lowQualScore : 00 0 11111 0 0 11111 00 0000 11111 5
lowQualScore : .. . ..... . . ..... .. .... ..... .
lowQualScore : 66 4 00000 4 4 00000 66 9999 00000 5
consensus : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
Reference ( gi|49238 ) : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAATTAACGACGGA
gi|49244 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAAATATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49250 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49283 : TTTG--ACG-AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGCAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49308 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AG-----GCTAAAAATTAACGACGGA
gi|49315 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGAAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GGTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49356 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGTGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49337 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGAGTCACCTAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49365 : TTTG--ACG-AATCAAGC-----TTG-CTTGAACAAA-CATGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49385 : TTTG--ACG-AATCAATA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTATGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49279 : TTTG--ACG-AATCAAGG-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACTCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGG
gi|49294 : TTTGGTACG-AATCTAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49273 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACGAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49401 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--GTTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAAATGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49296 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTTTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAAGGACGGA
gi|49303 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTGAAAT-----TTTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49229 : TTTG--ATA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAAA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49410 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACCAA-CTTGGTAGACGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCTAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49305 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TCTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49310 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTAGTAGAGGGTTACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49415 : TTTG--ACA-AAGCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ACTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGACGGA
gi|49430 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-ATTTGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTAGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49325 : TTTG--AGG-AATCAAAA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GGTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49446 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----AATATCAAA--ATTGACCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAAGTAACGACGGA
gi|49334 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGTGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49338 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTAGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAATGGA
gi|49359 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGTTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGCCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49487 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAT-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGACCATTTCTGTGAAGT-----TATATAAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49492 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGCGGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--GTTGGCCCAATGGTTTCAGAGGAGAAGCTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49503 : TTTA--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACA----TTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49507 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTCGGAAGT-----TATATCAAA--ACTGGCCCAGTGGTTTCAAAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49376 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGTACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAA
gi|49375 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CGTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----ACTAAAAGTTAACGA
gi|49398 : TTTT--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--TTTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----ACTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49389 : TTTG--ACG-AATCAAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCATTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCAAAAAGTTAACGA
gi|49509 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTTGAGGGTCACCCAAGGAACATTACTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49267 : TCTG--ATG-AATCAAGA-----CGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49368 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGATTTCAGAGGAGAAGTTATTAA----AA-----TCTAAAAGTTAACGATGGA
gi|49373 : TTTG--ACG-AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTTAAAT-----GATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGATGGA
gi|49498 : TTTG--AAA-AATCAAGA-----TGG-GTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAATT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49544 : TTTG--ACG-AATCTAGA-----TGG-CTTGAATAAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGAAACATTTCTGTGAAGT-----TATAACAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGACGGA
gi|49459 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGTTACCATATATCAAA--AATGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49423 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGATGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTTGCCCAGTGGTTTTAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACG
gi|49312 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTCCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTTAAAGTTAACGA
gi|49558 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTGGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTGG----AA------TTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49515 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-ATTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGATGGA
gi|49443 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGG-TCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--CTTGGCCCAGTAGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49437 : TTTA--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCTAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAA
gi|49425 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGG---AGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49448 : TTTG--AC--AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49474 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGACCTAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49568 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CATGTTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCA---GAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49478 : TTGG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTTTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49339 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAT-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGGCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAATTAA
gi|49574 : TTTA--ACGGAATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACACTTCTGTGAAGT-----TATATTATA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTTAAAGTTAACAACGGAgaa
gi|49370 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTACTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTTA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49581 : TTTG--ACG-AATCATGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCATAAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----TCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49598 : TTTG--ACA-CATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCGAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAAATAAAGA
gi|49564 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTAAACAAA-CTTGGTAGAGGGTGACCCAATGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAATGTTAACGATGGA
gi|49465 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGATCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTTAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAA
gi|49601 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAAAAATTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCCGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAATTTAACGATGGA
gi|49639 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTATAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATC-AA--ATTGGCCCAGTGGTTTCA---GAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAAAATTAACAACGGA
gi|49609 : TTTG--TCG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATGTCTTTGAAGT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGGGGAGAAGTCGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49528 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTGCTGTGAAAT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCATTGGTTTCAGAGGAGATGTTGTTAA----AA-----GCTGAAAGTTAACAACGGA
gi|49521 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACA----TTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCTGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49360 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCA---GAGAAGTTGTTAA----TA-----GCTAAAATTTAACGACGGA
gi|49611 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-TTTGGTAGAAAGTCACCCAAGGAACATTTCTTTGAAGT-----AATATCAAA--ATTGGCCAAATGGTTTCGGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49540 : TTTG--ATG-AATCAAAA-----AGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGAACATTTTTCTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49241 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAATGGGTCACCCAAGGAACAATTCTGTGAAAC-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49597 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTATAGGGTCACCCAAGGAACATTACTATGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGT-GTGTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49530 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-GTTGTACAAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGGGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAATTTAACGACGGA
gi|49628 : TTTG--ATG-AATCAAGC-----TGG-TTTTAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATC-AA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTT-ACAACGGA
gi|49556 : TTTA--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCAATGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAGGTTTACGAcga
gi|49326 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTTGTGG-GGGTCACCCAAGGAACAATTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--AGTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTAGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49663 : TTTT--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTTAACAAG-CTTGGTAGAGAGCCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCAAAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----TCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49587 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCACCCAAAGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTTAAAGTAAACGACGGA
gi|49619 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAATGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AAAAGTTGCTAAAATTTTACGA
gi|49673 : TTTG--ATG-AATCAAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGCAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCTTTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GTTAAATGTTAATGACGGA
gi|49539 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGCACATTTCTGTGAAAT-----TATATAACA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGATGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49485 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGTTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAAC-----TTTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49688 : TTTT--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCGATGGTTTCA---TAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49692 : TCTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAGA-CTTGGTAGAGAATTACCAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAC--ATTGGCCCAGTGGTTTTAAAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49698 : TTTT--ATG-AATCACTA-----CAA-TTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATAAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49707 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTTTAAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGCTAG----AA-----TCTAAACATTAATG
gi|49660 : TTTT--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTACAGGGTCATCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAGA--ATTAGCTCAGTGGTTCCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCCAAAAGTAAATGATGGA
gi|49650 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAGA-TTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAATGTTAATGA
gi|49667 : TTTG--ACG-AATCAAGT-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTCTA---GAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTGAACGA
gi|49510 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TTG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAATTAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTAACCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49682 : TTTG--ACG-AATCCAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CCTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATATCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGGAGATGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGCTAATGACGGA
gi|49703 : TTTA--ATG-AATCAAGA-----TGG-TTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTTAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTTTAGAGGTGAAGTTGTTAG----CA-----GCTTAAAGTTAACGATGGA
gi|49683 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGTGACACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGAAGAAATTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTA
gi|49618 : TTTG--ACG-AATCAATA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATAACAAA--ATTGGCCCAGCGGTTTGAAAAGAGAAATTGTTAC----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49694 : TTTA--ACA-AATCAAGACAAGATGGTCTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCATGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAGTTCTAA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49701 : TTTA--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTAAACAAAACTTGGTAGAGGGTCATGCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGACCCAGTGGTTTC---TGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49464 : TTTG--ACG-AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAA------TAAATAAAA--ATTGGCCCAGTTGTTTCTGAGGAGAAGGTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49377 : TTTG---CG-AAACAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTT----------CACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|50006 : TG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|50011 : TG--ATG-AATCAAGA-----CGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAAAATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAAC
gi|50032 : CA-AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----ACTAAAAGTAAACGACGGAtaa
gi|50038 : -AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGGAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TACATCAAA--ATTGGCCCAGTTGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
Alignments
lowQualScore : 00 0 11111 0 0 11111 00 0000 11111
lowQualScore : .. . ..... . . ..... .. .... .....
lowQualScore : 66 4 00000 4 4 00000 55 8888 00000
consensus : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
Reference ( family-32 ) : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49229 : TTTG--ATA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAAA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49238 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAATTAACGACGGA
gi|49241 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAATGGGTCACCCAAGGAACAATTCTGTGAAAC-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49244 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAAATATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49250 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49267 : TCTG--ATG-AATCAAGA-----CGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49273 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACGAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49279 : TTTG--ACG-AATCAAGG-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACTCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGG
gi|49283 : TTTG--ACG-AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGCAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49294 : TTTGGTACG-AATCTAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49296 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTTTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAAGGACGGA
gi|49303 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTGAAAT-----TTTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49305 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TCTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49308 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AG-----GCTAAAAATTAACGACGGA
gi|49310 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTAGTAGAGGGTTACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49312 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTCCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTTAAAGTTAACGA
gi|49315 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGAAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GGTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49325 : TTTG--AGG-AATCAAAA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GGTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49326 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTTGTGG-GGGTCACCCAAGGAACAATTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--AGTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTAGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49334 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGTGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49337 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGAGTCACCTAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49338 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTAGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAATGGA
gi|49339 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAT-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGGCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAATTAA
gi|49356 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGTGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGAgaa
gi|49359 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGTTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGCCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49360 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCA---GAGAAGTTGTTAA----TA-----GCTAAAATTTAACGACGGA
gi|49365 : TTTG--ACG-AATCAAGC-----TTG-CTTGAACAAA-CATGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49368 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGATTTCAGAGGAGAAGTTATTAA----AA-----TCTAAAAGTTAACGATGGA
gi|49370 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTACTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTTA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49373 : TTTG--ACG-AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTTAAAT-----GATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGATGGA
gi|49375 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CGTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----ACTAAAAGTTAACGA
gi|49376 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGTACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAA
gi|49377 : TTTG---CG-AAACAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTT----------CACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49385 : TTTG--ACG-AATCAATA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTATGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49389 : TTTG--ACG-AATCAAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCATTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCAAAAAGTTAACGA
gi|49398 : TTTT--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--TTTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----ACTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49401 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--GTTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAAATGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49410 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACCAA-CTTGGTAGACGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCTAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49415 : TTTG--ACA-AAGCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ACTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGACGGA
gi|49423 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGATGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTTGCCCAGTGGTTTTAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACG
gi|49425 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGG---AGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49430 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-ATTTGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTAGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49437 : TTTA--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCTAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAA
gi|49443 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGG-TCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--CTTGGCCCAGTAGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49446 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----AATATCAAA--ATTGACCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAAGTAACGACGGA
gi|49448 : TTTG--AC--AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49459 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGTTACCATATATCAAA--AATGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49464 : TTTG--ACG-AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAA------TAAATAAAA--ATTGGCCCAGTTGTTTCTGAGGAGAAGGTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49465 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGATCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTTAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAA
gi|49474 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGACCTAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49478 : TTGG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTTTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49485 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGTTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAAC-----TTTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49487 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAT-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGACCATTTCTGTGAAGT-----TATATAAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49492 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGCGGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--GTTGGCCCAATGGTTTCAGAGGAGAAGCTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49498 : TTTG--AAA-AATCAAGA-----TGG-GTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAATT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49503 : TTTA--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACA----TTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49507 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTCGGAAGT-----TATATCAAA--ACTGGCCCAGTGGTTTCAAAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49509 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTTGAGGGTCACCCAAGGAACATTACTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49510 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TTG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAATTAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTAACCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49515 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-ATTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGATGGA
gi|49521 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACA----TTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCTGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49528 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTGCTGTGAAAT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCATTGGTTTCAGAGGAGATGTTGTTAA----AA-----GCTGAAAGTTAACAACGGA
gi|49530 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-GTTGTACAAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGGGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAATTTAACGACGGA
gi|49539 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGCACATTTCTGTGAAAT-----TATATAACA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGATGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49540 : TTTG--ATG-AATCAAAA-----AGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGAACATTTTTCTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49544 : TTTG--ACG-AATCTAGA-----TGG-CTTGAATAAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGAAACATTTCTGTGAAGT-----TATAACAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGACGGA
gi|49556 : TTTA--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCAATGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAGGTTTACGA
gi|49558 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTGGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTGG----AA------TTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49564 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTAAACAAA-CTTGGTAGAGGGTGACCCAATGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAATGTTAACGATGGA
gi|49568 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CATGTTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCA---GAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49574 : TTTA--ACGGAATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACACTTCTGTGAAGT-----TATATTATA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTTAAAGTTAACAACGGA
gi|49581 : TTTG--ACG-AATCATGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCATAAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----TCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49587 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCACCCAAAGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTTAAAGTAAACGACGGA
gi|49597 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTATAGGGTCACCCAAGGAACATTACTATGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGT-GTGTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49598 : TTTG--ACA-CATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCGAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAAATAAAGA
gi|49601 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAAAAATTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCCGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAATTTAACGATGGA
gi|49609 : TTTG--TCG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATGTCTTTGAAGT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGGGGAGAAGTCGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49611 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-TTTGGTAGAAAGTCACCCAAGGAACATTTCTTTGAAGT-----AATATCAAA--ATTGGCCAAATGGTTTCGGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49618 : TTTG--ACG-AATCAATA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATAACAAA--ATTGGCCCAGCGGTTTGAAAAGAGAAATTGTTAC----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49619 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAATGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AAAAGTTGCTAAAATTTTACGA
gi|49628 : TTTG--ATG-AATCAAGC-----TGG-TTTTAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATC-AA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTT-ACAACGGA
gi|49639 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTATAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATC-AA--ATTGGCCCAGTGGTTTCA---GAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAAAATTAACAACGGAcga
gi|49650 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAGA-TTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAATGTTAATGA
gi|49660 : TTTT--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTACAGGGTCATCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAGA--ATTAGCTCAGTGGTTCCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCCAAAAGTAAATGATGGA
gi|49663 : TTTT--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTTAACAAG-CTTGGTAGAGAGCCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCAAAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----TCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49667 : TTTG--ACG-AATCAAGT-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTCTA---GAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTGAACGA
gi|49673 : TTTG--ATG-AATCAAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGCAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCTTTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GTTAAATGTTAATGACGGA
gi|49682 : TTTG--ACG-AATCCAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CCTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATATCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGGAGATGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGCTAATGACGGA
gi|49683 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGTGACACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGAAGAAATTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTA
gi|49688 : TTTT--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCGATGGTTTCA---TAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49692 : TCTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAGA-CTTGGTAGAGAATTACCAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAC--ATTGGCCCAGTGGTTTTAAAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49694 : TTTA--ACA-AATCAAGACAAGATGGTCTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCATGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAGTTCTAA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49698 : TTTT--ATG-AATCACTA-----CAA-TTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATAAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49701 : TTTA--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTAAACAAAACTTGGTAGAGGGTCATGCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGACCCAGTGGTTTC---TGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49703 : TTTA--ATG-AATCAAGA-----TGG-TTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTTAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTTTAGAGGTGAAGTTGTTAG----CA-----GCTTAAAGTTAACGATGGA
gi|49707 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTTTAAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGCTAG----AA-----TCTAAACATTAATG
gi|50006 : TG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|50011 : TG--ATG-AATCAAGA-----CGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAAAATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAAC
gi|50032 : CA-AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----ACTAAAAGTAAACGACGGAtaa
gi|50038 : -AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGGAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TACATCAAA--ATTGGCCCAGTTGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
Alignments
lowQualScore : 00 0 11111 0 0 11111 00 0000 11111
lowQualScore : .. . ..... . . ..... .. .... .....
lowQualScore : 66 4 00000 4 4 00000 55 8888 00000
consensus : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
Reference ( family-32 ) : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49229 : TTTG--ATA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAAA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49238 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAATTAACGACGGA
gi|49241 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAATGGGTCACCCAAGGAACAATTCTGTGAAAC-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49244 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAAATATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49250 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49267 : TCTG--ATG-AATCAAGA-----CGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49273 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACGAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49279 : TTTG--ACG-AATCAAGG-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACTCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGG
gi|49283 : TTTG--ACG-AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGCAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49294 : TTTGGTACG-AATCTAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49296 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTTTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAAGGACGGA
gi|49303 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTGAAAT-----TTTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49305 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TCTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49308 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AG-----GCTAAAAATTAACGACGGA
gi|49310 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTAGTAGAGGGTTACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49312 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTCCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTTAAAGTTAACGA
gi|49315 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGAAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GGTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49325 : TTTG--AGG-AATCAAAA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GGTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49326 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTTGTGG-GGGTCACCCAAGGAACAATTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--AGTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTAGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49334 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGTGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49337 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGAGTCACCTAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49338 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTAGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAATGGA
gi|49339 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAT-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGGCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAATTAA
gi|49356 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGTGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGAgaa
gi|49359 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGTTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGCCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49360 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCA---GAGAAGTTGTTAA----TA-----GCTAAAATTTAACGACGGA
gi|49365 : TTTG--ACG-AATCAAGC-----TTG-CTTGAACAAA-CATGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49368 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGATTTCAGAGGAGAAGTTATTAA----AA-----TCTAAAAGTTAACGATGGA
gi|49370 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTACTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTTA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49373 : TTTG--ACG-AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTTAAAT-----GATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGATGGA
gi|49375 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CGTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----ACTAAAAGTTAACGA
gi|49376 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGTACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAA
gi|49377 : TTTG---CG-AAACAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTT----------CACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49385 : TTTG--ACG-AATCAATA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTATGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49389 : TTTG--ACG-AATCAAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCATTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCAAAAAGTTAACGA
gi|49398 : TTTT--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--TTTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----ACTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49401 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--GTTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAAATGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49410 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACCAA-CTTGGTAGACGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCTAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49415 : TTTG--ACA-AAGCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ACTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGACGGA
gi|49423 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGATGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTTGCCCAGTGGTTTTAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACG
gi|49425 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGG---AGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49430 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-ATTTGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTAGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49437 : TTTA--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCTAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAA
gi|49443 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGG-TCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--CTTGGCCCAGTAGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49446 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----AATATCAAA--ATTGACCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAAGTAACGACGGA
gi|49448 : TTTG--AC--AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49459 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGTTACCATATATCAAA--AATGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49464 : TTTG--ACG-AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAA------TAAATAAAA--ATTGGCCCAGTTGTTTCTGAGGAGAAGGTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49465 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGATCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTTAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAA
gi|49474 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGACCTAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49478 : TTGG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTTTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49485 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGTTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAAC-----TTTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49487 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAT-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGACCATTTCTGTGAAGT-----TATATAAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49492 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGCGGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--GTTGGCCCAATGGTTTCAGAGGAGAAGCTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49498 : TTTG--AAA-AATCAAGA-----TGG-GTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAATT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49503 : TTTA--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACA----TTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49507 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTCGGAAGT-----TATATCAAA--ACTGGCCCAGTGGTTTCAAAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49509 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTTGAGGGTCACCCAAGGAACATTACTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49510 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TTG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAATTAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTAACCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49515 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-ATTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGATGGA
gi|49521 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACA----TTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCTGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49528 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTGCTGTGAAAT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCATTGGTTTCAGAGGAGATGTTGTTAA----AA-----GCTGAAAGTTAACAACGGA
gi|49530 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-GTTGTACAAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGGGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAATTTAACGACGGA
gi|49539 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGCACATTTCTGTGAAAT-----TATATAACA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGATGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49540 : TTTG--ATG-AATCAAAA-----AGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGAACATTTTTCTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49544 : TTTG--ACG-AATCTAGA-----TGG-CTTGAATAAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGAAACATTTCTGTGAAGT-----TATAACAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGACGGA
gi|49556 : TTTA--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCAATGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAGGTTTACGA
gi|49558 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTGGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTGG----AA------TTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49564 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTAAACAAA-CTTGGTAGAGGGTGACCCAATGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAATGTTAACGATGGA
gi|49568 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CATGTTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCA---GAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49574 : TTTA--ACGGAATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACACTTCTGTGAAGT-----TATATTATA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTTAAAGTTAACAACGGA
gi|49581 : TTTG--ACG-AATCATGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCATAAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----TCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49587 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCACCCAAAGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTTAAAGTAAACGACGGA
gi|49597 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTATAGGGTCACCCAAGGAACATTACTATGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGT-GTGTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49598 : TTTG--ACA-CATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCGAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAAATAAAGA
gi|49601 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAAAAATTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCCGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAATTTAACGATGGA
gi|49609 : TTTG--TCG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATGTCTTTGAAGT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGGGGAGAAGTCGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49611 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-TTTGGTAGAAAGTCACCCAAGGAACATTTCTTTGAAGT-----AATATCAAA--ATTGGCCAAATGGTTTCGGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49618 : TTTG--ACG-AATCAATA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATAACAAA--ATTGGCCCAGCGGTTTGAAAAGAGAAATTGTTAC----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49619 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAATGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AAAAGTTGCTAAAATTTTACGA
gi|49628 : TTTG--ATG-AATCAAGC-----TGG-TTTTAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATC-AA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTT-ACAACGGA
gi|49639 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTATAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATC-AA--ATTGGCCCAGTGGTTTCA---GAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAAAATTAACAACGGAcga
gi|49650 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAGA-TTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAATGTTAATGA
gi|49660 : TTTT--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTACAGGGTCATCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAGA--ATTAGCTCAGTGGTTCCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCCAAAAGTAAATGATGGA
gi|49663 : TTTT--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTTAACAAG-CTTGGTAGAGAGCCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCAAAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----TCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49667 : TTTG--ACG-AATCAAGT-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTCTA---GAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTGAACGA
gi|49673 : TTTG--ATG-AATCAAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGCAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCTTTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GTTAAATGTTAATGACGGA
gi|49682 : TTTG--ACG-AATCCAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CCTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATATCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGGAGATGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGCTAATGACGGA
gi|49683 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGTGACACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGAAGAAATTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTA
gi|49688 : TTTT--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCGATGGTTTCA---TAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49692 : TCTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAGA-CTTGGTAGAGAATTACCAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAC--ATTGGCCCAGTGGTTTTAAAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49694 : TTTA--ACA-AATCAAGACAAGATGGTCTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCATGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAGTTCTAA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49698 : TTTT--ATG-AATCACTA-----CAA-TTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATAAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49701 : TTTA--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTAAACAAAACTTGGTAGAGGGTCATGCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGACCCAGTGGTTTC---TGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49703 : TTTA--ATG-AATCAAGA-----TGG-TTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTTAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTTTAGAGGTGAAGTTGTTAG----CA-----GCTTAAAGTTAACGATGGA
gi|49707 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTTTAAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGCTAG----AA-----TCTAAACATTAATG
gi|50006 : TG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|50011 : TG--ATG-AATCAAGA-----CGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAAAATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAAC
gi|50032 : CA-AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----ACTAAAAGTAAACGACGGAtaa
gi|50038 : -AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGGAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TACATCAAA--ATTGGCCCAGTTGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
blockSeqs : CAAGA
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
finalCons : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
Alignments
lowQualScore : 00 0 11111 0 0 11111 00 0000 11111
lowQualScore : .. . ..... . . ..... .. .... .....
lowQualScore : 66 4 00000 4 4 00000 55 8888 00000
consensus : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
Reference ( family-32 ) : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49229 : TTTG--ATA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAAA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49238 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAATTAACGACGGA
gi|49241 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAATGGGTCACCCAAGGAACAATTCTGTGAAAC-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49244 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAAATATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49250 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49267 : TCTG--ATG-AATCAAGA-----CGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49273 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACGAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49279 : TTTG--ACG-AATCAAGG-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACTCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGG
gi|49283 : TTTG--ACG-AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGCAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49294 : TTTGGTACG-AATCTAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49296 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTTTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAAGGACGGA
gi|49303 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTGAAAT-----TTTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49305 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TCTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49308 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AG-----GCTAAAAATTAACGACGGA
gi|49310 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTAGTAGAGGGTTACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49312 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTCCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTTAAAGTTAACGA
gi|49315 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGAAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GGTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49325 : TTTG--AGG-AATCAAAA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GGTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49326 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTTGTGG-GGGTCACCCAAGGAACAATTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--AGTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTAGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49334 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGTGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49337 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGAGTCACCTAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49338 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTAGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAATGGA
gi|49339 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAT-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGGCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAATTAA
gi|49356 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGTGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGAgaa
gi|49359 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGTTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGCCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49360 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCA---GAGAAGTTGTTAA----TA-----GCTAAAATTTAACGACGGA
gi|49365 : TTTG--ACG-AATCAAGC-----TTG-CTTGAACAAA-CATGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49368 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGATTTCAGAGGAGAAGTTATTAA----AA-----TCTAAAAGTTAACGATGGA
gi|49370 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTACTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTTA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49373 : TTTG--ACG-AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTTAAAT-----GATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGATGGA
gi|49375 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CGTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----ACTAAAAGTTAACGA
gi|49376 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGTACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAA
gi|49377 : TTTG---CG-AAACAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTT----------CACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49385 : TTTG--ACG-AATCAATA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTATGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49389 : TTTG--ACG-AATCAAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCATTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCAAAAAGTTAACGA
gi|49398 : TTTT--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--TTTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----ACTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49401 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--GTTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAAATGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49410 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACCAA-CTTGGTAGACGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCTAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49415 : TTTG--ACA-AAGCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ACTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGACGGA
gi|49423 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGATGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTTGCCCAGTGGTTTTAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACG
gi|49425 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGG---AGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49430 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-ATTTGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTAGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49437 : TTTA--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCTAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAA
gi|49443 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGG-TCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--CTTGGCCCAGTAGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49446 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----AATATCAAA--ATTGACCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAAGTAACGACGGA
gi|49448 : TTTG--AC--AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATTTTTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49459 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGTTACCATATATCAAA--AATGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49464 : TTTG--ACG-AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAA------TAAATAAAA--ATTGGCCCAGTTGTTTCTGAGGAGAAGGTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGAAGGA
gi|49465 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAAAGGATCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTTAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAA
gi|49474 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGACCTAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49478 : TTGG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTTTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49485 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGTTAGAGGGTCACCCAAGGAATATTTCTGTGAAAC-----TTTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49487 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAT-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGACCATTTCTGTGAAGT-----TATATAAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49492 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGCGGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--GTTGGCCCAATGGTTTCAGAGGAGAAGCTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49498 : TTTG--AAA-AATCAAGA-----TGG-GTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAATT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49503 : TTTA--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACA----TTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49507 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTCGGAAGT-----TATATCAAA--ACTGGCCCAGTGGTTTCAAAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49509 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTTGAGGGTCACCCAAGGAACATTACTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAAAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49510 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TTG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAATTAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTAACCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49515 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-ATTGGTAGAGGGTCGCCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGATGGA
gi|49521 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACA----TTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCTGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49528 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTGCTGTGAAAT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCATTGGTTTCAGAGGAGATGTTGTTAA----AA-----GCTGAAAGTTAACAACGGA
gi|49530 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-GTTGTACAAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGA-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGGGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAATTTAACGACGGA
gi|49539 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGCACATTTCTGTGAAAT-----TATATAACA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGATGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49540 : TTTG--ATG-AATCAAAA-----AGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGAACATTTTTCTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49544 : TTTG--ACG-AATCTAGA-----TGG-CTTGAATAAA-CTTGGTAGAGGATCACCCAAGAAACATTTCTGTGAAGT-----TATAACAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTAAACGACGGA
gi|49556 : TTTA--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCAATGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAGGTTTACGA
gi|49558 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTGGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTGG----AA------TTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49564 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTAAACAAA-CTTGGTAGAGGGTGACCCAATGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAATGTTAACGATGGA
gi|49568 : TTTG--AAG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CATGTTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCA---GAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49574 : TTTA--ACGGAATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACACTTCTGTGAAGT-----TATATTATA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTTAAAGTTAACAACGGA
gi|49581 : TTTG--ACG-AATCATGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCATAAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----TCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49587 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGA-CTTGAACAAA-CTTTGTAGAGGGTCACCCAAAGAATATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGTCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTTAAAGTAAACGACGGA
gi|49597 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTATAGGGTCACCCAAGGAACATTACTATGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGT-GTGTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49598 : TTTG--ACA-CATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCGAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAAATAAAGA
gi|49601 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAAAAATTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCCGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAATTTAACGATGGA
gi|49609 : TTTG--TCG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATGTCTTTGAAGT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGGGGAGAAGTCGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACAACGGA
gi|49611 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-TTTGGTAGAAAGTCACCCAAGGAACATTTCTTTGAAGT-----AATATCAAA--ATTGGCCAAATGGTTTCGGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49618 : TTTG--ACG-AATCAATA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATAACAAA--ATTGGCCCAGCGGTTTGAAAAGAGAAATTGTTAC----AA-----GCTAAAAGTTAACGA
gi|49619 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAATGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AAAAGTTGCTAAAATTTTACGA
gi|49628 : TTTG--ATG-AATCAAGC-----TGG-TTTTAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATC-AA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTT-ACAACGGA
gi|49639 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTATAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATC-AA--ATTGGCCCAGTGGTTTCA---GAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAAAATTAACAACGGAcga
gi|49650 : TTTG--ACG-AATCAAGA-----TAG-CTTGAACAGA-TTTGGTAGAAGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTATTAG----AA-----GCTAAATGTTAATGA
gi|49660 : TTTT--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTACAGGGTCATCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAGA--ATTAGCTCAGTGGTTCCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCCAAAAGTAAATGATGGA
gi|49663 : TTTT--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTTAACAAG-CTTGGTAGAGAGCCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCAAAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----TCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49667 : TTTG--ACG-AATCAAGT-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTCTA---GAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTGAACGA
gi|49673 : TTTG--ATG-AATCAAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGCAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCTTTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GTTAAATGTTAATGACGGA
gi|49682 : TTTG--ACG-AATCCAGC-----TGG-CTTGAACAAA-CCTGGTAGAGGGTCACCAAAGGAACATATCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGGAGATGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGCTAATGACGGA
gi|49683 : TTTG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGATAGAGTGACACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCAAGTGGTTTCAGAGAAGAAATTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTA
gi|49688 : TTTT--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TGTATCAAA--ATTGGCCCGATGGTTTCA---TAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAATGACGGA
gi|49692 : TCTG--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAGA-CTTGGTAGAGAATTACCAAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAC--ATTGGCCCAGTGGTTTTAAAGAAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49694 : TTTA--ACA-AATCAAGACAAGATGGTCTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCATGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAGTTCTAA-----GCTAAAAGTTAATGA
gi|49698 : TTTT--ATG-AATCACTA-----CAA-TTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTAAAGT-----TATATAAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49701 : TTTA--ACG-AATCAAGA-----TGG-CTTAAACAAAACTTGGTAGAGGGTCATGCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGACCCAGTGGTTTC---TGAGAAGTTGTTAA----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|49703 : TTTA--ATG-AATCAAGA-----TGG-TTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGAAACATTTCTGTTAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCTAGTGGTTTTAGAGGTGAAGTTGTTAG----CA-----GCTTAAAGTTAACGATGGA
gi|49707 : TTTG--ACA-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTTTAAAGT-----TATATCAAA--ATTAGCCCAGTGGTTTCAGAGAAGAAGTTGCTAG----AA-----TCTAAACATTAATG
gi|50006 : TG--ATG-AATCAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TATATTAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGAAAAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGACGGA
gi|50011 : TG--ATG-AATCAAGA-----CGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAAAATTTCTGTGAAGT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAAC
gi|50032 : CA-AATTAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGTAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAAT-----TATATCAAA--ATTGGCCCAGTGGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAA----AA-----ACTAAAAGTAAACGACGGAtaa
gi|50038 : -AATAAAGA-----TGG-CTTGAACAAA-CTTGGGAGAGGGTCACCCAAGGAACATTTCTGTGAAGT-----TACATCAAA--ATTGGCCCAGTTGTTTCAGAGGAGAAGTTGTTAG----AA-----GCTAAAAGTTAACGA