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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|131458                     :     TTTTTT-TGT----T---TTTT------TTTC-AA-TT-----AC--C-----GTT---T-----A----G-CAA---C------------CCATTTATTTTCCC----CG--TGA-ACG-AGTG--TG--T-A---GCTG--G-TCGAGGAG-------GACC-A---T-CCC-----------ACCGCACAgatcgcatagttcacaa
gi|131459                     :       TTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AG-TC-----AC--C-----AAA---A-----ATATGG-TGA---C------------CCATTTAATCACCC----TG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGG---G--G--G-TTGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---CCA-ACAAACCGTACAAtttcacaa
gi|131460                     :       TTGT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AG-TC-----AC--C-----AAA---AATAT-A----G-TGA---C------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGG---G--G--G-TCTGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---CCA-ACAAACCGTACAA
gi|131461                     :     TTTTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131462                     :     TTTGTT-TTG----T---TTTT---A-ATTTC-AG-TC-----AC--C-----AAA---T-----ATAT-GCTGA---C------------CAATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGG---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---CCA-ACAAACCGTACAA
gi|131463                     :       TTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131464                     :       TTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131465                     :       TTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131466                     :       TTTC-TTT----A---TTTT---A-TTTTC-AA-CC-----AC--C-----ATC---A-----A----G-TGA---T------------TCATTTATTCACCC----CG--T-A-A----GTCGGTG--TAA---GACG--G-TCGAGTTA-------GACCAA---T-CTC---TCA-
gi|131467                     :     TTTTTT-TTT----T---TTTT------TTTC-AG-CT-----AC--C-----AAA---T-----G----G-TAA---C------------TCATTTATTCTCCT----CG--TCA-ATG-AGTG--TGT-TGT---G--G--G-TTGAGGaattttaatgcaccttgcaa
gi|131468                     :       TTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-AC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------TCATTTAATCACCC----CG--T-T-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-GCAAACCGTACAAa
gi|131469                     :       TCTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131470                     :       TTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATTACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131471                     :       TTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AT--T-----TAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTA--TG--TGA---T--G--G-TCGGGATG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131472                     :     TTTTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AG-TC-----AC--C-----AAA---A-----ATATGG-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGG---G--G--G-TCGGGGTG-------G
gi|131473                     : ttttTTTCTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAC---A-----A----G-TGA---T------------CCATTAAATCACCC----CG--T-A-ATT-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---CCA-ACAAACCGTACAAa
gi|131474                     :   ttttTTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-AGA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGTC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131475                     :     TTATTA-TTA----T---TTTT---A-ATTTC-AG-TC-----AC--C-----AAA---ACTAT-G----G-TGA---C------------ACATTTAATCACTC----TG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGG---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---CCA-ACAAACAGTACAA
gi|131476                     :     TTTTTT-TTT----T---TTTTTTCA-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-------T------------CAATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCAGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131477                     :      tTTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------AGCC-A---T-C
gi|131478                     :         TT-TTT----T---TTTC---A-GTTTC-AG-AC-----TC--C-----AAACTGG-----A----G-T-----C------------CCATTTATTCTCCC----CGTCT-C-AT--GCTG--TA--TGA---GC-G--G-TCGAGGAG-------GAAC-A---T-CAC---CAA-ATACAGCTTACAA
gi|131480                     :       TTTT-TTT----T---TTTA---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CTATTTAAACACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGTC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131481                     :      TTTAT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AG-TC-----AC--C-----AAA---A-----ATATGG-TGA---C------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TT--AGG---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---CCA-ACAAACCGTACAA
gi|131482                     :       TTAT-TTT----T---TTTC---A-GTTTC-AG--------AC--T-----TCA---A-----A----G-TGGAGTC------------CCATTTATTCTCCC----CG--T---CTC-GTGC--TGTATGAG--G--G--G-TCGAGGAG-------GAAC-A---TCCCC---TCATACAG--CTTACAA
gi|131483                     : ttttaTTTTT-TTT----T---TATT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--C-----TAATT-A-----ATG--G-TGA---T------------CTATTTATTTGCCC----CA--T-C-ATA-GGTT--TA--TGA---G--G--T-CCAGGGTG-------GACC-A---T-CTC---TCT-ATAAACATTACAA
gi|131484                     :     TTGTTT-TTT----T---TTTA---A-ATTTC-AA-AC-----AT--T-----AAA---T-----G----G-TGG---TACATTTAGTCACCCATTTAATCATCC----CG--T-G-ATA-GGTG--TA--TCA---A--G--G-TCGGGGCG-------AGCC-A---T-CCC---GCC-ATACACCTTACAA
gi|131485                     :        TTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TAA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---
gi|131486                     :      TTTTT-TTT----T---TGTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-AGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-AGA-AGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131487                     :     TTTCTT-TGTAATGT---TTTA---A-ATTTC-AA-CC-----AC--C-----AAT---AT----G----G-TGG---T------------CCATTTATTCACCC----TG--T-T-ATA-GGTG--TA--TGA---G--G--G-
gi|131488                     :       TTCT-TCT----T---TTTT------TTCC-AG-TT-----AC--CCTTT-G----------------G-CAA---C------------CCATTTATTCTCCC----CG--TAA-ATG-GGTG--TGT-TGC---G--G--G-TCGGGTCG-------GACC-A---T-CCC---ACC-GCACACCTCACAA
gi|131489                     :          T-TTT----G---TTTT---G-TTTTT-AAGCC-----AC--C-----TTA---A-----T----G-GGA---C------------CCATTTATTCTCCCTCATCG--T-ATATG-AG-----G--CAA---G--A--G-TTGGGGAG-------GACC-A---C-CCC---CTG-TCACACCGTATAA
gi|131490                     :       TTTT-GTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----CC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131491                     :       TTTT-TTT----T---TTTT------TTTG-AG-CT-----AC--C-----GTA---A-----C----G-TTG---C------------CCGTTTATT-ACCC----CG--T-A-ATG-GGTC--TG--CAG---G--G--G-CCAGGG-----------CC-A---T-CCC---GCT-GCAAACCGCACAA
gi|131492                     :       TTTT-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TCTGAAAAC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTCAATAACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TA--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCA-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131493                     :        TTA-TTT----T---TTTT---A--TTTG-AG-CT-----AC--C-----GTA---A-----G----G-TTG---C------------CCGTTTATT-ACCC----CG--T-A-ATG-GATC--TG--CAG---G--G--G-TCG----G-------GGCC-A---T-CCC---GCT-GCAAACCGCACAA
gi|131495                     :          T-TTT----T---TTTC---C-ATTTC-AG-CC-----AA--C-----TTA---A-----G----G-TGA---C------------CCATTTATTTTCCC----TG--T-C-ATA-GATG--AGA-CGA---G--G--G-TCGGGGAG-------GACC-A---C-CCCCTGTCA-ACA----GTACAA
gi|131496                     :         TT-TTT----T---TTTT-----ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----TG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--A--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131497                     :       TTTT-TTT----T---TTTA---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----AAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----TG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGAAG-------GGCC-A---T-CCT---TCA-ACAAACCGTACA
gi|131498                     :          T-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----AG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131499                     :          T-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TAA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CTC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131500                     :          T-TTT----T---TTAT---A-TTTTC-AA-TC-----AC--T-------A---A-----T----GTTGA---T------------CCATTTATTCACCC----TG--T-A-ATA-GGTG--TC--TGA---G--G--GTTCGGG
gi|131501                     :          T-TTA----T---TTTT---A-TTTTC-AA-CC-----AT--C-----------------ATTTTG-TGA---T------------TCATTTATCCACCC----CG--T-T-ATA-GGCG--TA--TG
gi|131502                     :       TTTT-TTT----T---TTTA---A-ATGCC-AA-CC-----AT--C-----AAA---ATTAATG----G-TGG---T------------CCGTTGAATCATCC----CA--T-A-GTA-GGTG--TT--TGA---G--G--G-TTGGAGTG-------GGCC-A---C-CCC---
gi|131503                     :        TTT-TTT----T---TTTC---A-GTTTC-AG-AC-----TC--C-------A---A-----A----G-TGGAGTC------------CCATTTATTCTCCC----CGTCT-C-AT--GCTG--TA--TGA---G--G--GTTCATGGAG-------GAAC-A---TCCCC---TCATACAG--CTTACAAatggtgcaccttaca
gi|131504                     :     TTTTTT-TTT----TCAATTTC---A-ATTTC-AA-TT-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131505                     :           -TTT----T---GTTG---ATATTTT-AA-CC-----AC--CATT--GAA----------------TGG---T------------CCGGTTATTCTCCC----CG--C-C-ACA-GGT----G--TGA---G--GAGG-TCGGGGAG-------TACC-----T-CCC---TCCTTCACACCGTACA
gi|131506                     :         TT-TTA----T---TTTG---C-ATTTC-AG-CC-----ACACC-----TTA---A-----G----G-TGG---C------------CCATTTATCCTCCC----CG--T-C-ATA-GGTG--AGA-CAA---G--A--A-TCGGGGAG-------GACC-
gi|131507                     :          T-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AA--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131508                     :         TT-TTT----T---TTTT---A-AATTT-AA-CC-----AC--C-----AAATT-A-----ATG--A-TGA---T------------CCATTTATTCACCC----TG--C-C-ATA-GGTT--TT--TGA---G--G--G-TAGGAGTT-------GTCC-A---T-CCC---TCC-ACAAACCTCACA
gi|131509                     :          T-TTT----T---TTTT---A-ATTTT-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TAA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131510                     :          T-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CGATTTAATCACCC----CA--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CTT---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131511                     :       TTTT-TTT----T---TTTT---C-AT-------TC-----AC--T-----AAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCG----TG--T-A-ATA-GGTT--TG--TGA---G--G--G-TCAGAGTG-------GGCC-A---T-CCC---
gi|131512                     :          T-TAT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-CC-----AC--C-----AAAT--G-----A----G--GG---T------------CCATTTATTCACCC----CG--T-T-TTA-TGTG--TA--TGG---A--G--G-TCGGTACG-------GGTT-A---T-CCC---TCT-ATACACC
gi|131513                     :              T----T---TTTT------TTTC-AG-TC-----AC--CCATTTGAA----------------TGA---T------------CCATTTCTTCTCCT----CG--T-C-CTA-GGTG--TG--CGG---G--G--G-TCGGGGAG-------GACC-A---C-CCC---CCtaattaca
gi|131514                     :             TT----T---TTTT---G-ATTTTTAA-CC-----AC--C-----AAT---G-----G----A-TAG---T------------CCGGTTATTCTCCC----CG--T-C-GTA-GGT----G--TGA---G--GAGG-TCGGGGAG-------GACC-----T-CCC---TCCTTCTCACCGTACAActacacccctttcaa
gi|131515                     :           -TTT----T---TCTT------TTCC-AG-AC-----AC--C-----CAT---TTT---A----G-TGA---C------------CCATTTATTCTCCC----CG--T-C-CTA-GGTG--TG--TGG---G--
gi|131516                     :         TT-GTT----T---TTTT--------------TC-----AC--C-----AAA---T-----G----G-TGG---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-AATG--TA--TGA---G--G--G-TCGGAATG-------GGTC-A---T-CCC---T
gi|131517                     :           -TTT----T---TTTC---A-ATTTA-AA-TC-----AC--T-----AAA---A-----A----G-TGA---C------------CTTTTTATTCACCC----CG--T-A-ATA-GGTT--TG--TTG---G--G--A-TCGGGAAG-------GACC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAAt
gi|131519                     :             TT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----CAA---A-----A----G-GGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ACA-GGTC--TG--TGA---G--G--A-TCGCGTTA-------GGCC-A---T-CCC---CCA-ACAAACCTTACA
gi|131520                     :              T----T---TTTT------TTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGG
gi|131521                     :          T-TTT----T---GTTG---A-ACCTC-----C-----AT--T-----GGA----------------TGG---T------------CCATTTATTCTCCC----CG--T-C-ATA-GGT----G--TGA---G--GAGG-TCAGGGAG-------GACC-A---C-CCT---CCT-TCACACCGTACAA
gi|131522                     :                               -ATTTC-AA-TC-----AC--T-----AAA---A-----T----A-TGA---T------------CTATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTT--TG--TGA---G--G--G-TCGCGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCATGCAA
gi|131523                     :      tcttT-TTT----T---TTTT---A-GCT-------------AC--C-----TTA---A-----G----G-TTG---C------------CCGTTTATT-ACCC----TG--T-A-ATG-GGTC--TG--CAG---G--G--G-CCGGGG-----------CC-A---T-CCC---ACT-GCAAACCGCACAA
gi|131524                     :                    ---TTTT------TTTT-AG-TC-----AC--C-----TTC---A-----G----A-TGA---T------------CAGTTTATTCTCCC----CG--T-T-ACATGG----TG--GGACAGG--G--G-TCGGGGAA-------CACC-A---T-CCC---CTG-TCACACCTTACA
gi|131525                     :           -TTT----T---TTTT---A-AC--C-AA-TT-----G--------------------------G-TGG---T------------CCATTTATTTACCA----CG--T-A-ATA-AGTG--AA--AGA---G--G--A-ACAGGGCG-------GGCC-A---T-ATC---TCA-ATATACCTCACA
gi|131526                     :                                  TTC-AG-CT-----AC--C-----GTA---A-----G----G-TGA---T------------CCATTTATT-ACCC----TG--T-A-ATT-GGTC--TG--CAA---G--G--G-TCA----G-------GGCC-A---T-CCC---GCT-ACCAACCACACAA
gi|131527                     :          ttcta----T---TTTA---A-ATTTC-AA-CC-----AC--C-----AAT---AT----G----G-TGG---T------------CCATTTATTCAACA----TG--T-T-ATA-GGTG--TA--TGA---G--G--
gi|131528                     :               ----T---TTTA---A-ATTTC-AA-CC-----AC--C-----AAT---AT----G----G-TGG---T------------CCATTTATTCAACA----TG--T-T-ATA-GGTG--TA--TGA---G--G--
gi|131529                     :                                 TTTT-AA-CC-----AC--T-----AAT---T-----G----A-TGG---T------------CCGTTTATTCTTCC----CG--T-C-ATA-GG----TG--TGA---GGAG--G-TCAGGCTGTTGGCGAGACC-ACTTT-CAC---TCA-CCA---CGTACA
gi|131530                     :                               ttTTTC-AA-CC-----AC--C-----AAT---AT----G----G-TGG---T------------CCATTTATTCAACC----TG--T-T-ATA-GGTG--TA--TGA---G--G--G-CCGGG
gi|131531                     :                                                                                                   TTTATTCTCCC----AG--T-T-ATA-GGT----G--TAA---G--GAGG-TCGGGGAG-------GACC-A---C-CCT---CCT-TCACACAGTACAA
gi|131532                     :                                                tttaaccactatttgatgggctg----G-TGA---C------------CCATTTATTCTCCC----TG--T-C-CTA-CGTG--TG--TTT---G--C--G-AAGGGG-G-------GACC-A---T-CCC---
gi|131533                     :                                                                   tttt----G-TGA---T------------CCATTTAATTACCC----CG--C-T-ATA-GGTT--TG--TGA---C--G--G-TCGGAGAG-------GACC-A---T-CCC---TCC-ACAAGCCTTACAcgtcacacct
gi|131534                     :                                                                     tg----G-CGG---T------------CCATGTAATCACTC----CG--T-A-ATA-GGTG--TA--TGA---G--G--G-CAGGGGTG-------CGCC-T---T-CCC---TCT-AAACACCTTACAA
gi|131535                     :                                                                     tg----G-TGA---T--------------ATTTTTTT-CCC----TG--T-C-CTA-GGTG--TG--CGG---G--G--G-TCGGGGAG-------GACC-A---T-CCC---CCT-ACACACCTTACAA
gi|131536                     :                                                                       ----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TTGGGGTG-------GGCC-A---T-CCT---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131537                     :                                                                                                           CCC----CG--T-C-ATA-GGTG--AGA-CAA---G--A--A-TCGGGGAG-------GACC-A---C-CCC---CTG-TCACACCGTACAA


blockSeqs                     :               AATG        TTCA            TGAAA     AAAATTAATG                 AGT ACATTTAGTCAC       T      TCAT  TC CA        CGG  TA   CAG CT AG T      A TTGGCGA          C   CTG  AT
blockSeqs                     :               .           AT              .         AAAAATATG                  AGT .                  T      .     TC GA        G    A    G   AC AG T      A .                C   .    AT
blockSeqs                     :               .           A               .         AAAAATATA                  .   .                  T      .     .  CA        G    A    .   GA AG .      A .                .   .    CT
blockSeqs                     :               .           A               .         AAAAATATG                  .   .                  T      .     .  AA        G    T    .   C  AG .      A .                .   .    CT
blockSeqs                     :               .           A               .         AAAACTATG                  .   .                  T      .     .  AT        G    T    .   .  .  .      A .                .   .    G 
blockSeqs                     :               .           A               .         AAAAATATG                  .   .                  T      .     .  C         G    A    .   .  .  .      A .                .   .    G 
blockSeqs                     :               .           A               .         TAATTAATG                  .   .                  A      .     .  C         C    A    .   .  .  .      T .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           A               .         AAATTAATG                  .   .                  A      .     .  C         C    A    .   .  .  .      T .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           A               .         CATTTGGA                   .   .                  A      .     .  C         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         CATTTGGA                   .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         AAATATAT                   .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         AAACTGGA                   .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         CATTTGAA                   .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         CATTTTA                    .   .                  T      .     .  A         G    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         AATATG                     .   .                  T      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         ATTGAA                     .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         AAATGA                     .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         AATATG                     .   .                  A      .     .  T         A    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         AATATG                     .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         AATATG                     .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         TTAAG                      .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         TTAAG                      .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         ATTTG                      .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GTTTA                      .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  A         G    .    .   .  .  .      A .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  T      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  C         C    .    .   .  .  .      A .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           G               .         ATCAA                      .   .                  T      .     .  A         T    .    .   .  .  .      T .                .   .    C 
blockSeqs                     :               .           A               .         AAATG                      .   .                  T      .     .  A         G    .    .   .  .  .      C .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  C         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    C 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  G         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    G 
blockSeqs                     :               .           C               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  A         G    .    .   .  .  .      C .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         TAAAA                      .   .                  T      .     .  A         G    .    .   .  .  .      A .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           A               .         GACAA                      .   .                  T      .     .  T         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  T      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      A .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  T      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  A         G    .    .   .  .  .      A .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         TCAAA                      .   .                  T      .     .  C         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         AAATG                      .   .                  T      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           C               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  A         C    .    .   .  .  .      A .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         CTTTG                      .   .                  A      .     .  A         G    .    .   .  .  .      T .                .   .    C 
blockSeqs                     :               .           A               .         TTAAT                      .   .                  A      .     .  A         G    .    .   .  .  .      A .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  T      .     .  T         G    .    .   .  .  .      A .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           C               .         GTAAC                      .   .                  T      .     .  A         G    .    .   .  .  .      T .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  C         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           G               .         GTAAG                      .   .                  T      .     .  A         G    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         TTAAG                      .   .                  A      .     .  C         C    .    .   .  .  .      T .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  T      .     .  C         T    .    .   .  .  .      T .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         AAAAA                      .   .                  T      .     .  A         C    .    .   .  .  .      C .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  C         C    .    .   .  .  .      A .                .   .    G 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  T      .     .  A         T    .    .   .  .  .      A .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           A               .         ATTTT                      .   .                  A      .     .  A         G    .    .   .  .  .      T .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           A               .         GAAAA                      .   .                  A      .     .  A         G    .    .   .  .  .      A .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           .               .         TTAAG                      .   .                  A      .     .  T         G    .    .   .  .  .      T .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           .               .         GAAAA                      .   .                  T      .     .  C         G    .    .   .  .  .      A .                .   .    C 
blockSeqs                     :               .           .               .         GAAAA                      .   .                  T      .     .  C         T    .    .   .  .  .      T .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           .               .         GAAAA                      .   .                  T      .     .  C         C    .    .   .  .  .      A .                .   .    T 
blockSeqs                     :               .           .               .         AAAAA                      .   .                  T      .     .  A         C    .    .   .  .  .      C .                .   .    A 
blockSeqs                     :               .           .               .         AATGG                      .   .                  A      .     .  A         T    .    .   .  .  .      T .                .   .    G 
blockSeqs                     :               .           .               .         AAATG                      .   .                  T      .     .  A         C    .    .   .  .  .      A .                .   .    . 
blockSeqs                     :               .           .               .         AAAAA                      .   .                  A      .     .  A         G    .    .   .  .  .      A .                .   .      
blockSeqs                     :               .           .               .         CAAAA                      .   .                  A      .     .  C         C    .    .   .  .  .      T .                .   .      
blockSeqs                     :               .           .               .         GAAAA                      .   .                  T      .     .  A         G    .    .   .  .  .      A .                .   .      
blockSeqs                     :               .           .               .         AAAAT                      .   .                  A      .     .  A         G    .    .   .  .  .      T .                .   .      
blockSeqs                     :               .           .               .         TTAAG                      .   .                  T      .     .  T         G    .    .   .  .  .      A .                .   .      
blockSeqs                     :               .           .               .         TTCAG                      .   .                  T      .     .  A         G    .    .   .  .  .      . .                .   .      
blockSeqs                     :               .           .               .         GTAAG                      .   .                  T      .     .  A         T    .    .   .  .  .      . .                .          
blockSeqs                     :                           .               .         AATTG                      .   .                  T      .     .  T         G    .    .   .  .  .      . .                .          
blockSeqs                     :                                           .         AAT                        .   .                  T      .     .  T         G    .    .   .  .  .      . .                           
blockSeqs                     :                                           .         AAA                        .   .                  T      .     .  C         C    .    .   .  .  .      . .                           
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blockSeqs                     :                                           .         .                          .   .                  T      .     .  T         .    .    .   .  .  .                                    
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gi|131501                     :          T-TTA----T---TTTT---A-TTTTC-AA-CC-----AT--C-----------------ATTTTG-TGA---T------------TCATTTATCCACCC----CG--T-T-ATA-GGCG--TA--TG
gi|131502                     :       TTTT-TTT----T---TTTA---A-ATGCC-AA-CC-----AT--C-----AAA---ATTAATG----G-TGG---T------------CCGTTGAATCATCC----CA--T-A-GTA-GGTG--TT--TGA---G--G--G-TTGGAGTG-------GGCC-A---C-CCC---
gi|131503                     :        TTT-TTT----T---TTTC---A-GTTTC-AG-AC-----TC--C-------A---A-----A----G-TGGAGTC------------CCATTTATTCTCCC----CGTCT-C-AT--GCTG--TA--TGA---G--G--GTTCATGGAG-------GAAC-A---TCCCC---TCATACAG--CTTACAAatggtgcaccttaca
gi|131504                     :     TTTTTT-TTT----TCAATTTC---A-ATTTC-AA-TT-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131505                     :           -TTT----T---GTTG---ATATTTT-AA-CC-----AC--CATT--GAA----------------TGG---T------------CCGGTTATTCTCCC----CG--C-C-ACA-GGT----G--TGA---G--GAGG-TCGGGGAG-------TACC-----T-CCC---TCCTTCACACCGTACA
gi|131506                     :         TT-TTA----T---TTTG---C-ATTTC-AG-CC-----ACACC-----TTA---A-----G----G-TGG---C------------CCATTTATCCTCCC----CG--T-C-ATA-GGTG--AGA-CAA---G--A--A-TCGGGGAG-------GACC-
gi|131507                     :          T-TTT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AA--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGGTG-------GGCC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAA
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gi|131512                     :          T-TAT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-CC-----AC--C-----AAAT--G-----A----G--GG---T------------CCATTTATTCACCC----CG--T-T-TTA-TGTG--TA--TGG---A--G--G-TCGGTACG-------GGTT-A---T-CCC---TCT-ATACACC
gi|131513                     :              T----T---TTTT------TTTC-AG-TC-----AC--CCATTTGAA----------------TGA---T------------CCATTTCTTCTCCT----CG--T-C-CTA-GGTG--TG--CGG---G--G--G-TCGGGGAG-------GACC-A---C-CCC---CCtaattaca
gi|131514                     :             TT----T---TTTT---G-ATTTTTAA-CC-----AC--C-----AAT---G-----G----A-TAG---T------------CCGGTTATTCTCCC----CG--T-C-GTA-GGT----G--TGA---G--GAGG-TCGGGGAG-------GACC-----T-CCC---TCCTTCTCACCGTACAActacacccctttcaa
gi|131515                     :           -TTT----T---TCTT------TTCC-AG-AC-----AC--C-----CAT---TTT---A----G-TGA---C------------CCATTTATTCTCCC----CG--T-C-CTA-GGTG--TG--TGG---G--
gi|131516                     :         TT-GTT----T---TTTT--------------TC-----AC--C-----AAA---T-----G----G-TGG---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-AATG--TA--TGA---G--G--G-TCGGAATG-------GGTC-A---T-CCC---T
gi|131517                     :           -TTT----T---TTTC---A-ATTTA-AA-TC-----AC--T-----AAA---A-----A----G-TGA---C------------CTTTTTATTCACCC----CG--T-A-ATA-GGTT--TG--TTG---G--G--A-TCGGGAAG-------GACC-A---T-CCC---TCA-ACAAACCGTACAAt
gi|131519                     :             TT----T---TTTT---A-ATTTC-AA-TC-----AC--T-----CAA---A-----A----G-GGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ACA-GGTC--TG--TGA---G--G--A-TCGCGTTA-------GGCC-A---T-CCC---CCA-ACAAACCTTACA
gi|131520                     :              T----T---TTTT------TTTC-AA-TC-----AC--T-----GAA---A-----A----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TCGGGG
gi|131521                     :          T-TTT----T---GTTG---A-ACCTC-----C-----AT--T-----GGA----------------TGG---T------------CCATTTATTCTCCC----CG--T-C-ATA-GGT----G--TGA---G--GAGG-TCAGGGAG-------GACC-A---C-CCT---CCT-TCACACCGTACAA
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gi|131523                     :      tcttT-TTT----T---TTTT---A-GCT-------------AC--C-----TTA---A-----G----G-TTG---C------------CCGTTTATT-ACCC----TG--T-A-ATG-GGTC--TG--CAG---G--G--G-CCGGGG-----------CC-A---T-CCC---ACT-GCAAACCGCACAA
gi|131524                     :                    ---TTTT------TTTT-AG-TC-----AC--C-----TTC---A-----G----A-TGA---T------------CAGTTTATTCTCCC----CG--T-T-ACATGG----TG--GGACAGG--G--G-TCGGGGAA-------CACC-A---T-CCC---CTG-TCACACCTTACA
gi|131525                     :           -TTT----T---TTTT---A-AC--C-AA-TT-----G--------------------------G-TGG---T------------CCATTTATTTACCA----CG--T-A-ATA-AGTG--AA--AGA---G--G--A-ACAGGGCG-------GGCC-A---T-ATC---TCA-ATATACCTCACA
gi|131526                     :                                  TTC-AG-CT-----AC--C-----GTA---A-----G----G-TGA---T------------CCATTTATT-ACCC----TG--T-A-ATT-GGTC--TG--CAA---G--G--G-TCA----G-------GGCC-A---T-CCC---GCT-ACCAACCACACAA
gi|131527                     :          ttcta----T---TTTA---A-ATTTC-AA-CC-----AC--C-----AAT---AT----G----G-TGG---T------------CCATTTATTCAACA----TG--T-T-ATA-GGTG--TA--TGA---G--G--
gi|131528                     :               ----T---TTTA---A-ATTTC-AA-CC-----AC--C-----AAT---AT----G----G-TGG---T------------CCATTTATTCAACA----TG--T-T-ATA-GGTG--TA--TGA---G--G--
gi|131529                     :                                 TTTT-AA-CC-----AC--T-----AAT---T-----G----A-TGG---T------------CCGTTTATTCTTCC----CG--T-C-ATA-GG----TG--TGA---GGAG--G-TCAGGCTGTTGGCGAGACC-ACTTT-CAC---TCA-CCA---CGTACA
gi|131530                     :                               ttTTTC-AA-CC-----AC--C-----AAT---AT----G----G-TGG---T------------CCATTTATTCAACC----TG--T-T-ATA-GGTG--TA--TGA---G--G--G-CCGGG
gi|131531                     :                                                                                                   TTTATTCTCCC----AG--T-T-ATA-GGT----G--TAA---G--GAGG-TCGGGGAG-------GACC-A---C-CCT---CCT-TCACACAGTACAA
gi|131532                     :                                                tttaaccactatttgatgggctg----G-TGA---C------------CCATTTATTCTCCC----TG--T-C-CTA-CGTG--TG--TTT---G--C--G-AAGGGG-G-------GACC-A---T-CCC---
gi|131533                     :                                                                   tttt----G-TGA---T------------CCATTTAATTACCC----CG--C-T-ATA-GGTT--TG--TGA---C--G--G-TCGGAGAG-------GACC-A---T-CCC---TCC-ACAAGCCTTACAcgtcacacct
gi|131534                     :                                                                     tg----G-CGG---T------------CCATGTAATCACTC----CG--T-A-ATA-GGTG--TA--TGA---G--G--G-CAGGGGTG-------CGCC-T---T-CCC---TCT-AAACACCTTACAA
gi|131535                     :                                                                     tg----G-TGA---T--------------ATTTTTTT-CCC----TG--T-C-CTA-GGTG--TG--CGG---G--G--G-TCGGGGAG-------GACC-A---T-CCC---CCT-ACACACCTTACAA
gi|131536                     :                                                                       ----G-TGA---T------------CCATTTAATCACCC----CG--T-A-ATA-GGTC--TG--TGA---G--G--G-TTGGGGTG-------GGCC-A---T-CCT---TCA-ACAAACCGTACAA
gi|131537                     :                                                                                                           CCC----CG--T-C-ATA-GGTG--AGA-CAA---G--A--A-TCGGGGAG-------GACC-A---C-CCC---CTG-TCACACCGTACAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|131479 ): TTTTTGTGTGTTTTTTTTAATCACATTCAGATGATCCGTTTATTCTCCCGGGTCGGGGATTACCATCCCCTGTCACACCTTACA
Unaligned ( gi|131518 ): TCTTTTTCAGTTTCAGACTCTATGATGGAGTTCTATTTATTCTTACCGTCTATATGAGGGGTCGAGGCGGAACATCCCCTCATACAGTTTACAA
Unaligned ( gi|131494 ): TTTTGTTTTGTTTTTTACTCATTTTGGTGACCCATTAATTCTCCCCGTCCTAGGTCTTTATGAAGTCAGG