lowQualScore : 22222222222222
lowQualScore : 5 111111 00 0 00 1 0 666 00 333 1 11111111 22222222222222 11 1 0 00 1 000 11
lowQualScore : . ...... .. . .. . . ... .. ... . ........ .............. .. . . .. . ... ..
lowQualScore : 9 444444 77 5 77 0 5 000 77 666 4 77777777 99999999999999 66 0 5 77 0 999 88
consensus : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
Reference ( gi|106066 ) : TTAAGGTAATTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106008 : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-GT--C-GG-ATTTT--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-AGCGTAAATT--AT-TA---AA--AATCT
gi|106009 : acTTAAGGTAGTTCG------TGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--TG--T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAATTT--AT-TA---AA--AATCT
gi|106013 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GA-A---T--T---A-TT--------T---GA---------C--A-TCA-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AA
gi|106044 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---TATT--------T---A----------C--A-TTT-AGCGTAAATT--GT-CA---AA--
gi|106007 : tTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GATCCT-AT--C-AG-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-GCT-GGCGTAGATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106045 : atTTAAGGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106046 : tTTAACATAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--CAGG-G---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATC
gi|106047 : tTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCGTAATTT--AT-CA---
gi|106014 : tTTAAGGTAGTTCG------AGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-CGCGTAATTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106026 : acTTAAGGTAATTTA------CGTT--GCTCTT-AT--C-AG-A---C--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106049 : acTTAAAGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GACGTAAA-T--ATGCA---AA--AATCT
gi|106021 : tTTAAGATAGTTTA------TGGT--GTTCCTTAT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106051 : acTTAAGGTAGTTTG------CAGC--CTGCCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TTT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AA
gi|106028 : tTTAAGGTA-TTTT------CGGC--ATTCCT-GT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TTT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106067 : acTTAAGGTAGTTTG------GGGC--ATTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------TTG-A----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-TA---AA--AAT
gi|106053 : TTAAGGTAGTTCG------CAGC--ATTCAT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAAAT--AT-AA---AA--AATC
gi|106052 : tTTAAGGTCGTTCG------CGGC--GTTCAC-AT--C-GG-A----------T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CC---AA--AA
gi|106055 : tTTAAGGTAGTTCG------TGGT--ATTC-T-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGAAAATT--AC-CA---AA--AATTT
gi|106017 : tTTAAGGCAGTTCA------CTGT--GTTCCT-GT--C-TG-A---TGTT---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106029 : atTTAAGGTAATTCG------CGGT--ATTTCT-TT--C-GG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--
gi|106023 : atTTATGGTAGCTTG------CTGT--GTTCCT-AT--C-TG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AGTCT
gi|106019 : atTTAAGGTTGTTTG------CGGT--GTTCTT-AT--T-GG-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-GGCGTAATTT--AT-CA---AA--AA
gi|106025 : atTTAAGATAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TC--------G---GA---------C--A-TCT-GGTGTTATTT--AT-AA---AA--AATCT
gi|106024 : atTTCAGGTAGCTCG------CAGT--GTACCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTTCA----------C--A-TCT-GACGAAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106068 : acTTAAGATAGTTTG------CAGT--GTTCCT-AC--T-GG-AA--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CG---GT--AATCT
gi|106020 : TTAAGGTAGTTCG------CGTT--GTTCCT-AA--C-GG-A---T--TTTGT-TT--------T---A----------C--A-TCT-AACGTAAAAT--AT-CA---AA--AAT
gi|106030 : atTTAAGGTAGTTTG------CGGT--GTTCCT-AC--A-CG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAACT--A--CA---GAT-AATCT
gi|106054 : atTTAAGGTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AT--C-GG-AT--T--T---T-TT--------T---G----------T--AGCCT-GGTGCAAGTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106069 : tTTAAGGTAGTTGG------CGGC--GTTCTT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCCTAATTG--AT-C----AA--AATCT
gi|106015 : TTAAGGTAGTTTAAAATTATGGC--GTTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCGTAAGTA--AT-TA---AA--AATTT
gi|106071 : atTTAATGTAGTTCT------AAGC--GTTCTT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GC---------C--A-AAT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106057 : TTAAA-TAATTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-----TAAATC--AT-CA---AA--AATCT
gi|106056 : tTTAAGGTAGTTCG------GTGC--GTTCCT-AT--C-GG-ATTTT--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAA
gi|106031 : tTTAAGGTAGTTGG------CAGT--GTATCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-TGCATAAACT--AT-CA---AA--CATCT
gi|106036 : atTTTAGTTAGTTCG------CGGC--GTTCAT-AT--C-GG-G---T--G---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGTGTAAATG--AT-AA---AA--CATCT
gi|106034 : acTTAAGGTAGTTCG------CAGC--GTTCCT-AT--C-GA-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-TGCGTAATAT--AT-CA---AATTGATCT
gi|106058 : atTTAAGGTAGTTTG------CGGT--GCTACT-AT--C-GG-A---T--TTG-T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAAAT--AT-
gi|106035 : tTTAAAGTAGTTCG------CGGC--GTTCTT-AT--T-GG-A---T--T---C-TT--------T---GA---------T--A-TCT-AGCGTAAA
gi|106072 : atTTAAGTTAGTTTA------CGGT--GTTGCT-GT--C-GG-A---T--TG--T-TT--------T---T----------C--A-TGA-GGCGTAAATT--AT-AA---AA--AATCT
gi|106016 : TTAAGGTAGTTCA------CGGC--GTTCTT-AG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-TACGAAAATT--AT-CA---A
gi|106059 : acTTACGGTCGTTCG------CGGT--CTTACT-TT--T-GG-A---T--T---T-TT--------TTT-A----------C--A-TCT-GGCGTAAATA--AT-CA---AG--AATCT
gi|106074 : tTTAGGATAGTTCG------GGAT--GTTCCT-AT--CCGA-A---T--T---G-TT--------T---GT---------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AT--CATCT
gi|106070 : TTAAAGTAGCTTG------TGAC--GTTCCC-AC--C-TG-A---T--TG--T-TT--------T---A----------C--A-TTT-GATGTAAATT--AT-CA---AT--AATCT
gi|106060 : TTCAGGTAGTTCG------CGGC--GCTATC-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTA-A----------C--A-TCT-GACGGATATT--AT-CA---AA--
gi|106061 : tTTAAGGTGGTTCG------CAGC--ATTCCT-AC--C-AG-A---T--T---T-TT--------A---A----------T--A-TATAGGTTTAAATT--AT-CA---AT--AATC
gi|106043 : tTTATGGTAATTCA-------GGC--ATTCCT-AG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-CGCGAAAATT--AT-CA---GT--AATCT
gi|106038 : acTTAAGGTAGCTCG------CAGT--GTTCTT-TT--C-TG-A---T--T---T-TG--------T---GA---------C--A-TCC-GACATAAATT--AT-CT---AT--AATCT
gi|106033 : atTTTAGGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-CT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TT---ACTTAATTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106037 : atTTAAGGTAGAGAG------CGGC--ATTCCT-AC--C-GG-A---C--A---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-AGCGTAATTG--AT-TA---AA--AATCT
gi|106040 : acTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GATCCT-GG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-CTCCAAAATT--AT-CA---AT--AACCT
gi|106062 : atTTAAGGTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AC--C-TG-A---T--T---T-CT--------G---GGGGTAAATAAC--A-TAT-GGGGTAAATT--AT-CA---AT--AATCT
gi|106073 : tTTAAGGTAGTTTG------CGGC--ATTTCT-AT--C-AG-AC--T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-TAC-CAAATTTAAT--A---AA--AATCT
gi|106022 : TTAAGGTAGTTTG------C-GT--ACTTCT-AT--T-GG-A---C--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-GGCATAATTT--AT-AA---AT--AATCT
gi|106063 : atTTAAGATAGTTTG------CGGT--GTTCAT-AT--T-GG-A---T--T---TGTT--------T---T----------C--A-TCT-GGCATATTTT--ATACAGATAA--AAT
gi|106076 : tTTAAGGTAGTTTG------CAGC--ATTCCT-AG--C-CA-A---T--A---T-TT--------G---A----------C--A-TTT-CGCGAAAATT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106039 : TTAAGCTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AT--C-TT-A---G--T---T-TTGTGACATCT---GGGACGA----C--A-TCT-GGTGTAAATC--AT-CA---AA--AATCT
gi|106077 : atTTAAGGTAGT-CG------CGGC--GTTTTT-ACAAT-AG-T---T--A---T-TT--------T---GT---------C--A-TCT-GGCGTTAATT--AT-GA---AT--AATCT
gi|106027 : TTGAGGGAGTTTG------CAGT--GTTCCT-AT--C-CA-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TGT-GGCGTAAATT--
gi|106041 : atTTACGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT-------A---T----------------------------------------T-GGTGTAAATT--AT-CA---AT--AATC
gi|106064 : atTTAAGATAGTTCA------TGAT--GTTACT-AT--C-GG-G---T--A---T-TT--------T---GA---------T--A-TTT-TATCTAAATT--AT-CA---AA--AGTCT
gi|106065 : tTTACGTTAGTTCG------CGGA--GGACCT-GT--C-AGTG---T--T---T-CT--------T---A----------C--A-TCT-CGCGTAATTT--AT-CA---GA--AAT
gi|106032 : tTTAAGGAAGTTCG------TGAT--GTTCCT-AC--C--C-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-AATATAAATC--AC-CA---AT--AATCT
gi|106012 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--T--G-A---T--T---T-
gi|106010 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCC---G--C-G-----------------------------A----------C--A-TCT-CGCAAAAAGT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106011 : atTAAGGTAGTTCG------CGGC--ATTCCT-AT--C-CG-AC--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCAAAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106079 : atcTAAGGAAGTTCG------CGGT--TTTTCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TT--------G---A----------T--A-TCT-GGCATAAATT--AC-CA---AA--AACCT
gi|106078 : TAAGGTAGTTCG------CGGT--GTTCGT-AT--C-G----------------T--------T---C----------C--A-TCT-GGCGTAGATT--AT-CA---AA--CATCT
gi|106050 : TAAGGTAGTTTT------AAGT--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---A----------CATA-TCT-GGCGT-AATC--A---A---AA--AATCT
gi|106042 : tcTAAGGTAGTTCG------CGGT--GTTCCT-GT--C-TG-A---C--G---T-TT--------G---GA---------C--A-TAA-AGAGTAAATT--TT-CA---AA--TATCT
gi|106080 : ataTACGGTAGGTTG------TGGC--ATTCCT-AT--C-AA-G---T--T---TATT--------T---A----------C--A-TCT-A----AAATT--AT-CA---AA--TATTT
gi|106048 : AAGGTAGTTCG------TGGC--GGTCCT-AT--C-GA-A---T--T---G-TT--------T---GA---------C--A-CCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106082 : tttaAAGGTAGTTCG------CGGC--TTTCCT-AT--C-GG-A---G--T---T-TT--------G---G----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-AA---AA--AA
gi|106083 : AAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTG-A----------C--A-TCT-GGAGTAATTT--AT-CA---
gi|106018 : AAGGTATTTAG------CGGA--GTTC-T-AT--C-GG-AA--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106084 : attaAAGGTATTTCC------CAGT--GTTCAT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------TT--A----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATC
gi|106085 : AAGGTATTTTG------CGGT--GCTCTT-AT--C-AG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-GCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AAT
gi|106081 : AAGGCAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-TA-A---T--T---A-TT--------G---A----------C--A-TCT-GACTTAAATT--AT-CA---AGC-AATCT
gi|106086 : GGTAGGTTG------CGGC--GTTCGT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------A--AATCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--GATCT
gi|106088 : GTAGTTCG------TGGT--GTTCCT-AT--C-GG-A---G--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGTGGTTATT--CT-CA---AA--AATCT
gi|106087 : GTAGTATG------CGGC--GTTCCT-AG--C-CT-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-CGCGAAAATT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106089 : GTAATTCT------CGGTCTGTTCAC-AT--C-GG-A---T--TAT-T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATC--A
gi|106075 : CA------CGAT--GTTCCC-TT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------CC-A-CCT-GGTGTAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106090 : ttaacatagGGT--ATTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGAGTAAATT--AT-CA---AA--AATTT
gi|106091 : --GTTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---T----------CC-A-TTT-GACGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
Alignments
lowQualScore : 22222222222222
lowQualScore : 111111 00 0 00 0 0 555 00 333 1 11111111 33333333333333 11 0 0 00 1 000 11
lowQualScore : ...... .. . .. . . ... .. ... . ........ .............. .. . . .. . ... ..
lowQualScore : 444444 66 5 66 9 5 999 66 555 4 77777777 00000000000000 66 5 5 77 0 999 88
consensus : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
Reference ( family-346 ) : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106007 : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GATCCT-AT--C-AG-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-GCT-GGCGTAGATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106008 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-GT--C-GG-ATTTT--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-AGCGTAAATT--AT-TA---AA--AATCT
gi|106009 : acTTAAGGTAGTTCG------TGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--TG--T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAATTT--AT-TA---AA--AATCT
gi|106010 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCC---G--C-G-----------------------------A----------C--A-TCT-CGCAAAAAGT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106011 : atTAAGGTAGTTCG------CGGC--ATTCCT-AT--C-CG-AC--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCAAAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106012 : atcTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--T--G-A---T--T---T-
gi|106013 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GA-A---T--T---A-TT--------T---GA---------C--A-TCA-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AA
gi|106014 : atTTAAGGTAGTTCG------AGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-CGCGTAATTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106015 : acTTAAGGTAGTTTAAAATTATGGC--GTTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCGTAAGTA--AT-TA---AA--AATTT
gi|106016 : atTTAAGGTAGTTCA------CGGC--GTTCTT-AG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-TACGAAAATT--AT-CA---A
gi|106017 : acTTAAGGCAGTTCA------CTGT--GTTCCT-GT--C-TG-A---TGTT---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106018 : atAAGGTATTTAG------CGGA--GTTC-T-AT--C-GG-AA--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106019 : attaTTAAGGTTGTTTG------CGGT--GTTCTT-AT--T-GG-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-GGCGTAATTT--AT-CA---AA--AA
gi|106020 : atTTAAGGTAGTTCG------CGTT--GTTCCT-AA--C-GG-A---T--TTTGT-TT--------T---A----------C--A-TCT-AACGTAAAAT--AT-CA---AA--AAT
gi|106021 : atTTAAGATAGTTTA------TGGT--GTTCCTTAT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106022 : acTTAAGGTAGTTTG------C-GT--ACTTCT-AT--T-GG-A---C--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-GGCATAATTT--AT-AA---AT--AATCT
gi|106023 : atTTATGGTAGCTTG------CTGT--GTTCCT-AT--C-TG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AGTCT
gi|106024 : atTTCAGGTAGCTCG------CAGT--GTACCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTTCA----------C--A-TCT-GACGAAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106025 : acTTAAGATAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TC--------G---GA---------C--A-TCT-GGTGTTATTT--AT-AA---AA--AATCT
gi|106026 : atTTAAGGTAATTTA------CGTT--GCTCTT-AT--C-AG-A---C--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106027 : acTTGAGGGAGTTTG------CAGT--GTTCCT-AT--C-CA-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TGT-GGCGTAAATT--
gi|106028 : atTTAAGGTATTTT-------CGGC--ATTCCT-GT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TTT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106029 : acTTAAGGTAATTCG------CGGT--ATTTCT-TT--C-GG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--
gi|106030 : atTTAAGGTAGTTTG------CGGT--GTTCCT-AC--A-CG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAACT--A--CA---GAT-AATCT
gi|106031 : atTTAAGGTAGTTGG------CAGT--GTATCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-TGCATAAACT--AT-CA---AA--CATCT
gi|106032 : atTTAAGGAAGTTCG------TGAT--GTTCCT-AC--C--C-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-AATATAAATC--AC-CA---AT--AATCT
gi|106033 : atTTTAGGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-CT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TT---ACTTAATTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106034 : atTTAAGGTAGTTCG------CAGC--GTTCCT-AT--C-GA-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-TGCGTAATAT--AT-CA---AATTGATCT
gi|106035 : atTTAAAGTAGTTCG------CGGC--GTTCTT-AT--T-GG-A---T--T---C-TT--------T---GA---------T--A-TCT-AGCGTAAA
gi|106036 : atTTTAGTTAGTTCG------CGGC--GTTCAT-AT--C-GG-G---T--G---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGTGTAAATG--AT-AA---AA--CATCT
gi|106037 : acTTAAGGTAGAGAG------CGGC--ATTCCT-AC--C-GG-A---C--A---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-AGCGTAATTG--AT-TA---AA--AATCT
gi|106038 : acTTAAGGTAGCTCG------CAGT--GTTCTT-TT--C-TG-A---T--T---T-TG--------T---GA---------C--A-TCC-GACATAAATT--AT-CT---AT--AATCT
gi|106039 : atTTAAGCTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AT--C-TT-A---G--T---T-TTGTGACATCT---GGGACGA----C--A-TCT-GGTGTAAATC--AT-CA---AA--AATCT
gi|106040 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GATCCT-GG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-CTCCAAAATT--AT-CA---AT--AACCT
gi|106041 : atTTACGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT-------A---T----------------------------------------T-GGTGTAAATT--AT-CA---AT--AATC
gi|106042 : atTAAGGTAGTTCG------CGGT--GTTCCT-GT--C-TG-A---C--G---T-TT--------G---GA---------C--A-TAA-AGAGTAAATT--TT-CA---AA--TATCT
gi|106043 : ataTTATGGTAATTCA-------GGC--ATTCCT-AG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-CGCGAAAATT--AT-CA---GT--AATCT
gi|106044 : acTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---TATT--------T---A----------C--A-TTT-AGCGTAAATT--GT-CA---AA--
gi|106045 : tTTAAGGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106046 : tTTAACATAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--CAGG-G---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATC
gi|106047 : tTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCGTAATTT--AT-CA---
gi|106048 : tAAGGTAGTTCG------TGGC--GGTCCT-AT--C-GA-A---T--T---G-TT--------T---GA---------C--A-CCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106049 : tttaTTAAAGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GACGTAAA-T--ATGCA---AA--AATCT
gi|106050 : tTAAGGTAGTTTT------AAGT--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---A----------CATA-TCT-GGCGT-AATC--A---A---AA--AATCT
gi|106051 : tcTTAAGGTAGTTTG------CAGC--CTGCCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TTT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AA
gi|106052 : tTTAAGGTCGTTCG------CGGC--GTTCAC-AT--C-GG-A----------T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CC---AA--AA
gi|106053 : tTTAAGGTAGTTCG------CAGC--ATTCAT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAAAT--AT-AA---AA--AATC
gi|106054 : tTTAAGGTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AT--C-GG-AT--T--T---T-TT--------T---G----------T--AGCCT-GGTGCAAGTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106055 : tTTAAGGTAGTTCG------TGGT--ATTC-T-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGAAAATT--AC-CA---AA--AATTT
gi|106056 : tTTAAGGTAGTTCG------GTGC--GTTCCT-AT--C-GG-ATTTT--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAA
gi|106057 : tTTAAA-TAATTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-----TAAATC--AT-CA---AA--AATCT
gi|106058 : tTTAAGGTAGTTTG------CGGT--GCTACT-AT--C-GG-A---T--TTG-T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAAAT--AT-
gi|106059 : tTTACGGTCGTTCG------CGGT--CTTACT-TT--T-GG-A---T--T---T-TT--------TTT-A----------C--A-TCT-GGCGTAAATA--AT-CA---AG--AATCT
gi|106060 : tTTCAGGTAGTTCG------CGGC--GCTATC-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTA-A----------C--A-TCT-GACGGATATT--AT-CA---AA--
gi|106061 : tTTAAGGTGGTTCG------CAGC--ATTCCT-AC--C-AG-A---T--T---T-TT--------A---A----------T--A-TATAGGTTTAAATT--AT-CA---AT--AATC
gi|106062 : tTTAAGGTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AC--C-TG-A---T--T---T-CT--------G---GGGGTAAATAAC--A-TAT-GGGGTAAATT--AT-CA---AT--AATCT
gi|106063 : tTTAAGATAGTTTG------CGGT--GTTCAT-AT--T-GG-A---T--T---TGTT--------T---T----------C--A-TCT-GGCATATTTT--ATACAGATAA--AAT
gi|106064 : tTTAAGATAGTTCA------TGAT--GTTACT-AT--C-GG-G---T--A---T-TT--------T---GA---------T--A-TTT-TATCTAAATT--AT-CA---AA--AGTCT
gi|106065 : tTTACGTTAGTTCG------CGGA--GGACCT-GT--C-AGTG---T--T---T-CT--------T---A----------C--A-TCT-CGCGTAATTT--AT-CA---GA--AAT
gi|106066 : tTTAAGGTAATTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106067 : TTAAGGTAGTTTG------GGGC--ATTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------TTG-A----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-TA---AA--AAT
gi|106068 : TTAAGATAGTTTG------CAGT--GTTCCT-AC--T-GG-AA--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CG---GT--AATCT
gi|106069 : TTAAGGTAGTTGG------CGGC--GTTCTT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCCTAATTG--AT-C----AA--AATCT
gi|106070 : TTAAAGTAGCTTG------TGAC--GTTCCC-AC--C-TG-A---T--TG--T-TT--------T---A----------C--A-TTT-GATGTAAATT--AT-CA---AT--AATCT
gi|106071 : TTAATGTAGTTCT------AAGC--GTTCTT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GC---------C--A-AAT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106072 : TTAAGTTAGTTTA------CGGT--GTTGCT-GT--C-GG-A---T--TG--T-TT--------T---T----------C--A-TGA-GGCGTAAATT--AT-AA---AA--AATCT
gi|106073 : TTAAGGTAGTTTG------CGGC--ATTTCT-AT--C-AG-AC--T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-TAC-CAAATTTAAT--A---AA--AATCT
gi|106074 : TTAGGATAGTTCG------GGAT--GTTCCT-AT--CCGA-A---T--T---G-TT--------T---GT---------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AT--CATCT
gi|106075 : TTAACATAG--CA------CGAT--GTTCCC-TT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------CC-A-CCT-GGTGTAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106076 : TTAAGGTAGTTTG------CAGC--ATTCCT-AG--C-CA-A---T--A---T-TT--------G---A----------C--A-TTT-CGCGAAAATT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106077 : TTAAGGTAGT-CG------CGGC--GTTTTT-ACAAT-AG-T---T--A---T-TT--------T---GT---------C--A-TCT-GGCGTTAATT--AT-GA---AT--AATCT
gi|106078 : TAAGGTAGTTCG------CGGT--GTTCGT-AT--C-G----------------T--------T---C----------C--A-TCT-GGCGTAGATT--AT-CA---AA--CATCT
gi|106079 : TAAGGAAGTTCG------CGGT--TTTTCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TT--------G---A----------T--A-TCT-GGCATAAATT--AC-CA---AA--AACCT
gi|106080 : TACGGTAGGTTG------TGGC--ATTCCT-AT--C-AA-G---T--T---TATT--------T---A----------C--A-TCT-A----AAATT--AT-CA---AA--TATTT
gi|106081 : AAGGCAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-TA-A---T--T---A-TT--------G---A----------C--A-TCT-GACTTAAATT--AT-CA---AGC-AATCT
gi|106082 : AAGGTAGTTCG------CGGC--TTTCCT-AT--C-GG-A---G--T---T-TT--------G---G----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-AA---AA--AA
gi|106083 : AAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTG-A----------C--A-TCT-GGAGTAATTT--AT-CA---
gi|106084 : AAGGTATTTCC------CAGT--GTTCAT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------TT--A----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATC
gi|106085 : AAGGTATTTTG------CGGT--GCTCTT-AT--C-AG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-GCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AAT
gi|106086 : GGTAGGTTG------CGGC--GTTCGT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------A--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--GATCT
gi|106087 : GTAGTATG------CGGC--GTTCCT-AG--C-CT-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-CGCGAAAATT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106088 : GTAGTTCG------TGGT--GTTCCT-AT--C-GG-A---G--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGTGGTTATT--CT-CA---AA--AATCT
gi|106089 : GTAATTCT------CGGTCTGTTCAC-AT--C-GG-A---T--TAT-T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATC--A
gi|106090 : GGT--ATTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGAGTAAATT--AT-CA---AA--AATTT
gi|106091 : --GTTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---T----------CC-A-TTT-GACGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
Alignments
lowQualScore : 22222222222222
lowQualScore : 111111 00 0 00 0 0 555 00 333 1 11111111 33333333333333 11 0 0 00 1 000 11
lowQualScore : ...... .. . .. . . ... .. ... . ........ .............. .. . . .. . ... ..
lowQualScore : 444444 66 5 66 9 5 999 66 555 4 77777777 00000000000000 66 5 5 77 0 999 88
consensus : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
Reference ( family-346 ) : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106007 : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GATCCT-AT--C-AG-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-GCT-GGCGTAGATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106008 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-GT--C-GG-ATTTT--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-AGCGTAAATT--AT-TA---AA--AATCT
gi|106009 : acTTAAGGTAGTTCG------TGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--TG--T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAATTT--AT-TA---AA--AATCT
gi|106010 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCC---G--C-G-----------------------------A----------C--A-TCT-CGCAAAAAGT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106011 : atTAAGGTAGTTCG------CGGC--ATTCCT-AT--C-CG-AC--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCAAAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106012 : atcTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--T--G-A---T--T---T-
gi|106013 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GA-A---T--T---A-TT--------T---GA---------C--A-TCA-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AA
gi|106014 : atTTAAGGTAGTTCG------AGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-CGCGTAATTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106015 : acTTAAGGTAGTTTAAAATTATGGC--GTTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCGTAAGTA--AT-TA---AA--AATTT
gi|106016 : atTTAAGGTAGTTCA------CGGC--GTTCTT-AG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-TACGAAAATT--AT-CA---A
gi|106017 : acTTAAGGCAGTTCA------CTGT--GTTCCT-GT--C-TG-A---TGTT---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106018 : atAAGGTATTTAG------CGGA--GTTC-T-AT--C-GG-AA--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106019 : attaTTAAGGTTGTTTG------CGGT--GTTCTT-AT--T-GG-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-GGCGTAATTT--AT-CA---AA--AA
gi|106020 : atTTAAGGTAGTTCG------CGTT--GTTCCT-AA--C-GG-A---T--TTTGT-TT--------T---A----------C--A-TCT-AACGTAAAAT--AT-CA---AA--AAT
gi|106021 : atTTAAGATAGTTTA------TGGT--GTTCCTTAT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106022 : acTTAAGGTAGTTTG------C-GT--ACTTCT-AT--T-GG-A---C--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-GGCATAATTT--AT-AA---AT--AATCT
gi|106023 : atTTATGGTAGCTTG------CTGT--GTTCCT-AT--C-TG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AGTCT
gi|106024 : atTTCAGGTAGCTCG------CAGT--GTACCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTTCA----------C--A-TCT-GACGAAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106025 : acTTAAGATAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TC--------G---GA---------C--A-TCT-GGTGTTATTT--AT-AA---AA--AATCT
gi|106026 : atTTAAGGTAATTTA------CGTT--GCTCTT-AT--C-AG-A---C--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106027 : acTTGAGGGAGTTTG------CAGT--GTTCCT-AT--C-CA-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TGT-GGCGTAAATT--
gi|106028 : atTTAAGGTATTTT-------CGGC--ATTCCT-GT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TTT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106029 : acTTAAGGTAATTCG------CGGT--ATTTCT-TT--C-GG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--
gi|106030 : atTTAAGGTAGTTTG------CGGT--GTTCCT-AC--A-CG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAACT--A--CA---GAT-AATCT
gi|106031 : atTTAAGGTAGTTGG------CAGT--GTATCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-TGCATAAACT--AT-CA---AA--CATCT
gi|106032 : atTTAAGGAAGTTCG------TGAT--GTTCCT-AC--C--C-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-AATATAAATC--AC-CA---AT--AATCT
gi|106033 : atTTTAGGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-CT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TT---ACTTAATTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106034 : atTTAAGGTAGTTCG------CAGC--GTTCCT-AT--C-GA-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-TGCGTAATAT--AT-CA---AATTGATCT
gi|106035 : atTTAAAGTAGTTCG------CGGC--GTTCTT-AT--T-GG-A---T--T---C-TT--------T---GA---------T--A-TCT-AGCGTAAA
gi|106036 : atTTTAGTTAGTTCG------CGGC--GTTCAT-AT--C-GG-G---T--G---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGTGTAAATG--AT-AA---AA--CATCT
gi|106037 : acTTAAGGTAGAGAG------CGGC--ATTCCT-AC--C-GG-A---C--A---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-AGCGTAATTG--AT-TA---AA--AATCT
gi|106038 : acTTAAGGTAGCTCG------CAGT--GTTCTT-TT--C-TG-A---T--T---T-TG--------T---GA---------C--A-TCC-GACATAAATT--AT-CT---AT--AATCT
gi|106039 : atTTAAGCTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AT--C-TT-A---G--T---T-TTGTGACATCT---GGGACGA----C--A-TCT-GGTGTAAATC--AT-CA---AA--AATCT
gi|106040 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GATCCT-GG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-CTCCAAAATT--AT-CA---AT--AACCT
gi|106041 : atTTACGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT-------A---T----------------------------------------T-GGTGTAAATT--AT-CA---AT--AATC
gi|106042 : atTAAGGTAGTTCG------CGGT--GTTCCT-GT--C-TG-A---C--G---T-TT--------G---GA---------C--A-TAA-AGAGTAAATT--TT-CA---AA--TATCT
gi|106043 : ataTTATGGTAATTCA-------GGC--ATTCCT-AG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-CGCGAAAATT--AT-CA---GT--AATCT
gi|106044 : acTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---TATT--------T---A----------C--A-TTT-AGCGTAAATT--GT-CA---AA--
gi|106045 : tTTAAGGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106046 : tTTAACATAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--CAGG-G---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATC
gi|106047 : tTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCGTAATTT--AT-CA---
gi|106048 : tAAGGTAGTTCG------TGGC--GGTCCT-AT--C-GA-A---T--T---G-TT--------T---GA---------C--A-CCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106049 : tttaTTAAAGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GACGTAAA-T--ATGCA---AA--AATCT
gi|106050 : tTAAGGTAGTTTT------AAGT--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---A----------CATA-TCT-GGCGT-AATC--A---A---AA--AATCT
gi|106051 : tcTTAAGGTAGTTTG------CAGC--CTGCCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TTT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AA
gi|106052 : tTTAAGGTCGTTCG------CGGC--GTTCAC-AT--C-GG-A----------T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CC---AA--AA
gi|106053 : tTTAAGGTAGTTCG------CAGC--ATTCAT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAAAT--AT-AA---AA--AATC
gi|106054 : tTTAAGGTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AT--C-GG-AT--T--T---T-TT--------T---G----------T--AGCCT-GGTGCAAGTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106055 : tTTAAGGTAGTTCG------TGGT--ATTC-T-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGAAAATT--AC-CA---AA--AATTT
gi|106056 : tTTAAGGTAGTTCG------GTGC--GTTCCT-AT--C-GG-ATTTT--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAA
gi|106057 : tTTAAA-TAATTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-----TAAATC--AT-CA---AA--AATCT
gi|106058 : tTTAAGGTAGTTTG------CGGT--GCTACT-AT--C-GG-A---T--TTG-T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAAAT--AT-
gi|106059 : tTTACGGTCGTTCG------CGGT--CTTACT-TT--T-GG-A---T--T---T-TT--------TTT-A----------C--A-TCT-GGCGTAAATA--AT-CA---AG--AATCT
gi|106060 : tTTCAGGTAGTTCG------CGGC--GCTATC-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTA-A----------C--A-TCT-GACGGATATT--AT-CA---AA--
gi|106061 : tTTAAGGTGGTTCG------CAGC--ATTCCT-AC--C-AG-A---T--T---T-TT--------A---A----------T--A-TATAGGTTTAAATT--AT-CA---AT--AATC
gi|106062 : tTTAAGGTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AC--C-TG-A---T--T---T-CT--------G---GGGGTAAATAAC--A-TAT-GGGGTAAATT--AT-CA---AT--AATCT
gi|106063 : tTTAAGATAGTTTG------CGGT--GTTCAT-AT--T-GG-A---T--T---TGTT--------T---T----------C--A-TCT-GGCATATTTT--ATACAGATAA--AAT
gi|106064 : tTTAAGATAGTTCA------TGAT--GTTACT-AT--C-GG-G---T--A---T-TT--------T---GA---------T--A-TTT-TATCTAAATT--AT-CA---AA--AGTCT
gi|106065 : tTTACGTTAGTTCG------CGGA--GGACCT-GT--C-AGTG---T--T---T-CT--------T---A----------C--A-TCT-CGCGTAATTT--AT-CA---GA--AAT
gi|106066 : tTTAAGGTAATTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106067 : TTAAGGTAGTTTG------GGGC--ATTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------TTG-A----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-TA---AA--AAT
gi|106068 : TTAAGATAGTTTG------CAGT--GTTCCT-AC--T-GG-AA--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CG---GT--AATCT
gi|106069 : TTAAGGTAGTTGG------CGGC--GTTCTT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCCTAATTG--AT-C----AA--AATCT
gi|106070 : TTAAAGTAGCTTG------TGAC--GTTCCC-AC--C-TG-A---T--TG--T-TT--------T---A----------C--A-TTT-GATGTAAATT--AT-CA---AT--AATCT
gi|106071 : TTAATGTAGTTCT------AAGC--GTTCTT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GC---------C--A-AAT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106072 : TTAAGTTAGTTTA------CGGT--GTTGCT-GT--C-GG-A---T--TG--T-TT--------T---T----------C--A-TGA-GGCGTAAATT--AT-AA---AA--AATCT
gi|106073 : TTAAGGTAGTTTG------CGGC--ATTTCT-AT--C-AG-AC--T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-TAC-CAAATTTAAT--A---AA--AATCT
gi|106074 : TTAGGATAGTTCG------GGAT--GTTCCT-AT--CCGA-A---T--T---G-TT--------T---GT---------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AT--CATCT
gi|106075 : TTAACATAG--CA------CGAT--GTTCCC-TT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------CC-A-CCT-GGTGTAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106076 : TTAAGGTAGTTTG------CAGC--ATTCCT-AG--C-CA-A---T--A---T-TT--------G---A----------C--A-TTT-CGCGAAAATT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106077 : TTAAGGTAGT-CG------CGGC--GTTTTT-ACAAT-AG-T---T--A---T-TT--------T---GT---------C--A-TCT-GGCGTTAATT--AT-GA---AT--AATCT
gi|106078 : TAAGGTAGTTCG------CGGT--GTTCGT-AT--C-G----------------T--------T---C----------C--A-TCT-GGCGTAGATT--AT-CA---AA--CATCT
gi|106079 : TAAGGAAGTTCG------CGGT--TTTTCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TT--------G---A----------T--A-TCT-GGCATAAATT--AC-CA---AA--AACCT
gi|106080 : TACGGTAGGTTG------TGGC--ATTCCT-AT--C-AA-G---T--T---TATT--------T---A----------C--A-TCT-A----AAATT--AT-CA---AA--TATTT
gi|106081 : AAGGCAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-TA-A---T--T---A-TT--------G---A----------C--A-TCT-GACTTAAATT--AT-CA---AGC-AATCT
gi|106082 : AAGGTAGTTCG------CGGC--TTTCCT-AT--C-GG-A---G--T---T-TT--------G---G----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-AA---AA--AA
gi|106083 : AAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTG-A----------C--A-TCT-GGAGTAATTT--AT-CA---
gi|106084 : AAGGTATTTCC------CAGT--GTTCAT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------TT--A----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATC
gi|106085 : AAGGTATTTTG------CGGT--GCTCTT-AT--C-AG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-GCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AAT
gi|106086 : GGTAGGTTG------CGGC--GTTCGT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------A--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--GATCT
gi|106087 : GTAGTATG------CGGC--GTTCCT-AG--C-CT-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-CGCGAAAATT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106088 : GTAGTTCG------TGGT--GTTCCT-AT--C-GG-A---G--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGTGGTTATT--CT-CA---AA--AATCT
gi|106089 : GTAATTCT------CGGTCTGTTCAC-AT--C-GG-A---T--TAT-T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATC--A
gi|106090 : GGT--ATTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGAGTAAATT--AT-CA---AA--AATTT
gi|106091 : --GTTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---T----------CC-A-TTT-GACGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
blockSeqs : AAATTA TTT TTG A GTGACATC GGGGTAAATAA AT G TT
blockSeqs : . TTT TG G . GGGACGA C A T
blockSeqs : . C AT A . TTCA C . C
blockSeqs : . A G . . TTA . . .
blockSeqs : . T G . . TAA . . .
blockSeqs : . T G . . TGA . . .
blockSeqs : . T . . . TGA . . .
blockSeqs : . T . . . GA . . .
blockSeqs : . A . . . AA . . .
blockSeqs : . C . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . AA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GC . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GT . . .
blockSeqs : . . . . . GT . . .
blockSeqs : . . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . GA . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : ***
originalCons : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
finalCons : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
Alignments
lowQualScore : 22222222222222
lowQualScore : 111111 00 0 00 0 0 555 00 333 1 11111111 33333333333333 11 0 0 00 1 000 11
lowQualScore : ...... .. . .. . . ... .. ... . ........ .............. .. . . .. . ... ..
lowQualScore : 444444 66 5 66 9 5 999 66 555 4 77777777 00000000000000 66 5 5 77 0 999 88
consensus : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
Reference ( family-346 ) : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106007 : TTAAGGTAGTTCG------CGGC--GATCCT-AT--C-AG-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-GCT-GGCGTAGATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106008 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-GT--C-GG-ATTTT--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-AGCGTAAATT--AT-TA---AA--AATCT
gi|106009 : acTTAAGGTAGTTCG------TGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--TG--T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAATTT--AT-TA---AA--AATCT
gi|106010 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCC---G--C-G-----------------------------A----------C--A-TCT-CGCAAAAAGT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106011 : atTAAGGTAGTTCG------CGGC--ATTCCT-AT--C-CG-AC--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCAAAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106012 : atcTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--T--G-A---T--T---T-
gi|106013 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GA-A---T--T---A-TT--------T---GA---------C--A-TCA-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AA
gi|106014 : atTTAAGGTAGTTCG------AGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-CGCGTAATTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106015 : acTTAAGGTAGTTTAAAATTATGGC--GTTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCGTAAGTA--AT-TA---AA--AATTT
gi|106016 : atTTAAGGTAGTTCA------CGGC--GTTCTT-AG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-TACGAAAATT--AT-CA---A
gi|106017 : acTTAAGGCAGTTCA------CTGT--GTTCCT-GT--C-TG-A---TGTT---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106018 : atAAGGTATTTAG------CGGA--GTTC-T-AT--C-GG-AA--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106019 : attaTTAAGGTTGTTTG------CGGT--GTTCTT-AT--T-GG-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-GGCGTAATTT--AT-CA---AA--AA
gi|106020 : atTTAAGGTAGTTCG------CGTT--GTTCCT-AA--C-GG-A---T--TTTGT-TT--------T---A----------C--A-TCT-AACGTAAAAT--AT-CA---AA--AAT
gi|106021 : atTTAAGATAGTTTA------TGGT--GTTCCTTAT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106022 : acTTAAGGTAGTTTG------C-GT--ACTTCT-AT--T-GG-A---C--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-GGCATAATTT--AT-AA---AT--AATCT
gi|106023 : atTTATGGTAGCTTG------CTGT--GTTCCT-AT--C-TG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AGTCT
gi|106024 : atTTCAGGTAGCTCG------CAGT--GTACCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTTCA----------C--A-TCT-GACGAAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106025 : acTTAAGATAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TC--------G---GA---------C--A-TCT-GGTGTTATTT--AT-AA---AA--AATCT
gi|106026 : atTTAAGGTAATTTA------CGTT--GCTCTT-AT--C-AG-A---C--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106027 : acTTGAGGGAGTTTG------CAGT--GTTCCT-AT--C-CA-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TGT-GGCGTAAATT--
gi|106028 : atTTAAGGTATTTT-------CGGC--ATTCCT-GT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TTT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106029 : acTTAAGGTAATTCG------CGGT--ATTTCT-TT--C-GG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--
gi|106030 : atTTAAGGTAGTTTG------CGGT--GTTCCT-AC--A-CG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAACT--A--CA---GAT-AATCT
gi|106031 : atTTAAGGTAGTTGG------CAGT--GTATCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-TGCATAAACT--AT-CA---AA--CATCT
gi|106032 : atTTAAGGAAGTTCG------TGAT--GTTCCT-AC--C--C-A---T--T---T-TT--------TA--A----------C--A-TCT-AATATAAATC--AC-CA---AT--AATCT
gi|106033 : atTTTAGGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-CT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TT---ACTTAATTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106034 : atTTAAGGTAGTTCG------CAGC--GTTCCT-AT--C-GA-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-TGCGTAATAT--AT-CA---AATTGATCT
gi|106035 : atTTAAAGTAGTTCG------CGGC--GTTCTT-AT--T-GG-A---T--T---C-TT--------T---GA---------T--A-TCT-AGCGTAAA
gi|106036 : atTTTAGTTAGTTCG------CGGC--GTTCAT-AT--C-GG-G---T--G---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGTGTAAATG--AT-AA---AA--CATCT
gi|106037 : acTTAAGGTAGAGAG------CGGC--ATTCCT-AC--C-GG-A---C--A---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-AGCGTAATTG--AT-TA---AA--AATCT
gi|106038 : acTTAAGGTAGCTCG------CAGT--GTTCTT-TT--C-TG-A---T--T---T-TG--------T---GA---------C--A-TCC-GACATAAATT--AT-CT---AT--AATCT
gi|106039 : atTTAAGCTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AT--C-TT-A---G--T---T-TTGTGACATCT---GGGACGA----C--A-TCT-GGTGTAAATC--AT-CA---AA--AATCT
gi|106040 : atTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GATCCT-GG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-CTCCAAAATT--AT-CA---AT--AACCT
gi|106041 : atTTACGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT-------A---T----------------------------------------T-GGTGTAAATT--AT-CA---AT--AATC
gi|106042 : atTAAGGTAGTTCG------CGGT--GTTCCT-GT--C-TG-A---C--G---T-TT--------G---GA---------C--A-TAA-AGAGTAAATT--TT-CA---AA--TATCT
gi|106043 : ataTTATGGTAATTCA-------GGC--ATTCCT-AG--C-CG-A---T--T---T-TT--------G---A----------C--A-TCT-CGCGAAAATT--AT-CA---GT--AATCT
gi|106044 : acTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---TATT--------T---A----------C--A-TTT-AGCGTAAATT--GT-CA---AA--
gi|106045 : tTTAAGGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106046 : tTTAACATAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--CAGG-G---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATC
gi|106047 : tTTAAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCGTAATTT--AT-CA---
gi|106048 : tAAGGTAGTTCG------TGGC--GGTCCT-AT--C-GA-A---T--T---G-TT--------T---GA---------C--A-CCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106049 : tttaTTAAAGTAGTTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GACGTAAA-T--ATGCA---AA--AATCT
gi|106050 : tTAAGGTAGTTTT------AAGT--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---A----------CATA-TCT-GGCGT-AATC--A---A---AA--AATCT
gi|106051 : tcTTAAGGTAGTTTG------CAGC--CTGCCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TTT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AA
gi|106052 : tTTAAGGTCGTTCG------CGGC--GTTCAC-AT--C-GG-A----------T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CC---AA--AA
gi|106053 : tTTAAGGTAGTTCG------CAGC--ATTCAT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGCATAAAAT--AT-AA---AA--AATC
gi|106054 : tTTAAGGTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AT--C-GG-AT--T--T---T-TT--------T---G----------T--AGCCT-GGTGCAAGTT--AT-CA---AC--AATCT
gi|106055 : tTTAAGGTAGTTCG------TGGT--ATTC-T-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGAAAATT--AC-CA---AA--AATTT
gi|106056 : tTTAAGGTAGTTCG------GTGC--GTTCCT-AT--C-GG-ATTTT--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAA
gi|106057 : tTTAAA-TAATTTG------CGGC--GTTCCT-AT--T-GG-AT--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-----TAAATC--AT-CA---AA--AATCT
gi|106058 : tTTAAGGTAGTTTG------CGGT--GCTACT-AT--C-GG-A---T--TTG-T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAAAT--AT-
gi|106059 : tTTACGGTCGTTCG------CGGT--CTTACT-TT--T-GG-A---T--T---T-TT--------TTT-A----------C--A-TCT-GGCGTAAATA--AT-CA---AG--AATCT
gi|106060 : tTTCAGGTAGTTCG------CGGC--GCTATC-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTA-A----------C--A-TCT-GACGGATATT--AT-CA---AA--
gi|106061 : tTTAAGGTGGTTCG------CAGC--ATTCCT-AC--C-AG-A---T--T---T-TT--------A---A----------T--A-TATAGGTTTAAATT--AT-CA---AT--AATC
gi|106062 : tTTAAGGTAGTTTG------TGGT--GTTCCT-AC--C-TG-A---T--T---T-CT--------G---GGGGTAAATAAC--A-TAT-GGGGTAAATT--AT-CA---AT--AATCT
gi|106063 : tTTAAGATAGTTTG------CGGT--GTTCAT-AT--T-GG-A---T--T---TGTT--------T---T----------C--A-TCT-GGCATATTTT--ATACAGATAA--AAT
gi|106064 : tTTAAGATAGTTCA------TGAT--GTTACT-AT--C-GG-G---T--A---T-TT--------T---GA---------T--A-TTT-TATCTAAATT--AT-CA---AA--AGTCT
gi|106065 : tTTACGTTAGTTCG------CGGA--GGACCT-GT--C-AGTG---T--T---T-CT--------T---A----------C--A-TCT-CGCGTAATTT--AT-CA---GA--AAT
gi|106066 : tTTAAGGTAATTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106067 : TTAAGGTAGTTTG------GGGC--ATTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------TTG-A----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-TA---AA--AAT
gi|106068 : TTAAGATAGTTTG------CAGT--GTTCCT-AC--T-GG-AA--T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CG---GT--AATCT
gi|106069 : TTAAGGTAGTTGG------CGGC--GTTCTT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TAT-GGCCTAATTG--AT-C----AA--AATCT
gi|106070 : TTAAAGTAGCTTG------TGAC--GTTCCC-AC--C-TG-A---T--TG--T-TT--------T---A----------C--A-TTT-GATGTAAATT--AT-CA---AT--AATCT
gi|106071 : TTAATGTAGTTCT------AAGC--GTTCTT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---GC---------C--A-AAT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106072 : TTAAGTTAGTTTA------CGGT--GTTGCT-GT--C-GG-A---T--TG--T-TT--------T---T----------C--A-TGA-GGCGTAAATT--AT-AA---AA--AATCT
gi|106073 : TTAAGGTAGTTTG------CGGC--ATTTCT-AT--C-AG-AC--T--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-TAC-CAAATTTAAT--A---AA--AATCT
gi|106074 : TTAGGATAGTTCG------GGAT--GTTCCT-AT--CCGA-A---T--T---G-TT--------T---GT---------C--A-TCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AT--CATCT
gi|106075 : TTAACATAG--CA------CGAT--GTTCCC-TT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---G----------CC-A-CCT-GGTGTAATTT--AT-CA---AA--AATCT
gi|106076 : TTAAGGTAGTTTG------CAGC--ATTCCT-AG--C-CA-A---T--A---T-TT--------G---A----------C--A-TTT-CGCGAAAATT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106077 : TTAAGGTAGT-CG------CGGC--GTTTTT-ACAAT-AG-T---T--A---T-TT--------T---GT---------C--A-TCT-GGCGTTAATT--AT-GA---AT--AATCT
gi|106078 : TAAGGTAGTTCG------CGGT--GTTCGT-AT--C-G----------------T--------T---C----------C--A-TCT-GGCGTAGATT--AT-CA---AA--CATCT
gi|106079 : TAAGGAAGTTCG------CGGT--TTTTCT-AT--C-GG-A---C--T---T-TT--------G---A----------T--A-TCT-GGCATAAATT--AC-CA---AA--AACCT
gi|106080 : TACGGTAGGTTG------TGGC--ATTCCT-AT--C-AA-G---T--T---TATT--------T---A----------C--A-TCT-A----AAATT--AT-CA---AA--TATTT
gi|106081 : AAGGCAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-TA-A---T--T---A-TT--------G---A----------C--A-TCT-GACTTAAATT--AT-CA---AGC-AATCT
gi|106082 : AAGGTAGTTCG------CGGC--TTTCCT-AT--C-GG-A---G--T---T-TT--------G---G----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-AA---AA--AA
gi|106083 : AAGGTAGTTCG------CGGC--GTTCCT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------TTG-A----------C--A-TCT-GGAGTAATTT--AT-CA---
gi|106084 : AAGGTATTTCC------CAGT--GTTCAT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------TT--A----------C--A-TCT-GGCATAAATT--AT-CA---AA--AATC
gi|106085 : AAGGTATTTTG------CGGT--GCTCTT-AT--C-AG-A---T--A---T-TT--------T---GA---------C--A-GCT-GGTGTAAATT--AT-CA---AA--AAT
gi|106086 : GGTAGGTTG------CGGC--GTTCGT-AT--C-GG-A---T--T---T-TT--------T---GA---------A--A-TCT-GGCGTAAATT--AT-CA---AA--GATCT
gi|106087 : GTAGTATG------CGGC--GTTCCT-AG--C-CT-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-CGCGAAAATT--AT-CA---AT--AATTT
gi|106088 : GTAGTTCG------TGGT--GTTCCT-AT--C-GG-A---G--T---T-TT--------T---GA---------C--A-TCT-GGTGGTTATT--CT-CA---AA--AATCT
gi|106089 : GTAATTCT------CGGTCTGTTCAC-AT--C-GG-A---T--TAT-T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGTGTAAATC--A
gi|106090 : GGT--ATTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---A----------C--A-TCT-GGAGTAAATT--AT-CA---AA--AATTT
gi|106091 : --GTTCCT-AT--C-AG-A---T--T---T-TT--------T---T----------CC-A-TTT-GACGTAAATT--AT-CA---AA--AATCT