lowQualScore                  :        44 0       0000   0000 11    0 111111    111111 55  6 0        2 4      00       000    3  
lowQualScore                  :        .. .       ....   .... ..    . ......    ...... ..  . .        . .      ..       ...    .  
lowQualScore                  :        99 9       9999   9999 11    4 222222    222222 66  6 4        4 5      77       999    9  
consensus                     :    TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACCTTTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CGTCGTC
Reference ( gi|47377 )        :    TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGTG-ACCTTTTG-CAATCGCC--TTTTGTC---CGTCATC
gi|47369                      :    TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACCATTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CGTCGTC
gi|47370                      :   tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGG-GCCTTTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CGCC
gi|47305                      :   tTTTA--A-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTA------A--AGGG-ACTTTTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CGTCGTCgcc
gi|47326                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AACG-ACATTTTG-CAATCGCC--CTTTTTC---TGTCATC
gi|47307                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACATTTTG-GAATCACC--TTTTGTC---CGTCG
gi|47308                      :  ttTTTT--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------T--AGGG-ACCTTTTG-TGATCGCC--TTTTGTC---CGTCA
gi|47306                      :  ttTTTA--G-TTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACCTTTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CGT
gi|47371                      :  tcTTTA--G-GTAACCT----GAG----A--CTTT-G------TATC------A--AGAG-ACCTTTTG-GGATCGCC--TTTTGTC---CGTCGTCttccgtc
gi|47313                      :   tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACCAATTG-CAATAGCC--TTTTGTC---CGTTGTC
gi|47316                      :  ttTTTA--T-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TTTA------A--AGGG-ACCTTTTG-CAATCGCC--TTTTGTC---CAT
gi|47372                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTA------A--AGGG-ACCTTTTG-CGATCACA--TTTTGTC---TGTCGtgt
gi|47317                      :   tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTCTGTCTCG--AGGG-ACCTTTTG-CAATCGCC--CTTTGTC---CATTGTC
gi|47310                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACATTTTG-CGATTGTG--TTTTGTC---TGTCGTC
gi|47319                      :  ttTTTAA-G-GTCATCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGA-AGCTTTTG-CAATCGCC--TTTTGTC---CATTGTC
gi|47312                      :   tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-T------TCCC------A--AGGG-ACCTTTCG-CGATTGCC--TTTTGTC---CATC
gi|47320                      :  ttTTTA--G-GTCTCCTCAGTGAG----A--CTTT-G------TCTA------A--AGGG-ACCTTTTG-CAATCGCC--TTATGTC---CGTCGTCg
gi|47379                      :  ttTTAA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACCTTTTG-CGATTGCT--TTTAGTC---AGTCGTC
gi|47332                      :    TTTA--G-GTCACCT----AAC----A--CTTT-G------TCTC------A--AGTG-AACTTTTG-TGATTGCC--TTTTGTC---CAT
gi|47314                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-A------TCGC------A--AGGG-ATCTTTTA-CGATCACC--TTTTGTC---CATCGtgcc
gi|47315                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-T------TCTC------A--ATGG-ACCTTTTG-CGATCACC--TTTTTAC---CGTCGTC
gi|47345                      :  ttTTTA--G-GTCACTT----AAA----A--CTTT-G------TCTC------A--AGTG-ACCTTTTG-CAATCACT--TTTT
gi|47322                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTTTG------TCTC------A--AGAG-ACCTTTTG-TGATCGCC--TTTT-TC---TGTtatctatcgt
gi|47380                      :  ttTTTA--G-ATCATCT----GAA----A--CATT-G------TCTC------A--AGGG-ACCTTTTG-CAATCGCA--TTTAATC---CGTCGTCagtc
gi|47318                      :    TTTA--T-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--A-TGAACCTTTTA-TGATCGTC--TTTTATC---CGTCGTC
gi|47329                      :  ttTTTAA-G-GTCATCT----GAC----G--CTTT-G------TCTC------A--AGGA-ACCTTTTG-TAATCGCC--TTTTGTC---CATTGTC
gi|47323                      :   tTTTAA-G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGA-ACCTTTTG-CGATCGCC---TTTATC---TGTC
gi|47347                      :   tTTTA--G-GTGACCT----GAG----A--CT---G------TCTC------A--ATTG-ACCTTTTG-TGATTCCC--TTTTGTC---CATCAg
gi|47328                      :  ttTTTA--A-GTCACCT----GAG----A--CCTT-G------TCTC------G--AGGG-CTTTTTTG-CGACCGCC--TTTTGTC---CGT
gi|47374                      :  tcTTTAAGG-GTCACCT----TAG----A--CTTT-G------CCTC------A--AGGG-AACTTTTG-CGATCGCC--TTTTATC---CATCtgt
gi|47327                      :   tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-C------TTTC------A--AAGA-ATATTTTA-CTATCGCC--TTTTGTC---CGTCGTCg
gi|47325                      :  ttTTTAA-G-GTCACCT----AGG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGA-ACCTTTTG-CGATCGCC---TTTATC---TGTC
gi|47341                      :   tTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--TGAG-ACCTTTTG-TGAATGCC--TTTTATC---Cg
gi|47349                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----ATG----A--CTTT-T------T-------------GT--ACCTTTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CGTCATCcttgt
gi|47334                      :  ttTTTA--A-GTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACCTTTTG-CGATCGTC--ATGCGTCGTGCGTC
gi|47337                      :  ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--TTTT-G------TCTT------A--AGGA-ACCTTTTG-CGATTGCC--TTTTAT
gi|47331                      :   tTTTA--AAGTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGA-ACCTTTTG-TGATTGCC---TTTATC---TGTC
gi|47340                      :   tTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--TGGG-ATC-TTTG-AGATCACC--TTTTGTC---TGTCg
gi|47339                      :   tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACCTTTTG-T--TCGTC---ATCGTG---CGTCGTC
gi|47333                      :  ttTTTA--G-GTCATTT----TAG----A--TTTT-G------TCTC------A--AGGG-ATATTTTG-CGATCCCC--TTTTGTC---CATTGTCcatcgt
gi|47324                      :  ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGA-ACCTTTGG-AGATCGCC--TTT
gi|47342                      :   tTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTT------------C------A--AGGG-ACCTTTTG-TGATCGCC--TTTTGTC---GGTatctatcg
gi|47335                      :  ttTTTA--G-ATCACCT----GAG----A--ATTT-G------TTTC------A--ATGG-ACGTTTTG-AGATTGCC--TTTTGTA---CGTCGTCtttcgtc
gi|47378                      :  ttTTAA--G-GTCACCT----------------TT-G------TCTC------A--AGGG-ACCTTTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CATTGTC
gi|47355                      :    TTTA--G-GTTACCT----CTG----A--CTTT-G------TGTC------A---GTG-ATCTTTTG-CAATCGCC---TTTGTC---CAT
gi|47348                      :  ttTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--C--------------A------A--AGTG-ACCTTTC--CGATCGCC--TTTTGTC---CGTCGTCtgt
gi|47338                      :  ttTTTA--G-GTAATCT----GAG----A--CTTT-G------TATA------A--AGGG-ACTTTCTG-TGATTGCC--TTTTGTC---TGTCG
gi|47346                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--ATGG-ACCTTTTGTCCATCATC--ATACGTC---CGT
gi|47376                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--A----------TG-GA----CC--TTTTGTC---CATCATC
gi|47344                      :   tTTTA--G-TTCAACT----GAG----A--CTTT-G------TTTC------A--TGGG-ACCTTTTG-CGGTCGCC--GTGCGTC---GGTCGTCatgcgtccat
gi|47350                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--CTGG-ACCTTTTGTCCATCATC--ATGCGTC---CGT
gi|47353                      :  ttTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AG-G-GCTTTTTGTCCGTCGTC--GTGCGTC---CGT
gi|47375                      :  ttTTTA--G-GTCATCG----GAG-------------------TCTC------A--AGGA-ATCTTTTG-CGATTGCC--TTTTGTC---CGT
gi|47351                      :   tTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TTTC------A--ATGG-ACCTTTTGTCCATCATC--ATGCGTC---CGTtgcc
gi|47352                      :   tTTTA--G-GTCACCT----AAG----A--CTTT-G------TTTC------A--ATGG-ACCTTTTG-
gi|47381                      :  ttTTTA--T-GTCACTT----GAG----A--CATT-G------TCT--------------------TTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CGTCGTC
gi|47358                      :    TTTA--G-TTCACCT----GAG----C--C----GAAAGGCTCAC------A--AGTG-AGCTTTTG-TGATCGCC--TTGTGTC---CGTC
gi|47365                      :  ttTTTA--G-GTCACCC----GAG----A--TAAA-A------TCTC------A--TTTG-ACCTTTTT-TGATTGTC--TTTTGTC---CGTCTTCg
gi|47357                      :  ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-A------TCTC------T--ATGG-ACCTTTCT-TCATCATC--ATGCGTC---CGT
gi|47373                      :  ttTTTA--ATGTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------T--AGGG-ACCTTTCGTCCGTTGTC--TTGCGTC---
gi|47366                      :   tTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTG-AGCTTTTG-TGATCGCC--TGGTGTC---CGTCGTCgt
gi|47362                      :  tcTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTG-AGCTTTTG-TGATCGCC--TGGTGTC---CGTCGTC
gi|47361                      :  ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTG-AGCTTTTG-TGATCGCC--TGGTGTC---CGTCGTC
gi|47360                      :  ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTG-AGCTTTTG-TGATCGCC--TGGTGTC---CGTCGTC
gi|47359                      :  ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTG-AGCTTTTG-TGATCGCC--TGGTGTC---CGTCGTC
gi|47354                      :  ttTTTA--G-GTCAC------------------TT-G------TCTC------A--AAGG-ACCTTTTG-TGATTGCCTTTTTTGTC---AGTTGTC
gi|47382                      :  ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGTG-AGCTTTTG-TGATCGCC--TGGTGTC---CGTCGTC
gi|47356                      :    TTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGTG-AGCTTTTG-TGATCGCC--TGGTGTC---CGTCGTC
gi|47364                      :  ttTTTAA-G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--ATGG-ACC
gi|47367                      :   tTTTA--G-CTCACCT----GAGCAGAA-------G------TCTC------ACAGGTG-GGCTTTTG-TGATTGCC--TGGTGTC---CGTCGTC
gi|47368                      :  ttTTTA--G-TTCATCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTG-AGCTTTTG-TGATCGCC--TGGTGTC---CGTCGTC
gi|47363                      :  ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGAG-AGCTTTTG-TGATCCCC--TTATGTC---CGTCGTC
gi|47311                      :   ttTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AATA-ACCTTTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CGTCATC
gi|47309                      :  ttaTTA--G-GTCGACT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGA-ACCTTTTG-CGATCGCC--TTTTATC---CGTCGTC
gi|47330                      :  ttgTTA--G-ATCACCT----GAG----A--CTTT-G------CCTC------A--AGTG-ACCTTTTG-TGATTGCC--TATTGTC---CGTC
gi|47343                      : tttaTTA--G-GTCACCT----GAG----A--TTTT-G------TCTT------A--AGTC--CCTTTTG-CAAACGCC--TTTTGTC---CGTCGTC
gi|47383                      : tttaTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CATT-G------TCTC------A--AAGG-ACCTTTTG-CGGTCACC--TTTTGTC---CATTGTC
gi|47321                      :     TTA--G-GTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TTTC------A--AGGG-ACCTTTTG-CGGTTGCC--TTTTATC---TGTC
gi|47336                      :  ttgTTA--G-TTCACCT----GAG----A--ATTT-G------TCTC------A--AGGG-GTCTTTTG-CGATCACC--TTTAGTC---CGTCAg
gi|47311                      :    ttgA--G-GTTATTT----GAG----A--CAAA-G------TCTC------A--GGTG-ACCT
gi|47384                      :  ttattA--G-GTCGCCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------G--AGTG-ACCTTTTG-CAATTGCC--TCTTGTC---CGTCATCtttgcgatcgccttttgtccgtcatc
gi|47384                      :       A--G-GTCACTC----GAG----A--CAAA-G------TCTC------A--GGCG-ACCT
gi|47330                      :       A--G-GTCACTT----GAG----G--CAAA-G------TCTC------A--GGTG-ATCTtttgcaattgcctcttgtccgtcatc
gi|47379                      : tttattA--G-GTCCCTT----GAG----A--CAAA-G------TCTC------A--GGTG-ACCTTtttgtgattgcctattgtccgtc
gi|47383                      :     ttA--G-GTCCTTT----GAG----A--CAAT-G------TCTC------A--GGTG-ACCTtttgcgattgcttttagtcagtcgtc
gi|47345                      :     ttA--G-GTCACTT----GAG----A--CAAA-G------TTTT------A--AGTG-ACCTtttgcggtcaccttttgtccattgtc
gi|47323                      :  tttttA--G-GTTCCTT----GAG----A--CAAA-G------TCTC------A--AGTG-ACCTTtttgcaatcacttttttatctatcgt
gi|47341                      :   ttttA--G-GTCTCAT----GAG----A--CAAA-G------TCTC------A--AGTG-ACCTtttgcgatcgcctttatctgtcg
gi|47339                      :  tttttA--G-GTCCCTT----GAG----A--CAAA-G------TCTC------A--GGTG-ACCTtttgtgaatgccttttatcccttgt
gi|47324                      :  tttttA--G-GTTCCTT----GAG----A--CAAA-G------TCTC------A--GGTG-ACCTTtttgttcgtcatcgtgcgtcgtccatcgt
gi|47385                      :   ttttA--G-GTTGCCT----CAG----A--AAAA-G------TCTT------A--TGTG-ACCTTTTG-CAATCACC--TTTTGTC---CGTCGTCttggagatcgcctttatctatcg
gi|47385                      :       A--G-GTCACAT----AAG----A--CTTT-T------TCTG------A--GGCA-ACCT
gi|47365                      :       A--G-GTCAAAT----GAG----A--TTTT-A------TCTC------G--GGTG-ACCTtttgcaatcaccttttgtccgtcgtc
gi|47386                      :        tttttTCCCCT----TAG----A--CT---G------TCTC------A--AGAG-AACTTTTG-CGAACGCC--TTTTGTC---CGTCGTCtttttgattgtcttttgtccgtcttc
gi|47388                      :                CTT----GGG----AATCTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACCTTTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CGTCGTC
gi|47387                      :                CTT----GGG----AATCTTT-G------TCTC------A--AGGG-ACCTTTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---CGTCGTC
gi|47389                      :                  T----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A--AGGA-ACCTTTTG-TGATCGCG--ATTT-TC---CGT
gi|47348                      :                          ----A--CTTT-G------TCTC------A--AGTG-ACCTggtc
gi|47390                      :                             tttttTTT-G------TCTT------G--AGGG-ACCTTTTG-CGATCGCC--TTTTGTC---TGTCgacctttccgatcgccttttgtccgtcgtc
gi|47391                      :                                               TC------A--AGTG-ACTTTTTG-CGATCGTC--TTTTGTC---CGTCGTCg





Alignments
lowQualScore                  :         55 1       1111   1111 11    0 111111    111111 4   4         22       0 00       000  000 111    
lowQualScore                  :         .. .       ....   .... ..    . ......    ...... .   .         ..       . ..       ...  ... ...    
lowQualScore                  :         66 0       0000   0000 33    5 333333    333333 6   6         55       5 66       888  888 333    
consensus                     :     TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
Reference ( family-336 )      :     TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47305                      :     TTTA--A-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTA------A-AGG-GACTTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47306                      :   ttTTTA--G-TTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---TTTCCGTC
gi|47307                      :   tcTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACATTTTG--GAATCAC-C--TTTTGTC---CG---T---CGT
gi|47308                      :   ttTTTT--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------T-AGG-GACCTTTTG--TGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CAT
gi|47309                      :    ttTTA--G-GTCGACT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTATC---CG---T---CGTC
gi|47310                      :  ttgTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACATTTTG--CGATTGT-G--TTTTGTC---TG---T---CGTC
gi|47311                      :    ttTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AAT-AACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CATC
gi|47312                      :  ttaTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-T------TCCC------A-AGG-GACCTTTCG--CGATTGC-C--TTTTGTC---CA---T---CG
gi|47313                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCAATTG--CAATAGC-C--TTTTGTC---CG---T---TGTC
gi|47314                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-A------TCGC------A-AGG-GATCTTTTA--CGATCAC-C--TTTTGTC---CA---T---CGT
gi|47315                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-T------TCTC------A-ATG-GACCTTTTG--CGATCAC-C--TTTTTAC---CG---T---CGTC
gi|47316                      :   ttTTTA--T-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TTTA------A-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGT
gi|47317                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTCTGTCTCG-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-C--CTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47318                      :   ttTTTA--T-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-AACCTTTTA--TGATCGT-C--TTTTATC---CG---T---CGTC
gi|47319                      :   ttTTTAA-G-GTCATCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AAGCTTTTG--CAATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47320                      :    tTTTA--G-GTCTCCTCAGTGAG----A--CTTT-G------TCTA------A-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-C--TTATGTC---CG---T---CGTC
gi|47321                      :    ttTTA--G-GTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TTTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGGTTGC-C--TTTTATC---TG---T---CG
gi|47322                      :  ttgTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTTTG------TCTC------A-AGA-GACCTTTTG--TGATCGC-C--TTTT-TC---TG---T---AGTC
gi|47323                      :   ttTTTAA-G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--CGATCGC-C---TTTATC---TG---T---CG
gi|47324                      :    tTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTGG--AGATCGC-C---TTTATC---TA---T---CG
gi|47325                      :    tTTTAA-G-GTCACCT----AGG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--CGATCGC-C---TTTATC---TG---T---CG
gi|47326                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AAC-GACATTTTG--CAATCGC-C--CTTTTTC---TG---T---CATC
gi|47327                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-C------TTTC------A-AAG-AATATTTTA--CTATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47328                      :   ttTTTA--A-GTCACCT----GAG----A--CCTT-G------TCTC------G-AGG-GCTTTTTTG--CGACCGC-C--TTTTGTC---CG---T---TGT
gi|47329                      :   tcTTTAA-G-GTCATCT----GAC----G--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--TAATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47330                      :     tTTA--G-ATCACCT----GAG----A--CTTT-G------CCTC------A-AGT-GACCTTTTG--TGATTGC-C--TATTGTC---CG---T---
gi|47331                      : tttaTTTA--AAGTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--TGATTGC-C---TTTATC---TG---T---CG
gi|47332                      :    tTTTA--G-GTCACCT----AAC----A--CTTT-G------TCTC------A-AGT-GAACTTTTG--TGATTGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGCC
gi|47333                      :   ttTTTA--G-GTCATTT----TAG----A--TTTT-G------TCTC------A-AGG-GATATTTTG--CGATCCC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47334                      :   ttTTTA--A-GTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGT-C--ATGCGT----CG---TG--CGTC
gi|47335                      :   ttTTTA--G-ATCACCT----GAG----A--ATTT-G------TTTC------A-ATG-GACGTTTTG--AGATTGC-C--TTTTGTA---CG---T---CGTC
gi|47336                      :    ttTTA--G-TTCACCT----GAG----A--ATTT-G------TCTC------A-AGG-GGTCTTTTG--CGATCAC-C--TTTAGTC---CG---T---CAT
gi|47337                      :  ttgTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--TTTT-G------TCTT------A-AGG-AACCTTTTG--CGATTGC-C--TTTTAT
gi|47338                      :    tTTTA--G-GTAATCT----GAG----A--CTTT-G------TATA------A-AGG-GACTTTCTG--TGATTGC-C--TTTTGTC---TG---T---CGT
gi|47339                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--T--TCGT-C---ATCGTG---CG---T---CGTC
gi|47340                      :   ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-TGG-GATC-TTTG--AGATCAC-C--TTTTGTC---TG---T---catcgt
gi|47341                      :    tTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-TGA-GACCTTTTG--TGAATGC-C--TTTTATC---CC---T---TGT
gi|47342                      :   ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTT------------C------A-AGG-GACCTTTTG--TGATCGC-C--TTTTGTC---GGTTTT---CGTC
gi|47343                      :    ttTTA--G-GTCACCT----GAG----A--TTTT-G------TCTT------A-AGT-C-CCTTTTG--CAAACGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47344                      : tttaTTTA--G-TTCAACT----GAG----A--CTTT-G------TTTC------A-TGG-GACCTTTTG--CGGTCGC-C--GTGCGTC---GG---T---CGTC
gi|47345                      :   ttTTTA--G-GTCACTT----AAA----A--CTTT-G------TCTC------A-AGT-GACCTTTTG--CAATCACTT--TTTTATC---TA---T---CGT
gi|47346                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATACGTC---CG---T---
gi|47347                      :   ttTTTA--G-GTGACCT----GAG----A--CT---G------TCTC------A-ATT-GACCTTTTG--TGATTCC-C--TTTTGTC---CA---T---CAT
gi|47348                      :   ttTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--C--------------A------A-AGT-GACCTTTC---CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47349                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----ATG----A--CTTT-T------T-------------G-TACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CATC
gi|47350                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-CTG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATGCGTC---CG---T---
gi|47351                      :   ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TTTC------A-ATG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATGCGTC---CG---T---
gi|47352                      :    tTTTA--G-GTCACCT----AAG----A--CTTT-G------TTTC------A-ATG-GACCTTTTG--
gi|47353                      :   ttTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-G-CTTTTTGTCCG-TCGT-C--GTGCGTC---CG---T---
gi|47354                      :   ttTTTA--G-GTCAC------------------TT-G------TCTC------A-AAG-GACCTTTTG--TGATTGC-CTTTTTTGTC---AG---T---TGTC
gi|47355                      :   ttTTTA--G-GTTACCT----CTG----A--CTTT-G------TGTC------A--GT-GATCTTTTG--CAATCGC-C---TTTGTC---CA---T---TGT
gi|47356                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47357                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-A------TCTC------T-ATG-GACCTTTCT--TCATCAT-C--ATGCGTC---CG---T---
gi|47358                      :   ttTTTA--G-TTCACCT----GAG----C--C----GAAAGGCTCAC------A-AGT-GAGCTTTTG--TGATCGC-C--TTGTGTC---CG---T---CG
gi|47359                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47360                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47361                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47362                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47363                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGAGAGCTTTTG--TGATCCC-C--TTATGTC---CG---T---CGTC
gi|47364                      :   ttTTTAA-G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-GACC
gi|47365                      :    tTTTA--G-GTCACCC----GAG----A--TAAA-A------TCTC------A-TTT-GACCTTTTT--TGATTGT-C--TTTTGTC---CG---T---CTTC
gi|47366                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47367                      :   tcTTTA--G-CTCACCT----GAGCAGAA-------G------TCTC------ACAGGTGGGCTTTTG--TGATTGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47368                      :   ttTTTA--G-TTCATCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47369                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCATTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47370                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GGCCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---C---CGCC
gi|47371                      :    tTTTA--G-GTAACCT----GAG----A--CTTT-G------TATC------A-AGA-GACCTTTTG--GGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47372                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTA------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCAC-A--TTTTGTC---TG---T---CGT
gi|47373                      :    tTTTA--ATGTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------T-AGG-GACCTT--------TCGT-C--CGTTGTCTTGCG---T---CGT
gi|47374                      :    tTTTAAGG-GTCACCT----TAG----A--CTTT-G------CCTC------A-AGG-GAACTTTTG--CGATCGC-C--TTTTATC---CA---T---CG
gi|47375                      :    tTTTA--G-GTCATCG----GAG-------------------TCTC------A-AGG-AATCTTTTG--CGATTGC-C--TTTTGTC---CG---T---TGCC
gi|47376                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATGCGTC---CA---T---
gi|47377                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGT-GACCTTTTG--CAATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CATC
gi|47378                      :     TTAA--G-GTCACCT----------------TT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47379                      :     TTAA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATTGC-T--TTTAGTC---AG---T---CGTC
gi|47380                      :     TTTA--G-ATCATCT----GAA----A--CATT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-A--TTTAATC---CG---T---CGTC
gi|47381                      :     TTTA--T-GTCACTT----GAG----A--CATT-G------TCT-------------------TTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47382                      :     TTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47383                      :      TTA--G-GTCACCT----GAG----A--CATT-G------TCTC------A-AAG-GACCTTTTG--CGGTCAC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47384                      :        A--G-GTCGCCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------G-AGT-GACCTTTTG--CAATTGC-C--TCTTGTC---CG---T---CATC
gi|47385                      :        A--G-GTTGCCT----CAG----A--AAAA-G------TCTT------A-TGT-GACCTTTTG--CAATCAC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47386                      :              TCCCCT----TAG----A--CT---G------TCTC------A-AGA-GAACTTTTG--CGAACGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47387                      :                 CTT----GGG----AATCTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47388                      :                 CTT----GGG----AATCTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47389                      :                   T----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--TGATCGC-G--ATTT-TC---CG---T---GGTC
gi|47390                      :                                   TTT-G------TCTT------G-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---TG---T---CG
gi|47391                      :                                                TC------A-AGT-GACTTTTTG--CGATCGT-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC





Alignments
lowQualScore                  :         55 1       1111   1111 11    0 111111    111111 4   4         22       0 00       000  000 111    
lowQualScore                  :         .. .       ....   .... ..    . ......    ...... .   .         ..       . ..       ...  ... ...    
lowQualScore                  :         66 0       0000   0000 33    5 333333    333333 6   6         55       5 66       888  888 333    
consensus                     :     TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
Reference ( family-336 )      :     TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47305                      :     TTTA--A-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTA------A-AGG-GACTTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47306                      :   ttTTTA--G-TTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---TTTCCGTC
gi|47307                      :   tcTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACATTTTG--GAATCAC-C--TTTTGTC---CG---T---CGT
gi|47308                      :   ttTTTT--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------T-AGG-GACCTTTTG--TGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CAT
gi|47309                      :    ttTTA--G-GTCGACT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTATC---CG---T---CGTC
gi|47310                      :  ttgTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACATTTTG--CGATTGT-G--TTTTGTC---TG---T---CGTC
gi|47311                      :    ttTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AAT-AACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CATC
gi|47312                      :  ttaTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-T------TCCC------A-AGG-GACCTTTCG--CGATTGC-C--TTTTGTC---CA---T---CG
gi|47313                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCAATTG--CAATAGC-C--TTTTGTC---CG---T---TGTC
gi|47314                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-A------TCGC------A-AGG-GATCTTTTA--CGATCAC-C--TTTTGTC---CA---T---CGT
gi|47315                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-T------TCTC------A-ATG-GACCTTTTG--CGATCAC-C--TTTTTAC---CG---T---CGTC
gi|47316                      :   ttTTTA--T-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TTTA------A-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGT
gi|47317                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTCTGTCTCG-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-C--CTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47318                      :   ttTTTA--T-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-AACCTTTTA--TGATCGT-C--TTTTATC---CG---T---CGTC
gi|47319                      :   ttTTTAA-G-GTCATCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AAGCTTTTG--CAATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47320                      :    tTTTA--G-GTCTCCTCAGTGAG----A--CTTT-G------TCTA------A-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-C--TTATGTC---CG---T---CGTC
gi|47321                      :    ttTTA--G-GTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TTTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGGTTGC-C--TTTTATC---TG---T---CG
gi|47322                      :  ttgTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTTTG------TCTC------A-AGA-GACCTTTTG--TGATCGC-C--TTTT-TC---TG---T---AGTC
gi|47323                      :   ttTTTAA-G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--CGATCGC-C---TTTATC---TG---T---CG
gi|47324                      :    tTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTGG--AGATCGC-C---TTTATC---TA---T---CG
gi|47325                      :    tTTTAA-G-GTCACCT----AGG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--CGATCGC-C---TTTATC---TG---T---CG
gi|47326                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AAC-GACATTTTG--CAATCGC-C--CTTTTTC---TG---T---CATC
gi|47327                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-C------TTTC------A-AAG-AATATTTTA--CTATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47328                      :   ttTTTA--A-GTCACCT----GAG----A--CCTT-G------TCTC------G-AGG-GCTTTTTTG--CGACCGC-C--TTTTGTC---CG---T---TGT
gi|47329                      :   tcTTTAA-G-GTCATCT----GAC----G--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--TAATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47330                      :     tTTA--G-ATCACCT----GAG----A--CTTT-G------CCTC------A-AGT-GACCTTTTG--TGATTGC-C--TATTGTC---CG---T---
gi|47331                      : tttaTTTA--AAGTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--TGATTGC-C---TTTATC---TG---T---CG
gi|47332                      :    tTTTA--G-GTCACCT----AAC----A--CTTT-G------TCTC------A-AGT-GAACTTTTG--TGATTGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGCC
gi|47333                      :   ttTTTA--G-GTCATTT----TAG----A--TTTT-G------TCTC------A-AGG-GATATTTTG--CGATCCC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47334                      :   ttTTTA--A-GTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGT-C--ATGCGT----CG---TG--CGTC
gi|47335                      :   ttTTTA--G-ATCACCT----GAG----A--ATTT-G------TTTC------A-ATG-GACGTTTTG--AGATTGC-C--TTTTGTA---CG---T---CGTC
gi|47336                      :    ttTTA--G-TTCACCT----GAG----A--ATTT-G------TCTC------A-AGG-GGTCTTTTG--CGATCAC-C--TTTAGTC---CG---T---CAT
gi|47337                      :  ttgTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--TTTT-G------TCTT------A-AGG-AACCTTTTG--CGATTGC-C--TTTTAT
gi|47338                      :    tTTTA--G-GTAATCT----GAG----A--CTTT-G------TATA------A-AGG-GACTTTCTG--TGATTGC-C--TTTTGTC---TG---T---CGT
gi|47339                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--T--TCGT-C---ATCGTG---CG---T---CGTC
gi|47340                      :   ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-TGG-GATC-TTTG--AGATCAC-C--TTTTGTC---TG---T---catcgt
gi|47341                      :    tTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-TGA-GACCTTTTG--TGAATGC-C--TTTTATC---CC---T---TGT
gi|47342                      :   ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTT------------C------A-AGG-GACCTTTTG--TGATCGC-C--TTTTGTC---GGTTTT---CGTC
gi|47343                      :    ttTTA--G-GTCACCT----GAG----A--TTTT-G------TCTT------A-AGT-C-CCTTTTG--CAAACGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47344                      : tttaTTTA--G-TTCAACT----GAG----A--CTTT-G------TTTC------A-TGG-GACCTTTTG--CGGTCGC-C--GTGCGTC---GG---T---CGTC
gi|47345                      :   ttTTTA--G-GTCACTT----AAA----A--CTTT-G------TCTC------A-AGT-GACCTTTTG--CAATCACTT--TTTTATC---TA---T---CGT
gi|47346                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATACGTC---CG---T---
gi|47347                      :   ttTTTA--G-GTGACCT----GAG----A--CT---G------TCTC------A-ATT-GACCTTTTG--TGATTCC-C--TTTTGTC---CA---T---CAT
gi|47348                      :   ttTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--C--------------A------A-AGT-GACCTTTC---CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47349                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----ATG----A--CTTT-T------T-------------G-TACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CATC
gi|47350                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-CTG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATGCGTC---CG---T---
gi|47351                      :   ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TTTC------A-ATG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATGCGTC---CG---T---
gi|47352                      :    tTTTA--G-GTCACCT----AAG----A--CTTT-G------TTTC------A-ATG-GACCTTTTG--
gi|47353                      :   ttTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-G-CTTTTTGTCCG-TCGT-C--GTGCGTC---CG---T---
gi|47354                      :   ttTTTA--G-GTCAC------------------TT-G------TCTC------A-AAG-GACCTTTTG--TGATTGC-CTTTTTTGTC---AG---T---TGTC
gi|47355                      :   ttTTTA--G-GTTACCT----CTG----A--CTTT-G------TGTC------A--GT-GATCTTTTG--CAATCGC-C---TTTGTC---CA---T---TGT
gi|47356                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47357                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-A------TCTC------T-ATG-GACCTTTCT--TCATCAT-C--ATGCGTC---CG---T---
gi|47358                      :   ttTTTA--G-TTCACCT----GAG----C--C----GAAAGGCTCAC------A-AGT-GAGCTTTTG--TGATCGC-C--TTGTGTC---CG---T---CG
gi|47359                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47360                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47361                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47362                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47363                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGAGAGCTTTTG--TGATCCC-C--TTATGTC---CG---T---CGTC
gi|47364                      :   ttTTTAA-G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-GACC
gi|47365                      :    tTTTA--G-GTCACCC----GAG----A--TAAA-A------TCTC------A-TTT-GACCTTTTT--TGATTGT-C--TTTTGTC---CG---T---CTTC
gi|47366                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47367                      :   tcTTTA--G-CTCACCT----GAGCAGAA-------G------TCTC------ACAGGTGGGCTTTTG--TGATTGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47368                      :   ttTTTA--G-TTCATCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47369                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCATTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47370                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GGCCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---C---CGCC
gi|47371                      :    tTTTA--G-GTAACCT----GAG----A--CTTT-G------TATC------A-AGA-GACCTTTTG--GGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47372                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTA------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCAC-A--TTTTGTC---TG---T---CGT
gi|47373                      :    tTTTA--ATGTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------T-AGG-GACCTT--------TCGT-C--CGTTGTCTTGCG---T---CGT
gi|47374                      :    tTTTAAGG-GTCACCT----TAG----A--CTTT-G------CCTC------A-AGG-GAACTTTTG--CGATCGC-C--TTTTATC---CA---T---CG
gi|47375                      :    tTTTA--G-GTCATCG----GAG-------------------TCTC------A-AGG-AATCTTTTG--CGATTGC-C--TTTTGTC---CG---T---TGCC
gi|47376                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATGCGTC---CA---T---
gi|47377                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGT-GACCTTTTG--CAATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CATC
gi|47378                      :     TTAA--G-GTCACCT----------------TT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47379                      :     TTAA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATTGC-T--TTTAGTC---AG---T---CGTC
gi|47380                      :     TTTA--G-ATCATCT----GAA----A--CATT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-A--TTTAATC---CG---T---CGTC
gi|47381                      :     TTTA--T-GTCACTT----GAG----A--CATT-G------TCT-------------------TTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47382                      :     TTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47383                      :      TTA--G-GTCACCT----GAG----A--CATT-G------TCTC------A-AAG-GACCTTTTG--CGGTCAC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47384                      :        A--G-GTCGCCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------G-AGT-GACCTTTTG--CAATTGC-C--TCTTGTC---CG---T---CATC
gi|47385                      :        A--G-GTTGCCT----CAG----A--AAAA-G------TCTT------A-TGT-GACCTTTTG--CAATCAC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47386                      :              TCCCCT----TAG----A--CT---G------TCTC------A-AGA-GAACTTTTG--CGAACGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47387                      :                 CTT----GGG----AATCTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47388                      :                 CTT----GGG----AATCTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47389                      :                   T----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--TGATCGC-G--ATTT-TC---CG---T---GGTC
gi|47390                      :                                   TTT-G------TCTT------G-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---TG---T---CG
gi|47391                      :                                                TC------A-AGT-GACTTTTTG--CGATCGT-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC


blockSeqs                     :         AG                     AT      AAAGGC    TGTCTC C   T         TC                           TTC
blockSeqs                     :         A                      AT      .         .      C   T         T                            G  
blockSeqs                     :         A                      .       .         .      C   T         T                            .  
blockSeqs                     :         A                      .       .         .      C   T         T                            .  
blockSeqs                     :         A                      .       .         .      C   T         T                            .  
blockSeqs                     :         A                      .       .         .      C   A         .                            .  
blockSeqs                     :         A                      .       .         .      C   T         .                            .  
blockSeqs                     :         A                      .       .         .      C   T         .                            .  
blockSeqs                     :         A                      .       .         .      C   T         .                            .  
blockSeqs                     :         A                      .       .         .      C   T         .                            .  
blockSeqs                     :         A                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :         .                      .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :                                .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :                                .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :                                .       .         .      .   .         .                            .  
blockSeqs                     :                                .       .         .      .   .         .                               
blockSeqs                     :                                        .         .      .   .         .                               
blockSeqs                     :                                                  .      .   .                                         


blockSeqCons                  :     
originalCons                  :     TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
finalCons                     :     TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC





Alignments
lowQualScore                  :         55 1       1111   1111 11    0 111111    111111 4   4         22       0 00       000  000 111    
lowQualScore                  :         .. .       ....   .... ..    . ......    ...... .   .         ..       . ..       ...  ... ...    
lowQualScore                  :         66 0       0000   0000 33    5 333333    333333 6   6         55       5 66       888  888 333    
consensus                     :     TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
Reference ( family-336 )      :     TTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47305                      :     TTTA--A-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTA------A-AGG-GACTTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47306                      :   ttTTTA--G-TTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---TTTCCGTC
gi|47307                      :   tcTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACATTTTG--GAATCAC-C--TTTTGTC---CG---T---CGT
gi|47308                      :   ttTTTT--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------T-AGG-GACCTTTTG--TGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CAT
gi|47309                      :    ttTTA--G-GTCGACT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTATC---CG---T---CGTC
gi|47310                      :  ttgTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACATTTTG--CGATTGT-G--TTTTGTC---TG---T---CGTC
gi|47311                      :    ttTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AAT-AACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CATC
gi|47312                      :  ttaTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-T------TCCC------A-AGG-GACCTTTCG--CGATTGC-C--TTTTGTC---CA---T---CG
gi|47313                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCAATTG--CAATAGC-C--TTTTGTC---CG---T---TGTC
gi|47314                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-A------TCGC------A-AGG-GATCTTTTA--CGATCAC-C--TTTTGTC---CA---T---CGT
gi|47315                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-T------TCTC------A-ATG-GACCTTTTG--CGATCAC-C--TTTTTAC---CG---T---CGTC
gi|47316                      :   ttTTTA--T-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TTTA------A-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGT
gi|47317                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTCTGTCTCG-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-C--CTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47318                      :   ttTTTA--T-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-AACCTTTTA--TGATCGT-C--TTTTATC---CG---T---CGTC
gi|47319                      :   ttTTTAA-G-GTCATCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AAGCTTTTG--CAATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47320                      :    tTTTA--G-GTCTCCTCAGTGAG----A--CTTT-G------TCTA------A-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-C--TTATGTC---CG---T---CGTC
gi|47321                      :    ttTTA--G-GTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TTTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGGTTGC-C--TTTTATC---TG---T---CG
gi|47322                      :  ttgTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTTTG------TCTC------A-AGA-GACCTTTTG--TGATCGC-C--TTTT-TC---TG---T---AGTC
gi|47323                      :   ttTTTAA-G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--CGATCGC-C---TTTATC---TG---T---CG
gi|47324                      :    tTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTGG--AGATCGC-C---TTTATC---TA---T---CG
gi|47325                      :    tTTTAA-G-GTCACCT----AGG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--CGATCGC-C---TTTATC---TG---T---CG
gi|47326                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AAC-GACATTTTG--CAATCGC-C--CTTTTTC---TG---T---CATC
gi|47327                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-C------TTTC------A-AAG-AATATTTTA--CTATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47328                      :   ttTTTA--A-GTCACCT----GAG----A--CCTT-G------TCTC------G-AGG-GCTTTTTTG--CGACCGC-C--TTTTGTC---CG---T---TGT
gi|47329                      :   tcTTTAA-G-GTCATCT----GAC----G--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--TAATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47330                      :     tTTA--G-ATCACCT----GAG----A--CTTT-G------CCTC------A-AGT-GACCTTTTG--TGATTGC-C--TATTGTC---CG---T---
gi|47331                      : tttaTTTA--AAGTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--TGATTGC-C---TTTATC---TG---T---CG
gi|47332                      :    tTTTA--G-GTCACCT----AAC----A--CTTT-G------TCTC------A-AGT-GAACTTTTG--TGATTGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGCC
gi|47333                      :   ttTTTA--G-GTCATTT----TAG----A--TTTT-G------TCTC------A-AGG-GATATTTTG--CGATCCC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47334                      :   ttTTTA--A-GTCACCT----GAA----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGT-C--ATGCGT----CG---TG--CGTC
gi|47335                      :   ttTTTA--G-ATCACCT----GAG----A--ATTT-G------TTTC------A-ATG-GACGTTTTG--AGATTGC-C--TTTTGTA---CG---T---CGTC
gi|47336                      :    ttTTA--G-TTCACCT----GAG----A--ATTT-G------TCTC------A-AGG-GGTCTTTTG--CGATCAC-C--TTTAGTC---CG---T---CAT
gi|47337                      :  ttgTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--TTTT-G------TCTT------A-AGG-AACCTTTTG--CGATTGC-C--TTTTAT
gi|47338                      :    tTTTA--G-GTAATCT----GAG----A--CTTT-G------TATA------A-AGG-GACTTTCTG--TGATTGC-C--TTTTGTC---TG---T---CGT
gi|47339                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--T--TCGT-C---ATCGTG---CG---T---CGTC
gi|47340                      :   ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-TGG-GATC-TTTG--AGATCAC-C--TTTTGTC---TG---T---catcgt
gi|47341                      :    tTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-TGA-GACCTTTTG--TGAATGC-C--TTTTATC---CC---T---TGT
gi|47342                      :   ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTT------------C------A-AGG-GACCTTTTG--TGATCGC-C--TTTTGTC---GGTTTT---CGTC
gi|47343                      :    ttTTA--G-GTCACCT----GAG----A--TTTT-G------TCTT------A-AGT-C-CCTTTTG--CAAACGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47344                      : tttaTTTA--G-TTCAACT----GAG----A--CTTT-G------TTTC------A-TGG-GACCTTTTG--CGGTCGC-C--GTGCGTC---GG---T---CGTC
gi|47345                      :   ttTTTA--G-GTCACTT----AAA----A--CTTT-G------TCTC------A-AGT-GACCTTTTG--CAATCACTT--TTTTATC---TA---T---CGT
gi|47346                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATACGTC---CG---T---
gi|47347                      :   ttTTTA--G-GTGACCT----GAG----A--CT---G------TCTC------A-ATT-GACCTTTTG--TGATTCC-C--TTTTGTC---CA---T---CAT
gi|47348                      :   ttTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--C--------------A------A-AGT-GACCTTTC---CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47349                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----ATG----A--CTTT-T------T-------------G-TACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CATC
gi|47350                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-CTG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATGCGTC---CG---T---
gi|47351                      :   ttTTTAA-G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TTTC------A-ATG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATGCGTC---CG---T---
gi|47352                      :    tTTTA--G-GTCACCT----AAG----A--CTTT-G------TTTC------A-ATG-GACCTTTTG--
gi|47353                      :   ttTTTA--G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-G-CTTTTTGTCCG-TCGT-C--GTGCGTC---CG---T---
gi|47354                      :   ttTTTA--G-GTCAC------------------TT-G------TCTC------A-AAG-GACCTTTTG--TGATTGC-CTTTTTTGTC---AG---T---TGTC
gi|47355                      :   ttTTTA--G-GTTACCT----CTG----A--CTTT-G------TGTC------A--GT-GATCTTTTG--CAATCGC-C---TTTGTC---CA---T---TGT
gi|47356                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47357                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-A------TCTC------T-ATG-GACCTTTCT--TCATCAT-C--ATGCGTC---CG---T---
gi|47358                      :   ttTTTA--G-TTCACCT----GAG----C--C----GAAAGGCTCAC------A-AGT-GAGCTTTTG--TGATCGC-C--TTGTGTC---CG---T---CG
gi|47359                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47360                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47361                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47362                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47363                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGAGAGCTTTTG--TGATCCC-C--TTATGTC---CG---T---CGTC
gi|47364                      :   ttTTTAA-G-GTCACTT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-GACC
gi|47365                      :    tTTTA--G-GTCACCC----GAG----A--TAAA-A------TCTC------A-TTT-GACCTTTTT--TGATTGT-C--TTTTGTC---CG---T---CTTC
gi|47366                      :   ttTTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47367                      :   tcTTTA--G-CTCACCT----GAGCAGAA-------G------TCTC------ACAGGTGGGCTTTTG--TGATTGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47368                      :   ttTTTA--G-TTCATCT----GAG----C--CGAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47369                      :   ttTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCATTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47370                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GGCCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---C---CGCC
gi|47371                      :    tTTTA--G-GTAACCT----GAG----A--CTTT-G------TATC------A-AGA-GACCTTTTG--GGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47372                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTA------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCAC-A--TTTTGTC---TG---T---CGT
gi|47373                      :    tTTTA--ATGTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------T-AGG-GACCTT--------TCGT-C--CGTTGTCTTGCG---T---CGT
gi|47374                      :    tTTTAAGG-GTCACCT----TAG----A--CTTT-G------CCTC------A-AGG-GAACTTTTG--CGATCGC-C--TTTTATC---CA---T---CG
gi|47375                      :    tTTTA--G-GTCATCG----GAG-------------------TCTC------A-AGG-AATCTTTTG--CGATTGC-C--TTTTGTC---CG---T---TGCC
gi|47376                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-ATG-GACCTTTTGT-CCATCAT-C--ATGCGTC---CA---T---
gi|47377                      :    tTTTA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGT-GACCTTTTG--CAATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CATC
gi|47378                      :     TTAA--G-GTCACCT----------------TT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47379                      :     TTAA--G-GTCACCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATTGC-T--TTTAGTC---AG---T---CGTC
gi|47380                      :     TTTA--G-ATCATCT----GAA----A--CATT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CAATCGC-A--TTTAATC---CG---T---CGTC
gi|47381                      :     TTTA--T-GTCACTT----GAG----A--CATT-G------TCT-------------------TTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47382                      :     TTTA--G-CTCACCT----GAG----C--CAAA-G------GCTC------ACAGGTGAGCTTTTG--TGATCGC-C--TGGTGTC---CG---T---CGTC
gi|47383                      :      TTA--G-GTCACCT----GAG----A--CATT-G------TCTC------A-AAG-GACCTTTTG--CGGTCAC-C--TTTTGTC---CA---T---TGTC
gi|47384                      :        A--G-GTCGCCT----GAG----A--CTTT-G------TCTC------G-AGT-GACCTTTTG--CAATTGC-C--TCTTGTC---CG---T---CATC
gi|47385                      :        A--G-GTTGCCT----CAG----A--AAAA-G------TCTT------A-TGT-GACCTTTTG--CAATCAC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47386                      :              TCCCCT----TAG----A--CT---G------TCTC------A-AGA-GAACTTTTG--CGAACGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47387                      :                 CTT----GGG----AATCTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47388                      :                 CTT----GGG----AATCTTT-G------TCTC------A-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC
gi|47389                      :                   T----GAG----A--CTTT-G------TCTC------A-AGG-AACCTTTTG--TGATCGC-G--ATTT-TC---CG---T---GGTC
gi|47390                      :                                   TTT-G------TCTT------G-AGG-GACCTTTTG--CGATCGC-C--TTTTGTC---TG---T---CG
gi|47391                      :                                                TC------A-AGT-GACTTTTTG--CGATCGT-C--TTTTGTC---CG---T---CGTC