lowQualScore : 333 555 00 0 11111 000 222 0 00 0 11111 0 5 111 1111 111 0 2222 66
lowQualScore : ... ... .. . ..... ... ... . .. . ..... . . ... .... ... . .... ..
lowQualScore : 222 555 77 5 88888 888 111 5 66 4 55555 4 0 888 3333 333 4 9999 44
consensus : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATCT-CCTTA-----TT-GCC---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
Reference ( gi|110795 ) : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATCT-CCTTA-----TT-GTC---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCCAGCTTGGATA
gi|110796 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATCT-CCTAA-----TT-GTT---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--ATGTTTCATAAACCTAGCTTGGATA
gi|110797 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTATCT-CCTTA-----TT-GCT---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--AAAGTTCACAACCCTAGCTTGAATA
gi|110807 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--CTATGT-CCTTA-----TT-GTC---C----TC---TACCCAC-ATGC-A--GAGATTTGCAAACCTAGCTTGGATA
gi|110798 : AAAA---AACAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATC---CTTA-----TT-GCC---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--AAGTTTCATGAACCTAGCTTG
gi|110801 : AAAA---GATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCG--TTATCT-CCTTA-----TT-GCC---C----TC---TATCTAC-ATGC-A--AAGTATCAAGAACCTAGCTTAGACA
gi|110803 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTGTCT-CCTTA-----TT-GCCCT-C----TC---TATCCAT-ATGC-A--AAATTTCACAAACCTGACCTGAAT
gi|110808 : AATA---AATAA---A--A-T-----GG---CC---T-GCA--TTATCT-CCTTA-----CT-GTC---C----AC---TATCCAC-CTGC-A--AAGTTTCACAAACGTAGC-TGGAT
gi|110804 : AACA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATCG-CCTTA-----TT-TCC---C----TC---TATCCAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATGTAGCTTGGATA
gi|110805 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATCT-CCT-A-----TT-TTC---C----TC---TATCCAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAACTTAGCTA
gi|110812 : AAAA---AATAA---A----T-----GG---CT---T-GCA--TGGTCT-CCTCA-----TT-GCC---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCGAACTTG
gi|110811 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATCT-TTTTA-----TT-GCC---C----TT---TATCCAC-ATTC-A--AAGTTTCTCAAACTTAGCT
gi|110813 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---TC---T-ACA--TTATCT-CCTTT-----CT-GCC---C----TT---TTTCAAT-ATGC-A--AAGCTTGACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110814 : AAAAGT-AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATCT-CCTTA-----TT-GCC---C----TC---TATCCAC-AT-C-AT-AAGTTGCGCAAATGTAGCGTGGATA
gi|110817 : AAAA---AATAA---A--T-T-----GA---CA---T-GCA--TTGTCT-CCTTA-----TT-GAC---T----TC---TATTCGC-GCGC-A--ACGTTTCACAAACCTCACTTGGATA
gi|110809 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TTATCT-CCTCG-----TT-GCC---C----TC---TATTGAC-ATGC-T--CAGTTTCACAAATGTAGCTTGGATA
gi|110815 : AAAA---CATGA---A--A-T-----GA---CT---T-GAA--ATAATG-CCTTA-----TT-GCT---T----TC---TATCCAC-ATGT-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110818 : AAAA---AATAA---A--A-T------------------------ATCT-CCGTA-----TT-GCC---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--AAGTTTCACCAAACTAGCTTGGATA
gi|110822 : AAAA---AATAA---A--A-T-----AA---CC---T-GAA--TTATCT-CCTTA-----TT-GCC---T----TC---TATCCAA-TTTC-A--CAATTTCTCGAGCCCAACTTGAATA
gi|110820 : AAAA---AATATT--G--A-T-----GA---CT---T-GCA--TTATCT-CCTTA-----TT-GCT---C----TC---TATTGAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAAC
gi|110819 : AAAA---AATCA---A--A-T-----AA---TT---T-GCA--TTATCT-CCTTA-----TT-G-C---C----T---------AC-ATGT-C--AAGTTTCATAAACCTAGCTTGGATA
gi|110824 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTAGTT-TCTTT-----TT-AT---------TC---TATCAAT-ATCT-----AGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110810 : AAAA---AATAA---A--G-T-----AA---CC---T-GCT--TCATTT-CGTTT-----TT-ACC---CA---TT---TATTCAC-ATGC-A--AAGTTTAACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110830 : AAAA---AATAA---A--A-G-----TA---TCGGGC-GCA--TTATCT-CCTTA-----TT-GCC---C----TA---TATC--C-ATGT-G--AAGGTTCACAAACCAAGCTTTGA
gi|110826 : AAGA---AGTAA---A--A-T-----TA---TG---T-GAA--TGTTCT-CCTTA-----TT-GCC---C----TC---TATTCAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATATAGCTTGGTTA
gi|110834 : AAAA---AATAA---T--A-TCACAGGA---TC---T-GCA--TTATCT-C-TTA-----TT-GTC---C----TC---TGTACACAAAGC-T--AAGTTTCACAATCTTAGCTTTGAT
gi|110816 : AAAA---AATAA---A--A-T-----G----CC---T-GCA--TTTTCT-CATTT-----TT-GTT---G----TC---TAGGCAT-ATGA-A--AAGTTTCACAAACCTAGTTT
gi|110827 : AAAA---TATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--GAATCT-CCTTA-----TT-G----------CC---TATGCAC-ATGCTA--AATTTTCACAAATGTAGCTAAGATA
gi|110831 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----AA---TC---T-GCA--TAATCT-CCT----------------------C---TATCCAC-ATGC-T--TAGTTTCACAAACCTTACTTGGATA
gi|110828 : AAAAGT-AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GC---TTGTTTTCCTTA-----TT-GCC---C----TC---TGTCCAT-ATGC-A--AAGTTT-GCAAACCTAGCT
gi|110832 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GT---CC---G-GCA--TCATC-----------------C---C----TC---TATCCAC-ATGT-A--AAGTTTCATGAATCTTGCTTGGATA
gi|110829 : AAAT---GATAG---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGATCT-CCGTA-----TA-GCC---C----TC---TATCCAC-ATAT-T--AAGTTTCACAAATGTAG-TTGGATA
gi|110799 : AAAA---AGTAATTAA--A-G-----GG---TC---T-GCA--TGATGT-CCTTA-----TT--TCA--C----TA---TATCCAC-ATGC-A--AATTTTCACAAAAGTAGCTTGGATA
gi|110836 : AAAA---AATTG---A----C-----GA---CA---T-GCA--TGATCT-CCTTA-----TT-GTC---A----TC---TATTTAC-ATGA-A--ATGTTTCACATGTGTAGCTTGGATA
gi|110835 : AAAA---AATAATGAA--A-T-----AA---CT---C-AGA--TGAAGT-CCTTA-----TT-GCT---C----TT---TATTCAC-GTGC-A--AAGTTTCACAAATGCAGCTTTGATA
gi|110825 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GG---CC---T-GCA--TAATCT-CCTTA-----TT-GCA---T----TC---TAACCAC-AGTT-T--AAGTTATACAAATGTGGCTTGGACA
gi|110821 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---AC---T-ACA--TAATCT-CC-TA-----GT-GTT---C----TC---TATCCAC-ATGC-T--TAACTTAATAAATGTAGCTAGGATA
gi|110800 : AAAA---AGTAATTAA--A-A-----GA---TG---T-GTA--TGATCT-CCTTA-----TT-GCC---C----T-----GTCCAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATGTAACTTGGATA
gi|110802 : AAAA---AATAACTAA--A-G-----AA---TC---T-ACA--TGATGT-CCATA-----TT-TCT---C----TC---TTTCCAC-ATGC-A--AATTTTCACAAATGTAGCTCGGATA
gi|110837 : AAAA---CATAA---A--A-T-----GA---CC---C-GCA--TTATCT-CTTTATCTCTTT-ATCTCTC----TC---TGTACAC-ACGC-A--ATGTTTCACAAAACTAAC
gi|110806 : AAAATTTAATTA---A--A-T-----GG---TG---T-ACA--TGGTGT-CCTTA-----TT-TCC---C----TC---TTTCCAC-ATGC-T--AAGTTCCAAAAATGTAGCTTGGATA
gi|110823 : AAAA---AATAATTAA--A-G-----AA---TC---T-ACA--TGATAA-CCTTA-----TT-TCT---C----TC---TACTCAC-ACGC-A--AAG-TTCATAAAATTAGCTTGGATA
gi|110838 : AAAA---AATAA---A--T-T-----GA---CC---T-GCA--TTATTT-TCTTA-----TT-GCC---C----TC---TA
gi|110839 : AAAA---ATTAA---A--A-T-----TA---CC---T-ACA--TTATCT-CCCTT-----TT-GC-------------------------C-A--AAGTTTCACAAACCTATCTTGTATA
gi|110833 : AAAATT-AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCAAGTTGTT---CTTA-----TT-GCC---A----AC---TATCCAC-ATGCTA--AAG-TTCACACATGTAGCTCAGATA
gi|110841 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATCT-CCTTA-----TT-GCC---T----TA---TATCCAC-AAGC-A--AAGTTTCA-GAACCTAGCTTAGATA
gi|110842 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--GTATCT-CTTTA-----TT-TCC---T----TC---TATCCAC-ATGC-A--ACGTTTCACAAACCTAGCTCGGATA
gi|110843 : AAA---AACAA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTATCT-CCTCA-----TT-GTC---C----TC---TATCCAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTATCTTGAATA
gi|110840 : AAA---AA-AA---A--A-------GA---CC---T-ACA--TTATCT-TCCTA-----TT-GCC---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110844 : AAA---AA-GA---A--A-T-----GA---CA---T-GCA--TTATCT-TGTTA-----TT-GCC---C----TC---TATTTAC-CTGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110845 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---TC---T-ACA--TTATCT-CCTTA-----CT-GTC---C----CC---CATAAAC-ATGC-A--AAGCTAGACAAACCGAGCTTGAAT
gi|110847 : AAA---AATTA---A--A-T-----GA---CC---C-GTA--ATATCT-CCTTA-----TT-GTT---C----TC---TCTGCAG-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTGGA
gi|110848 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CT---T--CA--TTATTT-CCTTA-----TT-GCC---CCGGCTC---TATCTTC-ATGC-A--TAATTTAACAATTCTACCGTGGATA
gi|110849 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---G-TCA--TTATCT-CCTTAT----TT-TTT---C----TC---TATCAAC-ATGC-A--AATTTT
gi|110846 : AAA---AATTA---ATTA-TCT---GA---TC---T-ACA--TGATGT-TCTTA-----TT---T---C----TCAT-TATCCAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAAAGTAGCTTAGATA
gi|110850 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CG---TGGCA---TATCT-TCTTT-----GT-GCC---G----TC---TATCCAT-ACGT-A--AATTTCCAC
gi|110851 : AA---AATAA---A--AAT-----GA---CC---T-GCA--ATATTT-CCATA-----TT-GCC---C----TCATATATGCAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGAT
gi|110853 : AA---AA-AA---C--A-T-----AA---CC---T-GCA--TTATTT-CCTTA-----TT-TCC---C----TC---TATTCAC-ATGC-A--ATGTTCCACAAACCTAGCTTAGATA
gi|110854 : AA---TATAA---A--A-T-----GA---CT---T-ACA--TTATCT-CCTTA-----TT-GCC---C----TC---TTTCCAC-ATAC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTTGATA
gi|110855 : AA---ATTAT---A--A-G-----GA---CA---T-GCA--TTATCT-CCATA-----TT-GCC---C----TC---TTTACAC-ATGC-A--AAGTTTCACACGCTGAGCTTGGTTA
gi|110852 : AG---AATAA---A--A-T-----GG---TG---T-GCA--TGATCT-CCTTA-----TT-GCC---T----CC---TATCTAC-ATGC-T--TAGTTTAAAAAATGTAGCTTGGATA
gi|110856 : AA---AATAA---A--A-T-----GAAAATCATGT-GCA--TAATCG-TCTTA-----TT-GCC---C----TC---TTTCCAA-ATGC-A--AAGTTTCACAAACC
gi|110857 : A---ACTAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTATCT-CCTTA-----TA-GCC---C----TC---TATCCAC-ATAC-A--GAGTTGCACAAACCTACCTTGGACAttaaatggata
gi|110859 : A---AATAAGGAA--A-T-----GA---CT---T-GCA--TTATAT-CCTTA-----TT-GCC---C----TC---TATTCAC-ACGC-T--AAGATTCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110860 : A---AATAA---C--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATCT-CCTTA-----TT-GCC---C----TC---TATCCAC-ATG-------G------AAACCTATCTTGGATA
gi|110858 : A---ACTAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTATCT-CCTTA-----TA-GCC---C----TC---TATCCAC-AAAC-A--GAGTT
gi|110861 : A---AATAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTAACT-CCTTA-----TT-GCC---A----TC---TATCC
gi|110864 : ---AATAA---A--A-T-----GA---CT---T-GTA--TTATCT-CCCGA-----TT-GCC---C----TC---TATCCAA-ATAC-----AGTTTCACCAATCAGGCTTGGATA
gi|110866 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGGTAT-TCTTA-----TT-ATC---T----TT---TATCCAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTTGATA
gi|110862 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TT---A-GTA--TGATCC-CCTTA-----TT-GCC---C----TC---TATCTAT-ATGC-T--AAGTTTCACA-----AGCGTGGATA
gi|110867 : ---AATTA---A--A-T-----GA---TG---T-ACA--TGATGT-CCTTA-----TT-GCT---C----TC---TATCCAC-ATAC-A--AAGTCTTACAAATGTAGCTAGGA
gi|110868 : ---AATTG---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATTG-TCTTA-----TT-GCC---C----TT---TATTCA-----C-A--AAGTTTCACAAATGCACCTTG
gi|110865 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TA---T-AGA--TGATGT-CCTTA-----TT-G-C---C----TC---TATCCAC-AAGC-----AGTTTCACAAATGAAGCTTGAACA
gi|110863 : ---AATAA---A----T-----AA---CTA--T-GGA--TTATTT-TCTTA-----GT-ACC---C----TC---TATTCAC-CTGT-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTGAA
gi|110869 : ATAA---A--A-T-----GA------------------TCT-CATTA-----TT-GCC---C----TC---TATCCAC-ATGC-T--AAGTTT-ACAAATGCAGCTTGGATA
gi|110870 : TAA---A--A-T-----GA---AC---T-GCA--TTATTG-CCTTA-----TT-TCC---C----TC---TGTCCAC-ATGC-A--AAGTTCCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110871 : TAA---A--A-T-----GA---TC---T-CCA--TTATAT-CCTTA-----TT-GAC---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--AAATTTCATAAACCAAACCTGAACA
gi|110873 : TAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--TTATCT-CCTCA-----TT-GTC---C----TA---TA------------------TTCACAAATGTAGCTTGGAT
gi|110874 : TAA---G--A-T-----AA---CG---T-GCA--TAACCT-CCTCA-----TG-GCC---C----TC---CATCATC-ATAG-T--AAGTTTCATGACCCTAACTTGAATA
gi|110872 : TAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATTT-CTTCA-----TT-GCC---C----TC---TA
gi|110875 : AA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--CTATCT-CCTTT-----TTTGCC---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--CAGTGTCACAAACCTAGCTTTGA
gi|110876 : AA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGATCT-CCTTA-----GT-GCC---C----TC---TATCCAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAAACTAGTGTGGATA
gi|110877 : AA---A--A-C-----GA---TG---T-GCA--GGATTT-TCTTA-----TT-GCC---C----TC---TATTTAC-ATGC-A--TTGTTTCACAAA
gi|110878 : ---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTATCT-CCTTA-----TT------------TC---CATCTAC-ATGC-A--CAGTTTCCCAAACCTAGTTTGGATA
gi|110879 : --A-T-----GC---CC---T-GCA--TTATCT-CCTTA-----TT-GCC---C----TC---TATCCAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTATGATA
gi|110880 : CA--TGATGT-CCTTA-----TT-TCT---C----TC---TGTCCAC-ATGT-A--AAGTTTCACAAAAGTGGCATGGATA
gi|110881 : A--TAATCT-CCTTA-----TT-GCT---C----TC---TTTTCAC-ATGC-A--AAATTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110882 : --TTATCT-GCTTA-----CT-ACA---T----TC---TATCTAC-ATAT-ACTAAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110885 : ATTT-CCTTA-----TT-ACC---C----TC---TATCCAC-ATGC-T--AAGATTCATAAATGTAGCTTGGATA
gi|110884 : ATCT-CCTT------TT-CCC---C----TT---TATCCAC-ATGC-C--AAGTTCCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110883 : ATCT-CCTT------TT-CCC---C----TT---TATCCAC-ATGC-C--AAGTTCCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110886 : ATCT-CCTTA-----TT-GCC---C----TC---TTT--AC-GTGC-T--AAGTTCCACAAATCTAGCTTG
gi|110887 : TTA-----TT-GCT---C----TG---TATCCAC-ATGC-A--ACGTTTCACAAA
gi|110888 : -----TT-GCC---A----TC---TATCCAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTTGATAtgtagataagata
gi|110889 : ---TGTCCAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACTTAGCTTCGATA
Alignments
lowQualScore : 333 555 00 0 11111 000 222 0 00 000 0 0 0 00 1111 000 1111111111 0 2222 0
lowQualScore : ... ... .. . ..... ... ... . .. ... . . . .. .... ... .......... . .... .
lowQualScore : 222 555 66 5 88888 888 111 5 66 888 4 4 4 66 3333 777 9999999999 4 2222 4
consensus : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
Reference ( family-321 ) : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110795 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GTC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCCAGCTTGGATA
gi|110796 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTAA-TT-GTT--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--ATGTTTCATAAACCTAGCTTGGATA
gi|110797 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAAGTTCACAACCCTAGCTTGAATA
gi|110798 : AAAA---AACAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TC---CTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCATGAACCTAGCTTG
gi|110799 : AAAA---AGTAATTAA--A-G-----GG---TC---T-GCA--TGA---TGT-CCTTA-TT-TCA--C----TA---TATC----------CAC-ATGC-A--AATTTTCACAAAAGTAGCTTGGATA
gi|110800 : AAAA---AGTAATTAA--A-A-----GA---TG---T-GTA--TGA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----T-----GTC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATGTAACTTGGATA
gi|110801 : AAAA---GATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCG--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------TAC-ATGC-A--AAGTATCAAGAACCTAGCTTAGACA
gi|110802 : AAAA---AATAACTAA--A-G-----AA---TC---T-ACA--TGA---TGT-CCATA-TT-TCT--C----TC---TTTC----------CAC-ATGC-A--AATTTTCACAAATGTAGCTCGGATA
gi|110803 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTG---TCT-CCTTA-TT-GCCCTC----TC---TATC----------CAT-ATGC-A--AAATTTCACAAACCTGACCTGAAT
gi|110804 : AACA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCG-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATGTAGCTTGGATA
gi|110805 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCT-A-TT-TTC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAACTTAGCTA
gi|110806 : AAAATTTAATTA---A--A-T-----GG---TG---T-ACA--TGG---TGT-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TTTC----------CAC-ATGC-T--AAGTTCCAAAAATGTAGCTTGGATA
gi|110807 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--CTA---TGT-CCTTA-TT-GTC--C----TC---TACC----------CAC-ATGC-A--GAGATTTGCAAACCTAGCTTGGATA
gi|110808 : AATA---AATAA---A--A-T-----GG---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-CT-GTC--C----AC---TATC----------CAC-CTGC-A--AAGTTTCACAAACGTAGC-TGGAT
gi|110809 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TTA---TCT-CCTCG-TT-GCC--C----TC---TATT----------GAC-ATGC-T--CAGTTTCACAAATGTAGCTTGGATA
gi|110810 : AAAA---AATAA---A--G-T-----AA---CC---T-GCT--TCA---TTT-CGTTT-TT-ACC--CA---TT---TATT----------CAC-ATGC-A--AAGTTTAACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110811 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-TTTTA-TT-GCC--C----TT---TATC----------CAC-ATTC-A--AAGTTTCTCAAACTTAGCT
gi|110812 : AAAA---AATAA---A----T-----GG---CT---T-GCA--TGG---TCT-CCTCA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCGAACTTG
gi|110813 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---TC---T-ACA--TTA---TCT-CCTTT-CT-GCC--C----TT---TTTC----------AAT-ATGC-A--AAGCTTGACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110814 : AAAAGT-AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-AT-C-AT-AAGTTGCGCAAATGTAGCGTGGATA
gi|110815 : AAAA---CATGA---A--A-T-----GA---CT---T-GAA--ATA---ATG-CCTTA-TT-GCT--T----TC---TATC----------CAC-ATGT-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110816 : AAAA---AATAA---A--A-T-----G----CC---T-GCA--TTT---TCT-CATTT-TT-GTT--G----TC---TAGG----------CAT-ATGA-A--AAGTTTCACAAACCTAGTTT
gi|110817 : AAAA---AATAA---A--T-T-----GA---CA---T-GCA--TTG---TCT-CCTTA-TT-GAC--T----TC---TATT----------CGC-GCGC-A--ACGTTTCACAAACCTCACTTGGATA
gi|110818 : AAAA---AATAA---A--A-T------------------------A---TCT-CCGTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACCAAACTAGCTTGGATA
gi|110819 : AAAA---AATCA---A--A-T-----AA---TT---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GC----------------C----------TAC-ATGT-C--AAGTTTCATAAACCTAGCTTGGATA
gi|110820 : AAAA---AATATT--G--A-T-----GA---CT---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TATT----------GAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAAC
gi|110821 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---AC---T-ACA--TAA---TCT-CC-TA-GT-GTT--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--TAACTTAATAAATGTAGCTAGGATA
gi|110822 : AAAA---AATAA---A--A-T-----AA---CC---T-GAA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--T----TC---TATC----------CAA-TTTC-A--CAATTTCTCGAGCCCAACTTGAATA
gi|110823 : AAAA---AATAATTAA--A-G-----AA---TC---T-ACA--TGA---TAA-CCTTA-TT-TCT--C----TC---TACT----------CAC-ACGC-A--AAG-TTCATAAAATTAGCTTGGATA
gi|110824 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTAGTTTCT-TTTTA-TT------------C---TATC----------AAT-ATCT-A----GTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110825 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GG---CC---T-GCA--TAA---TCT-CCTTA-TT-GCA--T----TC---TAAC----------CAC-AGTT-T--AAGTTATACAAATGTGGCTTGGACA
gi|110826 : AAGA---AGTAA---A--A-T-----TA---TG---T-GAA--TGT---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATATAGCTTGGTTA
gi|110827 : AAAA---TATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--GAA---TCT-CCTTA-TT-GC---------C---TATG----------CAC-ATGCTA--AATTTTCACAAATGTAGCTAAGATA
gi|110828 : AAAAGT-AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GC---TTG---TTTTCCTTA-TT-GCC--C----TC---TGTC----------CAT-ATGC-A--AAGTTT-GCAAACCTAGCT
gi|110829 : AAAT---GATAG---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGA---TCT-CCGTA-TA-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATAT-T--AAGTTTCACAAATGTAG-TTGGATA
gi|110830 : AAAA---AATAA---A--A-G-----TA---TCGGGC-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TA---TATC------------C-ATGT-G--AAGGTTCACAAACCAAGCTTTGA
gi|110831 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----AA---TC---T-GCA--TAA---TCT-CCT-----------------C---TATC----------CAC-ATGC-T--TAGTTTCACAAACCTTACTTGGATA
gi|110832 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GT---CC---G-GCA--TCA---TC-------------C--C----TC---TATC----------CAC-ATGT-A--AAGTTTCATGAATCTTGCTTGGATA
gi|110833 : AAAATT-AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCAAGTTG---TT---CTTA-TT-GCC--A----AC---TATC----------CAC-ATGCTA--AAG-TTCACACATGTAGCTCAGATA
gi|110834 : AAAA---AATAA---T--A-TCACAGGA---TC---T-GCA--TTA---TCT--CTTA-TT-GTC--C----TC---TGTA----------CACAAAGC-T--AAGTTTCACAATCTTAGCTTTGAT
gi|110835 : AAAA---AATAATGAA--A-T-----AA---CT---C-AGA--TGA---AGT-CCTTA-TT-GCT--C----TT---TATT----------CAC-GTGC-A--AAGTTTCACAAATGCAGCTTTGATA
gi|110836 : AAAA---AATTG---A----C-----GA---CA---T-GCA--TGA---TCT-CCTTA-TT-GTC--A----TC---TATT----------TAC-ATGA-A--ATGTTTCACATGTGTAGCTTGGATA
gi|110837 : AAAA---CATAA---A--A-T-----GA---CC---C-GCA--TTA---TCT-CTTTA-T---CT--C----TT---TATCTCTCTCTGTACAC-ACGC-A--ATGTTTCACAAAACTAAC
gi|110838 : AAAA---AATAA---A--T-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TTT-TCTTA-TT-GCC--C----TC---TA
gi|110839 : AAAA---ATTAA---A--A-T-----TA---CC---T-ACA--TTA---TCT-CCCTT-TT-GCC-----------------------------------A--AAGTTTCACAAACCTATCTTGTATA
gi|110840 : AAA---AA-AA---A--A-------GA---CC---T-ACA--TTA---TCT-TCCTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110841 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--T----TA---TATC----------CAC-AAGC-A--AAGTTTCA-GAACCTAGCTTAGATA
gi|110842 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--GTA---TCT-CTTTA-TT-TCC--T----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--ACGTTTCACAAACCTAGCTCGGATA
gi|110843 : AAA---AACAA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTCA-TT-GTC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTATCTTGAATA
gi|110844 : AAA---AA-GA---A--A-T-----GA---CA---T-GCA--TTA---TCT-TGTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------TAC-CTGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110845 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---TC---T-ACA--TTA---TCT-CCTTA-CT-GTC--C----CC---CATA----------AAC-ATGC-A--AAGCTAGACAAACCGAGCTTGAAT
gi|110846 : AAA---AATTA---ATTA-TCT---GA---TC---T-ACA--TGA---TGT-TCTTA-TT-TCT--C----AT---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAAAGTAGCTTAGATA
gi|110847 : AAA---AATTA---A--A-T-----GA---CC---C-GTA--ATA---TCT-CCTTA-TT-GTT--C----TC---TCTG----------CAG-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTGGA
gi|110848 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CT---T--CA--TTA---TTT-CCTTA-TT-GCC--CCGGCTC---TATC----------TTC-ATGC-A--TAATTTAACAATTCTACCGTGGATA
gi|110849 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---G-TCA--TTA---TCT-CCTTATTT-TTT--C----TC---TATC----------AAC-ATGC-A--AATTTT
gi|110850 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CG---TGGCA---TA---TCT-TCTTT-GT-GCC--G----TC---TATC----------CAT-ACGT-A--AATTTCCAC
gi|110851 : AA---AATAA---A--AAT-----GA---CC---T-GCA--ATA---TTT-CCATA-TT-GCC--C----TCATATATG----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGAT
gi|110852 : AG---AATAA---A--A-T-----GG---TG---T-GCA--TGA---TCT-CCTTA-TT-GCC--T----CC---TATC----------TAC-ATGC-T--TAGTTTAAAAAATGTAGCTTGGATA
gi|110853 : AA---AA-AA---C--A-T-----AA---CC---T-GCA--TTA---TTT-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TATT----------CAC-ATGC-A--ATGTTCCACAAACCTAGCTTAGATA
gi|110854 : AA---TATAA---A--A-T-----GA---CT---T-ACA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TTTC----------CAC-ATAC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTTGATA
gi|110855 : AA---ATTAT---A--A-G-----GA---CA---T-GCA--TTA---TCT-CCATA-TT-GCC--C----TC---TTTA----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACACGCTGAGCTTGGTTA
gi|110856 : AA---AATAA---A--A-T-----GAAAATCATGT-GCA--TAA---TCG-TCTTA-TT-GCC--C----TC---TTTC----------CAA-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTTAAATGGATA
gi|110857 : A---ACTAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTTA-TA-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATAC-A--GAGTTGCACAAACCTACCTTGGACA
gi|110858 : A---ACTAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTTA-TA-GCC--C----TC---TATC----------CAC-AAAC-A--GAGTT
gi|110859 : A---AATAAGGAA--A-T-----GA---CT---T-GCA--TTA---TAT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------CAC-ACGC-T--AAGATTCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110860 : A---AATAA---C--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATG-------G------AAACCTATCTTGGATA
gi|110861 : A---AATAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---ACT-CCTTA-TT-GCC--A----TC---TATC----------C
gi|110862 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TT---A-GTA--TGA---TCC-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------TAT-ATGC-T--AAGTTTCACA-----AGCGTGGATA
gi|110863 : ---AATAA---A----T-----AA---CTA--T-GGA--TTA---TTT-TCTTA-GT-ACC--C----TC---TATT----------CAC-CTGT-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTGAA
gi|110864 : ---AATAA---A--A-T-----GA---CT---T-GTA--TTA---TCT-CCCGA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAA-ATAC-----AGTTTCACCAATCAGGCTTGGATA
gi|110865 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TA---T-AGA--TGA---TGT-CCTTA-TT-G-C--C----TC---TATC----------CAC-AAGC-----AGTTTCACAAATGAAGCTTGAACA
gi|110866 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGG---TAT-TCTTA-TT-ATC--T----TT---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTTGATA
gi|110867 : ---AATTA---A--A-T-----GA---TG---T-ACA--TGA---TGT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TATC----------CAC-ATAC-A--AAGTCTTACAAATGTAGCTAGGA
gi|110868 : ---AATTG---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TTG-TCTTA-TT-GCC--C----TT---TATT----------CA-----C-A--AAGTTTCACAAATGCACCTTG
gi|110869 : ATAA---A--A-T-----GA---------------------TCT-CATTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTT-ACAAATGCAGCTTGGATA
gi|110870 : TAA---A--A-T-----GA---AC---T-GCA--TTA---TTG-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TGTC----------CAC-ATGC-A--AAGTTCCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110871 : TAA---A--A-T-----GA---TC---T-CCA--TTA---TAT-CCTTA-TT-GAC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAATTTCATAAACCAAACCTGAACA
gi|110872 : TAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TTT-CTTCA-TT-GCC--C----TC---TA
gi|110873 : TAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--TTA---TCT-CCTCA-TT-GTC--C----TA---TA----------------------------TTCACAAATGTAGCTTGGAT
gi|110874 : TAA---G--A-T-----AA---CG---T-GCA--TAA---CCT-CCTCA-TG-GCC--C----TC---CATC----------ATC-ATAG-T--AAGTTTCATGACCCTAACTTGAATA
gi|110875 : AA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--CTA---TCT-CCTTT-TTTGCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--CAGTGTCACAAACCTAGCTTTGA
gi|110876 : AA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGA---TCT-CCTTA-GT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAAACTAGTGTGGATA
gi|110877 : AA---A--A-C-----GA---TG---T-GCA--GGA---TTT-TCTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------TAC-ATGC-A--TTGTTTCACAAA
gi|110878 : ---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-----------TC---CATC----------TAC-ATGC-A--CAGTTTCCCAAACCTAGTTTGGATA
gi|110879 : --A-T-----GC---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTATGATA
gi|110880 : CA--TGA---TGT-CCTTA-TT-TCT--C----TC---TGTC----------CAC-ATGT-A--AAGTTTCACAAAAGTGGCATGGATA
gi|110881 : A--TAA---TCT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TTTT----------CAC-ATGC-A--AAATTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110882 : --TTA---TCT-GCTTA-CT-ACA--T----TC---TATC----------TAC-ATAT-ACTAAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110883 : A---TCT-CCTT--TT-CCC--C----TT---TATC----------CAC-ATGC-C--AAGTTCCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110884 : A---TCT-CCTT--TT-CCC--C----TT---TATC----------CAC-ATGC-C--AAGTTCCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110885 : A---TTT-CCTTA-TT-ACC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGATTCATAAATGTAGCTTGGATA
gi|110886 : A---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TTT------------AC-GTGC-T--AAGTTCCACAAATCTAGCTTG
gi|110887 : TTA-TT-GCT--C----TG---TATC----------CAC-ATGC-A--ACGTTTCACAAATGTAGATAAGATA
gi|110888 : -TT-GCC--A----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110889 : ---TGTC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACTTAGCTTCGATA
Alignments
lowQualScore : 333 555 00 0 11111 000 222 0 00 000 0 0 0 00 1111 000 1111111111 0 2222 0
lowQualScore : ... ... .. . ..... ... ... . .. ... . . . .. .... ... .......... . .... .
lowQualScore : 222 555 66 5 88888 888 111 5 66 888 4 4 4 66 3333 777 9999999999 4 2222 4
consensus : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
Reference ( family-321 ) : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110795 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GTC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCCAGCTTGGATA
gi|110796 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTAA-TT-GTT--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--ATGTTTCATAAACCTAGCTTGGATA
gi|110797 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAAGTTCACAACCCTAGCTTGAATA
gi|110798 : AAAA---AACAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TC---CTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCATGAACCTAGCTTG
gi|110799 : AAAA---AGTAATTAA--A-G-----GG---TC---T-GCA--TGA---TGT-CCTTA-TT-TCA--C----TA---TATC----------CAC-ATGC-A--AATTTTCACAAAAGTAGCTTGGATA
gi|110800 : AAAA---AGTAATTAA--A-A-----GA---TG---T-GTA--TGA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----T-----GTC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATGTAACTTGGATA
gi|110801 : AAAA---GATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCG--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------TAC-ATGC-A--AAGTATCAAGAACCTAGCTTAGACA
gi|110802 : AAAA---AATAACTAA--A-G-----AA---TC---T-ACA--TGA---TGT-CCATA-TT-TCT--C----TC---TTTC----------CAC-ATGC-A--AATTTTCACAAATGTAGCTCGGATA
gi|110803 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTG---TCT-CCTTA-TT-GCCCTC----TC---TATC----------CAT-ATGC-A--AAATTTCACAAACCTGACCTGAAT
gi|110804 : AACA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCG-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATGTAGCTTGGATA
gi|110805 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCT-A-TT-TTC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAACTTAGCTA
gi|110806 : AAAATTTAATTA---A--A-T-----GG---TG---T-ACA--TGG---TGT-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TTTC----------CAC-ATGC-T--AAGTTCCAAAAATGTAGCTTGGATA
gi|110807 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--CTA---TGT-CCTTA-TT-GTC--C----TC---TACC----------CAC-ATGC-A--GAGATTTGCAAACCTAGCTTGGATA
gi|110808 : AATA---AATAA---A--A-T-----GG---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-CT-GTC--C----AC---TATC----------CAC-CTGC-A--AAGTTTCACAAACGTAGC-TGGAT
gi|110809 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TTA---TCT-CCTCG-TT-GCC--C----TC---TATT----------GAC-ATGC-T--CAGTTTCACAAATGTAGCTTGGATA
gi|110810 : AAAA---AATAA---A--G-T-----AA---CC---T-GCT--TCA---TTT-CGTTT-TT-ACC--CA---TT---TATT----------CAC-ATGC-A--AAGTTTAACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110811 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-TTTTA-TT-GCC--C----TT---TATC----------CAC-ATTC-A--AAGTTTCTCAAACTTAGCT
gi|110812 : AAAA---AATAA---A----T-----GG---CT---T-GCA--TGG---TCT-CCTCA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCGAACTTG
gi|110813 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---TC---T-ACA--TTA---TCT-CCTTT-CT-GCC--C----TT---TTTC----------AAT-ATGC-A--AAGCTTGACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110814 : AAAAGT-AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-AT-C-AT-AAGTTGCGCAAATGTAGCGTGGATA
gi|110815 : AAAA---CATGA---A--A-T-----GA---CT---T-GAA--ATA---ATG-CCTTA-TT-GCT--T----TC---TATC----------CAC-ATGT-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110816 : AAAA---AATAA---A--A-T-----G----CC---T-GCA--TTT---TCT-CATTT-TT-GTT--G----TC---TAGG----------CAT-ATGA-A--AAGTTTCACAAACCTAGTTT
gi|110817 : AAAA---AATAA---A--T-T-----GA---CA---T-GCA--TTG---TCT-CCTTA-TT-GAC--T----TC---TATT----------CGC-GCGC-A--ACGTTTCACAAACCTCACTTGGATA
gi|110818 : AAAA---AATAA---A--A-T------------------------A---TCT-CCGTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACCAAACTAGCTTGGATA
gi|110819 : AAAA---AATCA---A--A-T-----AA---TT---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GC----------------C----------TAC-ATGT-C--AAGTTTCATAAACCTAGCTTGGATA
gi|110820 : AAAA---AATATT--G--A-T-----GA---CT---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TATT----------GAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAAC
gi|110821 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---AC---T-ACA--TAA---TCT-CC-TA-GT-GTT--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--TAACTTAATAAATGTAGCTAGGATA
gi|110822 : AAAA---AATAA---A--A-T-----AA---CC---T-GAA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--T----TC---TATC----------CAA-TTTC-A--CAATTTCTCGAGCCCAACTTGAATA
gi|110823 : AAAA---AATAATTAA--A-G-----AA---TC---T-ACA--TGA---TAA-CCTTA-TT-TCT--C----TC---TACT----------CAC-ACGC-A--AAG-TTCATAAAATTAGCTTGGATA
gi|110824 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTAGTTTCT-TTTTA-TT------------C---TATC----------AAT-ATCT-A----GTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110825 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GG---CC---T-GCA--TAA---TCT-CCTTA-TT-GCA--T----TC---TAAC----------CAC-AGTT-T--AAGTTATACAAATGTGGCTTGGACA
gi|110826 : AAGA---AGTAA---A--A-T-----TA---TG---T-GAA--TGT---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATATAGCTTGGTTA
gi|110827 : AAAA---TATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--GAA---TCT-CCTTA-TT-GC---------C---TATG----------CAC-ATGCTA--AATTTTCACAAATGTAGCTAAGATA
gi|110828 : AAAAGT-AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GC---TTG---TTTTCCTTA-TT-GCC--C----TC---TGTC----------CAT-ATGC-A--AAGTTT-GCAAACCTAGCT
gi|110829 : AAAT---GATAG---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGA---TCT-CCGTA-TA-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATAT-T--AAGTTTCACAAATGTAG-TTGGATA
gi|110830 : AAAA---AATAA---A--A-G-----TA---TCGGGC-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TA---TATC------------C-ATGT-G--AAGGTTCACAAACCAAGCTTTGA
gi|110831 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----AA---TC---T-GCA--TAA---TCT-CCT-----------------C---TATC----------CAC-ATGC-T--TAGTTTCACAAACCTTACTTGGATA
gi|110832 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GT---CC---G-GCA--TCA---TC-------------C--C----TC---TATC----------CAC-ATGT-A--AAGTTTCATGAATCTTGCTTGGATA
gi|110833 : AAAATT-AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCAAGTTG---TT---CTTA-TT-GCC--A----AC---TATC----------CAC-ATGCTA--AAG-TTCACACATGTAGCTCAGATA
gi|110834 : AAAA---AATAA---T--A-TCACAGGA---TC---T-GCA--TTA---TCT--CTTA-TT-GTC--C----TC---TGTA----------CACAAAGC-T--AAGTTTCACAATCTTAGCTTTGAT
gi|110835 : AAAA---AATAATGAA--A-T-----AA---CT---C-AGA--TGA---AGT-CCTTA-TT-GCT--C----TT---TATT----------CAC-GTGC-A--AAGTTTCACAAATGCAGCTTTGATA
gi|110836 : AAAA---AATTG---A----C-----GA---CA---T-GCA--TGA---TCT-CCTTA-TT-GTC--A----TC---TATT----------TAC-ATGA-A--ATGTTTCACATGTGTAGCTTGGATA
gi|110837 : AAAA---CATAA---A--A-T-----GA---CC---C-GCA--TTA---TCT-CTTTA-T---CT--C----TT---TATCTCTCTCTGTACAC-ACGC-A--ATGTTTCACAAAACTAAC
gi|110838 : AAAA---AATAA---A--T-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TTT-TCTTA-TT-GCC--C----TC---TA
gi|110839 : AAAA---ATTAA---A--A-T-----TA---CC---T-ACA--TTA---TCT-CCCTT-TT-GCC-----------------------------------A--AAGTTTCACAAACCTATCTTGTATA
gi|110840 : AAA---AA-AA---A--A-------GA---CC---T-ACA--TTA---TCT-TCCTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110841 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--T----TA---TATC----------CAC-AAGC-A--AAGTTTCA-GAACCTAGCTTAGATA
gi|110842 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--GTA---TCT-CTTTA-TT-TCC--T----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--ACGTTTCACAAACCTAGCTCGGATA
gi|110843 : AAA---AACAA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTCA-TT-GTC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTATCTTGAATA
gi|110844 : AAA---AA-GA---A--A-T-----GA---CA---T-GCA--TTA---TCT-TGTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------TAC-CTGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110845 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---TC---T-ACA--TTA---TCT-CCTTA-CT-GTC--C----CC---CATA----------AAC-ATGC-A--AAGCTAGACAAACCGAGCTTGAAT
gi|110846 : AAA---AATTA---ATTA-TCT---GA---TC---T-ACA--TGA---TGT-TCTTA-TT-TCT--C----AT---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAAAGTAGCTTAGATA
gi|110847 : AAA---AATTA---A--A-T-----GA---CC---C-GTA--ATA---TCT-CCTTA-TT-GTT--C----TC---TCTG----------CAG-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTGGA
gi|110848 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CT---T--CA--TTA---TTT-CCTTA-TT-GCC--CCGGCTC---TATC----------TTC-ATGC-A--TAATTTAACAATTCTACCGTGGATA
gi|110849 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---G-TCA--TTA---TCT-CCTTATTT-TTT--C----TC---TATC----------AAC-ATGC-A--AATTTT
gi|110850 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CG---TGGCA---TA---TCT-TCTTT-GT-GCC--G----TC---TATC----------CAT-ACGT-A--AATTTCCAC
gi|110851 : AA---AATAA---A--AAT-----GA---CC---T-GCA--ATA---TTT-CCATA-TT-GCC--C----TCATATATG----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGAT
gi|110852 : AG---AATAA---A--A-T-----GG---TG---T-GCA--TGA---TCT-CCTTA-TT-GCC--T----CC---TATC----------TAC-ATGC-T--TAGTTTAAAAAATGTAGCTTGGATA
gi|110853 : AA---AA-AA---C--A-T-----AA---CC---T-GCA--TTA---TTT-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TATT----------CAC-ATGC-A--ATGTTCCACAAACCTAGCTTAGATA
gi|110854 : AA---TATAA---A--A-T-----GA---CT---T-ACA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TTTC----------CAC-ATAC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTTGATA
gi|110855 : AA---ATTAT---A--A-G-----GA---CA---T-GCA--TTA---TCT-CCATA-TT-GCC--C----TC---TTTA----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACACGCTGAGCTTGGTTA
gi|110856 : AA---AATAA---A--A-T-----GAAAATCATGT-GCA--TAA---TCG-TCTTA-TT-GCC--C----TC---TTTC----------CAA-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTTAAATGGATA
gi|110857 : A---ACTAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTTA-TA-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATAC-A--GAGTTGCACAAACCTACCTTGGACA
gi|110858 : A---ACTAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTTA-TA-GCC--C----TC---TATC----------CAC-AAAC-A--GAGTT
gi|110859 : A---AATAAGGAA--A-T-----GA---CT---T-GCA--TTA---TAT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------CAC-ACGC-T--AAGATTCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110860 : A---AATAA---C--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATG-------G------AAACCTATCTTGGATA
gi|110861 : A---AATAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---ACT-CCTTA-TT-GCC--A----TC---TATC----------C
gi|110862 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TT---A-GTA--TGA---TCC-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------TAT-ATGC-T--AAGTTTCACA-----AGCGTGGATA
gi|110863 : ---AATAA---A----T-----AA---CTA--T-GGA--TTA---TTT-TCTTA-GT-ACC--C----TC---TATT----------CAC-CTGT-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTGAA
gi|110864 : ---AATAA---A--A-T-----GA---CT---T-GTA--TTA---TCT-CCCGA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAA-ATAC-----AGTTTCACCAATCAGGCTTGGATA
gi|110865 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TA---T-AGA--TGA---TGT-CCTTA-TT-G-C--C----TC---TATC----------CAC-AAGC-----AGTTTCACAAATGAAGCTTGAACA
gi|110866 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGG---TAT-TCTTA-TT-ATC--T----TT---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTTGATA
gi|110867 : ---AATTA---A--A-T-----GA---TG---T-ACA--TGA---TGT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TATC----------CAC-ATAC-A--AAGTCTTACAAATGTAGCTAGGA
gi|110868 : ---AATTG---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TTG-TCTTA-TT-GCC--C----TT---TATT----------CA-----C-A--AAGTTTCACAAATGCACCTTG
gi|110869 : ATAA---A--A-T-----GA---------------------TCT-CATTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTT-ACAAATGCAGCTTGGATA
gi|110870 : TAA---A--A-T-----GA---AC---T-GCA--TTA---TTG-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TGTC----------CAC-ATGC-A--AAGTTCCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110871 : TAA---A--A-T-----GA---TC---T-CCA--TTA---TAT-CCTTA-TT-GAC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAATTTCATAAACCAAACCTGAACA
gi|110872 : TAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TTT-CTTCA-TT-GCC--C----TC---TA
gi|110873 : TAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--TTA---TCT-CCTCA-TT-GTC--C----TA---TA----------------------------TTCACAAATGTAGCTTGGAT
gi|110874 : TAA---G--A-T-----AA---CG---T-GCA--TAA---CCT-CCTCA-TG-GCC--C----TC---CATC----------ATC-ATAG-T--AAGTTTCATGACCCTAACTTGAATA
gi|110875 : AA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--CTA---TCT-CCTTT-TTTGCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--CAGTGTCACAAACCTAGCTTTGA
gi|110876 : AA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGA---TCT-CCTTA-GT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAAACTAGTGTGGATA
gi|110877 : AA---A--A-C-----GA---TG---T-GCA--GGA---TTT-TCTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------TAC-ATGC-A--TTGTTTCACAAA
gi|110878 : ---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-----------TC---CATC----------TAC-ATGC-A--CAGTTTCCCAAACCTAGTTTGGATA
gi|110879 : --A-T-----GC---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTATGATA
gi|110880 : CA--TGA---TGT-CCTTA-TT-TCT--C----TC---TGTC----------CAC-ATGT-A--AAGTTTCACAAAAGTGGCATGGATA
gi|110881 : A--TAA---TCT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TTTT----------CAC-ATGC-A--AAATTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110882 : --TTA---TCT-GCTTA-CT-ACA--T----TC---TATC----------TAC-ATAT-ACTAAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110883 : A---TCT-CCTT--TT-CCC--C----TT---TATC----------CAC-ATGC-C--AAGTTCCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110884 : A---TCT-CCTT--TT-CCC--C----TT---TATC----------CAC-ATGC-C--AAGTTCCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110885 : A---TTT-CCTTA-TT-ACC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGATTCATAAATGTAGCTTGGATA
gi|110886 : A---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TTT------------AC-GTGC-T--AAGTTCCACAAATCTAGCTTG
gi|110887 : TTA-TT-GCT--C----TG---TATC----------CAC-ATGC-A--ACGTTTCACAAATGTAGATAAGATA
gi|110888 : -TT-GCC--A----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110889 : ---TGTC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACTTAGCTTCGATA
blockSeqs : TTT TTA CACAG GGG CGGC TCTCTCTGTA ACT
blockSeqs : GT TTA CT ATG A . AT
blockSeqs : GT CTA . A . . TA
blockSeqs : TT TTA . . . . TA
blockSeqs : . TGA . . . . A
blockSeqs : . GGA . . . . A
blockSeqs : . T . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . A
blockSeqs : . . . . . T
blockSeqs : . . . . . A
blockSeqs : . . . . . A
blockSeqs : . . . . . A
blockSeqs : . . . . . A
blockSeqs : . . . . . A
blockSeqs : . . . . . C
blockSeqs : . . . . . C
blockSeqs : . . . . . T
blockSeqs : . . . . T
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . A
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
finalCons : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
Alignments
lowQualScore : 333 555 00 0 11111 000 222 0 00 000 0 0 0 00 1111 000 1111111111 0 2222 0
lowQualScore : ... ... .. . ..... ... ... . .. ... . . . .. .... ... .......... . .... .
lowQualScore : 222 555 66 5 88888 888 111 5 66 888 4 4 4 66 3333 777 9999999999 4 2222 4
consensus : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
Reference ( family-321 ) : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110795 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GTC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCCAGCTTGGATA
gi|110796 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTAA-TT-GTT--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--ATGTTTCATAAACCTAGCTTGGATA
gi|110797 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAAGTTCACAACCCTAGCTTGAATA
gi|110798 : AAAA---AACAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TC---CTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCATGAACCTAGCTTG
gi|110799 : AAAA---AGTAATTAA--A-G-----GG---TC---T-GCA--TGA---TGT-CCTTA-TT-TCA--C----TA---TATC----------CAC-ATGC-A--AATTTTCACAAAAGTAGCTTGGATA
gi|110800 : AAAA---AGTAATTAA--A-A-----GA---TG---T-GTA--TGA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----T-----GTC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATGTAACTTGGATA
gi|110801 : AAAA---GATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCG--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------TAC-ATGC-A--AAGTATCAAGAACCTAGCTTAGACA
gi|110802 : AAAA---AATAACTAA--A-G-----AA---TC---T-ACA--TGA---TGT-CCATA-TT-TCT--C----TC---TTTC----------CAC-ATGC-A--AATTTTCACAAATGTAGCTCGGATA
gi|110803 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTG---TCT-CCTTA-TT-GCCCTC----TC---TATC----------CAT-ATGC-A--AAATTTCACAAACCTGACCTGAAT
gi|110804 : AACA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCG-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATGTAGCTTGGATA
gi|110805 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCT-A-TT-TTC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAACTTAGCTA
gi|110806 : AAAATTTAATTA---A--A-T-----GG---TG---T-ACA--TGG---TGT-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TTTC----------CAC-ATGC-T--AAGTTCCAAAAATGTAGCTTGGATA
gi|110807 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--CTA---TGT-CCTTA-TT-GTC--C----TC---TACC----------CAC-ATGC-A--GAGATTTGCAAACCTAGCTTGGATA
gi|110808 : AATA---AATAA---A--A-T-----GG---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-CT-GTC--C----AC---TATC----------CAC-CTGC-A--AAGTTTCACAAACGTAGC-TGGAT
gi|110809 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TTA---TCT-CCTCG-TT-GCC--C----TC---TATT----------GAC-ATGC-T--CAGTTTCACAAATGTAGCTTGGATA
gi|110810 : AAAA---AATAA---A--G-T-----AA---CC---T-GCT--TCA---TTT-CGTTT-TT-ACC--CA---TT---TATT----------CAC-ATGC-A--AAGTTTAACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110811 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-TTTTA-TT-GCC--C----TT---TATC----------CAC-ATTC-A--AAGTTTCTCAAACTTAGCT
gi|110812 : AAAA---AATAA---A----T-----GG---CT---T-GCA--TGG---TCT-CCTCA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCGAACTTG
gi|110813 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---TC---T-ACA--TTA---TCT-CCTTT-CT-GCC--C----TT---TTTC----------AAT-ATGC-A--AAGCTTGACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110814 : AAAAGT-AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-AT-C-AT-AAGTTGCGCAAATGTAGCGTGGATA
gi|110815 : AAAA---CATGA---A--A-T-----GA---CT---T-GAA--ATA---ATG-CCTTA-TT-GCT--T----TC---TATC----------CAC-ATGT-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110816 : AAAA---AATAA---A--A-T-----G----CC---T-GCA--TTT---TCT-CATTT-TT-GTT--G----TC---TAGG----------CAT-ATGA-A--AAGTTTCACAAACCTAGTTT
gi|110817 : AAAA---AATAA---A--T-T-----GA---CA---T-GCA--TTG---TCT-CCTTA-TT-GAC--T----TC---TATT----------CGC-GCGC-A--ACGTTTCACAAACCTCACTTGGATA
gi|110818 : AAAA---AATAA---A--A-T------------------------A---TCT-CCGTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACCAAACTAGCTTGGATA
gi|110819 : AAAA---AATCA---A--A-T-----AA---TT---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GC----------------C----------TAC-ATGT-C--AAGTTTCATAAACCTAGCTTGGATA
gi|110820 : AAAA---AATATT--G--A-T-----GA---CT---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TATT----------GAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAAC
gi|110821 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---AC---T-ACA--TAA---TCT-CC-TA-GT-GTT--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--TAACTTAATAAATGTAGCTAGGATA
gi|110822 : AAAA---AATAA---A--A-T-----AA---CC---T-GAA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--T----TC---TATC----------CAA-TTTC-A--CAATTTCTCGAGCCCAACTTGAATA
gi|110823 : AAAA---AATAATTAA--A-G-----AA---TC---T-ACA--TGA---TAA-CCTTA-TT-TCT--C----TC---TACT----------CAC-ACGC-A--AAG-TTCATAAAATTAGCTTGGATA
gi|110824 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTAGTTTCT-TTTTA-TT------------C---TATC----------AAT-ATCT-A----GTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110825 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GG---CC---T-GCA--TAA---TCT-CCTTA-TT-GCA--T----TC---TAAC----------CAC-AGTT-T--AAGTTATACAAATGTGGCTTGGACA
gi|110826 : AAGA---AGTAA---A--A-T-----TA---TG---T-GAA--TGT---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCATAAATATAGCTTGGTTA
gi|110827 : AAAA---TATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--GAA---TCT-CCTTA-TT-GC---------C---TATG----------CAC-ATGCTA--AATTTTCACAAATGTAGCTAAGATA
gi|110828 : AAAAGT-AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GC---TTG---TTTTCCTTA-TT-GCC--C----TC---TGTC----------CAT-ATGC-A--AAGTTT-GCAAACCTAGCT
gi|110829 : AAAT---GATAG---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGA---TCT-CCGTA-TA-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATAT-T--AAGTTTCACAAATGTAG-TTGGATA
gi|110830 : AAAA---AATAA---A--A-G-----TA---TCGGGC-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TA---TATC------------C-ATGT-G--AAGGTTCACAAACCAAGCTTTGA
gi|110831 : AAAA---AGTAA---A--A-T-----AA---TC---T-GCA--TAA---TCT-CCT-----------------C---TATC----------CAC-ATGC-T--TAGTTTCACAAACCTTACTTGGATA
gi|110832 : AAAA---AATAA---A--A-T-----GT---CC---G-GCA--TCA---TC-------------C--C----TC---TATC----------CAC-ATGT-A--AAGTTTCATGAATCTTGCTTGGATA
gi|110833 : AAAATT-AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCAAGTTG---TT---CTTA-TT-GCC--A----AC---TATC----------CAC-ATGCTA--AAG-TTCACACATGTAGCTCAGATA
gi|110834 : AAAA---AATAA---T--A-TCACAGGA---TC---T-GCA--TTA---TCT--CTTA-TT-GTC--C----TC---TGTA----------CACAAAGC-T--AAGTTTCACAATCTTAGCTTTGAT
gi|110835 : AAAA---AATAATGAA--A-T-----AA---CT---C-AGA--TGA---AGT-CCTTA-TT-GCT--C----TT---TATT----------CAC-GTGC-A--AAGTTTCACAAATGCAGCTTTGATA
gi|110836 : AAAA---AATTG---A----C-----GA---CA---T-GCA--TGA---TCT-CCTTA-TT-GTC--A----TC---TATT----------TAC-ATGA-A--ATGTTTCACATGTGTAGCTTGGATA
gi|110837 : AAAA---CATAA---A--A-T-----GA---CC---C-GCA--TTA---TCT-CTTTA-T---CT--C----TT---TATCTCTCTCTGTACAC-ACGC-A--ATGTTTCACAAAACTAAC
gi|110838 : AAAA---AATAA---A--T-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TTT-TCTTA-TT-GCC--C----TC---TA
gi|110839 : AAAA---ATTAA---A--A-T-----TA---CC---T-ACA--TTA---TCT-CCCTT-TT-GCC-----------------------------------A--AAGTTTCACAAACCTATCTTGTATA
gi|110840 : AAA---AA-AA---A--A-------GA---CC---T-ACA--TTA---TCT-TCCTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110841 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--T----TA---TATC----------CAC-AAGC-A--AAGTTTCA-GAACCTAGCTTAGATA
gi|110842 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--GTA---TCT-CTTTA-TT-TCC--T----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--ACGTTTCACAAACCTAGCTCGGATA
gi|110843 : AAA---AACAA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTCA-TT-GTC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTATCTTGAATA
gi|110844 : AAA---AA-GA---A--A-T-----GA---CA---T-GCA--TTA---TCT-TGTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------TAC-CTGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110845 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---TC---T-ACA--TTA---TCT-CCTTA-CT-GTC--C----CC---CATA----------AAC-ATGC-A--AAGCTAGACAAACCGAGCTTGAAT
gi|110846 : AAA---AATTA---ATTA-TCT---GA---TC---T-ACA--TGA---TGT-TCTTA-TT-TCT--C----AT---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAAAGTAGCTTAGATA
gi|110847 : AAA---AATTA---A--A-T-----GA---CC---C-GTA--ATA---TCT-CCTTA-TT-GTT--C----TC---TCTG----------CAG-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTGGA
gi|110848 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CT---T--CA--TTA---TTT-CCTTA-TT-GCC--CCGGCTC---TATC----------TTC-ATGC-A--TAATTTAACAATTCTACCGTGGATA
gi|110849 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CC---G-TCA--TTA---TCT-CCTTATTT-TTT--C----TC---TATC----------AAC-ATGC-A--AATTTT
gi|110850 : AAA---AATAA---A--A-T-----GA---CG---TGGCA---TA---TCT-TCTTT-GT-GCC--G----TC---TATC----------CAT-ACGT-A--AATTTCCAC
gi|110851 : AA---AATAA---A--AAT-----GA---CC---T-GCA--ATA---TTT-CCATA-TT-GCC--C----TCATATATG----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTGGAT
gi|110852 : AG---AATAA---A--A-T-----GG---TG---T-GCA--TGA---TCT-CCTTA-TT-GCC--T----CC---TATC----------TAC-ATGC-T--TAGTTTAAAAAATGTAGCTTGGATA
gi|110853 : AA---AA-AA---C--A-T-----AA---CC---T-GCA--TTA---TTT-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TATT----------CAC-ATGC-A--ATGTTCCACAAACCTAGCTTAGATA
gi|110854 : AA---TATAA---A--A-T-----GA---CT---T-ACA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TTTC----------CAC-ATAC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTTGATA
gi|110855 : AA---ATTAT---A--A-G-----GA---CA---T-GCA--TTA---TCT-CCATA-TT-GCC--C----TC---TTTA----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACACGCTGAGCTTGGTTA
gi|110856 : AA---AATAA---A--A-T-----GAAAATCATGT-GCA--TAA---TCG-TCTTA-TT-GCC--C----TC---TTTC----------CAA-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTTAAATGGATA
gi|110857 : A---ACTAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTTA-TA-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATAC-A--GAGTTGCACAAACCTACCTTGGACA
gi|110858 : A---ACTAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---TCT-CCTTA-TA-GCC--C----TC---TATC----------CAC-AAAC-A--GAGTT
gi|110859 : A---AATAAGGAA--A-T-----GA---CT---T-GCA--TTA---TAT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------CAC-ACGC-T--AAGATTCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110860 : A---AATAA---C--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATG-------G------AAACCTATCTTGGATA
gi|110861 : A---AATAT---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--TTA---ACT-CCTTA-TT-GCC--A----TC---TATC----------C
gi|110862 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TT---A-GTA--TGA---TCC-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------TAT-ATGC-T--AAGTTTCACA-----AGCGTGGATA
gi|110863 : ---AATAA---A----T-----AA---CTA--T-GGA--TTA---TTT-TCTTA-GT-ACC--C----TC---TATT----------CAC-CTGT-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTGAA
gi|110864 : ---AATAA---A--A-T-----GA---CT---T-GTA--TTA---TCT-CCCGA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAA-ATAC-----AGTTTCACCAATCAGGCTTGGATA
gi|110865 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TA---T-AGA--TGA---TGT-CCTTA-TT-G-C--C----TC---TATC----------CAC-AAGC-----AGTTTCACAAATGAAGCTTGAACA
gi|110866 : ---AATAA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGG---TAT-TCTTA-TT-ATC--T----TT---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAATGTAGCTTTGATA
gi|110867 : ---AATTA---A--A-T-----GA---TG---T-ACA--TGA---TGT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TATC----------CAC-ATAC-A--AAGTCTTACAAATGTAGCTAGGA
gi|110868 : ---AATTG---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TTG-TCTTA-TT-GCC--C----TT---TATT----------CA-----C-A--AAGTTTCACAAATGCACCTTG
gi|110869 : ATAA---A--A-T-----GA---------------------TCT-CATTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTT-ACAAATGCAGCTTGGATA
gi|110870 : TAA---A--A-T-----GA---AC---T-GCA--TTA---TTG-CCTTA-TT-TCC--C----TC---TGTC----------CAC-ATGC-A--AAGTTCCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110871 : TAA---A--A-T-----GA---TC---T-CCA--TTA---TAT-CCTTA-TT-GAC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAATTTCATAAACCAAACCTGAACA
gi|110872 : TAA---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TTT-CTTCA-TT-GCC--C----TC---TA
gi|110873 : TAA---A--A-T-----GA---CC---T-ACA--TTA---TCT-CCTCA-TT-GTC--C----TA---TA----------------------------TTCACAAATGTAGCTTGGAT
gi|110874 : TAA---G--A-T-----AA---CG---T-GCA--TAA---CCT-CCTCA-TG-GCC--C----TC---CATC----------ATC-ATAG-T--AAGTTTCATGACCCTAACTTGAATA
gi|110875 : AA---A--A-T-----GA---CC---T-GTA--CTA---TCT-CCTTT-TTTGCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--CAGTGTCACAAACCTAGCTTTGA
gi|110876 : AA---A--A-T-----GA---TG---T-GCA--TGA---TCT-CCTTA-GT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGTTTCACAAAACTAGTGTGGATA
gi|110877 : AA---A--A-C-----GA---TG---T-GCA--GGA---TTT-TCTTA-TT-GCC--C----TC---TATT----------TAC-ATGC-A--TTGTTTCACAAA
gi|110878 : ---A--A-T-----GA---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-----------TC---CATC----------TAC-ATGC-A--CAGTTTCCCAAACCTAGTTTGGATA
gi|110879 : --A-T-----GC---CC---T-GCA--TTA---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTATGATA
gi|110880 : CA--TGA---TGT-CCTTA-TT-TCT--C----TC---TGTC----------CAC-ATGT-A--AAGTTTCACAAAAGTGGCATGGATA
gi|110881 : A--TAA---TCT-CCTTA-TT-GCT--C----TC---TTTT----------CAC-ATGC-A--AAATTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110882 : --TTA---TCT-GCTTA-CT-ACA--T----TC---TATC----------TAC-ATAT-ACTAAGTTTCACAAACCTAGCTTGGATA
gi|110883 : A---TCT-CCTT--TT-CCC--C----TT---TATC----------CAC-ATGC-C--AAGTTCCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110884 : A---TCT-CCTT--TT-CCC--C----TT---TATC----------CAC-ATGC-C--AAGTTCCACAAATCTAGCTTGCATA
gi|110885 : A---TTT-CCTTA-TT-ACC--C----TC---TATC----------CAC-ATGC-T--AAGATTCATAAATGTAGCTTGGATA
gi|110886 : A---TCT-CCTTA-TT-GCC--C----TC---TTT------------AC-GTGC-T--AAGTTCCACAAATCTAGCTTG
gi|110887 : TTA-TT-GCT--C----TG---TATC----------CAC-ATGC-A--ACGTTTCACAAATGTAGATAAGATA
gi|110888 : -TT-GCC--A----TC---TATC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACCTAGCTTTGATA
gi|110889 : ---TGTC----------CAC-ATGC-A--AAGTTTCACAAACTTAGCTTCGATA