lowQualScore : 1111111111 3333333333333333
lowQualScore : 00 2 0000 0 22222 0 0 000 0 4444444444 0 77777777 0 22222 1111 111 1 1 66666666 222222 2222 1111 4 2222222222222222 00
lowQualScore : .. . .... . ..... . . ... . .......... . ........ . ..... .... ... . . ........ ...... .... .... . ................ ..
lowQualScore : 66 0 9999 4 00000 4 4 777 4 6666666666 4 77777777 4 88888 9999 555 3 9 22222222 000000 4444 4444 0 1111111111111111 88
consensus : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT----AA--GC-GT--A--TAC---AG---C-TCATCGT----C--A------T----AC----A-AA-A-TAC--AAT----AAT--CAATGCAT
Reference ( gi|132776 ) : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT----AA--GC-AT--A--TAC---AG---C-TCATCAT----C--A------T----AC----A-AA-G-TAC--AAT---TAAT--CAATGCAT
gi|132708 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT----AA--GC-AT--A--TAC---AG---C-TCATCAT----C--A------T----AC----A-AA-G-TAC--AAT---TAAT--CAATACA
gi|132709 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT----AA--GC-AT--A--TAC---AG---C-TCATCAT----C--A------T----AC----A-AA-G-TAC--AAT---TACT--CAATGCAT
gi|132711 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT----AA--GC-AT--A--TAG---AG---T-TCATCAT----C--A------T----ACA---A-AA-A-TAC--AAT---TAAT--CAATGCAT
gi|132777 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---AT-T-T----C---TA-CTTT---AA--GC-AA--A--TAC---AG---C-TCATCAT----C--A------T----AC----A-AA-A-TAC--AAT---TAAT--CAA
gi|132750 : CAAAACA--GAACA----AAA-CA-----TA-TATTT-T---TT-T-T----C---GA-CTT----GA--GC-AT--A--TAC---AG---C-TCATCAT----C--A------T----AC----A-AC-T-AAT--AAT---TAAT--CAATGCAT
gi|132712 : aCAGAACA--GAACA----GGA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT----AA--GC-AT--A--TAC---AG---C-TCATCAT----C--A------T----AC----A-AA-
gi|132751 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT----AA--GC-AT-----TAC---AG---C-TCATCGT----C--A------T----AC----GTAT-A-TAC--AA-----AAT--CAATACAT
gi|132714 : aCAGAACA--GAACA----GGA-CA-----TA-CATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT----AA--GC-AT-----TAC---AG---C-TCATCGT----C--A------T----AC----ATAT-A-TGC--AA-----AAT--CAATACAT
gi|132715 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------AATCTT----AA--GC-AT-----TAC---AG---C-TCATCGT----C--ATTG---T----AT----A------TAC--AA-----AAT--CAATACAT
gi|132720 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT--------GC-AC--A--TA----AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----A-A----TAC--A
gi|132719 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT--------GC-AC--A--TA----AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----A-A----TAC--A
gi|132718 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT--------GC-AC--A--TA----AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----A-A----TAC--A
gi|132721 : aaCAGAATA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT--------GC-AC--A--TA----AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----A-A----TAC--A
gi|132722 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TGT--------GC-AC--A--TA----AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----A-A----TAC--A
gi|132723 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT--------GC-AC--A--TA----AG---T-ACATCAT----C--A------A----AC----A-A----TAC--A
gi|132764 : aaCAGGACA--GAACA----GAA-CA-----T--TCTTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT----AA--GC-AT-----TACAAAAG---C-TTTTCAC----C--A------T----A
gi|132757 : aCAGAACA--GAACA----GAA-CG-----TA-TATTT-T---AT-T-T--------GA-CTT----AT--AC-AT--AG-TAC---AT---CGTCAT-AT----CT-A------T----AC----A-aataacatattcaaatacat
gi|132737 : aCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-AATTT-T---AT-T----------GA-TTT--------GC-AC--A--TA----AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----
gi|132728 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAATtatacatacataataaa
gi|132727 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132726 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132725 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132724 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132738 : aaCATAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T--------GA-CTT----AT--AC-AT--AG-TAC---AT---CGTCATAAC----T--A------T----AC----A-
gi|132729 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CAGAAGGTA-TATTT-T---A---------C---AG-TTT--------GC-AT--G--TAA---AG---T-TCATCAT----G--A------T----AC----A-TA-A-TACA-AAA---AAAT--CAATACATttttttaacaaatatatttagatca
gi|132730 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT----AA--AC--T--A--TAC---AG---T-TTTTCGT----CT-A------TGTA-AC----A-AA-ATTAC--AAA---TAAA--CA
gi|132731 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TT---------G--GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132732 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132734 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAT--AATATACAAT--CAAT
gi|132733 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT----GT--AC-AA--AG-TAC---A------TCATCATAATAT--A------T----AC----A-AT-A-TAC--AAT---CAAT--
gi|132710 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---TT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132735 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT----AA--AC--T--A--TAC---AG---T-TTCGCGT----CT-A------T----AT----A-AA----AA--AAT---T
gi|132739 : aaCAGAACATAGAACA----GAC-TA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT----A----T-AC--A--TAC---AGTATT-TCATCATGA--C--A------T----AT----A-caa
gi|132740 : aaCATAACA--GAACA----AAA-C------TG-AATTT-T---AT-T-TAATAT---AA-CTT----GA--AC-AT--A--TAC---AG---C-TCATCGT----T--A------T----
gi|132748 : aaCAGAACA--AAACA----GAA-CA-----GA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-TTT----GT--GC-ATAAA--TAC---AT---CGTCATAAT----A--ACCTATTT----AC----A-AC-A-TAC--AAT-----AT--CA
gi|132741 : agCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TAGTT-T---AT-T-T--------GA-CT---------G--AT--A--CAT---AG---T-ACATTGT----C--A------T----A
gi|132742 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CAGAAT-TG-TGTTT-T---AT-T-T----TTTAAA-ATT----GA--GC-A---A--CAT---AG---C-TCATCGT----CATA------T----AC----A-AA-
gi|132778 : aaCAGAATA--GAACA----GA-------------ATTT-T----T-T-T----A---GA-CTT----GG--GC-AT-----TAT---AG---C-TTGTCGT----C--A------T----AT----ACAA----AC--ATT---T--T--CAATGCATcattttcaaaacat
gi|132745 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----GA-AATTT-T---GT-T-T----A---GA-CTG----GA--GC-AT-----CAT---AG---T-TCATCGT----C--G------T-----CGTCTA-AA----AC--AAT---ACAT--CAGTG
gi|132743 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-A---AT-T-A----G---GA-TTT----GT--AC-AA--AG-TAC---A------TCATCATAATAT--A------T----AC----A-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132773 : aaCAAAAAA--GATCA----GAA-CA-----GA-AATTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT----GA--GC-AT-----CAT---AG---C-TTATCGT----C--A------T----AT----A-GA-A--AC--ATT---T--T--TTATGCAT
gi|132746 : aCAGAATA--CAACA----GAA-AT-----TA-TATTT------T-T-T----A---GA-CTTTCAAGA--GC-AT-----CAT---AG---C-TCATCGT----C--A------T----AT----A-CA----AC--ATT---T--T--CAATGCAT
gi|132747 : aaCAGTAAA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132749 : aaCAGAACA--GATCA----GAA-CA-----GA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-CTT----GT--AC-AT--A--AAT---A-------CATCGT----C--A------T----A-----A-TA-A-CAT--ATT---TA----CAATACAT
gi|132752 : aaAAAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT----AA--GG-AT-----TAC---AG---C-TCATCGT----C--A------T----AC----ATAT-A-TAC--AA-----AAT--CAATACAT
gi|132716 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTC-T---AT-T-T----C---GA-CTT----TA--GC-AT--------------------------------A------T----AC----A-AA-A-TAC--AAT---TAAT--CAATGCAT
gi|132753 : aaaAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT----AA--GC-AT-----TAC---AG---C-TCATCGT----C--A------T----AC----ATAT-A-TGC--AA-----AAC--CAAAACAT
gi|132779 : atAAAACA--GAACA----GAAACA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-A-A----AA--GC-AT--A--TAC---AG---C-TGACCTT----C--A------T----GA----G-TA-A-TAC--AAA---AAAT--CAATGCAT
gi|132755 : AGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT----A----T-AC--A--TAC---AGTATC-TCATCATGA--C--A------T----AT----A-
gi|132754 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GT-GT--A--TAC---AG---C-TC--CA-----G--A------T----AC----A-AA-A------AA-----AAT--CAATACATcatatatacatattcatta
gi|132756 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-GTT----AA--GC-GT--T--TAC---AG---C-T--TCA-----A--A------T----AC----A-AA-A--AA--AAT---TAAT--ACATGCGT
gi|132783 : atAGAACA--GAACA----AAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-CTT----AA--AT-AC--A--TA----AA---T-ACATCGT----C--A------T----A
gi|132758 : AGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---AG---C-TC--CA-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCATataacatatttaa
gi|132780 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--TC-GT--A--TAC---AG---C-T--TCA-----A--A------T----AT----A-AA-A------AA-----AAT--CAATACAT
gi|132762 : AGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GC-TTT--------GC-AC--A--TA----AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----A-A----CAC--AAT---
gi|132759 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TATTT-C---AG-T-T----G---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---AG---C-TC-TAA--------A------C----AC----A-A-----AC--A------AAT--CAATGCATacatataat
gi|132763 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---TG---C-TC--C-T----T--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132781 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-C----CA--GA-CTT----GT--AC-ATA-A--TAT---A-------CATCGT----C--A------T----AA----A-AACA-TAC--A
gi|132765 : AGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TATTT-C---AA-T-T----G---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TGC---AG---C-TC-TAA--------A------C----AC----A-AA-A-------------AAT--CAATGCAT
gi|132782 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---TG---C-TC--CA-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132771 : AGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---TG---C-TC--CA-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132770 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---TG---C-TC--CA-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132769 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---TG---C-TC--CA-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132768 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---TG---C-TC--CA-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132767 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---TG---C-TC--CA-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132766 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---TG---C-TC--CA-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132772 : atAGAACA--TA-TA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---TG---C-TC--CA-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132775 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--AC-GT--A--TAC---TG---C-TCA--A-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132774 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--AC-GT--A--TAC---TG---C-TCA--A-----A--A------T----AC----A-AA--------AAT-----AT--CAAAGCAT
gi|132761 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-CATTT-C---AA-T-C----G---GA-TTT----AA--GC-AT--A--TAA---AG---C-TC-TAA--------A------C----AC----A-AA-A------AA-----AAT--CAATGCAT
gi|132784 : atGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTA-T---AT-T-C----C---GA-CTT----AA--GC-AT--A--TAC---AG---C-TCATCAT----C--A------T----AT----A-AA-G-TAC--AAT---TAAT--CAATGCAT
gi|132785 : GAACA--TA-CA----GAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-AT--A--TAC---AT---C-TC--CA-----G--A------T----AC----A-AA----AC--AAT------T--CAATACAT
gi|132786 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA--ATTT-T---AT-T-CAATAT---AA-CTT----GA--AC-AT--A--TAC---AG---G-TCATCGT----T--A------TTTACAC----A-A-----AC--AAT------C--CAATGCAT
gi|132787 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT--------GC-AC--A--CA----AG---T-ACATCAT----T--A------T----AC----A-A----TAC--A
gi|132788 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA--AGTT-T---AT-T----------GA-CTT----AA--ACTGT--A--TAC---AG---T-TTGTCATAA--G--A------T----AC----A-AA---TAC--AAT---TTAC----ATGCA
gi|132736 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT----AA--AC--T--A--TAC---AG---T-TTCTCGC----CT-A------TGTA-AC----A-AA-A-T-C--AAT---T-AT--CAA
gi|132789 : aatgGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TGTTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AC----T-AT-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132790 : AATA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT----AA--GC-AT-----TAC---AG---C-TCATCGT----C--A------T----AC----A-TA---TAT--AAA---CAAT--CAAAACAT
gi|132791 : AACA--GAACA----AAG-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT----AA--GC-AT-----TAC---GG---C-TCATCGT----C--A------C----AC----ATAT-A-TAC--AA-----AGT--CAATACAT
gi|132792 : AACA--GAACA----GAA-GA-----GA--ATTT-T---AT-T-T--------AA-CTT----AA--GC-AT-----TAC---AG---C-TAATCGT----C--A------T----AC----ATAT-A-TGC--AA-----AAT--CAATACAT
gi|132793 : AAAA--GATCA----GAA-CA-----TAATATTT-G---ATAT-T----C---GG-CTT----AATTAC-AT--A--TAC---AG---G-ACATCCT----C--A------T----AC----A-AA-A-TAC--AAA---AAAT--CCAT
gi|132744 : AACA--GAACA----GAA-CA-----GA-TTTTT-TTTAAT-T-T----TCA-GA-CTT----GT--GC--T--T--TAT---AG---C-TCATCGT----C--A------T----A------------TAC--AAT---CATTTCCAATGCAT
gi|132794 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AC-T----------AA-ATT----AA--GC-AT-----TAC---AA---C-TCATCGT----C--A------T----AC----ATAT-A-TGC--AA-----AAT--CAATACAT
gi|132795 : ATA--AAGCA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-TCT----T---GA-TTT----AA--GC-AT--ATGTGC---AG---C-TCGCCAT----C--A------T----GC----A-AA-A-TACAAAAC---AAAG--CAATGTAT
gi|132796 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATC------AT---------------------------C-AT--A---AC---AG---C-TCACCAT----C--A------T----AC----A-GA-A-CAC--AAT---TAAT--CAATGCAT
gi|132797 : ATA--GAACA----GAA-CA-----TA-AATTT-T---A--A-T----A---AA-CTT----AA--AC-AT--A---AC---AG---C-TCATGGT----C--A------T----AC----ATAT-A-TAC--AA-----AAT--CAATACAT
gi|132799 : ATA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT----AA--AC--T--A--TAC---AG---T-TTCTCGT----C---------T----AT----G-AA-A-CAC--AAT---TTAT--AAATG
gi|132798 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT-----------GT--A--CAA---AG---T-ACATCAT----C--A------T----AA----T-AA-A-TAC--AATATACAAT--CAAT
gi|132800 : CA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTA----AA--GC-AT--A--TAC---AG---C-TCATCAC----A--A------T----AC----A-AA-A-TAG--AAT---TAAT--CAATACAT
gi|132801 : A--GAACATATGGAA-CA-----TA-TACTT-T---GT-T-T----C---GA-TTT----AA--GC-AT--A--TAC---AG---C-T--TCA-----A--A------T----AC----A-AA-A------AA-----AAG--CAATACAT
gi|132713 : AACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-TAT----AA--GT-AT--A--TAC---AG---C-TCATCAC----C--A------T----GC----A-AC-A-TAC--AAT---TAAT--CAATGCAT
gi|132760 : aacagaacatattttttttACA----AAA-CA-----TA-T--TT-A---AT-T-T----C---GA-TTT----AA--G--GT--A--TAC---AA---C-ACATCAT----C--A------T----AC----A-AA-A-------------AAT--CAATGCAT
gi|132802 : atagaaaatATA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---TA-TTT----AA--GC-GT--A--TAC---AG---C-T--TCA-----A--A------T----AC----A-AA----AA--AA-----AAT--CAATACAT
gi|132717 : A-----TA-TATTTAT---AT-TAT----C---GA-CTT----AA--GC-AT--A--TAC---AG---C-TCATCAT----C--A------T----AC----A-CA-A-TAC--AA----AAAT--CAATgcgt
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1111111 22222222222
lowQualScore : 00 1 0000 0 11111 0 0 000 0 4444444444 0 888888 22 0 0 333333 111 0 222 3 11 1111111 222222222222 111 00 555 111 0 33333 11 1 99999999999 000 0 0
lowQualScore : .. . .... . ..... . . ... . .......... . ...... .. . . ...... ... . ... . .. ....... ............ ... .. ... ... . ..... .. . ........... ... . .
lowQualScore : 66 9 9999 4 99999 4 4 777 4 2222222222 4 000000 99 4 4 333333 555 4 444 7 77 3333333 777777777777 555 66 777 444 9 99999 55 4 88888888888 999 5 5
consensus : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-A---T----A--AT---C-A-ATGCAT
Reference ( family-320 ) : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-A---T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132708 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATACA
gi|132709 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--CT---C-A-ATGCAT
gi|132710 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---TT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132711 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--G---AG---TT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--CAA-A---A-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132712 : aaCAGAACA--GAACA----GGA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-
gi|132713 : aaAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-TAT--AA--GT-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAC--C-------A------------T---G--C-A-A---C-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132714 : aacagaacatattttttttCAGAACA--GAACA----GGA-CA-----TA-CATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132715 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------AATCTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---T--G-T-A---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132716 : aaAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTC-T---AT-T-T----C---GA-CTT--TA--GC-AT-------------------------------------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132717 : aaaA-----TA-TATTTAT---AT-TAT----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-C---A-A----TAC--A-A---A----A--AT---C-A-AT
gi|132718 : aacaaaggagatcatatactaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132719 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132720 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132721 : aaCAGAATA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132722 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TGT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132723 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------A---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132724 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132725 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132726 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132727 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132728 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132729 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CAGAAGGTA-TATTT-T---A---------C---AG-TTT------GC-AT-GT-A--A---AG---TT-C--ATCAT--G-------A------------T---A--C-A-T---A-A----TACAAA-A---A----A--AT---C-A-ATACAT
gi|132730 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--TTCGT--CT------A------------TGTAA--C-A-A---A-AT---TACA-A-A---T----A--AA---C-A-
gi|132731 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TT-------G--GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132732 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132733 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--A-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132734 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAT--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132735 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--CGCGT--CT------A------------T---A--T-A-A---A-AAAATTAC--A-A---
gi|132736 : aaGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--CTCGC--CT------A------------TGTAA--C-A-A---A-A----T-C--A-A---T----T--AT---C-A-A
gi|132737 : aatgCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-AATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----CAT--ACA---T----A--AT---A-A-A
gi|132738 : aaCATAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T--------GA-CTT--A-------T-AC-A--T---AG---TA-C--ATCGT--C-------A------------T---A--
gi|132739 : aaCAGAACATAGAACA----GAC-TA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AT--AC----AT-A--C---AGTATTT-C--ATCATGAC-------A------------T---A--T-A-actatacattttttaacaaatatatttagatca
gi|132740 : aaCATAACA--GAACA----AAA-C------TG-AATTT-T---AT-T-TAATAT---AA-CTT--GA--AC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--T-------A------------T---
gi|132741 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TAGTT-T---AT-T-T--------GA-CTG--A-------T-AC-A--T---AG---TA-C--ATTGT--C-------A------------T---A--
gi|132742 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CAGAAT-TG-TGTTT-T---AT-T-T----TTTAAA-ATT--GA--GC-A--AC-A--T---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--T-A-C---A-A-----AC--A-
gi|132743 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-A---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--CATAATATA------------T---A--C-A-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-ATttttcaaaacat
gi|132744 : aaAACA--GAACA----GAA-CA-----GA-TTTTT-TTTAAT-T-T----TCA-GA-CTT--GT--GC-TT--T-A--T---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T----------------A----TAC--A-A---T----C--ATTTCC-A-ATGCAT
gi|132745 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----GA-AATTT-T---GT-T-T----A---GA-CTG--GA--GC-AT--C-A--T---AG---TT-C--ATCGT--C-------G------------T---CGTC-T-A---A-A-----AC--A-A---T----AC-AT---C-A-GTG
gi|132746 : aaCAGAATA--CAACA----GAA-AT-----TA-TATTT-T------T-T----A---GA-CTTTCAA--GA-GC-ATCA--T---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T----------------A----TAC--A-A---C----ATTTT---C-A-ATGCAT
gi|132747 : aaCAGTAAA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132748 : aaCAGAACA--AAACA----GAA-CA-----GA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-TTT--GT--GC-AT-AA-A--T---A-------C--ATCGT--C-------ATAATAACCTATTT---A--C-A-A---C-A----TAC--A-A---T-------AT---C-A-
gi|132749 : agCAGAACA--GATCA----GAA-CA-----GA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-CTT---------GT-AC-A--T---AA---ATAC--ATCGT--C-------A------------T---A----A-T---A-A----CAT--A-T---T----T--A----C-A-ATACAT
gi|132750 : aaCAAAACA--GAACA----AAA-CA-----TA-TATTT-T---TT-T-T----C---GA-CTT--GA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-ACT-A-A----TA---A-T---T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132751 : aCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-GTA---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132752 : aAAAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GG-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132753 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AC---C-A-AAACAT
gi|132754 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GT-GT-AT-A--C---AG---CT-C---------CAG-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132755 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AT--AC----AT-A--C---AGTATCT-C--ATCATGAC-------A------------T---A--T-A-C---ATA----TAT--ACA---T----A--TT---C-A-
gi|132756 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-GTT--AA--GC-GT-TT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---T-A-ATACATtta
gi|132757 : atCAGAACA--GAACA----GAA-CG-----TA-TATTT-T---AT-T-T--------GA-CTT--A-------T-AC-A--T---AG---TA-C--ATCGT--C-------A------------T---A--gcgt
gi|132758 : aAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCATtctataca
gi|132759 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TATTT-C---AG-T-T----G---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C---------T-------A------------A---A--C-A-C---A-A-----AC--A----------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132760 : atACA----AAA-CA-----TA-T--TT-A---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--G--GT-AT-A--C---AA---CA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A--------------------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132761 : atagaaaatAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-CATTT-C---AA-T-C----G---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-A--A---AG---CT-CTAA--------------A------------C---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132762 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GC-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-ACACA-A----TAC--ATA---T----A--AT---
gi|132763 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C----C-T--T-------A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132764 : atCAGGACA--GAACA----GAA-CA-----T--TCTTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AA--GC-AT--T-A--CAAAAG---CT-T--TTCAC--C-------A------------T----------A---A-A----TAA--C-A---T----A--TT---CAA-ATACAT
gi|132765 : aAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TATTT-C---AA-T-T----G---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-G--C---AG---CT-CTAA--------------A------------C---A--C-A-A---A-A--------------------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132766 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132767 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132768 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132769 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132770 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132771 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132772 : atAGAACA--TA-TA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132773 : atCAAAAAA--GATCA----GAA-CA-----GA-AATTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--GA--GC-AT--C-A--T---AG---CT-T--ATCGT--C-------A------------T---A--T-A-G---A-A-----AC--A-
gi|132774 : aAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--AC-GT-AT-A--C---TG---CT---------------------------------------C-A-A---A-A----TAC--A-A---A----AATAT---C-A-AAGCATttttttatgcat
gi|132775 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--AC-GT-AT-A--C---TG---CT---------------------------------------C-A-A---A-A----TAC--A-A---A----AATAT---C-A-AAGCAT
gi|132776 : atCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132777 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---AT-T-T----C---TA-CTTT-AA--GC-AA-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-A
gi|132778 : CAGAATA--GAACA----GA-------------ATTT-T----T-T-T----A---GA-CTT--GG--GC-AT--T-A--T---AG---CT-T--GTCGT--C-------A------------T---A--T-A-C---A-A-----AC----A---T----T--TT---C-A-ATGCAT
gi|132779 : AAAACA--GAACA----GAAACA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-A-A--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-G--ACCTT--C-------A------------T---G--A-G-T---A-A----TACA-A-A---A----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132780 : AGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--TC-GT-AT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--T-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132781 : AGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-C----CA--GA-CTT--GT--AC-ATAAT-A--T---A-------C--ATCGT--C-------A------------T---A--A-A-A---ACA----TAC--A-
gi|132782 : AGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132783 : AGAACA--GAACA----AAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-CTT--AA--AT-AC-AT-A------AA---TA-C--ATCGT--C-------A------------T---A--
gi|132784 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTA-T---AT-T-C----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--T-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCATataacatatttaa
gi|132785 : GAACA--TA-CA----GAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AT---CT-C---------CAG-----A------------T---A--C-A-A---A-------AC--A-A---T--------T---C-A-ATACAT
gi|132786 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA--ATTT-T---AT-T-CAATAT---AA-CTT--GA--AC-AT-AT-A--C---AG---GT-C--ATCGT--T-------ATT----------T---A--C-A-C---A-A-----AC--A-A---T--------C---C-A-ATGCAT
gi|132787 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AC-A------AG---TA-C--ATCAT--T-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132788 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA--AGTT-T---AT-T----------GA-CTT--AA--ACTGT-AT-A--C---AG---TT-T--GTCATAAG-------A------------T---A--C---A---A-A----TAC--A-A---T--------T---T-ACATGCA
gi|132789 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TGTTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132790 : AATA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TA---A-A---C----A--AT---C-A-AAACAT
gi|132791 : AACA--GAACA----AAG-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---GG---CT-C--ATCGT--C-------A------------C---A--C-ATA---T-A----TAC--A-A--------A--GT---C-A-ATACAT
gi|132792 : AACA--GAACA----GAA-GA-----GA--ATTT-T---AT-T-T--------AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-A--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132793 : AAAA--GATCA----GAA-CA-----TAATATTT-G---ATAT-T----C---GG-CTT--AATTAC-AT-AT-A--C---AG---GA-C--ATCCT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-A--------A--A------A-ATCCAT
gi|132794 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AC-T----------AA-ATT--AA--GC-AT--T-A--C---AA---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132795 : ATA--AAGCA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-TCT----T---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-GTGC---AG---CT-C--GCCAT--C-------A------------T---G--C-A-A---A-A----TAC--A-AAACA----A--AG---C-A-ATGTAT
gi|132796 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATC------AT-------------------------C-AT-A--A--C---AG---CT-C--ACCAT--C-------A------------T---A--C-A-G---A-A----CAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132797 : ATA--GAACA----GAA-CA-----TA-AATTT-T---A--A-T----A---AA-CTT--AA--AC-AT-A--A--C---AG---CT-C--ATGGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132798 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--A-T-A---A-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132799 : ATA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--CTCGT--C--------------------T---A--T-G-A---A-A----CAC--A-A---T----
gi|132800 : CA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTA--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAC--A-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAG--A-AT--T----A--AT---C-A-ATACATttataaatg
gi|132801 : A--GAACATATGGAA-CA-----TA-TACTT-T---GT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AG---C-A-ATACAT
gi|132802 : ATA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---TA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A---A----A--AT---C-A-ATACAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1111111 22222222222
lowQualScore : 00 1 0000 0 11111 0 0 000 0 4444444444 0 888888 22 0 0 333333 111 0 222 3 11 1111111 222222222222 111 00 555 111 0 33333 11 1 99999999999 000 0 0
lowQualScore : .. . .... . ..... . . ... . .......... . ...... .. . . ...... ... . ... . .. ....... ............ ... .. ... ... . ..... .. . ........... ... . .
lowQualScore : 66 9 9999 4 99999 4 4 777 4 2222222222 4 000000 99 4 4 333333 555 4 444 7 77 3333333 777777777777 555 66 777 444 9 99999 55 4 88888888888 999 5 5
consensus : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-A---T----A--AT---C-A-ATGCAT
Reference ( family-320 ) : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-A---T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132708 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATACA
gi|132709 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--CT---C-A-ATGCAT
gi|132710 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---TT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132711 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--G---AG---TT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--CAA-A---A-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132712 : aaCAGAACA--GAACA----GGA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-
gi|132713 : aaAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-TAT--AA--GT-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAC--C-------A------------T---G--C-A-A---C-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132714 : aacagaacatattttttttCAGAACA--GAACA----GGA-CA-----TA-CATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132715 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------AATCTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---T--G-T-A---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132716 : aaAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTC-T---AT-T-T----C---GA-CTT--TA--GC-AT-------------------------------------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132717 : aaaA-----TA-TATTTAT---AT-TAT----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-C---A-A----TAC--A-A---A----A--AT---C-A-AT
gi|132718 : aacaaaggagatcatatactaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132719 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132720 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132721 : aaCAGAATA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132722 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TGT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132723 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------A---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132724 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132725 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132726 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132727 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132728 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132729 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CAGAAGGTA-TATTT-T---A---------C---AG-TTT------GC-AT-GT-A--A---AG---TT-C--ATCAT--G-------A------------T---A--C-A-T---A-A----TACAAA-A---A----A--AT---C-A-ATACAT
gi|132730 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--TTCGT--CT------A------------TGTAA--C-A-A---A-AT---TACA-A-A---T----A--AA---C-A-
gi|132731 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TT-------G--GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132732 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132733 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--A-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132734 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAT--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132735 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--CGCGT--CT------A------------T---A--T-A-A---A-AAAATTAC--A-A---
gi|132736 : aaGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--CTCGC--CT------A------------TGTAA--C-A-A---A-A----T-C--A-A---T----T--AT---C-A-A
gi|132737 : aatgCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-AATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----CAT--ACA---T----A--AT---A-A-A
gi|132738 : aaCATAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T--------GA-CTT--A-------T-AC-A--T---AG---TA-C--ATCGT--C-------A------------T---A--
gi|132739 : aaCAGAACATAGAACA----GAC-TA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AT--AC----AT-A--C---AGTATTT-C--ATCATGAC-------A------------T---A--T-A-actatacattttttaacaaatatatttagatca
gi|132740 : aaCATAACA--GAACA----AAA-C------TG-AATTT-T---AT-T-TAATAT---AA-CTT--GA--AC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--T-------A------------T---
gi|132741 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TAGTT-T---AT-T-T--------GA-CTG--A-------T-AC-A--T---AG---TA-C--ATTGT--C-------A------------T---A--
gi|132742 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CAGAAT-TG-TGTTT-T---AT-T-T----TTTAAA-ATT--GA--GC-A--AC-A--T---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--T-A-C---A-A-----AC--A-
gi|132743 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-A---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--CATAATATA------------T---A--C-A-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-ATttttcaaaacat
gi|132744 : aaAACA--GAACA----GAA-CA-----GA-TTTTT-TTTAAT-T-T----TCA-GA-CTT--GT--GC-TT--T-A--T---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T----------------A----TAC--A-A---T----C--ATTTCC-A-ATGCAT
gi|132745 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----GA-AATTT-T---GT-T-T----A---GA-CTG--GA--GC-AT--C-A--T---AG---TT-C--ATCGT--C-------G------------T---CGTC-T-A---A-A-----AC--A-A---T----AC-AT---C-A-GTG
gi|132746 : aaCAGAATA--CAACA----GAA-AT-----TA-TATTT-T------T-T----A---GA-CTTTCAA--GA-GC-ATCA--T---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T----------------A----TAC--A-A---C----ATTTT---C-A-ATGCAT
gi|132747 : aaCAGTAAA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132748 : aaCAGAACA--AAACA----GAA-CA-----GA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-TTT--GT--GC-AT-AA-A--T---A-------C--ATCGT--C-------ATAATAACCTATTT---A--C-A-A---C-A----TAC--A-A---T-------AT---C-A-
gi|132749 : agCAGAACA--GATCA----GAA-CA-----GA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-CTT---------GT-AC-A--T---AA---ATAC--ATCGT--C-------A------------T---A----A-T---A-A----CAT--A-T---T----T--A----C-A-ATACAT
gi|132750 : aaCAAAACA--GAACA----AAA-CA-----TA-TATTT-T---TT-T-T----C---GA-CTT--GA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-ACT-A-A----TA---A-T---T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132751 : aCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-GTA---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132752 : aAAAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GG-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132753 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AC---C-A-AAACAT
gi|132754 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GT-GT-AT-A--C---AG---CT-C---------CAG-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132755 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AT--AC----AT-A--C---AGTATCT-C--ATCATGAC-------A------------T---A--T-A-C---ATA----TAT--ACA---T----A--TT---C-A-
gi|132756 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-GTT--AA--GC-GT-TT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---T-A-ATACATtta
gi|132757 : atCAGAACA--GAACA----GAA-CG-----TA-TATTT-T---AT-T-T--------GA-CTT--A-------T-AC-A--T---AG---TA-C--ATCGT--C-------A------------T---A--gcgt
gi|132758 : aAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCATtctataca
gi|132759 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TATTT-C---AG-T-T----G---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C---------T-------A------------A---A--C-A-C---A-A-----AC--A----------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132760 : atACA----AAA-CA-----TA-T--TT-A---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--G--GT-AT-A--C---AA---CA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A--------------------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132761 : atagaaaatAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-CATTT-C---AA-T-C----G---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-A--A---AG---CT-CTAA--------------A------------C---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132762 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GC-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-ACACA-A----TAC--ATA---T----A--AT---
gi|132763 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C----C-T--T-------A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132764 : atCAGGACA--GAACA----GAA-CA-----T--TCTTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AA--GC-AT--T-A--CAAAAG---CT-T--TTCAC--C-------A------------T----------A---A-A----TAA--C-A---T----A--TT---CAA-ATACAT
gi|132765 : aAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TATTT-C---AA-T-T----G---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-G--C---AG---CT-CTAA--------------A------------C---A--C-A-A---A-A--------------------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132766 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132767 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132768 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132769 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132770 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132771 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132772 : atAGAACA--TA-TA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132773 : atCAAAAAA--GATCA----GAA-CA-----GA-AATTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--GA--GC-AT--C-A--T---AG---CT-T--ATCGT--C-------A------------T---A--T-A-G---A-A-----AC--A-
gi|132774 : aAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--AC-GT-AT-A--C---TG---CT---------------------------------------C-A-A---A-A----TAC--A-A---A----AATAT---C-A-AAGCATttttttatgcat
gi|132775 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--AC-GT-AT-A--C---TG---CT---------------------------------------C-A-A---A-A----TAC--A-A---A----AATAT---C-A-AAGCAT
gi|132776 : atCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132777 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---AT-T-T----C---TA-CTTT-AA--GC-AA-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-A
gi|132778 : CAGAATA--GAACA----GA-------------ATTT-T----T-T-T----A---GA-CTT--GG--GC-AT--T-A--T---AG---CT-T--GTCGT--C-------A------------T---A--T-A-C---A-A-----AC----A---T----T--TT---C-A-ATGCAT
gi|132779 : AAAACA--GAACA----GAAACA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-A-A--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-G--ACCTT--C-------A------------T---G--A-G-T---A-A----TACA-A-A---A----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132780 : AGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--TC-GT-AT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--T-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132781 : AGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-C----CA--GA-CTT--GT--AC-ATAAT-A--T---A-------C--ATCGT--C-------A------------T---A--A-A-A---ACA----TAC--A-
gi|132782 : AGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132783 : AGAACA--GAACA----AAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-CTT--AA--AT-AC-AT-A------AA---TA-C--ATCGT--C-------A------------T---A--
gi|132784 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTA-T---AT-T-C----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--T-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCATataacatatttaa
gi|132785 : GAACA--TA-CA----GAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AT---CT-C---------CAG-----A------------T---A--C-A-A---A-------AC--A-A---T--------T---C-A-ATACAT
gi|132786 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA--ATTT-T---AT-T-CAATAT---AA-CTT--GA--AC-AT-AT-A--C---AG---GT-C--ATCGT--T-------ATT----------T---A--C-A-C---A-A-----AC--A-A---T--------C---C-A-ATGCAT
gi|132787 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AC-A------AG---TA-C--ATCAT--T-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132788 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA--AGTT-T---AT-T----------GA-CTT--AA--ACTGT-AT-A--C---AG---TT-T--GTCATAAG-------A------------T---A--C---A---A-A----TAC--A-A---T--------T---T-ACATGCA
gi|132789 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TGTTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132790 : AATA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TA---A-A---C----A--AT---C-A-AAACAT
gi|132791 : AACA--GAACA----AAG-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---GG---CT-C--ATCGT--C-------A------------C---A--C-ATA---T-A----TAC--A-A--------A--GT---C-A-ATACAT
gi|132792 : AACA--GAACA----GAA-GA-----GA--ATTT-T---AT-T-T--------AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-A--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132793 : AAAA--GATCA----GAA-CA-----TAATATTT-G---ATAT-T----C---GG-CTT--AATTAC-AT-AT-A--C---AG---GA-C--ATCCT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-A--------A--A------A-ATCCAT
gi|132794 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AC-T----------AA-ATT--AA--GC-AT--T-A--C---AA---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132795 : ATA--AAGCA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-TCT----T---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-GTGC---AG---CT-C--GCCAT--C-------A------------T---G--C-A-A---A-A----TAC--A-AAACA----A--AG---C-A-ATGTAT
gi|132796 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATC------AT-------------------------C-AT-A--A--C---AG---CT-C--ACCAT--C-------A------------T---A--C-A-G---A-A----CAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132797 : ATA--GAACA----GAA-CA-----TA-AATTT-T---A--A-T----A---AA-CTT--AA--AC-AT-A--A--C---AG---CT-C--ATGGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132798 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--A-T-A---A-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132799 : ATA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--CTCGT--C--------------------T---A--T-G-A---A-A----CAC--A-A---T----
gi|132800 : CA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTA--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAC--A-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAG--A-AT--T----A--AT---C-A-ATACATttataaatg
gi|132801 : A--GAACATATGGAA-CA-----TA-TACTT-T---GT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AG---C-A-ATACAT
gi|132802 : ATA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---TA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A---A----A--AT---C-A-ATACAT
blockSeqs : A GAAGG TAATAT TCAA TG CAAA TAT TAA A GA ATAATAT TAATAACCTATT GTA AA CAC AAATT AA C TATACA
blockSeqs : A GAAT CAATAT AATT A TGC TAT TAA A GA AG TT GTA AT CT TT A C TATACA
blockSeqs : A . TTTTA TAA G C . A A AA AA . . GT . T A T TATACA
blockSeqs : A . TTCA AA A A . A A . AA . . AT . T . . TATACA
blockSeqs : A . ATC AA A G . A A . AA . . AT . T . . TATACA
blockSeqs : A . TCA AA A C . A G . AA . . AT . T . . TATACA
blockSeqs : A . TCA AA A C . A G . AA . . AT . T . . TATACA
blockSeqs : A . CCA AA A C . A A . AA . . AT . T . . TATACA
blockSeqs : A . TCA AA A C . A A . AA . . AT . T . . TATACA
blockSeqs : A . CTT TA A C . A A . AA . . AT . T . . TATACA
blockSeqs : A . TT AA A A . A A . AA . . A . T . . TATACA
blockSeqs : A . AG AA A A . A A . AA . . T . T . . TATACA
blockSeqs : A . TC AA A A . A A . AA . . A . T . . TATACA
blockSeqs : A . TT AA A A . A A . AG . . A . T . . TATACA
blockSeqs : A . TC AT A A . A A . AA . . T . T . . AACAA
blockSeqs : A . TA GA A A . A A . AA . . A . T . . CATT
blockSeqs : A . TC GA G C . A A . T . . A . T . . AAAT
blockSeqs : A . AG GT G A . A A . T . . T . T . . AAAT
blockSeqs : A . AG GA G A . A A . T . . T . T . . TTA
blockSeqs : A . AG GT G A . A A . . . . T . T . . TTA
blockSeqs : A . AG GA G A . A G . . . . T . T . . TTA
blockSeqs : A . AG AA A C . A A . . . . T . T . . TTA
blockSeqs : A . CA AA G C . T A . . . . A . T . . TAC
blockSeqs : A . AG AA G T . A A . . . . A . T . . TTA
blockSeqs : A . AG AA G C . A A . . . . T . T . . TTA
blockSeqs : A . AG AT G C . A G . . . . T . T . . TTA
blockSeqs : A . AG AA A T . A G . . . . T . T . . TTA
blockSeqs : A . CA AA A T . C A . . . . T . C . . TTA
blockSeqs : A . CA AA A A . C G . . . . A . T . . AA
blockSeqs : A . TT AA G T . A A . . . . A . T . . AA
blockSeqs : A . AG AA T T . A G . . . . T . T . . TA
blockSeqs : A . TA AA A T . A G . . . . A . T . . TT
blockSeqs : A . TA AA G A . A G . . . . A . T . . TA
blockSeqs : A . AG AA G T . A A . . . . A . C . . TC
blockSeqs : A . TC AA A T . A G . . . . T . T . . TT
blockSeqs : A . TA AA G C . A G . . . . T . T . . TA
blockSeqs : A . TA AA A C . A G . . . . A . T . . TA
blockSeqs : A . TA AA A C . A A . . . . A . T . . TA
blockSeqs : A . TC AA A C . A G . . . . A . T . . TA
blockSeqs : T . TT AA A C . A G . . . . A . T . . TT
blockSeqs : A . TC AA G C . A A . . . . A . T . . AA
blockSeqs : A . TC GA G C . A G . . . . A . T . . CA
blockSeqs : A . TG AA G T . A G . . . . A . T . . AA
blockSeqs : A . TC AA G C . A G . . . . A . T . . A
blockSeqs : A . CG AA G C . A A . . . . A . T . . A
blockSeqs : A . TC GG A C . A G . . . . A . T . . T
blockSeqs : A . TT AA A A . A A . . . . A . T . . A
blockSeqs : A . TG AA G C . A A . . . . A . T . . A
blockSeqs : A . TC GT A C . A A . . . . A . T . . A
blockSeqs : T . TC AA G C . A G . . . . A . T . . A
blockSeqs : A . TC AA G C . T A . . . . A . T . . A
blockSeqs : A . TC AA G C . A A . . . . A . T . . T
blockSeqs : A . TC AA G C . A G . . . . A . T . . A
blockSeqs : A . TC GA G C . A T . . . . A . T . . A
blockSeqs : A . TC AA G C . G G . . . . A . T . . A
blockSeqs : A . CA AA G C . A G . . . . A . T . . T
blockSeqs : A . TC AA G T . A A . . . . A . T . . A
blockSeqs : A . TC AA A C . A G . . . . A . C . . T
blockSeqs : A . TC AA G C . A A . . . . A . T . . T
blockSeqs : A . TC AA G C . A A . . . . A . T . . T
blockSeqs : A . TA AA A C . A A . . . . A . C . . T
blockSeqs : A . TC AA A T . G G . . . . A . T . . T
blockSeqs : A . TC AA A C . A G . . . . G . . . . T
blockSeqs : A . TC AA A C . A G . . . . A . . . . T
blockSeqs : T . CC AA G T . A C . . . . A . . . . A
blockSeqs : A . TC A A C . A G . . . . A . . . . T
blockSeqs : G . AG A G C . A A . . . . A . . . . T
blockSeqs : A . TA A A C . A A . . . . A . . . . T
blockSeqs : A . TA . A C . G G . . . . A . . . . T
blockSeqs : A . TC . A C . A A . . . . T . . . . A
blockSeqs : A . TA . A A . A G . . . . A . . . . A
blockSeqs : A . AG . A C . A A . . . . A . . . . A
blockSeqs : A . CA . G C . C . . . . . A . . . . A
blockSeqs : A . TC . A C . A . . . . . T . . . . A
blockSeqs : . . TC . A C . . . . . . . G . . . . A
blockSeqs : . . TC . A C . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . C . A C . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . T . A C . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . T . A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : TA*********
originalCons : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-A---T----A--AT---C-A-ATGCAT
finalCons : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-ATA---------AT---C-A-ATGCAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111 1111111 22222222222
lowQualScore : 00 1 0000 0 11111 0 0 000 0 4444444444 0 888888 22 0 0 333333 111 0 222 3 11 1111111 222222222222 111 00 555 111 0 33333 11 1 99999999999 000 0 0
lowQualScore : .. . .... . ..... . . ... . .......... . ...... .. . . ...... ... . ... . .. ....... ............ ... .. ... ... . ..... .. . ........... ... . .
lowQualScore : 66 9 9999 4 99999 4 4 777 4 2222222222 4 000000 99 4 4 333333 555 4 444 7 77 3333333 777777777777 555 66 777 444 9 99999 55 4 88888888888 999 5 5
consensus : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-A---T----A--AT---C-A-ATGCAT
Reference ( family-320 ) : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-A---T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132708 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATACA
gi|132709 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--CT---C-A-ATGCAT
gi|132710 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---TT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132711 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--G---AG---TT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--CAA-A---A-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132712 : aaCAGAACA--GAACA----GGA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-
gi|132713 : aaAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-TAT--AA--GT-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAC--C-------A------------T---G--C-A-A---C-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132714 : aacagaacatattttttttCAGAACA--GAACA----GGA-CA-----TA-CATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132715 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------AATCTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---T--G-T-A---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132716 : aaAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTC-T---AT-T-T----C---GA-CTT--TA--GC-AT-------------------------------------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132717 : aaaA-----TA-TATTTAT---AT-TAT----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-C---A-A----TAC--A-A---A----A--AT---C-A-AT
gi|132718 : aacaaaggagatcatatactaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132719 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132720 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132721 : aaCAGAATA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132722 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TGT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132723 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------A---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132724 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132725 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132726 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132727 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132728 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132729 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CAGAAGGTA-TATTT-T---A---------C---AG-TTT------GC-AT-GT-A--A---AG---TT-C--ATCAT--G-------A------------T---A--C-A-T---A-A----TACAAA-A---A----A--AT---C-A-ATACAT
gi|132730 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--TTCGT--CT------A------------TGTAA--C-A-A---A-AT---TACA-A-A---T----A--AA---C-A-
gi|132731 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TT-------G--GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132732 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132733 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--A-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132734 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAT--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132735 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--CGCGT--CT------A------------T---A--T-A-A---A-AAAATTAC--A-A---
gi|132736 : aaGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--CTCGC--CT------A------------TGTAA--C-A-A---A-A----T-C--A-A---T----T--AT---C-A-A
gi|132737 : aatgCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-AATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----CAT--ACA---T----A--AT---A-A-A
gi|132738 : aaCATAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T--------GA-CTT--A-------T-AC-A--T---AG---TA-C--ATCGT--C-------A------------T---A--
gi|132739 : aaCAGAACATAGAACA----GAC-TA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AT--AC----AT-A--C---AGTATTT-C--ATCATGAC-------A------------T---A--T-A-actatacattttttaacaaatatatttagatca
gi|132740 : aaCATAACA--GAACA----AAA-C------TG-AATTT-T---AT-T-TAATAT---AA-CTT--GA--AC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCGT--T-------A------------T---
gi|132741 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TAGTT-T---AT-T-T--------GA-CTG--A-------T-AC-A--T---AG---TA-C--ATTGT--C-------A------------T---A--
gi|132742 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CAGAAT-TG-TGTTT-T---AT-T-T----TTTAAA-ATT--GA--GC-A--AC-A--T---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--T-A-C---A-A-----AC--A-
gi|132743 : aaCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-A---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--CATAATATA------------T---A--C-A-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-ATttttcaaaacat
gi|132744 : aaAACA--GAACA----GAA-CA-----GA-TTTTT-TTTAAT-T-T----TCA-GA-CTT--GT--GC-TT--T-A--T---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T----------------A----TAC--A-A---T----C--ATTTCC-A-ATGCAT
gi|132745 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----GA-AATTT-T---GT-T-T----A---GA-CTG--GA--GC-AT--C-A--T---AG---TT-C--ATCGT--C-------G------------T---CGTC-T-A---A-A-----AC--A-A---T----AC-AT---C-A-GTG
gi|132746 : aaCAGAATA--CAACA----GAA-AT-----TA-TATTT-T------T-T----A---GA-CTTTCAA--GA-GC-ATCA--T---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T----------------A----TAC--A-A---C----ATTTT---C-A-ATGCAT
gi|132747 : aaCAGTAAA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132748 : aaCAGAACA--AAACA----GAA-CA-----GA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-TTT--GT--GC-AT-AA-A--T---A-------C--ATCGT--C-------ATAATAACCTATTT---A--C-A-A---C-A----TAC--A-A---T-------AT---C-A-
gi|132749 : agCAGAACA--GATCA----GAA-CA-----GA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-CTT---------GT-AC-A--T---AA---ATAC--ATCGT--C-------A------------T---A----A-T---A-A----CAT--A-T---T----T--A----C-A-ATACAT
gi|132750 : aaCAAAACA--GAACA----AAA-CA-----TA-TATTT-T---TT-T-T----C---GA-CTT--GA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-ACT-A-A----TA---A-T---T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132751 : aCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-GTA---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132752 : aAAAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GG-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132753 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AC---C-A-AAACAT
gi|132754 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GT-GT-AT-A--C---AG---CT-C---------CAG-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132755 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AT--AC----AT-A--C---AGTATCT-C--ATCATGAC-------A------------T---A--T-A-C---ATA----TAT--ACA---T----A--TT---C-A-
gi|132756 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-GTT--AA--GC-GT-TT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---T-A-ATACATtta
gi|132757 : atCAGAACA--GAACA----GAA-CG-----TA-TATTT-T---AT-T-T--------GA-CTT--A-------T-AC-A--T---AG---TA-C--ATCGT--C-------A------------T---A--gcgt
gi|132758 : aAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCATtctataca
gi|132759 : atAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TATTT-C---AG-T-T----G---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT-C---------T-------A------------A---A--C-A-C---A-A-----AC--A----------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132760 : atACA----AAA-CA-----TA-T--TT-A---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--G--GT-AT-A--C---AA---CA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A--------------------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132761 : atagaaaatAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-CATTT-C---AA-T-C----G---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-A--A---AG---CT-CTAA--------------A------------C---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132762 : atAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GC-TTT------GC-AC-AT-A------AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-ACACA-A----TAC--ATA---T----A--AT---
gi|132763 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C----C-T--T-------A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132764 : atCAGGACA--GAACA----GAA-CA-----T--TCTTT-T---AT-T-T----T---GA-CTT--AA--GC-AT--T-A--CAAAAG---CT-T--TTCAC--C-------A------------T----------A---A-A----TAA--C-A---T----A--TT---CAA-ATACAT
gi|132765 : aAGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TATTT-C---AA-T-T----G---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-G--C---AG---CT-CTAA--------------A------------C---A--C-A-A---A-A--------------------A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132766 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132767 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132768 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132769 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132770 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132771 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132772 : atAGAACA--TA-TA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132773 : atCAAAAAA--GATCA----GAA-CA-----GA-AATTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--GA--GC-AT--C-A--T---AG---CT-T--ATCGT--C-------A------------T---A--T-A-G---A-A-----AC--A-
gi|132774 : aAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--AC-GT-AT-A--C---TG---CT---------------------------------------C-A-A---A-A----TAC--A-A---A----AATAT---C-A-AAGCATttttttatgcat
gi|132775 : atAGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--AC-GT-AT-A--C---TG---CT---------------------------------------C-A-A---A-A----TAC--A-A---A----AATAT---C-A-AAGCAT
gi|132776 : atCAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132777 : CAGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-CATTT-T---AT-T-T----C---TA-CTTT-AA--GC-AA-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-A
gi|132778 : CAGAATA--GAACA----GA-------------ATTT-T----T-T-T----A---GA-CTT--GG--GC-AT--T-A--T---AG---CT-T--GTCGT--C-------A------------T---A--T-A-C---A-A-----AC----A---T----T--TT---C-A-ATGCAT
gi|132779 : AAAACA--GAACA----GAAACA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-A-A--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-G--ACCTT--C-------A------------T---G--A-G-T---A-A----TACA-A-A---A----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132780 : AGAACA--TA-CA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--TC-GT-AT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--T-A-A---A-A---------A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132781 : AGAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-C----CA--GA-CTT--GT--AC-ATAAT-A--T---A-------C--ATCGT--C-------A------------T---A--A-A-A---ACA----TAC--A-
gi|132782 : AGAACA--TA-CA----AAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---TG---CT-C---------CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-----------A-A---T-------AT---C-A-AAGCAT
gi|132783 : AGAACA--GAACA----AAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----CA--GA-CTT--AA--AT-AC-AT-A------AA---TA-C--ATCGT--C-------A------------T---A--
gi|132784 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTA-T---AT-T-C----C---GA-CTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAT--C-------A------------T---A--T-A-A---A-G----TAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCATataacatatttaa
gi|132785 : GAACA--TA-CA----GAA-CA-----TG-TACTT-T---AT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AT---CT-C---------CAG-----A------------T---A--C-A-A---A-------AC--A-A---T--------T---C-A-ATACAT
gi|132786 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA--ATTT-T---AT-T-CAATAT---AA-CTT--GA--AC-AT-AT-A--C---AG---GT-C--ATCGT--T-------ATT----------T---A--C-A-C---A-A-----AC--A-A---T--------C---C-A-ATGCAT
gi|132787 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T----------GA-TTT------GC-AC-AC-A------AG---TA-C--ATCAT--T-------A------------T---A--C-------A-A----TAC--A-
gi|132788 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA--AGTT-T---AT-T----------GA-CTT--AA--ACTGT-AT-A--C---AG---TT-T--GTCATAAG-------A------------T---A--C---A---A-A----TAC--A-A---T--------T---T-ACATGCA
gi|132789 : GAACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TGTTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--C-T-A---T-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132790 : AATA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TA---A-A---C----A--AT---C-A-AAACAT
gi|132791 : AACA--GAACA----AAG-CA-----TA-TATTT-T---A--T-T----A---AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---GG---CT-C--ATCGT--C-------A------------C---A--C-ATA---T-A----TAC--A-A--------A--GT---C-A-ATACAT
gi|132792 : AACA--GAACA----GAA-GA-----GA--ATTT-T---AT-T-T--------AA-CTT--AA--GC-AT--T-A--C---AG---CT-A--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132793 : AAAA--GATCA----GAA-CA-----TAATATTT-G---ATAT-T----C---GG-CTT--AATTAC-AT-AT-A--C---AG---GA-C--ATCCT--C-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAC--A-A--------A--A------A-ATCCAT
gi|132794 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AC-T----------AA-ATT--AA--GC-AT--T-A--C---AA---CT-C--ATCGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TGC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132795 : ATA--AAGCA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-TCT----T---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-GTGC---AG---CT-C--GCCAT--C-------A------------T---G--C-A-A---A-A----TAC--A-AAACA----A--AG---C-A-ATGTAT
gi|132796 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATC------AT-------------------------C-AT-A--A--C---AG---CT-C--ACCAT--C-------A------------T---A--C-A-G---A-A----CAC--A-AT--T----A--AT---C-A-ATGCAT
gi|132797 : ATA--GAACA----GAA-CA-----TA-AATTT-T---A--A-T----A---AA-CTT--AA--AC-AT-A--A--C---AG---CT-C--ATGGT--C-------A------------T---A--C-ATA---T-A----TAC--A-A--------A--AT---C-A-ATACAT
gi|132798 : ACA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-A----G---GA-TTT---------GT-AC-A--A---AG---TA-C--ATCAT--C-------A------------T---A--A-T-A---A-A----TAC--A-A---TATACA--AT---C-A-AT
gi|132799 : ATA--GAACA----GAA-CA-----TA-C-TTT-T---AT-T-C----A---GA-CTT--AA--AC--T-AT-A--C---AG---TT-T--CTCGT--C--------------------T---A--T-G-A---A-A----CAC--A-A---T----
gi|132800 : CA--GAACA----GAA-CA-----TA-TATTT-T---AT-T-T----C---GA-CTA--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT-C--ATCAC--A-------A------------T---A--C-A-A---A-A----TAG--A-AT--T----A--AT---C-A-ATACATttataaatg
gi|132801 : A--GAACATATGGAA-CA-----TA-TACTT-T---GT-T-T----C---GA-TTT--AA--GC-AT-AT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A--------A--AG---C-A-ATACAT
gi|132802 : ATA----GAA-CA-----TA-TACTT-T---AT-T-T----C---TA-TTT--AA--GC-GT-AT-A--C---AG---CT--------T--CAA-----A------------T---A--C-A-A---A-A---------A-A---A----A--AT---C-A-ATACAT