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lowQualScore                  :            . .  . ... . ....    .   .... .     .  .      . ...... .. ....  .............    ..   ..  . ... .. ...... .  ..  .. .   .      .        
lowQualScore                  :            6 8  2 666 6 9999    8   9999 5     6  8      5 111111 99 1111  0000000000000    22   77  5 999 22 444444 0  77  77 5   5      5        
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Reference ( gi|143674 )       :         AAA-A-AA-C---A-A----AGCTAAAA----CAAAAGCGGAGACTTCA-T------A-AT--A-CA----AG-G-----GTAC--AGA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143666                     :         AAA-ATAA-C---A-A----AGCTAAAA----CAAAAGCAGATTCTTCA-T------A-AT--A-CA----AG-T-----GTAC--AAA--TT-T---T--T------A-AT--TA--C-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143629                     :         AAA-A-AA-C---A-A----AGCTAAAA----CAAAAGCTGAAACTTCA-T------A-GT--A-CA----AG-T-----GTAC--AGG--TT-T---C--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAG-
gi|143628                     :       aaAAA-C-AA-C---A-A----AGCTTAAA----CAAAAGCTGAGACTTCA-T------A-GT--A-TA----GA-T-----GTAC--AGA--TT-T---T--T------G-AT--GA--T-TTA-CACCAG-ATGTC
gi|143676                     :       aaAAA-A-AA-C---A-A----AGCTAAAAAA--CGAAGGCTAAGACTTCA-A------A-GT--A-CA----AG-T-----GTAC--AAA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CTCCAG-ATGTAAAA
gi|143639                     :         AAC-A-GA-C---A-A----AGCTAAAA----CGAAAGCTGATAATTCA-T------A-GT--A-TA----TG-T-----GTAC--AGA--TC-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATTTCAAA
gi|143634                     :       aaAAC-A-AA-T---A-A----AGCTAAAA----CGAAAACTGAGACTTCA-T------AGAA--A-CA----AG-T-----GTAC--AGA--TG-A---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAG-ATGACAAA
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gi|143688                     :          AA-A-AA-CTGCA-C----AGCTAAAA----CAAAAGCTGAGATTTCA-T------A-GT--A-TA----AG-T-----GTAC--AGA--TT-A---T--T------G-
gi|143658                     :          AA-A-AA-C---A-ACTA-AACTTAAA----TGAAATCTGATACTTAA-T------A-GT--A-AA----CG-T-----GAAC--AGA--TT-G---T--T------G-AT--AA--T-CTA-GGCAAG-ATGTCAAAcaagctac
gi|143631                     :           A-A-AA-C---A-A----AGCTTAAA----CGAAAGCTGAGACTTCA-T------ACAT----CA----AT-T-----GAAC--AGA--TT-T---T--C------G-AT--AA--C-TTA-TGCCTG-ATGGCAAA
gi|143689                     :       aaacA-A-AA-A---G-A----AGTTAAAA----CGAAAGCTACGACTTCA-C------A-GT--A-CA----AG-T-----GTAC--AGA--TT-T---T--T------T-AT--AA--T-TTA-CGCC
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gi|143636                     :     aaaagcA-A-AA-C---A-A----AGCTTAAA----CAAGAGCTGAGACTTCA-T------T-AC--T-CA----GT-T-----GTAC--ATT--TT-T---T--T------G-AC--AA--A-TAA-CACCAG-ATGTCAAA
gi|143662                     :       aaatA-A-AA-C---A-A----AACTTAAA----CGAAAGCTGAGACTTCA-T------AGAT----CA----AT-T-----GTAC--AGA--CT-A---C--T------G-AT--AA--A-TTA-CACCAG-CTGACAAA
gi|143632                     :        aatA-A-AA-C---A-A----AACTTAAA----CGAAAGCTGAGAATTCA-G------G-A---A-AA----AT-T-----GTAC--AGA--TT-T---T--T------G-AG--AAAGT-AGA-CGCCAG-ATGTCA
gi|143690                     :       aaatA-A-AA-C---A-A----AGTTAAAG----CGAAAGCTGATACTTCA-G------A-GT--A-TA----CT-GTGAT-ATAC--AGA--TT-T---T--T--------ATTAAA--T-TTG--GTAAG-ATGTCAAA
gi|143691                     :            -A-AA-A---A-A----AGCTAAAA----CGAAAGATGATACTTTA-T------A-AC--A-TA----AC-T-----GTAC--AGA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATG-CAAA
gi|143649                     :            -A-AA-A---A-A----AACGAAAA----CGAAAACTTAGACTTCG-T------G-GA--A-CA----AT-T-----ATAC--ACA--AA-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAT-ATGTCAAA
gi|143692                     :            -A-AA-T---A-ATG--AGCTAAAA----CGAAAGCTGAGATGACT-T------A-GA--A-CA----AA-T-----GTAC--AGA--TA-T---T--T------G-AA--AA--T-TTA-CTCTTT-ATGTCCAA
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gi|143695                     :                   ---A-A----AACTAAAA----CGAAAGCCGATACTTTG-T------T-GT--A-TA----AG-A-----GAAC--AGA--TG-T---T--T------G-AT--AG--T-TTA-TGCAAG-ATGTCAAA
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|143693 ): AAAAAAATCTGTGACGAATGCTGAAAAATTTCATAGATCAGTTGTACAGATTGTTGATAAATTAAGTAATGTAAAA






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Reference ( family-359 )      :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
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gi|143656                     :        aaaagcAAA-A-AA-C---G-A---AGTTAAAT----CGA-AAGTTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GC-G---T----AT-A-GA--TTAT---C--T------G--T--AG--T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
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gi|143659                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCCAAAA----CGA-AATACGAG--A--CTTCA-TT-G-T--A---CC----T-----TT-G---T----AC-A-CA--TT-A---T--T------A-AT--AA--T-CTACCATCTGTATGTCAAA
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gi|143661                     :             aAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGG-AAGTTGAG--A--CTTCT-TA-G-T--A---TA----A-----GT-C---T----AC-A-G--------------------------AA--T-TTA-CGCCAC-ATGTAAAA
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gi|143664                     :             aAAA-A-AATC---A-A---AGCTCAAA----CTA-AACCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----AATAC-AT-G---T----AT-ACGATTTT-T---T--T------T-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGCCAAA
gi|143665                     :              AAA-A-AA-C---A-ACA-AGCTGAAT----CAA-AAGCTGAT--A--CTTTA-TT-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------T-AT--AA--A-TTA-TGCCAG-ATGTTAAA
gi|143666                     :             aAAA-ATAA-C---A-A---AGCTAAAA----CAA-AAGCAGAT--T--CTTCA-TA-A-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------A-AT--TA--C-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143667                     :              AAA-A-GA-C---A-A---AGCTCAA-----CGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TATATGA-----CT-G---T----GC-A-GA--TG-T---T--T------T-AT--CA--T-TTA-CACCAG-ATGTCAAA
gi|143668                     :             aAAA-A-AA-T---A-A---TGGTGAAA----CGA-AAACTGGG--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---C--C------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143669                     :             aAAATA-AG-C---A-A---AGCTTACA----CGA-AAGCAGAT--A--CTTCG-TA-G-A--T---CA----A-----------------------------T---T--T------G-AT--AT--A-TTA-CGCAAT-ATGTCAAA
gi|143670                     :                                        A----CGA-AAGCTGAT--A--CTTTA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---A----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAT-TTGGCAAA
gi|143671                     : aaaaagtcacttgAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----TGA-CAGCTGAG--A--CTTCT-TA-G-T--A---TA----A-----AT-A---T----AG-A-GA--TT-A---T--T------A-TT--AA--TCCTA-TGCCAG-AAGTAAAA
gi|143672                     :             aAAA-A-CA-C---A-A---AGATAAAA----CGA-AAGATAAT--A--CTTCA-T-----------------A-----AT-G---A----AC-A-TT--TT-T---T--TG-----G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143673                     :             aAAA-A-AA-T---A-A---AGTTAAA-----CAA-AAGCTGAG--A--CTTTA-AA-G-T--A---CA----C-----GT-G---T----AC-A-AA--TTATCAAT--T------G-AT--AA--T-TTT-CGTAAG-ATGTCAAA
gi|143674                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CAA-AAGCGGAG--A--CTTCA-TA-A-T--A---CA----A-----GG-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143675                     :              AAC-A-AA-T---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTTAA--A--CTTCA-TC-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-AT--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCCAG-ATGTTAAA
gi|143676                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAAAA--CGA-AGGCTAAG--A--CTTCA-AA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CTCCAG-ATGTAAAA
gi|143677                     :              AAA-A-AA-A---A-A---AGCTTAAA----CGA-AAGCAAAG--A--CT-----------------------------T-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-TGCCAG-ATGTCAAA
gi|143678                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTTTAC----CGA-AATCAGAG--A--GTTTA-TA-G-A--T---TA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--AT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTG-CGCCAA-A
gi|143679                     :              AAA-A-AA-A---A-A---AGCTAAAATAAACAA-AAGCTGTG--A--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CCCCAT-ATGTTA
gi|143680                     :              AAA-A-AA-C---A-A---CGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--TTTCA-TT-G-T--A---TA----A-----CT-G---T----AT-A-GA--TT-A---T--T------G-GT--GA--T-TTA-TATTAG-ATGTTAAA
gi|143681                     :              AAA-A-AA-T---A-A----GTTTAAA----CAA-AAGCTGAG--A--CTTTA-TA-G-T--A---CA----C-----GC-G---T----AC-A-AA--TT-A---T--T------G-AT--AC--T-TTT-TGCGAG-ATGTC
gi|143682                     :                            -A---AGCAAAAA----CAA-AAGCTGGA--A--CTTCA-TA-G-C--A---CA----T-----GT-A---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------G-GT--AA--T-TTT-CACCAG-ATGTAAAA
gi|143683                     :           aagAAA-A-AA-CT--A-A---AACTAAAA----TAA-AAGATAAG--A--TTTTA-TA-G-C--A---GA----A-----GT-G---G----AC-A-GA--TT-A---T--A------G-AT--AA--T-TTA-TGTCGG-ATGTCA
gi|143684                     :               AA-A-AA-G---A-A---A-CTGAAA----CAA-AGGCTAAG--A--TTTCA-TT-G-A--A---CA----A-----TT-G---T----AC-A-CA--TT-T---T--T------A-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATG
gi|143685                     :               AA-A-AA-C---A-A---AACTAAAA----CAA-AAGCTTAG--A--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GT-A--------AC-A-GA--CT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGTCAAA
gi|143686                     :               AA-A-AA-A---A-A---GGTTAAAA----CAA-AAGCTACG--A--CTTCA-AA-T-T--A---CA----G-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-GTGTCAAA
gi|143687                     :               AA-A-AA-A---A-A---A--TAACA----TGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT----------AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAG-ATGTAAAA
gi|143688                     :               AA-A-AA-CTGCA-C---AGCTAAAA----CAA-AAGCTGAG--A--TTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------G-
gi|143689                     :                A-A-AA-A---G-A---AGTTAAAA----CGA-AAGCTACG--A--CTTCA-CA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------T-AT--AA--T-TTA-CGCCcaagctac
gi|143690                     :                A-A-AA-C---A-A---AGTTAAAG----CGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-GA-G-T--A---TA----CT----GT-GATAT----AC-A-GA--TT-T---T--T--------ATTAAA--T-TTG--GTAAG-ATGTCAAA
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gi|143692                     :                 -A-AA-T---A-ATG-AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--TGACT-TA-G-A--A---CA----A-----AT-G---T----AC-A-GA--TA-T---T--T------G-AA--AA--T-TTA-CTCTTT-ATGTCCAA
gi|143693                     :                 -A-AA-A---A-A---ATCTGTGA----CGA-ATGCTGAA--AAATTTCA-TA-G-A--T---CA----G-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-G---T--T------G-AT--AA--A-TTA-AGT--A-ATGTAAAA
gi|143694                     :                   -AA-A---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGGT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----T-----GT-G---T----TC-A-CA--TT-------------------------T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143695                     :                        ---A-A---AACTAAAA----CGA-AAGCCGAT--A--CTTTG-TT-G-T--A---TA----A-----GA-G---A----AC-A-GA--TG-T---T--T------G-AT--AG--T-TTA-TGCAAG-ATGTCAAA
gi|143696                     :                                     AAAA----C-A-AAGCT----------TCA-TA-G-A--T---CA----A-----TT-A---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
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gi|143699                     :                                      AAA----TGA-AAACTGAT--T--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CATCAA-ATGTAAAA
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gi|143703                     :                                         ----CGA-AAGTTGAT--A--CTTCA-TA-G-TGTA---CA----GAGTATGT-G---T----AC-A-GA--TT-T---TTTT------G-AT--AA--T-TTA-CGCCTG-ATGTCAAA
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gi|143705                     :                                                     TGAG--A--CTTTA-TA-G-T--T---CA----A-----GT-G---T----AC-T-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGTAAAA
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Alignments
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lowQualScore                  :                 . .  . ... . ...    .   ....   .       ... ..     .  . . .. ...  .... ...... . ... ....  . .  ..  . ... .. ...... .  ..  .. .   .      .        
lowQualScore                  :                 6 8  8 666 6 666    6   8888   5       555 77     5  5 5 77 444  0000 888888 5 888 0000  5 5  77  4 888 11 999999 5  77  77 5   5      5        
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Reference ( family-359 )      :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143625                     :                A-A-AA-C---A-A---AGCTTAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-GA-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-AA--TG-T---G--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCCAT-ATGTCAAA
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gi|143645                     :           aagAAA-C-AATC---A-A---AGCTAAAA----TGA-AAGTTGAT--A--CTTCA-TA-A-T--A---TA----A-----GT-G---T----AC-T-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAG-ATGTAAAA
gi|143646                     :            aaAAA-ATAA-T---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAT--T--CTTTA-AA-G-T--A----------------T-A---T----ACGA-GA--TT-T---T--T------G-AG--AA--T-AAC-CACCAG-ATGTCAAA
gi|143647                     :             aAAA-A-AA-T---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAT--A--CTTGA-TA-G-A--A---TA----T-----GT-G---TATACAT-A-GA--TTGC---T--T------G-AT--AA--T-TTA-AGTCAG-ATGTCAA
gi|143648                     :            aaAAA-A-AC-C---A-A---AGCTTAAA----TGA-AAGTTAAG--A--GTTC--CA-A-T--A---TC----T-----GTAG---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-CTA-CGCCAG-CTGTAAAA
gi|143649                     :               aa-A-AA-A---A-A---AACGAAAA----CGA-AAACTTAG--A--CTTCG-TG-G-A--A---CA----A-----TT-A---T----AC-A-CA--AA-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAT-ATGTCAAA
gi|143650                     :                A-A-AT-C---A-A---AGCTAAAC----CGA-AAGCTGAT--A--TTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--CT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-GATAAA-ATATCAAA
gi|143651                     :           aaacAA-A-AA-C---A-A---AGATGAAA----CGA-AAGCTGAT--A--CTTTC-TA-G-T--A---TA----A-----GT-G---T----CC-C-GA--TT-T---T--T------T-AT--AT--T-TTA-TGCCAG-ATGTCAAA
gi|143652                     :           aatAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAACTCAG--A--CTTCG-CG-G-A--A---CA----T-----CT-T---A----AC-A-GA--TT-G---T--T------G-AT--AA--C-TTG-CACCAG-
gi|143653                     :            aaAAA-A-AA-C---A-G---AGCTAAAA----CGA-AAGC-------------A-TA-G-T--A---TA----A-----AT-G---T----AC-G-GA--TT-T---TT-T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAA-ATGTCAAA
gi|143654                     :            aaAAA-A-AA-A---A-A---AGTTTAAA----CAA-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----T-----GT-G---T----AC-A-G---TT-------------------------T-TTA-CGCTAG-ATATCAAA
gi|143655                     :              aaA-A-AA-C---A-G---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----T-----GT-G---T----TC-A-GA-----T---T--T------G-AT--AA--T-ATC-CGTCAG-ATGTTAAA
gi|143656                     :        aaaagcAAA-A-AA-C---G-A---AGTTAAAT----CGA-AAGTTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GC-G---T----AT-A-GA--TTAT---C--T------G--T--AG--T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143657                     :            aaAAA-G-AA-A---G-A---AGCTAAAA----CAA-AAGCTGAG--A--CTTTA-TA-G-T--A---CA----C-----GT-G---T----TC-A-GG--TT-A---T--T------G-AT--AA--T-TTT-GGAGAG-ATGTCAAA
gi|143658                     :             aaAA-A-AA-C---A-ACTAAACTTAAA----TGA-AATCTGAT--A--CTTAA-TA-G-T--A---AA----C-----GT-G---A----AC-A-GA--TT-G---T--T------G-AT--AA--T-CTA-GGCAAG-ATGTCAAA
gi|143659                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCCAAAA----CGA-AATACGAG--A--CTTCA-TT-G-T--A---CC----T-----TT-G---T----AC-A-CA--TT-A---T--T------A-AT--AA--T-CTACCATCTGTATGTCAAA
gi|143660                     :            aaAAA-A-AA-C---A-A---AGCTTAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCT-TA-G-A--T---TA----A-----TT-G---G----AC-A-TA--TT-T---C--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCGAG-ATGT
gi|143661                     :             aAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGG-AAGTTGAG--A--CTTCT-TA-G-T--A---TA----A-----GT-C---T----AC-A-G--------------------------AA--T-TTA-CGCCAC-ATGTAAAA
gi|143662                     :               aA-A-AA-C---A-A---AACTTAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-TA-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--CT-A---C--T------G-AT--AA--A-TTA-CACCAG-CTGACAAA
gi|143663                     :           aatAAA-A-AA-A---G-A---AGTTAAA-----CAA-AAGCTGAG--A--CTTAA-TATG-T--A---CA----C-----GT-G---T----AC-A-AA--TT-A---T--T------G-AT--AA--T-TTT-CGCGAG-ATGTAAAA
gi|143664                     :             aAAA-A-AATC---A-A---AGCTCAAA----CTA-AACCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----AATAC-AT-G---T----AT-ACGATTTT-T---T--T------T-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGCCAAA
gi|143665                     :              AAA-A-AA-C---A-ACA-AGCTGAAT----CAA-AAGCTGAT--A--CTTTA-TT-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------T-AT--AA--A-TTA-TGCCAG-ATGTTAAA
gi|143666                     :             aAAA-ATAA-C---A-A---AGCTAAAA----CAA-AAGCAGAT--T--CTTCA-TA-A-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------A-AT--TA--C-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143667                     :              AAA-A-GA-C---A-A---AGCTCAA-----CGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TATATGA-----CT-G---T----GC-A-GA--TG-T---T--T------T-AT--CA--T-TTA-CACCAG-ATGTCAAA
gi|143668                     :             aAAA-A-AA-T---A-A---TGGTGAAA----CGA-AAACTGGG--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---C--C------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143669                     :             aAAATA-AG-C---A-A---AGCTTACA----CGA-AAGCAGAT--A--CTTCG-TA-G-A--T---CA----A-----------------------------T---T--T------G-AT--AT--A-TTA-CGCAAT-ATGTCAAA
gi|143670                     :                                        A----CGA-AAGCTGAT--A--CTTTA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---A----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAT-TTGGCAAA
gi|143671                     : aaaaagtcacttgAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----TGA-CAGCTGAG--A--CTTCT-TA-G-T--A---TA----A-----AT-A---T----AG-A-GA--TT-A---T--T------A-TT--AA--TCCTA-TGCCAG-AAGTAAAA
gi|143672                     :             aAAA-A-CA-C---A-A---AGATAAAA----CGA-AAGATAAT--A--CTTCA-T-----------------A-----AT-G---A----AC-A-TT--TT-T---T--TG-----G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143673                     :             aAAA-A-AA-T---A-A---AGTTAAA-----CAA-AAGCTGAG--A--CTTTA-AA-G-T--A---CA----C-----GT-G---T----AC-A-AA--TTATCAAT--T------G-AT--AA--T-TTT-CGTAAG-ATGTCAAA
gi|143674                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CAA-AAGCGGAG--A--CTTCA-TA-A-T--A---CA----A-----GG-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143675                     :              AAC-A-AA-T---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTTAA--A--CTTCA-TC-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-AT--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCCAG-ATGTTAAA
gi|143676                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAAAA--CGA-AGGCTAAG--A--CTTCA-AA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CTCCAG-ATGTAAAA
gi|143677                     :              AAA-A-AA-A---A-A---AGCTTAAA----CGA-AAGCAAAG--A--CT-----------------------------T-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-TGCCAG-ATGTCAAA
gi|143678                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTTTAC----CGA-AATCAGAG--A--GTTTA-TA-G-A--T---TA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--AT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTG-CGCCAA-A
gi|143679                     :              AAA-A-AA-A---A-A---AGCTAAAATAAACAA-AAGCTGTG--A--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CCCCAT-ATGTTA
gi|143680                     :              AAA-A-AA-C---A-A---CGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--TTTCA-TT-G-T--A---TA----A-----CT-G---T----AT-A-GA--TT-A---T--T------G-GT--GA--T-TTA-TATTAG-ATGTTAAA
gi|143681                     :              AAA-A-AA-T---A-A----GTTTAAA----CAA-AAGCTGAG--A--CTTTA-TA-G-T--A---CA----C-----GC-G---T----AC-A-AA--TT-A---T--T------G-AT--AC--T-TTT-TGCGAG-ATGTC
gi|143682                     :                            -A---AGCAAAAA----CAA-AAGCTGGA--A--CTTCA-TA-G-C--A---CA----T-----GT-A---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------G-GT--AA--T-TTT-CACCAG-ATGTAAAA
gi|143683                     :           aagAAA-A-AA-CT--A-A---AACTAAAA----TAA-AAGATAAG--A--TTTTA-TA-G-C--A---GA----A-----GT-G---G----AC-A-GA--TT-A---T--A------G-AT--AA--T-TTA-TGTCGG-ATGTCA
gi|143684                     :               AA-A-AA-G---A-A---A-CTGAAA----CAA-AGGCTAAG--A--TTTCA-TT-G-A--A---CA----A-----TT-G---T----AC-A-CA--TT-T---T--T------A-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATG
gi|143685                     :               AA-A-AA-C---A-A---AACTAAAA----CAA-AAGCTTAG--A--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GT-A--------AC-A-GA--CT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGTCAAA
gi|143686                     :               AA-A-AA-A---A-A---GGTTAAAA----CAA-AAGCTACG--A--CTTCA-AA-T-T--A---CA----G-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-GTGTCAAA
gi|143687                     :               AA-A-AA-A---A-A---A--TAACA----TGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT----------AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAG-ATGTAAAA
gi|143688                     :               AA-A-AA-CTGCA-C---AGCTAAAA----CAA-AAGCTGAG--A--TTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------G-
gi|143689                     :                A-A-AA-A---G-A---AGTTAAAA----CGA-AAGCTACG--A--CTTCA-CA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------T-AT--AA--T-TTA-CGCCcaagctac
gi|143690                     :                A-A-AA-C---A-A---AGTTAAAG----CGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-GA-G-T--A---TA----CT----GT-GATAT----AC-A-GA--TT-T---T--T--------ATTAAA--T-TTG--GTAAG-ATGTCAAA
gi|143691                     :                 -A-AA-A---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGATGAT--A--CTTTA-TA-A-C--A---TA----A-----CT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATG-CAAA
gi|143692                     :                 -A-AA-T---A-ATG-AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--TGACT-TA-G-A--A---CA----A-----AT-G---T----AC-A-GA--TA-T---T--T------G-AA--AA--T-TTA-CTCTTT-ATGTCCAA
gi|143693                     :                 -A-AA-A---A-A---ATCTGTGA----CGA-ATGCTGAA--AAATTTCA-TA-G-A--T---CA----G-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-G---T--T------G-AT--AA--A-TTA-AGT--A-ATGTAAAA
gi|143694                     :                   -AA-A---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGGT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----T-----GT-G---T----TC-A-CA--TT-------------------------T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143695                     :                        ---A-A---AACTAAAA----CGA-AAGCCGAT--A--CTTTG-TT-G-T--A---TA----A-----GA-G---A----AC-A-GA--TG-T---T--T------G-AT--AG--T-TTA-TGCAAG-ATGTCAAA
gi|143696                     :                                     AAAA----C-A-AAGCT----------TCA-TA-G-A--T---CA----A-----TT-A---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143697                     :                                 ttaaaAAA----CGT-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-----------------------------------C-A-GA--TT-T---T--T------GCAT---A--T-TTA-CGTCAG-ATGTCAAA
gi|143698                     :                                      AAA----C---AATTTGAG--A--CTTCA-TA-G-T--G---CA----A-----GT-A---T----AC-A-GA--TG-T---T--T------G-AT--AA--T-CTA-CGCCAG-ATG
gi|143699                     :                                      AAA----TGA-AAACTGAT--T--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CATCAA-ATGTAAAA
gi|143700                     :                                      AAA----TGA-AAACTGAG--A--CTTCA-TA-A-T--A---CA----A-----AT-G---------C-A-GA--TT-A---T--TCATATAT-AT--AA--T-TTA-CACCAG-AAGTCAAA
gi|143701                     :                                       AA----CGAGAAACTGCGGTA--CT--A-TA-T-T--AAATCA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------A-AT--AA--A-TTA-CACCAG-ATGTAAAA
gi|143702                     :                                        A----CGA-AAGCCGAG--T--CTTCA-TA-A----A---TC----A-----TT-C---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------C-AT--AA--T-TAA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143703                     :                                         ----CGA-AAGTTGAT--A--CTTCA-TA-G-TGTA---CA----GAGTATGT-G---T----AC-A-GA--TT-T---TTTT------G-AT--AA--T-TTA-CGCCTG-ATGTCAAA
gi|143704                     :                                                    CTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT-G---T----AC-A-TA--TA-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAA-ATGTAAAA
gi|143705                     :                                                     TGAG--A--CTTTA-TA-G-T--T---CA----A-----GT-G---T----AC-T-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGTAAAA
gi|143706                     :                                                       AA--A--CTTCA-GA---T--AT--CA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-CACCAG-GTGGCAAA
gi|143707                     :                                                         --A--CTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----TA-A-GG--TT-T---T--T------G-GT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATATCAAA


blockSeqs                     :                   T  T TGC   CTA        TAAA           GGT                  AAT  TATG AGTATG       ATAC           G     TT CATATA
blockSeqs                     :                   T  T T     CA         AA             G                    CT   .    ATACA        .              A     T  G     
blockSeqs                     :                   T  T .     TG         .              G                    T    .    TG           .              A     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    A    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              A                    T    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    T    .    A            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    A            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    A            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              A                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    C            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    A            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    C            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    A            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    A            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              A                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    C            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              A                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    C            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    A            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              T                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                   .  . .     .          .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                        .     .          .              A                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                              .          .              T                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                         .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                         .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                         .              G                    .    .    A            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                         .              T                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                         .              G                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                         .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                         .              T                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                         .              T                    .    .    T            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                         .              G                    .    .    G            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                                        A                    .    .    .            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                                        .                    .    .    .            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                                        .                    .    .    .            .              .     .  .     
blockSeqs                     :                                                                             .    .    .            .              .     .  .     


blockSeqCons                  :              
originalCons                  :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
finalCons                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA





Alignments
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lowQualScore                  :                 . .  . ... . ...    .   ....   .       ... ..     .  . . .. ...  .... ...... . ... ....  . .  ..  . ... .. ...... .  ..  .. .   .      .        
lowQualScore                  :                 6 8  8 666 6 666    6   8888   5       555 77     5  5 5 77 444  0000 888888 5 888 0000  5 5  77  4 888 11 999999 5  77  77 5   5      5        
consensus                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
Reference ( family-359 )      :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143625                     :                A-A-AA-C---A-A---AGCTTAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-GA-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-AA--TG-T---G--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCCAT-ATGTCAAA
gi|143626                     :            aaatA-A-AA-C---A-A---GGCCTAAA----CGA-AAGCTGAG--A--TTTCA-TA-GAT--A----A----A-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-G---T--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCGAG-ATGTTAAA
gi|143627                     :          aaatAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAG----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-CA-G-A--A---CA----A-----TT-G---T----AC-A-TA--TT-T---T--T------G-AT--AT--T-TTA-CGTTAG-ATGTAAAA
gi|143628                     :            aaAAA-C-AA-C---A-A---AGCTTAAA----CAA-AAGCTGAG--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----G-----AT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--GA--T-TTA-CACCAG-ATGTC
gi|143629                     :            aaAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CAA-AAGCTGAA--A--CTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GG--TT-T---C--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAG-
gi|143630                     :              aaA-A-AA-C---A-A---AGCTTAAA----CAA-AAGCTGAG--A--CTTCA-GA-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-GA---T-T---T--T------G-AT--CA--A-TTA-GGCCAT-ATGTCAAA
gi|143631                     :            aaatA-A-AA-C---A-A---AGCTTAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-TA---C--AT--CA----A-----TT-G---A----AC-A-GA--TT-T---T--C------G-AT--AA--C-TTA-TGCCTG-ATGGCAAA
gi|143632                     :            aaacA-A-AA-C---A-A---AACTTAAA----CGA-AAGCTGAG--A--ATTCA--G-G-A--A---AA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AG--AAAGT-AGA-CGCCAG-ATGTCA
gi|143633                     :          aaatAAA-A-AA-A---G-G---AACTTAAA----CAA-AAGCTGAG--A--CTTTA-TA-G-C--A---CA----C-----AT-G---T----AC-A-GA--TT-A---C--T------G-AT--AA--T-TTT-CGCGAG-ATGTCAAA
gi|143634                     :             aAAC-A-AA-T---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAACTGAG--A--CTTCA-TA-G-A--AA--CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TG-A---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAG-ATGACAAA
gi|143635                     :             aaAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----TGA-AAGCTGAT--A--CTTAA-TT-G-T--A---TA----A-----AT-G---T----AT-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGTCAAA
gi|143636                     :             aacA-A-AA-C---A-A---AGCTTAAA----CAA-GAGCTGAG--A--CTTCA-T----T--ACT-CA----G-----TT-G---T----AC-A-TT--TT-T---T--T------G-AC--AA--A-TAA-CACCAG-ATGTCAAA
gi|143637                     :          aaatAAA-A-AA-C---A-A----GCATAAA----CAA-AAGTTGAT--A--CTTCA-TA-G-A--C---CA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T---------T--GA----TTA-CGCCAG-ATAT
gi|143638                     :            aaAAA-A-AC-C---ACA---AGCTAAAA----CAA-AAGCTGCT--A--CTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---A----AC---CA--TT-T---T--T------A-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGTCAAA
gi|143639                     :            aaAAC-A-GA-C---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAT--A--ATTCA-TA-G-T--A---TA----T-----GT-G---T----AC-A-GA--TC-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATTTCAAA
gi|143640                     :            aaAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGTTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----T-----GT-T---G----AC-C-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAT-ATGTTAAA
gi|143641                     :            aaAAA-ATAA-C---A-A---AGCTGAAA----TGA-GAGCTGAT--A--CTTCA-AA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGTCAA-ATG
gi|143642                     :              aaA-A-CA-C---A-A---AGCTTAAA----CGA-AAGCAGAT--A--CTTCA-TA---T--AT--CA----A-----GT-T---T----AA-A-GA--TT-T---T--T------A-AT--CA--A-TTA-CGCTAG-ATGTCAAA
gi|143643                     :    aaaaaaatatAAA-A-AATC---A-A---AGCTTAAA----CAA-AAGCTGAA--A--CTGCAATG-A-T------CA----A-----TT-C---T----GC-A-GA--TT-C---T--T------G-AT--TA--T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143644                     :             aaAA-A-AA-C---A-A----GCTTAAA----CGA-AAGTTGGT--A--CTTCA-CA-G-T--A---TA----A-----GC-G---T----AT-A-GA--TT-T---T--T------A-AT--AA--T-TTA-CGCTAG-ATGTAAAA
gi|143645                     :           aagAAA-C-AATC---A-A---AGCTAAAA----TGA-AAGTTGAT--A--CTTCA-TA-A-T--A---TA----A-----GT-G---T----AC-T-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAG-ATGTAAAA
gi|143646                     :            aaAAA-ATAA-T---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAT--T--CTTTA-AA-G-T--A----------------T-A---T----ACGA-GA--TT-T---T--T------G-AG--AA--T-AAC-CACCAG-ATGTCAAA
gi|143647                     :             aAAA-A-AA-T---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAT--A--CTTGA-TA-G-A--A---TA----T-----GT-G---TATACAT-A-GA--TTGC---T--T------G-AT--AA--T-TTA-AGTCAG-ATGTCAA
gi|143648                     :            aaAAA-A-AC-C---A-A---AGCTTAAA----TGA-AAGTTAAG--A--GTTC--CA-A-T--A---TC----T-----GTAG---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-CTA-CGCCAG-CTGTAAAA
gi|143649                     :               aa-A-AA-A---A-A---AACGAAAA----CGA-AAACTTAG--A--CTTCG-TG-G-A--A---CA----A-----TT-A---T----AC-A-CA--AA-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAT-ATGTCAAA
gi|143650                     :                A-A-AT-C---A-A---AGCTAAAC----CGA-AAGCTGAT--A--TTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--CT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-GATAAA-ATATCAAA
gi|143651                     :           aaacAA-A-AA-C---A-A---AGATGAAA----CGA-AAGCTGAT--A--CTTTC-TA-G-T--A---TA----A-----GT-G---T----CC-C-GA--TT-T---T--T------T-AT--AT--T-TTA-TGCCAG-ATGTCAAA
gi|143652                     :           aatAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAACTCAG--A--CTTCG-CG-G-A--A---CA----T-----CT-T---A----AC-A-GA--TT-G---T--T------G-AT--AA--C-TTG-CACCAG-
gi|143653                     :            aaAAA-A-AA-C---A-G---AGCTAAAA----CGA-AAGC-------------A-TA-G-T--A---TA----A-----AT-G---T----AC-G-GA--TT-T---TT-T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAA-ATGTCAAA
gi|143654                     :            aaAAA-A-AA-A---A-A---AGTTTAAA----CAA-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----T-----GT-G---T----AC-A-G---TT-------------------------T-TTA-CGCTAG-ATATCAAA
gi|143655                     :              aaA-A-AA-C---A-G---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----T-----GT-G---T----TC-A-GA-----T---T--T------G-AT--AA--T-ATC-CGTCAG-ATGTTAAA
gi|143656                     :        aaaagcAAA-A-AA-C---G-A---AGTTAAAT----CGA-AAGTTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GC-G---T----AT-A-GA--TTAT---C--T------G--T--AG--T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143657                     :            aaAAA-G-AA-A---G-A---AGCTAAAA----CAA-AAGCTGAG--A--CTTTA-TA-G-T--A---CA----C-----GT-G---T----TC-A-GG--TT-A---T--T------G-AT--AA--T-TTT-GGAGAG-ATGTCAAA
gi|143658                     :             aaAA-A-AA-C---A-ACTAAACTTAAA----TGA-AATCTGAT--A--CTTAA-TA-G-T--A---AA----C-----GT-G---A----AC-A-GA--TT-G---T--T------G-AT--AA--T-CTA-GGCAAG-ATGTCAAA
gi|143659                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCCAAAA----CGA-AATACGAG--A--CTTCA-TT-G-T--A---CC----T-----TT-G---T----AC-A-CA--TT-A---T--T------A-AT--AA--T-CTACCATCTGTATGTCAAA
gi|143660                     :            aaAAA-A-AA-C---A-A---AGCTTAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCT-TA-G-A--T---TA----A-----TT-G---G----AC-A-TA--TT-T---C--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCGAG-ATGT
gi|143661                     :             aAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CGG-AAGTTGAG--A--CTTCT-TA-G-T--A---TA----A-----GT-C---T----AC-A-G--------------------------AA--T-TTA-CGCCAC-ATGTAAAA
gi|143662                     :               aA-A-AA-C---A-A---AACTTAAA----CGA-AAGCTGAG--A--CTTCA-TA-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--CT-A---C--T------G-AT--AA--A-TTA-CACCAG-CTGACAAA
gi|143663                     :           aatAAA-A-AA-A---G-A---AGTTAAA-----CAA-AAGCTGAG--A--CTTAA-TATG-T--A---CA----C-----GT-G---T----AC-A-AA--TT-A---T--T------G-AT--AA--T-TTT-CGCGAG-ATGTAAAA
gi|143664                     :             aAAA-A-AATC---A-A---AGCTCAAA----CTA-AACCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----AATAC-AT-G---T----AT-ACGATTTT-T---T--T------T-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGCCAAA
gi|143665                     :              AAA-A-AA-C---A-ACA-AGCTGAAT----CAA-AAGCTGAT--A--CTTTA-TT-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------T-AT--AA--A-TTA-TGCCAG-ATGTTAAA
gi|143666                     :             aAAA-ATAA-C---A-A---AGCTAAAA----CAA-AAGCAGAT--T--CTTCA-TA-A-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------A-AT--TA--C-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143667                     :              AAA-A-GA-C---A-A---AGCTCAA-----CGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TATATGA-----CT-G---T----GC-A-GA--TG-T---T--T------T-AT--CA--T-TTA-CACCAG-ATGTCAAA
gi|143668                     :             aAAA-A-AA-T---A-A---TGGTGAAA----CGA-AAACTGGG--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---C--C------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143669                     :             aAAATA-AG-C---A-A---AGCTTACA----CGA-AAGCAGAT--A--CTTCG-TA-G-A--T---CA----A-----------------------------T---T--T------G-AT--AT--A-TTA-CGCAAT-ATGTCAAA
gi|143670                     :                                        A----CGA-AAGCTGAT--A--CTTTA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---A----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAT-TTGGCAAA
gi|143671                     : aaaaagtcacttgAAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----TGA-CAGCTGAG--A--CTTCT-TA-G-T--A---TA----A-----AT-A---T----AG-A-GA--TT-A---T--T------A-TT--AA--TCCTA-TGCCAG-AAGTAAAA
gi|143672                     :             aAAA-A-CA-C---A-A---AGATAAAA----CGA-AAGATAAT--A--CTTCA-T-----------------A-----AT-G---A----AC-A-TT--TT-T---T--TG-----G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143673                     :             aAAA-A-AA-T---A-A---AGTTAAA-----CAA-AAGCTGAG--A--CTTTA-AA-G-T--A---CA----C-----GT-G---T----AC-A-AA--TTATCAAT--T------G-AT--AA--T-TTT-CGTAAG-ATGTCAAA
gi|143674                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAA----CAA-AAGCGGAG--A--CTTCA-TA-A-T--A---CA----A-----GG-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143675                     :              AAC-A-AA-T---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTTAA--A--CTTCA-TC-G-A--T---CA----A-----TT-G---T----AC-A-AT--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCCAG-ATGTTAAA
gi|143676                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTAAAAAA--CGA-AGGCTAAG--A--CTTCA-AA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CTCCAG-ATGTAAAA
gi|143677                     :              AAA-A-AA-A---A-A---AGCTTAAA----CGA-AAGCAAAG--A--CT-----------------------------T-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-TGCCAG-ATGTCAAA
gi|143678                     :              AAA-A-AA-C---A-A---AGCTTTAC----CGA-AATCAGAG--A--GTTTA-TA-G-A--T---TA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--AT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTG-CGCCAA-A
gi|143679                     :              AAA-A-AA-A---A-A---AGCTAAAATAAACAA-AAGCTGTG--A--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CCCCAT-ATGTTA
gi|143680                     :              AAA-A-AA-C---A-A---CGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--TTTCA-TT-G-T--A---TA----A-----CT-G---T----AT-A-GA--TT-A---T--T------G-GT--GA--T-TTA-TATTAG-ATGTTAAA
gi|143681                     :              AAA-A-AA-T---A-A----GTTTAAA----CAA-AAGCTGAG--A--CTTTA-TA-G-T--A---CA----C-----GC-G---T----AC-A-AA--TT-A---T--T------G-AT--AC--T-TTT-TGCGAG-ATGTC
gi|143682                     :                            -A---AGCAAAAA----CAA-AAGCTGGA--A--CTTCA-TA-G-C--A---CA----T-----GT-A---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------G-GT--AA--T-TTT-CACCAG-ATGTAAAA
gi|143683                     :           aagAAA-A-AA-CT--A-A---AACTAAAA----TAA-AAGATAAG--A--TTTTA-TA-G-C--A---GA----A-----GT-G---G----AC-A-GA--TT-A---T--A------G-AT--AA--T-TTA-TGTCGG-ATGTCA
gi|143684                     :               AA-A-AA-G---A-A---A-CTGAAA----CAA-AGGCTAAG--A--TTTCA-TT-G-A--A---CA----A-----TT-G---T----AC-A-CA--TT-T---T--T------A-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATG
gi|143685                     :               AA-A-AA-C---A-A---AACTAAAA----CAA-AAGCTTAG--A--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GT-A--------AC-A-GA--CT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGTCAAA
gi|143686                     :               AA-A-AA-A---A-A---GGTTAAAA----CAA-AAGCTACG--A--CTTCA-AA-T-T--A---CA----G-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-GTGTCAAA
gi|143687                     :               AA-A-AA-A---A-A---A--TAACA----TGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT----------AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAG-ATGTAAAA
gi|143688                     :               AA-A-AA-CTGCA-C---AGCTAAAA----CAA-AAGCTGAG--A--TTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------G-
gi|143689                     :                A-A-AA-A---G-A---AGTTAAAA----CGA-AAGCTACG--A--CTTCA-CA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------T-AT--AA--T-TTA-CGCCcaagctac
gi|143690                     :                A-A-AA-C---A-A---AGTTAAAG----CGA-AAGCTGAT--A--CTTCA-GA-G-T--A---TA----CT----GT-GATAT----AC-A-GA--TT-T---T--T--------ATTAAA--T-TTG--GTAAG-ATGTCAAA
gi|143691                     :                 -A-AA-A---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGATGAT--A--CTTTA-TA-A-C--A---TA----A-----CT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CGCCAG-ATG-CAAA
gi|143692                     :                 -A-AA-T---A-ATG-AGCTAAAA----CGA-AAGCTGAG--A--TGACT-TA-G-A--A---CA----A-----AT-G---T----AC-A-GA--TA-T---T--T------G-AA--AA--T-TTA-CTCTTT-ATGTCCAA
gi|143693                     :                 -A-AA-A---A-A---ATCTGTGA----CGA-ATGCTGAA--AAATTTCA-TA-G-A--T---CA----G-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-G---T--T------G-AT--AA--A-TTA-AGT--A-ATGTAAAA
gi|143694                     :                   -AA-A---A-A---AGCTAAAA----CGA-AAGCTGGT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----T-----GT-G---T----TC-A-CA--TT-------------------------T-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143695                     :                        ---A-A---AACTAAAA----CGA-AAGCCGAT--A--CTTTG-TT-G-T--A---TA----A-----GA-G---A----AC-A-GA--TG-T---T--T------G-AT--AG--T-TTA-TGCAAG-ATGTCAAA
gi|143696                     :                                     AAAA----C-A-AAGCT----------TCA-TA-G-A--T---CA----A-----TT-A---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-CGCCAG-ATGTAAAA
gi|143697                     :                                 ttaaaAAA----CGT-AAGCTGAT--A--CTTCA-TA-----------------------------------C-A-GA--TT-T---T--T------GCAT---A--T-TTA-CGTCAG-ATGTCAAA
gi|143698                     :                                      AAA----C---AATTTGAG--A--CTTCA-TA-G-T--G---CA----A-----GT-A---T----AC-A-GA--TG-T---T--T------G-AT--AA--T-CTA-CGCCAG-ATG
gi|143699                     :                                      AAA----TGA-AAACTGAT--T--CTTCA-TA-G-T--T---TA----A-----GT-G---T----AC-A-GA--TT-A---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CATCAA-ATGTAAAA
gi|143700                     :                                      AAA----TGA-AAACTGAG--A--CTTCA-TA-A-T--A---CA----A-----AT-G---------C-A-GA--TT-A---T--TCATATAT-AT--AA--T-TTA-CACCAG-AAGTCAAA
gi|143701                     :                                       AA----CGAGAAACTGCGGTA--CT--A-TA-T-T--AAATCA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------A-AT--AA--A-TTA-CACCAG-ATGTAAAA
gi|143702                     :                                        A----CGA-AAGCCGAG--T--CTTCA-TA-A----A---TC----A-----TT-C---T----AC-A-AA--TT-T---T--T------C-AT--AA--T-TAA-CGCCAG-ATGTCAAA
gi|143703                     :                                         ----CGA-AAGTTGAT--A--CTTCA-TA-G-TGTA---CA----GAGTATGT-G---T----AC-A-GA--TT-T---TTTT------G-AT--AA--T-TTA-CGCCTG-ATGTCAAA
gi|143704                     :                                                    CTGAT--A--CTTCA-TA-G-T--A---TA----A-----GT-G---T----AC-A-TA--TA-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-CACCAA-ATGTAAAA
gi|143705                     :                                                     TGAG--A--CTTTA-TA-G-T--T---CA----A-----GT-G---T----AC-T-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATGTAAAA
gi|143706                     :                                                       AA--A--CTTCA-GA---T--AT--CA----A-----TT-G---T----AC-A-GA--TT-T---T--T------G-AT--AA--A-TTA-CACCAG-GTGGCAAA
gi|143707                     :                                                         --A--CTTCA-TA-G-T--A---CA----A-----GT-G---T----TA-A-GG--TT-T---T--T------G-GT--AA--T-TTA-TGCCAG-ATATCAAA