lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 9 0 1 22 000 0 0 00 00 0 22 1111 88 0 0 4444444444 2222 0 11 0 00 0 00 111111 00 0 0 0 22 0
lowQualScore : . . . . .. ... . . .. .. . .. .... .. . . .......... .... . .. . .. . .. ...... .. . . . .. .
lowQualScore : 8 4 6 2 00 666 3 7 44 88 3 66 6666 88 3 6 2222222222 0000 3 11 3 44 3 44 666666 55 4 4 4 55 5
consensus : TTAA-ATNT-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCCAG
Reference ( gi|162110 ) : TTAA-ATAT-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCAAG
gi|162057 : TTAA-ATAT-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--C-A--T----TG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TC
gi|162058 : ttatttgaatcTTAA-ATTT-TT-GCCAT-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TTT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTATG--TCc
gi|162064 : ttgtttgattaTCAA-ATTT-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--C-T--A----AT--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC----AA-----ACATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCCAGc
gi|162059 : ttatatggataTTAA-TTTT-TT-TACAA-T---TT-G-A--GT--C-T--GTCGGAG--TCT-A-AA---T------C----T-CG--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCCAG
gi|162090 : ttatttgaatcTTAA-ATGT-TT-GACAT-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCT-T-AA---T------C----T-CA--G-AC--AC-A--AG-----ATATTG--AT-AAA-T-TTAGG--CC
gi|162099 : tatatgaatcTTAA-ATTT-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--C-C-------AG--TCA-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGc
gi|162060 : atttgaatcTTAA-ATTT-TT-GACAT-T---TT-G-T--GT--T-A--G----AG--TCT-A-TA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCTAGtcc
gi|162077 : ttatttgaataTTAA-CT-T-TT-GACAT-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCT-A-AA---T------A----T-CA--G-AG--TT-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-ATAGG--TCAAG
gi|162066 : tcatttcaatttTTAA-ATGT-TT-GACAT-T---TC-T-A--GT--C-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--AC-A--AA-----ATATTG--AC-GCA-T-TTAGG--T
gi|162100 : ttatttgaatcTTAA-ATTT-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--CCT-T-AA---T------C----T-CA--G-AC--TA-A--AA-----TTTTTC--AT-GAA-T-TTAGG--TCCAGtcag
gi|162068 : attggaatcTTAA-ATTT-TT-GACAC-T---TT-G-A--GT--C-C--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AA--TC-A--AT-----ATACTG--AT-AAA-G-TTAGG--TC
gi|162069 : ttatttgagttTTAA-ATTT-TT-GACAT-T---TT-G-A--GT--C-C--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AA--TC-A--AT-----ATACTG--AT-AAA-G-TTAGG--TCc
gi|162072 : ttatttgaattTTGG-ATAT-TT-GACAA-T---AT-G-A--AT--C-T--T----AA--TCT-A-AA---T------C----T-AA--G-AC--TC-A--AA-----ATTTTG--AT-GAA-T-TTAGG--Tc
gi|162070 : tcatttgaattTTAA-AAGT-TT-GACAT-A---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--ACT-A-TA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----CTATTG--AT-GAG-T-TTAGG--TCCAGgcag
gi|162071 : ttacttgaatcTTAA-AGTT-TT-GACAA-T---TT-G-A--G-----------------TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--CA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCCAG
gi|162109 : ttgtttcaataTTAA-ATTT-TTCGACAA-T---TT-G-A--GC--C-T--G----A----------A---C------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TC
gi|162091 : tgTTAA-ATCT-TT-AACAA-T---TT-T-C--GT--C-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-CC--AC-T--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--c
gi|162080 : tattcgaatcTTAA-ATTT-TT-GATAT-T---TT-G-A--GT--C-T--G----TG--TCT-A-TA---T------C----T-CC--G-AG--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAAG--T
gi|162076 : ttacttagaatcTTGA-ATTC-TT-CACAA-T---TT-G-A--GT------------AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--CT-GAA-A-TTAGG--TCgcag
gi|162111 : ttatttgaaacTTAA-AAAT-GT-AA-AA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCC-G-AT---T------C----T-CA--G-AT--TC-A--AA-----TTATTG--AT-AAA-T-TTAGG--CCAAGcgg
gi|162081 : TTAA-AT-T-TT-ATTAAGT---TT-G-A--GT--C-T--A----AG--ATC-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAG
gi|162094 : ttatttagatcTTAA-TTTC-TT-TACAA-T---TT-G-A--GT--C-A--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-GC--GC-A--AA-----TAATTG--AT-GAA-T-TTAGG--CC
gi|162093 : tatttgaatcTTAA-ATTT-TA-GACAA-T---TT-G-A--GG--C-T--A----A---------AA---T------C----T-AA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGA--TCCAG
gi|162074 : tatttgaatcTTAA-AT-T-TT-CCCGT-T---TT-G-A--GT--C-TT-G----AG--TGT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TT-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-GCAGG--TCCAG
gi|162079 : ttatttgaatcTTAA-ACTT-TT-GATAT-T---TT-G-A--AT--C-TTTG----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-GC--TC-ATTAC-----ATACTG--AA-GAA-T-TTAGG--TCCAG
gi|162096 : ttatttgaatcTTAA-ATTC-TT-GACAA-T---TT-G-A------C-T------------CT-A-AA---T------C----T-TA--G-AC--TG-A--AA-----ATGTTC--AT-GAA-C-TTAGG--TCTAG
gi|162103 : tatctgaatcTTAA-ATGT-TT-CATAT-T---TT-T-G--GT--C-C--A----AG--TCT-T-AA---T------C----T-TA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTC--AT-GAA-T-TAAG
gi|162086 : atttgaatgTTAA-ATTT-TT-GACAA-T---TT-A-A--GT--C---------------T-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TT-T--AA-----ATATTT--GT-GAA-T-TTaccc
gi|162087 : ttatttgaatcTTAA-ATTT-TT-AACAA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCT-T-AA---T------A----T-TA--G-ACAGTC-A--AA-----
gi|162085 : ttacttgaatcTTAA-ATGT-TT-AGCGT-T---CC-C-A--AT--T-C--G----GA--TCT-A-TA---T------C----T-CA--T-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAG
gi|162098 : ttatttgaatcTTAA-ATGT-TC-CATAT-T---TT-T-A--GT--C-T--GT---AG--TTT-G-AG---TACGATTC----T-CA--T-AC--TC-A--AA-----CTATTG--GT-GAA-T-TTAGactcag
gi|162061 : tatttggttTAA-ATAT-TA-GACAA-T---TT-G-A--GT--C-C--G----AG--TCC-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TG-A--AC-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCtcca
gi|162092 : ttatttgaatccTAA-TTGT-TT-TACAG-T---TT-G-A--GT--T-T--A----AA--TCT-A-AA---T------C----C-CA--G-AC--TT-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCc
gi|162116 : tatttaaatcTAA-ATTT-TT-GTCA--T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCT-A-AT---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----AGATTG--AT-TAA-T-TTGGG--TC
gi|162111 : TAA-ATTTATC-AATAA-T---TT-G-A--AT--C-T--G----AG--------AA---T------CGGACT-CA--G-AC--TC-A--AA-----c
gi|162118 : ttaaaaatgtaaaaTAATATAT-TT-GACA--T---TT-T-A--AT--C-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-T--AA-----ATATTC--AT-AAA-T-TAAGG--ggccaag
gi|162084 : TAA-TTCT-TT-GATAT-T---TT-G-A--GT--T-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TT-A--AA-----CTATCG--AT-GAA-T-TTAacca
gi|162117 : ttgtttgtctaaTAT-ATAT-AC-AACA--T---TT---A--GT--C-G--G----TG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC----AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCCAG
gi|162102 : TAA-A-AT-GT-AACAT-T---TT-A-A--GT--C-T--G----AG--TCC-G-AT---T------C----T-CA--G-AC--CC-A--AT-----TTATTG--AT-GAA-T-TCAGG--TCTAG
gi|162119 : atttgaTAA-ATAT-----AGCA-T---TT-G-A--GT--T-T--G----AG--TCC-G-AT---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----TTATAG--AT-GCA-T-TAAGG--TC
gi|162055 : AA-ATTT-TT-GACAA-T---AT-G-A--GT--T-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCc
gi|162056 : ttatttgaatatgAA-GTTT-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--A-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--A-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCc
gi|162121 : ttatttgattatgAA-ATTT-TT-GACAT-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CG--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GGA-T-TTAGA--TCTAG
gi|162065 : AA-ATTT-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--C-TA-G----AG--TCT-TTAA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTACG--TC
gi|162122 : ttatttgaatatgAA-AAAA-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--C-C--G----AG--TCT-G-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----CTATTT--AT-GAC-T-TTAGG--TCCAGc
gi|162124 : AA-AT-T-TT-GAAAT-T---TT-T-A--TT--C-T--G----GG--TAT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TG-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TAAGG--TC
gi|162083 : AA-ATAT-TC-GATA--T---TT-G-A--GC--T-T--G----AT--TCT-A-AA---T------C----C-AA--A-AC--TC-G--AA-----ATATGA--AT-GAA-T-TTAGG--TCTAGca
gi|162125 : ttatctgaatcttaAA-AAAT-GT-AAGAA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AT--TTG-G-AT---T------C----T-CA--A-AC--TC-A--AA-----TTATTG--AT-GAA-T-TTATG--CCCAG
gi|162108 : AA-ATGT-TA-GA----T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCC-G-AT---T------C----T-CA--A-AC--TC-A--AA-----TTATGG--AT-TAA-T-TTAGA--CCCAG
gi|162107 : ttataaAA-ATAT----AAGAT-T---TT-G-A--GT--C-G--G----AG--TCA-G-AT---T------C----T-CA--G-AC--AC-A--AA-----TTATTG--AT-GAA-T-TAAGG--CCCAG
gi|162067 : ttacaA-ATTT-TT-GACAA-T---TT-G-A--AT--C-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-AGT-T-TTAGG--TC
gi|162073 : ttatttgaatcgtA-ATAT-TTTAACAC-T---TT-G-A--GT--CCT--G----TG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AT--TC-A--AA-----ATGT-----T-GAA-T-TTAGG--TCCAGc
gi|162063 : ttatttgaatcttTAT-TT-TACAA-T---TT-G-A--GT--C-C--G----AG--TCT-A-AA---T------C----TCCA--G-AC--TC----AA-----GTATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TC
gi|162090 : ttatttgaatatgatttAT-TT-ATCAA-TATCTT-G-T--GT--C-T--G----AG--ATT-A-AG---A------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATGTca
gi|162073 : tatatgaatcttaaatgtttgAT-TC-AACAT-T---TT-G-A--AT--C-T--G----AGA-TTT-A-GA----------C----A-CA--GGAC--TC-A--AA-----GTGTTA--A---AA-TATTAAGATTCAttaggccc
gi|162089 : ttatT-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCA-A-AA---T------C----T-CA--A-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCCAGttaggtccag
gi|162062 : tatttgaatatgacagtT-TT-TACAA-T---TT-G-A--GT--C-T--A----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CAA-G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--TC
gi|162106 : ttatttgaatattatttttT-TT-GATAT-T---TT-G-A--GT--C-G--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-GC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGG--ca
gi|162129 : tcattaaaagttactT-TT-GA-AA-T---TT-GGA--GT--C-T--G----AG--TCT-T-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATGTTG--AT-GAA-T-TTAGG--TC
gi|162101 : T-TT-GACAA-T---TT-G-A--GT--T-G--A----AG--TCT-A-AA---T------C----A-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--GT-GAA-T-TTATG--TCCAG
gi|162095 : atttgaatttgaatttT-TT-GACAT-T---TT-G-A--AC--C-T--G----AG--TCT-A-AA---T------T----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATTTTG--AT-GAA-T-TTATG--T
gi|162078 : tatttgaatcttatttttttT-TT-GGCAT-T---TT-G-A--AT--C-T--G----AT--TCT-A-AA---T------C----T-CT--G-GC--TC-A--AA-----ATACTG--AT-GAA-T-TTAGG--TC
gi|162082 : ttatttgaattgtatgtcT-TT-GACAT-T---TT-G-A--GT--C----G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-A---------AA-----ATATTG--AT-GAT-T-TTAGG--TCCAGc
gi|162088 : ttattgaatcttaccttT-TT-GACAT-T---TT-G-A--GC--C-G--G----CG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATAGCC--AT-GAA-T-TTATG--T
gi|162097 : tcatttgtatcttaatctT-TT-GACAA-T---T--G-A--GTT-C-T--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----CAAATA--AT-GAA-T-T
gi|162084 : tatttgaatcctacgct-TC-GATAG-T---TT-A-A--GT--C-T--G----AGA-TTT-A-GA----------C----T-CA--A-AC--TC-A--AA-----ATATCA--AA-GAA-T-Tgacgttc
gi|162129 : ttgtttgtctaatACAT-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--ATT-A-AG---A------C----T-CA--G-AC--TC-C--AA-----ATtgaattta
gi|162122 : tttgaaATAG-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AGA-TTC-A-GA----------C----T-CG--G-AC--TC-A--A--------ATTG---T-CAA-T-TTtgatgaatttaggtc
gi|162070 : aaaATAG-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG---AT-ATAG---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AT-----ATGTttatgactttaggtccag
gi|162123 : ttacttgaatcttaaaagtttgATAA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--------AA---TTGGA--C----T-CG--G-AC--TC-A--AA-----tgatgagtttaggtccag
gi|162133 : aaaaatgtaagaACAA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AGA-TTT-G-GA----------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----tgatgaatttaggccc
gi|162130 : aATAA-T---TT-G-A--GT--C-T--T----A-------A-AA---T------CAGACT-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATCTTtgatggatttagacccag
gi|162127 : tATAA-C---TC-G-A--GT--C-T--G----AGAATCG-A-A-----------C----T-CA--G-GC--TC-A--AA-----ATCTTtgatgaatttaggccc
gi|162115 : aaaatgtATAG-T---TC-G-A--GT--C-TTAG----AA--TC--A-AA----------C----T-CG--G-AC--TC-A--AA-----ATCTTtgatgaatttaggccc
gi|162113 : ttacaaaatgtACAA-T---TT-G-A--AT--C-T--G----AGAAT-T-A-GA----------C----T-CA--A-AC--TC-T--AA-----ATCTTtgatgaattttaggcccag
gi|162125 : ttacaaaatgtATAA-T---TT-G-A--GT--T-T--G----AGAATCC-A-AA---T------C-------A--G-AC--TC-A--AA-----tgatcaatttagaccc
gi|162119 : aaaaatgtaagaaATAA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AGAATCG-G-A-----------C----T-CA--A-AC--TC-A--AATGCT-ATATTtgatgaatttatgcccag
gi|162108 : taATAA-T---TT-G-A--GT--T-T--G----AG--------AA---T------CGGACT-CA--G-AC--TC-A--AA-----agatgcattaaggtcc
gi|162114 : ttataaaaatgttagaATAA-T---TT-G-A--GT--G-T--G----AGAATC--A-GA----------C----T-CAA-G-AC--TC-A--AA-----ATCTTggattaatttagacccag
gi|162107 : ttacaaaatgtATAA-T---TT-G-T--GT--C-T--G----AGAATCT-G-A-----------C----T-CC--G-AC--TC-A--AA-----ATCTTtgataaatttgcacccag
gi|162131 : ttacaaaatatACAA-T---TC-A-A--GTTGC-T--G----AG--TTT-A-AG---TTCGATTC----T-CG--T-AC--TC-A--AA-----TTATTG--AT-GAA-T-TTAGG--tgatgaattaaggcccag
gi|162128 : aACAA-T---TT-G-A--GT--C-TAAG----AA--TCG-G-A-----------C----T-CA--G-AC--TC-----------ATATTaccag
gi|162100 : atgtaaAA-T---TT-T-A--GT--C-T--G----AG--ATT-A-AG---G------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----TTGTCA--A--AAA-T-TTAAG--agatgaattaaggctcag
gi|162128 : attggaatAA-T---AT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCC-G-AT---T------C----T-TA--G-AC--TC-A--AA-----TTGTAG--AT-GAA-T-TAAGGC-TCAtttcatgaatttaggtccag
gi|162123 : atgtaaA-T---TT-G-A--GT--C-C--G----AG--TCC-A-AT---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----TTATTG--AT-GAA-T-TTAGG--CCg
gi|162133 : aaaaatgtaagA-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCC-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----TTGTTG--AT-GGA-T-TTAGA--CCCAGc
gi|162104 : A-T---TT-G-A--AT--A-T--G----AAAATCT-C-AA---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATCG--AT-GAA-T-TTAGG--CC
gi|162075 : ttgcttgttaaaatggagttA-T---TG-G-A--AT--C-T--A----AG--TCT-G-AT---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----TTATTG--AT-GAA-T-TTAca
gi|162126 : ttacttggttttacaaaaaggtaagA-T---TT-G-A--GC--C-C--T----AG--TTT-G-AT---T------C----T-CA--G-AA--TC-A--AA-----TTATTG--AT-GAA-T-TTAGG--CCCAGtgaccag
gi|162105 : aaaaatgtaagA-T---TT-G-C--GT--C-T--G----AG--TCC-G-AT---T------C----T-CA--G-AC--TC----AG-----TTATTG--AT-GAA-T-TTAAG--CCCAG
gi|162113 : ttaacaaaaatgtaatA-T---TTAG-A--GT--T-T--G----AG--TCT-A-AT---T------C----T-CA--G-AT--TC-A--AA-----TTGTTG--AT-CAA-T-TTAG
gi|162132 : ttacaaaatgtaagA-T---TT-A-A--AT--C-T--G----AG--TCC-G-AT---T------C----C-C---G-AC--TC-A--AA-----TTAGTG--AT-GAA-T-TTAGG--CCaccc
gi|162134 : A-T---GT-A-A--GT--G-T--A----AA--TCCGA-AA---T------T----T-CA--G-AC--TC-C--AA-----ATATTG--AT-GAA-T-TTAGC--TC
gi|162055 : -T---TT-G-A--GT--C-T--G----AGA-TTT-A-GA----------C----T-CA--A-AC--TC-----------ATATTGTCAA-AAA-T-TTc
gi|162089 : ttatttgaatatg-T---TT-G-A--GT--T-T--G----AGATTTT-G-A-----------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----atattgatgaatttaggtcc
gi|162056 : tatttgaatatgacagttttgacaa-T---TT-G-A--GT--T-T--G----AGA-TTT-A-GA----------C----T-CA--T-AC--TC-A--AA-----atattgatgaatttaggtccag
gi|162121 : ttatttgattatgaagtttttgacaa-T---TT-G-A--GT--C-C--G----AGA-TTT-A-GA----------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATGTCA--A--AAA-T-TTatattgatgaatttaggtc
gi|162062 : -T---TT-G-A--GT--C-TT-G----AGA-TTT-A-GA----------C----T-TA--G-AC--TC-A--AA-----atattgatggatttagatctag
gi|162058 : ttatttgaatattatttttttttacaa-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AGA-TTT-A-AA----------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATatattgatgaatttaggtcca
gi|162067 : ttgtttgattattaaatttttgcc-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AGA-TTT-A-GA----------C----T-CA--G-AT--TC-A--AA-----atattgatgaatttatgtcc
gi|162065 : ttatttgaatcgtaatttttgacaa-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--ATT-A-AAGACT------C----T--A--G-AC--TC-A--AA-----TTGTCA--A--AAA-T-TTatattgatagttttaggtcc
gi|162106 : ttatttgaatatg-T---TT-G-A--GC--C-T--G----AGA-TTT-A-GA----------C----T-CC--G-AC--TC-A--AA-----ATATatattgatgaatttacgtcc
gi|162116 : tcattaaaagttacttttg-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AGAAT-T-A-GA----------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----atattgatgaatttagg
gi|162095 : taaatttttgtca-T---TT-G-A--GT--C-T--GA---AA--TTT-A-GA----------C----T-CA--G-GT--TC-A--AA-----ATGTagattgattaatttgggtcc
gi|162080 : tatttgaatcttattttttttttg-T---TT-G-A--CT--C-G--G----AGA-TAT-A-GA----------C----A-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATCA--A--AAA-T-TTAAG--attttgatgaatttatgt
gi|162081 : ttacttagaat-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--ATT-T-GA---T------C----T-TA--G-AC--TC-A--AA-------CTTA--ATAAAA-T-TTAAG--atattgatgaatttaagtgcag
gi|162130 : ttatttagat-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCT-G-AT---T------T----T-AA--G-AC--TC-A--AA-----TTATTG--AT-GAA-T-TTAGG--CCatattgatgaatttag
gi|162135 : taagat-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCC-G-AT---T------A----T-CT--G-AC--TC-A--AA-----CTATTG--AT-GAA-T-TTCGG--CCAAGc
gi|162112 : -T---TT-G-C--AC--C-T--G----AG--TTC-A-AT---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----TTATTG--AT-GAA-T-TTAGG--CC
gi|162127 : ttacaaaatgtaagat-T---TT-G-A--GC--C-T--G----AG--TTC-G-AT---T------C----T-CA--G-AC--TC-G--AG-----TTATTG--AT-GAA-T-TTAGG--CC
gi|162115 : aaaatgtaagat-T---TT-G-A--GT--C-C--G----AG--TTT-G-AT---T------C----T-AA--G-AC--TC-G--AA-----CTATTG--AT-GAATT-TTAGG--CCCAGc
gi|162136 : ttacaaaatgtaagat-T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCC-G-AT---T------C----T-CA--G-AC--TC-C--AGCTTCTGTATTG--AT-GAA-T-CTAGG--CC
gi|162087 : -T---TT-G-ACTGT--C-T--A----AT--ATT-A-AG---A------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----TTGTTA--A--AAA-T-TTAAGATTCAAGc
gi|162114 : tta-T---TT-G-A--GT--C-TT-G----AG--TCT-G-AT---T------C----T-CA--C-AC--TC-A--AA-----TTATTG--AT-AAA-T-TT
gi|162138 : ttacaaaatgtaagat-T---TT-G-A--GT--C-C--G----AG--TCT-G-AT---T------C----T-CC--A-AC--TG-A--AA-----TTATTG--AT-GAA-T-GTAGG--CCgcacccag
gi|162137 : -T---TT-G-A--GT--C-T--G----AG--TCT--------------------------G-AC--TC-A--TA-----CTATTG--AT-GAA-T-TTATG--TCca
gi|162068 : ---TT-G-A--TT--C-T--G----AGA-TTT-A-GA----------C----T-CG--G-AC--TC-A--AA-----GTGTCA--A--AAA-T-TTAc
gi|162069 : ttatttgagttt---TT-G-A--TT--C-T--G----AGA-TTT-A-GA----------C----T-CG--G-AC--TC-A--AA-----ATGTCA--A--AAA-T-TTAtatactgataaagttaggtcc
gi|162120 : ttatttgaattt---TT-GTA--GT--C-T--C----AG--TCC-A-AT---T------C----T-CA--G-AC--TT-A--AT-----TTATTG--AT-GAA-T-TTAGG--CCtatactgataaagttaggtcc
gi|162139 : aaaaatgtaaga---TT-G-A--GA--T-T--G----AG--TCT-G-GG---T------T----T-TA--G-TT--TC-A--AA-----ATGTTG--AT-GAA-T-TTAGG--TCca
gi|162079 : T-G-A--GC--C-T--G----AGA-TTT-A-GA----------C----T-CAAAG-AT--TC-A--AA-----ATATCA--A--AAG-T-TTAAGATTCAc
gi|162140 : ttat-G-A--TT--T-T--G----AG--TCC-A-AT---T------C----C-CA--G-AC--TC-A--AA-----TTAATG--AT-GAA-T-TTAGG--TCttacatactgaagaatttaggtccag
gi|162141 : -G-A--GT--C-C--C----AG--TCT-G-AA---T------C----T-AT--A-AC--TC-A--AA-----ATACTG--AT-GAA-T-TTTGG--Tc
gi|162142 : --GT--C-C--G----AG--TCT-A-AA---T------C----T-CA--G-AC--TCAA--AA-----ATGTTT--AT-GAA-T-TTAtc
gi|162143 : --C-T--GC---AA--TCT-T-AA---TT-----C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----ATATTG--AT-TAA-T-TCAGG--TCCAGtagccag
gi|162144 : ---T------C----T-CA--G-AC--TC-A--AA-----TTATTG--AT-GAA-T-TTAAG--CCCAG
Alignments
lowQualScore : 1 3 0 1 2 0 0 11 0 22 1111 00 0 0 333333 0 0 00 0 00 222222 0
lowQualScore : . . . . . . . .. . .. .... .. . . ...... . . .. . .. ...... .
lowQualScore : 6 1 7 3 2 5 9 11 4 00 9999 66 4 4 000000 4 4 66 4 66 555555 4
consensus : TTAA-ATTTT-T-GACAATTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
Reference ( family-332 ) : TTAA-ATNTT-T-GACAATTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162055 : AA-ATTTT-T-GACAATAT-G-AGT--T-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162056 : ttatttgaatatgAA-GTTTT-T-GACAATTT-G-AGT--A-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162057 : ttatttgattatgTTAA-ATATT-T-GACAATTT-G-AGT--C-A--T----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162058 : ttatttgaatcTTAA-ATTTT-T-GCCATTTT-G-AGT--C-T--G----AG--TTT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTATGTCC
gi|162059 : ttgtttgattaTTAA-TTTTT-T-TACAATTT-G-AGT--C-T--GTCGGAG--TCT-A-AAT------CT-CG-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162060 : ttatttgaatcTTAA-ATTTT-T-GACATTTT-G-TGT--T-A--G----AG--TCT-A-TAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCTAG
gi|162061 : ttatttgaataTAA-ATATT-A-GACAATTT-G-AGT--C-C--G----AG--TCC-A-AAT------CT-CA-GAC--TG-A--AC-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162062 : ttatttgaatccTTTT-T-TACAATTT-G-AGT--C-T--A----AG--TCT-A-AAT------CT-CAAGAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCA
gi|162063 : ttatttgaatattatttTATT-T-TACAATTT-G-AGT--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CTCCA-GAC--TC----AA-----GTATTGATGAA-TTTAGGTCCA
gi|162064 : ttatttgaatatgatttTCAA-ATTTT-T-GACAATTT-G-AGT--C-T--A----AT--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC----AA-----ACATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162065 : ttatatggataAA-ATTTT-T-GACAATTT-G-AGT--C-TA-G----AG--TCT-TTAAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTACGTCC
gi|162066 : ttatttgaatatgTTAA-ATGTT-T-GACATTTC-T-AGT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--AC-A--AA-----ATATTGACGCA-TTTAGGTTCAG
gi|162067 : ttatttgaatcA-ATTTT-T-GACAATTT-G-AAT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATAGT-TTTAGGTCC
gi|162068 : ttatttgaatcgtTTAA-ATTTT-T-GACACTTT-G-AGT--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAA--TC-A--AT-----ATACTGATAAA-GTTAGGTCC
gi|162069 : ttatttgagttTTAA-ATTTT-T-GACATTTT-G-AGT--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAA--TC-A--AT-----ATACTGATAAA-GTTAGGTCC
gi|162070 : ttatttgaattTTAA-AAGTT-T-GACATATT-G-AGT--C-T--G----AG--ACT-A-TAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CTATTGATGAG-TTTAGGTCCAG
gi|162071 : ttacttgaatcTTAA-AGTTT-T-GACAATTT-G-AG-----------------TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--CA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162072 : ttgtttcaataTTGG-ATATT-T-GACAATAT-G-AAT--C-T--T----AA--TCT-A-AAT------CT-AA-GAC--TC-A--AA-----ATTTTGATGAA-TTTAGGTGCAG
gi|162073 : tcatttgaattTTAATAT-TT-T-AACACTTT-G-AGT--CCT--G----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----ATGT---TGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162074 : ttatttgaatcTTAA-AT-TT-T-CCCGTTTT-G-AGT--C-TT-G----AG--TGT-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TGCAGGTCCAG
gi|162075 : ttatttgaatcATTG-G-AAT--C-T--A----AG--TCT-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTATGACCAG
gi|162076 : ttacttggttttacaaaaaggtaagTTGA-ATTCT-T-CACAATTT-G-AGT------------AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGCTGAA-ATTAGGTCCGG
gi|162077 : ttatttgaaacTTTA-ACTTT-T-GACATTTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------AT-CA-GAG--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TATAGGTCAAG
gi|162078 : tcatttcaattTCTT-T-GGCATTTT-G-AAT--C-T--G----AT--TCT-A-AAT------CT-CT-GGC--TC-A--AA-----ATACTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162079 : ttatttgaattgtatgTTAA-ACTTT-T-GATATTTT-G-AAT--C-TTTG----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--TC-ATTAC-----ATACTGAAGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162080 : ttatttgaatcTTAA-ATTTT-T-GATATTTT-G-AGT--C-T--G----TG--TCT-A-TAT------CT-CC-GAG--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAAGTGCAG
gi|162081 : ttacttagaatcTTAA-ATTTTAT-TA-AGTTT-G-AGT--C-T--A----AG--ATC-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAG
gi|162082 : ttatttagatcTTTT-T-GACATTTT-G-AGT--C----G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GA---------AA-----ATATTGATGAT-TTTAGGTCCAG
gi|162083 : ttattgaatcttaccAA-ATATT-C-GATA-TTT-G-AGC--T-T--G----AT--TCT-A-AAT------CC-AA-AAC--TC-G--AA-----ATATGAATGAA-TTTAGGTCTAG
gi|162084 : ttatctgaatcttaTAA-TTCTT-T-GATATTTT-G-AGT--T-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-A--AA-----CTATCGATGAA-TTTA
gi|162085 : ttgtttgtctaaTTAA-ATGTT-T-AGCGTTCC-C-AAT--T-C--G----GA--TCT-A-TAT------CT-CA-TAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGACTCAG
gi|162086 : ttatttgaatcTTAA-ATTTT-T-GACAATTT-A-AGT--C---------------T-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-T--AA-----ATATTTGTGAA-TTT
gi|162087 : ttatttgaatcTTAA-ATTTT-T-AACAATTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------AT-TA-GACAGTC-A--AA-----
gi|162088 : ttacttgaatcTTAA-TCTTT-T-GACATTTT-G-AGC--C-G--G----CG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATAGCCATGAA-TTTATGT
gi|162089 : tcatttgtatcTT-T-GACAATTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCA-A-AAT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162090 : tatttgaatatgacagtTTAA-ATGTT-T-GACATTTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------CT-CA-GAC--AC-A--AG-----ATATTGATAAA-TTTAGGCCC
gi|162091 : tatatgaatcTTAA-ATCTT-T-AACAATTT-T-CGT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GCC--AC-T--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGG
gi|162092 : tattcgaatcTAA-TTGTT-T-TACAGTTT-G-AGT--T-T--A----AA--TCT-A-AAT------CC-CA-GAC--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162093 : tatttaaatcTTAA-ATTTT-A-GACAATTT-G-AGG--C-T--A----A---------AAT------CT-AA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGATCCAG
gi|162094 : tatttgaatcTTAA-TTTCT-T-TACAATTT-G-AGT--C-A--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--GC-A--AA-----TAATTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162095 : tatttgaatcTTTT-T-GACATTTT-G-AAC--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------TT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATTTTGATGAA-TTTATGT
gi|162096 : tatttgaatcttatttttTTAA-ATTCT-T-GACAATTT-G-A----C-T------------CT-A-AAT------CT-TA-GAC--TG-A--AA-----ATGTTCATGAA-CTTAGGTCTAG
gi|162097 : tatctgaatcTT-T-GACAATT--G-AGTT-C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CAAATAATGAA-TTGACGTTC
gi|162098 : tatttgaatcctacgctTTAA-ATGTT-C-CATATTTT-T-AGT--C-T--GT---AG--TTT-G-AGTACGATTCT-CA-TAC--TC-A--AA-----CTATTGGTGAA-TTTA-GTCCA
gi|162099 : tatttggttTTAA-ATTTT-T-GACAATTT-G-AGT--C-C-------AG--TCA-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTA-GTCC
gi|162100 : atttgaatcTTAA-ATTTT-T-GACAATTT-G-AGT--C-T--G----AG--CCT-T-AAT------CT-CA-GAC--TA-A--AA-----TTTTTCATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162101 : attggaatcTTGA-ATTTT-TTGACAATTT-G-AGT--T-G--A----AG--TCT-A-AAT------CA-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGGTGAA-TTTATGTCCAG
gi|162102 : atttgaatAA-ATGT----AACATTTT-A-AGT--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--CC-A--AT-----TTATTGATGAA-TTCAGGTCTAG
gi|162103 : atttgataTTAA-ATGTT-T-CATATTTT-T-GGT--C-C--A----AG--TCT-T-AAT------CT-TA-GAC--TC-A--AA-----ATATTCATGAA-TTAAGACCC
gi|162104 : atttgaatgATTT-G-AAT--A-T--G----AAAATCT-C-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATCGATGAA-TTTAGGCCCA
gi|162105 : ttgcttgttaaaatggagttATTT-G-CGT--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC----AG-----TTATTGATGAA-TTTAAGCCCAG
gi|162106 : ttaacaaaaatgtaat-ACTTT-T-GATATTTT-G-AGT--C-G--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGG
gi|162107 : tcattaaaagttTTT-G-AGT--C-G--G----AG--TCA-G-ATT------CT-CA-GAC--AC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTAAGGCCCAG
gi|162108 : ttacaaaatataagatAA-ATGTT-A-GA---TTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----TTATGGATTAA-TTTAGACCCAG
gi|162109 : ttataaTTAA-ATTTT-TCGACAATTT-G-AGC--C-T--G----A----------AC------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162110 : tgTTAA-ATATT-T-GACAATTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCAAG
gi|162111 : TTAA-AAATG-T-AA-AATTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----TTATTGATAAA-TTTAGGCCAAG
gi|162112 : TTT-G-CAC--C-T--G----AG--TTC-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162113 : ttacaaaatgtaagatATTTAG-AGT--T-T--G----AG--TCT-A-ATT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----TTGTTGATCAA-TTTAGACCC
gi|162114 : ttacaaaatgtaagTTT-G-AGT--C-TT-G----AG--TCT-G-ATT------CT-CA-CAC--TC-A--AA-----TTATTGATAAA-TTTGCACCCAG
gi|162115 : ttacaaaatgtaagatTTT-G-AGT--C-C--G----AG--TTT-G-ATT------CT-AA-GAC--TC-G--AA-----CTATTGATGAATTTTAGGCCCAG
gi|162116 : ttacaaaatgtaagatTAA-ATTTT-T-GTCA-TTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCT-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----AGATTGATTAA-TTTGGGTCC
gi|162117 : ATTT---AGT--C-G--G----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA------TATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162118 : tatatatacaacTAATATATT-T-GACA-TTT-T-AAT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-T--AA-----ATATTCATAAA-TTAAGGACCA
gi|162119 : ATTT-G-AGT--T-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATAGATGCA-TTAAGGTCC
gi|162120 : taaatatagcTT-GTAGT--C-T--C----AG--TCC-A-ATT------CT-CA-GAC--TT-A--AT-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCCA
gi|162121 : aaaaatgtaagaAA-ATTTT-T-GACATTTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CG-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGGA-TTTAGATCTAG
gi|162122 : T-T-GACAATTT-G-AGT--C-C--G----AG--TCT-G-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CTATTTATGAC-TTTAGGTCCAG
gi|162123 : aaaaaaATTT-G-AGT--C-C--G----AG--TCC-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162124 : aaaaatgtaagAA-AT-TT-T-GAAATTTT-T-ATT--C-T--G----GG--TAT-A-AAT------CT-CA-GAC--TG-A--AA-----ATATTGATGAA-TTAAGGTCCA
gi|162125 : AA-ATGT----AAGAATTT-G-AGT--C-T--G----AT--TTG-G-ATT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTATGCCCAG
gi|162126 : aaATTT-G-AGC--C-C--T----AG--TTT-G-ATT------CT-CA-GAA--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCCAG
gi|162127 : aaaaatgtaagTTT-G-AGC--C-T--G----AG--TTC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-G--AG-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162128 : aaaatgtaagatAATAT-G-AGT--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-TA-GAC--TC-A--AA-----TTGTAGATGAA-TTAAGGCTCAG
gi|162129 : atgtaaTT-T-GA-AATTT-GGAGT--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATGTTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162130 : TTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCT-G-ATT------TT-AA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162131 : taagatACAATTC-A-AGTTGC-T--G----AG--TTT-A-AGTTCGATTCT-CG-TAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGACCAG
gi|162132 : aATTT-A-AAT--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CC-C--GAC--TC-A--AA-----TTAGTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162133 : ATTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCC-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTGTTGATGGA-TTTAGACCCAG
gi|162134 : ATGT-A-AGT--G-T--A----AA--TCCGA-AAT------TT-CA-GAC--TC-C--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGCTCC
gi|162135 : TTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------AT-CT-GAC--TC-A--AA-----CTATTGATGAA-TTTCGGCCAAG
gi|162136 : TTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-C--AGCTTCTGTATTGATGAA-TCTAGGCCC
gi|162137 : TTT-G-AGT--C-T--G----AG--TCT------------------GAC--TC-A--TA-----CTATTGATGAA-TTTATGTCC
gi|162138 : TTT-G-AGT--C-C--G----AG--TCT-G-ATT------CT-CC-AAC--TG-A--AA-----TTATTGATGAA-TGTAGGCCCA
gi|162139 : TT-G-AGA--T-T--G----AG--TCT-G-GGT------TT-TA-GTT--TC-A--AA-----ATGTTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162140 : -G-ATT--T-T--G----AG--TCC-A-ATT------CC-CA-GAC--TC-A--AA-----TTAATGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162141 : -G-AGT--C-C--C----AG--TCT-G-AAT------CT-AT-AAC--TC-A--AA-----ATACTGATGAA-TTTTGGTTC
gi|162142 : GT--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TCAA--AA-----ATGTTTATGAA-TTTATAGCCAG
gi|162143 : --C-T--GC---AA--TCT-T-AATT-----CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATTAA-TTCAGGTCCAG
gi|162144 : T------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAAGCCCAG
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 1 0 1 0 1 0 00 0 22 1111 00 0 0 111111 0 0 00 0 00 222222 0
lowQualScore : . . . . . . . . . .. . .. .... .. . . ...... . . .. . .. ...... .
lowQualScore : 8 7 7 4 7 8 5 4 5 66 4 00 4444 66 4 4 777777 4 4 66 4 66 555555 4
consensus : TTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
Reference ( family-332 ) : TTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162055 : AA-AT-T-TT-T-GACAATAT-G-AG-T--T-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162056 : ttatttgaatatgAA-GT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--A-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162057 : ttatttgattatgTTAA-AT-A-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-A--T----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162058 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GCCATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TTT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTATGTCC
gi|162059 : ttgtttgattaTTAA-TT-T-TT-T-TACAATTT-G-AG-T--C-T--GTCGGAG--TCT-A-AAT------CT-CG-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162060 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GACATTTT-G-TG-T--T-A--G----AG--TCT-A-TAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCTAG
gi|162061 : ttatttgaataTAA-AT-A-TT-A-GACAATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCC-A-AAT------CT-CA-GAC--TG-A--AC-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162062 : ttatttgaatccT-T-TT-T-TACAATTT-G-AG-T--C-T--A----AG--TCT-A-AAT------CT-CAAGAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCA
gi|162063 : ttatttgaatattattt-AT-T-TT----ACAATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CTCCA-GAC--TC----AA-----GTATTGATGAA-TTTAGGTCCA
gi|162064 : ttatttgaatatgattttTCAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--A----AT--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC----AA-----ACATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162065 : ttatatggataAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-TA-G----AG--TCT-TTAAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTACGTCC
gi|162066 : ttatttgaatatgTTAA-AT-G-TT-T-GACATTTC-T-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--AC-A--AA-----ATATTGACGCA-TTTAGGTTCAG
gi|162067 : ttatttgaatcA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AA-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATAGT-TTTAGGTCC
gi|162068 : ttatttgaatcgtTTAA-AT-T-TT-T-GACACTTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAA--TC-A--AT-----ATACTGATAAA-GTTAGGTCC
gi|162069 : ttatttgagttTTAA-AT-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAA--TC-A--AT-----ATACTGATAAA-GTTAGGTCC
gi|162070 : ttatttgaattTTAA-AA-G-TT-T-GACATATT-G-AG-T--C-T--G----AG--ACT-A-TAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CTATTGATGAG-TTTAGGTCCAG
gi|162071 : ttacttgaatcTTAA-AG-T-TT-T-GACAATTT-G-AG------------------TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--CA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162072 : ttgtttcaataTTGG-AT-A-TT-T-GACAATAT-G-AA-T--C-T--T----AA--TCT-A-AAT------CT-AA-GAC--TC-A--AA-----ATTTTGATGAA-TTTAGGTGCAG
gi|162073 : tcatttgaattA-ATAT-TT-T-AACACTTT-G-AG-T--CCT--G----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----ATGT---TGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162074 : ttatttgaatcttTTAA-AT-T-TT-C-C-CGTTTT-G-AG-T--C-TT-G----AG--TGT-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TGCAGGTCCAG
gi|162075 : ttatttgaatcATTG-G-AA-T--C-T--A----AG--TCT-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTATGACCAG
gi|162076 : ttacttggttttacaaaaaggtaagTTGA-AT-T-CT-T-CACAATTT-G-AG-T------------AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGCTGAA-ATTAGGTCCGG
gi|162077 : ttatttgaaacTTTA-AC-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------AT-CA-GAG--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TATAGGTCAAG
gi|162078 : tcatttcaattT-C-TT-T-GGCATTTT-G-AA-T--C-T--G----AT--TCT-A-AAT------CT-CT-GGC--TC-A--AA-----ATACTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162079 : ttatttgaattgtatgTTAA-AC-T-TT-T-GATATTTT-G-AA-T--C-TTTG----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--TC-ATTAC-----ATACTGAAGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162080 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GATATTTT-G-AG-T--C-T--G----TG--TCT-A-TAT------CT-CC-GAG--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAAGTGCAG
gi|162081 : ttacttagaatcTTAA-AT-T-TTAT-TA-AGTTT-G-AG-T--C-T--A----AG--ATC-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAG
gi|162082 : ttatttagatcT-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C----G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GA---------AA-----ATATTGATGAT-TTTAGGTCCAG
gi|162083 : ttattgaatcttaccAA-AT-A-TT-C-GATA-TTT-G-AG-C--T-T--G----AT--TCT-A-AAT------CC-AA-AAC--TC-G--AA-----ATATGAATGAA-TTTAGGTCTAG
gi|162084 : ttatctgaatcttaTAA-TT-C-TT-T-GATATTTT-G-AG-T--T-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-A--AA-----CTATCGATGAA-TTTA
gi|162085 : ttgtttgtctaaTTAA-AT-G-TT-T-AGCGTTCC-C-AA-T--T-C--G----GA--TCT-A-TAT------CT-CA-TAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGACTCAG
gi|162086 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-A-AG-T--C---------------T-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-T--AA-----ATATTTGTGAA-TTT
gi|162087 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-AACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------AT-TA-GACAGTC-A--AA-----
gi|162088 : ttacttgaatcTTAA-TC-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-C--C-G--G----CG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATAGCCATGAA-TTTATGT
gi|162089 : tcatttgtatc-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCA-A-AAT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162090 : tatttgaatatgacagTTAA-AT-G-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------CT-CA-GAC--AC-A--AG-----ATATTGATAAA-TTTAGGCCC
gi|162091 : tatatgaatcTTAA-AT-C-TT-T-AACAATTT-T-CG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GCC--AC-T--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGG
gi|162092 : tattcgaatcA-AT-TGTT-T-TACAGTTT-G-AG-T--T-T--A----AA--TCT-A-AAT------CC-CA-GAC--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162093 : tatttaaatctTTAA-AT-T-TT-A-GACAATTT-G-AG-G--C-T--A----A---------AAT------CT-AA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGATCCAG
gi|162094 : tatttgaatcTTAA-TT-T-CT-T-TACAATTT-G-AG-T--C-A--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--GC-A--AA-----TAATTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162095 : tatttgaatcT-T-TT-T-GACATTTT-G-AA-C--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------TT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATTTTGATGAA-TTTATGT
gi|162096 : tatttgaatcttatttttTTAA-AT-T-CT-T-GACAATTT-G-A-----C-T------------CT-A-AAT------CT-TA-GAC--TG-A--AA-----ATGTTCATGAA-CTTAGGTCTAG
gi|162097 : tatctgaatc-T-TT-T-GACAA-TT-G-AGTT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CAAATAATGAA-TTGACGTTC
gi|162098 : tatttgaatcctacgc-AT-T-TT-T----AGTCT-GTAG-T--T-T--G----AG--TAC-G-ATT------CT-CA-TAC--TC-A--AA-----CTATTGGTGAA-TTTA-GTCCA
gi|162099 : tatttggttttaaatgttccatTTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-C-------AG--TCA-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTA-GTCC
gi|162100 : atttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--CCT-T-AAT------CT-CA-GAC--TA-A--AA-----TTTTTCATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162101 : attggaatcTTGA-AT-T-TTTT-GACAATTT-G-AG-T--T-G--A----AG--TCT-A-AAT------CA-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGGTGAA-TTTATGTCCAG
gi|162102 : atttgaat-T-AACATTTT-A-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--CC-A--AT-----TTATTGATGAA-TTCAGGTCTAG
gi|162103 : atttgataaaatgTTAA-AT-G-TT-T-CATATTTT-T-GG-T--C-C--A----AG--TCT-T-AAT------CT-TA-GAC--TC-A--AA-----ATATTCATGAA-TTAAGACCC
gi|162104 : atttgaatgATTT-G-AA-T--A-T--G----AAAATCT-C-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATCGATGAA-TTTAGGCCCA
gi|162105 : ttgcttgttaaaatggagttATTT-G-CG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC----AG-----TTATTGATGAA-TTTAAGCCCAG
gi|162106 : ttaacaaaaatgtaat-AC-T-TT-T-GATATTTT-G-AG-T--C-G--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGG
gi|162107 : tcattaaaagttTTT-G-AG-T--C-G--G----AG--TCA-G-ATT------CT-CA-GAC--AC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTAAGGCCCAG
gi|162108 : ttacaaaatataagatATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----TTATGGATTAA-TTTAGACCCAG
gi|162109 : ttataaaaatgttagTTAA-AT-T-TT-TCGACAATTT-G-AG-C--C-T--G----A----------AC------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162110 : tgTTAA-AT-A-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCAAG
gi|162111 : AATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----TTATTGATAAA-TTTAGGCCAAG
gi|162112 : ttaaaaatgtaaTTT-G-CA-C--C-T--G----AG--TTC-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162113 : ttacaaaatgtaagatATTTAG-AG-T--T-T--G----AG--TCT-A-ATT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----TTGTTGATCAA-TTTAGACCC
gi|162114 : ttacaaaatgtaagTTT-G-AG-T--C-TT-G----AG--TCT-G-ATT------CT-CA-CAC--TC-A--AA-----TTATTGATAAA-TTTGCACCCAG
gi|162115 : ttacaaaatgtaagatTTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TTT-G-ATT------CT-AA-GAC--TC-G--AA-----CTATTGATGAATTTTAGGCCCAG
gi|162116 : ttacaaaatgtaagatTAA-AT-T-TT-T-GTCA-TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----AGATTGATTAA-TTTGGGTCC
gi|162117 : ATTT---AG-T--C-G--G----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA------TATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162118 : tatatatacaacTAATAT-A-TT-T-GACA-TTT-T-AA-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-T--AA-----ATATTCATAAA-TTAAGGACCA
gi|162119 : ATTT-G-AG-T--T-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATAGATGCA-TTAAGGTCC
gi|162120 : taaatatagcTT-GTAG-T--C-T--C----AG--TCC-A-ATT------CT-CA-GAC--TT-A--AT-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCCA
gi|162121 : aaaaatgtaagaAA-AT-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CG-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGGA-TTTAGATCTAG
gi|162122 : T-T-GACAATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-G-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CTATTTATGAC-TTTAGGTCCAG
gi|162123 : aaaaaaATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCC-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162124 : aaaaatgtaagAA-AT-T-TT---GAAATTTT-T-AT-T--C-T--G----GG--TAT-A-AAT------CT-CA-GAC--TG-A--AA-----ATATTGATGAA-TTAAGGTCCA
gi|162125 : AATTT-G-AG-T--C-T--G----AT--TTG-G-ATT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTATGCCCAG
gi|162126 : aaaaatgtaagATTT-G-AG-C--C-C--T----AG--TTT-G-ATT------CT-CA-GAA--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCCAG
gi|162127 : aaaaatgtaagTTT-G-AG-C--C-T--G----AG--TTC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-G--AG-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162128 : aaaatgtaagatAATAT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-TA-GAC--TC-A--AA-----TTGTAGATGAA-TTAAGGCTCAG
gi|162129 : atgtaa-TT-T-GA-AATTT-GGAG-T--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATGTTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162130 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-G-ATT------TT-AA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162131 : taagatACAATTC-A-AG-TTGC-T--G----AG--TTT-A-AGTTCGATTCT-CG-TAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGACCAG
gi|162132 : aATTT-A-AA-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CC-C--GAC--TC-A--AA-----TTAGTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162133 : ATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTGTTGATGGA-TTTAGACCCAG
gi|162134 : ATGT-A-AG-T--G-T--A----AA--TCCGA-AAT------TT-CA-GAC--TC-C--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGCTCC
gi|162135 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------AT-CT-GAC--TC-A--AA-----CTATTGATGAA-TTTCGGCCAAG
gi|162136 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-C--AGCTTCTGTATTGATGAA-TCTAGGCCC
gi|162137 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT------------------GAC--TC-A--TA-----CTATTGATGAA-TTTATGTCC
gi|162138 : TTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-G-ATT------CT-CC-AAC--TG-A--AA-----TTATTGATGAA-TGTAGGCCCA
gi|162139 : TT-G-AG-A--T-T--G----AG--TCT-G-GGT------TT-TA-GTT--TC-A--AA-----ATGTTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162140 : -G-AT-T--T-T--G----AG--TCC-A-ATT------CC-CA-GAC--TC-A--AA-----TTAATGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162141 : -G-AG-T--C-C--C----AG--TCT-G-AAT------CT-AT-AAC--TC-A--AA-----ATACTGATGAA-TTTTGGTTC
gi|162142 : G-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TCAA--AA-----ATGTTTATGAA-TTTATAGCCAG
gi|162143 : --C-T--GC---AA--TCT-T-AATT-----CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATTAA-TTCAGGTCCAG
gi|162144 : T------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAAGCCCAG
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 1 0 1 0 1 0 00 0 22 1111 00 0 0 111111 0 0 00 0 00 222222 0
lowQualScore : . . . . . . . . . .. . .. .... .. . . ...... . . .. . .. ...... .
lowQualScore : 8 7 7 4 7 8 5 4 5 66 4 00 4444 66 4 4 777777 4 4 66 4 66 555555 4
consensus : TTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
Reference ( family-332 ) : TTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162055 : AA-AT-T-TT-T-GACAATAT-G-AG-T--T-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162056 : ttatttgaatatgAA-GT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--A-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162057 : ttatttgattatgTTAA-AT-A-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-A--T----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162058 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GCCATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TTT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTATGTCC
gi|162059 : ttgtttgattaTTAA-TT-T-TT-T-TACAATTT-G-AG-T--C-T--GTCGGAG--TCT-A-AAT------CT-CG-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162060 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GACATTTT-G-TG-T--T-A--G----AG--TCT-A-TAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCTAG
gi|162061 : ttatttgaataTAA-AT-A-TT-A-GACAATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCC-A-AAT------CT-CA-GAC--TG-A--AC-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162062 : ttatttgaatccT-T-TT-T-TACAATTT-G-AG-T--C-T--A----AG--TCT-A-AAT------CT-CAAGAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCA
gi|162063 : ttatttgaatattattt-AT-T-TT----ACAATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CTCCA-GAC--TC----AA-----GTATTGATGAA-TTTAGGTCCA
gi|162064 : ttatttgaatatgattttTCAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--A----AT--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC----AA-----ACATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162065 : ttatatggataAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-TA-G----AG--TCT-TTAAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTACGTCC
gi|162066 : ttatttgaatatgTTAA-AT-G-TT-T-GACATTTC-T-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--AC-A--AA-----ATATTGACGCA-TTTAGGTTCAG
gi|162067 : ttatttgaatcA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AA-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATAGT-TTTAGGTCC
gi|162068 : ttatttgaatcgtTTAA-AT-T-TT-T-GACACTTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAA--TC-A--AT-----ATACTGATAAA-GTTAGGTCC
gi|162069 : ttatttgagttTTAA-AT-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAA--TC-A--AT-----ATACTGATAAA-GTTAGGTCC
gi|162070 : ttatttgaattTTAA-AA-G-TT-T-GACATATT-G-AG-T--C-T--G----AG--ACT-A-TAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CTATTGATGAG-TTTAGGTCCAG
gi|162071 : ttacttgaatcTTAA-AG-T-TT-T-GACAATTT-G-AG------------------TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--CA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162072 : ttgtttcaataTTGG-AT-A-TT-T-GACAATAT-G-AA-T--C-T--T----AA--TCT-A-AAT------CT-AA-GAC--TC-A--AA-----ATTTTGATGAA-TTTAGGTGCAG
gi|162073 : tcatttgaattA-ATAT-TT-T-AACACTTT-G-AG-T--CCT--G----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----ATGT---TGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162074 : ttatttgaatcttTTAA-AT-T-TT-C-C-CGTTTT-G-AG-T--C-TT-G----AG--TGT-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TGCAGGTCCAG
gi|162075 : ttatttgaatcATTG-G-AA-T--C-T--A----AG--TCT-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTATGACCAG
gi|162076 : ttacttggttttacaaaaaggtaagTTGA-AT-T-CT-T-CACAATTT-G-AG-T------------AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGCTGAA-ATTAGGTCCGG
gi|162077 : ttatttgaaacTTTA-AC-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------AT-CA-GAG--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TATAGGTCAAG
gi|162078 : tcatttcaattT-C-TT-T-GGCATTTT-G-AA-T--C-T--G----AT--TCT-A-AAT------CT-CT-GGC--TC-A--AA-----ATACTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162079 : ttatttgaattgtatgTTAA-AC-T-TT-T-GATATTTT-G-AA-T--C-TTTG----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--TC-ATTAC-----ATACTGAAGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162080 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GATATTTT-G-AG-T--C-T--G----TG--TCT-A-TAT------CT-CC-GAG--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAAGTGCAG
gi|162081 : ttacttagaatcTTAA-AT-T-TTAT-TA-AGTTT-G-AG-T--C-T--A----AG--ATC-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAG
gi|162082 : ttatttagatcT-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C----G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GA---------AA-----ATATTGATGAT-TTTAGGTCCAG
gi|162083 : ttattgaatcttaccAA-AT-A-TT-C-GATA-TTT-G-AG-C--T-T--G----AT--TCT-A-AAT------CC-AA-AAC--TC-G--AA-----ATATGAATGAA-TTTAGGTCTAG
gi|162084 : ttatctgaatcttaTAA-TT-C-TT-T-GATATTTT-G-AG-T--T-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-A--AA-----CTATCGATGAA-TTTA
gi|162085 : ttgtttgtctaaTTAA-AT-G-TT-T-AGCGTTCC-C-AA-T--T-C--G----GA--TCT-A-TAT------CT-CA-TAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGACTCAG
gi|162086 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-A-AG-T--C---------------T-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-T--AA-----ATATTTGTGAA-TTT
gi|162087 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-AACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------AT-TA-GACAGTC-A--AA-----
gi|162088 : ttacttgaatcTTAA-TC-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-C--C-G--G----CG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATAGCCATGAA-TTTATGT
gi|162089 : tcatttgtatc-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCA-A-AAT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162090 : tatttgaatatgacagTTAA-AT-G-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------CT-CA-GAC--AC-A--AG-----ATATTGATAAA-TTTAGGCCC
gi|162091 : tatatgaatcTTAA-AT-C-TT-T-AACAATTT-T-CG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GCC--AC-T--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGG
gi|162092 : tattcgaatcA-AT-TGTT-T-TACAGTTT-G-AG-T--T-T--A----AA--TCT-A-AAT------CC-CA-GAC--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162093 : tatttaaatctTTAA-AT-T-TT-A-GACAATTT-G-AG-G--C-T--A----A---------AAT------CT-AA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGATCCAG
gi|162094 : tatttgaatcTTAA-TT-T-CT-T-TACAATTT-G-AG-T--C-A--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--GC-A--AA-----TAATTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162095 : tatttgaatcT-T-TT-T-GACATTTT-G-AA-C--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------TT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATTTTGATGAA-TTTATGT
gi|162096 : tatttgaatcttatttttTTAA-AT-T-CT-T-GACAATTT-G-A-----C-T------------CT-A-AAT------CT-TA-GAC--TG-A--AA-----ATGTTCATGAA-CTTAGGTCTAG
gi|162097 : tatctgaatc-T-TT-T-GACAA-TT-G-AGTT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CAAATAATGAA-TTGACGTTC
gi|162098 : tatttgaatcctacgc-AT-T-TT-T----AGTCT-GTAG-T--T-T--G----AG--TAC-G-ATT------CT-CA-TAC--TC-A--AA-----CTATTGGTGAA-TTTA-GTCCA
gi|162099 : tatttggttttaaatgttccatTTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-C-------AG--TCA-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTA-GTCC
gi|162100 : atttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--CCT-T-AAT------CT-CA-GAC--TA-A--AA-----TTTTTCATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162101 : attggaatcTTGA-AT-T-TTTT-GACAATTT-G-AG-T--T-G--A----AG--TCT-A-AAT------CA-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGGTGAA-TTTATGTCCAG
gi|162102 : atttgaat-T-AACATTTT-A-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--CC-A--AT-----TTATTGATGAA-TTCAGGTCTAG
gi|162103 : atttgataaaatgTTAA-AT-G-TT-T-CATATTTT-T-GG-T--C-C--A----AG--TCT-T-AAT------CT-TA-GAC--TC-A--AA-----ATATTCATGAA-TTAAGACCC
gi|162104 : atttgaatgATTT-G-AA-T--A-T--G----AAAATCT-C-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATCGATGAA-TTTAGGCCCA
gi|162105 : ttgcttgttaaaatggagttATTT-G-CG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC----AG-----TTATTGATGAA-TTTAAGCCCAG
gi|162106 : ttaacaaaaatgtaat-AC-T-TT-T-GATATTTT-G-AG-T--C-G--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGG
gi|162107 : tcattaaaagttTTT-G-AG-T--C-G--G----AG--TCA-G-ATT------CT-CA-GAC--AC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTAAGGCCCAG
gi|162108 : ttacaaaatataagatATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----TTATGGATTAA-TTTAGACCCAG
gi|162109 : ttataaaaatgttagTTAA-AT-T-TT-TCGACAATTT-G-AG-C--C-T--G----A----------AC------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162110 : tgTTAA-AT-A-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCAAG
gi|162111 : AATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----TTATTGATAAA-TTTAGGCCAAG
gi|162112 : ttaaaaatgtaaTTT-G-CA-C--C-T--G----AG--TTC-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162113 : ttacaaaatgtaagatATTTAG-AG-T--T-T--G----AG--TCT-A-ATT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----TTGTTGATCAA-TTTAGACCC
gi|162114 : ttacaaaatgtaagTTT-G-AG-T--C-TT-G----AG--TCT-G-ATT------CT-CA-CAC--TC-A--AA-----TTATTGATAAA-TTTGCACCCAG
gi|162115 : ttacaaaatgtaagatTTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TTT-G-ATT------CT-AA-GAC--TC-G--AA-----CTATTGATGAATTTTAGGCCCAG
gi|162116 : ttacaaaatgtaagatTAA-AT-T-TT-T-GTCA-TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----AGATTGATTAA-TTTGGGTCC
gi|162117 : ATTT---AG-T--C-G--G----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA------TATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162118 : tatatatacaacTAATAT-A-TT-T-GACA-TTT-T-AA-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-T--AA-----ATATTCATAAA-TTAAGGACCA
gi|162119 : ATTT-G-AG-T--T-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATAGATGCA-TTAAGGTCC
gi|162120 : taaatatagcTT-GTAG-T--C-T--C----AG--TCC-A-ATT------CT-CA-GAC--TT-A--AT-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCCA
gi|162121 : aaaaatgtaagaAA-AT-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CG-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGGA-TTTAGATCTAG
gi|162122 : T-T-GACAATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-G-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CTATTTATGAC-TTTAGGTCCAG
gi|162123 : aaaaaaATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCC-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162124 : aaaaatgtaagAA-AT-T-TT---GAAATTTT-T-AT-T--C-T--G----GG--TAT-A-AAT------CT-CA-GAC--TG-A--AA-----ATATTGATGAA-TTAAGGTCCA
gi|162125 : AATTT-G-AG-T--C-T--G----AT--TTG-G-ATT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTATGCCCAG
gi|162126 : aaaaatgtaagATTT-G-AG-C--C-C--T----AG--TTT-G-ATT------CT-CA-GAA--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCCAG
gi|162127 : aaaaatgtaagTTT-G-AG-C--C-T--G----AG--TTC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-G--AG-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162128 : aaaatgtaagatAATAT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-TA-GAC--TC-A--AA-----TTGTAGATGAA-TTAAGGCTCAG
gi|162129 : atgtaa-TT-T-GA-AATTT-GGAG-T--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATGTTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162130 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-G-ATT------TT-AA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162131 : taagatACAATTC-A-AG-TTGC-T--G----AG--TTT-A-AGTTCGATTCT-CG-TAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGACCAG
gi|162132 : aATTT-A-AA-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CC-C--GAC--TC-A--AA-----TTAGTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162133 : ATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTGTTGATGGA-TTTAGACCCAG
gi|162134 : ATGT-A-AG-T--G-T--A----AA--TCCGA-AAT------TT-CA-GAC--TC-C--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGCTCC
gi|162135 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------AT-CT-GAC--TC-A--AA-----CTATTGATGAA-TTTCGGCCAAG
gi|162136 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-C--AGCTTCTGTATTGATGAA-TCTAGGCCC
gi|162137 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT------------------GAC--TC-A--TA-----CTATTGATGAA-TTTATGTCC
gi|162138 : TTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-G-ATT------CT-CC-AAC--TG-A--AA-----TTATTGATGAA-TGTAGGCCCA
gi|162139 : TT-G-AG-A--T-T--G----AG--TCT-G-GGT------TT-TA-GTT--TC-A--AA-----ATGTTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162140 : -G-AT-T--T-T--G----AG--TCC-A-ATT------CC-CA-GAC--TC-A--AA-----TTAATGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162141 : -G-AG-T--C-C--C----AG--TCT-G-AAT------CT-AT-AAC--TC-A--AA-----ATACTGATGAA-TTTTGGTTC
gi|162142 : G-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TCAA--AA-----ATGTTTATGAA-TTTATAGCCAG
gi|162143 : --C-T--GC---AA--TCT-T-AATT-----CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATTAA-TTCAGGTCCAG
gi|162144 : T------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAAGCCCAG
blockSeqs : A A T TT TCGG TCGATT CTTCTG
blockSeqs : T A T A C T A
blockSeqs : . T G T . . A
blockSeqs : . A . T . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . G
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . C . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . A . . . . C
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . C . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . T
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . G . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . A . . . . C
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . G . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . T . . . . T
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . G . . . . C
blockSeqs : . A . . . . C
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . T
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . T . . . . T
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . T . . . . T
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . T
blockSeqs : . A . . . . T
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . A
blockSeqs : . A . . . . T
blockSeqs : A . . . . T
blockSeqs : T . . . . T
blockSeqs : A . . . . T
blockSeqs : A . . . . C
blockSeqs : T . . . . A
blockSeqs : A . . . . A
blockSeqs : A . . . . T
blockSeqs : A . . . . T
blockSeqs : A . . . . A
blockSeqs : A . . . . C
blockSeqs : A . . . . T
blockSeqs : A . . . . A
blockSeqs : A . . . . T
blockSeqs : . . . . . T
blockSeqs : . . . . . T
blockSeqs : . . . . . T
blockSeqs : . . . . A
blockSeqs : . . . . T
blockSeqs : . . . . T
blockSeqs : . . . . T
blockSeqs : . . . . T
blockSeqs : . . . . A
blockSeqs : . . . . C
blockSeqs : . . . . C
blockSeqs : . . . . T
blockSeqs : . . . . A
blockSeqs : . . . . T
blockSeqs : . . . . A
blockSeqs : . . . . A
blockSeqs : . . . . A
blockSeqs : . . . T
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : TTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
finalCons : TTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 1 0 1 0 1 0 00 0 22 1111 00 0 0 111111 0 0 00 0 00 222222 0
lowQualScore : . . . . . . . . . .. . .. .... .. . . ...... . . .. . .. ...... .
lowQualScore : 8 7 7 4 7 8 5 4 5 66 4 00 4444 66 4 4 777777 4 4 66 4 66 555555 4
consensus : TTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
Reference ( family-332 ) : TTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162055 : AA-AT-T-TT-T-GACAATAT-G-AG-T--T-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162056 : ttatttgaatatgAA-GT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--A-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162057 : ttatttgattatgTTAA-AT-A-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-A--T----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162058 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GCCATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TTT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTATGTCC
gi|162059 : ttgtttgattaTTAA-TT-T-TT-T-TACAATTT-G-AG-T--C-T--GTCGGAG--TCT-A-AAT------CT-CG-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162060 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GACATTTT-G-TG-T--T-A--G----AG--TCT-A-TAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCTAG
gi|162061 : ttatttgaataTAA-AT-A-TT-A-GACAATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCC-A-AAT------CT-CA-GAC--TG-A--AC-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162062 : ttatttgaatccT-T-TT-T-TACAATTT-G-AG-T--C-T--A----AG--TCT-A-AAT------CT-CAAGAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCA
gi|162063 : ttatttgaatattattt-AT-T-TT----ACAATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CTCCA-GAC--TC----AA-----GTATTGATGAA-TTTAGGTCCA
gi|162064 : ttatttgaatatgattttTCAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--A----AT--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC----AA-----ACATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162065 : ttatatggataAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-TA-G----AG--TCT-TTAAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTACGTCC
gi|162066 : ttatttgaatatgTTAA-AT-G-TT-T-GACATTTC-T-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--AC-A--AA-----ATATTGACGCA-TTTAGGTTCAG
gi|162067 : ttatttgaatcA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AA-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATAGT-TTTAGGTCC
gi|162068 : ttatttgaatcgtTTAA-AT-T-TT-T-GACACTTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAA--TC-A--AT-----ATACTGATAAA-GTTAGGTCC
gi|162069 : ttatttgagttTTAA-AT-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAA--TC-A--AT-----ATACTGATAAA-GTTAGGTCC
gi|162070 : ttatttgaattTTAA-AA-G-TT-T-GACATATT-G-AG-T--C-T--G----AG--ACT-A-TAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CTATTGATGAG-TTTAGGTCCAG
gi|162071 : ttacttgaatcTTAA-AG-T-TT-T-GACAATTT-G-AG------------------TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--CA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162072 : ttgtttcaataTTGG-AT-A-TT-T-GACAATAT-G-AA-T--C-T--T----AA--TCT-A-AAT------CT-AA-GAC--TC-A--AA-----ATTTTGATGAA-TTTAGGTGCAG
gi|162073 : tcatttgaattA-ATAT-TT-T-AACACTTT-G-AG-T--CCT--G----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----ATGT---TGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162074 : ttatttgaatcttTTAA-AT-T-TT-C-C-CGTTTT-G-AG-T--C-TT-G----AG--TGT-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TGCAGGTCCAG
gi|162075 : ttatttgaatcATTG-G-AA-T--C-T--A----AG--TCT-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTATGACCAG
gi|162076 : ttacttggttttacaaaaaggtaagTTGA-AT-T-CT-T-CACAATTT-G-AG-T------------AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGCTGAA-ATTAGGTCCGG
gi|162077 : ttatttgaaacTTTA-AC-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------AT-CA-GAG--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TATAGGTCAAG
gi|162078 : tcatttcaattT-C-TT-T-GGCATTTT-G-AA-T--C-T--G----AT--TCT-A-AAT------CT-CT-GGC--TC-A--AA-----ATACTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162079 : ttatttgaattgtatgTTAA-AC-T-TT-T-GATATTTT-G-AA-T--C-TTTG----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--TC-ATTAC-----ATACTGAAGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162080 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GATATTTT-G-AG-T--C-T--G----TG--TCT-A-TAT------CT-CC-GAG--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAAGTGCAG
gi|162081 : ttacttagaatcTTAA-AT-T-TTAT-TA-AGTTT-G-AG-T--C-T--A----AG--ATC-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAG
gi|162082 : ttatttagatcT-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C----G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GA---------AA-----ATATTGATGAT-TTTAGGTCCAG
gi|162083 : ttattgaatcttaccAA-AT-A-TT-C-GATA-TTT-G-AG-C--T-T--G----AT--TCT-A-AAT------CC-AA-AAC--TC-G--AA-----ATATGAATGAA-TTTAGGTCTAG
gi|162084 : ttatctgaatcttaTAA-TT-C-TT-T-GATATTTT-G-AG-T--T-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-A--AA-----CTATCGATGAA-TTTA
gi|162085 : ttgtttgtctaaTTAA-AT-G-TT-T-AGCGTTCC-C-AA-T--T-C--G----GA--TCT-A-TAT------CT-CA-TAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGACTCAG
gi|162086 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-A-AG-T--C---------------T-A-AAT------CT-CA-GAC--TT-T--AA-----ATATTTGTGAA-TTT
gi|162087 : ttatttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-AACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------AT-TA-GACAGTC-A--AA-----
gi|162088 : ttacttgaatcTTAA-TC-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-C--C-G--G----CG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATAGCCATGAA-TTTATGT
gi|162089 : tcatttgtatc-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCA-A-AAT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162090 : tatttgaatatgacagTTAA-AT-G-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------CT-CA-GAC--AC-A--AG-----ATATTGATAAA-TTTAGGCCC
gi|162091 : tatatgaatcTTAA-AT-C-TT-T-AACAATTT-T-CG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GCC--AC-T--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGG
gi|162092 : tattcgaatcA-AT-TGTT-T-TACAGTTT-G-AG-T--T-T--A----AA--TCT-A-AAT------CC-CA-GAC--TT-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162093 : tatttaaatctTTAA-AT-T-TT-A-GACAATTT-G-AG-G--C-T--A----A---------AAT------CT-AA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGATCCAG
gi|162094 : tatttgaatcTTAA-TT-T-CT-T-TACAATTT-G-AG-T--C-A--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--GC-A--AA-----TAATTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162095 : tatttgaatcT-T-TT-T-GACATTTT-G-AA-C--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------TT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATTTTGATGAA-TTTATGT
gi|162096 : tatttgaatcttatttttTTAA-AT-T-CT-T-GACAATTT-G-A-----C-T------------CT-A-AAT------CT-TA-GAC--TG-A--AA-----ATGTTCATGAA-CTTAGGTCTAG
gi|162097 : tatctgaatc-T-TT-T-GACAA-TT-G-AGTT--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CAAATAATGAA-TTGACGTTC
gi|162098 : tatttgaatcctacgc-AT-T-TT-T----AGTCT-GTAG-T--T-T--G----AG--TAC-G-ATT------CT-CA-TAC--TC-A--AA-----CTATTGGTGAA-TTTA-GTCCA
gi|162099 : tatttggttttaaatgttccatTTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-C-------AG--TCA-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTA-GTCC
gi|162100 : atttgaatcTTAA-AT-T-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--CCT-T-AAT------CT-CA-GAC--TA-A--AA-----TTTTTCATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162101 : attggaatcTTGA-AT-T-TTTT-GACAATTT-G-AG-T--T-G--A----AG--TCT-A-AAT------CA-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGGTGAA-TTTATGTCCAG
gi|162102 : atttgaat-T-AACATTTT-A-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--CC-A--AT-----TTATTGATGAA-TTCAGGTCTAG
gi|162103 : atttgataaaatgTTAA-AT-G-TT-T-CATATTTT-T-GG-T--C-C--A----AG--TCT-T-AAT------CT-TA-GAC--TC-A--AA-----ATATTCATGAA-TTAAGACCC
gi|162104 : atttgaatgATTT-G-AA-T--A-T--G----AAAATCT-C-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATCGATGAA-TTTAGGCCCA
gi|162105 : ttgcttgttaaaatggagttATTT-G-CG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC----AG-----TTATTGATGAA-TTTAAGCCCAG
gi|162106 : ttaacaaaaatgtaat-AC-T-TT-T-GATATTTT-G-AG-T--C-G--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GGC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGG
gi|162107 : tcattaaaagttTTT-G-AG-T--C-G--G----AG--TCA-G-ATT------CT-CA-GAC--AC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTAAGGCCCAG
gi|162108 : ttacaaaatataagatATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----TTATGGATTAA-TTTAGACCCAG
gi|162109 : ttataaaaatgttagTTAA-AT-T-TT-TCGACAATTT-G-AG-C--C-T--G----A----------AC------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162110 : tgTTAA-AT-A-TT-T-GACAATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGGTCAAG
gi|162111 : AATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----TTATTGATAAA-TTTAGGCCAAG
gi|162112 : ttaaaaatgtaaTTT-G-CA-C--C-T--G----AG--TTC-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162113 : ttacaaaatgtaagatATTTAG-AG-T--T-T--G----AG--TCT-A-ATT------CT-CA-GAT--TC-A--AA-----TTGTTGATCAA-TTTAGACCC
gi|162114 : ttacaaaatgtaagTTT-G-AG-T--C-TT-G----AG--TCT-G-ATT------CT-CA-CAC--TC-A--AA-----TTATTGATAAA-TTTGCACCCAG
gi|162115 : ttacaaaatgtaagatTTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TTT-G-ATT------CT-AA-GAC--TC-G--AA-----CTATTGATGAATTTTAGGCCCAG
gi|162116 : ttacaaaatgtaagatTAA-AT-T-TT-T-GTCA-TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----AGATTGATTAA-TTTGGGTCC
gi|162117 : ATTT---AG-T--C-G--G----TG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA------TATTGATGAA-TTTAGGTCCAG
gi|162118 : tatatatacaacTAATAT-A-TT-T-GACA-TTT-T-AA-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-T--AA-----ATATTCATAAA-TTAAGGACCA
gi|162119 : ATTT-G-AG-T--T-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATAGATGCA-TTAAGGTCC
gi|162120 : taaatatagcTT-GTAG-T--C-T--C----AG--TCC-A-ATT------CT-CA-GAC--TT-A--AT-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCCA
gi|162121 : aaaaatgtaagaAA-AT-T-TT-T-GACATTTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CG-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATGGA-TTTAGATCTAG
gi|162122 : T-T-GACAATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-G-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----CTATTTATGAC-TTTAGGTCCAG
gi|162123 : aaaaaaATTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCC-A-ATT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162124 : aaaaatgtaagAA-AT-T-TT---GAAATTTT-T-AT-T--C-T--G----GG--TAT-A-AAT------CT-CA-GAC--TG-A--AA-----ATATTGATGAA-TTAAGGTCCA
gi|162125 : AATTT-G-AG-T--C-T--G----AT--TTG-G-ATT------CT-CA-AAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTATGCCCAG
gi|162126 : aaaaatgtaagATTT-G-AG-C--C-C--T----AG--TTT-G-ATT------CT-CA-GAA--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCCAG
gi|162127 : aaaaatgtaagTTT-G-AG-C--C-T--G----AG--TTC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-G--AG-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162128 : aaaatgtaagatAATAT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-TA-GAC--TC-A--AA-----TTGTAGATGAA-TTAAGGCTCAG
gi|162129 : atgtaa-TT-T-GA-AATTT-GGAG-T--C-T--G----AG--TCT-T-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATGTTGATGAA-TTTAGGTC
gi|162130 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT-G-ATT------TT-AA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGCCC
gi|162131 : taagatACAATTC-A-AG-TTGC-T--G----AG--TTT-A-AGTTCGATTCT-CG-TAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAGGACCAG
gi|162132 : aATTT-A-AA-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CC-C--GAC--TC-A--AA-----TTAGTGATGAA-TTTAGGCC
gi|162133 : ATTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-A-AAT------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTGTTGATGGA-TTTAGACCCAG
gi|162134 : ATGT-A-AG-T--G-T--A----AA--TCCGA-AAT------TT-CA-GAC--TC-C--AA-----ATATTGATGAA-TTTAGCTCC
gi|162135 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------AT-CT-GAC--TC-A--AA-----CTATTGATGAA-TTTCGGCCAAG
gi|162136 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCC-G-ATT------CT-CA-GAC--TC-C--AGCTTCTGTATTGATGAA-TCTAGGCCC
gi|162137 : TTT-G-AG-T--C-T--G----AG--TCT------------------GAC--TC-A--TA-----CTATTGATGAA-TTTATGTCC
gi|162138 : TTT-G-AG-T--C-C--G----AG--TCT-G-ATT------CT-CC-AAC--TG-A--AA-----TTATTGATGAA-TGTAGGCCCA
gi|162139 : TT-G-AG-A--T-T--G----AG--TCT-G-GGT------TT-TA-GTT--TC-A--AA-----ATGTTGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162140 : -G-AT-T--T-T--G----AG--TCC-A-ATT------CC-CA-GAC--TC-A--AA-----TTAATGATGAA-TTTAGGTCC
gi|162141 : -G-AG-T--C-C--C----AG--TCT-G-AAT------CT-AT-AAC--TC-A--AA-----ATACTGATGAA-TTTTGGTTC
gi|162142 : G-T--C-C--G----AG--TCT-A-AAT------CT-CA-GAC--TCAA--AA-----ATGTTTATGAA-TTTATAGCCAG
gi|162143 : --C-T--GC---AA--TCT-T-AATT-----CT-CA-GAC--TC-A--AA-----ATATTGATTAA-TTCAGGTCCAG
gi|162144 : T------CT-CA-GAC--TC-A--AA-----TTATTGATGAA-TTTAAGCCCAG