lowQualScore : 0 0 0 0 0 5555 0 22222 0 0 0 0 22222 999999999 0 0 66666 0 111 1 333 11 9 1
lowQualScore : . . . . . .... . ..... . . . . ..... ......... . . ..... . ... . ... .. . .
lowQualScore : 5 5 5 5 4 0000 4 77777 4 4 9 4 00000 777777777 9 4 55555 7 000 6 444 11 3 1
consensus : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--CG-G-A-T-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
Reference ( gi|31183 ) : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T---A-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--CA-G-A-T-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31185 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----A---A-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--AG-G-A-T-A-G---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31184 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----A---A-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--AG-G-A-T-A-G---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31187 : TAAATTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----C---A-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--AT-G-A-T-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31186 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AA---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----C---A-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--AG-G-T-T-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31199 : TAAGGTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----TG--A-----GTCA-T-TATGGCGAGC--CG-G-A-T-A-A---GA--CGACTA-T-TAAAA
gi|31196 : TAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---AA----GTCA-T-TTTGGCGAGC--CG-G-A-T-A-A---GG--TGATTA-T-TGAAA
gi|31190 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---AA----GTCA-T-TTTGGCGAGC--CG-G-A-T-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31189 : TAAATTT-T-T-A-TTT-AC---TCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T---A-----GTCA-T-TTTGGCGA-C--CAGG-A-T-A-A---GA--TAATTA-T-TAAAA
gi|31188 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---TGT-CGC-----GC-TTTG-A-A-T-----C---A-----GTCA-T-TTTAGCGAGC--AG-G-A-T-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31192 : TAAGTGT-T-T-C-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---AA----GTCA-T-TTTGGCGAGC--CG-G-A-T-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31201 : TAAGTTC-T-A-A-TTT-AT---CCT-CAC-----GC-TTTG-A-A-C-----TG--A-----GTCA-T-TTTAGTGAGC--TG-G-A-T-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31193 : TAAGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCC-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---AA----GTCA-T-TTTGGCGAGC--CG-G-A-T-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31194 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---ATTTAAGTCA-T-TTTGGCGAGC--CG-G-A-T-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31195 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---AA----GTCA-T-TTTTGCGAGC--CG-G-A-T-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31197 : TAAGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-T-C-----T---AA----GTCA-T-TTTGGCAAGC--CG-G-A-T-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31200 : TAAATAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----TA--A-----GTCA-T-TTTGACGAGC--CG-G-A-G-A-A---GA--GGATTATT-TAAAA
gi|31173 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGG-----GC-TTTG-A-A-A-----C---A-----GTCA-T-TTAGGTGAG---CA-G-ATT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31172 : tTAATTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GC-TTTG-A-A-C-----C---AA----GTCA-T-TTTGGCGAGC--CG-G-A-T-A-A---GA--GGATTATT-TAAAA
gi|31203 : tTAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----A---A-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--AA-A-C-T-A-T---GG--TGA
gi|31198 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----C---A-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--AA-A-A-T-C-AGT-GACTTGATTA-T-gactttaatgaaa
gi|31191 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----ACCTTTG-A-A-C-----T---AA----GTCA-T-TTTGGCGAGC--CG-A-G-T-A-G---GA--TGATTATT-TAAAAat
gi|31147 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----TTCA-T-TTTGGCGAGC--AA-G-A-A-A-A---TA--GAGTTA-T-
gi|31146 : ttTGAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----AC-CATA-A-A-C-----T---A-----GTCA-T-TTTGTCGAG---CA-GCA-T-A-A---GA--TGATTA-T-TGAAAata
gi|31151 : ttTAAGTTT-T-T-A-TCT-AC---CCT-CGT-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TCTGGCGAG---CA-G-A-T-A-
gi|31144 : ttTAAGTAT-T-T-A-TTTTAT---CCT-CAC-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAG---CA-G-A-
gi|31145 : ttTAAGTTG-TGT-T-TTT-AC---CCT-TGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-ATTGGCGAGC--AG-G-A-A-A-A---GA--TGATTA-T-at
gi|31152 : ttTAAGCTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----AC-TATG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--GA-A-A-T-A-tgaaa
gi|31157 : ttTAAGTTT-T-T-A-TTT-TC---CCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTTA-T-TTTGGCGAG
gi|31153 : tcTAAGATT-A-T-AATTT-AC---CCT-CGC-----TT-TTTG-A-G-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAG---CA-G-A-A-A-A---GA--TTATTA-
gi|31204 : ttTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GA-TTTG-A-A-T-----C---A-----GTCA-A-TTTGGCGAGC--
gi|31154 : TATGTTT-T-T-A-TTT-AC---CTT-CAC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAAC--ag
gi|31202 : ttTAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-AAC-----GC-TTTG-A-A-A-----T---A-----GTAA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31180 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CAA-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GCCA-T-TTTGGTGAa
gi|31150 : tTAAGTTT-A-T-G-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGTGAaaagaat
gi|31205 : ttTACGTTT-T-T-A-TTA-AC---TCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTTA-T-TTTGGCGAGC--tca
gi|31149 : TAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-AGT-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GCCA-T-TTTGGCAGGC--agg
gi|31148 : ttTAAGATT-T-T-T-TTT-AC---CTT-CGC-----GC-CTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-TTTTTTGCGGGC--AG-G-A-A-A-T---GA--TGATCA-T-ag
gi|31155 : ttTGAGTTT-T-A-A-TAT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-C-C-----T---G-----GTTG-T-TTTGGCTAGC--AG-G-A-T-ATAC--GA--TGGTTtgaaa
gi|31207 : ttTAAGCGT-T-T-C-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTGG-A-T-C-----T---A-----GGCT-T-TTTGGCGAGC--AA-G-A-A-C-A---GA--AGATTA-
gi|31206 : TAAGTTT-T-A-A-TTC-AC---CCT-CGC-----GA-TTTG-A-T-T-----C---A-----GTAA-T-TTTGGCGAGC--
gi|31209 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---ATT-TGC-----AC-CTTG-----C-----TTGAA-----G-CA-T-TTTGGCGAGC--CG-G-A-A-C-A---GA--AAATTA-T-ag
gi|31160 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCG-TTT-----GC-TTTG-A-A-A-----T---T-----GTCA-T-TTTGTCGAGC--ta
gi|31158 : ttTAAGTCT-C-T-G-TTT-AC---CCT-CTT-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----ACTA-T-TTTTGCGAG---CA-G-A-a
gi|31165 : ttTAAGTTT-T-G-A-TTT-AC---CCT-TGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---------GTCA-T-TTTGa
gi|31163 : ttTAAGTTT-T-A-A-TTT-AC---TCT-TGT-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----ACCA-T-TTTGTCTAGC--
gi|31208 : ttTAATTTT-T-T-A-TTT-AC---CAT-CGC-----AC-TTTG-A-A-------------------CA-T-TTTAGCGAGC--a
gi|31159 : TAAGTCT-T-T---TTG-AC---CTT-TTC-----GC-GTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--ag
gi|31162 : ttTAAGTTT-T-T-T-TTT-ATTTTCCT-CAC-----GC-TTTG-T-T-G-----C---A-----GGCA-T-TTTGGCGAGC--agtaacggtacattata
gi|31166 : ttTAAGTTT-T-T-----T-AA---CCTGTAC-----GC-GTTG-A-A-C-----T---G-----GTCG-T-TTTGGCGAGC--agggcaaagcgttatgtaa
gi|31168 : ttTAAGTTT-T-G-A-TAT-AC---CTT-CGC-----AC-TTTT-A-A-T-----T---G-----GTCA-T-GATGGCGAGC--ag
gi|31214 : ttAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-A-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--CT-G-A-A-C-A---GA--TGCTTA----AAAAa
gi|31211 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTTA-T-TTTGGCGAGC--AT-G-A-A-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31213 : AGGTTT-G-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGCA-CG-A-A-C-A-A----A--TGATTA----AAAA
gi|31212 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---G-----TTCA-T-TTTGGCGAGC--AT-G-A-A-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31210 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-ATTG-A-A-C-----C---A-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--
gi|31177 : AAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTA-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--atggat
gi|31176 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTA-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31175 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTA-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31174 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTA-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31215 : tcAAGTTT-T-T-C-TTT-AC---CCC-CGC-----GT-TTTGAA-A-C-----T---A-----GGCA-T-TTTGGCCAGC--AG-G-G-T-A-A---GC--TGGTTA-a
gi|31178 : AAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTA-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGACGAGC--
gi|31179 : tcAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CGT-CAC-----GC-TTTA-A-A-C-----T---G-----ATCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31216 : tcAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T---T-----GCCA-T-TCTGGCGAAC--a
gi|31156 : AAGTTT-T-T-A-TAT-AC---CAT-CGCA----GC-TTTG-C-T-C-----T---A-----GGCA-T-TTTGGCGAGC--AA-T-A-CAA-A---GA--TGATTA-T-atga
gi|31217 : ttgAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TCTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGACAAAC--gta
gi|31181 : AAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGG-----GC-TTTA-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31161 : tcAAGTTT-A-T-A-TTT-AT---CCT-AGC-----GC-TTTG-A-T-C-----T---G-----GTCATT-TTTGGCGAGC--a
gi|31182 : ttgAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-ATTT-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31218 : tcAAGTTT-T-TTA-TTT-AA---CCT-CGT-----GC-TTTG-A-G-C-----A---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGa
gi|31164 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GCC
gi|31169 : ttcAAGTTT-T-T----TT-AC---CTT-CGT-----GC-TCTG-A-A-G-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCAAG
gi|31220 : ttcAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CAC-----GC-TTTG-A-A-C-----C---T-----GTCA-T-TTTGGCAAGC--AA-T-A-C-A-ATGTAA--TGTTTACT-TAAA
gi|31219 : AGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GT-GTTG-A-A-C-----C---C-----GTCA-T-ATTGGCAAGC--AG-A-A-T-A-A---GG--TGATTA-A-TAAA
gi|31223 : AGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CAT-----AC-TCTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGC
gi|31167 : AGTTT-T-T-A-TTT-AC---CAT-CGC-----AC-TTTG-C-A-CG----T---A-----G-CA-T-TTTGGTATGCAGCA-G-A-T-A-
gi|31221 : ttttAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CACACTTAGC-TTTA-A-G-C-----T--------------T-TTTGGCGAG---CA-G-A-A-ACA---GA--AGATT
gi|31222 : AGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGCACTTAGC-TTTA-A-G-C-----T--------------T-TTTGGCGAGC--AG-G-A-A-C-A---GA--AGATT
gi|31225 : GTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGA-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-GTTAGCG
gi|31170 : GTTT-T-T-G-TTA-AT---CCT-CGC-----GT-TTTG-A-A-C-----A---G-----GTCATT-TTTGGCGAGC--
gi|31224 : ttcaacGTTTGT-T-T-TTT-GC---ACT-CGC-----GC-TTCG-A-A-A-----T---G-----GTCA-T-TTCGGCAAAT--TG-G-A-A-A-A---GA--TGATT
gi|31226 : TTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----CG--A-----GTCA-T-TTTGGAGAGC--CG-G-A-T-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31171 : TTT-T-T-A-TTT-A-----CT--GC-----AT-TTTG-A-A-CAATATT---AAAA--GTCA-T-TTTGGCAAGC--AA-T-A-A-A-A---AA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31228 : tttattTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-C-C-----GC-TTTG-A-A-C-----T---G-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--
gi|31227 : TT-T-T-C-TTT-AT---CCT-TGC-----AC-TTTG-ATA-C-----T---T-----GTCA-T-TTAGATGAGC--AG-G-A-T-A-G---GC--TGATTA-a
gi|31229 : -T-T-C-TTT-AC---GCT-CTT-----GC-TTTG-A-AAC-----A---A-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--AA-G-A-T-A-A---GC--TGGTTA-T-
gi|31230 : -T-A-TTT-GC---TCT-CGC-----GT-CTTC-A-A-C-----T---A-----GTCA-T-TTTGGCGAGC--AA-G-gta
gi|31231 : -TTT-AC---CCT-CTT-----GC-TTTG-A-A-C-----T---A-----GTCA-T-GTTGGCAAGC--AG-G-A-T-A-A---GG--TGATTA-
gi|31232 : -TTA-AT---CCT-CGC-----AC-TTTG-ATC-C-----T---T-----GACA-T-TTTGGCGAGT--AG-G-A-T-A-G---GC--TGATTA-
gi|31233 : -AC---CCT-TGC-----AC-TTTG-T-A-CG----T---A-----GT-A-T-TTTGGCGAGC--AA-G-A-A-C-A---GA--AGATTA-TGTAA
gi|31234 : TCA-T-TTTGGCGAGC--AA-G-A-T-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 0 000 0 22222 0 0 0 0 22222 7777777 00 0 0 888 111 0 333 11 8 2
lowQualScore : . . . . . ... . ..... . . . . ..... ....... .. . . ... ... . ... .. . .
lowQualScore : 5 5 5 4 4 888 4 77777 4 4 9 4 00000 8888888 66 9 4 333 333 8 444 11 9 1
consensus : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--AGGAT---A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
Reference ( family-329 ) : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--CGGAT---A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31144 : TAAGTAT-T-T-A-TTTTAT---CCT-CAC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--AGAAT---
gi|31145 : ttTAAGTTG-TGT-T-TTT-AC---CCT-TGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-ATTGGCGAGC--AGGAA---A-A---GA--TGATTA-T-
gi|31146 : ttTGAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----AC-CATA-A-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGTCGAGC--AGCAT---A-A---GA--TGATTA-T-TGAAAtgaaa
gi|31147 : ttTAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----T--TCA-T-TTTGGCGAGC--AAGAA---A-A---TA--GAGTTA-T-
gi|31148 : ttTAAGATT-T-T-T-TTT-AC---CTT-CGC-----GC-CTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCATT-TTTTGCGGGC--AGGAA---A-T---GA--TGATCA-T-ata
gi|31149 : ttTAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-AGT-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--CCA-T-TTTGGCAGGC--tgaaa
gi|31150 : ttTAAGTTT-A-T-G-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGTGAag
gi|31151 : ttTAAGTTT-T-T-A-TCT-AC---CCT-CGT-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TCTGGCGAG---CAGAT---A-tca
gi|31152 : ttTAAGCTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----AC-TATG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--
gi|31153 : ttTAAGATT-A-T-AATTT-AC---CCT-CGC-----TT-TTTG-A-G-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--AGAA----A-A---GA--TTATTA-gaaata
gi|31154 : ttTATGTTT-T-T-A-TTT-AC---CTT-CAC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAAC--
gi|31155 : ttTGAGTTT-T-A-A-TAT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-C-C-----T-G-----G--TTG-T-TTTGGCTAGC--AGGAT---ATAC--GA--TGGTTa
gi|31156 : ttAAGTTT-T-T-A-TAT-AC---CAT-CGCA----GC-TTTG-C-T-C-----T-A-----G--GCA-T-TTTGGCGAGC----AATACAA-A---GA--TGATTA-T-
gi|31157 : ttgTAAGTTT-T-T-A-TTT-TC---CCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGgta
gi|31158 : tcTAAGTCT-C-T-G-TTT-AC---CCT-CTT-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----A--CTA-T-TTTTGCGAGC--
gi|31159 : ttTAAGTCT-T-T---TTG-AC---CTT-TTC-----GC-GTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--agaa
gi|31160 : ttTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCG-TTT-----GC-TTTG-A-A-A-----T-T-----G--TCA-T-TTTGTCGAGC--agtaacggtacattata
gi|31161 : ttAAGTTT-A-T-A-TTT-AT---CCT-AGC-----GC-TTTG-A-T-C-----T-G-----G--TCATT-TTTGGCGAGC--a
gi|31162 : ttgTAAGTTT-T-T-T-TTT-ATTTTCCT-CAC-----GC-TTTG-----T-----T-GCA---G--GCA-T-TTTGGCGAGC--AGGGC---A-A---AG--CG-TTA-TGTAAa
gi|31163 : ttTAAGTTT-T-A-A-TTT-AC---TCT-TGT-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----A--CCA-T-TTTGTCTAGC--
gi|31164 : ttAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--CCa
gi|31165 : ttcTAAGTTT-T-G-A-TTT-AC---CCT-TGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-------G--TCA-T-TTTG
gi|31166 : ttTAAGTTT-T-T-----T-AA---CCTGTAC-----GC-GTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCG-T-TTTGGCGAGC--
gi|31167 : ttAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CAT-CGC-----AC-TTTG-C-A-CG----T-A-----G---CA-T-TTTGGTATGCAGCAGAT---A-ag
gi|31168 : ttttTAAGTTT-T-G-A-TAT-AC---CTT-CGC-----AC-TTTT-A-A-T-----T-G-----G--TCA-T-GATGGCGAGC--
gi|31169 : ttAAGTTT-T-T----TT-AC---CTT-CGT-----GC-TCTG-A-A-G-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCAAGa
gi|31170 : ttcGTTT-T-T-G-TTA-AT---CCT-CGC-----GT-TTTG-A-A-C-----A-G-----G--TCA-TTTTTGGCGAGC--
gi|31171 : ttcaacTTT-T-T-A-TTT-AC---T----GC-----AT-TTTG-A-A-CAATATT-AAAA--G--TCA-T-TTTGGCAAGC--AATAA---A-A---AA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31172 : tttattTAATTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GC-TTTG-A-A-C-----C-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--CGGAT---A-A---GA--GGATTATT-TAAAA
gi|31173 : tTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGG-----GC-TTTG-A-A-A-----C-A-----G--TCA-T-TTAGGTGAGC--AGATT---A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31174 : tAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTA-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--
gi|31175 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTA-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31176 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTA-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31177 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTA-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31178 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTA-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGACGAGC--a
gi|31179 : tcAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CGT-CAC-----GC-TTTA-A-A-C-----T-G-----A--TCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31180 : tcTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CAA-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--CCA-T-TTTGGTGAa
gi|31181 : tAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGG-----GC-TTTA-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--aaagaat
gi|31182 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-ATTT-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31183 : tcTAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--CAGAT---A-A---GA--TGATTA-T-TAAAAa
gi|31184 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--AGGAT---A-G---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31185 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--AGGAT---A-G---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31186 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AA---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--AGGTT---A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31187 : TAAATTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--ATGAT---A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31188 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---TGT-CGC-----GC-TTTG-A-A-T-----C-A-----G--TCA-T-TTTAGCGAGC--AGGAT---A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31189 : TAAATTT-T-T-A-TTT-AC---TCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGACC--AGGAT---A-A---GA--TAATTA-T-TAAAA
gi|31190 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--CGGAT---A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31191 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----ACCTTTG-A-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--CGAGT---A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31192 : TAAGTGT-T-T-C-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--CGGAT---A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31193 : TAAGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCC-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--CGGAT---A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31194 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-ATTTAAG--TCA-T-TTTGGCGAGC--CGGAT---A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31195 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTTGCGAGC--CGGAT---A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31196 : TAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--CGGAT---A-A---GG--TGATTA-T-TGAAA
gi|31197 : TAAGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-T-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCAAGC--CGGAT---A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31198 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--AAAAT---C-AGT-GACTTGATTA-T-
gi|31199 : TAAGGTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-GA----G--TCA-T-TATGGCGAGC--CGGAT---A-A---GA--CGACTA-T-TAAAAat
gi|31200 : TAAATAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----TAA-----G--TCA-T-TTTGACGAGC--CGGAG---A-A---GA--GGATTATT-TAAAA
gi|31201 : TAAGTTC-T-A-A-TTT-AT---CCT-CAC-----GC-TTTG-A-A-C-----T-GA----G--TCA-T-TTTAGTGAGC--TGGAT---A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31202 : TAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-AAC-----GC-TTTG-A-A-A-----T-A-----G--TAA-T-TTTGGCGAGC--
gi|31203 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTG-A-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--a
gi|31204 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GA-TTTG-A-A-T-----C-A-----G--TCA-A-TTTGGCGAGC--aaactatggtgagactttaatgaaa
gi|31205 : TACGTTT-T-T-A-TTA-AC---TCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGC--AGGag
gi|31206 : TAAGTTT-T-A-A-TTC-AC---CCT-CGC-----GA-TTTG-A-T-T-----C-A-----G--TAA-T-TTTGGCGAGC--
gi|31207 : TAAGCGT-T-T-C-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTGG-A-T-C-----T-A-----G--GCT-T-TTTGGCGAGC--AAGAA---C-A---GA--AGATTA-ag
gi|31208 : TAATTTT-T-T-A-TTT-AC---CAT-CGC-----AC-TTTG-A-A-------------------CA-T-TTTAGCGAGC--
gi|31209 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---ATT-TGC-----AC-CTTG-----C-----T-T-----GAAGCA-T-TTTGGCGAGC--CGGAA---C-A---GA--AAATTA-T-ag
gi|31210 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-ATTG-A-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-TGGAT---ta
gi|31211 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGC--ATGAA---C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31212 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-G-----T--TCA-T-TTTGGCGAGC--ATGAA---C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31213 : AGGTTT-G-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-CGAAC---A-A----A--TGATTA----AAAA
gi|31214 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-A-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--CTGAA---C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31215 : AAGTTT-T-T-C-TTT-AC---CCC-CGC-----GT-TTTGAA-A-C-----T-A-----G--GCA-T-TTTGGCCAGC--AGGGT---A-A---GC--TGGTTA-
gi|31216 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTG-A-A-C-----T-T-----G--CCA-T-TCTGGCGAAC--
gi|31217 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TCTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGACAAAC--atga
gi|31218 : AAGTTT-T-TTA-TTT-AA---CCT-CGT-----GC-TTTG-A-G-C-----A-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGa
gi|31219 : AGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GT-GTTG-A-A-C-----C-C-----G--TCA-T-ATTGGCAAGC--AGAAT---A-A---GG--TGATTA-A-TAAA
gi|31220 : AGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CAC-----GC-TTTG-A-A-C-----C-T-----G--TCA-T-TTTGGCAAGC--AATAC---A-ATGTAA--TGTTTACT-TAAA
gi|31221 : AGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CACACTTAGC-TTTA-A-G-C-----T--------------T-TTTGGCGAGC--AGAAA---C-A---GA--AGATT
gi|31222 : AGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGCACTTAGC-TTTA-A-G-C-----T--------------T-TTTGGCGAGC--AGGAA---C-A---GA--AGATT
gi|31223 : AGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CAT-----AC-TCTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGC
gi|31224 : GTTTGT-T-T-TTT-GC---ACT-CGC-----GC-TTCG-A-A-A-----T-G-----G--TCA-T-TTCGGCAAAT--TGGAA---A-A---GA--TGATT
gi|31225 : GTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGA-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-GTTAGCG
gi|31226 : TTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTG-A-A-C-----C-GA----G--TCA-T-TTTGGAGAGC--CGGAT---A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31227 : TT-T-T-C-TTT-AT---CCT-TGC-----AC-TTTG-ATA-C-----T-T-----G--TCA-T-TTAGATGAGC--AGGAT---A-G---GC--TGATTA-
gi|31228 : TT-T-T-G-TTT-AC---CCT-C-C-----GC-TTTG-A-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--
gi|31229 : -T-T-C-TTT-AC---GCT-CTT-----GC-TTTG-A-AAC-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--AAGAT---A-A---GC--TGGTTA-T-a
gi|31230 : -T-A-TTT-GC---TCT-CGC-----GT-CTTC-A-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGC--gta
gi|31231 : -TTT-AC---CCT-CTT-----GC-TTTG-A-A-C-----T-A-----G--TCA-T-GTTGGCAAGC--AGGAT---A-A---GG--TGATTA-aag
gi|31232 : -TTA-AT---CCT-CGC-----AC-TTTG-ATC-C-----T-T-----G--ACA-T-TTTGGCGAGT--AGGAT---A-G---GC--TGATTA-
gi|31233 : -AC---CCT-TGC-----AC-TTTG-T-A-CG----T-A-----G--T-A-T-TTTGGCGAGC--AAGAA---C-A---GA--AGATTA-TGTAA
gi|31234 : --TCA-T-TTTGGCGAGC--AAGAT---A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 0 000 0 22222 0 0 0 22222 7777777 00 0 0 0 00 0 0 333 11 8 2
lowQualScore : . . . . . ... . ..... . . . ..... ....... .. . . . .. . . ... .. . .
lowQualScore : 5 5 5 4 4 888 4 77777 4 9 9 00000 8888888 66 9 4 5 88 7 8 333 11 9 1
consensus : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
Reference ( family-329 ) : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31144 : TAAGTAT-T-T-A-TTTTAT---CCT-CAC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--AAT-
gi|31145 : ttTAAGTTG-TGT-T-TTT-AC---CCT-TGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-ATTGGCGAGCA-G--GAA-A-A---GA--TGATTA-T-
gi|31146 : ttTGAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----AC-CATAA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGTCGAGCA-G--CAT-A-A---GA--TGATTA-T-TGAAAtgaaa
gi|31147 : ttTAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----T--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--GAA-A-A---TA--GAGTTA-T-
gi|31148 : ttTAAGATT-T-T-T-TTT-AC---CTT-CGC-----GC-CTTGA-A-C-----T-G-----G--TCATT-TTTTGCGGGCA-G--GAA-A-T---GA--TGATCA-T-ata
gi|31149 : ttTAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-AGT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--CCA-T-TTTGGCAGGCA-G--tgaaa
gi|31150 : ttTAAGTTT-A-T-G-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGTGATCA-
gi|31151 : ttTAAGTTT-T-T-A-TCT-AC---CCT-CGT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TCTGGCGAGCA----GAT-A-
gi|31152 : ttTAAGCTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----AC-TATGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCG-A--AAT-A-
gi|31153 : ttTAAGATT-A-T-AATTT-AC---CCT-CGC-----TT-TTTGA-G-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--AA--A-A---GA--TTATTA-
gi|31154 : ttTATGTTT-T-T-A-TTT-AC---CTT-CAC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAACA-
gi|31155 : ttTGAGTTT-T-A-A-TAT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-C-C-----T-G-----G--TTG-T-TTTGGCTAGCA-G--GAT-ATAC--GA--TGGTT
gi|31156 : ttAAGTTT-T-T-A-TAT-AC---CAT-CGCA----GC-TTTGC-T-C-----T-A-----G--GCA-T-TTTGGCGAGCA-A--TACAA-A---GA--TGATTA-T-
gi|31157 : ttgTAAGTTT-T-T-A-TTT-TC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGgta
gi|31158 : tcTAAGTCT-C-T-G-TTT-AC---CCT-CTT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----A--CTA-T-TTTTGCGAGCA-G--AA
gi|31159 : ttTAAGTCT-T-T---TTG-AC---CTT-TTC-----GC-GTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--
gi|31160 : ttTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCG-TTT-----GC-TTTGA-A-A-----T-T-----G--TCA-T-TTTGTCGAGCA-taacggtacattata
gi|31161 : ttAAGTTT-A-T-A-TTT-AT---CCT-AGC-----GC-TTTGA-T-C-----T-G-----G--TCATT-TTTGGCGAGCA-
gi|31162 : ttgTAAGTTT-T-T-T-TTT-ATTTTCCT-CAC-----GC-TTTG----T-----T-GCA---G--GCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GGC-A-A---AG--CG-TTA-TGTAA
gi|31163 : ttTAAGTTT-T-A-A-TTT-AC---TCT-TGT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----A--CCA-T-TTTGTCTAGCA-
gi|31164 : ttAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--CC
gi|31165 : ttcTAAGTTT-T-G-A-TTT-AC---CCT-TGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-------G--TCA-T-TTTG
gi|31166 : ttTAAGTTT-T-T-----T-AA---CCTGTAC-----GC-GTTGA-A-C-----T-G-----G--TCG-T-TTTGGCGAGCA-G--
gi|31167 : ttAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CAT-CGC-----AC-TTTGC-A-CG----T-A-----G---CA-T-TTTGGTATGCA-GCAGAT-A-
gi|31168 : ttttTAAGTTT-T-G-A-TAT-AC---CTT-CGC-----AC-TTTTA-A-T-----T-G-----G--TCA-T-GATGGCGAGCA-
gi|31169 : ttAAGTTT-T-T----TT-AC---CTT-CGT-----GC-TCTGA-A-G-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCAAG
gi|31170 : ttcGTTT-T-T-G-TTA-AT---CCT-CGC-----GT-TTTGA-A-C-----A-G-----G--TCA-TTTTTGGCGAGC
gi|31171 : ttcaacTTT-T-T-A-TTT-AC---T----GC-----AT-TTTGA-A-CAATATT-AAAA--G--TCA-T-TTTGGCAAGCA-A--TAA-A-A---AA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31172 : tttattTAATTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GC-TTTGA-A-C-----C-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--GGATTATT-TAAAA
gi|31173 : tTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGG-----GC-TTTGA-A-A-----C-A-----G--TCA-T-TTAGGTGAGCA-G--ATT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31174 : tAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31175 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31176 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31177 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31178 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGACGAGCA-
gi|31179 : tcAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CGT-CAC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----A--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31180 : tcTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CAA-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--CCA-T-TTTGGTGAAAA-G--AAT-
gi|31181 : tAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGG-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31182 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-ATTTA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31183 : tcTAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-A--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31184 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-G---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31185 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-G---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31186 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AA---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GTT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31187 : TAAATTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-T--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31188 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---TGT-CGC-----GC-TTTGA-A-T-----C-A-----G--TCA-T-TTTAGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31189 : TAAATTT-T-T-A-TTT-AC---TCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGACCA-G--GAT-A-A---GA--TAATTA-T-TAAAA
gi|31190 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31191 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----ACCTTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--AGT-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31192 : TAAGTGT-T-T-C-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31193 : TAAGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCC-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31194 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-ATTTAAG--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31195 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTTGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31196 : TAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GG--TGATTA-T-TGAAA
gi|31197 : TAAGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-T-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCAAGCC-G--GAT-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31198 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--AAT-C-AGT-GACTTGATTA-T-
gi|31199 : TAAGGTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-GA----G--TCA-T-TATGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--CGACTA-T-TAAAAat
gi|31200 : TAAATAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----TAA-----G--TCA-T-TTTGACGAGCC-G--GAG-A-A---GA--GGATTATT-TAAAA
gi|31201 : TAAGTTC-T-A-A-TTT-AT---CCT-CAC-----GC-TTTGA-A-C-----T-GA----G--TCA-T-TTTAGTGAGCT-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31202 : TAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-AAC-----GC-TTTGA-A-A-----T-A-----G--TAA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31203 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--ACT-A-T---GG--TGA
gi|31204 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GA-TTTGA-A-T-----C-A-----G--TCA-A-TTTGGCGAGCA-G--gactttaatgaaa
gi|31205 : TACGTTT-T-T-A-TTA-AC---TCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGCA-G--G
gi|31206 : TAAGTTT-T-A-A-TTC-AC---CCT-CGC-----GA-TTTGA-T-T-----C-A-----G--TAA-T-TTTGGCGAGCA-G--
gi|31207 : TAAGCGT-T-T-C-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTGGA-T-C-----T-A-----G--GCT-T-TTTGGCGAGCA-A--GAA-C-A---GA--AGATTA-
gi|31208 : TAATTTT-T-T-A-TTT-AC---CAT-CGC-----AC-TTTGA-A-------------------CA-T-TTTAGCGAGCA-G--
gi|31209 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---ATT-TGC-----AC-CTTG----C-----T-T-----GAAGCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAA-C-A---GA--AAATTA-T-
gi|31210 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-ATTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCATG--GAT-ta
gi|31211 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGCA-T--GAA-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31212 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----T--TCA-T-TTTGGCGAGCA-T--GAA-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31213 : AGGTTT-G-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-C--GAA-C-A---AA--TGATTA----AAAA
gi|31214 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-A-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-T--GAA-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31215 : AAGTTT-T-T-C-TTT-AC---CCC-CGC-----GT-TTTGA-AAC-----T-A-----G--GCA-T-TTTGGCCAGCA-G--GGT-A-A---GC--TGGTTA-
gi|31216 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-T-----G--CCA-T-TCTGGCGAACA-T--GA
gi|31217 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TCTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGACAAACA-
gi|31218 : AAGTTT-T-TTA-TTT-AA---CCT-CGT-----GC-TTTGA-G-C-----A-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAG
gi|31219 : AGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GT-GTTGA-A-C-----C-C-----G--TCA-T-ATTGGCAAGCA-G--AAT-A-A---GG--TGATTA-A-TAAA
gi|31220 : AGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CAC-----GC-TTTGA-A-C-----C-T-----G--TCA-T-TTTGGCAAGCA-A--TAC-A-ATGTAA--TGTTTACT-TAAA
gi|31221 : AGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CACACTTAGC-TTTAA-G-C-----T--------------T-TTTGGCGAGCA-G--AAA-C-A---GA--AGATT
gi|31222 : AGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGCACTTAGC-TTTAA-G-C-----T--------------T-TTTGGCGAGCA-G--GAA-C-A---GA--AGATT
gi|31223 : AGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CAT-----AC-TCTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGC
gi|31224 : GTTTGT-T-T-TTT-GC---ACT-CGC-----GC-TTCGA-A-A-----T-G-----G--TCA-T-TTCGGCAAATT-G--GAA-A-A---GA--TGATT
gi|31225 : GTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGA-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-GTTAGCG
gi|31226 : TTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-GA----G--TCA-T-TTTGGAGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31227 : TT-T-T-C-TTT-AT---CCT-TGC-----AC-TTTGATA-C-----T-T-----G--TCA-T-TTAGATGAGCA-G--GAT-A-G---GC--TGATTA-
gi|31228 : TT-T-T-G-TTT-AC---CCT-C-C-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31229 : -T-T-C-TTT-AC---GCT-CTT-----GC-TTTGA-AAC-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--GAT-A-A---GC--TGGTTA-T-
gi|31230 : -T-A-TTT-GC---TCT-CGC-----GT-CTTCA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--Ggta
gi|31231 : -TTT-AC---CCT-CTT-----GC-TTTGA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-GTTGGCAAGCA-G--GAT-A-A---GG--TGATTA-
gi|31232 : -TTA-AT---CCT-CGC-----AC-TTTGATC-C-----T-T-----G--ACA-T-TTTGGCGAGTA-G--GAT-A-G---GC--TGATTA-
gi|31233 : -AC---CCT-TGC-----AC-TTTGT-A-CG----T-A-----G--T-A-T-TTTGGCGAGCA-A--GAA-C-A---GA--AGATTA-TGTAA
gi|31234 : --TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 0 000 0 22222 0 0 0 22222 7777777 00 0 0 0 00 0 0 333 11 8 2
lowQualScore : . . . . . ... . ..... . . . ..... ....... .. . . . .. . . ... .. . .
lowQualScore : 5 5 5 4 4 888 4 77777 4 9 9 00000 8888888 66 9 4 5 88 7 8 333 11 9 1
consensus : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
Reference ( family-329 ) : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31144 : TAAGTAT-T-T-A-TTTTAT---CCT-CAC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--AAT-
gi|31145 : ttTAAGTTG-TGT-T-TTT-AC---CCT-TGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-ATTGGCGAGCA-G--GAA-A-A---GA--TGATTA-T-
gi|31146 : ttTGAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----AC-CATAA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGTCGAGCA-G--CAT-A-A---GA--TGATTA-T-TGAAAtgaaa
gi|31147 : ttTAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----T--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--GAA-A-A---TA--GAGTTA-T-
gi|31148 : ttTAAGATT-T-T-T-TTT-AC---CTT-CGC-----GC-CTTGA-A-C-----T-G-----G--TCATT-TTTTGCGGGCA-G--GAA-A-T---GA--TGATCA-T-ata
gi|31149 : ttTAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-AGT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--CCA-T-TTTGGCAGGCA-G--tgaaa
gi|31150 : ttTAAGTTT-A-T-G-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGTGATCA-
gi|31151 : ttTAAGTTT-T-T-A-TCT-AC---CCT-CGT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TCTGGCGAGCA----GAT-A-
gi|31152 : ttTAAGCTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----AC-TATGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCG-A--AAT-A-
gi|31153 : ttTAAGATT-A-T-AATTT-AC---CCT-CGC-----TT-TTTGA-G-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--AA--A-A---GA--TTATTA-
gi|31154 : ttTATGTTT-T-T-A-TTT-AC---CTT-CAC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAACA-
gi|31155 : ttTGAGTTT-T-A-A-TAT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-C-C-----T-G-----G--TTG-T-TTTGGCTAGCA-G--GAT-ATAC--GA--TGGTT
gi|31156 : ttAAGTTT-T-T-A-TAT-AC---CAT-CGCA----GC-TTTGC-T-C-----T-A-----G--GCA-T-TTTGGCGAGCA-A--TACAA-A---GA--TGATTA-T-
gi|31157 : ttgTAAGTTT-T-T-A-TTT-TC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGgta
gi|31158 : tcTAAGTCT-C-T-G-TTT-AC---CCT-CTT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----A--CTA-T-TTTTGCGAGCA-G--AA
gi|31159 : ttTAAGTCT-T-T---TTG-AC---CTT-TTC-----GC-GTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--
gi|31160 : ttTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCG-TTT-----GC-TTTGA-A-A-----T-T-----G--TCA-T-TTTGTCGAGCA-taacggtacattata
gi|31161 : ttAAGTTT-A-T-A-TTT-AT---CCT-AGC-----GC-TTTGA-T-C-----T-G-----G--TCATT-TTTGGCGAGCA-
gi|31162 : ttgTAAGTTT-T-T-T-TTT-ATTTTCCT-CAC-----GC-TTTG----T-----T-GCA---G--GCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GGC-A-A---AG--CG-TTA-TGTAA
gi|31163 : ttTAAGTTT-T-A-A-TTT-AC---TCT-TGT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----A--CCA-T-TTTGTCTAGCA-
gi|31164 : ttAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--CC
gi|31165 : ttcTAAGTTT-T-G-A-TTT-AC---CCT-TGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-------G--TCA-T-TTTG
gi|31166 : ttTAAGTTT-T-T-----T-AA---CCTGTAC-----GC-GTTGA-A-C-----T-G-----G--TCG-T-TTTGGCGAGCA-G--
gi|31167 : ttAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CAT-CGC-----AC-TTTGC-A-CG----T-A-----G---CA-T-TTTGGTATGCA-GCAGAT-A-
gi|31168 : ttttTAAGTTT-T-G-A-TAT-AC---CTT-CGC-----AC-TTTTA-A-T-----T-G-----G--TCA-T-GATGGCGAGCA-
gi|31169 : ttAAGTTT-T-T----TT-AC---CTT-CGT-----GC-TCTGA-A-G-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCAAG
gi|31170 : ttcGTTT-T-T-G-TTA-AT---CCT-CGC-----GT-TTTGA-A-C-----A-G-----G--TCA-TTTTTGGCGAGC
gi|31171 : ttcaacTTT-T-T-A-TTT-AC---T----GC-----AT-TTTGA-A-CAATATT-AAAA--G--TCA-T-TTTGGCAAGCA-A--TAA-A-A---AA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31172 : tttattTAATTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GC-TTTGA-A-C-----C-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--GGATTATT-TAAAA
gi|31173 : tTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGG-----GC-TTTGA-A-A-----C-A-----G--TCA-T-TTAGGTGAGCA-G--ATT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31174 : tAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31175 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31176 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31177 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31178 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGACGAGCA-
gi|31179 : tcAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CGT-CAC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----A--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31180 : tcTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CAA-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--CCA-T-TTTGGTGAAAA-G--AAT-
gi|31181 : tAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGG-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31182 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-ATTTA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31183 : tcTAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-A--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31184 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-G---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31185 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-G---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31186 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AA---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GTT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31187 : TAAATTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-T--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31188 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---TGT-CGC-----GC-TTTGA-A-T-----C-A-----G--TCA-T-TTTAGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31189 : TAAATTT-T-T-A-TTT-AC---TCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGACCA-G--GAT-A-A---GA--TAATTA-T-TAAAA
gi|31190 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31191 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----ACCTTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--AGT-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31192 : TAAGTGT-T-T-C-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31193 : TAAGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCC-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31194 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-ATTTAAG--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31195 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTTGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31196 : TAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GG--TGATTA-T-TGAAA
gi|31197 : TAAGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-T-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCAAGCC-G--GAT-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31198 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--AAT-C-AGT-GACTTGATTA-T-
gi|31199 : TAAGGTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-GA----G--TCA-T-TATGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--CGACTA-T-TAAAAat
gi|31200 : TAAATAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----TAA-----G--TCA-T-TTTGACGAGCC-G--GAG-A-A---GA--GGATTATT-TAAAA
gi|31201 : TAAGTTC-T-A-A-TTT-AT---CCT-CAC-----GC-TTTGA-A-C-----T-GA----G--TCA-T-TTTAGTGAGCT-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31202 : TAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-AAC-----GC-TTTGA-A-A-----T-A-----G--TAA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31203 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--ACT-A-T---GG--TGA
gi|31204 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GA-TTTGA-A-T-----C-A-----G--TCA-A-TTTGGCGAGCA-G--gactttaatgaaa
gi|31205 : TACGTTT-T-T-A-TTA-AC---TCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGCA-G--G
gi|31206 : TAAGTTT-T-A-A-TTC-AC---CCT-CGC-----GA-TTTGA-T-T-----C-A-----G--TAA-T-TTTGGCGAGCA-G--
gi|31207 : TAAGCGT-T-T-C-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTGGA-T-C-----T-A-----G--GCT-T-TTTGGCGAGCA-A--GAA-C-A---GA--AGATTA-
gi|31208 : TAATTTT-T-T-A-TTT-AC---CAT-CGC-----AC-TTTGA-A-------------------CA-T-TTTAGCGAGCA-G--
gi|31209 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---ATT-TGC-----AC-CTTG----C-----T-T-----GAAGCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAA-C-A---GA--AAATTA-T-
gi|31210 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-ATTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCATG--GAT-ta
gi|31211 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGCA-T--GAA-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31212 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----T--TCA-T-TTTGGCGAGCA-T--GAA-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31213 : AGGTTT-G-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-C--GAA-C-A---AA--TGATTA----AAAA
gi|31214 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-A-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-T--GAA-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31215 : AAGTTT-T-T-C-TTT-AC---CCC-CGC-----GT-TTTGA-AAC-----T-A-----G--GCA-T-TTTGGCCAGCA-G--GGT-A-A---GC--TGGTTA-
gi|31216 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-T-----G--CCA-T-TCTGGCGAACA-T--GA
gi|31217 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TCTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGACAAACA-
gi|31218 : AAGTTT-T-TTA-TTT-AA---CCT-CGT-----GC-TTTGA-G-C-----A-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAG
gi|31219 : AGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GT-GTTGA-A-C-----C-C-----G--TCA-T-ATTGGCAAGCA-G--AAT-A-A---GG--TGATTA-A-TAAA
gi|31220 : AGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CAC-----GC-TTTGA-A-C-----C-T-----G--TCA-T-TTTGGCAAGCA-A--TAC-A-ATGTAA--TGTTTACT-TAAA
gi|31221 : AGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CACACTTAGC-TTTAA-G-C-----T--------------T-TTTGGCGAGCA-G--AAA-C-A---GA--AGATT
gi|31222 : AGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGCACTTAGC-TTTAA-G-C-----T--------------T-TTTGGCGAGCA-G--GAA-C-A---GA--AGATT
gi|31223 : AGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CAT-----AC-TCTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGC
gi|31224 : GTTTGT-T-T-TTT-GC---ACT-CGC-----GC-TTCGA-A-A-----T-G-----G--TCA-T-TTCGGCAAATT-G--GAA-A-A---GA--TGATT
gi|31225 : GTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGA-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-GTTAGCG
gi|31226 : TTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-GA----G--TCA-T-TTTGGAGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31227 : TT-T-T-C-TTT-AT---CCT-TGC-----AC-TTTGATA-C-----T-T-----G--TCA-T-TTAGATGAGCA-G--GAT-A-G---GC--TGATTA-
gi|31228 : TT-T-T-G-TTT-AC---CCT-C-C-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31229 : -T-T-C-TTT-AC---GCT-CTT-----GC-TTTGA-AAC-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--GAT-A-A---GC--TGGTTA-T-
gi|31230 : -T-A-TTT-GC---TCT-CGC-----GT-CTTCA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--Ggta
gi|31231 : -TTT-AC---CCT-CTT-----GC-TTTGA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-GTTGGCAAGCA-G--GAT-A-A---GG--TGATTA-
gi|31232 : -TTA-AT---CCT-CGC-----AC-TTTGATC-C-----T-T-----G--ACA-T-TTTGGCGAGTA-G--GAT-A-G---GC--TGATTA-
gi|31233 : -AC---CCT-TGC-----AC-TTTGT-A-CG----T-A-----G--T-A-T-TTTGGCGAGCA-A--GAA-C-A---GA--AGATTA-TGTAA
gi|31234 : --TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
blockSeqs : ACTTA AATAT ATTTAA TGT CT T G
blockSeqs : ACTTA G AAAA GT . T G
blockSeqs : A G GCA C . T .
blockSeqs : . . AA . . T .
blockSeqs : . . AA . . T .
blockSeqs : . . AA . . T .
blockSeqs : . . AA . . T .
blockSeqs : . . AA . . T .
blockSeqs : . . AA . . T .
blockSeqs : . . AA . . C .
blockSeqs : . . AA . . . .
blockSeqs : . . GA . . . .
blockSeqs : . . AA . . . .
blockSeqs : . . GA . . . .
blockSeqs : . . GA . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . A . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . A . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . T . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . A . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . . .
blockSeqs : . . G . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . G . . .
blockSeqs : . . G . . .
blockSeqs : . . G . . .
blockSeqs : . . G . . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . T
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
finalCons : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
Alignments
lowQualScore : 0 0 0 0 0 000 0 22222 0 0 0 22222 7777777 00 0 0 0 00 0 0 333 11 8 2
lowQualScore : . . . . . ... . ..... . . . ..... ....... .. . . . .. . . ... .. . .
lowQualScore : 5 5 5 4 4 888 4 77777 4 9 9 00000 8888888 66 9 4 5 88 7 8 333 11 9 1
consensus : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
Reference ( family-329 ) : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31144 : TAAGTAT-T-T-A-TTTTAT---CCT-CAC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--AAT-
gi|31145 : ttTAAGTTG-TGT-T-TTT-AC---CCT-TGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-ATTGGCGAGCA-G--GAA-A-A---GA--TGATTA-T-
gi|31146 : ttTGAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----AC-CATAA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGTCGAGCA-G--CAT-A-A---GA--TGATTA-T-TGAAAtgaaa
gi|31147 : ttTAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----T--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--GAA-A-A---TA--GAGTTA-T-
gi|31148 : ttTAAGATT-T-T-T-TTT-AC---CTT-CGC-----GC-CTTGA-A-C-----T-G-----G--TCATT-TTTTGCGGGCA-G--GAA-A-T---GA--TGATCA-T-ata
gi|31149 : ttTAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-AGT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--CCA-T-TTTGGCAGGCA-G--tgaaa
gi|31150 : ttTAAGTTT-A-T-G-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGTGATCA-
gi|31151 : ttTAAGTTT-T-T-A-TCT-AC---CCT-CGT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TCTGGCGAGCA----GAT-A-
gi|31152 : ttTAAGCTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----AC-TATGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCG-A--AAT-A-
gi|31153 : ttTAAGATT-A-T-AATTT-AC---CCT-CGC-----TT-TTTGA-G-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--AA--A-A---GA--TTATTA-
gi|31154 : ttTATGTTT-T-T-A-TTT-AC---CTT-CAC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAACA-
gi|31155 : ttTGAGTTT-T-A-A-TAT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-C-C-----T-G-----G--TTG-T-TTTGGCTAGCA-G--GAT-ATAC--GA--TGGTT
gi|31156 : ttAAGTTT-T-T-A-TAT-AC---CAT-CGCA----GC-TTTGC-T-C-----T-A-----G--GCA-T-TTTGGCGAGCA-A--TACAA-A---GA--TGATTA-T-
gi|31157 : ttgTAAGTTT-T-T-A-TTT-TC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGgta
gi|31158 : tcTAAGTCT-C-T-G-TTT-AC---CCT-CTT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----A--CTA-T-TTTTGCGAGCA-G--AA
gi|31159 : ttTAAGTCT-T-T---TTG-AC---CTT-TTC-----GC-GTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--
gi|31160 : ttTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCG-TTT-----GC-TTTGA-A-A-----T-T-----G--TCA-T-TTTGTCGAGCA-taacggtacattata
gi|31161 : ttAAGTTT-A-T-A-TTT-AT---CCT-AGC-----GC-TTTGA-T-C-----T-G-----G--TCATT-TTTGGCGAGCA-
gi|31162 : ttgTAAGTTT-T-T-T-TTT-ATTTTCCT-CAC-----GC-TTTG----T-----T-GCA---G--GCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GGC-A-A---AG--CG-TTA-TGTAA
gi|31163 : ttTAAGTTT-T-A-A-TTT-AC---TCT-TGT-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----A--CCA-T-TTTGTCTAGCA-
gi|31164 : ttAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--CC
gi|31165 : ttcTAAGTTT-T-G-A-TTT-AC---CCT-TGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-------G--TCA-T-TTTG
gi|31166 : ttTAAGTTT-T-T-----T-AA---CCTGTAC-----GC-GTTGA-A-C-----T-G-----G--TCG-T-TTTGGCGAGCA-G--
gi|31167 : ttAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CAT-CGC-----AC-TTTGC-A-CG----T-A-----G---CA-T-TTTGGTATGCA-GCAGAT-A-
gi|31168 : ttttTAAGTTT-T-G-A-TAT-AC---CTT-CGC-----AC-TTTTA-A-T-----T-G-----G--TCA-T-GATGGCGAGCA-
gi|31169 : ttAAGTTT-T-T----TT-AC---CTT-CGT-----GC-TCTGA-A-G-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCAAG
gi|31170 : ttcGTTT-T-T-G-TTA-AT---CCT-CGC-----GT-TTTGA-A-C-----A-G-----G--TCA-TTTTTGGCGAGC
gi|31171 : ttcaacTTT-T-T-A-TTT-AC---T----GC-----AT-TTTGA-A-CAATATT-AAAA--G--TCA-T-TTTGGCAAGCA-A--TAA-A-A---AA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31172 : tttattTAATTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GC-TTTGA-A-C-----C-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--GGATTATT-TAAAA
gi|31173 : tTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGG-----GC-TTTGA-A-A-----C-A-----G--TCA-T-TTAGGTGAGCA-G--ATT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31174 : tAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31175 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31176 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31177 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31178 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGACGAGCA-
gi|31179 : tcAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CGT-CAC-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----A--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31180 : tcTAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CAA-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--CCA-T-TTTGGTGAAAA-G--AAT-
gi|31181 : tAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGG-----GC-TTTAA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31182 : tcAAGTTC-T-T-A-TTT-AC---CGT-CGC-----GC-ATTTA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31183 : tcTAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-A--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31184 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-G---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31185 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GAT-A-G---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31186 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AA---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-G--GTT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31187 : TAAATTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-T--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31188 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---TGT-CGC-----GC-TTTGA-A-T-----C-A-----G--TCA-T-TTTAGCGAGCA-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31189 : TAAATTT-T-T-A-TTT-AC---TCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGACCA-G--GAT-A-A---GA--TAATTA-T-TAAAA
gi|31190 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31191 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----ACCTTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--AGT-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31192 : TAAGTGT-T-T-C-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31193 : TAAGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCC-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31194 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-ATTTAAG--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31195 : TAAGTAT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTTGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31196 : TAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CAC-----AC-TTTGA-A-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GG--TGATTA-T-TGAAA
gi|31197 : TAAGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-T-C-----T-AA----G--TCA-T-TTTGGCAAGCC-G--GAT-A-G---GA--TGATTATT-TAAAA
gi|31198 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--AAT-C-AGT-GACTTGATTA-T-
gi|31199 : TAAGGTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----T-GA----G--TCA-T-TATGGCGAGCC-G--GAT-A-A---GA--CGACTA-T-TAAAAat
gi|31200 : TAAATAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----TAA-----G--TCA-T-TTTGACGAGCC-G--GAG-A-A---GA--GGATTATT-TAAAA
gi|31201 : TAAGTTC-T-A-A-TTT-AT---CCT-CAC-----GC-TTTGA-A-C-----T-GA----G--TCA-T-TTTAGTGAGCT-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31202 : TAAGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-AAC-----GC-TTTGA-A-A-----T-A-----G--TAA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31203 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGC-----GC-TTTGA-A-C-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--ACT-A-T---GG--TGA
gi|31204 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GA-TTTGA-A-T-----C-A-----G--TCA-A-TTTGGCGAGCA-G--gactttaatgaaa
gi|31205 : TACGTTT-T-T-A-TTA-AC---TCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGCA-G--G
gi|31206 : TAAGTTT-T-A-A-TTC-AC---CCT-CGC-----GA-TTTGA-T-T-----C-A-----G--TAA-T-TTTGGCGAGCA-G--
gi|31207 : TAAGCGT-T-T-C-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTGGA-T-C-----T-A-----G--GCT-T-TTTGGCGAGCA-A--GAA-C-A---GA--AGATTA-
gi|31208 : TAATTTT-T-T-A-TTT-AC---CAT-CGC-----AC-TTTGA-A-------------------CA-T-TTTAGCGAGCA-G--
gi|31209 : TAAGTTT-T-T-A-TTT-AC---ATT-TGC-----AC-CTTG----C-----T-T-----GAAGCA-T-TTTGGCGAGCC-G--GAA-C-A---GA--AAATTA-T-
gi|31210 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----GC-ATTGA-A-C-----C-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCATG--GAT-ta
gi|31211 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TTA-T-TTTGGCGAGCA-T--GAA-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31212 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----T--TCA-T-TTTGGCGAGCA-T--GAA-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31213 : AGGTTT-G-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-C--GAA-C-A---AA--TGATTA----AAAA
gi|31214 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-A-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCC-T--GAA-C-A---GA--TGCTTA----AAAA
gi|31215 : AAGTTT-T-T-C-TTT-AC---CCC-CGC-----GT-TTTGA-AAC-----T-A-----G--GCA-T-TTTGGCCAGCA-G--GGT-A-A---GC--TGGTTA-
gi|31216 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TTTGA-A-C-----T-T-----G--CCA-T-TCTGGCGAACA-T--GA
gi|31217 : AAGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGC-----AC-TCTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGACAAACA-
gi|31218 : AAGTTT-T-TTA-TTT-AA---CCT-CGT-----GC-TTTGA-G-C-----A-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAG
gi|31219 : AGTAT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CGT-----GT-GTTGA-A-C-----C-C-----G--TCA-T-ATTGGCAAGCA-G--AAT-A-A---GG--TGATTA-A-TAAA
gi|31220 : AGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CAC-----GC-TTTGA-A-C-----C-T-----G--TCA-T-TTTGGCAAGCA-A--TAC-A-ATGTAA--TGTTTACT-TAAA
gi|31221 : AGTTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-CACACTTAGC-TTTAA-G-C-----T--------------T-TTTGGCGAGCA-G--AAA-C-A---GA--AGATT
gi|31222 : AGTTT-T-T-G-TTT-AC---CCT-CGCACTTAGC-TTTAA-G-C-----T--------------T-TTTGGCGAGCA-G--GAA-C-A---GA--AGATT
gi|31223 : AGTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CAT-----AC-TCTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGC
gi|31224 : GTTTGT-T-T-TTT-GC---ACT-CGC-----GC-TTCGA-A-A-----T-G-----G--TCA-T-TTCGGCAAATT-G--GAA-A-A---GA--TGATT
gi|31225 : GTTT-T-T-A-TTT-AT---CCT-CGA-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-GTTAGCG
gi|31226 : TTT-T-T-A-TTT-AC---CCT-TGC-----GC-TTTGA-A-C-----C-GA----G--TCA-T-TTTGGAGAGCC-G--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA
gi|31227 : TT-T-T-C-TTT-AT---CCT-TGC-----AC-TTTGATA-C-----T-T-----G--TCA-T-TTAGATGAGCA-G--GAT-A-G---GC--TGATTA-
gi|31228 : TT-T-T-G-TTT-AC---CCT-C-C-----GC-TTTGA-A-C-----T-G-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-
gi|31229 : -T-T-C-TTT-AC---GCT-CTT-----GC-TTTGA-AAC-----A-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--GAT-A-A---GC--TGGTTA-T-
gi|31230 : -T-A-TTT-GC---TCT-CGC-----GT-CTTCA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--Ggta
gi|31231 : -TTT-AC---CCT-CTT-----GC-TTTGA-A-C-----T-A-----G--TCA-T-GTTGGCAAGCA-G--GAT-A-A---GG--TGATTA-
gi|31232 : -TTA-AT---CCT-CGC-----AC-TTTGATC-C-----T-T-----G--ACA-T-TTTGGCGAGTA-G--GAT-A-G---GC--TGATTA-
gi|31233 : -AC---CCT-TGC-----AC-TTTGT-A-CG----T-A-----G--T-A-T-TTTGGCGAGCA-A--GAA-C-A---GA--AGATTA-TGTAA
gi|31234 : --TCA-T-TTTGGCGAGCA-A--GAT-A-A---GA--TGATTA-T-TAAAA