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gi|74035 : A--AAAAAAT------AAAATT--TTCGCCGACT--CGTGTTAGGGATGGTTCTGGTGCTCCAAGTATCGGACGAAAACC-ATTATA-TGGAA-CTGTATACCAAAGACGA------------------A--------A----C----TTTCAG-AAAAGTGGGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAA-A-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGG--GA-AAAA-----AGA--AATGACACAAAATCGTTTCTGAAATTGTTACAGTA------TT------TATTC-TTTCTATATTTCAACTA----AATTATAATTATTAAATCATTTGCAAACTAGACATTGAACGTTCCTCGGCAATA-A-G--TT-ATAACA--TGAGGAAATTCTTGTTGAATCTCCAAGGA-AT---C-T-ATTCATC-ACGA--ATCGTTCACCAT--T-TT--TT----
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gi|74037 : --AAAAAAT-----AAACAAT--TTCGCCGACTGTCGTGTTAGGGATGGTTTGGGTGCTCCAAGTATTGGGC-AAAACC-AATATA-TAAAA-CTGTATACCAAAGACGATA-TTGAAC-ACGTCCAAA--------A----C----TTTTAG-AAAAGTGTGACTTGAAATT-GA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACG-AAAA-A-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---ATGT--GA-AAA------AGA--AACGACACAAAATCGTTTCTGAAATTATTACAGTA------TTAATTTTTATTC-TTTCTACATTTCAACGC----AATTATGATTATTAAATCATTTGCAAACTAGACATAGAACATTCCTCGGCAATA-A-G--TT-ATAACA--CGAGGAAATTCTTGTTGAATCTCCAGGGA-AT---C-T-ATTCATC-GCGA--ATTCTTCGCCAT--T-TTTCTT----G-TA-TAAGGT-A-TCGAGGCGCGCA--TGCAC-AAC----TTT-CTAATCTT-GGT-------T------TAAACT----T----C----GG------G-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CCT--TAT-----T-----T-----GT------C-----G----TGTTGTTTT
gi|74038 : TT----AAAAAATATTTCGCAGACTGTCATGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAG
gi|74039 : AAAAT--TTCGCCAACTGTCGTGTTAGGGATGGTTCGGGTGCTCCAAG
gi|74040 : GAAAATC-AATATA-TAACA-CTGTATACCAAAGACGATCTTT-----AC------ATGTCTAAAA----C----TTTTAG-AAGAGTGCGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ATTGTGCCACAAGACC-AAAA-A-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGT--GA-AAA------AGA--AATGACATAAAATCATTTCTGAAATTGTAACAGTA------TT------TATTC-TTTCTACATTTCAATGC----AATTATAATTATTAAATCATTTGCAAACTAGACATTGAACGTTCCTTGGCAATA-A-G--TT-ATAACA--TGAGGATATTCTTGCTGAATCTTGAAGGA-AT---C-T-ATTAATC-ACGA--ATCGTTCGCCAT--T-TT--CTTGTAC-TA-TAAGGT-A-TCGAGGCGCGCA--TGCGT-GAC----TTT-ATAATCTC-GGT-------T------TAAACA----T----C----GG------G-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CAG--TAT-----T-----T-----GC------T-----A----TGTTTTTTT
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gi|74057 : AATTTCGTGTTGAGTCTTCAAGGA-CA---C-T-TTTCATT-ACAA--ACCATTCCGCATAAT-TT--TT----T-CA-TAAGGT-A-T-GAGACGCGTA--TGCAC-AGC----TTT-TTAATACC-GGT-------T------TAAAAA----T----C----AG------G-----C----------------------------T-T----T---T-----CGG--TCT-----T-----caatttcgtgttgagtcttcaaggacacttttcattacaaaccattccgcataattttttcataaggtatgagacgcgtatgcacagctttttaataccggtttaaaaatcaggcttttcggtctt
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Reference ( family-344 ) : AAAAAA--AAAAAATT----AAAAAAT--TTCGCCGACTGTCGTGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAGTATCGGGCGAAAACC-AATATA-TAAAA-CTGTATACCAAAGACGAT------C------AC------A--------A----C----TTTTAG-AAAAGTGCGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGTGA-AAA------A--GA--AATGACNCAAAGTCGTTTCTGAAA-T-G-TTACGGTA------TT------TA-TTC-TTTCTATATTTCANCGC----AATTGTAATTATTAAATCATTTGCAAACTNGACATTGAACGTTCNTCGACGATA-A-G--TT-ATAACA--CGAGGAANTTCTTGTCGAGTCTCCGAGGA-AN---CT-T-TTCATT-ACGA--ATCGTTCGCCAT--T-TT--TT----C-TA-TAAGGT-A-TCGAGACGCGCA--TGCGC-GAC----NTT-TTAATACC-GGT-------T------TAAACA----T----C----GG------A-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CGG--TAT-----T-----T-----GC------C-----T----TGTTTTTTT
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gi|74042 : GAAAACC-AATATA-TAAAAACTGTATACCAAAGACGAT------CTTTAACACGTCCAAA--------A----C----TTTTAG-AAAAGTGCGACTTGAAATTCAA--AGCACA------ACTGTGCCACAAGACC-AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGTGA-AAT------T--GA--AATGACACAAAATCATTTCTGAAA-TAG-TTACAGTA------TT------TA-TTC-TTTCTACATATCAACGA----AATTATAAT
gi|74043 : -AATATAATAAAA-TTGTATATCAAAGATGAT------CTTTA--AC------A--------AGGCCCAATATTTTTG-AAAAATGTGACTTGAAATTCTA--ATCACA------A-----------GACC-AAAAA-T---AAACAA-A----CTGA--AAAAAA-TTGTGA-AAA---------------TGA----AAGTCGCTTCTGAAA-TCG-TTACAGTACCTGTATT------TA-TTTATTTTTATGTTTCAATGT----AATAAATATCATTAAATCATTTGCAAACTAGACACTGATTGTTTCTCGACAATA-A-G--TT-ATAACA--CAAGGAAATACTTTTTAAATCTTTAAGGA-AT---CTAA-TTCATT-ACAA--ATCATTCGCCAT--T-TTG-TT----G-TA-TAAGGT-A-TCGAGTCGTGCA--TGTAC-AGA----TTT-TTAGTCCC-TGT-------T------TAAACA----T----C----AG------A-----C------T-------A-------T-----T-T----C---C-----CAA--CCT-----T-----T-----GC------C-----A----TGTGTTTTT
gi|74044 : ----TTTTAG-AAAA-TGCCAGTTGAA-TTCCG--GGCACA--------------TGAAAA---AAAAA-TGTGAGTCAA-TTT--CTAACCAAAATATCTGTCC-AAA------A--CA--AATG--CCAATGTTGTATCTGAAATT-G-TTAC
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gi|74046 : ----TTTTAATAAAAG--CAAGTTGAAATTCCA--GGAACATGAAATATT-TGGCCGA-GATCGAAAAA-T---AAACAA---------------A---CTGTGA-AAA------A--GA--AATGATCCAAAATCATTACCAAAA-TCG-TAATGGTA------TT------TA-TTT-TTTCTATATTTCATTGC-------TGTAAATAT---ATCAATTGTAAATTTGAC-TTAAACGTTGATCAAC--TT-A-A--TC-AT---------GCAATTTCTTATTGAGTCTCTAAGGA-CA---CT-T-TTCATT-TCAA--AGCATTCGGCAT--A-TT--T-------TA-TAATCT-A-TCAA
gi|74047 : -AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAA----CTGTAATAAA------A--GA--AATGATTCAAAGTCATT--------------ACGGTA------TT------TA-TTC-TTT------------GC----A-TTGCG--TATAAAATTATGT----------CATTTAACATTCATCAGCGATA-A-C--TTTATTATG--C----AATTTCTTGTAGAGCTTCCAAGGA-TA---TT-T-TTCATT-ACAA--AGCGTTCAGCAT--A-AT--TT----C-TA-TAAGGT-A-TTGAGACACGCA--TGCGC-AGC----TTT-TTAATGTT-GGT-------T------TAAAAA----T----C----GG------A-----C------T-------G-------T-----T-TAGTCT---T-----CGG--CATA----T-----T-----TC------C-----C----GATCTTTTT
gi|74048 : ttggccaagattaAGATC-AAAAAAT---AAACAA-T----CTG----------CTA-AA-AAA------A--GT--AATGATCCAAAGTCATT----AA----------GGTA------TT------TA-TTC-TCTCTATATTTCATTGC-------TGTAA--AT---ATAATTTGTAAATTTGATATTTAACGGTCATCAATGATA-ACT--TT-ATAATG--C----AATTTCTTGTCGAGTCTCCAAGGA-CA---GT-T-TTCATT-ATAA--ACCATTCGGCATAAT-TT--TT------TA-TAAGCT-A-GTGAGACTCGCA--TGCGC-AGCATTTTTT-TTAATGCT-TGT-------T------TAAAAA----T----------A------A-----C------TTTTC---A-------G-----T-C----T---C-----CGGAATAT-----T-----A-----AC------G-----T----TTTTTTTTT
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gi|74052 : AGATC-AAAAAAT---AAACAA-T----CTGA--AAA----CTGTAA-AAA------A--GA--AATGATCCTAAGTCGTT--------------ACAGTA------TT------TA-TTC-TTTCTATATTTCATTGC-------TGTAAGTAT-----CATTTGTAAATTTGACATTTA-TGTTCATCAACAATA-A-C--TT--TATTA--TG--TAATTTCTTGTCTAGTCTCCAAGGA-CA---CA-T-TTCATT-ACAA--AGCGTTCGGTAT--TATT--TT---------------------------GCA--TGCAC-AGC----TTT-TGAATGTC-GGT-------T------AAAAAA----T----T----GG------A-----C------T-------G-------T-----A-T---------------GGAATAT-----T-----T-------------C-----C----TGTCTTTTTtt
gi|74053 : AGATCGAAAAA-T---AAAAAA-T----CTGA--AAA----CTGTAA-AAA------A--GA--AATGATCCAAAGTC-TTT-----A-T-G-TTA------------T------TACTTC-TTTCTTTATTTCATCG-------TTGTAA--AT---ATCGTTT-TAAATTTGACATTTAATGTT-ATCAACAA-A-A-A--TT-GTCATG--C----AATTTCTTGTCGAGTCTCGAAGGA-CA---TT-T-TTTATT-ACGA--AGCTTTTGGCAT--A-AA--TT----C-TA-TAAGGT-A-TCAAGACGCTCA--TGC
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gi|74055 : AGATA-AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAA----CTGTCA-AAA------A--GA--AATGATCCAAAGTC-------------G-TTACGGTA------TT------TA-CTC-ATTCTATATTTCATTGC-------TGTAAATATTA
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gi|74057 : AATTTCGTGTTGAGTCTTCAAGGA-CA---CT-T-TTCATT-ACAA--ACCATTCCGCATAAT-TT--TT----T-CA-TAAGGT-A-T-GAGACGCGTA--TGCAC-AGC----TTT-TTAATACC-GGT-------T------TAAAAA----T----C----AG------G-----C----------------------------T-T----T---T-----CGG--TCT-----T-----caatttcgtgttgagtcttcaaggacacttttcattacaaaccattccgcataattttttcataaggtatgagacgcgtatgcacagctttttaataccggtttaaaaatcaggcttttcggtctt
gi|74058 : aaaaataaacaatctaaaaacgataaaaaaaagtaatgatccaaagtcgttacggcatttattctttctatatttcattgctgtaaatattatttgtaaatttgc-AAAAG-T---AAACAA-T----CTGA--AAA----CTGTAA-AAA------A--GA--AATGATCCAATGTCGTTCC--------------GGTA------TT------TA-TTC-TTTCTATATTTCATTGC-------TGTAA--AT---ATCATTTATAAATTTGACATTTAGCGTACATCAACGATA-A-C--TT--TATCA--T--GCAATTTCTTTTTGAGT
gi|74059 : AA-G---AAACAG-T------GA--AAAA---TTGTCA-AAA------A--GA--ATTGACCCAAAGTTGTTTCTGAAA-T-GGTTACTGTA------TT------TA-TTC-ATTCTATATTTCAATGC----CATGACTATCATCATATTATTTGTAAATTTCACATTGAATTTTCATCCACGATC-A-G--TT-TTA
gi|74060 : AA-TC--AAACCACT----GTGA--AAAA---CTGTCT-AAACTTGCCA--GA--A-------GAAGTCGTATCCAAAA-T-A-TTACCGTA------TT------AA-TTC-TTTCTATCTTTTAACAC-------TGTAA--AT---ATCATT---AAACT-GACATTGGAAATTCATCAACAATACA-A--TT-A-AGCA--TGAGCAAGCTCTTGT---------------AA---CT-T-TTTATT-ACAA--AATGGACACCAT--T-TTG-TT----T-TA-TAAGGT-A-TTGAG
gi|74061 : ------A--GA--AATGATCCATAGTCGTTACCGAAA-TCG-TTACTGAA------TT------TA-TTC-TTTCTATACTTCATTG-------TTGTAAC------ACCATTTGTACATTTGACATTGAACTTTCATCAACAATA-A-C--TT-TTATCA--TGAACAATTTCTTATCGAGTCTCCGAGGA-CA---CT-T-TTCATT-ATAA--AGTGTGCGGCAT--A-TT--TT----T-TA-TACGGC-A-TCATGACGTGCA--TGCGC-AGC----TTT-CTTATGCT-GGT-------T------TAAA
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gi|74064 : AATTGTTACATAATTCGTAAAAT-GACATTGAACAACCTTCAACATTA-A-G--TG-TTTGCA--GAAAAAAGGTCT------ATATCTG-GGA-AA---CT-T-TTCGTT-ACAAT-AT-GACCGCCAT--T-TTG-TT----T-TA-AAAGGT-A-TTGAGTTGCGCA--TGCAT-CAC----TTG-CTGATTAT-TGT-------T------TAAACA----T----C----AA------A------------T-------A-------C-----T-T----T---C-----TGG--CCT-----T-----T-----
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gi|74112 : -TT--TT----C-TC-TAAGGT-A-TCAAGATGCATA--TGCAC-GCC----ATT-TTAATACC-AGT-------T------TAAACA----TAGGCC----GG------T-----C------C-------A-------TGTG--T-T----T---A-----CGG--TAT-----T-----
gi|74113 : -TT--TT----C-TG-TAAGGT-A-TTGAGACGCGCA--TGCGT-AAC----ATT-TAAATACA-AGT-------T------TAAACAACGGT----C----AG------T-----C------C-------AAG-----T-----T-T----TA--CGG---CGG--TAT-----TCCAG-T-----GC------CG----TTTA-TGTTTCTTT
gi|74114 : -TA-TAAGGT-A-TCGAGACGCGCA--TGCAT-GAC----ATT-TTAATACT-AGT-------T------TAAACA----
gi|74115 : -TCGAGACGCACA--TGCGC-GAC----ATT-TTAATACC-AGT-------T------TAAACA----T----A----GGC-----AGGTCTC------T-------G-------T-----T-T----T---TGCGG-CGG--TAT-----TCCCGGT-----GC------C-----------GTTT
blockSeqs : TT TTTGA AT G C A A TATTGAACACGTCCAAA GGCC AATA T AC TGAAAT G A GTG C TGAT CC ATAT T CTTGCC AA GT TA G TCTGAAATGG A CCTGTA AATTTT C A AC CATAAAT TT CAA A C G A C GCT TA TT GAGG A T A C CTCA A A G GG TC GC AA TC TGTAC ATTTT GG AGGGCAG TACCGA ACGG AGGC AGCT CCAGTCCCTGTTTTTACGG AA TCCCG CCCGGC GGAATA GTGGTT
blockSeqs : . T . G . . . TCTTTAACACGTCCGAA . . . . . G A G . TT . AAA . . A T CA G TCTGAAATGG A . . . . AT AAT TT TTA A C A A . CT A . GAGG A T A . T . . . T TT GC AA C AG T G . . . AGGC . CAGGTCTCTGTTTTTGCGG AA A CCCGGA . TATTA
blockSeqs : . T . G . . . TCTTTAACACGTCCAAA . . . . . G . C . . . A . . . T CA G TCTGAAATAG A . . . . AC AAT TT TAA A C G A . CT A . GAGG A T A . T . . . . TC GC AA G G T G . . . AGGC . TCAGTCCAAGTTTTACGG AA C CCCGGT . GTTTA
blockSeqs : . T . A . . . TCTTTACATGTCTAAA . . . . . G . . . . . A . . . . CA G TCTGAAATGG A . . . . TC AAT TT TAA A C G A . CA A . GAGA A T A . T . . . . TC GC AA G G T G . . . . . CCAGTCAAAGTTTTAGGG . . CCAGT . GTTTA
blockSeqs : . T . G . . . TCTTTAACA . . . . . G . . . . . A . . . . CA G TCTGAAATTG A . . . . AC AAT TT TAA A C G A . G A . GAGG A T A . T . . . . TC AC AA G G T A . . . . . CTGGTCCAAGTTTTACAG . . CCCT . ATT
blockSeqs : . T . G . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . CA G TCTGAAATTG A . . . . AC AAT TT TAA A C G A . G A . GAGG A T A . T . . . . TC AC . G G T G . . . . . CCGGTCAAAGTTTTAGGG . . CCCT . T
blockSeqs : . . . G . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . CA G TCTGAAATTA A . . . . AC TAA TT TAA A C G A . G A . GAGG A T A . T . . . . TT GC . G G T G . . . . . CCAGTCCATGTTTTACAA . . CACG . T
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . CA A TCTGAAATTG A . . . . AT AAT TT TAA A C G A . G A . GAGG A T A . T . . . . TC GC . G G T G . . . . . CCGGTCACAGTTTTACGG . . T . T
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . CA C TCTGAAATTG A . . . . AC AAT TA TAA A C G A . G A . GAAG A T A . T . . . . TT GC . G G T T . . . . . TCCATGTGTTCACAG . . T . T
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . CA A TCTGAAATAG A . . . . AC ATT TC TAA A C G A . G A . AAGG G T G . T . . . . TC GC . G G T T . . . . . TCCATGTTTTTACGG . . T . A
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . CA G TCTGAAATCG A . . . . AT AAT TC TAA T A A A . G A . AAAC T T A . A . . . . AT GC . G A T G . . . . . TCCAAGTTTTACGG . . T . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . TC G TCTGAAATTG G . . . . AC AAT AT AAA T A A G . G T . TATT T A A . A . . . . GC GG . G C T G . . . . . ACTGTTTAGTCTT . . T . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . TT G ACCAAAATCG G . . . . TT CAT CT CAT T A A G . G A . GAGC T C A . A . . . . GC AG . G T T T . . . . . ACTTTTCAGTCTC . . T . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . . . TC A TCTGAAATGG G . . . . TT AAT GT TAA T A A G . G A . GAAC T C A . A . . . . CC GG . G T T G . . . . . ACTTTTTGGTCTT . . T . A
blockSeqs : . . . . . . A . . . . TC A ACCGAAATCG G . . . . TT AAT TC TAA T A A G . A A . AAGG T C A . A . . . . CC GG . G T T G . . . . . TCCATGTGTTTA . . T . C
blockSeqs : . . . . . . A . . . . TC A TCCAAAATA G . . . . TT AT AT TAC T A A G . A A . AAGA T T A . C . . . . CC GG . G C T G . . . . . TCTATGTTTC . . T . T
blockSeqs : . . . . . . A . . . . TC G TCTGAAAT G . . . . TT GC AT TAA T G A A . C G . AAAA T C A . C . . . . GC AA . . T T G . . . . . GCTAATTTC . . T . T
blockSeqs : . . . . . . A . . . . TC G TATG A . . . . TT T TC T T A A A . C A . GATC T C A . A . . . . GC GG . . T T G . . . . . ACTATTTTC . . A . C
blockSeqs : . . . . . . A . . . . TC G AATG G . . . . TC T TT T T A A A . C A . GC C C A . A . . . . GC GG . . T T G . . . . . ACTATTTTC . . C . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . CG G ATG A . . . . TT . TT . T A A G . C T . GC T T A . A . . . . GT GT . . T T G . . . . . ACTATTTTC . . T . C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TC G AA G . . . . TT . TT . T A A G . A A . GT T T G . A . . . . CC CG . . G T G . . . . . GCTATTTTC . . T . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TC G CC G . . . . TT . TC . T A A G . C T . GC T T A . A . . . . CC CG . . T T T . . . . . GCTATTTTC . . T . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TC G G T . . . . TT . T . T A C A . G A . . G C A . A . . . . AT AC . . G T A . . . . . GCTATTTTC . . C . G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TC . G C . . . . TT . C . A A A A . A A . . T T G . T . . . . GT GG . . G T G . . . . . ACTATTTCC . . C . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . CC . G T . . . . AT . . . A A A A . C T . . A T A . T . . . . TC GC . . T T A . . . . . AGTATTTTG . . T . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TC . . A . . . . AC . . . T C A A . G . . . A T A . A . . . . GC GC . . T T A . . . . . GCTATTTTC . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . C . . . . . . . TT . . . . C A A . G . . . G C G . A . . . . GT GC . . T T A . . . . . ACTGTGTTC . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . T A A . G . . . A . G . A . . . . TA GG . . T T A . . . . . GCTATTTTC . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . AT . . . . A A G . G . . . T . G . A . . . . TC GT . . T T A . . . . . GCTATTTTC . . T
blockSeqs : . . . . . . . . A A . . C . G . C . . . . TC GC . . T T G . . . . . ACTGTTTT . . T
blockSeqs : . G . A . . . . T GC . . C T A . . . . . ACTGTTTC . . T
blockSeqs : G . A . . . . T GC . . T A T . . . . . ATACTTTC . . .
blockSeqs : . . C . . . . T GC . . T G A . . . . . ACTGTAT . .
blockSeqs : . . A . . . . T C . . T T A . . . . . CCAGTTC . .
blockSeqs : . . A . . . . T . . . T T A . . . . . ACTTTT . .
blockSeqs : . . . T . . . T A A . . . . . GCTTTT . .
blockSeqs : . T . . . G T G . . . . . GCTTTT . .
blockSeqs : . . . C T A . . . . . AATA .
blockSeqs : . . . C A A . . . . . TTTT .
blockSeqs : . . C A A . . . . . GC
blockSeqs : . . C A A . . . . . C
blockSeqs : . . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . A A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . G A A . . . . .
blockSeqs : . C T T . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . G A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C T A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . C A A . . . . .
blockSeqs : . . A A . . . . .
blockSeqs : . . A A . . .
blockSeqs : . . A A . .
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : AAAAAA--AAAAAATT----AAAAAAT--TTCGCCGACTGTCGTGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAGTATCGGGCGAAAACC-AATATA-TAAAA-CTGTATACCAAAGACGAT------C------AC------A--------A----C----TTTTAG-AAAAGTGCGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGTGA-AAA------A--GA--AATGACNCAAAGTCGTTTCTGAAA-T-G-TTACGGTA------TT------TA-TTC-TTTCTATATTTCANCGC----AATTGTAATTATTAAATCATTTGCAAACTNGACATTGAACGTTCNTCGACGATA-A-G--TT-ATAACA--CGAGGAANTTCTTGTCGAGTCTCCGAGGA-AN---CT-T-TTCATT-ACGA--ATCGTTCGCCAT--T-TT--TT----C-TA-TAAGGT-A-TCGAGACGCGCA--TGCGC-GAC----NTT-TTAATACC-GGT-------T------TAAACA----T----C----GG------A-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CGG--TAT-----T-----T-----GC------C-----T----TGTTTTTTT
finalCons : AAAAAA--AAAAAATT----AAAAAAT--TTCGCCGACTGTCGTGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAGTATCGGGCGAAAACC-AATATA-TAAAA-CTGTATACCAAAGACGAT------C------AC------A--------A----C----TTTTAG-AAAAGTGCGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGTGA-AAA------A--GA--AATGACNCAAAGTCGTTTCTGAAA-T-G-TTACGGTA------TT------TA-TTC-TTTCTATATTTCANCGC----AATTGTAATTATTAAATCATTTGCAAACTNGACATTGAACGTTCNTCGACGATA-A-G--TT-ATAACA--CGAGGAANTTCTTGTCGAGTCTCCGAGGA-AN---CT-T-TTCATT-ACGA--ATCGTTCGCCAT--T-TT--TT----C-TA-TAAGGT-A-TCGAGACGCGCA--TGCGC-GAC----NTT-TTAATACC-GGT-------T------TAAACA----T----C----GG------A-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CGG--TAT-----T-----T-----GC------C-----T----TGTTTTTTT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111
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lowQualScore : 99 33333 55 6 3 3 3 3333333333333333333333333333333 1111 7777 7 77 777777 5 4 4 8 222 4 8888 99 7777 9 4 888888 22 55 77 7 111111111111 8 888888 777777 3 3 55 9999999 2 11 666 0 4 0 1 5 3 5555 22 88 4444 0 5 4 1 9999 1 1 1 55 00 22 44 5 77 666666 5 5 5 77 5 22222 5 66 8888888 666666 2222 6666 2222 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 77777 66666666666 000000 7777777777
consensus : AAAAAA--AAAAAATT----AAAAAAT--TTCGCCGACTGTCGTGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAGTATCGGGCGAAAACC-AATATA-TAAAA-CTGTATACCAAAGACGAT------C------AC------A--------A----C----TTTTAG-AAAAGTGCGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGTGA-AAA------A--GA--AATGACNCAAAGTCGTTTCTGAAA-T-G-TTACGGTA------TT------TA-TTC-TTTCTATATTTCANCGC----AATTGTAATTATTAAATCATTTGCAAACTNGACATTGAACGTTCNTCGACGATA-A-G--TT-ATAACA--CGAGGAANTTCTTGTCGAGTCTCCGAGGA-AN---CT-T-TTCATT-ACGA--ATCGTTCGCCAT--T-TT--TT----C-TA-TAAGGT-A-TCGAGACGCGCA--TGCGC-GAC----NTT-TTAATACC-GGT-------T------TAAACA----T----C----GG------A-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CGG--TAT-----T-----T-----GC------C-----T----TGTTTTTTT
Reference ( family-344 ) : AAAAAA--AAAAAATT----AAAAAAT--TTCGCCGACTGTCGTGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAGTATCGGGCGAAAACC-AATATA-TAAAA-CTGTATACCAAAGACGAT------C------AC------A--------A----C----TTTTAG-AAAAGTGCGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGTGA-AAA------A--GA--AATGACNCAAAGTCGTTTCTGAAA-T-G-TTACGGTA------TT------TA-TTC-TTTCTATATTTCANCGC----AATTGTAATTATTAAATCATTTGCAAACTNGACATTGAACGTTCNTCGACGATA-A-G--TT-ATAACA--CGAGGAANTTCTTGTCGAGTCTCCGAGGA-AN---CT-T-TTCATT-ACGA--ATCGTTCGCCAT--T-TT--TT----C-TA-TAAGGT-A-TCGAGACGCGCA--TGCGC-GAC----NTT-TTAATACC-GGT-------T------TAAACA----T----C----GG------A-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CGG--TAT-----T-----T-----GC------C-----T----TGTTTTTTT
gi|74030 : AAAAAA--AAAAAATT----AAAATAA--TTCGCCGACTGTCGTGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAGTATCGGGCGAACACC-AATATA-TAAAA-ATGTATATCAAAGACGA----------------------A--------A----C----TTTTAG-AAAAGTGTGACTTAAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAAG-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGTGA-AAA------A--GA--AATGACACAAATTCGTTTCTAAAA-T-GGTTACATAA------TT------TA-TTC-TTTCTACATTTCAACGC----AATTATAATTATTAAATCATTTGCAAACTAGACATTGAATGTTCCTCGGCAATA-A-G--TT-ATAACA--CGAGGAAATTCTTGTTGAATCTCCAAGGA-AT---CT-A-TTCATC-GCGA--ATTGTTCGCCAT--T-TT--TT----G-TA-TAAGGT-A-TCGAGGCGCGCA--TGCGC-AAC----TTT-CTAATCTC-GGT-------T------TAAACA----T----C----AG------A-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CGG--TAT-----T-----T-----GC------C-----T----TGTTTTTTT
gi|74031 : aAAAAAA--AAAAAATT----AAAAAAA--TTCGCCGACTGTCGTGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAGTATGGGGCGAAAACC-AATATA-TAAAA-CTGTATAACAAAGACGA----------------------A--------A----C----TTTTAG-AAAAGTTTGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAAG-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGTGA-AAA------A--GA--AATAATACAAATTTGTTTCTGAAA-T-GGTTACAGTA------TT------TA-TTC-TTTCTACATTTCAACGC----AATTATAATTATCAAATCATTTGCAAATTAGACATTGAACGTTCCTCGGCAATA-A-G--TT-AAAACA--CGAGGAAATTCTTGTTGAATCTCCAAGGA-AT---CT-A-TTCATT-GCGA--ATCGTTCGCCAT--T-TT--TT----G-TA-TAAGGT-A-TCGAGGCACGCA--TGCGC-AAC----TTT-CTAATCTC-GGT-------T------TAAACA----T----C----GG------G-----C------T-------A-------A-----T-T----T---C-----CGG--TAT-----T-----T-----GC------C-----T----TGTTTTTTT
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gi|74033 : aAAAAAATTAAAAAATT----AAAAAAT--TTGGCCGACTGTCGTGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAGTATCGGGCGAACACCCAATATA-TAAAA-CCGTATACCAAAGACGA----------------------A--------A----C----TTTTAG-AAAAGTGCGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGTCTGAAGACC-AAAAG-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGTGA-AAA------A--GA--AATGACACAAATTCGTTTCTGAAA-TAG-TTACAGTA------TT------TA-TTC-TTTCTACATTTCAACAC----AATTATAATTATTAAATCATTTGCAAACTAGACATTGAATGTTCCATGGCAATA-A-G--TT-ATAACA--CGAGGA
gi|74033 : a-ACGAGGATCGTTCGCCAT--T-TT--TT----G-TA-TAAGGT-A-TCGAGGCGCGCA--TGCGC-AAC----TTT-CTAATCTC-GGT-------T------TAAACA----T----C----GG------A-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CGG--TAT-----T-----T-----GC------C-----T----TGTTTTTTTtcgttcgccattttttgtataaggtatcgaggcgcgcatgcgcaactttctaatctcggtttaaacatcggactattttccggtatttgccttgttttttt
gi|74034 : aaaaaaattaaaaaattaaaaaatttggccgactgtcgtgttagggatggttcaggtgctccaagtatcgggcgaacacccaatatataaaaccgtataccaaagacgaaacttttagaaaagtgcgacttgaaattcgaagcacaactgtgtctgaagaccaaaagtaaacaatctgaaaaactgtgaaaaagaaatgacacaaattcgtttctgaaatagttacagtatttattctttctacatttcaacacaattataattattaaatcatttgcaaactagacattgaatgttccatggcaataagttataacAAAAAA--GAAAAATT----AAAAAAT--TTCGCCGACTATCGTGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAGTATCGGGCGAAAACA-AATATA-TAAAA-CTGTATACAAAAGACGA----------------------A--------A---------TTTTAG-AAAAGTGCGACTTGAAATTCGA--AACACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAAG-T---GAACAA-T----CTGA--AAAA---CTATGA-AAA------A--GA--AATGACACAAATTCGTTTCTGAAA-T-GGTTACAGTA------TT------TA-TTC-TTTCTACATTTCATCGC----AATTATAATTATTAAATCATTTGCAAACTAGACATTGAATGTTCCTCGGCAATA-A-G--TT-ATAACA--CGAGAAAATTCTTGTTGAATCTCCAAGGA-AT---CT-G-TTCATC-GCGA--ATCGTTCGCCAT--T-TT--TT----G-TA-TAAGGT-A-TCGAGGCGCGCA--TGCGC-AAC----TTT-CTAATATC-AGT-------T------TAAACA----T----C----GG------A-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CGG--TAT-----T-----T-----GC------C-----T----TGTTTTTTT
gi|74035 : A--AAAAAAT------AAAATT--TTCGCCGACT--CGTGTTAGGGATGGTTCTGGTGCTCCAAGTATCGGACGAAAACC-ATTATA-TGGAA-CTGTATACCAAAGACGA----------------------A--------A----C----TTTCAG-AAAAGTGGGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGGGA-AAA------AA-GA--AATGACACAAAATCGTTTCTGAAA-TTG-TTACAGTA------TT------TA-TTC-TTTCTATATTTCAACTA----AATTATAATTATTAAATCATTTGCAAACTAGACATTGAACGTTCCTCGGCAATA-A-G--TT-ATAACA--TGAGGAAATTCTTGTTGAATCTCCAAGGA-AT---CT-A-TTCATC-ACGA--ATCGTTCACCAT--T-TT--TT----
gi|74036 : AAAAA--AAAAAGTTTTGAAAAAAAT--TTTGCCGACT--CGTGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAGTACCTGGCGAAAACC-AATATA-TAAAA-CTGTATAACAAAGACGA----------------------A--------A----C----TTTTAG-AAAAATGTGACTTGAAATTCGA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACC-AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---CTGTAA-AAA------A--GA--AATGACACAAAATCGTTTCTGAAA-TTG-TTACAGTA------TT------TA-TTC-TTTCTACATTTCAACGC----TAATATAATTATTAAATCATTTGCAAACTAGATATTGAACGTTCCTCGGCAATA-A-G--TT-ATAACA--TGAGGAAATTCTTGTTGAATCTCCAAGGA-AT---CT-A-TTCAGT-GCGA--ATCATTCACCAT--T-TT--TT----G-TA-TAAGGT-A-TCGAGGCGCGTA--TGCAC-AAC----TTT-CTAATCTC-GGT-------T------TAAACA----T----C----GG------G-----C--------------------------------------------------TAT-----T-----T-----GC------C-----A----TGTTTTTTT
gi|74037 : --AAAAAAT-----AAACAAT--TTCGCCGACTGTCGTGTTAGGGATGGTTTGGGTGCTCCAAGTATTGGGC-AAAACC-AATATA-TAAAA-CTGTATACCAAAGACGATATTGAAC------ACGTCCAAA--------A----C----TTTTAG-AAAAGTGTGACTTGAAATT-GA--AGCACA------ACTGTGCCTGAAGACG-AAAAA-T---AAACAA-T----CTGA--AAAA---ATGTGA-AAA------A--GA--AACGACACAAAATCGTTTCTGAAA-TTA-TTACAGTA------TTAATTTTTA-TTC-TTTCTACATTTCAACGC----AATTATGATTATTAAATCATTTGCAAACTAGACATAGAACATTCCTCGGCAATA-A-G--TT-ATAACA--CGAGGAAATTCTTGTTGAATCTCCAGGGA-AT---CT-A-TTCATC-GCGA--ATTCTTCGCCAT--T-TTTCTT----G-TA-TAAGGT-A-TCGAGGCGCGCA--TGCAC-AAC----TTT-CTAATCTT-GGT-------T------TAAACT----T----C----GG------G-----C------T-------A-------T-----T-T----T---C-----CCT--TAT-----T-----T-----GT------C-----G----TGTTGTTTT
gi|74038 : TT----AAAAAATATTTCGCAGACTGTCATGTTAGGGATGGTTCAGGTGCTCCAAG
gi|74039 : AAAAT--TTCGCCAACTGTCGTGTTAGGGATGGTTCGGGTGCTCCAAG
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gi|74112 : -TT--TT----C-TC-TAAGGT-A-TCAAGATGCATA--TGCAC-GCC----ATT-TTAATACC-AGT-------T------TAAACA----TAGGCC----GG------T-----C------C-------A-------TGTG--T-T----T---A-----CGG--TAT-----T-----
gi|74113 : -TT--TT----C-TG-TAAGGT-A-TTGAGACGCGCA--TGCGT-AAC----ATT-TAAATACA-AGT-------T------TAAACAACGGT----C----AG------T-----C------C-------AAG-----T-----T-T----TA--CGG---CGG--TAT-----TCCAG-T-----GC------CG----TTTA-TGTTTCTTT
gi|74114 : -TA-TAAGGT-A-TCGAGACGCGCA--TGCAT-GAC----ATT-TTAATACT-AGT-------T------TAAACA----
gi|74115 : -TCGAGACGCACA--TGCGC-GAC----ATT-TTAATACC-AGT-------T------TAAACA----T----A----GGC-----AGGTCTC------T-------G-------T-----T-T----T---TGCGG-CGG--TAT-----TCCCGGT-----GC------C-----------GTTT