATTAATCCGCTg
gi|90614 : ttgTT-GTTTAA-GTCCCA-TC---------TG---ATAAGT----T---TT-TT-T--A-GTTAG--AGG----T---GT----G---G--C----A---T-CGG--ACCTGCTACCC-C-T-TGGTTCACAG---A-CGA--AGG-CCTT-AACC-ACTGGACCACTAAT
gi|90615 : attaTT-GTTTAA-GTCCCA-TC---------TG---ATAAGT----G---TT-TT-T--A-GTTAG--AGG----T---GT----G---G--C----A---T-CGG--ACCTGCTACCG-C-T-TGGTTCACAG---A-CGA--AGG-CCTT-AACC-ACTGGACCACTAATttaatccactc
gi|90631 : attaTT-TTTAAA-GTTTCA-TCTGAAAA-ACTG---AAAAGTG---A---TT-T-----A-GTTTG--AGG----A---GT--G-G---G--A-G--A---T-TGA--AACTGCAACCC-C-T-TGGTTTGCAG---C-CCA--AGG-ATAT-CTCC-ATTAGGCCACTttaatccactc
gi|90632 : T-GTTAAA-GTCTCA-TCCGAAAG-ACTA---ATTAGT----A---TT-TT----A-GTTGG--AGG----A---GC--G-G---G--G-G--A---T-CAA--ACCTGCCACCC-C-T-GAGTTTGCAG---T-CCA--AGG-CATT-AACC-GCTGGACCTGTAATCCGCT
gi|90611 : T-GTTAAA-GTCCCA-TCCAAAAG-ACT--------------A---TT-TT-CTGA-GTTTG--AGG----A---GC--G-G---A--A-G--A---T-CGA--ACATGCGGCTA-C-A-GGGTTCGCAA---T-TCA--AGA-CATT-AACC-ACTGAACCACTAATCCAC
gi|90625 : attac-GTTAAA-GTCCCA-TTCTAAAG-ACTA---ATAAGT----A---TT-TT-T----GAAGG--AGG----A---A---A-G---G--TGG--A---T-CGA--ACCTGCGATCC-C-T-GAGCTCG----------A--A--------ACCC-ATTGGACCACTAATCCACTt
gi|90633 : ttctgTTAAA-TTTACA-TCCAAACA-ACTG----TAAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGGCCAGT--------TC--T-G---G--G-A--A---T-CGA--ACCCGCGACCC-C-
gi|90636 : TTAAA-GTCCCA-TATGAACG-A-TA---GTGAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGGCCAGT----C---CC--G-G---G--A-G------T-CAA--ACCCGCAACCC-C-
gi|90639 : TTAAA-GTCCCA-TATGAACG-ATTG---TTA-GT----A---TT-TT-T--A-GTTTGCCAGC----C---CC--G-G---G----A--A---T-CAA--ACCAGCAACCC-C-T-aagactagaagtc
gi|90638 : TTAAA-GTCCCA-TATGAACG-A-TA---GTTAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGGCCAGC----C---CC--G-G---G--A-G------T-CAA--ACCCGCAACCC-C-ag
gi|90635 : TTAAA-GTCCCA-TCCGAATG-ACTG----TTAGT----A---CT-TT-T--A-GTTAGCCAGC----T---CC--G-G---G----A--A---T-CGA--ACCCGCAAC
gi|90637 : TTAAA-GTCCCA-TCTGAATG-AATG---TTA-GT----A---CT-TT-T--A-GTCAGCCAGC----T---CC--G-G---G----A--A---T-CGA--ACCCGCAACCC-C-
gi|90640 : TTGAA-GTCCCA-TCCGAACG-ACTG----TAAGC----A----T-TT-T--A-GCTGGCCAGC----C---CC--G-G---G----A--A---T-AGA--ACCTGCAAACC-
gi|90634 : TTAAA-GTTTCG-TCGGAAAG-ACTG---TTAGTT----A----T-TT-T--A-GT--G--A-G----A---GC--G-G---G----G--G---T-CAA--AATTAC----------AAGTCCGCA-------------G-CATT-AACC-ACTGGA
gi|90641 : TTAAA-GGCTTA-TCCTAACG-ACT----ATTAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGGC-CAG----C---CC--C-G---G--A-A--A---T-TGA--ACCCGCAATCC-
gi|90642 : AAA-GTCTCA-CCCAAAAG-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT-T--A-GTTAG--AGG----A---GC--T-G---T--A-G--G---T-CGA--ACCTGCGACCG-C-T-TGGTTTGC------------------TT-AATC-ACAGGTCTATTAATCCGCT
gi|90643 : AAG-GTCTCG-TCCAAAAG-ACTGTATATAAGT--------------T--A-G--GG--AGA----A---GC--A-G---T--G-G--A---T-CCA--ACTCATGACCC-C-T-GGATCAAGAT---T-CCAGCATG-CT----ACC-CCTGGACAAC
gi|90644 : A-ATCTCA-TCTGAAAG-ACTG---ATAAGT----A---TT-TA----A-GTTGT--AGG----A---GC--G-G---G--G-G--A---T-CGA--ACCTGCGATCC-C-T-TGGTTCGTAG---T-CCA--AAG-CTGT-AACC-ACTGGGCCACTAATCCGCTcttatctgctc
gi|90646 : TCTCA-TCCAAAAG-ACTG----TGAGTGATTA---TT-TT-A--A-GTTGT--AAG----A---GC--G-G---G--G-G--A---T-CAA--ATATGTGATCT-C-T-GGGTTCGCAG---T-CCA--AGG-CCTT-AACC-ACTGGACCACTTATCC
gi|90613 : TCTCA-TCTGAAAG-G-------TAAGT----ACTTTT-TT-T--A-GTTGG--AGG----A---AC----G---G--C-T--A---T-TGA--ACCTGCGACCC-T-T-GAGTTTTCAG---T-CCA--AGG-CCTT-ACAC-ACTGGACCTCTAATCCACT
gi|90647 : atttttgTA-TCCAAAAG-ACTG---ATAGG-----A-----------------GG--A-G----A---GC--A-G---G--T-G--A---T-CGA--ACCTGCGACCC-C-T-GAGTTCACAG---T-GCA--ACG-CCTT-AACC-ACTGGACCAC
gi|90645 : tA-TCCGAAAT-ACAG---ATAAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGA--AGG----A---GT--G-A---A--G-G--A---T-CGA--ACCTACGATCC-C-TGGGGTTCGCAG---T-CCA--AGG-CCAA-GACC-ACTGGACCACTTATCCGCT
gi|90648 : gtatcCGAAAG-ACTG---ATAAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AGG----A---GT--G-G---GGGT-G--GGG-T-CAA--ACCTGCGATCC-C-T-GGGTTCGCAG---T-CCA--AGA-CCTT-AACC-ACTGAA
gi|90649 : TAAGT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--AGG----A---TT--G-G---G--G-G--A---T-CGA--ACCTGGGACCC-A-T-GTGTTCGTAG---T-CCG--AGG-CCTT-GACC-ACTTTTCCACT
gi|90650 : TAAGT----A---TA-TT-G--A-GTTGG--AGG----A---GC--G-G---G------------------------GATCC-C-T-GGGTCCGCAA---T-CCA--AGC-CCTT-AAt
gi|90651 : AAGT----G---TT-TT-T--A-GTTGG--AGA----A---GT--G-G---G--G-G--A---T-CGA--ACCTGGGACCC-C-T-GGGTTCATAG---T-CCA--AGG-C----------CTGGACCACTGATCCAC
gi|90652 : AAGT----A---CT-TT-T--A-GTTTG--AGG----A---GT--G-G---G--G-G--A---T-CGA--ACCTGAGACCC-C-T-GGGTTCGTAG---T-CCA--AGG-C----------CTGGACCACTGATCCAtt
gi|90653 : GT----A---TT-TT-T--A-GTTGG--ATG----A---GT--T-G---T--G-G--A---T-CGA--ACCTGCGACCC-A-T-GGCTTCGTAG---T-ACA--AGT-CCTT-AACC-ACTGGCCCACTAATCCACTttt
gi|90654 : ---TT-TT-T--A-G------AGGTCA-A---GC----G---C--T-GG-A---T-CGA--ACCTGCGACCT-C-T-G
gi|90655 : T-TT-T--A-GTTGA--AGG----A---TC--G-A---G--A-G--A---T-CGA--ATCTGCGA-CC-T-T-GGGTTAACAG---T-CCA--gcgttagcggccaacaacctatccact
gi|90656 : G--AAA----A---GC--A-G---C--T-G--A---C-CGA--ACCT----------T-GAGTTCACAG---T-CCA--AGG-CCTT-AACC-ACTGGACCATTAATCCACT
gi|90659 : TGAGACCC-C-T-GTGTTCGAAG---T-CCA--AGG-CCTT-AACC-ACTGGGACACT
gi|90658 : TGAGACTC-C-T-GGGTTCGAAG---T-CCA--ATG-CCTT-AACC-ACTGAAACACTTATCTGCTtttctgctc
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|90657 ): GAGCGGGGGAATCGAACTCACGCCCTCTGGATTGACAGTCAGAGGCGCTAACGACTGAGCCA
Alignments
lowQualScore : 0 1111111 0 111 0 1111 111 0 0 11 0 0 5555555 000 000 00 111 2222 1 11 00 0 0 0 000 0 111 111 0 0 0
lowQualScore : . ....... . ... . .... ... . . .. . . ....... ... ... .. ... .... . .. .. . . . ... . ... ... . . .
lowQualScore : 7 9999999 6 000 5 6666 999 5 5 22 5 5 0000000 999 999 77 444 1111 0 22 77 5 5 5 999 5 666 000 6 6 6
consensus : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
Reference ( family-360 ) : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90577 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTGACCCGAAAG-ACTG---ATTAG-T----A---TT-TT-T--ATG-TTGG-------AAG---A---G--CGG---GGG----A-G--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAATG---C---GTT-AACC-ACTGGTCCA-CTAATCCGCTC
gi|90578 : ATATTT-GTTAA-------AATCCTATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CAG---GTG----A-T--C--AAACCTGCGACCC-CT-GA-GTTCACAG---T-CTAAGG---C---TTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCACCC
gi|90579 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCCCATTCGAAAG-ACGG---ATTAG-T----A---TT-TT-T--A-A-TTGG-------AAG---A---G--CGA---CAG----A-T--C--GAGCCTGCGACTC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---GTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCCTCTC
gi|90580 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-TCTG---ATGAG-T----A---TT-TT----A-G-TTCG-------AGG---A---G--CGG---GTG----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTCGCAA---TCCCGCGG---C---TTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATTCGCTC
gi|90581 : ATTTTT-GTTAA-------AGTTTTATCCGAAAG-ACTG---ATTAT-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AAG---A---G--CGG---GTG----A-T--C--GAACCTGCGACTT-CT-TT-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---GTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90582 : ATTTTT-GTTTA-------AGTCTTATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-GA-G--A-G-TGGG-------CGG---A---G--CTG---GGA----A-T--C--GAACCTGCGACCC-AT-GG-GTTCGCAG---C-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCCGC
gi|90583 : ATCTTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAG-ACTG---TTGAG-T----A---TT-TT----A-G-TTGG-------AGG---A---G--AGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCA-CT-GA-GCTCACAG---T-CTAAGG---C---CTTAAACC-ACTGGACCA-CTTATCCACT
gi|90584 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAG-ACTG---ATACG-T----A---AT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGT---AGG----G-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTCGAACA-CTAGTCAACTC
gi|90585 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCAACCGAAAG-AATG---ATAAG-T----A---TT-CT-T--G-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGGT---A-T--C--GAACCTGGGATCCGCT-GG--TTTGCAG---T-TCAAGG---C---CTT-AATC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90586 : ATTTTT-GTTAA-------AATCTCACCCGAAAG-ACTG---ATACA-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GTG----C-T--C--GAACCTGCAACCC-CT-GG-GTTCGCCG---T-CCAAGG---G---TTT-AATC-ACTGGATCA-CTAATGCGCTC
gi|90587 : ATTTTT-GTTAA-------AATCTCATCTGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TTCTT-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--TGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTTA-AG---T-CCAGGG---C---CTT-AACC-ACCAGACTA-CTAATCCACTC
gi|90588 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCACCCAAACG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T----G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGA----A-T--C--GAGCCTGCGACGC-CC-GG-GTTCGCAA---C-CGAAGG---C---CTT-AACC-ATTGGACCA-CTAATTCACTC
gi|90589 : ATTTTT---TAA--------GTCTCATCCAACAG-ATTG---TTCAG-A----A---CT-TT-T--A-G-TTTG-------AGA---A---A--CGG---GGG----A-T--C--TAACCTGCAATCT-CT-TG-GTTCGCAG---T-CCAATG---C---CTC-AATC-ACTAGACCA-CTTATACGTTC
gi|90590 : ATTTTT-GTTTA-------AGTCTCATCCGAAAT-ACTG---ATAAA-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGA----C-T--C--GGACCTGCGATCC-CG-TG-GTTCGCAG---T-CTAAGG---C---CTT-AACC-ATTGGACCA-CTAGTTCACT
gi|90591 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATTCAAAAA-ATTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AAG---A---G--CGG---GAG----A-T--C--GAGCCTGCGACCC-AT-TG-GTCTGCAG---T-CCAAGG---T---ATT-AACC-ACTGGACCA-CTAATACG
gi|90592 : ATTTTT-GCTAA-------AGTCCCATCTGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-CTTG-------AGG---A---G--GGG---AGG----A-T--C--GAACCTGCAACCC-CT-GG-TTTGGCAG---T-CCAAGG---T---C-T-AATCGACTGGACCA-CTAATCCACTC
gi|90593 : ATTTTT-GTTAA-------ACTCCCATCCGGAAG-CCTG---CTAAG-T----A---TT-TT-T--A-A-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GG-------T--C--GAACCTGCGACCC-CT-TG-GTTCGCAT---T-CCAAGG---C---CGT-AACC-ACTAGACCA-CT
gi|90594 : ATTTTT-GGGAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAT-T----T---TT-TA-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--CGA---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACTC-TT-GG-ATTCGCAG---T-TCAAGG---C---TTT-AACA-TCTGGACCA-CTAATCCTCTCgtgtcc
gi|90595 : ATTTTT-GATAA-------AGTCTTATCCGAAAG-ACAG---ATTAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------TGA---A---G--CGG---GGT----A-T--C--GAACCTGCGACCC-AT-GG--------G---T-CCAAGG---C---GTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCCAC
gi|90596 : ATATTT-GTTAA-------TGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATGAA-T----A---TT-TT----A-G-TTGGTGGTGAGAGG---G---G--GTG---GGG----G-T--A--AAATCTGTGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CAT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90597 : ATTTTT--TTAT--------GTCTTATTCGAAAG-ACT------AAG-T----AC--TT-TT-T--A-G-TTGG-------ATG---A---G--CAG---GGG----G-TGTC--GAACCTGCGATCC-CT-TG-TTTCGCAG---T-CCAAGG---T---TTG-AACT-ACTCGACCA-CTTATCCCCT
gi|90598 : ATTTTT-GTTA---------GTCTCATCCAAAAG-ACTG---ATAAG-T----AT--TT-TT-T--A-G-TT-G-------AGG---G---G--CAG---GGA----T-T--C--GAACCTTCAGCTC-CT-AG-GTTTGCAG---T-CCAAGA---C---CTT-AACC-ATTGGACCA-CTAATCTGCTC
gi|90599 : ATTTTT-GTT------------CCCATCCGAAAA-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT----A-G-TTGT-------AGG---A---G--CGG---AAA----A-T--C--GAACCTGCAGTCC-CT-AG-GTTTGCAG---T-CCAAGA---C---CTT-GACC-ACTGGACCA-CTTATCC
gi|90600 : ATTTTT-GTTAA-------AGTTTTATCCAAAAG-ACTG---GTA-------------T-TT-T--A-G-TTCG-------AGT---A---G--CGG---TGG----T-T--C--GAACTTGCGACCC-CT-GT-GTTCGTAG---T-CCAAGG---T---CTT-GTCC-ACTGGAACA-CTTATCCGCTC
gi|90601 : ATTTTTAGTTAA-------ATTCTCATCCGAAAG-ACTG---TTAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--G--GAACCTGT------------GTTCGCAG---T-TCAAGG---C---CTT-AACC-GCTGGACGA-CAAATCCGCTC
gi|90602 : ATTTTT-GTTAG-------AGTCTCATCCGAAAG-TCTT---ATAAG-T----T---TT-TT-T----G-TTGG-------AGG---A---G--CGA---GGG----A-T--C--GAATCTGCGGCAC-CT-GG-ATTCGCAG---T--AAAGGT--T---TTT-AACC-ACTCGATCA-CTTACCCGC
gi|90603 : ATTTTT-ATTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTT---ATAAT-T----A---TT-TT----A-G-TAGG-------AGA---A---G--CGA---CGG----A-C--C--GAACATGCGACCC-CT-GG-CTTCACAG---T-CTGAGG---C---CTT-AACC-ACTGCACCA-C
gi|90604 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTACTCCCAAAG-ACTG---ATGAG-T----A---TT-CT-T--A-G-TTGG-------TGG---A---A--CTG---GGTT---A-TA-CAAGAACCTGCTACCC-CT-AG-GTTTGCAG---T-TTAAGG---C---CTA-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90605 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---AAAAAAT----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---G---G--CGG---GGA----AAT--A--GAACCTGCGG----------------AG---T-CCAAGG---C---TTT-AACC-ACTGGACCG-CTAATCCGCTC
gi|90606 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATACG-T----A---CT-TT-T--A-G-ATGT-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACTC-CT-GG-GTTCGAAG---T-C
gi|90607 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-ATGT-------ATG---A---G--CGG---GGA----A-T--C--GAACCTGCGACTC-CT-GG-ATTCGAAG---T-C
gi|90608 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATACG-T----A---TT-TT-T--A-G-ATGT-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCGACTC-CT-GG-GTTTAAAG---T-C
gi|90609 : ATATTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAG-ACTT---ATAAG-T----A---TT-----------TTAG-------AGG---A---G--CAT---GTG----A-T--C--TAACCTGCGACCC----AA-GTTCACAG---T-GCAACG---C---CTT-CACC-AATGGACCA-CTTAT
gi|90610 : ATTTTT-GTGAA-------AGTCTTATGCGATAG-ACTT---ATACG-T----A---TT-TT-A--G-A-TTGG-------AGG---A---A--CAG---TGG----A-T--T--GAATCTGCGTTCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---TTT-AAC------GACTA-CTA
gi|90611 : ATTACT-GTTAA-------AGTCCCATCCAAAAG-ACT---------------A---TT-TT-CTGA-G-TTTG-------AGG---A---G--CGG---AAG----A-T--C--GAACATGCGGCTA-CA-GG-GTTCGCAA---T-TCAAGA---C---ATT-AACC-ACTGAACCA-CTAATCCACTc
gi|90612 : ATATTT-GTTAA-------AGTCTCGACCAAAAG-ACTG---ATAAT-T----A---TT-TT-T--A-G-ATGT-------AGG---A---G--CAG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACTC-CT-GG-GTTCAAAG---T-C
gi|90613 : ATTTTT-GT-------------CTCATCTGAAAG-G-------TAAG-T----ACTTTT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---A--CGG---CT-----A-T--T--GAACCTGCGACCC-TT-GA-GTTTTCAG---T-CCAAGG---C---CTT-ACAC-ACTGGACCT-CTAATCCACTC
gi|90614 : ATTATT-GTTTA-------AGTCCCATC---------TG---ATAAG-T----T---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG----------TGT---GGC----A-T--C--GGACCTGCTACCC-CT-TG-GTTCACAG---A-CGAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAAT
gi|90615 : ATTATT-GTTTA-------AGTCCCATC---------TG---ATAAG-T----G---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG----------TGT---GGC----A-T--C--GGACCTGCTACCG-CT-TG-GTTCACAG---A-CGAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATttaatccactc
gi|90616 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCACACCCGAAAT-AATG---ATAAA-T----A---TT-AT----A-G-TTGG-------AGA---A---G--CGG---GGA------------------------C-CT-GG-GTTCGCAG---T-CAGAGG---C---TTT-AACC-ACT--------TA-TCCGCTttaatccactc
gi|90617 : ATTTTT-GTTGA-------CGTCTCATCTGAAAT-ACTG---ATGAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTCG-------AGG---A---C--CGG---GGA----A-A--C--GAA------------------------------CCAATG---C---GTT-AAAC-ACTGGCCCA-CTAATCCGCTC
gi|90618 : ATTTTT-GTTAA-------AAGCTTATCCGAAAG-ACTT---ATCAG-T----A---TT-TA-G--A-G-CTGG-------AGG---A---G--CGG---
gi|90619 : TTTTT-GTTAA--------GTCTCATCTGAAAT-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TAAG-------AGG---A---G--TGA---GGG----A-T--C--AAACCTATGACCC-CT-GG-GTTAGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTTGACCA-CTAATCTACTC
gi|90620 : TTTTT-ATTAA-------ATTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAA-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--TGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCATTCC-CT-GG-GTTTGCAT---A-TTAAGG---C---CTT-AACC-ACTGAACCA-CTAATACGCTC
gi|90621 : TTGTT-GTTGA-------AGTCTTATCCGAAAT-ACTG---ATAAG-T----G---TA-GT-T--A-G-TTGG-------AAG---A---G--CAG---CAG----A-T--C--GAACCTACGACCA-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---A---TGT-AACT-ACTGGACCA-TTAATCCGCTC
gi|90622 : TTTTT-GTTTA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTT---GTCAC-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CAG---GGG----A-T--C--GAACCTGTGACCC-CT-GG-GTTCGTAG---T-TCAA
gi|90623 : TTTTT-GTTAA-------AGTTTCATCCGAAAGTACT-------------------TT-TT-T--A-A-TTGG-------AGG---A---G--CGT---GGT----A-T--C--AAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CTAATG---C---CTT-AACC-AC
gi|90624 : TTTTT-GTTAA-------AGCTTCATGTAAAAT-ACTG---ATGGG-T----A---TT-TT-C----G-TATC-------AGG---A---G--CGGC--GGG----A----C--GAACCTGCGAACT-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-ACCT-ACTGGGCCA-CTGCTCCG
gi|90625 : TTCTG-GTTAA-------AGTCCCATTCTAAAG-ACTA---ATAAG-T----A---TT-TT-T----G-AAGG-------AGG---A---A--AGG---TGG----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-GA-GCTCG----------AA-------------ACCC-ATTGGACCA-CTAATCCACTC
gi|90626 : TTTT-GTTAA-------AGATCCTTCCGTAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TG-G--A-G-TAGG-------AGG---A---G--CTG---GGG----A-T--C--AGGACTGCAACCC-CT-TG-GTTCGCAT---T-CCAAGG---C---
gi|90627 : TTTT-GATAA-------AATTTTATTCAAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-A--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---ACA----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CA-GG-GTTTGCAG---T-CCAAGG---T---CTT-AACC-ACTGAATCA-C
gi|90628 : TTTT-GTTAA-------TGTCTCATCTGAAAG--------------T----A---TT-TTTT--A-G-TTGG-------AGG---A---T--CAG---GGA----A-T--C--GAACCTGCAACCC-CT-GG-GTTCACAG---T-TCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-TTAATCTGCT
gi|90629 : TTTT-GTTAATTTATTAAGTCTCATCTAAAAA-ACTT---GTTAG-T----A---TT-TT-TT-G-G-TTGA-------AGG---A---G--CGG---GG-----A-T--C--AAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTAGCAG---T-CCAAGA---C---TTT-AACC-ACTGGACCA-TTAATCCACTC
gi|90630 : TTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAT-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG---AATGG--CGGGGCGGG----G-T--C--GAACCTGCGACGC-CT-TG-GTTCGCGGCAAC-CTAAGT---C---GCT-AACC-ACTGGACCA-CT
gi|90631 : TT-TTTAA-------AGTTTCATCTGAAAA-ACTG---AAAAG-TG---A---TT-T-----A-G-TTTG-------AGG---A---G--TGG---GAG----A-T--T--GAAACTGCAACCC-CT-TG-GTTTGCAG---C-CCAAGGATAT---CT----CC-ATTAGGCCA-CT
gi|90632 : T-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTA---ATTAG-T----A---TT-TT----A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCCACCC-CT-GA-GTTTGCAG---T-CCAAGG---C---ATT-AACC-GCTGGACCT-GTAATCCGCTC
gi|90633 : TTAA-------ATTTACATCCAAACA-ACTG----TAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------CC----A---GTTCTG---GGA----A-T--C--GAACCCGCGACCC-C
gi|90634 : TTAA-------AGTTTCGTCGGAAAG-ACTG---TTAGT-T----A----T-TT-T--A-G-T--G-------A-G---A---G--CGG---GGG------T--C--AAAATTACAA----------GTCCGCAG------CA-----------TT-AACC-ACTGGA
gi|90635 : TTAA-------AGTCCCATCCGAATG-ACTG----TTAG-T----A---CT-TT-T--A-G-TTAGC------CAG---C---T--CCG---GGA----A-T--C--GAACCCGCAAC
gi|90636 : TTAA-------AGTCCCATATGAACG-A-TA---GTGAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGGCC-----AGT---C---C--CGG---GAG------T--C--AAACCCGCAACCC-CA-AG-ACTAGAAG---T-C
gi|90637 : TTAA-------AGTCCCATCTGAATG-AATG----TTAG-T----A---CT-TT-T--A-G-TCAGC------CAG---C---T--CCG---GGA----A-T--C--GAACCCGCAACCC-C
gi|90638 : TTAA-------AGTCCCATATGAACG-A-TA---GTTAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGGCC-----AGC---C---C--CGG---GAG------T--C--AAACCCGCAACCC-C
gi|90639 : TTAA-------AGTCCCATATGAACG-ATTG----TTAG-T----A---TT-TT-T--A-GTTTGC-------CAG---C---C--CCG---GGA----A-T--C--AAACCAGCAACCC-CT-AG-
gi|90640 : TTGA-------AGTCCCATCCGAACG-ACTG----TAAG-C----A----T-TT-T--A-G-CTGGC------CAG---C---C--CCG---GGA----A-T--A--GAACCTGCAAACC-
gi|90641 : TTAA-------AGGCTTATCCTAACG-ACT----ATTAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGGC------CAG---C---C--CCG---GAA----A-T--T--GAACCCGCAATCC-
gi|90642 : AA-------AGTCTCACCCAAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG---A---G--CTG---TAG----G-T--C--GAACCTGCGACCG-CT-TG-GTTTG---------------------CTT-AATC-ACAGGTCTA-TTAATCCGCTC
gi|90643 : AA-------GGTCTCGTCCAAAAG-ACTGTATATAAG-T--------------T--A-G---GG-------AGA---A---G--CAG---TGG----A-T--C--CAACTCATGACCC-CT-GG-ATCAAGAT---T-CCA--G---CATGCT---ACC-CCTGGACAACCTTATCTGCTC
gi|90644 : -------AATCTCATCTGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TA----A-G-TTGT-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-TG-GTTCGTAG---T-CCAAAG---C---TGT-AACC-ACTGGGCCA-CTAATCCGCTC
gi|90645 : GTATCATCCGAAAT-ACAG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGA-------AGG---A---G--TGA---AGG----A-T--C--GAACCTACGATCC-CTGGG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CAA-GACC-ACTGGACCA-CTTATCCGCTC
gi|90646 : TCTCATCCAAAAG-ACTG----TGAG-TGATTA---TT-TT-A--A-G-TTGT-------AAG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--AAATATGTGATCT-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCC
gi|90647 : TTATCCAAAAG-ACTG---ATAGG------A------------------GG-------A-G---A---G--CAG---GTG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GA-GTTCACAG---T-GCAACG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-C
gi|90648 : CGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--TGG---GGGTGGGG-T--C--AAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGA---C---CTT-AACC-ACTGAA
gi|90649 : TAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---T--TGG---GGG----A-T--C--GAACCTGGGACCC-AT-GT-GTTCGTAG---T-CCGAGG---C---CTT-GACC-ACTTTTCCA-CT
gi|90650 : TAAG-T----A---TA-TT-G--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GG----------------------ATCC-CT-GG-GTCCGCAA---T-CCAAGC---C---CTT-AAt
gi|90651 : AAG-T----G---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGA---A---G--TGG---GGG----A-T--C--GAACCTGGGACCC-CT-GG-GTTCATAG---T-CCAAGG---C---CTG-GACC-ACTGATCCA-CT
gi|90652 : AAG-T----A---CT-TT-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--TGG---GGG----A-T--C--GAACCTGAGACCC-CT-GG-GTTCGTAG---T-CCAAGG---C---CTG-GACC-ACTGATCCA-TTt
gi|90653 : G-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------ATG---A---G--TTG---TGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-AT-GG-CTTCGTAG---T-ACAAGT---C---CTT-AACC-ACTGGCCCA-CTAATCCACTCt
gi|90654 : ---TT-TT-T--A-G------------AGGTCAA---G--CGC---TGG----A-T--C--GAACCTGCGACCT-CT-GGCGTTAGCGG-----CCAACA---A---CCT-ATCC-ACT
gi|90655 : T-TT-T--A-G-TTGA-------AGG---A---T--CGA---GAG----A-T--C--GAATCTGCGA-CC-TT-GG-GTTAACAG---T-CCA
gi|90656 : G-------AAA---A---G--CAG---CTG----A-C--C--GAACCT---------T-GA-GTTCACAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-TTAATCCACTC
gi|90657 : G---A---G--CGG---GGG----AAT--C--GAACTCACGCCCT-CT-GG-ATTGACAG---T-CAGAGG---C---GCT-AACG-ACTGAGCCA-
gi|90658 : TGAGACTC-CT-GG-GTTCGAAG---T-CCAATG---C---CTT-AACC-ACTGAAACA-CTTATCTGCTC
gi|90659 : TGAGACCC-CT-GT-GTTCGAAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGGACA-CTTTTCTGCTC
Alignments
lowQualScore : 0 1111111 0 111 0 1111 111 0 0 11 0 0 5555555 000 000 00 111 2222 1 11 00 0 0 0 000 0 111 111 0 0 0
lowQualScore : . ....... . ... . .... ... . . .. . . ....... ... ... .. ... .... . .. .. . . . ... . ... ... . . .
lowQualScore : 7 9999999 6 000 5 6666 999 5 5 22 5 5 0000000 999 999 77 444 1111 0 22 77 5 5 5 999 5 666 000 6 6 6
consensus : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
Reference ( family-360 ) : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90577 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTGACCCGAAAG-ACTG---ATTAG-T----A---TT-TT-T--ATG-TTGG-------AAG---A---G--CGG---GGG----A-G--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAATG---C---GTT-AACC-ACTGGTCCA-CTAATCCGCTC
gi|90578 : ATATTT-GTTAA-------AATCCTATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CAG---GTG----A-T--C--AAACCTGCGACCC-CT-GA-GTTCACAG---T-CTAAGG---C---TTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCACCC
gi|90579 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCCCATTCGAAAG-ACGG---ATTAG-T----A---TT-TT-T--A-A-TTGG-------AAG---A---G--CGA---CAG----A-T--C--GAGCCTGCGACTC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---GTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCCTCTC
gi|90580 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-TCTG---ATGAG-T----A---TT-TT----A-G-TTCG-------AGG---A---G--CGG---GTG----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTCGCAA---TCCCGCGG---C---TTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATTCGCTC
gi|90581 : ATTTTT-GTTAA-------AGTTTTATCCGAAAG-ACTG---ATTAT-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AAG---A---G--CGG---GTG----A-T--C--GAACCTGCGACTT-CT-TT-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---GTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90582 : ATTTTT-GTTTA-------AGTCTTATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-GA-G--A-G-TGGG-------CGG---A---G--CTG---GGA----A-T--C--GAACCTGCGACCC-AT-GG-GTTCGCAG---C-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCCGC
gi|90583 : ATCTTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAG-ACTG---TTGAG-T----A---TT-TT----A-G-TTGG-------AGG---A---G--AGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCA-CT-GA-GCTCACAG---T-CTAAGG---C---CTTAAACC-ACTGGACCA-CTTATCCACT
gi|90584 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAG-ACTG---ATACG-T----A---AT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGT---AGG----G-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTCGAACA-CTAGTCAACTC
gi|90585 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCAACCGAAAG-AATG---ATAAG-T----A---TT-CT-T--G-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGGT---A-T--C--GAACCTGGGATCCGCT-GG--TTTGCAG---T-TCAAGG---C---CTT-AATC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90586 : ATTTTT-GTTAA-------AATCTCACCCGAAAG-ACTG---ATACA-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GTG----C-T--C--GAACCTGCAACCC-CT-GG-GTTCGCCG---T-CCAAGG---G---TTT-AATC-ACTGGATCA-CTAATGCGCTC
gi|90587 : ATTTTT-GTTAA-------AATCTCATCTGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TTCTT-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--TGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTTA-AG---T-CCAGGG---C---CTT-AACC-ACCAGACTA-CTAATCCACTC
gi|90588 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCACCCAAACG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T----G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGA----A-T--C--GAGCCTGCGACGC-CC-GG-GTTCGCAA---C-CGAAGG---C---CTT-AACC-ATTGGACCA-CTAATTCACTC
gi|90589 : ATTTTT---TAA--------GTCTCATCCAACAG-ATTG---TTCAG-A----A---CT-TT-T--A-G-TTTG-------AGA---A---A--CGG---GGG----A-T--C--TAACCTGCAATCT-CT-TG-GTTCGCAG---T-CCAATG---C---CTC-AATC-ACTAGACCA-CTTATACGTTC
gi|90590 : ATTTTT-GTTTA-------AGTCTCATCCGAAAT-ACTG---ATAAA-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGA----C-T--C--GGACCTGCGATCC-CG-TG-GTTCGCAG---T-CTAAGG---C---CTT-AACC-ATTGGACCA-CTAGTTCACT
gi|90591 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATTCAAAAA-ATTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AAG---A---G--CGG---GAG----A-T--C--GAGCCTGCGACCC-AT-TG-GTCTGCAG---T-CCAAGG---T---ATT-AACC-ACTGGACCA-CTAATACG
gi|90592 : ATTTTT-GCTAA-------AGTCCCATCTGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-CTTG-------AGG---A---G--GGG---AGG----A-T--C--GAACCTGCAACCC-CT-GG-TTTGGCAG---T-CCAAGG---T---C-T-AATCGACTGGACCA-CTAATCCACTC
gi|90593 : ATTTTT-GTTAA-------ACTCCCATCCGGAAG-CCTG---CTAAG-T----A---TT-TT-T--A-A-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GG-------T--C--GAACCTGCGACCC-CT-TG-GTTCGCAT---T-CCAAGG---C---CGT-AACC-ACTAGACCA-CT
gi|90594 : ATTTTT-GGGAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAT-T----T---TT-TA-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--CGA---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACTC-TT-GG-ATTCGCAG---T-TCAAGG---C---TTT-AACA-TCTGGACCA-CTAATCCTCTCgtgtcc
gi|90595 : ATTTTT-GATAA-------AGTCTTATCCGAAAG-ACAG---ATTAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------TGA---A---G--CGG---GGT----A-T--C--GAACCTGCGACCC-AT-GG--------G---T-CCAAGG---C---GTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCCAC
gi|90596 : ATATTT-GTTAA-------TGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATGAA-T----A---TT-TT----A-G-TTGGTGGTGAGAGG---G---G--GTG---GGG----G-T--A--AAATCTGTGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CAT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90597 : ATTTTT--TTAT--------GTCTTATTCGAAAG-ACT------AAG-T----AC--TT-TT-T--A-G-TTGG-------ATG---A---G--CAG---GGG----G-TGTC--GAACCTGCGATCC-CT-TG-TTTCGCAG---T-CCAAGG---T---TTG-AACT-ACTCGACCA-CTTATCCCCT
gi|90598 : ATTTTT-GTTA---------GTCTCATCCAAAAG-ACTG---ATAAG-T----AT--TT-TT-T--A-G-TT-G-------AGG---G---G--CAG---GGA----T-T--C--GAACCTTCAGCTC-CT-AG-GTTTGCAG---T-CCAAGA---C---CTT-AACC-ATTGGACCA-CTAATCTGCTC
gi|90599 : ATTTTT-GTT------------CCCATCCGAAAA-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT----A-G-TTGT-------AGG---A---G--CGG---AAA----A-T--C--GAACCTGCAGTCC-CT-AG-GTTTGCAG---T-CCAAGA---C---CTT-GACC-ACTGGACCA-CTTATCC
gi|90600 : ATTTTT-GTTAA-------AGTTTTATCCAAAAG-ACTG---GTA-------------T-TT-T--A-G-TTCG-------AGT---A---G--CGG---TGG----T-T--C--GAACTTGCGACCC-CT-GT-GTTCGTAG---T-CCAAGG---T---CTT-GTCC-ACTGGAACA-CTTATCCGCTC
gi|90601 : ATTTTTAGTTAA-------ATTCTCATCCGAAAG-ACTG---TTAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--G--GAACCTGT------------GTTCGCAG---T-TCAAGG---C---CTT-AACC-GCTGGACGA-CAAATCCGCTC
gi|90602 : ATTTTT-GTTAG-------AGTCTCATCCGAAAG-TCTT---ATAAG-T----T---TT-TT-T----G-TTGG-------AGG---A---G--CGA---GGG----A-T--C--GAATCTGCGGCAC-CT-GG-ATTCGCAG---T--AAAGGT--T---TTT-AACC-ACTCGATCA-CTTACCCGC
gi|90603 : ATTTTT-ATTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTT---ATAAT-T----A---TT-TT----A-G-TAGG-------AGA---A---G--CGA---CGG----A-C--C--GAACATGCGACCC-CT-GG-CTTCACAG---T-CTGAGG---C---CTT-AACC-ACTGCACCA-C
gi|90604 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTACTCCCAAAG-ACTG---ATGAG-T----A---TT-CT-T--A-G-TTGG-------TGG---A---A--CTG---GGTT---A-TA-CAAGAACCTGCTACCC-CT-AG-GTTTGCAG---T-TTAAGG---C---CTA-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90605 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---AAAAAAT----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---G---G--CGG---GGA----AAT--A--GAACCTGCGG----------------AG---T-CCAAGG---C---TTT-AACC-ACTGGACCG-CTAATCCGCTC
gi|90606 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATACG-T----A---CT-TT-T--A-G-ATGT-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACTC-CT-GG-GTTCGAAG---T-C
gi|90607 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-ATGT-------ATG---A---G--CGG---GGA----A-T--C--GAACCTGCGACTC-CT-GG-ATTCGAAG---T-C
gi|90608 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATACG-T----A---TT-TT-T--A-G-ATGT-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCGACTC-CT-GG-GTTTAAAG---T-C
gi|90609 : ATATTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAG-ACTT---ATAAG-T----A---TT-----------TTAG-------AGG---A---G--CAT---GTG----A-T--C--TAACCTGCGACCC----AA-GTTCACAG---T-GCAACG---C---CTT-CACC-AATGGACCA-CTTAT
gi|90610 : ATTTTT-GTGAA-------AGTCTTATGCGATAG-ACTT---ATACG-T----A---TT-TT-A--G-A-TTGG-------AGG---A---A--CAG---TGG----A-T--T--GAATCTGCGTTCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---TTT-AAC------GACTA-CTA
gi|90611 : ATTACT-GTTAA-------AGTCCCATCCAAAAG-ACT---------------A---TT-TT-CTGA-G-TTTG-------AGG---A---G--CGG---AAG----A-T--C--GAACATGCGGCTA-CA-GG-GTTCGCAA---T-TCAAGA---C---ATT-AACC-ACTGAACCA-CTAATCCACTc
gi|90612 : ATATTT-GTTAA-------AGTCTCGACCAAAAG-ACTG---ATAAT-T----A---TT-TT-T--A-G-ATGT-------AGG---A---G--CAG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACTC-CT-GG-GTTCAAAG---T-C
gi|90613 : ATTTTT-GT-------------CTCATCTGAAAG-G-------TAAG-T----ACTTTT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---A--CGG---CT-----A-T--T--GAACCTGCGACCC-TT-GA-GTTTTCAG---T-CCAAGG---C---CTT-ACAC-ACTGGACCT-CTAATCCACTC
gi|90614 : ATTATT-GTTTA-------AGTCCCATC---------TG---ATAAG-T----T---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG----------TGT---GGC----A-T--C--GGACCTGCTACCC-CT-TG-GTTCACAG---A-CGAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAAT
gi|90615 : ATTATT-GTTTA-------AGTCCCATC---------TG---ATAAG-T----G---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG----------TGT---GGC----A-T--C--GGACCTGCTACCG-CT-TG-GTTCACAG---A-CGAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATttaatccactc
gi|90616 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCACACCCGAAAT-AATG---ATAAA-T----A---TT-AT----A-G-TTGG-------AGA---A---G--CGG---GGA------------------------C-CT-GG-GTTCGCAG---T-CAGAGG---C---TTT-AACC-ACT--------TA-TCCGCTttaatccactc
gi|90617 : ATTTTT-GTTGA-------CGTCTCATCTGAAAT-ACTG---ATGAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTCG-------AGG---A---C--CGG---GGA----A-A--C--GAA------------------------------CCAATG---C---GTT-AAAC-ACTGGCCCA-CTAATCCGCTC
gi|90618 : ATTTTT-GTTAA-------AAGCTTATCCGAAAG-ACTT---ATCAG-T----A---TT-TA-G--A-G-CTGG-------AGG---A---G--CGG---
gi|90619 : TTTTT-GTTAA--------GTCTCATCTGAAAT-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TAAG-------AGG---A---G--TGA---GGG----A-T--C--AAACCTATGACCC-CT-GG-GTTAGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTTGACCA-CTAATCTACTC
gi|90620 : TTTTT-ATTAA-------ATTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAA-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--TGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCATTCC-CT-GG-GTTTGCAT---A-TTAAGG---C---CTT-AACC-ACTGAACCA-CTAATACGCTC
gi|90621 : TTGTT-GTTGA-------AGTCTTATCCGAAAT-ACTG---ATAAG-T----G---TA-GT-T--A-G-TTGG-------AAG---A---G--CAG---CAG----A-T--C--GAACCTACGACCA-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---A---TGT-AACT-ACTGGACCA-TTAATCCGCTC
gi|90622 : TTTTT-GTTTA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTT---GTCAC-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CAG---GGG----A-T--C--GAACCTGTGACCC-CT-GG-GTTCGTAG---T-TCAA
gi|90623 : TTTTT-GTTAA-------AGTTTCATCCGAAAGTACT-------------------TT-TT-T--A-A-TTGG-------AGG---A---G--CGT---GGT----A-T--C--AAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CTAATG---C---CTT-AACC-AC
gi|90624 : TTTTT-GTTAA-------AGCTTCATGTAAAAT-ACTG---ATGGG-T----A---TT-TT-C----G-TATC-------AGG---A---G--CGGC--GGG----A----C--GAACCTGCGAACT-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-ACCT-ACTGGGCCA-CTGCTCCG
gi|90625 : TTCTG-GTTAA-------AGTCCCATTCTAAAG-ACTA---ATAAG-T----A---TT-TT-T----G-AAGG-------AGG---A---A--AGG---TGG----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-GA-GCTCG----------AA-------------ACCC-ATTGGACCA-CTAATCCACTC
gi|90626 : TTTT-GTTAA-------AGATCCTTCCGTAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TG-G--A-G-TAGG-------AGG---A---G--CTG---GGG----A-T--C--AGGACTGCAACCC-CT-TG-GTTCGCAT---T-CCAAGG---C---
gi|90627 : TTTT-GATAA-------AATTTTATTCAAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-A--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---ACA----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CA-GG-GTTTGCAG---T-CCAAGG---T---CTT-AACC-ACTGAATCA-C
gi|90628 : TTTT-GTTAA-------TGTCTCATCTGAAAG--------------T----A---TT-TTTT--A-G-TTGG-------AGG---A---T--CAG---GGA----A-T--C--GAACCTGCAACCC-CT-GG-GTTCACAG---T-TCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-TTAATCTGCT
gi|90629 : TTTT-GTTAATTTATTAAGTCTCATCTAAAAA-ACTT---GTTAG-T----A---TT-TT-TT-G-G-TTGA-------AGG---A---G--CGG---GG-----A-T--C--AAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTAGCAG---T-CCAAGA---C---TTT-AACC-ACTGGACCA-TTAATCCACTC
gi|90630 : TTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAT-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG---AATGG--CGGGGCGGG----G-T--C--GAACCTGCGACGC-CT-TG-GTTCGCGGCAAC-CTAAGT---C---GCT-AACC-ACTGGACCA-CT
gi|90631 : TT-TTTAA-------AGTTTCATCTGAAAA-ACTG---AAAAG-TG---A---TT-T-----A-G-TTTG-------AGG---A---G--TGG---GAG----A-T--T--GAAACTGCAACCC-CT-TG-GTTTGCAG---C-CCAAGGATAT---CT----CC-ATTAGGCCA-CT
gi|90632 : T-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTA---ATTAG-T----A---TT-TT----A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCCACCC-CT-GA-GTTTGCAG---T-CCAAGG---C---ATT-AACC-GCTGGACCT-GTAATCCGCTC
gi|90633 : TTAA-------ATTTACATCCAAACA-ACTG----TAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------CC----A---GTTCTG---GGA----A-T--C--GAACCCGCGACCC-C
gi|90634 : TTAA-------AGTTTCGTCGGAAAG-ACTG---TTAGT-T----A----T-TT-T--A-G-T--G-------A-G---A---G--CGG---GGG------T--C--AAAATTACAA----------GTCCGCAG------CA-----------TT-AACC-ACTGGA
gi|90635 : TTAA-------AGTCCCATCCGAATG-ACTG----TTAG-T----A---CT-TT-T--A-G-TTAGC------CAG---C---T--CCG---GGA----A-T--C--GAACCCGCAAC
gi|90636 : TTAA-------AGTCCCATATGAACG-A-TA---GTGAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGGCC-----AGT---C---C--CGG---GAG------T--C--AAACCCGCAACCC-CA-AG-ACTAGAAG---T-C
gi|90637 : TTAA-------AGTCCCATCTGAATG-AATG----TTAG-T----A---CT-TT-T--A-G-TCAGC------CAG---C---T--CCG---GGA----A-T--C--GAACCCGCAACCC-C
gi|90638 : TTAA-------AGTCCCATATGAACG-A-TA---GTTAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGGCC-----AGC---C---C--CGG---GAG------T--C--AAACCCGCAACCC-C
gi|90639 : TTAA-------AGTCCCATATGAACG-ATTG----TTAG-T----A---TT-TT-T--A-GTTTGC-------CAG---C---C--CCG---GGA----A-T--C--AAACCAGCAACCC-CT-AG-
gi|90640 : TTGA-------AGTCCCATCCGAACG-ACTG----TAAG-C----A----T-TT-T--A-G-CTGGC------CAG---C---C--CCG---GGA----A-T--A--GAACCTGCAAACC-
gi|90641 : TTAA-------AGGCTTATCCTAACG-ACT----ATTAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGGC------CAG---C---C--CCG---GAA----A-T--T--GAACCCGCAATCC-
gi|90642 : AA-------AGTCTCACCCAAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG---A---G--CTG---TAG----G-T--C--GAACCTGCGACCG-CT-TG-GTTTG---------------------CTT-AATC-ACAGGTCTA-TTAATCCGCTC
gi|90643 : AA-------GGTCTCGTCCAAAAG-ACTGTATATAAG-T--------------T--A-G---GG-------AGA---A---G--CAG---TGG----A-T--C--CAACTCATGACCC-CT-GG-ATCAAGAT---T-CCA--G---CATGCT---ACC-CCTGGACAACCTTATCTGCTC
gi|90644 : -------AATCTCATCTGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TA----A-G-TTGT-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-TG-GTTCGTAG---T-CCAAAG---C---TGT-AACC-ACTGGGCCA-CTAATCCGCTC
gi|90645 : GTATCATCCGAAAT-ACAG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGA-------AGG---A---G--TGA---AGG----A-T--C--GAACCTACGATCC-CTGGG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CAA-GACC-ACTGGACCA-CTTATCCGCTC
gi|90646 : TCTCATCCAAAAG-ACTG----TGAG-TGATTA---TT-TT-A--A-G-TTGT-------AAG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--AAATATGTGATCT-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCC
gi|90647 : TTATCCAAAAG-ACTG---ATAGG------A------------------GG-------A-G---A---G--CAG---GTG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GA-GTTCACAG---T-GCAACG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-C
gi|90648 : CGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--TGG---GGGTGGGG-T--C--AAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGA---C---CTT-AACC-ACTGAA
gi|90649 : TAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---T--TGG---GGG----A-T--C--GAACCTGGGACCC-AT-GT-GTTCGTAG---T-CCGAGG---C---CTT-GACC-ACTTTTCCA-CT
gi|90650 : TAAG-T----A---TA-TT-G--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GG----------------------ATCC-CT-GG-GTCCGCAA---T-CCAAGC---C---CTT-AAt
gi|90651 : AAG-T----G---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGA---A---G--TGG---GGG----A-T--C--GAACCTGGGACCC-CT-GG-GTTCATAG---T-CCAAGG---C---CTG-GACC-ACTGATCCA-CT
gi|90652 : AAG-T----A---CT-TT-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--TGG---GGG----A-T--C--GAACCTGAGACCC-CT-GG-GTTCGTAG---T-CCAAGG---C---CTG-GACC-ACTGATCCA-TTt
gi|90653 : G-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------ATG---A---G--TTG---TGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-AT-GG-CTTCGTAG---T-ACAAGT---C---CTT-AACC-ACTGGCCCA-CTAATCCACTCt
gi|90654 : ---TT-TT-T--A-G------------AGGTCAA---G--CGC---TGG----A-T--C--GAACCTGCGACCT-CT-GGCGTTAGCGG-----CCAACA---A---CCT-ATCC-ACT
gi|90655 : T-TT-T--A-G-TTGA-------AGG---A---T--CGA---GAG----A-T--C--GAATCTGCGA-CC-TT-GG-GTTAACAG---T-CCA
gi|90656 : G-------AAA---A---G--CAG---CTG----A-C--C--GAACCT---------T-GA-GTTCACAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-TTAATCCACTC
gi|90657 : G---A---G--CGG---GGG----AAT--C--GAACTCACGCCCT-CT-GG-ATTGACAG---T-CAGAGG---C---GCT-AACG-ACTGAGCCA-
gi|90658 : TGAGACTC-CT-GG-GTTCGAAG---T-CCAATG---C---CTT-AACC-ACTGAAACA-CTTATCTGCTC
gi|90659 : TGAGACCC-CT-GT-GTTCGAAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGGACA-CTTTTCTGCTC
blockSeqs : TTTATTA GATT CTT TG TGGTGAG GGC TGGG A GT ATA ATG
blockSeqs : . G C T CC C T A A T .
blockSeqs : . . T . CC . T . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
finalCons : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
Alignments
lowQualScore : 0 1111111 0 111 0 1111 111 0 0 11 0 0 5555555 000 000 00 111 2222 1 11 00 0 0 0 000 0 111 111 0 0 0
lowQualScore : . ....... . ... . .... ... . . .. . . ....... ... ... .. ... .... . .. .. . . . ... . ... ... . . .
lowQualScore : 7 9999999 6 000 5 6666 999 5 5 22 5 5 0000000 999 999 77 444 1111 0 22 77 5 5 5 999 5 666 000 6 6 6
consensus : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
Reference ( family-360 ) : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90577 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTGACCCGAAAG-ACTG---ATTAG-T----A---TT-TT-T--ATG-TTGG-------AAG---A---G--CGG---GGG----A-G--C--GAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAATG---C---GTT-AACC-ACTGGTCCA-CTAATCCGCTC
gi|90578 : ATATTT-GTTAA-------AATCCTATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CAG---GTG----A-T--C--AAACCTGCGACCC-CT-GA-GTTCACAG---T-CTAAGG---C---TTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCACCC
gi|90579 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCCCATTCGAAAG-ACGG---ATTAG-T----A---TT-TT-T--A-A-TTGG-------AAG---A---G--CGA---CAG----A-T--C--GAGCCTGCGACTC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---GTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCCTCTC
gi|90580 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-TCTG---ATGAG-T----A---TT-TT----A-G-TTCG-------AGG---A---G--CGG---GTG----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTCGCAA---TCCCGCGG---C---TTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATTCGCTC
gi|90581 : ATTTTT-GTTAA-------AGTTTTATCCGAAAG-ACTG---ATTAT-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AAG---A---G--CGG---GTG----A-T--C--GAACCTGCGACTT-CT-TT-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---GTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90582 : ATTTTT-GTTTA-------AGTCTTATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-GA-G--A-G-TGGG-------CGG---A---G--CTG---GGA----A-T--C--GAACCTGCGACCC-AT-GG-GTTCGCAG---C-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCCGC
gi|90583 : ATCTTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAG-ACTG---TTGAG-T----A---TT-TT----A-G-TTGG-------AGG---A---G--AGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACCA-CT-GA-GCTCACAG---T-CTAAGG---C---CTTAAACC-ACTGGACCA-CTTATCCACT
gi|90584 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAG-ACTG---ATACG-T----A---AT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGT---AGG----G-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTCGAACA-CTAGTCAACTC
gi|90585 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCAACCGAAAG-AATG---ATAAG-T----A---TT-CT-T--G-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGGT---A-T--C--GAACCTGGGATCCGCT-GG--TTTGCAG---T-TCAAGG---C---CTT-AATC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90586 : ATTTTT-GTTAA-------AATCTCACCCGAAAG-ACTG---ATACA-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GTG----C-T--C--GAACCTGCAACCC-CT-GG-GTTCGCCG---T-CCAAGG---G---TTT-AATC-ACTGGATCA-CTAATGCGCTC
gi|90587 : ATTTTT-GTTAA-------AATCTCATCTGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TTCTT-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--TGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTTA-AG---T-CCAGGG---C---CTT-AACC-ACCAGACTA-CTAATCCACTC
gi|90588 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCACCCAAACG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T----G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGA----A-T--C--GAGCCTGCGACGC-CC-GG-GTTCGCAA---C-CGAAGG---C---CTT-AACC-ATTGGACCA-CTAATTCACTC
gi|90589 : ATTTTT---TAA--------GTCTCATCCAACAG-ATTG---TTCAG-A----A---CT-TT-T--A-G-TTTG-------AGA---A---A--CGG---GGG----A-T--C--TAACCTGCAATCT-CT-TG-GTTCGCAG---T-CCAATG---C---CTC-AATC-ACTAGACCA-CTTATACGTTC
gi|90590 : ATTTTT-GTTTA-------AGTCTCATCCGAAAT-ACTG---ATAAA-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGA----C-T--C--GGACCTGCGATCC-CG-TG-GTTCGCAG---T-CTAAGG---C---CTT-AACC-ATTGGACCA-CTAGTTCACT
gi|90591 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATTCAAAAA-ATTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AAG---A---G--CGG---GAG----A-T--C--GAGCCTGCGACCC-AT-TG-GTCTGCAG---T-CCAAGG---T---ATT-AACC-ACTGGACCA-CTAATACG
gi|90592 : ATTTTT-GCTAA-------AGTCCCATCTGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-CTTG-------AGG---A---G--GGG---AGG----A-T--C--GAACCTGCAACCC-CT-GG-TTTGGCAG---T-CCAAGG---T---C-T-AATCGACTGGACCA-CTAATCCACTC
gi|90593 : ATTTTT-GTTAA-------ACTCCCATCCGGAAG-CCTG---CTAAG-T----A---TT-TT-T--A-A-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GG-------T--C--GAACCTGCGACCC-CT-TG-GTTCGCAT---T-CCAAGG---C---CGT-AACC-ACTAGACCA-CT
gi|90594 : ATTTTT-GGGAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAT-T----T---TT-TA-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--CGA---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACTC-TT-GG-ATTCGCAG---T-TCAAGG---C---TTT-AACA-TCTGGACCA-CTAATCCTCTCgtgtcc
gi|90595 : ATTTTT-GATAA-------AGTCTTATCCGAAAG-ACAG---ATTAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------TGA---A---G--CGG---GGT----A-T--C--GAACCTGCGACCC-AT-GG--------G---T-CCAAGG---C---GTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCCAC
gi|90596 : ATATTT-GTTAA-------TGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATGAA-T----A---TT-TT----A-G-TTGGTGGTGAGAGG---G---G--GTG---GGG----G-T--A--AAATCTGTGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CAT-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90597 : ATTTTT--TTAT--------GTCTTATTCGAAAG-ACT------AAG-T----AC--TT-TT-T--A-G-TTGG-------ATG---A---G--CAG---GGG----G-TGTC--GAACCTGCGATCC-CT-TG-TTTCGCAG---T-CCAAGG---T---TTG-AACT-ACTCGACCA-CTTATCCCCT
gi|90598 : ATTTTT-GTTA---------GTCTCATCCAAAAG-ACTG---ATAAG-T----AT--TT-TT-T--A-G-TT-G-------AGG---G---G--CAG---GGA----T-T--C--GAACCTTCAGCTC-CT-AG-GTTTGCAG---T-CCAAGA---C---CTT-AACC-ATTGGACCA-CTAATCTGCTC
gi|90599 : ATTTTT-GTT------------CCCATCCGAAAA-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT----A-G-TTGT-------AGG---A---G--CGG---AAA----A-T--C--GAACCTGCAGTCC-CT-AG-GTTTGCAG---T-CCAAGA---C---CTT-GACC-ACTGGACCA-CTTATCC
gi|90600 : ATTTTT-GTTAA-------AGTTTTATCCAAAAG-ACTG---GTA-------------T-TT-T--A-G-TTCG-------AGT---A---G--CGG---TGG----T-T--C--GAACTTGCGACCC-CT-GT-GTTCGTAG---T-CCAAGG---T---CTT-GTCC-ACTGGAACA-CTTATCCGCTC
gi|90601 : ATTTTTAGTTAA-------ATTCTCATCCGAAAG-ACTG---TTAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--G--GAACCTGT------------GTTCGCAG---T-TCAAGG---C---CTT-AACC-GCTGGACGA-CAAATCCGCTC
gi|90602 : ATTTTT-GTTAG-------AGTCTCATCCGAAAG-TCTT---ATAAG-T----T---TT-TT-T----G-TTGG-------AGG---A---G--CGA---GGG----A-T--C--GAATCTGCGGCAC-CT-GG-ATTCGCAG---T--AAAGGT--T---TTT-AACC-ACTCGATCA-CTTACCCGC
gi|90603 : ATTTTT-ATTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTT---ATAAT-T----A---TT-TT----A-G-TAGG-------AGA---A---G--CGA---CGG----A-C--C--GAACATGCGACCC-CT-GG-CTTCACAG---T-CTGAGG---C---CTT-AACC-ACTGCACCA-C
gi|90604 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTACTCCCAAAG-ACTG---ATGAG-T----A---TT-CT-T--A-G-TTGG-------TGG---A---A--CTG---GGTT---A-TA-CAAGAACCTGCTACCC-CT-AG-GTTTGCAG---T-TTAAGG---C---CTA-AACC-ACTGGACCA-CTAATCCGCTC
gi|90605 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---AAAAAAT----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---G---G--CGG---GGA----AAT--A--GAACCTGCGG----------------AG---T-CCAAGG---C---TTT-AACC-ACTGGACCG-CTAATCCGCTC
gi|90606 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATACG-T----A---CT-TT-T--A-G-ATGT-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACTC-CT-GG-GTTCGAAG---T-C
gi|90607 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-ATGT-------ATG---A---G--CGG---GGA----A-T--C--GAACCTGCGACTC-CT-GG-ATTCGAAG---T-C
gi|90608 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATACG-T----A---TT-TT-T--A-G-ATGT-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCGACTC-CT-GG-GTTTAAAG---T-C
gi|90609 : ATATTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAG-ACTT---ATAAG-T----A---TT-----------TTAG-------AGG---A---G--CAT---GTG----A-T--C--TAACCTGCGACCC----AA-GTTCACAG---T-GCAACG---C---CTT-CACC-AATGGACCA-CTTAT
gi|90610 : ATTTTT-GTGAA-------AGTCTTATGCGATAG-ACTT---ATACG-T----A---TT-TT-A--G-A-TTGG-------AGG---A---A--CAG---TGG----A-T--T--GAATCTGCGTTCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---TTT-AAC------GACTA-CTA
gi|90611 : ATTACT-GTTAA-------AGTCCCATCCAAAAG-ACT---------------A---TT-TT-CTGA-G-TTTG-------AGG---A---G--CGG---AAG----A-T--C--GAACATGCGGCTA-CA-GG-GTTCGCAA---T-TCAAGA---C---ATT-AACC-ACTGAACCA-CTAATCCACTc
gi|90612 : ATATTT-GTTAA-------AGTCTCGACCAAAAG-ACTG---ATAAT-T----A---TT-TT-T--A-G-ATGT-------AGG---A---G--CAG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGACTC-CT-GG-GTTCAAAG---T-C
gi|90613 : ATTTTT-GT-------------CTCATCTGAAAG-G-------TAAG-T----ACTTTT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---A--CGG---CT-----A-T--T--GAACCTGCGACCC-TT-GA-GTTTTCAG---T-CCAAGG---C---CTT-ACAC-ACTGGACCT-CTAATCCACTC
gi|90614 : ATTATT-GTTTA-------AGTCCCATC---------TG---ATAAG-T----T---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG----------TGT---GGC----A-T--C--GGACCTGCTACCC-CT-TG-GTTCACAG---A-CGAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAAT
gi|90615 : ATTATT-GTTTA-------AGTCCCATC---------TG---ATAAG-T----G---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG----------TGT---GGC----A-T--C--GGACCTGCTACCG-CT-TG-GTTCACAG---A-CGAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTAATttaatccactc
gi|90616 : ATTTTT-GTTAA-------AGTCACACCCGAAAT-AATG---ATAAA-T----A---TT-AT----A-G-TTGG-------AGA---A---G--CGG---GGA------------------------C-CT-GG-GTTCGCAG---T-CAGAGG---C---TTT-AACC-ACT--------TA-TCCGCTttaatccactc
gi|90617 : ATTTTT-GTTGA-------CGTCTCATCTGAAAT-ACTG---ATGAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTCG-------AGG---A---C--CGG---GGA----A-A--C--GAA------------------------------CCAATG---C---GTT-AAAC-ACTGGCCCA-CTAATCCGCTC
gi|90618 : ATTTTT-GTTAA-------AAGCTTATCCGAAAG-ACTT---ATCAG-T----A---TT-TA-G--A-G-CTGG-------AGG---A---G--CGG---
gi|90619 : TTTTT-GTTAA--------GTCTCATCTGAAAT-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TAAG-------AGG---A---G--TGA---GGG----A-T--C--AAACCTATGACCC-CT-GG-GTTAGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTTGACCA-CTAATCTACTC
gi|90620 : TTTTT-ATTAA-------ATTCTCATCCGAAAG-ACTG---ATAAA-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--TGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCATTCC-CT-GG-GTTTGCAT---A-TTAAGG---C---CTT-AACC-ACTGAACCA-CTAATACGCTC
gi|90621 : TTGTT-GTTGA-------AGTCTTATCCGAAAT-ACTG---ATAAG-T----G---TA-GT-T--A-G-TTGG-------AAG---A---G--CAG---CAG----A-T--C--GAACCTACGACCA-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---A---TGT-AACT-ACTGGACCA-TTAATCCGCTC
gi|90622 : TTTTT-GTTTA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTT---GTCAC-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CAG---GGG----A-T--C--GAACCTGTGACCC-CT-GG-GTTCGTAG---T-TCAA
gi|90623 : TTTTT-GTTAA-------AGTTTCATCCGAAAGTACT-------------------TT-TT-T--A-A-TTGG-------AGG---A---G--CGT---GGT----A-T--C--AAACCTGCGACCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CTAATG---C---CTT-AACC-AC
gi|90624 : TTTTT-GTTAA-------AGCTTCATGTAAAAT-ACTG---ATGGG-T----A---TT-TT-C----G-TATC-------AGG---A---G--CGGC--GGG----A----C--GAACCTGCGAACT-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-ACCT-ACTGGGCCA-CTGCTCCG
gi|90625 : TTCTG-GTTAA-------AGTCCCATTCTAAAG-ACTA---ATAAG-T----A---TT-TT-T----G-AAGG-------AGG---A---A--AGG---TGG----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-GA-GCTCG----------AA-------------ACCC-ATTGGACCA-CTAATCCACTC
gi|90626 : TTTT-GTTAA-------AGATCCTTCCGTAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TG-G--A-G-TAGG-------AGG---A---G--CTG---GGG----A-T--C--AGGACTGCAACCC-CT-TG-GTTCGCAT---T-CCAAGG---C---
gi|90627 : TTTT-GATAA-------AATTTTATTCAAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-A--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---ACA----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CA-GG-GTTTGCAG---T-CCAAGG---T---CTT-AACC-ACTGAATCA-C
gi|90628 : TTTT-GTTAA-------TGTCTCATCTGAAAG--------------T----A---TT-TTTT--A-G-TTGG-------AGG---A---T--CAG---GGA----A-T--C--GAACCTGCAACCC-CT-GG-GTTCACAG---T-TCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-TTAATCTGCT
gi|90629 : TTTT-GTTAATTTATTAAGTCTCATCTAAAAA-ACTT---GTTAG-T----A---TT-TT-TT-G-G-TTGA-------AGG---A---G--CGG---GG-----A-T--C--AAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTAGCAG---T-CCAAGA---C---TTT-AACC-ACTGGACCA-TTAATCCACTC
gi|90630 : TTT-GTTAA-------AGTCCCATCCGAAAT-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG---AATGG--CGGGGCGGG----G-T--C--GAACCTGCGACGC-CT-TG-GTTCGCGGCAAC-CTAAGT---C---GCT-AACC-ACTGGACCA-CT
gi|90631 : TT-TTTAA-------AGTTTCATCTGAAAA-ACTG---AAAAG-TG---A---TT-T-----A-G-TTTG-------AGG---A---G--TGG---GAG----A-T--T--GAAACTGCAACCC-CT-TG-GTTTGCAG---C-CCAAGGATAT---CT----CC-ATTAGGCCA-CT
gi|90632 : T-GTTAA-------AGTCTCATCCGAAAG-ACTA---ATTAG-T----A---TT-TT----A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--AAACCTGCCACCC-CT-GA-GTTTGCAG---T-CCAAGG---C---ATT-AACC-GCTGGACCT-GTAATCCGCTC
gi|90633 : TTAA-------ATTTACATCCAAACA-ACTG----TAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------CC----A---GTTCTG---GGA----A-T--C--GAACCCGCGACCC-C
gi|90634 : TTAA-------AGTTTCGTCGGAAAG-ACTG---TTAGT-T----A----T-TT-T--A-G-T--G-------A-G---A---G--CGG---GGG------T--C--AAAATTACAA----------GTCCGCAG------CA-----------TT-AACC-ACTGGA
gi|90635 : TTAA-------AGTCCCATCCGAATG-ACTG----TTAG-T----A---CT-TT-T--A-G-TTAGC------CAG---C---T--CCG---GGA----A-T--C--GAACCCGCAAC
gi|90636 : TTAA-------AGTCCCATATGAACG-A-TA---GTGAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGGCC-----AGT---C---C--CGG---GAG------T--C--AAACCCGCAACCC-CA-AG-ACTAGAAG---T-C
gi|90637 : TTAA-------AGTCCCATCTGAATG-AATG----TTAG-T----A---CT-TT-T--A-G-TCAGC------CAG---C---T--CCG---GGA----A-T--C--GAACCCGCAACCC-C
gi|90638 : TTAA-------AGTCCCATATGAACG-A-TA---GTTAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGGCC-----AGC---C---C--CGG---GAG------T--C--AAACCCGCAACCC-C
gi|90639 : TTAA-------AGTCCCATATGAACG-ATTG----TTAG-T----A---TT-TT-T--A-GTTTGC-------CAG---C---C--CCG---GGA----A-T--C--AAACCAGCAACCC-CT-AG-
gi|90640 : TTGA-------AGTCCCATCCGAACG-ACTG----TAAG-C----A----T-TT-T--A-G-CTGGC------CAG---C---C--CCG---GGA----A-T--A--GAACCTGCAAACC-
gi|90641 : TTAA-------AGGCTTATCCTAACG-ACT----ATTAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGGC------CAG---C---C--CCG---GAA----A-T--T--GAACCCGCAATCC-
gi|90642 : AA-------AGTCTCACCCAAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTAG-------AGG---A---G--CTG---TAG----G-T--C--GAACCTGCGACCG-CT-TG-GTTTG---------------------CTT-AATC-ACAGGTCTA-TTAATCCGCTC
gi|90643 : AA-------GGTCTCGTCCAAAAG-ACTGTATATAAG-T--------------T--A-G---GG-------AGA---A---G--CAG---TGG----A-T--C--CAACTCATGACCC-CT-GG-ATCAAGAT---T-CCA--G---CATGCT---ACC-CCTGGACAACCTTATCTGCTC
gi|90644 : -------AATCTCATCTGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TA----A-G-TTGT-------AGG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--GAACCTGCGATCC-CT-TG-GTTCGTAG---T-CCAAAG---C---TGT-AACC-ACTGGGCCA-CTAATCCGCTC
gi|90645 : GTATCATCCGAAAT-ACAG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGA-------AGG---A---G--TGA---AGG----A-T--C--GAACCTACGATCC-CTGGG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CAA-GACC-ACTGGACCA-CTTATCCGCTC
gi|90646 : TCTCATCCAAAAG-ACTG----TGAG-TGATTA---TT-TT-A--A-G-TTGT-------AAG---A---G--CGG---GGG----A-T--C--AAATATGTGATCT-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-CTTATCC
gi|90647 : TTATCCAAAAG-ACTG---ATAGG------A------------------GG-------A-G---A---G--CAG---GTG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-CT-GA-GTTCACAG---T-GCAACG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-C
gi|90648 : CGAAAG-ACTG---ATAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---G--TGG---GGGTGGGG-T--C--AAACCTGCGATCC-CT-GG-GTTCGCAG---T-CCAAGA---C---CTT-AACC-ACTGAA
gi|90649 : TAAG-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGG---A---T--TGG---GGG----A-T--C--GAACCTGGGACCC-AT-GT-GTTCGTAG---T-CCGAGG---C---CTT-GACC-ACTTTTCCA-CT
gi|90650 : TAAG-T----A---TA-TT-G--A-G-TTGG-------AGG---A---G--CGG---GG----------------------ATCC-CT-GG-GTCCGCAA---T-CCAAGC---C---CTT-AAt
gi|90651 : AAG-T----G---TT-TT-T--A-G-TTGG-------AGA---A---G--TGG---GGG----A-T--C--GAACCTGGGACCC-CT-GG-GTTCATAG---T-CCAAGG---C---CTG-GACC-ACTGATCCA-CT
gi|90652 : AAG-T----A---CT-TT-T--A-G-TTTG-------AGG---A---G--TGG---GGG----A-T--C--GAACCTGAGACCC-CT-GG-GTTCGTAG---T-CCAAGG---C---CTG-GACC-ACTGATCCA-TTt
gi|90653 : G-T----A---TT-TT-T--A-G-TTGG-------ATG---A---G--TTG---TGG----A-T--C--GAACCTGCGACCC-AT-GG-CTTCGTAG---T-ACAAGT---C---CTT-AACC-ACTGGCCCA-CTAATCCACTCt
gi|90654 : ---TT-TT-T--A-G------------AGGTCAA---G--CGC---TGG----A-T--C--GAACCTGCGACCT-CT-GGCGTTAGCGG-----CCAACA---A---CCT-ATCC-ACT
gi|90655 : T-TT-T--A-G-TTGA-------AGG---A---T--CGA---GAG----A-T--C--GAATCTGCGA-CC-TT-GG-GTTAACAG---T-CCA
gi|90656 : G-------AAA---A---G--CAG---CTG----A-C--C--GAACCT---------T-GA-GTTCACAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGACCA-TTAATCCACTC
gi|90657 : G---A---G--CGG---GGG----AAT--C--GAACTCACGCCCT-CT-GG-ATTGACAG---T-CAGAGG---C---GCT-AACG-ACTGAGCCA-
gi|90658 : TGAGACTC-CT-GG-GTTCGAAG---T-CCAATG---C---CTT-AACC-ACTGAAACA-CTTATCTGCTC
gi|90659 : TGAGACCC-CT-GT-GTTCGAAG---T-CCAAGG---C---CTT-AACC-ACTGGGACA-CTTTTCTGCTC